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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF4298_low_5 (Length: 613)
Name: NF4298_low_5
Description: NF4298
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF4298_low_5 |
 | |
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Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 592; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 31340346 - 31339751
Alignment:
| Q |
2 |
catcagtcgatcaataatgttttccttattctcacacatctaaggtaacaaatccccatggtcgagcaacaaaggctcaataaaattttgtagaatttag |
101 |
Q |
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| T |
31340346 |
catcagtcgatcaataatgttttccttattctcacacatctaaggtaacaaatccccatggtcgagcaacaaaggctcaataaaattttgtagaatttag |
31340247 |
T |
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| Q |
102 |
atgggtccctatcaccggaaacctcaccacatcacccatcatagtcaccatgtaactatgatatgtttcttcaaaagaaaaatgtaactatatatgatat |
201 |
Q |
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| T |
31340246 |
atgggtccctatcaccggaaacctcaccacatcacccatcatagtcaccatgtaactatgatatgtttcttcaaaagaaaaatgtaactatatatgatat |
31340147 |
T |
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| Q |
202 |
gcatgaacatgcattgtcaacttaacatatgaacatacaacaatttacacataatccaacatatgtaacaataataacatgcttatatcacatatattca |
301 |
Q |
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| T |
31340146 |
gcatgaacatgcattgtcaacttaacatatgaacatacaacaatttacacataatccaacatatgtaacaataataacatgcttatatcacatatattca |
31340047 |
T |
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| Q |
302 |
tatgcaaacatcacttattacatttcaataggaaaatttatttattctaaatcatatgaaagcagataatcatcaatatgaacatcgttgtgataaatac |
401 |
Q |
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| T |
31340046 |
tatgcaaacatcacttattacatttcaataggaaaatttatttattctaaatcatatgaaagcagataatcatcaatatgaacatcgttgtgataaatac |
31339947 |
T |
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| Q |
402 |
atcctaaacaaggcaccctatcatgcgtagaaaacacacatgcattcaattaaatataatttcgttaaaatataacattacttgtataactttccaaacc |
501 |
Q |
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| T |
31339946 |
atcctaaacaaggcaccctatcatgcgtagaaaacacacatgcattcaattaaatataatttcgttaaaatataacattacttgtataactttccaaacc |
31339847 |
T |
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| Q |
502 |
cacacaactcaaagtcaccaatatagtagtttaggtgagcctcatagctctaagaaattctactcacctgtggtctagttcaacaatggtcaaaag |
597 |
Q |
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| T |
31339846 |
cacacaactcaaagtcaccaatatagtagtttaggtgagcctcatagctctaagaaattctactcacccgtggtctagttcaacaatggtcaaaag |
31339751 |
T |
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