View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4353-Insertion-1 (Length: 1000)

Name: NF4353-Insertion-1
Description: NF4353
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4353-Insertion-1
NF4353-Insertion-1
[»] chr3 (149 HSPs)
chr3 (353-868)||(25533107-25533629)
chr3 (352-868)||(53917734-53918251)
chr3 (352-868)||(1313081-1313596)
chr3 (353-868)||(53915566-53916082)
chr3 (353-857)||(457950-458461)
chr3 (353-857)||(746422-746934)
chr3 (352-857)||(455572-456084)
chr3 (353-868)||(51943042-51943557)
chr3 (352-857)||(4103976-4104484)
chr3 (353-857)||(10621610-10622127)
chr3 (355-868)||(42989954-42990491)
chr3 (353-813)||(42991953-42992417)
chr3 (353-773)||(41848804-41849244)
chr3 (353-735)||(27635830-27636212)
chr3 (563-858)||(6561693-6561987)
chr3 (590-863)||(3314593-3314866)
chr3 (603-868)||(4308351-4308616)
chr3 (603-868)||(39715392-39715656)
chr3 (605-868)||(1626753-1627016)
chr3 (605-868)||(28102072-28102335)
chr3 (603-868)||(43228213-43228478)
chr3 (605-868)||(43423533-43423796)
chr3 (604-868)||(11170327-11170591)
chr3 (590-868)||(880521-880800)
chr3 (584-863)||(24979611-24979889)
chr3 (602-868)||(45882860-45883126)
chr3 (604-857)||(3859451-3859704)
chr3 (603-868)||(51727077-51727341)
chr3 (604-862)||(18099246-18099504)
chr3 (606-868)||(10956097-10956359)
chr3 (606-868)||(43421485-43421747)
chr3 (603-868)||(43226008-43226272)
chr3 (605-868)||(5926834-5927097)
chr3 (606-868)||(10958393-10958655)
chr3 (604-868)||(18096970-18097235)
chr3 (604-868)||(22114375-22114639)
chr3 (645-868)||(30005805-30006028)
chr3 (645-868)||(38890004-38890227)
chr3 (602-868)||(32264108-32264379)
chr3 (604-857)||(5191576-5191829)
chr3 (602-862)||(26720469-26720728)
chr3 (605-868)||(36011751-36012014)
chr3 (605-868)||(53468526-53468788)
chr3 (645-868)||(10084459-10084682)
chr3 (645-868)||(27101251-27101474)
chr3 (645-868)||(29956650-29956873)
chr3 (590-868)||(28761499-28761776)
chr3 (602-867)||(15780781-15781061)
chr3 (590-868)||(889843-890119)
chr3 (604-857)||(6065876-6066131)
chr3 (645-868)||(9604677-9604899)
chr3 (602-863)||(18162585-18162845)
chr3 (604-846)||(35777344-35777587)
chr3 (605-836)||(28100143-28100374)
chr3 (604-857)||(6063526-6063782)
chr3 (645-857)||(38210334-38210547)
chr3 (605-841)||(28180948-28181182)
chr3 (605-861)||(47148972-47149233)
chr3 (603-868)||(35918013-35918284)
chr3 (604-857)||(50493922-50494176)
chr3 (602-868)||(10191380-10191649)
chr3 (602-841)||(12268061-12268302)
chr3 (604-857)||(5522707-5522949)
chr3 (602-868)||(48361741-48362006)
chr3 (685-868)||(1321483-1321666)
chr3 (605-868)||(54691644-54691906)
chr3 (657-857)||(25388882-25389082)
chr3 (606-868)||(51674836-51675087)
chr3 (671-857)||(28413112-28413299)
chr3 (592-863)||(23636938-23637205)
chr3 (590-868)||(31151256-31151530)
chr3 (605-868)||(54884081-54884341)
chr3 (591-868)||(53591105-53591371)
chr3 (584-868)||(23633363-23633640)
chr3 (584-868)||(53597144-53597423)
chr3 (605-819)||(28137425-28137628)
chr3 (584-863)||(32218999-32219266)
chr3 (690-849)||(7606676-7606833)
chr3 (602-868)||(13420256-13420508)
chr3 (732-863)||(25688236-25688367)
chr3 (694-868)||(6484372-6484547)
chr3 (605-735)||(47701798-47701928)
chr3 (644-868)||(4666488-4666703)
chr3 (604-749)||(11163073-11163218)
chr3 (692-868)||(25635395-25635568)
chr3 (661-868)||(1673956-1674159)
chr3 (729-864)||(6231849-6231983)
chr3 (606-734)||(6231374-6231502)
chr3 (699-868)||(17795280-17795445)
chr3 (699-868)||(19103720-19103885)
chr3 (692-868)||(561847-562020)
chr3 (745-868)||(11168165-11168288)
chr3 (606-724)||(3306724-3306842)
chr3 (742-849)||(5886261-5886367)
chr3 (742-857)||(5899734-5899848)
chr3 (602-785)||(24177200-24177380)
chr3 (653-867)||(36871373-36871583)
chr3 (353-427)||(6561613-6561687)
chr3 (759-868)||(3306839-3306948)
chr3 (585-868)||(4560362-4560618)
chr3 (743-868)||(14634512-14634638)
chr3 (802-868)||(24181501-24181567)
chr3 (363-436)||(53974124-53974197)
chr3 (603-669)||(6484307-6484373)
chr3 (363-519)||(11066255-11066429)
chr3 (363-436)||(11072644-11072717)
chr3 (602-681)||(1321362-1321441)
chr3 (808-868)||(47701741-47701801)
chr3 (743-819)||(10094196-10094273)
chr3 (743-819)||(10201076-10201153)
chr3 (743-819)||(16462186-16462263)
chr3 (743-819)||(22626106-22626183)
chr3 (743-819)||(47883004-47883081)
chr3 (675-817)||(13419878-13420015)
chr3 (385-508)||(54287487-54287627)
chr3 (743-819)||(10100213-10100290)
chr3 (743-819)||(10208122-10208199)
chr3 (743-819)||(29914075-29914152)
chr3 (743-819)||(47878293-47878370)
chr3 (743-819)||(54193209-54193286)
chr3 (743-806)||(6303293-6303358)
chr3 (761-819)||(10595156-10595213)
chr3 (692-785)||(25633934-25634024)
chr3 (743-819)||(1620581-1620657)
chr3 (824-868)||(25634030-25634074)
chr3 (743-819)||(10896988-10897065)
chr3 (743-819)||(20031440-20031517)
chr3 (743-819)||(54188492-54188569)
chr3 (761-819)||(27762108-27762165)
chr3 (743-818)||(38002852-38002928)
chr3 (438-503)||(53974011-53974077)
chr3 (352-393)||(27000082-27000123)
chr3 (743-819)||(5858529-5858604)
chr3 (743-796)||(27544256-27544311)
chr3 (804-868)||(27635728-27635792)
chr3 (721-783)||(31021300-31021361)
chr3 (743-819)||(10612900-10612977)
chr3 (762-800)||(10949400-10949438)
chr3 (743-819)||(11066652-11066730)
chr3 (766-819)||(4535622-4535674)
chr3 (645-678)||(6719357-6719390)
chr3 (725-770)||(7606828-7606873)
chr3 (770-819)||(11007634-11007683)
chr3 (758-819)||(11079517-11079577)
chr3 (743-783)||(7768632-7768672)
chr3 (433-503)||(11072731-11072801)
chr3 (48-126)||(31636752-31636830)
chr3 (584-677)||(1618916-1619012)
chr3 (683-796)||(27420656-27420765)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (353-868)||(78883-79401)
[»] chr1 (125 HSPs)
chr1 (353-868)||(47905956-47906477)
chr1 (353-862)||(31735601-31736115)
chr1 (352-868)||(24325346-24325870)
chr1 (346-868)||(17324710-17325234)
chr1 (353-862)||(39931762-39932274)
chr1 (353-857)||(9459501-9460013)
chr1 (353-857)||(9463328-9463840)
chr1 (353-868)||(48664852-48665385)
chr1 (380-868)||(21948262-21948756)
chr1 (351-868)||(28998327-28998846)
chr1 (351-868)||(29004043-29004562)
chr1 (353-857)||(27339215-27339730)
chr1 (352-868)||(15294908-15295440)
chr1 (353-857)||(27337024-27337532)
chr1 (351-868)||(2949305-2949817)
chr1 (475-868)||(2510399-2510801)
chr1 (465-857)||(46431792-46432207)
chr1 (602-868)||(38925552-38925818)
chr1 (584-868)||(31422947-31423232)
chr1 (604-868)||(51749982-51750246)
chr1 (602-868)||(15823487-15823753)
chr1 (606-868)||(18307054-18307316)
chr1 (605-868)||(18839531-18839794)
chr1 (588-867)||(50078896-50079175)
chr1 (602-868)||(41646861-41647127)
chr1 (590-868)||(50076746-50077024)
chr1 (602-851)||(13215022-13215271)
chr1 (605-868)||(2617460-2617723)
chr1 (577-868)||(6995774-6996065)
chr1 (605-868)||(17186202-17186465)
chr1 (602-857)||(28842434-28842691)
chr1 (605-868)||(50307620-50307884)
chr1 (603-868)||(9241160-9241425)
chr1 (590-868)||(11457549-11457827)
chr1 (579-857)||(20302378-20302655)
chr1 (604-857)||(51752308-51752560)
chr1 (603-868)||(6756469-6756733)
chr1 (605-867)||(31489859-31490119)
chr1 (605-868)||(50248646-50248909)
chr1 (602-868)||(16428594-16428860)
chr1 (602-857)||(28840619-28840876)
chr1 (604-857)||(13761780-13762033)
chr1 (584-867)||(39462443-39462725)
chr1 (603-868)||(12302579-12302849)
chr1 (604-868)||(10399902-10400166)
chr1 (606-868)||(25251349-25251611)
chr1 (584-863)||(14098049-14098327)
chr1 (604-857)||(16226110-16226364)
chr1 (604-857)||(20291400-20291653)
chr1 (626-868)||(31425089-31425335)
chr1 (631-868)||(4131450-4131692)
chr1 (645-868)||(25127856-25128079)
chr1 (604-862)||(6822958-6823215)
chr1 (602-868)||(3579690-3579958)
chr1 (353-545)||(4131690-4131882)
chr1 (584-868)||(42922157-42922437)
chr1 (348-543)||(45693834-45694029)
chr1 (645-857)||(47177346-47177559)
chr1 (645-857)||(47179697-47179910)
chr1 (606-868)||(17318838-17319094)
chr1 (353-538)||(6115532-6115718)
chr1 (602-868)||(28207140-28207406)
chr1 (605-867)||(17324009-17324269)
chr1 (590-868)||(40133864-40134151)
chr1 (604-860)||(6823827-6824091)
chr1 (584-868)||(8347347-8347627)
chr1 (353-541)||(6997214-6997395)
chr1 (602-868)||(47451589-47451849)
chr1 (585-868)||(18800647-18800925)
chr1 (484-850)||(26520205-26520583)
chr1 (605-868)||(14183666-14183923)
chr1 (602-864)||(15669472-15669731)
chr1 (353-468)||(46432521-46432636)
chr1 (391-551)||(6996067-6996221)
chr1 (584-868)||(8349126-8349407)
chr1 (652-868)||(16432396-16432601)
chr1 (348-506)||(16561126-16561284)
chr1 (592-868)||(49495285-49495549)
chr1 (728-868)||(25248626-25248766)
chr1 (728-857)||(16231630-16231760)
chr1 (626-868)||(13125532-13125772)
chr1 (741-868)||(6115177-6115304)
chr1 (757-857)||(51757627-51757727)
chr1 (746-868)||(16429042-16429164)
chr1 (755-857)||(23785933-23786036)
chr1 (602-868)||(30790475-30790734)
chr1 (363-519)||(13785662-13785835)
chr1 (740-868)||(16561545-16561674)
chr1 (433-519)||(11693580-11693666)
chr1 (626-700)||(25248756-25248830)
chr1 (743-868)||(26613314-26613440)
chr1 (492-554)||(6115479-6115541)
chr1 (743-868)||(30738704-30738830)
chr1 (684-868)||(28279292-28279473)
chr1 (363-434)||(32260746-32260817)
chr1 (802-868)||(23816027-23816093)
chr1 (604-701)||(16231544-16231641)
chr1 (743-819)||(155788-155864)
chr1 (743-819)||(2232580-2232657)
chr1 (390-519)||(10115509-10115653)
chr1 (436-519)||(14352759-14352842)
chr1 (665-819)||(27916504-27916652)
chr1 (743-819)||(2401343-2401420)
chr1 (743-819)||(4144805-4144882)
chr1 (743-819)||(9526449-9526526)
chr1 (743-867)||(14353047-14353170)
chr1 (743-819)||(21353468-21353545)
chr1 (743-819)||(25134054-25134131)
chr1 (743-818)||(26332613-26332688)
chr1 (584-656)||(16431024-16431096)
chr1 (743-819)||(9521698-9521775)
chr1 (363-430)||(11693686-11693753)
chr1 (747-868)||(43104245-43104368)
chr1 (758-819)||(14997040-14997100)
chr1 (685-785)||(26332719-26332814)
chr1 (433-482)||(32260833-32260882)
chr1 (743-820)||(2393403-2393481)
chr1 (637-677)||(6115344-6115384)
chr1 (353-392)||(6997388-6997427)
chr1 (611-785)||(13127790-13127959)
chr1 (420-469)||(13112050-13112099)
chr1 (743-853)||(49959129-49959241)
chr1 (833-868)||(15916562-15916597)
chr1 (400-431)||(16855265-16855296)
chr1 (353-384)||(21964366-21964397)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (352-868)||(11545-12062)
[»] chr7 (120 HSPs)
chr7 (353-868)||(11756925-11757447)
chr7 (353-862)||(18345237-18345752)
chr7 (353-868)||(38393683-38394203)
chr7 (353-868)||(7470094-7470621)
chr7 (353-868)||(20299155-20299677)
chr7 (352-868)||(20625733-20626255)
chr7 (352-868)||(20629624-20630146)
chr7 (352-868)||(20642043-20642565)
chr7 (352-858)||(37412209-37412717)
chr7 (353-868)||(42331069-42331593)
chr7 (353-868)||(7472052-7472574)
chr7 (353-859)||(3035415-3035932)
chr7 (352-868)||(21989852-21990367)
chr7 (353-857)||(31155993-31156500)
chr7 (352-857)||(7351734-7352247)
chr7 (353-857)||(7349355-7349867)
chr7 (353-868)||(28485261-28485783)
chr7 (353-868)||(28487249-28487770)
chr7 (353-868)||(1849665-1850198)
chr7 (361-868)||(24258166-24258680)
chr7 (422-868)||(13099547-13099996)
chr7 (433-868)||(43253589-43254035)
chr7 (457-862)||(20297163-20297573)
chr7 (353-700)||(7094662-7095015)
chr7 (353-689)||(7092426-7092768)
chr7 (605-868)||(44724533-44724796)
chr7 (563-868)||(443507-443812)
chr7 (353-653)||(1606171-1606472)
chr7 (353-621)||(21470614-21470883)
chr7 (353-634)||(38395986-38396269)
chr7 (590-862)||(11355197-11355469)
chr7 (590-868)||(20137181-20137459)
chr7 (602-868)||(27306302-27306567)
chr7 (602-868)||(31435119-31435385)
chr7 (605-868)||(21679981-21680244)
chr7 (602-868)||(35580-35846)
chr7 (590-868)||(4296006-4296286)
chr7 (605-868)||(24748548-24748811)
chr7 (605-868)||(25276095-25276358)
chr7 (604-857)||(40836825-40837078)
chr7 (603-868)||(48457601-48457870)
chr7 (604-857)||(1049378-1049631)
chr7 (353-553)||(47865328-47865528)
chr7 (605-868)||(21678020-21678283)
chr7 (602-868)||(44515-44781)
chr7 (645-868)||(3878571-3878794)
chr7 (605-868)||(39146059-39146322)
chr7 (590-868)||(9680753-9681037)
chr7 (602-844)||(26804524-26804765)
chr7 (645-857)||(1047007-1047219)
chr7 (592-868)||(22828705-22828981)
chr7 (624-868)||(21592215-21592459)
chr7 (605-868)||(27832705-27832969)
chr7 (605-868)||(42223110-42223375)
chr7 (352-673)||(3676996-3677301)
chr7 (650-868)||(40946327-40946545)
chr7 (604-857)||(25542484-25542735)
chr7 (645-868)||(9679053-9679276)
chr7 (584-867)||(7188476-7188755)
chr7 (604-868)||(22251618-22251878)
chr7 (584-868)||(20091617-20091897)
chr7 (353-501)||(443326-443474)
chr7 (607-868)||(24817426-24817682)
chr7 (602-769)||(18567564-18567731)
chr7 (721-868)||(7092284-7092431)
chr7 (680-868)||(24813571-24813755)
chr7 (721-868)||(7094532-7094678)
chr7 (606-865)||(24465503-24465751)
chr7 (356-519)||(40281824-40281989)
chr7 (729-857)||(38396713-38396841)
chr7 (602-796)||(22392424-22392606)
chr7 (755-857)||(2935372-2935475)
chr7 (755-857)||(9027276-9027378)
chr7 (755-857)||(1606484-1606586)
chr7 (755-857)||(22108171-22108273)
chr7 (755-857)||(40549931-40550033)
chr7 (602-868)||(6332177-6332437)
chr7 (743-868)||(16297095-16297222)
chr7 (755-857)||(22137182-22137284)
chr7 (755-857)||(40552209-40552311)
chr7 (781-868)||(6348912-6348999)
chr7 (805-868)||(22393876-22393939)
chr7 (802-868)||(26295598-26295664)
chr7 (363-436)||(10690684-10690756)
chr7 (363-416)||(20297108-20297161)
chr7 (665-868)||(6048889-6049087)
chr7 (665-796)||(11081526-11081651)
chr7 (651-712)||(38396316-38396377)
chr7 (743-819)||(3320172-3320249)
chr7 (743-819)||(3324920-3324997)
chr7 (743-819)||(7069763-7069840)
chr7 (743-819)||(7074770-7074847)
chr7 (743-819)||(25351336-25351413)
chr7 (743-819)||(25357030-25357107)
chr7 (743-819)||(25405376-25405453)
chr7 (743-819)||(25410113-25410190)
chr7 (743-819)||(42006646-42006723)
chr7 (758-819)||(2120899-2120959)
chr7 (743-819)||(8378626-8378703)
chr7 (743-819)||(15541117-15541194)
chr7 (743-819)||(30246953-30247030)
chr7 (743-819)||(44512647-44512724)
chr7 (370-436)||(12310542-12310608)
chr7 (361-407)||(43254023-43254069)
chr7 (721-796)||(12310160-12310234)
chr7 (743-809)||(44143997-44144065)
chr7 (746-849)||(40281468-40281572)
chr7 (761-819)||(34546985-34547042)
chr7 (743-796)||(11084467-11084520)
chr7 (743-796)||(21369625-21369680)
chr7 (433-519)||(12310442-12310528)
chr7 (743-796)||(26210631-26210685)
chr7 (585-663)||(30906327-30906405)
chr7 (611-736)||(6348778-6348903)
chr7 (400-431)||(6628853-6628884)
chr7 (400-431)||(12657667-12657698)
chr7 (743-806)||(7464652-7464717)
chr7 (400-430)||(12485044-12485074)
chr7 (400-430)||(12506475-12506505)
chr7 (525-554)||(443461-443490)
[»] chr5 (112 HSPs)
chr5 (353-862)||(18468698-18469212)
chr5 (353-862)||(27912219-27912737)
chr5 (355-868)||(18511284-18511800)
chr5 (353-868)||(26097421-26097939)
chr5 (353-862)||(27910135-27910651)
chr5 (356-868)||(18509390-18509904)
chr5 (353-868)||(25803707-25804232)
chr5 (352-868)||(18596325-18596852)
chr5 (353-796)||(26098395-26098841)
chr5 (353-857)||(15551925-15552442)
chr5 (433-862)||(18466453-18466885)
chr5 (373-857)||(10586549-10587028)
chr5 (495-868)||(40221349-40221729)
chr5 (353-621)||(3373360-3373630)
chr5 (602-868)||(25921545-25921811)
chr5 (602-868)||(4236570-4236836)
chr5 (602-868)||(21947968-21948233)
chr5 (605-868)||(17072827-17073090)
chr5 (605-868)||(25904047-25904310)
chr5 (605-857)||(2174863-2175115)
chr5 (603-862)||(39854426-39854684)
chr5 (604-857)||(38882048-38882302)
chr5 (602-868)||(2818407-2818674)
chr5 (645-868)||(16092272-16092495)
chr5 (602-868)||(16776098-16776364)
chr5 (590-868)||(31472685-31472963)
chr5 (603-868)||(10529171-10529436)
chr5 (605-860)||(39398073-39398327)
chr5 (605-868)||(1189681-1189949)
chr5 (603-868)||(17818562-17818826)
chr5 (603-868)||(37705852-37706117)
chr5 (608-868)||(10474395-10474655)
chr5 (605-867)||(695833-696083)
chr5 (585-868)||(6756419-6756699)
chr5 (604-857)||(31179453-31179707)
chr5 (604-857)||(31545023-31545277)
chr5 (605-866)||(34530740-34531001)
chr5 (645-868)||(6745053-6745275)
chr5 (604-857)||(31542678-31542931)
chr5 (602-858)||(12556006-12556261)
chr5 (605-868)||(24126800-24127063)
chr5 (605-819)||(20042994-20043208)
chr5 (683-868)||(658425-658610)
chr5 (602-868)||(36402400-36402666)
chr5 (566-866)||(6661260-6661555)
chr5 (604-868)||(31466051-31466314)
chr5 (613-868)||(2954368-2954623)
chr5 (645-857)||(21684534-21684746)
chr5 (645-868)||(6747290-6747511)
chr5 (605-819)||(20044954-20045168)
chr5 (645-857)||(34477135-34477349)
chr5 (645-857)||(34479500-34479714)
chr5 (352-536)||(21288528-21288713)
chr5 (360-505)||(17415748-17415893)
chr5 (636-841)||(21288739-21288949)
chr5 (728-857)||(4410090-4410219)
chr5 (739-868)||(20505913-20506042)
chr5 (602-743)||(20507659-20507800)
chr5 (606-868)||(9020167-9020425)
chr5 (728-868)||(41585816-41585956)
chr5 (740-858)||(39798126-39798244)
chr5 (563-700)||(41585946-41586083)
chr5 (352-457)||(6661929-6662034)
chr5 (605-868)||(36208524-36208783)
chr5 (584-821)||(42770697-42770926)
chr5 (703-868)||(17413239-17413402)
chr5 (723-862)||(2723964-2724094)
chr5 (755-857)||(10749794-10749897)
chr5 (755-857)||(38960214-38960316)
chr5 (648-868)||(20053834-20054042)
chr5 (755-857)||(3373219-3373322)
chr5 (353-432)||(40221282-40221361)
chr5 (433-648)||(15143262-15143475)
chr5 (755-849)||(10757271-10757365)
chr5 (755-857)||(15354657-15354759)
chr5 (755-857)||(15356933-15357035)
chr5 (755-857)||(23665138-23665240)
chr5 (755-857)||(23793347-23793449)
chr5 (743-868)||(15143547-15143673)
chr5 (787-868)||(42770936-42771017)
chr5 (353-407)||(18466411-18466465)
chr5 (363-436)||(5779144-5779217)
chr5 (351-407)||(15143218-15143274)
chr5 (743-819)||(2298123-2298200)
chr5 (603-701)||(4409999-4410101)
chr5 (761-868)||(4897828-4897936)
chr5 (743-819)||(1170794-1170871)
chr5 (743-819)||(35385574-35385651)
chr5 (703-819)||(4754198-4754311)
chr5 (743-819)||(22672817-22672894)
chr5 (743-819)||(25452478-25452555)
chr5 (605-655)||(2723911-2723961)
chr5 (761-819)||(11962555-11962612)
chr5 (764-857)||(23741941-23742034)
chr5 (763-819)||(25445501-25445556)
chr5 (743-819)||(1240411-1240488)
chr5 (743-819)||(28786387-28786464)
chr5 (743-820)||(16093412-16093489)
chr5 (743-868)||(34033639-34033768)
chr5 (665-793)||(29748356-29748479)
chr5 (665-796)||(2144709-2144836)
chr5 (743-819)||(10627347-10627424)
chr5 (743-819)||(17841371-17841448)
chr5 (712-819)||(15224890-15224997)
chr5 (743-819)||(32520518-32520596)
chr5 (831-868)||(15445339-15445376)
chr5 (743-796)||(31782601-31782656)
chr5 (458-506)||(32520268-32520316)
chr5 (400-434)||(2532750-2532784)
chr5 (48-126)||(33305864-33305942)
chr5 (764-818)||(40222769-40222822)
chr5 (831-868)||(20045210-20045247)
[»] chr2 (103 HSPs)
chr2 (353-862)||(23452315-23452829)
chr2 (347-868)||(42452443-42452964)
chr2 (353-868)||(42923581-42924094)
chr2 (353-857)||(35215668-35216184)
chr2 (351-857)||(35218045-35218567)
chr2 (590-868)||(17849022-17849300)
chr2 (606-863)||(15539552-15539809)
chr2 (605-868)||(19007560-19007823)
chr2 (602-853)||(40032145-40032396)
chr2 (602-857)||(42064432-42064687)
chr2 (603-868)||(45280056-45280322)
chr2 (606-862)||(19502089-19502345)
chr2 (590-862)||(28196542-28196814)
chr2 (602-868)||(21520765-21521033)
chr2 (604-862)||(19504424-19504681)
chr2 (604-857)||(27104718-27104970)
chr2 (605-868)||(11739632-11739895)
chr2 (604-857)||(13910127-13910380)
chr2 (613-862)||(34979657-34979906)
chr2 (602-868)||(6258889-6259153)
chr2 (602-868)||(22287408-22287674)
chr2 (606-868)||(6264221-6264479)
chr2 (590-868)||(17848350-17848623)
chr2 (605-868)||(14837193-14837450)
chr2 (604-857)||(24162305-24162548)
chr2 (608-857)||(3022086-3022335)
chr2 (590-868)||(31732849-31733115)
chr2 (602-868)||(43623652-43623906)
chr2 (353-621)||(27583645-27583907)
chr2 (605-862)||(44289146-44289403)
chr2 (645-868)||(45239049-45239271)
chr2 (605-868)||(11578181-11578439)
chr2 (605-782)||(22163106-22163282)
chr2 (602-868)||(18800386-18800640)
chr2 (602-755)||(22407594-22407747)
chr2 (363-554)||(28568556-28568740)
chr2 (645-785)||(38020162-38020302)
chr2 (603-868)||(22874060-22874313)
chr2 (735-862)||(5375424-5375550)
chr2 (602-868)||(17897318-17897580)
chr2 (695-868)||(28459262-28459435)
chr2 (665-868)||(20146681-20146880)
chr2 (352-482)||(27136368-27136506)
chr2 (602-868)||(35107217-35107477)
chr2 (360-448)||(34575608-34575696)
chr2 (645-740)||(5377629-5377724)
chr2 (756-857)||(36558946-36559048)
chr2 (756-857)||(36561223-36561325)
chr2 (741-868)||(40699429-40699557)
chr2 (758-868)||(20589763-20589874)
chr2 (695-868)||(27136197-27136368)
chr2 (584-849)||(37963030-37963283)
chr2 (363-519)||(15693583-15693755)
chr2 (755-857)||(45332263-45332366)
chr2 (606-699)||(38020064-38020157)
chr2 (363-428)||(28568346-28568411)
chr2 (363-436)||(41303549-41303623)
chr2 (602-676)||(12342673-12342748)
chr2 (458-554)||(34575528-34575617)
chr2 (703-819)||(43139395-43139508)
chr2 (743-819)||(17462419-17462496)
chr2 (743-819)||(20054887-20054964)
chr2 (743-819)||(22712638-22712715)
chr2 (743-819)||(22717347-22717424)
chr2 (602-818)||(35028496-35028707)
chr2 (728-819)||(38414202-38414291)
chr2 (743-819)||(39680028-39680105)
chr2 (743-819)||(39686966-39687043)
chr2 (743-819)||(45567392-45567469)
chr2 (743-819)||(17921754-17921832)
chr2 (802-868)||(22407526-22407592)
chr2 (758-819)||(2736205-2736265)
chr2 (742-868)||(15693958-15694087)
chr2 (743-819)||(17932617-17932694)
chr2 (743-819)||(17943520-17943597)
chr2 (743-819)||(27517761-27517838)
chr2 (761-819)||(12781343-12781400)
chr2 (758-819)||(2740941-2741001)
chr2 (823-868)||(22707825-22707870)
chr2 (742-818)||(26345661-26345738)
chr2 (744-796)||(27583483-27583535)
chr2 (743-819)||(28458950-28459028)
chr2 (367-431)||(39286892-39286952)
chr2 (433-504)||(39286971-39287042)
chr2 (761-819)||(37170874-37170931)
chr2 (743-806)||(38190980-38191045)
chr2 (811-868)||(7463020-7463077)
chr2 (743-818)||(7502975-7503052)
chr2 (781-868)||(13828415-13828503)
chr2 (605-700)||(38414281-38414365)
chr2 (366-417)||(7502582-7502633)
chr2 (743-799)||(20050163-20050221)
chr2 (743-819)||(30478977-30479054)
chr2 (434-519)||(7502638-7502723)
chr2 (433-511)||(41303457-41303535)
chr2 (363-436)||(41304898-41304964)
chr2 (747-795)||(10942658-10942707)
chr2 (747-795)||(10948527-10948576)
chr2 (825-868)||(23870956-23870999)
chr2 (743-785)||(34575265-34575308)
chr2 (433-512)||(41304806-41304884)
chr2 (743-794)||(33674551-33674604)
chr2 (584-653)||(40699209-40699278)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (352-868)||(15808961-15809481)
chr8 (351-868)||(3873748-3874273)
chr8 (353-857)||(28283302-28283813)
chr8 (353-868)||(41384493-41385007)
chr8 (353-868)||(608470-608997)
chr8 (353-862)||(43529871-43530372)
chr8 (354-868)||(41382420-41382925)
chr8 (563-862)||(32339263-32339566)
chr8 (602-868)||(14807748-14808014)
chr8 (605-861)||(27106976-27107232)
chr8 (603-858)||(1225164-1225419)
chr8 (590-868)||(14419263-14419541)
chr8 (590-867)||(30480576-30480853)
chr8 (602-857)||(27829294-27829549)
chr8 (602-857)||(27826983-27827238)
chr8 (584-868)||(27910994-27911277)
chr8 (584-868)||(27957413-27957696)
chr8 (602-868)||(15067978-15068244)
chr8 (602-868)||(15072707-15072974)
chr8 (602-868)||(28251639-28251905)
chr8 (590-868)||(13858557-13858834)
chr8 (605-851)||(14477276-14477522)
chr8 (563-857)||(24873263-24873564)
chr8 (604-857)||(18810707-18810960)
chr8 (606-868)||(36865538-36865798)
chr8 (605-868)||(25952521-25952783)
chr8 (605-868)||(5372250-5372512)
chr8 (605-819)||(33541509-33541723)
chr8 (604-857)||(44720842-44721096)
chr8 (645-868)||(22684725-22684951)
chr8 (602-862)||(4424015-4424275)
chr8 (653-857)||(43079650-43079855)
chr8 (645-857)||(43082013-43082226)
chr8 (353-511)||(32339094-32339252)
chr8 (604-857)||(18812892-18813134)
chr8 (590-796)||(5622882-5623088)
chr8 (603-782)||(26775199-26775378)
chr8 (584-868)||(15185787-15186066)
chr8 (590-768)||(35872555-35872728)
chr8 (504-700)||(181434-181632)
chr8 (584-868)||(31162192-31162472)
chr8 (353-465)||(3265640-3265752)
chr8 (605-868)||(21482322-21482573)
chr8 (695-868)||(15956051-15956220)
chr8 (636-868)||(21480545-21480765)
chr8 (635-866)||(3005706-3005932)
chr8 (633-819)||(37214321-37214517)
chr8 (728-868)||(181622-181764)
chr8 (602-716)||(12517248-12517364)
chr8 (602-705)||(3886153-3886256)
chr8 (703-868)||(31573798-31573961)
chr8 (743-868)||(31578350-31578476)
chr8 (740-868)||(31035252-31035380)
chr8 (743-863)||(17847661-17847783)
chr8 (811-868)||(2468202-2468259)
chr8 (602-785)||(2468261-2468436)
chr8 (743-819)||(9021229-9021306)
chr8 (363-434)||(13986304-13986374)
chr8 (743-819)||(16752644-16752721)
chr8 (743-819)||(16757389-16757466)
chr8 (743-819)||(28327891-28327968)
chr8 (743-819)||(28895485-28895562)
chr8 (743-806)||(17799558-17799623)
chr8 (680-777)||(31035144-31035238)
chr8 (743-819)||(590777-590854)
chr8 (743-819)||(4812609-4812686)
chr8 (743-819)||(28332614-28332691)
chr8 (363-434)||(30679186-30679256)
chr8 (743-819)||(33032637-33032714)
chr8 (743-818)||(29554908-29554984)
chr8 (433-519)||(11701364-11701447)
chr8 (743-856)||(13985163-13985278)
chr8 (761-819)||(3276347-3276404)
chr8 (743-809)||(23179692-23179760)
chr8 (743-785)||(33839077-33839120)
chr8 (603-653)||(14419784-14419834)
chr8 (743-795)||(11701102-11701155)
chr8 (743-815)||(21033853-21033925)
chr8 (743-819)||(25684626-25684703)
chr8 (743-819)||(30423195-30423273)
chr8 (743-796)||(13985957-13986011)
chr8 (405-434)||(27820149-27820178)
[»] chr4 (138 HSPs)
chr4 (352-867)||(56030188-56030704)
chr4 (353-868)||(14787503-14788021)
chr4 (351-868)||(24347957-24348479)
chr4 (353-857)||(22132474-22132987)
chr4 (347-857)||(44599920-44600434)
chr4 (351-868)||(17662317-17662828)
chr4 (353-857)||(22134699-22135219)
chr4 (37-352)||(42356481-42356796)
chr4 (353-743)||(5100743-5101133)
chr4 (460-868)||(19322547-19322954)
chr4 (602-868)||(22802806-22803072)
chr4 (481-859)||(53404998-53405387)
chr4 (602-868)||(22800934-22801200)
chr4 (602-868)||(47274722-47274987)
chr4 (590-868)||(19095865-19096144)
chr4 (602-868)||(40091487-40091753)
chr4 (602-868)||(48486314-48486580)
chr4 (602-863)||(24878984-24879245)
chr4 (603-868)||(40637070-40637335)
chr4 (602-868)||(24888791-24889057)
chr4 (606-868)||(33415560-33415821)
chr4 (606-868)||(37313138-37313400)
chr4 (602-868)||(5637537-5637807)
chr4 (602-863)||(24880446-24880707)
chr4 (602-857)||(22044473-22044728)
chr4 (602-857)||(22046768-22047023)
chr4 (590-868)||(38928249-38928528)
chr4 (603-862)||(47868397-47868656)
chr4 (602-857)||(51015241-51015496)
chr4 (602-857)||(9148246-9148503)
chr4 (563-857)||(18709246-18709548)
chr4 (592-868)||(12395917-12396193)
chr4 (645-868)||(8631491-8631714)
chr4 (369-867)||(30136331-30136809)
chr4 (602-867)||(36919657-36919925)
chr4 (592-868)||(12400879-12401155)
chr4 (602-868)||(36921565-36921833)
chr4 (603-868)||(16453305-16453570)
chr4 (602-862)||(5198415-5198675)
chr4 (604-857)||(37089454-37089710)
chr4 (529-862)||(47210830-47211159)
chr4 (604-857)||(11434952-11435205)
chr4 (603-868)||(14633316-14633579)
chr4 (603-868)||(6764835-6765105)
chr4 (604-857)||(16934225-16934479)
chr4 (602-857)||(38409194-38409455)
chr4 (645-857)||(11006319-11006532)
chr4 (603-868)||(36378288-36378553)
chr4 (645-868)||(3824642-3824863)
chr4 (602-857)||(31849681-31849937)
chr4 (604-857)||(16931871-16932125)
chr4 (645-849)||(11008656-11008861)
chr4 (604-862)||(7941316-7941578)
chr4 (603-857)||(2484955-2485210)
chr4 (609-868)||(41997494-41997753)
chr4 (602-868)||(619519-619785)
chr4 (604-857)||(18847150-18847404)
chr4 (607-857)||(9176556-9176807)
chr4 (645-868)||(13543997-13544220)
chr4 (604-857)||(9174228-9174482)
chr4 (605-862)||(18409425-18409681)
chr4 (584-863)||(52942536-52942802)
chr4 (602-868)||(8756324-8756588)
chr4 (645-857)||(22782820-22783033)
chr4 (645-857)||(22780455-22780668)
chr4 (590-868)||(18537547-18537821)
chr4 (605-835)||(3937314-3937543)
chr4 (605-819)||(6132871-6133084)
chr4 (680-857)||(26086059-26086236)
chr4 (353-820)||(10112626-10113081)
chr4 (8-248)||(42357519-42357759)
chr4 (590-863)||(18534910-18535179)
chr4 (352-503)||(47211158-47211309)
chr4 (683-868)||(36380425-36380610)
chr4 (590-768)||(24446756-24446929)
chr4 (605-768)||(38270158-38270321)
chr4 (351-553)||(9022058-9022252)
chr4 (720-868)||(16455354-16455502)
chr4 (687-868)||(38890298-38890476)
chr4 (351-554)||(38890517-38890703)
chr4 (584-868)||(15032621-15032892)
chr4 (692-868)||(27499130-27499303)
chr4 (749-868)||(2891433-2891552)
chr4 (605-724)||(2891314-2891434)
chr4 (757-868)||(13547304-13547415)
chr4 (353-507)||(9863499-9863650)
chr4 (355-450)||(19322410-19322506)
chr4 (606-868)||(28453686-28453943)
chr4 (606-868)||(40999022-40999281)
chr4 (742-868)||(12102221-12102348)
chr4 (353-424)||(14789500-14789571)
chr4 (611-868)||(9863712-9863967)
chr4 (784-868)||(4215483-4215567)
chr4 (743-866)||(47150968-47151092)
chr4 (742-868)||(31983600-31983727)
chr4 (363-519)||(38209098-38209259)
chr4 (746-868)||(3982249-3982374)
chr4 (743-868)||(25357772-25357902)
chr4 (743-819)||(55822248-55822325)
chr4 (369-431)||(5516771-5516833)
chr4 (802-868)||(5635548-5635614)
chr4 (433-519)||(54929094-54929180)
chr4 (743-819)||(7050379-7050456)
chr4 (743-819)||(11853532-11853609)
chr4 (743-868)||(16185908-16186035)
chr4 (808-868)||(5101130-5101190)
chr4 (743-819)||(8529250-8529327)
chr4 (661-868)||(9022362-9022566)
chr4 (433-512)||(10979676-10979755)
chr4 (802-857)||(11437558-11437613)
chr4 (743-819)||(18586949-18587026)
chr4 (743-819)||(31300407-31300484)
chr4 (761-819)||(4556181-4556238)
chr4 (761-819)||(4558314-4558371)
chr4 (743-806)||(4884857-4884922)
chr4 (761-819)||(15316961-15317018)
chr4 (584-677)||(16186099-16186193)
chr4 (367-436)||(29609914-29609983)
chr4 (743-819)||(4570077-4570154)
chr4 (743-819)||(15831124-15831201)
chr4 (743-819)||(16489332-16489409)
chr4 (743-819)||(16689062-16689139)
chr4 (743-819)||(25699732-25699809)
chr4 (743-819)||(36769462-36769539)
chr4 (743-819)||(36771379-36771456)
chr4 (914-974)||(42357658-42357720)
chr4 (743-868)||(54906722-54906849)
chr4 (363-434)||(54929198-54929267)
chr4 (743-819)||(13072103-13072180)
chr4 (743-819)||(15312299-15312376)
chr4 (761-819)||(47566496-47566553)
chr4 (758-819)||(5336904-5336964)
chr4 (721-785)||(10114443-10114505)
chr4 (603-676)||(16455283-16455356)
chr4 (755-819)||(29609592-29609656)
chr4 (924-970)||(42356601-42356649)
chr4 (758-816)||(16638827-16638884)
chr4 (584-653)||(25357614-25357683)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (353-868)||(51709-52227)
scaffold0005 (603-868)||(183713-183976)
scaffold0005 (353-424)||(50159-50230)
[»] chr6 (98 HSPs)
chr6 (352-868)||(30034675-30035197)
chr6 (353-868)||(30966923-30967443)
chr6 (353-857)||(12195597-12196104)
chr6 (353-857)||(2628968-2629479)
chr6 (351-855)||(19704653-19705167)
chr6 (351-857)||(26932644-26933160)
chr6 (355-868)||(17011781-17012282)
chr6 (352-734)||(17852266-17852650)
chr6 (605-868)||(13057173-13057436)
chr6 (590-868)||(3390343-3390621)
chr6 (603-868)||(28241393-28241658)
chr6 (605-868)||(25477253-25477516)
chr6 (604-868)||(11983101-11983365)
chr6 (352-621)||(18317750-18318021)
chr6 (607-868)||(3632010-3632271)
chr6 (605-868)||(3629936-3630199)
chr6 (612-868)||(14458839-14459093)
chr6 (605-868)||(13039733-13039996)
chr6 (602-857)||(14507258-14507513)
chr6 (584-867)||(15541213-15541495)
chr6 (602-868)||(9019902-9020168)
chr6 (603-868)||(1230321-1230586)
chr6 (645-862)||(4816309-4816526)
chr6 (353-554)||(5275727-5275928)
chr6 (584-868)||(15532753-15533036)
chr6 (602-868)||(15530195-15530460)
chr6 (605-868)||(3233802-3234065)
chr6 (603-868)||(30728896-30729165)
chr6 (605-868)||(24338519-24338783)
chr6 (604-834)||(19227514-19227744)
chr6 (602-868)||(32279973-32280238)
chr6 (645-857)||(26065005-26065214)
chr6 (645-857)||(26084974-26085183)
chr6 (605-862)||(22490618-22490876)
chr6 (645-857)||(20915438-20915651)
chr6 (605-868)||(12161629-12161889)
chr6 (602-868)||(3027926-3028188)
chr6 (353-634)||(22858261-22858536)
chr6 (579-868)||(15719600-15719884)
chr6 (605-753)||(32447502-32447651)
chr6 (602-750)||(1072067-1072215)
chr6 (355-519)||(20526548-20526708)
chr6 (746-868)||(1069791-1069913)
chr6 (612-754)||(13870608-13870749)
chr6 (725-857)||(5273298-5273431)
chr6 (602-868)||(16455498-16455762)
chr6 (605-867)||(14466312-14466564)
chr6 (590-867)||(15367000-15367272)
chr6 (602-725)||(8995455-8995578)
chr6 (742-868)||(12186144-12186271)
chr6 (605-867)||(19696420-19696681)
chr6 (741-868)||(26945258-26945386)
chr6 (755-857)||(26066206-26066309)
chr6 (590-771)||(15346355-15346524)
chr6 (755-857)||(33308986-33309088)
chr6 (755-857)||(33311255-33311357)
chr6 (605-717)||(10584105-10584212)
chr6 (755-857)||(26068477-26068580)
chr6 (755-857)||(29754791-29754894)
chr6 (375-519)||(30445243-30445404)
chr6 (744-868)||(28037802-28037927)
chr6 (363-436)||(30443022-30443097)
chr6 (743-819)||(13878710-13878787)
chr6 (743-819)||(13883458-13883535)
chr6 (743-819)||(16785902-16785979)
chr6 (721-867)||(20526902-20527046)
chr6 (743-819)||(26887346-26887423)
chr6 (743-819)||(31248836-31248913)
chr6 (743-819)||(35201448-35201525)
chr6 (743-818)||(19701985-19702061)
chr6 (761-819)||(22351974-22352031)
chr6 (743-868)||(25078630-25078755)
chr6 (743-819)||(3577637-3577713)
chr6 (743-819)||(17036038-17036115)
chr6 (743-819)||(17694973-17695050)
chr6 (712-819)||(22858076-22858181)
chr6 (743-818)||(11138423-11138499)
chr6 (743-819)||(13467586-13467662)
chr6 (743-868)||(7542455-7542581)
chr6 (765-819)||(12166268-12166321)
chr6 (825-867)||(15346546-15346588)
chr6 (603-677)||(12186330-12186406)
chr6 (602-677)||(12937457-12937536)
chr6 (764-819)||(25941650-25941703)
chr6 (801-868)||(30445698-30445766)
chr6 (743-819)||(33215810-33215887)
chr6 (761-819)||(22342923-22342980)
chr6 (761-819)||(26643179-26643236)
chr6 (761-819)||(26749145-26749202)
chr6 (590-677)||(26945112-26945201)
chr6 (831-867)||(3833481-3833517)
chr6 (367-410)||(12158532-12158575)
chr6 (825-868)||(28078268-28078310)
chr6 (433-519)||(30443111-30443195)
chr6 (48-126)||(13998096-13998174)
chr6 (579-633)||(28038012-28038066)
chr6 (766-819)||(5165937-5165989)
chr6 (823-868)||(25465664-25465708)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (352-862)||(1734-2251)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (602-868)||(3947-4212)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (603-868)||(41555-41820)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (602-868)||(14969-15235)
scaffold0131 (645-868)||(14454-14677)
scaffold0131 (743-785)||(31124-31168)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (645-857)||(69374-69586)
scaffold0025 (645-755)||(73208-73318)
scaffold0025 (717-767)||(73160-73210)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (604-857)||(2832-3085)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (590-868)||(79797-80075)
scaffold0004 (743-819)||(188364-188441)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (604-857)||(6151-6405)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (584-868)||(15894-16174)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (645-857)||(34-247)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (605-832)||(35593-35819)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (645-857)||(29164-29376)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (590-868)||(85169-85446)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (606-868)||(16723-16981)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (496-868)||(1715-2080)
scaffold0468 (354-468)||(2070-2184)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (719-857)||(1535-1673)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (353-501)||(4546-4694)
scaffold0133 (563-858)||(4726-5016)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (353-447)||(1-95)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (603-773)||(993-1168)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (755-857)||(22219-22321)
scaffold0140 (755-857)||(24494-24596)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (743-819)||(224802-224879)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (436-506)||(57836-57905)
scaffold0008 (746-868)||(57501-57626)
scaffold0008 (363-434)||(57926-57995)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (743-819)||(16308-16385)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (761-819)||(17108-17165)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (390-431)||(2232-2273)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (363-413)||(10443-10493)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 25533107 - 25533629
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  25533107 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatgg 25533206  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533207 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 25533306  T
Q  553 agnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga---- 648  Q
    ||        ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||        
T  25533307 agaaaaaaa-cgtatcttcagtgtgatatttgttctaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 25533405  T
Q  649 ----tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25533406 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 25533505  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25533506 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25533605  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  25533606 ttgatttctcttttgtaacgttac 25533629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 53918251 - 53917734
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  53918251 ttgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatg 53918152  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53918151 gacaataaatatatttttttaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 53918052  T
Q  552 gagnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagata 650  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||  |||||||||||||     
T  53918051 gagaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatg 53917952  T
Q  651 gagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 750  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917951 gagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 53917852  T
Q  751 ccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgata 850  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917851 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata 53917752  T
Q  851 tctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53917751 tctcttttgtaaagttac 53917734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Original strand, 1313081 - 1313596
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1313081 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatg 1313180  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313181 gacaataaatatatttctgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 1313280  T
Q  552 gagnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag 651  Q
    |||         ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1313281 gagaaaaaaaaagtatctttagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatag 1313380  T
Q  652 agggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 751  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313381 agggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 1313479  T
Q  752 cttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1313480 cttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 1313579  T
Q  852 ctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| |||||    
T  1313580 ctcttttgtaacgttac 1313596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 53916082 - 53915566
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53916082 tgttgtagtatgactcaaaatttgagggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 53915983  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915982 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 53915883  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag 651  Q
    ||         |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  53915882 agaaaaaaaaacgtatcttgagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatag 53915783  T
Q  652 agggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 751  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  53915782 agggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttac 53915683  T
Q  752 cttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915682 cttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 53915583  T
Q  852 ctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| |||||    
T  53915582 ctcttttgtaatgttac 53915566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Original strand, 457950 - 458461
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  457950 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtgg 458049  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458050 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 458149  T
Q  553 agnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga-- 648  Q
    ||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||      
T  458150 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagaga 458249  T
Q  649 --tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 746  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  458250 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttga 458349  T
Q  747 ttcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  458350 ttcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 458449  T
Q  846 tgatatctcttt 857  Q
    |||| |||||||    
T  458450 tgatttctcttt 458461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Original strand, 746422 - 746934
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  746422 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 746521  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746522 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 746621  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------g 645  Q
    ||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||      |    
T  746622 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 746721  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  746722 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 746821  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  746822 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 746921  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||    
T  746922 ttgatttctcttt 746934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 857
Target Start/End: Original strand, 455572 - 456084
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  455572 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtg 455671  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455672 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 455771  T
Q  552 gagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga- 648  Q
    |||          ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||     
T  455772 gagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgcggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagag 455871  T
Q  649 ---tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  455872 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 455971  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  455972 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 456071  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||    
T  456072 ttgatttctcttt 456084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 51943042 - 51943557
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51943042 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 51943141  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51943142 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcattgaagg 51943241  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag 651  Q
    ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  51943242 agaaagaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgatttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatag 51943341  T
Q  652 agggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 751  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943342 agggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcac 51943441  T
Q  752 cttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  51943442 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgt 51943540  T
Q  852 ctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| |||||    
T  51943541 ctcttttgtaacgttac 51943557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 4104484 - 4103976
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  4104484 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatactttatgctgaaaatatatttatg 4104385  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4104384 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 4104285  T
Q  552 gagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga- 648  Q
    |||          ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||     
T  4104284 gagaaaaaaaaaacgtatc---agtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 4104188  T
Q  649 ---tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4104187 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 4104088  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4104087 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 4103988  T
Q  846 tgatatctcttt 857  Q
    |||| |||||||    
T  4103987 tgatttctcttt 4103976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 10622127 - 10621610
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  10622127 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatgg 10622028  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622027 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 10621928  T
Q  553 agnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt-------- 644  Q
    ||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||            
T  10621927 agaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 10621828  T
Q  645 ----gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 740  Q
        ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  10621827 gagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtg 10621728  T
Q  741 ggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgta 839  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10621727 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 10621628  T
Q  840 acccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||| |||||||    
T  10621627 acccattgatttctcttt 10621610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 355 - 868
Target Start/End: Original strand, 42989954 - 42990491
Alignment:
Q  355 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgac 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  42989954 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttttgctgaaagtatatttatggac 42990053  T
Q  455 aataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 554  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990054 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 42990153  T
Q  555 --nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga---- 648  Q
               ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||   ||||| ||||||        
T  42990154 aaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgctaaactttgagagaga 42990253  T
Q  649 ------------------tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacact 730  Q
                      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42990254 gagactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacatt 42990353  T
Q  731 agggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagactt 830  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  42990354 aggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 42990453  T
Q  831 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  42990454 attcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttac 42990491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 353 - 813
Target Start/End: Original strand, 42991953 - 42992417
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42991953 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaaggtttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42992052  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992053 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 42992152  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----gag 647  Q
    ||         ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||| ||    |||    
T  42992153 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtaatattaattccaaatttatgagttatacttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagag 42992252  T
Q  648 atagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 747  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  42992253 atagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgat 42992352  T
Q  748 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||    
T  42992353 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagtg-gactttgggtag 42992417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 353 - 773
Target Start/End: Original strand, 41848804 - 41849244
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41848804 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 41848903  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  41848904 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaaag 41849003  T
Q  553 ag----------nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacc 642  Q
    ||                  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||     
T  41849004 agaaaaaaaaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacattgtatcaggctaaact 41849103  T
Q  643 ttg----------agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 732  Q
    |||          |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41849104 ttgagagagagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 41849203  T
Q  733 ggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt 773  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41849204 ggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 353 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 27636212 - 27635830
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27636212 tgttgtagtatgatttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaatattagtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27636113  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636112 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 27636013  T
Q  553 agnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttata-cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag 651  Q
    ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  | ||| || || ||||||||||||||||    
T  27636012 agaaaaaaat-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatattttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatag 27635914  T
Q  652 agggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 735  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635913 agggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 563 - 858
Target Start/End: Original strand, 6561693 - 6561987
Alignment:
Q  563 cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 662  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6561693 cgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttct-ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaa 6561791  T
Q  663 ataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaaca 762  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6561792 acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 6561891  T
Q  763 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 858  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6561892 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 6561987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 590 - 863
Target Start/End: Original strand, 3314593 - 3314866
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3314593 aatttatgagggatgcttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaa 3314692  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3314693 actagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaca 3314792  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    |||||||  || | ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314793 ggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 3314866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 4308616 - 4308351
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4308616 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4308517  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4308516 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 4308417  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4308416 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 4308351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 39715392 - 39715656
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  39715392 tacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgta 39715490  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  39715491 tagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 39715590  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715591 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttac 39715656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626753
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1626816 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 1626753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28102072
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |    
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 28102136  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 28102072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 43228213 - 43228478
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43228213 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgta 43228312  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43228313 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43228412  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43228413 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 43228478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423533
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |    
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43423596 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttac 43423533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 604 - 868
Target Start/End: Original strand, 11170327 - 11170591
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11170327 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11170426  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11170427 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctggga 11170526  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11170527 ctttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 11170591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 880800 - 880521
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  880800 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaa 880701  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttac 788  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  880700 actagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttac 880601  T
Q  789 gggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || |||||  || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880600 ggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 880521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 584 - 863
Target Start/End: Original strand, 24979611 - 24979889
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24979611 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaac 24979709  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24979710 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttg 24979809  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  24979810 gttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaa 24979889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 45882860 - 45883126
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45882860 atacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 45882959  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  45882960 atagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 45883059  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  45883060 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttac 45883126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 3859451 - 3859704
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3859451 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3859550  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859551 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 3859650  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3859651 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctcttt 3859704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 51727341 - 51727077
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  51727341 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgta 51727242  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51727241 tagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgag 51727143  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  51727142 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 51727077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 604 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 18099504 - 18099246
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt-gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18099504 acttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 18099406  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18099405 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 18099306  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18099305 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 18099246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 10956359 - 10956097
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10956359 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10956260  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956259 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 10956160  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  10956159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttac 10956097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421485
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  || |  |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 43421485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 43226008 - 43226272
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  43226008 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgta 43226106  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43226107 tagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43226206  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  43226207 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 43226272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926834
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 5926898  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  5926897 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttac 5926834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 10958655 - 10958393
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10958655 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10958556  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10958555 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacact 10958456  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  10958455 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttac 10958393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 604 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 18097235 - 18096970
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt-gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18097235 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 18097136  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18097135 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 18097036  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||    
T  18097035 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttac 18096970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 604 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 22114639 - 22114375
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22114639 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtat 22114540  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22114539 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 22114440  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22114439 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 22114375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006028
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  30006005 ttgatttctcttttgtaacgttac 30006028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Original strand, 38890004 - 38890227
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38890004 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38890103  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38890104 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 38890203  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  38890204 ttgatttctcttttgtaacgttac 38890227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 32264379 - 32264108
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaa----ccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggt 697  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  32264379 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagt 32264280  T
