View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4285_high_2 (Length: 714)

Name: NF4285_high_2
Description: NF4285
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4285_high_2
NF4285_high_2
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (23-702)||(6223736-6224419)
chr5 (83-256)||(40296310-40296483)
chr5 (76-244)||(6500453-6500620)
chr5 (35-257)||(299478-299702)
chr5 (78-256)||(42405588-42405764)
chr5 (78-256)||(15370089-15370267)
chr5 (76-253)||(1028505-1028682)
chr5 (76-256)||(25327925-25328105)
chr5 (78-257)||(34753015-34753194)
chr5 (89-256)||(36492218-36492385)
chr5 (74-244)||(18603106-18603276)
chr5 (23-256)||(26075093-26075330)
chr5 (23-240)||(9498590-9498806)
chr5 (87-240)||(41170640-41170793)
chr5 (76-244)||(6500825-6500992)
chr5 (132-256)||(26074602-26074726)
chr5 (76-244)||(27502024-27502192)
chr5 (104-253)||(13415776-13415925)
chr5 (87-259)||(3295344-3295514)
chr5 (85-253)||(41632775-41632943)
chr5 (78-244)||(624198-624364)
chr5 (76-250)||(3295003-3295176)
chr5 (76-253)||(36568557-36568732)
chr5 (87-256)||(12662651-12662820)
chr5 (86-244)||(32487396-32487553)
chr5 (88-251)||(35150002-35150164)
chr5 (23-244)||(623820-624040)
chr5 (132-253)||(26074190-26074311)
chr5 (87-256)||(11416976-11417143)
chr5 (76-221)||(15370427-15370572)
chr5 (73-253)||(24489191-24489369)
chr5 (132-256)||(26074825-26074950)
chr5 (132-256)||(35167882-35168006)
chr5 (85-257)||(35914838-35915010)
chr5 (92-234)||(33747783-33747925)
chr5 (148-254)||(42508604-42508710)
chr5 (132-244)||(29549299-29549411)
chr5 (132-256)||(300949-301065)
chr5 (165-253)||(39309677-39309764)
chr5 (166-244)||(26074320-26074398)
chr5 (96-241)||(38427553-38427697)
chr5 (139-256)||(41635242-41635359)
chr5 (108-244)||(5723811-5723947)
chr5 (132-254)||(31509615-31509738)
chr5 (138-253)||(36521946-36522061)
chr5 (171-244)||(7768852-7768925)
chr5 (77-243)||(2411010-2411176)
chr5 (78-160)||(26900007-26900089)
chr5 (132-209)||(26590954-26591031)
chr5 (204-256)||(35150737-35150789)
chr5 (204-256)||(35151028-35151080)
chr5 (132-243)||(36522281-36522392)
chr5 (132-253)||(13786045-13786166)
chr5 (35-159)||(38427306-38427432)
chr5 (186-243)||(6225047-6225104)
chr5 (200-256)||(26900082-26900138)
chr5 (132-179)||(13042606-13042653)
chr5 (148-246)||(42524717-42524814)
chr5 (132-232)||(31509745-31509846)
chr5 (114-162)||(795258-795306)
chr5 (131-179)||(13112604-13112652)
chr5 (132-188)||(32445943-32445999)
chr5 (222-254)||(36527217-36527249)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (25-258)||(16454563-16454797)
chr6 (23-256)||(2579807-2580040)
chr6 (26-244)||(29518505-29518724)
chr6 (35-256)||(2377744-2377966)
chr6 (87-256)||(2578442-2578610)
chr6 (27-244)||(35210206-35210423)
chr6 (87-244)||(29518922-29519079)
chr6 (87-244)||(32741181-32741338)
chr6 (76-256)||(16454897-16455077)
chr6 (23-256)||(16107668-16107904)
chr6 (87-244)||(2378128-2378285)
chr6 (77-242)||(3415462-3415629)
chr6 (23-253)||(2578769-2578999)
chr6 (98-244)||(3409261-3409407)
chr6 (24-253)||(10074298-10074528)
chr6 (98-244)||(26544051-26544197)
chr6 (87-244)||(1846750-1846907)
chr6 (23-256)||(2579044-2579273)
chr6 (78-244)||(14748332-14748494)
chr6 (76-256)||(5832016-5832194)
chr6 (87-244)||(3409662-3409819)
chr6 (86-244)||(3058228-3058386)
chr6 (23-241)||(2579426-2579645)
chr6 (87-256)||(2843544-2843714)
chr6 (88-253)||(10073991-10074156)
chr6 (138-256)||(32460630-32460748)
chr6 (73-253)||(10073601-10073779)
chr6 (155-256)||(16108053-16108154)
chr6 (104-256)||(1950201-1950353)
chr6 (76-244)||(593695-593865)
chr6 (75-240)||(1127366-1127531)
chr6 (91-258)||(6999799-6999966)
chr6 (136-256)||(9062398-9062517)
chr6 (132-254)||(6071124-6071246)
chr6 (132-254)||(8481919-8482040)
chr6 (132-253)||(10911558-10911680)
chr6 (35-253)||(12092428-12092647)
chr6 (132-256)||(5958647-5958771)
chr6 (76-179)||(31714736-31714838)
chr6 (54-244)||(12071657-12071847)
chr6 (132-231)||(2975567-2975666)
chr6 (54-253)||(12085001-12085198)
chr6 (168-209)||(14789284-14789325)
chr6 (173-226)||(35210498-35210551)
chr6 (134-178)||(22605301-22605345)
chr6 (54-200)||(30618584-30618727)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (32-256)||(6421375-6421599)
chr2 (32-253)||(42514642-42514863)
chr2 (35-244)||(36178552-36178761)
chr2 (73-256)||(15880253-15880436)
chr2 (35-244)||(37105926-37106136)
chr2 (35-244)||(14745612-14745823)
chr2 (78-244)||(5542615-5542781)
chr2 (90-244)||(37106190-37106344)
chr2 (76-244)||(41283463-41283631)
chr2 (35-253)||(962591-962808)
chr2 (54-244)||(5542964-5543154)
chr2 (87-256)||(6712966-6713136)
chr2 (95-256)||(36005887-36006047)
chr2 (24-251)||(35580659-35580886)
chr2 (25-253)||(23346228-23346457)
chr2 (88-256)||(15511495-15511661)
chr2 (87-230)||(6422126-6422269)
chr2 (89-256)||(38796619-38796788)
chr2 (91-253)||(40679632-40679794)
chr2 (104-253)||(5367448-5367597)
chr2 (132-257)||(28254281-28254406)
chr2 (90-256)||(33731636-33731804)
chr2 (73-228)||(36178156-36178311)
chr2 (87-256)||(40733507-40733676)
chr2 (135-253)||(28531361-28531479)
chr2 (136-256)||(31259664-31259787)
chr2 (87-256)||(40733873-40734041)
chr2 (32-249)||(7598225-7598443)
chr2 (139-244)||(36178320-36178425)
chr2 (98-249)||(1769889-1770040)
chr2 (134-253)||(37632643-37632762)
chr2 (139-256)||(16542439-16542556)
chr2 (132-256)||(29676893-29677022)
chr2 (138-256)||(31468800-31468914)
chr2 (132-249)||(7598606-7598715)
chr2 (132-240)||(14745338-14745446)
chr2 (168-256)||(38796298-38796386)
chr2 (158-257)||(31899496-31899595)
chr2 (99-235)||(40163383-40163520)
chr2 (23-184)||(6421793-6421955)
chr2 (98-255)||(12529038-12529195)
chr2 (134-254)||(37895107-37895227)
chr2 (189-256)||(36785664-36785731)
chr2 (132-250)||(29874067-29874185)
chr2 (54-254)||(30313170-30313369)
chr2 (76-253)||(16590881-16591053)
chr2 (138-253)||(33561501-33561616)
chr2 (198-256)||(6421294-6421352)
chr2 (88-238)||(29676543-29676687)
chr2 (132-254)||(30323456-30323578)
chr2 (134-251)||(37894738-37894855)
chr2 (78-192)||(3673122-3673236)
chr2 (35-174)||(3672773-3672913)
chr2 (138-253)||(33953821-33953936)
chr2 (139-253)||(9231242-9231356)
chr2 (139-253)||(12910221-12910335)
chr2 (141-230)||(28254165-28254254)
chr2 (138-254)||(29873587-29873703)
chr2 (132-204)||(31385779-31385851)
chr2 (54-204)||(30312831-30312982)
chr2 (115-193)||(36784287-36784365)
chr2 (211-256)||(3673075-3673120)
chr2 (184-253)||(42515005-42515078)
chr2 (86-184)||(6421688-6421786)
chr2 (211-256)||(3672709-3672754)
chr2 (132-253)||(33954306-33954426)
chr2 (139-253)||(41678419-41678534)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (23-256)||(1085550-1085784)
chr7 (24-243)||(37533299-37533519)
chr7 (76-258)||(7517568-7517750)
chr7 (23-258)||(45433229-45433462)
chr7 (24-244)||(37532946-37533166)
chr7 (77-256)||(30244260-30244439)
chr7 (73-256)||(30245067-30245246)
chr7 (87-256)||(40094773-40094942)
chr7 (76-259)||(22567027-22567209)
chr7 (87-257)||(23376-23546)
chr7 (86-256)||(24177425-24177595)
chr7 (23-256)||(45754706-45754937)
chr7 (43-256)||(47129085-47129297)
chr7 (132-256)||(7554015-7554139)
chr7 (78-256)||(11845183-11845359)
chr7 (137-256)||(22566711-22566830)
chr7 (87-256)||(45434626-45434795)
chr7 (76-244)||(29157567-29157735)
chr7 (78-258)||(30032555-30032735)
chr7 (90-256)||(34218036-34218202)
chr7 (87-251)||(6054555-6054719)
chr7 (132-256)||(16569186-16569310)
chr7 (132-256)||(16596352-16596476)
chr7 (79-255)||(36939724-36939900)
chr7 (78-257)||(41854624-41854802)
chr7 (98-238)||(19122740-19122879)
chr7 (78-256)||(118290-118469)
chr7 (133-253)||(8128486-8128606)
chr7 (132-244)||(14681512-14681624)
chr7 (132-256)||(36534828-36534952)
chr7 (148-259)||(41910654-41910765)
chr7 (90-256)||(9901635-9901799)
chr7 (138-256)||(24838751-24838870)
chr7 (132-251)||(40230335-40230454)
chr7 (134-256)||(1085294-1085417)
chr7 (181-256)||(30245484-30245559)
chr7 (181-256)||(30255329-30255404)
chr7 (135-257)||(36622949-36623071)
chr7 (176-256)||(30244691-30244771)
chr7 (132-256)||(43241485-43241609)
chr7 (158-253)||(28301613-28301708)
chr7 (181-255)||(36109010-36109084)
chr7 (141-241)||(44361517-44361616)
chr7 (73-204)||(30253534-30253661)
chr7 (132-256)||(20599304-20599430)
chr7 (88-163)||(47129452-47129527)
chr7 (90-187)||(37167840-37167937)
chr7 (194-258)||(36967335-36967399)
chr7 (73-158)||(37532736-37532821)
chr7 (196-253)||(40094502-40094559)
chr7 (77-200)||(28300242-28300366)
chr7 (132-179)||(21416185-21416232)
chr7 (54-125)||(30245276-30245347)
chr7 (42-125)||(30253691-30253774)
chr7 (132-177)||(23569046-23569091)
chr7 (23-67)||(40094702-40094746)
chr7 (89-163)||(28300569-28300644)
chr7 (134-179)||(21619091-21619136)
chr7 (76-125)||(30244473-30244522)
[»] chr4 (79 HSPs)
chr4 (32-257)||(10245909-10246135)
chr4 (42-256)||(25483326-25483540)
chr4 (25-251)||(3340802-3341029)
chr4 (25-252)||(44620654-44620880)
chr4 (76-253)||(36629230-36629407)
chr4 (23-251)||(39404013-39404242)
chr4 (89-256)||(39404388-39404555)
chr4 (88-256)||(36572009-36572177)
chr4 (98-253)||(52884688-52884844)
chr4 (89-256)||(1731646-1731813)
chr4 (73-256)||(36608644-36608827)
chr4 (78-249)||(54017583-54017754)
chr4 (87-257)||(50002415-50002585)
chr4 (79-244)||(55933113-55933278)
chr4 (23-253)||(20825829-20826061)
chr4 (76-244)||(50630741-50630909)
chr4 (79-257)||(22183253-22183431)
chr4 (23-252)||(49076765-49076992)
chr4 (34-256)||(22028311-22028537)
chr4 (90-253)||(39792860-39793023)
chr4 (26-237)||(44621011-44621220)
chr4 (23-253)||(2740693-2740914)
chr4 (87-244)||(41370359-41370516)
chr4 (132-256)||(34646691-34646815)
chr4 (105-256)||(4955332-4955483)
chr4 (132-256)||(52884877-52885002)
chr4 (76-256)||(22027947-22028127)
chr4 (98-253)||(54108908-54109060)
chr4 (89-256)||(50459711-50459878)
chr4 (132-254)||(41707507-41707628)
chr4 (132-258)||(54936188-54936310)
chr4 (23-237)||(44620362-44620569)
chr4 (74-256)||(4390085-4390267)
chr4 (132-244)||(49880162-49880274)
chr4 (32-256)||(54108527-54108751)
chr4 (23-256)||(16889469-16889703)
chr4 (93-253)||(20826210-20826370)
chr4 (87-236)||(54343005-54343147)
chr4 (95-253)||(32941128-32941286)
chr4 (88-243)||(49302907-49303064)
chr4 (87-220)||(18932746-18932879)
chr4 (137-253)||(2741064-2741180)
chr4 (78-256)||(16888804-16888983)
chr4 (23-192)||(23817612-23817783)
chr4 (89-256)||(45489331-45489497)
chr4 (131-256)||(3341118-3341243)
chr4 (132-256)||(43174496-43174621)
chr4 (138-256)||(54017750-54017870)
chr4 (152-256)||(49076510-49076614)
chr4 (138-253)||(3244499-3244614)
chr4 (132-231)||(45496820-45496919)
chr4 (139-253)||(54741227-54741341)
chr4 (157-253)||(10246340-10246436)
chr4 (91-251)||(34004586-34004744)
chr4 (181-257)||(44620285-44620361)
chr4 (183-254)||(3700357-3700428)
chr4 (104-256)||(19504695-19504838)
chr4 (90-200)||(18879852-18879962)
chr4 (145-255)||(51768115-51768225)
chr4 (132-253)||(28034222-28034343)
chr4 (132-225)||(48111740-48111833)
chr4 (132-240)||(6975498-6975606)
chr4 (181-256)||(44620934-44621010)
chr4 (87-206)||(43827480-43827598)
chr4 (181-252)||(44621420-44621491)
chr4 (24-195)||(31691203-31691375)
chr4 (132-241)||(760194-760302)
chr4 (132-248)||(40067041-40067158)
chr4 (194-244)||(50788087-50788137)
chr4 (198-254)||(45050593-45050649)
chr4 (26-246)||(45489650-45489870)
chr4 (87-192)||(3271841-3271948)
chr4 (132-179)||(11197293-11197340)
chr4 (136-204)||(34544148-34544217)
chr4 (172-256)||(11348410-11348494)
chr4 (132-204)||(15841410-15841482)
chr4 (132-179)||(10396198-10396245)
chr4 (205-256)||(11706636-11706687)
chr4 (139-252)||(15841034-15841146)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (35-256)||(460-682)
scaffold0702 (87-244)||(146-298)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (23-256)||(34834866-34835098)
chr8 (54-244)||(3669689-3669879)
chr8 (34-256)||(3038234-3038458)
chr8 (96-256)||(30359261-30359421)
chr8 (73-244)||(3670062-3670232)
chr8 (78-256)||(34835199-34835377)
chr8 (88-253)||(9608738-9608903)
chr8 (80-260)||(33113359-33113539)
chr8 (23-254)||(40518061-40518295)
chr8 (23-236)||(18371928-18372142)
chr8 (73-244)||(30441083-30441258)
chr8 (88-258)||(37544490-37544660)
chr8 (78-256)||(6876852-6877031)
chr8 (78-256)||(34835464-34835643)
chr8 (78-256)||(34835730-34835909)
chr8 (85-251)||(1513912-1514078)
chr8 (91-256)||(70277-70441)
chr8 (92-256)||(9482608-9482770)
chr8 (88-256)||(25561815-25561984)
chr8 (92-257)||(30359598-30359763)
chr8 (92-220)||(9483191-9483319)
chr8 (23-256)||(147441-147675)
chr8 (23-244)||(1014178-1014401)
chr8 (90-251)||(40518577-40518738)
chr8 (132-256)||(9309345-9309469)
chr8 (74-244)||(45121896-45122066)
chr8 (98-251)||(45122067-45122220)
chr8 (88-256)||(8918764-8918932)
chr8 (88-255)||(5915863-5916025)
chr8 (78-244)||(40579496-40579662)
chr8 (95-256)||(45121663-45121823)
chr8 (96-244)||(1013879-1014027)
chr8 (76-244)||(20870561-20870731)
chr8 (91-253)||(41972151-41972316)
chr8 (24-253)||(9308970-9309204)
chr8 (23-220)||(45122650-45122852)
chr8 (87-256)||(45122996-45123165)
chr8 (138-254)||(5420643-5420759)
chr8 (74-221)||(32305502-32305649)
chr8 (133-256)||(43274824-43274947)
chr8 (132-256)||(8794101-8794225)
chr8 (98-256)||(147819-147968)
chr8 (132-209)||(9609122-9609199)
chr8 (87-239)||(18371660-18371807)
chr8 (89-242)||(18380020-18380171)
chr8 (158-239)||(41416241-41416322)
chr8 (142-256)||(18372988-18373098)
chr8 (141-241)||(20130454-20130553)
chr8 (76-243)||(32640519-32640682)
chr8 (132-254)||(9507769-9507896)
chr8 (132-253)||(4154710-4154831)
chr8 (174-243)||(18372342-18372411)
chr8 (174-243)||(18372785-18372854)
chr8 (96-244)||(6731906-6732045)
chr8 (138-248)||(18372656-18372762)
chr8 (97-252)||(12283867-12284021)
chr8 (181-236)||(25561737-25561792)
chr8 (87-239)||(6651510-6651653)
chr8 (25-163)||(8919082-8919219)
chr8 (77-171)||(40579258-40579352)
chr8 (73-253)||(9620663-9620841)
chr8 (156-243)||(3037776-3037865)
chr8 (132-254)||(4154325-4154446)
chr8 (76-161)||(41129073-41129158)
chr8 (23-146)||(18372218-18372342)
chr8 (169-253)||(33831971-33832055)
chr8 (137-242)||(43398117-43398225)
chr8 (202-243)||(18372485-18372526)
chr8 (189-253)||(20995502-20995566)
chr8 (132-251)||(5274770-5274889)
chr8 (154-209)||(18373236-18373291)
chr8 (42-125)||(3037921-3038006)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (54-256)||(43346756-43346959)
chr3 (23-256)||(37990911-37991145)
chr3 (77-257)||(42342377-42342557)
chr3 (73-256)||(29644887-29645070)
chr3 (32-256)||(32462843-32463069)
chr3 (86-253)||(35946515-35946682)
chr3 (32-256)||(52634666-52634889)
chr3 (54-254)||(54017782-54017982)
chr3 (73-256)||(12114547-12114730)
chr3 (87-256)||(37990638-37990807)
chr3 (23-258)||(3135389-3135631)
chr3 (32-256)||(15772844-15773069)
chr3 (73-257)||(29644566-29644750)
chr3 (87-257)||(54018197-54018367)
chr3 (87-244)||(22304571-22304728)
chr3 (23-253)||(33803186-33803417)
chr3 (87-256)||(32589694-32589862)
chr3 (77-256)||(25739413-25739593)
chr3 (35-257)||(22303900-22304117)
chr3 (90-256)||(42342092-42342258)
chr3 (87-256)||(25755384-25755553)
chr3 (132-256)||(45901703-45901828)
chr3 (34-256)||(41359710-41359929)
chr3 (96-237)||(39934963-39935104)
chr3 (96-256)||(49336694-49336855)
chr3 (88-257)||(31190006-31190167)
chr3 (24-256)||(53577354-53577588)
chr3 (94-256)||(15773182-15773346)
chr3 (132-256)||(32462602-32462727)
chr3 (132-244)||(39389072-39389184)
chr3 (86-254)||(45395651-45395819)
chr3 (87-253)||(21832344-21832508)
chr3 (113-254)||(3135098-3135237)
chr3 (132-253)||(8327897-8328018)
chr3 (105-244)||(4823657-4823796)
chr3 (73-258)||(53117961-53118144)
chr3 (99-256)||(39914242-39914399)
chr3 (138-253)||(33175711-33175829)
chr3 (140-256)||(1634366-1634483)
chr3 (75-172)||(41359478-41359575)
chr3 (93-236)||(42584829-42584970)
chr3 (132-256)||(11661941-11662066)
chr3 (170-244)||(50612534-50612608)
chr3 (132-253)||(9240142-9240263)
chr3 (144-252)||(33362349-33362460)
chr3 (86-254)||(44160545-44160710)
chr3 (181-256)||(11661525-11661600)
chr3 (190-256)||(43346640-43346706)
chr3 (91-188)||(22303662-22303759)
chr3 (132-253)||(47964562-47964683)
chr3 (169-244)||(51886563-51886638)
chr3 (154-243)||(7767380-7767469)
chr3 (191-244)||(22304248-22304301)
chr3 (23-128)||(22304311-22304419)
chr3 (181-244)||(37726506-37726569)
chr3 (139-249)||(3384317-3384427)
chr3 (23-112)||(9239947-9240037)
chr3 (151-251)||(39336292-39336392)
chr3 (138-253)||(46546375-46546490)
chr3 (136-196)||(52634990-52635050)
chr3 (132-176)||(54017592-54017636)
chr3 (137-204)||(12749211-12749278)
chr3 (32-112)||(41360079-41360161)
chr3 (132-253)||(47964959-47965080)
chr3 (214-254)||(12747878-12747918)
chr3 (134-178)||(17731950-17731994)
chr3 (134-178)||(19033181-19033225)
chr3 (132-204)||(39336014-39336086)
chr3 (132-179)||(53596027-53596074)
chr3 (132-179)||(53596342-53596389)
chr3 (132-179)||(53596542-53596589)
[»] chr1 (65 HSPs)
chr1 (23-256)||(31767096-31767329)
chr1 (23-244)||(44290757-44290981)
chr1 (73-254)||(17294569-17294751)
chr1 (78-244)||(44290448-44290614)
chr1 (23-256)||(41156981-41157217)
chr1 (87-257)||(41142361-41142532)
chr1 (24-257)||(26661833-26662067)
chr1 (23-256)||(34649428-34649662)
chr1 (87-256)||(26661521-26661690)
chr1 (32-256)||(34364497-34364722)
chr1 (23-253)||(22077429-22077660)
chr1 (27-242)||(9955911-9956129)
chr1 (77-254)||(41157367-41157545)
chr1 (23-254)||(66406-66638)
chr1 (87-238)||(14318875-14319026)
chr1 (27-256)||(37850539-37850768)
chr1 (88-241)||(3537599-3537752)
chr1 (132-256)||(34364915-34365039)
chr1 (97-256)||(37556101-37556260)
chr1 (104-260)||(38804371-38804527)
chr1 (88-244)||(41759485-41759641)
chr1 (87-256)||(11977270-11977439)
chr1 (76-250)||(45084378-45084546)
chr1 (88-254)||(5319965-5320131)
chr1 (86-244)||(48588486-48588644)
chr1 (23-243)||(50051958-50052178)
chr1 (92-244)||(3550722-3550871)
chr1 (96-255)||(40082398-40082556)
chr1 (76-254)||(3875319-3875497)
chr1 (86-256)||(29798189-29798359)
chr1 (132-244)||(32594760-32594872)
chr1 (152-256)||(41184489-41184593)
chr1 (86-256)||(39066199-39066368)
chr1 (85-244)||(45493971-45494135)
chr1 (34-251)||(22077774-22077991)
chr1 (97-255)||(37555721-37555878)
chr1 (132-240)||(5575110-5575218)
chr1 (167-244)||(3537226-3537303)
chr1 (88-244)||(32168698-32168843)
chr1 (137-253)||(66136-66254)
chr1 (95-253)||(24600321-24600479)
chr1 (79-220)||(22077101-22077242)
chr1 (132-209)||(44043816-44043893)
chr1 (165-256)||(21378118-21378209)
chr1 (98-256)||(45839617-45839779)
chr1 (88-253)||(19283455-19283620)
chr1 (152-253)||(44685449-44685551)
chr1 (94-254)||(22793270-22793431)
chr1 (152-253)||(24132049-24132150)
chr1 (140-253)||(30630690-30630803)
chr1 (132-236)||(5528798-5528902)
chr1 (199-259)||(35154150-35154210)
chr1 (87-181)||(11977009-11977103)
chr1 (132-253)||(1188632-1188753)
chr1 (187-253)||(50469180-50469246)
chr1 (178-246)||(4266872-4266940)
chr1 (88-147)||(21378059-21378118)
chr1 (138-219)||(4956218-4956299)
chr1 (23-125)||(41184340-41184445)
chr1 (185-253)||(4878796-4878864)
chr1 (132-163)||(12466366-12466397)
chr1 (132-191)||(35154047-35154106)
chr1 (138-251)||(1187414-1187527)
chr1 (138-183)||(31877262-31877307)
chr1 (152-197)||(41184152-41184197)
[»] scaffold0391 (4 HSPs)
scaffold0391 (78-257)||(1096-1275)
scaffold0391 (132-199)||(1735-1802)
scaffold0391 (195-256)||(3092-3153)
scaffold0391 (23-118)||(1618-1713)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (132-254)||(5349-5471)
scaffold0078 (95-256)||(4972-5133)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (97-265)||(5377-5546)
scaffold0734 (156-256)||(5767-5867)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (132-256)||(17498-17624)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (87-256)||(47350-47519)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (169-257)||(10192-10280)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (214-254)||(39830-39870)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 587; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 6224419 - 6223736
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6224419 tgcctcagtcgtacccttcgtcgaaccgggctctgatactgctgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcac 6224320  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6224319 aagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgaag 6224220  T
Q  223 tgggacatataactcacacttgtacacaacaacataaagcacccactaaatgtgcatcaaaatctttctgctaaagccagcccgcaatactgttaagcaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6224219 tgggacatataactcacacttgtacacaacaacataaagcacccactaaatgtgcatcaaaatctttctgctaaagccaacccgcaatactgttaagcaa 6224120  T
Q  323 agtacagtgtactaaaatgtacacacattacagcatacttttttagctgggatatcaacaaatttctgaccacctctcacatatgatatacttcaacagg 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6224119 agtacagtgtactaaaatgtacacgcattacagcatacttttttagctgagatatcaacaaatttctgaccacctctcacatatgatatacttcaatagg 6224020  T
Q  423 atgttcagttatacctatagctgccaaattcaaaacattaaaataagctagattattgatacaaaattacaaatacacctctgtggtgatattttagtta 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6224019 atgttcagttatacctatagctgccaaattcaaaacattaaaataagctacattattgatacaaaattacaaatacacctctgtggtgatattttagtta 6223920  T
Q  523 tataacc----ttagaattttcaatgaataattttccttgaacaccaataaccttcatcagactttgcagtactcttctacagtccacctttaaaatccc 618  Q
    |||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6223919 tatagccttaattagaattttcaatgaataattttccttgaacaccaataaccttcatcagactttgcagtactcttccatagtccacctttaaaatccc 6223820  T
Q  619 aatttcgctcataattatcaacagcctccgattcatgatagaatctccaagcattacccttaccatttaaccactgtgcatagt 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6223819 aatttcgctcataattatcaacagcctccgattcatgatagaatctccaagcattacccttaccatttaaccactttgcatagt 6223736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 256
Target Start/End: Original strand, 40296310 - 40296483
Alignment:
Q  83 gcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatc 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  40296310 gcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctc 40296409  T
Q  183 ttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  40296410 ttacttataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaccaaca 40296483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6500620 - 6500453
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||      
T  6500620 gaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaa 6500521  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6500520 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 6500453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 35 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 299702 - 299478
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaa-cacgaggggagc-ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaa 132  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||   || ||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||||||||   |    
T  299702 acccttcgtcgaacgaggctctgataccactgttggggtcatgaggggagctccgggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaataga 299603  T
Q  133 gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatat 232  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  299602 gacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatat 299503  T
Q  233 aactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||||||||  |||||||||||    
T  299502 aactcacacttgcgcacaacaacat 299478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Original strand, 42405588 - 42405764
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |    
T  42405588 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaag--agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgag 42405685  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42405686 tccttttacttgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttgtacacaacaaca 42405764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15370267 - 15370089
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||    
T  15370267 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatggg 15370168  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15370167 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 15370089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Original strand, 1028505 - 1028682
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |   |||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  1028505 gaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatg 1028604  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028605 ggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 1028682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25328105 - 25327925
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||    
T  25328105 gaggggagctcgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 25328006  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25328005 ggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacacttagacacaacaaca 25327925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Original strand, 34753015 - 34753194
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  34753015 ggggagcttgggaaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatggg 34753114  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34753115 tcttcttacttataaggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataacttacatttgtacacaacaacat 34753194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492385
Alignment:
Q  89 gggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactt 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| |||||| |||| ||||||||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactt 36492317  T
Q  189 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36492318 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacaacaaca 36492385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 74 - 244
Target Start/End: Original strand, 18603106 - 18603276
Alignment:
Q  74 acgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttta 173  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18603106 acgaggggagccaggagaaccgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 18603205  T
Q  174 tgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18603206 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 18603276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 26075093 - 26075330
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacg--aggggagcct-gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccg 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| | |   |||||||| | ||||||  |||||||| ||||||| | |||||     
T  26075093 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaacgaggctctgataccactgttggatcgctttaggggagcttagggggatagtccacatcgaggctaaaacaacca 26075192  T
Q  120 cacaagcaactaagacaccacactctt-accaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatcc 218  Q
    |||  ||||   ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26075193 cacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatcc 26075292  T
Q  219 gacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26075293 gatgtgagacatataaatcacacttgtacacaacaaca 26075330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 240
Target Start/End: Original strand, 9498590 - 9498806
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |  | ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||     
T  9498590 tgcctcggtcgtaccctttgtcgaacggggctctgataccgcacttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacattgaggctagaccagca-cat 9498688  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    || |||   |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |    
T  9498689 aaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatg 9498788  T
Q  223 tgggacatataactcaca 240  Q
    || |||||||||||||||    
T  9498789 tgagacatataactcaca 9498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41170793 - 41170640
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41170793 gggggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 41170694  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcaca 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41170693 ttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 41170640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6500992 - 6500825
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||   |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||    
T  6500992 gaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 6500893  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6500892 ggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 6500825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26074726 - 26074602
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  26074726 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacata 26074627  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  26074626 taactcacacttgtacacaaaaaca 26074602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Original strand, 27502024 - 27502192
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27502024 gaggggagctagggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatg 27502123  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27502124 ggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 27502192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 253
Target Start/End: Original strand, 13415776 - 13415925
Alignment:
Q  104 gaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacc 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13415776 gaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 13415875  T
Q  204 tttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13415876 tttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 13415925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Original strand, 3295344 - 3295514
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  3295344 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttaccaaaa-ccttaaggcaattggtttatgggtcctcttac 3295442  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacataa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  3295443 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacacttccacacaacaagataa 3295514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41632943 - 41632775
Alignment:
Q  85 ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctt 184  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  41632943 ctgggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctctt 41632844  T
Q  185 acttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41632843 acttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgcacacaaca 41632775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 624364 - 624198
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |   |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  624364 ggggagctcggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatggg 624265  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  624264 tcatcttacttataacgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttg 624198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 250
Target Start/End: Original strand, 3295003 - 3295176
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||   ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  3295003 gaggggagcgagggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatg 3295102  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacaca 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3295103 ggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgcacaca 3295176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Original strand, 36568557 - 36568732
