View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4264_low_7 (Length: 240)

Name: NF4264_low_7
Description: NF4264
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4264_low_7
NF4264_low_7
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (19-235)||(96-312)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (19-235)||(22932495-22932711)
chr6 (19-235)||(23854940-23855156)
chr6 (19-235)||(27270198-27270414)
chr6 (19-235)||(27627322-27627538)
chr6 (19-235)||(15421931-15422147)
chr6 (19-235)||(24866085-24866301)
chr6 (19-235)||(13296562-13296778)
chr6 (19-235)||(16752190-16752406)
chr6 (19-235)||(26920746-26920962)
chr6 (20-235)||(27046756-27046971)
chr6 (19-234)||(27287975-27288190)
chr6 (19-235)||(27021505-27021721)
chr6 (19-235)||(3698452-3698668)
chr6 (19-235)||(16676509-16676725)
chr6 (19-235)||(17090054-17090270)
chr6 (20-235)||(4527653-4527868)
chr6 (20-235)||(4543386-4543601)
chr6 (20-235)||(4721747-4721962)
chr6 (20-235)||(4760132-4760347)
chr6 (20-235)||(4775249-4775464)
chr6 (20-235)||(27010100-27010315)
chr6 (20-235)||(27487502-27487717)
chr6 (20-235)||(28209823-28210038)
chr6 (20-235)||(29575383-29575598)
chr6 (19-235)||(34462117-34462333)
chr6 (20-235)||(16941639-16941854)
chr6 (20-235)||(26114024-26114239)
chr6 (20-235)||(29503785-29504000)
chr6 (19-235)||(26991258-26991478)
chr6 (20-235)||(30555628-30555843)
chr6 (19-235)||(20162989-20163205)
chr6 (19-235)||(22169626-22169842)
chr6 (74-235)||(29551849-29552011)
chr6 (137-210)||(29552012-29552085)
chr6 (19-66)||(29552095-29552142)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (19-235)||(24972285-24972501)
chr5 (19-235)||(30937015-30937231)
chr5 (19-235)||(33779868-33780084)
chr5 (19-235)||(22996682-22996898)
chr5 (18-235)||(24685709-24685926)
chr5 (19-235)||(11551734-11551950)
chr5 (19-235)||(15656323-15656539)
chr5 (19-235)||(23894585-23894801)
chr5 (20-235)||(30170848-30171063)
chr5 (19-235)||(33294907-33295123)
chr5 (20-235)||(6876684-6876899)
chr5 (20-235)||(8663041-8663256)
chr5 (20-235)||(9319855-9320070)
chr5 (20-235)||(12134554-12134769)
chr5 (20-235)||(28651621-28651836)
chr5 (20-235)||(34618897-34619112)
chr5 (19-233)||(22890846-22891060)
chr5 (19-235)||(23628348-23628564)
chr5 (19-235)||(41677084-41677300)
chr5 (20-235)||(26482773-26482988)
chr5 (20-235)||(30031807-30032022)
chr5 (20-235)||(30154410-30154625)
chr5 (20-235)||(31433843-31434058)
chr5 (20-235)||(32593840-32594055)
chr5 (20-235)||(43080634-43080849)
chr5 (20-234)||(3791921-3792135)
chr5 (20-234)||(40471116-40471330)
chr5 (19-235)||(18498290-18498506)
chr5 (19-235)||(37669051-37669267)
chr5 (20-235)||(13322396-13322611)
chr5 (20-235)||(37356209-37356424)
chr5 (20-235)||(37757362-37757577)
chr5 (20-235)||(5640167-5640382)
chr5 (20-235)||(18373100-18373315)
chr5 (20-235)||(24683821-24684036)
chr5 (20-235)||(24726348-24726563)
chr5 (20-235)||(28957351-28957566)
chr5 (23-235)||(2513441-2513653)
chr5 (20-235)||(33518759-33518974)
chr5 (20-235)||(37768557-37768772)
chr5 (20-235)||(15756418-15756633)
chr5 (20-235)||(31823973-31824188)
chr5 (22-178)||(25202714-25202870)
chr5 (22-178)||(25266869-25267025)
chr5 (182-235)||(25201411-25201464)
chr5 (182-235)||(25265566-25265619)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (19-235)||(2156943-2157159)
chr7 (19-235)||(5130365-5130581)
chr7 (19-235)||(16515983-16516199)
chr7 (19-235)||(10914422-10914638)
chr7 (19-235)||(11422332-11422548)
chr7 (21-235)||(2107718-2107932)
chr7 (19-235)||(4201758-4201974)
chr7 (24-235)||(4142804-4143015)
chr7 (20-235)||(26317402-26317617)
chr7 (20-235)||(26437626-26437841)
chr7 (19-235)||(26272639-26272855)
chr7 (20-235)||(26667468-26667683)
chr7 (19-237)||(26535426-26535644)
chr7 (20-235)||(9621019-9621234)
chr7 (20-235)||(11443256-11443471)
chr7 (20-235)||(31561944-31562159)
chr7 (20-235)||(45389589-45389804)
chr7 (19-235)||(16447559-16447775)
chr7 (20-235)||(24590088-24590303)
chr7 (20-235)||(26515161-26515376)
chr7 (19-235)||(5144893-5145109)
chr7 (20-235)||(16734015-16734230)
chr7 (20-235)||(16749071-16749286)
chr7 (20-235)||(17525903-17526118)
chr7 (20-235)||(17527096-17527311)
chr7 (19-235)||(16043688-16043904)
chr7 (20-235)||(3447675-3447890)
chr7 (112-233)||(10844014-10844135)
chr7 (112-233)||(10843617-10843738)
chr7 (19-87)||(10843547-10843615)
chr7 (185-235)||(16501113-16501163)
chr7 (19-86)||(10844138-10844205)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (19-235)||(36342185-36342401)
chr4 (19-235)||(14667401-14667617)
chr4 (20-235)||(5008260-5008475)
chr4 (19-235)||(14760974-14761190)
chr4 (19-235)||(17015431-17015647)
chr4 (19-235)||(24590029-24590245)
chr4 (19-235)||(34186628-34186844)
chr4 (19-235)||(6572243-6572459)
chr4 (19-233)||(15230259-15230473)
chr4 (20-235)||(39853022-39853237)
chr4 (20-235)||(54835776-54835991)
chr4 (19-235)||(1902638-1902854)
chr4 (19-235)||(27160985-27161201)
chr4 (20-235)||(18314847-18315062)
chr4 (20-235)||(18798283-18798498)
chr4 (20-235)||(30756145-30756360)
chr4 (19-233)||(15282596-15282810)
chr4 (19-235)||(24115047-24115263)
chr4 (20-235)||(40103306-40103521)
chr4 (20-235)||(14100928-14101143)
chr4 (20-235)||(21972086-21972301)
chr4 (20-235)||(33671469-33671684)
chr4 (20-235)||(31124181-31124396)
chr4 (19-219)||(15389046-15389246)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (19-235)||(27432098-27432314)
chr2 (19-235)||(12657907-12658123)
chr2 (19-235)||(20840284-20840500)
chr2 (19-235)||(23126225-23126441)
chr2 (19-235)||(28884578-28884794)
chr2 (20-235)||(21674833-21675048)
chr2 (20-235)||(37683553-37683768)
chr2 (20-235)||(37698818-37699033)
chr2 (19-235)||(11632841-11633057)
chr2 (19-235)||(21700827-21701043)
chr2 (19-235)||(37377542-37377758)
chr2 (20-235)||(9347644-9347859)
chr2 (20-235)||(13934205-13934420)
chr2 (20-235)||(27806074-27806289)
chr2 (20-235)||(34864055-34864270)
chr2 (20-235)||(37927740-37927955)
chr2 (20-235)||(39049477-39049692)
chr2 (19-235)||(258410-258626)
chr2 (19-235)||(12589179-12589395)
chr2 (20-235)||(12714259-12714474)
chr2 (20-235)||(19414159-19414374)
chr2 (20-235)||(31878657-31878872)
chr2 (20-235)||(32052174-32052389)
chr2 (20-235)||(16826996-16827211)
chr2 (20-235)||(16894269-16894484)
chr2 (20-235)||(39892440-39892655)
chr2 (19-233)||(19454080-19454294)
chr2 (19-235)||(40235879-40236095)
chr2 (95-235)||(34288720-34288860)
chr2 (95-235)||(34293780-34293920)
chr2 (19-231)||(27393937-27394149)
chr2 (193-235)||(37949153-37949195)
[»] scaffold0089 (5 HSPs)
scaffold0089 (19-235)||(44659-44875)
scaffold0089 (146-235)||(37861-37950)
scaffold0089 (19-114)||(2560-2655)
scaffold0089 (19-114)||(37767-37862)
scaffold0089 (146-178)||(2529-2561)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (19-235)||(2134889-2135105)
chr8 (19-235)||(27606534-27606750)
chr8 (19-235)||(9356996-9357212)
chr8 (19-235)||(14559995-14560211)
chr8 (19-235)||(16285814-16286030)
chr8 (19-235)||(18711855-18712071)
chr8 (19-235)||(19690469-19690685)
chr8 (19-235)||(18793076-18793292)
chr8 (19-235)||(16279921-16280137)
chr8 (20-235)||(19205992-19206207)
chr8 (20-235)||(19676818-19677033)
chr8 (20-235)||(33261105-33261320)
chr8 (20-235)||(12090353-12090568)
chr8 (20-235)||(28359582-28359797)
chr8 (20-235)||(29831697-29831912)
chr8 (24-235)||(31487506-31487717)
chr8 (20-235)||(31356899-31357114)
chr8 (72-235)||(3327186-3327349)
chr8 (19-219)||(22078540-22078739)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (19-235)||(22385289-22385505)
chr3 (19-235)||(48468260-48468476)
chr3 (19-235)||(4723964-4724180)
chr3 (19-235)||(6204236-6204452)
chr3 (19-235)||(8287181-8287397)
chr3 (19-235)||(15738805-15739021)
chr3 (19-235)||(18053595-18053811)
chr3 (19-235)||(18274763-18274979)
chr3 (19-235)||(18290064-18290280)
chr3 (19-235)||(18305365-18305581)
chr3 (19-235)||(20068373-20068589)
chr3 (19-235)||(29146467-29146683)
chr3 (19-235)||(32441484-32441700)
chr3 (19-235)||(8298304-8298520)
chr3 (19-235)||(15890416-15890632)
chr3 (19-235)||(18332970-18333186)
chr3 (19-235)||(22868559-22868775)
chr3 (19-235)||(22883618-22883834)
chr3 (19-235)||(4794346-4794562)
chr3 (19-235)||(18532716-18532932)
chr3 (19-235)||(28113665-28113881)
chr3 (19-235)||(35883099-35883315)
chr3 (20-235)||(4419248-4419463)
chr3 (19-235)||(7075539-7075755)
chr3 (20-235)||(4344388-4344603)
chr3 (20-235)||(11108064-11108279)
chr3 (20-235)||(18245074-18245289)
chr3 (20-234)||(28341511-28341725)
chr3 (20-235)||(6540454-6540669)
chr3 (20-235)||(20574555-20574770)
chr3 (20-235)||(47025786-47026001)
chr3 (19-235)||(5469321-5469537)
chr3 (19-235)||(29662681-29662897)
chr3 (20-235)||(5594069-5594284)
chr3 (20-235)||(7998893-7999108)
chr3 (20-235)||(10645406-10645621)
chr3 (20-235)||(31962167-31962382)
chr3 (19-233)||(16622201-16622415)
chr3 (20-235)||(5607026-5607241)
chr3 (20-235)||(17982661-17982876)
chr3 (20-235)||(51784356-51784571)
chr3 (19-235)||(8214068-8214284)
chr3 (19-235)||(10398477-10398693)
chr3 (20-235)||(5016047-5016262)
chr3 (20-235)||(18227529-18227744)
chr3 (20-235)||(28023615-28023830)
chr3 (19-235)||(19696824-19697039)
chr3 (19-235)||(21677036-21677252)
chr3 (20-235)||(24330496-24330711)
chr3 (72-235)||(36994962-36995125)
[»] scaffold0143 (5 HSPs)
scaffold0143 (19-235)||(29665-29881)
scaffold0143 (112-233)||(18069-18190)
scaffold0143 (112-233)||(18466-18587)
scaffold0143 (19-87)||(18589-18657)
scaffold0143 (19-86)||(17999-18066)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (20-235)||(11943-12158)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (18-235)||(32831-33049)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (20-235)||(10965039-10965254)
chr1 (19-235)||(16205699-16205915)
chr1 (18-233)||(20463352-20463567)
chr1 (20-235)||(51640592-51640807)
chr1 (20-235)||(10947451-10947666)
chr1 (20-235)||(41790979-41791194)
chr1 (20-235)||(28587359-28587574)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (30-235)||(6350-6555)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (20-235)||(6848-7063)
scaffold0159 (20-235)||(21968-22183)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (20-235)||(23860-24075)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (20-235)||(10321-10536)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (19-235)||(8384-8600)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (19-235)||(14954-15169)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (20-235)||(12597-12812)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (21-233)||(8419-8631)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (74-232)||(44511-44678)


Alignment Details
Target: scaffold1697 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 96 - 312
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  96 tggatgagtccttctcaatttctgtctgacgggaggacattcaggcttcgtgggaatccgatgctccacaattttaggatctagacctggcatatcttca 195  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  196 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatattctttttaaccccttcctctagagcaacaccgatcttgatttctcgcttgt 295  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  296 tttcctcggtacctatg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 22932495 - 22932711
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22932495 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 22932594  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22932595 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 22932694  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  22932695 tctcctcggtacctatg 22932711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 23854940 - 23855156
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23854940 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 23855039  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23855040 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 23855139  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  23855140 tctcctcggtacctatg 23855156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 27270198 - 27270414
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  27270198 tggacgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgtggggatccgatgctccacaattctagggtctagacctggcatatcttca 27270297  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27270298 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 27270397  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  27270398 tttcctcggtacctatg 27270414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 27627322 - 27627538
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27627322 tggatgagtccttctcaatttctgcctgccgggaggacattcaggctttgtggggatccgatgctccacaattttaggatctagacctggcatatcctca 27627421  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27627422 tacgaccatgcaaagatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 27627521  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  27627522 tttcctcggtacctatg 27627538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 15421931 - 15422147
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15421931 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 15422030  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15422031 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcctggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 15422130  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  15422131 tctcctcggtacctatg 15422147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24866301 - 24866085
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24866301 tggatgagtccttctcaatttctgcctaacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcttagaatctagacctggcatatcttca 24866202  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24866201 tacgaccatgcaaaaatatccgggtattcccggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 24866102  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  24866101 tctcctcggtacctatg 24866085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 13296562 - 13296778
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13296562 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggattcgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 13296661  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13296662 tacgaccatgcaaaaatattcggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 13296761  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  13296762 tctcctcggtacctatg 13296778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16752406 - 16752190
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16752406 tggatgattcattctcaatttctgcctgacgggaggccattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 16752307  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16752306 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 16752207  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  16752206 tctcctcggtacctatg 16752190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26920962 - 26920746
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26920962 tggatgagtccttctcaatttttgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgttccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 26920863  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26920862 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 26920763  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  26920762 tctcctcggtacctatg 26920746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27046971 - 27046756
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27046971 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 27046872  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27046871 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgtt 27046772  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  27046771 ttcctcggtacctatg 27046756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Original strand, 27287975 - 27288190
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27287975 tggacgagtccttctcaatctctacctgacgggaggacattcaggctttgtggggatccgatgctccacaattttagggtctagacctggcatatcttca 27288074  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27288075 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttagccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 27288174  T
Q  219 tctcctcggtacctat 234  Q
    | ||||||||||||||    
T  27288175 tttcctcggtacctat 27288190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27021721 - 27021505
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27021721 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 27021622  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  27021621 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccagaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagaatagtaccgatcttgatttctcgcttgt 27021522  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  27021521 tctcctcggtacctatg 27021505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3698668 - 3698452
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  3698668 tggatgagtcctcctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 3698569  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3698568 taggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccgatcttgatttctcgcttgt 3698469  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  3698468 tttcctcggtacctatg 3698452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16676725 - 16676509
