View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4364-Insertion-7 (Length: 788)

Name: NF4364-Insertion-7
Description: NF4364
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4364-Insertion-7
NF4364-Insertion-7
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (8-777)||(13191314-13192083)
chr6 (342-732)||(13492699-13493090)
chr6 (342-717)||(9351973-9352347)
chr6 (424-727)||(17027382-17027685)
chr6 (432-727)||(20850321-20850616)
chr6 (367-727)||(7911813-7912173)
chr6 (357-717)||(7912235-7912595)
chr6 (339-632)||(16519876-16520168)
chr6 (432-727)||(20896538-20896834)
chr6 (341-707)||(17730980-17731350)
chr6 (427-727)||(23776436-23776735)
chr6 (493-727)||(13492393-13492628)
chr6 (432-728)||(2681070-2681362)
chr6 (432-728)||(23986167-23986463)
chr6 (432-686)||(20126074-20126328)
chr6 (531-727)||(28780209-28780405)
chr6 (427-727)||(21311966-21312266)
chr6 (432-702)||(17850918-17851188)
chr6 (431-702)||(2720439-2720711)
chr6 (468-702)||(2890715-2890949)
chr6 (451-705)||(11062304-11062558)
chr6 (470-727)||(21311553-21311810)
chr6 (432-580)||(3652486-3652634)
chr6 (472-727)||(9440708-9440963)
chr6 (447-617)||(15929597-15929767)
chr6 (432-593)||(6330897-6331058)
chr6 (468-727)||(9440160-9440419)
chr6 (432-686)||(14771611-14771865)
chr6 (432-615)||(17851374-17851557)
chr6 (427-572)||(27334156-27334301)
chr6 (427-572)||(27394896-27395041)
chr6 (206-341)||(10970894-10971029)
chr6 (446-714)||(20735709-20735977)
chr6 (470-658)||(33774922-33775112)
chr6 (432-566)||(31821704-31821838)
chr6 (468-712)||(20732614-20732857)
chr6 (222-340)||(19992309-19992426)
chr6 (446-613)||(28065800-28065970)
chr6 (531-702)||(2891170-2891340)
chr6 (222-341)||(12974503-12974621)
chr6 (468-604)||(32292921-32293055)
chr6 (468-696)||(1991589-1991817)
chr6 (567-695)||(3652658-3652786)
chr6 (467-571)||(15929234-15929338)
chr6 (477-698)||(12194374-12194593)
chr6 (477-617)||(17205384-17205523)
chr6 (482-717)||(28583013-28583249)
chr6 (471-616)||(3885052-3885194)
chr6 (385-518)||(9440488-9440620)
chr6 (446-504)||(3652993-3653051)
chr6 (637-727)||(15929344-15929434)
chr6 (50-114)||(10972445-10972509)
chr6 (470-610)||(30729807-30729947)
chr6 (367-490)||(13490056-13490179)
chr6 (667-727)||(6331219-6331279)
chr6 (578-702)||(3653048-3653168)
chr6 (468-575)||(10964340-10964447)
chr6 (222-294)||(5489214-5489283)
chr6 (476-614)||(33470882-33471019)
chr6 (52-120)||(19992115-19992183)
chr6 (501-617)||(34660469-34660585)
chr6 (644-703)||(27334305-27334364)
chr6 (644-703)||(27395045-27395104)
chr6 (559-702)||(31415965-31416107)
chr6 (635-705)||(11062032-11062102)
chr6 (446-517)||(9441064-9441135)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (342-727)||(25147446-25147830)
chr8 (342-727)||(34308330-34308715)
chr8 (342-727)||(34308786-34309175)
chr8 (432-727)||(22548400-22548695)
chr8 (432-727)||(22548846-22549141)
chr8 (432-727)||(12827105-12827400)
chr8 (432-727)||(22026379-22026675)
chr8 (341-710)||(12100601-12100968)
chr8 (357-727)||(25147892-25148261)
chr8 (468-727)||(17103117-17103377)
chr8 (432-727)||(27022190-27022484)
chr8 (468-711)||(41658972-41659215)
chr8 (342-727)||(21315961-21316345)
chr8 (435-727)||(10844466-10844758)
chr8 (432-727)||(27925899-27926193)
chr8 (432-696)||(2044058-2044322)
chr8 (432-727)||(32292397-32292699)
chr8 (342-617)||(25144682-25144957)
chr8 (427-686)||(8080234-8080493)
chr8 (510-727)||(31283503-31283719)
chr8 (432-592)||(10844883-10845043)
chr8 (432-717)||(28453338-28453623)
chr8 (465-616)||(6464872-6465023)
chr8 (427-686)||(33852150-33852409)
chr8 (459-702)||(41912997-41913240)
chr8 (342-716)||(27819110-27819481)
chr8 (16-341)||(22883013-22883365)
chr8 (475-686)||(3745144-3745355)
chr8 (465-689)||(3744671-3744895)
chr8 (446-590)||(28375042-28375186)
chr8 (583-727)||(32292092-32292236)
chr8 (427-622)||(22840486-22840680)
chr8 (207-341)||(9893888-9894021)
chr8 (207-341)||(18832053-18832186)
chr8 (481-702)||(15818892-15819112)
chr8 (106-341)||(23637698-23637932)
chr8 (497-702)||(30527358-30527563)
chr8 (342-681)||(22705090-22705424)
chr8 (222-341)||(24621963-24622082)
chr8 (446-553)||(27021904-27022011)
chr8 (207-341)||(24382049-24382183)
chr8 (225-327)||(24622147-24622249)
chr8 (481-617)||(15567517-15567653)
chr8 (469-702)||(6466748-6466976)
chr8 (239-341)||(23637013-23637114)
chr8 (521-710)||(25307855-25308042)
chr8 (468-617)||(1297043-1297192)
chr8 (207-340)||(17625309-17625440)
chr8 (504-710)||(6466329-6466534)
chr8 (236-341)||(20503405-20503509)
chr8 (483-615)||(15567972-15568100)
chr8 (8-114)||(9894134-9894253)
chr8 (528-610)||(10729654-10729736)
chr8 (451-594)||(30334892-30335035)
chr8 (342-407)||(31283367-31283432)
chr8 (558-679)||(10729749-10729870)
chr8 (471-543)||(17429539-17429611)
chr8 (645-716)||(9251098-9251169)
chr8 (522-617)||(34687920-34688015)
chr8 (451-529)||(29971450-29971528)
chr8 (635-684)||(6463438-6463487)
chr8 (9-106)||(20503127-20503230)
chr8 (466-602)||(28912826-28912962)
chr8 (664-727)||(27021840-27021903)
chr8 (207-287)||(22602715-22602796)
chr8 (640-710)||(29117444-29117514)
chr8 (477-539)||(36968434-36968496)
chr8 (223-284)||(25280086-25280144)
chr8 (558-609)||(29117362-29117413)
chr8 (584-702)||(28373999-28374116)
chr8 (664-725)||(17444235-17444296)
[»] chr4 (85 HSPs)
chr4 (342-727)||(49998546-49998931)
chr4 (342-712)||(35871538-35871907)
chr4 (342-727)||(23350128-23350513)
chr4 (342-727)||(44471170-44471555)
chr4 (432-727)||(24629281-24629573)
chr4 (432-727)||(50398383-50398678)
chr4 (448-729)||(7678465-7678746)
chr4 (342-727)||(44470720-44471099)
chr4 (432-658)||(12691913-12692139)
chr4 (367-714)||(14572012-14572355)
chr4 (432-702)||(1645619-1645889)
chr4 (432-727)||(4127739-4128029)
chr4 (432-714)||(4127276-4127577)
chr4 (481-727)||(23943087-23943333)
chr4 (432-727)||(50398839-50399133)
chr4 (432-686)||(23942675-23942929)
chr4 (432-631)||(24628918-24629120)
chr4 (432-733)||(51331122-51331421)
chr4 (432-702)||(3169206-3169476)
chr4 (342-611)||(15306052-15306326)
chr4 (498-667)||(50814730-50814899)
chr4 (432-682)||(9423748-9423998)
chr4 (468-702)||(21067770-21068001)
chr4 (446-617)||(21220286-21220457)
chr4 (468-689)||(27026539-27026759)
chr4 (432-597)||(53996090-53996255)
chr4 (481-709)||(17628560-17628788)
chr4 (446-702)||(29628524-29628793)
chr4 (470-717)||(31817708-31817954)
chr4 (446-727)||(13266100-13266381)
chr4 (465-717)||(1464180-1464431)
chr4 (432-696)||(21067282-21067546)
chr4 (16-342)||(6407043-6407395)
chr4 (342-712)||(27578317-27578683)
chr4 (432-686)||(14351795-14352049)
chr4 (449-695)||(8467690-8467923)
chr4 (343-686)||(27578795-27579137)
chr4 (367-591)||(14571702-14571926)
chr4 (206-341)||(21957378-21957512)
chr4 (470-641)||(17029368-17029539)
chr4 (446-617)||(4185729-4185900)
chr4 (560-715)||(14571545-14571700)
chr4 (342-611)||(41869830-41870097)
chr4 (476-616)||(33764904-33765044)
chr4 (493-615)||(23091468-23091590)
chr4 (426-613)||(17028868-17029055)
chr4 (486-589)||(27029331-27029434)
chr4 (562-727)||(27578134-27578296)
chr4 (492-614)||(20306122-20306241)
chr4 (483-609)||(43928927-43929052)
chr4 (607-716)||(15268029-15268138)
chr4 (464-615)||(23976175-23976327)
chr4 (240-341)||(11774178-11774279)
chr4 (476-596)||(13613874-13613993)
chr4 (570-702)||(40607069-40607201)
chr4 (549-617)||(11828440-11828508)
chr4 (470-594)||(31817376-31817500)
chr4 (635-727)||(35477863-35477955)
chr4 (663-728)||(50399335-50399400)
chr4 (450-610)||(17628986-17629145)
chr4 (238-341)||(13842370-13842473)
chr4 (446-580)||(4186181-4186315)
chr4 (451-593)||(42838642-42838787)
chr4 (207-341)||(14616041-14616176)
chr4 (627-702)||(4414257-4414332)
chr4 (465-617)||(26200248-26200394)
chr4 (486-608)||(34554483-34554605)
chr4 (614-702)||(7381449-7381537)
chr4 (637-727)||(5810039-5810129)
chr4 (446-580)||(52048659-52048792)
chr4 (560-702)||(53854717-53854859)
chr4 (468-617)||(24271506-24271654)
chr4 (663-727)||(13265867-13265931)
chr4 (528-611)||(33294852-33294936)
chr4 (481-581)||(44831046-44831146)
chr4 (471-550)||(45682242-45682321)
chr4 (432-518)||(53854861-53854947)
chr4 (470-553)||(53391925-53392008)
chr4 (682-727)||(10668381-10668426)
chr4 (682-727)||(10668887-10668932)
chr4 (682-727)||(10882526-10882571)
chr4 (606-707)||(31817003-31817104)
chr4 (663-727)||(21220199-21220263)
chr4 (507-547)||(39902478-39902518)
chr4 (117-156)||(17957128-17957167)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (342-717)||(13124996-13125372)
chr7 (342-727)||(9124869-9125254)
chr7 (367-727)||(2941608-2941968)
chr7 (342-727)||(18833196-18833581)
chr7 (432-727)||(36422252-36422546)
chr7 (432-710)||(34405459-34405737)
chr7 (342-727)||(42515002-42515387)
chr7 (432-727)||(2193256-2193551)
chr7 (432-714)||(28495854-28496136)
chr7 (432-726)||(2189144-2189438)
chr7 (446-709)||(42515558-42515821)
chr7 (446-727)||(6718926-6719206)
chr7 (446-730)||(28495467-28495740)
chr7 (459-728)||(2465951-2466219)
chr7 (342-581)||(11517386-11517624)
chr7 (472-652)||(2465773-2465953)
chr7 (522-717)||(13122365-13122561)
chr7 (342-714)||(5406451-5406823)
chr7 (528-727)||(7646329-7646528)
chr7 (432-686)||(35474013-35474267)
chr7 (427-702)||(2611535-2611803)
chr7 (432-727)||(29038871-29039166)
chr7 (446-686)||(679831-680071)
chr7 (446-727)||(6747457-6747730)
chr7 (446-702)||(22529111-22529367)
chr7 (531-727)||(7646514-7646710)
chr7 (432-639)||(46425741-46425947)
chr7 (549-689)||(43776179-43776319)
chr7 (470-712)||(25182399-25182641)
chr7 (468-686)||(29357348-29357566)
chr7 (356-518)||(13124761-13124923)
chr7 (445-708)||(11372464-11372719)
chr7 (473-713)||(31406452-31406689)
chr7 (471-597)||(35527102-35527228)
chr7 (471-617)||(1628755-1628898)
chr7 (546-702)||(3305224-3305380)
chr7 (470-585)||(26421753-26421868)
chr7 (431-585)||(36015404-36015558)
chr7 (467-616)||(20966086-20966235)
chr7 (459-596)||(26421287-26421424)
chr7 (612-713)||(43233137-43233238)
chr7 (432-553)||(43233413-43233534)
chr7 (476-616)||(9623252-9623391)
chr7 (207-341)||(15815807-15815938)
chr7 (465-585)||(16192352-16192472)
chr7 (432-532)||(26957603-26957703)
chr7 (476-568)||(31743834-31743926)
chr7 (243-341)||(26150596-26150694)
chr7 (446-611)||(11372913-11373074)
chr7 (206-341)||(20913899-20914031)
chr7 (476-689)||(37672204-37672417)
chr7 (635-702)||(6747952-6748019)
chr7 (668-727)||(43776321-43776380)
chr7 (504-585)||(7461344-7461424)
chr7 (623-727)||(36422573-36422677)
chr7 (243-341)||(15002924-15003022)
chr7 (450-516)||(3305374-3305440)
chr7 (470-613)||(37671726-37671864)
chr7 (244-341)||(868238-868335)
chr7 (244-341)||(1229515-1229612)
chr7 (479-553)||(6585655-6585731)
chr7 (465-518)||(16811906-16811959)
chr7 (682-727)||(18833633-18833678)
chr7 (238-332)||(26009187-26009283)
chr7 (664-709)||(26419104-26419149)
chr7 (270-338)||(16463766-16463834)
chr7 (470-529)||(2490077-2490136)
chr7 (641-702)||(7461258-7461319)
chr7 (239-302)||(9129388-9129452)
chr7 (640-705)||(36015342-36015407)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (340-717)||(30966142-30966519)
chr2 (342-727)||(30966600-30966985)
chr2 (342-728)||(24818236-24818621)
chr2 (342-727)||(5399668-5400053)
chr2 (427-727)||(25337848-25338148)
chr2 (342-694)||(29259504-29259856)
chr2 (468-727)||(33771037-33771296)
chr2 (432-729)||(33174958-33175253)
chr2 (431-682)||(8256525-8256776)
chr2 (446-686)||(16379407-16379647)
chr2 (433-702)||(16378938-16379207)
chr2 (427-658)||(41754284-41754515)
chr2 (432-702)||(25433932-25434202)
chr2 (427-727)||(1912520-1912819)
chr2 (479-714)||(30963127-30963362)
chr2 (432-610)||(29804682-29804860)
chr2 (465-631)||(11388221-11388386)
chr2 (451-728)||(1707060-1707337)
chr2 (538-717)||(32377577-32377756)
chr2 (564-727)||(32377758-32377921)
chr2 (432-702)||(33174505-33174772)
chr2 (470-683)||(15619936-15620149)
chr2 (489-729)||(30961732-30961972)
chr2 (465-631)||(11394568-11394732)
chr2 (479-727)||(15639781-15640029)
chr2 (479-727)||(30963569-30963819)
chr2 (446-729)||(83031-83314)
chr2 (432-582)||(18098874-18099024)
chr2 (432-686)||(27882818-27883072)
chr2 (431-623)||(38898867-38899059)
chr2 (476-710)||(13191018-13191252)
chr2 (470-586)||(20502061-20502176)
chr2 (422-712)||(1953145-1953434)
chr2 (484-710)||(8073944-8074170)
chr2 (16-121)||(20509391-20509503)
chr2 (481-711)||(16542034-16542263)
chr2 (432-542)||(18447954-18448064)
chr2 (209-341)||(28772213-28772342)
chr2 (467-685)||(8181254-8181462)
chr2 (242-341)||(30622013-30622112)
chr2 (242-341)||(30624634-30624733)
chr2 (238-340)||(24533882-24533984)
chr2 (663-727)||(29804878-29804942)
chr2 (483-548)||(36924452-36924519)
chr2 (242-341)||(30667766-30667865)
chr2 (470-593)||(37552606-37552726)
chr2 (626-710)||(11389677-11389761)
chr2 (626-710)||(11406338-11406422)
chr2 (558-689)||(18875874-18876005)
chr2 (640-702)||(20502172-20502234)
chr2 (238-340)||(24300834-24300936)
chr2 (242-341)||(30665338-30665442)
chr2 (624-686)||(36924373-36924435)
chr2 (296-341)||(22574853-22574898)
chr2 (482-554)||(9909142-9909214)
chr2 (489-553)||(26864841-26864905)
chr2 (342-411)||(30963429-30963498)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (342-727)||(105630-106015)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (342-727)||(3886908-3887293)
chr5 (342-717)||(2474315-2474690)
chr5 (342-727)||(3886452-3886837)
chr5 (342-705)||(22556446-22556810)
chr5 (340-714)||(2473867-2474231)
chr5 (337-731)||(188985-189367)
chr5 (446-727)||(8641886-8642166)
chr5 (357-708)||(22556894-22557246)
chr5 (432-727)||(34371612-34371907)
chr5 (446-710)||(17445323-17445587)
chr5 (343-686)||(1821817-1822160)
chr5 (432-717)||(15512873-15513159)
chr5 (432-727)||(42788497-42788792)
chr5 (470-717)||(34372106-34372353)
chr5 (432-727)||(2193816-2194099)
chr5 (432-659)||(21886065-21886292)
chr5 (432-704)||(10927277-10927549)
chr5 (432-686)||(27646727-27646981)
chr5 (432-727)||(34867790-34868073)
chr5 (432-697)||(8391203-8391467)
chr5 (446-653)||(10926871-10927078)
chr5 (432-686)||(20039367-20039620)
chr5 (468-696)||(18750078-18750306)
chr5 (465-702)||(29679983-29680213)
chr5 (342-727)||(30684407-30684792)
chr5 (446-727)||(39146953-39147227)
chr5 (431-705)||(18304430-18304704)
chr5 (486-730)||(20858390-20858633)
chr5 (512-714)||(11757145-11757347)
chr5 (342-616)||(30719767-30720041)
chr5 (482-710)||(24182114-24182341)
chr5 (446-616)||(16370673-16370840)
chr5 (367-512)||(22975076-22975221)
chr5 (222-340)||(19266253-19266370)
chr5 (481-611)||(42429194-42429324)
chr5 (239-341)||(22433460-22433562)
chr5 (465-604)||(32574632-32574770)
chr5 (471-686)||(1880120-1880330)
chr5 (481-583)||(4673466-4673568)
chr5 (207-318)||(39606549-39606656)
chr5 (562-727)||(30720111-30720276)
chr5 (562-727)||(30684862-30685027)
chr5 (468-616)||(4657956-4658102)
chr5 (271-341)||(22910812-22910882)
chr5 (470-597)||(5066872-5066999)
chr5 (532-585)||(5785901-5785954)
chr5 (465-546)||(11160713-11160794)
chr5 (471-727)||(2058508-2058763)
chr5 (663-717)||(21883946-21884000)
chr5 (560-617)||(4102924-4102981)
chr5 (9-120)||(22433263-22433381)
chr5 (468-598)||(43356600-43356729)
chr5 (635-684)||(187761-187810)
chr5 (561-686)||(8366595-8366719)
chr5 (606-682)||(38063725-38063800)
chr5 (73-120)||(19266491-19266538)
chr5 (243-341)||(22652738-22652836)
chr5 (558-615)||(5785971-5786028)
chr5 (509-542)||(39801498-39801531)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (342-732)||(107309-107699)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (342-728)||(10210-10595)
scaffold0018 (244-341)||(49957-50055)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (342-727)||(31284127-31284512)
chr3 (368-729)||(8067216-8067577)
chr3 (432-727)||(32227072-32227367)
chr3 (427-727)||(28561741-28562040)
chr3 (367-717)||(27187190-27187541)
chr3 (432-727)||(16811381-16811674)
chr3 (446-717)||(11179895-11180166)
chr3 (432-727)||(50347746-50348041)
chr3 (427-727)||(39653159-39653459)
chr3 (432-727)||(14813949-14814244)
chr3 (476-727)||(13150405-13150656)
chr3 (468-727)||(32386585-32386844)
chr3 (432-717)||(13149960-13150245)
chr3 (432-729)||(32227501-32227797)
chr3 (432-727)||(14820154-14820449)
chr3 (432-727)||(16810925-16811220)
chr3 (342-727)||(25248021-25248407)
chr3 (427-702)||(30529682-30529956)
chr3 (345-632)||(41472214-41472500)
chr3 (446-696)||(25230587-25230837)
chr3 (446-696)||(25238174-25238424)
chr3 (465-702)||(20884993-20885230)
chr3 (484-702)||(4067236-4067454)
chr3 (342-650)||(41473907-41474215)
chr3 (431-702)||(25230124-25230395)
chr3 (431-702)||(25237711-25237982)
chr3 (476-686)||(25238576-25238786)
chr3 (446-730)||(37045049-37045330)
chr3 (342-702)||(7477102-7477461)
chr3 (446-617)||(39640951-39641122)
chr3 (342-702)||(7493792-7494151)
chr3 (459-617)||(29224351-29224509)
chr3 (432-585)||(25239070-25239223)
chr3 (432-686)||(2911095-2911338)
chr3 (446-696)||(25802430-25802680)
chr3 (447-577)||(32796936-32797066)
chr3 (465-617)||(25802965-25803117)
chr3 (340-498)||(12820552-12820710)
chr3 (479-689)||(26309878-26310088)
chr3 (521-707)||(53150683-53150869)
chr3 (222-341)||(12782308-12782426)
chr3 (342-457)||(32388852-32388967)
chr3 (243-341)||(8875170-8875268)
chr3 (500-709)||(3899868-3900077)
chr3 (226-341)||(16307307-16307424)
chr3 (226-341)||(16308378-16308495)
chr3 (207-340)||(11834908-11835040)
chr3 (492-686)||(15392570-15392764)
chr3 (492-686)||(15405606-15405800)
chr3 (492-630)||(15417431-15417569)
chr3 (468-603)||(31103933-31104070)
chr3 (492-617)||(15411015-15411140)
chr3 (634-727)||(41473743-41473836)
chr3 (492-686)||(15388203-15388397)
chr3 (492-630)||(15377344-15377482)
chr3 (53-120)||(12782092-12782159)
chr3 (492-615)||(15376056-15376179)
chr3 (468-605)||(47518295-47518429)
chr3 (244-341)||(16279749-16279845)
chr3 (635-702)||(25239003-25239070)
chr3 (534-612)||(15381232-15381310)
chr3 (534-612)||(15396467-15396545)
chr3 (534-612)||(15410603-15410681)
chr3 (534-612)||(15373670-15373748)
chr3 (522-584)||(43736715-43736777)
chr3 (238-341)||(3295561-3295664)
chr3 (500-547)||(3890046-3890093)
chr3 (238-321)||(13437939-13438022)
chr3 (238-321)||(10835872-10835953)
chr3 (534-604)||(15392157-15392227)
chr3 (534-612)||(15417019-15417096)
chr3 (637-727)||(18318860-18318950)
chr3 (645-686)||(25230989-25231030)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (432-727)||(20054387-20054682)
chr1 (432-727)||(20054843-20055138)
chr1 (432-727)||(20055299-20055594)
chr1 (432-727)||(20055755-20056050)
chr1 (432-727)||(20056211-20056506)
chr1 (432-727)||(20057114-20057409)
chr1 (427-727)||(20057570-20057870)
chr1 (342-727)||(35759459-35759844)
chr1 (432-727)||(20053931-20054226)
chr1 (468-727)||(20056667-20056926)
chr1 (432-727)||(20845512-20845807)
chr1 (432-729)||(38340906-38341203)
chr1 (432-727)||(52250206-52250501)
chr1 (432-727)||(16451784-16452079)
chr1 (432-727)||(16460937-16461232)
chr1 (432-727)||(50002926-50003221)
chr1 (367-727)||(46693586-46693948)
chr1 (432-710)||(50002575-50002853)
chr1 (344-647)||(35760845-35761148)
chr1 (487-728)||(20060190-20060431)
chr1 (446-714)||(51372738-51373006)
chr1 (450-702)||(43056941-43057193)
chr1 (356-581)||(20061188-20061413)
chr1 (530-727)||(52250641-52250838)
chr1 (530-727)||(52250978-52251175)
chr1 (432-686)||(43057415-43057669)
chr1 (342-580)||(2328225-2328463)
chr1 (432-617)||(50002246-50002431)
chr1 (432-640)||(12883524-12883732)
chr1 (465-597)||(12728024-12728157)
chr1 (350-613)||(23180649-23180911)
chr1 (468-713)||(16907270-16907516)
chr1 (432-617)||(2634924-2635109)
chr1 (432-617)||(30872911-30873096)
chr1 (446-611)||(31822630-31822795)
chr1 (446-632)||(7548105-7548291)
chr1 (222-340)||(18623919-18624036)
chr1 (106-341)||(21416607-21416842)
chr1 (470-610)||(16440547-16440687)
chr1 (432-596)||(10820592-10820758)
chr1 (470-689)||(16410612-16410831)
chr1 (238-341)||(21199852-21199955)
chr1 (465-606)||(842905-843046)
chr1 (450-686)||(2634484-2634720)
chr1 (639-727)||(35759915-35760003)
chr1 (604-727)||(31822970-31823093)
chr1 (540-617)||(8278065-8278142)
chr1 (645-727)||(49996531-49996613)
chr1 (521-617)||(7229904-7230000)
chr1 (501-565)||(31823097-31823161)
chr1 (467-605)||(2739557-2739695)
chr1 (558-632)||(35009942-35010016)
chr1 (8-95)||(18623815-18623909)
chr1 (257-341)||(20406044-20406129)
chr1 (586-702)||(7547791-7547907)
chr1 (655-714)||(28181357-28181416)
chr1 (644-727)||(39582553-39582636)
chr1 (465-604)||(42066114-42066253)
chr1 (51-105)||(21416862-21416916)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (342-727)||(2061-2446)
scaffold0040 (342-392)||(2556-2606)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (424-727)||(18958-19261)
scaffold0322 (360-496)||(18203-18339)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (432-727)||(1220-1515)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (342-714)||(162541-162914)
scaffold0022 (531-727)||(162985-163181)
scaffold0022 (528-727)||(163167-163366)
scaffold0022 (446-727)||(69666-69947)
scaffold0022 (676-727)||(162483-162534)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (468-710)||(1919-2161)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (446-716)||(2756-3026)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (432-717)||(154757-155042)