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||  |   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  36568557 gaggggagctcgggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaagagag--agacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacg 36568654  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36568655 ggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 36568732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 12662651 - 12662820
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||  ||||||    
T  12662651 gggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttac 12662750  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12662751 ttataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 12662820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32487553 - 32487396
Alignment:
Q  86 tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||   | ||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32487553 tgggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 32487454  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32487453 cttata-ggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 32487396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35150164 - 35150002
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||  |   |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  35150164 ggggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttact 35150066  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35150065 tataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 35150002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 624040 - 623820
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||  |||  | |||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  624040 tgccacggtcgtacccttcttcgaacagggctctgataccactgttgggtcact-gaggagctcgggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccac 623942  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    |||  |   |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |    
T  623941 aagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttacttgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatg 623842  T
Q  223 tgggacatataactcacacttg 244  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  623841 tgagacatataactcacacttg 623820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Original strand, 26074190 - 26074311
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  26074190 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacata 26074289  T
Q  232 taactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  26074290 taactcacacttgcacacaaca 26074311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 11416976 - 11417143
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||| | |||||||||   ||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  11416976 gggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttac 11417075  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  11417076 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataact--cacttgcacacaacaaca 11417143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15370572 - 15370427
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  15370572 gaggggagcatggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatg 15370473  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  15370472 ggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtttcatccgac 15370427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 253
Target Start/End: Original strand, 24489191 - 24489369
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||   |||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  24489191 cacgaggggagtctgagggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggttt 24489290  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| || || |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24489291 atgggt--tcttactaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgaacacaaca 24489369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 26074825 - 26074950
Alignment:
Q  132 agacaccacactctt-accaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26074825 agacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacat 26074924  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074925 ataactcacacttgtacacaacaaca 26074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 35167882 - 35168006
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | |    
T  35167882 agacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagataca 35167981  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  35167982 taactcatacttgtacacaacaaca 35168006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35915010 - 35914838
Alignment:
Q  85 ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |  | ||||||   ||| |||||| ||||| | || |  ||| ||| |||| |||| ||||| ||||    
T  35915010 ctgggggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttctt 35914911  T
Q  185 acttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35914910 acttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatacttatacacaacaacat 35914838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  92 accgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttata 191  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||   |||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  192 aggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataa 234  Q
    | || || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33747825 aagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 42508710 - 42508604
Alignment:
Q  148 ccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtac 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  42508710 ccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttgtac 42508611  T
Q  248 acaacaa 254  Q
    |||||||    
T  42508610 acaacaa 42508604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Original strand, 29549299 - 29549411
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||| |||||    
T  29549299 agacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttactattttatctgatatggaacata 29549398  T
Q  232 taactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||    
T  29549399 taactcacacttg 29549411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 301065 - 300949
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||         ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  301065 agacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaatggattc--------tcttacttataaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacata 300974  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||    
T  300973 taacccacacttgtacacaaaaaca 300949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39309764 - 39309677
Alignment:
Q  165 atgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39309764 atgggtttatgg-tcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttgtacacaaca 39309677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26074398 - 26074320
Alignment:
Q  166 tgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26074398 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427553
Alignment:
Q  96 tccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggt 195  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||  |   ||||  |||||||||||  ||||||||||| | |||| || ||||||| ||| ||||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctct-acttataagat 38427599  T
Q  196 gttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacac 241  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 256
Target Start/End: Original strand, 41635242 - 41635359
Alignment:
Q  139 acactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| | |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |  ||||||||||||    
T  41635242 acactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgggaaacatataactca 41635341  T
Q  239 cacttgtacacaacaaca 256  Q
     |||| ||||||||||||    
T  41635342 tacttatacacaacaaca 41635359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 244
Target Start/End: Original strand, 5723811 - 5723947
Alignment:
Q  108 ctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaaccttta 207  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||||| | |||||| || ||||||||||| | ||   || ||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5723811 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  208 ctcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
     | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 5723947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31509738 - 31509615
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaa-ccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||| ||| |||||    
T  31509738 agacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacat 31509639  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  31509638 ataactcacacttgcacacaacaa 31509615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Original strand, 36521946 - 36522061
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||| |  |||||||||||  ||| || |||| || ||||||||||||||||    
T  36521946 cacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataactc 36522045  T
Q  238 acacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||  |||||||    
T  36522046 acacttgcgcacaaca 36522061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768852
Alignment:
Q  171 ttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttg 7768852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2411176 - 2411010
Alignment:
Q  77 aggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgg 176  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||| |||| ||| |   |||| ||   ||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  2411176 aggggagcttgggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgg 2411077  T
Q  177 gtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacactt 243  Q
    ||  ||||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  2411076 gttctcttacttacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 160
Target Start/End: Original strand, 26900007 - 26900089
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaa 160  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26900007 ggggagcttgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Original strand, 26590954 - 26591031
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttact 209  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26590954 agacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttact 26591031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150737
Alignment:
Q  204 tttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 35150737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151028
Alignment:
Q  204 tttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 35151028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 243
Target Start/End: Original strand, 36522281 - 36522392
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||| ||| ||||||||  |||||||| |  | | || ||||| | ||| ||||||    
T  36522281 agacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgagacata 36522380  T
Q  232 taactcacactt 243  Q
    ||||||||||||    
T  36522381 taactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Original strand, 13786045 - 13786166
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat- 230  Q
    ||||| |||||||||| | |||| |||||| | || | |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| |||  ||||     
T  13786045 agacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttacttataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgatgtgaaacata 13786143  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    || |||||||||||| |||||||    
T  13786144 attactcacacttgtgcacaaca 13786166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38427432 - 38427306
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaaca-cgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaa 132  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || ||| ||||||  ||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||   |    
T  38427432 acccttcgtcgaaccggggctctaataccactgttggatcatcgaagggagctcgggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagaga 38427333  T
Q  133 gacaccacactcttaccaaaaacctta 159  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  38427332 gacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225047
Alignment:
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| ||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 256
Target Start/End: Original strand, 26900082 - 26900138
Alignment:
Q  200 aacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26900082 aaccttaactcttttatctgatgtgggacatataactcaaatttgtacacaacaaca 26900138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13042653 - 13042606
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtc 179  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13042653 agacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42524814 - 42524717
Alignment:
Q  148 ccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgta 246  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||| ||| ||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  42524814 ccaaaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgta 42524717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31509846 - 31509745
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttacca-aaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||| ||| |||||    
T  31509846 agacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacat 31509747  T
Q  231 at 232  Q
    ||    
T  31509746 at 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 162
Target Start/End: Original strand, 795258 - 795306
Alignment:
Q  114 caaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaagg 162  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  795258 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13112652 - 13112604
Alignment:
Q  131 aagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtc 179  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13112652 aagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 13112604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32445999 - 32445943
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactt 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  32445999 agacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 254
Target Start/End: Original strand, 36527217 - 36527249
Alignment:
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36527217 gtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 36527249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 6e-70; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16454797 - 16454563
Alignment:
Q  25 cctcggacgtacccttcgtcgaacc-gggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcaca 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16454797 cctcggtcgtacccttcgtcgaacctgggctctgataccactgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcaca 16454698  T
Q  124 agcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgt 223  Q
    |||||   |||| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||    
T  16454697 agcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgt 16454598  T
Q  224 gggacatataactcacacttgtacacaacaacata 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454597 gggacacataactcacacttgtacacaacaacata 16454563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 2579807 - 2580040
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||   | ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2579807 tgcctcggtcgtacccttcgtggaaccggggctctgataccactgttgggtaatgaggggagcttgggg-accttccacatcgaggctagaacaaccgca 2579905  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    |||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  2579906 caagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactcttttatccgat 2580005  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2580006 gtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 2580040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29518724 - 29518505
Alignment:
Q  26 ctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaa 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||   | ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29518724 ctcggtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggttatgagaggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaa 29518625  T
Q  125 gcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtg 224  Q
    ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29518624 gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 29518525  T
Q  225 ggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29518524 ggacatataactcacacttg 29518505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2377966 - 2377744
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaag 133  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||  ||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||  |||| | |||||||  |||    
T  2377966 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcactggggaagctcgggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaag 2377867  T
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatata 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2377866 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatata 2377767  T
Q  234 actcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  2377766 actcacacttgtgcacaacaaca 2377744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 2578442 - 2578610
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2578442 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttac 2578541  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578542 ttataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 2578610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 35210423 - 35210206
Alignment:
Q  27 tcggacgtacccttcgtcgaaccg-ggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaag 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||  |||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35210423 tcggtcgtacccttcgtcgaaccgaggctttgataccactgttgggtcactgggggagccagggg-accgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaag 35210325  T
Q  126 caactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgg 225  Q
    |||   | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  35210324 caaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtga 35210225  T
Q  226 gacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35210224 gacatataactcacacttg 35210206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29519079 - 29518922
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  29519079 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttac 29518980  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29518979 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 29518922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32741338 - 32741181
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  32741338 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttac 32741239  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32741238 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 32741181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16455077 - 16454897
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  16455077 gaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatg 16454978  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16454977 ggtcctattacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcacatttgtacacaacaaca 16454897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16107904 - 16107668
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacg--aggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccg 119  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||   |||||||   |||| |||  |||||| ||||||||| ||||||    
T  16107904 tgcctcggtcatacccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcactgaaggggagttaggggtaccacccacatcgaggctagagcaaccg 16107805  T
Q  120 cacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccg 219  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16107804 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtttaacctttacttttttatccg 16107705  T
Q  220 acgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107704 atgtgacacatataactcacacttgtacacaacaaca 16107668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2378285 - 2378128
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  2378285 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttac 2378186  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2378185 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 2378128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3415629 - 3415462
Alignment:
Q  77 aggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagac--caaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttat 174  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3415629 aggggagcttgggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttat 3415530  T
Q  175 gggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacact 242  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  3415529 gggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacact 3415462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 2578769 - 2578999
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||    
T  2578769 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgattcatgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccaca 2578868  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||     
T  2578869 caagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgat 2578967  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    | ||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  2578968 gagggacatataaatcacacttgctcacaaca 2578999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409261
Alignment:
Q  98 cacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3409261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Original strand, 10074298 - 10074528
Alignment:
Q  24 gcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |  || ||  ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  10074298 gcctcggtcgtacccttcttcgaaccggggctctgatacaagagttgggtcacaaggggagcctgggggactatccacatcgaggctagaacaaccacac 10074397  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
     ||  |   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  10074398 tagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatg 10074497  T
Q  223 tgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  10074498 tgggacctctaactcacacttgcacacaaca 10074528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544051
Alignment:
Q  98 cacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 26544051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1846907 - 1846750
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  1846907 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttac 1846808  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || |||||||||    
T  1846807 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttg 1846750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 2579044 - 2579273
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||  || ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  2579044 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaaccgggactctgatatcactgttgggtcatgaggggagc-tcggggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccaca 2579142  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    | |||||   |||||||||||||||| | ||| |||||| |  |||||||||||| || |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2579143 cgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagttatgggtttatggttcct----cttataaggtgttcaacttttactcttttatccgat 2579238  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2579239 gtgggacatataactaacacttgtacacaacaaca 2579273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 78 - 244
Target Start/End: Original strand, 14748332 - 14748494
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    || |||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
T  14748332 ggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaa----gagaccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatggg 14748427  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14748428 tcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 14748494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 5832016 - 5832194
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||||||    
T  5832016 gaggggagcctgggg-accgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg-tggctttatg 5832113  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5832114 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttgtgcacaacaaca 5832194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3409819 - 3409662
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3409819 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 3409720  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  3409719 ttataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttg 3409662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3058386 - 3058228
Alignment:
Q  86 tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||| | |||  ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||    
T  3058386 tgggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcata 3058287  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3058286 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttg 3058228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 241
Target Start/End: Original strand, 2579426 - 2579645
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |   |  |||||||||||| || ||| ||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  2579426 tgcctcggtcgtaccgttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgattcgtgaggggagcctgtggaaccatccacatcgaggttagaacaaccaca 2579525  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    |||||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||     
T  2579526 caagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttttgtccgat 2579625  T
Q  222 gtgggacatataactcacac 241  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2579626 gtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2843714 - 2843544
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttat-gggtcatctta 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  2843714 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctctta 2843615  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2843614 cttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcacaattgtgcacaacaaca 2843544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 88 - 253
Target Start/End: Original strand, 10073991 - 10074156
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||  | |||| |   |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10073991 ggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 10074090  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  10074091 tataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgcacacaaca 10074156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460748
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  238 acacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||| | | ||||||||||    
T  32460730 acacctttgcacaacaaca 32460748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 253
Target Start/End: Original strand, 10073601 - 10073779
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||  |   |||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||    
T  10073601 cacgaggggagcctgaaggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagttt 10073700  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10073701 atggatcctcttacttataaggtgttcaaccttta--cttttctccgatgtgggacatataactaacacttgcacacaaca 10073779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16108154 - 16108053
Alignment:
Q  155 ccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108154 ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaa 16108055  T
Q  255 ca 256  Q
    ||    
T  16108054 ca 16108053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 256
Target Start/End: Original strand, 1950201 - 1950353
Alignment:
Q  104 gaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacc 203  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||   ||||  |||||||||||  |||||||||||||  | | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  1950201 gaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaacc 1950300  T
Q  204 tttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1950301 tttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttatacgcaacaaca 1950353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Original strand, 593695 - 593865
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagaca--ccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttta 173  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||||| ||   ||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||    
T  593695 gaggggagctcgggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggttta 593794  T
Q  174 tgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  593795 tgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttg 593865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1127531 - 1127366
Alignment:
Q  75 cgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttat 174  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||| |||| |||| ||||| || ||| ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  1127531 cgaggggagctttggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttat 1127432  T
Q  175 gggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcaca 240  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  1127431 gagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcaca 1127366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999966
Alignment:
Q  91 gaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttat 190  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||  |||||   |||| ||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||| || |||||| |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  191 aaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 258  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacacttatacacaataacata 6999966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 256
Target Start/End: Original strand, 9062398 - 9062517
Alignment:
Q  136 accacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataac 235  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9062398 accacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataac 9062496  T
Q  236 tcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| || ||||||| ||||    
T  9062497 tcacatttatacacaataaca 9062517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6071246 - 6071124
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||| | | ||||||||||    
T  6071246 agacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttctattcaatgtgggacata 6071147  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  6071146 taactcacacttgcacacaacaa 6071124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8482040 - 8481919
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  ||| || |||| || || |||||||    
