View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4274_low_1 (Length: 640)

Name: NF4274_low_1
Description: NF4274
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4274_low_1
NF4274_low_1
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (17-640)||(39675752-39676375)
chr5 (17-326)||(10873494-10873803)
chr5 (17-326)||(10878565-10878874)
chr5 (17-326)||(10883636-10883945)
chr5 (17-326)||(10866502-10866811)
chr5 (17-326)||(10887554-10887863)
chr5 (393-601)||(10866218-10866426)
chr5 (393-601)||(10873879-10874087)
chr5 (393-601)||(10878950-10879158)
chr5 (393-601)||(10884021-10884229)
chr5 (17-310)||(10046138-10046431)
chr5 (387-612)||(10887942-10888167)
chr5 (410-610)||(10045775-10045975)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (21-172)||(30709537-30709688)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 608; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 608; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 39676375 - 39675752
Alignment:
Q  17 acaaccttcagtggttgccattggcacggtgtattctttaccatcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctattggcatc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39676375 acaaccttcagtggttgccattggcacggtgtattctttaccatcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctattggcatc 39676276  T
Q  117 tcgcaacattgtcctaatatagaatcataatcaaaaccttccattggtaaaccttcaagtgaccttccagtaactctctccacagcttggttcctaatca 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39676275 tcgcaacattgtcctaatatagaatcataatcaaaaccttccattggtaaaccttcaagtgaccttccagtaactctctccacagcttggttcctaatca 39676176  T
Q  217 cagcagcacgtcggcaatctccaagcttcgattcaagcgagtaagatggaattgatccagacaccactgcaccaacaacctcctcatcttccatcgacaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39676175 cagcagcacgtcggcaatctccaagcttcgattcaagcgagtaagatggaattgatccagacaccactgcaccaacaacctcctcatcttccatggacaa 39676076  T
Q  317 aactttttggacaaggatttcctccggtagatttggcatgactttggtggttttcgcagcaatgtcagcaacttcatcttcttcttcatcgtaatgaagg 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39676075 aactttttggacaaggatttcctccggtagatttggcatgactttggtggttttcgcagcaatgtcagcaacttcatcttcttcttcatcgtaatgaagg 39675976  T
Q  417 atgaaggcaacgccgaagaaagccgtaaggtagataaggcaagcaatgagggaaactagagcaagaatctcggagattgtgaggacatggagaggtgtaa 516  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39675975 atgaaggcaacgccaaagaaagccgtaaggtagataaggcaagcaatgagggaaactagagcaagaatctcggagattgtgaggacatggagaggtgtag 39675876  T
Q  517 aggttcggatcttttcacgccaccggttaagaagaaagtatgcgacggagaagaagagaccgaagaaaaaagtgtttgttaagtaaagtgaagaagtttg 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39675875 aggttcggatcttttcacgccaccggttaagaagaaagtatgcgacggagaagaagagaccgaagaaaaaagtgtttgttaagtaaagtgaagaagtttg 39675776  T
Q  617 tgacagtgaattctgctgcctttg 640  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  39675775 tgacagtgaattctgctgcttttg 39675752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 10873494 - 10873803
Alignment:
Q  17 acaaccttcagtggttgccattggcacggtgtattctttaccatcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctattggcatc 116  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10873494 acaaccttcggttgttgccatgggcaccgtgtactcattcccgtcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctatgggcatc 10873593  T
Q  117 tcgcaacattgtcctaatatagaatcataatcaaaaccttccattggtaaaccttcaagtgaccttccagtaactctctccacagcttggttcctaatca 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||      
T  10873594 tcgcaacactgtcctaatatagaatcgtaatcaaaaccttccatcggtaaaccttcaagtgaccttccggtaactctctccacggcttggttcctaatat 10873693  T
Q  217 cagcagcacgtcggcaatctccaagcttcgattcaagcgagtaagatggaattgatccagacaccactgcaccaacaacctcctcatcttccatcgacaa 316  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||     