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  16676725 tggatgagtcctcctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 16676626  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  16676625 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 16676526  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  16676525 tttcctcggtacctatg 16676509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 17090054 - 17090270
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  17090054 tggatgagtccttctcaatttctgcttgacgggagggcattcaggctttgttgggatccgatgttccacaatcttaggatctagtcctggcatatcttca 17090153  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  17090154 tacgaccatgcaaaaatatccgggtattcctggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctaaagtggcaccgaccttgatttctctcttgt 17090253  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  17090254 tctcctcggtacctatg 17090270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4527868 - 4527653
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  4527868 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 4527769  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4527768 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagggtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 4527669  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  4527668 ttcctcggtacctatg 4527653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 4543386 - 4543601
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  4543386 ggatgagtcctcctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 4543485  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4543486 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 4543585  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  4543586 ttcctcggtacctatg 4543601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 4721747 - 4721962
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  4721747 ggatgagtcctcctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 4721846  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4721847 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 4721946  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  4721947 ttcctcggtacctatg 4721962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4760347 - 4760132
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  4760347 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 4760248  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4760247 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccctttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 4760148  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  4760147 ttcctcggtacctatg 4760132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4775464 - 4775249
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  4775464 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctctacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 4775365  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4775364 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 4775265  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  4775264 ttcctcggtacctatg 4775249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27010315 - 27010100
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  27010315 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 27010216  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  27010215 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 27010116  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  27010115 ttcctcggtacctatg 27010100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27487717 - 27487502
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27487717 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 27487618  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27487617 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccctttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 27487518  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  27487517 ttcctcggtacctatg 27487502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28210038 - 28209823
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  28210038 ggatgagtcctcctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 28209939  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28209938 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 28209839  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  28209838 ttcctcggtacctatg 28209823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29575598 - 29575383
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29575598 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctctacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 29575499  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29575498 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 29575399  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  29575398 ttcctcggtacctatg 29575383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 34462117 - 34462333
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  34462117 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttca 34462216  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  34462217 tacgaccatgcgaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcctctttttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 34462316  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  34462317 tttcctcggtacctatg 34462333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 16941639 - 16941854
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  16941639 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacaggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 16941738  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16941739 atgaccatgcgaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 16941838  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  16941839 ttcctcggtacctatg 16941854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 26114024 - 26114239
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  26114024 ggatgagtcctcctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 26114123  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26114124 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 26114223  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     || ||||||||||||    
T  26114224 ttcttcggtacctatg 26114239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29504000 - 29503785
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  29504000 ggatgagtccttctcaatttttgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttcat 29503901  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  29503900 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 29503801  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  29503800 ttcctcggtacctatg 29503785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26991478 - 26991258
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26991478 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgttccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 26991379  T
Q  119 tacgaccatg--caaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatctt--ctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcac 214  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26991378 tacgaccatgacaaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatctttcttttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgc 26991279  T
Q  215 ttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26991278 ttgttctcctcggtacctatg 26991258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 30555628 - 30555843
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  30555628 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 30555727  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30555728 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagtcggatgatcttctgtttaaccccttcttctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 30555827  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  30555828 ttcctcggtacctatg 30555843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20163205 - 20162989
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20163205 tggacgagttcttctcaatttctgcctgacgggaggacattcgggcttggttgggattcgatgttccacgatcttaggatctagacctggcatatcttca 20163106  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || | ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||    
T  20163105 tacgaccatgcaaaaatgtctggatactctcggagaagttgaaagatcttcttcttaaccccttcctctagagtggcaccaaccttgatttctcgcttgt 20163006  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| || |||||||||    
T  20163005 tctcttcagtacctatg 20162989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 22169626 - 22169842
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22169626 tggacgagttcttctcaatttctgcctgacgggaggacattcgggcttggttgggattcgatgttccacgatcttaggatctagacctggcatatcttca 22169725  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || | ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||    
T  22169726 tacgaccatgcaaaaatgtctggatactctcggagaagttgaaagatcttcttcttaaccccttcctctagagtggcaccaaccttgatttctcgcttgt 22169825  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| || |||||||||    
T  22169826 tctcttcagtacctatg 22169842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29552011 - 29551849
Alignment:
Q  74 atccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcatacgaccatgcaaaaatgtccggatattc-ccggaggagctggatgatcttcttt 172  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29552011 atccgatgctccacaatcataggatctagacgcggccaatcttcatacgaccatgcaaacatatccggatattcgccggaggagttggatgatcttcttt 29551912  T
Q  173 ttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29551911 ttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgttctccttggtacctatg 29551849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29552085 - 29552012
Alignment:
Q  137 tccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttc 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29552085 tccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttc 29552012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 29552142 - 29552095
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggctt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  29552142 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctt 29552095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24972501 - 24972285
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24972501 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgtggggatccgatgctccacaattttaggatctagacctggcatatcttca 24972402  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24972401 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatggtcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 24972302  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  24972301 tctcctcggtacctatg 24972285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30937231 - 30937015
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30937231 tggatgagtccttctcaatttctgcttgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 30937132  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30937131 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 30937032  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  30937031 tctcctcggtacctatg 30937015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33780084 - 33779868
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33780084 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggacctagacctggcatatcttca 33779985  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33779984 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 33779885  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  33779884 tctcctcggtacctatg 33779868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 22996682 - 22996898
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  22996682 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagatctggcatatcttca 22996781  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22996782 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttcttgcttgt 22996881  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  22996882 tctcctcggtacctatg 22996898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Original strand, 24685709 - 24685926
Alignment:
Q  18 ttggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  24685709 ttggatgagtccttctcaatttctgcttgacgggaggacattcaggcttggtggggatccaatgctccacaatcttaggatctagacctggcatatcttc 24685808  T
Q  118 atacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttg 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24685809 atacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatctctcgcttg 24685908  T
Q  218 ttctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  24685909 ttctccttggtacctatg 24685926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11551950 - 11551734
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11551950 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 11551851  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||    
T  11551850 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgattttgatctctcgtttgt 11551751  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  11551750 tctcctcggtacctatg 11551734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 15656323 - 15656539
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  15656323 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagccctggcatatcttca 15656422  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15656423 tacgaccatgcaaaaacatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 15656522  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  15656523 tctcctcggtacctatg 15656539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23894801 - 23894585
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23894801 tggatgggtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggttttgtggggatccgatgctccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 23894702  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23894701 tacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggatgatcttccttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 23894602  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  23894601 tctcctcggtacctatg 23894585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30171063 - 30170848
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  30171063 ggatgagtccttctcaatttctgtctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 30170964  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30170963 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 30170864  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  30170863 ttcctcggtacctatg 30170848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33295123 - 33294907
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33295123 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgttccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 33295024  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  33295023 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttataaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatctcttgcttgt 33294924  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  33294923 tctcctcggtacctatg 33294907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6876899 - 6876684
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  6876899 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttcat 6876800  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6876799 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagccggatgatcttctgtttaacccctttctctagagcagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 6876700  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  6876699 ctcctcggtacctatg 6876684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 8663041 - 8663256
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  8663041 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggagggcattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatatgatctagaccgggcatatcttcat 8663140  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8663141 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 8663240  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  8663241 ttcctcggtacctatg 8663256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9320070 - 9319855
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  9320070 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcgggcttggtagggatccggtgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 9319971  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9319970 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccgtaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttcccgcttgtt 9319871  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  9319870 ctcctcggtacctatg 9319855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12134769 - 12134554