T  8482040 agacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-ggacata 8481942  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  8481941 taactcacacttgcacacaacaa 8481919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10911680 - 10911558
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttac-tcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    ||||| ||||||||||   ||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||    
T  10911680 agacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacat 10911581  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  10911580 ataactcacacttgcatacaaca 10911558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 253
Target Start/End: Original strand, 12092428 - 12092647
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccg-ggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaag 133  Q
    |||||||||| ||||| || ||| ||||||  || || |||||||||| |||  |||||||  ||||||  |||| ||| ||||| ||||||  |   ||    
T  12092428 acccttcgtcaaaccgcggctctaataccagagttgggacacgaggggggccaaggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagag 12092527  T
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatata 233  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||| ||||||||| ||    
T  12092528 acaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatcta 12092627  T
Q  234 actcacacttgtacacaaca 253  Q
    || ||| |||| ||||||||    
T  12092628 acacacccttgcacacaaca 12092647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 5958647 - 5958771
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||| ||||||||  || ||||| ||||| | ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||    
T  5958647 agacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacata 5958746  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  5958747 taactcacaattgcacaccacaaca 5958771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31714838 - 31714736
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |  || || ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||    
T  31714838 gaggggagtctgggagaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcga-aaaaacgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatg 31714740  T
Q  176 ggtc 179  Q
    ||||    
T  31714739 ggtc 31714736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 244
Target Start/End: Original strand, 12071657 - 12071847
Alignment:
Q  54 tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaa 153  Q
    ||||||||||||||  |  || ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||  |   |||| ||||||||||||| |||    
T  12071657 tctgataccactgttaggtcatgaggggagcttaggggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaa 12071756  T
Q  154 accttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||  || |||||||| ||| | |   |||||| |||||||| ||  | | || |||| || | | |||||||||||||||||||    
T  12071757 accttaaggtcataggtttatgagtcctttctattataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttg 12071847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2975666 - 2975567
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||| ||||||||||   ||||| ||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||  || ||||||||||    
T  2975666 agacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggacata 2975567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Original strand, 12085001 - 12085198
Alignment:
Q  54 tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaa 153  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||||| | || |||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||  |   |||| ||||||||||||| |||    
T  12085001 tctgataccactgtgggt-catgaggggagcttaggagaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaa 12085099  T
Q  154 accttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| | |   |||||| |||||||| ||  ||| || |||| || |  |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12085100 accttaaggccatggttttatgagtcctttctattataaagtgttcaaactccact-ttctatctgatgcaggacatataactcacacttgcacaaaaca 12085198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 14789284 - 14789325
Alignment:
Q  168 ggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttact 209  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789284 ggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210498
Alignment:
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtggg 226  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg 35210498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605345
Alignment:
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggt 178  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22605345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Original strand, 30618584 - 30618727
Alignment:
Q  54 tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaa 153  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||| ||||| || ||| ||   |||||||||| | ||||| | |    
T  30618584 tctgagaccactgttgggtcacgaggggagccttggggaccacccacatt-aggcaagagcaaccacataagtaagagagacaccacatttttacccata 30618682  T
Q  154 accttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttca 200  Q
    |||||||| | |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30618683 accttaagac-aacggtttat-ggtcatcttacttataaagtgttca 30618727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6421599 - 6421375
Alignment:
Q  32 cgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaacta 131  Q
    ||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||       
T  6421599 cgtaccctttgtcgaacggtgctctgataccactgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagag 6421500  T
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6421499 agacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacata 6421400  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  6421399 taactcacacttgtgcacaacaaca 6421375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 42514863 - 42514642
Alignment:
Q  32 cgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaacta 131  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||       
T  42514863 cgtacccttcgtcgaacagggctctgataccactgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagag 42514764  T
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || || |||||||    
T  42514763 agacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacata 42514664  T
Q  232 taactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  42514663 taactcacacttgcatacaaca 42514642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 35 - 244
Target Start/End: Original strand, 36178552 - 36178761
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaag 133  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||  |||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   ||    
T  36178552 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactattgggtcacgaggg-agcgcgggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagag 36178650  T
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatata 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36178651 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 36178750  T
Q  234 actcacacttg 244  Q
    |||||||||||    
T  36178751 actcacacttg 36178761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15880436 - 15880253
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    |||||| |||||  || ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15880436 cacgagtggagctcggaggaacgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 15880337  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880336 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 15880253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37106136 - 37105926
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaag 133  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||   ||    
T  37106136 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcacaaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagag 37106037  T
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatata 233  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  37106036 acaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatata 37105937  T
Q  234 actcacacttg 244  Q
    |||||||||||    
T  37105936 actcacacttg 37105926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 244
Target Start/End: Original strand, 14745612 - 14745823
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgagggg-agcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaa 132  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||   |    
T  14745612 acccttcatcgaaccggggctctgataccactgttgggtcacgagggggagctcgggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagaga 14745711  T
Q  133 gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatat 232  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  14745712 gacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatat 14745811  T
Q  233 aactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||    
T  14745812 aactcacacttg 14745823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 244
Target Start/End: Original strand, 5542615 - 5542781
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5542615 ggggagctcgggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatggg 5542714  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  5542715 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttg 5542781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106190
Alignment:
Q  90 ggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactta 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  190 taaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 37106190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Original strand, 41283463 - 41283631
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  41283463 gaggggagcatgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatg 41283562  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41283563 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttg 41283631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 962808 - 962591
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaaga 134  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||| || | ||||||   ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    ||    
T  962808 acccttcatcgaaccgggctctaatactactgttggatcatg-ggggagttcgggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtga 962710  T
Q  135 caccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataa 234  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  962709 caacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataa 962610  T
Q  235 ctcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  962609 ctcacacttgcatacaaca 962591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 244
Target Start/End: Original strand, 5542964 - 5543154
Alignment:
Q  54 tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaa 153  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||    || ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||    
T  5542964 tctgataccactgttggatcatggggggagctcaaggtaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaa 5543063  T
Q  154 accttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    | |||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5543064 atcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttg 5543154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6713136 - 6712966
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||||    
T  6713136 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctctta 6713037  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6713036 cttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtatacaacaaca 6712966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 256
Target Start/End: Original strand, 36005887 - 36006047
Alignment:
Q  95 gtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagg 194  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36005887 gtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 36005986  T
Q  195 tgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36005987 tgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 36006047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 251
Target Start/End: Original strand, 35580659 - 35580886
Alignment:
Q  24 gcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||  ||   |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  35580659 gcctcggtcatacccttcgtcgaaccggggctctgataccattattgggtcattgggggagtcagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccac 35580758  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    || |||   |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |    
T  35580759 aaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg-tcctctcacttataaggtgttcaacatttattgttttatccgatg 35580857  T
Q  223 tgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35580858 tgggacatataactcacacttgcacacaa 35580886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23346457 - 23346228
Alignment:
Q  25 cctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaa 124  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| ||  || |||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  23346457 cctcggtcgtaccctacgtcaaaccgggctctgataccattgttgggtcatgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaa 23346358  T
Q  125 gcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtg 224  Q
    ||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||| |||    
T  23346357 gcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtg 23346259  T
Q  225 ggac--atataactcacacttgtacacaaca 253  Q
     |||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  23346258 agacatatataactcacactcgcacacaaca 23346228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 256
Target Start/End: Original strand, 15511495 - 15511661
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  15511495 ggggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 15511594  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  15511595 tataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataact--cacttgcacacaacaaca 15511661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6422269 - 6422126
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  6422269 gggggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaa 6422170  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  6422169 ttataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Original strand, 38796619 - 38796788
Alignment:
Q  89 gggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccaca--ctcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||   |||| |||||  |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||    
T  38796619 gggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttac 38796718  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38796719 ttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 38796788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679794
Alignment:
Q  91 gaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttat 190  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  191 aaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgcacacaaca 40679794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5367597 - 5367448
Alignment:
Q  104 gaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacc 203  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5367597 gaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaacc 5367498  T
Q  204 tttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5367497 tttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttgtacacaaca 5367448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 257
Target Start/End: Original strand, 28254281 - 28254406
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  28254281 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacata 28254380  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  28254381 taagtcacactggcacacaacaacat 28254406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33731804 - 33731636
Alignment:
Q  90 ggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactta 189  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||    
T  33731804 ggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttactta 33731705  T
Q  190 taaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc--acacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  33731704 taaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacacacttgaacacaacaaca 33731636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 228
Target Start/End: Original strand, 36178156 - 36178311
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| | ||||| |||||||||   || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  36178156 cacgaggggagcgcgggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt 36178255  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggac 228  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  36178256 atgggttcccttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40733676 - 40733507
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| || || | ||| ||||||| |   |||||||||||||||||| ||||| ||||||   | |||||||||||| ||||||    
T  40733676 gggggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttac 40733577  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40733576 ttataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataaca 40733507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 253
Target Start/End: Original strand, 28531361 - 28531479
Alignment:
Q  135 caccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataa 234  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  28531361 caccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttacttataaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataa 28531460  T
Q  235 ctcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  28531461 ctcacacttgcacacaaca 28531479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 256
Target Start/End: Original strand, 31259664 - 31259787
Alignment:
Q  136 accacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatcc---gacgtgggacatat 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||| |||||||    
T  31259664 accacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgagacatat 31259763  T
Q  233 aactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| |||||  |||||||||||    
T  31259764 aactcgcacttacacacaacaaca 31259787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40734041 - 40733873
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||| |   |||||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||| ||| | | ||||||    
T  40734041 gggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtaggtt-atgagccctcttac 40733943  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40733942 ttataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataaca 40733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7598443 - 7598225
Alignment:
Q  32 cgtacccttcgtcgaacc-gggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaact 130  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  |||||||||||    ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||  |      
T  7598443 cgtacccttcgtcgaacctgggctttgataccagtgttgggtcacgaggggagatcaggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgaga 7598344  T
Q  131 aagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
     |||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||| || | ||||    
T  7598343 gagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacat 7598244  T
Q  231 ataactcacacttgtacac 249  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  7598243 ataattcacacttgcacac 7598225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 244
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178425
Alignment:
Q  139 acactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  239 cacttg 244  Q
    ||||||    
T  36178420 cacttg 36178425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1770040 - 1769889
Alignment:
Q  98 cacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||||   ||| | | || || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1770040 cacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgt 1769941  T
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacac 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1769940 tcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacac 1769889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 253
Target Start/End: Original strand, 37632643 - 37632762
Alignment:
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatata 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  37632643 acaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatata 37632742  T
Q  234 actcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  37632743 actcacacttgcacacaaca 37632762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542439
Alignment:
Q  139 acactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  239 cacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||| |||||||||||    
T  16542456 cacttgcacacaacaaca 16542439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29677022 - 29676893
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctt-----acttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtggg 226  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||      || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29677022 agacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctctcacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtggg 29676923  T
Q  227 acatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29676922 acatataactcacacctgcacacaacaaca 29676893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468914
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    |||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  238 acacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  31468896 acacttgcacacaacaaca 31468914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7598715 - 7598606
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  7598715 agacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacata 7598624  T
Q  232 taactcacacttgtacac 249  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  7598623 taactcacacttgcacac 7598606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 240
Target Start/End: Original strand, 14745338 - 14745446
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  14745338 agacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaagatgttcaaccattactattttattcgatgtgggacata 14745437  T
Q  232 taactcaca 240  Q
    |||||||||    
T  14745438 taactcaca 14745446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 256
Target Start/End: Original strand, 38796298 - 38796386
Alignment:
Q  168 ggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38796298 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 38796386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 257
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899595
Alignment:
Q  158 taaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactttcacacaacaacat 31899595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 235
Target Start/End: Original strand, 40163383 - 40163520
Alignment:
Q  99 acattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcga-tgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||| |  | | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40163383 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgt 40163482  T
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataac 235  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  40163483 tcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6421955 - 6421793
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccg-ggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| || ||  || |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||    
T  6421955 tgcctcggtcgtaccctttgtcgaaccgaggctctaataccaccgttgggtcatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccaca 6421856  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctt 184  Q
    ||||  |   |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  6421855 caagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529195
Alignment:
Q  98 cacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||   |||||| ||  ||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaac 255  Q
    |||| ||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgcatacaacaac 12529195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 254
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895227
Alignment:
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatata 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||| |||||| |||||| |||| | || ||||||| ||||||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  234 actcacacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||| ||| | |||||||||    
T  37895207 actcaaactcgcacacaacaa 37895227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 256
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785731
Alignment:
Q  189 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 36785731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 29874067 - 29874185
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||  ||| || |||| || ||||||||||    
T  29874067 agacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacata 29874166  T
Q  232 taactcacacttgtacaca 250  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  29874167 taacacacacttgtacaca 29874185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30313369 - 30313170
Alignment:
Q  54 tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaa 153  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||| |||| | ||  |||| ||| ||||| ||||||  |   |||| ||||||||||||| |||    
T  30313369 tctgataccactgttgggtcacgaggagagcccgggggatcgtcaaaatccaggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaa 30313270  T
Q  154 accttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  30313269 atcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttgcacacaaca 30313171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16591053 - 16590881
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||   |||||  | | ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16591053 gaggggagctcgggagactgtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatg 16590954  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttac-tcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||| ||||||||      |||||||||||||| | ||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16590953 ggtcctcttactt------tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 16590881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Original strand, 33561501 - 33561616
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| || |||| |||||||||||    
T  33561501 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaacatataactc 33561600  T
Q  238 acacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||| ||||||||    
T  33561601 acacttgcacacaaca 33561616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421294
Alignment:
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaaca 6421294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29676687 - 29676543
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||  |||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||      ||| ||| ||||||||||  ||| |||    
T  29676687 ggggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa------ggcaatgagtttatgggttctctcact 29676594  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30323578 - 30323456
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||  | | || |||| ||  |||||||||    
T  30323578 agacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggacata 30323479  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    |||| |||||||| |||||||||    
T  30323478 taacacacacttgcacacaacaa 30323456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 251
Target Start/End: Original strand, 37894738 - 37894855
Alignment:
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatata 233  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| || ||| | | ||||||||||||    
T  37894738 acaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtgggacatata 37894837  T
Q  234 actcacacttgtacacaa 251  Q
    ||||||| ||| ||||||    
T  37894838 actcacatttgcacacaa 37894855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3673236 - 3673122
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||   ||||| |||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||||||     
T  3673236 ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatgga 3673137  T
Q  178 tcatcttacttataa 192  Q
    || ||||||||||||    
T  3673136 tcctcttacttataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3672913 - 3672773
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacga-ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaag 133  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||  || ||  ||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||  ||   ||    
T  3672913 acccttcgtcgaacggggctctgataacagcgttgggtcactagggggagccaggggaaccgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagag 3672814  T
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttat 174  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  3672813 acaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953936
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||| || ||||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  238 acacttgtacacaaca 253  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  33953921 acatttgcacacaaca 33953936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9231356 - 9231242
Alignment:
Q  139 acactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||| ||  || |||||||||||||    
T  9231356 acactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatttataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactca 9231257  T
Q  239 cacttgtacacaaca 253  Q
     ||||  ||||||||    
T  9231256 tacttacacacaaca 9231242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910221
Alignment:
Q  139 acactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||  ||||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  239 cacttgtacacaaca 253  Q
     ||||  ||||||||    
T  12910235 aacttacacacaaca 12910221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 230
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  141 actcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    |||||||||  |||| ||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Original strand, 29873587 - 29873703
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||  ||||||||  ||||||||||  ||| || |||| || ||||||||| |||| |    
T  29873587 cacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacac 29873686  T
Q  238 acacttgtacacaacaa 254  Q
    || |||| |||||||||    
T  29873687 acccttgcacacaacaa 29873703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31385851 - 31385779
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacct 204  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  31385851 agacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacct 31385779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30312982 - 30312831
Alignment:
Q  54 tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaacta-agacaccacactcttaccaaa 152  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||      | ||||  |||||| ||||| ||    