Q  698 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 797  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32264279 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 32264180  T
Q  798 ctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttac 868  Q
    |||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32264179 ctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttac 32264108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 5191576 - 5191829
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||   | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5191576 acttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 5191675  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5191676 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 5191775  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5191776 ctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctcttt 5191829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 602 - 862
Target Start/End: Original strand, 26720469 - 26720728
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26720469 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 26720568  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  26720569 atagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgg 26720667  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  26720668 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaa 26720728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012014
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgac 36011950  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36011951 tttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 36012014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468526
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || |||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggac 53468590  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53468589 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 53468526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 10084682 - 10084459
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10084682 gagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 10084583  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  10084582 gattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccg 10084483  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  10084482 ttgatttctcttttgtaacgttac 10084459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 27101474 - 27101251
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27101474 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27101375  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  27101374 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 27101275  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  27101274 ttgatatctcttttgcaacgttac 27101251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956873
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  29956850 ttgatttctcttttgtaacgttac 29956873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 28761776 - 28761499
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28761776 aatttatgagggatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaa 28761677  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28761676 actagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttaca 28761578  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||   ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28761577 ggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 28761499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 602 - 867
Target Start/End: Original strand, 15780781 - 15781061
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15780781 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 15780880  T
Q  702 atagagtt-----------tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 790  Q
    ||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15780881 atagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgg 15780980  T
Q  791 gaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagtta 867  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  15780981 gaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagtta 15781061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 890119 - 889843
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||    
T  890119 aatttatgagggatgcttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aa 890022  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttac 788  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  890021 cctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 889922  T
Q  789 gggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  889921 gggaaga-gttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttac 889843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 6066131 - 6065876
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6066131 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6066032  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||     
T  6066031 tagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 6065932  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6065931 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6065876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604677
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggtt 9604801  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9604800 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 9604701  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  9604700 ttgatttctcttttgtaacgttac 9604677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 602 - 863
Target Start/End: Original strand, 18162585 - 18162845
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatca-gtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||||| | |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18162585 atacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 18162682  T
Q  701 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 800  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18162683 tatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 18162782  T
Q  801 agactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18162783 ggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaa 18162845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 604 - 846
Target Start/End: Original strand, 35777344 - 35777587
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35777344 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 35777443  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |    
T  35777444 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 35777543  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccatt 846  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  35777544 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 605 - 836
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |    
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattctt 836  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28100174 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 6063782 - 6063526
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6063782 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6063683  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctg 800  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  6063682 atagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 6063583  T
Q  801 agactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6063582 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6063526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Original strand, 38210334 - 38210547
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38210334 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38210433  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  38210434 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 38210533  T
Q  844 attgatatctcttt 857  Q
    |||||| |||||||    
T  38210534 attgatttctcttt 38210547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 605 - 841
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  28181146 tttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 605 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148972
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||  ||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 798  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttg-gaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 47149035  T
Q  799 tgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgta 861  Q
    || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149034 tgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgta 47148972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 35918284 - 35918013
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35918284 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 35918185  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35918184 tagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagag 35918085  T
Q  797 gctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     ||| || ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35918084 actgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 35918013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 50493922 - 50494176
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||||  | ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  50493922 actttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 50494021  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  || |    
T  50494022 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattggg 50494121  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50494122 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 50494176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 10191649 - 10191380
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggt 697  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| | | |||| ||    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10191649 atacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggt 10191550  T
Q  698 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 797  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10191549 ttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagagg 10191450  T
Q  798 ctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||    
T  10191449 ctg-gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttac 10191380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 602 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 12268302 - 12268061
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaat-tagggtttg 700  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  12268302 atacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttg 12268203  T
Q  701 tatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  12268202 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 12268103  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    | | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12268102 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 5522949 - 5522707
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  5522949 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-- 5522852  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
             ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5522851 ---------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 5522761  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5522760 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 5522707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 48362006 - 48361741
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  48362006 atacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaatgacaacaacaaaactagggtttgt 48361908  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||     
T  48361907 atagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgg 48361808  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | |||| ||||||||||| | | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  48361807 ggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttac 48361741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 685 - 868
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321666
Alignment:
Q  685 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 784  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  785 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 1321666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691644
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  |  | |    
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggc 54691708  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| || ||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  54691707 tttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttac 54691644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 657 - 857
Target Start/End: Original strand, 25388882 - 25389082
Alignment:
Q  657 gctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttga 756  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25388882 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg- 25388980  T
Q  757 gaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctct 855  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25388981 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctct 25389080  T
Q  856 tt 857  Q
    ||    
T  25389081 tt 25389082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674836
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |    
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttac 51674836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 671 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413112
Alignment:
Q  671 ttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagg 770  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  771 attg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 28413112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 592 - 863
Target Start/End: Original strand, 23636938 - 23637205
Alignment:
Q  592 tttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaat 691  Q
    ||||||||  ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||     
T  23636938 tttatgagggataattttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaac 23637036  T
Q  692 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 791  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  23637037 tagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatggg 23637133  T
Q  792 aagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    ||||   |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23637134 aagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttataaa 23637205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Original strand, 31151256 - 31151530
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaaca 687  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |    
T  31151256 aatttatgagggatgcttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaaga 31151354  T
Q  688 aaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtta 787  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31151355 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 31151451  T
Q  788 cgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||| ||  || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31151452 cgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttac 31151530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884341
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||      
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta-- 54884178  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaac 54884278  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||  |||||||||   ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  54884279 tttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttac 54884341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 591 - 868
Target Start/End: Original strand, 53591105 - 53591371
Alignment:
Q  591 atttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaa 690  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  53591105 atttatgaggaatgcttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaa 53591204  T
Q  691 ttagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 790  Q
     ||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  53591205 ctagggttt-----------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacga 53591293  T
Q  791 gaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| ||  |  || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  53591294 gaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttac 53591371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Original strand, 23633363 - 23633640
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| | ||||    
T  23633363 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaac 23633461  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23633462 aagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttg 23633556  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  23633557 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttac 23633640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Original strand, 53597144 - 53597423
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || | ||||    
T  53597144 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaacaagggtttataa-gtcaac 53597241  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53597242 aagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 53597338  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || | | ||| ||  ||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  53597339 gtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttac 53597423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 605 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137425
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  || | |    
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggc 28137440  T
Q  805 tttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||    
T  28137439 tttgggtagaattag 28137425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 584 - 863
Target Start/End: Original strand, 32218999 - 32219266
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||  | ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32218999 gttccaaattt-taagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaac 32219097  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    ||||||| |||           |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32219098 aacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttg 32219186  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    ||| |||||||||  || ||||||||| |||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32219187 gttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaa 32219266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 690 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 7606833 - 7606676
Alignment:
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606833 attagggtttgta--gagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 7606736  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7606735 ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgat 7606676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 13420508 - 13420256
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||          ||  ||| ||||||||||    
T  13420508 atacttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgt 13420419  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  13420418 atagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 13420323  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13420322 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttac 13420256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 732 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688236
Alignment:
Q  732 gggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagactta 831  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  832 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 25688236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 694 - 868
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484547
Alignment:
Q  694 gggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 792  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  793 agaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||  || |  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttac 6484547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 605 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggt 735  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 644 - 868
Target Start/End: Original strand, 4666488 - 4666703
Alignment:
Q  644 tgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 743  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||           |||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  4666488 tgagatagagggggctgaaagaagggtctagtaagacaacaacaaaaatagggttt-----------gtctcttgacaacagacactagggtttgagggt 4666576  T
Q  744 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggaga--cttattcttgtaac 841  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||     
T  4666577 tgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaat 4666676  T
Q  842 ccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4666677 ccattgatatctcttttgtaaggttac 4666703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 604 - 749
Target Start/End: Original strand, 11163073 - 11163218
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    |||||||| |||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11163073 acttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11163172  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163173 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 692 - 868
Target Start/End: Original strand, 25635395 - 25635568
Alignment:
Q  692 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 791  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25635395 tagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacggg 25635491  T
Q  792 aagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25635492 aagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttac 25635568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 661 - 868
Target Start/End: Original strand, 1673956 - 1674159
Alignment:
Q  661 aaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaa 760  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||    
T  1673956 aaataagggtttagaa-gttaacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaa 1674051  T
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 860  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  1674052 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgt 1674151  T
Q  861 aaagttac 868  Q
    ||||||||    
T  1674152 aaagttac 1674159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 729 - 864
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6231983
Alignment:
Q  729 ctagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagac 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| | ||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  829 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 864  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 6231983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 606 - 734
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactaggg 734  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 699 - 868
Target Start/End: Original strand, 17795280 - 17795445
Alignment:
Q  699 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 798  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||      
T  17795280 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 17795375  T
Q  799 tgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795376 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 17795445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 699 - 868
Target Start/End: Original strand, 19103720 - 19103885
Alignment:
Q  699 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 798  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||      
T  19103720 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 19103815  T
Q  799 tgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19103816 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 19103885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 692 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 562020 - 561847
Alignment:
Q  692 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 791  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  562020 tagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtg 561924  T
Q  792 aagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  561923 aagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttac 561847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 745 - 868
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168288
Alignment:
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttac 11168288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 606 - 724
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  706 agtttgtctctttggaaca 724  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 742 - 849
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886367
Alignment:
Q  742 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttg-gaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  842 ccattgat 849  Q
    ||||||||    
T  5886360 ccattgat 5886367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 742 - 857
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899848
Alignment:
Q  742 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttg-gaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  842 ccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||| |||||||    
T  5899833 ccattgatttctcttt 5899848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 602 - 785
Target Start/End: Original strand, 24177200 - 24177380
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||  | |||||| |||| |||||||||    
T  24177200 atacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttagat-gtcaacaagaaaactagggtttg 24177298  T
Q  701 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 785  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177299 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 653 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871373
Alignment:
Q  653 gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 752  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcacc 36871488  T
Q  753 ttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    |||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||| |   | ||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  36871487 ttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttat 36871388  T
Q  852 ctcttttgtaaagtta 867  Q
    ||| ||||||||||||    
T  36871387 ctc-tttgtaaagtta 36871373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 353 - 427
Target Start/End: Original strand, 6561613 - 6561687
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 427  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561613 tgttgtagtatgactcgaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 6561687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 759 - 868
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306948
Alignment:
Q  759 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 858  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  859 gtaaagttac 868  Q
    ||||||||||    
T  3306939 gtaaagttac 3306948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 585 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 4560618 - 4560362
Alignment:
Q  585 ttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaaca 684  Q
    |||||| |||| |||  ||||||| ||||||| ||||  |  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||    
T  4560618 ttccaattttacgagggatactttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaaca 4560519  T
Q  685 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 784  Q
    |||||| |||           |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||    
T  4560518 acaaaactag-----------agtttgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttgg 4560438  T
Q  785 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||  ||   |||||||||||||||| |||    |||    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4560437 ttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag----ctt----ttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttac 4560362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634512
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  842 ccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttac 14634512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 802 - 868
Target Start/End: Original strand, 24181501 - 24181567
Alignment:
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24181501 gactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttac 24181567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 363 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 53974197 - 53974124
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 436  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974197 tgactcaaaatttgatggatgaagaatgttgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaattatattttgtgct 53974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 603 - 669
Target Start/End: Original strand, 6484307 - 6484373
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaggg 669  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6484307 tacttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 363 - 519
Target Start/End: Original strand, 11066255 - 11066429
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaat-ataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatat 444  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||                 |||||||     
T  11066255 tgactcataatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaaagataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgctttcggaagattgttgttgaaaatac 11066354  T
Q  445 atttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11066355 atttatggacaataaatatatttttttaccatatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaagagaatatt 11066429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 436
Target Start/End: Original strand, 11072644 - 11072717
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 436  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11072644 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgcaaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgct 11072717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 602 - 681
Target Start/End: Original strand, 1321362 - 1321441
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggca 681  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1321362 atacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 808 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701741
Alignment:
Q  808 gggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 47701741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 10094273 - 10094196
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10094273 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 10094196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 10201153 - 10201076
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10201153 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 10201076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 16462186 - 16462263
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16462186 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 16462263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 22626183 - 22626106
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22626183 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 22626106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 47883081 - 47883004
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  47883081 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 47883004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 675 - 817
Target Start/End: Original strand, 13419878 - 13420015
Alignment:
Q  675 aaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattg 774  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  13419878 aaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatca 13419972  T
Q  775 agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatt 817  Q
    ||||||||||| |||| |||||  | | | |||||||||||||    
T  13419973 agtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 385 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 54287627 - 54287487
Alignment:
Q  385 agaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-----------------tgaaaatatatttatcgacaataaatatattt 467  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||                 ||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  54287627 agaagattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttcgtgcttccaaaagattgctgttgaaaatatatttatggataataaatacattt 54287528  T
Q  468 ttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttga 508  Q
    || ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  54287527 ttgtactgtatgaaggaatatttgatgcaaatatattttga 54287487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 10100290 - 10100213
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  10100290 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattag 10100213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 10208199 - 10208122
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10208199 ttgattcaccttgaacaaaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 10208122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 29914152 - 29914075
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  29914152 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 29914075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 47878370 - 47878293
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  47878370 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 47878293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 54193209 - 54193286
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  54193209 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 54193286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 743 - 806
Target Start/End: Original strand, 6303293 - 6303358
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 806  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6303293 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 6303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595156
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattag 10595156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 692 - 785
Target Start/End: Original strand, 25633934 - 25634024
Alignment:
Q  692 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 785  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |  | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633934 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620581
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattag 1620581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 824 - 868
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634074
Alignment:
Q  824 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttac 25634074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 10896988 - 10897065
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10896988 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 10897065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 20031517 - 20031440
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  20031517 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattag 20031440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 54188492 - 54188569
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  54188492 ttgattcaccttgaacaaagcactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 54188569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762108
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattag 27762108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 818
Target Start/End: Original strand, 38002852 - 38002928
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 818  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38002852 ttgattcaccttgaacaaaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 53974077 - 53974011
Alignment:
Q  438 aaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatg-aagaacaatttgatgcaaatatat 503  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  53974077 aaaatatatttatagacaataaatatatttttgtaccgtatgaaaggaagatttgatgcaaatatat 53974011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 393
Target Start/End: Original strand, 27000082 - 27000123
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattg 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27000082 ttgttgtagtatgactgaaaatttgatggatggagaatattg 27000123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 5858529 - 5858604
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5858529 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgag--tcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 5858604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 796
Target Start/End: Original strand, 27544256 - 27544311
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27544256 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 804 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635728
Alignment:
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 27635728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 721 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  721 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 10612977 - 10612900
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10612977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 10612900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 762 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949400
Alignment:
Q  762 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 800  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 10949400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066730
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattag 11066730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 766 - 819
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535674
Alignment:
Q  766 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattag 4535674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 645 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 6719390 - 6719357
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaag 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6719390 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaag 6719357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 725 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  725 aacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagg 770  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 770 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007634
Alignment:
Q  770 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattag 11007634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 758 - 819
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079577
Alignment:
Q  758 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattag 11079577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 743 - 783
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 433 - 503
Target Start/End: Original strand, 11072731 - 11072801
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatat 503  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| | | |  |||||||||||||||||    
T  11072731 tgctgaaaatacatttatggacaacaaatagatttttgtaccgtattacggaagatttgatgcaaatatat 11072801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 31636830 - 31636752
Alignment:
Q  48 taacctttggtgggagtttaagcttccaaatgatactccaatgacctgttactctatgttgcgtcataacactatcatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||| || | |||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  31636830 taacctttggtgggagtttaagattccaaatagaattccaatgcccaggtactctatgttgcagcatgacaatatcatt 31636752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 1619012 - 1618916
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt--gagatagagggggctg-aaataagggtttagaaa 677  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||  | ||||| ||  |||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1619012 gttccaattttatgagggatactttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 683 - 796
Target Start/End: Original strand, 27420656 - 27420765
Alignment:
Q  683 caacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac-cttgagaaacactattaggattgagtctct 781  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||   |||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||    
T  27420656 caacaaaattagggtttgtagagaattt---tcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcacgctggagaaatactattagaactcagtctct 27420750  T
Q  782 tggttacgggaagag 796  Q
    |||| ||||||||||    
T  27420751 tggtcacgggaagag 27420765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 78883 - 79401
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  78883 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtctcaaatatattttctgctaaaaatatatttatgg 78982  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78983 ataataaatatatttttgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 79082  T
Q  553 agnnnnnnnnc---gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagat 649  Q
    ||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  79083 aggaaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacctttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagat 79182  T
Q  650 agagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 749  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  79183 agagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattc 79282  T
Q  750 accttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  79283 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 79382  T
Q  850 atctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||| |||||    
T  79383 ttctcttttgtaacgttac 79401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 125)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 47905956 - 47906477
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47905956 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 47906055  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47906056 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 47906155  T
Q  553 agnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------ga 646  Q
    ||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||      ||    
T  47906156 agaaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagaga 47906255  T
Q  647 gatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 746  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47906256 gatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttga 47906355  T
Q  747 ttcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccatt 846  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  47906356 ttcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 47906455  T
Q  847 gatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  47906456 gatttctcttttgtaacgttac 47906477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 31736115 - 31735601
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31736115 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaaggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 31736016  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736015 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 31735916  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacct----tgag 647  Q
    ||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |    ||||    
T  31735915 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgag 31735816  T
Q  648 atagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 747  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31735815 atagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 31735716  T
Q  748 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattg 847  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  31735715 tcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattg 31735616  T
Q  848 atatctcttttgtaa 862  Q
    || ||||||||||||    
T  31735615 atttctcttttgtaa 31735601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Original strand, 24325346 - 24325870
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  24325346 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatg 24325445  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325446 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 24325545  T
Q  552 gag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------ 644  Q
    |||          ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||          
T  24325546 gagaaaaaaaaatgtatctttagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagaga 24325645  T
Q  645 --gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 742  Q
      ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24325646 gagagatagagggggctgaaacaaggg-ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggg 24325744  T
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacc 842  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24325745 ttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 24325844  T
Q  843 cattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    
T  24325845 cattgatttctcttttgtaatgttac 24325870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 346 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 17325234 - 17324710
Alignment:
Q  346 atatgtttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatata 445  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17325234 atatggttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgagttgaaaatata 17325135  T
Q  446 tttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttca 545  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17325134 tttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgcaagggaatattatattttttatgcaaatattctttca 17325035  T
Q  546 ctgaaggagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacct 643  Q
    |||||||||          ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | ||| ||||||||    
T  17325034 ctgaaggagaaaaaaaaaacgtatcttcagggtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacct 17324935  T
Q  644 tgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 743  Q
      ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17324934 gaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggt 17324835  T
Q  744 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  17324834 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 17324735  T
Q  844 attgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  17324734 attgatatctcttttgtaacgttac 17324710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 862
Target Start/End: Original strand, 39931762 - 39932274
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39931762 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 39931861  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39931862 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatacttttgatgcaaatattcttttattgaagg 39931961  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt--gagat 649  Q
    ||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| ||   |||| ||  |||||    
T  39931962 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagat 39932061  T
Q  650 agagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 749  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  39932062 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgatta 39932161  T
Q  750 accttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39932162 accttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgat 39932261  T
Q  850 atctcttttgtaa 862  Q
     ||||||||||||    
T  39932262 ttctcttttgtaa 39932274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 9460013 - 9459501
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9460013 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 9459914  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9459913 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 9459814  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------g 645  Q
    ||         |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||      |    
T  9459813 agaaaaaaaaacgtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 9459714  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  9459713 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttg 9459614  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  9459613 attcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccca 9459514  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||    
T  9459513 ttgatttctcttt 9459501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 9463840 - 9463328
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9463840 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 9463741  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9463740 acaataaatatatttttatatcgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 9463641  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------g 645  Q
    ||         |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||      |    
T  9463640 agaaaaaaaaacgtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 9463541  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  9463540 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttg 9463441  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  9463440 attcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaaccca 9463341  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||    
T  9463340 ttgatttctcttt 9463328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 48664852 - 48665385
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48664852 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 48664951  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag- 551  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  48664952 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcacatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaga 48665051  T
Q  552 ----------gagnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaac 641  Q
               |         |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||    
T  48665052 aagaaaaaaaaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtagtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaac 48665151  T
Q  642 cttgagata------gagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 735  Q
    ||| |||||      ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665152 cttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 48665251  T
Q  736 ttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtta-cgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattc 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48665252 ttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 48665351  T
Q  835 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48665352 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 48665385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 380 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 21948756 - 21948262
Alignment:
Q  380 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  21948756 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg 21948657  T
Q  480 aagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnn---cgtatcttcagtgt 576  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||    
T  21948656 aagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcacagaaggaggaaaaaaaaaacgtatcttcagtgt 21948557  T
Q  577 ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataagggttt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||   ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21948556 ggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 21948457  T
Q  673 agaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggat 772  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21948456 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg-gaaacactattaggat 21948358  T
Q  773 tgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21948357 tgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 21948262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 351 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 28998846 - 28998327
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998846 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 28998747  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 550  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998746 ggacaataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 28998647  T
Q  551 ggagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga 648  Q
    ||||          ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||    
T  28998646 ggagaaaaaaaaaccgtatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgaga 28998547  T
Q  649 tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 748  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28998546 tagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgatt 28998447  T
Q  749 caccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattga 848  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  28998446 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 28998347  T
Q  849 tatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||| || |||||    
T  28998346 catctcttttgcaacgttac 28998327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 351 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 29004562 - 29004043
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004562 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 29004463  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 550  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004462 ggacaataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 29004363  T
Q  551 ggagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga 648  Q
    ||||          ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||    
T  29004362 ggagaaaaaaaaaccgtatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgaga 29004263  T
Q  649 tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 748  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29004262 tagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgatt 29004163  T
Q  749 caccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattga 848  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  29004162 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 29004063  T
Q  849 tatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||| || |||||    
T  29004062 catctcttttgcaacgttac 29004043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 27339730 - 27339215
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatat----tt 448  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  27339730 tgttgtagtatgactccaaatttgacggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatatattt 27339631  T
Q  449 atcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactg 548  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339630 atggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactg 27339531  T
Q  549 aaggagnnnnnnnn---cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt- 644  Q
    |||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||  ||||| ||     
T  27339530 aaggaaaaaaaaaagaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttg 27339431  T
Q  645 ---gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 741  Q
       ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27339430 agagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgg 27339331  T
Q  742 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  27339330 gttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaac 27339231  T
Q  842 ccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||| |||||||    
T  27339230 ccattgatttctcttt 27339215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 15295440 - 15294908
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15295440 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 15295341  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295340 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 15295241  T
Q  552 gag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----- 644  Q
    |||           ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||         
T  15295240 gagaaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttcctaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 15295141  T
Q  645 ---------gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 735  Q
             ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15295140 agagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggtt 15295041  T
Q  736 ttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattct 835  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||| |||||||    
T  15295040 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattct 15294941  T
Q  836 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15294940 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 15294908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 27337532 - 27337024
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27337532 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27337433  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27337432 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaagg 27337333  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----gag 647  Q
    |          |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||  ||||| ||    |||    
T  27337332 aaaaaaaaaaacgtatcttcgatgtggtatttgttccaaatttatgcgttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagag 27337233  T
Q  648 atagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 747  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27337232 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgat 27337134  T
Q  748 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattg 847  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27337133 tcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 27337034  T
Q  848 atatctcttt 857  Q
    || |||||||    
T  27337033 atttctcttt 27337024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 351 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 2949817 - 2949305
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949817 tttgttatagtatgactcaaaatttcatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 2949718  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 550  Q
     |||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2949717 ggacaataaatatatttttgtattgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaatattctttcactgaa 2949618  T
Q  551 g-gagnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagat 649  Q
    | ||         ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||| | | ||||||||||||    
T  2949617 gagaaaaaaaaaacgtatctt------ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagat 2949524  T
Q  650 agagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 749  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2949523 agagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattc 2949424  T
Q  750 accttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  || | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||     
T  2949423 accttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 2949324  T
Q  850 atctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  2949323 atctcttttgtaacgttac 2949305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 475 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 2510801 - 2510399
Alignment:
Q  475 gtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnn------cgtatc 568  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||     
T  2510801 gtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagggaaagaaaaaaaacgtatt 2510702  T
Q  569 ttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaat 664  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||     
T  2510701 ttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaac 2510602  T
Q  665 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacact 764  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2510601 aagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacact 2510502  T
Q  765 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 864  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2510501 attaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggca-gagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaag 2510403  T
Q  865 ttac 868  Q
    ||||    
T  2510402 ttac 2510399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 465 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 46432207 - 46431792
Alignment:
Q  465 tttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnn-- 562  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  46432207 tttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaa 46432108  T
Q  563 cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagag--------- 653  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||||| ||||             
