View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4306-Insertion-79 (Length: 318)

Name: NF4306-Insertion-79
Description: NF4306
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4306-Insertion-79
NF4306-Insertion-79
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (1-318)||(29894243-29894562)
chr6 (1-318)||(29348588-29348907)
chr6 (1-318)||(29366411-29366730)
chr6 (1-318)||(29073453-29073772)
chr6 (1-318)||(29106026-29106345)
chr6 (1-318)||(29834905-29835224)
chr6 (1-318)||(29866339-29866658)
chr6 (1-318)||(29897767-29898086)
chr6 (17-318)||(28926537-28926840)
chr6 (1-318)||(29084708-29085027)
chr6 (1-318)||(29357969-29358288)
chr6 (27-318)||(29905355-29905648)
chr6 (1-318)||(29099033-29099352)
chr6 (1-318)||(29115951-29116270)
chr6 (72-318)||(29078288-29078536)
chr6 (1-318)||(29886987-29887306)
chr6 (116-318)||(30118731-30118935)
chr6 (1-229)||(29902946-29903180)
chr6 (1-318)||(29882125-29882444)
chr6 (1-318)||(29909281-29909600)
chr6 (1-318)||(29928963-29929282)
chr6 (1-296)||(24263764-24264061)
chr6 (140-314)||(30060156-30060332)
chr6 (1-296)||(24271959-24272256)
chr6 (132-318)||(30127045-30127233)
chr6 (1-318)||(24730545-24730864)
chr6 (17-318)||(29876531-29876834)
chr6 (145-318)||(29946271-29946446)
chr6 (203-318)||(30061985-30062100)
chr6 (156-318)||(24890236-24890400)
chr6 (150-318)||(29889569-29889739)
chr6 (150-318)||(30999928-31000098)
chr6 (19-318)||(25450826-25451127)
chr6 (1-91)||(29889210-29889300)
chr6 (256-318)||(29211383-29211445)
chr6 (1-254)||(24886571-24886830)
chr6 (17-60)||(24890496-24890539)
chr6 (18-84)||(30154207-30154273)
chr6 (18-201)||(29953803-29953986)
chr6 (18-76)||(15727402-15727460)
chr6 (18-84)||(24884847-24884913)
chr6 (164-318)||(15727179-15727335)
chr6 (25-88)||(31000160-31000223)
chr6 (18-84)||(29950123-29950189)
chr6 (5-195)||(30053121-30053311)
chr6 (18-84)||(30149234-30149300)
chr6 (15-84)||(30028842-30028911)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-318)||(53586-53905)
[»] scaffold0573 (1 HSPs)
scaffold0573 (17-318)||(3843-4146)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-317)||(22033-22351)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (17-318)||(15062866-15063169)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (27-298)||(24219245-24219518)
chr3 (140-315)||(33997769-33997946)
chr3 (150-318)||(11991151-11991321)
chr3 (236-317)||(16350977-16351058)
chr3 (44-84)||(11991045-11991085)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (17-286)||(10129843-10130114)
chr1 (23-279)||(4260346-4260604)
chr1 (23-279)||(4263968-4264226)
chr1 (225-318)||(17251229-17251322)
chr1 (45-82)||(41316003-41316040)
[»] scaffold0014 (5 HSPs)
scaffold0014 (17-318)||(137080-137383)
scaffold0014 (44-308)||(140031-140297)
scaffold0014 (236-318)||(104728-104810)
scaffold0014 (25-89)||(121692-121756)
scaffold0014 (236-318)||(121470-121552)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (227-315)||(3151-3239)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (150-318)||(8834-9004)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (23-84)||(126349-126410)
scaffold0019 (236-318)||(126113-126195)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (45-189)||(43406-43550)
scaffold0051 (238-318)||(47893-47973)
scaffold0051 (237-315)||(43278-43356)
[»] scaffold0429 (2 HSPs)
scaffold0429 (45-84)||(5930-5969)
scaffold0429 (237-315)||(6124-6202)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (227-317)||(3642955-3643045)
chr7 (23-84)||(3642749-3642810)
[»] scaffold0654 (1 HSPs)
scaffold0654 (227-318)||(1210-1301)
[»] scaffold0652 (1 HSPs)
scaffold0652 (44-89)||(1507-1552)
[»] scaffold1840 (1 HSPs)
scaffold1840 (23-87)||(1121-1185)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29894243 - 29894562
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29894243 gatgaaacaaggcattaaacctaatgttgttacctattgctctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 29894342  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29894343 actatgtctcagaggggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 29894442  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29894443 ttaaagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaa 29894542  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29894543 gctagttgatgagatgcatg 29894562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29348907 - 29348588
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29348907 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttattgctctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaagagtatattcaac 29348808  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    |||||| ||||| | ||||||| | || || |||| || ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29348807 actatggctcaggggggagtgactgctaatgttcagagctacaatatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctct 29348708  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29348707 ttaaagaaatgcattgcaaaaacattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcagggaaaatctcttatgctttgaa 29348608  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  29348607 gctagtcgatgagatgcatg 29348588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29366730 - 29366411
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||  ||    
T  29366730 gatgaaacaaggcattaaacctgacgtttttacttataactctttaatggatagatattgcctagttaaagaagtcaataaggctaaacatatattcaac 29366631  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29366630 actatatctcagaggggagtgaatcctaatattcacagctacagtatcatgattcacgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccatgaatctct 29366531  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  ||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29366530 ttaaagaaatgcattgcaataacattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaa 29366431  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  29366430 gctagtcgatgagatgcatg 29366411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29073453 - 29073772
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  29073453 gatgaaacaaggcattaaacctaatgttgttacttattgctctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaatagtatattcaac 29073552  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29073553 actatggctcaggggggagtgaatcctgatactcagagttacaatatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctct 29073652  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  | ||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29073653 ttaaaaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttacacttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 29073752  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  29073753 gctagtcgatgagatgcatg 29073772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29106026 - 29106345