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  12134769 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcgggcttggtagggatccggtgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 12134670  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12134669 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccgtaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttcccgcttgtt 12134570  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  12134569 ctcctcggtacctatg 12134554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28651836 - 28651621
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28651836 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcataggatctagacctggcatatcttcat 28651737  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28651736 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttccgtttaaccccttcctctaaagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 28651637  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  28651636 ttcctcggtacctatg 28651621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34619112 - 34618897
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  34619112 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 34619013  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34619012 acgaccatgcaaaaatatccagatattcccggaggagctggacaatcttctttttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 34618913  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  34618912 ctcctcggtacctatg 34618897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22891060 - 22890846
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22891060 tggatgagtccttctcaatttctgcctgatgggaggacattcaggctttgttgggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 22890961  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22890960 tacgaccatgcaaaaatatccaggtattctcggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttgatttctcgcttgt 22890861  T
Q  219 tctcctcggtaccta 233  Q
    |||| ||||||||||    
T  22890860 tctcttcggtaccta 22890846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23628564 - 23628348
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23628564 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 23628465  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||     
T  23628464 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggagaagttggatgatcttctttttaaccccttcctctaaaatagcaccgatcttgatttctcgcttgc 23628365  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  23628364 tctcctcggtacctatg 23628348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41677300 - 41677084
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||| ||||||||||||    
T  41677300 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggcggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtccagacctggcatatcttca 41677201  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41677200 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 41677101  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  41677100 tttcctcggtacctatg 41677084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26482988 - 26482773
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  26482988 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttcat 26482889  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  26482888 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttcccgtttgtt 26482789  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  26482788 ctcctcggtacctatg 26482773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30032022 - 30031807
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  30032022 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 30031923  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30031922 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtggcaccaatcttgatttctcgcttgtt 30031823  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  30031822 ttcctcggtacctatg 30031807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30154625 - 30154410
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  30154625 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 30154526  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  30154525 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 30154426  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  30154425 ttcctcggtacctatg 30154410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31434058 - 31433843
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  31434058 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 31433959  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31433958 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 31433859  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  31433858 ttcctcggtacctatg 31433843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 32593840 - 32594055
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  32593840 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 32593939  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32593940 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 32594039  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  32594040 ttcctcggtacctatg 32594055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43080849 - 43080634
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  43080849 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 43080750  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43080749 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 43080650  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  43080649 ttcctcggtacctatg 43080634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3792135 - 3791921
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  3792135 ggatgagtccttctcaatttctgtctgacgggaagacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 3792036  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  3792035 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 3791936  T
Q  220 ctcctcggtacctat 234  Q
     ||||||||||||||    
T  3791935 ttcctcggtacctat 3791921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 40471116 - 40471330
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  40471116 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttcat 40471215  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40471216 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 40471315  T
Q  220 ctcctcggtacctat 234  Q
     ||||||||||||||    
T  40471316 ttcctcggtacctat 40471330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 18498290 - 18498506
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  18498290 tggatgagtccttctcaatttctgcctgatgggaggacactcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacccggcatatcttca 18498389  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18498390 tatgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccaatcttgatttctcgcttgt 18498489  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  18498490 tctcctcggtacctatg 18498506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 37669051 - 37669267
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  37669051 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccaatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttca 37669150  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  37669151 taggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 37669250  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  37669251 tttcctcggtacctatg 37669267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 13322396 - 13322611
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  13322396 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 13322495  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13322496 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgattttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 13322595  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  13322596 ttcctcggtacctatg 13322611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 37356209 - 37356424
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  37356209 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 37356308  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37356309 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 37356408  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     || ||||||||||||    
T  37356409 ttcttcggtacctatg 37356424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37757577 - 37757362
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  37757577 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 37757478  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37757477 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcccctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 37757378  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  37757377 ttcctcggtacctatg 37757362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5640382 - 5640167
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  5640382 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 5640283  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5640282 aggaccatgcaaaaatatctggatattcccggaggagttggatgatcctctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 5640183  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  5640182 ttcctcggtacctatg 5640167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 18373100 - 18373315
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  18373100 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 18373199  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18373200 aggaccatgcaaaaatatctggatattcccggaggagttggatgatcctctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 18373299  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  18373300 ttcctcggtacctatg 18373315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24684036 - 24683821
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24684036 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacaatcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 24683937  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24683936 atgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctttagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 24683837  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  24683836 ttcctcggtacctatg 24683821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24726563 - 24726348
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24726563 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacaatcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 24726464  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24726463 atgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctttagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 24726364  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  24726363 ttcctcggtacctatg 24726348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 28957351 - 28957566
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28957351 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 28957450  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  28957451 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggacaatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaaccttgatttctcgcttgtt 28957550  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  28957551 ttcctcggtacctatg 28957566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2513653 - 2513441
Alignment:
Q  23 tgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcatacg 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  2513653 tgagtccttctcaatttctgcctgacgggagggcattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcatagg 2513554  T
Q  123 accatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctc 222  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  2513553 accatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttattctc 2513454  T
Q  223 ctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||    
T  2513453 ctcggtacctatg 2513441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33518974 - 33518759
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  33518974 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccggtgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 33518875  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33518874 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagtcggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 33518775  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  33518774 ttcctcggtacctatg 33518759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 37768557 - 37768772
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  37768557 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 37768656  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  37768657 aggaccatgcaaaaatatccggatactcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcccctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 37768756  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  37768757 ttcctcggtacctatg 37768772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 15756418 - 15756633
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  15756418 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 15756517  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  15756518 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttatt 15756617  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  15756618 ttcctcggtacctatg 15756633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 31823973 - 31824188
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  31823973 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 31824072  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  31824073 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttccgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 31824172  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  31824173 ttcctcggtacctatg 31824188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25202870 - 25202714
Alignment:
Q  22 atgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcatac 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25202870 atgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcagactttgtggggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttcatac 25202771  T
Q  122 gaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacc 178  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25202770 gaccatgcaaaaatatccggatactctcggaggagctggataatcttccttttaacc 25202714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25267025 - 25266869
Alignment:
Q  22 atgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcatac 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25267025 atgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcagactttgtggggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttcatac 25266926  T
Q  122 gaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacc 178  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25266925 gaccatgcaaaaatatccggatactctcggaggagctggataatcttccttttaacc 25266869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25201464 - 25201411
Alignment:
Q  182 tcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25201464 tcctctagagcagcaccgaccttgatttctcgcttgttctcttcggtacctatg 25201411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25265619 - 25265566
Alignment:
Q  182 tcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25265619 tcctctagagcagcaccgaccttgatttctcgcttgttctcttcggtacctatg 25265566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2157159 - 2156943
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2157159 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttcgtggggatccgatgctccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 2157060  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2157059 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatctctcgcttgt 2156960  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  2156959 tctcctcggtacctatg 2156943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5130581 - 5130365
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5130581 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 5130482  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5130481 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 5130382  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  5130381 tctcctcggtacctatg 5130365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 16515983 - 16516199
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16515983 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgtggggatccgatgctcgacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 16516082  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16516083 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcggcaccgatcttgatttctcgcttgt 16516182  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  16516183 tctcctcggtacctatg 16516199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 10914422 - 10914638
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10914422 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 10914521  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10914522 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagaagcaccgatcttgatttctcgcttgt 10914621  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  10914622 tctcctcggtacctatg 10914638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 11422332 - 11422548
