View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4267_low_56 (Length: 300)

Name: NF4267_low_56
Description: NF4267
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4267_low_56
NF4267_low_56
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (1-145)||(19774379-19774523)
chr3 (1-145)||(16751641-16751800)
chr3 (3-143)||(30064798-30064955)
chr3 (1-117)||(27411077-27411193)
chr3 (1-117)||(17318136-17318254)
chr3 (1-143)||(7108647-7108805)
chr3 (1-143)||(7112582-7112740)
chr3 (1-143)||(22320615-22320773)
chr3 (1-143)||(22335670-22335828)
chr3 (1-143)||(28948793-28948951)
chr3 (1-143)||(4108239-4108397)
chr3 (1-143)||(4112091-4112249)
chr3 (1-143)||(11069099-11069257)
chr3 (1-143)||(11166528-11166686)
chr3 (1-143)||(14498356-14498514)
chr3 (1-143)||(15616586-15616744)
chr3 (1-143)||(55021936-55022094)
chr3 (1-103)||(15963942-15964045)
chr3 (1-103)||(15971790-15971893)
chr3 (10-103)||(15967866-15967961)
chr3 (13-103)||(14159826-14159918)
chr3 (27-87)||(14067598-14067658)
chr3 (93-143)||(15963857-15963907)
chr3 (93-143)||(15967781-15967831)
chr3 (93-143)||(15971705-15971755)
chr3 (28-89)||(31097889-31097950)
chr3 (28-89)||(7574705-7574766)
chr3 (28-89)||(1983181-1983242)
chr3 (28-89)||(7793697-7793757)
chr3 (28-89)||(15482372-15482433)
chr3 (26-89)||(2898173-2898236)
chr3 (1-35)||(8490072-8490106)
chr3 (1-35)||(8490179-8490213)
chr3 (1-35)||(11301310-11301344)
chr3 (1-35)||(14664796-14664830)
chr3 (1-35)||(14667960-14667994)
chr3 (1-35)||(37440537-37440571)
chr3 (28-89)||(327512-327572)
chr3 (1-34)||(11853917-11853950)
chr3 (28-89)||(20461847-20461907)
chr3 (28-113)||(322235-322322)
chr3 (32-92)||(3833380-3833439)
chr3 (95-134)||(855751-855790)
chr3 (95-134)||(16369070-16369109)
chr3 (99-134)||(16909543-16909578)
chr3 (28-112)||(19726289-19726375)
chr3 (1-35)||(5220149-5220183)
chr3 (28-81)||(3403327-3403380)
chr3 (28-89)||(11557756-11557817)
chr3 (262-291)||(16751916-16751945)
chr3 (262-290)||(3802006-3802034)
chr3 (262-290)||(9532294-9532322)
chr3 (262-290)||(10834956-10834984)
chr3 (262-290)||(11912463-11912491)
chr3 (262-290)||(12304210-12304238)
chr3 (262-290)||(12853378-12853406)
chr3 (262-290)||(14670062-14670090)
chr3 (262-290)||(14764810-14764838)
chr3 (262-290)||(16795539-16795567)
chr3 (262-290)||(18899489-18899517)
chr3 (262-290)||(20249864-20249892)
chr3 (262-290)||(29545953-29545981)
chr3 (32-92)||(38814090-38814149)
chr3 (262-290)||(54519633-54519661)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (1-145)||(31479216-31479360)
chr6 (1-117)||(16623013-16623129)
chr6 (1-143)||(11565810-11565968)
chr6 (1-143)||(12619842-12620000)
chr6 (1-117)||(16759226-16759343)
chr6 (1-117)||(23394057-23394174)
chr6 (1-143)||(23988908-23989066)
chr6 (1-103)||(19869632-19869735)
chr6 (1-103)||(22948120-22948223)
chr6 (1-103)||(22952076-22952179)
chr6 (1-103)||(23413979-23414082)
chr6 (1-103)||(23870564-23870667)
chr6 (1-103)||(23874520-23874623)
chr6 (1-84)||(14471317-14471400)
chr6 (1-143)||(8242822-8242980)
chr6 (93-143)||(19869547-19869597)
chr6 (93-143)||(23394001-23394051)
chr6 (93-143)||(23413909-23413959)
chr6 (93-143)||(16759185-16759235)
chr6 (93-145)||(16622970-16623022)
chr6 (90-143)||(22948065-22948118)
chr6 (90-143)||(22952021-22952074)
chr6 (90-143)||(23870509-23870562)
chr6 (90-143)||(23874465-23874518)
chr6 (28-112)||(27567981-27568068)
chr6 (28-112)||(16523770-16523856)
chr6 (31-89)||(19298105-19298162)
chr6 (1-35)||(22075030-22075064)
chr6 (95-134)||(21740434-21740473)
chr6 (31-89)||(12706398-12706455)
chr6 (31-89)||(16740916-16740974)
chr6 (57-112)||(20908362-20908419)
chr6 (28-89)||(17803896-17803956)
chr6 (1-30)||(23400974-23401003)
chr6 (28-89)||(27553942-27554003)
chr6 (262-290)||(1254195-1254223)
chr6 (262-290)||(12941257-12941285)
chr6 (262-290)||(23400714-23400742)
chr6 (262-290)||(23538017-23538045)
chr6 (262-290)||(27222868-27222896)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (1-145)||(10751998-10752142)
chr5 (1-143)||(18355222-18355381)
chr5 (1-117)||(40724535-40724653)
chr5 (1-143)||(20294849-20295007)
chr5 (1-143)||(19473684-19473842)
chr5 (29-103)||(11219969-11220045)
chr5 (29-103)||(11224555-11224631)
chr5 (29-103)||(11228378-11228454)
chr5 (29-103)||(11230367-11230443)
chr5 (93-131)||(40724644-40724682)
chr5 (1-41)||(20911869-20911909)
chr5 (28-83)||(24221568-24221623)
chr5 (1-35)||(15237941-15237975)
chr5 (28-89)||(17919525-17919587)
chr5 (28-89)||(17410179-17410239)
chr5 (83-143)||(11226481-11226540)
chr5 (28-117)||(23439635-23439726)
chr5 (28-117)||(23451002-23451093)
chr5 (28-117)||(23458246-23458337)
chr5 (28-117)||(23462507-23462598)
chr5 (32-92)||(33408934-33408993)
chr5 (28-112)||(21367052-21367138)
chr5 (96-134)||(18770395-18770433)
chr5 (31-89)||(18773913-18773970)
chr5 (31-89)||(18783756-18783813)
chr5 (31-89)||(23535904-23535962)
chr5 (39-89)||(26743092-26743141)
chr5 (262-291)||(9774975-9775004)
chr5 (262-291)||(10751852-10751881)
chr5 (262-291)||(15238132-15238161)
chr5 (262-291)||(22108464-22108493)
chr5 (262-290)||(19510498-19510526)
chr5 (262-290)||(22120606-22120634)
chr5 (262-290)||(22339048-22339076)
chr5 (262-290)||(23113417-23113445)
chr5 (262-290)||(28372096-28372124)
chr5 (262-290)||(37600023-37600051)
chr5 (262-290)||(38146433-38146461)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (10-143)||(52634757-52634892)
chr1 (1-117)||(39244952-39245068)
chr1 (1-117)||(39248507-39248623)
chr1 (1-145)||(41389400-41389559)
chr1 (1-143)||(1009671-1009829)
chr1 (1-143)||(1926153-1926311)
chr1 (1-143)||(20925167-20925325)
chr1 (1-143)||(16376404-16376562)
chr1 (8-102)||(33796577-33796673)
chr1 (93-143)||(33796491-33796541)
chr1 (28-89)||(3705436-3705497)
chr1 (28-89)||(36819644-36819705)
chr1 (95-134)||(22831790-22831829)
chr1 (28-89)||(18394334-18394395)
chr1 (28-89)||(21172711-21172771)
chr1 (28-89)||(21312827-21312887)
chr1 (28-112)||(18182512-18182598)
chr1 (57-92)||(46975196-46975231)
chr1 (262-291)||(39245185-39245214)
chr1 (262-291)||(39248740-39248769)
chr1 (262-291)||(41389679-41389708)
chr1 (95-132)||(42865679-42865716)
chr1 (262-290)||(16370961-16370989)
chr1 (262-290)||(22132113-22132141)
chr1 (113-145)||(39245079-39245111)
chr1 (113-145)||(39248634-39248666)
chr1 (262-290)||(41801293-41801321)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (1-143)||(11465-11608)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (1-145)||(18424416-18424576)
chr7 (1-143)||(32057-32215)
chr7 (1-143)||(12705667-12705825)
chr7 (1-143)||(12713872-12714030)
chr7 (1-143)||(18278391-18278549)
chr7 (1-143)||(18282354-18282512)
chr7 (1-103)||(71807-71910)
chr7 (1-103)||(75916-76019)
chr7 (1-143)||(12717696-12717854)
chr7 (1-143)||(12722607-12722765)
chr7 (1-92)||(45171031-45171121)
chr7 (93-143)||(45171169-45171219)
chr7 (93-143)||(71930-71980)
chr7 (93-143)||(76039-76089)
chr7 (28-109)||(2759785-2759868)
chr7 (28-89)||(12317834-12317895)
chr7 (28-87)||(15605609-15605668)
chr7 (29-89)||(9446531-9446591)
chr7 (99-134)||(9752124-9752159)
chr7 (28-112)||(14429528-14429614)
chr7 (1-35)||(2833126-2833160)
chr7 (31-89)||(9593056-9593113)
chr7 (1-35)||(15083414-15083448)
chr7 (1-35)||(39721384-39721418)
chr7 (93-134)||(16582849-16582890)
chr7 (28-89)||(42203681-42203742)
chr7 (32-92)||(13148861-13148920)
chr7 (83-132)||(32216941-32216992)
chr7 (93-132)||(9702936-9702975)
chr7 (95-134)||(17138527-17138566)
chr7 (1-35)||(2531009-2531043)
chr7 (32-89)||(13635803-13635860)
chr7 (28-89)||(14152340-14152400)
chr7 (262-291)||(18424270-18424299)
chr7 (262-291)||(23666467-23666496)
chr7 (262-290)||(146536-146564)
chr7 (262-290)||(838148-838176)
chr7 (262-290)||(1203328-1203356)
chr7 (262-290)||(7520230-7520258)
chr7 (262-290)||(10607335-10607363)
chr7 (262-290)||(11660318-11660346)
chr7 (262-290)||(13891666-13891694)
chr7 (262-290)||(13892049-13892077)
chr7 (262-290)||(14420823-14420851)
chr7 (262-290)||(16005040-16005068)
chr7 (262-290)||(16109990-16110018)
chr7 (262-290)||(18606374-18606402)
chr7 (262-290)||(18871333-18871361)
chr7 (262-290)||(20486778-20486806)
chr7 (262-290)||(39268328-39268356)
chr7 (262-290)||(39721232-39721260)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (1-145)||(15223727-15223887)
chr4 (1-143)||(9555478-9555636)
chr4 (1-143)||(14758426-14758584)
chr4 (1-143)||(14955191-14955349)
chr4 (1-143)||(33741248-33741406)
chr4 (1-143)||(4562285-4562443)
chr4 (1-143)||(5757810-5757968)
chr4 (1-103)||(12486688-12486791)
chr4 (1-103)||(25688906-25689009)
chr4 (93-143)||(12486603-12486653)
chr4 (28-112)||(15353677-15353764)
chr4 (90-143)||(25688851-25688904)
chr4 (93-132)||(13813698-13813737)
chr4 (93-139)||(13818210-13818256)
chr4 (31-89)||(1952099-1952156)
chr4 (1-35)||(10712013-10712047)
chr4 (1-35)||(10925783-10925817)
chr4 (1-35)||(20158231-20158265)
chr4 (1-35)||(20160907-20160941)
chr4 (1-35)||(20163685-20163719)
chr4 (28-89)||(11250930-11250991)
chr4 (99-132)||(22634750-22634783)
chr4 (28-89)||(36134286-36134346)
chr4 (93-132)||(13569175-13569214)
chr4 (93-134)||(15125505-15125546)
chr4 (262-291)||(15223581-15223610)
chr4 (28-89)||(18603067-18603127)
chr4 (99-140)||(23996574-23996615)
chr4 (262-290)||(631762-631790)
chr4 (32-92)||(2014485-2014544)
chr4 (262-290)||(13813847-13813875)
chr4 (262-290)||(13818335-13818363)
chr4 (262-290)||(15533255-15533283)
chr4 (32-92)||(16243740-16243799)
chr4 (262-290)||(17052460-17052488)
chr4 (262-290)||(18211640-18211668)
chr4 (262-290)||(22634941-22634969)
chr4 (262-290)||(23996981-23997009)
chr4 (262-290)||(24048399-24048427)
chr4 (262-290)||(30145819-30145847)
chr4 (262-290)||(36036988-36037016)
chr4 (262-290)||(49549097-49549125)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (1-143)||(4858-5016)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-143)||(21977632-21977790)
chr8 (1-143)||(21973541-21973699)
chr8 (1-143)||(22110999-22111157)
chr8 (1-143)||(43250759-43250917)
chr8 (1-103)||(21828976-21829079)
chr8 (1-103)||(30941110-30941213)
chr8 (1-103)||(18863635-18863738)
chr8 (93-143)||(18863773-18863823)
chr8 (95-143)||(30941235-30941283)
chr8 (93-143)||(21829099-21829149)
chr8 (28-110)||(20856811-20856894)
chr8 (1-35)||(14398803-14398837)
chr8 (31-89)||(16231813-16231870)
chr8 (1-35)||(21386517-21386551)
chr8 (1-35)||(21410089-21410123)
chr8 (1-35)||(21804581-21804615)
chr8 (31-89)||(22044594-22044651)
chr8 (32-92)||(23847355-23847414)
chr8 (99-134)||(19259961-19259996)
chr8 (95-134)||(20466450-20466489)
chr8 (1-35)||(21386409-21386443)
chr8 (31-89)||(23833882-23833939)
chr8 (57-112)||(39095324-39095381)
chr8 (93-133)||(21169189-21169229)
chr8 (262-290)||(21328602-21328630)
chr8 (262-290)||(27942700-27942728)
chr8 (262-290)||(44385848-44385876)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (1-143)||(10102808-10102966)
chr2 (1-143)||(24629479-24629637)
chr2 (1-143)||(24648303-24648461)
chr2 (1-143)||(27380352-27380510)
chr2 (1-143)||(27384398-27384556)
chr2 (1-143)||(30346015-30346173)
chr2 (1-143)||(27600780-27600938)
chr2 (1-103)||(41531973-41532076)
chr2 (1-103)||(1282454-1282557)
chr2 (93-143)||(1282384-1282434)
chr2 (93-143)||(41532111-41532161)
chr2 (28-89)||(24174485-24174546)
chr2 (28-112)||(37524328-37524414)
chr2 (31-93)||(19928841-19928902)
chr2 (28-89)||(25961903-25961965)
chr2 (1-35)||(31344281-31344315)
chr2 (28-89)||(19691982-19692042)
chr2 (93-134)||(40622674-40622715)
chr2 (29-89)||(24735102-24735161)
chr2 (28-89)||(24655708-24655770)
chr2 (262-290)||(6481820-6481848)
chr2 (262-290)||(6485287-6485315)
chr2 (262-290)||(9240710-9240738)
chr2 (262-290)||(19663572-19663600)
chr2 (262-290)||(20260293-20260321)
chr2 (262-290)||(21074522-21074550)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (1-143)||(6019-6177)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-143)||(68180-68338)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (1-103)||(33686-33789)
scaffold0157 (93-143)||(33824-33874)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-103)||(15120-15223)
scaffold0141 (93-143)||(15243-15293)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-103)||(79576-79679)
scaffold0029 (8-41)||(62675-62708)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (28-112)||(1451-1537)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (28-112)||(414419-414506)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (32-112)||(7135-7217)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (28-89)||(18897-18958)
scaffold0044 (28-83)||(12619-12674)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (28-89)||(195296-195357)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (28-89)||(173003-173064)
scaffold0001 (57-112)||(422920-422978)
scaffold0001 (93-132)||(204498-204537)
scaffold0001 (57-89)||(178706-178738)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (28-89)||(20347-20408)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (28-89)||(228705-228766)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (28-112)||(10666-10752)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (1-35)||(541-575)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (1-35)||(8946-8980)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-35)||(11998-12032)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (102-139)||(848-885)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (28-89)||(18968-19029)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (28-89)||(4572-4633)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (93-134)||(32059-32100)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (28-89)||(66762-66822)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (28-89)||(53264-53324)
scaffold0031 (262-290)||(37217-37245)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (32-92)||(9127-9186)
[»] scaffold0013 (3 HSPs)
scaffold0013 (36-84)||(3014-3062)
scaffold0013 (31-89)||(81563-81620)
scaffold0013 (262-290)||(74346-74374)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (99-134)||(1793-1828)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (28-112)||(7524-7610)
