View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4290-Insertion-24 (Length: 218)

Name: NF4290-Insertion-24
Description: NF4290
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4290-Insertion-24
NF4290-Insertion-24
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (23-218)||(24113167-24113362)
chr8 (23-218)||(18594548-18594743)
chr8 (29-218)||(14422720-14422909)
chr8 (23-218)||(144405-144600)
chr8 (23-218)||(10836756-10836951)
chr8 (23-218)||(35118032-35118227)
chr8 (23-217)||(2042526-2042720)
chr8 (23-218)||(13110415-13110610)
chr8 (23-218)||(39206597-39206792)
chr8 (23-218)||(29938072-29938267)
chr8 (17-218)||(7774769-7774970)
chr8 (23-218)||(33278411-33278606)
chr8 (5-218)||(22260631-22260844)
chr8 (22-218)||(44804945-44805141)
chr8 (23-218)||(6144274-6144469)
chr8 (23-214)||(34679462-34679653)
chr8 (23-218)||(34842366-34842561)
chr8 (23-218)||(39218788-39218983)
chr8 (23-218)||(7791422-7791617)
chr8 (23-218)||(41575524-41575719)
chr8 (30-215)||(38167159-38167344)
chr8 (23-218)||(5320575-5320770)
chr8 (23-218)||(7812006-7812201)
chr8 (29-218)||(4035864-4036053)
chr8 (23-218)||(34998897-34999092)
chr8 (23-218)||(8021730-8021917)
chr8 (23-218)||(42571605-42571797)
chr8 (17-216)||(28639283-28639484)
chr8 (23-165)||(33287079-33287221)
chr8 (23-165)||(40117906-40118048)
chr8 (23-218)||(36491168-36491363)
chr8 (8-218)||(66180-66391)
chr8 (23-149)||(26783803-26783929)
chr8 (91-216)||(9807339-9807464)
chr8 (23-140)||(5005177-5005294)
chr8 (23-163)||(2322068-2322208)
chr8 (23-99)||(9806884-9806960)
chr8 (17-108)||(39220261-39220352)
chr8 (182-216)||(33287040-33287074)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (23-218)||(9008058-9008253)
chr5 (23-218)||(8374340-8374534)
chr5 (23-216)||(1165604-1165797)
chr5 (23-216)||(1579048-1579241)
chr5 (23-216)||(1605574-1605767)
chr5 (17-218)||(16737448-16737649)
chr5 (17-218)||(33991146-33991347)
chr5 (10-218)||(24105672-24105880)
chr5 (10-218)||(31883143-31883351)
chr5 (23-218)||(16069365-16069560)
chr5 (5-218)||(27679170-27679383)
chr5 (23-215)||(27420870-27421062)
chr5 (23-218)||(5202984-5203179)
chr5 (9-218)||(3386487-3386696)
chr5 (23-218)||(33491197-33491392)
chr5 (23-218)||(38598451-38598646)
chr5 (28-218)||(4120954-4121144)
chr5 (23-218)||(3921593-3921788)
chr5 (17-218)||(20992147-20992348)
chr5 (23-218)||(19358538-19358733)
chr5 (23-218)||(35782645-35782840)
chr5 (23-216)||(31410488-31410681)
chr5 (48-218)||(26602943-26603113)
chr5 (68-218)||(27025013-27025163)
chr5 (23-149)||(33284645-33284771)
chr5 (10-146)||(20992354-20992494)
chr5 (22-147)||(31638156-31638281)
chr5 (169-218)||(35420425-35420474)
chr5 (77-146)||(41818536-41818605)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (23-218)||(25999394-25999589)
chr3 (23-218)||(37698130-37698325)
chr3 (28-218)||(8042618-8042808)
chr3 (23-218)||(21581048-21581243)
chr3 (17-218)||(12117645-12117846)
chr3 (23-218)||(15520129-15520324)
chr3 (23-214)||(32244126-32244317)
chr3 (23-218)||(22174977-22175172)
chr3 (23-218)||(42104958-42105153)
chr3 (23-218)||(42307892-42308087)
chr3 (34-218)||(46452149-46452333)
chr3 (23-218)||(20842335-20842530)
chr3 (23-218)||(25494272-25494467)
chr3 (23-218)||(38856099-38856294)
chr3 (23-218)||(50528935-50529130)
chr3 (23-214)||(54870165-54870356)
chr3 (9-218)||(35226439-35226648)
chr3 (23-218)||(44609320-44609515)
chr3 (23-218)||(15520642-15520837)
chr3 (23-218)||(20699155-20699350)
chr3 (23-218)||(32359265-32359460)
chr3 (23-218)||(38933952-38934146)
chr3 (4-214)||(29445475-29445685)
chr3 (9-218)||(53028217-53028418)
chr3 (23-218)||(26122820-26123015)
chr3 (23-218)||(54534315-54534508)
chr3 (29-218)||(34700353-34700542)
chr3 (22-218)||(2895190-2895390)
chr3 (38-218)||(44688782-44688961)
chr3 (23-218)||(24835686-24835881)
chr3 (23-218)||(48924990-48925183)
chr3 (23-165)||(35643223-35643365)
chr3 (40-216)||(12915930-12916105)
chr3 (23-149)||(50529829-50529955)
chr3 (68-218)||(16354397-16354547)
chr3 (133-218)||(24366145-24366230)
chr3 (23-145)||(49128055-49128177)
chr3 (138-218)||(13696914-13696994)
chr3 (23-58)||(24366098-24366133)
chr3 (171-214)||(50528873-50528916)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (23-218)||(31517216-31517411)
chr2 (10-218)||(33906048-33906256)
chr2 (9-218)||(42937714-42937924)
chr2 (23-214)||(28329844-28330033)
chr2 (23-218)||(3873245-3873440)
chr2 (28-218)||(39635466-39635656)
chr2 (29-218)||(5733414-5733603)
chr2 (28-199)||(1108293-1108464)
chr2 (23-218)||(4016048-4016243)
chr2 (23-218)||(6174829-6175024)
chr2 (23-218)||(18806885-18807080)
chr2 (29-218)||(26323187-26323376)
chr2 (23-214)||(19901143-19901333)
chr2 (23-218)||(1482904-1483098)
chr2 (23-218)||(4232143-4232338)
chr2 (23-218)||(30270680-30270875)
chr2 (22-211)||(16066302-16066491)
chr2 (27-216)||(19383938-19384127)
chr2 (6-218)||(16588777-16588989)
chr2 (28-218)||(851011-851201)
chr2 (23-218)||(2178770-2178965)
chr2 (23-217)||(30420181-30420363)
chr2 (11-215)||(429813-430017)
chr2 (23-218)||(44947550-44947738)
chr2 (37-163)||(3585313-3585439)
chr2 (49-146)||(42446642-42446739)
chr2 (50-148)||(22101218-22101316)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (8-218)||(44379176-44379386)
chr4 (9-218)||(28032701-28032910)
chr4 (23-218)||(15241017-15241212)
chr4 (23-218)||(19913619-19913814)
chr4 (23-218)||(20877056-20877251)
chr4 (23-218)||(38055166-38055361)
chr4 (23-217)||(23776449-23776643)
chr4 (23-218)||(54189554-54189749)
chr4 (17-218)||(31969684-31969885)
chr4 (23-218)||(1756753-1756948)
chr4 (23-218)||(16700790-16700985)
chr4 (23-214)||(45424527-45424718)
chr4 (29-218)||(6611349-6611538)
chr4 (23-216)||(30423556-30423748)
chr4 (22-205)||(38071325-38071505)
chr4 (23-218)||(6688616-6688805)
chr4 (23-218)||(53717453-53717648)
chr4 (23-218)||(53875666-53875861)
chr4 (23-218)||(54412637-54412832)
chr4 (17-218)||(33703844-33704045)
chr4 (17-218)||(37464724-37464925)
chr4 (17-218)||(40428709-40428910)
chr4 (23-216)||(52139212-52139405)
chr4 (34-218)||(27488637-27488821)
chr4 (8-216)||(43289951-43290159)
chr4 (9-217)||(48909841-48910049)
chr4 (23-218)||(1617093-1617288)
chr4 (23-218)||(2481397-2481592)
chr4 (23-214)||(14987801-14987992)
chr4 (23-210)||(50055098-50055285)
chr4 (28-218)||(8591081-8591271)
chr4 (29-218)||(37968746-37968935)
chr4 (23-218)||(19164962-19165156)
chr4 (23-218)||(44784906-44785101)
chr4 (23-218)||(50353810-50354005)
chr4 (10-216)||(23704200-23704406)
chr4 (23-218)||(27536093-27536284)
chr4 (29-218)||(11639567-11639756)
chr4 (23-218)||(8932167-8932362)
chr4 (23-218)||(15669192-15669387)
chr4 (11-185)||(28360427-28360602)
chr4 (23-218)||(35490762-35490957)
chr4 (23-218)||(40680027-40680222)
chr4 (23-210)||(44375854-44376041)
chr4 (23-218)||(47632043-47632239)
chr4 (23-218)||(30171589-30171784)
chr4 (8-218)||(55344814-55345024)
chr4 (23-218)||(27583621-27583816)
chr4 (40-218)||(53353085-53353267)
chr4 (36-216)||(16703843-16704023)
chr4 (91-218)||(23269035-23269162)
chr4 (23-163)||(50053452-50053592)
chr4 (133-218)||(53408138-53408224)
chr4 (23-99)||(23265865-23265941)
chr4 (28-163)||(44548185-44548320)
chr4 (156-218)||(23261875-23261937)
chr4 (169-218)||(9595891-9595940)
chr4 (170-218)||(50055301-50055349)
chr4 (87-162)||(51780763-51780838)
chr4 (153-218)||(48748197-48748262)
chr4 (23-188)||(17493342-17493507)
chr4 (185-218)||(55344682-55344715)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (23-218)||(43067964-43068159)
chr7 (10-218)||(933282-933490)
chr7 (23-217)||(3511333-3511527)
chr7 (1-218)||(33846520-33846732)
chr7 (23-218)||(12101169-12101364)
chr7 (3-218)||(24792323-24792538)
chr7 (23-218)||(33359081-33359276)
chr7 (17-218)||(22649685-22649886)
chr7 (23-218)||(20346498-20346693)
chr7 (23-218)||(30181015-30181210)
chr7 (23-218)||(42964987-42965182)
chr7 (26-218)||(38866557-38866749)
chr7 (23-218)||(1803036-1803231)
chr7 (23-218)||(5280870-5281065)
chr7 (23-218)||(32041552-32041747)
chr7 (17-218)||(6394755-6394956)
chr7 (34-218)||(12097581-12097765)
chr7 (23-218)||(42204164-42204360)
chr7 (23-214)||(7164194-7164385)
chr7 (23-218)||(36890821-36891015)
chr7 (23-218)||(46891330-46891526)
chr7 (23-218)||(4477312-4477507)
chr7 (23-218)||(9452600-9452795)
chr7 (23-218)||(15655922-15656117)
chr7 (23-217)||(43156723-43156917)
chr7 (23-218)||(42673475-42673666)
chr7 (48-217)||(48865665-48865837)
chr7 (29-218)||(8630682-8630871)
chr7 (50-218)||(25748524-25748692)
chr7 (23-202)||(4347283-4347462)
chr7 (23-218)||(46134295-46134490)
chr7 (48-214)||(16894502-16894668)
chr7 (28-218)||(17753615-17753805)
chr7 (17-158)||(19828274-19828415)
chr7 (23-218)||(43021571-43021762)
chr7 (24-108)||(37704991-37705075)
chr7 (10-163)||(37005857-37006010)
chr7 (17-109)||(43405024-43405116)
chr7 (29-107)||(27691428-27691506)
chr7 (23-147)||(36849599-36849723)
chr7 (23-147)||(20163829-20163953)
chr7 (39-147)||(15655474-15655582)
chr7 (23-163)||(30075277-30075414)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (23-218)||(3347524-3347719)
chr6 (23-218)||(26946877-26947072)
chr6 (6-218)||(6086600-6086812)
chr6 (23-218)||(30691862-30692057)
chr6 (23-218)||(2837556-2837751)
chr6 (23-218)||(18613549-18613744)
chr6 (29-218)||(21893472-21893661)
chr6 (29-218)||(26704340-26704529)
chr6 (23-218)||(9459574-9459769)
chr6 (23-205)||(3955780-3955962)
chr6 (18-218)||(1153599-1153799)
chr6 (23-218)||(11167251-11167446)
chr6 (23-218)||(17261074-17261269)
chr6 (23-218)||(34887293-34887488)
chr6 (23-218)||(20726802-20726993)
chr6 (23-218)||(28199509-28199705)
chr6 (23-212)||(16307015-16307204)
chr6 (23-214)||(30698934-30699125)
chr6 (17-218)||(35198289-35198489)
chr6 (23-165)||(52847-52989)
chr6 (85-218)||(33464402-33464535)
chr6 (105-218)||(53001-53114)
chr6 (23-90)||(33463712-33463779)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (23-218)||(16052105-16052300)
chr1 (23-216)||(1170447-1170640)
chr1 (10-218)||(38829065-38829273)
chr1 (23-218)||(20089480-20089675)
chr1 (23-218)||(25897383-25897578)
chr1 (23-218)||(29288158-29288351)
chr1 (23-218)||(29078525-29078720)
chr1 (23-218)||(42370796-42370991)
chr1 (23-218)||(46760975-46761170)
chr1 (23-218)||(52753148-52753343)
chr1 (23-218)||(8120878-8121073)
chr1 (23-218)||(26663267-26663462)
chr1 (23-218)||(33510493-33510688)
chr1 (23-218)||(39260347-39260542)
chr1 (23-218)||(41928496-41928691)
chr1 (29-218)||(2347671-2347861)
chr1 (23-218)||(1168512-1168707)
chr1 (23-218)||(1940748-1940943)
chr1 (15-218)||(23498461-23498664)
chr1 (23-218)||(26580271-26580466)
chr1 (23-218)||(970525-970722)
chr1 (29-218)||(19715162-19715351)
chr1 (23-218)||(5215394-5215589)
chr1 (23-218)||(12682829-12683024)
chr1 (23-218)||(32671588-32671783)
chr1 (23-218)||(40092500-40092695)
chr1 (23-218)||(52696800-52696995)
chr1 (17-218)||(15203115-15203316)
chr1 (34-218)||(17591709-17591892)
chr1 (10-218)||(43905650-43905858)
chr1 (10-218)||(46409431-46409641)
chr1 (48-218)||(40149497-40149667)
chr1 (23-218)||(8079710-8079905)
chr1 (23-218)||(7145216-7145411)
chr1 (29-216)||(2473737-2473924)
chr1 (23-214)||(6765468-6765659)
chr1 (23-218)||(51359218-51359412)
chr1 (23-216)||(15717794-15717986)
chr1 (10-218)||(13996724-13996932)
chr1 (30-214)||(17587510-17587694)
chr1 (34-218)||(15554153-15554329)
chr1 (29-218)||(49146187-49146376)
chr1 (23-165)||(29695684-29695827)
chr1 (10-218)||(38171828-38172023)
chr1 (9-143)||(52086262-52086396)
chr1 (28-189)||(23322870-23323031)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (23-218)||(145246-145441)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (23-218)||(36714-36909)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (23-214)||(22956-23147)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (23-218)||(10247-10442)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (34-218)||(7-191)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (23-218)||(296-491)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (29-218)||(3725-3914)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (23-218)||(7-203)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24113362 - 24113167
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  24113362 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcatagtttcataag 24113263  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24113262 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 24113167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 18594548 - 18594743
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  18594548 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 18594647  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18594648 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 18594743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 14422720 - 14422909
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  14422720 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 14422819  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14422820 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 14422909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 144405 - 144600
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  144405 attgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagtttcataag 144504  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  144505 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 144600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10836951 - 10836756
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10836951 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataaa 10836852  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  10836851 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattatctct 10836756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35118227 - 35118032
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  35118227 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 35118128  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35118127 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctct 35118032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2042720 - 2042526
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  2042720 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 2042621  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2042620 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 2042526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 13110415 - 13110610
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  13110415 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttaataag 13110514  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13110515 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgattctctct 13110610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 39206597 - 39206792
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  39206597 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 39206696  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39206697 ctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 39206792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 29938072 - 29938267
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||     
T  29938072 attggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataag 29938171  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29938172 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 29938267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 7774769 - 7774970
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7774769 gtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagttt 7774868  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7774869 cataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 7774968  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  7774969 ct 7774970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 33278411 - 33278606
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33278411 attggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 33278510  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33278511 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 33278606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22260844 - 22260631
Alignment:
Q  5 catataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagt 104  Q
    ||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||     
T  22260844 catataggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagc 22260745  T
Q  105 ttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctt 204  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22260744 ttatcctagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 22260645  T
Q  205 cttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||    
T  22260644 cttcgattctctct 22260631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44805141 - 44804945
Alignment:
Q  22 aattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44805141 aattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 44805042  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44805041 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 44804945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6144469 - 6144274
