View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4284_high_3 (Length: 592)

Name: NF4284_high_3
Description: NF4284
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4284_high_3
NF4284_high_3
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (11-504)||(6311100-6311598)
chr8 (11-506)||(30655446-30655946)
chr8 (11-504)||(36979184-36979676)
chr8 (11-507)||(18852964-18853460)
chr8 (11-505)||(18870358-18870850)
chr8 (11-504)||(4759871-4760366)
chr8 (11-481)||(33037605-33038073)
chr8 (11-492)||(10688937-10689421)
chr8 (129-504)||(7289831-7290210)
chr8 (129-467)||(25328184-25328521)
chr8 (14-504)||(1261757-1262238)
chr8 (17-487)||(31071035-31071498)
chr8 (134-463)||(39784734-39785063)
chr8 (14-505)||(26287712-26288184)
chr8 (14-505)||(26312963-26313435)
chr8 (14-344)||(26301123-26301441)
chr8 (134-467)||(35745233-35745566)
chr8 (134-463)||(10684174-10684504)
chr8 (14-343)||(7412305-7412630)
chr8 (14-309)||(19175561-19175851)
chr8 (14-309)||(4456028-4456318)
chr8 (15-77)||(7289769-7289831)
chr8 (224-309)||(26403240-26403327)
chr8 (14-309)||(23799383-23799674)
chr8 (15-77)||(25327996-25328058)
chr8 (15-77)||(25328122-25328184)
chr8 (227-309)||(4696609-4696693)
chr8 (213-306)||(6127224-6127320)
chr8 (213-309)||(5702481-5702580)
chr8 (246-307)||(9765852-9765914)
chr8 (213-309)||(19752393-19752491)
chr8 (14-83)||(4696415-4696482)
chr8 (26-76)||(39784678-39784728)
chr8 (14-83)||(5702287-5702354)
chr8 (431-507)||(26300955-26301030)
chr8 (246-305)||(43079877-43079937)
chr8 (246-305)||(43082248-43082308)
chr8 (243-309)||(6813683-6813750)
chr8 (18-83)||(9054231-9054294)
chr8 (14-83)||(19752201-19752268)
chr8 (213-288)||(9054835-9054912)
chr8 (26-76)||(10684116-10684168)
chr8 (246-279)||(18810982-18811015)
chr8 (14-83)||(26403034-26403103)
chr8 (26-76)||(35745572-35745624)
chr8 (14-77)||(4731569-4731629)
chr8 (14-77)||(15212697-15212757)
chr8 (14-77)||(33352061-33352121)
chr8 (14-77)||(43036334-43036394)
chr8 (246-305)||(44721118-44721178)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (11-504)||(7167051-7167545)
chr3 (12-505)||(28503662-28504146)
chr3 (11-506)||(2671383-2671878)
chr3 (11-504)||(9091098-9091592)
chr3 (15-504)||(8738864-8739354)
chr3 (11-506)||(40372593-40373087)
chr3 (129-483)||(22173100-22173456)
chr3 (11-504)||(8477171-8477664)
chr3 (12-266)||(28501495-28501750)
chr3 (133-483)||(18656256-18656609)
chr3 (17-504)||(1305761-1306239)
chr3 (14-343)||(26928395-26928721)
chr3 (14-504)||(32143133-32143613)
chr3 (130-467)||(2676993-2677331)
chr3 (130-467)||(2672837-2673175)
chr3 (134-467)||(8512057-8512392)
chr3 (134-467)||(8516937-8517272)
chr3 (40-343)||(27452924-27453224)
chr3 (130-459)||(24967957-24968286)
chr3 (175-463)||(32475330-32475618)
chr3 (175-463)||(32480188-32480476)
chr3 (14-309)||(27974748-27975039)
chr3 (14-343)||(27986252-27986567)
chr3 (14-309)||(16264350-16264639)
chr3 (14-309)||(8370285-8370573)
chr3 (14-308)||(36029094-36029383)
chr3 (261-467)||(10207775-10207983)
chr3 (14-309)||(40592578-40592869)
chr3 (14-309)||(33386471-33386753)
chr3 (14-309)||(6794511-6794800)
chr3 (14-309)||(21711223-21711512)
chr3 (15-77)||(22173038-22173100)
chr3 (213-309)||(18552871-18552970)
chr3 (213-306)||(1736293-1736389)
chr3 (213-309)||(30709778-30709877)
chr3 (213-309)||(3715990-3716089)
chr3 (213-309)||(48438214-48438313)
chr3 (285-487)||(1309683-1309878)
chr3 (213-309)||(25795781-25795880)
chr3 (213-309)||(26298988-26299087)
chr3 (227-309)||(1417493-1417577)
chr3 (213-309)||(47923894-47923993)
chr3 (14-309)||(35925483-35925768)
chr3 (213-309)||(37466291-37466389)
chr3 (227-309)||(39039995-39040079)
chr3 (213-309)||(40844652-40844750)
chr3 (213-309)||(3328345-3328443)
chr3 (14-83)||(4386773-4386840)
chr3 (26-76)||(18656614-18656664)
chr3 (243-309)||(4386947-4387014)
chr3 (213-309)||(24695152-24695251)
chr3 (14-83)||(1736100-1736167)
chr3 (14-83)||(3323487-3323554)
chr3 (14-83)||(3328153-3328220)
chr3 (14-83)||(24694962-24695029)
chr3 (14-83)||(26299211-26299278)
chr3 (14-153)||(39032351-39032485)
chr3 (18-83)||(47923704-47923767)
chr3 (213-288)||(3323679-3323755)
chr3 (14-77)||(23392106-23392167)
chr3 (246-305)||(38210569-38210629)
chr3 (246-305)||(50494198-50494258)
chr3 (242-305)||(53894055-53894119)
chr3 (17-83)||(8126853-8126917)
chr3 (26-76)||(2672783-2672835)
chr3 (26-76)||(2676939-2676991)
chr3 (26-76)||(8512398-8512450)
chr3 (26-76)||(8517278-8517330)
chr3 (42-83)||(10274605-10274646)
chr3 (14-74)||(23410529-23410587)
chr3 (26-76)||(24968288-24968340)
chr3 (246-305)||(458483-458543)
chr3 (14-77)||(5236653-5236713)
chr3 (246-305)||(6063444-6063504)
chr3 (246-305)||(10621528-10621588)
chr3 (14-77)||(22835199-22835259)
chr3 (431-487)||(27452786-27452841)
chr3 (431-487)||(27986649-27986704)
chr3 (262-309)||(39153357-39153405)
chr3 (14-77)||(39153558-39153618)
chr3 (14-77)||(40734409-40734469)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (11-504)||(20357344-20357837)
chr7 (11-504)||(2057765-2058268)
chr7 (11-508)||(1533241-1533734)
chr7 (128-483)||(12406155-12406512)
chr7 (129-483)||(12396735-12397091)
chr7 (129-483)||(24024232-24024589)
chr7 (14-504)||(21639620-21640102)
chr7 (129-483)||(31109489-31109844)
chr7 (14-507)||(21645815-21646300)
chr7 (220-483)||(4866553-4866820)
chr7 (14-505)||(18408575-18409056)
chr7 (14-507)||(18413450-18413932)
chr7 (134-463)||(19992158-19992487)
chr7 (134-463)||(21812149-21812478)
chr7 (134-463)||(24266112-24266442)
chr7 (134-463)||(24261233-24261563)
chr7 (175-463)||(16879918-16880207)
chr7 (175-463)||(16884774-16885063)
chr7 (56-308)||(21983285-21983536)
chr7 (15-309)||(29159803-29160096)
chr7 (15-77)||(12397091-12397153)
chr7 (15-77)||(31109427-31109489)
chr7 (14-309)||(2479337-2479626)
chr7 (15-75)||(4873310-4873370)
chr7 (15-75)||(12406513-12406573)
chr7 (96-309)||(44848570-44848781)
chr7 (213-309)||(46516308-46516407)
chr7 (213-309)||(49091661-49091760)
chr7 (15-77)||(24024170-24024232)
chr7 (213-309)||(2647694-2647793)
chr7 (213-309)||(33332448-33332547)
chr7 (213-309)||(9190007-9190105)
chr7 (213-309)||(20284089-20284187)
chr7 (167-309)||(2580390-2580531)
chr7 (213-309)||(55948-56046)
chr7 (18-308)||(21988909-21989194)
chr7 (226-309)||(35960816-35960901)
chr7 (227-309)||(9185178-9185262)
chr7 (246-343)||(28617258-28617356)
chr7 (213-309)||(4796665-4796764)
chr7 (14-83)||(20284312-20284379)
chr7 (14-83)||(23402820-23402887)
chr7 (14-309)||(47263678-47263956)
chr7 (16-83)||(4796477-4796542)
chr7 (14-83)||(2580613-2580679)
chr7 (14-83)||(2647504-2647571)
chr7 (14-83)||(44847932-44847999)
chr7 (14-83)||(46516112-46516179)
chr7 (246-305)||(31155911-31155971)
chr7 (26-76)||(21812092-21812143)
chr7 (14-83)||(3047477-3047544)
chr7 (14-83)||(9184981-9185048)
chr7 (380-492)||(2479161-2479271)
chr7 (26-76)||(24266054-24266106)
chr7 (246-305)||(1049296-1049356)
chr7 (246-305)||(2935497-2935557)
chr7 (246-305)||(3035953-3036013)
chr7 (246-309)||(5817303-5817366)
chr7 (246-305)||(7351652-7351712)
chr7 (262-309)||(8153466-8153514)
chr7 (246-305)||(9027194-9027254)
chr7 (431-483)||(9190222-9190274)
chr7 (246-305)||(22108295-22108355)
chr7 (246-305)||(22137306-22137366)
chr7 (14-77)||(38671419-38671479)
chr7 (246-305)||(40550055-40550115)
chr7 (246-305)||(40552333-40552393)
chr7 (14-77)||(47676333-47676393)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (11-507)||(24741745-24742240)
chr4 (11-504)||(29760449-29760941)
chr4 (129-504)||(51520258-51520637)
chr4 (129-483)||(9224312-9224668)
chr4 (129-483)||(9229099-9229455)
chr4 (130-483)||(45347723-45348079)
chr4 (129-467)||(3813865-3814202)
chr4 (130-483)||(45357203-45357558)
chr4 (177-504)||(56146664-56146995)
chr4 (133-483)||(5732486-5732839)
chr4 (134-467)||(18855568-18855900)
chr4 (14-504)||(28468341-28468813)
chr4 (14-487)||(31985440-31985902)
chr4 (14-309)||(5396478-5396768)
chr4 (14-309)||(16623100-16623390)
chr4 (15-77)||(51520637-51520699)
chr4 (213-309)||(10047379-10047478)
chr4 (213-309)||(39245994-39246093)
chr4 (15-77)||(18712609-18712671)
chr4 (213-309)||(36315228-36315326)
chr4 (213-309)||(36329437-36329535)
chr4 (15-77)||(9224250-9224312)
chr4 (15-77)||(9229037-9229099)
chr4 (213-309)||(3796517-3796616)
chr4 (14-155)||(16628679-16628815)
chr4 (224-309)||(38152449-38152536)
chr4 (14-308)||(3777550-3777839)
chr4 (225-308)||(5143260-5143345)
chr4 (96-308)||(5147678-5147889)
chr4 (227-309)||(5269204-5269288)
chr4 (22-77)||(3814202-3814257)
chr4 (213-305)||(16630678-16630773)
chr4 (224-309)||(24333809-24333896)
chr4 (224-304)||(6743425-6743507)
chr4 (26-76)||(45347671-45347721)
chr4 (18-83)||(5112460-5112523)
chr4 (26-76)||(5732844-5732894)
chr4 (14-83)||(5269007-5269074)
chr4 (14-83)||(10047604-10047671)
chr4 (26-76)||(18855906-18855956)
chr4 (14-83)||(25861840-25861907)
chr4 (14-83)||(36315037-36315104)
chr4 (14-83)||(36329246-36329313)
chr4 (26-76)||(45357151-45357201)
chr4 (14-154)||(5143414-5143550)
chr4 (213-288)||(39774303-39774380)
chr4 (246-305)||(16931789-16931849)
chr4 (246-305)||(16934143-16934203)
chr4 (246-305)||(22780373-22780433)
chr4 (246-305)||(44599838-44599898)
chr4 (18-83)||(6743226-6743289)
chr4 (225-309)||(54867184-54867269)
chr4 (14-82)||(38152245-38152311)
chr4 (14-77)||(5429590-5429650)
chr4 (14-77)||(6542378-6542439)
chr4 (246-305)||(6765117-6765177)
chr4 (246-305)||(7941596-7941656)
chr4 (246-305)||(18709164-18709224)
chr4 (246-305)||(22782738-22782798)
chr4 (16-83)||(42599383-42599448)
chr4 (14-77)||(48142953-48143013)
chr4 (14-77)||(51336974-51337035)
chr4 (14-77)||(52082854-52082914)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (11-504)||(11098724-11099217)
chr2 (11-506)||(14291293-14291788)
chr2 (11-505)||(9296199-9296692)
chr2 (163-483)||(44312563-44312885)
chr2 (130-467)||(32246626-32246966)
chr2 (129-463)||(39811894-39812227)
chr2 (96-505)||(25398304-25398708)
chr2 (96-507)||(25403440-25403846)
chr2 (14-511)||(3491556-3492044)
chr2 (134-463)||(19344266-19344596)
chr2 (134-463)||(19349124-19349454)
chr2 (14-343)||(40738810-40739124)
chr2 (96-279)||(25407653-25407835)
chr2 (14-309)||(28258984-28259274)
chr2 (14-309)||(36757569-36757859)
chr2 (14-306)||(13569331-13569619)
chr2 (15-309)||(23078279-23078567)
chr2 (224-309)||(8040060-8040147)
chr2 (213-309)||(21629944-21630042)
chr2 (213-309)||(10445442-10445541)
chr2 (213-309)||(17865203-17865302)
chr2 (213-309)||(20522220-20522319)
chr2 (213-309)||(34682332-34682431)
chr2 (14-308)||(34388859-34389141)
chr2 (15-77)||(39811832-39811894)
chr2 (14-83)||(25409854-25409923)
chr2 (213-309)||(14699006-14699104)
chr2 (213-308)||(10707250-10707348)
chr2 (213-306)||(8390148-8390244)
chr2 (224-309)||(31056044-31056131)
chr2 (213-309)||(33528619-33528718)
chr2 (213-309)||(39482931-39483030)
chr2 (213-309)||(42039668-42039766)
chr2 (224-309)||(16940219-16940306)
chr2 (224-309)||(17010884-17010971)
chr2 (213-309)||(33118136-33118235)
chr2 (26-76)||(32246968-32247018)
chr2 (14-83)||(39483156-39483223)
chr2 (17-83)||(21630168-21630232)
chr2 (14-83)||(41586357-41586425)
chr2 (246-319)||(2838063-2838136)
chr2 (14-83)||(14698816-14698883)
chr2 (14-83)||(17865428-17865495)
chr2 (14-83)||(20522445-20522512)
chr2 (14-83)||(33118358-33118425)
chr2 (14-83)||(33528431-33528498)
chr2 (246-306)||(1345574-1345635)
chr2 (213-306)||(2869691-2869787)
chr2 (246-305)||(35215586-35215646)
chr2 (246-305)||(35217963-35218023)
chr2 (226-288)||(27149306-27149369)
chr2 (14-83)||(10445274-10445341)
chr2 (14-83)||(31056266-31056335)
chr2 (249-305)||(45332181-45332238)
chr2 (16-83)||(2869501-2869566)
chr2 (431-483)||(10445660-10445712)
chr2 (14-77)||(11151788-11151848)
chr2 (246-305)||(23452237-23452297)
chr2 (246-305)||(36558864-36558924)
chr2 (246-305)||(36561141-36561201)
chr2 (14-77)||(39284796-39284856)
chr2 (14-77)||(42362263-42362323)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (15-487)||(30631227-30631702)
chr5 (11-386)||(31180138-31180513)
chr5 (129-504)||(1457067-1457445)
chr5 (129-472)||(43592115-43592459)
chr5 (129-507)||(27449612-27449994)
chr5 (129-504)||(27444771-27445150)
chr5 (129-507)||(43598522-43598904)
chr5 (129-507)||(43604014-43604396)
chr5 (129-507)||(43609506-43609888)
chr5 (11-504)||(24135659-24136146)
chr5 (129-483)||(15044512-15044865)
chr5 (14-504)||(38219208-38219692)
chr5 (14-504)||(35387474-35387956)
chr5 (113-504)||(38191983-38192369)
chr5 (134-463)||(37556533-37556863)
chr5 (134-463)||(37561355-37561685)
chr5 (134-467)||(28807485-28807818)
chr5 (134-467)||(2785217-2785550)
chr5 (134-467)||(33791158-33791491)
chr5 (134-467)||(31396901-31397236)
chr5 (134-467)||(31401758-31402093)
chr5 (14-309)||(15464532-15464824)
chr5 (175-467)||(33768021-33768314)
chr5 (14-309)||(36932155-36932447)
chr5 (14-309)||(9353139-9353429)
chr5 (14-309)||(14520230-14520520)
chr5 (15-77)||(1457005-1457067)
chr5 (15-77)||(27445150-27445212)
chr5 (15-77)||(27449994-27450056)
chr5 (15-77)||(43592459-43592521)
chr5 (15-77)||(43598904-43598966)
chr5 (15-77)||(43604396-43604458)
chr5 (15-77)||(43609888-43609950)
chr5 (14-308)||(11916779-11917068)
chr5 (213-309)||(10281751-10281850)
chr5 (15-77)||(15044865-15044928)
chr5 (14-309)||(17003766-17004057)
chr5 (441-506)||(31180077-31180142)
chr5 (213-309)||(3880299-3880398)
chr5 (213-306)||(12084174-12084269)
chr5 (213-309)||(19588746-19588845)
chr5 (213-309)||(28832259-28832357)
chr5 (213-309)||(42127409-42127507)
chr5 (13-83)||(24553333-24553401)
chr5 (26-76)||(28807429-28807479)
chr5 (246-305)||(4410241-4410301)
chr5 (16-82)||(11181641-11181705)
chr5 (17-83)||(28832480-28832544)
chr5 (230-309)||(31300612-31300693)
chr5 (246-305)||(15552464-15552524)
chr5 (246-305)||(31179371-31179431)
chr5 (16-83)||(31300404-31300469)
chr5 (246-305)||(31542953-31543013)
chr5 (246-305)||(31545299-31545359)
chr5 (435-506)||(15464341-15464411)
chr5 (14-75)||(7160711-7160770)
chr5 (14-83)||(19588968-19589035)
chr5 (213-309)||(24553506-24553603)
chr5 (252-305)||(27910675-27910729)
chr5 (26-76)||(2785556-2785608)
chr5 (26-76)||(31396843-31396895)
chr5 (26-76)||(31401700-31401752)
chr5 (26-76)||(33768365-33768417)
chr5 (26-76)||(33791497-33791549)
chr5 (246-305)||(3373137-3373197)
chr5 (246-305)||(10749919-10749979)
chr5 (14-77)||(13488114-13488174)
chr5 (246-305)||(15354575-15354635)
chr5 (14-77)||(19806295-19806355)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (11-470)||(24787161-24787624)
chr1 (14-505)||(24202572-24203055)
chr1 (129-467)||(41398079-41398415)
chr1 (129-412)||(41390483-41390760)
chr1 (130-467)||(25444996-25445333)
chr1 (14-506)||(19361236-19361724)
chr1 (134-467)||(44023785-44024116)
chr1 (14-507)||(19358647-19359135)
chr1 (134-467)||(39445341-39445673)
chr1 (55-506)||(19379916-19380364)
chr1 (134-467)||(1054923-1055255)
chr1 (134-467)||(43988372-43988709)
chr1 (14-196)||(19366111-19366292)
chr1 (16-309)||(3281708-3281995)
chr1 (14-309)||(26644705-26644994)
chr1 (14-309)||(13604429-13604720)
chr1 (14-309)||(21536377-21536666)
chr1 (15-77)||(41398415-41398477)
chr1 (213-309)||(19072928-19073027)
chr1 (213-309)||(19120818-19120917)
chr1 (18-77)||(41390760-41390819)
chr1 (224-309)||(47703946-47704033)
chr1 (16-309)||(37069770-37070055)
chr1 (213-309)||(16124514-16124613)
chr1 (213-309)||(27104370-27104469)
chr1 (224-309)||(9476261-9476348)
chr1 (224-309)||(13598398-13598485)
chr1 (224-309)||(29651811-29651898)
chr1 (130-203)||(25439803-25439875)
chr1 (224-309)||(775672-775759)
chr1 (213-309)||(47098823-47098921)
chr1 (213-309)||(32889439-32889537)
chr1 (14-83)||(47098632-47098699)
chr1 (14-83)||(47102646-47102713)
chr1 (213-306)||(47102840-47102935)
chr1 (26-76)||(1054867-1054917)
chr1 (26-76)||(25439751-25439801)
chr1 (26-76)||(25444944-25444994)
chr1 (14-83)||(29652036-29652103)
chr1 (26-76)||(39445679-39445729)
chr1 (26-76)||(44023729-44023779)
chr1 (246-305)||(9459419-9459479)
chr1 (246-305)||(9463246-9463306)
chr1 (16-83)||(13598623-13598688)
chr1 (246-305)||(16226386-16226446)
chr1 (16-83)||(27104211-27104275)
chr1 (408-467)||(41386590-41386650)
chr1 (14-83)||(32889661-32889728)
chr1 (14-83)||(40816621-40816690)
chr1 (26-76)||(43988314-43988366)
chr1 (14-83)||(47703740-47703809)
chr1 (14-77)||(197105-197165)
chr1 (21-80)||(22819657-22819714)
chr1 (246-305)||(23786058-23786118)
chr1 (435-483)||(27104587-27104635)
chr1 (246-305)||(51752582-51752642)
[»] chr6 (57 HSPs)
chr6 (11-504)||(5674567-5675057)
chr6 (129-483)||(22010602-22010958)
chr6 (129-483)||(11856795-11857154)
chr6 (129-483)||(14737482-14737838)
chr6 (129-483)||(14742342-14742697)
chr6 (129-467)||(28184344-28184684)
chr6 (130-483)||(28155477-28155832)
chr6 (134-483)||(6438324-6438674)
chr6 (134-467)||(6005259-6005592)
chr6 (130-467)||(16838586-16838923)
chr6 (130-467)||(33330351-33330690)
chr6 (130-467)||(33335848-33336187)
chr6 (14-343)||(22708984-22709300)
chr6 (357-504)||(30125937-30126084)
chr6 (14-309)||(5757285-5757575)
chr6 (23-309)||(21356036-21356318)
chr6 (15-77)||(11857154-11857216)
chr6 (15-77)||(14737420-14737482)
chr6 (15-77)||(22010540-22010602)
chr6 (264-467)||(5343322-5343527)
chr6 (15-77)||(14742280-14742342)
chr6 (213-309)||(5572239-5572338)
chr6 (213-309)||(10077163-10077262)
chr6 (213-309)||(31086471-31086570)
chr6 (213-309)||(4629954-4630053)
chr6 (213-309)||(31979513-31979612)
chr6 (213-297)||(21801342-21801429)
chr6 (213-309)||(22963700-22963798)
chr6 (213-309)||(23824595-23824693)
chr6 (213-288)||(18232867-18232944)
chr6 (15-77)||(28184684-28184749)
chr6 (26-76)||(28155425-28155475)
chr6 (227-309)||(5017482-5017566)
chr6 (246-309)||(31936587-31936651)
chr6 (14-83)||(5017303-5017370)
chr6 (26-76)||(6438680-6438730)
chr6 (14-83)||(31936798-31936865)
chr6 (435-504)||(31936398-31936466)
chr6 (246-305)||(12195515-12195575)
chr6 (14-115)||(5572050-5572148)
chr6 (14-83)||(22963922-22963989)
chr6 (14-83)||(23824404-23824471)
chr6 (14-83)||(24435779-24435845)
chr6 (14-115)||(31979704-31979802)
chr6 (246-318)||(5273203-5273276)
chr6 (26-76)||(6005598-6005650)
chr6 (26-76)||(16838925-16838977)
chr6 (14-83)||(21801149-21801218)
chr6 (26-76)||(33330297-33330349)
chr6 (26-76)||(33335794-33335846)
chr6 (246-305)||(4816231-4816291)
chr6 (246-305)||(19704567-19704627)
chr6 (246-305)||(20915356-20915416)
chr6 (246-305)||(26932562-26932622)
chr6 (14-77)||(28137605-28137665)
chr6 (246-305)||(29754709-29754769)
chr6 (246-305)||(33309110-33309170)
[»] scaffold0135 (2 HSPs)
scaffold0135 (129-483)||(34967-35323)
scaffold0135 (15-77)||(34905-34967)
[»] scaffold0355 (5 HSPs)
scaffold0355 (129-467)||(9549-9883)
scaffold0355 (129-213)||(3754-3837)
scaffold0355 (15-77)||(3692-3754)
scaffold0355 (335-427)||(1-89)
scaffold0355 (42-77)||(9514-9549)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (14-507)||(17755-18241)
scaffold0188 (14-504)||(23848-24331)
[»] scaffold0464 (2 HSPs)
scaffold0464 (134-463)||(208-536)
scaffold0464 (26-76)||(542-592)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (134-467)||(148866-149199)
scaffold0028 (26-76)||(148808-148860)
[»] scaffold0197 (4 HSPs)
scaffold0197 (134-463)||(14219-14549)
scaffold0197 (134-467)||(19075-19408)
scaffold0197 (26-76)||(14161-14213)
scaffold0197 (26-75)||(19017-19068)
[»] scaffold0259 (2 HSPs)
scaffold0259 (134-467)||(2161-2494)
scaffold0259 (26-76)||(2103-2155)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (277-504)||(300-527)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (14-309)||(8224-8516)
scaffold0140 (246-305)||(22343-22403)
scaffold0140 (246-305)||(24618-24678)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (241-463)||(181980-182204)
scaffold0009 (26-76)||(176829-176881)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (14-309)||(36639-36929)
scaffold0087 (14-309)||(43768-44058)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (14-309)||(133086-133377)
scaffold0006 (224-309)||(5683-5770)
scaffold0006 (224-309)||(2492-2579)
scaffold0006 (16-83)||(5908-5973)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (14-308)||(85684-85973)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (213-309)||(10729-10828)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (227-309)||(45253-45337)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (246-305)||(269-329)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (408-467)||(34132-34192)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (246-279)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (246-305)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 6311598 - 6311100
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  6311598 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatcaaaag 6311499  T
Q  110 cttcctctagtgacttctctttt--agggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6311498 cttcctctagtgacttctcttttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgt-cttgtgtaaagcttgaaggc 6311400  T
Q  208 tagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311399 tagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 6311300  T
Q  308 ttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgtt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6311299 ttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgtt 6311200  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    |||||||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6311199 gtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 6311100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 30655946 - 30655446
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  30655946 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 30655847  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30655846 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgt-aagcttgaaggcta 30655748  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 308  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655747 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 30655648  T
Q  309 tctcggtg----ttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg--ttttg 402  Q
    ||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||  |||||    
T  30655647 tcttggtgttttttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttg 30655548  T
Q  403 ttgttgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaa 502  Q
    |||||| |||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30655547 ttgttg-ttgcttggaaaccattttgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagtttcaaccggattcacaa 30655450  T
Q  503 caat 506  Q
    ||||    
T  30655449 caat 30655446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 36979676 - 36979184
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  36979676 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttaggttgggaaaa-cattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 36979578  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36979577 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggcta 36979479  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 308  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979478 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 36979379  T
Q  309 tctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgtt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36979378 tcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtt 36979280  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    | |||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36979279 g-ttgcttggaaaccattttgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 36979184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 507
Target Start/End: Original strand, 18852964 - 18853460
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18852964 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaatattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 18853063  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18853064 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgcta 18853162  T
Q  210 gagtttcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 307  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853163 ttgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 18853262  T
Q  308 ttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggc-tgttttgttgt 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||||||| | |||| ||||    
T  18853263 ttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgt 18853361  T
Q  407 tgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaat 506  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18853362 tgtttgcttggaaaccatttgactcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtt--tcgttggtgtgagtttcaaccggattcacaacaat 18853459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 505
Target Start/End: Original strand, 18870358 - 18870850
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18870358 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 18870457  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18870458 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgcta 18870556  T
Q  210 gagtttcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 307  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18870557 ttgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatc 18870656  T
Q  308 ttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgtt 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||||||| ||||| |||||    
T  18870657 ttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggc-gtttt-ttgtt 18870753  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaa 505  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18870754 gtttgcttggaaaccatttaactcatagattaccattatctcttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaa 18870850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Original strand, 4759871 - 4760366
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaa-cattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  4759871 caaagggttgagtgtctttgtagagagagtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 4759970  T
Q  109 gcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggct 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4759971 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggct 4760069  T
Q  209 agagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 307  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760070 attgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 4760169  T
Q  308 ttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgt 406  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4760170 ttcttgatgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgt 4760269  T
Q  407 tgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    || |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4760270 tg-ttgcttggaaaccattttgctcattgattaccactatctctagctccacacatctttgtttttcattgatgtgagtttcaaccggattcacaaca 4760366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 11 - 481
Target Start/End: Original strand, 33037605 - 33038073
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  33037605 caaagggttgagtgtcttcgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 33037704  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33037705 cttcctctagtgtcttctcttt-agggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggcta 33037802  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037803 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 33037902  T
Q  310 ctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgtt--ttgttgtt 407  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33037903 cttggtgttttgttcttcttttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgtt 33038001  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgt 481  Q
    | |||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33038002 g-ttgcttggaaaccattttgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgttt-tcattggtgt 33038073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 492
Target Start/End: Original strand, 10688937 - 10689421
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa---ggaaggatctaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||    
T  10688937 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgggggaggatctaa 10689036  T
Q  108 agcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaagg 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10689037 agcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaagg 10689135  T
Q  207 ctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689136 ctattgtttcttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 10689235  T
Q  306 tcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgtt 404  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||| || |||||||    
T  10689236 tcttcttggtgttttgttcttcctttcttacttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgtt 10689334  T
Q  405 gttgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaacc 492  Q
    |||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10689335 gttg-ttgcttggaaaccattagactcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaacc 10689421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 129 - 504
Target Start/End: Original strand, 7289831 - 7290210
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7289831 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 7289929  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289930 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 7290029  T
Q  329 -tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  7290030 ttttatcacttatcttgtttatggtttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttg 7290129  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtgagttt-caaccagattcacaaca 504  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  7290130 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcaatgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 7290210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 129 - 467
Target Start/End: Original strand, 25328184 - 25328521
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25328184 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 25328281  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttc--tt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25328282 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttt 25328381  T
Q  327 cctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
    |||||   | |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25328382 cctttaccgtttatctcgtttatgttttggtatctc-ttgtgtggttttgctatacactagt-tagggttgttttgttgttgttggcttggagaccattt 25328479  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |  ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25328480 gttctcattgattatcactatcacttgctccgcacatcattg 25328521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 504
Target Start/End: Original strand, 1261757 - 1262238
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  1261757 agggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 1261855  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| | ||||   |    
T  1261856 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgtacttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 1261953  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  1261954 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatcttttt 1262053  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||  |||||   |||||  || || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  1262054 ggtgtgtttgttcttcctttctatcttatcttgtt--tgc-ttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 1262146  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    ||||| |||| || ||  ||||||||||||||||  || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1262147 tgcttggaga-cactttactcatagattaccactcccttttactccacacatctttgttt-tcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 1262238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 487
Target Start/End: Original strand, 31071035 - 31071498
Alignment:
Q  17 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttcctc 116  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  |||||||||| ||||||||||    
T  31071035 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcttaagcttcctc 31071133  T
Q  117 tagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttc 216  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   ||||    
T  31071134 ttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-tttc 31071231  T
Q  217 ttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcgg 314  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||    
T  31071232 ttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctttttgg 31071331  T
Q  315 tgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtttg 412  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |  ||   |||||  || || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  31071332 tgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttggt--tgctttgtatttgct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttg 31071425  T
