View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4347_high_5 (Length: 246)

Name: NF4347_high_5
Description: NF4347
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4347_high_5
NF4347_high_5
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (49-239)||(6330945-6331136)
chr6 (49-239)||(3652408-3652599)
chr6 (53-239)||(20126215-20126402)
chr6 (49-239)||(23986350-23986541)
chr6 (49-245)||(20896715-20896912)
chr6 (125-239)||(14771752-14771866)
chr6 (125-239)||(16519967-16520081)
chr6 (49-239)||(2681249-2681440)
chr6 (49-239)||(21311893-21312084)
chr6 (124-226)||(17731159-17731261)
chr6 (105-239)||(23776420-23776554)
chr6 (49-226)||(2720610-2720788)
chr6 (121-239)||(7911873-7911991)
chr6 (121-239)||(7912305-7912423)
chr6 (121-239)||(13492784-13492902)
chr6 (121-239)||(17027564-17027682)
chr6 (125-233)||(31821731-31821839)
chr6 (49-239)||(20850243-20850434)
chr6 (121-239)||(13191546-13191664)
chr6 (126-239)||(9352062-9352175)
chr6 (115-239)||(11062275-11062398)
chr6 (52-239)||(15929507-15929695)
chr6 (121-215)||(9440485-9440579)
chr6 (125-239)||(9440342-9440456)
chr6 (101-239)||(17851349-17851487)
chr6 (127-239)||(20735696-20735808)
chr6 (115-239)||(27334150-27334274)
chr6 (115-239)||(27394890-27395014)
chr6 (125-239)||(21311514-21311628)
chr6 (51-195)||(3652903-3653048)
chr6 (146-239)||(15929219-15929312)
chr6 (105-239)||(17850897-17851031)
chr6 (128-226)||(32292887-32292985)
chr6 (162-239)||(20732614-20732691)
chr6 (128-233)||(28065877-28065982)
chr6 (162-223)||(10964340-10964401)
chr6 (125-245)||(2890866-2890985)
chr6 (191-239)||(13492397-13492445)
chr6 (171-245)||(9440884-9440958)
chr6 (175-233)||(28583012-28583070)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (49-239)||(33174880-33175071)
chr2 (49-239)||(1706964-1707154)
chr2 (105-239)||(33174484-33174616)
chr2 (105-239)||(11388168-11388300)
chr2 (105-239)||(18098911-18099045)
chr2 (121-239)||(30966229-30966347)
chr2 (49-233)||(18447957-18448142)
chr2 (111-239)||(1912510-1912638)
chr2 (125-239)||(1953154-1953268)
chr2 (51-239)||(38898945-38899134)
chr2 (52-239)||(41754214-41754402)
chr2 (49-239)||(29804604-29804795)
chr2 (121-239)||(30966685-30966803)
chr2 (49-239)||(25338030-25338221)
chr2 (134-239)||(8256534-8256639)
chr2 (118-239)||(16379385-16379506)
chr2 (49-233)||(25434095-25434280)
chr2 (122-239)||(29259653-29259770)
chr2 (121-233)||(24818321-24818433)
chr2 (127-239)||(16378938-16379050)
chr2 (124-239)||(5399850-5399965)
chr2 (137-226)||(8181397-8181486)
chr2 (146-239)||(11394555-11394647)
chr2 (115-239)||(15619887-15620011)
chr2 (135-239)||(30963753-30963857)
chr2 (49-239)||(33770932-33771114)
chr2 (125-236)||(30961919-30962038)
chr2 (162-239)||(8073928-8074005)
chr2 (125-226)||(16541984-16542085)
chr2 (125-239)||(27882959-27883073)
chr2 (121-226)||(83012-83117)
chr2 (162-239)||(13191010-13191087)
chr2 (128-233)||(30963302-30963407)
chr2 (136-187)||(9909102-9909153)
chr2 (176-231)||(20502073-20502128)
chr2 (198-239)||(15639806-15639847)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (49-239)||(50398565-50398756)
chr4 (121-239)||(44471352-44471470)
chr4 (49-239)||(50399020-50399210)
chr4 (51-239)||(4127464-4127654)
chr4 (106-226)||(29628707-29628827)
chr4 (49-239)||(1645776-1645967)
chr4 (125-239)||(4127916-4128030)
chr4 (105-215)||(53854858-53854968)
chr4 (106-239)||(3169186-3169319)
chr4 (52-239)||(23942816-23943001)
chr4 (49-239)||(12692026-12692217)
chr4 (124-239)||(14572177-14572292)
chr4 (101-239)||(1464122-1464260)
chr4 (121-239)||(23350310-23350428)
chr4 (121-238)||(44470902-44471019)
chr4 (115-239)||(21220358-21220482)
chr4 (121-233)||(35871623-35871735)
chr4 (49-239)||(51331308-51331499)
chr4 (121-239)||(49998631-49998749)
chr4 (53-239)||(9423885-9424072)
chr4 (107-239)||(53996142-53996274)
chr4 (129-239)||(8467827-8467937)
chr4 (106-239)||(24629460-24629593)
chr4 (105-239)||(21067261-21067395)
chr4 (120-245)||(24628998-24629126)
chr4 (121-245)||(14571742-14571866)
chr4 (121-245)||(41869913-41870037)
chr4 (56-226)||(21067666-21067834)
chr4 (49-233)||(27026426-27026610)
chr4 (128-236)||(24271580-24271690)
chr4 (161-239)||(7678649-7678727)
chr4 (105-239)||(14351774-14351908)
chr4 (121-231)||(17028869-17028979)
chr4 (125-223)||(27578952-27579050)
chr4 (137-239)||(43928990-43929092)
chr4 (106-239)||(13613924-13614057)
chr4 (49-239)||(31817425-31817616)
chr4 (130-233)||(42838628-42838730)
chr4 (166-239)||(27029317-27029390)
chr4 (121-236)||(17029325-17029440)
chr4 (176-239)||(17628561-17628624)
chr4 (176-239)||(23943269-23943332)
chr4 (176-239)||(31817879-31817942)
chr4 (129-236)||(53391890-53391997)
chr4 (128-239)||(26200312-26200425)
chr4 (128-233)||(52048699-52048804)
chr4 (104-144)||(44830977-44831017)
chr4 (180-239)||(23976246-23976305)
chr4 (164-239)||(33764898-33764973)
chr4 (124-159)||(35477801-35477836)
chr4 (111-149)||(10165939-10165977)
chr4 (64-149)||(33987188-33987274)
chr4 (162-239)||(4185751-4185828)
chr4 (124-233)||(13266084-13266193)
chr4 (133-213)||(2499647-2499727)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (105-239)||(2044037-2044171)
chr8 (49-239)||(8080375-8080566)
chr8 (49-239)||(22840562-22840753)
chr8 (49-239)||(28453261-28453451)
chr8 (121-239)||(34308512-34308630)
chr8 (49-233)||(27022377-27022562)
chr8 (131-239)||(17103086-17103194)
chr8 (112-223)||(29971450-29971561)
chr8 (49-239)||(10844805-10844996)
chr8 (49-239)||(22549028-22549219)
chr8 (121-220)||(34308991-34309090)
chr8 (49-239)||(41659138-41659328)
chr8 (121-239)||(25147531-25147649)
chr8 (49-239)||(22026301-22026492)
chr8 (125-239)||(6464943-6465057)
chr8 (106-239)||(27925879-27926012)
chr8 (115-239)||(12827287-12827411)
chr8 (120-239)||(33852291-33852410)
chr8 (121-239)||(12100687-12100804)
chr8 (135-233)||(22705181-22705279)
chr8 (49-239)||(27021912-27022107)
chr8 (105-239)||(28375087-28375221)
chr8 (49-239)||(22548582-22548773)
chr8 (121-239)||(25147962-25148080)
chr8 (125-239)||(27819279-27819393)
chr8 (115-239)||(32292386-32292510)
chr8 (161-232)||(3744673-3744744)
chr8 (129-239)||(10844648-10844758)
chr8 (121-239)||(25144767-25144885)
chr8 (124-233)||(21316148-21316257)
chr8 (125-239)||(30334941-30335055)
chr8 (162-239)||(1297043-1297120)
chr8 (49-189)||(25307687-25307828)
chr8 (126-226)||(17429501-17429600)
chr8 (138-233)||(15568044-15568139)
chr8 (121-239)||(15567589-15567707)
chr8 (164-234)||(36968433-36968503)
chr8 (170-239)||(3745145-3745214)
chr8 (162-231)||(41913006-41913075)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (105-233)||(18173-18301)
scaffold0047 (105-225)||(17645-17765)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (49-239)||(6747631-6747822)
chr7 (105-239)||(42515523-42515657)
chr7 (49-239)||(2611685-2611876)
chr7 (124-239)||(42515090-42515205)
chr7 (121-239)||(9124954-9125072)
chr7 (49-239)||(34405624-34405815)
chr7 (121-239)||(2941790-2941908)
chr7 (53-226)||(26957603-26957777)
chr7 (121-233)||(11517428-11517539)
chr7 (107-239)||(28495835-28495967)
chr7 (120-239)||(6719107-6719226)
chr7 (105-239)||(679796-679929)
chr7 (128-226)||(25182363-25182461)
chr7 (125-239)||(29039053-29039167)
chr7 (125-239)||(35474154-35474268)
chr7 (115-233)||(43233402-43233520)
chr7 (106-238)||(2193236-2193368)
chr7 (121-239)||(13125169-13125287)
chr7 (125-239)||(28495641-28495755)
chr7 (125-239)||(36422251-36422365)
chr7 (125-239)||(46425740-46425854)
chr7 (121-233)||(5406627-5406739)
chr7 (49-207)||(3305377-3305536)
chr7 (121-239)||(18833281-18833399)
chr7 (175-236)||(26421341-26421402)
chr7 (52-239)||(2189069-2189257)
chr7 (115-245)||(22529262-22529392)
chr7 (161-239)||(2465959-2466037)
chr7 (105-239)||(29357489-29357622)
chr7 (125-239)||(31406617-31406731)
chr7 (115-245)||(35527148-35527278)
chr7 (170-239)||(2465777-2465846)
chr7 (106-239)||(9623188-9623321)
chr7 (106-226)||(33316707-33316828)
chr7 (121-216)||(13124757-13124852)
chr7 (115-231)||(36015452-36015568)
chr7 (130-236)||(20966055-20966161)
chr7 (161-225)||(11372486-11372550)
chr7 (155-206)||(16811912-16811963)
chr7 (180-226)||(6585662-6585708)
chr7 (121-239)||(31743857-31743975)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (49-239)||(30529609-30529800)
chr3 (105-239)||(39640916-39641050)
chr3 (51-239)||(28561670-28561859)
chr3 (105-239)||(20885150-20885283)
chr3 (50-239)||(32227254-32227444)
chr3 (105-239)||(25230738-25230872)
chr3 (105-239)||(25238325-25238459)
chr3 (122-239)||(41472297-41472413)
chr3 (49-239)||(16811303-16811494)
chr3 (49-239)||(39653086-39653277)
chr3 (121-239)||(31284309-31284427)
chr3 (126-239)||(7493881-7493994)
chr3 (49-239)||(50347668-50347859)
chr3 (105-239)||(25230281-25230415)
chr3 (105-239)||(25237868-25238002)
chr3 (125-239)||(32796968-32797082)
chr3 (134-239)||(11180067-11180172)
chr3 (104-245)||(13150126-13150267)
chr3 (115-239)||(14813938-14814062)
chr3 (125-239)||(25239110-25239224)
chr3 (126-239)||(7477191-7477304)
chr3 (122-239)||(41473993-41474110)
chr3 (49-239)||(16810847-16811038)
chr3 (121-239)||(25248106-25248224)
chr3 (105-239)||(32227480-32227613)
chr3 (105-239)||(37045014-37045148)
chr3 (115-239)||(2911084-2911208)
chr3 (162-245)||(32386761-32386844)
chr3 (124-233)||(8067278-8067387)
chr3 (166-239)||(25238717-25238790)
chr3 (49-219)||(25803057-25803228)
chr3 (128-239)||(29224326-29224437)
chr3 (169-239)||(13150587-13150657)
chr3 (178-239)||(4067393-4067454)
chr3 (124-239)||(27187363-27187478)
chr3 (162-239)||(31103993-31104070)
chr3 (135-239)||(25802581-25802685)
chr3 (106-233)||(14820134-14820261)
chr3 (121-185)||(12820639-12820703)
chr3 (176-233)||(47518358-47518415)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (49-239)||(43057556-43057747)
chr1 (49-239)||(30872983-30873175)
chr1 (49-239)||(43057098-43057288)
chr1 (125-239)||(50002740-50002854)
chr1 (49-239)||(16451966-16452157)
chr1 (49-239)||(16461119-16461310)
chr1 (49-239)||(20054113-20054304)
chr1 (49-239)||(20054569-20054760)
chr1 (49-239)||(20055025-20055216)
chr1 (49-239)||(20055481-20055672)
chr1 (49-239)||(20055937-20056128)
chr1 (49-239)||(20056393-20056584)
chr1 (49-239)||(20057296-20057487)
chr1 (124-239)||(35760947-35761062)
chr1 (115-239)||(50002318-50002442)
chr1 (49-239)||(20845694-20845885)
chr1 (124-239)||(35759641-35759756)
chr1 (49-239)||(52250128-52250319)
chr1 (126-239)||(31822696-31822809)
chr1 (49-239)||(12883446-12883637)
chr1 (121-239)||(2328310-2328428)
chr1 (121-239)||(7548086-7548204)
chr1 (121-239)||(20061224-20061342)
chr1 (115-239)||(20057752-20057876)
chr1 (106-233)||(38340886-38341013)
chr1 (51-233)||(51372913-51373096)
chr1 (105-223)||(10820571-10820689)
chr1 (120-245)||(50003102-50003227)
chr1 (124-239)||(46693768-46693884)
chr1 (49-239)||(20056849-20057031)
chr1 (124-226)||(23180728-23180830)
chr1 (125-239)||(2634923-2635037)
chr1 (161-239)||(12728026-12728105)
chr1 (162-245)||(16907270-16907353)
chr1 (176-239)||(16440612-16440675)
chr1 (181-239)||(20060373-20060431)
chr1 (158-239)||(2739554-2739635)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (107-239)||(10927436-10927568)
chr5 (49-239)||(42788679-42788869)
chr5 (49-239)||(20039507-20039698)
chr5 (106-239)||(39146919-39147052)
chr5 (107-239)||(17445488-17445620)
chr5 (121-239)||(3887090-3887208)
chr5 (50-233)||(10926985-10927170)
chr5 (49-239)||(2193738-2193929)
chr5 (121-239)||(189063-189181)
chr5 (121-239)||(2474400-2474518)
chr5 (111-239)||(42429131-42429258)
chr5 (121-239)||(2473954-2474072)
chr5 (121-239)||(22556531-22556649)
chr5 (105-239)||(27646868-27647002)
chr5 (106-239)||(34867770-34867903)
chr5 (124-239)||(1821904-1822019)
chr5 (125-239)||(8391355-8391468)
chr5 (105-239)||(11160714-11160848)
chr5 (121-239)||(22556964-22557082)
chr5 (125-238)||(2058690-2058803)
chr5 (49-239)||(4658026-4658216)
chr5 (124-239)||(8642067-8642182)
chr5 (124-239)||(3886634-3886749)
chr5 (49-239)||(34371534-34371725)
chr5 (49-239)||(34371990-34372181)
chr5 (115-239)||(21886179-21886303)
chr5 (108-239)||(5066924-5067055)
chr5 (112-239)||(15513045-15513173)
chr5 (128-226)||(16370754-16370852)
chr5 (105-239)||(18304410-18304544)
chr5 (121-206)||(22975076-22975161)
chr5 (164-239)||(24182278-24182353)
chr5 (136-195)||(29680177-29680236)
chr5 (121-239)||(5549339-5549458)
chr5 (140-239)||(18750229-18750328)
chr5 (125-239)||(30719838-30719952)
chr5 (164-233)||(39801501-39801571)
chr5 (171-239)||(4673504-4673572)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (49-239)||(2664-2855)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (121-239)||(162711-162829)
scaffold0022 (162-225)||(69862-69925)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (121-239)||(107496-107614)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (124-239)||(245084-245199)
scaffold0005 (121-245)||(245510-245634)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (121-239)||(2243-2361)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (121-239)||(105715-105833)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (121-239)||(142307-142425)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (49-239)||(1142-1333)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (121-239)||(18961-19079)
scaffold0322 (122-189)||(18204-18271)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (104-245)||(154735-154876)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (121-233)||(10295-10407)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (120-239)||(2084-2203)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (115-238)||(23662-23785)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (106-239)||(4541-4674)
scaffold0333 (106-239)||(4996-5134)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (126-226)||(45387-45486)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (124-239)||(4015-4130)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (105-174)||(729-798)
scaffold0557 (171-239)||(2150-2218)
[»] scaffold1138 (1 HSPs)
scaffold1138 (157-195)||(774-812)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6331136 - 6330945
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||  ||    
T  6331136 ggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagatgga 6331037  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6331036 tcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaatatgcatcttctt 6330945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 3652408 - 3652599
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  3652408 ggctgatgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggga 3652507  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3652508 tcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtctgatactacctatatcaacaagatgcatcttctt 3652599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20126402 - 20126215
Alignment:
Q  53 gacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 151  Q
    ||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||   |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20126402 gacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcctgacaacttctagacaagctgaatcacatcggaatgagagggatcct 20126303  T
Q  152 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
     | || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20126302 aaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaatggtttgatactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20126215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23986541 - 23986350
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23986541 ggctgacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggga 23986442  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  23986441 tccggaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctatatgaacaagatgcatcttctt 23986350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20896912 - 20896715
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | |  | || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  20896912 ggctgacgaggacggagagtggtcgccgttgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 20896813  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  20896812 tccttaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagt 20896715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14771866 - 14771752
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14771866 gaatcacgccggaatgagagggatcccgaagccgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 14771767  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || || |||||||||    
T  14771766 aagatccatattctt 14771752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Original strand, 16519967 - 16520081
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16519967 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaaggaaggcttatgagatttgtttggtactacctatatcaac 16520066  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  16520067 aagatgcatcttctt 16520081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2681440 - 2681249
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||  |||||||| | ||   ||||  || |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  2681440 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtacacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagtttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 2681341  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  2681340 tcctgaggccgtgtaggtttgggactgcatggttgaatgaagacttataagaattgtttggtactacccatatcaacaagatgcatcttctt 2681249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 21311893 - 21312084
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| || |||||| ||||||||| ||||  ||| | ||| || | ||||||||||||| | ||||||||| |     
T  21311893 ggctgacgagggcgggaagtggtcgccagtgcacaaggcacaacaatgagcgactcccgatagcttctaaaggaactgaatcacaccagaatgagagggt 21311992  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21311993 tcatgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 21312084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17731261 - 17731159
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17731261 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgttcaggtatgggactgcatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 17731162  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  17731161 caa 17731159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 23776420 - 23776554
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23776420 cgacagcttctagaggaactgaatcacgccggaatgagaggtatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaatcgt 23776519  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
     || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23776520 ctggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 23776554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2720788 - 2720610
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||| ||  |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||  ||||| | ||||||||||| ||    