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  29106026 gatgaaacaaggcattaaacctaatgttgttacttattgctctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaatagtatattcaac 29106125  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29106126 actatggctcaggggggagtgaatcctgatactcagagttacaatatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctct 29106225  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  | ||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29106226 ttaaaaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttacacttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 29106325  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  29106326 gctagtcgatgagatgcatg 29106345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29834905 - 29835224
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  29834905 gatgaaacaaggcatgaaacccaatgttgttacttatagcgctttaatggatggatattgcctagttaaaaaagtgaataaggcgaagagtatattcaac 29835004  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    || ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||    
T  29835005 acaatggctcaggggggagtgaatcctgatattcacagttacagtatcttgattaatgggctttgtaagattaaaatgacggatgaagccatgaatctct 29835104  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  ||||||||||  || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29835105 ttgaagaaatgcattgcagaaaaattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaa 29835204  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29835205 gctagttgatgagatgcatg 29835224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29866339 - 29866658
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  29866339 gatgaaacaaggcatgaaacccaatgttgttacttatagcgctttaatggatggatattgcctagttaaaaaagtgaataaggcgaagagtatattcaac 29866438  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    || ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||    
T  29866439 acaatggctcaggggggagtgaatcctgatattcacagttacagtatcttgattaatgggctttgtaagattaaaatgacggatgaagccatgaatctct 29866538  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  ||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29866539 ttgaagaaatgcattgcagaaaaattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgcaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 29866638  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29866639 gctagttgatgagatgcatg 29866658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29897767 - 29898086
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29897767 gatgaaacaagacattaaacctaatgtttttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaac 29897866  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  29897867 actatggctcagggaggagtgaatcctgatattcacagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagagtaaaatgaccgatgaagccatgaatctct 29897966  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  ||||||||||   | | |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  29897967 ttgaagaaatgcattgtagaaagctaattcctgatgtggtaacttacaattctcttatcgatggtttgtgtaaattggggaaattctcttacgcgttgaa 29898066  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  29898067 gctagtcgatgagatgcatg 29898086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28926840 - 28926537
Alignment:
Q  17 aaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagag 116  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | |    
T  28926840 aaacctaacgttgttacttatagctctttaatggatggatattgccttgttaaagaagtgaacaaggctaagagtatattcaacaatatggctcaggggg 28926741  T
Q  117 gagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatca 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||      
T  28926740 gagtgaatcctgatattcagagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagattaaaatgaccgatgcagccatgaatctctttgaagaaatgcattg 28926641  T
Q  215 caaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatg 314  Q
    || | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28926640 cagaaaaattattcctaatgtggtaacttacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatg 28926541  T
Q  315 catg 318  Q
    ||||    
T  28926540 catg 28926537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29084708 - 29085027
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  29084708 gatgaaacaaggcatcatacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaatacggctaagagtatattcaac 29084807  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    |||||| ||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29084808 actatggctcaaggcggagtgaatcctgatattcgcagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgataaagctatgaatctct 29084907  T
Q  201 tta--gaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    |||  |||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||||| |    
T  29084908 ttaatgaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttacaattctcttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgca 29085007  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||| || ||| |||||||||    
T  29085008 gcttgtcgatcagatgcatg 29085027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29358288 - 29357969
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29358288 gatgatacaaggcattaaacctggcgttgttacttataactctttaatggatggatatttcctagttaaacaagtgaataaggctaagagtatattcaac 29358189  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    |||||| |||||   ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| | ||      
T  29358188 actatggctcagttgggagtgagtcctgatattcagagttacagtatcttgattaatgggttttgtaagattaaaatgatggatgaagccatggaactac 29358089  T
Q  201 t--tagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    |   |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29358088 tcaaagaaatgcatcacaaacaaattattcctaacgtggtaacttacagttcccttattgatggtttatgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 29357989  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  29357988 gctagtggatgagatgcatg 29357969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Original strand, 29905355 - 29905648
Alignment:
Q  27 ttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagaggagtgaatcc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||   |||||||||||    
T  29905355 ttgttacttataactctttaatggatggatattgcttacttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaacactatggctcaggagggagtgaatcc 29905454  T
Q  127 tgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaacatatt 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||   | | |  |     
T  29905455 tgctattcaaagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccataaatctctttgaagaaatgcattgtagaaaatta 29905554  T
Q  225 attcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29905555 attcctgatgtggtaacttacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatctggaaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 29905648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29099033 - 29099352
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29099033 gatgaaacaaggcatcaaacctaattttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaac 29099132  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  29099133 actatggctcaggggggagtgaatcctgatattcagagttacagtatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaagtttgatgaagccatgaatctct 29099232  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||||| |    