[»] scaffold0210 (4 HSPs)
scaffold0210 (95-134)||(22303-22342)
scaffold0210 (95-134)||(30195-30234)
scaffold0210 (95-127)||(22271-22303)
scaffold0210 (95-127)||(30163-30195)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (93-132)||(23298-23337)
scaffold0081 (93-132)||(38722-38761)
scaffold0081 (93-122)||(14287-14316)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (95-134)||(19114-19153)
scaffold0080 (95-134)||(55850-55889)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (28-107)||(8213-8294)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (28-89)||(7653-7715)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (57-112)||(15610-15667)
scaffold0017 (57-112)||(20132-20189)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (31-89)||(22926-22983)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (28-127)||(34223-34327)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (93-122)||(8279-8308)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (30-112)||(17507-17591)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (95-132)||(69409-69446)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (262-290)||(236-264)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (262-290)||(5278-5306)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (262-290)||(4157-4185)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (262-290)||(6975-7003)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (28-112)||(1831-1917)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (262-290)||(10836-10864)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (262-290)||(21354-21382)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (262-290)||(25582-25610)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (28-117)||(5203-5294)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (262-290)||(109637-109665)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (262-290)||(224157-224185)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19774523 - 19774379
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19774523 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattttttatcaaagatgctattgtttaag 19774424  T
Q  101 atgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774423 atgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 19774379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 16751641 - 16751800
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat-------- 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  16751641 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 16751740  T
Q  93 -------tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 145  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751741 atgactatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 16751800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30064955 - 30064798
Alignment:
Q  3 gattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc------------- 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  30064955 gattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaag 30064856  T
Q  90 ----tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30064855 atgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 30064798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 27411077 - 27411193
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27411077 atgataaattattattaagtaaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgttattgtttaag 27411176  T
Q  101 atgtttatgttgaagat 117  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  27411177 atgattatgtttaagat 27411193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 17318136 - 17318254
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17318136 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaaagttgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatgatgttta 17318235  T
Q  99 agatgtttatgttgaagat 117  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  17318236 agatgattatgtttaagat 17318254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7108805 - 7108647
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  7108805 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 7108707  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7108706 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 7108647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 7112740 - 7112582
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  7112740 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 7112642  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7112641 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 7112582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22320773 - 22320615
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  22320773 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 22320675  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22320674 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 22320615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22335828 - 22335670
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  22335828 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 22335730  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22335729 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 22335670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28948951 - 28948793
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  28948951 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 28948853  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28948852 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 28948793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 4108239 - 4108397
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  4108239 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 4108337  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4108338 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgactttggtgttagta 4108397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 4112091 - 4112249
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  4112091 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 4112189  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4112190 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgactttggtgttagta 4112249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11069257 - 11069099
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  11069257 atgattaat-attattaaatgaatattatattatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 11069159  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11069158 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 11069099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 11166528 - 11166686
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  11166528 atgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 11166626  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11166627 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 11166686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 14498514 - 14498356
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  14498514 atgattaat-attgttaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatattta 14498416  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14498415 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 14498356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15616744 - 15616586
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  15616744 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 15616646  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15616645 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttaattttggtgttagta 15616586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 55022094 - 55021936
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  55022094 atgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 55021996  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55021995 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 55021936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15964045 - 15963942
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15964045 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 15963947  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  15963946 agatg 15963942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15971893 - 15971790
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15971893 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 15971795  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  15971794 agatg 15971790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15967961 - 15967866
Alignment:
Q  10 tattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15967961 tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatg 15967866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 14159826 - 14159918
Alignment:
Q  13 tattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14159826 tattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatg 14159918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Original strand, 14067598 - 14067658
Alignment:
Q  27 tatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagat 87  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14067598 tatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagat 14067658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15963907 - 15963857
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15963907 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 15963857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15967831 - 15967781
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15967831 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 15967781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15971755 - 15971705
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15971755 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 15971705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 31097889 - 31097950
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097889 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 31097950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 7574766 - 7574705
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7574766 atgttatgttattgatgatgattgaaagctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 7574705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 1983181 - 1983242
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1983181 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattatttatcaaagatgc 1983242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 7793697 - 7793757
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7793697 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 7793757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15482433 - 15482372
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15482433 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 15482372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 89
Target Start/End: Original strand, 2898173 - 2898236
Alignment:
Q  26 ttatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2898173 ttatgttatgttattggtgatggttgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 2898236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 8490072 - 8490106
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490072 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 8490106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 8490179 - 8490213
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490179 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 8490213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 11301310 - 11301344
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11301310 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 11301344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 14664830 - 14664796
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14664830 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 14664796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 14667994 - 14667960
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14667994 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 14667960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 37440537 - 37440571
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440537 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 37440571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 327512 - 327572
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  327512 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 327572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 11853950 - 11853917
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttat 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11853950 atgattaattattattaagtgaatattatgttat 11853917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 20461847 - 20461907
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20461847 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 20461907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 322322 - 322235
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttga 113  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  |||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  322322 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgacatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgttga 322235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3833439 - 3833380
Alignment:
Q  32 tatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 92  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3833439 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctat 3833380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 855790 - 855751
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  855790 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 855751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16369109 - 16369070