Q  413 cttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagttt 487  Q
    ||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31071426 cttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttt 31071498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Original strand, 39784734 - 39785063
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  39784734 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 39784830  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 329  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  39784831 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 39784929  T
Q  330 ttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-g 428  Q
    ||   ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||      
T  39784930 ttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgtt 39785028  T
Q  429 ctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39785029 ctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 39785063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26288184 - 26287712
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  26288184 agggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 26288086  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  26288085 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaac-acaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 26287989  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||          |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26287988 ttcttgtaac----------actttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 26287899  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |  ||   |||||  || || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  26287898 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttggt--tgctttgtatttgct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 26287805  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaa 505  Q
    ||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  26287804 tgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttatccgaattcacaacaa 26287712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26313435 - 26312963
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  26313435 agggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 26313337  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  26313336 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaac-acaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 26313240  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||          |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26313239 ttcttgtaac----------actttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 26313150  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |  ||   |||||  || || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  26313149 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttggt--tgctttgtatttgct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 26313056  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaa 505  Q
    ||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  26313055 tgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttatccgaattcacaacaa 26312963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26301441 - 26301123
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  26301441 agggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 26301343  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  26301342 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaac-acaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 26301246  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||          |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26301245 ttcttgtaac----------actttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 26301156  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttg 344  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26301155 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttg 26301123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 35745566 - 35745233
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  35745566 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 35745470  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  35745469 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 35745371  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  35745370 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 35745274  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  35745273 cactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 35745233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Original strand, 10684174 - 10684504
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  10684174 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgta 10684270  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttc 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||    
T  10684271 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttc 10684370  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttg-tttgcttagagaccattt 426  Q
     ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  10684371 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccattt 10684466  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10684467 gcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 10684504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7412630 - 7412305
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||||||    
T  7412630 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattgaaaggatcaaaagcttc 7412534  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || |  || ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | | ||       
T  7412533 cttttatgtcttctctt--agggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttat-- 7412440  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttc 310  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  7412439 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttc 7412340  T
Q  311 tcggtgt-tttgttcttcctttc-ttgcttatctt 343  Q
      ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  7412339 atggtgtgtttgttccttctttcattgcttatctt 7412305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 19175561 - 19175851
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||| |||| |||    
T  19175561 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggattgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcactattggaaggatcaaaagtttc 19175657  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| || || | ||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||       
T  19175658 cttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtggg-aaacacaaatgtgtagaagttaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaggctatt- 19175752  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19175753 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4456318 - 4456028
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |   |||||||| ||||||||    
T  4456318 agggttgagtgtctctgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattagaaggatcaaaagcttc 4456222  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||  || || ||||||||  || |  |||||||||||||| |||||   ||||       
T  4456221 cttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgggtaac-acaaatgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaa-gcttgccagctat-- 4456127  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4456126 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatctt 4456028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 7289769 - 7289831
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289769 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 7289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403327
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26403327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 23799383 - 23799674
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaa-gctt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||| ||| | ||||  |  ||||||||| ||| ||||    
T  23799383 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggggaa--cattgtaaacaccttgagtagggag-atttcaccattggaaggatcaaaaagctt 23799479  T
Q  113 cctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctaga 211  Q
    ||| | |||  ||| |||  ||| |||||||||||| ||||||  |  || ||| ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||      
T  23799480 ccttttgtgttttccctt--aggattcatattgtgacagtgggtgac-acaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgtaagctaa- 23799574  T
Q  212 gtttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23799575 -tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 23799673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 25327996 - 25328058
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25327996 gggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 25328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 25328122 - 25328184
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328122 gggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 25328184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696693
Alignment:
Q  227 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatctt 4696693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6127320 - 6127224
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  6127320 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 6127224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 5702481 - 5702580
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5702481 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5702580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 307
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 19752393 - 19752491
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19752393 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19752491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 4696415 - 4696482
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4696415 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 4696482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 39784678 - 39784728
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784678 ctttgatgagagagtctcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 39784728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 5702287 - 5702354
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5702287 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaatattgtaaacaccttgggtagtgag 5702354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26301030 - 26300955
Alignment:
Q  431 catagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaatt 507  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  26301030 catagattaccacttccttttgctccacgcatctttgttta-cattggtgtgagttttatccgaattcacaacaatt 26300955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 43079877 - 43079937
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43079877 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 43082248 - 43082308
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43082248 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6813750 - 6813683
Alignment:
Q  243 tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  6813750 tattggattggagagctgctctctcccctagtgtaggttatattggaccgaactgggttaacaatctt 6813683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Original strand, 9054231 - 9054294
Alignment:
Q  18 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||| ||||| | |||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9054231 ttgagtgtttttgtagtgagattctcttgggttgg--aaaacattataatcaccttgggtagtgag 9054294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 19752201 - 19752268
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19752201 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgtg--aaatattgtaaacaccttgggtagtgag 19752268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 288
Target Start/End: Original strand, 9054835 - 9054912
Alignment:
Q  213 tttcttgtaacct-tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 288  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  9054835 tttcttgtaaccactttgtatcactttcatcttagtggattagagagctgctctctcctccagagtaggtcatattgg 9054912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 10684116 - 10684168
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10684116 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 10684168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 279
Target Start/End: Original strand, 18810982 - 18811015
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810982 tggattggagggctgctctctcccccagattagg 18811015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 26403034 - 26403103
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  26403034 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 26403103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 35745624 - 35745572
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35745624 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 35745572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 4731569 - 4731629
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  4731569 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 4731629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 15212697 - 15212757
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15212697 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 15212757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 33352061 - 33352121
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  33352061 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 33352121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 43036334 - 43036394
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  43036334 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 43036394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 44721118 - 44721178
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  44721118 tggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44721178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 7167545 - 7167051
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaa-cattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  7167545 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 7167446  T
Q  109 gcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggct 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7167445 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggct 7167347  T
Q  209 agagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 307  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167346 attgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 7167247  T
Q  308 ttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgtt 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167246 ttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttgttgtt 7167147  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    | |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7167146 g-ttgcttggaaaccattttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 7167051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 505
Target Start/End: Original strand, 28503662 - 28504146
Alignment:
Q  12 aaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaagc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  28503662 aaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaatattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagc 28503761  T
Q  111 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28503762 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctag 28503861  T
Q  211 agtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503862 agtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttc 28503961  T
Q  311 tcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtt 410  Q
    ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  28503962 tcggtgttttgttcttcctt---------tcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggctgttttgttgttg-t 28504051  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaa 505  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  28504052 tgcttggaaaccatttttctcatagattatcactaccttttgctccacacatcattgttattcattggtgtgagttaagaccggattcacaacaa 28504146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 506
Target Start/End: Original strand, 2671383 - 2671878
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  2671383 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 2671482  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |  |||    
T  2671483 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttggtcttgtgtaa-gcttgcaatcta 2671581  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 308  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671582 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 2671681  T
Q  309 tctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgtt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2671682 tcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgtt 2671780  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaat 506  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2671781 gtttgcttggagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaat 2671878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Original strand, 9091098 - 9091592
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaa-ggatctaaag 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  9091098 caaagggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgaaaggatctaaag 9091197  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9091198 cttcctctagtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggcta 9091296  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 308  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091297 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 9091396  T
Q  309 tctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtgg-atttactatacactagtctagggctg-ttttgttgt 406  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||  | || || |||||||||| | |||||||||    
T  9091397 tcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgt 9091495  T
Q  407 tgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  9091496 tatttgcttggaaaccatttgactcatagattaccactatttcttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagtctcaaccgaattcacaaca 9091592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 504
Target Start/End: Original strand, 8738864 - 8739354
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaa-ggatctaaagcttc 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  8738864 gggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgaaaggatctaaagcttc 8738963  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  8738964 ctctagtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgt 8739062  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8739063 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt 8739162  T
Q  313 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtgg-atttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||  | || || |||||||||| | |||||||||| ||    
T  8739163 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatt 8739261  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8739262 tgcttggaaaccatttgactcatagattaccactatttcttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagtctcaaccgaattcacaaca 8739354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 506
Target Start/End: Original strand, 40372593 - 40373087
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  40372593 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 40372692  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||    
T  40372693 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattatgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagcta 40372791  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 308  Q
       |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372792 tt-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 40372890  T
Q  309 tctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggct-gttttgttgtt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    |  |||| |||  | |  ||   |  ||||| ||||    
T  40372891 tcttggtgttttgttcttcctatcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctatgtgaaattaaactaaacaaaaataaagaaatatttttgatgtt 40372989  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaat 506  Q
    |||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40372990 gtttgcttggaaaccattttgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgttt-tcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaat 40373087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Original strand, 22173100 - 22173456
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22173100 ttttagggttcatattaggagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 22173198  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173199 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 22173298  T
Q  329 tttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
    |||    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22173299 ttttaccgcttatcttattt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 22173397  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22173398 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 22173456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 8477664 - 8477171
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcatta-aaggaaggatctaaag 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  8477664 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 8477565  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagt-ggggaaataccaaagggtagaatctagggtttg-ttcttgtgtaaagcttgaaggc 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||| | ||    
T  8477564 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttattgtgt-aagcttgcaagc 8477466  T
Q  208 tagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaat 306  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477465 tattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaat 8477366  T
Q  307 cttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggct-gttttgtt 404  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||||  ||  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8477365 cttcttggtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattatctt--tgtggtgttgttctacactagtctagggctggttttgtt 8477270  T
Q  405 gttgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttca-accagattcacaac 503  Q
    |||| |||||| |  | | |||  ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  8477269 gttg-ttgcttgggaaactttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagttttataccggattcacaac 8477172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 266
Target Start/End: Original strand, 28501495 - 28501750
Alignment:
Q  12 aaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaagc 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  28501495 aaagggatgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaagc 28501594  T
Q  111 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28501595 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctag 28501694  T
Q  211 agtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501695 agtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 133 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 18656609 - 18656256
Alignment:
Q  133 agggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  18656609 agggtttatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagagt--cttgtaaccttttgtaa 18656513  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg----ttttgttc-tt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||||| ||    
T  18656512 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttcttt 18656413  T
Q  327 cctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
    |||||   | ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18656412 cctttaccgtttatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggtttttctatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccattt 18656315  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgt-ttatcattggtgtga 483  Q
    |  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18656314 gttctcattgattaccaccatcacttgctccacacatcattgtattttcattggtgtga 18656256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 1306239 - 1305761
Alignment:
Q  17 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttcctc 116  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  |||||||||| ||||||||||    
T  1306239 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcttaagcttcctc 1306141  T
Q  117 tagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttc 216  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||| |  |||   ||||    
T  1306140 ttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgt-aagcttgcaaacta-tttttc 1306043  T
Q  217 ttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggt 315  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1306042 ttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ttggt 1305944  T
Q  316 gt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtttgc 413  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |  ||   |||||  || || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1305943 gtgtttgttcttcctttcttgcttatcttggt--tgctttgtatttgct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-ttgc 1305850  T
Q  414 ttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    || |||| || ||  | ||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  1305849 ttggaga-cactttacacatagattaccacttctttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttatccgaattcacaaca 1305761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 26928395 - 26928721
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  26928395 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtaatgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 26928491  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||   |    
T  26928492 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgt-aagcttgcaagctatttt 26928590  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26928591 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 26928689  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 343  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  26928690 ggtgtgtttgttctttctttctagcttatctt 26928721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 32143613 - 32143133
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  32143613 agggttgagtgtctttgtagtgatgatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 32143517  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  32143516 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 32143419  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttct 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| |    
T  32143418 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt-t 32143320  T
Q  312 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgt 409  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  |  ||   |||||  || || |||||||| ||||| ||| |||||||||||     
T  32143319 tggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatct--ttattgctttgtatttgct---tgtggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttg- 32143226  T
Q  410 ttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    |||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  32143225 ttgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttatccgaattcacaaca 32143133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 467
Target Start/End: Original strand, 2676993 - 2677331
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||    
T  2676993 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 2677089  T
Q  228 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 324  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  2677090 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 2677188  T
Q  325 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagacca 423  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  2677189 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggcca 2677286  T
Q  424 tttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  2677287 tttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 2677331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 467
Target Start/End: Original strand, 2672837 - 2673175
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttt 227  Q
    |||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||    
T  2672837 tttaaggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 2672933  T
Q  228 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 324  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  2672934 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 2673032  T
Q  325 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagacca 423  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  2673033 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggcca 2673130  T
Q  424 ttt-ggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |||   ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  2673131 tttactctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 2673175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8512392 - 8512057
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8512392 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgta 8512296  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttc 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  8512295 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttc 8512196  T
Q  328 ctttcttg-cttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
     ||| | |  ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| | | ||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  8512195 gtttatcgttttatcttg--tatgc-ttgttaactcttagtgtggttgtgctacacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccattt 8512099  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  8512098 gctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 8512057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8517272 - 8516937
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  8517272 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgta 8517176  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttc 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  8517175 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttc 8517076  T
Q  328 ctttcttg-cttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
     ||| | |  ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| | | ||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  8517075 gtttatcgttttatcttg--tatgc-ttgttaactcttagtgtggttgtgctacacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccattt 8516979  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  8516978 gctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 8516937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27453224 - 27452924
Alignment:
Q  40 tctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttc 139  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  27453224 tctcttgggttggcaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctcttttagggttc 27453128  T
Q  140 atattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc 239  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27453127 atattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaaataggaattgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-tttcttgtaaccctttgtaacactttc 27453030  T
Q  240 -tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgc 336  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||    
T  27453029 atcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt-ttggtgtgtttgttccttctttcttgc 27452931  T
Q  337 ttatctt 343  Q
    |||||||    
T  27452930 ttatctt 27452924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 130 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24968286 - 24967957
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||    
T  24968286 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaagtaccaaagggtaga-tctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 24968190  T
Q  228 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  24968189 tgtaacacattcacatattggattggagagctactctctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt 24968091  T
Q  325 -ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagacca 423  Q
     ||| ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  24968090 tttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggcca 24967994  T