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  11422332 tggatgagtccttcttaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgttccacaatcataggatctagacctgacatatcttca 11422431  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11422432 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 11422531  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  11422532 tctcctcggtacctatg 11422548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 2107718 - 2107932
Alignment:
Q  21 gatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcata 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2107718 gatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcata 2107817  T
Q  121 cgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||     
T  2107818 cgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatctcttgcttgttt 2107917  T
Q  221 tcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  2107918 tcctcggtacctatg 2107932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4201974 - 4201758
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  4201974 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 4201875  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4201874 tacgaccatgcgaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttcccgcttgt 4201775  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  4201774 tctcctcggtacctatg 4201758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 4142804 - 4143015
Alignment:
Q  24 gagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcatacga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4142804 gagtccttctcaatttctgtctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcatacga 4142903  T
Q  124 ccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctcc 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  4142904 ccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctttagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgttttcc 4143003  T
Q  224 tcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||    
T  4143004 tcggtacctatg 4143015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 26317402 - 26317617
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  26317402 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcgggcttggtagggatccggtgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 26317501  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26317502 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccgtaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttcccgcttgtt 26317601  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  26317602 ctcctcggtacctatg 26317617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26437841 - 26437626
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26437841 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 26437742  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26437741 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 26437642  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  26437641 ctcctcggtacctatg 26437626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 26272639 - 26272855
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26272639 tggatgagtccttctcaatttctgtctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 26272738  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  26272739 tatgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 26272838  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  26272839 tttcctcggtacctatg 26272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 26667468 - 26667683
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  26667468 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 26667567  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26667568 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 26667667  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  26667668 ttcctcggtacctatg 26667683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 237
Target Start/End: Original strand, 26535426 - 26535644
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  26535426 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacatccaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 26535525  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  26535526 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 26535625  T
Q  219 tctcctcggtacctatgct 237  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26535626 tctcctcggtacctatgct 26535644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9621234 - 9621019
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  9621234 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttcat 9621135  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9621134 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcctctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 9621035  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  9621034 ttcctcggtacctatg 9621019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11443471 - 11443256
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  11443471 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 11443372  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11443371 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttagatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 11443272  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  11443271 ttcctcggtacctatg 11443256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 31561944 - 31562159
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  31561944 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctctacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 31562043  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31562044 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 31562143  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  31562144 ttcctcggtacctatg 31562159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45389804 - 45389589
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45389804 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagaccgggcatatcttcat 45389705  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  45389704 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgaccttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 45389605  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  45389604 ttcctcggtacctatg 45389589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 16447559 - 16447775
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16447559 tggatgggtccttctcaatttctgcctgacgagaggacattcaggctttgtggggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 16447658  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16447659 tacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggatgatcttccttttaaccctttcctctagagcagcaccgaccttgatttctcgcttgt 16447758  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  16447759 tctcttcggtacctatg 16447775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 24590088 - 24590303
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  24590088 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 24590187  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24590188 aggaccatgcaaaaatatctggatattcccggaggagttggatgatcctctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 24590287  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  24590288 ttcctcggtacctatg 24590303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26515376 - 26515161
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| | |||||||||||    
T  26515376 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctgacatatcttcat 26515277  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26515276 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccctcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 26515177  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  26515176 ttcctcggtacctatg 26515161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 5144893 - 5145109
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||||||||||    
T  5144893 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagccctggcatatcttca 5144992  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||    
T  5144993 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgt 5145092  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  5145093 tttcctcggtacctatg 5145109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 16734015 - 16734230
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  16734015 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 16734114  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  16734115 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttatt 16734214  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  16734215 ctcctcggtacctatg 16734230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 16749071 - 16749286
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  16749071 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 16749170  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  16749171 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttatt 16749270  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  16749271 ctcctcggtacctatg 16749286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17526118 - 17525903
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  17526118 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 17526019  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  17526018 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttatt 17525919  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  17525918 ctcctcggtacctatg 17525903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 17527096 - 17527311
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  17527096 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 17527195  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  17527196 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttatt 17527295  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  17527296 ctcctcggtacctatg 17527311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16043904 - 16043688
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  16043904 tggatgagtccttcttaatttcttcctgacgggaggacattcaggcttcgtgggaatctgatgttccacaatcttaggatctagacctgacatatcttca 16043805  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  16043804 tacgaccatgcaaaagtatccggatactctcggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttaatttctcgcttgt 16043705  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  16043704 tctcttcggtacctatg 16043688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3447890 - 3447675
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  3447890 ggatgagtccttctcaacttctgcctgacgggagggcattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 3447791  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  3447790 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttatt 3447691  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  3447690 ttcctcggtacctatg 3447675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10844135 - 10844014
Alignment:
Q  112 atcttcatacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10844135 atcttcatacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggaagatcttccttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttgatctct 10844036  T
Q  212 cacttgttctcctcggtaccta 233  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  10844035 cgcttgttctcctcggtaccta 10844014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Original strand, 10843617 - 10843738
Alignment:
Q  112 atcttcatacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  10843617 atcttcatacgaccaagcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggaagatcttccctttaaccccttcctttagagcagcaccgaccttgatctct 10843716  T
Q  212 cacttgttctcctcggtaccta 233  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  10843717 cgcttgttctcctcggtaccta 10843738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Original strand, 10843547 - 10843615
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccac 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  10843547 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgttgggatccgatgttccac 10843615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 16501113 - 16501163
Alignment:
Q  185 tctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16501113 tctagagcggcaccgatcttgatttctcgcttgttctcctcggtacctatg 16501163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10844205 - 10844138
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctcca 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10844205 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacgttcaggctttgttgggatccgatgttcca 10844138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 36342185 - 36342401
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36342185 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 36342284  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36342285 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 36342384  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  36342385 tctcctcggtacctatg 36342401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14667617 - 14667401
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14667617 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcttagaatctagacctggcatatcttca 14667518  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14667517 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 14667418  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  14667417 tctcctcggtacctatg 14667401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5008475 - 5008260
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5008475 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggttgggatccgatgctccacaatcataggatctagaccgggcatatcttcat 5008376  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5008375 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttcccgcttgtt 5008276  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  5008275 ctcctcggtacctatg 5008260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 14760974 - 14761190
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14760974 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 14761073  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14761074 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 14761173  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  14761174 tctcctcggtacctatg 14761190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17015647 - 17015431
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17015647 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 17015548  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17015547 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 17015448  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17015447 tctcctcggtatctatg 17015431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 24590029 - 24590245
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  24590029 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctgacatatcttca 24590128  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24590129 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 24590228  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  24590229 tctcctcggtacctatg 24590245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 34186628 - 34186844
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34186628 tggacgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 34186727  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34186728 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggagaagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 34186827  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  34186828 tctcctcggtacctatg 34186844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6572459 - 6572243
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6572459 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacccggcatatcttca 6572360  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6572359 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 6572260  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  6572259 tttcctcggtacctatg 6572243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15230473 - 15230259
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15230473 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttcgttgggatccgatgttccataatcttaggatctagacctggcatatcttca 15230374  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  15230373 tacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggatgatcttctttttaaccctttcctctagagcagcaccgaccttgatctctcgcttgt 15230274  T
Q  219 tctcctcggtaccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  15230273 tctcctcggtaccta 15230259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39853237 - 39853022