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16369109 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 16369070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16909578 - 16909543
Alignment:
Q  99 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16909578 agatgtttatgttgaagatttatgatgttaattatg 16909543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 19726289 - 19726375
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19726289 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgttg 19726375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 5220183 - 5220149
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5220183 atgattaattattattaagagaatattatgttatg 5220149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Original strand, 3403327 - 3403380
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatc 81  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  3403327 atgttttgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatc 3403380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 11557756 - 11557817
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  11557756 atgttatgttattgatgatgattgaatgaagtgattacttgataactgtttaacaaagatgc 11557817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Original strand, 16751916 - 16751945
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751916 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 16751945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3802034 - 3802006
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802034 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 3802006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9532322 - 9532294
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9532322 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 9532294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 10834956 - 10834984
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834956 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 10834984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11912491 - 11912463
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11912491 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 11912463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12304238 - 12304210
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304238 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 12304210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 12853378 - 12853406
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12853378 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 12853406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14670090 - 14670062
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670090 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 14670062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 14764810 - 14764838
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764810 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 14764838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16795567 - 16795539
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16795567 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16795539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18899517 - 18899489
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18899517 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18899489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 20249864 - 20249892
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249864 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 20249892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 29545953 - 29545981
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545953 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 29545981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 38814149 - 38814090
Alignment:
Q  32 tatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 92  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38814149 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattggttatcaaagatgctat 38814090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 54519661 - 54519633
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54519661 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 54519633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 31479216 - 31479360
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31479216 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 31479315  T
Q  101 atgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 145  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31479316 atgattatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 31479360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16623129 - 16623013
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623129 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 16623030  T
Q  101 atgtttatgttgaagat 117  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  16623029 atgattatgtttaagat 16623013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11565968 - 11565810
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  11565968 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 11565870  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11565869 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 11565810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 12619842 - 12620000
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  12619842 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 12619940  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12619941 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 12620000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16759343 - 16759226
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16759343 atgattaat-attattaagtaaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 16759245  T
Q  99 agatgtttatgttgaagat 117  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  16759244 agatgattatgtttaagat 16759226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23394174 - 23394057
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23394174 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 23394076  T
Q  99 agatgtttatgttgaagat 117  Q
    ||||| | ||||| |||||    
T  23394075 agatgataatgtttaagat 23394057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23989066 - 23988908
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  23989066 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 23988968  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23988967 agatgatattgtttaagatgtttatgtttaagatttatgatgttgattttggtgttagta 23988908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19869735 - 19869632
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19869735 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 19869637  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  19869636 agatg 19869632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22948223 - 22948120
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22948223 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 22948125  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  22948124 agatg 22948120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22952179 - 22952076
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22952179 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 22952081  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  22952080 agatg 22952076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23414082 - 23413979
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23414082 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 23413984  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  23413983 agatg 23413979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23870667 - 23870564
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23870667 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 23870569  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  23870568 agatg 23870564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23874623 - 23874520
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23874623 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 23874525  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  23874524 agatg 23874520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14471400 - 14471317
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaa 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14471400 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaa 14471317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8242980 - 8242822
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatca-----------------a 83  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||                 |    
T  8242980 atgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttgctaattgtttatcaaatatgctatgatgttta 8242882  T
Q  84 agatgctattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8242881 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 8242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19869597 - 19869547
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19869597 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 19869547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23394051 - 23394001
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394051 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 23394001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23413959 - 23413909
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23413959 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 23413909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16759235 - 16759185
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16759235 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 16759185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16623022 - 16622970
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16623022 tgtttaagatgtttatgttaaagatttatgatgttaattatggtgttagtacg 16622970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22948118 - 22948065
Alignment:
Q  90 tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22948118 tattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattagggtgttagta 22948065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22952074 - 22952021
Alignment:
Q  90 tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22952074 tattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattagggtgttagta 22952021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23870562 - 23870509
Alignment:
Q  90 tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23870562 tattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattagggtgttagta 23870509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23874518 - 23874465
Alignment:
Q  90 tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23874518 tattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattagggtgttagta 23874465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 27567981 - 27568068
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaaga-tgtttatgttg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  27567981 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgcaattatgtttaagattgtttatgttg 27568068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 16523770 - 16523856
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  16523770 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgttg 16523856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19298162 - 19298105
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19298162 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 19298105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 22075030 - 22075064
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075030 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 22075064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Original strand, 21740434 - 21740473
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21740434 tttaagatgtttatgttgaatatttatgatgttaattatg 21740473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 12706455 - 12706398
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12706455 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattttttatcaaagatgc 12706398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16740974 - 16740916
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| |||||||||||||   | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16740974 ttatgttattgatgatgatttgaagctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 16740916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Original strand, 20908362 - 20908419
Alignment:
Q  57 tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  20908362 tgtgattacttgataattgtttataaaaaatgcaatgatgtttaagatgtttatgttg 20908419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17803956 - 17803896
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17803956 atgttatgttattgatgatgattgaatactgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 17803896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 23401003 - 23400974
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatg 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23401003 atgattaattattattaagtgaatattatg 23400974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 27553942 - 27554003
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  27553942 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtggatacttattaattgtttatcaaagatgc 27554003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1254223 - 1254195
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1254223 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 1254195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12941285 - 12941257