T  2720788 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaagtcacgacaatgagcgacttcggacagcttctagacgaaccaaatcataccggaatgagaggga 2720689  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||  | | |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2720688 tcccaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaa 2720610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 7911873 - 7911991
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7911873 aactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtataggactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatat 7911972  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  7911973 caacaagatgcatcttctt 7911991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 7912305 - 7912423
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  7912305 aactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaaacttatatgaattgtttggtactacctatat 7912404  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  7912405 caacaagatgcattttctt 7912423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 13492784 - 13492902
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  13492784 aactgaatcatatcggaatgagaaggatcctgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatat 13492883  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  13492884 caacaagatgcatcttctt 13492902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17027682 - 17027564
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17027682 aactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 17027583  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| || ||| |||||    
T  17027582 caacaagattcatcttctt 17027564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31821839 - 31821731
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  31821839 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattatttggtactaactatatcaac 31821740  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  31821739 aagatgcat 31821731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 20850243 - 20850434
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20850243 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20850342  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20850343 tcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttttgtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20850434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13191664 - 13191546
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |  |  | |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13191664 aactaaatcacatcggaatgagagggatcctaagactatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 13191565  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  13191564 caacaagatgcatcttctt 13191546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Original strand, 9352062 - 9352175
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  9352062 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaagggagacttataatatttgtttggtactacctatataaaca 9352161  T
Q  226 acatgcatattctt 239  Q
    | |||||| |||||    
T  9352162 agatgcatcttctt 9352175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 11062275 - 11062398
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||    
T  11062275 tagaggaaccgaatcacatcgacatgagag-gatcctgaggctgtgtaggtatgaaactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgttttgtactac 11062373  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||| |||||| |||||    
T  11062374 ctatatcaacaagatgcatcttctt 11062398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 15929507 - 15929695
Alignment:
Q  52 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcc 150  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||  || |||||||||| |||||||| | ||   |||||||| |||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  15929507 tgacgagggccgggtgtggtcgttggtgcataaggcatgacaatgagcggctccggacaacttctagatgaatcgaatcacatcagaataagagagatcc 15929606  T
Q  151 tgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    | | ||| | || ||||  ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15929607 taatgccttgtatgtattggactacatggttgaatgaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaacaaaatgcatcttctt 15929695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9440579 - 9440485
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  9440579 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgggacttcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacc 9440485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9440456 - 9440342
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||  |||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||    
T  9440456 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaatgaaagcttataagaattgttcggtactacttatatcaac 9440357  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  9440356 aagatgcattttctt 9440342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 239
Target Start/End: Original strand, 17851349 - 17851487
Alignment:
Q  101 ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaa 200  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||  |||||| || |||| ||||| |||     
T  17851349 ctttagacaacttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagagggatcccgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaaggcttataagat 17851448  T
Q  201 ttgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
     |||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  17851449 atgtttggtactacctttatcaacaagatgcatcttctt 17851487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 239
Target Start/End: Original strand, 20735696 - 20735808
Alignment:
Q  127 atcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||||||||  |||||||| |||| |||  | || |||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20735696 atcacatcataatgagagggatcttgagactgtgtaggtatgtgactacatgattgtaggaaggcttataagaattgtttgatactacttatatcaacaa 20735795  T
Q  227 catgcatattctt 239  Q
     |||||| |||||    
T  20735796 gatgcatcttctt 20735808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 27334150 - 27334274
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| | |||  |||||||  |||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27334150 tagaggaactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactac 27334249  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||| ||| || |||||    
T  27334250 ctatatcaacaagatgaatcttctt 27334274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 27394890 - 27395014
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| | |||  |||||||  |||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27394890 tagaggaactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactac 27394989  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||| ||| || |||||    
T  27394990 ctatatcaacaagatgaatcttctt 27395014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Original strand, 21311514 - 21311628
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| || |||    
T  21311514 gaatcacatcggaatgagagggttcatgaggccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaagccttataagaattgtttggtattacctagataaac 21311613  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || || ||| |||||    
T  21311614 aagatccatcttctt 21311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Original strand, 3652903 - 3653048
Alignment:
Q  51 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  3652903 ctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagatgaaccgactcacatcggaatgagagggatc 3653002  T
Q  150 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat 195  Q
    |||| || || |||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||    
T  3653003 ctgaggctgtgtaggtatgggactgcatggttgaacgaaggcttat 3653048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 239
Target Start/End: Original strand, 15929219 - 15929312
Alignment:
Q  146 gatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||| || | |||||||||| || ||||||||||||    
T  15929219 gatcctgaggccgtttaggtatgagactacaaggttgaagaaaagcttataagaattgtttggtaatgcctatatcaataagatgcatattctt 15929312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 17850897 - 17851031
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| ||||  |||||| || |||  || || |||  |||    
T  17850897 cgacaacttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaatgctgataagatatgt 17850996  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  17850997 ttggtactacctttatcaacaagatgcatcttctt 17851031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Original strand, 32292887 - 32292985
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |   |||  ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32292887 tcacattggaatgagagaaatccttagatcgtgcaggtatgagactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaa 32292985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 239
Target Start/End: Original strand, 20732614 - 20732691
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  20732614 aggtatgtgactacatggttgtaggaaggcttataagaattatttggtactacctatattaataatatgcatattctt 20732691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28065982 - 28065877
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||  |||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||     
T  28065982 tcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgtagaaatgagactgtatgattgaatgaaagcttataagaattgtttggtactatctctatcaacaag 28065883  T
Q  228 atgcat 233  Q
    ||||||    
T  28065882 atgcat 28065877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 10964340 - 10964401
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10964340 aggtatgagactgtatggtagaagaaagacttacaagaattgtttggtactacatatatcaa 10964401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2890985 - 2890866
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||| |  ||||||||||||||     
T  2890985 gaatcacattagaatgagag-gatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttataagaattgttagggactacctatatcaaa 2890887  T
Q  225 aacatgcatattcttctcagt 245  Q
    || |||| | ||||| |||||    
T  2890886 aagatgcttcttcttttcagt 2890866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 239
Target Start/End: Original strand, 13492397 - 13492445
Alignment:
Q  191 cttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13492397 cttataagaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcatcttctt 13492445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9440958 - 9440884
Alignment:
Q  171 actatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  9440958 actacatggttgaaggaatgcttataagaattctttggtactacttttatcaacaagatgcattttcttttcagt 9440884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Original strand, 28583012 - 28583070
Alignment:
Q  175 tatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28583012 tatggttgaatgaaggcttataagaattatttgatacgatctatatcaacaagatgcat 28583070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 33174880 - 33175071
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  33174880 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagtggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 33174979  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33174980 tcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 33175071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 1706964 - 1707154
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||  |||||||| | ||  |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1706964 ggctaacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaatttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagag-ga 1707062  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||  | || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1707063 tcctgagactgtgtaggtatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 1707154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 33174484 - 33174616
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33174484 cgacagcttctagacgaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgatgccgtgtaggtatgggactaca--gttgaaggaaggcttataagaattgt 33174581  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33174582 ttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 33174616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 11388168 - 11388300
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||    
T  11388168 cgacaacttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagag-gatcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgctta-aaaaattgt 11388265  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11388266 ttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 11388300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18099045 - 18098911
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18099045 cgacagcttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggaatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaagggatgcttataagaattgt 18098946  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18098945 ttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 18098911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 30966229 - 30966347
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30966229 aactgaatcgcatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 30966328  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  30966329 caacaagatgcatcttctt 30966347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18448142 - 18447957
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttc-gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | || || ||||||  ||||||||   || | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  18448142 ggctggcgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggttcccgacagcttttagaggaaccgaatcacatcggaatgataggga 18448043  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||    
T  18448042 tcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaagtaagacttataagaattgtttggtactacttgtatcaacaagatgcat 18447957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Original strand, 1912510 - 1912638
Alignment:
Q  111 cttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgata 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   | |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||    
T  1912510 cttttagaggaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggttatgtaggtatgagactacatggttgaaagtagatttataagaattgtttggta 1912609  T
Q  211 ctacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1912610 ctacctatatcaacaagatgcatcttctt 1912638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Original strand, 1953154 - 1953268
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1953154 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacctataagaattgtttggtactacctatatcaac 1953253  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
     | |||||| |||||    
T  1953254 tagatgcatcttctt 1953268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 38899134 - 38898945
Alignment:
Q  51 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||| | |||||| | ||  ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  38899134 ctgacgagggcggggagtggtcgttggtgcataagacatgaaaatgagtggctcccgacaacttctagacaagccaaatcacatcggaaggagagtgatc 38899035  T
Q  150 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
     ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38899034 ttgaggccgtgtaggtatcagactacatggttgaaggagagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctt 38898945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 41754214 - 41754402
Alignment:
Q  52 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcc 150  Q
    |||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||     
T  41754214 tgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggttct 41754313  T
Q  151 tgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  41754314 tgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttctt 41754402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 29804604 - 29804795
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  | |||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  29804604 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgataatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 29804703  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29804704 tcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggcaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 29804795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 30966685 - 30966803
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30966685 aactgaatcgcatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatat 30966784  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  30966785 caacaagatgcatcttctt 30966803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25338221 - 25338030
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  25338221 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggt 25338122  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25338121 tcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 25338030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Original strand, 8256534 - 8256639
Alignment:
Q  134 cggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  8256534 cggaatgagagggatcttgaagccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 8256633  T
Q  234 attctt 239  Q
     |||||    
T  8256634 cttctt 8256639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 239
Target Start/End: Original strand, 16379385 - 16379506
Alignment:
Q  118 acgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactaccta 217  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16379385 acgaaccgaatcaaattggaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatacgaattgtttggtactaccta 16379484  T
Q  218 tatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  16379485 tatcaacaagatgcatcttctt 16379506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25434280 - 25434095
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  25434280 ggctgacgagggcggggagtggccgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctaaacgaaccgaatcacaccggaatgagaggga 25434181  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||   |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  25434180 tcctgaggccgtgctggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatacaacctttatcaacaagatgcat 25434095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29259770 - 29259653
Alignment:
Q  122 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  29259770 actgaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttattaaaattgtttggtactacatatatc 29259671  T
Q  222 aacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  29259670 aacaagatgcatcttctt 29259653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 24818321 - 24818433
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  24818321 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatat 24818420  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  24818421 caacaagatgcat 24818433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 239