scaffold0002 (635-727)||(154505-154597)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (432-702)||(4561-4830)
scaffold0333 (432-727)||(5016-5315)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (367-714)||(245021-245364)
scaffold0005 (367-591)||(245450-245674)
scaffold0005 (560-715)||(245676-245831)
scaffold0005 (207-341)||(201201-201336)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (520-715)||(13396-13591)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (446-702)||(17474-17730)
scaffold0047 (427-686)||(18027-18285)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (531-727)||(14553-14749)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (342-549)||(142303-142510)
[»] scaffold0557 (1 HSPs)
scaffold0557 (481-717)||(2154-2381)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (543-716)||(421-594)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (573-727)||(1552-1706)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (116-335)||(17590-17810)
scaffold0118 (260-341)||(15818-15899)
[»] scaffold0068 (4 HSPs)
scaffold0068 (197-341)||(49609-49753)
scaffold0068 (197-341)||(63057-63201)
scaffold0068 (50-104)||(49866-49920)
scaffold0068 (50-104)||(63314-63368)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (50-341)||(4605-4916)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (432-554)||(4006-4128)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (468-544)||(23709-23785)
[»] scaffold0112 (2 HSPs)
scaffold0112 (207-340)||(18424-18558)
scaffold0112 (52-114)||(18669-18731)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (239-340)||(26380-26479)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (446-615)||(26084-26251)
scaffold0036 (467-548)||(16071-16152)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (117-307)||(4762-4953)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (470-618)||(14779-14927)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (207-341)||(6533-6665)
[»] scaffold0508 (1 HSPs)
scaffold0508 (222-341)||(5381-5497)
[»] scaffold0412 (3 HSPs)
scaffold0412 (233-341)||(1085-1191)
scaffold0412 (53-114)||(1357-1417)
scaffold0412 (113-166)||(1285-1338)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (249-341)||(15196-15287)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (492-630)||(44669-44807)
scaffold0071 (534-612)||(45142-45219)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (500-617)||(7009-7127)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (224-341)||(218387-218504)
scaffold0003 (25-121)||(218205-218308)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (238-341)||(627-730)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (663-717)||(62968-63022)
scaffold0065 (666-727)||(67214-67275)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (471-543)||(45425-45497)
[»] scaffold0442 (1 HSPs)
scaffold0442 (663-714)||(6-57)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (628-686)||(37205-37263)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 666; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 666; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 13192083 - 13191314
Alignment:
Q  8 gttgcttgggtgagttgcttgaggaaagctcggagcttcctcgctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtctt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13192083 gttgcttgggtgagttgcttgaggaaagctcggagcttcctcgctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtctt 13191984  T
Q  108 atgactagttgttgagatgagattttatacttggtgatgtattataatttgagacatggttaattcgagatgttctactgattgtattggtgacgatatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13191983 atgactagttgttgagatgagattttatacttggtgatgtattatgatttgagacatggttaattcgagatgttctactgattgtattggtgatgatatt 13191884  T
Q  208 tttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattag 307  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191883 tttattccggtgcgatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattag 13191784  T
Q  308 cataatttatcgcttttagaatttagggtgttactgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13191783 cataatttatcgcttttagaatttagggtgttactgtaatgcctccgcttggtgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggcgagtagtccggctc 13191684  T
Q  408 ttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaat 507  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191683 ttggtatgcttcgaggaaaaactaaatcacatcggaatgagagggatcctaagactatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaat 13191584  T
Q  508 tgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggg 607  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13191583 tgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcgttccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgag 13191484  T
Q  608 atgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctga 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13191483 atgggtgaccaaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaatacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttga 13191384  T
Q  708 aagcagtctgcggtgttacagttacactcaccacccgtcccaccaccatccatcacaacctccgaactcc 777  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191383 aagcagtctggggtgttacagttacactcaccaccggtcccaccaccatccatcacaacctccgaactcc 13191314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 342 - 732
Target Start/End: Original strand, 13492699 - 13493090
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||    
T  13492699 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatcg 13492798  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13492799 gaatgagaaggatcctgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 13492898  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||    
T  13492899 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttagagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttacccggtaagcg 13492998  T
Q  642 tgcgagtgagga-taaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagttac 732  Q
    ||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13492999 tgcgagtgaggacaaaaacatgctgaaaagactcgtgttgatttgtagggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctggggtgttacacttac 13493090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 342 - 717
Target Start/End: Original strand, 9351973 - 9352347
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  9351973 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaacataatcacatcg 9352071  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
     |  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9352072 aaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaagggagacttataatatttgtttggtactacctatataaacaagatgcatct 9352171  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||    
T  9352172 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctacctggaagtttctcggtaagcg 9352271  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9352272 tgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 9352347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 424 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 17027685 - 17027382
Alignment:
Q  424 caaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgccta 523  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17027685 caaaactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 17027586  T
Q  524 tatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgg 623  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17027585 tatcaacaagattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgg 17027486  T
Q  624 gaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgt 723  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17027485 gaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgt 17027386  T
Q  724 taca 727  Q
    ||||    
T  17027385 taca 17027382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 20850321 - 20850616
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| || | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20850321 aatcacaccggaatgagagggttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttttgtactacctatatcaaca 20850420  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20850421 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20850520  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20850521 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatggggtgttaca 20850616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 367 - 727
Target Start/End: Original strand, 7911813 - 7912173
Alignment:
Q  367 gtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatg 466  Q
    ||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||   ||||  ||    
T  7911813 gtaacacccgaggctgatgagagcggggagtggtccgactcctggcatgtttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtg 7911912  T
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7911913 caggtataggactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataag 7912012  T
Q  567 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctga 666  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  7912013 aactccacagttatgcttgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagattctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctga 7912112  T
Q  667 aaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7912113 aaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 7912173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 357 - 717
Target Start/End: Original strand, 7912235 - 7912595
Alignment:
Q  357 tggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcc 456  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||     
T  7912235 tggtgggcatgtaacgcccgacgcagatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcggaatgagagggatct 7912334  T
Q  457 taaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctc 556  Q
      ||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7912335 cgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaaacttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctc 7912434  T
Q  557 gttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataa 656  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||   ||||||| |||||||||| ||    
T  7912435 attccataagaactccatagttaaacgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctgctgggaagtttcccgttaagcgtacgagtgaggacaa 7912534  T
Q  657 aatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  7912535 aacacgctgaaaagactcatgttggtttgtggggttagtcggcaatcctgaaagcaatctg 7912595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 339 - 632
Target Start/End: Original strand, 16519876 - 16520168
Alignment:
Q  339 tactgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcaca 438  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||||    
T  16519876 tactgtaacgcctccacttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaacagaatcaca 16519974  T
Q  439 ccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgca 538  Q
     ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16519975 tcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaaggaaggcttatgagatttgtttggtactacctatatcaacaagatgca 16520074  T
Q  539 tcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcc 632  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  16520075 tcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgacctgccgggaagtttcc 16520168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20896834 - 20896538
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20896834 aatcacatcggaatgagagggatccttaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20896735  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20896734 agatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacggttaagcgtgcttggcttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttc 20896635  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgagga-taaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20896634 ccggtaagtgtgcgagtgaggagaaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccggcaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 20896538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 341 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 17731350 - 17730980
Alignment:
Q  341 ctgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacacc 440  Q
    |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||| | ||||||| |    
T  17731350 ctgtaacgtccctgcttggtgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaattgaatcacatc 17731251  T
Q  441 ggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca----agatg 536  Q
    |||  |||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||    
T  17731250 ggaatgagagggatcctgaggccgttcaggtatgggactgcatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatagatg 17731151  T
Q  537 catcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagt 636  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||    ||    
T  17731150 catcttcttttcggtagctcattctttaagaactccacatttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagataggtgacctaccggaaagtttatcggt 17731051  T
Q  637 aagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctga 707  Q
    |||||||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  17731050 aagcgtgcaagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatcctga 17730980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 427 - 727
Target Start/End: Original strand, 23776436 - 23776735
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| |||||| |||||  |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  23776436 aactgaatcacgccggaatgagaggtatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaatcgtctggtactacctatat 23776535  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23776536 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaacttcaca-ttaagcgtacttgacttggagcaattttgggatggatgacctactgggaa 23776634  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttac 726  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23776635 gtttcctagtaaacgtgcgagtgacgacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtggagtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttac 23776734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 493 - 727
Target Start/End: Original strand, 13492393 - 13492628
Alignment:
Q  493 aaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 592  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13492393 aaggcttataagaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 13492492  T
Q  593 tggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgagg-ataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggct 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13492493 tggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcgtgcgagtgaggaaaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggt 13492592  T
Q  692 cagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  13492593 cagtcggcaatcttgaaagcagtctagggtgttaca 13492628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 432 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 2681362 - 2681070
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2681362 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtttgggactgcatggttgaatgaagacttataagaattgtttggtactacccatatcaaca 2681263  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||     || ||||||||||    
T  2681262 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacaattaagcgtgcttaatttggaacaattttgggatgggt----tactgggaagtttc 2681167  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacag 728  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  2681166 ctagtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgttgagaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagctgtctgggatgttacag 2681070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 432 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 23986463 - 23986167
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23986463 aatcacatcggaatgagagggatccggaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctatatgaaca 23986364  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  23986363 agatgcatcttcttttcggtagctcaaaccataagaacttcacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgggaagtttc 23986264  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacag 728  Q
       | ||||||||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  23986263 acggaaagcgtgcgagtgaggagaagacacgctgaaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaagcagtatgggatgttacag 23986167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 432 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 20126328 - 20126074
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  20126328 aatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaatggtttgatactacctatatcaaca 20126229  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | | || | ||||| |||| |||  ||||||||    
T  20126228 agatgcatcttctttttggtagcacattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttgaatgggcgacctacctagaagtttc 20126129  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20126128 ccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgt 20126074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 531 - 727
Target Start/End: Original strand, 28780209 - 28780405
Alignment:
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28780209 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 28780308  T
Q  631 cctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  28780309 tctggtaagtgtgcgagtgaggataaaacattttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 28780405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 427 - 727
Target Start/End: Original strand, 21311966 - 21312266
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||||| ||  ||||||| || | ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21311966 aactgaatcacaccagaatgagagggttcatgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatat 21312065  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||  |||| |||||| ||||||||    
T  21312066 caacaagatgcatcttctttttggtagcccatttcataagaaatccatagttaaacgtgcttgacttggagcagtcttatgatgagtgacctaccgggaa 21312165  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttac 726  Q
    ||||||  ||||| |||  ||||| || |||| ||  |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| || ||||  ||||| | ||||||    
T  21312166 gtttcccggtaagtgtgtaagtgaagacaaaacacattgaaaagactggtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttac 21312265  T
Q  727 a 727  Q
    |    
T  21312266 a 21312266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 432 - 702
Target Start/End: Original strand, 17850918 - 17851188
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||   || | |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  17850918 aatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaatgctgataagatatgtttggtactacctttatcaaca 17851017  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| |||| || ||||||||||    
T  17851018 agatgcatcttctttctggtagcccattctataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttcggatgggagacctactgggaagtttc 17851117  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||| |    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  17851118 ctagtacgcgtgcgagttaggacaaaacaagtcgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcaatcggcaat 17851188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 431 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 2720711 - 2720439
Alignment:
Q  431 aaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaac 530  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| ||||   || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2720711 aaatcataccggaatgagagggatcccaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaac 2720612  T
Q  531 aagatgcatcttcttttt-ggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtt 629  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |||||||||||  |  ||||||||    
T  2720611 aagacacatctttttttttggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacatattgggaagtt 2720512  T
Q  630 tcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||   |||||||||||||||| | |||| || |||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||    
T  2720511 tcccgataagcgtgcgagtgagaacaaaacacgctgagaagactcgtgtcggtttgcagggtcagtcggcaat 2720439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 468 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 2890949 - 2890715
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  2890949 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttataagaattgttagggactacctatatcaaaaagatgcttcttcttttcagtagcccattccataaga 2890850  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | |  | |||||||||||| || | |||||||||   |||||||||||||||||| |||| || || ||    
T  2890849 actccacagttaagcgtgcttgacttgaaatagtactaggatgggtgacctactgagaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaa 2890750  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  2890749 aagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 2890715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 451 - 705