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941285 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 12941257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23400742 - 23400714
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23400742 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23400714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23538045 - 23538017
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538045 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23538017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27222896 - 27222868
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222896 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 27222868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10752142 - 10751998
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752142 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctattgtttaag 10752043  T
Q  101 atgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 145  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752042 atgattatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 10751998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18355381 - 18355222
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  18355381 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 18355282  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18355281 agacgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 18355222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 40724535 - 40724653
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  40724535 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttagcaaagatgctatgatgttta 40724634  T
Q  99 agatgtttatgttgaagat 117  Q
    ||||| ||||||| |||||    
T  40724635 agatgattatgtttaagat 40724653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20295007 - 20294849
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  20295007 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgccatgatgttta 20294909  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20294908 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 20294849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 19473684 - 19473842
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  19473684 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 19473782  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19473783 agatgatattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattatggtgttagta 19473842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11220045 - 11219969
Alignment:
Q  29 tgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatg 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11220045 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatg 11219969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11224631 - 11224555
Alignment:
Q  29 tgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatg 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11224631 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatg 11224555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11228454 - 11228378
Alignment:
Q  29 tgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatg 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11228454 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatg 11228378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11230443 - 11230367
Alignment:
Q  29 tgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatg 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11230443 tgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatg 11230367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 131
Target Start/End: Original strand, 40724644 - 40724682
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatt 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724644 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatt 40724682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 20911869 - 20911909
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattg 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20911869 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattg 20911909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 24221623 - 24221568
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaa 83  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24221623 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaa 24221568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 15237941 - 15237975
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15237941 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 15237975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 17919525 - 17919587
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17919525 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 17919587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17410239 - 17410179
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17410239 atgttatgttattggtgatgattgaatgttgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 17410179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11226540 - 11226481
Alignment:
Q  83 aagatgctattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  11226540 aagatgatattgtttaagatgattatgtttaagatgt-ttatgttgattatggtgttagta 11226481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23439726 - 23439635
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttgaagat 117  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  23439726 atgttatgttatttgtgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagat 23439635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23451093 - 23451002
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttgaagat 117  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  23451093 atgttatgttatttgtgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatcaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagat 23451002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23458337 - 23458246
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttgaagat 117  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  23458337 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatgaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagat 23458246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23462598 - 23462507
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttgaagat 117  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  23462598 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgataatttgttatgaatgatgctatgatgtttaagatgattatgttgaagat 23462507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 33408993 - 33408934
Alignment:
Q  32 tatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 92  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33408993 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctat 33408934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 21367052 - 21367138
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21367052 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgttg 21367138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 134
Target Start/End: Original strand, 18770395 - 18770433
Alignment:
Q  96 ttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18770395 ttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 18770433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18773970 - 18773913
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18773970 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 18773913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18783813 - 18783756
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18783813 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 18783756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 23535904 - 23535962
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23535904 ttatgttattgatgatgattgaaatctgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 23535962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 89
Target Start/End: Original strand, 26743092 - 26743141
Alignment:
Q  39 ttgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26743092 ttgatgatgattgaa-gttgtgattacgtgataattgtttatcaaagatgc 26743141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9775004 - 9774975
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9775004 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 9774975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10751881 - 10751852
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751881 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 10751852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Original strand, 15238132 - 15238161
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15238132 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 15238161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Original strand, 22108464 - 22108493
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108464 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 22108493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19510526 - 19510498
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19510526 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 19510498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 22120606 - 22120634
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120606 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22120634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22339076 - 22339048
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22339076 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22339048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 23113417 - 23113445
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23113417 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23113445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 28372096 - 28372124
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28372096 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 28372124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 37600023 - 37600051
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37600023 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 37600051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 38146433 - 38146461
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38146433 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 38146461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 52634892 - 52634757
Alignment:
Q  10 tattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgttta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52634892 tattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagatgttta 52634793  T
Q  108 tgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52634792 tgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 52634757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 39244952 - 39245068
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244952 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 39245051  T
Q  101 atgtttatgttgaagat 117  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  39245052 atgattatgtttaagat 39245068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 39248507 - 39248623
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248507 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 39248606  T
Q  101 atgtttatgttgaagat 117  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  39248607 atgattatgtttaagat 39248623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 41389400 - 41389559
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat-------- 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  41389400 atgattaattattattaagtgaatattatattatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgtttaag 41389499  T
Q  93 -------tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 145  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41389500 atgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 41389559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1009829 - 1009671
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  1009829 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 1009731  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1009730 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 1009671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 1926153 - 1926311
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  1926153 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 1926251  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1926252 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 1926311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 20925167 - 20925325
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  20925167 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 20925265  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20925266 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 20925325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 16376404 - 16376562
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  16376404 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcaaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgccatgatgttta 16376502  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16376503 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 16376562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 33796673 - 33796577
Alignment:
Q  8 attattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33796673 attattattaagtgaatattatgttatgttattgaagatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgtttaagat 33796577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33796541 - 33796491
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33796541 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 33796491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 3705436 - 3705497