Target Start/End: Original strand, 16378938 - 16379050
Alignment:
Q  127 atcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | || |||||  | ||||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16378938 atcacaccggaatgagagggattccgaggccgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagtcttatacgaattgtttgatactacctatatcaacaa 16379037  T
Q  227 catgcatattctt 239  Q
     |||||| |||||    
T  16379038 gatgcatcttctt 16379050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5399965 - 5399850
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  | ||||| || | ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5399965 tgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaagtatgggagtgtatggtttaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 5399866  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| |||||    
T  5399865 caagatgcatcttctt 5399850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8181486 - 8181397
Alignment:
Q  137 aatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||||| ||||| ||  || |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8181486 aatgagagggatcccgagaccttataggtatgggactttgtggttgaaggaagacttttaagaattgtttggtactacctatatcaacaa 8181397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 239
Target Start/End: Original strand, 11394555 - 11394647
Alignment:
Q  146 gatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11394555 gatcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgctta-aaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 11394647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 15619887 - 15620011
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||  || |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15619887 tagacgaaccgaattacatcagaatgagagggatcccgatgccgtgcaagtatgagactgcatagttgaaggcaagcttataagaattgtttggtactac 15619986  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||| || ||| |||||    
T  15619987 ctatatcaacaagatacatcttctt 15620011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30963857 - 30963753
Alignment:
Q  135 ggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcata 234  Q
    |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||     
T  30963857 ggaatgagagggatcatgaagccgtgcaggtaagagaatgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtatggttctacctatatcaacaagatgcatc 30963758  T
Q  235 ttctt 239  Q
    |||||    
T  30963757 ttctt 30963753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 33770932 - 33771114
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  33770932 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggt 33771031  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||         |||||| ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33771032 tcctga---------ggtatgggactgcagggttgaagaaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 33771114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30962038 - 30961919
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttga--------aggaagacttatgagaattgtttgatactacct 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||        |||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  30962038 gaatcacatcagaatgagagagatcctgaagccgtgtaggtatgggattgcatggttgaaggatttaaggaagtcttataagatttgattggtactacct 30961939  T
Q  217 atatcaacaacatgcatatt 236  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  30961938 atatcaacaagatgcatatt 30961919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 239
Target Start/End: Original strand, 8073928 - 8074005
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  8073928 aggtatgggtctataaggttgaagggagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttctt 8074005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Original strand, 16541984 - 16542085
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||| |||||| || |||||   ||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16541984 gaatcacatcagaatgatagggatcccagagctgtgtaggtatgactctacatggttgaaggaagacttataataattgttttgtactacctatatcaac 16542083  T
Q  225 aa 226  Q
    ||    
T  16542084 aa 16542085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27883073 - 27882959
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||  || ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||     
T  27883073 gaatcacaccgaaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgagactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtattatctatatcaat 27882974  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  27882973 aagatgcatcttctt 27882959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 83012 - 83117
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    ||  ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  83012 aactgaatcacgtcgaaatgagagggatcctgagattgtgcaggtatgagactacatggttgaaggtatgcttataagaatcgtttggtactacctatac 83111  T
Q  221 caacaa 226  Q
    ||||||    
T  83112 caacaa 83117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 239
Target Start/End: Original strand, 13191010 - 13191087
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||    
T  13191010 aggtataagactgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatcttctt 13191087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30963407 - 30963302
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||  || |  ||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  30963407 tcacatcagaatgagagggatcatgaagccgcacatgtatatgaatgcatgattgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaag 30963308  T
Q  228 atgcat 233  Q
    ||||||    
T  30963307 atgcat 30963302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Original strand, 9909102 - 9909153
Alignment:
Q  136 gaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaagga 187  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9909102 gaatgagagggatcctgaaatcgtataagtatgagactatatggttgaagga 9909153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 231
Target Start/End: Original strand, 20502073 - 20502128
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgc 231  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  20502073 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactttctatatcaacaagatgc 20502128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 239
Target Start/End: Original strand, 15639806 - 15639847
Alignment:
Q  198 gaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15639806 gaattgtttggtactacctatatcaacaacatacatcttctt 15639847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50398756 - 50398565
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  50398756 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 50398657  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50398656 tcctgaggccgtgtaggtataggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 50398565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44471470 - 44471352
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44471470 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatat 44471371  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  44471370 caacaagatgcatcttctt 44471352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50399210 - 50399020
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||||| |||||||| | |||  |||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  50399210 ggctgacgagggcggg-agtggtcgccagtgcacaaggcatgacaatgagcggcttctgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 50399112  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  50399111 tcctgagaccgtgtaggtatgagattacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacacgatgcatcttctt 50399020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4127654 - 4127464
Alignment:
Q  51 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaactttta-gacgaactgaatcacatcggaatgagagagat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4127654 ctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttctaagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggat 4127555  T
Q  149 cctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4127554 cctgaggccatgtaggtatgggactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 4127464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29628827 - 29628707
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29628827 gacagcttctagaggaaccgaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtt 29628728  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaa 226  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  29628727 tggtactacctatatcaacaa 29628707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1645967 - 1645776
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  |    
T  1645967 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggaa 1645868  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1645867 tcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcatcttctt 1645776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4128030 - 4127916
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4128030 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggcatgagactatatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 4127931  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  4127930 aagatgcatcttctt 4127916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53854968 - 53854858
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53854968 cgacagcttatagacgaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaagcagtgtaggtatgagactatatggttgaaggaagacttataagaattgt 53854869  T
Q  205 ttgatactacc 215  Q
    ||| |||||||    
T  53854868 ttggtactacc 53854858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 3169186 - 3169319
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3169186 gacagcttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataaaaattgtt 3169285  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3169286 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 3169319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23943001 - 23942816
Alignment:
Q  52 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 151  Q
    |||||||||||||||||||| | | || || ||||||  ||||||||  | |  |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23943001 tgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagctcct--gacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcct 23942904  T
Q  152 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |  ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23942903 ggggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 23942816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12692217 - 12692026
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  12692217 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 12692118  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12692117 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 12692026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14572292 - 14572177
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14572292 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 14572193  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| |||||    
T  14572192 caagatgcatcttctt 14572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 239
Target Start/End: Original strand, 1464122 - 1464260
Alignment:
Q  101 ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaa 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||| || || |||||| ||| |||||| ||||    
T  1464122 ctttcgacaccttttagacgaaccgaatcacatcagaatgagagggatcatgcgaccgtgtaggtatgagaatacatagttgaaagaaaacttataagaa 1464221  T
Q  201 ttgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1464222 ttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 1464260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23350428 - 23350310
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  23350428 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtaggggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacttcctatat 23350329  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  23350328 caacaagatgcatcttctt 23350310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44471019 - 44470902
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||| |||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44471019 aactgaatcacatcggaatgagagagatcatgacgctgtacaagtatgtgactgtatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 44470920  T
Q  221 caacaacatgcatattct 238  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  44470919 caacaagatgcatcttct 44470902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21220482 - 21220358
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21220482 tagaggaaccgaatcacatcagaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgaaactatatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactac 21220383  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||| |||||| |||||    
T  21220382 ctatatcaacaagatgcatcttctt 21220358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 35871623 - 35871735
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  35871623 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtaccacctatat 35871722  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  35871723 caacaagatgcat 35871735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 51331499 - 51331308
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttcg-acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||   || |  | ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||  |    
T  51331499 ggctgatgagggcggggagtggttgtcggtgcacaaggcatgataatgagcggttccctataacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggaa 51331400  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||    
T  51331399 tcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatacatcttctt 51331308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 49998631 - 49998749
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  49998631 aactaaatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatat 49998730  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  49998731 caacaagatgcatcttctt 49998749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9424072 - 9423885
Alignment:
Q  53 gacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||  |||| ||| | ||  |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9424072 gacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaaagagtggctcccgacgacttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagagggatcct 9423973  T
Q  152 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || | |||  | ||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9423972 gaggtcgtgcatgtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 9423885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 53996274 - 53996142
Alignment:
Q  107 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||  | ||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||    
T  53996274 acaacttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagaaggatcctgaggctatgtagatatgggactacatggttgaaggaatgcttataaaaattgttt 53996175  T
Q  207 gatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  53996174 ggtactacctatatcaacaagattcatcttctt 53996142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8467937 - 8467827
Alignment:
Q  129 cacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaaca 228  Q
    |||||| |||||| || ||||||||  | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  8467937 cacatcagaatgaaagggatcctgagactgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaaga 8467838  T
Q  229 tgcatattctt 239  Q
    ||||| |||||    
T  8467837 tgcatcttctt 8467827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24629593 - 24629460
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||  |||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  24629593 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaatgcttataagaattgtt 24629494  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24629493 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 24629460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 21067261 - 21067395
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| || | |||  | ||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||| |    
T  21067261 cgacaacttatagacgaatcgaatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcatgtatgagactgcatggttgaaggaagactaataataattat 21067360  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  21067361 ttggtactacatatatcaacaagatgcatcttctt 21067395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24629126 - 24628998
Alignment:
Q  120 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaa---gacttatgagaattgtttgatactacct 216  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24629126 gaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaattaggcttataagaattgtttggtactacct 24629027  T
Q  217 atatcaacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  24629026 atatcaacaagatgcatcttcttttcagt 24628998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14571866 - 14571742
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||| |||  |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14571866 aactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatat 14571767  T
Q  221 caacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||    
T  14571766 caacaagatgcatcttcttttcagt 14571742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Original strand, 41869913 - 41870037
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |  |||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41869913 aactaaatcacatcggagtgagagggatcctgagactgtacatatatgggactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtatgatactacctatat 41870012  T
Q  221 caacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    |||||| | |||| ||||| |||||    
T  41870013 caacaagacgcatcttcttttcagt 41870037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 226
Target Start/End: Original strand, 21067666 - 21067834
Alignment:
Q  56 gagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaa 154  Q
    |||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  |||||| || ||||||||| |||||||| | |||||   || |||| ||     
T  21067666 gagggcggggagtggtcgccggtgcagaaggcacgacaatgagcggctcccgacaaattatagacgaaccgaatcacaccagaatg---gaaatcccgag 21067762  T
Q  155 gccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21067763 gccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaa 21067834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 27026426 - 27026610
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||| ||||   |  | ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  27026426 ggctgacgagaacggggagtggtcgtcggtgcacaaggcatgacaatgagcgactcctggtagcttttaggcaaaccgaatcacatcagaatgagaggga 27026525  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |  || | | ||  ||||||| ||||| | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27026526 tattgga-cggtgcaggtatgggactacacgattgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcat 27026610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24271690 - 24271580