Target Start/End: Original strand, 11062304 - 11062558
Alignment:
Q  451 ggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttgg 550  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062304 ggatcctgaggctgtgtaggtatgaaactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgttttgtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttgg 11062403  T
Q  551 tagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtga 650  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| | ||| ||||||||   ||| |  | ||||||    
T  11062404 tagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcggaaagtttcccgataaacccgtgagtga 11062503  T
Q  651 ggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcct 705  Q
    ||| |||| || ||||||| | | |||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  11062504 ggacaaaacacgctgaaaaaatttgtgttgatttatagagtcagtcggcaatcct 11062558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 470 - 727
Target Start/End: Original strand, 21311553 - 21311810
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21311553 gtatgggactgcatggttgaaggaagccttataagaattgtttggtattacctagataaacaagatccatcttctttttggaagctcattccataagaac 21311652  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaa 669  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||  ||||||||||| ||||||| |||| |  ||||| |||||||||| || |||| || ||| ||     
T  21311653 tccgcagttaagcgtgcttgactttgagtagtcttatgatgggtgacctaccgggatgttttccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgtaag 21311752  T
Q  670 gactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||| |||| || ||||  ||||| | |||||||    
T  21311753 gactcgtgttggtttgtagggtcaatcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 21311810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 432 - 580
Target Start/End: Original strand, 3652486 - 3652634
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  3652486 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtctgatactacctatatcaaca 3652585  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3652586 agatgcatcttctttttggtagttcattccataagaactccacagttaa 3652634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 472 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 9440963 - 9440708
Alignment:
Q  472 atgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactc 571  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||  ||||| |   |||||||||||     
T  9440963 atggaactacatggttgaaggaatgcttataagaattctttggtactacttttatcaacaagatgcattttcttttcagtagcccaaaccataagaactt 9440864  T
Q  572 cacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaaga 671  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    ||  |||| ||||| || ||||||| ||||||| |    
T  9440863 cacagttaagtgtgtttgactttgagcaattttgggatgggtgaccttcttggaagtttcccgaaaaatgtgcaagtgatgacaaaatacgctgaaaaaa 9440764  T
Q  672 ctcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  9440763 ctcgtgctggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 9440708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 447 - 617
Target Start/End: Original strand, 15929597 - 15929767
Alignment:
Q  447 agagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttcttt 546  Q
    |||| |||||||| ||  |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15929597 agagagatcctaatgccttgtatgtattggactacatggttgaatgaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaacaaaatgcatcttcttt 15929696  T
Q  547 ttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||    
T  15929697 tcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttaacatgaagcaattttgggatgggtgacc 15929767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 432 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6331058 - 6330897
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6331058 aatcacatcggaatgagatggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 6330959  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgactt 593  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6330958 atatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgactt 6330897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 468 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 9440419 - 9440160
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  9440419 aggtatggaactgcatggttgaatgaaagcttataagaattgttcggtactacttatatcaacaagatgcattttcttttcggtagctcactccataaga 9440320  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||  |  || |||| || ||| || ||||||  || ||    
T  9440319 acttcacagttaagtgtgcttgatttggagcaatttttggatgggtgaccttatgggaagtttctaaaaaaacgtgtgaatgatgacaaaatatactaaa 9440220  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||  | |||| ||| || |||||||||    
T  9440219 aaaactcgtgttgatttgtgggatcagtcgacaattttaaaagtagtttggggtgttaca 9440160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 432 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 14771865 - 14771611
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||| |||||  |||||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14771865 aatcacgccggaatgagagggatcccgaagccgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 14771766  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||| ||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | | || ||||| |||||| ||  ||||||||     
T  14771765 agatccatattctttttggtaatctattccataagaactccacagttaagtgtgctagacgtggagtagtctttggatgagtgacctactcggaagttta 14771666  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    | ||||| ||| |||| ||||| |||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  14771665 ccagtaaacgtacgagcgaggacaaaacacgctgataagactcatgttggtttgt 14771611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 432 - 615
Target Start/End: Original strand, 17851374 - 17851557
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  ||||  || | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  17851374 aatcacaccggaatgagagggatcccgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaaggcttataagatatgtttggtactacctttatcaaca 17851473  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtga 615  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||    
T  17851474 agatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttcggatgggtga 17851557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 572
Target Start/End: Original strand, 27334156 - 27334301
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||   || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27334156 aactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 27334255  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactcc 572  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27334256 caacaagatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27334301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 427 - 572
Target Start/End: Original strand, 27394896 - 27395041
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||   || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27394896 aactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 27394995  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactcc 572  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27394996 caacaagatgaatcttcttttcggtagctcattccataagaactcc 27395041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 206 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10971029 - 10970894
Alignment:
Q  206 tttttattccagtgcaatgtttt-gagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcat 304  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10971029 tttttattccactgcgatgtttttgagaaaatttttatttatgcatgtttggtgatttattgaagaagtaacatctaaattcttgatatgt-cgtatcat 10970931  T
Q  305 tagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10970930 tagcataatctatcgcttttagagtttagggtgttac 10970894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 446 - 714
Target Start/End: Original strand, 20735709 - 20735977
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||| | || || |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20735709 gagagggatcttgagactgtgtaggtatgtgactacatgattgtaggaaggcttataagaattgtttgatactacttatatcaacaagatgcatcttctt 20735808  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    || |||||  | ||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |   || |||||||| |||  |  ||||||||||  | |||| |||     
T  20735809 ttcggtagtccattctataaaaactccatagttaagtgtggttggcttggagtagcctttggatgggtaaccttcaaggaagtttccaggaaagcatgca 20735908  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    | |||||| |||| || || |||||||| | || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  20735909 attgaggacaaaacacgctaaaaagacttgcgtcggtttgtggggtcagttgacaatcctgaaagcagt 20735977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 33775112 - 33774922
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaaga--tgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  33775112 gtatgtgaccgcatggttgaaggaaggattataagaattgtctggtgctacctatatcaacaagagatgcatcttctttttgatagtccattccataaga 33775013  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaa 658  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || | | || |||||||||||| || | |||||||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  33775012 actccacagttaagtgtgtttgacttgcagtagtctttggatgggtgacctactgagaagtttttcggtaagcgtgcgagtgaggaaaaaa 33774922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 432 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 31821838 - 31821704
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  31821838 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattatttggtactaactatatcaaca 31821739  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31821738 agatgcatcttttttttggtagctcattccataag 31821704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 468 - 712
Target Start/End: Original strand, 20732614 - 20732857
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | ||| |||| |    
T  20732614 aggtatgtgactacatggttgtaggaaggcttataagaattatttggtactacctatattaataatatgcatattcttttcggtagcccattcaataaaa 20732713  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||| | | ||    ||||||||     | |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  20732714 actctacggttaagagtgcttgacttggagtagtcttttattgggtgacattgtgagaagtttcctagaaagcttgcgagtgaggaaaaaacacactgaa 20732813  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagca 712  Q
    |||  | ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  20732814 aag-tttgtgttggtttgtggggtcattcagcaatcctgaaagca 20732857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Original strand, 19992309 - 19992426
Alignment:
Q  222 atgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgct 321  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  19992309 atgttttgagaaaattgttatttacgcatgcttgatgttttattgaagaagtaacatctaaattcttgatatg-ccgtatcattagtgtaatttatcgct 19992407  T
Q  322 tttagaatttagggtgtta 340  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  19992408 tttagagtttagggtgtta 19992426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 446 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 28065970 - 28065800
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatc---tt 542  Q
    ||||||||||||||||   |||||  ||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||   ||    
T  28065970 gagagggatcctaaggtcgtgtagaaatgagactgtatgattgaatgaaagcttataagaattgtttggtactatctctatcaacaagatgcatcttttt 28065871  T
Q  543 ctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggt 613  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28065870 ttttttggtagcttattccataagaactccacaattaagcatgtttgactttgagcagttttgtgatgggt 28065800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 531 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 2891340 - 2891170
Alignment:
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| | | || |||||||||||| ||   || ||||    
T  2891340 aagatgcatctttgttttggtagcccattccataaaaactccacagttaaatgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgacctactacgatgttt 2891241  T
Q  631 cctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2891240 ccg-gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaat 2891170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 222 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12974621 - 12974503
Alignment:
Q  222 atgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgct 321  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   || |||||||||    
T  12974621 atgtttcgagaaaaatcttatttatgcatgcttggtgatttattgaagaagtaacatctagattcttgatatgctcgtatcattaatgtagtttatcgct 12974522  T
Q  322 tttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  12974521 tttag-agttagggtgttac 12974503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 468 - 604
Target Start/End: Original strand, 32292921 - 32293055
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||| ||| | | ||  ||||||    
T  32292921 aggtatgagactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaaaatacatcttgtttttagtaacacatt--ataaga 32293018  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 604  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  32293019 actccatagttaagcgaacttgactttgagcaatttt 32293055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 468 - 696
Target Start/End: Original strand, 1991589 - 1991817
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  1991589 aggtatgagactacatggttggaagaaggcttacaagaattgtttggtattacatatctaaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataaga 1991688  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    ||| ||||||||| | |  |||| |||||| | |||| ||||||||||||  | |  |||||| |    |||| || |||||| || ||| ||| |||||    
T  1991689 acttcacagttaaacattattgatttggagtagtttttggatgggtgaccttctgaaaagttttccgaaaagcatgtgagtgaagacaaagtacgctgaa 1991788  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtc 696  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  1991789 aaaactcgtgttgatttgtgggatcagtc 1991817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 567 - 695
Target Start/End: Original strand, 3652658 - 3652786
Alignment:
Q  567 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctga 666  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| |  ||||    
T  3652658 aactccacagttaagcttgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagcttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaaaagctga 3652757  T
Q  667 aaagactcgtgttggtttgtgggctcagt 695  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  3652758 aaagactcttgttggtttgtagggtcagt 3652786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 467 - 571
Target Start/End: Original strand, 15929234 - 15929338
Alignment:
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
    |||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  15929234 taggtatgagactacaaggttgaagaaaagcttataagaattgtttggtaatgcctatatcaataagatgcatattcttttcggtagctcattccataag 15929333  T
Q  567 aactc 571  Q
    |||||    
T  15929334 aactc 15929338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 477 - 698
Target Start/End: Original strand, 12194374 - 12194593
Alignment:
Q  477 actgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacag 576  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| | || ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||    
T  12194374 actgcatgattgaagaaagacttataa-atttttttggcactatctatatcaacaagatgcatcttcttttttataattcattccataagaactccacag 12194472  T
Q  577 ttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgt 676  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||     | |||||| | || || |||| ||||  ||| |||| || |||||||||||| |    
T  12194473 ttaagcatgtttgacatggagcaattttaggatggatgaccttttagaaagttttccagaaaacgtgtgagtttggacaaaacacactgaaaagactcat 12194572  T
Q  677 gttggtttgtgggctcagtcgg 698  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  12194573 gttggttt-tggggtcagtcgg 12194593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 477 - 617
Target Start/End: Original strand, 17205384 - 17205523
Alignment:
Q  477 actgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacag 576  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||  |    
T  17205384 actgcatgattgaatgaagaattataagaattgtttggtactacctttaccaacaagattcatcttgtttt-ggtagcccattccataagaactccattg 17205482  T
Q  577 ttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    |||| | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  17205483 ttaaacatgcttgatttggagtaattttgggatgggagacc 17205523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 482 - 717
Target Start/End: Original strand, 28583013 - 28583249
Alignment:
Q  482 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaag 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  28583013 atggttgaatgaaggcttataagaattatttgatacgatctatatcaacaagatgcatcatctttccggtagttcattccataagaaatccacagctaag 28583112  T
Q  582 cgtgcttgacttgg-agcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttg 680  Q
     || |||||| ||| |  | | || | ||| || ||   | || |||||||| || ||||||| ||||| ||| |||| |  |||||||||||| ||||     
T  28583113 tgtccttgacatggaattagtctttgtatgagttactttctggaaagtttcccagaaagcgtgtgagtggggacaaaacatactgaaaagactcatgtta 28583212  T
Q  681 gtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  28583213 gtttgtggggtcagtcggcaatctcgaaagcagtctg 28583249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 471 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 3885194 - 3885052
Alignment:
Q  471 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaact 570  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||| || ||||||   ||||||||||  |||||||||||||    
T  3885194 tatgagactgcatagttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacatatactaacaaaatacatctt---tttggtagcttattccataagaact 3885098  T
Q  571 ccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 616  Q
     || |||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3885097 tcaaagttgaacgtgcttgacttggagcaattttgagataggtgac 3885052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 9440620 - 9440488
Alignment:
Q  385 gagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatg 484  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||| | |   || |||||||||||| ||||    
T  9440620 gagggtggggagtggtccggctctttgca-gcttctagggaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgggacttcatg 9440522  T
Q  485 gttgaaggaaggcttataagaattgtttggtact 518  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9440521 gttgaatgaaggcttataagaattgtttggtact 9440488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 446 - 504
Target Start/End: Original strand, 3652993 - 3653051
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataag 504  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3652993 gagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactgcatggttgaacgaaggcttataag 3653051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 637 - 727
Target Start/End: Original strand, 15929344 - 15929434
Alignment:
Q  637 aagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  15929344 aagcgtgtgagtgaggacaaaatacgctaaaaagacttgtgttgatttgtggggtcactcggcaatccttaaagcagtctgggatgttaca 15929434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10972509 - 10972445
Alignment:
Q  50 gctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtcttatgacta 114  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10972509 gctttttcgaagtctagtttgtcggctctaattaggacgtctttatgtttggagtcttatgacta 10972445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 470 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 30729947 - 30729807
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||  |||||||||| |||||    ||| ||||||||    
T  30729947 gtatgagacagcatggttgaaggaggactcataaaaattgtttggtactacgtatataaacatgattgatcttcttttgggtagtcaattctataagaac 30729848  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatg 610  Q
    |  | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  30729847 tttatagttaagcgttcttgaatttgagcaattttgggatg 30729807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 490
Target Start/End: Original strand, 13490056 - 13490179
Alignment:
Q  367 gtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatg 466  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||| ||||||| || |  ||||| |||| | ||||| ||    
T  13490056 gtaacgcccgaggctgatgaaggcggggagtggtccggctcctgacatgcttctaggaaaaacttaatcacatcgaaatgagagagatcatgaggctgtg 13490155  T
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaa 490  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
T  13490156 caggtataggactgcatggttgaa 13490179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 667 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 6331279 - 6331219
Alignment:
Q  667 aaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6331279 aaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctgagatgttaca 6331219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 702