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  39853237 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 39853138  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39853137 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 39853038  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  39853037 ttcctcggtacctatg 39853022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54835991 - 54835776
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  54835991 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatccagacctggcatatcttcat 54835892  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  54835891 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgacttctcgcttgtt 54835792  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  54835791 ttcctcggtacctatg 54835776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1902854 - 1902638
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  1902854 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgtggggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttcg 1902755  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1902754 tacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctttagagcagcaccgaccttgatttctcgcttgt 1902655  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  1902654 tctcttcggtacctatg 1902638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 27160985 - 27161201
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  27160985 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttca 27161084  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  27161085 taggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 27161184  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  27161185 tttcctcggtacctatg 27161201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 18314847 - 18315062
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18314847 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 18314946  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18314947 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccctttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 18315046  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  18315047 ctcctcggtacctatg 18315062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 18798283 - 18798498
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18798283 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 18798382  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18798383 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagggtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 18798482  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  18798483 ctcctcggtacctatg 18798498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30756360 - 30756145
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30756360 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 30756261  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30756260 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 30756161  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  30756160 ttcctcggtacctatg 30756145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 15282596 - 15282810
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15282596 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgttgggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 15282695  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  15282696 tacgaccatgcaaaaatatccgggtattttcggaggagctggaagatcttccttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttgatctctcgcttgt 15282795  T
Q  219 tctcctcggtaccta 233  Q
    |||||||||||||||    
T  15282796 tctcctcggtaccta 15282810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24115263 - 24115047
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24115263 tggatgagtccttctcaatttttgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcgtatcttca 24115164  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24115163 tacgaccatgcaaaaatatctggatattcccggaggagttggatgatcctctttttagccccttcccctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 24115064  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  24115063 tctcctcggtacctatg 24115047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 40103306 - 40103521
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  40103306 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 40103405  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40103406 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttgaatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 40103505  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  40103506 ttcctcggtacctatg 40103521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14101143 - 14100928
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  14101143 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 14101044  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14101043 aggaccatgcaaaaatatctggatattcccggaggagttggatgatcctctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 14100944  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  14100943 ttcctcggtacctatg 14100928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21972301 - 21972086
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  21972301 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 21972202  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  21972201 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 21972102  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  21972101 ttcctcggtacctatg 21972086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 33671469 - 33671684
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  33671469 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggattcgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 33671568  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  33671569 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 33671668  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  33671669 ttcctcggtacctatg 33671684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 31124181 - 31124396
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  31124181 ggatgggtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 31124280  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31124281 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagtcggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 31124380  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  31124381 ttcctcggtacctatg 31124396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 15389046 - 15389246
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  15389046 tggacgagtccttctcaatttctgtctaacgggagggcattcaggctttgtcggtatccgatgttccacaatcttaggatctagacccggcatatcttcg 15389145  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  15389146 tatgaccatgcaaaaatatccggatactctcggagaagttggaagatcttctttttaaccctctcctcaagagcagcaccgaccttgatctctcgcttgt 15389245  T
Q  219 t 219  Q
    |    
T  15389246 t 15389246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 27432098 - 27432314
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27432098 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgagaggacattcaggctttgtggggatccgatgctccacaattttaggatctagacctggcatatcttca 27432197  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27432198 tacgaccatgcaaaaatatccagatattcccggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 27432297  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  27432298 tctcctcggtacctatg 27432314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12658123 - 12657907
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12658123 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 12658024  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12658023 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatctctcgcttgt 12657924  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  12657923 tctcctcggtacctatg 12657907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20840500 - 20840284
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20840500 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 20840401  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20840400 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatctctcgcttgt 20840301  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  20840300 tctcctcggtacctatg 20840284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 23126225 - 23126441
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23126225 tggatgagtccttctcaatttttgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 23126324  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  23126325 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagaatagcaccgatcttgatttctcgcttgt 23126424  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  23126425 tctcctcggtacctatg 23126441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28884794 - 28884578
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28884794 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaaccataggatctagacctggcatattttca 28884695  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  28884694 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagaatagcaccgatcttgatttctcgcttgt 28884595  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  28884594 tctcctcggtacctatg 28884578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 21674833 - 21675048
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  21674833 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggagggcattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcataggatctagaccgggcatatcttcat 21674932  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21674933 aggaccatgcaaaaatatccagatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 21675032  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  21675033 ttcctcggtacctatg 21675048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 37683553 - 37683768
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  37683553 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 37683652  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37683653 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 37683752  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  37683753 ttcctcggtacctatg 37683768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 37698818 - 37699033
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  37698818 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 37698917  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37698918 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 37699017  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  37699018 ttcctcggtacctatg 37699033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 11632841 - 11633057
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  11632841 tggatgagtccttctcaacttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 11632940  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11632941 tacgaccatgcgaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttcccgcttgt 11633040  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  11633041 tctcctcggtacctatg 11633057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 21700827 - 21701043
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21700827 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttcgtgggaatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 21700926  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  21700927 tacgaccatgcaaaaatatccggatactctcggaggagctggatgatcttctttttaacccattcctctagagcagcaccgaccttaatttctcgcttgt 21701026  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  21701027 tctcttcggtacctatg 21701043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37377758 - 37377542
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||    
T  37377758 tggatgagtccttctcaatttctgcccgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctgacatatcttca 37377659  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  37377658 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttcttgcttgc 37377559  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  37377558 tctcctcggtacctatg 37377542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 9347644 - 9347859
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  9347644 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttcat 9347743  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9347744 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 9347843  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  9347844 ttcctcggtacctatg 9347859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 13934205 - 13934420
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  13934205 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttcat 13934304  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13934305 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcctctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 13934404  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  13934405 ctcctcggtacctatg 13934420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27806289 - 27806074
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  27806289 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttcat 27806190  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27806189 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 27806090  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  27806089 ttcctcggtacctatg 27806074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34864270 - 34864055
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  34864270 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 34864171  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  34864170 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 34864071  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  34864070 ttcctcggtacctatg 34864055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37927955 - 37927740
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  37927955 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 37927856  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37927855 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 37927756  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  37927755 ttcctcggtacctatg 37927740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 39049477 - 39049692
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  39049477 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 39049576  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39049577 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 39049676  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  39049677 ttcctcggtacctatg 39049692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 258410 - 258626
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  258410 tggatgagtcctcctcaatttctgcctaacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 258509  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  258510 taggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 258609  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  258610 tttcctcggtacctatg 258626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12589395 - 12589179
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  12589395 tggatgagtcctcctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 12589296  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  12589295 taggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 12589196  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  12589195 tttcctcggtacctatg 12589179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 12714259 - 12714474
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  12714259 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtgggaatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 12714358  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  12714359 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 12714458  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  12714459 ttcctcggtacctatg 12714474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 19414159 - 19414374
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  19414159 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtaggaatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 19414258  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  19414259 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 19414358  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  19414359 ttcctcggtacctatg 19414374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31878872 - 31878657
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  31878872 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 31878773  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31878772 aggaccatgcaaaaatatctggatattcccggaggagttggatgatcctctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 31878673  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  31878672 ttcctcggtacctatg 31878657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32052389 - 32052174