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtat--aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | ||| |  ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  24271690 tcacatcggaatgagagggttcctgaggtcgtgtgcaggtatgagactacatggttaaagtaagacatataagaattatttgatactacctatacgaaca 24271591  T
Q  226 acatgcatatt 236  Q
    | |||||||||    
T  24271590 agatgcatatt 24271580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7678727 - 7678649
Alignment:
Q  161 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7678727 taggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 7678649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 14351774 - 14351908
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| | |||  | ||||||| ||  |||||||||||||| ||| | ||| || |    
T  14351774 cgacaacttctagacaaaccgaatcacaccagaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgagtctgcatggttgaaggaaggcttgtaagagtttt 14351873  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  14351874 ttggtactatctatatcaacaagatgcatcttctt 14351908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 17028869 - 17028979
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||||  || ||||||||| || || | ||||||||| | | ||||||||||    
T  17028869 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccttgcatgtatgggactgcatagttgaaggaggatttgtaagaattgttaggtgctacctatat 17028968  T
Q  221 caacaacatgc 231  Q
    |||||| ||||    
T  17028969 caacaagatgc 17028979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27579050 - 27578952
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | ||| ||| ||||||||| ||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27579050 gaatcacatcggaataagagggatcttaaagtcgtgtaggtatgacactacttggttgactgaagacttataagaattgtttggtactacatatatcaa 27578952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43929092 - 43928990
Alignment:
Q  137 aatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatatt 236  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||  ||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||    
T  43929092 aatgagagggttcctgaagccgtgcaggtatgagactatttggtcgaaggaaagcttacaagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctt 43928993  T
Q  237 ctt 239  Q
    |||    
T  43928992 ctt 43928990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13614057 - 13613924
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||| || |  ||  | | ||||||||  ||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  13614057 gacaacttttagataaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtt 13613958  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  13613957 tgataccacctatatcaacaagatgcatcttctt 13613924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31817616 - 31817425
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttc-gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||| || ||||||| ||||||||   || | ||||| |||||||| |   ||||||||||| ||| |||| ||    
T  31817616 ggctgacgaggccggggagtggtcaccagtgcacaaggcatgacaatgagcggttcccgacaatttttagacaaggagaatcacatcgaaataagaggga 31817517  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| | |||  | ||||||||||  |||||||||||||   |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  31817516 tcatgaggtcgtgcatgtatgagacttcatggttgaaggaacgtttataataattgtttggtactacctataccaacaaaatgcatcttctt 31817425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 42838628 - 42838730
Alignment:
Q  130 acatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacat 229  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  | || || ||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  42838628 acatcagaatgagag-gatcctgagactgtgtaagtatgagactacatagttcaaggaagacgtataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaat 42838726  T
Q  230 gcat 233  Q
    ||||    
T  42838727 gcat 42838730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 239
Target Start/End: Original strand, 27029317 - 27029390
Alignment:
Q  166 atgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  27029317 atgagactacacgattgaaggaagacttataagaattatttggtactacttatatcaacaagatgcatcttctt 27029390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 17029325 - 17029440
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||  || | |||  | ||||| ||||  || |||||| |||||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  17029325 aactgaattacatcggaatgagagggatctagaggtcgtgcaagtatgggactgcatagttgaatgaagacttgtaataattgtttagtactacctatat 17029424  T
Q  221 caacaacatgcatatt 236  Q
    |||||| |||||||||    
T  17029425 caacaagatgcatatt 17029440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 239
Target Start/End: Original strand, 17628561 - 17628624
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  17628561 atggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttctt 17628624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23943332 - 23943269
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23943332 atggttgaaggaagacttataaaaaatatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 23943269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31817942 - 31817879
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  31817942 atggttgaaggaaggcttataagaattgttcggtactacctataccaacaagatgcatcttctt 31817879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 236
Target Start/End: Original strand, 53391890 - 53391997
Alignment:
Q  129 cacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaaca 228  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||   ||||||||||  |||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  53391890 cacatcagaatgagagagatcttgaagttgtaagagtatgagactgcatggttgaagaaatgcttataaaaattgtttgataccatctatatcaacaaga 53391989  T
Q  229 tgcatatt 236  Q
    | ||||||    
T  53391990 tacatatt 53391997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26200425 - 26200312
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaaga--cttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    || |||||||| |||   |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  26200425 tcacatcagaatgagagggatcctgatattgtgtaggtatgggacatcatggttgaaggaagaggcttataacaattgtttgatactaactatacaaaca 26200326  T
Q  226 acatgcatattctt 239  Q
    | ||||||||||||    
T  26200325 agatgcatattctt 26200312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52048804 - 52048699
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 227  Q
    |||| |||||||||||| | |||| | |||||| |||||||| |||  || | |||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  52048804 tcacgtcggaatgagagggttcctaaggccgtacaggtatgaaactgcatagctgaaggaaaatttataagaattgtttgatactacgtatactaacaag 52048705  T
Q  228 atgcat 233  Q
    ||||||    
T  52048704 atgcat 52048699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Original strand, 44830977 - 44831017
Alignment:
Q  104 tcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagag 144  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44830977 tcgacaacttttagatgaaccgaatcacatcggaatgagag 44831017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23976305 - 23976246
Alignment:
Q  180 ttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||    
T  23976305 ttgaaggaagagttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcatcttctt 23976246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 239
Target Start/End: Original strand, 33764898 - 33764973
Alignment:
Q  164 gtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  33764898 gtataagactacatggttggatgaagacttttaagaattgtttggtgctacctataccaacaagatgcatcttctt 33764973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 159
Target Start/End: Original strand, 35477801 - 35477836
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35477801 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgt 35477836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 149
Target Start/End: Original strand, 10165939 - 10165977
Alignment:
Q  111 cttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10165939 cttttagacgaaccgaatcacatcggaatgagaaagatc 10165977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33987274 - 33987188
Alignment:
Q  64 ggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    |||||||| |||||| || ||||||| |||||||| |||| | | || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33987274 ggagtggtcgtcagtgcacaaggcatgacaatgagcgactcttggcagcttctaggcaaactgaatcacatcggaatgagagggatc 33987188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 239
Target Start/End: Original strand, 4185751 - 4185828
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||   |||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| |||||    
T  4185751 aggtatgagacggcatggttaaaggaatacatataagaattgtttgataccacatataccaacaagatgcatcttctt 4185828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 13266084 - 13266193
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||  ||||||| || |  |||||||||||||| ||||| | |||| |||  |||| ||||||||||    
T  13266084 tgaatcacattagaatgagagggatcttaaagccgtgcaggtatgggaatgcatggttgaaggaaggcttataataattttttagtactccctatatcaa 13266183  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
     || ||||||    
T  13266184 taagatgcat 13266193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2499727 - 2499647
Alignment:
Q  133 tcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatacta 213  Q
    |||||||||||| ||| || || ||||  ||||||||||||  |||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||    
T  2499727 tcggaatgagagggattctaaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaagcaacacttataaaaattgtttggtacta 2499647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 2044037 - 2044171
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2044037 cgacaacttctagaggaacagaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgt 2044136  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2044137 ttgatactacctatatcaacaagatgcattttctt 2044171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8080566 - 8080375
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||  |||||||| | || |  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8080566 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcttaacagcttctagaggaactgaatcacatcggaatgagaggga 8080467  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8080466 tcctgaagccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagctgataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctt 8080375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22840753 - 22840562
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | || |||||| ||  | |||||| | ||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22840753 ggctgacaagggcggggagtggtcgccggtgcataagacacgataatgagcggctcccgataacttctagagtaactgaatcacatcggaatgagagaga 22840654  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22840653 tcctgaggctttgtaggtatgagactacatggtcgaatgaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttctt 22840562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 28453261 - 28453451
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||  |||||||| | ||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||    
T  28453261 ggctgacgagggcggggagtggttgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttttagatga-ctgaatcacaccggaatgagaggga 28453359  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| || | |||  ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  28453360 tcccgaggtcgtgcaggtatgagacttcatggttgaaagaaaacttataagaattgttttatactacctatattaacaagatgcatcttctt 28453451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34308630 - 34308512
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  34308630 aactgaatcacatcggaatgaaagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatat 34308531  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  34308530 caacaagatgcatcttctt 34308512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27022562 - 27022377
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||    
T  27022562 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggagccgaatcacatcggaatgagaggga 27022463  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27022462 tcttgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaacatgcat 27022377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 239
Target Start/End: Original strand, 17103086 - 17103194
Alignment:
Q  131 catcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||    
T  17103086 catcggaatgagagagatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagctg 17103185  T
Q  231 catattctt 239  Q
    ||| |||||    
T  17103186 catcttctt 17103194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29971561 - 29971450
Alignment:
Q  112 ttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29971561 ttttagacgaactgaatcacatcagaattggaaggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttgatac 29971462  T
Q  212 tacctatatcaa 223  Q
    || |||||||||    
T  29971461 tatctatatcaa 29971450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 10844805 - 10844996
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  10844805 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 10844904  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10844905 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 10844996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22549219 - 22549028
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||       
T  22549219 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagaggct 22549120  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22549119 tcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 22549028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34309090 - 34308991
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  34309090 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatat 34308991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41659328 - 41659138
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||| ||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  41659328 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaag-cacgacaatgagtggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 41659230  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41659229 tcctgatgtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 41659138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 25147531 - 25147649
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  25147531 aactaaatcacatcggaatgagagagatcctaagactgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtgctacctatat 25147630  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  25147631 caacaagatgcatcttctt 25147649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 22026301 - 22026492
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  22026301 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 22026400  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| |||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22026401 tcgtgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 22026492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6465057 - 6464943
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6465057 gaatcacattggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6464958  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  6464957 aagatgcattttctt 6464943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 27925879 - 27926012
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  27925879 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtt 27925978  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27925979 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 27926012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12827411 - 12827287
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  12827411 tagaagaaccgaatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactac 12827312  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||| |||||| |||||    
T  12827311 ctatatcaacaagatgcatcttctt 12827287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 33852410 - 33852291
Alignment:
Q  120 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 219  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33852410 gaactgaatcacaccagaatgagagggatcccgagaccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctata 33852311  T
Q  220 tcaacaacatgcatattctt 239  Q
    | ||||| ||| || |||||    
T  33852310 ttaacaagatgtatcttctt 33852291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 12100687 - 12100804
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  12100687 aactgaatcacatcgaaatgaga-agatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggcaagcttataagatttgtttggtactacctatat 12100785  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| || |||||| |||||    
T  12100786 caataagatgcatcttctt 12100804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Original strand, 22705181 - 22705279
Alignment:
Q  135 ggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22705181 ggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactggatgattgaaggaagggttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 22705279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27022107 - 27021912
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatga----ga 143  Q
    |||||||||||| |||||||||| |   || || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||    ||    
T  27022107 ggctgacgagggtggggagtggtcgcgggtgcacaaggcacgacaatgagtggctcccgacaacttctagaggagccgaatcacatcggaatgaatgaga 27022008  T
Q  144 gagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    | |||||||| ||| | ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  27022007 gggatcctgaggccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcatcttctt 27021912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28375221 - 28375087
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  28375221 cgacagcttctagacgaaacgaatcacaccataatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaaggcttataagaattgt 28375122  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  28375121 ttggtactacctacatcaacaagatgcatcttctt 28375087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22548773 - 22548582
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||| || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||| |     
T  22548773 ggctgatgagggtggggagtggtcgccagtgcacaaggcactacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaacctaatcacaccggaatgagagggt 22548674  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22548673 tcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagttttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 22548582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 25147962 - 25148080