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  6144469 attgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 6144370  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6144369 ctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 6144274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34679653 - 34679462
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34679653 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 34679554  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34679553 ctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 34679462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34842561 - 34842366
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34842561 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 34842462  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34842461 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctccttcgattctctct 34842366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 39218788 - 39218983
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  39218788 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcatagcttcataag 39218887  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39218888 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 39218983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 7791422 - 7791617
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  7791422 attggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataag 7791521  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7791522 ctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 7791617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 41575524 - 41575719
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||     
T  41575524 attggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagtttcataag 41575623  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41575624 ctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctct 41575719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38167344 - 38167159
Alignment:
Q  30 tattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctta 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38167344 tattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatcatagtttcataagctgctta 38167245  T
Q  130 tgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctc 215  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38167244 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctc 38167159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 5320575 - 5320770
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  5320575 attggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatcatagtttcataag 5320674  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5320675 ttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 5320770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 7812006 - 7812201
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  7812006 attggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataag 7812105  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7812106 ctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctct 7812201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 4035864 - 4036053
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||   || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  4035864 ttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 4035963  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4035964 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 4036053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34999092 - 34998897
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||     
T  34999092 attggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttagtttcataag 34998993  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  34998992 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctccttcgattctctct 34998897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 8021730 - 8021917
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  8021730 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 8021829  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  8021830 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttt--------catccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacctacttcgattctctct 8021917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 42571605 - 42571797
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  42571605 attggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtttcataag 42571703  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  42571704 ctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctctttcgattctctct 42571797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 28639283 - 28639484
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccata----atcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcata 112  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639283 gtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatcata 28639382  T
Q  113 gttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgatt 212  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  28639383 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaacctccttcgatt 28639480  T
Q  213 ctct 216  Q
    ||||    
T  28639481 ctct 28639484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33287221 - 33287079
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33287221 attgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 33287122  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttacc 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33287121 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacc 33287079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 40118048 - 40117906
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  40118048 attggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 40117949  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttacc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40117948 ctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttacc 40117906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 36491168 - 36491363
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  36491168 attggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataac 36491267  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36491268 ttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctct 36491363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 66391 - 66180
Alignment:
Q  8 ataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagttta 107  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||||| | |||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  66391 ataggatccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataactta 66292  T
Q  108 tcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagctta-ccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttct 206  Q
    | ||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||    
T  66291 taatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctcct 66192  T
Q  207 tcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||    
T  66191 tcgattctctct 66180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26783929 - 26783803
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||     
T  26783929 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttcataag 26783830  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcct 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26783829 ctgcttatgccatattttaataagcct 26783803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 216
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807464
Alignment:
Q  91 taaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatga 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  191 atttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  9807439 atttatgaaacctccttcgtttctct 9807464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Original strand, 5005177 - 5005294
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||  || | | |||||    
T  5005177 attggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctactctcataaa 5005276  T
Q  123 ctgcttatgtcatatttt 140  Q
    |||||||||  |||||||    
T  5005277 ctgcttatgctatatttt 5005294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2322208 - 2322068
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||  |||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||| | ||| ||||     
T  2322208 attggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatcacaatttcataag 2322109  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagctta 163  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  2322108 ctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 99
Target Start/End: Original strand, 9806884 - 9806960
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaa 99  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9806884 attgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 39220261 - 39220352
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttat 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  39220261 gtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttat 39220352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33287074 - 33287040
Alignment:
Q  182 agcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33287074 agcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33287040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9008253 - 9008058
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  9008253 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 9008154  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008153 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 9008058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8374534 - 8374340
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  8374534 attgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 8374435  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8374434 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctccttcgattctctct 8374340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1165797 - 1165604
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  1165797 attgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 1165698  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1165697 ttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1165604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 1579048 - 1579241
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1579048 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 1579147  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1579148 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1605767 - 1605574
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1605767 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 1605668  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1605667 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1605574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16737649 - 16737448
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16737649 gtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 16737550  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16737549 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 16737450  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  16737449 ct 16737448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 33991146 - 33991347
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33991146 gtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 33991245  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33991246 cataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 33991345  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  33991346 ct 33991347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24105880 - 24105672
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24105880 aggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 24105781  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 209  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24105780 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 24105681  T
Q  210 attctctct 218  Q
    |||||||||    
T  24105680 attctctct 24105672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 31883143 - 31883351
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31883143 aggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 31883242  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 209  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31883243 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 31883342  T
Q  210 attctctct 218  Q
    |||||||||    
T  31883343 attctctct 31883351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 16069365 - 16069560
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  16069365 attgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 16069464  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16069465 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 16069560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27679383 - 27679170
Alignment:
Q  5 catataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagt 104  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  27679383 catataggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 27679284  T
Q  105 ttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctt 204  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  27679283 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctc 27679184  T
Q  205 cttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||    
T  27679183 cttcgattctctct 27679170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 215
Target Start/End: Original strand, 27420870 - 27421062
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27420870 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 27420969  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctc 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27420970 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctc 27421062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 5202984 - 5203179
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5202984 attgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 5203083  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5203084 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcaccttcttcgattctctct 5203179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3386696 - 3386487
Alignment:
Q  9 taggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttat 108  Q
    |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3386696 tagggtctgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 3386597  T
Q  109 catagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttc 208  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3386596 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctccttc 3386497  T
Q  209 gattctctct 218  Q
    |||| |||||    
T  3386496 gattatctct 3386487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33491392 - 33491197
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  33491392 attggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 33491293  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33491292 ctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 33491197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38598646 - 38598451
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||     
T  38598646 attggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataag 38598547  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598546 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 38598451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 4120954 - 4121144
Alignment:
Q  28 cttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgct 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  4120954 cttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcatagtttcataagctgct 4121053  T
Q  128 tatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4121054 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgattctctct 4121144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 3921593 - 3921788
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  3921593 attgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 3921692  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3921693 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 3921788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20992348 - 20992147