T  29099233 ttaaagaaatgcatcgcaaaaacattattcctgatgtcgtaacttacagttcccttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgca 29099332  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||| || ||| |||||||||    
T  29099333 gcttgtcgatcagatgcatg 29099352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29115951 - 29116270
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29115951 gatgaaacaaggcatcaaacctaattttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaac 29116050  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  29116051 actatggctcaggggggagtgaatcctgatattcagagttacagtatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaagtttgatgaagccatgaatctct 29116150  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||||| |    
T  29116151 ttaaagaaatgcatcgcaaaaacattattcctgatgtcgtaacttacagttcccttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgca 29116250  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||| || ||| |||||||||    
T  29116251 gcttgtcgatcagatgcatg 29116270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 318
Target Start/End: Original strand, 29078288 - 29078536
Alignment:
Q  72 aagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagat 171  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  29078288 aagtgaataaggctaatagtatattcaacactatggctcaggggggagtgaatcctgatactcagagttacaatatcatgattaacgggttttgtaagat 29078387  T
Q  172 taaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgt 269  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29078388 taaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaaaaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttacacttctcttattgatggtttgtgt 29078487  T
Q  270 aaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29078488 aaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatg 29078536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29886987 - 29887306
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||   |    
T  29886987 gatgaaacaaggcatcaatcctaatgctgttacttatagctctttaatggatggatattgcctagttaatgaagtgaacaatgccaagggtatattcagc 29887086  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    ||||||||||  || ||||||| | || || ||   || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  29887087 actatgtctcttaggggagtgactgctaatgtttggagctacaatatcatgattaatggattttgtaagattaaaatgaccgatgaagccatgaatctct 29887186  T
Q  201 tt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    ||  ||||||||||   | | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887187 ttgaagaaatgcattgtagaaaactaattcctgatgtggtaacttacaattcccttatcaatggtttgtgcaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 29887286  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  29887287 gctagtcgatgagatgcatg 29887306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 116 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30118935 - 30118731
Alignment:
Q  116 ggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatc 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||     
T  30118935 ggagtgaatcctgctattcaaagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccataaatctctttgaagaaatgcatt 30118836  T
Q  214 acaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagat 313  Q
      | | |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30118835 gtagaaaattaattcctgatgtggtaacttacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatctggaaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagat 30118736  T
Q  314 gcatg 318  Q
    |||||    
T  30118735 gcatg 30118731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29902946 - 29903180
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29902946 gatgaaacaaggcatcaaacctgacgttgttacttataactctttaatggatggatactgcatagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattaaac 29903045  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgat----gggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaat 196  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||     
T  29903046 actatgtctcagaggggagtgaatcctgatattcacagctacaacatcatgattaattaacgggttttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaa 29903145  T
Q  197 ctctt--tagaaatgcatcacaaacatattattcc 229  Q
    || ||   ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  29903146 cttttcagagaaatgcatcgcaaacaaatttttcc 29903180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29882125 - 29882444
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||||||||||  ||    
T  29882125 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttacagctctttaatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatattcaac 29882224  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    ||||||||||| || ||||||| | || || |||| || |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || |    
T  29882225 actatgtctcataggggagtgactgctaatgttcagagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttt 29882324  T
Q  201 t--tagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||||||| |    
T  29882325 tcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataacttatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttgga 29882424  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
     || || |||||||||||||    
T  29882425 acttgtcgatgagatgcatg 29882444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29909281 - 29909600
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||||||||||  ||    
T  29909281 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttacagctctttaatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatattcaac 29909380  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    ||||||||||| || ||||||| | || || |||| || |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || |    
T  29909381 actatgtctcataggggagtgactgctaatgttcagagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttt 29909480  T
Q  201 t--tagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||||||| |    
T  29909481 tcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataacttatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttgga 29909580  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
     || || |||||||||||||    
T  29909581 acttgtcgatgagatgcatg 29909600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 29928963 - 29929282
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||||||||||  ||    
T  29928963 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttacagctctttaatggatggatattgtcttgtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatattcaac 29929062  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    ||||||||||| || ||||||| | || ||  | | || |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || |    
T  29929063 actatgtctcataggggagtgactgctaatgctaagagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttt 29929162  T