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||| || | ||| |||||||| |||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  25147962 aactgaatcacataagaatgagagggatcccgaggtcgtgtaggtatgggactgtgtcgttgaaggaaggcttataagaattgtttggtcttacctatat 25148061  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  25148062 caacaagatgcatattctt 25148080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27819393 - 27819279
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27819393 gaatcacatcagaatgagagggatcatgaagtcatgcaagtatgagacttcatggttgaaggaaggctaataagaattgtttggtactacctatatcaac 27819294  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  27819293 aaaatgcatcttctt 27819279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 32292386 - 32292510
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||     
T  32292386 tagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactat 32292485  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||    
T  32292486 ctatatcaacaagttgcatcttctt 32292510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 232
Target Start/End: Original strand, 3744673 - 3744744
Alignment:
Q  161 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgca 232  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  3744673 taggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttgacactacctataccaacaatatgca 3744744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10844758 - 10844648
Alignment:
Q  129 cacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaaca 228  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  10844758 cacaccggaatgagagggttcctgaggccttgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatattaacaaga 10844659  T
Q  229 tgcatattctt 239  Q
    ||||| |||||    
T  10844658 tgcatcttctt 10844648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 25144767 - 25144885
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||  ||||||| || |  ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25144767 aactgaatcacatcagaatgagagagatctcgaggtcgtgcaggtatgggattgcatgattgaaggcaggcttataagaattgtttggtactacctatat 25144866  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| |||||| |||||    
T  25144867 cagcaagatgcatcttctt 25144885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21316257 - 21316148
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||||| ||||||| || ||   ||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21316257 tgaatcacatcgcgatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaatgagcgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaa 21316158  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  21316157 caagatgcat 21316148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30335055 - 30334941
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||  | ||  ||||||| ||||  | ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30335055 gaatcacatcggaattagatggatcctgagactgtgcaggtatgcgactgcaaggttgaaagaagacttataaaaattgtttgatactacctataccaac 30334956  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || || ||| |||||    
T  30334955 aagatacatcttctt 30334941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 239
Target Start/End: Original strand, 1297043 - 1297120
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  1297043 aggtatgagactgcatggttgaagtaaaacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatttatattctt 1297120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 189
Target Start/End: Original strand, 25307687 - 25307828
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||| ||  |||||||| |  |||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||    
T  25307687 ggctgacgagggccgggagtggtagtcggtgtacaagacacgacaatgagcggttttcgacagctttgagacaaactgaatcacactggaatgagagcga 25307786  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaag 189  Q
    | |  | |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25307787 ttccaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaag 25307828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Original strand, 17429501 - 17429600
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||  |  |||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  17429501 aatcacatcggaatgagag-gatcttgagaccgtgcatatatgtgactgcattgttgaaggaagacttatgagtattatttggtactacctatatcaaca 17429599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15568139 - 15568044
Alignment:
Q  138 atgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  15568139 atgagagagatcctgagaccgtacaaatatgtgacttcttggttgaaggaagacttataacaattgtttggtatgacctatatcaacaagatgcat 15568044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15567707 - 15567589
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | |||| ||||   ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||     
T  15567707 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgacatcgcgcaagtattagacatcatggtggaaggaaggcttataagaattgtttgacactacatatac 15567608  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| || ||| |||||    
T  15567607 caacaagatacatcttctt 15567589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36968503 - 36968433
Alignment:
Q  164 gtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcata 234  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||    
T  36968503 gtatgaaactgtatggttgaaggatgacttataagaattgattggtgctacttatatcaacaagatgcata 36968433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 239
Target Start/End: Original strand, 3745145 - 3745214
Alignment:
Q  170 gactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  3745145 gactacatggttgaaggaaaacttataagaactgtttagtactacctataccaacaatatgcatcttctt 3745214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 231
Target Start/End: Original strand, 41913006 - 41913075
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgc 231  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  41913006 aggtatgggactgcatgtttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgc 41913075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18301 - 18173
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18301 cgacagcttctagaggaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatagttgaaggaagacttataagaattgt 18202  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18201 ttgatactacctatatcaacaagatgcat 18173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17765 - 17645
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| | || |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  17765 cgacaacttcttgaggaaccgaatgacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgt 17666  T
Q  205 ttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  17665 ttggtactacctatatcaaca 17645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6747822 - 6747631
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||    
T  6747822 ggctgacgagggcagggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagctgaatcacattggaatgagaggga 6747723  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6747722 tcctgaggccgtgtaggtatgatactacatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 6747631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 42515523 - 42515657
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  42515523 cgacagcttctagacgaaccgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgt 42515622  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42515623 ttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 42515657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2611876 - 2611685
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  2611876 ggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaactgaatcacatcggaatgagagggg 2611777  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| | | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  2611776 tcctgaggtcatgtaggtatgagactatatggtggaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctataacaacaagatgcatcttctt 2611685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Original strand, 42515090 - 42515205
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42515090 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 42515189  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| |||||    
T  42515190 caagatgcattttctt 42515205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 9124954 - 9125072
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9124954 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 9125053  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  9125054 caacaagatgcatcttctt 9125072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34405815 - 34405624
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  34405815 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagaggga 34405716  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  34405715 tcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaggatgcatcttctt 34405624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2941908 - 2941790
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  2941908 aactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggctgataagaattgtttggtactacctatat 2941809  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  2941808 caacaagatgcatcttctt 2941790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26957777 - 26957603
Alignment:
Q  53 gacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 151  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  26957777 gacgagggcgggaagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatctt 26957678  T
Q  152 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    || || || ||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26957677 gaggctgtgtaggtatggaactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 26957603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11517539 - 11517428
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11517539 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggt-gaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 11517441  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  11517440 caacaagatgcat 11517428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Original strand, 28495835 - 28495967
Alignment:
Q  107 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||     
T  28495835 acaacttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaactgttg 28495934  T
Q  207 gatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28495935 ggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 28495967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6719226 - 6719107
Alignment:
Q  120 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 219  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6719226 gaaccgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctata 6719127  T
Q  220 tcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  6719126 tcaacaagatgcatcttctt 6719107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 679796 - 679929
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  679796 cgacagcttctagaggaactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggagtacatggctgaaggaaggcttataagaattg- 679894  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  679895 ttggtactacctatatcaacaagatgcatattctt 679929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Original strand, 25182363 - 25182461
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25182363 tcacatcggaatgagagagatcctgagactgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 25182461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29039167 - 29039053
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29039167 gaatcacatcggaatgagaggcatcctgaggccgtgtagatatgtgactacatggttgaatggaggcttacaagaattgtttggtactacctatatcaac 29039068  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||| |||||    
T  29039067 aacatgcatcttctt 29039053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35474268 - 35474154
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  35474268 gaatcacaccggaatgagagggatccttaggtcgtgtaggtatgagactacatggttgaagaaagacttataagaattgtttagtactacttatatcaac 35474169  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  35474168 aagatgcatcttctt 35474154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 43233402 - 43233520
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  43233402 tagaggaaccgaatcacaccgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgtgactgtatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactat 43233501  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  43233502 ctatatcaacaagatgcat 43233520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 238
Target Start/End: Original strand, 2193236 - 2193368
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||  ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2193236 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgagaccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtt 2193335  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcatattct 238  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2193336 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttct 2193368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13125287 - 13125169
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13125287 aactgaatcatatcggaatgagagggatcttgaggccctgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 13125188  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
     ||||| |||||| |||||    
T  13125187 taacaagatgcatcttctt 13125169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28495755 - 28495641
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||||||    
T  28495755 gaatcccatcggaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgttgagttttacctatatcaac 28495656  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  28495655 aagatgcatcttctt 28495641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Original strand, 36422251 - 36422365
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36422251 gaatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 36422350  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  36422351 aagatgcatcttctt 36422365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Original strand, 46425740 - 46425854
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  46425740 gaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccatgtaggtatgggactacatggttgaaataaggcttataagaattgtttggtattacctatatcaac 46425839  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  46425840 aagatgcatcttctt 46425854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5406739 - 5406627
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||   |||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5406739 aactgaatcacatcggaatgatagggatcctaaagtcgtgccggtatgggactgcatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtattacctatat 5406640  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  5406639 caacaagatgcat 5406627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3305536 - 3305377
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | ||  ||||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||| | ||    
T  3305536 ggctgacgagggcggagagtggtcgccggtggataaggcacgacaatgagcagctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcgaaatgaggggga 3305437  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttg 207  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3305436 tcctgaggccgtgtaagtatgggactacatggttgaatgaaggcttatgagaattgtttg 3305377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 18833281 - 18833399
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||  |||  |||||||| ||||  |||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  18833281 aactgaatcacatcggaatgagagggttcctgaggccgtacaggtatggaactgcatggttgagggaaagcttatatgaattgtttagtactacctatat 18833380  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  18833381 caacaagatgcatcttctt 18833399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26421402 - 26421341
Alignment:
Q  175 tatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26421402 tatggttgaaggaagacttataagaattgcttgatactacctatatcaacaagatgcatatt 26421341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 239
Target Start/End: Original strand, 2189069 - 2189257
Alignment:
Q  52 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcc 150  Q
    |||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||    
T  2189069 tgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcc 2189168  T
Q  151 tgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| || ||  |||| || ||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2189169 tgaggctgtgcaggtgtgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggcactacctatatcaacaagatgcatcttctt 2189257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22529392 - 22529262
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| | | | || ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||     
T  22529392 tagacgaaccgaatcatatccgaatgagagggatcctgaggtcatgtaagtatgggcctacatggttgaaggaaggcttataagaaatgtttggtactat 22529293  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  22529292 ctatataaacaagatgcatcttcttttcagt 22529262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 239
Target Start/End: Original strand, 2465959 - 2466037
Alignment:
Q  161 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2465959 taggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagttgcatcttctt 2466037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29357622 - 29357489
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| || | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||   |||| ||||||||    
T  29357622 cgacaacttctagatgaactgaatcacaccg-aatgagaggtatcccgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaatgtttataagaattgt 29357524  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  29357523 ttggtactaactatatcaacaagatgcatcttctt 29357489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31406731 - 31406617
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  || | || ||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  31406731 gaatcacatcaaaatgagagggatcctgaagccgtgcagatctgggactgaatggttgaaagatgacttattagaattgtttggtgttacctatatcaac 31406632  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  31406631 aagatgcatcttctt 31406617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35527278 - 35527148
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || | |||  |  |||| ||||   |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  35527278 tagacgaaccgaatcacaccgaaatgagagggatcccgaggtcgtgcaaatatgggactggttggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctac 35527179  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35527178 ctatatcaacaagatgcatattcttttcagt 35527148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 239
Target Start/End: Original strand, 2465777 - 2465846
Alignment:
Q  170 gactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2465777 gactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 2465846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 9623188 - 9623321
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||| || |  ||  | | ||||||||  ||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  9623188 gacaacttttagataaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtt 9623287  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  9623288 tgataccacctatatcaacaagatgcatcttctt 9623321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Original strand, 33316707 - 33316828
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatc-acatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  33316707 gacagcttctagacaaactgaatccacatcggaatgagataaattttgatgtcgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaaaaattataagaattgt 33316806  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||| | ||| |||||||||||    
T  33316807 ttgacaatacttatatcaacaa 33316828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13124852 - 13124757
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacct 216  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  13124852 aactgaatcatattggaatgagagggatcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtgtggtactacct 13124757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36015568 - 36015452
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||  | || ||  | ||||||||||  |||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||    
T  36015568 tagacgaaccaaatcacaccggaatgagagggatcccaaggcagtgcaagtatgagactccatggttgaaggaaagcttaaaagaattgtttggtactac 36015469  T
Q  215 ctatatcaacaacatgc 231  Q
     ||||||||||| ||||    
T  36015468 atatatcaacaagatgc 36015452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 236
Target Start/End: Original strand, 20966055 - 20966161
Alignment:
Q  130 acatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacat 229  Q
    ||||||||||||||| | || ||| ||| | |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| |||||| |||  || |||||||| |||||| ||    
T  20966055 acatcggaatgagagtggtcttgaggccatctaggtatgagactgcatgattgaaggatgacttataagaattattttgtaatacctataccaacaagat 20966154  T
Q  230 gcatatt 236  Q
    | |||||    
T  20966155 gtatatt 20966161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 11372486 - 11372550
Alignment:
Q  161 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11372486 taggtatgaaattgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctgtaccaaca 11372550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16811963 - 16811912
Alignment:
Q  155 gccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  16811963 gccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattgttt 16811912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 6585662 - 6585708
Alignment:
Q  180 ttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6585662 ttgaaagaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaa 6585708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31743975 - 31743857
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||| |||| |||||||  |||| ||||  |||  | | ||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  31743975 aactgaatcatatcgaaatgagatggatcttgaaatcgtgcaagcatgagactgcatggttgaaggaatgcttataagaatggtttggtgctatctatat 31743876  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  31743875 caacaagatgcatcttctt 31743857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 30529609 - 30529800
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||  ||||| || | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30529609 ggctgacgagggcgatgagtggtcgtcagtgcacaaggcacgacaataagcagctcccgacaacttctagaggaactgaatcacatcggaatgagaggga 30529708  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30529709 tcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaagtaaggcttataagaattttttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 30529800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 39640916 - 39641050
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39640916 cgacagcttttagaagaatcgaatcacatcagaatgagagagatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagagttgt 39641015  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  39641016 ttggtactacctatatcaataagatgcatcttctt 39641050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 239
Target Start/End: Original strand, 28561670 - 28561859
Alignment:
Q  51 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  28561670 ctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctactgacaacttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggttc 28561769  T
Q  150 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28561770 ctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 28561859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20885283 - 20885150
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20885283 cgacaacttctagaggaacc-aatcacatcgcaatgagagggatcttgaggtcgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaagacttataagaattgt 20885185  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20885184 ttgatactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20885150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32227444 - 32227254
Alignment:
Q  50 gctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||| | ||  | ||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||    
T  32227444 gctgacgagggcggggagtggtcgccagtgcacaaggcacaacaatgagcggctcccaacaacttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggat 32227345  T
Q  149 cctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  32227344 cctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaacaagatgcatcttctt 32227254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25230872 - 25230738
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  25230872 cgacagcttatagaggaaccaaatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgt 25230773  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25230772 ttggtactacctatatcaacaagatgcattttctt 25230738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25238459 - 25238325
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  25238459 cgacagcttatagaggaaccaaatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgt 25238360  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25238359 ttggtactacctatatcaacaagatgcattttctt 25238325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 239
Target Start/End: Original strand, 41472297 - 41472413
Alignment:
Q  122 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  41472297 actgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaag-cttataagaattgtttggtactacatatatc 41472395  T
Q  222 aacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  41472396 aacaagatgcatcttctt 41472413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 16811303 - 16811494
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16811303 ggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16811402  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  16811403 tcctgaggccgtgtaggtttgggactccatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatttcaacaagatgcatcttctt 16811494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 39653086 - 39653277
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  39653086 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggt 39653185  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39653186 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgttggatactacctatatcaacaagatgcatcttctt 39653277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31284427 - 31284309
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31284427 aactgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 31284328  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  31284327 caacaagatgcatcttctt 31284309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Original strand, 7493881 - 7493994
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  7493881 aatcacatcggaatgagagagatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 7493980  T
Q  226 acatgcatattctt 239  Q
    | |||||| |||||    
T  7493981 agatgcatcttctt 7493994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 50347668 - 50347859
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | || || |||| |  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  50347668 ggctgacgagggcggggagtgatcgccggtgcacaaggaacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagaggga 50347767  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50347768 tcctgaggccttgtatgtatgagactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 50347859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25230415 - 25230281
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  25230415 cgacatcttatagaggaaccaaatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattat 25230316  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  25230315 ttggtactacctatatcaacaagatacatcttctt 25230281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25238002 - 25237868
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  25238002 cgacatcttatagaggaaccaaatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattat 25237903  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  25237902 ttggtactacctatatcaacaagatacatcttctt 25237868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32797082 - 32796968
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||  || | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32797082 gaatcacatcgaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgaaactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 32796983  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  32796982 aagatgcatcttctt 32796968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11180172 - 11180067
Alignment:
Q  134 cggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  11180172 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 11180073  T
Q  234 attctt 239  Q
     |||||    
T  11180072 cttctt 11180067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13150267 - 13150126
Alignment:
Q  104 tcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattg 203  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| | |||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13150267 tcgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattg 13150168  T
Q  204 tttgatactacctatatcaacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    || | |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  13150167 ttgggtactacctgtatcaacaagatgcatcttcttttcagt 13150126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 14813938 - 14814062
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  14813938 tagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgagactgcatggttaaaggaaggcttataataattgtttggtactac 14814037  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||| || |||||| |||||    
T  14814038 ctatatcaataagatgcatcttctt 14814062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25239224 - 25239110
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25239224 gaatcacaccggtatgagagggattctgaggtcgtgtaggtatgggactatatggttgaaggaacgcttataagaattttttggtactacctatatcaac 25239125  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  25239124 aagatgcatcttctt 25239110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Original strand, 7477191 - 7477304
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  7477191 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 7477290  T
Q  226 acatgcatattctt 239  Q
    | || ||| |||||    
T  7477291 agatacatcttctt 7477304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 239
Target Start/End: Original strand, 41473993 - 41474110
Alignment:
Q  122 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatc 221  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||  ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41473993 actgaatcacatcgaaatgagagggatcttgaggtcgttcaggtatgtgactggatggttaaaggaagacttataagaattgtttgatacttcctatatc 41474092  T
Q  222 aacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||| ||  ||||||||    
T  41474093 aacaagattgatattctt 41474110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 16810847 - 16811038
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16810847 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16810946  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| ||||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  16810947 tcttgaggccgtgtagatatgggactgcatggttgatggaaggcttataagaattgttgcgtactaactatatctacaagatgcatcttctt 16811038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 25248106 - 25248224
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||  ||||||| ||||  |||||| ||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25248106 aactgaatcacatcggaatgagagggattctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttaaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatat 25248205  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  25248206 caacaagatgcatcttctt 25248224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 32227480 - 32227613
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32227480 cgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggatc-tgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgt 32227578  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    | | |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  32227579 tgggtactacctatattaacaagatgcatcttctt 32227613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 37045014 - 37045148
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||    
T  37045014 cgacagcttctagaggaaccgaatcacatctgaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtgtgggactacatgaatgaaggaatgcttataagaattgt 37045113  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| || |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  37045114 ttggtaatacctatatcaacaaggtgcatcttctt 37045148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 2911084 - 2911208
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||    
T  2911084 tagacgaaccgaatcacacctgaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggaccacatggttgaaagaatggttataaaaattgtttgatattac 2911183  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  2911184 ctatatcaacaagatgcatattctt 2911208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32386844 - 32386761
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  32386844 aggtatgggactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcagt 32386761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 8067278 - 8067387
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| || |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8067278 tgaatcacatcggaatgagagggaccctgaggccgtgcaggtatgggattgcatggttgaaggccggcttataagaattgtttagtactacctatatcaa 8067377  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  8067378 caagatgcat 8067387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25238790 - 25238717
Alignment:
Q  166 atgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  25238790 atgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactatctttatcaacaagatgcatcttctt 25238717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25803228 - 25803057
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |   || || |||||||||||||||| | ||| | ||| ||| |||| |||| |||||| |||||||| |||| |     
T  25803228 ggctgactaggacggggagtggtcgctggtgcacaaggcataacaatgagcggcttccaacagcttctagatgaaccgaatcatatcggaataagagggt 25803129  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 219  Q
    |||| | | ||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  25803128 tcctaatgtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaagtaagacttgtaagaattgtttggtactacctata 25803057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Original strand, 29224326 - 29224437
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 227  Q
    ||||||| |||||| || | || ||| ||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||     
T  29224326 tcacatcagaatgaaagggttcatgaggccatgtagatatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatactaacaag 29224425  T
Q  228 atgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||    
T  29224426 atgcatcttctt 29224437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13150657 - 13150587
Alignment:
Q  169 agactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13150657 agactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 13150587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4067454 - 4067393
Alignment:
Q  178 ggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4067454 ggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 4067393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27187478 - 27187363
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||  | ||||| ||||  |||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  27187478 tgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgcatgtatgggactgcatggttaaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcac 27187379  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
     || |||||| |||||    
T  27187378 taagatgcatcttctt 27187363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31104070 - 31103993
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||    
T  31104070 aggtatgagattgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttgatactatctataccaactagatgcattttctt 31103993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25802685 - 25802581
Alignment:
Q  135 ggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcata 234  Q
    |||||||||| |||| ||  ||| | |||||||||||||  |||||| | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  25802685 ggaatgagagggatcatgtggccatgtaggtatgagactgcatggttaacggaaggctgataagaatggtttggtactacctatatcaacaagatgcatc 25802586  T
Q  235 ttctt 239  Q
    |||||    
T  25802585 ttctt 25802581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 14820134 - 14820261
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| || |||||||| | ||||||  |||| |||||||| | ||  | || | ||||||| ||||| |||||||||    
T  14820134 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccgcaatgagagggttcctgagcccgtgtaggtatggggctgcacggctaaaggaaggcttataagaattgtt 14820233  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  14820234 tggtactacttatatcaacaagatgcat 14820261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 185
Target Start/End: Original strand, 12820639 - 12820703
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaag 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  12820639 aactgaatcacatcggaatgagagggattctaaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaag 12820703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47518415 - 47518358
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || || |||||| ||||||    