Q  424 tttg-gctcatagattaccactatctcttgctccaca 459  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  24967993 tttgcactcatagattatctctatcacttgctccaca 24967957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 175 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32475618 - 32475330
Alignment:
Q  175 tctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 273  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475618 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 32475522  T
Q  274 attaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||    
T  32475521 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgt 32475425  T
Q  370 ggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttg-tttgcttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    |||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| || | || ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32475424 ggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 32475330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 175 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32480476 - 32480188
Alignment:
Q  175 tctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 273  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480476 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 32480380  T
Q  274 attaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||    
T  32480379 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgt 32480283  T
Q  370 ggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttg-tttgcttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    |||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| || | || ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32480282 ggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 32480188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 27974748 - 27975039
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  27974748 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtcgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 27974844  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  27974845 cttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagaatggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt- 27974940  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27974941 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 27986252 - 27986567
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  27986252 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 27986348  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    || | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||| | |||    |    
T  27986349 cttttgtgtcttctcttttagggttgatattgagagagt-gggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgt-aagcttgcaagct----t 27986442  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttct 311  Q
    || |       | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  27986443 tttt-------tcttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt-t 27986534  T
Q  312 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 343  Q
     ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  27986535 tggtgtgtttgttcattctttcttgcttatctt 27986567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 16264639 - 16264350
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    ||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  16264639 agggttgagtgtctttgtaatgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 16264543  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||  || || | ||||||  ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||       
T  16264542 cttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgggtaac-acaaatgtgtagaaattaggtcttgttcttgtggaa-gcttgcaagctat-- 16264449  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16264448 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 8370285 - 8370573
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| |||| |||    
T  8370285 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagtttc 8370381  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    || | |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||  |  || || ||||||||  || |  |||||||||||||| ||||  | ||||   |    
T  8370382 cttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgac-acaaatgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaa-gcttttaagctaa--t 8370475  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8370476 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36029383 - 36029094
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  36029383 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 36029287  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | |||  |||||||  ||| |||||||| |||||||| |  |  || ||| ||||||||  ||||  |||||||||||||| | ||| | ||||       
T  36029286 cttttgtgttttctctt--aggattcatattttgagagtgagtgac-acaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gtttgtaagctaa-- 36029193  T
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36029192 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207775
Alignment:
Q  261 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctttcttgctt-atcttgtttatgctttgt 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  | |||| || || |||||||| |||||| ||    
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttt-gttcttttcttttcatggtttatcttgtt-atgctt-gt 10207887  T
Q  357 tatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctc 455  Q
    || ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||    
T  10207886 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctc 10207787  T
Q  456 cacacatcattg 467  Q
    ||||||||||||    
T  10207786 cacacatcattg 10207775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 40592578 - 40592869
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaa-gctt 112  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||| ||||    
T  40592578 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagctt 40592674  T
Q  113 cctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctaga 211  Q
    ||| | |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||  |  || ||| ||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||| | ||||      
T  40592675 ccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgac-acaaaatgggtagaaattagattttgttcttgtgtaa-gcttgtaagctaa- 40592769  T
Q  212 gtttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40592770 -tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 40592868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 33386471 - 33386753
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  33386471 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgagaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 33386567  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||| |  |||       
T  33386568 cttttgtgtcttctcttttagggttcattattgagagagt-gggaaacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgt-aagcttgcaaacta--- 33386662  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||         | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  33386663 ttt--------ttcttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 6794511 - 6794800
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    ||||||||||||| |||| | |||  ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  |||| || | ||||||||    
T  6794511 agggttgagtgtcattgtagtgaggttctcttgagttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaatgaacaaaagcttc 6794607  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    || | ||   |||||||  |||||||||||||||||||||||  |  || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | |||| | |    
T  6794608 cttttgtattttctctt--agggttcatattgtgagagtgggtgac-acaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagcta-att 6794702  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  6794703 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatctt 6794800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21711512 - 21711223
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  21711512 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgagtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 21711416  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtg-gggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | |||  |||||||  ||| |||||  | |||||||| ||| || || || ||||||||  ||||  ||| |||||||||| ||||  | ||||       
T  21711415 cttttgtgttttctctt--aggattcattat-tgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaa-gcttttaagctaa-- 21711322  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21711321 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21711223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 22173038 - 22173100
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173038 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 22173100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 18552871 - 18552970
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18552871 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 18552970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 306
Target Start/End: Original strand, 1736293 - 1736389
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1736293 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 30709778 - 30709877
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30709778 tttcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 3715990 - 3716089
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3715990 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 3716089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 48438313 - 48438214
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  48438313 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatctt 48438214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1309878 - 1309683
Alignment:
Q  285 ttggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactataca 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |  ||   |||||  || || ||||    
T  1309878 ttggctgaactgggtcaacaatctttt-ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttggt--tgctttgtatttgct---tgtggtgttgctctaca 1309785  T
Q  384 ctagtctagggctg-ttttgttgttgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtg 482  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1309784 ctagactagggctgtttttgttgttg-ttgcttgaaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtg 1309688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25795880 - 25795781
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25795880 tttcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26299087 - 26298988
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26299087 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 26298988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Original strand, 1417493 - 1417577
Alignment:
Q  227 ttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1417493 ttgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 1417577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 47923894 - 47923993
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47923894 tttcttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatctt 47923993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35925768 - 35925483
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  35925768 agggttgaatgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 35925672  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    || | |||  |||||||  ||| |||||||||||||||| |||  | || || ||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||  |  ||  | |    
T  35925671 cttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagt-gggtgacacaaatgggtagaaattaggttttgttctagtgt-aagcttataaact--aat 35925578  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   | | |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  35925577 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagaactgc---ccctcccaaattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 35925483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37466389 - 37466291
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  37466389 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatctt 37466291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  227 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40844750 - 40844652
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  40844750 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatctt 40844652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 3328345 - 3328443
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3328345 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatctt 3328443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 4386773 - 4386840
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4386773 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaatcaccttgagtagtgag 4386840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18656664 - 18656614
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656664 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 18656614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Original strand, 4386947 - 4387014
Alignment:
Q  243 tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  || |||||||| |||||||||    
T  4386947 tattggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatactgaactaaactgggtaaacaatctt 4387014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 24695152 - 24695251
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  24695152 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 24695251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 1736100 - 1736167
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  1736100 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctattgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 1736167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 3323487 - 3323554
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  3323487 agggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 3323554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 3328153 - 3328220
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3328153 agggttgaatgtctttgtagtgagcttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 3328220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 24694962 - 24695029
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24694962 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtggtgag 24695029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 26299278 - 26299211
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  26299278 agggttgaatgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 26299211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 39032351 - 39032485
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  39032351 agggttgagtgtctttgtagtgaga-tctcttgggttggtaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaagcttc 39032446  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtg 153  Q
    || | ||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  39032447 cttttgtgtcttctc--ttagggttcatcattgagagagtg 39032485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Original strand, 47923704 - 47923767
Alignment:
Q  18 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  47923704 ttgagtgtctttgtagtgagaatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 47923767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 288
Target Start/End: Original strand, 3323679 - 3323755
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 288  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3323679 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgg 3323755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23392167 - 23392106
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23392167 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggt 23392106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 38210569 - 38210629
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38210569 tggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 50494198 - 50494258
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 50494258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 53894119 - 53894055
Alignment:
Q  242 atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  53894119 atattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 53894055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 8126917 - 8126853
Alignment:
Q  17 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    ||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  8126917 gttgagtgtctttgtagtgaggttttcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 8126853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 2672783 - 2672835
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2672783 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 2672835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 2676939 - 2676991
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2676939 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 2676991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 8512450 - 8512398
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8512450 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 8512398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 8517330 - 8517278
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8517330 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 8517278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 10274646 - 10274605
Alignment:
Q  42 tcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  10274646 tcttgggttgggaaacacattatattcaccttgggtagtgag 10274605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23410587 - 23410529
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttg 74  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  23410587 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttg 23410529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24968340 - 24968288
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24968340 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 24968288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 458483 - 458543
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  458483 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaa 458543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 5236713 - 5236653
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  5236713 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 5236653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6063504 - 6063444
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||| ||||    
T  6063504 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaa 6063444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10621588 - 10621528
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  10621588 tggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaa 10621528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22835259 - 22835199
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22835259 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgtgttgggaaa--cattgtaatcaccttgggt 22835199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27452841 - 27452786
Alignment:
Q  431 catagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagttt 487  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  27452841 catagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgttagttt 27452786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 487
Target Start/End: Original strand, 27986649 - 27986704
Alignment:
Q  431 catagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagttt 487  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27986649 catagattaccacttccttttgctccatacatctttgttta-cattggtgtgagttt 27986704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153357
Alignment:
Q  262 tctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 39153357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 39153618 - 39153558
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  39153618 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 39153558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 40734409 - 40734469
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  40734409 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 40734469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Original strand, 20357344 - 20357837
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  20357344 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 20357443  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20357444 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 20357543  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357544 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 20357643  T
Q  310 ctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgtt 407  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20357644 cttggtattttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtt 20357741  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20357742 gttagcttggagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 20357837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 2058268 - 2057765
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa---ggaaggatctaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||    
T  2058268 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgggggaggatctaa 2058169  T
Q  108 agcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaagg 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  2058168 agcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaatg 2058070  T
Q  207 ctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058069 ctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 2057970  T
Q  306 tcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttg----tttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-tt 399  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||||||| | ||    
T  2057969 tcttcttggtgttttgttcttccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggttt 2057870  T
Q  400 ttgttgttgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattca 499  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2057869 ttgttgttgtttgcttggaaaccatttgactcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccggattca 2057770  T
Q  500 caaca 504  Q
    |||||    
T  2057769 caaca 2057765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 508
Target Start/End: Original strand, 1533241 - 1533734
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  1533241 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcaccattggaaggatctaaagc 1533340  T
Q  111 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttg-ttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||||    
T  1533341 ttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgt-aagcttgcaagcta 1533439  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 308  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533440 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 1533539  T
Q  309 tctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggct-gttttgttgt 406  Q
    | | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||  |||||  || || |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  1533540 tattggtgtgtttgttctttctttcttgcttatattgtt--tgctttgtattctctt--tgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgt 1533635  T
Q  407 tgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaat 506  Q
    || |||||| || | | |||  ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1533636 tg-ttgcttgga-aacttttttctcattgattaccactatattttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaat 1533732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 128 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 12406512 - 12406155
Alignment:
Q  128 cttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12406512 cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaaccttt 12406414  T
Q  228 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12406413 tgtaacactttctcatattggattggagagctattctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttt 12406314  T
Q  328 ctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
    ||||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12406313 cttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccattt 12406215  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12406214 gttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 12406155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 12397091 - 12396735
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  12397091 ttttagggttcatattgtgatagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagagtt-cttgtaacctttt 12396993  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt-c 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12396992 gtaacactttctcatattggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 12396893  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
    ||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12396892 ctttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 12396794  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12396793 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 12396735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Original strand, 24024232 - 24024589
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  24024232 ttttagggttcatcgtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacatttt 24024329  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg-ttttgttctt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  24024330 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttctt 24024429  T
Q  327 cc-tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatt 425  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24024430 ccttttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatatactagtcataggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatt 24024528  T
Q  426 tg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24024529 tgttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 24024589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 21640102 - 21639620
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  21640102 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 21640004  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  21640003 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 21639906  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21639905 ttcttgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 21639806  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtt 410  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   |||||  || || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21639805 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 21639712  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    ||||| |||| || ||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  21639711 tgcttggaga-cactttactcatagattaccactcccttttgctccacacatctttgttta-cattgatgtgagttttaatcggattcacaaca 21639620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Original strand, 31109489 - 31109844
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31109489 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 31109586  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31109587 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttc 31109686  T
Q  328 c-tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31109687 cttttcttgtttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 31109784  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
    |  ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31109785 gttctcattgattatcactatcacttgctgcacacatcattgtttatttcattggtgtga 31109844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21646300 - 21645815
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||| ||||    
T  21646300 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaatcttc 21646202  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  21646201 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 21646104  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21646103 ttcttgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 21646004  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtt 410  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||||   |||||  || || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21646003 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgttttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 21645910  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaatt 507  Q
    ||||| |||| || ||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21645909 tgcttggaga-cactttactcatagattaccactcccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttaaccggattcacaacaatt 21645815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 220 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 4866820 - 4866553
Alignment:
Q  220 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866820 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttt 4866721  T
Q  320 tgttcttcctttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggattta-ctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttag 417  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4866720 tgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttgg 4866622  T
Q  418 agaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4866621 agaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 4866553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 18409056 - 18408575
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |    |||||||| |||||||    
T  18409056 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattaaaaggatcttaagcttc 18408958  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| | | ||   |    
T  18408957 ctcttgtgtcttc-cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttatt-t 18408861  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18408860 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 18408762  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtt 410  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||  |||||  || || |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |    
T  18408761 ggtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttgtt--tgctttg-tatttgtt--tgtggtgttgctctacactagactacggctgtttttgttgttg-t 18408668  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaa 505  Q
    ||| | |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  18408667 tgcgtggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttatccgaattcacaacaa 18408575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18413932 - 18413450
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||  |  |||||||||| |||||||    
T  18413932 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacaatgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcttaagcttc 18413834  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |  |||   |    
T  18413833 ctcttgtgtcttc-cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgt-aagcttgcaatcta-ttt 18413737  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18413736 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 18413639  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtt 410  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |  ||   |||||  || || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  18413638 ggtgtgtttgttctttctttcttgcttatcttggt--tgctttgtatttgct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 18413545  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaatt 507  Q
    ||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  18413544 tgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctcctcacatctttgttta-cattggtgtgagttttatccgaattcacaacaatt 18413450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19992487 - 19992158
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  19992487 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 19992391  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  19992390 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 19992291  T
Q  330 ttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-g 428  Q
    ||   | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||| ||  |||||||      
T  19992290 ttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagccatttgtt 19992193  T
Q  429 ctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19992192 ctcattgattatcactatcacctgctccacacatc 19992158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Original strand, 21812149 - 21812478
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagctt-ga-aggctagagtttcttgtaaccttttgta 231  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||  |||| |||||||||||    