Q  201 t--tagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| |    
T  29929163 tcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataacttatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatcagggagaatctcatatgctttgca 29929262  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||| || ||| |||||||||    
T  29929263 gcttgtcgatcagatgcatg 29929282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24264061 - 24263764
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| | ||| |||||||||||| ||    
T  24264061 gatgaaacaaggcattaaacctgacattgttacttataactctttaatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacatggccaagagtatattaaac 24263962  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||  | |||  || ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || |    
T  24263961 actatgtctcataggggagtgactgctactgttcggagctacaatattgtgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatcaagccatgaaacttt 24263862  T
Q  201 t--tagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttg 296  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || |||||||||    
T  24263861 tcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctaatgtgataacttataattcccttattgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttg 24263764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 140 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30060332 - 30060156
Alignment:
Q  140 tacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtgg 237  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  30060332 tacaatataatgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcaaaaacattattcctgatgtgg 30060233  T
Q  238 taacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatg 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30060232 taacatacaattcccttattgatggtatctgtaaatcggggaaaatctcttatgctttaaagctagtcgatgagatg 30060156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24272256 - 24271959
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||||||  ||    
T  24272256 gatgaaacaaggcattaaacctgacgttgttacttataactctttaatggatcgatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccaagagtatattcaac 24272157  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    ||||||||||| || |||||||   || || |||  || |||| |||| ||||| || | |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || |    
T  24272156 actatgtctcataggggagtgaccgctaatgttcggagctacagtatcatgattaatagattttgtaagattaaaatggtggatcaagccatgaaacttt 24272057  T
Q  201 t--tagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttg 296  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || |||||||||    
T  24272056 tcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctaatgtgataacttatagttcccttattgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttg 24271959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30127233 - 30127045
Alignment:
Q  132 ttcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaacatattattcc 229  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||  |||||||||   |||| | ||||||||    
T  30127233 ttcaaagctacaatatcatgattaatgggttttgtaagattaaaagggtgggtgaagccattaatctctttgaagaaatgcaatgcaaaaaaattattcc 30127134  T
Q  230 tgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  30127133 tgatgtggtaacttatagttcccttattgatggtttctgtaaatcggagaaaatctctcatgctttgaatctagtcaatgagatgcatg 30127045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 24730545 - 24730864
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||   ||||||  |     
T  24730545 gatgaaaaaagacattatacttgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcttagttaaagaaattaacaaggccaaagatatattcgat 24730644  T
Q  101 actatgtc-tcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctc 199  Q
    | |||| | ||| || ||||| | | || || |||| || || |  | | ||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  24730645 agtatggcctca-aggggagtcattgctaatgttcagagctataccaccatgattaatggattatgtaagattaaaatggtggatgaagctgtaaatctc 24730743  T
Q  200 ttt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttga 297  Q
    |||  |||||||| |   | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  24730744 tttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgggtaaattggggaaaatctcttgtgtgttga 24730843  T
Q  298 agctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  24730844 agctagtcgatgagatgcatg 24730864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 29876531 - 29876834
Alignment:
Q  17 aaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagag 116  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||| ||||||  ||||||||  |||||| |    
T  29876531 aaacctgatattattacttataactctttaatggatggatattgtctggttaaagaagtggacaaggctaagaatatattcaacactatggttcagaggg 29876630  T
Q  117 gagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctctt--tagaaatgcatca 214  Q
    |||||| | |  || |||  || |||| |||| ||||| |||| ||||||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||   ||||||||||      
T  29876631 gagtgactgcaaatgttcggagctacagtatcatgattaatggattttgtaaggttaaaatgatggatgaagcaatgaatctcttccaagaaatgcattg 29876730  T
Q  215 caaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatg 314  Q
     ||| | || |||||||||  | || |||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| |||  |  | |||||| |||| ||||||||||||    
T  29876731 taaagaaataattcctgatacgatagcttatagttcccttattgatggtttttgcaaatcggggagaattccacaggctttggagcttgttgatgagatg 29876830  T
Q  315 catg 318  Q
    ||||    
T  29876831 catg 29876834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 318
Target Start/End: Original strand, 29946271 - 29946446
Alignment:
Q  145 tatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaact 242  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  29946271 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatgtggtaact 29946370  T
Q  243 tacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  29946371 tacaattcccttattaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatg 29946446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 203 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30062100 - 30061985
Alignment:
Q  203 agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagcta 302  Q
    ||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30062100 agaaatgcattgcaaaaacattattcccgatgtggtagcttacaattcccttattgatggtttttgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagcta 30062001  T
Q  303 gttgatgagatgcatg 318  Q
    || |||||||||||||    
T  30062000 gtcgatgagatgcatg 30061985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24890400 - 24890236
Alignment:
Q  156 atgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattccct 253  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||  |||||||| |   | | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24890400 atggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtggtaacttacagttccct 24890301  T