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20992348 gtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcatagttt 20992249  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20992248 cataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 20992149  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  20992148 ct 20992147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 19358538 - 19358733
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  19358538 attgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 19358637  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19358638 ctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctctct 19358733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35782840 - 35782645
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  35782840 attgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 35782741  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcg-gcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| | || |||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35782740 ctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctt-acaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctct 35782645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 31410488 - 31410681
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  31410488 attgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagttttataag 31410587  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31410588 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 31410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26603113 - 26602943
Alignment:
Q  48 gcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagc 147  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26603113 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagc 26603014  T
Q  148 ctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     | | ||||||| ||||  |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26603013 ataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctct 26602943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Original strand, 27025013 - 27025163
Alignment:
Q  68 ctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccat 167  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27025013 ctttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattttcagcttaccct 27025112  T
Q  168 tcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27025113 ccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctccttcgattctctct 27025163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33284771 - 33284645
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33284771 attgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagttttataaa 33284672  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcct 149  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  33284671 ctgcttataccatatttcaataagcct 33284645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20992494 - 20992354
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgt----gggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtt 105  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  20992494 aggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagca 20992395  T
Q  106 tatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataag 146  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20992394 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Original strand, 31638156 - 31638281
Alignment:
Q  22 aattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||  ||||| ||||| |||| |||||| | |||||  |||||||||  |||||| | ||||||||    
T  31638156 aattgacttattttatgtttatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataa 31638255  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagc 147  Q
     || ||||||||||||||||||||||    
T  31638256 gcttcttatgtcatattttaataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35420474 - 35420425
Alignment:
Q  169 cggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35420474 cggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 35420425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818536
Alignment:
Q  77 ggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataag 146  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttatattgtattttaataag 41818536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 25999394 - 25999589
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  25999394 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 25999493  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999494 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 25999589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37698325 - 37698130
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  37698325 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 37698226  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37698225 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 37698130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 8042618 - 8042808
Alignment:
Q  28 cttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgct 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8042618 cttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgct 8042717  T
Q  128 tatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8042718 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 8042808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 21581048 - 21581243
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  21581048 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataag 21581147  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21581148 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctctct 21581243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12117846 - 12117645
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117846 gtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagttt 12117747  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12117746 cataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctct 12117647  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  12117646 ct 12117645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15520324 - 15520129
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  15520324 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatcgtttcataaa 15520225  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15520224 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctct 15520129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 32244126 - 32244317
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32244126 attggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 32244225  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32244226 ctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 32244317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22175172 - 22174977
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  22175172 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 22175073  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22175072 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 22174977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42105153 - 42104958
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  42105153 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcataag 42105054  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42105053 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattccctct 42104958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42308087 - 42307892
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  42308087 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 42307988  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42307987 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctct 42307892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46452333 - 46452149
Alignment:
Q  34 ttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtc 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  46452333 ttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgcttatgcc 46452234  T
Q  134 atattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46452233 atattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 46452149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20842530 - 20842335
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||     
T  20842530 attggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 20842431  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20842430 ctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 20842335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25494467 - 25494272
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  25494467 attgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 25494368  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25494367 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctct 25494272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 38856099 - 38856294
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  38856099 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 38856198  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  38856199 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattatctct 38856294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 50528935 - 50529130
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  50528935 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 50529034  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50529035 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 50529130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 54870356 - 54870165
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  54870356 attggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatcgtttcataag 54870257  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54870256 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 54870165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 35226439 - 35226648
Alignment:
Q  9 taggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttat 108  Q
    ||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||    
T  35226439 taggccctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttat 35226538  T
Q  109 catagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttc 208  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35226539 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 35226638  T
Q  209 gattctctct 218  Q
    ||||||||||    
T  35226639 gattctctct 35226648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44609515 - 44609320
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  44609515 attggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 44609416  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44609415 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctctttcgattctctct 44609320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 15520642 - 15520837
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  15520642 attggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataag 15520741  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15520742 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctccttcgattctctct 15520837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 20699155 - 20699350
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  20699155 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataag 20699254  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20699255 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctccttcgattctctct 20699350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 32359265 - 32359460
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32359265 attggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 32359364  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32359365 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 32359460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 38933952 - 38934146
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  38933952 attggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 38934050  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38934051 ctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 38934146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 29445475 - 29445685
Alignment:
Q  4 acatataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatag 103  Q
    |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29445475 acatataggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatag 29445574  T
Q  104 tttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacct 203  Q
     |||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29445575 cttatcatagtttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 29445674  T
Q  204 tcttcgattct 214  Q
     |||| |||||    
T  29445675 ccttccattct 29445685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 53028217 - 53028418
Alignment:
Q  9 taggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttat 108  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||        |||||||||||||||| ||||    
T  53028217 taggccctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttat 53028308  T
Q  109 catagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttc 208  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53028309 catattttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 53028408  T
Q  209 gattctctct 218  Q
    ||||||||||    
T  53028409 gattctctct 53028418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 26122820 - 26123015
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  26122820 attggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 26122919  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26122920 ctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaacattcttcgattctctct 26123015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 54534508 - 54534315
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||     
T  54534508 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat-ggtttataag 54534410  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  54534409 ctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 54534315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 34700353 - 34700542
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  34700353 ttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 34700452  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  34700453 atgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcctttgattatctct 34700542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 218
Target Start/End: Original strand, 2895190 - 2895390
Alignment:
Q  22 aattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  2895190 aattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcatagtttcataa 2895289  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagct----tatgaatttatgtaaccttcttcgattctctc 217  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2895290 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctccttcgattctctc 2895389  T
Q  218 t 218  Q
    |    
T  2895390 t 2895390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Original strand, 44688782 - 44688961
Alignment:
Q  38 gcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatat 137  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  44688782 gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catat 44688880  T
Q  138 tttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44688881 tttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctct 44688961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24835881 - 24835686
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||     
T  24835881 attgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattatagtttcataag 24835782  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24835781 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactccttcgattatctct 24835686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48925183 - 48924990
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  48925183 attggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 48925086  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48925085 ctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 48924990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Original strand, 35643223 - 35643365
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  35643223 attgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 35643322  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttacc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  35643323 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttacc 35643365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Original strand, 12915930 - 12916105
Alignment:
Q  40 ttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattt 139  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12915930 ttatgtgggcttatttact-ccataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatattt 12916028  T