T  21812149 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagagt--cttggaaccttttgta 21812245  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcc 328  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||     
T  21812246 agactt-cacatattggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttct 21812344  T
Q  329 tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg- 427  Q
    |||   | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||     
T  21812345 tttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttaactctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgttagcttggaagccatttgc 21812442  T
Q  428 gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21812443 tctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 21812478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Original strand, 24266112 - 24266442
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  24266112 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgta 24266208  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttc 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||    
T  24266209 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttc 24266308  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttg-tttgcttagagaccattt 426  Q
    |||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  24266309 ctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccattt 24266404  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24266405 gcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 24266442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Original strand, 24261233 - 24261563
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  24261233 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgta 24261329  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttc 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||    
T  24261330 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttc 24261429  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttg-tttgcttagagaccattt 426  Q
     ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  24261430 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccattt 24261525  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24261526 gcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 24261563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 175 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16880207 - 16879918
Alignment:
Q  175 tctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 273  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880207 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 16880110  T
Q  274 attaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||    
T  16880109 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgt 16880013  T
Q  370 ggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttg-tttgcttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    |||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16880012 ggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 16879918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 175 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16885063 - 16884774
Alignment:
Q  175 tctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 273  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16885063 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 16884966  T
Q  274 attaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||    
T  16884965 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgt 16884869  T
Q  370 ggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttg-tttgcttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    |||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16884868 ggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 16884774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21983536 - 21983285
Alignment:
Q  56 aaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggg 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  |||||||||  ||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21983536 aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcataagcttccttttgtgttttctcttt-agggttcatattttgagagtggg 21983439  T
Q  156 gaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacc--ttttgtaacactttc-tcatattggatt 251  Q
      |  || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21983438 tgac-acaaaatgggtagaaactaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat--tttcttgtaactctttttgtaacactttcatcatagtggatt 21983343  T
Q  252 ggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983342 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29160096 - 29159803
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaa-gct 111  Q
    ||||||||||||||| | | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||| |||    
T  29160096 gggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaacattggaaggatcaaaaagct 29160000  T
Q  112 tcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctag 210  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||| || | |  || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||     
T  29159999 tccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgtaagctaa 29159903  T
Q  211 agtttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatc 307  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  29159902 --tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 29159805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12397153 - 12397091
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397153 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 12397091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 31109427 - 31109489
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109427 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 31109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2479626 - 2479337
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  2479626 agggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 2479530  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || |  |  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  | ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  2479529 cttttatatcttctcttt-agggttcattattgagagagtggg-aaacacacatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat-- 2479435  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  2479434 tttcttataactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4873370 - 4873310
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873370 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 4873310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12406573 - 12406513
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406573 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 12406513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 309
Target Start/End: Original strand, 44848570 - 44848781
Alignment:
Q  96 ggaaggatctaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgt 194  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| || |||||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||  ||||  || |||||||||    
T  44848570 ggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctcttt-agagttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttattcttgtgt 44848667  T
Q  195 aaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctga 292  Q
    || ||||| | |||    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | ||    
T  44848668 aa-gcttgcaagcttt--tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccga 44848764  T
Q  293 actgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||||    
T  44848765 actgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 46516308 - 46516407
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46516308 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 46516407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49091760 - 49091661
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49091760 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatctt 49091661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 24024170 - 24024232
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24024170 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttggaaaaacattgtaatcaccgtgggt 24024232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 2647694 - 2647793
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2647694 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatctt 2647793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 33332448 - 33332547
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  33332448 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt 33332547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 9190007 - 9190105
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9190007 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9190105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20284187 - 20284089
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20284187 tttcttgtaacgcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 20284089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2580531 - 2580390
Alignment:
Q  167 gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctc 265  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |||||||||||   ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  2580531 gggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat--tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctc 2580435  T
Q  266 tcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  2580434 tcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 2580390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 56046 - 55948
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  56046 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 55948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21989194 - 21988909
Alignment:
Q  18 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttcctct 117  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |  |  |||||||||  ||||||||| |    
T  21989194 ttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-attttaccattggaaggatcataagcttccttt 21989098  T
Q  118 agtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttc 216  Q
    | ||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||  |  || ||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| |  |||   ||||    
T  21989097 attgttttctcttt-agggttcatatttttagagtgggtgac-acaaaatgggtagaaactaggttttattcttgtataa-gcttgcaatctat--tttc 21989003  T
Q  217 ttgtaacc--ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
    |||||||   ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21989002 ttgtaactctttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctc--ctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960816
Alignment:
Q  226 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatctt 35960816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185262
Alignment:
Q  227 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9185262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 28617258 - 28617356
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttg--ttcttcctttcttgcttatc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||   ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  28617258 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaatatt---ggtgtgtttgttttcttcctttcttgcttatc 28617354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 4796665 - 4796764
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||||    
T  4796665 tttcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatctt 4796764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 20284379 - 20284312
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20284379 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 20284312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 23402820 - 23402887
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23402820 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 23402887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 47263956 - 47263678
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||| || ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  47263956 agggttgagtgtctttgtagtgagaatctcttcggttggg--aaacattgtaaataccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaagcttc 47263860  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttca-tattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||| || || || |||||  ||||  |||||||||||| ||||||| | ||||       
T  47263859 cttttgtgtcttct-atttagggttcattattgagagagt-gggaaacacaaatggatagaaattaggtcttgttcttgtgt-aagcttgcaagcta--- 47263766  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||         | || |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47263765 ttt---------tcttataacactttcatcatagtggattggagagctg--ctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 4796477 - 4796542
Alignment:
Q  16 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4796477 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 4796542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2580679 - 2580613
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2580679 agggttgagtgtctttgt-gtgaggttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 2580613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 2647504 - 2647571
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2647504 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacatggtaagcaccttgggtagtgag 2647571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 44847932 - 44847999
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44847932 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttggatagtgag 44847999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 46516112 - 46516179
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  46516112 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgagttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 46516179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31155971 - 31155911
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31155971 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31155911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 21812092 - 21812143
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21812092 ctttgatgagagtgtttcttaggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 21812143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 3047544 - 3047477
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  3047544 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacactataatcatcttgggtagtgag 3047477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 9184981 - 9185048
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||| ||||||| |  ||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  9184981 agggttgagtatctttgtagtaaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 9185048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2479271 - 2479161
Alignment:
Q  380 tacactagtctagggctgtttt-gttgttgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattgg 478  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||  | ||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2479271 tacactagactaggtctgtttttgttgttgtt-gcttagagacacttta-cacattgattaccacttcct-ttgctccacacatctttgtttttcattgg 2479175  T
Q  479 tgtgagtttcaacc 492  Q
    ||||| | ||||||    
T  2479174 tgtgattatcaacc 2479161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 24266054 - 24266106
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24266054 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 24266106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1049356 - 1049296
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  1049356 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1049296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 2935497 - 2935557
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2935497 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 2935557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 3035953 - 3036013
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  3035953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3036013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 309
Target Start/End: Original strand, 5817303 - 5817366
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  5817303 tggattggagagctgctctct-ccccagagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctt 5817366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7351712 - 7351652
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7351712 tggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 7351652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 309
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153514
Alignment:
Q  262 tctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 8153514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9027254 - 9027194
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9027254 tggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9027194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 483
Target Start/End: Original strand, 9190222 - 9190274
Alignment:
Q  431 catagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtga 483  Q
    ||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9190222 cattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 9190274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 22108295 - 22108355
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22108295 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22108355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 22137306 - 22137366
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22137306 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22137366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 38671479 - 38671419
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  38671479 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 38671419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 40550055 - 40550115
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40550055 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40550115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 40552333 - 40552393
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40552333 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40552393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 47676393 - 47676333
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  47676393 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 47676333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24742240 - 24741745
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24742240 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 24742141  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24742140 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggcta 24742042  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 308  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742041 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 24741942  T
Q  309 tctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgtt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24741941 tcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtt 24741843  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaatt 507  Q
    | |||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24741842 g-ttgcttggaaaccattttgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaatt 24741745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 29760941 - 29760449
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaa-cattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  29760941 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 29760842  T
Q  109 gcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgtt-cttgtgtaaagcttgaaggc 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  29760841 gcttcctctagtgtcttctctt--agggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaggc 29760745  T
Q  208 tagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaat 306  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760744 tattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaat 29760645  T
Q  307 cttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgt 406  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29760644 cttcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggttgttttgttgt 29760546  T
Q  407 tgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    || |||||| || ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29760545 tg-ttgcttggaaaccattttgtttattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 29760449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 129 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 51520637 - 51520258
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51520637 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 51520539  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520538 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 51520439  T
Q  329 -tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51520438 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtatggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 51520339  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtgagttt-caaccagattcacaaca 504  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  51520338 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 51520258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Original strand, 9224312 - 9224668
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9224312 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttctaacctttt 9224410  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224411 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9224510  T
Q  329 tttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
    |||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9224511 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 9224609  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9224610 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 9224668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Original strand, 9229099 - 9229455
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9229099 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttctaacctttt 9229197  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229198 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9229297  T
Q  329 tttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
    |||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9229298 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 9229396  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9229397 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 9229455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 130 - 483
Target Start/End: Original strand, 45347723 - 45348079
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  45347723 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggt-cttgtaaccttttg 45347821  T
Q  230 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt--c 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45347822 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttcc 45347921  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     |||   ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  45347922 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 45348020  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45348021 ttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 45348079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 129 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 3814202 - 3813865
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  3814202 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaacctttt 3814106  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttc 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  3814105 gtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttcttc 3814006  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtgg-atttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3814005 ctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 3813907  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3813906 gctctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattg 3813865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 130 - 483
Target Start/End: Original strand, 45357203 - 45357558
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  45357203 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttg 45357300  T
Q  230 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctt--c 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  45357301 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttcc 45357400  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     |||   ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  45357401 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttg 45357499  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45357500 ttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 45357558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 177 - 504
Target Start/End: Original strand, 56146664 - 56146995
Alignment:
Q  177 tagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatt 276  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146664 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatt 56146762  T
Q  277 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggattt 375  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  56146763 aggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggtttt 56146862  T
Q  376 actatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--t 472  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  56146863 gctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttattt 56146962  T
Q  473 cattggtgtgagttt-caaccagattcacaaca 504  Q
    ||||||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  56146963 cattggtgtgaatttggaaccggattcacaaca 56146995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 133 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 5732839 - 5732486
Alignment:
Q  133 agggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  5732839 agggtttatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 5732743  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtg----ttttgttc-tt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    |||||||| ||    
T  5732742 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttcttt 5732643  T
Q  327 cctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
    |||||   | ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5732642 cctttaccgtttatcttgtt--tgctttgttagctctttgtgtggttttactatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccattt 5732545  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgt-ttatcattggtgtga 483  Q
    |  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5732544 gttctcattgattaccaccatcacttgctccacacatcattgtattttcattggtgtga 5732486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 18855900 - 18855568
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  18855900 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 18855804  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 329  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  18855803 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 18855705  T
Q  330 ttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-g 428  Q
    ||   | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||      
T  18855704 ttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgtt 18855607  T
Q  429 ctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18855606 ctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 18855568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 504
Target Start/End: Original strand, 28468341 - 28468813
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  28468341 agggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaatattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 28468439  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |  |||   |    
T  28468440 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttattgtgt-aagcttgcaaactatttt 28468538  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    |||          ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28468539 ttc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 28468627  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttgtt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |  ||   |||||  || || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  28468628 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttggt--tgctttgtatttgct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg-t 28468721  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    ||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  28468722 tgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttatccgaattcacaaca 28468813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 487
Target Start/End: Original strand, 31985440 - 31985902
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||| |||||   |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  31985440 agggttgagtgtttttgtattgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgaa-atttcaccatgggaaggatcaaaagcttc 31985536  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    || | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  31985537 cttttgtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 31985633  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttct 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  31985634 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt-t 31985731  T
Q  312 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg--ttttgttgttg 408  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||| |  |  |||||| || || |||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  31985732 tggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatct--ttattgctttg-tatatgct--tgtggagttgctctacactagactaggtctgttttttgttgttg 31985826  T
Q  409 tttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagttt 487  Q
     |||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31985827 -ttgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgcaccacacatctttgttta-cattggtgtgagttt 31985902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 5396478 - 5396768
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||| ||| |||||||     
T  5396478 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaagaatcaaaagcttt 5396574  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||  || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  5396575 cttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgagtaac-acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat-- 5396669  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5396670 tttcttgtaactctttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 16623100 - 16623390
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  16623100 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 16623196  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||  |  || ||| ||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||||    ||||       
T  16623197 cttttgtg--ttttcttttaggattcatattgtgagagtgggtgac-acaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttctgtaa-gcttattagctaa-- 16623290  T
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  16623291 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 16623390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 51520699 - 51520637
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520699 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 51520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10047478 - 10047379
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10047478 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10047379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39246093 - 39245994
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39246093 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 39245994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 18712609 - 18712671
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18712609 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgttatcaccttgggt 18712671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 36315228 - 36315326
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36315228 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattctt 36315326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 36329437 - 36329535