Target Start/End: Original strand, 3653048 - 3653168
Alignment:
Q  578 taagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtg 677  Q
    |||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| | || |||||||||   |||||||||    ||||| |||| || ||||||||||||||     
T  3653048 taagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcgagaagtttcccgataagcgtgc----gaggacaaaacacgctgaaaagactcgta 3653143  T
Q  678 ttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||    
T  3653144 ttggtttgtagggtcaatcggcaat 3653168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 575
Target Start/End: Original strand, 10964340 - 10964447
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||| || ||  || |||||||||||||||   ||||||| |    
T  10964340 aggtatgagactgtatggtagaagaaagacttacaagaattgtttggtactacatatatcaataaaataaatattctttttggtagcttaatccataaaa 10964439  T
Q  568 actccaca 575  Q
    ||||||||    
T  10964440 actccaca 10964447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 294
Target Start/End: Original strand, 5489214 - 5489283
Alignment:
Q  222 atgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatg 294  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5489214 atgttttgagaaaa---ttatttatgcatgttttgtgatttattggtgaagtagcatctagattcttaatatg 5489283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 614
Target Start/End: Original strand, 33470882 - 33471019
Alignment:
Q  476 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccaca 575  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||  |||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||| ||||||    
T  33470882 gacttcatggttaaaggaagacttattaga-ttacttggtattacctatactaacaagatgcatattcttttttgtagttcattacataagaattccaca 33470980  T
Q  576 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtg 614  Q
    |||| ||||| ||||||| ||    ||||||||||||||    
T  33470981 gttatgcgtgtttgactttgaaattttttgggatgggtg 33471019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 120
Target Start/End: Original strand, 19992115 - 19992183
Alignment:
Q  52 tttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtcttatgactagttgtt 120  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19992115 ttttttggagtctattgtgtcagctctgattaggacgtctatatgttttgagtcttatgactatttgtt 19992183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 34660585 - 34660469
Alignment:
Q  501 taagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaa 600  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||    |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  34660585 taagagttgtttggtattatctatatcgacaatatgcatcttccttctggtagctcaaatcatacgaactccatagttaagcatacttgacttgaagcaa 34660486  T
Q  601 ttttgggatgggtgacc 617  Q
     |||  |||||||||||    
T  34660485 gttttagatgggtgacc 34660469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 644 - 703
Target Start/End: Original strand, 27334305 - 27334364
Alignment:
Q  644 cgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatc 703  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27334305 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatc 27334364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 644 - 703
Target Start/End: Original strand, 27395045 - 27395104
Alignment:
Q  644 cgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatc 703  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27395045 cgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatc 27395104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 559 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 31416107 - 31415965
Alignment:
Q  559 tccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaa 658  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||  || |    || |||||||     || |||| ||||||||| ||||    
T  31416107 tccataagaactccacaattaagcgtgtttgacttagattagttttgggatggacgatcttatggaaagtttctcgaaaaacgtgtgagtgaggacaaaa 31416008  T
Q  659 tactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31416007 cacgctgaaaaga-tcgtgttggtttgtgggatcagtcggcaat 31415965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 635 - 705
Target Start/End: Original strand, 11062032 - 11062102
Alignment:
Q  635 gtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcct 705  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || |||| |||||||||||||||| || | |||||| ||||||    
T  11062032 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaaaactcgtgttggtttgtagggttagtcggtaatcct 11062102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 517
Target Start/End: Original strand, 9441064 - 9441135
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtac 517  Q
    |||||| ||||||| ||  || || |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9441064 gagaggaatcctaaagccgtgcagatatgtgactacatgattgaaggaaagcttataagaattgtttggtac 9441135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 25147446 - 25147830
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25147446 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacactcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcg 25147545  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25147546 gaatgagagagatcctaagactgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcatct 25147645  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  25147646 tcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaatcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcctgataagcg 25147745  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25147746 tgcgagtgagtacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg-tcagtcggcaatcctgaaagcagtcttgggtgttaca 25147830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 34308715 - 34308330
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  34308715 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgataagggcggggagtggtccggctcctggcgtgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 34308616  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  || ||||||||| ||||  |  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34308615 gaatgaaagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 34308516  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||     
T  34308515 tcttttcggtagcctattccataagaactccacacttaagcgtgcttggcttggagcaattttgagatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagca 34308416  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    || ||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34308415 tgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgctggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34308330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 34309175 - 34308786
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  34309175 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 34309076  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat----caacaagatgc 537  Q
    ||  |||||||||||| ||||  |  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    |||||||||||    
T  34309075 gaatgagagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatatatatcaacaagatgc 34308976  T
Q  538 atcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagta 637  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  34308975 atcttcttttcggtagcctattccataagaactccacagttaagcgtgcttggcttggagcaattttgagatgggtgacctaccgggaagtttcccggta 34308876  T
Q  638 agcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34308875 agcatgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34308786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 22548695 - 22548400
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22548695 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagttttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 22548596  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22548595 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 22548496  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  22548495 ccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 22548400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 22549141 - 22548846
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22549141 aatcacaccggaatgagaggcttcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 22549042  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22549041 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 22548942  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  22548941 ccagtaagcgtgcgagtgaggataaaacacgctgaacagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 22548846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 12827400 - 12827105
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12827400 aatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 12827301  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12827300 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 12827201  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12827200 ccggtaagtgtgcgagtgaggttaaaacacttttaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 12827105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 22026379 - 22026675
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| || | ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22026379 aatcacaccggaatgagagggttcgtgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 22026478  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  22026479 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatattgggatgggtaacctatcgggaagtttc 22026578  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgagga-taaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22026579 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 22026675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 341 - 710
Target Start/End: Original strand, 12100601 - 12100968
Alignment:
Q  341 ctgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacacc 440  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |    
T  12100601 ctgtaacgcctccgctcggtgtgcatgtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatc 12100700  T
Q  441 ggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatc 540  Q
    | |  |||| | ||||| ||||  |  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12100701 gaaatgagaag-atcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggcaagcttataagatttgtttggtactacctatatcaataagatgcatc 12100799  T
Q  541 ttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagc 640  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12100800 ttcttttcggtagctcatttcataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt-ggatgggtgacctaccgggaagtttcctcgtaagc 12100898  T
Q  641 gtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  12100899 gtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaag 12100968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 357 - 727
Target Start/End: Original strand, 25147892 - 25148261
Alignment:
Q  357 tggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcc 456  Q
    ||||||||| |||||||  |||  |||||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||   ||  |||||||||||    
T  25147892 tggtgggcatgtaacgctcgagtatgatgagggcggggagtggtttggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacataagaatgagagggatcc 25147991  T
Q  457 taaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctc 556  Q
      |||   ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25147992 cgaggtcgtgtaggtatgggactgtgtcgttgaaggaaggcttataagaattgtttggtcttacctatatcaacaagatgcatattcttttcggtagctc 25148091  T
Q  557 gttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataa 656  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||  ||    
T  25148092 attccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttccga-taaacgtgcgagtgaggtcaa 25148190  T
Q  657 aatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || | |||||||    
T  25148191 aacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtatgagatgttaca 25148261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 468 - 727
Target Start/End: Original strand, 17103117 - 17103377
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17103117 aggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagctgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 17103216  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggg-tgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctga 666  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  17103217 actccacggttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggttgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctga 17103316  T
Q  667 aaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||| | |||||||    
T  17103317 aaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 17103377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 27022484 - 27022190
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27022484 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 27022385  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    | ||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||     
T  27022384 acatgcatcttattttcggcagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactggaaagttt- 27022286  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
     | ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  27022285 ttggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 27022190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 468 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 41659215 - 41658972
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  41659215 aggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcgatagctcattacataaga 41659116  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  41659115 actccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccgggaagtttccctgtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 41659016  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagc 711  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41659015 aagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagc 41658972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 21316345 - 21315961
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| | || || ||| |||| | ||||||| ||    
T  21316345 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggcttctggcaagcatctaggaaaaattgaatcacatcg 21316246  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
        |||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  21316245 cgatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaatgagcgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcg 21316146  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    ||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||  |||||||    
T  21316145 tcttttcagtagctcatttcataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagtaattttggtaagggtgacctaccgcgaagtttcc-ggtaagcg 21316047  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21316046 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 21315961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 435 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 10844758 - 10844466
Alignment:
Q  435 cacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaaga 534  Q
    |||||||||  ||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10844758 cacaccggaatgagagggttcctgaggccttgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatattaacaaga 10844659  T
Q  535 tgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttccta 634  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  10844658 tgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcg 10844559  T
Q  635 gtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| ||||  ||||| | |||||||    
T  10844558 gtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtttgtttgtagggtcagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 10844466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 27925899 - 27926193
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27925899 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaaca 27925998  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  27925999 agatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaa-tttgggatgggtgaggtaccgggaagtttc 27926097  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||| ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||  ||||| | |||||||    
T  27926098 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 27926193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 432 - 696
Target Start/End: Original strand, 2044058 - 2044322
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2044058 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaaca 2044157  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| |  |||||||||     
T  2044158 agatgcattttctttttggtagcccattccataataactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaatgggaagtttt 2044257  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtc 696  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  2044258 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtattggtttgtagggtcagtc 2044322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 32292397 - 32292699
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32292397 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 32292496  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    || ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||| | ||||||||||||     
T  32292497 agttgcatcttctttttgctagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgatctaccgggaagtttt 32292596  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttgg-------tttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgtt 724  Q
    |  ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||       ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  32292597 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtactttgtagggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctgggatgtt 32292696  T
Q  725 aca 727  Q
    |||    
T  32292697 aca 32292699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 342 - 617
Target Start/End: Original strand, 25144682 - 25144957
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||| || ||||||||| |||| ||||||   ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |     
T  25144682 tgtaacacccccgcttggtaggcatgtaacgttcgaggctgatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatca 25144781  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||| ||||   |||   || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25144782 gaatgagagagatctcgaggtcgtgcaggtatgggattgcatgattgaaggcaggcttataagaattgtttggtactacctatatcagcaagatgcatct 25144881  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144882 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 25144957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 427 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 8080493 - 8080234
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||| ||||  |||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8080493 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagctgataagaattgtttggtactacctatat 8080394  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| ||| ||  ||||    
T  8080393 caacaagatgcattttctttttggtagcccattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtaacctactaggaa 8080294  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8080293 gtttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 8080234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 510 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 31283719 - 31283503
Alignment:
Q  510 tttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggat 609  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31283719 tttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagtgtgcttgactttgagcaatttt-ggat 31283621  T
Q  610 gggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaa 709  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||    
T  31283620 gggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacgcgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgttgaaa 31283521  T
Q  710 gcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||| | |||||||    
T  31283520 gtcgtctgggatgttaca 31283503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 432 - 592
Target Start/End: Original strand, 10844883 - 10845043
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10844883 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 10844982  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 592  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844983 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 10845043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 432 - 717
Target Start/End: Original strand, 28453338 - 28453623
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||   || ||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  28453338 aatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcaggtatgagacttcatggttgaaagaaaacttataagaattgttttatactacctatattaaca 28453437  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||  |||||||||    
