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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4268_high_1 (Length: 790)

Name: NF4268_high_1
Description: NF4268
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4268_high_1
NF4268_high_1
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (18-774)||(38286740-38287493)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 628; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 628; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 774
Target Start/End: Original strand, 38286740 - 38287493
Alignment:
Q  18 acaatgtgtgtgtacaaggagtacgtggggcaaagtcaaagtcgctggagtttattattattattgtgtgctttacaaattacaatataatttgctttga 117  Q
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T  38286740 acaatgtgtgtgtacaaggagtacgtggggcaaagtcaaagtcgctggagtttattattattattgtgtgctttacgaattacaatataatttgctttga 38286839  T
Q  118 gttgatagatagatagaattaatgaatgaattgaaattgtcgttgattcttttctttgccacataataatcatcacaatacagtgatagtcggcaaatcc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38286840 gttgatagatagatagaattaatgaatgaattgaaattgtcgttgattcttttctttgccacataataatcatcataatacagtgatagtcggcaaatcc 38286939  T
Q  218 ctctttaacctatctcttaattatttgtttagttaactaccaactatataactttgcatatacttcaatttgcttactttaaattacctcatctctaatt 317  Q
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T  38286940 ctctttaacctatctcttaattatttgtttaattaactaccaactatataactttgcatatacttcaatttgcttactttaaattacctcatctctaatt 38287039  T
Q  318 tctcaacactcattccatagtatgtatatcattttctctctattttctttgtatcttatcatcaacatattaattatatcgatcacatattcacataann 417  Q
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T  38287040 tctcaacactcattccatagtatgtatatcattttctctctattttctttgtatcttatcatcaacat----attatatcgatcacatattcacataatt 38287135  T
Q  418 nnnnnnatttctttctctcttaaagagtcaataaggtgtatttgtgtacaaagacaaattttctttaaattagctcatgcatcgatcacaaagctcaatc 517  Q
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T  38287136 ttttttatttctttctctcttaaagagtcaataaggtatatttgtgtacaaagacaaattttctttaaattagctcatgcatcgatcacaaagctcaatc 38287235  T
Q  518 aacagtaagattattagttatttttattgc-ttcattgatgacaatccagcaagtttataatcatgatgtctataattaattagtgatatgtgaacccgg 616  Q
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T  38287236 aacagtaagattattagtta---ttactgctttcattgatgacaatccagcaagtttataatcatgatgtctatgattaattagtgatatgtgaacccgg 38287332  T
Q  617 ttgattattgcttagatatgggatttggctttcc---nnnnnnnngtctgtgcgtatgatatcactttgtactggttccaaattgtataggagtggtact 713  Q
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T  38287333 ttgattattgcttagatatgggatttggctttcctttttttttttgtctgtgcgtatgatatcactttgtactggttccaaattgtataggagtggtact 38287432  T
Q  714 actctacccttttccattttccttaatacatatatagacacacaaatacacacacattcat 774  Q
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T  38287433 actctacccttttccattttccttaatacgtatatagacacacaaataaacacacattcat 38287493  T

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