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  36329437 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattctt 36329535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 9224250 - 9224312
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9224250 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggt 9224312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 9229037 - 9229099
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9229037 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggt 9229099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 3796517 - 3796616
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3796517 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 16628679 - 16628815
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  16628679 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 16628775  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggg 155  Q
    || | |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16628776 cttttgtg--ttttcttttaggattcatattgtgagagtggg 16628815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152536
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttctc-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 38152536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3777839 - 3777550
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaa-gctt 112  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  |||| |||| ||| ||||    
T  3777839 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaatgatcaaaaagctt 3777743  T
Q  113 cctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctaga 211  Q
    ||| | ||   |||||||  ||| |||||||||||||||||||  |  || ||| ||||||||  |||   |||||||||||||| | ||| | ||||      
T  3777742 ccttttgtattttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgac-acaaaatgggtagaaattagatcttgttcttgtgtaa-gtttgcaagctat- 3777648  T
Q  212 gtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3777647 -tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  225 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5147889 - 5147678
Alignment:
Q  96 ggaaggatctaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgt 194  Q
    |||||||||  ||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |  || ||| ||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  5147889 ggaaggatcataagcttccttttgtgttttctcttt-agggttcatattgtgagaatgggtgac-acaaaatgggtagaaattaggccttgttcttgtgt 5147792  T
Q  195 aaagcttgaaggctagagtttcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctg 291  Q
    || ||||| | ||||   |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |    
T  5147791 aa-gcttgcaagctat--tttcttgtaactattttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccg 5147695  T
Q  292 aactgggtcaacaatct 308  Q
    |||||||||||||||||    
T  5147694 aactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269288
Alignment:
Q  227 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 5269288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 3814257 - 3814202
Alignment:
Q  22 gtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814257 gtgtctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 3814202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 305
Target Start/End: Original strand, 16630678 - 16630773
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||    
T  16630678 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333809
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctt 24333809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 304  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 45347671 - 45347721
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347671 ctttgatgagagtgtctcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 45347721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 5112523 - 5112460
Alignment:
Q  18 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5112523 ttgagtgtctttgttgtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 5112460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 5732894 - 5732844
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732894 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 5732844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 5269007 - 5269074
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5269007 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttggatagtgag 5269074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 10047671 - 10047604
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    ||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  10047671 agggttgagtgtctttgtaatgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 10047604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 18855956 - 18855906
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855956 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 18855906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 25861840 - 25861907
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25861840 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgagtagtgag 25861907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 36315037 - 36315104
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36315037 agggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacacattgggtagtgag 36315104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 36329246 - 36329313
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36329246 agggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacacattgggtagtgag 36329313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 45357151 - 45357201
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357151 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 45357201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5143550 - 5143414
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||  | |||||| |||||| ||||||||| | ||||  |  |||||||||  |||||||    
T  5143550 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggattgggaaa--ctttgtaaacaccttaggtagtgag-atttcaccattggaaggatcataagcttc 5143454  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtgg 154  Q
    || | |||  |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5143453 cttttgtgttttctcttt-agggttcatattctgagagtgg 5143414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 288
Target Start/End: Original strand, 39774303 - 39774380
Alignment:
Q  213 tttcttgtaacct-tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 288  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  39774303 tttcttgtaacctatttgtatcactttcattttagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattgg 39774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16931849 - 16931789
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16931789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16934203 - 16934143
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16934143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22780433 - 22780373
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22780433 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44599898 - 44599838
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44599898 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 44599838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Original strand, 6743226 - 6743289
Alignment:
Q  18 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6743226 ttgagtgtctttgtagcgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtaatgag 6743289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 54867269 - 54867184
Alignment:
Q  225 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  54867269 ttttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 54867184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 38152245 - 38152311
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtga 82  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38152245 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggatggg--aaatattgtaaacaccttgggtagtga 38152311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 5429590 - 5429650
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  5429590 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 5429650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 6542439 - 6542378
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  6542439 agggttgagtgtctttgtaatgaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 6542378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 6765117 - 6765177
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  6765117 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6765177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 7941596 - 7941656
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  7941596 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7941656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18709224 - 18709164
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18709224 tggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 18709164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22782798 - 22782738
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  22782798 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaa 22782738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 42599383 - 42599448
Alignment:
Q  16 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42599383 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttcggttggg--aaacattctaaacaccttgggtagtgag 42599448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 48142953 - 48143013
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  48142953 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 48143013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 51336974 - 51337035
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  51336974 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggt 51337035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 52082914 - 52082854
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  52082914 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 52082854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Original strand, 11098724 - 11099217
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  11098724 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagtacattagttggaaggatctaaag 11098823  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  11098824 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgcaagcta 11098922  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 308  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098923 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 11099022  T
Q  309 tctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgtt 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11099023 tcttggtgttttgttcttcctttcttccttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtt 11099121  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    | |||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11099122 g-ttgcttggaaaccattttgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctttgtttttcattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 11099217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 14291788 - 14291293
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14291788 caaagggttgagcgtctttgtagatagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 14291689  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14291688 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggcta 14291590  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 308  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291589 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 14291490  T
Q  309 tctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgtt 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14291489 tcttggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgtt 14291391  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaat 506  Q
    |||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14291390 gtttgcttggaaaccattttgcccattgattaccactatctcttgctccacacacctttgttt-tcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaat 14291293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 505
Target Start/End: Original strand, 9296199 - 9296692
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  9296199 caaagggttgagtgtctttgtagaaagtgtctattgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcaccattggaaggatctaaagc 9296298  T
Q  111 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctag 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||     
T  9296299 ttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtat-aagcttgaaggctat 9296397  T
Q  211 agtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296398 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 9296497  T
Q  310 ctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttg 408  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9296498 cttggtgttttgttcttcctttcttgcttttcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg 9296596  T
Q  409 tttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaa 505  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9296597 tttgcttggaaaccattttgctcatagattaccactaccttttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 9296692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 163 - 483
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312885
Alignment:
Q  163 caaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 44312661  T
Q  263 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatct 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44312662 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatct 44312760  T
Q  362 ctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacac 460  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44312761 ctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 44312860  T
Q  461 atcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  44312861 atcattgtttatttcattggtgtga 44312885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 130 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 32246966 - 32246626
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  32246966 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaaccttttg 32246869  T
Q  230 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32246868 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcc 32246769  T
Q  329 ----tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccat 424  Q
        |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32246768 tttttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccat 32246670  T
Q  425 ttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32246669 ttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacatcattg 32246626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 129 - 463
Target Start/End: Original strand, 39811894 - 39812227
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39811894 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 39811991  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39811992 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 39812091  T
Q  329 tttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
    |||    ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39812092 ttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 39812190  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
      ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39812191 ttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 39812227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 96 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 25398708 - 25398304
Alignment:
Q  96 ggaaggatctaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgta 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  25398708 ggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgta 25398609  T
Q  196 aagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaac 294  Q
    | ||||| | ||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25398608 a-gcttgcaagctatt-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaac 25398511  T
Q  295 tgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagg 393  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||  || || ||||||||||||||    
T  25398510 tgggtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt--gctttgtattctctt-gtgtggtgttgctctacactagtctagg 25398414  T
Q  394 gctgtttt-gttgttgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaacc 492  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||  |||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25398413 gctgtttttgttgttgtt-gcttggagacacttta-cacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagtttcaacc 25398317  T
Q  493 agattcacaacaa 505  Q
    |||||||||||||    
T  25398316 agattcacaacaa 25398304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 96 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 25403846 - 25403440
Alignment:
Q  96 ggaaggatctaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgta 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  25403846 ggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgta 25403747  T
Q  196 aagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaac 294  Q
    | ||||| | ||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25403746 a-gcttgcaagctatt-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaac 25403649  T
Q  295 tgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagg 393  Q
    || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||  || || ||||||||||||||    
T  25403648 tgagtcaacaatctttttggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt--gctttgtattctctt-gtgtggtgttgctctacactagtctagg 25403552  T
Q  394 gctgtttt-gttgttgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaacc 492  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||  |||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25403551 gctgtttttgttgttgtt-gcttggagacacttta-cacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagtttcaacc 25403455  T
Q  493 agattcacaacaatt 507  Q
     ||||||||||||||    
T  25403454 ggattcacaacaatt 25403440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 3492044 - 3491556
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||  |  |||||||||| |||||||    
T  3492044 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggaaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-attccaccattggaaggatcttaagcttc 3491946  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  3491945 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 3491848  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3491847 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 3491749  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttg--tgtggatttactatacactagtctagggctg-ttttgttgttg 408  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||     ||| ||||  |||||  || || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3491748 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttggt--tgctt-----tctatttgcttgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttg 3491656  T
Q  409 tttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaattt 508  Q
     |||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||    
T  3491655 -ttgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttatccgaattcacaacagttt 3491559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19344596 - 19344266
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  19344596 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 19344500  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  19344499 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcc 19344400  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  19344399 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 19344303  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19344302 ctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 19344266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19349454 - 19349124
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  19349454 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 19349358  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  19349357 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcc 19349258  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  19349257 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 19349161  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349160 ctctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 19349124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40739124 - 40738810
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| | ||||  |  ||||||||| |||||||     
T  40739124 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtaatgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctta 40739028  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||| | ||||   |    
T  40739027 ctattgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaagacttgttcttgtgt-aagcttgcaagcta---t 40738932  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||         | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  40738931 tt--------ttcttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-tt 40738842  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 343  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40738841 ggtgtgtttgttcttcctttctagcttatctt 40738810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25407835 - 25407653
Alignment:
Q  96 ggaaggatctaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgta 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  25407835 ggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgta 25407736  T
Q  196 aagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 279  Q
    | ||||| | ||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407735 a-gcttgcaagctatt-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 28258984 - 28259274
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  28258984 agggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 28259080  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||  |||   |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  28259081 cttttgtgtcttctcttt-aggggtcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattagatcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat-- 28259175  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28259176 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 36757569 - 36757859
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  36757569 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 36757665  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||  || || ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| |||        
T  36757666 cttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgggtaac-acaaatgggtagaaattaggttttgttcttgtgtaa-gcttgaaagcttt-- 36757760  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36757761 tttcttataactctttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 36757859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13569619 - 13569331
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaa-gctt 112  Q
    |||||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||||  |  ||||||||| ||| ||||    
T  13569619 agggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattataaacaccttggatagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagctt 13569523  T
Q  113 cctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    ||| | |||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||  | ||||       
T  13569522 ccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacaaacaaagggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaaa-cttataagctaa-- 13569428  T
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13569427 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 309
Target Start/End: Original strand, 23078279 - 23078567
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttcc 114  Q
    |||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||| |||||||||    
T  23078279 gggttgagtgtctttgtgatgagaatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcatcattggaaggatcaaaagcttcc 23078375  T
Q  115 tctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtg-gggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    | | ||| ||||||||  |||||||||  | |||||||| ||| || || || ||||||||  || |  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  23078376 ttttgtgtcttctctt--agggttcatcat-tgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat--t 23078469  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  23078470 ttcttgtaactctttctaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattctt 23078567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040060
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 8040060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21630042 - 21629944
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21630042 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 21629944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 10445442 - 10445541
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  10445442 tttcttgtaactcttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 10445541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17865302 - 17865203
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17865302 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatctt 17865203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20522319 - 20522220
Alignment:
Q  213 tttcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20522319 tttcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 20522220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 34682332 - 34682431
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34682332 tttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 34682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34389141 - 34388859
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatc-taaagctt 112  Q
    ||||||| |||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||  |  |||||||||  |||||||    
T  34389141 agggttgtgtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaaagctt 34389045  T
Q  113 cctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctaga 211  Q
    ||| | |||  || ||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |  || ||||||||  ||||  |||||||||||| |||||          |    
T  34389044 ccttttgtg--ttttctcttaggattcatattgtgagagtgggtgacaca-aaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgt-aagct----------a 34388959  T
Q  212 gtttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  34388958 atttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 39811832 - 39811894
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39811832 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggttgagaaaaacattgtaatcaccttgggt 39811894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 25409923 - 25409854
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25409923 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 25409854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 14699006 - 14699104
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14699006 tttcttgtaactcttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14699104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 308
Target Start/End: Original strand, 10707250 - 10707348
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10707250 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 306
Target Start/End: Original strand, 8390148 - 8390244
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 306  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8390148 tttcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056044
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctt 31056044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 33528619 - 33528718
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33528619 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 33528718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39483030 - 39482931
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39483030 tttcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39482931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 42039668 - 42039766
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  42039668 tttcttgtaactcttcgtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 42039766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940306
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 16940306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010971
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 17010971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33118235 - 33118136
Alignment:
Q  213 tttcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  33118235 tttcttgtaactattttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatctt 33118136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 32247018 - 32246968
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32247018 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 32246968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 39483223 - 39483156
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39483223 agggttgagtgtctttgttgtgaggatctcttgggttggg--aaatattgtaaacaccttgggtagtgag 39483156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21630232 - 21630168
Alignment:
Q  17 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  21630232 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 21630168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 41586357 - 41586425
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaca-ttgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41586357 agggttgagtgtctttggtgagagcttctcttgggttgg--aaaacagttgtaaacaccttgggtagtgag 41586425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 319
Target Start/End: Original strand, 2838063 - 2838136
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttt 319  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2838063 tggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat-ttcttggtgttt 2838136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 14698816 - 14698883
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  14698816 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctctcgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 14698883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17865495 - 17865428
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  17865495 agggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 17865428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 20522512 - 20522445
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||    
T  20522512 agggttgagtgtctttgtagtgagtatctcttgggttggg--aagcattgtaaacaacttgggtagtgag 20522445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 33118425 - 33118358
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33118425 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--gaacattgtaaacaccttgggtagtgag 33118358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 33528431 - 33528498
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33528431 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacacattgggtagtgag 33528498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 306
Target Start/End: Original strand, 1345574 - 1345635
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 306  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1345574 tggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1345635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 306
Target Start/End: Original strand, 2869691 - 2869787
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 306  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  2869691 tttcttgtaactcctttgtatcactttcatcttagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 2869787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35215646 - 35215586
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35215646 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35215586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35218023 - 35217963
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35218023 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35217963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Original strand, 27149306 - 27149369
Alignment:
Q  226 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 288  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  27149306 tttgtatcactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattgg 27149369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 10445274 - 10445341