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  32052389 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 32052290  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32052289 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagtcggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 32052190  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  32052189 ttcctcggtacctatg 32052174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 16826996 - 16827211
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  16826996 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 16827095  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  16827096 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagtcggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 16827195  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  16827196 ttcctcggtacctatg 16827211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16894484 - 16894269
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  16894484 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 16894385  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  16894384 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagtcggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 16894285  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  16894284 ttcctcggtacctatg 16894269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39892655 - 39892440
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  39892655 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacaatcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 39892556  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39892555 aggaccatgcaaaaatatctggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccctcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 39892456  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  39892455 ttcctcggtacctatg 39892440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 19454080 - 19454294
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19454080 tggatgagtccttctcaatttctgcttgacgggaggacattcaggctttgttgggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 19454179  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  19454180 tacgaccatgcaaaaatatctgggtattctcggaggagctggaagatcttccttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttgatctctcgcttgt 19454279  T
Q  219 tctcctcggtaccta 233  Q
    ||  |||||||||||    
T  19454280 tcaactcggtaccta 19454294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40236095 - 40235879
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||||||||||    
T  40236095 tggatgagtcctcctcaatttctgcctgacgggaggacatttaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagccctggcatatcttca 40235996  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||    
T  40235995 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttgaatgatcttctttttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgt 40235896  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  40235895 tttcctcggtacctatg 40235879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34288860 - 34288720
Alignment:
Q  95 ggatctagaccgggcatatcttcatacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcag 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34288860 ggatctagacctggcatatcttcatacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagtag 34288761  T
Q  195 caccgatcttgatttctcacttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34288760 caccaatcttgatttctcgcttgttcccctcggtacctatg 34288720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34293920 - 34293780
Alignment:
Q  95 ggatctagaccgggcatatcttcatacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcag 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34293920 ggatctagacctggcatatcttcatacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagtag 34293821  T
Q  195 caccgatcttgatttctcacttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34293820 caccaatcttgatttctcgcttgttcccctcggtacctatg 34293780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27394149 - 27393937
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||     
T  27394149 tggacgagtccttctcaatttctgtctaacgggagggcattcaggctttgtcggtattcgatgttccacaatcttaggatctagacccggcatatcttcg 27394050  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  27394049 tatgaccatgcaaaaatatccggatactctcggagaagttggaagatcttctttttaaccctctcctcaagagcagcaccgaccttgatctctcgcttgt 27393950  T
Q  219 tctcctcggtacc 231  Q
    | || ||||||||    
T  27393949 tttcttcggtacc 27393937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Original strand, 37949153 - 37949195
Alignment:
Q  193 agcaccgatcttgatttctcacttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37949153 agcaccaatcttgatttctcgcttgttctccttggtacctatg 37949195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 44659 - 44875
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44659 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 44758  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44759 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 44858  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  44859 tctcctcggtacctatg 44875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 235
Target Start/End: Original strand, 37861 - 37950
Alignment:
Q  146 tcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  37861 tcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgttctctttggtacctatg 37950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 2655 - 2560
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  2655 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcttaggatctagacctggcatatc 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 37767 - 37862
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  37767 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcttaggatctagacctggcatatc 37862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2529
Alignment:
Q  146 tcccggaggagctggatgatcttctttttaacc 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2561 tcccggaggagttggatgatcttctttttaacc 2529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 2134889 - 2135105
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2134889 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 2134988  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2134989 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 2135088  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  2135089 tctcctcggtacctatg 2135105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 27606534 - 27606750
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27606534 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 27606633  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27606634 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 27606733  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  27606734 tctcctcggtacctatg 27606750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9357212 - 9356996
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9357212 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacccggcatatcttca 9357113  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9357112 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagcagcaccaatcttgatttctcgcttgt 9357013  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  9357012 tctcctcggtacctatg 9356996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14560211 - 14559995
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14560211 tggatgagtccttctcaatttctacctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 14560112  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  14560111 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttcacgcttgt 14560012  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  14560011 tctcctcggtacctatg 14559995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16286030 - 16285814
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16286030 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgtggggatccgatgctccacaatcttagggtctagacctggcatatcttca 16285931  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16285930 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaaccccttactctagagcagcactgatcttgatttctcgcttgt 16285831  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  16285830 tctcctcggtacctatg 16285814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18712071 - 18711855
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18712071 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccataatcataggatctagacctggcatatcttca 18711972  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18711971 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 18711872  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  18711871 tctcctcggtacctatg 18711855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19690685 - 19690469
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19690685 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgtgggtatccgatgctccacaattttaggatctagacctggcatatcctca 19690586  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19690585 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccagaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 19690486  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  19690485 tctcctcggtacctatg 19690469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18793292 - 18793076
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18793292 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 18793193  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  18793192 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagaatagcaccgatcttgatttctcgcttgt 18793093  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  18793092 tctcctcggtacctatg 18793076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16280137 - 16279921
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  16280137 tggatgagtccttctcaatatctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgttccacaatcataggatctagacctggcatatcttcg 16280038  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16280037 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccagaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 16279938  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  16279937 tctcctcggtacctatg 16279921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 19205992 - 19206207
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  19205992 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttcat 19206091  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19206092 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgtt 19206191  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  19206192 ttcctcggtacctatg 19206207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19677033 - 19676818
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  19677033 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 19676934  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19676933 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 19676834  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  19676833 ttcctcggtacctatg 19676818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33261320 - 33261105
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  33261320 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 33261221  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33261220 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 33261121  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  33261120 ttcctcggtacctatg 33261105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 12090353 - 12090568
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  12090353 ggatgagtcctcctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 12090452  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12090453 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 12090552  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  12090553 ttcctcggtacctatg 12090568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 28359582 - 28359797
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  28359582 ggatgagtccttctcaatttctgtctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 28359681  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28359682 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctgtttaaccccatcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 28359781  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  28359782 ttcctcggtacctatg 28359797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29831912 - 29831697
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  29831912 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 29831813  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29831812 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggagaagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 29831713  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  29831712 ttcctcggtacctatg 29831697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 235
Target Start/End: Original strand, 31487506 - 31487717
Alignment:
Q  24 gagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcatacga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  31487506 gagtccttctcaatttctgtctgacggggggacattcgggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcatagga 31487605  T
Q  124 ccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctcc 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  31487606 ccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgaccttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgttttcc 31487705  T
Q  224 tcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||    
T  31487706 tcggtacctatg 31487717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31357114 - 31356899
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  31357114 ggatgagtccttctcaatttttgcttgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 31357015  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  31357014 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgaccttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 31356915  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  31356914 ttcctcggtacctatg 31356899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Original strand, 3327186 - 3327349
Alignment:
Q  72 ggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcatacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctt 171  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  3327186 ggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcataggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctg 3327285  T
Q  172 tttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3327286 tttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgttttcctcggtacctatg 3327349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 22078540 - 22078739
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||     
T  22078540 tggacgagtccttctcaatttctgtctaacgggaggg-attcaggctttgtcggtatccgatgttccacaatcttaggatctagacccgacatatcttcg 22078638  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaa-cctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttg 217  Q
    || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22078639 tatgaccatgcaaaaatatccggatactctcggagaagttggaagatcttctttttaaccctctt-ctcaagagcagcaccgaccttgatctctcgcttg 22078737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 22385289 - 22385505
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22385289 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 22385388  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22385389 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 22385488  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  22385489 tctcctcggtacctatg 22385505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48468476 - 48468260
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48468476 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 48468377  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48468376 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 48468277  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  48468276 tctcctcggtacctatg 48468260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4724180 - 4723964
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4724180 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggagggcattcaggcttggtggggatccgatgttccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 4724081  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4724080 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 4723981  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  4723980 tctcatcggtacctatg 4723964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6204452 - 6204236
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6204452 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 6204353  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6204352 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatctctcgcttgt 6204253  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  6204252 tctcctcggtacctatg 6204236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 8287181 - 8287397