T  46432107 cgtatcttcactgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagaga 46432008  T
Q  654 ------------ggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 741  Q
                |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  46432007 gagagagagatgggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgg 46431908  T
Q  742 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46431907 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 46431808  T
Q  842 ccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||| |||||||    
T  46431807 ccattgatttctcttt 46431792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 38925818 - 38925552
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38925818 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 38925719  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  38925718 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 38925619  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38925618 gactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 38925552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 31423232 - 31422947
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31423232 gttccaattttatgggagatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 31423133  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaac-aaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31423132 aacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctctt 31423033  T
Q  783 ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31423032 ggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttac 31422947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 604 - 868
Target Start/End: Original strand, 51749982 - 51750246
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51749982 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51750081  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51750082 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 51750181  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  51750182 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 51750246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 15823487 - 15823753
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15823487 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 15823586  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823587 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctga 15823686  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15823687 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttac 15823753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307316
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18307254 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttac 18307316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839794
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagac 18839730  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18839731 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 18839794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 588 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 50079175 - 50078896
Alignment:
Q  588 caaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaaca 687  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  50079175 caaatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaaca 50079076  T
Q  688 aaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtta 787  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50079075 aaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggtta 50078976  T
Q  788 cgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    |||||||||  |  ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50078975 cgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 50078896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 41646861 - 41647127
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41646861 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 41646960  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||     
T  41646961 atagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgc 41647060  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41647061 gactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttac 41647127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 50077024 - 50076746
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  50077024 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaa 50076925  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076924 actagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 50076825  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||  || || ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50076824 ggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttac 50076746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 602 - 851
Target Start/End: Original strand, 13215022 - 13215271
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13215022 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 13215121  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  13215122 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgg 13215221  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215222 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 13215271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617723
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2617659  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2617660 tttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 2617723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 577 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 6996065 - 6995774
Alignment:
Q  577 ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaa 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  6996065 ggtattcgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaa 6995966  T
Q  677 aggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgag 776  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6995965 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgag 6995866  T
Q  777 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  6995865 tctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttac 6995774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186202
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||| ||||||||||    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   ||    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaac 17186266  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17186265 tttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttac 17186202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Original strand, 28842434 - 28842691
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28842434 atacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28842533  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28842534 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggct 28842633  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28842634 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 28842691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307620
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  705 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |     
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 50307685  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  50307684 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 50307620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 9241425 - 9241160
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9241425 tacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 9241327  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  9241326 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 9241227  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9241226 ggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttac 9241160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 11457827 - 11457549
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  11457827 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaa 11457728  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11457727 actagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacg 11457628  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     ||||||  || |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457627 cgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 11457549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 579 - 857
Target Start/End: Original strand, 20302378 - 20302655
Alignment:
Q  579 tattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaag 678  Q
    |||| ||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20302378 tatttgttccaaattt-taagtgaaacttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 20302476  T
Q  679 gcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtc 778  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20302477 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 20302576  T
Q  779 tcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20302577 tcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 20302655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 51752308 - 51752560
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51752308 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtat 51752407  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752408 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 51752506  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51752507 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 51752560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 6756469 - 6756733
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6756469 tacttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6756568  T
Q  703 tagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||     
T  6756569 tagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag--tcttgattacgagaagagattgg 6756666  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756667 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttac 6756733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 605 - 867
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490119
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||    
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31490057 tttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggtta 31490119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248646
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagac 50248710  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  50248709 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttac 50248646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 16428594 - 16428860
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||||||||||||||| |  || |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16428594 atacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 16428693  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  16428694 atagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 16428793  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16428794 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 16428860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Original strand, 28840619 - 28840876
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28840619 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggttt 28840718  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840719 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 28840818  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28840819 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 28840876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 13761780 - 13762033
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13761780 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtat 13761879  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13761880 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtga 13761979  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13761980 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 13762033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 584 - 867
Target Start/End: Original strand, 39462443 - 39462725
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||     
T  39462443 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaa 39462541  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39462542 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 39462641  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39462642 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagtta 39462725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 12302849 - 12302579
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggt 697  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12302849 tacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggt 12302750  T
Q  698 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 797  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12302749 ttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 12302650  T
Q  798 ctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  12302649 ttgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttac 12302579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 604 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 10400166 - 10399902
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    |||||| |||||||||||  | ||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  10400166 actttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 10400067  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  10400066 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 10399967  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10399966 ctttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 10399902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251349
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttac 25251349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 584 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 14098327 - 14098049
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||    
T  14098327 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaac 14098229  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14098228 tacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 14098129  T
Q  784 gttacgggaagaggctgaga-ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098128 gttacgggaagagatt-agagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 14098049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 16226110 - 16226364
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16226110 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16226209  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |    
T  16226210 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 16226309  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16226310 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 16226364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291653
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| || | |||  ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20291499  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||    
T  20291500 agagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactagga 20291599  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20291600 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 20291653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 626 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31425089
Alignment:
Q  626 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aaca 724  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  725 aacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgag---tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagac 821  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  822 aggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 31425089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 631 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 4131692 - 4131450
Alignment:
Q  631 tcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 728  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131692 tcagagtaaaccttgagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 4131593  T
Q  729 ctagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagac 828  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||    
T  4131592 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaac 4131494  T
Q  829 ttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  4131493 ttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttac 4131450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128079
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattca 25128055  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  25128056 ttgatatctcttttgtaaggttac 25128079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 604 - 862
Target Start/End: Original strand, 6822958 - 6823215
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    |||||||||||  |||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6822958 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6823057  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |     
T  6823058 agagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggg 6823156  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6823157 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaa 6823215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 3579958 - 3579690
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg--ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3579958 atacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggttt 3579859  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  3579858 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagatt 3579759  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | | ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579758 ggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 3579690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 353 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 4131882 - 4131690
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  4131882 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatgg 4131783  T
Q  453 ac-aataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttca 545  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4131782 acaaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattata-ttttgatgcaaatattctttca 4131690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Original strand, 42922157 - 42922437
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  42922157 gttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaac 42922255  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42922256 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttg 42922352  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || ||||||||||  || |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42922353 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 42922437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45694029 - 45693834
Alignment:
Q  348 atgtttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 447  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45694029 atgtgtgttgtactatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatt 45693930  T
Q  448 tatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttt 543  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  45693929 tatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaataatatattttttatgcaaatattcttt 45693834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Original strand, 47177346 - 47177559
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  47177346 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47177445  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggat-tgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47177446 gattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccc 47177545  T
Q  844 attgatatctcttt 857  Q
    |||||| |||||||    
T  47177546 attgatttctcttt 47177559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Original strand, 47179697 - 47179910
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  47179697 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47179796  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47179797 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47179896  T
Q  844 attgatatctcttt 857  Q
    |||||| |||||||    
T  47179897 attgatttctcttt 47179910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319094
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||      |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggact 17319031  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17319032 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttac 17319094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 353 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6115718 - 6115532
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaa-tttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6115718 tgttgtaggatgactcaaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 6115619  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatat 538  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6115618 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaatgacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatat 6115532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 28207406 - 28207140
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28207406 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 28207307  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||     
T  28207306 gtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattgg 28207207  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | |||||  || |||||  | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  28207206 ggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 28207140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 605 - 867
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324269
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  | ||| ||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||  ||    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaac 17324206  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17324207 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 17324269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Original strand, 40133864 - 40134151
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg---------gctgaaataagggtttagaaaggc 680  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||| |||||         ||||||| |||||||||||| | |    
T  40133864 aatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaatcttgagatataggggctgaaaggggctgaaacaagggtttagaatgac 40133963  T
Q  681 aacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctc 780  Q
    ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  40133964 aacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctc 40134063  T
Q  781 ttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| ||||||||||  ||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40134064 ttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttac 40134151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 604 - 860
Target Start/End: Original strand, 6823827 - 6824091
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||||||||  |||||  | ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6823827 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6823926  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgggaaga 795  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||       |||||||||||||    
T  6823927 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaaga 6824026  T
Q  796 ggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 860  Q
    |  || | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6824027 gattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 8347627 - 8347347
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaa 682  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||    
T  8347627 gttccaattttatgaggggtacttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaa 8347530  T
Q  683 caacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  8347529 caagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctctt 8347433  T
Q  783 ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | | ||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8347432 gatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 8347347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 353 - 541
Target Start/End: Original strand, 6997214 - 6997395
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  6997214 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatata-ttatgg 6997312  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattct 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6997313 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacgatttgatgcaaa------ttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattct 6997395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 47451589 - 47451849
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47451589 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgt 47451688  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||        |||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  47451689 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt-ag-----tgtttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 47451782  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  47451783 ggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 47451849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 585 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 18800925 - 18800647
Alignment:
Q  585 ttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaaca 684  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| | |||||    
T  18800925 ttccaattttatgagg-atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaaca 18800828  T
Q  685 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 784  Q
    | |||| || ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18800827 agaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctagg 18800731  T
Q  785 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||| ||||  |   ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800730 tcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttac 18800647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 484 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 26520583 - 26520205
Alignment:
Q  484 acaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnc--------gtatcttcagtg 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||                 ||||||||||||    
T  26520583 acaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaagaagaaaaaaacaaaagaaatgtatcttcagtg 26520484  T
Q  576 tggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaat-aagggttta 673  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||    
T  26520483 tgatattcgttccaaatttataagttatatttct-ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggttta 26520385  T
Q  674 gaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt 773  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26520384 gaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgatt 26520289  T
Q  774 gagtctcttg------gttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaacccattgata 850  Q
    ||||||||||      || ||||||||||  || ||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26520288 gagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata 26520205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183666
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||   ||| |||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtata 14183827  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |   |     
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaat 14183730  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14183729 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttac 14183666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 602 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 15669731 - 15669472
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaata-agggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||| | | |||| || ||||| ||||||||    
T  15669731 atacttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttggga-ggcagca-caaaagtagggttt 15669634  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  15669633 gtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 15669537  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 864  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15669536 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaag 15669472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 353 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 46432636 - 46432521
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46432636 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 46432537  T
Q  453 acaataaatatatttt 468  Q
    ||||||||||||||||    
T  46432536 acaataaatatatttt 46432521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 391 - 551
Target Start/End: Original strand, 6996067 - 6996221
Alignment:
Q  391 ttgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaattt 490  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6996067 ttgttgctaaaaatataaaagacttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaatacatatatttttgtaccgtatgaagaacgattt 6996166  T
Q  491 gatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||| |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6996167 gatgtaaa------ttgaaagggaatattatatttttgttgcaaatattctttcactgaag 6996221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 8349407 - 8349126
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaa 682  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||    |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||    
T  8349407 gttccaattttatgagggataattttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaa 8349309  T
Q  683 caacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  8349308 caagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgat 8349212  T
Q  783 ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  8349211 ggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttac 8349126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 652 - 868
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432601
Alignment:
Q  652 agggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 751  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||           ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  752 cttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatat 16432584  T
Q  852 ctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16432585 ctcttttgtaatgttac 16432601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 348 - 506
Target Start/End: Original strand, 16561126 - 16561284
Alignment:
Q  348 atgtttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 447  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561126 atgtctgttgttgtatgattcaaaatttgttggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 16561225  T
Q  448 tatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatatttt 506  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||    
T  16561226 tattgacaataaatatctttttgtaccgtatgaaggaatatttgaaacaaatatatttt 16561284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 592 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 49495549 - 49495285
Alignment:
Q  592 tttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaat 691  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||            
T  49495549 tttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatcaaac-------- 49495458  T
Q  692 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 791  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||     
T  49495457 tagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggt 49495362  T
Q  792 aagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||  || | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49495361 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 49495285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 728 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248626
Alignment:
Q  728 actagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggaga 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  828 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 25248626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 728 - 857
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231760
Alignment:
Q  728 actagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggag 826  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  827 acttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctcttt 16231760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 626 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 13125772 - 13125532
Alignment:
Q  626 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg-tatagagtttgtctctttggaaca 724  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||    
T  13125772 ttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgaca 13125675  T
Q  725 aacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacag 823  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| |   |    
T  13125674 aacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttg 13125577  T
Q  824 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13125576 aagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 13125532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 741 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115177
Alignment:
Q  741 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaa 840  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  841 cccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattac 6115177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 757 - 857
Target Start/End: Original strand, 51757627 - 51757727
Alignment:
Q  757 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 856  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  51757627 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttctctt 51757726  T
Q  857 t 857  Q
    |    
T  51757727 t 51757727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 746 - 868
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429164
Alignment:
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttac 16429164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 23785933 - 23786036
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23785933 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 23786032  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  23786033 cttt 23786036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 30790734 - 30790475
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |||  |  ||| ||||||||     
T  30790734 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt- 30790638  T
Q  701 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 800  Q
      ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||   |    
T  30790637 --tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatgg 30790544  T
Q  801 agactttgggtagaattagaca-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790543 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 30790475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 363 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 13785835 - 13785662
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatata 445  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||    
T  13785835 tgactcaaaaattgatggatggagaatattgtcgctaaaaatatgaaagatttgtttcaaatatattttgtgtttctagaatattgttgctgaaaatata 13785736  T
Q  446 tttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    ||||| || | ||||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13785735 tttatagatagtaaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 13785662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 740 - 868
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561674
Alignment:
Q  740 gggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgt 838  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||  ||||||||||||||||| || |   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  839 aacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttac 16561674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 433 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 11693666 - 11693580
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11693666 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 11693580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 626 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 25248830 - 25248756
Alignment:
Q  626 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25248830 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613314
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  842 ccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttac 26613314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 492 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 6115541 - 6115479
Alignment:
Q  492 atgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6115541 atgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 6115479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738704
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || || |||||||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  842 ccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttac 30738704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 684 - 868
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279473
Alignment:
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  783 ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| ||||||||||  || |||||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttac 28279473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Original strand, 32260746 - 32260817
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 434  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  32260746 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaatataaaagaattgtttaaaatatattttgtg 32260817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 802 - 868
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816093
Alignment:
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 23816093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 604 - 701
Target Start/End: Original strand, 16231544 - 16231641
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  16231544 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155864
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattag 155864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 2232580 - 2232657
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2232580 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 2232657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 519
Target Start/End: Original strand, 10115509 - 10115653
Alignment:
Q  390 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatatatttatcgacaataaatatatttttata 472  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||     
T  10115509 attgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgcttccataagattgttgttgaaaatatatttatggacaataaatat--ttttatc 10115606  T
Q  473 ccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10115607 ccgtatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaacggaatatt 10115653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 436 - 519
Target Start/End: Original strand, 14352759 - 14352842
Alignment:
Q  436 tgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    |||||||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14352759 tgaaaatatatttatgaatagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 14352842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 665 - 819
Target Start/End: Original strand, 27916504 - 27916652
Alignment:
Q  665 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacact 764  Q
    |||||||||||| | || ||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   |||||||||||||  |||||||    
T  27916504 aagggtttagaa-gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacact 27916597  T
Q  765 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||| |||||||    
T  27916598 attagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattag 27916652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 2401420 - 2401343
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2401420 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 2401343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 4144882 - 4144805
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  4144882 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattag 4144805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 9526449 - 9526526
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9526449 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 9526526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 867
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353170
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaa 840  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||||||||||    || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  841 cccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    ||| |||| |  |||||||||||||||    
T  14353146 ccctttgaaa--tcttttgtaaagtta 14353170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 21353545 - 21353468
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaac--actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21353545 ttgattcaccttgaacaacgcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 21353468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 25134054 - 25134131
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25134054 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 25134131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 818  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 584 - 656
Target Start/End: Original strand, 16431024 - 16431096
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 656  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16431024 gttccaattttatgagggatacttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 9521698 - 9521775
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9521698 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 9521775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 11693753 - 11693686
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 430  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11693753 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattattgctaaaattataaaaattttgttttaaatatattt 11693686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 747 - 868
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104368
Alignment:
Q  747 ttcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggaga-cttattcttgtaaccca 844  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||   ||| |||||||||||||||| |   | |||  || ||||||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttac 43104368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 758 - 819
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997100
Alignment:
Q  758 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattag 14997100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 685 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 26332814 - 26332719
Alignment:
Q  685 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 784  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26332814 acaaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttgg 26332720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 433 - 482
Target Start/End: Original strand, 32260833 - 32260882
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaag 482  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32260833 tgctgaaaatatatttatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 32260882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 2393481 - 2393403
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaga 820  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  2393481 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattaga 2393403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 637 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 6115384 - 6115344
Alignment:
Q  637 taaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaa 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6115384 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 353 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6997427 - 6997388
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatt 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6997427 tgttgtagtatgactcaaaatatgatggatggagaatatt 6997388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 611 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127790
Alignment:
Q  611 ctataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 710  Q
    |||||||||||  | ||||||| | ||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagaga-ggggttgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  711 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 785  Q
      || || | ||||||||||||||||   || | ||||||||||| |||||| | || | ||| |||||||||||    
T  13127861 -ccttttggcaacaaacactagggtt--gggatagattcaccttgggaaacattgttggaattaagtctcttggt 13127790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13112099 - 13112050
Alignment:
Q  420 caaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgacaataaatatattttt 469  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13112099 caaatgtattttatgctgaaaatatattcatggacaataaatatattttt 13112050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 743 - 853
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959241
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaa 840  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||  | |||||||||| || ||||||    || ||| |||||| |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  841 cccattgatatct 853  Q
    ||| |||||||||    
T  49959229 ccctttgatatct 49959241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 833 - 868
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916597
Alignment:
Q  833 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttac 15916597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16855296 - 16855265
Alignment:
Q  400 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16855296 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 16855265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21964397 - 21964366
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21964397 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgg 21964366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 12062 - 11545
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12062 ttgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 11963  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11962 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 11863  T
Q  552 gagnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagata 650  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  11862 gagaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagata 11763  T
Q  651 gagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 750  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  11762 gagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgatttt 11663  T
Q  751 ccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgata 850  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||     
T  11662 ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatt 11563  T
Q  851 tctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||| |||||    
T  11562 tctcttttgtaacgttac 11545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 120)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 11756925 - 11757447
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11756925 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 11757024  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757025 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 11757124  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--- 648  Q
    ||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||       
T  11757125 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 11757224  T
Q  649 -tagagggggctgaaataaggg-tttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttg 745  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11757225 atagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttg 11757324  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11757325 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 11757424  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  11757425 tgatttctcttttgtaacgttac 11757447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 862
Target Start/End: Original strand, 18345237 - 18345752
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18345237 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttattg 18345336  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345337 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaatggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 18345436  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----ga 646  Q
    ||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  | ||| ||    ||    
T  18345437 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgaggga 18345536  T
Q  647 gatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 746  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18345537 gatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttga 18345636  T
Q  747 ttcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccatt 846  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18345637 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 18345736  T
Q  847 gatatctcttttgtaa 862  Q
    ||| ||||||||||||    
T  18345737 gatttctcttttgtaa 18345752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 38393683 - 38394203
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38393683 tgttgtagtatgattctaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatttatttatgg 38393782  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393783 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 38393882  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--- 648  Q
     |         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||       
T  38393883 tgaaaaaataacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 38393982  T
Q  649 -tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 747  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38393983 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 38394082  T
Q  748 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattg 847  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  38394083 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 38394182  T
Q  848 atatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  38394183 atttctcttttgtaacgttac 38394203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 7470621 - 7470094
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7470621 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaacatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 7470522  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7470521 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 7470422  T
Q  553 agnnnnnnnn--------cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt 644  Q
    ||                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||    
T  7470421 agaaaagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaacttt 7470322  T
Q  645 gaga----tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 740  Q
    ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7470321 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtg 7470222  T
Q  741 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaa 840  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7470221 ggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7470122  T
Q  841 cccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7470121 cccattgatttctcttttgtaacgttac 7470094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 20299155 - 20299677
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20299155 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20299254  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299255 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 20299354  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--- 648  Q
    ||         |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||       
T  20299355 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccatatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 20299454  T
Q  649 -tagagggggctgaaataaggg-tttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttg 745  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20299455 atagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttg 20299554  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20299555 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 20299654  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  20299655 tgatttctcttttgtaacgttac 20299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Original strand, 20625733 - 20626255
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20625733 ttgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 20625832  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20625833 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaag 20625932  T
Q  552 gagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----g 645  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  | || ||||||  ||||| ||    |    
T  20625933 gagcaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagag 20626032  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20626033 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttg 20626132  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  20626133 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccat 20626232  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  20626233 tgatttctcttttgtaacgttac 20626255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Original strand, 20629624 - 20630146
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20629624 ttgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 20629723  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20629724 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaag 20629823  T
Q  552 gagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----g 645  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  | || ||||||  ||||| ||    |    
T  20629824 gagcaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagag 20629923  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20629924 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttg 20630023  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  20630024 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccat 20630123  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  20630124 tgatttctcttttgtaacgttac 20630146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Original strand, 20642043 - 20642565
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20642043 ttgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 20642142  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20642143 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaag 20642242  T
Q  552 gagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----g 645  Q
    |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  | || ||||||  ||||| ||    |    
T  20642243 gagcaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagag 20642342  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20642343 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttg 20642442  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  20642443 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccat 20642542  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  20642543 tgatttctcttttgtaacgttac 20642565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 37412717 - 37412209
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37412717 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 37412618  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    ||||||||||||| || | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37412617 gacaataaatataattatgtaacgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttccactgaag 37412518  T
Q  552 gagnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagata 650  Q
    |||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  37412517 gagaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagata 37412418  T
Q  651 gagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattc 749  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412417 tagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattc 37412318  T
Q  750 accttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37412317 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgat 37412218  T
Q  850 atctctttt 858  Q
    |||||||||    
T  37412217 atctctttt 37412209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 42331593 - 42331069
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42331593 tgttgtagtatgacttaaaatttgatgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42331494  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42331493 acaataagtatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 42331394  T
Q  553 agnnnnnnnn-------cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttg 645  Q
    ||               |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||    
T  42331393 agaaagaaaaaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttg 42331294  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42331293 agatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttg 42331194  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  42331193 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 42331094  T
Q  844 attgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42331093 attgatatctcttttgtaaagttac 42331069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 7472574 - 7472052
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7472574 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 7472475  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    |||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7472474 acaataaatatattattgtatcatatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 7472375  T
Q  553 agnnnnnnnn---cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga- 648  Q
    ||           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||     
T  7472374 agaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagag 7472275  T
Q  649 ---tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
       ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7472274 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 7472175  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  7472174 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccat 7472075  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  7472074 tgatttctcttttgtaacgttac 7472052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 859
Target Start/End: Original strand, 3035415 - 3035932
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3035415 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3035514  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035515 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 3035614  T
Q  553 agnnnnnnnn----cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga 648  Q
    ||            |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||    
T  3035615 agaaagaaaaaaaacgtatcttcagtatggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 3035714  T
Q  649 ----tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3035715 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 3035814  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgg---gaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3035815 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 3035914  T
Q  842 ccattgatatctcttttg 859  Q
    |||||||| |||||||||    
T  3035915 ccattgatttctcttttg 3035932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Original strand, 21989852 - 21990367
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||     
T  21989852 ttgttgtagtatgacccaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattgtgt--tgaaaatatatttatg 21989949  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21989950 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 21990049  T
Q  552 gagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagat 649  Q
    |||          ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||| |||||    
T  21990050 gaggaaaaaaaaacgtatcttctgtgtggtattcgttccaaatttatgagttataattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagat 21990149  T
Q  650 agagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 749  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990150 agagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 21990248  T