T  30312982 tctgataccactgttgggtcacgaggggagctcgggggaccacccacattcaggccagagcaaccgcacaaattgagagagactacacacttttacccaa 30312883  T
Q  153 aaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacct 204  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  30312882 aaccttaaggaaataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacct 30312831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 36784287 - 36784365
Alignment:
Q  115 aaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataag 193  Q
    |||| |||||||||   |||||| ||||| ||| | ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36784287 aaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3673120 - 3673075
Alignment:
Q  211 ttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3673120 ttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 3673075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 42515078 - 42515005
Alignment:
Q  184 tacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtggg----acatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  42515078 tacttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacatacatataactcacacctgcacacaaca 42515005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6421786 - 6421688
Alignment:
Q  86 tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctt 184  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  || ||||| ||||||  |   |||||||||||||||||| |||||||| || | || |||||||||||| ||||    
T  6421786 tggggtaccgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3672754 - 3672709
Alignment:
Q  211 ttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3672754 ttttattcgatgtgggacatataactcatacttgcacacaacaaca 3672709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Original strand, 33954306 - 33954426
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | |||||| || | |||||| ||||| | | |||||   |||| |||||  ||| || |||| || ||||||||||    
T  33954306 agacgccacactcttacccaaaatcgtaaggc-atagatttatgagtcatttaagttatataatgtttaacctcaacttttctatctgatgtgggacata 33954404  T
Q  232 taactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  33954405 taactcacacttgcacacaaca 33954426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678534
Alignment:
Q  139 acactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggac--atataact 236  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | || |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||   || || |||| || ||| |||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  237 cacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||| ||||||||    
T  41678518 cacacttgcacacaaca 41678534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 1085550 - 1085784
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  1085550 tgcctcggtcatacccttcatcgaaccggggctatgataccactgttgggtcatgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccaca 1085649  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    |||| ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  1085650 caagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgat 1085749  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1085750 gtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 1085784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 24 - 243
Target Start/End: Original strand, 37533299 - 37533519
Alignment:
Q  24 gcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  37533299 gcctcggtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcac 37533398  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |    
T  37533399 aagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatg 37533498  T
Q  223 tgggacatataactcacactt 243  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  37533499 tagaacatataactcacactt 37533519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7517750 - 7517568
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7517750 gaggggagccaaggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 7517651  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 258  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7517650 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacata 7517568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45433462 - 45433229
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacac-gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||   || |||  ||  |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||    
T  45433462 tgcctcggtcgtaccctttgtcgaaccgggctctgatac---tgcagggtcatagaggggagccagggggaccgaccacatcgaggctagaacaacccca 45433366  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45433365 caagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgat 45433266  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 258  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45433265 gtggatcatataactcacacttgtacacaacaacata 45433229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 244
Target Start/End: Original strand, 37532946 - 37533166
Alignment:
Q  24 gcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||    
T  37532946 gcctcggtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcacgatgggagcgcgggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcac 37533045  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    ||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  37533046 aagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatg 37533144  T
Q  223 tgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37533145 tgggacatataactcacacttg 37533166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 77 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30244439 - 30244260
Alignment:
Q  77 aggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgg 176  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||  |   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  30244439 aggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatga 30244340  T
Q  177 gtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244339 gtcctcttacttataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 30244260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30245246 - 30245067
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||  |    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  30245246 cacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagaga----gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagttt 30245151  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245150 atgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 30245067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 40094773 - 40094942
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40094773 gggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttac 40094872  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40094873 ttataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaaca 40094942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 22567027 - 22567209
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| |||||  || ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22567027 gaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatg 22567126  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacataa 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  22567127 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttgcatacaacaacataa 22567209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Original strand, 23376 - 23546
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  23376 gggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttac 23475  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23476 ttataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaacaacat 23546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24177595 - 24177425
Alignment:
Q  86 tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    ||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  24177595 tgggggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgctta 24177496  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24177495 cttataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgcacacaacaaca 24177425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45754937 - 45754706
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  ||   |||||||  | | ||||| | |||| |||||| || ||||| |||    
T  45754937 tgcctcggtcatacccttcgccgaacggggctctgataccactgttgggtcattgggggagctcgagtgaccg-ctacatcgaggcttgaacaaccacac 45754839  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  45754838 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatg 45754739  T
Q  223 tgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45754738 t-ggacatataactcacacttgtacacaacaaca 45754706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47129297 - 47129085
Alignment:
Q  43 tcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacac 142  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |  |   |||||||||||    
T  47129297 tcgaacggggctctgataccactgttggatcatgaggggagc-tcggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacac 47129199  T
Q  143 tcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacact 242  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  47129198 tcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacact 47129099  T
Q  243 tgtacacaacaaca 256  Q
    ||| ||||||||||    
T  47129098 tgtgcacaacaaca 47129085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7554139 - 7554015
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7554139 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 7554040  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  7554039 taactcacacttgcacacaacaaca 7554015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11845359 - 11845183
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11845359 ggggagcacgggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatggg 11845260  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11845259 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataact--cacttgtgcacaacaaca 11845183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Original strand, 22566711 - 22566830
Alignment:
Q  137 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataact 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22566711 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattact 22566810  T
Q  237 cacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||| | |||||||||    
T  22566811 cacacttgcatacaacaaca 22566830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45434795 - 45434626
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||| ||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||    
T  45434795 gggggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttac 45434696  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45434695 ttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaaca 45434626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 29157735 - 29157567
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||  || ||||| ||||  ||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  29157735 gaggagagtctgggagaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatg 29157636  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29157635 ggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttg 29157567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30032735 - 30032555
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||   |||   |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||     
T  30032735 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatgga 30032636  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 258  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30032635 tactcttacttataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacatgtacgcaacaacata 30032555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 256
Target Start/End: Original strand, 34218036 - 34218202
Alignment:
Q  90 ggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactta 189  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||  |||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  34218036 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcactta 34218135  T
Q  190 taaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34218136 taaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 34218202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6054719 - 6054555
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||| |    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  6054719 gggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttac 6054620  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6054619 ttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttgtccacaa 6054555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16569310 - 16569186
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  16569310 agacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagacata 16569211  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||| | |||||||||    
T  16569210 taactcacacttgcatacaacaaca 16569186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 16596352 - 16596476
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  16596352 agacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagacata 16596451  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||| | |||||||||    
T  16596452 taactcacacttgcatacaacaaca 16596476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 255
Target Start/End: Original strand, 36939724 - 36939900
Alignment:
Q  79 gggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggt 178  Q
    |||||| |||||  || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||   | |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36939724 gggagcatggggacccatccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggt 36939823  T
Q  179 catcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaac 255  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36939824 cctcttacttataaggtgttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgcacagaacaac 36939900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41854802 - 41854624
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||  |   ||||| ||    
T  41854802 ggggagtcagggggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttatagg 41854703  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  41854702 tcatcttgcttataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgcacacaaaaacat 41854624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  98 cacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Original strand, 118290 - 118469
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaa--gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||   |  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  118290 ggggagcctgggg-accgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatg 118388  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  118389 gatcctcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaaca 118469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 253
Target Start/End: Original strand, 8128486 - 8128606
Alignment:
Q  133 gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatat 232  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||||||||    
T  8128486 gacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatat 8128585  T
Q  233 aactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  8128586 aactcacacttgcacacaaca 8128606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14681624 - 14681512
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  14681624 agacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacata 14681525  T
Q  232 taactcacacttg 244  Q
    ||||| |||||||    
T  14681524 taacttacacttg 14681512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 36534828 - 36534952
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  36534828 agacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatccgaggtgggacata 36534927  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||    
T  36534928 taagttacacttgcacacaacaaca 36534952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 259
Target Start/End: Original strand, 41910654 - 41910765
Alignment:
Q  148 ccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtac 247  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  41910654 ccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctcagttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttacac 41910753  T
Q  248 acaacaacataa 259  Q
    ||||||||||||    
T  41910754 acaacaacataa 41910765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901635
Alignment:
Q  90 ggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactta 189  Q
    |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || ||| ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  190 taaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcacacttatacacaataaca 9901635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Original strand, 24838751 - 24838870
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcat-cttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataact 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  24838751 cacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttactcttttattcgatgtgagacatataact 24838850  T
Q  237 cacacttgtacacaacaaca 256  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  24838851 tacacttatacacaacaaca 24838870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Original strand, 40230335 - 40230454
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  40230335 agacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacata 40230434  T
Q  232 taactcacacttgtacacaa 251  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  40230435 taacttacacttgcacacaa 40230454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Original strand, 1085294 - 1085417
Alignment:
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat-at 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |     
T  1085294 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccgatatgggacataaa 1085393  T
Q  233 aactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  1085394 aactcacacttgcacacaacaaca 1085417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30245559 - 30245484
Alignment:
Q  181 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30245559 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 30245484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30255404 - 30255329
Alignment:
Q  181 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30255404 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgcacacaacaaca 30255329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36623071 - 36622949
Alignment:
Q  135 caccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataa 234  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||| || || |||||||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36623071 caccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 36622972  T
Q  235 ctcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  36622971 ctcacacttgcacacaataacat 36622949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244691
Alignment:
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 30244691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43241609 - 43241485
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  43241609 agacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtggaacata 43241510  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  43241509 taactcacacttgcacacaacaaca 43241485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 253
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301708
Alignment:
Q  158 taaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 28301708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 255
Target Start/End: Original strand, 36109010 - 36109084
Alignment:
Q  181 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaac 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36109010 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgcacacaacaac 36109084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  141 actcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcaca 240  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30253661 - 30253534
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||  |    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  30253661 cacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagaga----gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagttt 30253566  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacct 204  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  30253565 atgggttctcttacttataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20599430 - 20599304
Alignment:
Q  132 agacaccacactct--taccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggaca 229  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||  ||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  20599430 agacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggaca 20599331  T
Q  230 tataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||| || |||||||||    
T  20599330 tataactcacacttatagacaacaaca 20599304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 47129527 - 47129452
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggc 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47129527 ggggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 47129452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37167937 - 37167840
Alignment:
Q  90 ggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| || |||||||    
T  37167937 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact 37167840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967399
Alignment:
Q  194 gtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 258  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacata 36967399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 158
Target Start/End: Original strand, 37532736 - 37532821
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaacctt 158  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  37532736 cacgaggggagcgcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 253
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094559
Alignment:
Q  196 gttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgcacacaaca 40094559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 200
Target Start/End: Original strand, 28300242 - 28300366
Alignment:
Q  77 aggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttat-g 175  Q
    ||||||| | || ||||||||||||| |||||  || ||||| |||  ||||   |||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |    
T  28300242 aggggagtcaggaggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgg 28300341  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttca 200  Q
    |||  ||||||||||||||||||||    
T  28300342 ggttctcttacttataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Original strand, 21416185 - 21416232
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtc 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21416185 agacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30245347 - 30245276
Alignment:
Q  54 tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaag 125  Q
    |||||||||||||| ||  ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  30245347 tctgataccactgttgggtcataaggggagcatgggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaag 30245276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30253774 - 30253691
Alignment:
Q  42 gtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaag 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  30253774 gtcgaacggggctctgataccattgttgggtcatgaggggagcctgggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaag 30253691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 23569046 - 23569091
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23569046 agacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 67
Target Start/End: Original strand, 40094702 - 40094746
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgt 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40094702 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaacagggctctgataccactgt 40094746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 163
Target Start/End: Original strand, 28300569 - 28300644
Alignment:
Q  89 gggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactctta-ccaaaaaccttaaggc 163  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||| |||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28300569 gggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 179
Target Start/End: Original strand, 21619091 - 21619136
Alignment:
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtc 179  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21619091 acaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 21619136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 30244522 - 30244473
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaag 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  30244522 gaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaag 30244473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 79)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10246135 - 10245909
Alignment:
Q  32 cgtacccttcgtcgaaccggg-ttctgataccactgtaggaaca-cgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaac 129  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||     
T  10246135 cgtacccttcatcgaaccggggttctgataccactgttgggtcagcgaggggagcttgggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaag 10246036  T
Q  130 taagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggaca 229  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10246035 ggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttatgg-tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggca 10245937  T
Q  230 tataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10245936 tataactcacacttgcacacaacaacat 10245909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25483540 - 25483326
Alignment:
Q  42 gtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccaca 141  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||| ||  |||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||    
T  25483540 gtcgaacggggctatgataccactgttgggtcactgggggagccagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccaca 25483441  T
Q  142 ctcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25483440 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacac 25483341  T
Q  242 ttgtacacaacaaca 256  Q
    ||| |||||||||||    
T  25483340 ttgcacacaacaaca 25483326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3341029 - 3340802
Alignment:
Q  25 cctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcaca 123  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||  |||||||   || |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  3341029 cctcggtcgtaccgttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcactgggggagctcaggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccccaca 3340930  T
Q  124 agcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgt 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |     
T  3340929 agcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgc 3340830  T
Q  224 gggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3340829 gggacatataactcacacttgcacacaa 3340802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44620880 - 44620654
Alignment:
Q  25 cctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaa 124  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  44620880 cctcggtcgtaccctttgacgaacggggctctgataccactattggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaa 44620781  T
Q  125 gcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtg 224  Q
    ||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| |||    
T  44620780 gcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttat-ggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtg 44620682  T
Q  225 ggacatataactcacacttgtacacaac 252  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44620681 ggacatataactcacacttgcacacaac 44620654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36629407 - 36629230
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  36629407 gaggggagcatgtgggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 36629308  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36629307 ggtcctcttacttataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgaacacaaca 36629230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39404242 - 39404013
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacac-gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||  |  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  39404242 tgcctcggtcatacccttcgtcgaacagtgtcctgataccactgttggattagtgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccaca 39404143  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |     
T  39404142 caagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttattcaat 39404043  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39404042 gtaggacatataactcacacttgtacacaa 39404013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404388
Alignment:
Q  89 gggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactt 188  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||| |||| || ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  189 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 39404388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572009
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| |   |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact 36572078  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 36572009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884688
Alignment:
Q  98 cacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttacca-aaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtg 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  197 ttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 52884688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731813
Alignment:
Q  89 gggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||    
T  1731646 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttattt 1731745  T
Q  189 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1731746 ataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgcacacaacaaca 1731813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 256
Target Start/End: Original strand, 36608644 - 36608827
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||  |   |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  36608644 cacgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggattt 36608743  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36608744 atggatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgcacacaacaaca 36608827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 78 - 249
Target Start/End: Original strand, 54017583 - 54017754
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  54017583 ggggagctagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 54017682  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacac 249  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54017683 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgcacac 54017754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 50002585 - 50002415