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8287181 tggatgagtccttctcaatttctgcctaacaggaggacattcaggctttgtggggatccgatgctccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 8287280  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8287281 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatctctcgcttgt 8287380  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  8287381 tctcctcggtacctatg 8287397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 15738805 - 15739021
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15738805 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 15738904  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15738905 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagctgcaccgatcttgatttctcgcttgt 15739004  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  15739005 tctcctcggtacctatg 15739021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18053811 - 18053595
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||||    
T  18053811 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcttagaatctaggcctggcatatcttca 18053712  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18053711 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttccttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 18053612  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  18053611 tctcctcggtacctatg 18053595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 18274763 - 18274979
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18274763 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 18274862  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18274863 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 18274962  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  18274963 tctcctcggtacctatg 18274979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 18290064 - 18290280
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18290064 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 18290163  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18290164 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 18290263  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  18290264 tctcctcggtacctatg 18290280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 18305365 - 18305581
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18305365 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 18305464  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18305465 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 18305564  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  18305565 tctcctcggtacctatg 18305581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20068589 - 20068373
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20068589 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcttagaatctagacctggcatatcttca 20068490  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20068489 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 20068390  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  20068389 tctcctcggtacctatg 20068373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 29146467 - 29146683
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29146467 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 29146566  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29146567 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 29146666  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||| ||||    
T  29146667 tctcctcggtacttatg 29146683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32441700 - 32441484
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32441700 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtgggaatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 32441601  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32441600 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaacccattcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 32441501  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  32441500 tctcctcggtacctatg 32441484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8298520 - 8298304
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8298520 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaagcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 8298421  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8298420 tacgaccatgcaaaaatatccggatatttccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 8298321  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  8298320 tctcctcggtacctatg 8298304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 15890416 - 15890632
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15890416 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaagacattcaggctttgtggggatccgatgctctacaatcttaggatctagacccggcatatcttca 15890515  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15890516 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 15890615  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  15890616 tctcctcggtacctatg 15890632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18333186 - 18332970
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18333186 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 18333087  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18333086 tatgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 18332987  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18332986 tctcatcggtacctatg 18332970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 22868559 - 22868775
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  22868559 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 22868658  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22868659 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 22868758  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  22868759 tctcctcggtacctatg 22868775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 22883618 - 22883834
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  22883618 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 22883717  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22883718 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 22883817  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  22883818 tctcctcggtacctatg 22883834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 4794346 - 4794562
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4794346 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 4794445  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  4794446 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatattctttttaaccccttcctctagaatagcaccgatcttgatttctcgcttgt 4794545  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  4794546 tctcctcggtacctatg 4794562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18532932 - 18532716
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18532932 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgttgggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 18532833  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  18532832 tacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggatgatcttccttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttgatctctcgcttgt 18532733  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  18532732 tctcctcggtacctatg 18532716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 28113665 - 28113881
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  28113665 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 28113764  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28113765 tatgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 28113864  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  28113865 tctcctcggtacctatg 28113881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35883315 - 35883099
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35883315 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 35883216  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35883215 tacgaccatgcaaaaatatccggatattctcggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatctctcgcttgt 35883116  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||| ||||||    
T  35883115 tctcctcggtgcctatg 35883099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4419463 - 4419248
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  4419463 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 4419364  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4419363 acgaccatgcgaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttcccgcttgtt 4419264  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  4419263 ctcctcggtacctatg 4419248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7075755 - 7075539
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||| ||||||||||||    
T  7075755 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtccagacctggcatatcttca 7075656  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7075655 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgc 7075556  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  7075555 tctcctcggtacctatg 7075539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 4344388 - 4344603
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  4344388 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 4344487  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4344488 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 4344587  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  4344588 ctcctcggtacctatg 4344603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 11108064 - 11108279
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11108064 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttagtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 11108163  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11108164 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaacctcttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 11108263  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  11108264 ttcctcggtacctatg 11108279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18245289 - 18245074
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  18245289 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 18245190  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18245189 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 18245090  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  18245089 ttcctcggtacctatg 18245074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28341725 - 28341511
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  28341725 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 28341626  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28341625 aggaccatgcgaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttacttttaacctcttcccctagagcagcaccgatcttgatttcccgcttgtt 28341526  T
Q  220 ctcctcggtacctat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  28341525 ctcctcggtacctat 28341511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 6540454 - 6540669
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  6540454 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 6540553  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6540554 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 6540653  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  6540654 ttcctcggtacctatg 6540669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 20574555 - 20574770
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20574555 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 20574654  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20574655 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 20574754  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||| |||||    
T  20574755 ctcctcggtatctatg 20574770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47026001 - 47025786
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  47026001 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 47025902  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47025901 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 47025802  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  47025801 ttcctcggtacctatg 47025786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5469537 - 5469321
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  5469537 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttca 5469438  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  5469437 taggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagggtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 5469338  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  5469337 tttcctcggtacctatg 5469321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 29662681 - 29662897
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29662681 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttca 29662780  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  29662781 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 29662880  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||| ||||||||    
T  29662881 tttcctcgatacctatg 29662897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 5594069 - 5594284
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  5594069 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcgtagggtctagacctggcatatcttcat 5594168  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  5594169 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 5594268  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  5594269 ttcctcggtacctatg 5594284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7999108 - 7998893
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||    
T  7999108 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattccggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctaaacctggcatatcttcat 7999009  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7999008 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 7998909  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  7998908 ttcctcggtacctatg 7998893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10645621 - 10645406
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  10645621 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 10645522  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10645521 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagtcggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 10645422  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  10645421 ttcctcggtacctatg 10645406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 31962167 - 31962382
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  31962167 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 31962266  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  31962267 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgaccttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 31962366  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  31962367 ttcctcggtacctatg 31962382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 16622201 - 16622415
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16622201 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggatattcaggctttgttgggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttca 16622300  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  16622301 tacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggaagatcttccttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttgatctctcgcttgt 16622400  T
Q  219 tctcctcggtaccta 233  Q
    |||| ||||||||||    
T  16622401 tctcttcggtaccta 16622415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 5607026 - 5607241
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  5607026 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 5607125  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  5607126 aggaccatgcgaaaatatccggatattcccggaggagctggatgaccttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 5607225  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  5607226 ttcctcggtacctatg 5607241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 17982661 - 17982876
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  17982661 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 17982760  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17982761 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagtcggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 17982860  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  17982861 ttcctcggtacctatg 17982876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51784571 - 51784356
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  51784571 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtgggaatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 51784472  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  51784471 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 51784372  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  51784371 ttcctcggtacctatg 51784356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8214284 - 8214068