Q  750 accttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||    
T  21990249 accttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgat 21990348  T
Q  850 atctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  21990349 atctcttttgtaacgttac 21990367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 31156500 - 31155993
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31156500 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 31156401  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156400 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 31156301  T
Q  553 agnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagata 650  Q
    ||          || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||  | |||| ||||||||    
T  31156300 agaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagata 31156201  T
Q  651 gagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 750  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31156200 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattca 31156101  T
Q  751 ccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31156100 ccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 31156001  T
Q  850 atctcttt 857  Q
     |||||||    
T  31156000 ttctcttt 31155993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 7352247 - 7351734
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7352247 ttgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatg 7352148  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  7352147 gacaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaat 7352048  T
Q  552 gag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------ 644  Q
    |||         ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||          
T  7352047 gagaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagaga 7351948  T
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  7351947 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7351848  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7351847 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 7351748  T
Q  844 attgatatctcttt 857  Q
    |||||| |||||||    
T  7351747 attgatttctcttt 7351734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 7349867 - 7349355
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7349867 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 7349768  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  7349767 acaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatg 7349668  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------g 645  Q
    ||         ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||      |    
T  7349667 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 7349568  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7349567 agatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 7349468  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7349467 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 7349368  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||    
T  7349367 ttgatttctcttt 7349355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 28485261 - 28485783
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28485261 tgttgtagtatgattcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28485360  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28485361 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaagg 28485460  T
Q  553 agnnnnnnnn---cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga- 648  Q
    ||           |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||     
T  28485461 aggaaaaaaaacacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 28485560  T
Q  649 ---tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
       |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28485561 agatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttg 28485660  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  28485661 attcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccat 28485760  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  28485761 tgatttctcttttgtaacgttac 28485783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 28487249 - 28487770
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28487249 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgcttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28487348  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487349 acaataaatataattttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 28487448  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----ga 646  Q
    ||          |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||  ||||| ||    ||    
T  28487449 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttctaaatttatgagttatacttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagaga 28487548  T
Q  647 gatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 746  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||    
T  28487549 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttga 28487648  T
Q  747 ttcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccatt 846  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28487649 ttcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 28487748  T
Q  847 gatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  28487749 gatttctcttttgtaacgttac 28487770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 1849665 - 1850198
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1849665 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 1849764  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1849765 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaagg 1849864  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------ 644  Q
    ||          || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||  | |||| ||          
T  1849865 agaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagaga 1849964  T
Q  645 ----------gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 734  Q
              ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1849965 gagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggg 1850064  T
Q  735 tttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattc 834  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  1850065 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattc 1850164  T
Q  835 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1850165 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 1850198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 361 - 868
Target Start/End: Original strand, 24258166 - 24258680
Alignment:
Q  361 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgacaataaa 460  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24258166 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 24258265  T
Q  461 tatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnn 560  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          
T  24258266 tatatttttgtacagtatgaaggacgatt-gatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcactgaaggagaaaaaa 24258364  T
Q  561 nnc-------gtatcttcagtgtgg--tattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag 651  Q
              ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24258365 ataaagaaatgtatcttcagtgtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttct-ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatag 24258463  T
Q  652 agggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 751  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24258464 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcac 24258563  T
Q  752 cttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  24258564 cttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatat 24258663  T
Q  852 ctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||    
T  24258664 ctcttttgtaaagttac 24258680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 422 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 13099996 - 13099547
Alignment:
Q  422 aatatattttgtgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattat 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13099996 aatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatattttcgtaccgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattat 13099897  T
Q  522 atttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaata 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099896 atttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaata 13099797  T
Q  620 tatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttg 719  Q
    ||  | ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099796 tagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttg 13099697  T
Q  720 gaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  13099696 gaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 13099597  T
Q  820 acaggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttac 868  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13099596 gcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttac 13099547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 433 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 43254035 - 43253589
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 532  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254035 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 43253936  T
Q  533 aaatattctttcactgaaggagnnnnnnnncg----tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||         |    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  43253935 aaatattctttcactgaaggagaaaaaataagaaagtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttg 43253836  T
Q  629 tatcagtgtaaaccttgagatagaggg--------ggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttgg 720  Q
    ||||||  ||||| |||||| |||| |        |||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253835 tatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg 43253736  T
Q  721 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaga 820  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  43253735 aacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattagg 43253637  T
Q  821 caggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  43253636 cgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttac 43253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 457 - 862
Target Start/End: Original strand, 20297163 - 20297573
Alignment:
Q  457 taaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnn 556  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  20297163 taaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggagaa 20297262  T
Q  557 nnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----gagatag 651  Q
           |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||  ||||| ||    |||||||    
T  20297263 aaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttacgagttatacttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatag 20297362  T
Q  652 agggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 751  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20297363 agggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcac 20297462  T
Q  752 cttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20297463 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgattt 20297562  T
Q  852 ctcttttgtaa 862  Q
    |||||||||||    
T  20297563 ctcttttgtaa 20297573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 353 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 7095015 - 7094662
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7095015 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 7094916  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7094915 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 7094816  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----ga 646  Q
    ||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  | ||||||||| | |||| ||    ||    
T  7094815 aggaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagaga 7094716  T
Q  647 gatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7094715 gatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 353 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 7092768 - 7092426
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  7092768 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatgg 7092669  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092668 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 7092569  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----ga 646  Q
    ||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||    ||    
T  7092568 aggaaaaaaaattgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagaga 7092469  T
Q  647 gatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  7092468 gatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 7092426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724796
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44724733 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 44724796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 563 - 868
Target Start/End: Original strand, 443507 - 443812
Alignment:
Q  563 cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 662  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  443507 cgtatcttcagtgtggaattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaa 443606  T
Q  663 ataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaaca 762  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  443607 acaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 443706  T
Q  763 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  443707 ctattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataa 443806  T
Q  863 agttac 868  Q
     |||||    
T  443807 cgttac 443812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 353 - 653
Target Start/End: Original strand, 1606171 - 1606472
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1606171 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 1606270  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606271 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 1606370  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag 651  Q
    ||         || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| |||||||||    
T  1606371 agaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag 1606470  T
Q  652 ag 653  Q
    ||    
T  1606471 ag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 353 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 21470883 - 21470614
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21470883 tgttgtagtttgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 21470784  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470783 acaataaatatatttttatatcgtatgaagaacgatttgatgcgaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 21470684  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 621  Q
    ||         ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470683 agaaaaaaaaacgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 21470614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 353 - 634
Target Start/End: Original strand, 38395986 - 38396269
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38395986 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgt 38396085  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396086 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 38396185  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcag 634  Q
    ||          ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  38396186 agaaaaaaaaaacgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 38396269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 590 - 862
Target Start/End: Original strand, 11355197 - 11355469
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11355197 aatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 11355296  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11355297 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaca 11355396  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11355397 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaa 11355469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 20137459 - 20137181
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20137459 aatttatgagggattcttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 20137360  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20137359 actagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacg 20137260  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137259 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 20137181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 27306567 - 27306302
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27306567 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-t 27306469  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27306468 atagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 27306369  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27306368 gactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttac 27306302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 31435385 - 31435119
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31435385 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 31435286  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31435285 atagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 31435186  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435185 aactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 31435119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680244
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21680181 tttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttac 21680244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 35580 - 35846
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35580 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 35679  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35680 gtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 35779  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35780 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 35846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 4296286 - 4296006
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcatt-gtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaa 688  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  4296286 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaa 4296187  T
Q  689 aattagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtta 787  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296186 aactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 4296087  T
Q  788 cgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  4296086 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 4296006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748811
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || |||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 24748747  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24748748 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 24748811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276358
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 25276294  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25276295 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttac 25276358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 40837078 - 40836825
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||  | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40837078 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40836979  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836978 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 40836879  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40836878 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 40836825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 48457601 - 48457870
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtt 698  Q
    |||||| ||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48457601 tactttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 48457700  T
Q  699 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 798  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457701 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 48457800  T
Q  799 tgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  48457801 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 48457870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 1049631 - 1049378
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1049631 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1049532  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1049531 agagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 1049432  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1049431 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 1049378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 353 - 553
Target Start/End: Original strand, 47865328 - 47865528
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47865328 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 47865427  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865428 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 47865527  T
Q  553 a 553  Q
    |    
T  47865528 a 47865528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678283
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21678220 tttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttac 21678283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 44515 - 44781
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44515 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 44614  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  44615 gtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgg 44714  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  44715 gactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 44781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Original strand, 3878571 - 3878794
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  3878571 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggtt 3878670  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3878671 gattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3878770  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  3878771 ttgatttctcttttgtaacgttac 3878794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39146059
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaac 39146123  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39146122 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttac 39146059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Original strand, 9680753 - 9681037
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaaca 684  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  9680753 aatttatgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaaca 9680852  T
Q  685 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9680853 acaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttg 9680952  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9680953 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttac 9681037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 602 - 844
Target Start/End: Original strand, 26804524 - 26804765
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||    | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26804524 atacttttactataaatatagaccttgt----gagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 26804619  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactag---ggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 798  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26804620 atagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggc 26804719  T
Q  799 tgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26804720 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1047007
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1047020  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||    
T  1047019 ttgatttctcttt 1047007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 592 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 22828981 - 22828705
Alignment:
Q  592 tttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaat 691  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  22828981 tttatgagggatacttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaac 22828882  T
Q  692 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 791  Q
    || |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22828881 taaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatggg 22828782  T
Q  792 aagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22828781 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattac 22828705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 624 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 21592459 - 21592215
Alignment:
Q  624 cattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 723  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21592459 cattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaac 21592360  T
Q  724 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacag 823  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||   |    
T  21592359 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgg 21592260  T
Q  824 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  21592259 gagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 21592215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832705
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 27832770  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27832769 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttac 27832705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223375
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagg-gggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  704 agagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 42223309  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||| ||||||||| | | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  42223310 gctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttac 42223375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 352 - 673
Target Start/End: Original strand, 3676996 - 3677301
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  3676996 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatagatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaa---------- 3677085  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
             ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3677086 ---------tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 3677176  T
Q  552 gag----nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgag 647  Q
    |||            ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||| ||||| |||||| | |||    
T  3677177 gagagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatgtttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggag 3677276  T
Q  648 atagagggggctgaaataagggttta 673  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||    
T  3677277 ataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 650 - 868
Target Start/End: Original strand, 40946327 - 40946545
Alignment:
Q  650 agagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 749  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||     
T  40946327 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgattt 40946426  T
Q  750 accttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40946427 actttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 40946526  T
Q  850 atctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||| |||||    
T  40946527 ttctcttttgtaacgttac 40946545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 25542484 - 25542735
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25542484 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat 25542582  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  25542583 agagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg-gaaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactggga 25542681  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25542682 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 25542735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Original strand, 9679053 - 9679276
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggt 743  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  9679053 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 9679151  T
Q  744 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9679152 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 9679251  T
Q  844 attgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9679252 attgatatctcttttgtaaagttac 9679276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 584 - 867
Target Start/End: Original strand, 7188476 - 7188755
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  7188476 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaac 7188574  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7188575 aataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7188671  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7188672 gtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagtta 7188755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 604 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251618
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 22251779  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  22251778 agagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 22251687  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  22251686 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttac 22251618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 20091897 - 20091617
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaa 682  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | | |||||    
T  20091897 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaa 20091799  T
Q  683 caacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||| | ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  20091798 ca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctctt 20091703  T
Q  783 ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091702 ggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 20091617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 353 - 501
Target Start/End: Original strand, 443326 - 443474
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  443326 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 443425  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatat 501  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  443426 acaataaatatatttttgtaccgtctgaagaacaatttgatgcaaatat 443474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 607 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817426
Alignment:
Q  607 tttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 24817489  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24817488 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttac 24817426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 602 - 769
Target Start/End: Original strand, 18567564 - 18567731
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18567564 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 18567663  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattag 769  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18567664 atagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 721 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092284
Alignment:
Q  721 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaga 820  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||     
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  821 caggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttac 7092284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 680 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813571
Alignment:
Q  680 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtct 779  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  780 cttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttac 24813571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 721 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094532
Alignment:
Q  721 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaga 820  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || | ||||||||||||||||     
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  821 caggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttac 7094532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 606 - 865
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465751
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||        |||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatcaaac--------tagggtttgtata 24465594  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagt 865  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaagt 24465751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 356 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 40281989 - 40281824
Alignment:
Q  356 tgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaata--ttgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcga 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  40281989 tgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaagaatttgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgga 40281890  T
Q  454 caataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||    
T  40281889 aaataaatatatttttgtaccgtatgaaagaatatttgatacggatatatttttaaaaggaatatt 40281824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 729 - 857
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396841
Alignment:
Q  729 ctagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagac 828  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  829 ttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctcttt 38396841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 602 - 796
Target Start/End: Original strand, 22392424 - 22392606
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||        ||||||||||    
T  22392424 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatcaaac--------tagggtttgt 22392515  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    ||||| |||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22392516 atagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 2935372 - 2935475
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2935372 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 2935471  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  2935472 cttt 2935475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 9027378 - 9027276
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9027378 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttct 9027280  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  9027279 cttt 9027276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 1606484 - 1606586
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1606484 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttct 1606582  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  1606583 cttt 1606586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 22108171 - 22108273
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22108171 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 22108269  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  22108270 cttt 22108273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 40549931 - 40550033
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  40549931 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 40550029  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  40550030 cttt 40550033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 6332177 - 6332437
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaaaggca-acaacaaaattagggttt 699  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||  || |||||| | | |||||||    
T  6332177 atacttttactataaatataaaacttgtatcagagtaa-ccttgagagagagggggctggaaacaagggtttataaa--catacaacagact-agggttt 6332272  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
      |||||||||  ||||| | ||||||||||||| || |||  ||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  |    
T  6332273 --atagagttta-ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagatt 6332367  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacagga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6332368 gagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttac 6332437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297095
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaga-caggagacttattcttgtaac 841  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  842 cc-attgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||  || |||||||||||| ||||||||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttac 16297095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 22137182 - 22137284
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22137182 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 22137280  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  22137281 cttt 22137284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 40552209 - 40552311
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  40552209 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 40552307  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  40552308 cttt 40552311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 781 - 868
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6348999
Alignment:
Q  781 ttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattac 6348999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 805 - 868
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22393939
Alignment:
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 22393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 802 - 868
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295664
Alignment:
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 26295664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 436
Target Start/End: Original strand, 10690684 - 10690756
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 436  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10690684 tgactcaaaatttgatggagggagaagattgttgctaaaaatataaaag-tatgtttcaaatatattttgtgct 10690756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 416
Target Start/End: Original strand, 20297108 - 20297161
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297108 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 20297161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 665 - 868
Target Start/End: Original strand, 6048889 - 6049087
Alignment:
Q  665 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttga-gaaacac 763  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||    
T  6048889 aagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaaacac 6048982  T
Q  764 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||   ||||||||||| |||||||| |   | |||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  6048983 tattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatc-cctttgtaa 6049081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 665 - 796
Target Start/End: Original strand, 11081526 - 11081651
Alignment:
Q  665 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacact 764  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  11081526 aagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaacact 11081619  T
Q  765 attaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11081620 attaggattgagtctcttgatcacgggaagag 11081651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 651 - 712
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  651 gagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgt 712  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 3320249 - 3320172
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3320249 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 3320172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 3324997 - 3324920
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3324997 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 3324920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 7069763 - 7069840
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7069763 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 7069840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 7074770 - 7074847
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7074770 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 7074847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 25351336 - 25351413
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25351336 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 25351413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 25357030 - 25357107
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25357030 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 25357107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 25405376 - 25405453
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25405376 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 25405453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 25410113 - 25410190
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25410113 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 25410190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 42006646 - 42006723
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42006646 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 42006723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 758 - 819
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2120959
Alignment:
Q  758 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 2120959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 8378703 - 8378626
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8378703 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 8378626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 15541194 - 15541117
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  15541194 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattag 15541117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 30246953 - 30247030
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30246953 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 30247030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 44512724 - 44512647
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44512724 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 44512647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 370 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12310608 - 12310542
Alignment:
Q  370 aaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 436  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12310608 aaatttaatggatgaagaagattgttgctactgatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 12310542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 361 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 43254069 - 43254023
Alignment:
Q  361 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254069 tatgtctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 43254023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 721 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310160
Alignment:
Q  721 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgag-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 12310160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 44144065 - 44143997
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgg 809  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44144065 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 746 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281468
Alignment:
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |   | |||||||||||||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  845 ttgat 849  Q
    |||||    
T  40281472 ttgat 40281468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546985
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattag 34546985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 743 - 796
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084520
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 11084520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 796
Target Start/End: Original strand, 21369625 - 21369680
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21369625 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 21369680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 12310528 - 12310442
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    |||||||| |||| |||  |||| | ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12310528 tgctgaaattatacttaaggacagttaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgtaaatatatttttaaaaggaatatt 12310442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 796
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210685
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagag 26210685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 30906405 - 30906327
Alignment:
Q  585 ttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa 663  Q
    |||||| |||||||   |||||||| |||||||||||  | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30906405 ttccaattttatgatggatacttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaa 30906327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 611 - 736
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  611 ctataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagt 708  Q
    |||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||  || || |||| |||||||||||| ||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttag-aagtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  709 ttgtctctttggaacaaacactagggtt 736  Q
    ||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 431
Target Start/End: Original strand, 6628853 - 6628884
Alignment:
Q  400 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628853 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 6628884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12657698 - 12657667
Alignment:
Q  400 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657698 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 12657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 7464717 - 7464652
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 806  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  7464717 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctttgtcacggggagaggctgggactt 7464652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 400 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12485074 - 12485044
Alignment:
Q  400 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12485074 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 12485044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 400 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12506505 - 12506475
Alignment:
Q  400 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12506505 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 12506475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 525 - 554
Target Start/End: Original strand, 443461 - 443490
Alignment:
Q  525 tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443461 tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 443490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 112)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 862
Target Start/End: Original strand, 18468698 - 18469212
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18468698 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 18468797  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468798 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 18468897  T
Q  553 agnnnnnnnnc-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----gag 647  Q
    ||          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||   ||||| ||    |||    
T  18468898 agaaaataaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagag 18468997  T
Q  648 atagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 747  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18468998 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgat 18469097  T
Q  748 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattg 847  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  18469098 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattg 18469197  T
Q  848 atatctcttttgtaa 862  Q
    || ||||||||||||    
T  18469198 atttctcttttgtaa 18469212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 862
Target Start/End: Original strand, 27912219 - 27912737
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27912219 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27912318  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912319 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 27912418  T
Q  553 ag---nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----- 644  Q
    ||           ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||         
T  27912419 agaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 27912518  T
Q  645 -gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 743  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  27912519 agagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggt 27912618  T
Q  744 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27912619 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 27912718  T
Q  844 attgatatctcttttgtaa 862  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  27912719 attgatttctcttttgtaa 27912737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 355 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 18511800 - 18511284
Alignment:
Q  355 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgac 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18511800 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 18511701  T
Q  455 aataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 554  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511700 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 18511601  T
Q  555 nnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--tag 651  Q
             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||  |||    
T  18511600 aaaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatag 18511501  T
Q  652 agggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 751  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511500 agggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 18511401  T
Q  752 cttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18511400 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatat 18511301  T
Q  852 ctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||    
T  18511300 ctcttttgtaaagttac 18511284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 26097421 - 26097939
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26097421 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtactgaaaatatatttatgg 26097520  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaa--agggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 550  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097521 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaagaaggaaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 26097620  T
Q  551 ggagnnnnnnnnc--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga 648  Q
    ||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||| ||||||    
T  26097621 ggaggaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgaga 26097720  T
Q  649 tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 748  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26097721 tagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgatt 26097820  T
Q  749 caccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattga 848  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26097821 caccttg-gaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 26097919  T
Q  849 tatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  26097920 tatctcttttgtaacgttac 26097939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 862
Target Start/End: Original strand, 27910135 - 27910651
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27910135 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27910234  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910235 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 27910334  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------ 644  Q
    ||           ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||          
T  27910335 agaaaaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagaga 27910434  T
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27910435 gagatagcgggggctgaaacaa-ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27910533  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27910534 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27910633  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  27910634 ttgatttctcttttgtaa 27910651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 356 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 18509904 - 18509390
Alignment:
Q  356 tgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgaca 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18509904 tgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggaca 18509805  T
Q  456 ataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagn 555  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18509804 ataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggaga 18509705  T
Q  556 nnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagag- 653  Q
            ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||||| | ||     
T  18509704 aaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcatcccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagataga 18509605  T
Q  654 ggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 753  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509604 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 18509505  T
Q  754 tgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18509504 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatct 18509405  T
Q  854 cttttgtaaagttac 868  Q
     ||||||||||||||    
T  18509404 attttgtaaagttac 18509390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 25803707 - 25804232
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25803707 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 25803806  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803807 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 25803906  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacct-------- 643  Q
    ||         ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||  |            
T  25803907 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaatttgagagaga 25804006  T
Q  644 -tgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 742  Q
      ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25804007 gagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggg 25804106  T
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacc 842  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25804107 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 25804206  T
Q  843 cattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    
T  25804207 cattgatttctcttttgtaacgttac 25804232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Original strand, 18596325 - 18596852
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18596325 ttgttgtactatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatg 18596424  T
Q  452 gacaataaatata-----------tttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattc 540  Q
    |||||||||||||           ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18596425 gacaataaatataccataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatacaaatattc 18596524  T
Q  541 tttcactgaaggagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgta 638  Q
    | ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||    
T  18596525 tatcactgaaggagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagta 18596624  T
Q  639 aaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 738  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18596625 aaccttgggatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttg 18596722  T
Q  739 agggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgt 838  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  18596723 agggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgt 18596822  T
Q  839 aacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18596823 aactcattgatatctcttttgtaaagttac 18596852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 353 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 26098841 - 26098395
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26098841 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 26098742  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  26098741 acaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaaaattctttcattgaagg 26098642  T
Q  553 agnnnnnnnn---cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagat 649  Q
    ||           |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||| |||||    
T  26098641 agaaataaaaaaacgtatcttcaatgtggtattcgttccaattttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagat 26098542  T
Q  650 agagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098541 agagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 26098442  T
Q  750 accttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26098441 accttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagag 26098395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Original strand, 15551925 - 15552442
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  15551925 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatgg 15552024  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552025 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatgacatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 15552124  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------ 644  Q
    ||          ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||          
T  15552125 agaaaaaaaaaacgtatcttcagcgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagaga 15552224  T
Q  645 ----gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 740  Q
        |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  15552225 gagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtg 15552324  T
Q  741 ggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgta 839  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15552325 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 15552424  T
Q  840 acccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||| |||||||    
T  15552425 acccattgatttctcttt 15552442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 433 - 862
Target Start/End: Original strand, 18466453 - 18466885
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 532  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466453 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 18466552  T
Q  533 aaatattctttcactgaaggagnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatc 632  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  18466553 aaatattctttcactaaaggagaaaaaaaa-gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgtatc 18466651  T
Q  633 agtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 728  Q
    ||  ||||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18466652 aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaaca 18466751  T
Q  729 ctagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagac 828  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  18466752 ctaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 18466851  T
Q  829 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18466852 ttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 18466885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 284; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 373 - 857
Target Start/End: Original strand, 10586549 - 10587028
Alignment:
Q  373 tttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttata 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  10586549 tttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 10586648  T
Q  473 ccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag--nnnnnnnncgtatctt 570  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||    
T  10586649 tcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaacgtatctt 10586748  T
Q  571 cagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagataga---gggggctgaaataag 667  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||||| |||    |||||||||| |||    
T  10586749 cagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaag 10586848  T
Q  668 ggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttt-ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactat 766  Q
    ||||||||| |||||||||||||            |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10586849 ggtttagaatggcaacaacaaaa-----------ctagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 10586937  T