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  50002585 gggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttac 50002486  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  50002485 ttaaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaacaacaacat 50002415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 244
Target Start/End: Original strand, 55933113 - 55933278
Alignment:
Q  79 gggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggt 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  55933113 gggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 55933212  T
Q  179 catcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  55933213 cctcttacttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 55933278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20826061 - 20825829
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacac-gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||| ||| ||  || |||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    
T  20826061 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaattggggctctgatgccactgttggatcattgaagggagcatgggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgc 20825962  T
Q  121 acaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccga 220  Q
    | ||| ||   | |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20825961 ataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccga 20825862  T
Q  221 cgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20825861 tgtggaacatataactcacatttgtacacaaca 20825829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Original strand, 50630741 - 50630909
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||  || |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  50630741 gaggggagctaggcggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 50630840  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  50630841 ggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttg 50630909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 257
Target Start/End: Original strand, 22183253 - 22183431
Alignment:
Q  79 gggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggt 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |   |||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22183253 gggagtctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22183352  T
Q  179 catcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    | | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22183353 ccttttacttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgcacacaacaacat 22183431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 252
Target Start/End: Original strand, 49076765 - 49076992
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||  || ||||| |||   |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  49076765 tgcctcggtagtaccctttgtcgaacggggctctgataccactgttgggtcatgaggg-agctcaggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcac 49076863  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |      
T  49076864 aagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctcttac-tataaggtgttcaacctttactattttagccaata 49076962  T
Q  223 tgggacatataactcacacttgtacacaac 252  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  49076963 tggaacatataactcacacttgcacacaac 49076992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 256
Target Start/End: Original strand, 22028311 - 22028537
Alignment:
Q  34 tacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaaca-cgaggggagc-ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaacta 131  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||  ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||       
T  22028311 tacccttcgtcgaacggggctccgataccactgttgggtcagtgaggggagctttgggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagag 22028410  T
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaaccttta--ctcttttatccgacgtgggaca 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||| || |||||    
T  22028411 agacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttactaataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggaca 22028510  T
Q  230 tataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  22028511 tataagtaacacttgcacacaacaaca 22028537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 39792860 - 39793023
Alignment:
Q  90 ggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactta 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || |||| ||||    
T  39792860 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttctta 39792959  T
Q  190 taaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39792960 taaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 39793023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44621220 - 44621011
Alignment:
Q  26 ctcggacgtacccttcgtcgaacc-gggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaa 124  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  44621220 ctcggtcgtacccttcgtcaaaccagggctctgataccactgttggatcatgagaggagc---ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaa 44621124  T
Q  125 gcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtg 224  Q
    ||||   | |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44621123 gcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtg 44621024  T
Q  225 ggacatataactc 237  Q
    || |||| |||||    
T  44621023 ggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2740914 - 2740693
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |       ||||||||  |||||||| |||| || ||||||||| |||||  ||    
T  2740914 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaacggggctctgataccactgttg-------aggggagctcgggggaccatccatatcgaggctagaacaacc--ac 2740824  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    |||  |   |||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  2740823 aagtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatg 2740724  T
Q  223 tgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2740723 tgggacatataactcacacttgcacacaaca 2740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41370516 - 41370359
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||   |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41370516 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 41370417  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41370416 ttataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttg 41370359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 34646691 - 34646815
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34646691 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacata 34646790  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34646791 taactcacacttgtacacaacaaca 34646815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 256
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955483
Alignment:
Q  105 aggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacct 204  Q
    |||||||| |||||||||||| ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  205 ttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    | ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgcacacaacaaca 4955483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 52885002 - 52884877
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttacca-aaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  52885002 agacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 52884903  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  52884902 ataactcacacttgcacacaacaaca 52884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Original strand, 22027947 - 22028127
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| | ||||| || |||| |   |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||    
T  22027947 gaggggagcctgagggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatg 22028046  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22028047 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgcacacaacaaca 22028127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108908
Alignment:
Q  98 cacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggac--ataactgacacttgcacacaaca 54108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 50459878 - 50459711
Alignment:
Q  89 gggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactt 188  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||    
T  50459878 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactt 50459779  T
Q  189 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  50459778 ataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacacttatgcactacaaca 50459711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Original strand, 41707507 - 41707628
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41707507 agacaccacactcttaccaaaa-ccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacata 41707605  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41707606 taactcacacttgtacacaacaa 41707628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 54936310 - 54936188
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    |    
T  54936310 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggg----a 54936215  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaacata 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  54936214 taactcacacttgtacacaacaacata 54936188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44620569 - 44620362
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||    ||||||||||| ||| || ||| |||||   |||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||    
T  44620569 tgcctcggttgtacccttcgtcgaaccagg----gataccactgttggatcatgagaggagc---ggggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacac 44620477  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    ||||||   | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  44620476 aagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatg 44620377  T
Q  223 tgggacatataactc 237  Q
    ||| |||||||||||    
T  44620376 tggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Original strand, 4390085 - 4390267
Alignment:
Q  74 acgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttta 173  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||   ||||  |||||||||||| |||||||||| || ||| | | |    
T  4390085 acgacgggagcttgggagaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaa 4390184  T
Q  174 tgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4390185 aggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgcacacaacaaca 4390267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 49880274 - 49880162
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||    
T  49880274 agacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgggacata 49880175  T
Q  232 taactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||    
T  49880174 taactcacacttg 49880162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 54108751 - 54108527
Alignment:
Q  32 cgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcc-tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaact 130  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||  |||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||      
T  54108751 cgtacccttcgtcgaacgtggctctgataccgctgttgggtcactgggggagctatgggggaccg-ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaaga 54108653  T
Q  131 aagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatg-ggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggaca 229  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||     
T  54108652 tagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac- 54108554  T
Q  230 tataactcacacttg-tacacaacaaca 256  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||    
T  54108553 -ataactcacacttgcaacacaacaaca 54108527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 16889469 - 16889703
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||  |||| |||||||  | |||||||||||||| |||| |||| ||| | |||    
T  16889469 tgcctcagtcgtacccttcgtcgaacagggctctggtaccattgttgggtcacgtggggagctcgagggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacac 16889568  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    ||| ||   |||||||| ||||||||| ||||| |||||||  | ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||      
T  16889569 aaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatt 16889668  T
Q  223 tgggacatataactcacacttg-tacacaacaaca 256  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16889669 tgagacatataactcacacttgccacacaacaaca 16889703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826210
Alignment:
Q  93 ccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataa 192  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| ||   ||||| |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  193 ggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacatttctacataaca 20826210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Original strand, 54343005 - 54343147
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||       ||| ||||||    
T  54343005 gggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggg-------gtcctcttac 54343097  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataact 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  54343098 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 253
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941286
Alignment:
Q  95 gtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagg 194  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | | ||||| ||||||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  195 tgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgcagacaaca 32941286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49303064 - 49302907
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac- 186  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| ||| |||| ||| ||   | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  49303064 ggggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 49302965  T
Q  187 -ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacactt 243  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  49302964 tttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Original strand, 18932746 - 18932879
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | ||||| | |||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  18932746 gggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttat 18932845  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccga 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18932846 ttataaggtattcaacctttactattttatccga 18932879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741064
Alignment:
Q  137 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataact 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  237 cacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  2741080 cacacttgcacataaca 2741064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Original strand, 16888804 - 16888983
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||  ||||| ||| ||||||| |||   ||||| |||||||||||| |||||| |||| | ||| |||||| ||    
T  16888804 ggggagcttaggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttatagg 16888903  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg-tacacaacaaca 256  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16888904 ttctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgccacacaacaaca 16888983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 23817612 - 23817783
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaaca-cgaggggagcc-tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgc 120  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  23817612 tgcctcgatcgtacccttcgtcgaatggggctatgataccactgttggatcatcgaggggagctatgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccac 23817711  T
Q  121 acaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataa 192  Q
    || |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||    
T  23817712 actagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttacttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Original strand, 45489331 - 45489497
Alignment:
Q  89 gggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactt 188  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||   | | |||||| | ||  ||||||||    
T  45489331 gggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaacag-taggtttaagagttctcttactt 45489429  T
Q  189 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45489430 atatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttgtacacaacaaca 45489497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3341243 - 3341118
Alignment:
Q  131 aagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||  | |||   ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3341243 aagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacat 3341144  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  3341143 ataactcacacttgcacacaacaaca 3341118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43174621 - 43174496
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactc-ttttatccgacgtgggacat 230  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||||  || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||    
T  43174621 agacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcat 43174522  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43174521 ataactcacacttgtacacaacaaca 43174496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017870
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtggg--acatataac 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | |||||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatatataac 54017849  T
Q  236 tcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  54017850 tcacatttgcacacaacaaca 54017870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 152 - 256
Target Start/End: Original strand, 49076510 - 49076614
Alignment:
Q  152 aaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    |||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  49076510 aaactttaagacaatgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgcacacaa 49076609  T
Q  252 caaca 256  Q
    |||||    
T  49076610 caaca 49076614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Original strand, 3244499 - 3244614
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  3244499 cacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactc 3244598  T
Q  238 acacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||| ||||||||    
T  3244599 acacttgcacacaaca 3244614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45496919 - 45496820
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  45496919 agacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttatccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Original strand, 54741227 - 54741341
Alignment:
Q  139 acactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||    
T  54741227 acactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattca 54741326  T
Q  239 cacttgtacacaaca 253  Q
    |||||| ||||||||    
T  54741327 cacttgcacacaaca 54741341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246340
Alignment:
Q  157 ttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgcacacaaca 10246340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 251
Target Start/End: Original strand, 34004586 - 34004744
Alignment:
Q  91 gaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttat 190  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |   ||||  |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34004586 gaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagga-atgagtttatgggtcctcttacttat 34004684  T
Q  191 aaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004685 aagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgcacacaa 34004744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44620361 - 44620285
Alignment:
Q  181 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44620361 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactcatatttgtacacaacaacat 44620285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3700428 - 3700357
Alignment:
Q  183 ttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3700428 ttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 3700357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19504838 - 19504695
Alignment:
Q  104 gaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacc 203  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||||||||| ||||         |||||||||     
T  19504838 gaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttcaact 19504748  T
Q  204 tttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19504747 tttactattttatccgatatgggacatataactcatacttgtacacaacaaca 19504695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18879962 - 18879852
Alignment:
Q  90 ggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactta 189  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||   ||||  |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||    
T  18879962 ggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttactta 18879863  T
Q  190 taaggtgttca 200  Q
    |||||||||||    
T  18879862 taaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 255
Target Start/End: Original strand, 51768115 - 51768225
Alignment:
Q  145 ttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||| |||    
T  51768115 ttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcacatttg 51768214  T
Q  245 tacacaacaac 255  Q
     ||||||||||    
T  51768215 cacacaacaac 51768225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28034343 - 28034222
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||||||| | ||||||||    
T  28034343 agacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggacata 28034244  T
Q  232 taactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  28034243 taattcacacttgcacacaaca 28034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 225
Target Start/End: Original strand, 48111740 - 48111833
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgg 225  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48111740 agacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttacttataatgtgttcaacctttactcttttatccgaggtgg 48111833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 240
Target Start/End: Original strand, 6975498 - 6975606
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||   |||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||    
T  6975498 agacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatgtgagacata 6975597  T
Q  232 taactcaca 240  Q
    |||||||||    
T  6975598 taactcaca 6975606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44621010 - 44620934
Alignment:
Q  181 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg-tgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44621010 tcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttgtccacaacaaca 44620934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43827598 - 43827480
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||| |  |||||||||||| |||  |||||||||| |||||     
T  43827598 gggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatc-caaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttat 43827500  T
Q  187 ttataaggtgttcaaccttt 206  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  43827499 ttataaggagttcaatcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44621491 - 44621420
Alignment:
Q  181 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaac 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44621491 tcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgcacacaac 44621420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31691375 - 31691203
Alignment:
Q  24 gcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcaca 123  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||  ||   |||||||  |  ||| ||||||||| ||||||||| ||| || |||    
T  31691375 gcctcggtcgtacccttcgtcaaac-gggctctaataccactgttgggtcattgggggagctcgaaggatcgtccacatcgaggctagaacaatcgtaca 31691277  T
Q  124 agcaactaa--gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggt 195  Q
    |||||   |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31691276 agcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 760302 - 760194
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||||| | | || ||| ||| ||||||||||    
T  760302 agacaccacacttttaccaaaatc-ttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtgggacata 760204  T
Q  232 taactcacac 241  Q
    ||||||||||    
T  760203 taactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40067158 - 40067041
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaaccttt-actcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| |||||||   ||| | |||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| || | ||||    
T  40067158 agacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaactttttacacttttatccgatgtagaacat 40067059  T
Q  231 ataactcacacttgtaca 248  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40067058 ataactcacacttgtaca 40067041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 244
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788137
Alignment:
Q  194 gtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttg 50788137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050593
Alignment:
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaa 45050593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 45489650 - 45489870
Alignment:
Q  26 ctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaag 125  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||| ||  |||  | ||||  ||||||| || |||||| ||| ||||| |||||   ||||    
T  45489650 ctcggtcgtacccttcgtcaaacgggactctgataccattgttgggtcactggaggagtttgggggatcggccacatcgagactagaacaaccatgcaag 45489749  T
Q  126 caactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgg 225  Q
    | |   |||||||||||| ||||| ||||||||||       |||||| || |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| | |||     
T  45489750 cgagagagacaccacactattacccaaaaccttaaactttaaggtttaaggatcatcttacttatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtga 45489849  T
Q  226 gacatataactcacacttgta 246  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  45489850 tacatataactcacaattgta 45489870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3271948 - 3271841
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaacta-agacac-cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctt 184  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||  ||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||||    
T  3271948 gggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacacacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctctt 3271849  T
Q  185 acttataa 192  Q
    ||||||||    
T  3271848 acttataa 3271841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11197340 - 11197293
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtc 179  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11197340 agacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34544217 - 34544148
Alignment:
Q  136 accacactcttacc-aaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacct 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||    
T  34544217 accacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacct 34544148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Original strand, 11348410 - 11348494
Alignment:
Q  172 tatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| || ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| || || | |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11348410 tatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgcacacaacaaca 11348494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 204
Target Start/End: Original strand, 15841410 - 15841482
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacct 204  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  || ||| ||||| || |||||||||||    
T  15841410 agacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10396245 - 10396198
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtc 179  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10396245 agacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 256
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706687
Alignment:
Q  205 ttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgcacacaacaaca 11706687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 252
Target Start/End: Original strand, 15841034 - 15841146
Alignment:
Q  139 acactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| | || ||| ||||||||  |||||| |||  ||| || |||| ||  |||||||||||| |||    
T  15841034 acactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatgggacatataattca 15841132  T
Q  239 cacttgtacacaac 252  Q
    || |||||||||||    
T  15841133 catttgtacacaac 15841146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 123; Significance: 8e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 256
Target Start/End: Original strand, 460 - 682
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaag 133  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||  ||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||  |||| | |||||||  |||    
T  460 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcactggggaagctcgggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaag 559  T
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatata 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  560 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatata 659  T
Q  234 actcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  660 actcacacttgtgcacaacaaca 682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Original strand, 146 - 298
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||| ||||||| ||| ||| |||   |||| ||||||| || ||||||    
T  146 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atgg-tttatgg-tcctcttac 240  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  241 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34835098 - 34834866
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||| |||    |||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  34835098 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaaccgggctctgataccactgttgggtcactaggg-agcgcaagggatcatccacatcgaggctagaacaaccacac 34835000  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |    
T  34834999 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatg 34834900  T
Q  223 tgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834899 tgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 34834866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3669879 - 3669689
Alignment:
Q  54 tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaa 153  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||    
T  3669879 tctgataccaccgttgggtcacgaggggagctagggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaa 3669780  T
Q  154 accttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3669779 accttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3669689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 256
Target Start/End: Original strand, 3038234 - 3038458
Alignment:
Q  34 tacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacac-gag-gggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaacta 131  Q