T  10873694 ttgctgcacgtcggcaatctccaagcttggattcaagcgagtaagatggaattgatcctgacaccactgcactgacaacctcctcgtcttccatggacat 10873793  T
Q  317 aactttttgg 326  Q
    ||||||||||    
T  10873794 aactttttgg 10873803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 10878565 - 10878874
Alignment:
Q  17 acaaccttcagtggttgccattggcacggtgtattctttaccatcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctattggcatc 116  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10878565 acaaccttcggttgttgccatgggcaccgtgtactcattcccgtcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctatgggcatc 10878664  T
Q  117 tcgcaacattgtcctaatatagaatcataatcaaaaccttccattggtaaaccttcaagtgaccttccagtaactctctccacagcttggttcctaatca 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||      
T  10878665 tcgcaacactgtcctaatatagaatcgtaatcaaaaccttccatcggtaaaccttcaagtgaccttccggtaactctctccacggcttggttcctaatat 10878764  T
Q  217 cagcagcacgtcggcaatctccaagcttcgattcaagcgagtaagatggaattgatccagacaccactgcaccaacaacctcctcatcttccatcgacaa 316  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||     
T  10878765 ttgctgcacgtcggcaatctccaagcttggattcaagcgagtaagatggaattgatcctgacaccactgcactgacaacctcctcgtcttccatggacat 10878864  T
Q  317 aactttttgg 326  Q
    ||||||||||    
T  10878865 aactttttgg 10878874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 10883636 - 10883945
Alignment:
Q  17 acaaccttcagtggttgccattggcacggtgtattctttaccatcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctattggcatc 116  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10883636 acaaccttcggttgttgccatgggcaccgtgtactcattcccgtcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctatgggcatc 10883735  T
Q  117 tcgcaacattgtcctaatatagaatcataatcaaaaccttccattggtaaaccttcaagtgaccttccagtaactctctccacagcttggttcctaatca 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||      
T  10883736 tcgcaacactgtcctaatatagaatcgtaatcaaaaccttccatcggtaaaccttcaagtgaccttccggtaactctctccacggcttggttcctaatat 10883835  T
Q  217 cagcagcacgtcggcaatctccaagcttcgattcaagcgagtaagatggaattgatccagacaccactgcaccaacaacctcctcatcttccatcgacaa 316  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||     
T  10883836 ttgctgcacgtcggcaatctccaagcttggattcaagcgagtaagatggaattgatcctgacaccactgcactgacaacctcctcgtcttccatggacat 10883935  T
Q  317 aactttttgg 326  Q
    ||||||||||    
T  10883936 aactttttgg 10883945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10866811 - 10866502
Alignment:
Q  17 acaaccttcagtggttgccattggcacggtgtattctttaccatcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctattggcatc 116  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10866811 acaaccttcggttgttgccatgggcaccgtgtactcattcccgtcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctatcggcatc 10866712  T
Q  117 tcgcaacattgtcctaatatagaatcataatcaaaaccttccattggtaaaccttcaagtgaccttccagtaactctctccacagcttggttcctaatca 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||      
T  10866711 tcgcaacactgtcctaatatagaattgtagtcaaaaccttccatcggtaaaccttcaagtgaccttccggtaactctctccaccgcttggttcctaatat 10866612  T
Q  217 cagcagcacgtcggcaatctccaagcttcgattcaagcgagtaagatggaattgatccagacaccactgcaccaacaacctcctcatcttccatcgacaa 316  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||     
T  10866611 ttgctgcacgtcggcaatctccaagcttggattcaagcgagtaagatggaattgatcctgacaccactgcactgacaacctcctcgtcttccatggacat 10866512  T
Q  317 aactttttgg 326  Q
    ||||||||||    
T  10866511 aactttttgg 10866502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 326
Target Start/End: Original strand, 10887554 - 10887863
Alignment:
Q  17 acaaccttcagtggttgccattggcacggtgtattctttaccatcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctattggcatc 116  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10887554 acaaccttcggttgttgccatgggcaccgtgtattcattcccgtcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatttgaacaaaccctatcggcatc 10887653  T