Q  767 taggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10586938 taggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctcttt 10587028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 495 - 868
Target Start/End: Original strand, 40221349 - 40221729
Alignment:
Q  495 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnn---------cgtatcttcagtgtggtattcgt 585  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                 ||||||||||||||| ||| |||    
T  40221349 caaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgcaggagaaggaaaaaacaaaaaacgtatcttcagtgtgatatccgt 40221448  T
Q  586 tccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaa 685  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40221449 tctaaatttatgagtta--cttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaa 40221546  T
Q  686 caaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 785  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221547 caaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 40221646  T
Q  786 tacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| |||||||  || |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221647 tacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 40221729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 353 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 3373630 - 3373360
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  3373630 tgttgtagtatgactcagaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 3373531  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3373530 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 3373431  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 621  Q
    ||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373430 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 3373360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 25921811 - 25921545
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25921811 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 25921712  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25921711 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 25921612  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25921611 gactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 25921545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 4236570 - 4236836
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4236570 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4236669  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4236670 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 4236769  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  4236770 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 4236836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 21947968 - 21948233
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21947968 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 21948066  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21948067 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgg 21948166  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21948167 gactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttac 21948233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073090
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || | |    
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggc 17073026  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| | ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17073027 tttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 17073090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904310
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |    
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggc 25904246  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  25904247 tttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttac 25904310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 605 - 857
Target Start/End: Original strand, 2174863 - 2175115
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2174863 cttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 2174962  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2174963 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2175062  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2175063 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 2175115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 603 - 862
Target Start/End: Original strand, 39854426 - 39854684
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39854426 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 39854524  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||      
T  39854525 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgga 39854624  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854625 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 39854684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 38882048 - 38882302
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38882048 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 38882147  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38882148 tagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 38882247  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38882248 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 38882302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 2818674 - 2818407
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  2818674 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgt 2818575  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2818574 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctg 2818475  T
Q  801 agactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  2818474 ggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 2818407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092272
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16092296  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  16092295 ttgagatctcttttgtaaggttac 16092272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 16776098 - 16776364
Alignment:
Q  602 atacttttactataaa-tatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16776098 atacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttg 16776197  T
Q  701 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 800  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776198 tatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 16776297  T
Q  801 agactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  16776298 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttac 16776364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 31472963 - 31472685
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31472963 aatttatgagggatgcttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 31472864  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31472863 actagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 31472764  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||  || |||||| ||||||||||| | |||  | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472763 ggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttac 31472685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 10529436 - 10529171
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  10529436 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattttta 10529337  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  10529336 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 10529237  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10529236 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 10529171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 605 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39398073
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  705 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  |    
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 860  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398129 ctttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 39398073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189681
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttac 1189681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 17818826 - 17818562
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17818826 tacttttgttataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 17818728  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  17818727 tagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgag 17818628  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818627 gctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 17818562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 37706117 - 37705852
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  37706117 tacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgta 37706018  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |    
T  37706017 tagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 37705918  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
      ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37705917 gttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 37705852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 608 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474395
Alignment:
Q  608 ttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagag 707  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  708 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagacttt 807  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggacttt 10474456  T
Q  808 gggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10474455 gagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttac 10474395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 605 - 867
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696083
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 696020  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696021 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 696083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 585 - 868
Target Start/End: Original strand, 6756419 - 6756699
Alignment:
Q  585 ttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaaca 684  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    ||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  6756419 ttccaaattt-taagttatacttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaaca 6756517  T
Q  685 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 784  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6756518 acaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttgg 6756617  T
Q  785 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6756618 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttac 6756699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 31179707 - 31179453
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31179707 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31179608  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |    
T  31179607 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31179508  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31179507 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctcttt 31179453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 31545023 - 31545277
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31545023 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31545122  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |    
T  31545123 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattggg 31545222  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31545223 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 31545277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 605 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530740
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||| ||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtt 866  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34530801 tttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagtt 34530740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745275
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 6745251  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  6745252 ttgatttctcttttgtaacgttac 6745275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 31542678 - 31542931
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31542678 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31542777  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |    
T  31542778 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31542877  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  31542878 actttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctcttt 31542931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 602 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 12556261 - 12556006
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||    
T  12556261 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgt 12556162  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||     
T  12556161 atagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattg- 12556063  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 858  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  12556062 gagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttt 12556006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127063
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24127000 tttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 24127063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 605 - 819
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 20043193  T
Q  805 tttgggtagaattag 819  Q
    ||||| |||||||||    
T  20043194 tttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 683 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658425
Alignment:
Q  683 caacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  783 ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 658425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 36402666 - 36402400
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  || ||| ||||||||||    
T  36402666 atacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgt 36402567  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||     
T  36402566 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattgg 36402467  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36402466 aactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttac 36402400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 566 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 6661555 - 6661260
Alignment:
Q  566 atcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata 665  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  6661555 atcttcagtgttatatccgtttcaaatttatgagttata-tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaaca 6661457  T
Q  666 agggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacacta 765  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||| || |||||||||    
T  6661456 agggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacacta 6661361  T
Q  766 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagt 865  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6661360 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagt 6661261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 604 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 31466314 - 31466051
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||| || |||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||    
T  31466314 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtat 31466215  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  31466214 agagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 31466115  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31466114 ctttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttac 31466051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 613 - 868
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954623
Alignment:
Q  613 ataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgt 712  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  713 ctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 811  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  812 agaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttac 2954623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 21684746 - 21684534
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  21684746 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 21684647  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21684646 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 21684547  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||    
T  21684546 ttgatttctcttt 21684534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Original strand, 6747290 - 6747511
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6747290 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggtt 6747388  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  6747389 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 6747488  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||    
T  6747489 ttgatttct-ttttgtaacgttac 6747511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 605 - 819
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045168
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || |||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  805 tttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||    
T  20045154 tttgggtagaattag 20045168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477135
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagaca-ggagacttattcttgtaacc 842  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  843 cattgatatctcttt 857  Q
    ||||||| |||||||    
T  34477149 cattgatttctcttt 34477135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479500
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagaca-ggagacttattcttgtaacc 842  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  843 cattgatatctcttt 857  Q
    ||||||| |||||||    
T  34479514 cattgatttctcttt 34479500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 352 - 536
Target Start/End: Original strand, 21288528 - 21288713
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21288528 ttgttgtagtataactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaataaaaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 21288627  T
Q  452 gacaataaatatatttt-tataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 536  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288628 gacaataaatatattttcggtaccgtatgaagaacgattttatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 21288713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 360 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 17415893 - 17415748
Alignment:
Q  360 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgacaataa 459  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17415893 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggacaataa 17415794  T
Q  460 atatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattt 505  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17415793 atatatttttgtactgtatgaaggaaaatttgatgcaaatatattt 17415748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 636 - 841
Target Start/End: Original strand, 21288739 - 21288949
Alignment:
Q  636 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac------ 729  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  21288739 gtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 21288838  T
Q  730 tagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagact 829  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||  | ||||| |    
T  21288839 tagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagatt 21288937  T
Q  830 tattcttgtaac 841  Q
    | ||||||||||    
T  21288938 ttttcttgtaac 21288949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 728 - 857
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410219
Alignment:
Q  728 actagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggaga 827  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  828 cttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctcttt 4410219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 739 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505913
Alignment:
Q  739 agggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgt 838  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  839 aacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttac 20505913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 602 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 20507800 - 20507659
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20507800 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgt 20507701  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20507700 atagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020425
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttggga-ggcaaca-caaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    ||||||   ||||| | ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  ||       
T  9020265 agagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggag 9020360  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9020361 ctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattac 9020425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 728 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585816
Alignment:
Q  728 actagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggaga 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  828 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttac 41585816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 740 - 858
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798244
Alignment:
Q  740 gggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgta 839  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  840 acccattgatatctctttt 858  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  39798226 acccattgatttctctttt 39798244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 563 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 41586083 - 41585946
Alignment:
Q  563 cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 662  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41586083 cgtatcttcagtctggtattcgttccaaatctatgagttatacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaa 41585984  T
Q  663 ataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    | ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||    
T  41585983 acaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6662034 - 6661929
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  6662034 ttgttgtagtatgacttaaaacttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatg 6661935  T
Q  452 gacaat 457  Q
    ||||||    
T  6661934 gacaat 6661929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208783
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaact-agggttt-tag 36208620  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||| || |||||  |    | | |||||||||   |  ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  36208621 agagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgaga 36208717  T
Q  804 ctttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36208718 ctttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 36208783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 584 - 821
Target Start/End: Original strand, 42770697 - 42770926
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaa 682  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| |||||    
T  42770697 gttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaa-ggcaa 42770794  T
Q  683 caacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
    || |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||| ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||    
T  42770795 ca-caaaattagg-tttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctctt 42770887  T
Q  783 ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagac 821  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42770888 ggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagac 42770926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 703 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 17413402 - 17413239
Alignment:
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  17413402 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag 17413306  T
Q  803 actttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||| |   | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17413305 actttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 17413239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 723 - 862
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724094
Alignment:
Q  723 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagaca 822  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||||||| |     
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagag---------attggtagaattaggcg 2724054  T
Q  823 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 2724094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 10749794 - 10749897
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10749794 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 10749893  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  10749894 cttt 10749897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 38960316 - 38960214
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38960316 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttct 38960218  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  38960217 cttt 38960214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 648 - 868
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054042
Alignment:
Q  648 atagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 747  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  |||| ||| |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  748 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattg 847  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||  || ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  848 atatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20054022 atatctcttttgtaaagttac 20054042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 3373322 - 3373219
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3373322 gagaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 3373223  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  3373222 cttt 3373219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Original strand, 40221282 - 40221361
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221282 tgttgtagtatgactcaaaatttaattgatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 40221361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 433 - 648
Target Start/End: Original strand, 15143262 - 15143475
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 532  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  15143262 tgctaaaaatatatttatggacaataaatacatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgc 15143354  T
Q  533 aaatattctttcactgaa-----ggagnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcatt 627  Q
    ||||||||||||||||||     |||         ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | ||    
T  15143355 aaatattctttcactgaagaaggggaaaaaagaaacgtatcttcagcgtgatatccgttacaaatttatgagttata-tttctctataaatatagacctt 15143453  T
Q  628 gtatcag-tgtaaaccttgaga 648  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  15143454 gtatcagatgtaaaccttgaga 15143475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 755 - 849
Target Start/End: Original strand, 10757271 - 10757365
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10757271 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 10757365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 15354759 - 15354657
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15354759 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 15354661  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  15354660 cttt 15354657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 15357035 - 15356933
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15357035 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 15356937  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  15356936 cttt 15356933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 23665138 - 23665240
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23665138 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 23665236  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  23665237 cttt 23665240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 23793449 - 23793347
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  23793449 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 23793351  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  23793350 cttt 23793347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143673
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacagga-gacttattcttgtaac 841  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |  || |||||||||||||||    || ||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  842 ccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttac 15143673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 787 - 868
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771017
Alignment:
Q  787 acgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttac 42771017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 353 - 407
Target Start/End: Original strand, 18466411 - 18466465
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466411 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 18466465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 5779217 - 5779144
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 436  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5779217 tgacttaaaatttgatagatgaagaagattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 5779144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Original strand, 15143218 - 15143274
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 407  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15143218 tttgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 15143274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 2298200 - 2298123
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2298200 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattag 2298123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 603 - 701
Target Start/End: Original strand, 4409999 - 4410101
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtt 698  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4409999 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4410098  T
Q  699 tgt 701  Q
    |||    
T  4410099 tgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 761 - 868
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897936
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagac-aggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 859  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  860 taaagttac 868  Q
    |||||||||    
T  4897928 taaagttac 4897936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 1170794 - 1170871
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1170794 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 1170871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 35385651 - 35385574
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  35385651 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattag 35385574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 703 - 819
Target Start/End: Original strand, 4754198 - 4754311
Alignment:
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||  || |    
T  4754198 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtg 4754294  T
Q  803 actttgggtagaattag 819  Q
    ||||||| |||||||||    
T  4754295 actttggatagaattag 4754311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 22672817 - 22672894
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22672817 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattag 22672894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 25452478 - 25452555
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25452478 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 25452555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 605 - 655
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723961
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 655  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962555
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattag 11962555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 764 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741941
Alignment:
Q  764 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctcttt 23741941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 763 - 819
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445556
Alignment:
Q  763 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 25445556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 1240411 - 1240488
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1240411 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattag 1240488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 28786387 - 28786464
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  28786387 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattag 28786464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 16093489 - 16093412
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaga 820  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| || ||||||||||||    
T  16093489 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattaga 16093412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033639
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga-gactttgggtagaatt-agacaggagacttattcttgta 839  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | | || ||||||||||||| ||   | |||||| || | |||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaattaagtttgaagacttgttatggta 34033669  T
Q  840 acccatt-gatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34033668 accccttcgatatctcttttgtaaagttac 34033639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 665 - 793
Target Start/End: Original strand, 29748356 - 29748479
Alignment:
Q  665 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-agaaacac 763  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||| |||||||  ||| |||||||  |||| ||||||||    
T  29748356 aagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaaacac 29748449  T
Q  764 tattaggattgagtctcttggttacgggaa 793  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29748450 taataggattgagtctcttggtcacgggaa 29748479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 665 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 2144836 - 2144709
Alignment:
Q  665 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttg-agaaaca 762  Q
    |||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||    
T  2144836 aagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaaca 2144743  T
Q  763 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  2144742 ctattaggatggagtctcttggtcgcgggaagag 2144709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 10627347 - 10627424
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  10627347 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattag 10627424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 17841448 - 17841371
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  17841448 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctg-gaacttgggtagaattag 17841371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 712 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224890
Alignment:
Q  712 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgg 809  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||  | ||||||||||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgg 15224900  T
Q  810 gtagaattag 819  Q
    ||| ||||||    
T  15224899 gtaaaattag 15224890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 32520518 - 32520596
Alignment:
Q  743 ttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga-gactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  32520518 ttgattcacattcgagaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattag 32520596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 831 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 15445376 - 15445339
Alignment:
Q  831 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15445376 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 15445339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 743 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 31782656 - 31782601
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31782656 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagag 31782601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 506
Target Start/End: Original strand, 32520268 - 32520316
Alignment:
Q  458 aaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatatttt 506  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  32520268 aaatatatttttgtaccgtacgaagaaaaatttgatgcaaacatatttt 32520316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 400 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2532784 - 2532750
Alignment:
Q  400 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2532784 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatcttgtg 2532750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 126
Target Start/End: Original strand, 33305864 - 33305942
Alignment:
Q  48 taacctttggtgggagtttaagcttccaaatgatactccaatgacctgttactctatgttgcgtcataacactatcatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||| || | |||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  33305864 taacctttggtgggagtttaagattccaaatagaattccaatgcccaggtactctatgttgcagcatgacaatatcatt 33305942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 764 - 818
Target Start/End: Original strand, 40222769 - 40222822
Alignment:
Q  764 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 818  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  40222769 tattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctg-gaacttgggtagaatta 40222822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 831 - 868
Target Start/End: Original strand, 20045210 - 20045247
Alignment:
Q  831 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20045210 attcttttaacccattgatatcttttttgtaaagttac 20045247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 103)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 23452829 - 23452315
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  23452829 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaataaatttatgg 23452730  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452729 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 23452630  T
Q  553 agnnnnnnnnc-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag 651  Q
    ||          ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||||| ||    
T  23452629 agaaaaaaaaaagtaccttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 23452530  T
Q  652 a----gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 747  Q
    |    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23452529 acagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgat 23452430  T
Q  748 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattg 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  23452429 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattg 23452330  T
Q  848 atatctcttttgtaa 862  Q
    || ||||||||||||    
T  23452329 atttctcttttgtaa 23452315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 347 - 868
Target Start/End: Original strand, 42452443 - 42452964
Alignment:
Q  347 tatgtttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatat 446  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452443 tatgattgttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatat 42452542  T
Q  447 ttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcac 546  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452543 ttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcac 42452642  T
Q  547 tgaaggagnnnnnnnnc--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt 644  Q
    ||||||||           |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | |||| |     
T  42452643 tgaaggagaaaaaaaaaatgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttg 42452742  T
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||    
T  42452743 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctctgt--aacaaacactagagtttgtgggtt 42452840  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42452841 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 42452940  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  42452941 ttgatttctcttttgtaacgttac 42452964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 42924094 - 42923581
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42924094 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42923995  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923994 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaagaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 42923895  T
Q  553 agnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--ta 650  Q
    ||         ||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||  |||||||||||||  ||    
T  42923894 agaacaaataagtatcttcag----gtgttcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagata 42923799  T
Q  651 gagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 750  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923798 gaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 42923699  T
Q  751 ccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgata 850  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42923698 ccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgata 42923599  T
Q  851 tctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42923598 tctcttttgtaaagttac 42923581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 35216184 - 35215668
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35216184 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 35216085  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35216084 acaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaagg 35215985  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------- 644  Q
    ||          | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||           
T  35215984 agaaaaaaaaatgaatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 35215885  T
Q  645 ---gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 741  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  35215884 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgg 35215785  T
Q  742 gttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaa 840  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  35215784 gttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 35215685  T
Q  841 cccattgatatctcttt 857  Q
    | ||||||| |||||||    
T  35215684 ctcattgatttctcttt 35215668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 351 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 35218567 - 35218045
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218567 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 35218468  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 550  Q
     |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218467 ggacaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 35218368  T
Q  551 ggag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----- 644  Q
    ||||         || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||  ||||| ||         
T  35218367 ggagaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgctccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtataaggctaaactttgagag 35218268  T
Q  645 ---------gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 735  Q
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35218267 agagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggt 35218168  T
Q  736 ttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattc 834  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  35218167 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattc 35218068  T
Q  835 ttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  35218067 ttgtaacccgttgatttctcttt 35218045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Original strand, 17849022 - 17849300
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  17849022 aatttatgagggatgcttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaa 17849121  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17849122 actagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacg 17849221  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17849222 gtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 17849300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 606 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539552
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15539609 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaa 15539552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007823
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  || | |    
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19007760 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 19007823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 602 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 40032396 - 40032145
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40032396 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 40032297  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |      
T  40032296 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttag 40032197  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032196 gactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatct 40032145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Original strand, 42064432 - 42064687
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42064432 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 42064531  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064532 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 42064631  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42064632 gactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 42064687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 45280322 - 45280056
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaag-gcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  45280322 tactttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 45280223  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45280222 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 45280123  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45280122 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 45280056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 606 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19502089
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19502146  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19502145 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 19502089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 590 - 862
Target Start/End: Original strand, 28196542 - 28196814
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28196542 aatttatgagggattcttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa 28196641  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28196642 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatg 28196741  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196742 ggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 28196814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 21521033 - 21520765
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21521033 atacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggctt 21520934  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21520933 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct 21520834  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
      |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21520833 aggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 21520765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 604 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 19504681 - 19504424
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19504681 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19504582  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19504581 agagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagaggctggga 19504483  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19504482 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 19504424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 27104718 - 27104970
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27104718 acttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 27104817  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27104818 agagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 27104916  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27104917 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 27104970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739632
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  || |||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttac 11739632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 13910380 - 13910127
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13910380 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 13910281  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  13910280 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaa 13910181  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13910180 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 13910127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 613 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979657
Alignment:
Q  613 ataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgt 712  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  713 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggta 812  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  813 gaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaa 34979657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 6259153 - 6258889
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6259153 atacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgt 6259054  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  6259053 atagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttgg 6258956  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258955 ggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 6258889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 22287674 - 22287408
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22287674 atacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 22287575  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  22287574 atagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattga 22287475  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22287474 cacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttac 22287408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 6264479 - 6264221
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  6264479 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatag 6264384  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||  || | ||    
T  6264383 agtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggct 6264284  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264283 ttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 6264221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Original strand, 17848350 - 17848623
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  17848350 aatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagt--aatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaa 17848447  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttac 788  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848448 actagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 17848547  T
Q  789 gggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||   || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17848548 gggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttac 17848623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837450
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||  ||||||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gggaagagattgagac 14837386  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||  |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 14837450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 24162548 - 24162305
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24162548 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 24162449  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||          |||| ||    
T  24162448 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt----------gctggga 24162359  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24162358 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 24162305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 608 - 857
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022335
Alignment:
Q  608 ttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagag 707  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  708 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagacttt 807  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggtttt 3022285  T
Q  808 gggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3022286 aggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttt 3022335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 31733115 - 31732849
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  | ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31733115 aatttatgagggatgcttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 31733016  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||       
T  31733015 actagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt--- 31732919  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
             || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31732918 ---------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 31732849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 43623906 - 43623652
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43623906 atacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 43623807  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||            |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43623806 atagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43623719  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43623718 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 43623652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 353 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 27583907 - 27583645
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  27583907 tgttgtagtatgactcaaattttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatga 27583808  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27583807 acaataaatatatttttataccatatgaaggaatatttgatgcaaatatattttgaaaaggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaagg 27583715  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 621  Q
    ||           |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  27583714 agaaaaaagaaatgtatcttcagcgtgatatccgttccaaatttatgagttata-tttctctataaatata 27583645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 605 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289146
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||  | ||||||||| ||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggac 44289204  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    || |||||||||||    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44289203 ttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaa 44289146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239049
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggt 743  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagacttt--ctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 45239174  T
Q  744 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  45239173 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaaccc 45239074  T
Q  844 attgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45239073 attgatatctcttttgtaaagttac 45239049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578181
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    || ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11578244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 11578181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 605 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 18800640 - 18800386
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||   | |        ||||||||||    
T  18800640 atacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatcaagc--------tagggtttgt 18800549  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||     
T  18800548 atagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgg 18800453  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800452 ggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 18800386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 602 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 22407747 - 22407594
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22407747 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 22407648  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407647 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 22407594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 363 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 28568740 - 28568556
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgacaataaata 462  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28568740 tgactcaaaatttgatagatgaagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttcaaatatattttgttttgaaaatatatttatggacaataaata 28568641  T
Q  463 tatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 554  Q
    ||||||| || ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28568640 tatttttgtatcgtgtgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgcatatattctttcaccgaaggag 28568556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 645 - 785
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020302
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 785  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 22874060 - 22874313
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||        |||||||||||    
T  22874060 tacttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatcaaac--------tagggtttgta 22874151  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||    
T  22874152 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgag 22874247  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22874248 gctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 22874313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 735 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375424
Alignment:
Q  735 tttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattc 834  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattc 5375452  T
Q  835 ttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaa 5375424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 17897580 - 17897318
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctga-aataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||| ||||| |  |||| || |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  17897580 atacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggttt 17897483  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  |    
T  17897482 gtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagatt 17897387  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17897386 gagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttac 17897318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 695 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459262
Alignment:
Q  695 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 794  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  795 aggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||  || | |||  |||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttac 28459262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 665 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 20146880 - 20146681
Alignment:
Q  665 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacact 764  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||||| |    
T  20146880 aagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaat 20146785  T
Q  765 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 864  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20146784 agtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaag 20146685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 352 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 27136506 - 27136368