Q  254 tattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24890300 tattgatggtttgtgtaaattggggagaatcttttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatg 24890236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Original strand, 29889569 - 29889739
Alignment:
Q  150 tgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttta--gaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaa 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29889569 tgattaatgggttttgtaagattaaaaaagtcgatgaagccatgaatctctttaaagaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttacaa 29889668  T
Q  248 ttcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||| ||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| |||| |||| |||| || ||| |||||||||    
T  29889669 ttctcttattgatggtttaagcaaatcagggataatctcatatgttttgcagcttgtcgatcagatgcatg 29889739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31000098 - 30999928
Alignment:
Q  150 tgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaa 247  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||  |||||||| |   | | | ||||||| | ||||| ||| |||||     
T  31000098 tgattaatggattttgcaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcgtaatgtgttaatttacag 30999999  T
Q  248 ttcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30999998 tttccttattgatggtttgtgtaaatcggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatg 30999928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Original strand, 25450826 - 25451127
Alignment:
Q  19 acctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagagga 118  Q
    |||| ||||| | ||||||| || |||| || |||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||  | | |||| |||| || |||    
T  25450826 acctaatgttatcacttatagctgtttattgtatggatattgtctagttaatgaagtgaacgaggccaagagaatattcaaaagtatgactcaaagggga 25450925  T
Q  119 gtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcaca 216  Q
    |||| |  |||  |||  || |||| |||| |||||  |   |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || |||  |||||||||   ||    
T  25450926 gtgacttttgacgttcttagctacactatcatgattagtaaattttgtaagattaaaatggtggatgaagccaggaaactttttgaagaaatgcagtcca 25451025  T
Q  217 aacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgca 316  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||  || ||||||||||||| || |||||||||||    
T  25451026 aacaaatatttcctgatgtggtaacttacagttcccttgttgatggtttgtgcaaatcggagagaattcctaatgctttgaagcttgtcgatgagatgca 25451125  T
Q  317 tg 318  Q
    ||    
T  25451126 tg 25451127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 29889210 - 29889300
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagt 91  Q
    |||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  29889210 gatgaaacgagacatcaaacttaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggataagagt 29889300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 29211445 - 29211383
Alignment:
Q  256 ttgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29211445 ttgatgttttttgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtggatgagatgcatg 29211383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24886830 - 24886571
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||  ||||||  ||    
T  24886830 gatgaaacacggcatcaaacctagtgttgtcacttataacactttaatgaatggatattgcttagttaaagaaatgaacatggccaaggatatattcaac 24886731  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaat----cctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaat 196  Q
    ||||||   || || ||||||  |    ||| || |||| || |||| |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| | | |||||||| || |||    
T  24886730 actatgaaccaaagtggagtggttcctacctaatgttcatagctacactatcttgattaatggattttgcaaggttaaaatgatagatgaagccataaat 24886631  T
Q  197 ctcttt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattccctt 254  Q
    |||| |  ||||||||||   | | | | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24886630 ctctatgaagaaatgcattgtagaaaaaatattcctgatgtggtaacttacagttccctt 24886571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24890539 - 24890496
Alignment:
Q  17 aaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattg 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24890539 aaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattg 24890496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Original strand, 30154207 - 30154273
Alignment:
Q  18 aacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggc 84  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  30154207 aacctgatgttgttacttataattctttgatggatgggtatttcttggttaaagaagtgaataaggc 30154273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29953986 - 29953803
Alignment:
Q  18 aacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagagg 117  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |    ||||||  |||||||  |||| || ||    
T  29953986 aacctaatgttgttacttatacttctttgatggatgggtatttcctagttaaagaagtcaacaaggccacatatatattcaacactattgctcaaagggg 29953887  T
Q  118 agtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctctt 201  Q
    ||||| ||||||  |||| || |||||| || ||||| | || || ||||||| ||||| |||  ||||||||  |||||||||    
T  29953886 agtgactcctgaacttcatagctacaatgtcatgattaacggattatgtaagaataaaatggtgaatgaagctgcgaatctctt 29953803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15727460 - 15727402
Alignment:
Q  18 aacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtg 76  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15727460 aacctgatgttgttacatacaattcattaatggatggttattgcctagttaaagaagtg 15727402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Original strand, 24884847 - 24884913
Alignment:
Q  18 aacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggc 84  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||    
T  24884847 aacctaatgttgttacttatacttctttaatggatggttatttcttggttaaagaagtgaacaaggc 24884913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15727335 - 15727179
Alignment:
Q  164 tgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttta--gaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatg 261  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||  ||||||| |  ||||   |||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||    
T  15727335 tgtaagattaaaatgatcgatgaagccttgagtctctttaatgaaatgcgtagcaaaggaattactcctgataaggtaacttacaattctctcattgatg 15727236  T
Q  262 gtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||| ||| |  ||| |||| | | ||||| | || | ||||||||||||||||    
T  15727235 gtttgtgcaaagcaaggagaatcccctgtgcttgggagtttgttgatgagatgcatg 15727179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 31000223 - 31000160
Alignment:
Q  25 tgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaag 88  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| ||||| |||    
T  31000223 tgttgttacttatagctctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaag 31000160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 29950189 - 29950123
Alignment:
Q  18 aacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggc 84  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| | | ||||||||||| || |||||    
