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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF4285_high_20 (Length: 414)
Name: NF4285_high_20
Description: NF4285
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4285_high_20 |
 | |
|
| [»] scaffold0003 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0172 (1 HSPs) |
| | |
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| [»] scaffold0655 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3509942 - 3509554
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaa |
110 |
Q |
| |
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|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
3509942 |
cacataaataata-acataatattcatgccaaaacaacaacaccaaggtaattatcacatcaccaatatatagcacatagcattcacttcaaaacaacaa |
3509844 |
T |
|
| Q |
111 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcc |
210 |
Q |
| |
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||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3509843 |
cactatggtaaccatcacaacacaaatat--tcacacatacacatacggaagcgcatggaatgatgcccttacctttgcaccaagaactcttaaaattcc |
3509746 |
T |
|
| Q |
211 |
catgaagcattctttgttccactacgtctataccttcacaaaataattcaccactgattcttaataccaaaactaactaacattttaacaatcaaggctg |
310 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3509745 |
catgaagcattctttgttccactacgtctataccttcacaaaataattcaccactaattcttaataccaaaactaactaacattttaacattcaaggctg |
3509646 |
T |
|
| Q |
311 |
aagggtttggctaagggttctaatcaaaatatgaatattttacttagatat-------gactacctctttaaaattaagtccaaaaggtaaa |
395 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3509645 |
aagggtttggctaaggaatctaatcaaaatatgaatattttacttagatattcacaacgactacttctgtaaaattaagtccaaaaggtaaa |
3509554 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24540746 - 24540576
Alignment:
| Q |
16 |
aaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaacacta |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
24540746 |
aaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatataaaacatagcattcacttcaaaacaacaacaata |
24540647 |
T |
|
| Q |
116 |
tgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctt |
186 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24540646 |
tgataatcatcacaacacaaatatattcacacataaacgtacggaagcgtgtggagtgatacccttacctt |
24540576 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15277960 - 15277855
Alignment:
| Q |
41 |
aaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaacactatgataatcatcacaacacaaatata |
140 |
Q |
| |
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|
| T |
15277960 |
aaaacaacaccaccaagataattatcataccaccaatatataacacatagcattcatttccaaacaacaatattatgttaattatcaaaacacaaatata |
15277861 |
T |
|
| Q |
141 |
ttcaca |
146 |
Q |
| |
|
| |||| |
|
|
| T |
15277860 |
tacaca |
15277855 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8910183 - 8910139
Alignment:
| Q |
25 |
acataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcaca |
69 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
8910183 |
acatagtattcatgccaaaacaaccccacaaagatacttatcaca |
8910139 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10469 - 10084
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaa |
110 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10469 |
cacaaaaataata-acataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatataacacatagcattcacttcaaaacaacaa |
10371 |
T |
|
| Q |
111 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10370 |
cactatgataatcatcacaacacaaatag--tcacacatacacgtacggacgtgcgtggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcc |
10273 |
T |
|
| Q |
211 |
catgaagcattctttgttccactacgtctataccttcacaaaataattcaccactgattcttaataccaaaactaactaacattttaacaatcaaggctg |
310 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10272 |
catgaaacattctttgttccactacgtctataccttcacaaaataattcaccactaattcttaataccaaaactaactaacattttaacattcaaggc-- |
10175 |
T |
|
| Q |
311 |
aagggtttggctaagggttctaatcaaaatatgaatattttacttagatat-------gactacctctttaaaattaagtccaaaaggtaaa |
395 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10174 |
-agggtttggctaaggaatctaatcaaaatatgaatattttacttagatattcacaacgactacttctgtaaaattaagtccaaaagataaa |
10084 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16421757 - 16421372
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaa |
110 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16421757 |
cacaaaaataata-acataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatataacacatagcattcacttcaaaacaacaa |
16421659 |
T |
|
| Q |
111 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16421658 |
cactatgataatcatcacaacacaaatag--tcacacatacacgtacggacgtgcgtggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcc |
16421561 |
T |
|
| Q |
211 |
catgaagcattctttgttccactacgtctataccttcacaaaataattcaccactgattcttaataccaaaactaactaacattttaacaatcaaggctg |
310 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16421560 |
catgaaacattctttgttccactacgtctataccttcacaaaataattcaccactaattcttaataccaaaactaactaacattttaacattcaaggc-- |
16421463 |
T |
|
| Q |
311 |
aagggtttggctaagggttctaatcaaaatatgaatattttacttagatat-------gactacctctttaaaattaagtccaaaaggtaaa |
395 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16421462 |