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  8214284 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 8214185  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  8214184 taggaccatgcaaaaatatccggatattcctggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 8214085  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  8214084 tttcctcggtacctatg 8214068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10398693 - 10398477
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| || ||||||||||||    
T  10398693 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagccctggcatatcttca 10398594  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||    
T  10398593 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttccgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgt 10398494  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    | |||||||||||||||    
T  10398493 tttcctcggtacctatg 10398477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5016262 - 5016047
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  5016262 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggacccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 5016163  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5016162 aggaccatgcaaaaatatctggatattcccggaggagttggatgatcctctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 5016063  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  5016062 ttcctcggtacctatg 5016047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18227744 - 18227529
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  18227744 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 18227645  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  18227644 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagtcggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 18227545  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  18227544 ttcctcggtacctatg 18227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28023830 - 28023615
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28023830 ggatgagtccttctcaatctctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcatatcttcat 28023731  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28023730 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggacaatcttctgtttaaccccttcctttagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 28023631  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  28023630 ttcctcggtacctatg 28023615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19697039 - 19696824
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  19697039 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggttttgtggggatccgatgctccacaatcttaggatctagacctgacatatcttca 19696940  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  19696939 tacaaccatgcaaaaatatctggatactctcggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcc-ctagagcagcactgatcttaatttctcgcttgt 19696841  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19696840 tctcttcggtacctatg 19696824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21677252 - 21677036
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||  |||| ||||| || | ||||||||||    
T  21677252 tggatgagtccttctcaatttctgtctgacgggaggacattcaggcttggtgggaatccgatgctccacaatcatagggtctagccctgacatatcttca 21677153  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  21677152 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcctccttttaacccctttctctagggtagcaccaatcttgatttctcgcttgt 21677053  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  21677052 tctcctcggtacctatg 21677036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24330711 - 24330496
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  24330711 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 24330612  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  24330611 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttatt 24330512  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  24330511 ctcctcggtacctatg 24330496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 235
Target Start/End: Original strand, 36994962 - 36995125
Alignment:
Q  72 ggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcatacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctt 171  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  36994962 ggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcataggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctg 36995061  T
Q  172 tttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctcctcggtacctatg 235  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36995062 tttgaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgttctcctcggtacctatg 36995125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 5)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29881 - 29665
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  29881 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttca 29782  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29781 tacgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 29682  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  29681 tctcctcggtacctatg 29665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Original strand, 18069 - 18190
Alignment:
Q  112 atcttcatacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18069 atcttcatacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggaagatcttccttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttgatctct 18168  T
Q  212 cacttgttctcctcggtaccta 233  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  18169 cgcttgttctcctcggtaccta 18190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18587 - 18466
Alignment:
Q  112 atcttcatacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttct 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18587 atcttcatacgaccaagcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggaagatcttccttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttgatctct 18488  T
Q  212 cacttgttctcctcggtaccta 233  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  18487 cgcttgttctcctcggtaccta 18466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18657 - 18589
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccac 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18657 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgttgggatccgatgttccac 18589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 17999 - 18066
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctcca 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17999 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacgttcaggctttgttgggatccgatgttcca 18066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12158 - 11943
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  12158 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 12059  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12058 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccgatcttgatttctcgcttgtt 11959  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    || |||||||||||||    
T  11958 cttctcggtacctatg 11943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33049 - 32831
Alignment:
Q  18 ttggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  33049 ttggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggagaacattcaggcttcgtggggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttc 32950  T
Q  118 atacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctc-actt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  32949 atacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggatgatcttctttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttgatttctcgcctt 32850  T
Q  217 gttctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32849 gttctcctcggtacctatg 32831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10965254 - 10965039
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  10965254 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 10965155  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10965154 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagcagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 10965055  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  10965054 ttcctcggtacctatg 10965039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 16205699 - 16205915
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||     
T  16205699 tggatgagtccttctcaatttctgcctgacgagaggacattcaggcttcgtggggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctgacatatcttcg 16205798  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16205799 tacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggatgatcttctttttagccccttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 16205898  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||| ||||||||||||    
T  16205899 tctcttcggtacctatg 16205915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20463567 - 20463352
Alignment:
Q  18 ttggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  20463567 ttggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggctttgttgggatccgatgttccacaatcttaggatctagacctggcatatcttc 20463468  T
Q  118 atacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttg 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  20463467 atacgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggatgatcttccttttaaccccttcctctagagcagcatcgaccttgatctctcgcttg 20463368  T
Q  218 ttctcctcggtaccta 233  Q
    ||||| ||||||||||    
T  20463367 ttctcttcggtaccta 20463352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51640807 - 51640592
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  51640807 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 51640708  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51640707 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 51640608  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  51640607 ttcctcggtacctatg 51640592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10947666 - 10947451
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||    
T  10947666 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctaaacctggcatatcttcat 10947567  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10947566 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 10947467  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  10947466 ttcctcggtacctatg 10947451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 41790979 - 41791194
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  41790979 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggagggcattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 41791078  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  41791079 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttatt 41791178  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  41791179 ctcctcggtacctatg 41791194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28587574 - 28587359
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  28587574 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 28587475  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  28587474 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggataatcttctgcttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttatt 28587375  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  28587374 ctcctcggtacctatg 28587359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 6350 - 6555
Alignment:
Q  30 ttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcatacgaccatgc 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6350 ttctcaatttctgtctgacaggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgatcttaggatctagaccgggcatatcctcgtacgaccatgc 6449  T
Q  130 aaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttctcctcggta 229  Q
    |||||| || |  || || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  6450 aaaaatatctgtgtactctcggaggagctggatgatctttactttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgtcctccttggta 6549  T
Q  230 cctatg 235  Q
    ||||||    
T  6550 cctatg 6555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 6848 - 7063
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  6848 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 6947  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6948 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgaccttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 7047  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  7048 ttcctcggtacctatg 7063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22183 - 21968
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  22183 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacaatcatagggtctagacctggcatatcttcat 22084  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22083 acgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgaccttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 21984  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  21983 ttcctcggtacctatg 21968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 23860 - 24075
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  23860 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 23959  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||    
T  23960 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagctggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttcttgcttgtt 24059  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  24060 ttcctcggtacctatg 24075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10536 - 10321
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  10536 ggatgagtcctcctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 10437  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10436 aggaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagttggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 10337  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  10336 ttcctcggtacctatg 10321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8600 - 8384
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  8600 tggatgagtccttctcaatttctgcctgatgggaggacactcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcatagggtctagacccggcatatcttca 8501  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8500 tatgaccatgcaaaaatatccggatattcccggaggagtcggatgatcttctgtttaaccccttcctctagagcagcaccaatcttgatttctcgcttgt 8401  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  8400 tctcctcggtacctatg 8384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15169 - 14954
Alignment:
Q  19 tggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttca 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15169 tggatgagtccttctcaatttttgcctgacgggaggacattcaggcttggtggggatccgatgctccacaatcataggatctagacctggcgtatcttca 15070  T
Q  119 tacgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgt 218  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15069 tacgaccatgcaaaaatatctggatattcccggaggagttggatgatcctc-ttttaaccccttcccctagagcagcaccgatcttgatttctcgcttgt 14971  T
Q  219 tctcctcggtacctatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  14970 tctcctcggtacctatg 14954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 235
Target Start/End: Original strand, 12597 - 12812
Alignment:
Q  20 ggatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  12597 ggatgagtccttctcaatttctgcctgacgggaggacattcaggcttggtagggatccgatgctccacgatcatagggtctagacctggcatatcttcat 12696  T
Q  120 acgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgtt 219  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12697 aggaccatgcaaaaatatctggatattcccggaggagttggatgatcctctgtttaaccccttcctctagagtagcaccaatcttgatttctcgcttgtt 12796  T
Q  220 ctcctcggtacctatg 235  Q
     |||||||||||||||    
T  12797 ttcctcggtacctatg 12812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8631 - 8419
Alignment:
Q  21 gatgagtccttctcaatttctgtctgaccggagggcattcgggcttcgttgggatccgatgctccacgattttaggatctagaccgggcatatcttcata 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| || || || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8631 gatgagtccttctcaatttctgcttgacgggagggtattcagggtttgtggggatccgatgttccacaatcataggatctagacctggcatatcttcata 8532  T
Q  121 cgaccatgcaaaaatgtccggatattcccggaggagctggatgatcttctttttaacctcttcctctagagcagcaccgatcttgatttctcacttgttc 220  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8531 cgaccatgcaaaaatatccgggtattctcggaggagctggatgatcttccttttaaccccttcctctagagcagcaccgaccttgatttctcgcttgttc 8432  T
Q  221 tcctcggtaccta 233  Q
     ||||||||||||    
T  8431 acctcggtaccta 8419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 232
Target Start/End: Original strand, 44511 - 44678
Alignment:
Q  74 atccgatgctccacga-ttttagg-atctagaccgggcatatcttcatacgaccatgcaaaaa-tgtccggatattccc-ggaggagctgga--tgatct 167  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||   | |||    
T  44511 atccgatgctccactaattttaggtatctagacctggcatatcttcatacgaccatgcaaaaattatccggatattcccgggaggagctggagtgggtct 44610  T
Q  168 tctttttaacctctt-cctctagagcagcaccgatcttgatttc-tcacttgttc-tcctcggtacct 232  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  44611 tctttttaaccccttccctctagagcagcaccgatcttgatttcttcgcttgttcgtcctcggtacct 44678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University