T  28453438 agatgcatcttctttatggtagcccattccataagaactctacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctactcggaagtttc 28453537  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    ||| ||||  |||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28453538 ctaataagactgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagagtcgtgtttgtttgtaagatcagtcgacaatcctaaaagcagtctg 28453623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 465 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 6465023 - 6464872
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6465023 tgtaggtatggaactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctttttggtagctcattccata 6464924  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 616  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||    
T  6464923 acaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgac 6464872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 427 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 33852409 - 33852150
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||||||||  || |  || ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33852409 aactgaatcacaccagaatgagagggatcccgagaccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatat 33852310  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| | ||| ||    
T  33852309 taacaagatgtatcttctttttggtagcccattccataagaacttcacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcggaaa 33852210  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||| |||||    
T  33852209 gtttcatgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagactcatgttgatttgt 33852150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 459 - 702
Target Start/End: Original strand, 41912997 - 41913240
Alignment:
Q  459 aggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgt 558  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  41912997 aggccatgcaggtatgggactgcatgtttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcgtcttctttttggtagcccat 41913096  T
Q  559 tccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaa 658  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | || ||||| |||||| ||  | ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||    
T  41913097 tccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttggatgagtgacctactagaaagtttcttggtaagcgtgcaagtgaggacaaaa 41913196  T
Q  659 tactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
     ||  |||||| ||||||||| |||| | || ||||||| ||||    
T  41913197 cacgttgaaaaaactcgtgttagtttatagggtcagtcgacaat 41913240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 342 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 27819481 - 27819110
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||  |||||||||  |  ||||||||| ||| ||| | ||||  |||||||||  ||||||| |     
T  27819481 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaaggctcgaggttgatgagggtaggaagtggtccgactcctggaa-gcttttaggcaaaaccgaatcacatca 27819383  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||| | | |  ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27819382 gaatgagagggatcatgaagtcatgcaagtatgagacttcatggttgaaggaaggctaataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatct 27819283  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    ||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  | |  |||||| | || |||||    
T  27819282 tcttttcaatagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgactttgagtagtatttggatgggtgaccttctgataagttttccagaaagcg 27819183  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtct 716  Q
    || |||||||||  ||  || |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27819182 tgtgagtgagga-caagcacactgaaaagacccgtgtt-gattgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtct 27819110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22883365 - 22883013
Alignment:
Q  16 ggtgagttgcttgaggaaagctcggagcttcctcg-------ctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtctta 108  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  22883365 ggtgagttgcttaaggaaagctgggagcttcctcgtttactgctttttcggagtctagtgtgtcgactctgattaggatgtctttctgtctggagtcttg 22883266  T
Q  109 tgactagttgttg-------------------agatgagattttatacttggtgatgtattataat-ttgagacatggttaattcgagatgttctactga 188  Q
    |||||| ||||||                   ||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||| || || |||||||| |||| |    
T  22883265 tgactaattgttgttttatgactcagttattgagatgagattttatatttggtgatatagtatgatgttgagacatggctatttagagatgttttactaa 22883166  T
Q  189 ttgtattggtgacgatatttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattctt 288  Q
        | |  | | ||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  22883165 acacagttttaatgatgtttttattccgctgcgatgttttgaggaaattattatttatgcatgtttgatgatttattggcgaagtaacatctaaattatt 22883066  T
Q  289 gatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22883065 gatatgtccgtatcattagcgtaatttatcgcttttagagtttagggtgttac 22883013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 475 - 686
Target Start/End: Original strand, 3745144 - 3745355
Alignment:
Q  475 ggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccac 574  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  3745144 ggactacatggttgaaggaaaacttataagaactgtttagtactacctataccaacaatatgcatcttctttttggtagcccattccataataactccac 3745243  T
Q  575 agttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactc 674  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||  |  ||||||| || |||  |||||| |  ||||||||||||    
T  3745244 agtcaagcgtgcttgacttagagcaattttgggatggctgaccatctgagaagtttctcaaaaagcgtgtgaatgataataaaacatgctgaaaagactc 3745343  T
Q  675 gtgttggtttgt 686  Q
     ||||| |||||    
T  3745344 atgttgatttgt 3745355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 465 - 689
Target Start/End: Original strand, 3744671 - 3744895
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  3744671 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttgacactacctataccaacaatatgcaccttctttttggtagcacatttcata 3744770  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactct 664  Q
    ||||||| ||| |||||| |  || |||| ||||||||||||||| |||||| |   | ||||||||  || ||| |||  | |||| | |||| || ||    
T  3744771 agaactctacaattaagctttattaactttgagcaattttgggattggtgactatttgagaagtttctcagaaagtgtgttaatgagaacaaaacacact 3744870  T
Q  665 gaaaagactcgtgttggtttgtggg 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3744871 gaaaagactcgtgttggtttgtggg 3744895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 446 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 28375186 - 28375042
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28375186 gagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctacatcaacaagatgcatcttctt 28375087  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttga 590  Q
    || |||||||| |||||||| | || || ||||||||||||||||    
T  28375086 ttcggtagctctttccataacagcttcatagttaagcgtgcttga 28375042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 583 - 727
Target Start/End: Original strand, 32292092 - 32292236
Alignment:
Q  583 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggt 682  Q
    ||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  32292092 gtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 32292191  T
Q  683 ttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32292192 ttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 32292236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 22840680 - 22840486
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22840680 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggctttgtaggtatgagactacatggtcgaatgaagacttataagaattgtttggtactatctatat 22840581  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccg 622  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||  | | || |||||||||||| ||||    
T  22840580 caacaagatgcatcttctttttgttagctcattccataagaactccacag-taatcatgcttgacttagattagtctttggatgggtgacctaccg 22840486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9894021 - 9893888
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatta 306  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  9894021 ttttattccgctgcgatgttttgagaaaattgttatttatgcatgcttggtgacttattgaagaagtaacatctagattcttaatatg-ccgtatcttta 9893923  T
Q  307 gcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9893922 gcgtaatttatcgcttttagagtttagggtgttac 9893888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Original strand, 18832053 - 18832186
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatta 306  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  18832053 ttttatttcactgcgatgttttgagaaaattattatttatgcatgcttggtgatttattgaagaagtgacatctagattcttgatatgctcgtatgatta 18832152  T
Q  307 gcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18832153 -cgtaatttatcgcttttagagtttagggtgttac 18832186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 481 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 15819112 - 15818892
Alignment:
Q  481 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  15819112 catggttgaaggaatgcttagaaaaattgtttggtactacatatatcaacatgatgcatcttcttttcggtagcacattccataagaact-cacagttaa 15819014  T
Q  581 gcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttg 680  Q
       |||||||||||||| |   || ||||||| ||||  | |||||||||||    ||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||||    
T  15819013 atttgcttgacttggagtaggctttggatgggcgaccttctgggaagtttcccgaaaagtgtgcgagtgaggacaaagcacactgaaaagacttgtgttg 15818914  T
Q  681 gtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  15818913 gtttgtggggccagtcggcaat 15818892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23637932 - 23637698
Alignment:
Q  106 ttatgact-agttgttgagatgagatttt-atacttggtgatgtattataatttgagacatggttaattcgagatgttctactgattgtattggtgacga 203  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || || |||||||| || | |   || | |||| |     
T  23637932 ttatgactcagttattgagatgagatttttata-ttggtgatgtattatgatttgagacatgactacttggagatgttttattaaacatagttgtgatgt 23637834  T
Q  204 tatttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatca 303  Q
    | |||| |||||  ||| |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23637833 tgttttcattccgctgcgatgttttgagaaattt-ttatttatgcattcttggtgatttattgaagaagtaacatctagattcttgatatgt-tgtatca 23637736  T
Q  304 ttagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23637735 ttagcgtgatttatcgcttttagagtttagggtgttac 23637698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 497 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 30527563 - 30527358
Alignment:
Q  497 cttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgga 596  Q
    |||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||    
T  30527563 cttataagaattgtttggtaccacttacatcaataagatacatcttcttttgggtagcccatttcataagaactccacagttaagattgtttgactttga 30527464  T
Q  597 gcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtc 696  Q
    | ||| || |||||||||| | ||| | ||  ||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  30527463 gtaatctttggatgggtgatctacctgaaaacttcccggtaagcgtgcgagtgaggataaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtaggatcagtc 30527364  T
Q  697 ggcaat 702  Q
    | ||||    
T  30527363 gacaat 30527358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 342 - 681
Target Start/End: Original strand, 22705090 - 22705424
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||  ||       |    
T  22705090 tgtaacgcctccgctcggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgaggacggggagtggtcaggctcctggca-gcttcaaggcaaaaccgaa-------g 22705181  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  22705182 gaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactggatgattgaaggaagggttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgca--- 22705278  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaat-tttg-------------ggatgggtgaccaaccgggaag 627  Q
    ||||||||||| | | |||||||        ||||||||||||||||||||||||| | | ||||             ||| |||||||| |||||||||    
T  22705279 tctttttggtaacccattccata--------acagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttgaatgagtagctttggacgggtgacctaccgggaag 22705370  T
Q  628 tttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttgg 681  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  22705371 ttttccagtaagcgtgccagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgg 22705424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 222 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24622082 - 24621963
Alignment:
Q  222 atgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgct 321  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  24622082 atgttttgagaaaacagttttttatgcatgcttggtgatttattgaagaagtaacatctagattcttgatatgattgtatcattagcgtaatttatcact 24621983  T
Q  322 tttagaatttagggtgttac 341  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  24621982 tttagagtttagggtgttac 24621963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 446 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27022011 - 27021904
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27022011 gagagggatcctgaggccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcatcttctt 27021912  T
Q  546 tttggtag 553  Q
    || |||||    
T  27021911 ttcggtag 27021904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24382183 - 24382049
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgaga-aaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatt 305  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  24382183 ttttattccgttgcgatgttttgaaagaaactattatttatgcatgcttggtgttttattgaagaagtaacatctagattcataatatg-ccgtatcatt 24382085  T
Q  306 agcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24382084 agcgtaatttatcgctttaagagtttagggtgttac 24382049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24622249 - 24622147
Alignment:
Q  225 ttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgctttt 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24622249 ttttgagaaaactgttatttatgcatgtttggtgatttattgaagaagtaacatctagattctttatatgctcgtatcattagcgtaatttatcgctttt 24622150  T
Q  325 aga 327  Q
    |||    
T  24622149 aga 24622147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 15567653 - 15567517
Alignment:
Q  481 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  15567653 catggtggaaggaaggcttataagaattgtttgacactacatataccaacaagatacatcttctttttggtagttcatttcataagaactccgcagttaa 15567554  T
Q  581 gcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
     |||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  15567553 tcgtgtttgacttggagtagttttggaatggatgacc 15567517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 469 - 702
Target Start/End: Original strand, 6466748 - 6466976
Alignment:
Q  469 ggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaa 568  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||  |||| | || ||||||||    
T  6466748 ggtatggaactgcatggttaaagga-gacttataaaaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatctt---tttcatagc-catttcataagaa 6466842  T
Q  569 ctccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaa 668  Q
    || || | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||| |||| |||| | |||||||  | |||  || || |||    
T  6466843 ctacaaatttaagtgtacttgacttggagcaattttggtatgggtgaccttcttggaagttttctagaaagcatacgagtgaaaacaaagcacactaaaa 6466942  T
Q  669 agactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6466943 aaactcatgttggtttgtggggtcagtcggcaat 6466976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 239 - 341
Target Start/End: Original strand, 23637013 - 23637114
Alignment:
Q  239 ttatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23637013 ttatttatgcatgcttggtgatttattgtagaagtaacatctagattcttgatatgt-cgtatcattagcgtgatttatcgcttgaagagtttagggtgt 23637111  T
Q  339 tac 341  Q
    |||    
T  23637112 tac 23637114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 521 - 710
Target Start/End: Original strand, 25307855 - 25308042
Alignment:
Q  521 ctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaac 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | || |||||||||||  ||    
T  25307855 ctatatcaacaagatacatctt--ttttggtagcccattctgtaagaactccacagttaagcttgcttgacttggtgtagtctttggatgggtgacgtac 25307952  T
Q  621 cgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
      | ||||||    | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  25307953 ttgaaagtttttcggcaagcgtgcgagtgaggacaaagtacgctgaaaagactcgtgttgatttatgggatcagtcggcaatcctaaaag 25308042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 468 - 617
Target Start/End: Original strand, 1297043 - 1297192
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||| |||| | | ||  ||||||    
T  1297043 aggtatgagactgcatggttgaagtaaaacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatttatattcttttcggtatcccattatataaga 1297142  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| || ||| || ||||| ||||||    
T  1297143 actccatagttaagtgtgtttgacttgaagtaatctttggatgagtgacc 1297192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 340
Target Start/End: Original strand, 17625309 - 17625440
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatta 306  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  17625309 ttttattcccttgcaatgttttgagaaag-tgttaattatgcatgtttggtgatttattgacgaagtaacatctagattcttgatatg-atgtatcatta 17625406  T
Q  307 gcataatttatcgcttttagaatttagggtgtta 340  Q
       |||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  17625407 ctgtaatttattgcttttagagtttaggatgtta 17625440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 504 - 710
Target Start/End: Original strand, 6466329 - 6466534
Alignment:
Q  504 gaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 603  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || || |||||||| ||||  |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  6466329 gaattgtttggtactacttataccaacaagttgcatcttccttttggtag-tcatttcataagaaatccattgttaggtgtgcttgacttgaagcaattt 6466427  T
Q  604 tgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatc 703  Q
    || |||  ||| ||    ||||||||||  |  |||| | |||||||||| |||  || || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||     
T  6466428 tgagataagtggccttttgggaagtttctcaaaaagcatacgagtgaggacaaagcacgctaaaaagacttgtgttggtttgtggggccagtcggcaata 6466527  T
Q  704 ctgaaag 710  Q
    |||||||    
T  6466528 ctgaaag 6466534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 341
Target Start/End: Original strand, 20503405 - 20503509
Alignment:
Q  236 ctattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttaggg 335  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||| | |||||||    
T  20503405 ctattatttatgaatgtttggtgatttattgaagatgtaacatctaaattcttgatatgt-cgtatcattaacgtaattgatcacttttaaagtttaggg 20503503  T
Q  336 tgttac 341  Q
    ||||||    
T  20503504 tgttac 20503509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 483 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 15568100 - 15567972
Alignment:
Q  483 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagc 582  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||      |  ||  |||||||||||||| ||||||    
T  15568100 tggttgaaggaagacttataacaattgtttggtatgacctatatcaacaagatgcatctttttttt----ttttttttaataagaactccacaattaagc 15568005  T
Q  583 gtgcttgacttggagcaattttgggatgggtga 615  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15568004 gtacttgactcagagcaattttgggatgggtga 15567972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 9894253 - 9894134
Alignment:
Q  8 gttgcttgggtgagttgcttgaggaaagctcggagcttcctcg------------ctttttcggagtctagtgtgttggctctga-ttaggatgtcttta 94  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  9894253 gttgctttggtgagttgcctgaggaaagctcggagcttcctcgtttactgcttttttttttcggagtctagtgtgtcggctctgatttaggacgtcttta 9894154  T
Q  95 tgtttggagtcttatgacta 114  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9894153 tgtttggagtcttatgacta 9894134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 528 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 10729736 - 10729654
Alignment:
Q  528 aacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatg 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10729736 aacaagatgcatcttctttttggtagcctattccataaggactccacaattaagggtgcttggcttgaagcaattttgggatg 10729654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 451 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 30335035 - 30334892
Alignment:
Q  451 ggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttgg 550  Q
    ||||||| || || || ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |     
T  30335035 ggatcctgagactgtgcaggtatgcgactgcaaggttgaaagaagacttataaaaattgtttgatactacctataccaacaagatacatcttcttttcga 30334936  T
Q  551 tagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttg 594  Q
    ||||||  | ||||| |||| || ||||||  ||| ||||||||    
T  30334935 tagctcaattcataataacttcatagttaaatgtgtttgacttg 30334892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31283432 - 31283367