-agggtttggctaaggaatctaatcaaaatatgaatattttacttagatattcacaacgactacttctgtaaaattaagtccaaaagataaa |
16421372 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 194
Target Start/End: Original strand, 21268171 - 21268354
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaa |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
21268171 |
cacataaataatacccataatattcatgcaaaaacaacatcaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcactcatttcaaaacaacaa |
21268270 |
T |
|
| Q |
111 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaa |
194 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21268271 |
cactataataatcatcacaacacaaatatatacacacatacacgtacggaagcgcgtgaagtgatgcccttacctttgcaacaa |
21268354 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28393055 - 28392746
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaa |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
28393055 |
cacaaaaagaatacacataatattcataccaaaacaacaacaccaagagaattaccacaccaccaatatataacacataacattcatttcaaaacaacaa |
28392956 |
T |
|
| Q |
111 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcc |
210 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||| |||| || |||||||||| || | |||| | ||| || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
28392955 |
cattataataattatcaaaaaacaaatatatacata----cacacaccgaaacgcgtggagtgatgctcttgccttcacaacagaaacttttaaaattcc |
28392860 |
T |
|
| Q |
211 |
catgaagcattctttgttccactacgtctataccttcacaaaataattcaccactgattcttaataccaaaactaactaacattttaacaatcaaggctg |
310 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| | || ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
28392859 |
catgaagc-ttctttgttccactacgtctctaccttcacaaaataatccaccactaagtcttaatgccaaaactaaccaccactttaacattctaggctg |
28392761 |
T |
|
| Q |
311 |
aagggtttggctaag |
325 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||| |
|
|
| T |
28392760 |
atgggtatggctaag |
28392746 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28384174 - 28383870
Alignment:
| Q |
16 |
aaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaacacta |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
28384174 |
aaataatacacataatgttcatgccaaaacaacaccaccaag-taattaccacaccacgaatatataacacataacattcatttcaaaacaacaacatta |
28384076 |
T |
|
| Q |
116 |
tgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcccatga |
215 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||| |||||| || | ||| || ||| | ||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28384075 |
tgataattatcaaaacacagatatatacata----cacgtaccgaaatgcgtggagtgatactcttaccttcacaatggaaacttttaaaattcccatga |
28383980 |
T |
|
| Q |
216 |
agcattctttgttccactacgtctataccttcacaaaataattcaccactgattcttaataccaaaactaactaacattttaacaatcaaggctgaaggg |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| | || ||||||| || ||||||| || |
|
|
| T |
28383979 |
agcattctttgttccactacgtctctacgttcacaaaataatccaccactaagtcttaatgccaaaactaaccaccactttaacattctaggctgatgga |
28383880 |
T |
|
| Q |
316 |
tttggctaag |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
28383879 |
tttggctaag |
28383870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 194
Target Start/End: Original strand, 48187370 - 48187508
Alignment:
| Q |
56 |
agataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaacactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacat |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
48187370 |
agataattatcacatcaccaatatatagcacatagcattcacttcaaaacaacaacactatgataatcatcacaacacaaatatattcacacatacacgt |
48187469 |
T |
|
| Q |
156 |
aaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaa |
194 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48187470 |
atggaagcgcgtggagtgatgcccttacctttacaacaa |
48187508 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36018017 - 36017792
Alignment:
| Q |
49 |
accaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatag-catttacttcaaaacaacaacactatgataatcatcacaacacaaatatattcacag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
36018017 |
accaccaagataattatcacaacaccaatatataacacataatcattcatttcaaaacaacaccaatatgataattatcacaacacaattatatacacat |
36017918 |
T |
|
| Q |
148 |
atgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcccatgaagcattctttgttccactacgtctataccttc |
247 |
Q |
| |
|
|| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36017917 |
atacacgtacggaagcacgtggagtgatgcccttacctttgcaataacaactcttaaaatttccctgaagagttctcttttccactatgtctataccttc |
36017818 |
T |
|
| Q |
248 |
acaaaataattcaccactgattctta |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36017817 |
gcaaaataattcaccactaattctta |
36017792 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Original strand, 11283346 - 11283522
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataata-cacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatag-catttacttcaaaacaac |
108 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
11283346 |
cacacaaataataacacataatattcataccaaagcaa-accaccaagataattatcacaacaccaatatataacacataatcattcatttctaaacaac |
11283444 |
T |
|
| Q |
109 |
aacactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctt |
186 |
Q |
| |
|
| || ||||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11283445 |
atcattatgataattatcacaacacaattatacacacatatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgcccttacctt |