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaat--------a 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |    
T  27136506 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattggtgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatataaata 27136407  T
Q  444 tatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaag 482  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27136406 tatttatggaaaataaatatatttttgtaccgtatgaag 27136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 35107217 - 35107477
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||| |  || |||  ||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||    
T  35107217 atacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttg 35107314  T
Q  701 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 800  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  35107315 tatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 35107408  T
Q  801 agactttgggtagaattaga--caggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||||||||||    | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  35107409 tgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttac 35107477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 360 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34575696 - 34575608
Alignment:
Q  360 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 448  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575696 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttctaaatatattttgtgctgaaaatatattt 34575608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 645 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 5377724 - 5377629
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 740  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5377724 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 756 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 36559048 - 36558946
Alignment:
Q  756 agaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctc 854  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36559048 agaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 36558949  T
Q  855 ttt 857  Q
    |||    
T  36558948 ttt 36558946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 756 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 36561325 - 36561223
Alignment:
Q  756 agaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctc 854  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561325 agaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 36561226  T
Q  855 ttt 857  Q
    |||    
T  36561225 ttt 36561223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 741 - 868
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699557
Alignment:
Q  741 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgta 839  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||| |   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  840 acccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttac 40699557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 758 - 868
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589874
Alignment:
Q  758 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagaca-ggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 856  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  857 ttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||    
T  20589863 ttgtgaagttac 20589874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 695 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136197
Alignment:
Q  695 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 794  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  795 aggctgagactttgggtagaattagaca-ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |   || ||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttac 27136197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 584 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 37963283 - 37963030
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||            
T  37963283 gttccaattttatgatggatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga-------- 37963192  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    ||  ||| |||||||||| || |||||| |||||   ||||||||| | ||||   | |||||||| ||||   ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  37963191 aatcaaactagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttg 37963096  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    || ||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37963095 gtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgat 37963030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 363 - 519
Target Start/End: Original strand, 15693583 - 15693755
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatata 445  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||    
T  15693583 tgacttaaaatttgatggatgaataatattgttgctaaaaatataaa-gatttgtttcaaatatattttgtgcttccaaaaacttgttgctgaaaatata 15693681  T
Q  446 tttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15693682 tttatgggcaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaggggatatt 15693755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 45332366 - 45332263
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  45332366 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttct 45332267  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  45332266 cttt 45332263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 606 - 699
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 363 - 428
Target Start/End: Original strand, 28568346 - 28568411
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 428  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568346 tgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 28568411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 363 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41303623 - 41303549
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaa-tataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 436  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41303623 tgactcagaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 41303549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 602 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 12342748 - 12342673
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-taagggtttagaa 676  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12342748 atacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 458 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 34575617 - 34575528
Alignment:
Q  458 aaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 554  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575617 aaatatatttttgtaccatataaaggaaaatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 34575528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 703 - 819
Target Start/End: Original strand, 43139395 - 43139508
Alignment:
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||    
T  43139395 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgag 43139491  T
Q  803 actttgggtagaattag 819  Q
    ||||| |||||||||||    
T  43139492 actttaggtagaattag 43139508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 17462419 - 17462496
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17462419 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 17462496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 20054964 - 20054887
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20054964 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 20054887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 22712715 - 22712638
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22712715 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 22712638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 22717424 - 22717347
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22717424 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 22717347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 602 - 818
Target Start/End: Original strand, 35028496 - 35028707
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaata-agggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  | |||| | |||||||||||   |||||| |||||| ||||||    
T  35028496 atacttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttgaattagagagc-cggaaaaacagggtttagaatc-caacaataaaatttgggttt 35028593  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    |||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  |    
T  35028594 gta--gagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagatt 35028688  T
Q  800 gagactttgggtagaatta 818  Q
    || ||||||||||||||||    
T  35028689 gacactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 728 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414202
Alignment:
Q  728 actagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  || |||||| |||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattag 38414202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 39680028 - 39680105
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39680028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattag 39680105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 39686966 - 39687043
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  39686966 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 39687043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 45567392 - 45567469
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45567392 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 45567469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921832
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattag 17921832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 802 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 22407592 - 22407526
Alignment:
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22407592 gacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 22407526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 758 - 819
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736265
Alignment:
Q  758 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattag 2736265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 742 - 868
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694087
Alignment:
Q  742 gttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgt 838  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||   || ||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  839 aacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttac 15694087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 17932617 - 17932694
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17932617 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 17932694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 17943520 - 17943597
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17943520 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 17943597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 27517838 - 27517761
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27517838 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 27517761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781343
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 12781343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 819
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741001
Alignment:
Q  758 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattag 2741001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 823 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 22707870 - 22707825
Alignment:
Q  823 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22707870 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 22707825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 742 - 818
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  742 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaatta 818  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 744 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583483
Alignment:
Q  744 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27583483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 28459028 - 28458950
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||||||||||    
T  28459028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattag 28458950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 431
Target Start/End: Original strand, 39286892 - 39286952
Alignment:
Q  367 tcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 431  Q
    |||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39286892 tcaaaatttgatggatg----agattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatttt 39286952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 504
Target Start/End: Original strand, 39286971 - 39287042
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatatt 504  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  39286971 tgcttaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccatatgaatgaagatttgatgcaaatatatt 39287042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170874
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 37170874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 806
Target Start/End: Original strand, 38190980 - 38191045
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 806  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38190980 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 811 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7463020
Alignment:
Q  811 tagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttac 7463020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 743 - 818
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgagactttgggtagaatta 818  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 781 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828415
Alignment:
Q  781 ttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattac 13828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 38414365 - 38414281
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||||||||||| || |||||     ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38414365 cttttactataaatataggctttgta-----gtaaaccttgagatagagggggctgaaa------cttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38414281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 366 - 417
Target Start/End: Original strand, 7502582 - 7502633
Alignment:
Q  366 ctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgt 417  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7502582 ctcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctcaaagtataaaagatttgt 7502633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 20050221 - 20050163
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20050221 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggct 20050163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 30478977 - 30479054
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  30478977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattag 30479054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 434 - 519
Target Start/End: Original strand, 7502638 - 7502723
Alignment:
Q  434 gctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatga-agaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7502638 gctgaaaatatatttatgaacaataaaaatatttttgtattgtatgacagaaga-tttgatgcaaatatatttttaaaggaaatatt 7502723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 41303535 - 41303457
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaag 511  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  | ||||| |||||||||||| ||||    
T  41303535 tgctgaaaatatatttatggacagtaaatataattttgtaccgtgtgaaggaagaattgattcaaatatatttttaaag 41303457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41304964 - 41304898
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 436  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41304964 tgactcaaaatttgatggatgaagaagatt-----taaaaatataaaagatttg--tcaaatatattttgtgct 41304898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 747 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 10942707 - 10942658
Alignment:
Q  747 ttcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 795  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10942707 ttcaccttgaagaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaaga 10942658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 747 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 10948576 - 10948527
Alignment:
Q  747 ttcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 795  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10948576 ttcaccttgaagaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaaga 10948527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 825 - 868
Target Start/End: Original strand, 23870956 - 23870999
Alignment:
Q  825 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  23870956 agacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttac 23870999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575265
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggt 785  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggt 34575265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 41304884 - 41304806
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagg 512  Q
    |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||  ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  41304884 tgctgacaatatatttatggatagtaaatatatttttgtaca-tatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 41304806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 33674604 - 33674551
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaag 794  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674604 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 584 - 653
Target Start/End: Original strand, 40699209 - 40699278
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagag 653  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  40699209 gttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Original strand, 15808961 - 15809481
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15808961 ttgttttagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatg 15809060  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809061 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 15809160  T
Q  552 gagnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagata 650  Q
    |||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||||| |    
T  15809161 gagaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagaga 15809260  T
Q  651 ga----gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 746  Q
    ||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15809261 gataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttga 15809359  T
Q  747 ttcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccatt 846  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15809360 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 15809459  T
Q  847 gatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  15809460 gatttctcttttgtaacgttac 15809481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 351 - 868
Target Start/End: Original strand, 3873748 - 3874273
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873748 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 3873847  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaa-caatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga 549  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873848 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga 3873947  T
Q  550 aggagnnnnnnnn---cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttga 646  Q
    |||||           | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||    
T  3873948 aggagaaaaaaaaaaacatatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttga 3874047  T
Q  647 gataga----gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 742  Q
    || |||    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3874048 gagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggg 3874147  T
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacc 842  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3874148 ttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 3874247  T
Q  843 cattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    
T  3874248 cattgatttctcttttgtaacgttac 3874273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 28283813 - 28283302
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28283813 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28283714  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283713 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 28283614  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt------g 645  Q
    ||         ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||      |    
T  28283613 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 28283514  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283513 agatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttg 28283414  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||    
T  28283413 attcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccat 28283314  T
Q  846 tgatatctcttt 857  Q
    |||| |||||||    
T  28283313 tgatttctcttt 28283302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 41384493 - 41385007
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  41384493 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatgg 41384592  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41384593 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt-atgcaaatattctttcattgaagg 41384691  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag 651  Q
    |          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||  |||||  |||||||||    
T  41384692 aaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatag 41384791  T
Q  652 agggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 751  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41384792 agggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcac 41384890  T
Q  752 cttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||| |||||||||||   ||||| || |||||||||| |||||| ||    
T  41384891 cttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacat 41384990  T
Q  852 ctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| |||||    
T  41384991 ctcttttgtaacgttac 41385007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 608470 - 608997
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  608470 tgttgtagtatcactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 608569  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  608570 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatattttatgcaaatattctttcactgaagg 608669  T
Q  553 agnnnnnnnn-----cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgag 647  Q
    ||             ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  | || |||||  | |||| |||||    
T  608670 agaaaaaaaaaagaacgtatcttcggtgtgatatttgttccaaatttatgagttata-tttcactgtaaatatagaccttatatcatagcaaactttgag 608768  T
Q  648 a--------tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 739  Q
    |        ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608769 agagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 608868  T
Q  740 gggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgta 839  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  608869 gggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 608968  T
Q  840 acccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  608969 acccattgatttctcttttgtaacgttac 608997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 353 - 862
Target Start/End: Original strand, 43529871 - 43530372
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43529871 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 43529970  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43529971 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgctaatattctttcactgaagg 43530070  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----gag 647  Q
    ||          |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||    |||    
T  43530071 agaaaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttattccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagag 43530170  T
Q  648 atagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 747  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||             || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43530171 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac-------------gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgat 43530257  T
Q  748 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattg 847  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  43530258 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattg 43530357  T
Q  848 atatctcttttgtaa 862  Q
    || ||||||||||||    
T  43530358 atttctcttttgtaa 43530372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 354 - 868
Target Start/End: Original strand, 41382420 - 41382925
Alignment:
Q  354 gttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcga 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  41382420 gttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatgga 41382519  T
Q  454 caataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga 553  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  41382520 caataaatatatttttgtaccgtatgaacaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaatga 41382619  T
Q  554 g--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag 651  Q
    |          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41382620 gaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatag 41382719  T
Q  652 agggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 751  Q
    | |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41382720 atggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcac 41382819  T
Q  752 cttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
               |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  41382820 -----------ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacat 41382908  T
Q  852 ctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| |||||    
T  41382909 ctcttttgtaacgttac 41382925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 563 - 862
Target Start/End: Original strand, 32339263 - 32339566
Alignment:
Q  563 cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggc 658  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||    ||||||||||    
T  32339263 cgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggc 32339362  T
Q  659 tgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgaga 758  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  32339363 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggta 32339462  T
Q  759 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 858  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339463 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 32339562  T
Q  859 gtaa 862  Q
    ||||    
T  32339563 gtaa 32339566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 14807748 - 14808014
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14807748 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 14807847  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14807848 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 14807947  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14807948 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 14808014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 605 - 861
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106976
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 27107033  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgta 861  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27107032 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgta 27106976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 603 - 858
Target Start/End: Original strand, 1225164 - 1225419
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1225164 tacttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 1225263  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  1225264 aagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 1225363  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 858  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1225364 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 1225419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 14419541 - 14419263
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14419541 aatttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaa 14419442  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14419441 actagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacg 14419342  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  14419341 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttac 14419263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 590 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 30480853 - 30480576
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30480853 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 30480754  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30480753 actaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 30480654  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30480653 ggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 30480576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Original strand, 27829294 - 27829549
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27829294 atacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 27829393  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27829394 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 27829493  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27829494 gaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 27829549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Original strand, 27826983 - 27827238
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27826983 atacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 27827082  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27827083 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgg 27827182  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27827183 gaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 27827238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Original strand, 27910994 - 27911277
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27910994 gttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaac 27911092  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27911093 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 27911192  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27911193 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttac 27911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Original strand, 27957413 - 27957696
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27957413 gttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaac 27957511  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27957512 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 27957611  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27957612 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttac 27957696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 15067978 - 15068244
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15067978 atacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgt 15068077  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  15068078 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttga 15068177  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15068178 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 15068244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 15072707 - 15072974
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15072707 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgt 15072806  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga-ggctg 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  15072807 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttg 15072906  T
Q  801 agactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15072907 ggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 15072974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 28251905 - 28251639
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28251905 atacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 28251806  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28251805 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 28251706  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28251705 gactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttac 28251639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 13858834 - 13858557
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13858834 aatttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 13858735  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13858734 actagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacg 13858635  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||  || | |||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13858634 ggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttac 13858557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 605 - 851
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477522
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
     |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477476 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 563 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 24873564 - 24873263
Alignment:
Q  563 cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggg 656  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||      ||||||||    
T  24873564 cgtatcttcagtgttgtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggg 24873465  T
Q  657 gctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttga 756  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  24873464 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttg 24873365  T
Q  757 gaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctct 855  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24873364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctct 24873265  T
Q  856 tt 857  Q
    ||    
T  24873264 tt 24873263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 18810707 - 18810960
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18810707 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 18810806  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18810807 agagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctggga 18810906  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18810907 ctttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 18810960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865798
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||  ||  ||    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttac 36865798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952783
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagac 25952719  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25952720 attgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattac 25952783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372250
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5372313 tttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttac 5372250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 605 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541509
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggac 33541524  T
Q  805 tttgggtagaattag 819  Q
    ||| |||||||||||    
T  33541523 ttttggtagaattag 33541509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 44720842 - 44721096
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  44720842 acttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtat 44720941  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgag-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44720942 agagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 44721041  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44721042 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 44721096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684725
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggtt 22684852  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc- 843  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  22684851 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22684752  T
Q  844 --attgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
      |||||| ||||| |||||| |||||    
T  22684751 atattgatttctctattgtaacgttac 22684725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 602 - 862
Target Start/End: Original strand, 4424015 - 4424275
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4424015 atacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4424114  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  4424115 atagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 4424214  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
      |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4424215 agctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaa 4424275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 653 - 857
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079855
Alignment:
Q  653 gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 752  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  753 ttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatat 851  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  852 ctcttt 857  Q
    ||||||    
T  43079850 ctcttt 43079855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082226
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 43082212  T
Q  844 attgatatctcttt 857  Q
    |||||| |||||||    
T  43082213 attgatttctcttt 43082226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 353 - 511
Target Start/End: Original strand, 32339094 - 32339252
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32339094 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 32339193  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaag 511  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32339194 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 32339252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 18812892 - 18813134
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||             
T  18812892 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag--------- 18812982  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18812983 --agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtga 18813080  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18813081 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 18813134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 590 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 5623088 - 5622882
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5623088 aatttatgagtgattcttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 5622989  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  5622988 actagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacg 5622889  T
Q  790 ggaagag 796  Q
    |||||||    
T  5622888 ggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 603 - 782
Target Start/End: Original strand, 26775199 - 26775378
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26775199 tacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgta 26775298  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775299 tatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 15186066 - 15185787
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||  ||     
T  15186066 gttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaat 15185967  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagt--ctct 781  Q
    ||||||| || ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||    
T  15185966 aacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctct 15185867  T
Q  782 tggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15185866 tggttacgggaagag-------atttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttac 15185787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 590 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 35872728 - 35872555
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  35872728 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac--- 35872632  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactatta 768  Q
      |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35872631 --tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 504 - 700
Target Start/End: Original strand, 181434 - 181632
Alignment:
Q  504 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagtt 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181434 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaagaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagtt 181533  T
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  181534 atacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Original strand, 31162192 - 31162472
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct-gaaataagggtttagaaaggcaa 682  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||  |||    
T  31162192 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caa 31162289  T
Q  683 -caacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctct 781  Q
     |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31162290 gcaac-aaattagtgtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 31162385  T
Q  782 tggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| || |||||||  || ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31162386 tggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattac 31162472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 353 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3265752 - 3265640
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3265752 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3265653  T
Q  453 acaataaatatat 465  Q
    |||||||||||||    
T  3265652 acaataaatatat 3265640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482573
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||   |||        |||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatcaaac--------tagggtttgtata 21482413  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || | |    
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21482510 tttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 21482573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 695 - 868
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956220
Alignment:
Q  695 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 794  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  795 aggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15956220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 636 - 868
Target Start/End: Original strand, 21480545 - 21480765
Alignment:
Q  636 gtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 735  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||        |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |    
T  21480545 gtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatcaaac--------tagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggtt 21480635  T
Q  736 ttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattct 835  Q
    |   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |  ||| ||||||||||| | || ||||||||||    
T  21480636 t---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattct 21480732  T
Q  836 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21480733 tgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 21480765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 635 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 3005932 - 3005706
Alignment:
Q  635 tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||  |  ||| ||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| ||||    
T  3005932 tgtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagg 3005836  T
Q  734 gtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttatt 833  Q
    ||| ||   ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3005835 gttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 3005739  T
Q  834 cttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtt 866  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3005738 cttgtaatccattgatatctcttttgtaaagtt 3005706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 633 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 37214517 - 37214321
Alignment:
Q  633 agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaatt-------------------agggtttgtatagagtttgtc 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |                   |||||||||||||||||||||    
T  37214517 agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtc 37214418  T
Q  714 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         |||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||    
T  37214417 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtag 37214327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 728 - 868
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181764
Alignment:
Q  728 actagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaagaggctgagactttgggtagaattagacagg 824  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||  || |||||||||||||||||| | |     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  825 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttac 181764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 602 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 12517364 - 12517248
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12517364 atacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 12517265  T
Q  700 gtatagagtttgtctct 716  Q
    |||||||||||||||||    
T  12517264 gtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 602 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 3886256 - 3886153
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3886256 atacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 3886157  T
Q  702 atag 705  Q
    ||||    
T  3886156 atag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 703 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 31573961 - 31573798
Alignment:
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  31573961 tagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 31573865  T
Q  803 actttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  31573864 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttac 31573798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578350
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  842 ccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttac 31578350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 740 - 868
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035380
Alignment:
Q  740 gggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgt 838  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||| |   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  839 aacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttac 31035380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 743 - 863
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847783
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttga--gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgta 839  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  840 acccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    | || |||||||||||||||||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaaa 17847783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 811 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468202
Alignment:
Q  811 tagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttac 2468202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 602 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 2468436 - 2468261
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||   ||| ||    |    || | |    
T  2468436 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaaatcaaactacggttt----gtatat 2468341  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 785  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468340 atagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 9021306 - 9021229
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9021306 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 9021229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13986374 - 13986304
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 434  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13986374 tgactcaaaattttatggatgaagaagattgttgctaaaaatat-aaagatttgttttaaatatattttgtg 13986304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 16752721 - 16752644
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16752721 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 16752644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 16757466 - 16757389
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16757466 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 16757389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 28327891 - 28327968
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28327891 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 28327968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 28895485 - 28895562
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28895485 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 28895562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 743 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 17799623 - 17799558
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 806  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17799623 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 17799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 680 - 777
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035238
Alignment:
Q  680 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagt 777  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 590777 - 590854
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  590777 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 590854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 4812686 - 4812609
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4812686 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 4812609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 28332614 - 28332691
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28332614 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattag 28332691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 30679256 - 30679186
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 434  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30679256 tgactcaaaatttgatggatgaagaatat-gttggtaaaaataaaaaagatttgttttagatatattttgtg 30679186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 33032637 - 33032714
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  33032637 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 33032714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 743 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 29554984 - 29554908
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 818  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29554984 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 11701447 - 11701364
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||  ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11701447 tgctgaaaatatatttatggtcagtaaatatatttttgtaccgtatg--gaagaa-ttgatgtaaatatatttttaaagggaatatt 11701364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 13985278 - 13985163
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaa 840  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | | ||||||||||||||||||    || ||| ||||||||||    
T  13985278 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaa 13985179  T
Q  841 cccattgatatctctt 856  Q
    ||| |||  |||||||    
T  13985178 ccctttggaatctctt 13985163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276404
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 3276404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 743 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 23179760 - 23179692
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgg 809  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23179760 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg 23179692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839077
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggt 785  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt 33839077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 603 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 14419834 - 14419784
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagag 653  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14419834 tacttttgctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagag 14419784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 743 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 795  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 815
Target Start/End: Original strand, 21033853 - 21033925
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaa 815  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  21033853 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag-ggctgggac-ttgggtagaa 21033925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 25684626 - 25684703
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  25684626 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggac-ttgggtagaattag 25684703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 30423195 - 30423273
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||  ||||||| |||||||||    
T  30423195 ttgattcaccttgaacaaaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattag 30423273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985957
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 796  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagag 13985957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 405 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27820178 - 27820149
Alignment:
Q  405 ataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820178 ataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 27820149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 138)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 867
Target Start/End: Original strand, 56030188 - 56030704
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  56030188 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 56030287  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  56030288 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttggtgcaaatattctttcactgaag 56030387  T
Q  552 gagnnnnnnnnc-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagata 650  Q
    |||          |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  56030388 gagaaaaaaaaaagtatcttcggtgtggtattctttccaaatttatgagttatatttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagata 56030487  T
Q  651 gagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 750  Q
    || |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030488 gaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattca 56030587  T
Q  751 ccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgata 850  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |    
T  56030588 ccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca 56030687  T
Q  851 tctcttttgtaaagtta 867  Q
    | |||||||||| ||||    
T  56030688 tttcttttgtaacgtta 56030704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 14788021 - 14787503
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14788021 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatgg 14787922  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787921 acaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 14787822  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--t 649  Q
    ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||   ||||| ||||||  |    
T  14787821 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagat 14787722  T
Q  650 agagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 749  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14787721 agagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattc 14787622  T
Q  750 accttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||     
T  14787621 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgac 14787522  T
Q  850 atctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  14787521 atctcttttgtaacgttac 14787503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 351 - 868
Target Start/End: Original strand, 24347957 - 24348479
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24347957 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-gaaaatatatttat 24348055  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 550  Q
     |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348056 ggacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 24348155  T
Q  551 ggagnnnnnnnnc--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt---- 644  Q
    ||||           ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||   ||||| ||        
T  24348156 ggagaaaaaaaaaaagtatcttcaatgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgaga 24348255  T
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24348256 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggtt 24348355  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  24348356 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaaccca 24348455  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  24348456 ttgatttctcttttgtaacgttac 24348479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 22132987 - 22132474
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22132987 tgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 22132888  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132887 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 22132788  T
Q  553 ag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag 651  Q
    ||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||||| ||    
T  22132787 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagag 22132688  T
Q  652 ag---------ggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 742  Q
    ||         |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  22132687 agagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctc-ttcgaacaaacactagggtttgtggg 22132589  T
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacc 842  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22132588 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 22132489  T
Q  843 cattgatatctcttt 857  Q
    ||||||| |||||||    
T  22132488 cattgatttctcttt 22132474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 347 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 44600434 - 44599920
Alignment:
Q  347 tatgtttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatat 446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44600434 tatgattgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatat 44600335  T
Q  447 ttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcac 546  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600334 ttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcac 44600235  T
Q  547 tgaaggagnnnnnnnn---cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacct 643  Q
    ||||||||           || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  | |||| |    
T  44600234 tgaaggaggaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactt 44600135  T
Q  644 tgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 743  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  44600134 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 44600035  T
Q  744 tgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacc 842  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  44600034 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 44599935  T
Q  843 cattgatatctcttt 857  Q
    ||||||| |||||||    
T  44599934 cattgatttctcttt 44599920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 351 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 17662828 - 17662317
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662828 tttgttgtagtatgactacaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 17662729  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 550  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662728 ggacaataaatatatttttgtaccgtacgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 17662629  T
Q  551 ggag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----g 645  Q
    ||||          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||    |    
T  17662628 ggagaaaaaaaaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 17662529  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17662528 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg-----------gtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttg 17662440  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17662439 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 17662340  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  17662339 tgatttctcttttgtaacgttac 17662317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 22135219 - 22134699