Q  140 taataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     ||||||| | | ||||||||||||| | ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12916029 aaataagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaacccccttcgattctct 12916105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 50529955 - 50529829
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  50529955 attgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 50529856  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcct 149  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  50529855 ctgcttatgccatattttaatgagcct 50529829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Original strand, 16354397 - 16354547
Alignment:
Q  68 ctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccat 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  16354397 ctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcctaaattttcagcttatcct 16354496  T
Q  168 tcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     | |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16354497 cctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctgcgattatctct 16354547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 218
Target Start/End: Original strand, 24366145 - 24366230
Alignment:
Q  133 catattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24366145 catattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttagattctctct 24366230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 145
Target Start/End: Original strand, 49128055 - 49128177
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| || ||| ||||     
T  49128055 attgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatcgtaatttcataag 49128154  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataa 145  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  49128155 ctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 218
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696994
Alignment:
Q  138 tttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctctct 13696994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 58
Target Start/End: Original strand, 24366098 - 24366133
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctact 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24366098 attgacttattttgagcttatgtgggtttatctact 24366133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528873
Alignment:
Q  171 gcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattct 50528873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31517411 - 31517216
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31517411 attggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaa 31517312  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31517311 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 31517216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33906256 - 33906048
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33906256 aggccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33906157  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 209  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33906156 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 33906057  T
Q  210 attctctct 218  Q
    ||| |||||    
T  33906056 attatctct 33906048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 42937714 - 42937924
Alignment:
Q  9 taggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttat 108  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42937714 taggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 42937813  T
Q  109 catagttttataaactgcttatgtcatattttaat-aagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 207  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42937814 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42937913  T
Q  208 cgattctctct 218  Q
    |||||||||||    
T  42937914 cgattctctct 42937924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28330033 - 28329844
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28330033 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaa 28329934  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28329933 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct--agcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattct 28329844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3873440 - 3873245
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||     
T  3873440 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttcataag 3873341  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  3873340 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctcattcgattctctct 3873245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 39635466 - 39635656
Alignment:
Q  28 cttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgct 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  39635466 cttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtttcataagctgct 39635565  T
Q  128 tatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39635566 tatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctccttcgattctctct 39635656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 5733414 - 5733603
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||    
T  5733414 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgctt 5733513  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5733514 atgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctct 5733603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Original strand, 1108293 - 1108464
Alignment:
Q  28 cttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgct 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  1108293 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgct 1108392  T
Q  128 tatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgta 199  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1108393 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 4016048 - 4016243
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||||     
T  4016048 attggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatagtttcataag 4016147  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4016148 ctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 4016243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6175024 - 6174829
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  6175024 attggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataag 6174925  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  6174924 ctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctccttcgattctctct 6174829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18807080 - 18806885
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  18807080 attggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 18806981  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18806980 ctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 18806885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26323376 - 26323187
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  26323376 ttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 26323277  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26323276 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctct 26323187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19901333 - 19901143
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19901333 attggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaatagcttatcatagtttcataaa 19901235  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19901234 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 19901143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1483098 - 1482904
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||     
T  1483098 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctact-ccataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgtttcataag 1483000  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1482999 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattctctct 1482904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4232338 - 4232143
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  4232338 attggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 4232239  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4232238 ctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcattcgattatctct 4232143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30270875 - 30270680
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||| ||||||| || | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||     
T  30270875 attggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatcatagtttcataag 30270776  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  30270775 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattatctct 30270680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16066491 - 16066302
Alignment:
Q  22 aattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16066491 aattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 16066392  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgat 211  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16066391 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgat 16066302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19384127 - 19383938
Alignment:
Q  27 acttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgc 126  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||| |  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||     
T  19384127 acttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgt 19384028  T
Q  127 ttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19384027 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 19383938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16588989 - 16588777
Alignment:
Q  6 atataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtt 105  Q
    |||||||||| ||||  |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |    
T  16588989 atataggctccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagct 16588890  T
Q  106 tatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttc 205  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16588889 tattatagtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctcc 16588790  T
Q  206 ttcgattctctct 218  Q
     |||||| |||||    
T  16588789 gtcgattatctct 16588777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 851011 - 851201
Alignment:
Q  28 cttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgct 127  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||    
T  851011 cttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataattttataagctgct 851110  T
Q  128 tatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  851111 tatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 851201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2178965 - 2178770
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  2178965 attgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 2178866  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2178865 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 2178770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30420363 - 30420181
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||     
T  30420363 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataggttcataag 30420264  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctc 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||            ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30420263 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcag------------cttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattctctc 30420181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 429813 - 430017
Alignment:
Q  11 ggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatca 110  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||||||  ||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  429813 ggctccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 429912  T
Q  111 tagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 210  Q
    || ||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  429913 taatttcataagttgcttatgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcga 430012  T
Q  211 ttctc 215  Q
    |||||    
T  430013 ttctc 430017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44947738 - 44947550
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | ||||||| | |||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  44947738 attggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 44947639  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| |||||||        || ||||||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44947638 ctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 44947550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 163
Target Start/End: Original strand, 3585313 - 3585439
Alignment:
Q  37 agcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcata 136  Q
    |||||||||||  ||||| |||  ||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||| | ||| |||| ||||||||| ||||    
T  3585313 agcttatgtggatttatccactaacataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaatttcataagctgcttatgccata 3585412  T
Q  137 ttttaataagcctgaattttcagctta 163  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  3585413 ttttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 42446739 - 42446642
Alignment:
Q  49 cttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataag 146  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||||| | ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42446739 cttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgccatattttaataag 42446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22101316 - 22101218
Alignment:
Q  50 ttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcc 148  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||   ||||| |||||||| |  |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22101316 ttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgtcatattttaataagcc 22101218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44379386 - 44379176
Alignment:
Q  8 ataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagttta 107  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44379386 ataggccctgtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 44379287  T
Q  108 tcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 207  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  44379286 tcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 44379187  T
Q  208 cgattctctct 218  Q
    |||||||||||    
T  44379186 cgattctctct 44379176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28032910 - 28032701
Alignment:
Q  9 taggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttat 108  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28032910 taggccctgtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 28032811  T
Q  109 catagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttc 208  Q
    |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28032810 catagtatcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttc 28032711  T
Q  209 gattctctct 218  Q
    |||| |||||    
T  28032710 gattatctct 28032701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15241212 - 15241017
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  15241212 attggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttcataag 15241113  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15241112 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 15241017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19913814 - 19913619
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||     
T  19913814 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatcatagtttcataag 19913715  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19913714 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 19913619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 20877056 - 20877251
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20877056 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 20877155  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  20877156 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctccttagattctctct 20877251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 38055166 - 38055361
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  38055166 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataag 38055265  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38055266 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcgattctctct 38055361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23776643 - 23776449
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  23776643 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 23776544  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctc 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776543 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctc 23776449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 54189554 - 54189749