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3705436 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 3705497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 36819644 - 36819705
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36819644 atgttatgttatagatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 36819705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Original strand, 22831790 - 22831829
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22831790 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttaattatg 22831829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 18394334 - 18394395
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  18394334 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattaattgatgattgtttatcaaagatgc 18394395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21172771 - 21172711
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21172771 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 21172711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21312887 - 21312827
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21312887 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgggattacttgataattg-ttatcaaagatgc 21312827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 18182512 - 18182598
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18182512 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgttg 18182598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 46975231 - 46975196
Alignment:
Q  57 tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 92  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46975231 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctat 46975196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Original strand, 39245185 - 39245214
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245185 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 39245214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Original strand, 39248740 - 39248769
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39248740 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 39248769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Original strand, 41389679 - 41389708
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41389679 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 41389708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 132
Target Start/End: Original strand, 42865679 - 42865716
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42865679 tttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 42865716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16370989 - 16370961
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16370989 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16370961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 22132113 - 22132141
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132113 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22132141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 145
Target Start/End: Original strand, 39245079 - 39245111
Alignment:
Q  113 aagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39245079 aagatttatgatgttaattatggtgttagtacg 39245111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 145
Target Start/End: Original strand, 39248634 - 39248666
Alignment:
Q  113 aagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39248634 aagatttatgatgttaattatggtgttagtacg 39248666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 41801293 - 41801321
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41801293 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 41801321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11608 - 11465
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  11608 atgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtagttgtttatcaaagatactatgatgttta 11510  T
Q  99 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11509 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18424576 - 18424416
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatc-aaagatgctat------- 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           
T  18424576 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaaagatgctattgtttaa 18424477  T
Q  93 --------tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 145  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424476 gatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 18424416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32215 - 32057
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  32215 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 32117  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32116 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 32057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 12705667 - 12705825
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  12705667 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 12705765  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12705766 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 12705825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12714030 - 12713872
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||               
T  12714030 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattatttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 12713932  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12713931 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 12713872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18278549 - 18278391
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  18278549 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaattttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 18278451  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18278450 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 18278391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18282512 - 18282354
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  18282512 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaattttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 18282414  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18282413 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 18282354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 71807 - 71910
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  71807 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 71905  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  71906 agatg 71910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 75916 - 76019
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  75916 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 76014  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  76015 agatg 76019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12717854 - 12717696
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  12717854 atgattaat-attgttaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctaggatgttta 12717756  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12717755 aaatgatattgtttaacatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 12717696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12722765 - 12722607
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  12722765 atgattaat-attgttaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctaggatgttta 12722667  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12722666 aaatgatattgtttaacatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 12722607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 45171031 - 45171121
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 92  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45171031 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 45171121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 45171169 - 45171219
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45171169 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 45171219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 71930 - 71980
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  71930 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 71980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 76039 - 76089
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  76039 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 76089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 2759868 - 2759785
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  2759868 atgttatgatattgatgatgattgaatgaagtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatg 2759785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 12317895 - 12317834
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12317895 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 12317834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Original strand, 15605609 - 15605668
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagat 87  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15605609 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagat 15605668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 89
Target Start/End: Original strand, 9446531 - 9446591
Alignment:
Q  29 tgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9446531 tgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgc 9446591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 134
Target Start/End: Original strand, 9752124 - 9752159
Alignment:
Q  99 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9752124 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 9752159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14429614 - 14429528
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  14429614 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgttg 14429528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 2833126 - 2833160
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2833126 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 2833160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 9593113 - 9593056
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9593113 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 9593056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 15083448 - 15083414
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15083448 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 15083414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 39721418 - 39721384
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721418 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 39721384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16582890 - 16582849
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16582890 tgtttaagatgtttatgtttaagatttaagatgttgattatg 16582849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 42203742 - 42203681
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42203742 atgttatgttattgatgacgattgaatgatgtgaatacttgttaattgtttatcaaagatgc 42203681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 13148920 - 13148861
Alignment:
Q  32 tatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 92  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13148920 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctat 13148861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 132
Target Start/End: Original strand, 32216941 - 32216992
Alignment:
Q  83 aagatgctat--tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 132  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32216941 aagatgctatgatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 32216992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9702975 - 9702936
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9702975 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 9702936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Original strand, 17138527 - 17138566
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17138527 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 17138566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 2531009 - 2531043
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2531009 atgattaattattattaagagaatattatgttatg 2531043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 89
Target Start/End: Original strand, 13635803 - 13635860
Alignment:
Q  32 tatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  13635803 tatgttattgatgatgattgaatgctgtgattaattgataactgtttatcaaagatgc 13635860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 14152340 - 14152400
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14152340 atgttatgttattaatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 14152400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18424299 - 18424270
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18424299 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 18424270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Original strand, 23666467 - 23666496
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23666467 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 23666496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 146564 - 146536
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  146564 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 146536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 838148 - 838176
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  838148 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 838176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 1203328 - 1203356
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1203328 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 1203356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 7520230 - 7520258
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7520230 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 7520258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 10607335 - 10607363