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22135219 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 22135120  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22135119 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgattcaaatattctttcactgaagg 22135020  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagata 650  Q
    ||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||   ||||| |||||| |    
T  22135019 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagaga 22134920  T
Q  651 gag---------------ggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 735  Q
    |||               |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22134919 gagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-ttcaaacaaacactagggt 22134821  T
Q  736 ttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattct 835  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22134820 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattct 22134721  T
Q  836 tgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  22134720 tgtaacccattgatttctcttt 22134699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 37 - 352
Target Start/End: Original strand, 42356481 - 42356796
Alignment:
Q  37 acacaagtttctaacctttggtgggagtttaagcttccaaatgatactccaatgacctgttactctatgttgcgtcataacactatcattgtcgatgatt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42356481 acacaagtttctaacctttggtgggagtttaagcttccaaatgatactccaatgacctgttactctatgttgcgtcacaacactatcattgtcgatgatt 42356580  T
Q  137 tcccgataagcattgcagtatgtgtaatgatcgtccctttcaaacctctaggtagctacattgtcatgggccgatggcagcagtggcgtttgggaagttt 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42356581 tcccgataagcattgcaatatgtgtaatgatcgtccctttcaaacctctaggtagctacattgtcatgggccgatggcagcagtggcgtttgggaagttt 42356680  T
Q  237 gttgagttgtgtcaaaatcaaaaacatagtagatgaacttcatatttcattgcttggtatttgaccgcagcatatgcgttatcgtaaactcatcccacac 336  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42356681 gttgagttgtgccaaaatcaaaaacatagtagatgaacttcatatttcattgcttggtatttgacctcagcatatgcgttatcgtaaactcatcccacac 42356780  T
Q  337 gatgtgcaaatatgtt 352  Q
    ||||||||||||||||    
T  42356781 gatgtgcaaatatgtt 42356796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 353 - 743
Target Start/End: Original strand, 5100743 - 5101133
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5100743 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 5100842  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100843 acaacaaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 5100942  T
Q  553 agnnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagataga 652  Q
    ||        |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5100943 agaaaaaaaacgtatcttcaatctggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagataga 5101042  T
Q  653 gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 743  Q
    |||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101043 ggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 460 - 868
Target Start/End: Original strand, 19322547 - 19322954
Alignment:
Q  460 atatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnn 559  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  19322547 atatatttttgtactgtataaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaa 19322646  T
Q  560 nnnc----gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 655  Q
            ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19322647 aaagaaatgtatcttcaatgtgatattcattccaaatttatgagttatattcat-ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 19322745  T
Q  656 ggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 755  Q
    || ||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19322746 ggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttg 19322841  T
Q  756 agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctct 855  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19322842 ggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctct 19322941  T
Q  856 tttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||    
T  19322942 tttgtaaagttac 19322954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 22803072 - 22802806
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22803072 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 22802973  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22802972 atagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22802873  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22802872 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttac 22802806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 481 - 859
Target Start/End: Original strand, 53404998 - 53405387
Alignment:
Q  481 agaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnn---cgtatcttcagtgtg 577  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||           ||||| |||||||||    
T  53404998 agaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaaaattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaaaaaaaaaaacgtattttcagtgtg 53405097  T
Q  578 gtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagag---ggggctgaaataagggtttag 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||||| |||    |||||||||| ||||||||||    
T  53405098 gtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttag 53405197  T
Q  675 aaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattg 774  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53405198 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattg 53405296  T
Q  775 agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggaga------cttattcttgtaacccattgatatctcttttg 859  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||      |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53405297 agtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttg 53405387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 22801200 - 22800934
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||    
T  22801200 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgt 22801101  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22801100 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctga 22801001  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22801000 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 22800934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 47274722 - 47274987
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47274722 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 47274821  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  47274822 ata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgg 47274920  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274921 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 47274987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Original strand, 19095865 - 19096144
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  19095865 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 19095964  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttac 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19095965 attagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttac 19096064  T
Q  789 gggaagaggctgaga-ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19096065 gggaagagatt-agagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 19096144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 40091753 - 40091487
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  40091753 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgt 40091654  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40091653 ttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 40091554  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40091553 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttac 40091487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 48486314 - 48486580
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  48486314 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 48486413  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  48486414 atagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 48486513  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  48486514 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttac 48486580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 602 - 863
Target Start/End: Original strand, 24878984 - 24879245
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24878984 atacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 24879083  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24879084 atagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 24879183  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879184 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 24879245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 40637070 - 40637335
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40637070 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 40637169  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40637170 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgag 40637269  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  40637270 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 40637335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 24888791 - 24889057
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24888791 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgt 24888890  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  24888891 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactag 24888990  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24888991 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 24889057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415560
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  33415721 agtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 33415623  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33415622 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 33415560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313138
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 705  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  706 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37313200 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttac 37313138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 5637807 - 5637537
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggt 697  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| || | |||| ||    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5637807 atacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 5637708  T
Q  698 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 797  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637707 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 5637608  T
Q  798 ctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5637607 ctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 5637537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 602 - 863
Target Start/End: Original strand, 24880446 - 24880707
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||| | ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24880446 atacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 24880545  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24880546 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 24880645  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880646 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 24880707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 22044728 - 22044473
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22044728 atacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 22044629  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22044628 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22044529  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22044528 gactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctcttt 22044473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 22047023 - 22046768
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22047023 atacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 22046924  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22046923 atagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 22046824  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22046823 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 22046768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 38928528 - 38928249
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38928528 aatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaa 38928429  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttac 788  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928428 actagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 38928329  T
Q  789 gggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| ||  || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  38928328 gggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 38928249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 603 - 862
Target Start/End: Original strand, 47868397 - 47868656
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47868397 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 47868496  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868497 tagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 47868596  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47868597 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 47868656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Original strand, 51015241 - 51015496
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51015241 atacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 51015340  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51015341 atagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 51015440  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51015441 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 51015496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Original strand, 9148246 - 9148503
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  9148246 atacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattt 9148345  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148346 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 9148445  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9148446 gggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 9148503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 563 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 18709548 - 18709246
Alignment:
Q  563 cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--------tagagg 654  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||  ||||| ||||||        ||||||    
T  18709548 cgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagagagatagagg 18709449  T
Q  655 gggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 754  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18709448 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcacctt 18709349  T
Q  755 gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctc 854  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18709348 gggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 18709249  T
Q  855 ttt 857  Q
    |||    
T  18709248 ttt 18709246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 592 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 12396193 - 12395917
Alignment:
Q  592 tttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaat 691  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  12396193 tttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaac 12396094  T
Q  692 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396093 tagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 12395994  T
Q  792 aagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12395993 aagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 12395917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 8631714 - 8631491
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8631714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 8631615  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8631614 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 8631515  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  8631514 ttgatttctcttttgtaacgttac 8631491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 369 - 867
Target Start/End: Original strand, 30136331 - 30136809
Alignment:
Q  369 aaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttt 468  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30136331 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 30136430  T
Q  469 tataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag--nnnnnnnncgta 566  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||          ||||    
T  30136431 tgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagagaatattatatttttgattcaaatattctttcattgaaggagaaaaaaaaaacgta 30136530  T
Q  567 tcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatc-agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata 665  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||| | | ||||| | |||||| |||||||||||       |||| |    
T  30136531 tcttcagtgtgatattcgttctaaatttattagttata-tttctctataaatatatacctagtatcaaatgtaaatcttgagataga-------gaaaca 30136622  T
Q  666 agggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacacta 765  Q
    | ||||| |  |||||||           ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||    
T  30136623 aaggttt-gggaggcaac-----------ggtttgtatagagttt-actcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacacta 30136707  T
Q  766 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagt 865  Q
     || ||||| |||||||||| ||| |||||   || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  30136708 ctatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagt 30136807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 602 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 36919925 - 36919657
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttga--gatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36919925 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 36919826  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 798  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919825 ggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 36919726  T
Q  799 tgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36919725 tgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgtta 36919657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 592 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 12401155 - 12400879
Alignment:
Q  592 tttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaat 691  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  12401155 tttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaac 12401056  T
Q  692 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12401055 tagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacggg 12400956  T
Q  792 aagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12400955 aagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 12400879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 36921833 - 36921565
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggttt 699  Q
    |||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36921833 atacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 36921735  T
Q  700 gtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 798  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921734 gtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 36921635  T
Q  799 tgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36921634 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttac 36921565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 16453305 - 16453570
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16453305 tacttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 16453404  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |    
T  16453405 caaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 16453504  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16453505 actttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 16453570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 602 - 862
Target Start/End: Original strand, 5198415 - 5198675
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5198415 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgt 5198514  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||     
T  5198515 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgg 5198614  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5198615 ggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 5198675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 37089710 - 37089454
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacct---tgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37089710 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 37089611  T
Q  701 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 800  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37089610 tatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctg 37089511  T
Q  801 agactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37089510 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 37089454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 529 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 47211159 - 47210830
Alignment:
Q  529 atgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcat 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  47211159 atgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacct 47211060  T
Q  627 tgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttgg 720  Q
    ||||||||  ||||| ||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47211059 tgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg 47210960  T
Q  721 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaga 820  Q
    |||||||||||||||||| |            ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  47210959 aacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 47210872  T
Q  821 caggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47210871 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 47210830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 11434952 - 11435205
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11434952 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11435051  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||    
T  11435052 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctagga 11435151  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11435152 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 11435205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 14633316 - 14633579
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14633316 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 14633414  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  14633415 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattggg 14633513  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14633514 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttac 14633579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 6764835 - 6765105
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6764835 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6764934  T
Q  703 tagagtttgtctcttt-----ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 797  Q
    ||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6764935 tagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagagg 6765034  T
Q  798 ctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6765035 ctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 6765105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 16934479 - 16934225
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16934479 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16934380  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16934379 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 16934280  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16934279 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 16934225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Original strand, 38409194 - 38409455
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagg 695  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||      ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38409194 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagg 38409293  T
Q  696 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 795  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409294 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 38409393  T
Q  796 ggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38409394 ggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 38409455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 11006532 - 11006319
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11006532 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11006433  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11006432 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11006333  T
Q  844 attgatatctcttt 857  Q
    |||||| |||||||    
T  11006332 attgatttctcttt 11006319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Original strand, 36378288 - 36378553
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36378288 tacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 36378387  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || |    
T  36378388 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattggg 36378487  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  36378488 actttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttac 36378553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 3824863 - 3824642
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3824863 gagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggtt 3824766  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3824765 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3824666  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| |||||||||||| |||||    
T  3824665 ttgatttctcttttgtaacgttac 3824642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 31849937 - 31849681
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31849937 atacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 31849838  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 800  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31849837 atagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctg 31849738  T
Q  801 agactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31849737 agactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 31849681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 16932125 - 16931871
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16932125 acttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16932026  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16932025 agagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 16931926  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16931925 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 16931871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 645 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 11008861 - 11008656
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11008861 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11008762  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11008761 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11008662  T
Q  844 attgat 849  Q
    ||||||    
T  11008661 attgat 11008656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 604 - 862
Target Start/End: Original strand, 7941316 - 7941578
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941316 acttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 7941415  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaa--cactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 799  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941416 atagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct 7941515  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7941516 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 7941578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 603 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 2485210 - 2484955
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagataga-gggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2485210 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 2485111  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2485110 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 2485011  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2485010 gactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 2484955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 609 - 868
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997753
Alignment:
Q  609 tactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagt 708  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  709 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttg 808  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttg 41997693  T
Q  809 ggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41997694 ggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttac 41997753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 619785 - 619519
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||     
T  619785 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgc 619686  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||     
T  619685 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgg 619586  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | |||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  619585 gtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttac 619519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 18847150 - 18847404
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18847150 acttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 18847249  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |    
T  18847250 agagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattggg 18847349  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18847350 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 18847404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 607 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 9176807 - 9176556
Alignment:
Q  607 tttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtataga 706  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9176807 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaa 9176708  T
Q  707 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagact 805  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9176707 gtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagact 9176608  T
Q  806 ttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9176607 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 9176556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Original strand, 13543997 - 13544220
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggt 743  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  13543997 gagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggat 13544095  T
Q  744 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13544096 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 13544195  T
Q  844 attgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13544196 attgatatctcttttgtaaagttac 13544220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 9174482 - 9174228
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9174482 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 9174383  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9174382 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgag 9174283  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9174282 actttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt 9174228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 605 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409425
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||  |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409482 ttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 18409425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 584 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 52942802 - 52942536
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtat--cagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggca 681  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||  |||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  52942802 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggca 52942705  T
Q  682 acaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctct 781  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52942704 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 52942605  T
Q  782 tggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    ||||||||||             ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942604 tggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 52942536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 8756588 - 8756324
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  8756588 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttg 8756490  T
Q  701 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaagaggct 799  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |    
T  8756489 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagatt 8756393  T
Q  800 gagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8756392 gagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttac 8756324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782820
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22782834  T
Q  844 attgatatctcttt 857  Q
    |||||| |||||||    
T  22782833 attgatttctcttt 22782820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780455
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22780469  T
Q  844 attgatatctcttt 857  Q
    |||||| |||||||    
T  22780468 attgatttctcttt 22780455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 18537821 - 18537547
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaa 688  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||    
T  18537821 aatttatgagtgatgcttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaa 18537723  T
Q  689 aattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttac 788  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18537722 act-agggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcac 18537627  T
Q  789 gggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537626 gggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 18537547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 605 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  |||| |    
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattct 835  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  3937344 tttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 605 - 819
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133084
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaac-aagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  805 tttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||    
T  6133070 tttgggtagaattag 6133084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 680 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26086059
Alignment:
Q  680 caacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtct 779  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  780 cttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctcttt 26086059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 353 - 820
Target Start/End: Original strand, 10112626 - 10113081
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10112626 tgttgtagtatgacttaaaatttgttgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaag----gtttcaaatatattttgtgctgaaactatatttatgg 10112721  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||| |||||       ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10112722 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgtaaatata-tttgaaagagaata-------tttgatgcaaatattatttcactaaagg 10112813  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttata-cttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgaga 648  Q
    ||           |||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10112814 agaaaaaaaaaatgtatcttcagcgtgaaatccgttccaaatttatgagttatatttttttttataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgaga 10112913  T
Q  649 tagagggggctg-aaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 747  Q
     |||||| | || ||| |||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| | |||||    
T  10112914 gagagggagttgaaaacaagggtttag-aagccaacacaaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattgat 10113007  T
Q  748 tcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttac-gggaagaggctgagactttgggtagaattaga 820  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  10113008 tcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattaga 10113081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 248
Target Start/End: Original strand, 42357519 - 42357759
Alignment:
Q  8 catcatacccgacacataccacacagataacacaagtttctaacctttggtgggagtttaagcttccaaatgatactccaatgacctgttactctatgtt 107  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  42357519 catcatgctcgacacataccacataaataacacaagtttttagcctttggtggcattttaagcttccagatgatactccaatgatctattactctttgtt 42357618  T
Q  108 gcgtcataacactatcattgtcgatgatttcccgataagcattgcagtatgtgtaatgatcgtccctttcaaacctctaggtagctacattgtcatgggc 207  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  42357619 gcgtcacaacactatcattgttgatgatttctcaataagcattacggactgtgtaatgatcgtccctttcaaacctccaggtagctacattgtcatggac 42357718  T
Q  208 cgatggcagcagtggcgtttgggaagtttgttgagttgtgt 248  Q
    | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42357719 caatggcaatagtggcatttggaaagtttgttgagttgtgt 42357759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 590 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18535179 - 18534910
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaa 688  Q
    ||||||||||  || ||||||| |||||||||  | | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||   ||||||||    
T  18535179 aatttatgagggatgcttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaa 18535081  T
Q  689 aattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttac 788  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18535080 act-agggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcac 18534985  T
Q  789 gggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 863  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534984 gagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 18534910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 352 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 47211309 - 47211158
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  47211309 ttgttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctcaaaatatatttatg 47211210  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatat 503  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47211209 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 47211158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 683 - 868
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380610
Alignment:
Q  683 caacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  783 ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttac 36380610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 590 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 24446929 - 24446756
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  24446929 aatttatgagggatgcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac--- 24446833  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactatta 768  Q
      |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24446832 --tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 605 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactatta 768  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 351 - 553
Target Start/End: Original strand, 9022058 - 9022252
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9022058 tttgttgtagtatgattcaaaattttatggatgagaaatattgttgttgaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttat 9022157  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 550  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9022158 -gacaataaatatatttttctaccgtatgaagaaagatttgatgcaaatatattttaaaagggaata-------tttgatgcaaatattctttcactaaa 9022249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 720 - 868
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455502
Alignment:
Q  720 gaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  820 acaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 16455502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 687 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890298
Alignment:
Q  687 aaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtt 786  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  787 acgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 38890298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 351 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 38890703 - 38890517
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||    
T  38890703 tttgttgtagcatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatt------------------tat 38890622  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaaggg-aatattatatttttgatgcaaatattctttcactga 549  Q
     |||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38890621 ggacaataaatatatttttgtattgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaa 38890522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 15032892 - 15032621
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  | | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  15032892 gttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttag-aagtcaac 15032794  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||          ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15032793 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tga-ggttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttg 15032706  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |  ||| ||| ||  |  |||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032705 gacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15032621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 692 - 868
Target Start/End: Original strand, 27499130 - 27499303
Alignment:
Q  692 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  27499130 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgat 27499229  T
Q  792 aagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||  |||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||| |||||    
T  27499230 aagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttac 27499303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 749 - 868
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891552
Alignment:
Q  749 caccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattga 848  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  849 tatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttac 2891552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 605 - 724
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891434
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgta-tcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  704 agagtttgtctctttggaaca 724  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 757 - 868
Target Start/End: Original strand, 13547304 - 13547415
Alignment:
Q  757 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 856  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13547304 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatctt 13547403  T
Q  857 ttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||    
T  13547404 ttgtaaagttac 13547415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 353 - 507
Target Start/End: Original strand, 9863499 - 9863650
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||      
T  9863499 tgttgtaatatgactcaaaatttgttggatgaaatatattgttactaaaaatataaatgatttgtttcaaacatattttgtgctaaaaatatatttatga 9863598  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttg 507  Q
    ||||||||||||||||| |   | |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  9863599 acaataaatatatttttgt---gcatgaaggaagatttgatgcaaatatattttg 9863650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Original strand, 19322410 - 19322506
Alignment:
Q  355 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgtt-gctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19322410 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattttttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttatactgaaaatatatttat 19322506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28453943
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |  ||||||  |||||||||||| | |||||  |||| ||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgca- 28453782  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
     ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  28453783 -gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||||||||   | ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttac 28453943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 40999281 - 40999022
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||  |||||||||||  | |||||| |||| ||||| |||||||    
T  40999281 ttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagac-gtcaacaagaaaactaggggttgtata 40999184  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||| || |||  ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||    
T  40999183 gagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagac 40999087  T
Q  805 tttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| |   |||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40999086 tttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 40999022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 742 - 868
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102348
Alignment:
Q  742 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagaca-ggagacttattcttgtaa 840  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||  ||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  841 cccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttac 12102348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 353 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14789571 - 14789500
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789571 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 14789500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 611 - 868
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9863967
Alignment:
Q  611 ctataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatag-agggggctg--aaataagggtttagaaaggcaacaac-aaaattagggtttgtataga 706  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||| || | ||||  ||| |||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||  ||||    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttag-aagccaaaaacaaaaactagggtttg--taga 9863808  T
Q  707 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 806  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| ||||   || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  9863809 gtttgt-tcttggcaacaaacactaaggtt--gggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactt 9863905  T
Q  807 tgggtagaatt-agacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  9863906 tgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttac 9863967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 784 - 868
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215567
Alignment:
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 4215567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 743 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150968
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaac 841  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| |||||||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  842 ccattgatatctcttttgtaaagtt 866  Q
    || |||||||||||||| |||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagtt 47150968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 742 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983600
Alignment:
Q  742 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaa 840  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| |   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  841 cccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattac 31983600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 363 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 38209259 - 38209098
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct--gaaaatatatttatcgaca--ata 458  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | || ||  || | || |  |||    
T  38209259 tgactcaaaatttgatggatgaaaaatattgttgttaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgcttcaagaagattgttgttgaaaatata 38209160  T
Q  459 aatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatat-tttgaaagggaatatt 519  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38209159 aatatatttttgtactgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatatttgaaaaggaatatt 38209098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 746 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982249
Alignment:
Q  746 attcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgagactttgggtagaatt-agacaggagacttattcttgtaacc 842  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  843 cattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttac 3982249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357902
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggta----gaatta-gacaggagacttattcttg 837  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||| ||    |||||| |   | |||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  838 taacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttac 25357902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 55822248 - 55822325
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55822248 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattag 55822325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5516833 - 5516771
Alignment:
Q  369 aaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5516833 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaatgaattgtttcaaatatatttt 5516771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 802 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635548
Alignment:
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 5635548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 433 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 54929180 - 54929094
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  54929180 tgctgaaaatatatttatggacaaaaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaataggaatatt 54929094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 7050456 - 7050379
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7050456 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 7050379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 11853532 - 11853609
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11853532 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 11853609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 16186035 - 16185908
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgta 839  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||| |   | ||||||||||||| |    
T  16186035 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgca 16185936  T
Q  840 acccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  16185935 accctttgatatatc-tttgtaaagttac 16185908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 808 - 868
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101190
Alignment:
Q  808 gggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttac 5101190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 8529250 - 8529327
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8529250 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 8529327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 661 - 868
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022566
Alignment:
Q  661 aaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-agaa 759  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||| ||||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  760 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaac--ccattgatatctctt 856  Q
    ||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |   | ||||| |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctc-t 9022554  T
Q  857 ttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||    
T  9022555 ttgtaaagttac 9022566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 512
Target Start/End: Original strand, 10979676 - 10979755
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  10979676 tgctgaaaatatatttatggacaacaaatatatttttgtgctgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 10979755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 802 - 857
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437613
Alignment:
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 11437613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 18586949 - 18587026
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18586949 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 18587026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 31300407 - 31300484
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31300407 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 31300484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556181
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattag 4556181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558371
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 4558371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 743 - 806
Target Start/End: Original strand, 4884857 - 4884922
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 806  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4884857 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 4884922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317018
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 15317018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 584 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16186193 - 16186099
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct-gaaataagggtttagaaa 677  Q
    ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  16186193 gttccaattttaggagggatacttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 29609983 - 29609914
Alignment:
Q  367 tcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 436  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29609983 tcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaagtattcttgatttttttcaaatatattttgtgct 29609914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 4570077 - 4570154
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  4570077 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattag 4570154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 15831124 - 15831201
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  15831124 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattag 15831201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 16489332 - 16489409
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16489332 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattag 16489409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16689062
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16689139 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 16689062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 25699732 - 25699809
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  25699732 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattag 25699809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 36769462 - 36769539
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  36769462 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtaaaattag 36769539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 36771379 - 36771456
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36771379 ttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattag 36771456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 914 - 974
Target Start/End: Original strand, 42357658 - 42357720
Alignment:
Q  914 cattatggactgtgtaatgatcgtccctttcaaac--cctagtagctacattgtcatggacca 974  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  42357658 cattacggactgtgtaatgatcgtccctttcaaacctccaggtagctacattgtcatggacca 42357720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906849
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgta 839  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |  ||||||| |||||||||| |   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  840 acccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||    
T  54906822 actctttgatatctc-tttgtaaagttac 54906849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 54929267 - 54929198
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 434  Q
    ||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  54929267 tgacttaaaatttgatggaa--ataatattgttgctaaaaatataaaagatttgatttaaatgtattttgtg 54929198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 13072180 - 13072103
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13072180 ttgattcaccttgaacaaatcactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattag 13072103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 15312299 - 15312376
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  15312299 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgac-ttgggtagaattag 15312376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566553
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagactg-gaatttgggtagaattag 47566553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 758 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336904
Alignment:
Q  758 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattag 5336904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 721 - 785
Target Start/End: Original strand, 10114443 - 10114505
Alignment:
Q  721 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 785  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10114443 aacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 603 - 676
Target Start/End: Original strand, 16455283 - 16455356
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaa 676  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16455283 tacttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 755 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 29609656 - 29609592
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||  |||||||| | ||||||||||    
T  29609656 gagaaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattag 29609592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 924 - 970
Target Start/End: Original strand, 42356601 - 42356649
Alignment:
Q  924 tgtgtaatgatcgtccctttcaaacc-cta-gtagctacattgtcatgg 970  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42356601 tgtgtaatgatcgtccctttcaaacctctaggtagctacattgtcatgg 42356649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 758 - 816
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638884
Alignment:
Q  758 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaat 816  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaat 16638884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 584 - 653
Target Start/End: Original strand, 25357614 - 25357683
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagag 653  Q
    ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  25357614 gttccaattttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagag 25357683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 51709 - 52227
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  51709 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatgg 51808  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51809 acaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 51908  T
Q  553 agnnnnnnnn-cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--t 649  Q
    ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||   ||||| ||||||  |    
T  51909 agaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagat 52008  T
Q  650 agagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 749  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52009 agagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattc 52108  T
Q  750 accttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||     
T  52109 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgac 52208  T
Q  850 atctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  52209 atctcttttgtaacgttac 52227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 183976 - 183713