T  29950189 aacctgatattgttacttatagttctttaatggatggttatttcttggttaaagaagtcaacaaggc 29950123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Original strand, 30053121 - 30053311
Alignment:
Q  5 aaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacacta 104  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| | | || |||||||| || ||||| ||   | ||||  ||||||    
T  30053121 aaacaaggcgtggaacctaatgttgttacttatacttctttgatggatgggtatttcttggtaaaagaagtcaacaaggccaaacatgtattcaacacta 30053220  T
Q  105 tgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaa 195  Q
    | ||||  || ||||||| |||| || |||| || |||| | || ||||| |||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  30053221 tttctctaaggggagtgactcctaatgttcatagctacattgtcatgattaatggattatgtaagaataaaatggtggatgaagctgtgaa 30053311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Original strand, 30149234 - 30149300
Alignment:
Q  18 aacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggc 84  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| | | ||||||||||| || |||||    
T  30149234 aacctgatattgttacttatagttctttaatggatggttatttcttggttaaagaagtcaacaaggc 30149300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 84
Target Start/End: Original strand, 30028842 - 30028911
Alignment:
Q  15 ttaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggc 84  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  | ||| || ||||||||||||||    
T  30028842 ttaaacttaatgttgttacttatagttctttaatggatgggtattttcaagtcaatgaagtgaataaggc 30028911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 53905 - 53586
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||    
T  53905 gatgaaacaaggcattaaacctaatgttgttacttattgctctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaagaagatattcaac 53806  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || || |||| || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  53805 actatgtctcagaggggagtgactgctaatgttcatagctacaatatcatgattaatggattttgtaagattaaaaaggtggataaagccatgaaactct 53706  T
Q  201 t--tagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  53705 tcatagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatatcttatgctttcca 53606  T
Q  299 gctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  53605 gctagtcaatgagatgcatg 53586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0573 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0573
Description:

Target: scaffold0573; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 3843 - 4146
Alignment:
Q  17 aaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagag 116  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | |    
T  3843 aaacctaacgttgttacttatagctctttaatggatggatattgccttgttaaagaagtgaacaaggctaagagtatattcaacaatatggctcaggggg 3942  T
Q  117 gagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatca 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||      
T  3943 gagtgaatcctgatattcagagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagattaaaatgaccgatgcagccatgaatctctttgaagaaatgcattg 4042  T
Q  215 caaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatg 314  Q
    || | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4043 cagaaaaattattcctaatgtggtaacttacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatg 4142  T
Q  315 catg 318  Q
    ||||    
T  4143 catg 4146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 22033 - 22351
Alignment:
Q  1 gatgaaacaaggcattaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatac 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||||||||||  ||    
T  22033 gatgaaacaaagcattaaacctgatgttgttacttacagctctttaatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatattcaac 22132  T
Q  101 actatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctct 200  Q
    ||||||||||| || || |||| | || || |||| || ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || |    
T  22133 actatgtctcataggggtgtgactgctaatgttcagagctacaatatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttt 22232  T
Q  201 t--tagaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||||||| |    
T  22233 tcaaagaaatgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataacttatagttcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttgga 22332  T
Q  299 gctagttgatgagatgcat 317  Q
     || || ||||||||||||    
T  22333 acttgtcgatgagatgcat 22351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15063169 - 15062866
Alignment:
Q  17 aaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagag 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||  ||  |||| |||| || |    
T  15063169 aaacttgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcttagttaaacaagtgaacaaggccaagagtttattcaacgttatggctcaaaggg 15063070  T
Q  117 gagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatca 214  Q
    |||| | ||||||  ||   || |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||      
T  15063069 gagtaactcctgacgtttggagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtagatgaagccatgaagctctttgaagaaatgcattg 15062970  T
Q  215 caaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatg 314  Q
     ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | || ||| | ||||||| |||| || ||||| |||    
T  15062969 taaacaaatttttccaaatgtggtaacttacaattcccttgttgatggtttgtgtaaatctggaagaacctcgtgtgctttggagcttgtcgatgaaatg 15062870  T
Q  315 catg 318  Q
    ||||    
T  15062869 catg 15062866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24219518 - 24219245
Alignment:
Q  27 ttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagaggagtgaatcc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || || ||||| |||||  | ||||||||  |||||||| |||| |  ||||||  |||    
T  24219518 ttgttacttataactctttaatgaatggatattgtctggtaaatgaggtgaacaaggccgaaagtatattcaacactatggctcaaattggagtggctcc 24219419  T
Q  127 tgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaacatatt 224  Q
    |||  |||| ||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||  |||||| |||    
T  24219418 tgacgttcatagttacagtatcatgattagtggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaactctttgaagaaatgcattgcaaacaaatt 24219319  T
Q  225 attcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaa 298  Q
     |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||    
T  24219318 tttcccgatgtggtgacgtacaattcccttattgatggtttgtgcaaatcgggaagaatctcatatgctttgaa 24219245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 315
Target Start/End: Original strand, 33997769 - 33997946
Alignment:
Q  140 tacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttta--gaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtgg 237  Q
    ||||||||| | ||| |||| || || ||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||   ||| | |||| |||||||||||    
T  33997769 tacaatatcattattaatggattgtgcaagaaaaaaagggtggatgaagccatgaatctctttaaagagatgcattggaaaaagattaatcctgatgtgg 33997868  T