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10607335 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 10607363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11660346 - 11660318
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11660346 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 11660318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13891694 - 13891666
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891694 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13891666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13892077 - 13892049
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13892077 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13892049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14420851 - 14420823
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14420851 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 14420823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16005068 - 16005040
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16005068 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16005040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 16109990 - 16110018
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16109990 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 16110018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18606402 - 18606374
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18606402 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18606374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18871361 - 18871333
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18871361 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18871333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20486806 - 20486778
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20486806 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 20486778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 39268328 - 39268356
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39268328 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 39268356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39721260 - 39721232
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721260 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 39721232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15223887 - 15223727
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatc-aaagatgctat------- 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           
T  15223887 atgattaattattattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaaagatgctattgtttaa 15223788  T
Q  93 --------tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 145  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15223787 gatgattatgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagtacg 15223727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9555636 - 9555478
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  9555636 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 9555538  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9555537 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 9555478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 14758426 - 14758584
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  14758426 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 14758524  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14758525 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 14758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 14955191 - 14955349
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  14955191 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 14955289  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14955290 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 14955349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33741406 - 33741248
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  33741406 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 33741308  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33741307 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 33741248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 4562285 - 4562443
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  4562285 atgattaat-attattaagtgaatatcatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 4562383  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4562384 agaagatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 4562443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 5757810 - 5757968
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  5757810 atgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 5757908  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5757909 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 5757968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12486791 - 12486688
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12486791 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 12486693  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  12486692 agatg 12486688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25689009 - 25688906
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25689009 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 25688911  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  25688910 agatg 25688906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12486653 - 12486603
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12486653 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 12486603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 15353677 - 15353764
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaaga-tgtttatgttg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  15353677 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagattgtttatgttg 15353764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25688904 - 25688851
Alignment:
Q  90 tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25688904 tattgtttaagatgattatgtttaagatttatgatgttgattagggtgttagta 25688851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 132
Target Start/End: Original strand, 13813698 - 13813737
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813698 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 13813737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 139
Target Start/End: Original strand, 13818210 - 13818256
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgtt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13818210 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttaattatgatgtt 13818256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 1952099 - 1952156
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1952099 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 1952156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 10712047 - 10712013
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712047 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 10712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 10925817 - 10925783
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10925817 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 10925783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 20158231 - 20158265
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20158231 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 20158265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 20160907 - 20160941
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160907 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 20160941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 20163685 - 20163719
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20163685 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 20163719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 11250930 - 11250991
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  11250930 atgttatgttgttgatgatgattgaacgatgtgattacttgctaattgtttattgaagatgc 11250991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 22634750 - 22634783
Alignment:
Q  99 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634750 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 22634783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 36134286 - 36134346
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36134286 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 36134346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13569214 - 13569175
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13569214 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 13569175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 134
Target Start/End: Original strand, 15125505 - 15125546
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15125505 tgtttaagatggttatgttgaagatttatgttgttaattatg 15125546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15223610 - 15223581
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15223610 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatgt 15223581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 18603067 - 18603127
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18603067 atgttatgtcattgatgatgattgaa-gttgtgattaagtgataattgtttatcaaagatgc 18603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Original strand, 23996574 - 23996615
Alignment:
Q  99 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgtta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  23996574 agatgtttatgttgaagatttatgatattggttatgatgtta 23996615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 631762 - 631790
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  631762 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 631790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 2014544 - 2014485
Alignment:
Q  32 tatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 92  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2014544 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttggtaattgtttatccaggatgctat 2014485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 13813847 - 13813875
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813847 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13813875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 13818335 - 13818363
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13818335 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 13818363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15533283 - 15533255
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533283 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 15533255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Original strand, 16243740 - 16243799
Alignment:
Q  32 tatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 92  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16243740 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgactacttgataattgtttatcaaagatgctat 16243799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 17052460 - 17052488
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052460 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 17052488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18211668 - 18211640
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18211668 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 18211640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 22634941 - 22634969
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634941 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 22634969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 23996981 - 23997009
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996981 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 23997009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 24048399 - 24048427
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048399 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 24048427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30145847 - 30145819
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30145847 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 30145819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36037016 - 36036988
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36037016 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 36036988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 49549097 - 49549125
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49549097 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 49549125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 4858 - 5016
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  4858 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 4956  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4957 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 5016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 21977632 - 21977790
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  21977632 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 21977730  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21977731 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 21977790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 21973541 - 21973699
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  21973541 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgataatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 21973639  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21973640 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 21973699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22111157 - 22110999
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  22111157 atgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 22111059  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22111058 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 22110999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43250917 - 43250759