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  10445274 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctctcgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 10445341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31056335 - 31056266
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  31056335 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 31056266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45332238 - 45332181
Alignment:
Q  249 attggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  45332238 attggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 45332181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 2869501 - 2869566
Alignment:
Q  16 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2869501 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagttgg--aaaacattgtaaacacattgggtagtgag 2869566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 431 - 483
Target Start/End: Original strand, 10445660 - 10445712
Alignment:
Q  431 catagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtga 483  Q
    ||| ||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10445660 cattgattaccacttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 10445712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11151848 - 11151788
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  11151848 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 11151788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23452297 - 23452237
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  23452297 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 23452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36558924 - 36558864
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36558924 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36558864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36561201 - 36561141
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36561201 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36561141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 39284796 - 39284856
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  39284796 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 39284856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 42362263 - 42362323
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  42362263 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 42362323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30631702 - 30631227
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtg-aggagttcattaaa-ggaaggatctaaagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  30631702 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtggaggagttcattagttggaaggatctaaagctt 30631603  T
Q  113 cctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30631602 cctctagtgacttctcttt-agggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagag 30631504  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  30631503 tttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatcttctt 30631404  T
Q  313 ggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttg 412  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30631403 ggtgttttgttcttcctttcttacttatcttgtttatgctttgttatctatatatgtgattttgctatacactagtctagggctgttttgttgttg-ttg 30631305  T
Q  413 cttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtgagttt 487  Q
    |||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  30631304 cttgaaaaccatttgttctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcatttgtgtgagttt 30631227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31180513 - 31180138
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  31180513 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 31180414  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31180413 cttcctctagtgtcttctcttttatggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgt-cttgtgtaaagcttgaaggcta 31180315  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180314 gagtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 31180215  T
Q  310 ctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacacta 386  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31180214 cttggtgttttgttctttctttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 129 - 504
Target Start/End: Original strand, 1457067 - 1457445
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1457067 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 1457165  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457166 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 1457265  T
Q  329 tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg- 427  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1457266 tttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgt 1457365  T
Q  428 gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtgagttt-caaccagattcacaaca 504  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  1457366 tctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 1457445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 129 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 43592459 - 43592115
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43592459 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 43592361  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592360 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43592261  T
Q  329 -tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43592260 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 43592161  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttat 472  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592160 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttat 43592115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 129 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 27449994 - 27449612
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27449994 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 27449896  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449895 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 27449796  T
Q  329 -tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27449795 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttg 27449696  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtgagttt-caaccagattcacaacaatt 507  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  27449695 tactcattgattaccactatctcttgctccacatatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaacaatt 27449612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 129 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 27445150 - 27444771
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27445150 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 27445052  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445051 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 27444952  T
Q  329 -tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27444951 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttg 27444852  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtgagttt-caaccagattcacaaca 504  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  27444851 tactcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgagtttggaaccggattcacaaca 27444771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 129 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 43598904 - 43598522
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43598904 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 43598806  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598805 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43598706  T
Q  329 -tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43598705 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43598606  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtgagttt-caaccagattcacaacaatt 507  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  43598605 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaacaatt 43598522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 129 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 43604396 - 43604014
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43604396 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 43604298  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604297 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43604198  T
Q  329 -tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43604197 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43604098  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtgagttt-caaccagattcacaacaatt 507  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  43604097 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaacaatt 43604014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 129 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 43609888 - 43609506
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43609888 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 43609790  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609789 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 43609690  T
Q  329 -tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43609689 ttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattg 43609590  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtgagttt-caaccagattcacaacaatt 507  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  43609589 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtgactttggaaccggattcacaacaatt 43609506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 24136146 - 24135659
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  24136146 caaagggttgagtgtctttgtagaaagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcaccattggaaggatctaaagc 24136047  T
Q  111 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctag 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||     
T  24136046 ttcctctagtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat 24135948  T
Q  211 agtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
      |||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24135947 t-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24135849  T
Q  310 ctcggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgtt 407  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||   |||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24135848 cttggtgtgtttgttcttccttttctagcttatcttgtt--tgctttgtattatct---tgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttgttgtt 24135754  T
Q  408 gtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    |||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  24135753 gtttgcttggagactcttt-actcatagattaccactcccttttgctccacacatctttattt-tcattggtgtgagttttatccggattcacaaca 24135659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 15044865 - 15044512
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  15044865 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagt--cttgtaacctttt 15044768  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15044767 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgttttgttcttcc 15044668  T
Q  329 -tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  15044667 ttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttg 15044569  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtga 483  Q
      ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  15044568 ttctcattgattaccactatcacttgctctacacgtcattgtatttcattggtgtga 15044512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 38219692 - 38219208
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  38219692 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 38219594  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  38219593 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 38219496  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38219495 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 38219396  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgtttt-gttgttgtt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38219395 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt--gctttgtattctctt-gtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 38219299  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
     |||| |||||  |||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38219298 -gcttggagacacttta-cacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 38219208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 35387956 - 35387474
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||| ||||    
T  35387956 agggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaaacttc 35387858  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  35387857 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttattcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 35387760  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  35387759 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatcttttt 35387660  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgtttt-gttgttgtt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||   ||||| || || |||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35387659 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctcgttt--gctttgtattctctt---gtggagttgctctacactagactagggttgtttttgttgttgtt 35387565  T
Q  411 tgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
     |||| |||||  |||  | ||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35387564 -gcttggagacacttta-cacatagattatcacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 35387474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 113 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 38192369 - 38191983
Alignment:
Q  113 cctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  38192369 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt- 38192272  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttct 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38192271 tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctttt 38192172  T
Q  312 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgtttt-gttgttgt 409  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38192171 tggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgttt--gctttgtattctctt-gtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgt 38192075  T
Q  410 ttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    | |||| |||||  |||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38192074 t-gcttggagacacttta-cacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagtttcaaccggattcacaaca 38191983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Original strand, 37556533 - 37556863
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||    
T  37556533 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaa 37556629  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  37556630 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccat 37556729  T
Q  330 ttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-g 428  Q
    ||   | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||      
T  37556730 ttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgct 37556828  T
Q  429 ctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37556829 ctcatagattatcactatcacttgctccacacatc 37556863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Original strand, 37561355 - 37561685
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||    
T  37561355 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctaga--tacttgtaaccttttgtaa 37561451  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  37561452 cactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccat 37561551  T
Q  330 ttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-g 428  Q
    ||   | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||      
T  37561552 ttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgct 37561650  T
Q  429 ctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37561651 ctcatagattatcactatcacttgctccacacatc 37561685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Original strand, 28807485 - 28807818
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaac 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28807485 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaga--ttcttgtaaccttttgtaac 28807581  T
Q  234 actttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cctt 330  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||    
T  28807582 actt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttt 28807680  T
Q  331 tcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtgg--atttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg- 427  Q
    |   | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||   ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||     
T  28807681 taccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgagtggttttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgt 28807778  T
Q  428 gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28807779 tctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 28807818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 2785550 - 2785217
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  2785550 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 2785454  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  2785453 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 2785355  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  2785354 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 2785258  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  2785257 cactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 2785217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 33791491 - 33791158
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  33791491 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 33791395  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  33791394 acacattcacatattggattggagagctgctctttcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 33791296  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| | | ||||||||  ||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  33791295 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctctatatgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 33791199  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  33791198 cactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33791158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Original strand, 31396901 - 31397236
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgtt--cttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttg 229  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||    
T  31396901 gggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-tctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttg 31396997  T
Q  230 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgt---tttgttct 325  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |    
T  31396998 taacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgtt-t 31397096  T
Q  326 tcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatt 425  Q
    || ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| || |||| ||| ||  || ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  31397097 tcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctttacattaggcttaggatgttttgttgttgttagcttggaggccatt 31397193  T
Q  426 tg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    ||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  31397194 tgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 31397236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Original strand, 31401758 - 31402093
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgtt--cttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttg 229  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||    
T  31401758 gggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-tctagagttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttg 31401854  T
Q  230 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---t 325  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |    
T  31401855 taacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttt 31401953  T
Q  326 tcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatt 425  Q
    || ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  31401954 tcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctttacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatt 31402050  T
Q  426 tg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    ||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  31402051 tgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 31402093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15464824 - 15464532
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  15464824 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--catcgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 15464728  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  15464727 cttttgtgtcttctcttttagggttcattattgtgagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt- 15464631  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15464630 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 33768314 - 33768021
Alignment:
Q  175 tctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctccccca 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33768314 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctccccccca 33768217  T
Q  273 gattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---cctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtg 368  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   | ||| | | ||||| ||  ||||| |||||| |||| | ||    
T  33768216 gattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcctg--tatgc-ttgttagctctatatg 33768121  T
Q  369 tggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    ||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  33768120 tggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33768021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 36932155 - 36932447
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||| | | ||   |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  36932155 agggttgagtgtctttatagtgatgatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 36932251  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||  || |  |||||||| |||||| |||| | ||||       
T  36932252 ctcttgtgtcttctgttttagggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaagtcttgttcttatgtaaa-cttgcaagctatt- 36932348  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36932349 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 9353139 - 9353429
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  9353139 agggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 9353235  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||  |||   |||||||||||||| ||||| | |||        
T  9353236 cttttgtgtcttctctttaagg-ttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattagatcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagcttt-- 9353330  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9353331 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14520520 - 14520230
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  14520520 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttggatagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 14520424  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcata-ttgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||  || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  14520423 cttttgtgtcttctcttt-agggttcataattgagagagtgggtaac-acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat-- 14520329  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14520328 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 1457005 - 1457067
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457005 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 1457067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27445212 - 27445150
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445212 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 27445150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27450056 - 27449994
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450056 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 27449994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 43592521 - 43592459
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592521 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43592459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 43598966 - 43598904
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598966 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43598904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 43604458 - 43604396
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604458 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43604396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 43609950 - 43609888
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609950 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43609888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 308
Target Start/End: Original strand, 11916779 - 11917068
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||| ||||    
T  11916779 agggttgagtttctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaacttc 11916875  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | |||  |||||||  |||||||||  | ||||||||||  |  || ||| ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |  |||       
T  11916876 cttttgtgttttctctt--agggttcatcgtttgagagtgggtgac-acaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactat-- 11916969  T
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11916970 tttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10281850 - 10281751
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10281850 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15044928 - 15044865
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044928 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 15044865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 17003766 - 17004057
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaa-gctt 112  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||| ||||    
T  17003766 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgggtttggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagctt 17003862  T
Q  113 cctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggg-gaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctaga 211  Q
    ||| | |||  |||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||   || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | | ||      
T  17003863 ccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgagtgaaatta-aatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgtaagttaa- 17003957  T
Q  212 gtttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
     ||| ||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17003958 -ttttttgtaactcttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 17004056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 441 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 31180142 - 31180077
Alignment:
Q  441 cactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaat 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31180142 cactatctcttgctccacacatcattgttattcattggtgtgagtttcaaccggattcacaacaat 31180077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3880398 - 3880299
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  3880398 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatctt 3880299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 306
Target Start/End: Original strand, 12084174 - 12084269
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 306  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12084174 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19588845 - 19588746
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19588845 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28832357 - 28832259
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28832357 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatctt 28832259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 42127409 - 42127507
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  42127409 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatctt 42127507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Original strand, 24553333 - 24553401
Alignment:
Q  13 aagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24553333 aagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 24553401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 28807429 - 28807479
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807429 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 28807479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410301
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Original strand, 11181641 - 11181705
Alignment:
Q  16 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtga 82  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11181641 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtga 11181705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 28832544 - 28832480
Alignment:
Q  17 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  28832544 gttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 28832480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 309
Target Start/End: Original strand, 31300612 - 31300693
Alignment:
Q  230 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31300612 taacactttcatcttagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31300693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 15552464 - 15552524
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15552464 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31179431 - 31179371
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31179431 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 31300404 - 31300469
Alignment:
Q  16 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  31300404 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgagaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 31300469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 31542953 - 31543013
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31543013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 31545299 - 31545359
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31545299 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31545359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15464411 - 15464341
Alignment:
Q  435 gattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaat 506  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  15464411 gattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttatccgaattcacaacaat 15464341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Original strand, 7160711 - 7160770
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 75  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7160711 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttggattggg--aaacattgtaatcaccttgg 7160770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 19589035 - 19588968
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  19589035 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacatcttgggcagtgag 19588968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 24553506 - 24553603
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  24553506 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggagtggag-gctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 24553603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 305
Target Start/End: Original strand, 27910675 - 27910729
Alignment:
Q  252 ggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  27910675 ggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27910729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 2785608 - 2785556
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2785608 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 2785556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 31396843 - 31396895
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31396843 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 31396895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 31401700 - 31401752
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31401700 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 31401752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33768417 - 33768365