Q  117 tcgcaacattgtcctaatatagaatcataatcaaaaccttccattggtaaaccttcaagtgaccttccagtaactctctccacagcttggttcctaatca 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  10887654 tcgcaacactgtcctaatatagaatcgtagtcaaaacctttcatcggtaaaccttcaagtgaccttccggtaaccctctccactgcttggttcctaatct 10887753  T
Q  217 cagcagcacgtcggcaatctccaagcttcgattcaagcgagtaagatggaattgatccagacaccactgcaccaacaacctcctcatcttccatcgacaa 316  Q
      || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||     
T  10887754 ttgctgcacgacggcaatctccgagcttcgactcaagggagtaagaaggaattgatcccgataccactgcaccgacaacctcttcgtcttccatggacat 10887853  T
Q  317 aactttttgg 326  Q
    ||||||||||    
T  10887854 aactttttgg 10887863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 393 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 10866426 - 10866218
Alignment:
Q  393 tcttcttcttcatcgtaatgaaggatgaaggcaacgccgaagaaagccgtaaggtagataaggcaagcaatgagggaaactagagcaagaatctcggaga 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10866426 tcttcttcttcatcgtaatgaaggatgaaggcaatgccgaagaaagtgataaggtagacaaaggaagcgatgagggaaacaagagcgagaatctcagaga 10866327  T
Q  493 ttgtgaggacatggagaggtgtaaaggttcggatcttttcacgccaccggttaagaagaaagtatgcgacggagaagaagagaccgaagaaaaaagtgtt 592  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |   ||    
T  10866326 ttgtgaggacgtggagaggtgtagaggttcggatcttttcacgccacctgttgagaagaaagtaggcgacggagaagaagagaccaaagaaaacaacatt 10866227  T
Q  593 tgttaagta 601  Q
    |||||||||    
T  10866226 tgttaagta 10866218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 393 - 601
Target Start/End: Original strand, 10873879 - 10874087
Alignment:
Q  393 tcttcttcttcatcgtaatgaaggatgaaggcaacgccgaagaaagccgtaaggtagataaggcaagcaatgagggaaactagagcaagaatctcggaga 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10873879 tcttcttcttcatcgtaatgaaggatgaaggcaatgccgaagaaagtgataaggtagacaaaggaagcgatgagggaaacaagagcgagaatctcagaga 10873978  T
Q  493 ttgtgaggacatggagaggtgtaaaggttcggatcttttcacgccaccggttaagaagaaagtatgcgacggagaagaagagaccgaagaaaaaagtgtt 592  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |   ||    
T  10873979 ttgtgaggacgtggagaggtgtagaggttcggatcttttcacgccacctgttgagaagaaagtaggcgacggagaagaagagaccaaagaaaacaacatt 10874078  T
Q  593 tgttaagta 601  Q
    |||||||||    
T  10874079 tgttaagta 10874087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 393 - 601
Target Start/End: Original strand, 10878950 - 10879158
Alignment:
Q  393 tcttcttcttcatcgtaatgaaggatgaaggcaacgccgaagaaagccgtaaggtagataaggcaagcaatgagggaaactagagcaagaatctcggaga 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10878950 tcttcttcttcatcgtaatgaaggatgaaggcaatgccgaagaaagtgataaggtagacaaaggaagcgatgagggaaacaagagcgagaatctcagaga 10879049  T
Q  493 ttgtgaggacatggagaggtgtaaaggttcggatcttttcacgccaccggttaagaagaaagtatgcgacggagaagaagagaccgaagaaaaaagtgtt 592  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |   ||    
T  10879050 ttgtgaggacgtggagaggtgtagaggttcggatcttttcacgccacctgttgagaagaaagtaggcgacggagaagaagagaccaaagaaaacaacatt 10879149  T
Q  593 tgttaagta 601  Q
    |||||||||    
T  10879150 tgttaagta 10879158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 393 - 601
Target Start/End: Original strand, 10884021 - 10884229
Alignment:
Q  393 tcttcttcttcatcgtaatgaaggatgaaggcaacgccgaagaaagccgtaaggtagataaggcaagcaatgagggaaactagagcaagaatctcggaga 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  10884021 tcttcttcttcatcgtaatgaaggatgaaggcaatgccgaagaaagtgataaggtagacaaaggaagcgatgagggaaacaagagcgagaatctcagaga 10884120  T
Q  493 ttgtgaggacatggagaggtgtaaaggttcggatcttttcacgccaccggttaagaagaaagtatgcgacggagaagaagagaccgaagaaaaaagtgtt 592  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |   ||    