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  54189554 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 54189653  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54189654 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 54189749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 31969684 - 31969885
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969684 gtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 31969783  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31969784 cataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 31969883  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  31969884 ct 31969885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1756948 - 1756753
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  1756948 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataag 1756849  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1756848 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattctctct 1756753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 16700790 - 16700985
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  16700790 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 16700889  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16700890 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattctctct 16700985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45424718 - 45424527
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  45424718 attgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 45424619  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45424618 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 45424527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6611538 - 6611349
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||    
T  6611538 ttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgttt 6611439  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6611438 atgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 6611349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30423748 - 30423556
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  30423748 attggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 30423649  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30423648 ctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctccttcgattctct 30423556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38071505 - 38071325
Alignment:
Q  22 aattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38071505 aattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 38071406  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttc 205  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071405 gctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttc 38071325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6688805 - 6688616
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  6688805 attgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt------ 6688712  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6688711 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 6688616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 53717648 - 53717453
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  53717648 attggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 53717549  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53717548 ctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 53717453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 53875666 - 53875861
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  53875666 attggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttttataag 53875765  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53875766 ctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctct 53875861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 54412637 - 54412832
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  54412637 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 54412736  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54412737 ctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 54412832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 33703844 - 33704045
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  33703844 gttttaattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagttt 33703943  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33703944 cataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 33704043  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  33704044 ct 33704045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 37464724 - 37464925
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37464724 gtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagttt 37464823  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37464824 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 37464923  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  37464924 ct 37464925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40428910 - 40428709
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40428910 gtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 40428811  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40428810 cataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 40428711  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  40428710 ct 40428709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 52139212 - 52139405
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  52139212 attggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 52139311  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52139312 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 52139405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27488821 - 27488637
Alignment:
Q  34 ttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtc 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  27488821 ttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgcc 27488722  T
Q  134 atattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27488721 atattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 27488637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43290159 - 43289951
Alignment:
Q  8 ataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagttta 107  Q
    |||||||| ||||  |||| |||||||||||||| | || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  43290159 ataggctccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctta 43290060  T
Q  108 tcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 207  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43290059 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 43289960  T
Q  208 cgattctct 216  Q
    |||||||||    
T  43289959 cgattctct 43289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Original strand, 48909841 - 48910049
Alignment:
Q  9 taggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttat 108  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  48909841 taggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttat 48909940  T
Q  109 catagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttc 208  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  48909941 catagtttcataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttc 48910040  T
Q  209 gattctctc 217  Q
    |||||||||    
T  48910041 gattctctc 48910049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 1617093 - 1617288
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  1617093 attggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataag 1617192  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1617193 ctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 1617288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2481592 - 2481397
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  2481592 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataag 2481493  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2481492 ctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 2481397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 14987801 - 14987992
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  14987801 attggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 14987900  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14987901 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 14987992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50055285 - 50055098
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||     
T  50055285 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatggtttcataag 50055186  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50055185 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcga 50055098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8591271 - 8591081
Alignment:
Q  28 cttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgct 127  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  8591271 cttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgct 8591172  T
Q  128 tatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8591171 tatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcggttctctct 8591081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37968935 - 37968746
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  37968935 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 37968836  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37968835 atgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 37968746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19165156 - 19164962
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataa-tcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19165156 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataa 19165057  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19165056 gctgcttatgccata-tttaataagcctaaattttcagcttacc-ctcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgtttttctct 19164962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44785101 - 44784906
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  44785101 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagtttcataag 44785002  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44785001 ttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 44784906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 50353810 - 50354005
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||     
T  50353810 attggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatgatagtttcataag 50353909  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50353910 ctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctct 50354005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23704406 - 23704200
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23704406 aggccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 23704307  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 209  Q
    ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  23704306 atagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatttg 23704207  T
Q  210 attctct 216  Q
    |||||||    
T  23704206 attctct 23704200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27536284 - 27536093
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||    || |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27536284 attggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataaa 27536189  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27536188 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 27536093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11639756 - 11639567
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  11639756 ttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 11639657  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11639656 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgattctctct 11639567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8932362 - 8932167
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||     
T  8932362 attggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaacgtagtttcataag 8932263  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8932262 ctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 8932167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 15669192 - 15669387
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  15669192 attggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 15669291  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15669292 ctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctccttccattctctct 15669387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 28360427 - 28360602
Alignment:
Q  11 ggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatca 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28360427 ggctctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 28360526  T
Q  111 tagttttataaactgcttatgtca-tattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagct 185  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  28360527 tagttttataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35490957 - 35490762
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  35490957 attggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 35490858  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35490857 ttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccaccttcgattctctct 35490762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40680222 - 40680027
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  40680222 attgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 40680123  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40680122 ctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcattcgattctctct 40680027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 44375854 - 44376041
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | |||  | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44375854 attggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataaa 44375953  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44375954 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctccttcga 44376041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 47632043 - 47632239
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaa-ggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  47632043 attggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctcatagtttcataa 47632142  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47632143 gctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaattctctct 47632239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 30171589 - 30171784
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||     
T  30171589 attggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagtttcataag 30171688  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30171689 ctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctccttcgattctctct 30171784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55345024 - 55344814
Alignment:
Q  8 ataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagttta 107  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  55345024 ataggccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagctta 55344925  T
Q  108 tcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 207  Q
    ||||| ||  || |  || ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55344924 tcatatttgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 55344825  T
Q  208 cgattctctct 218  Q
     ||||||||||    
T  55344824 tgattctctct 55344814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27583816 - 27583621
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||     
T  27583816 attgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgcataag 27583717  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  27583716 ctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctct 27583621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 218
Target Start/End: Original strand, 53353085 - 53353267
Alignment:
Q  40 ttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattt 139  Q
    |||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  53353085 ttatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattt 53353184  T
Q  140 ta----ataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53353185 taatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaacctccttcgattctctct 53353267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Original strand, 16703843 - 16704023
Alignment:
Q  36 gagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcat 135  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  16703843 gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccat 16703942  T