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33768417 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 33768365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33791549 - 33791497
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33791549 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 33791497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3373197 - 3373137
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  3373197 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 3373137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 10749919 - 10749979
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  10749919 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 10749979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 13488114 - 13488174
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  13488114 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggt 13488174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15354635 - 15354575
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15354635 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15354575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Original strand, 19806295 - 19806355
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  19806295 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 19806355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 470
Target Start/End: Original strand, 24787161 - 24787624
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaa-ggaaggatctaaag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24787161 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattataatcaccttgggcagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 24787260  T
Q  110 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24787261 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggcta 24787360  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787361 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24787460  T
Q  310 ctcggtgttttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg--ttttgttgt 406  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  24787461 cttggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgt 24787558  T
Q  407 tgt--ttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttt 470  Q
    |||  |||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24787559 tgttgttgcttggaaaccattttgctcatttattaccactatctcttgctccacacatctttgttt 24787624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 505
Target Start/End: Original strand, 24202572 - 24203055
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |  ||||||||||||||||||    
T  24202572 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atctcaccattggaaggatctaaagcttc 24202670  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  24202671 ctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 24202768  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  24202769 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 24202868  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgttt 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   |||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24202869 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagtttagggctgttttgttgttgttt 24202963  T
Q  412 gcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaa 505  Q
    |||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24202964 gcttggaga-cactttacacatagattaccactcccttttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagttttaaccggattcacaacaa 24203055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 129 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 41398415 - 41398079
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41398415 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 41398318  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398317 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 41398218  T
Q  329 tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtgg--atttactatacactagtctagggctgtt---ttgttgttgtttgcttagagacca 423  Q
    ||     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  41398217 tt-----cttatcttgtttatgctttggtatctctttgtgtggttttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagacca 41398124  T
Q  424 tttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    | ||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41398123 tatgttctcattgattatcactatcacttgctccacacataattg 41398079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 129 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 41390760 - 41390483
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41390760 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 41390663  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41390662 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatcttctcgatgttttgttcttcc 41390563  T
Q  329 tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtgg--atttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttg 412  Q
    ||     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41390562 tt-----cttatcttgtttatgctttgatatctctttgtgtggttttttgctatacactagt-tagggctgttttgttgttgtttg 41390483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 130 - 467
Target Start/End: Original strand, 25444996 - 25445333
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  25444996 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagc-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaacctttt 25445092  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt- 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25445093 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttt 25445192  T
Q  327 -cctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatt 425  Q
     | |||   | |||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||    
T  25445193 ccttttaccgtttatcttgtttacgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatt 25445290  T
Q  426 tg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25445291 tgttctcattgattatcactatcgcttgctccacacatcattg 25445333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 506
Target Start/End: Original strand, 19361236 - 19361724
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  19361236 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaa-cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 19361333  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |  |||   |    
T  19361334 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgt-aagcttgcaaacta-ttt 19361431  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  19361432 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-tt 19361530  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgt- 409  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||  |  ||   |||||  || || |||||||| ||||||||||||| || || |     
T  19361531 ggtgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttggt--tgctttgtatttgct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgttttttttttttt 19361625  T
Q  410 ----ttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaa 505  Q
        |||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19361626 gttgttgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttaaccagattcacaacaa 19361723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Original strand, 44023785 - 44024116
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  44023785 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 44023881  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt-cctt 330  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44023882 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 44023980  T
Q  331 tcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-gc 429  Q
    |     ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||  |    
T  44023981 taccatttatcttgtttatgctt-gttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttc 44024078  T
Q  430 tcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  44024079 tcattgattatcactatcagttgctccacacatcattg 44024116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 507
Target Start/End: Original strand, 19358647 - 19359135
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  19358647 agggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaaa-cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 19358744  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  19358745 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 19358842  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  19358843 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-tt 19358941  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg--ttttgttgttg 408  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||  |  ||   |||||  || || |||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  19358942 gatgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttggt--tgctttgtatttgct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtatttttttgttg 19359036  T
Q  409 t--ttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaat 506  Q
    |  |||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19359037 ttgttgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttaaccggattcacaacaat 19359134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 39445673 - 39445341
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  39445673 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 39445577  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 329  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  39445576 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 39445478  T
Q  330 ttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-g 428  Q
    ||   | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||      
T  39445477 ttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgtt 39445380  T
Q  429 ctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39445379 cacattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 39445341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 506
Target Start/End: Original strand, 19379916 - 19380364
Alignment:
Q  55 aaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtgg 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19379916 aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtgg 19380014  T
Q  155 ggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattgg 253  Q
    ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |  |||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19380015 ggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactatt-tttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattgg 19380112  T
Q  254 agagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgt-tttgttcttcc-tttcttgcttatcttgtttatgc 351  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||    
T  19380113 agagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt-ttggtgtgtttgttcttccttttcttgcttatcttggt--tgc 19380209  T
Q  352 tttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgt-----ttgcttagagaccatttggctcatagattaccactat 446  Q
    |||||  |  ||   |||||  || || |||||||| ||||||||||||| || || |     |||||| |||| || ||  | ||||||||||||||      
T  19380210 tttgtatttgct---tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttttttttttgttgttgcttggaga-cactttacacatagattaccacttc 19380305  T
Q  447 ctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaat 506  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19380306 cttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttaaccagattcacaacaat 19380364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Original strand, 1054923 - 1055255
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  1054923 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 1055019  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 329  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  1055020 cactt-cacatattggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 1055118  T
Q  330 ttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-g 428  Q
    ||   | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||| ||   ||||||      
T  1055119 ttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagacatttgtt 1055216  T
Q  429 ctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1055217 cacattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 1055255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Original strand, 43988372 - 43988709
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgtt--cttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttg 229  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||    
T  43988372 gggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-tctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttg 43988468  T
Q  230 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--tt 326  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||    
T  43988469 taacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttctttt 43988568  T
Q  327 cctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
    | |||| || || | |  | ||||| |||||| ||||| |||||| | | ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  43988569 cttttcatggttttatcttgtatgc-ttgttagctcttagtgtggttgtgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccattt 43988667  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  43988668 gctctcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 43988709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 19366111 - 19366292
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  19366111 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaaaatattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 19366209  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa 196  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19366210 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa 19366292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3281995 - 3281708
Alignment:
Q  16 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttcct 115  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  3281995 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttcct 3281899  T
Q  116 ctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtt 214  Q
     | ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||   ||    
T  3281898 tttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat--tt 3281805  T
Q  215 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3281804 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 26644705 - 26644994
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | ||   ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  26644705 agggttgagtgtctttgtagtgaagatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgagtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 26644801  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||| | ||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  26644802 cttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgag-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat-- 26644895  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26644896 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 13604429 - 13604720
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  13604429 agggttgagtatctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 13604525  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| | ||| | ||||       
T  13604526 cttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gtttgcaagctatt- 13604621  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13604622 tttcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 13604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 21536377 - 21536666
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  21536377 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttaggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtaag-atttcaccattggaaggatcgaaagcttc 21536473  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||  || || ||||||||  || |  |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  21536474 cttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgggtaac-acaaacgggtagaaattaagtattgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat-- 21536567  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca-tattggctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||    
T  21536568 tttcttgtaactctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatctt 21536666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41398477 - 41398415
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398477 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 41398415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19073027 - 19072928
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19073027 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19120917 - 19120818
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19120917 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41390819 - 41390760
Alignment:
Q  18 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390819 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 41390760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704033
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47704033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37070055 - 37069770
Alignment:
Q  16 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttcct 115  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  37070055 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttggataatgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttcct 37069959  T
Q  116 ctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtt 214  Q
     | ||| ||||||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||  || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |  |||         
T  37069958 tttgtgtcttctcttt-atggttcattattgagtgagtgggtaac-acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaacta----- 37069867  T
Q  215 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    | |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37069866 ttttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 16124514 - 16124613
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16124514 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatctt 16124613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 27104370 - 27104469
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  27104370 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatctt 27104469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476261
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9476261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598398
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 13598398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651811
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatctt 29651811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 203
Target Start/End: Original strand, 25439803 - 25439875
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25439803 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-ctctagggtttgttcatgtgtaaagcttga 25439875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775672
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 775672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 47098823 - 47098921
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47098823 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47098921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32889537 - 32889439
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  32889537 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 32889439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 47098632 - 47098699
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47098632 agggttgagtgtctttgtagcgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 47098699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 47102646 - 47102713
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47102646 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 47102713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 306
Target Start/End: Original strand, 47102840 - 47102935
Alignment:
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 306  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| || || |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  47102840 tttcttgtaactcattgtaacattttcatcttagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 47102935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 1054867 - 1054917
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1054867 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 1054917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 25439751 - 25439801
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25439751 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 25439801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 25444944 - 25444994
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25444944 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 25444994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 29652103 - 29652036
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  29652103 agggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 29652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 39445729 - 39445679
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445729 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 39445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 44023729 - 44023779
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023729 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 44023779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9459479 - 9459419
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9459479 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9459419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9463306 - 9463246
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9463306 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9463246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 13598688 - 13598623
Alignment:
Q  16 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  13598688 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggcaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 13598623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 16226386 - 16226446
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Original strand, 27104211 - 27104275
Alignment:
Q  16 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  27104211 ggttgagtgtctttgtagtgag-gtctcttgggttgggaaa--cattataagcaccttgggtagtgag 27104275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 41386650 - 41386590
Alignment:
Q  408 gtttgcttagagaccatttgg-ctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41386650 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 41386590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 32889728 - 32889661
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  | | |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  32889728 agggttgagtgtctttgtagtgaggtttttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 32889661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 40816621 - 40816690
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  40816621 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 40816690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 43988314 - 43988366
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43988314 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 43988366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 47703740 - 47703809
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  47703740 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 47703809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 197165 - 197105
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  197165 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 197105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22819714 - 22819657
Alignment:
Q  21 agtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 80  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  22819714 agtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagt 22819657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 23786058 - 23786118
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  23786058 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 23786118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 435 - 483
Target Start/End: Original strand, 27104587 - 27104635
Alignment:
Q  435 gattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtga 483  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27104587 gattaccacttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga 27104635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 51752582 - 51752642
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  51752582 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51752642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 57)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 504
Target Start/End: Original strand, 5674567 - 5675057
Alignment:
Q  11 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  5674567 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcaccattggaaggatctaaagc 5674666  T
Q  111 ttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttg-ttcttgtgtaaagcttgaaggcta 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||||    
T  5674667 ttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgt-aagcttgcaagcta 5674765  T
Q  210 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 308  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674766 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 5674865  T
Q  309 tctcggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggct-gttttgttgt 406  Q
      | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||  |||||  || || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5674866 ctttggtgtgtttgttctttctttcttgcttatattgtt--tgctttgtattctctt--tgtggtgttgctctacactagactagggctggttttgttgt 5674961  T
Q  407 tgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    || |||||| |  | | |||  ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5674962 tg-ttgcttgggaaactttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctttgttt-tcattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 5675057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Original strand, 22010602 - 22010958
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22010602 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 22010700  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010701 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 22010800  T
Q  329 -tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22010801 ttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttg 22010899  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
      ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22010900 ttctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 22010958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 11857154 - 11856795
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11857154 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttgtaacctttt 11857056  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtg---ttttgttct 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||    
T  11857055 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttcttggtgtttttttgttct 11856956  T
Q  326 tcc-tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccat 424  Q
    ||| ||| | |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11856955 tccttttatcgcttgtcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccat 11856857  T
Q  425 ttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11856856 ttgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 11856795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Original strand, 14737482 - 14737838
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14737482 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 14737579  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14737580 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 14737679  T
Q  329 tttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctcttt-gtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
    |||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14737680 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctcttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 14737778  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
    |  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14737779 gttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 14737838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Original strand, 14742342 - 14742697
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14742342 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 14742439  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14742440 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 14742539  T
Q  329 tttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
    |||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14742540 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttgatatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttg 14742638  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
      ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14742639 ttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 14742697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 129 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 28184684 - 28184344
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  28184684 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtgt--tgtaacctttt 28184587  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28184586 gtaacactttctcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttctttc 28184487  T
Q  329 tttctt--gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
    ||| |   |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28184486 tttttaccgcttatcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccattt 28184388  T
Q  427 gg---ctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
         ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28184387 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 28184344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 130 - 483
Target Start/End: Original strand, 28155477 - 28155832
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccttttg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  28155477 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaa--ttcttgtaaccttttg 28155573  T
Q  230 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt-- 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      
T  28155574 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 28155673  T
Q  327 cctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccattt 426  Q
    | |||   | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  28155674 catttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttgaagaccattt 28155772  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttat--cattggtgtga 483  Q
    |  ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28155773 gctctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattgtttattgcattggtgtga 28155832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 134 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 6438674 - 6438324
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  6438674 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 6438578  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 329  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  6438577 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 6438479  T
Q  330 ttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-g 428  Q
    ||   | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |      
T  6438478 ttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccattggtt 6438381  T
Q  429 ctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6438380 ctcattgattaccactatcacttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 6438324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 6005592 - 6005259
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  6005592 gggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgta 6005496  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt---c 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |    