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  31283432 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggagagtggtccggctc 31283367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 679
Target Start/End: Original strand, 10729749 - 10729870
Alignment:
Q  558 ttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaa 657  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | | ||  |||||||||||    ||||| | |||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  10729749 ttccataagaactccacaattaagcgtgatagacttggagtagtcttttgatgggtgaccttatgggaaatatcctagaaagcgtgcgagtgtggacaaa 10729848  T
Q  658 atactctgaaaagactcgtgtt 679  Q
      || |||||||||||||||||    
T  10729849 gcacgctgaaaagactcgtgtt 10729870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 471 - 543
Target Start/End: Original strand, 17429539 - 17429611
Alignment:
Q  471 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttc 543  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17429539 tatgtgactgcattgttgaaggaagacttatgagtattatttggtactacctatatcaacaagatgtatcttc 17429611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 716
Target Start/End: Original strand, 9251098 - 9251169
Alignment:
Q  645 gagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtct 716  Q
    ||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9251098 gagtgaggacaaaacacgctgaaaaaacttgtgttggtttgtggggtcaatcgacaatcctgaaagcagtct 9251169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 522 - 617
Target Start/End: Original strand, 34687920 - 34688015
Alignment:
Q  522 tatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||  |||  ||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  34687920 tataccaaaaagatgcatcttctttttggtaggttattccataagaattccatagttaaatgtgtctgacttggagcaattatggtatggatgacc 34688015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 29971528 - 29971450
Alignment:
Q  451 ggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaa 529  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  29971528 ggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttgatactatctatatcaa 29971450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 635 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 6463487 - 6463438
Alignment:
Q  635 gtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggttt 684  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6463487 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 6463438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 106
Target Start/End: Original strand, 20503127 - 20503230
Alignment:
Q  9 ttgcttgggtgagttgcttgaggaaagctcggagcttcctcgctt------tttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttgga 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||      |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||    
T  20503127 ttgctttggtgagttgcttgaggatagcttggagctacctcgtttaacgcttttcggagtccagtgtgtcggctctgattaagacatctttatgttttga 20503226  T
Q  103 gtct 106  Q
    ||||    
T  20503227 gtct 20503230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 28912962 - 28912826
Alignment:
Q  466 gtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataa 565  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| || || |  || |||| |||||||||||||| |||||| || | | ||| ||||    
T  28912962 gtaggtatgacactgcatgattgaaagaagtcatataagaattgtctgatattatctgtatcgacaagatgcatcttatttttgatatcccattctataa 28912863  T
Q  566 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatt 602  Q
     |||||||||||||||  || | ||||| ||||||||    
T  28912862 taactccacagttaagtatgttcgactttgagcaatt 28912826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 664 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 27021903 - 27021840
Alignment:
Q  664 tgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  27021903 tgaaaagactcgtgttggtttgtgaagtcagtcggcaatcctgaaaacagtatgagatgttaca 27021840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Original strand, 22602715 - 22602796
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaa-ctattatttatgcatgcttggtgattt-attgatgaagtaacatctagattct 287  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  22602715 ttttattccagtgtaatattttgagaaaatgtatta-ttatgcatgcctggtgatttaattgaagatgtaacatctagattct 22602796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 710
Target Start/End: Original strand, 29117444 - 29117514
Alignment:
Q  640 cgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  29117444 cgtgcgagtgaggacaaatcatcctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcggtcggtaatcctgaaag 29117514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 477 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 36968496 - 36968434
Alignment:
Q  477 actgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcat 539  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  36968496 actgtatggttgaaggatgacttataagaattgattggtgctacttatatcaacaagatgcat 36968434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25280144 - 25280086
Alignment:
Q  223 tgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagat 284  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  25280144 tgttttgagaaaa---ttatttatgtatgcttggtgaattattgaagaagtaatatctagat 25280086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 609
Target Start/End: Original strand, 29117362 - 29117413
Alignment:
Q  558 ttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggat 609  Q
    |||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29117362 ttccatgagaactctacacttcaacgtgcttgacttggagcaattttgggat 29117413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 584 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 28374116 - 28373999
Alignment:
Q  584 tgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtt 683  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  | | | ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||| ||| || ||| ||    
T  28374116 tgcttgacttggagcaattttgg-atgagcgaccttctgagtagttttctagaaagtgtgtgagtgaggataaaacacgctgaaaaaacttgtattgatt 28374018  T
Q  684 tgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||| | ||| ||||||||    
T  28374017 tgtgagatcaatcggcaat 28373999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 664 - 725
Target Start/End: Original strand, 17444235 - 17444296
Alignment:
Q  664 tgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgtta 725  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  17444235 tgaaaagattcgtattggtttgtggggttagtcgacaatcttgaaagcagtttgcgatgtta 17444296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 85)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 49998546 - 49998931
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||   || ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  49998546 tgtaacgcctccccttggtgggcatgtaaagctcaaggctgatgagggcggggagtggtccagctcttggcatgcttctagacaaaactaaatcacatcg 49998645  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49998646 gaatgagagggatcctaaggctgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 49998745  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  49998746 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtg 49998845  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  49998846 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggacagtcggcaattctgaaagcagtttggggtgttaca 49998931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 342 - 712
Target Start/End: Original strand, 35871538 - 35871907
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  35871538 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 35871637  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  35871638 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtaccacctatatcaacaagatgcat-t 35871736  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||| ||    
T  35871737 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctatcggaaagtttcccggtaaacg 35871836  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagca 712  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35871837 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtcggcaatcctgaaagca 35871907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 23350513 - 23350128
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  23350513 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 23350414  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||| |||| | ||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23350413 gaatgagagagatcttgaggccgtacaggtaggggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacttcctatatcaacaagatgcatct 23350314  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||   |||||||    
T  23350313 tcttttcggtagctccttccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccgagaagtttctctgtaagcg 23350214  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23350213 tgtgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaagcagtctggggtgttaca 23350128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 44471555 - 44471170
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  44471555 tgtaacacctctgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 44471456  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||| |||| | ||||  |  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44471455 gaatgagagagatcttgaggccgtacaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 44471356  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  44471355 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcg 44471256  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
     ||||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||  || || |||||||||    
T  44471255 ggcgagtgaggacaaaacatgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaattcttaaagtcgtttggggtgttaca 44471170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 24629573 - 24629281
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24629573 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 24629474  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |    
T  24629473 agatgcatcttcttttcggtacctcgttccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa---ac 24629377  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24629376 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgtgatgttaca 24629281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 50398678 - 50398383
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50398678 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtataggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 50398579  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  50398578 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaagttta 50398479  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  50398478 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacactggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 50398383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 448 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 7678746 - 7678465
Alignment:
Q  448 gagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttt 547  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7678746 gagggatcttgaggccttgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttt 7678647  T
Q  548 tggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgag 647  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  7678646 cggtagcttattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgag 7678547  T
Q  648 tgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagt 729  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  7678546 tgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgtaggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacagt 7678465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 44471099 - 44470720
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  44471099 tgtaacgcctccgcttggttg-----taacgcccgaggctaatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 44471005  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||| |||| | | ||| |  | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44471004 gaatgagagagatcatgacgctgtacaagtatgtgactgtatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 44470905  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    ||| || | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  44470904 tctgttcg-taactcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggttgacctaccgggaagtttcccggtaagcg 44470806  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| || ||||||  |||| || ||||  ||||| |||||||||    
T  44470805 tgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcaacaattcttaaagtcgtctggggtgttaca 44470720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 432 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 12692139 - 12691913
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12692139 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 12692040  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12692039 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 12691940  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaa 658  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  12691939 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaa 12691913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 367 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 14572355 - 14572012
Alignment:
Q  367 gtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatg 466  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||  |||  | ||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||    
T  14572355 gtaacgcccaaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcatctagaaaaatatgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatg 14572256  T
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||     |||||||    
T  14572255 taggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccataag 14572157  T
Q  567 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctga 666  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||   | ||||||| ||||||||| |||| ||  |||    
T  14572156 aactccaca---aagcgtgcttgacttagagcaattttgagatgggtgaccttctgggaagtttctcggaaagcgtgtgagtgaggacaaaacacggtga 14572060  T
Q  667 aaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14572059 aaagactcgtgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctgaaagcagt 14572012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 432 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 1645889 - 1645619
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1645889 aatcacatcggaatgagaggaatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtattacctatatcaaca 1645790  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||| |||||||||    
T  1645789 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccaggaagtttc 1645690  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
     | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  1645689 tttgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagttggcaat 1645619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 4128029 - 4127739
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4128029 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggcatgagactatatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 4127930  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||     
T  4127929 agatgcatcttcttttcggtagccaattccataagaacttcagagttaagcgtgcttggcttagagcaattttgggatgggtgacctaccgaaaagtttt 4127830  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4127829 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgg-----gtcggcaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 4127739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 432 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 4127577 - 4127276
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4127577 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 4127478  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctc-------------------gttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggg 612  Q
    |||||||||||||||| ||||||||                   |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4127477 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttccataagaactccacagttaagcatgattggcttggagcaattttgggatggg 4127378  T
Q  613 tgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagca 712  Q
    ||| | | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4127377 tgagctatcgggaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagca 4127278  T
Q  713 gt 714  Q
    ||    
T  4127277 gt 4127276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 481 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 23943333 - 23943087
Alignment:
Q  481 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23943333 catggttgaaggaagacttataaaaaatatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 23943234  T
Q  581 gcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttg 680  Q
    ||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  23943233 gcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccaaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 23943134  T
Q  681 gtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||| || ||||||| |||| || ||||  ||||| | |||||||    
T  23943133 gtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 23943087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 50399133 - 50398839
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| || |  |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50399133 aatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtgtaggtatgagattacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 50399034  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||  ||||||||||| |||||| |  |||    
T  50399033 cgatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggga-attc 50398935  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  |||| ||||| |||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  50398934 ccggtaaacgtgcaagtgaggacaaaacacgttggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 50398839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 432 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 23942929 - 23942675
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||  |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23942929 aatcacatcggaatgagagggatcctggggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 23942830  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  23942829 agatgcatcttcttttttgtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggaaagtttc 23942730  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    | | |||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  23942729 caaataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaggacccgtgttggtttgt 23942675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 432 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 24629120 - 24628918
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaa---ggcttataagaattgtttggtactgcctatatca 528  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24629120 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaattaggcttataagaattgtttggtactacctatatca 24629021  T
Q  529 acaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagt 628  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  24629020 acaagatgcatcttcttttcagtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgcgaaat 24628921  T
Q  629 ttc 631  Q
    |||    
T  24628920 ttc 24628918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 432 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 51331421 - 51331122
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  51331421 aatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 51331322  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||| |||||||| |||     
T  51331321 agatacatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaaatttt 51331222  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagtta 731  Q
    | | ||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||||||| || |||||| || ||||||||||||||| |||| |||||  | ||||||| |||    
T  51331221 cga-taagcgtgcgaatgaggacaaaacacactg-aaagactcgtattagtttgtagggtcagtcggcaatcctaaaagtagtctaggatgttacattta 51331124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 432 - 702
Target Start/End: Original strand, 3169206 - 3169476
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3169206 aatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaaca 3169305  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||| ||| | |||||||    
T  3169306 agatgcatcttctttttggtaacccaatccataagaactccacacttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgagtgacctaccagaaagtttc 3169405  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
     | ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  3169406 ttggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaatactcgtgttggtttgtagggtcagttggcaat 3169476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 342 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 15306326 - 15306052