T  47518415 atggttgaaggaaaacttataagaattgtttgaaactatctctaccaacaagatgcat 47518358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43057747 - 43057556
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | | || || |||||||  ||||||| | ||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  43057747 ggctgaagagggcggggaatggtcgccggtgcacaaggcatgccaatgagcggctcccgacagcttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggga 43057648  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  43057647 tcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttctt 43057556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30873175 - 30872983
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggg--gagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagag 146  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||| || || ||||||  ||||||||    |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  30873175 ggctgacgagggcgcgtggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggcttcgacaatttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagaggg 30873076  T
Q  147 atcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30873075 attctgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagacttttaagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatcttctt 30872983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43057288 - 43057098
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | || || ||||||| |||||||| ||||  |||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| | ||    
T  43057288 ggctgacgaggacggggagtggttgccggtgcacaaggcatgacaatgagcgactcccgacaatttctagaggaaccgaatcacatcagaatgaggg-ga 43057190  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43057189 tcctaaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaaggcttagaagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatcttctt 43057098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50002854 - 50002740
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50002854 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50002755  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  50002754 aagatgcatcttctt 50002740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16452157 - 16451966
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16452157 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16452058  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||| | |||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16452057 tcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 16451966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16461310 - 16461119
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16461310 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16461211  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||| | |||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16461210 tcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 16461119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20054304 - 20054113
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20054304 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20054205  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20054204 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20054113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20054760 - 20054569
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20054760 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20054661  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20054660 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20054569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20055216 - 20055025
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20055216 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20055117  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20055116 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20055025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20055672 - 20055481
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20055672 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20055573  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20055572 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20055481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20056128 - 20055937
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20056128 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20056029  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20056028 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20055937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20056584 - 20056393
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20056584 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20056485  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20056484 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20056393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20057487 - 20057296
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20057487 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20057388  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20057387 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20057296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35761062 - 35760947
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35761062 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 35760963  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| |||||    
T  35760962 caagatgcatcttctt 35760947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50002442 - 50002318
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  50002442 tagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac 50002343  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||||||||| |||||| |||||    
T  50002342 ctttatcaacaagatgcatcttctt 50002318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20845885 - 20845694
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  |     
T  20845885 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagacggt 20845786  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20845785 tcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgttactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20845694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35759756 - 35759641
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35759756 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 35759657  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| |||||    
T  35759656 caagatgcatcttctt 35759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 52250128 - 52250319
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  52250128 ggctgacgagggcggggagcggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagaggga 52250227  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  52250228 tcatgaggccttgtaggtatgggactacatggtcgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 52250319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31822809 - 31822696
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  31822809 aatcacatcagaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattatttggtactacatatatcaaca 31822710  T
Q  226 acatgcatattctt 239  Q
    | |||||| |||||    
T  31822709 atatgcatcttctt 31822696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 12883446 - 12883637
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||| || || ||||||  |||||||| | || |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||    
T  12883446 ggctaacgagggtggtgagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctctcgacagcttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagatgga 12883545  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| || || ||  ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12883546 tcccgaggctgtgcaggtatgggactgcatgattgaaggaatacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctt 12883637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 2328310 - 2328428
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2328310 aactgaatcacattggaatgagagaaattatgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 2328409  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
     ||||| |||||| |||||    
T  2328410 taacaagatgcatcttctt 2328428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 7548086 - 7548204
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||    
T  7548086 aactgaatcacattgcaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatgattaaaggaagacttataaaaattgtttggtattaactatat 7548185  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  7548186 caacaagatgcatattctt 7548204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20061342 - 20061224
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20061342 aactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 20061243  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  20061242 caacaagatgcatcttctt 20061224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20057876 - 20057752
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20057876 tagaggaactgaatcacaccgaaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactac 20057777  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||| |||||| |||||    
T  20057776 ctatatcaacaagatgcatcttctt 20057752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 38340886 - 38341013
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  | |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  38340886 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagatggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtt 38340985  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  38340986 tggtactacctatatcaacaagatgcat 38341013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51373096 - 51372913
Alignment:
Q  51 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||   ||||||||| ||||    
T  51373096 ctgacgaggacgaagagtggttgccagtgcataaggcacgacaatgagcgactcccgacatcttctagacgtaccaaatcacactagaatgagagggatc 51372997  T
Q  150 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    | || ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  51372996 ccgaggccatacaggtatgtgactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcgacaagatgcat 51372913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 223
Target Start/End: Original strand, 10820571 - 10820689
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  ||| || || || ||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10820571 cgacaacttctagatgaaccgaatcacatcggagtgagagggattatgaggcggtgtatgtattggactacatggttgaaggaagatttataagaattgt 10820670  T
Q  205 ttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  10820671 ttggtactacctatatcaa 10820689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50003227 - 50003102
Alignment:
Q  120 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||  ||||  |||||| |||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  50003227 gaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgcaggtataggactgcatggttaaagggagacttataataattgttgggtactacctata 50003128  T
Q  220 tcaacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  50003127 tcaacaagatgcatcttcttttcagt 50003102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 46693884 - 46693768
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactat-atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatca 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||  | ||||| |||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  46693884 tgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgcatgtatgggactgtgatggttgaaggaaggcttataaaaattgtttggtactacctatatca 46693785  T
Q  223 acaacatgcatattctt 239  Q
    |||| |||||| |||||    
T  46693784 acaagatgcatcttctt 46693768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20057031 - 20056849
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20057031 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20056932  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||         |||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20056931 tcctga---------ggtatgggactgcagggttgaaggaaggcttatgagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20056849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 226
Target Start/End: Original strand, 23180728 - 23180830
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23180728 tgaatcacattggaatgagagggatcttgaagccgtgtaggaatgggactacgtggttgaaggaatgattataagaattgcttggtactacctatatcaa 23180827  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  23180828 caa 23180830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Original strand, 2634923 - 2635037
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||  ||||||| ||||  ||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2634923 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggataactcataagaattgtttggtactacctataccaac 2635022  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  2635023 aagatgcatcttctt 2635037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 239
Target Start/End: Original strand, 12728026 - 12728105
Alignment:
Q  161 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt-gatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  12728026 taggtatgggacaacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggttactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 12728105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 245
Target Start/End: Original strand, 16907270 - 16907353
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  16907270 aggtatgaaactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttcttttcagt 16907353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16440675 - 16440612
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  16440675 atggttgaagaaagacttataagaactgtttgctactaccgataacaacaagatgcatattctt 16440612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 181 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20060431 - 20060373
Alignment:
Q  181 tgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20060431 tgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 20060373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 239
Target Start/End: Original strand, 2739554 - 2739635
Alignment:
Q  158 gtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||| ||| || |||||    
T  2739554 gtataggtatgagactgtatggttaaggaaagacttataagaattgtttagcactacatatatcaacaatatgtatcttctt 2739635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10927568 - 10927436
Alignment:
Q  107 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10927568 acaacttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttt 10927469  T
Q  207 gatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10927468 ggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 10927436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42788869 - 42788679
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || |||||| |||| |||| | || |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  42788869 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacaaca-tgagcggctctcgacaacttctagaggaaccgaatcacaacggaatgagaggga 42788771  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||| ||||  || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42788770 tcctgaggccgtgtaggattgggactacatggttgaaagaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 42788679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20039698 - 20039507
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20039698 ggctgacgagggcggggaatggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcagctcccgacagcttctagacaaaccgaatcacatcggaatgagaggga 20039599  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| ||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20039598 tcatgaggccgtgtaggtataggactacatagttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctt 20039507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 39146919 - 39147052
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39146919 gacaacttctagaggaactgaatcacatcgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtagacttataagaattgtt 39147018  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  39147019 tgatactacttatattaacaagatgcatcttctt 39147052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17445620 - 17445488
Alignment:
Q  107 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17445620 acaacttctagaggaaccgaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttt 17445521  T
Q  207 gatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17445520 ggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 17445488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3887208 - 3887090
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  3887208 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatatgaattatttggtactacctatat 3887109  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  3887108 caacaagatgcatcttctt 3887090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10927170 - 10926985
Alignment:
Q  50 gctgacgagggc-ggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  10927170 gctgacgagggcaggggagtgatcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagtagctcccgacagcttatagaggaaccgaatcacatcagaatgagaggga 10927071  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10927070 tcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 10926985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 2193738 - 2193929
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  2193738 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagaggga 2193837  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2193838 tcatgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 2193929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 189063 - 189181
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  189063 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 189162  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||| || |||||    
T  189163 caacaagatgtatcttctt 189181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 2474400 - 2474518
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  2474400 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctaaggtcgtacagatatgggactgcatggttgaaggaagacttaaaagaattgtttggtactacctatat 2474499  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  2474500 caacaagatgcatcttctt 2474518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 239
Target Start/End: Original strand, 42429131 - 42429258
Alignment:
Q  111 cttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgata 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  42429131 cttttagacgaaccgaatcacatcggaataagag-gatcctgagaccgtgtaggtatgtgaacacatggttgaaggaggacttataagaattgtttggta 42429229  T
Q  211 ctacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42429230 ctacctttatcaacaatatgcatattctt 42429258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 2473954 - 2474072