    ||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||       
T  3038234 taccctttgtcgaacgaggctctgataccactgttgggtcactgagagggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagag 3038333  T
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3038334 agatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 3038433  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3038434 taactcacacttgtacacaacaaca 3038458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30359421 - 30359261
Alignment:
Q  96 tccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggt 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30359421 tccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggt 30359322  T
Q  196 gttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30359321 gttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 30359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3670232 - 3670062
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||    
T  3670232 cacgaggggagc-tagggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggttt 3670134  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3670133 atgggtcctcatacttataaggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3670062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34835377 - 34835199
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  34835377 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835278  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34835277 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttgtacacagcaaca 34835199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9608903 - 9608738
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||   |||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9608903 gggggccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttact 9608804  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9608803 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 9608738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 260
Target Start/End: Original strand, 33113359 - 33113539
Alignment:
Q  80 ggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtc 179  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  33113359 ggagccagagggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtc 33113458  T
Q  180 atcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacataaa 260  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33113459 ctcttacttataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaacttgtacacaacaacataaa 33113539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40518295 - 40518061
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacac-gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  |  ||| | |||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  40518295 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaacggggctctgataccattgtttggtcaccggggggagctcgggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccaca 40518196  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttac--tcttttatccg 219  Q
    |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||     
T  40518195 caagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttacttataaggtgttcaacctttacttttttttatcca 40518096  T
Q  220 acgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40518095 atgtggaacatataactcacacttgaacacaacaa 40518061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Original strand, 18371928 - 18372142
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctggggga-ccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18371928 tgcctcggtcgtaccctttgtcgaaccaggctctgataccactgttgggtcatgaggggagctcgggggaaccgttcacattgaggctagagcaaccgca 18372027  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    ||||| |   | |||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  18372028 caagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattggat 18372127  T
Q  222 gtgggacatataact 236  Q
    |||| ||||||||||    
T  18372128 gtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30441258 - 30441083
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30441258 cacgaggggagccaaggtgactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 30441159  T
Q  173 atgggtcatcttactta----taaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||| | |||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30441158 atgggccctcttacttataattaaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttg 30441083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 88 - 258
Target Start/End: Original strand, 37544490 - 37544660
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||| |||| ||    
T  37544490 ggggatcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttct 37544589  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 258  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37544590 tataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttgtgcacaacaacata 37544660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Original strand, 6876852 - 6877031
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||   | |||||||||||||||| |||||| |||| | ||| || ||||||    
T  6876852 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatggg 6876951  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggac-atataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6876952 tcatcttatttataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgcacacaacaaca 6877031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34835643 - 34835464
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  34835643 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835544  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatc-cgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34835543 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgtacacagcaaca 34835464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34835909 - 34835730
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  34835909 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835810  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatc-cgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34835809 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgtacacagcaaca 34835730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 251
Target Start/End: Original strand, 1513912 - 1514078
Alignment:
Q  85 ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctt 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| | ||   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  1513912 ctgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctctt 1514011  T
Q  185 acttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1514012 acttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttgtacacaa 1514078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 91 - 256
Target Start/End: Original strand, 70277 - 70441
Alignment:
Q  91 gaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttat 190  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||   ||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  70277 gaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 70376  T
Q  191 aaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  70377 aagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac-tttgtacacaacaaca 70441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482770
Alignment:
Q  92 accgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttata 191  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||   |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  192 aggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataact--cacttgtacacaacaaca 9482770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 256
Target Start/End: Original strand, 25561815 - 25561984
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttacca-aaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||   ||||||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||    
T  25561815 ggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 25561914  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25561915 ttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtagacaacaaca 25561984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359598
Alignment:
Q  92 accgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttata 191  Q
    ||||||||||| || | |||| |||||||| ||| ||   |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  192 aggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacat 30359598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 220
Target Start/End: Original strand, 9483191 - 9483319
Alignment:
Q  92 accgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttata 191  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9483191 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttata 9483290  T
Q  192 aggtgttcaacctttactcttttatccga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9483291 aggtgttcaacctttactcttttatccga 9483319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 147675 - 147441
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcc-tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgc 120  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||  || | |||||||  |||||||||  ||||||  | |||||| | |||||    
T  147675 tgcctcgatcgtaccctttgtcgaaccggggctctgatatcactgttgggtcatg-ggggagctatgggggaccacccacatcaatgctagaactaccgc 147577  T
Q  121 acaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccga 220  Q
    ||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147576 acaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccga 147477  T
Q  221 cgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
     ||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  147476 tgtgggacatataactcacacttacacgcaacaaca 147441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Original strand, 1014178 - 1014401
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctggggga-ccgtccacattgaggctagaccaaccgc 120  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||  |||||||  |||||| || ||||||| ||||||||| |||||||    
T  1014178 tgcctcagtcgtacccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgtatcactgggggagctcgggggaaccatccacatcgaggctagaacaaccgc 1014277  T
Q  121 acaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccga 220  Q
    |||||||    |||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1014278 acaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctga 1014377  T
Q  221 cgtgggacatataactcacacttg 244  Q
     ||  |||||||||||||||||||    
T  1014378 tgtatgacatataactcacacttg 1014401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518577
Alignment:
Q  90 ggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactta 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    |||  |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  190 taaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgaacacaa 40518577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9309469 - 9309345
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9309469 agacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacata 9309370  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  9309369 taactcacacttgcacacaacaaca 9309345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 244
Target Start/End: Original strand, 45121896 - 45122066
Alignment:
Q  74 acgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttta 173  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||| ||| |||||   |||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  45121896 acgaggggagcctgggggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagttta 45121995  T
Q  174 tgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45121996 tgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttg 45122066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 251
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122220
Alignment:
Q  98 cacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 45122220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 88 - 256
Target Start/End: Original strand, 8918764 - 8918932
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||||||||||||| |||| || | ||||| |||| ||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  8918764 ggggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttact 8918863  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8918864 tataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgcacacaacaaca 8918932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5916025 - 5915863
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||      
T  5916025 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta-- 5915928  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaac 255  Q
      ||| ||||| ||| |||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5915927 --taaagtgttaaac-tttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaac 5915863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 244
Target Start/End: Original strand, 40579496 - 40579662
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||    
T  40579496 ggggagcatggaggatcgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatggg 40579595  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  |||||||| |||||||||    
T  40579596 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttg 40579662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 256
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121823
Alignment:
Q  95 gtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagg 194  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||   ||| | |||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  195 tgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttgtacacaacaaca 45121823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014027
Alignment:
Q  96 tccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggt 195  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||||| |||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  196 gttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttg 1014027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Original strand, 20870561 - 20870731
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||  ||| |||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||||    
T  20870561 gaggggagccaggaggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatg 20870660  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggac--atataactcacacttg 244  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||  ||||||||||||||||    
T  20870661 ggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttg 20870731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41972316 - 41972151
Alignment:
Q  91 gaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaa---aaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    ||| ||||||||||||| ||   ||| ||| ||| ||||||||||||||| | | |||    
T  41972316 gaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcact 41972217  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41972216 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 41972151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9309204 - 9308970
Alignment:
Q  24 gcctcggacgtacccttcgtcgaaccggg-ttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||  |||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||     
T  9309204 gcctcggtcgtaccctccgtcgaactggggttctgataccacttttgggtcactgggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacat 9309105  T
Q  123 aagcaactaagacaccacact---cttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccg 219  Q
    | |  |   ||||||||||||   ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |    
T  9309104 a-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataacatgttcaacttttactcttttatctg 9309006  T
Q  220 acgtg--ggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    | |||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9309005 atgtgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 9308970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45122852 - 45122650
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggag-----cctgggggaccgtccacattgaggctagaccaac 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||||  |  || | ||||||     || |||||||| ||||||| |||||| || ||||    
T  45122852 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaactaggctctgatgccactgtttggtcatggggggagtcgggccagggggaccttccacatcgaggcttgaacaac 45122753  T
Q  118 cgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatc 217  Q
    | |||||||||   |||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45122752 cacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc 45122653  T
Q  218 cga 220  Q
    |||    
T  45122652 cga 45122650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45123165 - 45122996
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactct--taccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctt 184  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||  ||   ||||||||||||||  |||| |||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  45123165 gggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctt 45123066  T
Q  185 acttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45123065 actta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacagcaaca 45122996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5420759 - 5420643
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |    
T  5420759 cacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatac 5420660  T
Q  238 acacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||||| | |||||||    
T  5420659 acacttgcatacaacaa 5420643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32305649 - 32305502
Alignment:
Q  74 acgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttta 173  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||| ||| ||  ||||| ||||||||||| | |||| |||||||  |||||||||    
T  32305649 acgaggggagtcagggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggttta 32305550  T
Q  174 tgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32305549 taggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgac 32305502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274947
Alignment:
Q  133 gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatat 232  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  233 aactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  43274924 aactcacacttatacacaacaaca 43274947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8794225 - 8794101
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||    | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  8794225 agacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgagacata 8794126  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8794125 taactcacacttgtacacaacaaca 8794101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147819
Alignment:
Q  98 cacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  198 tcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 147819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9609199 - 9609122
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttact 209  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9609199 agacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttact 9609122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 18371660 - 18371807
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||   |   | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18371660 ggggaaccgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggc-atgggtttatgggtcttcttac 18371758  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcac 239  Q
    |||     ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18371759 ttaa----tgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 242
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380171
Alignment:
Q  89 gggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactt 188  Q
    ||||| |||||||| || ||||||  || |||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||| || |  |||||||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaag--aggcaccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  189 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacact 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 239
Target Start/End: Original strand, 41416241 - 41416322
Alignment:
Q  158 taaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcac 239  Q
    ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41416241 taaggtgataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 41416322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373098
Alignment:
Q  142 ctcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacac 241  Q
    |||||||| |||||||   ||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T
Q  242 ttgtacacaacaaca 256  Q
     ||||||||||||||    
T  18373085 -tgtacacaacaaca 18373098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  141 actcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcaca 240  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 243
Target Start/End: Original strand, 32640519 - 32640682
Alignment:
Q  76 gaggggagc-ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttat 174  Q
    ||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||| ||| | || ||||||   |||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32640519 gaggggagctctggcggaccgctcacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 32640618  T
Q  175 gggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacactt 243  Q
     |||| |||||| ||     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  32640619 cggtcctcttaccta-----tgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9507896 - 9507769
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttact---cttttatccgacgtg--gg 226  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |  ||  ||    
T  9507896 agacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttactgtacttttatccaatatggagg 9507797  T
Q  227 acatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||    
T  9507796 agatataactcacacttgcacacaacaa 9507769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Original strand, 4154710 - 4154831
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||  ||| || |||| || ||||||||||    
T  4154710 agacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttctatcagatgtgggacata 4154809  T
Q  232 taactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  4154810 taactcacacttgcacacaaca 4154831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 243
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372411
Alignment:
Q  174 tgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacactt 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 243
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  174 tgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacactt 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6732045 - 6731906
Alignment:
Q  96 tccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggt 195  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||           
T  6732045 tccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttactt------- 6731953  T
Q  196 gttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
      |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6731952 --tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6731906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 248
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372762
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    |||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  238 acacttgtaca 248  Q
    |||||||||||    
T  18372752 acacttgtaca 18372762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283867
Alignment:
Q  97 ccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtg 196  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |   |||||| ||||||||| | ||||||||||| |  || ||||||| ||||| |||||| |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagact-tgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  197 ttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaac 252  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgcacacaac 12283867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 236
Target Start/End: Original strand, 25561737 - 25561792
Alignment:
Q  181 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataact 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25561737 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6651653 - 6651510
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||  |||||     
T  6651653 gggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta- 6651555  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcac 239  Q
            | ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6651554 --------ttttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 8919082 - 8919219
Alignment:
Q  25 cctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaa 124  Q
    |||||| | |||||||||| |||| ||  |||||||||| ||| |   |||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  8919082 cctcggtcatacccttcgttgaacgggactctgataccattgttgagtcacgagggaagc-tgggggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaa 8919180  T
Q  125 gcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggc 163  Q
    ||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8919181 gcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggc 8919219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 171
Target Start/End: Original strand, 40579258 - 40579352
Alignment:
Q  77 aggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtt 171  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||    
T  40579258 aggggagctcgggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 253
Target Start/End: Original strand, 9620663 - 9620841
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||||||  |   ||||| || |||||||   |||| |||||||| ||| ||||    
T  9620663 cacgaggggagcccgggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagttt 9620760  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| ||||| | |||| || |||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9620761 atgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 9620841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 243
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  156 cttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggac--atataactcacactt 243  Q
    |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Original strand, 4154325 - 4154446
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||| || |||| || || |||||||    
T  4154325 agacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggtc-tctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggacata 4154423  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    
T  4154424 taactcacatttgcacacaacaa 4154446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41129158 - 41129073
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaag 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||| ||   ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41129158 gaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaag 41129073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 146
Target Start/End: Original strand, 18372218 - 18372342
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagc-ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||  || ||||||||| | |||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||    
T  18372218 tgcctcggtcgtaccctttgtcgaaccaggctctgataccactattgggtcatgaggggagctcgggggaaccgtccacatcgagactaaagcaaccgca 18372317  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactctt 146  Q
    ||||| |   |||||||||||||||    
T  18372318 caagcgagagagacaccacactctt 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831971
Alignment:
Q  169 gtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | |||| || | | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 33831971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 242
Target Start/End: Original strand, 43398117 - 43398225
Alignment:
Q  137 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatc---ttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatata 233  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||||||| |||  |||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  || || |||||    
T  43398117 ccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatata 43398216  T
Q  234 actcacact 242  Q
    |||||||||    
T  43398217 actcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 243
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  202 cctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacactt 243  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 253
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995566
Alignment:
Q  189 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 20995566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5274889 - 5274770
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||  |||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| | || |||||| | | || | |||||    
T  5274889 agacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttttattcaatgtagaacata 5274790  T
Q  232 taactcacacttgtacacaa 251  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  5274789 taactcatacttgcacacaa 5274770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 209
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373291
Alignment:
Q  154 accttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttact 209  Q
    |||||||| | ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttact 18373291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 125
Target Start/End: Original strand, 3037921 - 3038006
Alignment:
Q  42 gtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacac-ga-ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaag 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  3037921 gtcgaacggggctctgataccactgttgggtcactgagggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaag 3038006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 256
Target Start/End: Original strand, 43346756 - 43346959
Alignment:
Q  54 tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctggg-ggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaa 152  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||    
T  43346756 tctgataccactgttaggacatgaggggagcttcggaggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaa 43346855  T
Q  153 aaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaac 252  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346856 aaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaac 43346955  T
Q  253 aaca 256  Q
    ||||    
T  43346956 aaca 43346959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 37990911 - 37991145
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgagggg-agcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||| ||  || |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  37990911 tgcctcgatcgtaccctttgtcgaatggggccctgataccactgttgggtcatgagggggagcctgagggaccgtccacatcgaggctagaacaaccaca 37991010  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
     ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  37991011 taagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaat 37991110  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37991111 gtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 37991145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 77 - 257