T  10884121 ttgtgaggacgtggagaggtgtagaggttcggatcttttcacgccacctgttgagaagaaagtaggcgacggagaagaagagaccaaagaaaacaacatt 10884220  T
Q  593 tgttaagta 601  Q
    |||||||||    
T  10884221 tgttaagta 10884229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10046431 - 10046138
Alignment:
Q  17 acaaccttcagtggttgccattggcacggtgtattctttaccatcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctattggcatc 116  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10046431 acaaccttccgtcgttgccatcggcaccgtgtactctttcccatcaagcaacaaaggtccggcaactcccaccggaatctgaacaaatcctatcggcatc 10046332  T
Q  117 tcgcaacattgtcctaatatagaatcataatcaaaaccttccattggtaaaccttcaagtgaccttccagtaactctctccacagcttggttcctaatca 216  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |  |||     
T  10046331 tcacaacactgtcctaatatcgaatcataatcaaaaccttccattggtaaacccgagagtgactttccggtaactctctccaccgcttggttacgtatcg 10046232  T
Q  217 cagcagcacgtcggcaatctccaagcttcgattcaagcgagtaagatggaattgatccagacaccactgcaccaacaacctcctcatcttccat 310  Q
    | || ||||||  ||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||  || |  ||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  10046231 ccgccgcacgtttgcaatctccgagttttgattcaagcgagtatgacggaattgtaccggttaccaccgcacggacaacctcgtcatcttccat 10046138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 387 - 612
Target Start/End: Original strand, 10887942 - 10888167
Alignment:
Q  387 acttcatcttcttcttcatcgtaatgaaggatgaaggcaacgccgaagaaagccgtaaggtagataaggcaagcaatgagggaaactagagcaagaatct 486  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||  | | |||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  10887942 acttcgtcttcatcatcatcgtaatgaatgatgaaggcagtgccgaagaaagcaataaggtagacgaaggaagcgatgagggaaactacagcaacaatct 10888041  T
Q  487 cggagattgtgaggacatggagaggtgtaaaggttcggatcttttcacgccaccggttaagaagaaagtatgcgacggagaagaagagaccgaagaaaaa 586  Q
    | |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||     
T  10888042 cagagactgtgaggatgtggagaggtgtagaggttcggatcttttcacgccacctgttaagaagaaagtacgcggcggagaagaagagaccaaagaaaac 10888141  T
Q  587 agtgtttgttaagtaaagtgaagaag 612  Q
    || ||||||||| || ||||||||||    
T  10888142 agcgtttgttaaatacagtgaagaag 10888167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 410 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 10045975 - 10045775
Alignment:
Q  410 atgaaggatgaaggcaacgccgaagaaagccgtaaggtagataaggcaagcaatgagggaaactagagcaagaatctcggagattgtgaggacatggaga 509  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| | | |   |||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  10045975 atgaagaatgaagccaatgccgaagaaagccataaggtaaataaaggaagctatgagggaaacaacaccggcaatctcagagattgtgagaacatgaaga 10045876  T
Q  510 ggtgtaaaggttcggatcttttcacgccaccggttaagaagaaagtatgcgacggagaagaagagaccgaagaaaaaagtgtttgttaagtaaagtgaag 609  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||    
T  10045875 ggtgtggaggttcggatcttctcacgccacctgtgaagaagaaaatacgcgacggagaagaaaagaccgaagaaaattgcgtttgttaagtagagtgaag 10045776  T
Q  610 a 610  Q
    |    
T  10045775 a 10045775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Original strand, 30709537 - 30709688
Alignment:
Q  21 ccttcagtggttgccattggcacggtgtattctttaccatcgagcaacaaaggaccggcaacacccaccggaatctgaacaaaccctattggcatctcgc 120  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    ||||| | |||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  30709537 ccttcagtggtagccatgggcacagtgtactcaactccatctaacaacagtggacccgcaacaccaaccggaatttgaacaaaccctatcggcatctcac 30709636  T
Q  121 aacattgtcctaatatagaatcataatcaaaaccttccattggtaaaccttc 172  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30709637 aacactgtcccaatatcgaatcgtaatcaaaaccttccaacggtaaaccttc 30709688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University