11283522 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Original strand, 12528680 - 12528861
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataata-cacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatag-catttacttcaaaacaac |
108 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
12528680 |
cacacaaataataacacataatattcatacaaaagcaa-accaccaagataattatcacaacatcattatataacacataatcattcatttcaaaacaac |
12528778 |
T |
|
| Q |
109 |
aacactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaa |
191 |
Q |
| |
|
| || ||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12528779 |
accattatgacaattatcataacacaattatatacacatatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgcccttacctttgcaa |
12528861 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 48186614 - 48186667
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataatta |
64 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
48186614 |
cacaaaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaacaccaagataatta |
48186667 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16484042 - 16483965
Alignment:
| Q |
117 |
gataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaa |
194 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16484042 |
gataattatcacaacacaaatatatacacatatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgcccttaccttcgcaacaa |
16483965 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16484069 - 16484017
Alignment:
| Q |
30 |
atattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatata |
82 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
16484069 |
atattcatgccgaaacaaaaccaccaagataattatcacaacacaaatatata |
16484017 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 28393090 - 28393053
Alignment:
| Q |
16 |
aaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccac |
53 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28393090 |
aaataatacacataatgttcatgccaaaacaccaccac |
28393053 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 5537050 - 5537442
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataata-cacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatag-catttacttcaaaacaac |
108 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
5537050 |
cacacaaataataacacataatattcataccaaagcaa-accaccaagataattatcacaacaccactatataacacataatcattcatttcaaaacaac |
5537148 |
T |
|
| Q |
109 |
aacactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaatt |
208 |
Q |
| |
|
| || ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| || ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5537149 |
accattatgataattatcactacacaattatatacacatatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgctgttacctttgcaacaagaactcttaaaatt |
5537248 |
T |
|
| Q |
209 |
cccatgaagcattctttgttccactacgtctataccttcacaaaataattcaccactgattcttaataccaaaactaactaacattttaacaatcaaggc |
308 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5537249 |
cccaggaatcattctttgttccactacgtctataccttcgcaaaataattcaccactaattcttaataccaaaactaactaacattttaacattcaaggc |
5537348 |
T |
|
| Q |
309 |
tgaagggtttggctaagggttctaatcaaaatatgaatattttacttagatat-------gactacctctttaaaattaagtccaaaaggtaaa |
395 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5537349 |
tgaagggtttggctaagggttctaatcaaaatatgaatattttacttagatattcacaacgactacttctttaaaattaagttcaaaaggtaaa |
5537442 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44668990 - 44668815
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaa |
110 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44668990 |
cacataaataatacacataatattcatgccaaaacaacaacaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacataacattcacttc-aaacaacaa |
44668892 |
T |
|
| Q |
111 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttaccttt |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44668891 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacacatacacgtacggaagcgcgtagagtgatgcccttaccttt |
44668815 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 3897258 - 3897390
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataata-cacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatag-catttacttcaaaacaac |
108 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
3897258 |
cacacaaataataacacatgatattcatgccaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatatgtaacacatagtcattcatttcaaaacaac |
3897357 |
T |
|
| Q |
109 |
aacactatgataatcatcacaacacaaatatat |
141 |
Q |
| |
|
| ||| | ||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3897358 |
accaccaaaataattatcacaacacaattatat |
3897390 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6818647 - 6818486
Alignment:
| Q |
34 |
tcatgccaaaacaacaccaccaag-ataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaa-caacaacactatgataatcatcacaac |
131 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||| || ||| |||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6818647 |
tcatgccaagacaaaaccaccaaatataattatcacaacaacaacatataacagataacattcatttcaaaaacaacaccactatgataattatcacaat |
6818548 |
T |
|
| Q |
132 |
acaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaaca |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6818547 |
acaaatatatacaaatatacacgtacataagcgcgtggagtgatgcccttacctttacaaca |