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||  || |||| |     
T  15306326 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtctggctcctggca-gcttctaggcaaaacagaaccacatca 15306228  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattg------tttggtactgcctatatcaacaagat 535  Q
    ||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| |||      ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15306227 gaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggtcgaaagaagacttataagatttgagcaattttggtactacctatataaacaagat 15306128  T
Q  536 gcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 611  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15306127 gcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaatcttgggatgg 15306052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 498 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 50814899 - 50814730
Alignment:
Q  498 ttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 597  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50814899 ttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 50814800  T
Q  598 caattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  50814799 caattttgggatggatgacctaccgggaagtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 50814730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 432 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 9423998 - 9423748
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||   || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9423998 aatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaaca 9423899  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||| | | || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  9423898 agatgcatcttctttctagtagcccattccataagaatttcacaattaagtgtgcttgaattggagtagtcttaggatgggtgacctaccgggaaatttc 9423799  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggt 682  Q
    |   ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  9423798 ccgttaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggt 9423748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 468 - 702
Target Start/End: Original strand, 21067770 - 21068001
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||   ||||||||  | ||||||||||    
T  21067770 aggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatacatttt---tttggtagtccattccataaga 21067866  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || | | || |||||||||||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  21067867 acttcacagttaagcgtgcttgacttgaagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttaccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaacacactgaa 21067966  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    || | |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21067967 aaaattcgtgttggtttgtaggcttagtcggcaat 21068001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 446 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 21220457 - 21220286
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21220457 gagagggatcatgaggccatgtaggtatgaaactatatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 21220358  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21220357 tttggtaactcattctataagaactacacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggacgggtgacc 21220286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 468 - 689
Target Start/End: Original strand, 27026539 - 27026759
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  27026539 aggtatgggactacacgattgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatctt-tttttggtagcccattccataaga 27026637  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |  |||||||| | |  ||||||| || |||||| |||| || |||||    
T  27026638 actacgtagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggaagggtgaccttctaggaagtttaccaaaaagcgtgtgactgaggaaaaaacacgctgaa 27026737  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtggg 689  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  27026738 aagactcgtgtttgtttgtggg 27026759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 432 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 53996255 - 53996090
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  53996255 aatcacatcggaatgagaaggatcctgaggctatgtagatatgggactacatggttgaaggaatgcttataaaaattgtttggtactacctatatcaaca 53996156  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 597  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53996155 agattcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacagttaagtgtgcttgacttggag 53996090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 481 - 709
Target Start/End: Original strand, 17628560 - 17628788
Alignment:
Q  481 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |   ||||||||| ||||||||| |    
T  17628560 catggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcgatagcccaacccataagaattccacagttga 17628659  T
Q  581 gcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttg 680  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||| |||| |  ||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||    
T  17628660 gcgtgcctgacttggagcaattttgagatgggtgaccttctaggaagattcccataaagcgtgtgagtgaggacaaaacacactggaaagacttgtgttg 17628759  T
Q  681 gtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaa 709  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||    
T  17628760 gtatgtggagtcagtcggcaatcctgaaa 17628788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 446 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 29628793 - 29628524
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |     
T  29628793 gagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgtgtctt-tg 29628695  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa--------------gtttc 631  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||  ||||||||              |||||    
T  29628694 tttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacttaccgggaaactccagaaagtttgtttc 29628595  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  29628594 ccagtaagtgtacgagtgaggataaaatacgctgaaaaaactcgtgttgatttgtaggatcagtcggcaat 29628524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 470 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 31817954 - 31817708
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||    
T  31817954 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttcggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttcggtagtccatttcataagaac 31817855  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaa 669  Q
    | || |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||  | | ||||||||   | |||||||||||||||||  ||||  | |  ||     
T  31817854 ttcatagttaagcgtgcttgacttgtagtagttttaggatgggcgaccttcggtgaagtttcgcggaaagcgtgcgagtgagga-caaatcatgttgaat 31817756  T
Q  670 gactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31817755 gactcgtgttggtttgagggatcagtcagcaatcctgaaagcagtctg 31817708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 446 - 727
Target Start/End: Original strand, 13266100 - 13266381
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||| ||| ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  13266100 gagagggatcttaaagccgtgcaggtatgggaatgcatggttgaaggaaggcttataataattttttagtactccctatatcaataagatgcatcttatt 13266199  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    || |||||| |    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    ||||||||| |    ||| |||||    
T  13266200 ttcggtagcccaaatcacaagaaccccacagttaagcgtgcttgactttgagaaattttaggatgggtgaccttttgggaagttttccgaaaagtgtgcg 13266299  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||| |||| |   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||    
T  13266300 agtgaggagaaaacatgttgaaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 13266381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 465 - 717
Target Start/End: Original strand, 1464180 - 1464431
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    |||||||||| || | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  1464180 tgtaggtatgagaatacatagttgaaagaaaacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcata 1464279  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactct 664  Q
    |||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| | |  || ||||||||| |||| | || || ||    
T  1464280 agaacttcacaatttagcgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgagaagttttccaaaaaacgtgcgagttaggacacaacacgct 1464379  T
Q  665 gaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||||  |||||| |||||||||||    
T  1464380 gaaaa-actcgtgttgatttgtggggtcggtcgataatcctaaaagcagtctg 1464431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 432 - 696
Target Start/End: Original strand, 21067282 - 21067546
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||||||||||  |||   || | ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  21067282 aatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcatgtatgagactgcatggttgaaggaagactaataataattatttggtactacatatatcaaca 21067381  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21067382 agatgcatcttctttccggtagctcattctaaaagtactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtctttggaggggtgacctaccggaaagtttc 21067481  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtc 696  Q
       ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  21067482 tcggtaagcgtgcgagtggggacaaaacacactgaaaagactcgtgttagtttgttgggtcagtc 21067546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6407395 - 6407043
Alignment:
Q  16 ggtgagttgcttgaggaaagctcggagcttcctcg-------ctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtctta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  6407395 ggtgagttgcttgaggaaagctcagagcttcctcgtttactgctttttcggagtctagtgtgtcggctctgattaggatgtttttctgtttgaagtctta 6407296  T
Q  109 tgacta-------------------gttgttgagatgagattttatacttggtgatgtattataattt-gagacatggttaattcgagatgttctactga 188  Q
    ||||||                   ||||||||||| |||||||||| || |||||||| | | |||| ||||| ||  || || |||||||| |||| |    
T  6407295 tgactatttgttgttttatgactcagttgttgagattagattttatatttagtgatgtagtttgattttgagacgtgactacttagagatgttttactaa 6407196  T
Q  189 ttgtattggtgacgatatttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattctt 288  Q
     | || | |||| ||| |||| |||||  ||| | | |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6407195 atttagttgtgatgatgtttt-attccgctgcgaagatttgagtaaatttttatttatgcatgcttggtgatttattggtgaagtaacatctagattctt 6407097  T
Q  289 gatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttact 342  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6407096 gatatgctcgtatcattagcgtaatttatcgcttttagagtttagggtgttact 6407043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 342 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 27578683 - 27578317
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||  ||||| | |     
T  27578683 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacactcgaggctgatgagggcggggagcggtccggctcctggca-gcttctaggcaaaaccgaatcatatca 27578585  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||| ||   || | |   || |||| || |||||  |||||||| || || ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27578584 gaatgagatgg---ctgaagtcgtggaggtgtgagactgtgtggttgaatgatggtttataagaattatttggtgctacctatatcaacaagatgcatct 27578488  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||| | |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||  | ||||||||| |    |||||    
T  27578487 tcttttcggtatcccaaaccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttcgaacaattttgggatgagcgaccttctgggaagttttccgacaagcg 27578388  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagca 712  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  27578387 tgcgagtgaggacaaaacacgcagaaaagactcgtgatggtttgtgggatcagtcaacaatcctgaaagca 27578317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 432 - 686
Target Start/End: Original strand, 14351795 - 14352049
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||| |||   || | ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  14351795 aatcacaccagaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgagtctgcatggttgaaggaaggcttgtaagagttttttggtactatctatatcaaca 14351894  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | | || |||||| ||||| || |  ||||||     
T  14351895 agatgcatcttctttttggtatcctattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttcgagtagtctttggatggatgacctactgcaaagtttt 14351994  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  14351995 ccagtaagcgtgcaagtgaagacaaaatatgctgaaaagactcatgttggtttgt 14352049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 449 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 8467923 - 8467690
Alignment:
Q  449 agggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttcttttt 548  Q
    ||||||||| || || || ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  8467923 agggatcctgagactgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttcttttc 8467824  T
Q  549 ggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagt 648  Q
    |||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||    ||||||||||   | |||| |||||||    
T  8467823 ggtagccc--------agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt-----tgggtgaccttatgggaagtttctcggaaagcatgcgagt 8467737  T
Q  649 gaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagt 695  Q
    ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8467736 gaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagt 8467690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 343 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 27579137 - 27578795
Alignment:
Q  343 gtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccgg 442  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||| ||  ||| ||| |||||| || |||||||||| ||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||| |||    
T  27579137 gtaacgccttcgtttggtgggcatgtaatgctcgaggctggtgagggtggggagtggtccgactcttgaca-gcttctaggtaaaaccgaatcacatcgg 27579039  T
Q  443 agcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatctt 542  Q
    |   ||||||||| ||| |   ||||||||||  ||| | |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||  ||||||    
T  27579038 aataagagggatcttaaagtcgtgtaggtatgacactacttggttgactgaagacttataagaattgtttggtactacatatatcaattagacacatctt 27578939  T
Q  543 ctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgt 642  Q
    |||||  ||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||    
T  27578938 cttttcagtagccctatccataagaactacacagttaagcgtgcttaacttggagcgattttgggatgcgtgaccttctgggaagtttcccagaaagcgt 27578839  T
Q  643 gcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||||||||| |||  |  ||||||||||| |||||| |||||    
T  27578838 gcgagtgaggacaaatcatgctgaaaagacttgtgttgatttgt 27578795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 367 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 14571926 - 14571702
Alignment:
Q  367 gtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatg 466  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||| ||||||| |  |  || ||||||| | || |  ||    
T  14571926 gtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtg 14571827  T
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||     |||||||    
T  14571826 taggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccataag 14571727  T
Q  567 aactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14571726 aactccacagttaagcgtgcttgac 14571702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 206 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21957512 - 21957378
Alignment:
Q  206 tttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatt 305  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21957512 tttttattccgctgcgatgttttgagaaaattattatttatgcatgcttggtgatttattgaagaagtaacatctagattcttgatatgctcgtatcatt 21957413  T
Q  306 agcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21957412 agcgtaa-ttatcgcttttagagtttagggtgttac 21957378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 470 - 641
Target Start/End: Original strand, 17029368 - 17029539
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||||||    
T  17029368 gtatgggactgcatagttgaatgaagacttgtaataattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatattacttttggtaccttattccataagaac 17029467  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  | ||||||||||| || |||||    
T  17029468 tccacagttaagagtgcttaacttggagcatttttgggttgggtgaccttctgggaagtttcccagaaagcg 17029539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 446 - 617
Target Start/End: Original strand, 4185729 - 4185900
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    ||||||| || | |||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  4185729 gagagggttcatgaggccatgcaggtatgagacggcatggttaaaggaatacatataagaattgtttgataccacatataccaacaagatgcatcttctt 4185828  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4185829 tttggtagctcattctacaagaactctacagttaagtatgcttgacttggagcaattttgggataggtgacc 4185900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 560 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 14571700 - 14571545
Alignment:
Q  560 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaat 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    ||||||||||   | ||| ||| ||||||||| ||||     
T  14571700 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgagatgggtgatcttttgggaagtttctcggaaagtgtgtgagtgaggacaaaac 14571601  T
Q  660 actctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtc 715  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14571600 acgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgggaatcctgaaagcagtc 14571545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 342 - 611
Target Start/End: Original strand, 41869830 - 41870097
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||   || ||| ||| || || ||||||| || ||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  41869830 tgtaacgcctccgcttggtggacatgtaacgctcaaggctggtgacggggg-gagtggtacgtctcctg-taagcttctaggcaaaactaaatcacatcg 41869927  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||| |||||||||||| || || |  |  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41869928 gagtgagagggatcctgagactgtacatatatgggactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtatgatactacctatatcaacaagacgcatct 41870027  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 611  Q
    ||||||  ||| | |    |||||||||| |||| ||| || || ||||| | |||||||||||||||||    
T  41870028 tcttttcagtaacccaaatcataagaacttcacaattatgcatgtttgacatagagcaattttgggatgg 41870097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 476 - 616
Target Start/End: Original strand, 33764904 - 33765044
Alignment:
Q  476 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccaca 575  Q
    |||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  33764904 gactacatggttggatgaagacttttaagaattgtttggtgctacctataccaacaagatgcatcttcttttttgtagctcattttataagaacttcaca 33765003  T
Q  576 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 616  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33765004 cttaagcgtgcttgatttggatcaattttgggatgggtgac 33765044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 493 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23091590 - 23091468
Alignment:
Q  493 aaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgact 592  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23091590 aaggcgtataaaaattgtttggtactacatatattaacaagatgcatcttctttctggtagcttattctataaaaactccacagttaagcatgcttgact 23091491  T
Q  593 tggagcaattttgggatgggtga 615  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  23091490 tgtagcaattttgggatgggtga 23091468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 426 - 613
Target Start/End: Original strand, 17028868 - 17029055
Alignment:
Q  426 aaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctata 525  Q
    ||||| ||||||| ||||  |||||||||||| | ||  || | |||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||| ||| || ||||||    
T  17028868 aaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccttgcatgtatgggactgcatagttgaaggaggatttgtaagaattgttaggtgctacctata 17028967  T
Q  526 tcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggt 613  Q
    |||||||||||| |||| ||||   |||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17028968 tcaacaagatgcgtcttattttacctagcttattccataagaacttcatagttaagagtgcttgacttggagcaatttcgggatgggt 17029055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 589
Target Start/End: Original strand, 27029331 - 27029434
Alignment:
Q  486 ttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtg 585  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27029331 ttgaaggaagacttataagaattatttggtactacttatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagtgtg 27029430  T
Q  586 cttg 589  Q
    ||||    
T  27029431 cttg 27029434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 562 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 27578296 - 27578134