Q  136 attttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  16703943 attttaataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaacccccttcgattctct 16704023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269035
Alignment:
Q  91 taaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatga 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  191 atttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  23269062 atttatgtaatctccttcgattctctct 23269035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 50053452 - 50053592
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  50053452 attggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 50053551  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagctta 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  50053552 ctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 218
Target Start/End: Original strand, 53408138 - 53408224
Alignment:
Q  133 catattttaataagcctgaattttcagcttaccattc-ggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53408138 catattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 53408224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23265941 - 23265865
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23265941 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44548320 - 44548185
Alignment:
Q  28 cttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgct 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |  |||||| | ||||||||  || |    
T  44548320 cttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttatcacaattttataagttgtt 44548221  T
Q  128 tatgtcatattttaataagcctgaattttcagctta 163  Q
    |||| | ||||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  44548220 tatgccctattttattaagcccaaattttaagctta 44548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261875
Alignment:
Q  156 tcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 23261875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9595940 - 9595891
Alignment:
Q  169 cggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9595940 cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 9595891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 218
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055349
Alignment:
Q  170 ggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 50055349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 51780838 - 51780763
Alignment:
Q  87 taaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagctt 162  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  51780838 taaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 218
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748262
Alignment:
Q  153 ttttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctccttcaattctctct 48748262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Original strand, 17493342 - 17493507
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||  |||| ||  | |||||||| | |||| | ||||||| || ||||  |||||| ||||||||||  ||||  || ||||||||     
T  17493342 attgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttataag 17493441  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttat 188  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||   |||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||||    
T  17493442 ctgcttataccatgttttaataagctcaaattttgagcttaacaatatgcttattaatgagcttat 17493507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55344715 - 55344682
Alignment:
Q  185 ttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55344715 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 55344682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43068159 - 43067964
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  43068159 attgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 43068060  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43068059 cttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 43067964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 933282 - 933490
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  933282 aggccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 933381  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 209  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  933382 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcg 933481  T
Q  210 attctctct 218  Q
    | |||||||    
T  933482 aatctctct 933490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Original strand, 3511333 - 3511527
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||     
T  3511333 attgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatagtttcataag 3511432  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctc 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3511433 ctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 3511527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33846732 - 33846520
Alignment:
Q  1 gaaacatataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaa 100  Q
    ||||||| ||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33846732 gaaacatctaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaa 33846633  T
Q  101 tagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaa 200  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33846632 tagcttatcatagtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 33846538  T
Q  201 ccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  33846537 cctccttcgattctctct 33846520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12101364 - 12101169
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  12101364 attggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 12101265  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12101264 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 12101169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24792538 - 24792323
Alignment:
Q  3 aacatataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaata 102  Q
    ||||||||||| | ||||  |||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24792538 aacatataggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 24792439  T
Q  103 gtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacc 202  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24792438 gcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 24792339  T
Q  203 ttcttcgattctctct 218  Q
    | ||||||||||||||    
T  24792338 tccttcgattctctct 24792323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33359276 - 33359081
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  33359276 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 33359177  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33359176 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 33359081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22649886 - 22649685
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22649886 gtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcataattt 22649787  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  22649786 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgattttct 22649687  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  22649686 ct 22649685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 20346498 - 20346693
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  20346498 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataag 20346597  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20346598 ctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctccttcgattctctct 20346693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30181210 - 30181015
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  30181210 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 30181111  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30181110 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacccccttcgattctctct 30181015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42965182 - 42964987
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  42965182 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 42965083  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42965082 ctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 42964987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Original strand, 38866557 - 38866749
Alignment:
Q  26 gacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  38866557 gacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctg 38866656  T
Q  126 cttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  38866657 tttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctct 38866749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 1803036 - 1803231
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  1803036 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 1803135  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1803136 ctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 1803231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 5280870 - 5281065
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5280870 attggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 5280969  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5280970 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 5281065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 32041552 - 32041747
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  32041552 attggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 32041651  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32041652 ctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaaccttattcgattctctct 32041747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 6394755 - 6394956
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6394755 gtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatggttt 6394854  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6394855 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctct 6394954  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  6394955 ct 6394956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12097765 - 12097581
Alignment:
Q  34 ttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtc 133  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  12097765 ttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataagctacttatgtc 12097666  T
Q  134 atattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12097665 atattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 12097581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 42204164 - 42204360
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataa-tcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42204164 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataa 42204263  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42204264 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctccttcgattctctct 42204360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 7164194 - 7164385
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  7164194 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 7164293  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7164294 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 7164385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36891015 - 36890821
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  36891015 attgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 36890917  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36890916 ttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 36890821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46891526 - 46891330
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatccttttt-aaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46891526 attggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcatagttttataa 46891427  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  46891426 gctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctccttcgattgtctct 46891330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4477507 - 4477312
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||     
T  4477507 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggtttcataag 4477408  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4477407 ctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 4477312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 9452600 - 9452795
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  9452600 attgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataag 9452699  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9452700 ctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 9452795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 15655922 - 15656117
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  15655922 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataag 15656021  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15656022 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 15656117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Original strand, 43156723 - 43156917
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  43156723 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 43156822  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctc 217  Q
    ||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43156823 ctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 43156917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 42673475 - 42673666
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    || || |||||||||||| ||||     
T  42673475 attgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagcttatcatagtttcataag 42673570  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42673571 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 42673666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 48865665 - 48865837
Alignment:
Q  48 gcttatctacttccataatcctttt---taaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaata 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48865665 gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 48865764  T
Q  145 agcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctc 217  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48865765 agcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctc 48865837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 8630682 - 8630871
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8630682 ttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 8630781  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  8630782 atgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaatccccttcgattctctct 8630871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 218
Target Start/End: Original strand, 25748524 - 25748692
Alignment:
Q  50 ttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcct 149  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25748524 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcct 25748623  T
Q  150 gaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25748624 aaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctct 25748692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 202
Target Start/End: Original strand, 4347283 - 4347462
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||     
T  4347283 attgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaccatagtttcataag 4347382  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacc 202  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4347383 ctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 4347462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46134490 - 46134295
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  46134490 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattatagtttcataag 46134391  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  46134390 ctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctcattcgattctctct 46134295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16894668 - 16894502
Alignment:
Q  48 gcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagc 147  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16894668 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 16894569  T
Q  148 ctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    || ||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16894568 ctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatccttcgattct 16894502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 17753615 - 17753805
Alignment:
Q  28 cttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgct 127  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  17753615 cttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacatagtttcataagctgct 17753714  T
Q  128 tatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17753715 tatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctctct 17753805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Original strand, 19828274 - 19828415