6818486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18902073 - 18901833
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaa |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18902073 |
cacagaaataatacacataatattcatgcaaaaacaacaacaccaagataactatcacatcaccaatatatagcacatatcattcacttcaaaacaacaa |
18901974 |
T |
|
| Q |
111 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
18901973 |
cactataataatcatcacaacacaaatatattcacaaatacacgtacggaagcgcgtggaatgatacccttacctttgcaacagtaactcttaccgtttc |
18901874 |
T |
|
| Q |
211 |
catgaagcattctttgttccactacgtctataccttcacaa |
251 |
Q |
| |
|
||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18901873 |
catacacccgtctttgttccactacctctataccttcacaa |
18901833 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18153491 - 18153328
Alignment:
| Q |
23 |
acacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatag-catttacttcaaaacaacaacactatgataa |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
18153491 |
acacataatattcataccaaagcaa-accaccaagataattatcacaacaccaatatataacacataatcattcatttcaaaacaacaccattatgataa |
18153393 |
T |
|
| Q |
122 |
tcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctt |
186 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||| ||||| |||| || ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18153392 |
ttatcaccacacaattatatacacatatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgcccttacctt |
18153328 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Original strand, 51783494 - 51783658
Alignment:
| Q |
87 |
atagcatttacttcaaaacaacaacactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctt |
186 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
51783494 |
atagcatttacttcaaaacaacaacactataataatcattataacataaatatattcacacatatacgtacagaagcacgtggagtgatgcctttacctt |
51783593 |
T |
|
| Q |
187 |
tgcaacaagaactcttaaaattcccatgaagcattctttgttccactacgtctataccttcacaa |
251 |
Q |
| |
|
||||| | | |||||| | ||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
51783594 |
tgcaatagtagctcttacagttctcatacaaccgtctttgttccactatctctataccttcacaa |
51783658 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15419023 - 15418853
Alignment:
| Q |
16 |
aaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaacacta |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15419023 |
aaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatataaaacatagcattcacttcaaaacaacaacacta |
15418924 |
T |
|
| Q |
116 |
tgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctt |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15418923 |
tgataatcatcacaacacaaatatattcacacatatacgtacggaagcgtgtggagtgatgcccttacctt |
15418853 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15426045 - 15425870
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaa |
110 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15426045 |
cacataaataatacatataatattcatgccaaaacaacaccaccaagctaattatcacatcaccaatatatagaacatagcattcacttcaaaacaacaa |
15425946 |
T |
|
| Q |
111 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctt |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15425945 |
tactatgataatcatcacaacacaaatatattcacacatatacgtacggaagcgtgtggagtgatgcccttacctt |
15425870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Original strand, 28654414 - 28654579
Alignment:
| Q |
29 |
aatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatag-catttacttcaaaacaacaacactatgataatcatca |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||| |||| |
|
|
| T |
28654414 |
aatattcattccaaagcaa-accaccaagataattatcacaacaccaatatataacacataatcattcatttcaaaacaaccccattatgataattatca |
28654512 |
T |
|
| Q |
128 |
caacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaa |
194 |
Q |
| |
|
||||| || ||||| |||| || ||| || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28654513 |
caacagaattatatacacatatacacgtacggaaacgcgtggagtgatgcccttacctttacaacaa |
28654579 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 52944934 - 52944820
Alignment:
| Q |
23 |
acacataatatt-catgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaacactatgataa |
121 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
52944934 |
acacataatatttcatgctaaaataaaaccaccaaggtaattatcacaacaccaattaataatacatagcattcatttcaaaacaacacca-----ataa |
52944840 |
T |
|
| Q |
122 |
tcatcacaacacaaatatat |
141 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52944839 |
ttatcacaacacaaatatat |
52944820 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19932842 - 19932666
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaa |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19932842 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaccaccaccaagataactatcacatcagcaatatatagcacatagcattcacttcaaaacaacaa |
19932743 |
T |
|
| Q |
111 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttaccttt |
187 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19932742 |
cactataataatcatcacgacacaaatatattcataaatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgcccttaccttt |
19932666 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1311582 - 1311404
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaa |
110 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1311582 |
cacataaataatacacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatataacacatagtattcacttcaaaacaacaa |
1311483 |
T |
|
| Q |
111 |
cactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgc |
189 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
1311482 |
cactataataatcatcacaacacaaatatattcacacatacacgtacggaagcgcgtggagtgatactcttacatttgc |
1311404 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3224846 - 3224669
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataata-cacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaata--tatagcacatagcatttacttcaaaacaa |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
3224846 |
cacataaataataacacataatattcatgtcaaaacaacaacaccaagataattatcacaacaccaatatatatagcacataacattcatttc-aaacaa |
3224748 |
T |
|
| Q |
108 |
caacactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctt |
186 |
Q |
| |
|
|| || |||| |||| |||||||||||||||||| || || || || |||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3224747 |
cagcaatatgctaattatcacaacacaaatatataatcatatacatgtacggaaacgcgtggagtgatgcccttacctt |
3224669 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Original strand, 11034881 - 11035057
Alignment:
| Q |
11 |
cacagaaataata-cacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacat-agcatttacttcaaaacaac |
108 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
11034881 |
cacacaaataataacaaataatattcataccaaagcaa-atcaccaagataattatcacaacaccaatatataacacataatcattcatttcaaaacaac |
11034979 |
T |
|
| Q |
109 |
aacactatgataatcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctt |
186 |
Q |
| |
|
| || ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| || || || |||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11034980 |
atcattatgataattatcacaacacaattatatacacatatacatgtacggaaacgcgtgaagtgatgcccttacctt |
11035057 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0172 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:
Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Original strand, 34620 - 34792
Alignment:
| Q |
23 |
acacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacat-agcatttacttcaaaacaacaacactatgataa |
121 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||| | | || | ||||||| | || ||| | |||| |
|
|
| T |
34620 |
acacatgatattcatgccaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaatagcaccaccaaaataa |
34719 |
T |
|
| Q |
122 |
tcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaa |
194 |
Q |
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|
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| T |
34720 |
ttatcacaacacagttatatatacatatacacgtacggaaacgcgtggagtgatgcccttacctttacaacaa |
34792 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0655 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:
Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7650 - 7541
Alignment:
| Q |
23 |
acacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcatttacttcaaaacaacaacactatgataat |
122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| | | ||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7650 |
acacataatattcatggcaaaacaaaaccaccaagataattattacaacaccaatacataacacataac---catttcaa---aacaacaccatgataat |
7557 |
T |
|
| Q |
123 |
catcacaacacaaata |
138 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
7556 |
tatcacaacacaaata |
7541 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 89
Target Start/End: Original strand, 29963026 - 29963092
Alignment:
| Q |
23 |
acacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacata |
89 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| | |||||| |
|
|
| T |
29963026 |
acacatgatattcatgccaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacata |
29963092 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2039102 - 2038873
Alignment:
| Q |
23 |
acacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacat-agcatttacttcaaaacaacaacactatgataa |
121 |
Q |
| |
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| T |
2039102 |
acacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcataacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcaccaccaaaataa |
2039003 |
T |
|
| Q |
122 |
tcatcacaacacaaatatattcacagatgcacataaggaagcgtatggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcccatgaagcatt |
221 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||| ||| || || || |||||| |||||||||| |||||||||| ||| || || |||||| | | || | |||| | |
|
|
| T |
2039002 |
ttatcacaacacagttatatatacatatacatgtacggaagcacgtggagtgatgtccttacctttacaaaaacaatccttaaactcctcaaggagcagt |
2038903 |
T |
|
| Q |
222 |
ctttgttccactacgtctataccttcacaa |
251 |
Q |
| |
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|||||||||||||| || |||||||||||| |
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| T |
2038902 |
ctttgttccactacatccataccttcacaa |
2038873 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 146
Target Start/End: Original strand, 32870275 - 32870312
Alignment:
| Q |
109 |
aacactatgataatcatcacaacacaaatatattcaca |
146 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
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|
| T |
32870275 |
aacactatgataatcatcacaacataaatatatacaca |
32870312 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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