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  43250917 atgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 43250819  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43250818 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 43250759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 21828976 - 21829079
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21828976 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 21829074  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  21829075 agatg 21829079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 30941110 - 30941213
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  30941110 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 30941208  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  30941209 agatg 30941213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 18863635 - 18863738
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  18863635 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttgtcaaagatgctatgatgttta 18863733  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  18863734 agatg 18863738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 18863773 - 18863823
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863773 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 18863823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 143
Target Start/End: Original strand, 30941235 - 30941283
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30941235 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 30941283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 21829099 - 21829149
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21829099 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 21829149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Original strand, 20856811 - 20856894
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctattgt-ttaagatgtttatgt 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  20856811 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgttaagatgtttatgt 20856894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 14398803 - 14398837
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398803 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 14398837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 16231813 - 16231870
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16231813 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 16231870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 21386551 - 21386517
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21386551 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 21386517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 21410123 - 21410089
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410123 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 21410089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 21804615 - 21804581
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21804615 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 21804581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22044651 - 22044594
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22044651 ttatgttattgatgatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 22044594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Original strand, 23847355 - 23847414
Alignment:
Q  32 tatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 92  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23847355 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctat 23847414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 134
Target Start/End: Original strand, 19259961 - 19259996
Alignment:
Q  99 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19259961 agatgtttatgttgaagatttatgatgttaattatg 19259996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Original strand, 20466450 - 20466489
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20466450 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 20466489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 21386443 - 21386409
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21386443 atgattaattattattaagtgaatgttatgttatg 21386409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23833939 - 23833882
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  23833939 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 23833882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Original strand, 39095324 - 39095381
Alignment:
Q  57 tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||    
T  39095324 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatacaatgatgtttaagatgttcatgttg 39095381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 133
Target Start/End: Original strand, 21169189 - 21169229
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattat 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21169189 tgtttaagatgcttatgttgaagatgtatgatgtttattat 21169229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21328630 - 21328602
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21328630 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 21328602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 27942700 - 27942728
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27942700 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 27942728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 44385848 - 44385876
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385848 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 44385876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 10102808 - 10102966
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  10102808 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 10102906  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10102907 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 10102966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 24629479 - 24629637
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  24629479 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 24629577  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24629578 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 24629637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24648461 - 24648303
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  24648461 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 24648363  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24648362 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 24648303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 27380352 - 27380510
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  27380352 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 27380450  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27380451 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 27380510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 27384398 - 27384556
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  27384398 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 27384496  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27384497 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 27384556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 30346015 - 30346173
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  30346015 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 30346113  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30346114 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 30346173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27600938 - 27600780
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  27600938 atgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 27600840  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27600839 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 27600780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 41531973 - 41532076
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41531973 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 41532071  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  41532072 agatg 41532076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1282557 - 1282454
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1282557 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcaaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 1282459  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  1282458 agatg 1282454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1282434 - 1282384
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1282434 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 1282384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 41532111 - 41532161
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41532111 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 41532161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24174546 - 24174485
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24174546 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 24174485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 37524414 - 37524328
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  37524414 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgttg 37524328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Original strand, 19928841 - 19928902
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatt 93  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19928841 ttatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctatt 19928902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 25961903 - 25961965
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgatt-acttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25961903 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgatttacttgataattgtttatcaaagatgc 25961965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 31344315 - 31344281
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344315 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 31344281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 19691982 - 19692042
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19691982 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 19692042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 134
Target Start/End: Original strand, 40622674 - 40622715
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40622674 tgtttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 40622715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24735161 - 24735102
Alignment:
Q  29 tgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24735161 tgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 24735102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 24655708 - 24655770
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttat-caaagatgc 89  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24655708 atgttttgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatccaaagatgc 24655770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6481848 - 6481820
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6481848 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 6481820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6485315 - 6485287
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6485315 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 6485287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9240738 - 9240710
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240738 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 9240710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 19663572 - 19663600
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663572 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 19663600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20260321 - 20260293
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260321 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 20260293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 21074522 - 21074550
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21074522 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 21074550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 6019 - 6177
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  6019 atgattaat-attgttaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatattta 6117  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6118 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 6177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 68180 - 68338
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc----------- 89  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  68180 atgattaat-attattaaatgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 68278  T
Q  90 ------tattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  68279 agatgatattgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattttggtgttagta 68338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 33686 - 33789
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  33686 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 33784  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  33785 agatg 33789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 33824 - 33874
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33824 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 33874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 15120 - 15223
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15120 atgattaat-attattaagtgaatattatgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 15218  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  15219 agatg 15223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 15243 - 15293