Target Start/End: Original strand, 42342377 - 42342557
Alignment:
Q  77 aggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgg 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  42342377 aggggagccagggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgg 42342476  T
Q  177 gtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42342477 gtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacat 42342557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 256
Target Start/End: Original strand, 29644887 - 29645070
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  29644887 cacgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggttt 29644986  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29644987 atgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaaca 29645070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Original strand, 32462843 - 32463069
Alignment:
Q  32 cgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacga-ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaact 130  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| |||||||  |||||| | ||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||      
T  32462843 cgtacccttcgtcgaactaggctctgatgccactgttagaacactaaggggagcttggaagaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaga 32462942  T
Q  131 aagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacc-tttactcttttatccgacgtgggaca 229  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32462943 gagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttataaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggaca 32463042  T
Q  230 tataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  32463043 tataactcacacttgtacacaacaaca 32463069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35946682 - 35946515
Alignment:
Q  86 tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  35946682 tgggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctctta 35946583  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946582 cttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 35946515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 52634889 - 52634666
Alignment:
Q  32 cgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaacta 131  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||  |||  |||||||  ||||||| ||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||       
T  52634889 cgtacccttcgtcgaagggggctctgatatcactgttgggtcactgggggagctcgggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagag 52634790  T
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  52634789 agacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc-tcttacttataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacata 52634691  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  52634690 taactcacacttgtacacaacaaca 52634666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 54017782 - 54017982
Alignment:
Q  54 tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaa 153  Q
    |||||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||||||| |||    
T  54017782 tctgataccactgttgggtcactgggggagccagggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaa 54017881  T
Q  154 accttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54017882 accttaaggcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 54017981  T
Q  254 a 254  Q
    |    
T  54017982 a 54017982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 256
Target Start/End: Original strand, 12114547 - 12114730
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  12114547 cacgaggggagtctgggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggttt 12114646  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12114647 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgcacacaacaaca 12114730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 37990638 - 37990807
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  37990638 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttac 37990737  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990738 ttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 37990807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 258
Target Start/End: Original strand, 3135389 - 3135631
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| || ||  || |||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3135389 tgcctcgttcgtaccctttgtcgaatggggctctgataccacagttgggtcatgaggagagtcagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcac 3135488  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttat--gggtcatcttac-----ttataaggtgttcaacctttactctttta 215  Q
    ||||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||     | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3135489 aagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctcttactaatataataaggtgttcaacttttactctttta 3135588  T
Q  216 tccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 258  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135589 tctgaggtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 3135631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15773069 - 15772844
Alignment:
Q  32 cgtacccttcgtcgaacc-gggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaact 130  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||  || |||||||| |    ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||      
T  15773069 cgtacccttcgtcgaatcagggctctgataccactgttgggtcatgaggggagtcaaaaggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaaga 15772970  T
Q  131 aagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  15772969 gagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacat 15772870  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||    
T  15772869 ataactcacacttgcacacgacaaca 15772844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 257
Target Start/End: Original strand, 29644566 - 29644750
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||| | |||||||| ||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  29644566 cacgaggggagtttgggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggttt 29644665  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29644666 atgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaaaacat 29644750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Original strand, 54018197 - 54018367
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  54018197 gggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttac 54018296  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  54018297 ttataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgcacataacaacat 54018367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22304728 - 22304571
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  22304728 gggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttac 22304629  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22304628 ttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttg 22304571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 33803186 - 33803417
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccg-ggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||     || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  33803186 tgcctcagtcgtacccttcgtcgaatcgaggctctgataccactgttggtcattgatgggagtttgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccaca 33803285  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    ||||  |   |||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  33803286 caagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttactattttatccgat 33803385  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33803386 gtgggacatataactcacaattgcacacaaca 33803417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32589862 - 32589694
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32589862 gggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 32589763  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32589762 ttataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgcacacaacaaca 32589694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 77 - 256
Target Start/End: Original strand, 25739413 - 25739593
Alignment:
Q  77 aggggagcct-gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |   ||||  |||||||||||| ||||||| || || ||| |||||||    
T  25739413 aggggagccttgggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatg 25739512  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25739513 ggtcctcttacttatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 25739593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 257
Target Start/End: Original strand, 22303900 - 22304117
Alignment:
Q  35 acccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcct-gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaa 132  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  |||  ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||   |    
T  22303900 acccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttaggtcactgggggagccttgggggacaatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagaga 22303999  T
Q  133 gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatat 232  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||       ||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  22304000 gacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag-------acctttactattttatctgatgtgggacatat 22304092  T
Q  233 aactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22304093 aactcacacttgtacacaacaacat 22304117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 256
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342258
Alignment:
Q  90 ggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactta 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  190 taaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||  || ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgcacacaacaaca 42342258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25755553 - 25755384
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||| ||||| | ||| ||| | | |||| |||||| ||| ||||||    
T  25755553 gggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttac 25755454  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25755453 ttataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 25755384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45901828 - 45901703
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacc-tttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  45901828 agacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttacttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacat 45901729  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45901728 ataactcacacttgtacacaacaaca 45901703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 256
Target Start/End: Original strand, 41359710 - 41359929
Alignment:
Q  34 tacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagc-ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaa 132  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||| | ||  |||  ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |   |    
T  41359710 tacccttcgtcgaatggggctatgataccactattgggtcactgggggagctcggggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagaga 41359809  T
Q  133 gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatat 232  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||    ||    
T  41359810 gacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtggg----at 41359905  T
Q  233 aactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  41359906 aactcacacttgcacacaacaaca 41359929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935104
Alignment:
Q  96 tccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggt 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   ||||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  196 gttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactc 39935104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 256
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336855
Alignment:
Q  96 tccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaacta-agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagg 194  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||  ||  | |||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  195 tgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    || |||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcacacttgtacacaacaaca 49336855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 88 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31190167 - 31190006
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||| ||| |||    
T  31190167 ggggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaact 31190076  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31190075 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgcacacaacaacat 31190006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 53577588 - 53577354
Alignment:
Q  24 gcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgagg-ggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||| | | ||||   |||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  53577588 gcctcggtcgtacccttcgtcgaaccgggactctgataccactgttgggtcacaaagaggagttcgggggaccatccacaccgaggctagaacaaccaca 53577489  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    |  ||||   |||||||||||||||||| || |||||||||| ||  |||||||| ||  |||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  53577488 cttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatttttaagatgttcaacctttactgttttatccgat 53577389  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53577388 gtgtgacatataactcacacttgcacacaacaaca 53577354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15773346 - 15773182
Alignment:
Q  94 cgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacac--cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttata 191  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||  |||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  15773346 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttata 15773247  T
Q  192 aggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15773246 agatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 15773182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 32462602 - 32462727
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacc-tttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
T  32462602 agaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttacttataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacat 32462701  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32462702 ataactcacacttgtacacaacaaca 32462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39389184 - 39389072
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  39389184 agacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacata 39389085  T
Q  232 taactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||    
T  39389084 taactcacacttg 39389072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 254
Target Start/End: Original strand, 45395651 - 45395819
Alignment:
Q  86 tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |   |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |||||    
T  45395651 tgggagaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctctta 45395750  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  45395751 cttataacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgcacacaacaa 45395819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Original strand, 21832344 - 21832508
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||   |||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  21832344 gggggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttac 21832441  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21832442 ttataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgcacataaca 21832508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Original strand, 3135098 - 3135237
Alignment:
Q  113 ccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactctt 212  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3135098 ccaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactatt 3135197  T
Q  213 ttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3135198 ttatccgatgtgggacatataact--cacttgtacacaacaa 3135237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8328018 - 8327897
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8328018 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacata 8327919  T
Q  232 taactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  8327918 taactcacacttgcacacaaca 8327897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4823796 - 4823657
Alignment:
Q  105 aggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacct 204  Q
    |||||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |    
T  4823796 aggctagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactt 4823697  T
Q  205 ttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  4823696 ttactattttatccgatgtgagacttataactcacacttg 4823657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 258
Target Start/End: Original strand, 53117961 - 53118144
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||  |  |   |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  53117961 cacgaggggagc-tgggggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt 53118059  T
Q  173 atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 258  Q
     ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  53118060 -tgaatcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgcccacaacaacata 53118144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914242
Alignment:
Q  99 acattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgtt 198  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||  |   |||||||||||||||| | ||||  |||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  199 caacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaaca 39914242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Original strand, 33175711 - 33175829
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttat---gggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataa 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||||    
T  33175711 cacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataa 33175810  T
Q  235 ctcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33175811 ctcacacttgtacacaaca 33175829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Original strand, 1634366 - 1634483
Alignment:
Q  140 cactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacc-tttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| | || ||||||| |||||||||||||||||    
T  1634366 cactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactca 1634465  T
Q  239 cacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  1634466 cacttgcacacagcaaca 1634483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 172
Target Start/End: Original strand, 41359478 - 41359575
Alignment:
Q  75 cgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  41359478 cgaggggagtctgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgggttt 41359575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 236
Target Start/End: Original strand, 42584829 - 42584970
Alignment:
Q  93 ccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataa 192  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||   ||||||||||||||| |  |||| |||||| | || ||||||||| || ||||||||||||    
T  42584829 ccgtccacattgaaactagaacaaccgcataagtaag--agacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataa 42584926  T
Q  193 ggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataact 236  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42584927 ggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggacatataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11662066 - 11661941
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  11662066 agacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcacttttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcat 11661967  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
     ||||||||||||  | |||||||||    
T  11661966 ttaactcacacttacatacaacaaca 11661941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Original strand, 50612534 - 50612608
Alignment:
Q  170 tttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50612534 tttatgagtcctcttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 50612608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9240263 - 9240142
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||| ||||| |  ||| |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||| |||| |||||    
T  9240263 agacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacata 9240164  T
Q  232 taactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  9240163 taactcacacttgcacacaaca 9240142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 252
Target Start/End: Original strand, 33362349 - 33362460
Alignment:
Q  144 cttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtggga---catataactcaca 240  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| || ||   |||||||||||||    
T  33362349 cttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccgacatgagatatcatataactcaca 33362448  T
Q  241 cttgtacacaac 252  Q
    ||| ||||||||    
T  33362449 cttatacacaac 33362460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 254
Target Start/End: Original strand, 44160545 - 44160710
Alignment:
Q  86 tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  || ||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  44160545 tgggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttaccaaaa-ccttaagacaatgggtttatggatcctctta 44160641  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||| |  ||  |||||||||| ||||||| | |||||||    
T  44160642 tttataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgcatacaacaa 44160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11661600 - 11661525
Alignment:
Q  181 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11661600 tcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaccaaca 11661525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346640
Alignment:
Q  190 taaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgcacacaacaaca 43346640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 22303662 - 22303759
Alignment:
Q  91 gaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttactt 188  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||   | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22303662 gaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Original strand, 47964562 - 47964683
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||  ||  || ||||||| | ||||||||    
T  47964562 agacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttctatccgatgcgggacata 47964661  T
Q  232 taactcacacttgtacacaaca 253  Q
     |||||||||||| ||||||||    
T  47964662 caactcacacttgcacacaaca 47964683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51886638 - 51886563
Alignment:
Q  169 gtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  51886638 gtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttg 51886563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 243
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  154 accttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacactt 243  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304248
Alignment:
Q  191 aaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 22304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22304419 - 22304311
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacac-gaggggagcct-gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccg 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||  |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22304419 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcagtgaggggaagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccg 22304320  T
Q  120 cacaagcaa 128  Q
    |||||||||    
T  22304319 cacaagcaa 22304311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37726569 - 37726506
Alignment:
Q  181 tcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37726569 tcttacttataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 37726506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 249
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384427
Alignment:
Q  139 acactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  |  ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  239 cacttgtacac 249  Q
    | |||| ||||    
T  3384417 cgcttgcacac 3384427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9240037 - 9239947
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccg-ggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctaga 112  Q
    |||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9240037 tgcctcgatcgtaccctttgttgaaccgaggttctgatactactgttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctaga 9239947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 251
Target Start/End: Original strand, 39336292 - 39336392
Alignment:
Q  151 aaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacaca 250  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||  |   || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39336292 aaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacaca 39336391  T
Q  251 a 251  Q
    |    
T  39336392 a 39336392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546490
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |  ||| |||||||| |||||||||||  ||  ||  |||| | || |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  238 acacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||  ||||||||    
T  46546475 acacttacacacaaca 46546490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  136 accacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtg 196  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 176
Target Start/End: Original strand, 54017592 - 54017636
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgg 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  54017592 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12749278 - 12749211
Alignment:
Q  137 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacct 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  12749278 ccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgttcaacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Original strand, 41360079 - 41360161
Alignment:
Q  32 cgtacccttcgtcgaaccgg-gttctgataccactgtaggaaca-cgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctaga 112  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  41360079 cgtactcttcgtcgaaccggcgctctgataccactgttaggacagcgaggggagcccggggaaccgtccacatcgaggctaga 41360161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Original strand, 47964959 - 47965080
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||||   |||| |||||  ||| || ||||||| ||   |||||    
T  47964959 agacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacata 47965058  T
Q  232 taactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  47965059 taactcacacttgcacacaaca 47965080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 254
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747918
Alignment:
Q  214 tatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 12747918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17731994
Alignment:
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggt 178  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 17731994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 178
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033225
Alignment:
Q  134 acaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggt 178  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 19033225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 204
Target Start/End: Original strand, 39336014 - 39336086
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacct 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||    
T  39336014 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53596074 - 53596027
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtc 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  53596074 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53596389 - 53596342
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtc 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  53596389 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53596589 - 53596542
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtc 179  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  53596589 agacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 65)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 31767096 - 31767329
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  31767096 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaacggggctctgataccactgttgggtcatgagggaagcttgggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacac 31767195  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    ||||||   ||||  |||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  31767196 aagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatg 31767295  T
Q  223 tgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31767296 tggaacatataacccacacttgcacacaacaaca 31767329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 244
Target Start/End: Original strand, 44290757 - 44290981
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacac-gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgc 120  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||  | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  44290757 tgcctcggtcgcacccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcagtggggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgc 44290856  T
Q  121 acaagcaactaagacaccacactctt-accaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccg 219  Q
    ||||||||   | ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44290857 acaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 44290956  T
Q  220 acgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  44290957 atgtgggacatataactcacacttg 44290981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17294751 - 17294569
Alignment:
Q  73 cacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaacc-gcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtt 171  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17294751 cacgaggggagctcgggcgaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 17294652  T
Q  172 tatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294651 tatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 17294569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 78 - 244
Target Start/End: Original strand, 44290448 - 44290614
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44290448 ggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 44290547  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44290548 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 44290614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41157217 - 41156981
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacg--aggggagcct-gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccg 119  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||  |||   |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||     