Q  238 taacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgc 315  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||   | ||||| |||| |||||||||||||    
T  33997869 taacttacaatatccttattgatggtttgtgcaaattagggaaaatctcaacttctttggagcttgttgatgagatgc 33997946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Original strand, 11991151 - 11991321
Alignment:
Q  150 tgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttta--gaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaa 247  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||  || |||||   ||||   |||  |||||||  ||||||||| ||    
T  11991151 tgattaatggattttgtaagattaaaatggttgatgaagccttgagtctctttaatgatatgcagttcaaaggaattgctcctgataaggtaacttataa 11991250  T
Q  248 ttcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||    
T  11991251 ttctctcattgatggtttgtgcaaatcagggagaatctcctatgcttgggagcttgttgatgaaatgcatg 11991321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Original strand, 16350977 - 16351058
Alignment:
Q  236 ggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcat 317  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||| |||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  16350977 ggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaagcagggagaatcccctatgcttgggagcttgttgatgagatgcat 16351058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 84
Target Start/End: Original strand, 11991045 - 11991085
Alignment:
Q  44 ttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggc 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  11991045 ttaatggatggatattgcctagttaaccaagttaataaggc 11991085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Original strand, 10129843 - 10130114
Alignment:
Q  17 aaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagag 116  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||| ||  |||| |  |||| ||| | || || |    
T  10129843 aaacctaacgttgttacttataattctttaatagatggatattgtcttgttaaacaagtgaacaaggctgaggttatactcaacaccatggcccaaaggg 10129942  T
Q  117 gagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctctt--tagaaatgcatca 214  Q
    |||||| | | ||| |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||   |||||||||       
T  10129943 gagtgattgccgatgttcaaagttacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagctattgatctcttcaaagaaatgcaagg 10130042  T
Q  215 caaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctc 286  Q
    || |||  |  ||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  10130043 cagacaactcgttcctgatacgataacttatagttcccttattgatggcttgtgcaaatcagggagaatctc 10130114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4260604 - 4260346
Alignment:
Q  23 gatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagaggagtga 122  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||   |||||  | ||||||||  | |||||| || | || | | ||     
T  4260604 gatgttgttgcttatagctctttaatgaatggatattgccttgttaatgaagtgttcaaggcccaaagtatattcaaaactatggctgaaagggaattgt 4260505  T
Q  123 atcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaaca 220  Q
     |  |||  |||  || ||||||||| ||||| |||  |||||||| || |||| ||| |||||||| || || ||||||  |||||||| || ||||||    
T  4260504 cttatgacgttcgtagctacaatatcatgattaatgaattttgtaaaatgaaaatggtggatgaagccatcaaactctttgaagaaatgcctctcaaaca 4260405  T
Q  221 tattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcgggga 279  Q
     ||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4260404 aatatttcctgacgtggtaacttaccatacccttattgatggtttgtgcaaatccggga 4260346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4264226 - 4263968
Alignment:
Q  23 gatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagaggagtga 122  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||   |||||  | ||||||||  | |||||| || | || | | ||     
T  4264226 gatgttgttgcttatagctctttaatgaatggatattgccttgttaatgaagtgttcaaggcccaaagtatattcaaaactatggctgaaagggaattgt 4264127  T
Q  123 atcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaaca 220  Q
     |  |||  |||  || ||||||||| ||||| |||  |||||||| || |||| ||| |||||||| || || ||||||  |||||||| || ||||||    
T  4264126 cttatgacgttcgtagctacaatatcatgattaatgaattttgtaaaatgaaaatggtggatgaagccatcaaactctttgaagaaatgcctctcaaaca 4264027  T
Q  221 tattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcgggga 279  Q
     ||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4264026 aatatttcctgacgtggtaacttaccatacccttattgatggtttgtgcaaatccggga 4263968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 318
Target Start/End: Original strand, 17251229 - 17251322
Alignment:
Q  225 attcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||  |  ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  17251229 attcctgatgtagtagcttatagttctcttattgatggtttgtgcaaatcaggtagaatcaatagtgctttgaagtatgttgatgagatgcatg 17251322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 82
Target Start/End: Original strand, 41316003 - 41316040
Alignment:
Q  45 taatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataag 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41316003 taatggagggatattgcctagttaatgaagtgaataag 41316040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 5)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 318
Target Start/End: Original strand, 137080 - 137383
Alignment:
Q  17 aaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagag 116  Q
    ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||   | | |||  ||||||  |||  |  |    
T  137080 aaaccagatgttgttacatacaattcattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggccaaacatgttttaagcactattgctcgaatgg 137179  T
Q  117 gagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttta--gaaatgc-atc 213  Q
    |||||  |||||||  ||| || || |||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||  |     
T  137180 gagtggctcctgatgctcagagctataatatcatgattaatggattctgtaagattaaaatggtcaatgaagctttgagtctctttaatgaaatgcgttg 137279  T
Q  214 acaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagat 313  Q
     |||| | |||  |||  ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || | ||||||  |||||| |||||| || ||||||||    
T  137280 tcaaaga-atttctcccaatacggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaatcaggtagaatctcccatgcttggaagcttgtcgatgagat 137378  T
Q  314 gcatg 318  Q
    |||||    
T  137379 gcatg 137383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 308
Target Start/End: Original strand, 140031 - 140297
Alignment:
Q  44 ttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttaca 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   | | ||  ||| ||| ||||| |  ||||||  |||||||  ||| |  || |    
T  140031 ttaatggatggatattgcctagttaatgaagtaaataaggccaaacatgtgttcaacattatttctcaaatgggagtggctcctgatgctcatacctata 140130  T
Q  144 atatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttt--agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaac 241  Q
     |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||   ||||||| || || |   |||  |||| ||  ||||||    
T  140131 gtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggttgatgaagccttgagtctctttgatgaaatgcgtcgcagaggaattgctcctaatacggtaac 140230  T