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgttagta 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15243 tgtttaagatgtttatgttgaagatatatgatgttgattatggtgttagta 15293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 79679 - 79576
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgttta 98  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  79679 atgattaat-attattaagtgaatattgtgttatgttattgatgatgatcgaatgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctatgatgttta 79581  T
Q  99 agatg 103  Q
    |||||    
T  79580 agatg 79576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 41
Target Start/End: Original strand, 62675 - 62708
Alignment:
Q  8 attattattaagtgaatattatgttatggtattg 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62675 attattattaagtgaatattatgttatgttattg 62708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1537 - 1451
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1537 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgttg 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 414419 - 414506
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgatt-acttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  414419 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgatttacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagatgtttatgttg 414506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 7135
Alignment:
Q  32 tatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc--tattgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  7217 tatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcattgatgtttaagatgtttatgttg 7135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18958 - 18897
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18958 atgttatgttattgatgatgattgaatgttgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 18897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12674 - 12619
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaa 83  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12674 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataactgtttatcaa 12619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 195296 - 195357
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  195296 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 195357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 173064 - 173003
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  173064 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 173003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Original strand, 422920 - 422978
Alignment:
Q  57 tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc---tattgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  422920 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgattgtttaagatgtttatgttg 422978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 204537 - 204498
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  204537 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 204498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 178738 - 178706
Alignment:
Q  57 tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  178738 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 178706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 20347 - 20408
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20347 atgttatgttatcgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgc 20408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 228705 - 228766
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  228705 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataactgtttatcaaagatgc 228766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 10666 - 10752
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaaga-tgtttatgttg 112  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  10666 atgttatgttattgatgatgattgaatat-gtgattacttgataattgtttatcaaagatgcaatgatgtttaagattgtttatgttg 10752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 541 - 575
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  541 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 8980 - 8946
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8980 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 8946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 12032 - 11998
Alignment:
Q  1 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032 atgattaattattattaagtgaatattatgttatg 11998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 885 - 848
Alignment:
Q  102 tgtttatgttgaagatttatgatgttgattatggtgtt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  885 tgtttatgttgaagatttatgatgttgattatgatgtt 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 18968 - 19029
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18968 atgttatgttattgatgatgattgaatactgtgattacttgataattgtttctcaaagatgc 19029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 4572 - 4633
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  4572 atgttatgttattgatgatgattgaatgatgtgattaattgatgattgtttatcaaagatgc 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 32100 - 32059
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32100 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaattatg 32059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 66762 - 66822
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  66762 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgttaattg-ttatcaaagatgc 66822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 53324 - 53264
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  53324 atgttatgttattgatgatgattgaatgctgtgattacttgataattg-ttatcaaagatgc 53264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 37217 - 37245
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37217 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 37245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 9186 - 9127
Alignment:
Q  32 tatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat 92  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9186 tatgttattgattatgattgaa-gctgtgattacttgataattgtttatcaaagatgctat 9127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Original strand, 3014 - 3062
Alignment:
Q  36 gtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaa 84  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3014 gtattgatgatgattgaatgttttgatttcttggtaattgtttatcaaa 3062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 81563 - 81620
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  81563 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 81620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 74346 - 74374
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  74346 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 74374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1828 - 1793
Alignment:
Q  99 agatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1828 agatgtttatgttgaagatttatgatgttaattatg 1793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 7524 - 7610
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||| |||| |||||| | ||| || ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7524 atgttatgttatttatgatgtttgaatgtagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgttg 7610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 4)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Original strand, 22303 - 22342
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22303 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 22342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Original strand, 30195 - 30234
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30195 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 30234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Original strand, 22271 - 22303
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22271 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 22303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Original strand, 30163 - 30195
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgtt 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30163 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgtt 30195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23337 - 23298
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23337 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 23298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38761 - 38722
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38761 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 38722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14316 - 14287
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14316 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 14287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Original strand, 19114 - 19153
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19114 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 19153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Original strand, 55850 - 55889
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgattatg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55850 tttaagatgcttatgttgaagatttatgatgttaattatg 55889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8294 - 8213
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgttta 107  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  8294 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatatttgattatcaaagatgcaatgatgtttaagatgttta 8213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 89
Target Start/End: Original strand, 7653 - 7715
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaac-gttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7653 atgttatgttattgatgatgattgaaatgatgtgattacttgataattgtttataaaagatgc 7715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Original strand, 15610 - 15667
Alignment:
Q  57 tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||    
T  15610 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatacaatgatgtttaagatgttcatgttg 15667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 112
Target Start/End: Original strand, 20132 - 20189
Alignment:
Q  57 tgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||    
T  20132 tgtgattacttgataattgtttatcaaagatacaatgatgtttaagatgttcatgttg 20189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22983 - 22926
Alignment:
Q  31 ttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgc 89  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  22983 ttatgttattgatgatgattgaa-gttgtgattatgtgataattgtttatcaaagatgc 22926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 34223 - 34327
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tg-tttaagatgtttatgttgaaga--tttatg 122  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  34223 atgttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgataatttattatcaatgatgctatgatgttttaagatgattatgttgaagatgtttatg 34322  T
Q  123 atgtt 127  Q
    |||||    
T  34323 atgtt 34327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 122
Target Start/End: Original strand, 8279 - 8308
Alignment:
Q  93 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8279 tgtttaagatgtttatgttgaagatttatg 8308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 17507 - 17591
Alignment:
Q  30 gttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttg 112  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17507 gttatgttatttatgatgattgaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgtttatgttg 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 69446 - 69409
Alignment:
Q  95 tttaagatgtttatgttgaagatttatgatgttgatta 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  69446 tttaagatgtttatgttgaagatttatgttgttaatta 69409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 264 - 236
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  264 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5306 - 5278
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5306 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 5278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4185 - 4157
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4185 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 4157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 6975 - 7003
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6975 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 7003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1917 - 1831
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaaga-tgtttatgttg 112  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  1917 atgttatattattgatgatgattgaatgaagtgattacttgataattg-ttatcaaagatgcaatgatgtttaagattgtttatgttg 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 10836 - 10864
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 21354 - 21382
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21354 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 21382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 25582 - 25610
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25582 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 25610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Original strand, 5203 - 5294
Alignment:
Q  28 atgttatggtattgatgatgatcgaacgttgtgattacttggtaattgtttatcaaagatgctat--tgtttaagatgtttatgttgaagat 117  Q
    |||||||| |||| ||||||||  || |  ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5203 atgttatgttatttatgatgattaaatgaagtgattacttgatattttattatcaatgatgctatgatgtttaagatgcttatgttgaagat 5294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 109665 - 109637
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  109665 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 109637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 290
Target Start/End: Original strand, 224157 - 224185
Alignment:
Q  262 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  224157 ctatgagttgttaaatgtacttgatgatg 224185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University