T  41157217 tgccttggtcgtaccctttgtcgaacggggctctgataccattgttgggtcactgaaggggagccttgggggaccgcccacatcgaggctagaacaacca 41157118  T
Q  120 cacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccg 219  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157117 cacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccg 41157018  T
Q  220 acgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
       |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41157017 ttatgggacatataattcacacttgcacacaacaaca 41156981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41142532 - 41142361
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactctt-accaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  41142532 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttta 41142433  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41142432 cttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacagaacaacat 41142361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 257
Target Start/End: Original strand, 26661833 - 26662067
Alignment:
Q  24 gcctcggacgtacccttcgtcgaaccg-ggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcac 122  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||  ||||||||||||  ||| |||| ||| |||  ||| | || ||||| |||    
T  26661833 gcctcggtcgtacccttcgtcgaatcgaggttctaataccacttttgggtcacgaggggagctagggagaccatccgcatcaaggattgaacaaccacac 26661932  T
Q  123 aagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacg 222  Q
    ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  26661933 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgata 26662032  T
Q  223 tgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662033 tgggatatataactcacacttgtacacaacaacat 26662067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34649662 - 34649428
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagc-ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||  ||| |||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  34649662 tgcctcggtcgtacccttcatcgaacggggctctgataccactgttgggtcactagggaagctccgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccaca 34649563  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    | |||||   |||| || |||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34649562 ctagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgat 34649463  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34649462 gtgggacatataactcacacttgtatacaacaaca 34649428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 26661521 - 26661690
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    ||||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||    
T  26661521 gggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcac 26661620  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661621 ttataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 26661690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34364722 - 34364497
Alignment:
Q  32 cgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaact 130  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||  |||||||   ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |      
T  34364722 cgtacccttcgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcactgggggagctcagggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgaga 34364623  T
Q  131 aagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacat 230  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  34364622 gagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacat 34364523  T
Q  231 ataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  34364522 ataactcacacttgcacacaacaaca 34364497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 253
Target Start/End: Original strand, 22077429 - 22077660
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaacc-gggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||    
T  22077429 tgccttggtcgtacccttcgtcgaacctgggctctgatgccactgttgggtcacaaggggagcctgggggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgca 22077528  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
     |||  |   |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  22077529 taagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgat 22077628  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22077629 gtgagacatataactcacacttgcacacaaca 22077660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9956129 - 9955911
Alignment:
Q  27 tcggacgtacccttcgtcgaaccg-ggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaag 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9956129 tcggtcgtacccttcgtcgaaccgaggctctgataccactgttgggtcacgaggagagcctaggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaag 9956030  T
Q  126 caactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggttt-atgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttac-tcttttatccgacgt 223  Q
    |||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||    
T  9956029 caagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgt 9955930  T
Q  224 gggacatataactcacact 242  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9955929 gggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41157545 - 41157367
Alignment:
Q  77 aggggagcctgg-gggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  41157545 aggggagccttgagggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatg 41157446  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41157445 ggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 41157367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 254
Target Start/End: Original strand, 66406 - 66638
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||  || ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  66406 tgcctcggtcgtacccttcgtcgaaccgggactctgatatcactgttgggtcatgaggggagcttggataaccgtccacattgaggctagaacaaccgca 66505  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
    ||||| |   |||| | | ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  66506 caagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgat 66605  T
Q  222 gtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  66606 atggaacatataactcacacttgcacacaacaa 66638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14319026 - 14318875
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  14319026 gggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttac 14318927  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14318926 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 37850539 - 37850768
Alignment:
Q  27 tcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaag 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  || ||| || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37850539 tcggacgtaccctttgtcgaaccggggctctgataccagagttggatcatgaggggagc-taggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaag 37850637  T
Q  126 caactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgg 225  Q
      |   |||||||||||||||| |  |||||||||  |  | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  37850638 tgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgg 37850737  T
Q  226 gacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37850738 gacatataactcacacttgcacacaacaaca 37850768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 241
Target Start/End: Original strand, 3537599 - 3537752
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||    
T  3537599 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttact 3537698  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacac 241  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3537699 cataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacac 3537752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34365039 - 34364915
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  34365039 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgacata 34364940  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  34364939 taactcacacttgcacacaacaaca 34364915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556101
Alignment:
Q  97 ccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtg 196  Q
    |||||| |||||| || ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  197 ttcaacctttact-cttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 37556101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 260
Target Start/End: Original strand, 38804371 - 38804527
Alignment:
Q  104 gaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacc 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  38804371 gaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaacc 38804470  T
Q  204 tttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacataaa 260  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38804471 tttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaacaacaatataaa 38804527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759485
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 41759485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11977439 - 11977270
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||  ||||||    
T  11977439 gggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttac 11977340  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11977339 ttataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacagcaaca 11977270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45084546 - 45084378
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||      |||||    
T  45084546 gagggaagcctgggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagacg------ttatg 45084453  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacaca 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45084452 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgcacaca 45084378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 254
Target Start/End: Original strand, 5319965 - 5320131
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||    
T  5319965 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcact 5320064  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5320065 tataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgcatacaacaa 5320131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 244
Target Start/End: Original strand, 48588486 - 48588644
Alignment:
Q  86 tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||    
T  48588486 tgggcgaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttctta 48588585  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  48588586 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttg 48588644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 243
Target Start/End: Original strand, 50051958 - 50052178
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggt-tctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgca 121  Q
    |||||||| ||  ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||| ||||  ||    
T  50051958 tgcctcggtcgcgccctttgtcgaaccggggctctgataccactgttgggtcacgaggggagctcgggggactgtccacatcgaggttagaacaaca-ca 50052056  T
Q  122 caagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgac 221  Q
     || |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||   || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  50052057 taaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgat 50052156  T
Q  222 gtgggacatataactcacactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  50052157 gtgggacatataactcacactt 50052178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550722
Alignment:
Q  92 accgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttata 191  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |   ||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  192 aggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3550722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40082556 - 40082398
Alignment:
Q  96 tccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggt 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||  || |||||||||||||||    
T  40082556 tccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggt 40082458  T
Q  196 gttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaac 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  40082457 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcgcacaacaac 40082398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 76 - 254
Target Start/End: Original strand, 3875319 - 3875497
Alignment:
Q  76 gaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatg 175  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||  |   |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3875319 gaggggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatg 3875418  T
Q  176 ggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  3875419 agtcctcttacttataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgcacacaacaa 3875497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29798359 - 29798189
Alignment:
Q  86 tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    |||||||||||| | || |||| |||| ||||| |||  ||||   |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  29798359 tgggggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctctta 29798260  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29798259 cttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgcatacaacaaca 29798189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 132 - 244
Target Start/End: Original strand, 32594760 - 32594872
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||    
T  32594760 agacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtaggacata 32594859  T
Q  232 taactcacacttg 244  Q
    |||||||||||||    
T  32594860 taactcacacttg 32594872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 256
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184593
Alignment:
Q  152 aaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 41184588  T
Q  252 caaca 256  Q
    |||||    
T  41184589 caaca 41184593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Original strand, 39066199 - 39066368
Alignment:
Q  86 tgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctta 185  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||| ||   |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||    
T  39066199 tgggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatctta 39066297  T
Q  186 cttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39066298 gttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgcacacaacaaca 39066368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 244
Target Start/End: Original strand, 45493971 - 45494135
Alignment:
Q  85 ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatctt 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||| ||   |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  45493971 ctgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatctt 45494070  T
Q  185 acttataa----ggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatat-aactcacacttg 244  Q
    |||||||     ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45494071 acttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttg 45494135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 251
Target Start/End: Original strand, 22077774 - 22077991
Alignment:
Q  34 tacccttcgtcgaacc-gggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaa 132  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||| || |||||||| |||  |   |    
T  22077774 tacccttcgtcgaacctgggctctgatgccactgttgggtcacaaggggagcctggaggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaaga 22077873  T
Q  133 gacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatat 232  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||  |   ||||||    
T  22077874 gacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatat 22077972  T
Q  233 aactcacacttgtacacaa 251  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  22077973 aactcacacttgcacacaa 22077991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555721
Alignment:
Q  97 ccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtg 196  Q
    |||||| |||||| || ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| || || |||||||||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggatttaagg-tcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  197 ttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaac 255  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacacttttacacaacaac 37555721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5575218 - 5575110
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5575218 agacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttctatccgacgtgggacata 5575119  T
Q  232 taactcaca 240  Q
    ||| |||||    
T  5575118 taattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 244
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537303
Alignment:
Q  167 gggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3537303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 244
Target Start/End: Original strand, 32168698 - 32168843
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||        
T  32168698 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct---- 32168793  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttg 244  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  32168794 --taaggtgttcaacctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttg 32168843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 253
Target Start/End: Original strand, 66136 - 66254
Alignment:
Q  137 ccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttc-aacctttactcttttatccgacgtgggacat-ataa 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |    
T  66136 ccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaacctttacttttctatccgatgtgagacatgatta 66235  T
Q  235 ctcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  66236 ctcacacttgcacacaaca 66254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 95 - 253
Target Start/End: Original strand, 24600321 - 24600479
Alignment:
Q  95 gtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagg 194  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  || ||| |   |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||| ||  ||||||||||||      
T  24600321 gtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataata 24600420  T
Q  195 tgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24600421 tgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 24600479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 220
Target Start/End: Original strand, 22077101 - 22077242
Alignment:
Q  79 gggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||  |   ||||  |||||||||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  22077101 gggagcctgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggt 22077200  T
Q  179 catcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccga 220  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  22077201 cctcttacttataaggtattcaacctttacttttctatccga 22077242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Original strand, 44043816 - 44043893
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttact 209  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44043816 agacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttact 44043893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 256
Target Start/End: Original strand, 21378118 - 21378209
Alignment:
Q  165 atgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21378118 atgggtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgcacacaacaaca 21378209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839617
Alignment:
Q  98 cacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    ||||| ||||| ||| ||| | |||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  198 tc-----aacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||     |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45839679 tcgattcaacctttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttgtacacaacaaca 45839617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 253
Target Start/End: Original strand, 19283455 - 19283620
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttact 187  Q
    |||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||  |   |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |    
T  19283455 ggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctcatt 19283554  T
Q  188 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    || || ||| |||||||  ||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19283555 tacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 19283620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44685551 - 44685449
Alignment:
Q  152 aaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaa-cctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacaca 250  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44685551 aaacattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacaca 44685452  T
Q  251 aca 253  Q
    |||    
T  44685451 aca 44685449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22793431 - 22793270
Alignment:
Q  94 cgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcga-tgggtttatgggtcatcttacttataa 192  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||   ||||  |||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||    
T  22793431 cgtccatattgaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataa 22793332  T
Q  193 ggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
     || |||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22793331 agttttcaacctctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgctcacaacaa 22793270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 253
Target Start/End: Original strand, 24132049 - 24132150
Alignment:
Q  152 aaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaa 251  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  24132049 aaaccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgcatacaa 24132148  T
Q  252 ca 253  Q
    ||    
T  24132149 ca 24132150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 253
Target Start/End: Original strand, 30630690 - 30630803
Alignment:
Q  140 cactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcac 239  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  30630690 cactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgtcaaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcac 30630789  T
Q  240 acttgtacacaaca 253  Q
    ||||| ||| ||||    
T  30630790 acttgcacataaca 30630803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 236
Target Start/End: Original strand, 5528798 - 5528902
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||   ||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5528798 agacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagatgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacata 5528897  T
Q  232 taact 236  Q
    |||||    
T  5528898 taact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 199 - 259
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154210
Alignment:
Q  199 caacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacataa 259  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacataa 35154210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11977103 - 11977009
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcat 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  11977103 gggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtcat 11977009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Original strand, 1188632 - 1188753
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||| ||| ||||||||  | ||||||||  ||| || |||||||  ||| |||||    
T  1188632 agacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacata 1188731  T
Q  232 taactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  1188732 taactcacacttgcacacaaca 1188753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 253
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469246
Alignment:
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgcacacaaca 50469246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 4266872 - 4266940
Alignment:
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgta 246  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||    
T  4266872 tcatcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgta 4266940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 147
Target Start/End: Original strand, 21378059 - 21378118
Alignment:
Q  88 ggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactctta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   |||| |||||||||||    
T  21378059 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaatatagacgccacactctta 21378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4956299 - 4956218
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccg 219  Q
    |||||| ||||| ||||| |||  || ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  4956299 cacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 125
Target Start/End: Original strand, 41184340 - 41184445
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaac-cgggttctgataccactgtaggaacac-gaggggagc-ctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccg 119  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  41184340 tgcctcggtcttacccttcgtcgagctcgggctctgataccactgttggatcagtgaggggagctcggggggaccgtcgacatcgaggctggaacaaccg 41184439  T
Q  120 cacaag 125  Q
    ||||||    
T  41184440 cacaag 41184445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4878864 - 4878796
Alignment:
Q  185 acttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 253  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4878864 acttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaaca 4878796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12466397 - 12466366
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12466397 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggc 12466366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 35154047 - 35154106
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttata 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||||||    
T  35154047 agacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 251
Target Start/End: Original strand, 1187414 - 1187527
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactc 237  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  1187414 cacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagacatataattc 1187513  T
Q  238 acacttgtacacaa 251  Q
    ||||||| ||||||    
T  1187514 acacttgcacacaa 1187527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31877307 - 31877262
Alignment:
Q  138 cacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatct 183  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  31877307 cacactcttacctaaaaccttaagatgatgagtttatgggtcatct 31877262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 197
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184197
Alignment:
Q  152 aaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgt 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaagtgt 41184197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 257
Target Start/End: Original strand, 1096 - 1275
Alignment:
Q  78 ggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatggg 177  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1096 ggggagcttggggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgag 1195  T
Q  178 tcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1196 tcctttttcttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 1275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 199
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1802
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1735 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 256
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3153
Alignment:
Q  195 tgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaaca 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 118
Target Start/End: Original strand, 1618 - 1713
Alignment:
Q  23 tgcctcggacgtacccttcgtcgaaccgggttctgataccactgtaggaacacgaggggagcctgggggaccgtccacattgaggctagaccaacc 118  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||| |||||    
T  1618 tgcctcggttgtaccctttgtcgaacgaggctctgataccactgttgggtcacgaggggagctagggggactgcccacatcgaggctagaacaacc 1713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5471 - 5349
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacata 231  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||    
T  5471 agacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtggaacata 5372  T
Q  232 taactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  5371 taactcacacttgcacacaacaa 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5133 - 4972
Alignment:
Q  95 gtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagg 194  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |   |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||     
T  5133 gtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataaga 5034  T
Q  195 tgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    | || |||||||||| || | ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5033 tattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgcacacaacaaca 4972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5377
Alignment:
Q  97 ccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggt 195  Q
    |||||| |||||| || ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  196 gttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacataaagcacc 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaacaataagcacc 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5867 - 5767
Alignment:
Q  156 cttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaac 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5867 cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgcacacaacaac 5768  T
Q  256 a 256  Q
    |    
T  5767 a 5767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 256
Target Start/End: Original strand, 17498 - 17624
Alignment:
Q  132 agacaccacactcttacc--aaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggaca 229  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  17498 agacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtgaca 17597  T
Q  230 tataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17598 tataactcacacttgcacacaacaaca 17624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47519 - 47350
Alignment:
Q  87 gggggaccgtccacattgaggctagaccaaccgcacaagcaactaagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgggtttatgggtcatcttac 186  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||    
T  47519 gggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttac 47420  T
Q  187 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  47419 ttataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgcacacatcaaca 47350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10280
Alignment:
Q  169 gtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttgtgcacaacaacat 10280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39870 - 39830
Alignment:
Q  214 tatccgacgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39870 tatccgatgtgggacatataactcacacttgaacacaacaa 39830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University