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19828274 gtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatcatagttt 19828373  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttca 158  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  19828374 cataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 43021762 - 43021571
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||     
T  43021762 attggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattatagtttcataag 43021663  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||    |  | || ||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43021662 ctgcttatggcatatt----tcggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 43021571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 108
Target Start/End: Original strand, 37704991 - 37705075
Alignment:
Q  24 ttgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37704991 ttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37006010 - 37005857
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  37006010 aggctccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatc 37005911  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagctta 163  Q
     || ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| || | |||| ||||||    
T  37005910 gtaatttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 43405024 - 43405116
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  43405024 gtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatc 43405116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27691506 - 27691428
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagttta 107  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27691506 ttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatatttta 27691428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36849723 - 36849599
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||   |||||||||||| || ||||||  ||||    ||||||||||||||| | ||||| |||||||  || |||||| | ||| |||||    
T  36849723 attgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatcacaatttcataaa 36849624  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagc 147  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  36849623 ctgtttatgtcatattttaataagc 36849599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 147
Target Start/End: Original strand, 20163829 - 20163953
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||| |||   ||||||||||| | || | |||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||     
T  20163829 attgacttattttgggcttatatgagcttatttaccaacataatcctttgtgaatgcgtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttcataag 20163928  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagc 147  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||    
T  20163929 ctgcttatagcatattttaacaagc 20163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15655582 - 15655474
Alignment:
Q  39 cttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatatt 138  Q
    |||||||| |||| ||||||  |||||  |||||||||  | ||| | ||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||  || |||    
T  15655582 cttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttaccacaattttataaactgcttataccaaatt 15655483  T
Q  139 ttaataagc 147  Q
    |||||||||    
T  15655482 ttaataagc 15655474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30075414 - 30075277
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  ||||| || ||| | |   |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  30075414 attgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaat-aataaaaatagcttat-ata-tttcataaa 30075318  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagctta 163  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30075317 ccgcttataccatattttaataagccataattttgagctta 30075277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3347719 - 3347524
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  3347719 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 3347620  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3347619 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 3347524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26947072 - 26946877
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  26947072 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 26946973  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26946972 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 26946877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6086812 - 6086600
Alignment:
Q  6 atataggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtt 105  Q
    |||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6086812 atataggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 6086713  T
Q  106 tatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttc 205  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6086712 tatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 6086613  T
Q  206 ttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||    
T  6086612 ttcgattctctct 6086600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 30691862 - 30692057
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  30691862 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 30691961  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30691962 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 30692057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 2837556 - 2837751
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |     
T  2837556 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcatgag 2837655  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2837656 ctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 2837751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 18613549 - 18613744
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||||     
T  18613549 attgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttccataag 18613648  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18613649 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 18613744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 21893472 - 21893661
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  21893472 ttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 21893571  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21893572 atgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 21893661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26704529 - 26704340
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  26704529 ttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 26704430  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26704429 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 26704340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 9459574 - 9459769
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  9459574 attggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 9459673  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9459674 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctccttcgattctctct 9459769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3955962 - 3955780
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3955962 attggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaa 3955863  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttc 205  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955862 ctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttc 3955780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 218
Target Start/End: Original strand, 1153599 - 1153799
Alignment:
Q  18 tttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttt 117  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  1153599 tttagattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttc 1153698  T
Q  118 ataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctc 217  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1153699 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctccttcgtttctctc 1153798  T
Q  218 t 218  Q
    |    
T  1153799 t 1153799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 11167251 - 11167446
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  11167251 attggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 11167350  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11167351 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 11167446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17261269 - 17261074
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||     
T  17261269 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatattttcataag 17261170  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17261169 ctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 17261074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34887488 - 34887293
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  34887488 attgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 34887389  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34887388 ctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctccttcgattctctct 34887293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 20726802 - 20726993
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    ||||||||  |||||||||||| ||||     
T  20726802 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa----taaaaataacttatcatagtttcataag 20726897  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20726898 ctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 20726993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28199705 - 28199509
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctact--tccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttata 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28199705 attgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcata 28199606  T
Q  121 aactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
      ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28199605 tgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 28199509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16307204 - 16307015
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  16307204 attgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 16307105  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgatt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16307104 ctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcattcgatt 16307015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30699125 - 30698934
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  30699125 attgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttttattag 30699026  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30699025 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 30698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 35198289 - 35198489
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35198289 gtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 35198387  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  35198388 cataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtgatctcattcgattctct 35198487  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  35198488 ct 35198489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Original strand, 52847 - 52989
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  52847 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 52946  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttacc 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52947 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacc 52989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 218
Target Start/End: Original strand, 33464402 - 33464535
Alignment:
Q  85 ggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  33464402 ggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagc 33464501  T
Q  185 ttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33464502 ttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 33464535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53114
Alignment:
Q  105 ttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctt 204  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  205 cttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||    
T  53101 cttcgattctctct 53114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 90
Target Start/End: Original strand, 33463712 - 33463779
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaa 90  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33463712 attggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 16052105 - 16052300
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  16052105 attggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 16052204  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16052205 ctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 16052300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1170640 - 1170447
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||     
T  1170640 attggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataag 1170541  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1170540 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctct 1170447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 38829065 - 38829273
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38829065 aggctctgtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 38829164  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 209  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  38829165 atagtttcataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccatcg 38829264  T
Q  210 attctctct 218  Q
    |||||||||    
T  38829265 attctctct 38829273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 20089480 - 20089675
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  20089480 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 20089579  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20089580 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 20089675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 25897383 - 25897578
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  25897383 attgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 25897482  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25897483 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 25897578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 29288158 - 29288351
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29288158 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 29288257  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  29288258 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctccttcgattctctct 29288351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 29078525 - 29078720
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  29078525 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 29078624  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29078625 ctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 29078720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42370991 - 42370796
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||     
T  42370991 attgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatcatagtttcataag 42370892  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42370891 ctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 42370796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 46760975 - 46761170
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  46760975 attgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaa 46761074  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  46761075 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttccttcgattctctct 46761170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 52753343 - 52753148
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  52753343 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 52753244  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52753243 ctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 52753148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 8120878 - 8121073
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  8120878 attggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtttcataag 8120977  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8120978 ctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 8121073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 26663267 - 26663462
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  26663267 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 26663366  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26663367 ctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 26663462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 33510493 - 33510688