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||| ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  2473954 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtacaggcatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 2474053  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  2474054 caacaagatgcatcttctt 2474072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 22556531 - 22556649
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  22556531 aactgaatcacatcggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctatat 22556630  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  22556631 caacaagatgcatcttctt 22556649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27647002 - 27646868
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27647002 cgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctagggccgtgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgt 27646903  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  27646902 ttggtactacctataacaacaagatgcatcttctt 27646868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 34867770 - 34867903
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34867770 gacagcttctagaagaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtt 34867869  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34867870 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 34867903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Original strand, 1821904 - 1822019
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | | | |||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1821904 tgaattacatcggaatgagagagatcttaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 1822003  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| |||||    
T  1822004 caagatgcatcttctt 1822019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8391468 - 8391355
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  8391468 gaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtgtaggcatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtact-cctgtatcaac 8391370  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  8391369 aagatgcatcttctt 8391355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11160848 - 11160714
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11160848 cgacaatttttagatgaaccgaattgcatcggaatgagagggatcatgaagtcgtgtaggtatgacactacatagttgaaggaaggcttataataattgt 11160749  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  11160748 ttggtactatctatgtcaacaagatgcatattctt 11160714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 22556964 - 22557082
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  22556964 aactgaatcacatcggaatgagagagttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactaccaatat 22557063  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  22557064 caacaagatgcatcttctt 22557082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2058803 - 2058690
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  || |||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2058803 gaatcacatcggattgagagagatcctgaagtcatgcagctatgagactggatgattgaaggaagacttatatgaattgtttggtactacctatatcaac 2058704  T
Q  225 aacatgcatattct 238  Q
    || ||||| |||||    
T  2058703 aagatgcaaattct 2058690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4658216 - 4658026
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||  ||||   |||| | | ||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  4658216 ggctgacaaggacggggagtggtcgccagtgcataatgcatgacaatgaccgactcctgacagcctctaggcaaactgaatcacatcgaaataagaggga 4658117  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || |||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4658116 tcttgaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaacgaaga-ttataagacttgtttgatactacctataacaacaacatgcatcttctt 4658026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8642182 - 8642067
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  8642182 tgaatcacatcagaatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaa 8642083  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| |||||    
T  8642082 caagatgcatcttctt 8642067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3886749 - 3886634
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||| ||||  ||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  3886749 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtacaagtatgggactgcatggtagaaggaatgcttatatgaattgtttggtactacctatatcaa 3886650  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| |||||    
T  3886649 caagatgcatcttctt 3886634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 34371534 - 34371725
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  34371534 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 34371633  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||  | |||||| |||| || ||||  |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34371634 tcccaaggccgtacaggtgtgggactgcatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 34371725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 34371990 - 34372181
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| | ||||||||| |     
T  34371990 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcaggacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccagaatgagagggt 34372089  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||  | |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34372090 tcccaaggccgtacaagtatgggactacatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 34372181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21886303 - 21886179
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |  ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21886303 tagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac 21886204  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
     ||||||||||| |||||| |||||    
T  21886203 atatatcaacaagatgcatcttctt 21886179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5067055 - 5066924
Alignment:
Q  108 caacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttg 207  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||| || |||||  | |||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||    
T  5067055 caacttctagacaaatcgaatcacaccagaatgagagagatcccgaggccgtgcatgtatgagactgtatgattaaaggaaaacttataagaattgtttg 5066956  T
Q  208 atactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
     || || |||||||||||| |||||| |||||    
T  5066955 gtattatctatatcaacaagatgcattttctt 5066924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15513173 - 15513045
Alignment:
Q  112 ttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaaga--cttatgagaattgtttgat 209  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | | || || |||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||| |    
T  15513173 ttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcattaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatatgcttataagaattg-ttggt 15513075  T
Q  210 actacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  15513074 actaccaatatcaacaagatgcatcttctt 15513045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16370852 - 16370754
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||| | ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16370852 tcacatcgaaatgagagggttcctgatgccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacttatatcaacaa 16370754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Original strand, 18304410 - 18304544
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||| ||| | ||  |||||   ||||||    
T  18304410 cgacagcttctagacgaaccaaatcacaacggaatgagaaggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggatgatgaaaagcttatataaattgt 18304509  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18304510 ttggtactacctatatcaacaagatgcatattctt 18304544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22975161 - 22975076
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  22975161 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgtgactgcatggttgaagaaaagcttataagaattgttt 22975076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24182353 - 24182278
Alignment:
Q  164 gtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  24182353 gtatgagacgaaatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactatctataccaacaagatgcatcttctt 24182278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29680236 - 29680177
Alignment:
Q  136 gaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat 195  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  29680236 gaatgagagagatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttat 29680177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 5549339 - 5549458
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat-gagaattgtttgatactacctata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || |||| || | ||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||| ||||    
T  5549339 aactgaatcacatcggaatgagatggttcatgaaaccatgtaggtatgagattgtataattgaaggaaaacttataaaaaattgtttggtactacgtata 5549438  T
Q  220 tcaacaacatgcatattctt 239  Q
     |||||| |||  |||||||    
T  5549439 ccaacaatatgtttattctt 5549458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18750328 - 18750229
Alignment:
Q  140 gagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||  |||  ||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||    
T  18750328 gagagagatcctgaagtcgtgcaggtttggaactgcatggttgaaggaaggattataacaattgtttggtactacctataccaaaaagatgcatcttctt 18750229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30719952 - 30719838
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||  | ||||| |||   || ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||  |||    
T  30719952 gaatcacatcagaatgagagggatcctgaggttgtgcaagtatgggacatcattgttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctataaaaac 30719853  T
Q  225 aacatgcatattctt 239  Q
    || |||||| |||||    
T  30719852 aagatgcatcttctt 30719838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39801571 - 39801501
Alignment:
Q  164 gtatgagactatatggttgaaggaagactta-tgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  | | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  39801571 gtatgagactatatggttaaaagaagactttctaaaaatcgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 39801501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4673572 - 4673504
Alignment:
Q  171 actatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4673572 actacatgattgaaggaagtcttataagaattatttggtagcacctgtatcaacaagatgcatattctt 4673504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 2664 - 2855
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |  || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  2664 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggagcacaaggcacgacaatgagtggctcccgacaacttctagaggaatcgaatcacatcgaaatgagaggga 2763  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2764 tcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatattctt 2855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 162829 - 162711
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  162829 aactgaattacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatat 162730  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
     ||||| |||||| |||||    
T  162729 taacaagatgcatcttctt 162711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 69925 - 69862
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  69925 aggtatgagactgcatcgttgaaggaatgcttataataattgtttggtactacctatatcaaca 69862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 107614 - 107496
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  107614 aactgaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactaccaatat 107515  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  107514 caacaagatgcatcttctt 107496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Original strand, 245084 - 245199
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  245084 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 245183  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| |||||    
T  245184 caagatgcatcttctt 245199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Original strand, 245510 - 245634
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||| |||  |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  245510 aactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatat 245609  T
Q  221 caacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||    
T  245610 caacaagatgcatcttcttttcagt 245634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2361 - 2243
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2361 aactgaatcacatcggaatgagaaggatcctaaggccgtgcaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 2262  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  2261 caacaagatgcatcttctt 2243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 105715 - 105833
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  105715 aactaaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggaactgcagggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 105814  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  105815 caacaaaatgcatcttctt 105833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 142425 - 142307
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  142425 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggacttcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatat 142326  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  142325 caacaagatgcatcttctt 142307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 239
Target Start/End: Original strand, 1142 - 1333
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  |     
T  1142 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacaacttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagacggt 1241  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| ||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  1242 tcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatataaacaagatgcatcttctt 1333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 239
Target Start/End: Original strand, 18961 - 19079
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18961 aactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 19060  T
Q  221 caacaacatgcatattctt 239  Q
    |||||| || ||| |||||    
T  19061 caacaagattcatcttctt 19079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18271 - 18204
Alignment:
Q  122 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaag 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  18271 actgaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaag 18204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 245
Target Start/End: Original strand, 154735 - 154876
Alignment:
Q  104 tcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattg 203  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| | |||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  154735 tcgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattg 154834  T
Q  204 tttgatactacctatatcaacaacatgcatattcttctcagt 245  Q
    || | |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  154835 ttgggtactacctgtatcaacaagatgcatcttcttttcagt 154876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 10295 - 10407
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  10295 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatat 10394  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  10395 caacaagatgcat 10407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2203 - 2084
Alignment:
Q  120 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 219  Q
    |||| |||||||| | |||||| || | |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2203 gaaccgaatcacaccagaatgaaagggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 2104  T
Q  220 tcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  2103 tcaacaagatgcatcttctt 2084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Original strand, 23662 - 23785
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| | || ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  23662 tagaggaaccgaatcacaccgaaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac 23761  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattct 238  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  23762 ctatatcaacaagatgcatcttct 23785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 4541 - 4674
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||  |||||||||    
T  4541 gacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaaggagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttagaagaattgtt 4640  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4641 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 4674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5134
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagactt-----atgagaa 200  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||  ||     |  ||||    
T  4996 gacaacttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttaaaagagaagaa 5095  T
Q  201 ttgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  5096 ttgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttctt 5134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Original strand, 45387 - 45486
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||  |  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45387 aatcacatcggaatgagag-gatcttgagaccgtgcatatatgtgactacattgttgaaggaagacttatgagaattatttggtactacctatatcaaca 45485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 4130 - 4015
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  || ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4130 tgaatcacaccagaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctgtatcaa 4031  T
Q  224 caacatgcatattctt 239  Q
    ||| |||||| |||||    
T  4030 caagatgcatcttctt 4015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 174
Target Start/End: Original strand, 729 - 798
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagacta 174  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  729 cgacaacttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggacta 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 239
Target Start/End: Original strand, 2150 - 2218
Alignment:
Q  171 actatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattctt 239  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  2150 actacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactccctatataaacaagatgcatcttctt 2218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1138
Description:

Target: scaffold1138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 812 - 774
Alignment:
Q  157 cgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  812 cgtataggtatgagattatatggttgaaggaggacttat 774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University