Q  242 ttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgat 308  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||| | ||||||| | |||| ||||||    
T  140231 ttacaattctctcattgatggtttatgcaaatcagggagaatcccctatgcttgggagcttgttgat 140297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 104810 - 104728
Alignment:
Q  236 ggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| | |||| || |||||||||||||    
T  104810 ggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatctgggagattctcttgtgcttgggagcttgtggatgagatgcatg 104728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 121756 - 121692
Alignment:
Q  25 tgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaaga 89  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  121756 tgttgttacatataatacattaatggatgggtattgcctagataatgaagtgaataaggcaaaga 121692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 121552 - 121470
Alignment:
Q  236 ggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||| | | ||||  ||||| |||||||||    
T  121552 ggtaacttacagttctcttattgatgctttgtgcaaatcagggagaatctctcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatg 121470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 315
Target Start/End: Original strand, 3151 - 3239
Alignment:
Q  227 tcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgc 315  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  3151 tcctgatacggtaacttacaattctctaattgatggtttgtgcaaatctgggagaatctcctatgcttgggagcttgttgatgagatgc 3239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 318
Target Start/End: Original strand, 8834 - 9004
Alignment:
Q  150 tgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctcttta--gaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaa 247  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||  | |||||||||| ||| || ||||||  ||||||||   |||| | ||||| ||| ||  |||||||||||     
T  8834 tgattaatgggttgtgtaagaataaattgatcgatgaagccatggatttctttaaagaaatgcaaagcaaaaagattatccctaatacggtaacttacag 8933  T
Q  248 ttcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||| | || |  |||||||||||||||    
T  8934 ttctcttattgatggtttgtgcaaatcagggagaatttctcatgcttgggagttgcttgatgagatgcatg 9004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 126410 - 126349
Alignment:
Q  23 gatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggc 84  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  126410 gatgttgttacctacaattcattaatggatggatattgcctagttaatgaagtcaataaggc 126349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 126195 - 126113
Alignment:
Q  236 ggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||| | | || ||||||||||||||||    
T  126195 ggtaacttacagttcgctcattgatggtttgtgcaaatctgggagatactcttatgcttgggaccttgttgatgagatgcatg 126113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43550 - 43406
Alignment:
Q  45 taatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacactatgtctcagagaggagtgaatcctgatattcaaagttacaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||   | | |||  ||||||  |||| |  ||||||  |||||||  ||| || || ||    
T  43550 taatggatggatattgcctagttaatgaagtcaataaggccaaacatgttttaagcactattactcaaatgggagtgcctcctgatgctcagagctataa 43451  T
Q  145 tatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagc 189  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43450 tatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtcaatgaagc 43406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47973 - 47893
Alignment:
Q  238 taacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| | |||| | |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  47973 taacttacagttcgctcattgatggtttgtgcaaagctgggagattctcttgtgcttgggagcttgttgatgagatgcatg 47893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43356 - 43278
Alignment:
Q  237 gtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgc 315  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  || | |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  43356 gtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaattaggtagaatctcctatgcttgggagcttgttgatgagatgc 43278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 84
Target Start/End: Original strand, 5930 - 5969
Alignment:
Q  45 taatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggc 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5930 taatggatggatattgcctagttaatgaagtgaataaggc 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 315
Target Start/End: Original strand, 6124 - 6202
Alignment:
Q  237 gtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgc 315  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||| | || | |||||||||||||    
T  6124 gtaacttacagttctctcattgatggtttgtgtaaattaggtagaatctcctatgcttgggagtttgttgatgagatgc 6202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 317
Target Start/End: Original strand, 3642955 - 3643045
Alignment:
Q  227 tcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcat 317  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || | ||| || ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  3642955 tcctgatacggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaattaggaagaatatcctatgcttggcagcttgttgatgagatgcat 3643045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 84
Target Start/End: Original strand, 3642749 - 3642810
Alignment:
Q  23 gatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggc 84  Q
    ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3642749 gatgttgttacctacagttcattaatggatggatattgtctagttaatgaagtgaataaggc 3642810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0654 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0654
Description:

Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 1210
Alignment:
Q  227 tcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatg 318  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||| | | ||||  ||||| |||||||||    
T  1301 tcctgataaggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaagcagggaaaatttctcatgcatgggagcttcttgattagatgcatg 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0652 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0652
Description:

Target: scaffold0652; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1552 - 1507
Alignment:
Q  44 ttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaaga 89  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  1552 ttaatggatgggtattgcctagctaatgaagtgaataaggcaaaga 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1840 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1840
Description:

Target: scaffold1840; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Original strand, 1121 - 1185
Alignment:
Q  23 gatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaa 87  Q
    ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  1121 gatgttgttacctacagttcattaatggatggatattgtcttgttaatgaagttaataaggctaa 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University