T  6005495 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttcc 6005397  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  6005396 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 6005300  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  6005299 cactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 6005259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16838923 - 16838586
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||    
T  16838923 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctaga--ttcttgtaactcttt 16838827  T
Q  228 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  16838826 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgt 16838728  T
Q  325 -ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagacca 423  Q
     ||| ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||  || |||    
T  16838727 tttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttgaaggcca 16838631  T
Q  424 tttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||    
T  16838630 tttgcactcatagattatctctatcacttgctccacatatcattg 16838586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 467
Target Start/End: Original strand, 33330351 - 33330690
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||    
T  33330351 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 33330447  T
Q  228 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 324  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  33330448 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 33330546  T
Q  325 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtgg-atttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagacc 422  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||  ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  33330547 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggtttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggcc 33330644  T
Q  423 atttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  33330645 atttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33330690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 130 - 467
Target Start/End: Original strand, 33335848 - 33336187
Alignment:
Q  130 tttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||    
T  33335848 tttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttt 33335944  T
Q  228 tgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-- 324  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||      
T  33335945 tgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt 33336043  T
Q  325 ttcctttc-ttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtgg-atttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagacc 422  Q
    ||| |||| | | |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| | || ||| ||    
T  33336044 ttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggtttttactatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagtttggaggcc 33336141  T
Q  423 atttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  33336142 atttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 33336187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22709300 - 22708984
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| | ||||  |  ||||||||| ||| ||||    
T  22709300 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttggatagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaacttc 22709204  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||| | ||||   |    
T  22709203 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgt-aagcttgcaagcta---t 22709108  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttct 311  Q
    ||         | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  | ||||| |||||||||| || |    
T  22709107 tt--------ttcttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaat-tttt 22709017  T
Q  312 cggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatctt 343  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22709016 tggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatctt 22708984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 357 - 504
Target Start/End: Original strand, 30125937 - 30126084
Alignment:
Q  357 tatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgtttt-gttgttgtttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctc 455  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30125937 tatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttggctcatagattatcactacctcttgctc 30126036  T
Q  456 cacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30126037 cacacatctttgttt-tcattggtgtgattttcaaccggattcacaaca 30126084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 5757285 - 5757575
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    ||||||||||||||||||    ||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  5757285 agggttgagtgtctttgtatttaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 5757381  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    ||   ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||  || || ||||||||  ||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||       
T  5757382 cttccgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagagtggaac-acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtataa-gcttgcaagctat-- 5757476  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5757477 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21356318 - 21356036
Alignment:
Q  23 tgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttcctctagtga 122  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||| |  ||||| ||| |||||||||| | |||     
T  21356318 tgtctttgtagtgaggatctcttgggttaggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcatcattggaagaatcaaaagcttccttttgtgt 21356222  T
Q  123 cttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgta 221  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | | ||   |||||||||    
T  21356221 cttttcttt-agggttcattattgagagagtgag-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttatt-tttcttgta 21356126  T
Q  222 accttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21356125 actcttagtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11857216 - 11857154
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857216 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 11857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 14737420 - 14737482
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737420 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 14737482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 22010540 - 22010602
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010540 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 22010602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 5343527 - 5343322
Alignment:
Q  264 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttat 359  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||     
T  5343527 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttag 5343432  T
Q  360 ctctttgtgtgg-atttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctcca 457  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  5343431 ctcttagtgtggtttttgctatactttaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcca 5343332  T
Q  458 cacatcattg 467  Q
    ||||||||||    
T  5343331 cacatcattg 5343322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 14742280 - 14742342
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14742280 gggttaagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcactttgggt 14742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 5572239 - 5572338
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  5572239 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 5572338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 10077163 - 10077262
Alignment:
Q  213 tttcttgtaacctttt-gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  10077163 tttcttgtaacttttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 10077262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 31086471 - 31086570
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31086471 tttcttgtaactcctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatctt 31086570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4630053 - 4629954
Alignment:
Q  213 tttcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4630053 tttcttgtaactattttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31979612 - 31979513
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31979612 tttcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31979513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Original strand, 21801342 - 21801429
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgg 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21801342 tttcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22963798 - 22963700
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  22963798 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt 22963700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 23824595 - 23824693
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  23824595 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatctt 23824693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18232944 - 18232867
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232944 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 28184749 - 28184684
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg---aaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||    
T  28184749 gggttgagggtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaaaacatagtaatcaccttgggt 28184684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 28155425 - 28155475
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155425 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 28155475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017566
Alignment:
Q  227 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata-ttggctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatctt 5017566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936587
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 31936587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 5017303 - 5017370
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5017303 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaacattgtaaacaccttgggtaatgag 5017370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 6438730 - 6438680
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438730 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 6438680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31936865 - 31936798
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  31936865 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctattgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 31936798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 435 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 31936466 - 31936398
Alignment:
Q  435 gattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  31936466 gattaccacttccttttgctccacacatctttgtttttcattggtgtga-ttttaaccggattcacaaca 31936398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12195575 - 12195515
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  12195575 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Original strand, 5572050 - 5572148
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    ||||||| |||||||||| | | |  |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||  |||| |||| ||||||||    
T  5572050 agggttgggtgtctttgtagtggggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcactattggaatgatcaaaagcttc 5572146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22963989 - 22963922
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22963989 agggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 22963922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 23824404 - 23824471
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  23824404 agggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 23824471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 24435779 - 24435845
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  24435779 agggttgagtgtctttgt-gtgaggttctcttgagttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 24435845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 31979802 - 31979704
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  31979802 agggttgagtgtctttgtagtgaggttcttttgggttgagaaa--cattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaagcttc 31979706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5273276 - 5273203
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttctcggtgtt 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  5273276 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctcagtgtt 5273203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 6005650 - 6005598
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6005650 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 6005598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16838977 - 16838925
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaa--acattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16838977 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 16838925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 21801149 - 21801218
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttg--ggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  21801149 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 21801218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 33330297 - 33330349
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33330297 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 33330349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 33335794 - 33335846
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33335794 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 33335846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4816291 - 4816231
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  4816291 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4816231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19704627 - 19704567
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  19704627 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19704567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20915416 - 20915356
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  20915416 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20915356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26932622 - 26932562
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26932622 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 26932562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 28137665 - 28137605
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  28137665 agggttgagggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggt 28137605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29754769 - 29754709
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29754769 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 29754709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 33309110 - 33309170
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  33309110 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 33309170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 129 - 483
Target Start/End: Original strand, 34967 - 35323
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34967 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtt-cttctaacctttt 35065  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35066 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 35165  T
Q  329 tttctt-gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
    |||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35166 ttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttg 35264  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgttta--tcattggtgtga 483  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35265 ttctcattgattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatttcattggtgtga 35323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 34905 - 34967
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34905 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaacattgtaatcaccttgggt 34967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 5)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 129 - 467
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9883
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9549 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 9645  T
Q  229 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcc 9745  T
Q  329 tttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg- 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  9746 tttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctc-ttgtgtggttttgctatatactagcttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgc 9843  T
Q  428 gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9844 tctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 9883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 213
Target Start/End: Original strand, 3754 - 3837
Alignment:
Q  129 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3754 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagt 3837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 3692 - 3754
Alignment:
Q  15 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3692 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggttaggaaaaacattgtaatcaccttgggt 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 427
Target Start/End: Original strand, 1 - 89
Alignment:
Q  335 gcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||   |||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1 gcttatcttgtttatgctt-gttagctc---gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttg 89  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 77
Target Start/End: Original strand, 9514 - 9549
Alignment:
Q  42 tcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 77  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9514 tcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 507
Target Start/End: Original strand, 17755 - 18241
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  17755 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 17853  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  17854 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 17951  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17952 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 18051  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg--ttttgttgttgt 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||   |||||  || || ||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  18052 ggtgtgtttgttcttcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttg- 18145  T
Q  410 ttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaacaatt 507  Q
    |||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18146 ttgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtttgagttttaaccggattcacaacaatt 18241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 504
Target Start/End: Original strand, 23848 - 24331
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  23848 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttc 23946  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagagt 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||   |    
T  23947 ctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt-t 24044  T
Q  214 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctc 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  24045 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttttt 24144  T
Q  313 ggtgt-tttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctg--ttttgttgttgt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||  |||||   |||||  || || ||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  24145 ggtgtgtttgttcttcctttctttcttatcttgtt--ttctttgtattctct---tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttg- 24238  T
Q  410 ttgcttagagaccatttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatcattggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    |||||| |||| || ||  | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24239 ttgcttggaga-cactttacacatagattaccacttccttttgctccacacatctttgttta-cattggtgtgagttttaaccggattcacaaca 24331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 536 - 208
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaaccttttgtaa 232  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  536 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagt--cttgtaaccttttgtaa 440  T
Q  233 cactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctt--cct 329  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  439 cactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctt 341  T
Q  330 ttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg-g 428  Q
    ||   | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||      
T  340 ttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgtt 243  T
Q  429 ctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  242 ctcattgattatcaccatcacttgctccacacatc 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 592 - 542
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  592 ctttgatgagagagtttcttaggttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Original strand, 148866 - 149199
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  148866 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-tctatggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgta 148962  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttc 327  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||    
T  148963 acacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttc 149061  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
    |||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  149062 ctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 149158  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  149159 cactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 149199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 148808 - 148860
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  148808 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 148860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 134 - 463
Target Start/End: Original strand, 14219 - 14549
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  14219 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgta 14315  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttc 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||    
T  14316 acacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttc 14415  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttg-tttgcttagagaccattt 426  Q
     ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  14416 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccattt 14511  T
Q  427 g-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14512 gcactcatagattacctctatctcttgctccacacatc 14549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Original strand, 19075 - 19408
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  19075 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgta 19171  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttc 327  Q
    ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||    
T  19172 acacactcacatattgtattggagagctgctctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttc 19270  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
     ||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  19271 ttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 19367  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  19368 cactcatagattatctctatcacttgctccacacatcattg 19408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 14161 - 14213
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14161 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 14213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 19017 - 19068
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttgg 75  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19017 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgg 19068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 467
Target Start/End: Original strand, 2161 - 2494
Alignment:
Q  134 gggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttga-aggctagagtttcttgtaac-cttttgta 231  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  2161 gggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-tctatggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctaga--ttcttgtaactcttttgta 2257  T
Q  232 acactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttc 327  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||    
T  2258 acacattcacatattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttc 2356  T
Q  328 ctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttagagaccatttg 427  Q
    |||| | | ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  2357 ctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttg 2453  T
Q  428 -gctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
      ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  2454 cactcatggattatctttatcacttgctccacacatcattg 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 2103 - 2155
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2103 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 2155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 277 - 504
Target Start/End: Original strand, 300 - 527
Alignment:
Q  277 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctcggtgttttgttcttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggattta 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||     
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttcttggtgttttgttctttctttctagcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggttttg 398  T
Q  377 ctatacactagtctagggctg--ttttgttgttgtttgcttagagacca-tttggctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattgtttatc 473  Q
    ||   ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  399 ctcctcactagtttagggctgttttttgttgttg-ttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctttgttt-tc 496  T
Q  474 attggtgtgagtttcaaccagattcacaaca 504  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  497 attggtgtgagttttaaatggattcacaaca 527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 8224 - 8516
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||  ||||||||    
T  8224 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggattaaaagcttc 8320  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || ||   ||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  8321 cttttgtgtcttctcttttagggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatacgtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatt- 8417  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8418 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 22343 - 22403
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22343 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 24618 - 24678
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24618 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 24678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 241 - 463
Target Start/End: Original strand, 181980 - 182204
Alignment:
Q  241 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc---ttcctttcttgc 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| ||| | |     
T  181980 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgt 182079  T
Q  337 ttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggatttactatacactagtctagggctgttttgttgttg-tttgcttagagaccatttg-gctcata 434  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| || |||| ||| |||||||  ||||||    
T  182080 ttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcata 182175  T
Q  435 gattaccactatctcttgctccacacatc 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  182176 gattacctctatctcttgctccacacatc 182204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 176829 - 176881
Alignment:
Q  26 ctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaa--aacattgtaatcaccttggg 76  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  176829 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggg 176881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 36639 - 36929
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  36639 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 36735  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||   | |  |||||||||||||| ||||| | ||||       
T  36736 cttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaatcatgtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctat-- 36830  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36831 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 43768 - 44058
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  43768 agggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 43864  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||  || || ||||||||  ||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||       
T  43865 cttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagagtggaac-acaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtataa-gcttgcaagctat-- 43959  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43960 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 133086 - 133377
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||||||||    
T  133086 agggttgagtttctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttc 133182  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcat-attgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||  ||||  |||||||||||||| | ||| | ||||       
T  133183 cttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtggg-aaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaa-gtttgcaagctatt- 133278  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  133279 tttcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 133377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5683
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2492
Alignment:
Q  224 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatctt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 5973 - 5908
Alignment:
Q  16 ggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 83  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  5973 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggcaaa--cattgtaaacaccttgggtagtgag 5908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 85973 - 85684
Alignment:
Q  14 agggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattaaaggaaggatctaaagcttc 113  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| | ||||  |  ||||||||| ||| ||||    
T  85973 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgggaaa--cattgtaaacactttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaacttc 85877  T
Q  114 ctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaa-gggtagaatctagggtttgttcttgtgtaaagcttgaaggctagag 212  Q
    || | |||  || ||| ||||  ||||||||||| ||||||| | | || ||| ||||||||  ||||  ||| |||||||||| ||||  | ||||       
T  85876 cttttgtgtttt-tctcttagaattcatattgtgggagtggg-agacacaaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaa-gcttttaagctaa-- 85782  T
Q  213 tttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 308  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85781 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10828 - 10729
Alignment:
Q  213 tttcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  10828 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 10729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45253
Alignment:
Q  227 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 309  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctt 45253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Original strand, 269 - 329
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  269 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 467
Target Start/End: Original strand, 34132 - 34192
Alignment:
Q  408 gtttgcttagagaccatttgg-ctcatagattaccactatctcttgctccacacatcattg 467  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  34132 gtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatcattg 34192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11533 - 11500
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11533 tggattggagagctgctctctcccccagactagg 11500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 69352 - 69292
Alignment:
Q  246 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  69352 tggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 69292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University