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  183976 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 183878  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |    
T  183877 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattggg 183779  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  183778 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttac 183713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 353 - 424
Target Start/End: Original strand, 50159 - 50230
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50159 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 50230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 352 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 30035197 - 30034675
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  30035197 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttata 30035098  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30035097 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaag 30034998  T
Q  552 gagnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----g 645  Q
    |||          |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||    |    
T  30034997 gagaaaataaaaacgtatcttcaatgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagag 30034898  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30034897 agatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 30034798  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  30034797 attcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 30034698  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  30034697 tgatttctcttttgtaacgttac 30034675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 868
Target Start/End: Original strand, 30966923 - 30967443
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30966923 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 30967022  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967023 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 30967122  T
Q  553 agnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga-- 648  Q
    ||          || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||  ||||| ||||||      
T  30967123 agaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtat-aggctaaactttgagaga 30967221  T
Q  649 --tagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 746  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30967222 gatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttga 30967321  T
Q  747 ttcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccatt 846  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  30967322 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccatt 30967421  T
Q  847 gatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  30967422 gatttctcttttgtaacgttac 30967443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 12196104 - 12195597
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12196104 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 12196005  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12196004 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 12195905  T
Q  553 agnnnnnnnn--cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagata 650  Q
    ||          || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||    
T  12195904 agaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagata 12195805  T
Q  651 gagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 750  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12195804 gagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattca 12195705  T
Q  751 ccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgat 849  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12195704 ccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgat 12195605  T
Q  850 atctcttt 857  Q
     |||||||    
T  12195604 ttctcttt 12195597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 353 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 2629479 - 2628968
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2629479 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 2629380  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629379 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 2629280  T
Q  553 ag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagata 650  Q
    ||          |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||   ||||| |||||| |    
T  2629279 aggaaaaaaaaacgtatcttcagtgtagtatttgttccaaatttattagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagaga 2629180  T
Q  651 gag-----ggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 745  Q
    |||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2629179 gagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttg 2629080  T
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggag-acttattcttgtaaccca 844  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  2629079 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-ggagaatttattcttgtaaccca 2628981  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||    
T  2628980 ttgatttctcttt 2628968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 351 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 19705167 - 19704653
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19705167 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaagatattttgtgctgaaaatatatttat 19705068  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 550  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19705067 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaa 19704968  T
Q  551 ggag----nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt-- 644  Q
    ||||            |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||      
T  19704967 ggagaaaaaaaagaaacgtatcttaagtgtgatattcgttccaaatttatgagttata-tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttga 19704869  T
Q  645 ----gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 740  Q
        ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |    
T  19704868 gagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtg 19704769  T
Q  741 ggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgta 839  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19704768 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 19704669  T
Q  840 acccattgatatctct 855  Q
    |||||||||| |||||    
T  19704668 acccattgatttctct 19704653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 351 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 26933160 - 26932644
Alignment:
Q  351 tttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 450  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  26933160 tttgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatattattat 26933061  T
Q  451 cgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 550  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26933060 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 26932961  T
Q  551 ggag-nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaacctt----- 644  Q
    ||||         || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | |||| |||  | |||| ||         
T  26932960 ggagaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgggttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 26932861  T
Q  645 ---gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 741  Q
       ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  26932860 agagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgg 26932761  T
Q  742 gttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaa 840  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  26932760 gttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26932661  T
Q  841 cccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||| |||||||    
T  26932660 cccattgatttctcttt 26932644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 355 - 868
Target Start/End: Original strand, 17011781 - 17012282
Alignment:
Q  355 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgac 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| |||    
T  17011781 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattattgctaaaaatataaaag-tttgttttaaatat--tttgtgtagaaaatatatttatggac 17011877  T
Q  455 aataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 554  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  17011878 aataaatatatttttgtaccgtatgatggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaaaa- 17011976  T
Q  555 nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagg 654  Q
            ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17011977 ---aaaaacgtatcttcagagtgatgttcgttccaaatttatgagttata-tttctctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagagg 17012072  T
Q  655 gggctgaa-ataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 753  Q
    || ||||| | |||||||||| |||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17012073 ggtctgaataaaagggtttag-aagtaaacaac-aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaggg-ttga-ggttgattcacct 17012167  T
Q  754 tgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||  |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17012168 tctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatct 17012267  T
Q  854 cttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||    
T  17012268 cttttgtaaagttac 17012282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 352 - 734
Target Start/End: Original strand, 17852266 - 17852650
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgt--tgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattta 449  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  17852266 ttgttgaaatatgactcaaaatttgatg-atggagaatattgtgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatat--tttatgctgaaaatatattta 17852362  T
Q  450 tcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactga 549  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17852363 tggacaataaatatatttttgtaccttatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattatttcactga 17852462  T
Q  550 aggag----nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttg 645  Q
    | |||             |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||    
T  17852463 aagagaagaaaaaaaaaagtatcttc-gtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttg 17852561  T
Q  646 agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 734  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17852562 agatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057436
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 13057372  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13057373 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 13057436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Original strand, 3390343 - 3390621
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3390343 aatttatgagagatacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa 3390442  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3390443 actagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaca 3390542  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | |||||  || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390543 gaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 3390621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 28241658 - 28241393
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28241658 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 28241559  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28241558 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28241459  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28241458 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 28241393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477516
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || | |    
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggc 25477452  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25477453 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac 25477516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 604 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 11983365 - 11983101
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11983365 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11983266  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11983265 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 11983166  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11983165 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 11983101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 352 - 621
Target Start/End: Original strand, 18317750 - 18318021
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18317750 ttgttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 18317849  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18317850 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 18317949  T
Q  552 gag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 621  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18317950 gagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatactttcactataaatata 18318021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 607 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3632010
Alignment:
Q  607 tttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtataga 706  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  707 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 806  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactt 3632072  T
Q  807 tgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3632071 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 3632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629936
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |    
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggc 3630000  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629999 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 3629936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 612 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458839
Alignment:
Q  612 tataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttg 711  Q
    ||||||||||  | ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  712 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 811  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  812 agaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 14458839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13039996
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13039933 tttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 13039996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 602 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 14507513 - 14507258
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14507513 atacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 14507414  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14507413 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 14507314  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14507313 gactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 14507258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 584 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 15541495 - 15541213
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15541495 gttccaaattt-taagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaa 15541397  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15541396 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttg 15541297  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    || ||| ||||||  || |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541296 gtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 15541213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 9019902 - 9020168
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9019902 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 9020001  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||     
T  9020002 atagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgg 9020101  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020102 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 9020168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 1230586 - 1230321
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1230586 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 1230487  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  1230486 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctggg 1230387  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1230386 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 1230321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 645 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816309
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4816427  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4816426 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 4816327  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  4816326 ttgatttctcttttgtaa 4816309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 353 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 5275928 - 5275727
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5275928 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 5275829  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275828 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 5275729  T
Q  553 ag 554  Q
    ||    
T  5275728 ag 5275727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 15533036 - 15532753
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15533036 gttccaaattt-taagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaac 15532938  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15532937 aacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 15532838  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || | ||||||||  || |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532837 gtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 15530460 - 15530195
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15530460 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 15530361  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15530360 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattga 15530261  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15530260 ggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttac 15530195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233802
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  705 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  3233866 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 3233802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 30729165 - 30728896
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  30729165 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgta 30729066  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30729065 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggg 30728966  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaaagttac 868  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||    
T  30728965 gctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttac 30728896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338519
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacacta-gggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
     ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||  | |||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaaga 24338584  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24338583 ctttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 24338519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 604 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 19227744 - 19227514
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||| | |||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19227744 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19227645  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227644 agagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 19227545  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattc 834  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19227544 ctttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 32279973 - 32280238
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||||||  |||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  32279973 atacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgt 32280071  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  32280072 atagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 32280171  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280172 gacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 32280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065214
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26065201  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||  |||||||    
T  26065202 ttgacttctcttt 26065214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085183
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26085170  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||  |||||||    
T  26085171 ttgacttctcttt 26085183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 605 - 862
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490876
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggttta-gaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 22490817  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 862  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490818 ctttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 22490876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 20915651 - 20915438
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20915651 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 20915552  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20915551 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 20915452  T
Q  844 attgatatctcttt 857  Q
    |||||| |||||||    
T  20915451 attgatttctcttt 20915438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 605 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161629
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  12161790 gagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagac 12161693  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| |||| |||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12161692 tttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttac 12161629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 3028188 - 3027926
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 700  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  3028188 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaactagggtttg 3028091  T
Q  701 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 800  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||    
T  3028090 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattg 3027994  T
Q  801 agactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3027993 agactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 3027926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 353 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 22858536 - 22858261
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22858536 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttaataaaaatataaaagatttgttttaaatatactttgtgctgaaaatatatttatgg 22858437  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 552  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22858436 acaataaatatatttttgtaccgtatgaaagaagattagatgcaaatatattttgaaagggaa--------ttttgatgcaaatattctttcattgaagg 22858345  T
Q  553 ag---nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcag 634  Q
    ||           ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  | |||||||||    
T  22858344 agaaaaaaagaaacgtatcttcaacgtgatatacgttccaaatttatgagttata-tttctctataaatataaaccttgtatcag 22858261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 579 - 868
Target Start/End: Original strand, 15719600 - 15719884
Alignment:
Q  579 tattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtat-------cagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtt 671  Q
    |||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||       || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15719600 tatttgttccaattttatgagggttacttttactataaatatatacattgtatattgtatcaatataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtt 15719699  T
Q  672 tagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagga 771  Q
    ||||||   |||        |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15719700 tagaaatcaaac--------tagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattagga 15719787  T
Q  772 ttgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719788 ttgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15719884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 605 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 753  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 602 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 1072215 - 1072067
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1072215 atacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgt 1072116  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072115 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 355 - 519
Target Start/End: Original strand, 20526548 - 20526708
Alignment:
Q  355 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcgac 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  20526548 ttgtagtatgactcaaaatttgatgggtgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaatatatttat---- 20526643  T
Q  455 aataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatata-ttttgaaagggaatatt 519  Q
      || |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20526644 -gtacatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttgaaagagaatatt 20526708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 746 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069791
Alignment:
Q  746 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccat 845  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  846 tgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttac 1069791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  612 tataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttg 711  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  712 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 754  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 725 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273298
Alignment:
Q  725 aacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacag 823  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  824 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 5273298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 16455762 - 16455498
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtt 698  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||| |  ||||||  |||||||||||| | |||||  |||| |||||||    
T  16455762 atacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtt 16455665  T
Q  699 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 798  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||      
T  16455664 tgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagat 16455568  T
Q  799 tgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16455567 tgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattac 16455498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 605 - 867
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466564
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
     ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||    
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 14466500  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
     |||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14466501 gtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggtta 14466564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 590 - 867
Target Start/End: Original strand, 15367000 - 15367272
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcag-------tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaa 682  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||          
T  15367000 aatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagacatcggtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggcttataattc--- 15367096  T
Q  683 caacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 782  Q
         ||||||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15367097 -----aaattaggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctctt 15367187  T
Q  783 ggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
     ||  |||||||||  ||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15367188 cgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagtta 15367272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 602 - 725
Target Start/End: Original strand, 8995455 - 8995578
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8995455 atacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 8995554  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaa 725  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8995555 atagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 742 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186144
Alignment:
Q  742 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagaca-ggagacttattcttgtaa 840  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  841 cccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttac 12186144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 605 - 867
Target Start/End: Original strand, 19696420 - 19696681
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg--ggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||  |   ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  19696420 cttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ttagggtttgt 19696517  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  |   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||  |||    
T  19696518 atagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattga 19696614  T
Q  802 gactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    |||||||| |||||||| |   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19696615 gactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagtta 19696681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 741 - 868
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945386
Alignment:
Q  741 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgta 839  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| |   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  840 acccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttac 26945386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 26066309 - 26066206
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26066309 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 26066210  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  26066209 cttt 26066206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 590 - 771
Target Start/End: Original strand, 15346355 - 15346524
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||        |   ||    
T  15346355 aatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttaga--------attcaa 15346446  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagga 771  Q
    | ||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15346447 actagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 33308986 - 33309088
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33308986 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttct 33309084  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  33309085 cttt 33309088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 33311255 - 33311357
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33311255 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttct 33311353  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  33311354 cttt 33311357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 605 - 717
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584212
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| || |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  705 gagtttgtctctt 717  Q
    |||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 26068580 - 26068477
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26068580 gagaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttct 26068481  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  26068480 cttt 26068477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 29754894 - 29754791
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29754894 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttct 29754795  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  29754794 cttt 29754791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 375 - 519
Target Start/End: Original strand, 30445243 - 30445404
Alignment:
Q  375 tgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatatatttatcgacaat 457  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||  |||||    
T  30445243 tgatggatgaagaatattgttgctagaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgcttccagaatattgttgctgaaaatatatttatgaacaat 30445342  T
Q  458 aaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30445343 aaatatatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttaaaaaggaatatt 30445404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 744 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037802
Alignment:
Q  744 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggaga-cttattcttgtaacc 842  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || ||  |||||||||||||||||||||     | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  843 cattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttac 28037802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 436
Target Start/End: Original strand, 30443022 - 30443097
Alignment:
Q  363 tgactcaaaattt--gatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 436  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30443022 tgactcaaaatttatgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataagagatttgtttcaaatatattttttgct 30443097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 13878710 - 13878787
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13878710 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 13878787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 13883458 - 13883535
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13883458 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 13883535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 16785902 - 16785979
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16785902 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 16785979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 721 - 867
Target Start/End: Original strand, 20526902 - 20527046
Alignment:
Q  721 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta-g 819  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  | ||||||| |||||||||| |    
T  20526902 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattagg 20526999  T
Q  820 acaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
       | ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  20527000 tttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagtta 20527046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 26887423 - 26887346
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26887423 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 26887346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 31248913 - 31248836
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31248913 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 31248836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 35201525 - 35201448
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35201525 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 35201448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 743 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 19702061 - 19701985
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 818  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19702061 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351974
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattag 22351974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078630
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacagga-gacttattcttgtaac 841  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||  ||||||||||    || ||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  842 ccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttac 25078630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 3577713 - 3577637
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3577713 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattag 3577637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 17036038 - 17036115
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17036038 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 17036115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 17695050 - 17694973
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17695050 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 17694973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 712 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 22858181 - 22858076
Alignment:
Q  712 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggt 811  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||| |||    
T  22858181 tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggt 22858084  T
Q  812 agaattag 819  Q
    ||| ||||    
T  22858083 agatttag 22858076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 743 - 818
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 818  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   | |||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 13467662 - 13467586
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13467662 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattag 13467586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542455
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgagactttgggtagaatta-gacaggagacttattcttgtaa 840  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   || || ||||| |||||||| |   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  841 cccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctc-tttgtaaagttac 7542455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 765 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166268
Alignment:
Q  765 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 12166268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 825 - 867
Target Start/End: Original strand, 15346546 - 15346588
Alignment:
Q  825 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15346546 agacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagtta 15346588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12186406 - 12186330
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaaa 677  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12186406 tacttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12937536 - 12937457
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatat--gcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagag-ggggctgaaataagggtttagaaa 677  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  12937536 atacttttactataaatatatagacattgtatcagatgtaaaccttgagatacagaggggctgaaaacagggtttagaaa 12937457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 764 - 819
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941703
Alignment:
Q  764 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattag 25941703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 801 - 868
Target Start/End: Original strand, 30445698 - 30445766
Alignment:
Q  801 agactttgggtagaattagacagga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||||    || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30445698 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 30445766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 33215810 - 33215887
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  33215810 ttgattcaccttgaataaagcactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattag 33215887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342923
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattag 22342923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643236
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattag 26643236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749202
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattag 26749202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 590 - 677
Target Start/End: Original strand, 26945112 - 26945201
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatca-gtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaataagggtttagaaa 677  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  26945112 aatttatgaggaatgcttttactataaatataaaccttgtatcaggtataaaccttgagatatagggggccgaaaacaagggtttagaaa 26945201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 831 - 867
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833517
Alignment:
Q  831 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 867  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagtta 3833517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 410
Target Start/End: Original strand, 12158532 - 12158575
Alignment:
Q  367 tcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaa 410  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12158532 tcaaaatttgatgaatgaagaagattgttgctaaaaatataaaa 12158575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 825 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078268
Alignment:
Q  825 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttac 28078268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 519
Target Start/End: Original strand, 30443111 - 30443195
Alignment:
Q  433 tgctgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 519  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  30443111 tgctgaaaatatatttatggacaa--aatatatgtttgtaccgtataaaggaagatttgatgcaaatgtatttttaaaagaaatatt 30443195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 126
Target Start/End: Original strand, 13998096 - 13998174
Alignment:
Q  48 taacctttggtgggagtttaagcttccaaatgatactccaatgacctgttactctatgttgcgtcataacactatcatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||| || | |||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  13998096 taacctttggtgggagtttaagattccaaatagaattccaatgcccaggtactctatgttgcagcatgacaatatcatt 13998174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 579 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 28038066 - 28038012
Alignment:
Q  579 tattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatca 633  Q
    |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28038066 tatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatca 28038012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 766 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165937
Alignment:
Q  766 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattag 5165937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 823 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 25465708 - 25465664
Alignment:
Q  823 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25465708 ggagacttattcttgtacccctttgatatctc-tttgtaaagttac 25465664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 352 - 862
Target Start/End: Original strand, 1734 - 2251
Alignment:
Q  352 ttgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatc 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1734 ttgttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 1833  T
Q  452 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 551  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1834 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 1933  T
Q  552 gag--nnnnnnnncgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttg---- 645  Q
    |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | |||| |||  | |||| |||        
T  1934 gagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttataagttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 2033  T
Q  646 --agatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 743  Q
      ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2034 aaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggt 2132  T
Q  744 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  2133 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 2232  T
Q  844 attgatatctcttttgtaa 862  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  2233 attaatttctcttttgtaa 2251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 3947 - 4212
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3947 atacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4046  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4047 ata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgg 4145  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4146 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 4212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 603 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 41820 - 41555
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41820 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 41721  T
Q  703 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41720 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 41621  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41620 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 41555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 183; Significance: 2e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 602 - 868
Target Start/End: Original strand, 14969 - 15235
Alignment:
Q  602 atacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14969 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggttttt 15068  T
Q  702 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 801  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |    
T  15069 ataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattca 15168  T
Q  802 gactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15169 gactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 645 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 14677 - 14454
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14677 gagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggtt 14578  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14577 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 14478  T
Q  845 ttgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  14477 ttgatatctcttttgtaacgttac 14454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 743 - 785
Target Start/End: Original strand, 31124 - 31168
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggt 785  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31124 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggt 31168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 181; Significance: 3e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 69586 - 69374
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69586 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 69487  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  69486 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 69387  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||    
T  69386 ttgatttctcttt 69374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 645 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 73318 - 73208
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73318 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 73219  T
Q  745 gattcaccttg 755  Q
    |||||||||||    
T  73218 gattcaccttg 73208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 717 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73160
Alignment:
Q  717 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactatt 767  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 178; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 2832 - 3085
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2832 acttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2931  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 803  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  2932 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttgga 3031  T
Q  804 ctttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3032 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 3085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 168; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Original strand, 79797 - 80075
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  79797 aatttatgagggattcttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaa 79896  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttac 788  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  79897 actagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttac 79996  T
Q  789 gggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||  || | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  79997 gggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 80075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 188441 - 188364
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  188441 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 188364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 163; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 604 - 857
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6405
Alignment:
Q  604 acttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtat 703  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  6151 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtat 6250  T
Q  704 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgag 802  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  6251 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattggg 6350  T
Q  803 actttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6351 actttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttt 6405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 157; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 584 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 16174 - 15894
Alignment:
Q  584 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaac 683  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  16174 gttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaac 16076  T
Q  684 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 783  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16075 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttg 15979  T
Q  784 gttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    || ||||||||||  || |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15978 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 154; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Original strand, 34 - 247
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccc 843  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  844 attgatatctcttt 857  Q
    |||||| |||||||    
T  234 attgatttctcttt 247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 152; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 605 - 832
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  605 cttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35791  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttat 832  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35792 tttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 645 - 857
Target Start/End: Original strand, 29164 - 29376
Alignment:
Q  645 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  29164 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 29263  T
Q  745 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaaccca 844  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29264 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 29363  T
Q  845 ttgatatctcttt 857  Q
    ||||| |||||||    
T  29364 ttgatttctcttt 29376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 147; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 590 - 868
Target Start/End: Original strand, 85169 - 85446
Alignment:
Q  590 aatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaa 689  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| | ||  |||| |||| |||| |||| ||||||||||    
T  85169 aatttatgagggattcttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaa 85267  T
Q  690 attagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacg 789  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  85268 actagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacg 85367  T
Q  790 ggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
     ||||||  || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  85368 agaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttac 85446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 606 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16723
Alignment:
Q  606 ttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaat-aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtata 704  Q
    ||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtata 16884  T
Q  705 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 804  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||    
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagac 16787  T
Q  805 tttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16786 tttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 16723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 130; Significance: 8e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 496 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 2080 - 1715
Alignment:
Q  496 aaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnn-------cgtatcttcagtgtggtattcgttcc 588  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               | ||||||||| ||| ||| | ||||    
T  2080 aaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaaggaaacctatcttcagcgtgatatccattcc 1981  T
Q  589 aaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaaca 687  Q
    ||||||| |||||| | ||   || ||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| |    
T  1980 aaatttacgagttacattt---ctctaaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaga 1885  T
Q  688 aaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtta 787  Q
    ||| |||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  1884 aaactagggtttgtatagagtttc---------aacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtca 1796  T
Q  788 cgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795 cgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 1715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 354 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2184 - 2070
Alignment:
Q  354 gttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcga 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2184 gttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 2085  T
Q  454 caataaatatatttt 468  Q
    |||||||||||||||    
T  2084 caataaatatatttt 2070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 115; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 719 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1535
Alignment:
Q  719 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaatta 818  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  819 gacaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 857  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 1535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 109; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 353 - 501
Target Start/End: Original strand, 4546 - 4694
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatcg 452  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4546 tgttgcagtataactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatatttcgtgctgaaaatatatttatgg 4645  T
Q  453 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatat 501  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4646 acaatatatatatttttgtactgtatgaaggacaatttgatgcaaatat 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 563 - 858
Target Start/End: Original strand, 4726 - 5016
Alignment:
Q  563 cgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 662  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4726 cgtatcttcagtgtgatattcgtttcaaatttatgagttatatttct-ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaa 4824  T
Q  663 ataaggg-tttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaac 761  Q
    | || || ||||||| |  | ||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||| ||| |||  ||||||||  ||| |||||    
T  4825 aaaaaggatttagaa-gtaagcaacaaact-agggtttatatagcgttt-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaac 4919  T
Q  762 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 858  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||  |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4920 actattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttt 5016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 95; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 353 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 95 - 1
Alignment:
Q  353 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 88; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 603 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 1168 - 993
Alignment:
Q  603 tacttttactataaatatatgcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 702  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1168 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 1069  T
Q  703 tagagtttgtctc-----tttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt 773  Q
    |||||||||||||     |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1068 tagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 22219 - 22321
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  22219 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttct 22317  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  22318 cttt 22321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 755 - 857
Target Start/End: Original strand, 24494 - 24596
Alignment:
Q  755 gagaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattagacaggagacttattcttgtaacccattgatatct 853  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  24494 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttct 24592  T
Q  854 cttt 857  Q
    ||||    
T  24593 cttt 24596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 48; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 224802 - 224879
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  224802 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 224879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 47; Significance: 3e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 436 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 57905 - 57836
Alignment:
Q  436 tgaaaatatatttatcgacaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttgatgcaaatatatttt 506  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  57905 tgaaaatatatgtatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaa-aatttgatgcaaatatatttt 57836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 746 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 57626 - 57501
Alignment:
Q  746 attcaccttgagaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gagactttgggtagaattagacagga-gacttattcttgtaacc 842  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||  | | |||||||||| |||||||    || ||  |||||||||||||    
T  57626 attcaccttgaaaaaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaacc 57527  T
Q  843 cattgatatctcttttgtaaagttac 868  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||    
T  57526 ctttgatatctattttgtaaagttac 57501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 57995 - 57926
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 434  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  57995 tgactcaaaatttgatggatgatgaat--tgtttctaaaagtataaaagatttgttttatatattttttgtg 57926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 743 - 819
Target Start/End: Original strand, 16308 - 16385
Alignment:
Q  743 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16308 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattag 16385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 761 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17108
Alignment:
Q  761 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattag 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggac-ttgggtagaattag 17108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2273 - 2232
Alignment:
Q  390 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 431  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2273 attgttgcagaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 2232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0474 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 413
Target Start/End: Original strand, 10443 - 10493
Alignment:
Q  363 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagat 413  Q
    ||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  10443 tgactcaaaatttgatggataaaaaagattgttgttaaaaatataaaagat 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University