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33510493 attggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 33510592  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33510593 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 33510688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39260542 - 39260347
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  39260542 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 39260443  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39260442 ttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 39260347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41928691 - 41928496
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41928691 attggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 41928592  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928591 ctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 41928496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 2347671 - 2347861
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2347671 ttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 2347770  T
Q  129 atgtcata-ttttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2347771 atgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 2347861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 1168512 - 1168707
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  1168512 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 1168611  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  1168612 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattctctct 1168707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1940943 - 1940748
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  1940943 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 1940844  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1940843 ttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcaattctctct 1940748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Original strand, 23498461 - 23498664
Alignment:
Q  15 ctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 114  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23498461 ctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatcatagt 23498560  T
Q  115 tttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    || ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23498561 ttcataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctctttcgattct 23498660  T
Q  215 ctct 218  Q
    ||||    
T  23498661 ctct 23498664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26580466 - 26580271
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  26580466 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatcatagtttcataag 26580367  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26580366 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctct 26580271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 970722 - 970525
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc--atagttttata 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||    
T  970722 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatatagtttcata 970623  T
Q  121 aactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  970622 agctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctccttcgattctctct 970525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19715351 - 19715162
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  19715351 ttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattgtttcataagctgctt 19715252  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19715251 atgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 19715162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 5215394 - 5215589
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||     
T  5215394 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtttcataag 5215493  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5215494 ttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctct 5215589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 12682829 - 12683024
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  12682829 attgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 12682928  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12682929 ctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 12683024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 32671588 - 32671783
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  32671588 attggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 32671687  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  32671688 ctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccccttcgattctctct 32671783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 40092500 - 40092695
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  40092500 attgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcatagtttcataag 40092599  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40092600 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctttttcgattttctct 40092695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 52696800 - 52696995
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||     
T  52696800 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtttcataag 52696899  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  52696900 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattatctct 52696995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 15203115 - 15203316
Alignment:
Q  17 gtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 116  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15203115 gtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 15203214  T
Q  117 tataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
     |||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203215 cataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 15203314  T
Q  217 ct 218  Q
    ||    
T  15203315 ct 15203316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Original strand, 17591709 - 17591892
Alignment:
Q  34 ttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtc 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17591709 ttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttcataagctgcttatgtc 17591807  T
Q  134 atattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17591808 atattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 17591892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 43905650 - 43905858
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43905650 aggctccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 43905749  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 209  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  43905750 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctccttcg 43905849  T
Q  210 attctctct 218  Q
    ||| |||||    
T  43905850 attgtctct 43905858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 46409431 - 46409641
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  46409431 aggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 46409530  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggc--ttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttctt 207  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  46409531 atagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 46409630  T
Q  208 cgattctctct 218  Q
    |||||||||||    
T  46409631 cgattctctct 46409641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149667
Alignment:
Q  48 gcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtcatattttaataagc 147  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaataagc 40149596  T
Q  148 ctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    || ||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40149597 ctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 40149667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8079905 - 8079710
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  8079905 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 8079806  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  8079805 ctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattctctct 8079710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 7145216 - 7145411
Alignment:
Q  23 attgacttatttt-gagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7145216 attgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgttg-ggtaaataaacaaaaatagtttatcatagtttcataa 7145314  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7145315 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 7145411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 216
Target Start/End: Original strand, 2473737 - 2473924
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||    
T  2473737 ttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtttcataagctgctt 2473836  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  2473837 atgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacctccttcgagtctct 2473924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 6765468 - 6765659
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |     
T  6765468 attggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatattttcatgag 6765567  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6765568 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctccttcgattct 6765659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51359412 - 51359218
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||     
T  51359412 attggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatcatagtttcataag 51359314  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51359313 gtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 51359218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 216
Target Start/End: Original strand, 15717794 - 15717986
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||     
T  15717794 attgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtttcataag 15717892  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctct 216  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  15717893 ctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctccttcaattctct 15717986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13996932 - 13996724
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||     
T  13996932 aggccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttata 13996833  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 209  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  13996832 atggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcattcg 13996733  T
Q  210 attctctct 218  Q
    |||||||||    
T  13996732 attctctct 13996724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587510
Alignment:
Q  30 tattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctta 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  130 tgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 17587510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15554329 - 15554153
Alignment:
Q  34 ttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtc 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |||   || |||||||||| ||| |    
T  15554329 ttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag-----cat---ttcataaactgctgatgcc 15554238  T
Q  134 atattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15554237 atattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 15554153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 49146187 - 49146376
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  49146187 ttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 49146286  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  49146287 atgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacgtcattcgattctctct 49146376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Original strand, 29695684 - 29695827
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttt-taaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataa 121  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29695684 attggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatcatagtttcataa 29695783  T
Q  122 actgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttacc 165  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29695784 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacc 29695827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 38171828 - 38172023
Alignment:
Q  10 aggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatc 109  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  38171828 aggctccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatc 38171927  T
Q  110 atagttttataaactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcg 209  Q
    ||||||| |||| ||||||||||             |||| ||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38171928 atagtttcataagctgcttatgt-------------gcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctccttcg 38172014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Original strand, 52086262 - 52086396
Alignment:
Q  9 taggctctgtttaaattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttat 108  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||    
T  52086262 taggccctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttat 52086361  T
Q  109 catagttttataaactgcttatgtcatattttaat 143  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  52086362 cataatttcataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23323031 - 23322870
Alignment:
Q  28 cttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgct 127  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  23323031 cttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgct 23322932  T
Q  128 tatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||| |||||   || | |||||||| ||||||||||    
T  23322931 tatgtcatactttaataagcgcaaattttaagcttcatatacagcttaatacggagcttatg 23322870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 145441 - 145246
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  145441 attgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 145342  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  145341 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctccttcgattctctct 145246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 36714 - 36909
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  36714 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 36813  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36814 ctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 36909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23147 - 22956
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  23147 attggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 23048  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattct 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23047 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattct 22956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Original strand, 10247 - 10442
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10247 attgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 10346  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10347 ctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 10442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 191 - 7
Alignment:
Q  34 ttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgcttatgtc 133  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  191 ttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgcc 92  T
Q  134 atattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  91 atattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 491 - 296
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaa 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  491 attggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttcataag 392  T
Q  123 ctgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  391 ctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 3725 - 3914
Alignment:
Q  29 ttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttataaactgctt 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  3725 ttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 3824  T
Q  129 atgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  3825 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgattctctct 3914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 203 - 7
Alignment:
Q  23 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctact--tccataatcctttttaaaggtgtttcggtaaataaataaaaatagtttatcatagttttata 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  203 attgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcata 104  T
Q  121 aactgcttatgtcatattttaataagcctgaattttcagcttaccattcggcttaataaggagcttatgaatttatgtaaccttcttcgattctctct 218  Q
      ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  103 tgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctccttcgattctctct 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University