Alignment:
Q  562 ataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatac 661  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||| ||    
T  27578296 ataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcagttttgggatgagtgaccttatgggaagtttccctgaaaacgtgcgagtgaggacaaaacac 27578197  T
Q  662 tctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  27578196 gctgaaaagactcgtgttgggttgtagg---agtcggtaatcctgaaaggagtctgggatgttaca 27578134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 492 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 20306241 - 20306122
Alignment:
Q  492 gaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||| | | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20306241 gaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgca---tctttttggtatcccatttcataagaactacacggttaagcgtgcttgac 20306145  T
Q  592 ttggagcaattttgggatgggtg 614  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  20306144 ttggagcaatttttagatgggtg 20306122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 483 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 43929052 - 43928927
Alignment:
Q  483 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagc 582  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||| |||| |    
T  43929052 tggtcgaaggaaagcttacaagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatcttctttttggtag-ttatttcataagaaatccacaattaaac 43928954  T
Q  583 gtgcttgacttggagcaattttgggat 609  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43928953 gtgcttgactttgagcaattttgggat 43928927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 607 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 15268138 - 15268029
Alignment:
Q  607 gatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctg 706  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||   ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15268138 gatgggtgagctaccgggaaatttctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctg 15268039  T
Q  707 aaagcagtct 716  Q
    ||||||||||    
T  15268038 aaagcagtct 15268029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 464 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 23976327 - 23976175
Alignment:
Q  464 atgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttct-ttttggtagctcgttcca 562  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||      ||    
T  23976327 atgtaggtatgggtctgcatgattgaaggaagagttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcatcttcttttttcatagccaaaatca 23976228  T
Q  563 taagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtga 615  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  23976227 taaaaactccacagttaaacgtgcttgacttggaataattttgggatgagtga 23976175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11774279 - 11774178
Alignment:
Q  240 tatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgtt 339  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11774279 tatttatgcatgcttggtgaattattgaagaagtaacatctaaattctttatatgattgtatcattggcgtaatttatcgcttttagagtttagggtgtt 11774180  T
Q  340 ac 341  Q
    ||    
T  11774179 ac 11774178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 476 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 13613993 - 13613874
Alignment:
Q  476 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccaca 575  Q
    |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  13613993 gactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagttcattctataagaactccaca 13613895  T
Q  576 gttaagcgtgcttgacttgga 596  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  13613894 gttaagcgtgtttgacttgga 13613874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 570 - 702
Target Start/End: Original strand, 40607069 - 40607201
Alignment:
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaa 669  Q
    |||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  40607069 tccatagttaaacgtgtttgatttggagcaaatttgggatgggtgacctaccggaaagtttatcggtaagcgttcgagtgaggacaaaatacgctgaaaa 40607168  T
Q  670 gactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
     |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  40607169 aactcgtgttgatttgtggaatcagtcggcaat 40607201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 549 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 11828508 - 11828440
Alignment:
Q  549 ggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11828508 ggtagctccttccataagaactccacagttaagcgtgctttacttggagcatttttgggatgggtgacc 11828440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 470 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 31817500 - 31817376
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||  | ||| | |||| |||||||    
T  31817500 gtatgagacttcatggttgaaggaacgtttataataattgtttggtactacctataccaacaaaatgcatcttcttttccgcagcccattccttaagaac 31817401  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttg 594  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||    
T  31817400 tctacaattaagcgtgtttgacttg 31817376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 635 - 727
Target Start/End: Original strand, 35477863 - 35477955
Alignment:
Q  635 gtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  35477863 gtaaacgtgcgagagaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtatgggatgttaca 35477955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 663 - 728
Target Start/End: Original strand, 50399335 - 50399400
Alignment:
Q  663 ctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacag 728  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50399335 ctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcgatgttacag 50399400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 450 - 610
Target Start/End: Original strand, 17628986 - 17629145
Alignment:
Q  450 gggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttg 549  Q
    ||||||||||||   || ||||||| || || |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||     
T  17628986 gggatcctaaggtcgtgcaggtatgtgaatgtatggttgaataaaaacttataagaattgtttggtactacctatactaataagatgcctcttcttttta 17629085  T
Q  550 gtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatg 610  Q
    | ||| |  |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17629086 gaagcccaatccaaaagaattccaca-ttaagcatgcttgacttggagcaattttgagatg 17629145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 341
Target Start/End: Original strand, 13842370 - 13842473
Alignment:
Q  238 attatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtg 337  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||   |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13842370 attatttatgcatacttggtgaattattgaagaagtaacatctaaattccttatatgattgtatcaatagcgtaatttatcgtttttagagtttagggtg 13842469  T
Q  338 ttac 341  Q
    ||||    
T  13842470 ttac 13842473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 446 - 580
Target Start/End: Original strand, 4186181 - 4186315
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    ||||||| || |||||| ||| | ||||| ||||  ||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  4186181 gagagggttcgtaaggccatgcacgtatgagactaaatgtttaaaggaatgcttataagaatgatttggtactacctacatgaacaagattcatcttctt 4186280  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    ||||||||| | || |||||||||| |||||||||    
T  4186281 tttggtagcccattgcataagaactacacagttaa 4186315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 451 - 593
Target Start/End: Original strand, 42838642 - 42838787
Alignment:
Q  451 ggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatc-ttcttttt- 548  Q
    ||||||| || || |||| ||||| |||| ||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  42838642 ggatcctgagactgtgtaagtatgagactacatagttcaaggaagacgtataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatctttctttttc 42838741  T
Q  549 ggtagctcgttccataagaac-tccacagttaagcgtgcttgactt 593  Q
    | ||| || |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  42838742 gatagttcattccataagaactttcacagttaagcgtgtttgactt 42838787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Original strand, 14616041 - 14616176
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgattta-ttgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatt 305  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14616041 ttttattccgctgcgatgttttgagatagttgttatttatgcatgtttggtggtttaattgaagatgtaacatctagattcttgatatgt-cgtatcatc 14616139  T
Q  306 agcataatttatcgctttt-agaatttagggtgttac 341  Q
    ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14616140 agcgtgatttatcgcttttaagggtttagggtgttac 14616176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 627 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 4414332 - 4414257
Alignment:
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4414332 gtttcctggtaagcgtgcgagtcaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaat 4414257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 26200394 - 26200248
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaag--gcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttcca 562  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||| |||||| |||||||     |||    
T  26200394 tgtaggtatgggacatcatggttgaaggaagaggcttataacaattgtttgatactaactatacaaacaagatgcatattctttgtggtagccgaaacca 26200295  T
Q  563 taagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||||||  |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26200294 taagaacttaaca--------tgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 26200248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 486 - 608
Target Start/End: Original strand, 34554483 - 34554605
Alignment:
Q  486 ttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtg 585  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||| || |||||| | ||    
T  34554483 ttgaaagaatgcttataagaattgtttgacactacctataccagcaagatgcattttatttttggtagaccattccataagaacttcatagttaaacatg 34554582  T
Q  586 cttgacttggagcaattttggga 608  Q
     ||||||| ||| ||||||||||    
T  34554583 tttgacttagagaaattttggga 34554605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 614 - 702
Target Start/End: Original strand, 7381449 - 7381537
Alignment:
Q  614 gaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7381449 gacctaccgagaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtagggtcagtcggcaat 7381537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 637 - 727
Target Start/End: Original strand, 5810039 - 5810129
Alignment:
Q  637 aagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||| || | |||||||    
T  5810039 aagcgtgtgagtgaggataaaacacgctgaaaagactcatgttgatttgtggggttagtcggcaatcctaaaagaagtatgagatgttaca 5810129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 52048792 - 52048659
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    ||||||| |||||||||  |  |||||||  ||||||| | ||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||  |||||||||||||||| |    
T  52048792 gagagggttcctaaggccgtacaggtatgaaactgcatagctgaaggaaaatttataagaattgtttgatactacgtatactaacaagatgcatcttcat 52048693  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    ||| |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  52048692 ttt-gtaagtcattccataagaactccacagttaa 52048659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 560 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 53854859 - 53854717
Alignment:
Q  560 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaat 659  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | |||||| || | |||| ||||| |||||| |||   |||||| |  |||| ||||||||||| || |||||    
T  53854859 ccataagaactccatagttaagcatgttagacttgaagtagtttttggatgtgtgacctaccaaaaagtttaccggtaaacgtgcgagtgatgacaaaat 53854760  T
Q  660 actctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||    
T  53854759 acgttgaaaagactcgtgttgatttgtagggttagtcggcaat 53854717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 24271654 - 24271506
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||| || |||| |||||| | ||||||||||    
T  24271654 aggtatgagactacatggttaaagtaagacatataagaattatttgatactacctatacgaacaagatgcatatt-ttttgggtagcccattccataaga 24271556  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||  ||  ||| | ||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  24271555 actctgcaaataaacatgcttgagttagaacaattttgggatgcgtgacc 24271506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 663 - 727
Target Start/End: Original strand, 13265867 - 13265931
Alignment:
Q  663 ctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  13265867 ctgaaaagactcgtgttagtttgtgcggtcagtcggtaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 13265931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 528 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 33294936 - 33294852
Alignment:
Q  528 aacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgac-ttggagcaattttgggatgg 611  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  33294936 aacaaaatgcatcttcttttttgtagttcactccataagaactccacagtaaagcgtgctcgactttggaacaattttggaatgg 33294852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 581
Target Start/End: Original strand, 44831046 - 44831146
Alignment:
Q  481 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||| || ||||||| |||||| | || |||| ||||| |||||||||    
T  44831046 catggttgaagggaagcttataaaaattgtttggtactacctaaactaacaagatgtatattcttttcggtagcccatttcatatgaacttcacagttaa 44831145  T
Q  581 g 581  Q
    |    
T  44831146 g 44831146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 471 - 550
Target Start/End: Original strand, 45682242 - 45682321
Alignment:
Q  471 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttgg 550  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45682242 tatgggactacatgattgaatgaaggtttataagaattatttggtattatctataccaacaagatgcattttctttttgg 45682321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 53854947 - 53854861
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtact 518  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | | ||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53854947 aatcacatcggaatgagagggatcatgaagcagtgtaggtatgagactatatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtact 53854861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 553
Target Start/End: Original strand, 53391925 - 53392008
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag 553  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  53391925 gtatgagactgcatggttgaagaaatgcttataaaaattgtttgataccatctatatcaacaagatacatatttttttcggtag 53392008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 727
Target Start/End: Original strand, 10668381 - 10668426
Alignment:
Q  682 tttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10668381 tttgtggggtcagtgggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 10668426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 727
Target Start/End: Original strand, 10668887 - 10668932
Alignment:
Q  682 tttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10668887 tttgtggggtcagttggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 10668932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 727
Target Start/End: Original strand, 10882526 - 10882571
Alignment:
Q  682 tttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10882526 tttgtggggtcagtgggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 10882571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 31817104 - 31817003
Alignment:
Q  606 ggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcct 705  Q
    |||||||||||   | ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| |   |||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||    
T  31817104 ggatgggtgacattctgggaagtttcccagaaagcgtacgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcgtgctggtttgtggggccaatcgacaatcct 31817005  T
Q  706 ga 707  Q
    ||    
T  31817004 ga 31817003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 663 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 21220263 - 21220199
Alignment:
Q  663 ctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  21220263 ctgaaaagacttgtgctgatttctggggtcagtcggcaatcttgaaagcagtttgaggtgttaca 21220199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 507 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 39902518 - 39902478
Alignment:
Q  507 ttgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttt 547  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39902518 ttgtttggtactatctatatcaacaagatgcatcttctttt 39902478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17957167 - 17957128
Alignment:
Q  117 tgttgagatgagattttatacttggtgatgtattataatt 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17957167 tgttgagatgagattttatatttggtgatgtagtataatt 17957128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 342 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 13125372 - 13124996
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||    
T  13125372 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggcggatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatatcg 13125273  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13125272 gaatgagagggatcttgaggccctgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 13125173  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13125172 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcg 13125073  T
Q  642 tgcgagtgagga-taaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13125072 tgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaggactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 13124996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 9124869 - 9125254
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  9124869 tgtaacgccttcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 9124968  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||| |||| | ||||  || ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9124969 gaatgagagagatcttgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 9125068  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  9125069 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactcggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcg 9125168  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9125169 tgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 9125254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 367 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 2941968 - 2941608
Alignment:
Q  367 gtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatg 466  Q
    ||||||||  || ||||||||||||  |||||| |||||||  |  ||||||| |||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||| ||||  |     
T  2941968 gtaacgcccaaggctgatgagggcgaggagtggcccggctcccgccatgcttctaggcaaaactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgta 2941869  T
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2941868 caggtatgggactgcatggttgaaggaaggctgataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataag 2941769  T
Q  567 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctga 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  2941768 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggagaaaacacgctga 2941669  T
Q  667 aaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  2941668 aaagactcgtgttggtttgtgcggtcagtcggcaatcacgaaagcagtctgggatgttaca 2941608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 18833196 - 18833581
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||    | ||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  18833196 tgtaacgcccccgcttggtgggcatgtaacgctcagggctgatgagggcggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 18833295  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||||| |||| ||||  |  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18833296 gaatgagagggttcctgaggccgtacaggtatggaactgcatggttgagggaaagcttatatgaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 18833395  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||    
T  18833396 tcttttcggtagctaattacataagaactccacagttaagcgtgtttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaaacg 18833495  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18833496 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtgggataagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 18833581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 36422252 - 36422546
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36422252 aatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 36422351  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36422352 agatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaa-tttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 36422450  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  36422451 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 36422546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 432 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 34405737 - 34405459
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34405737 aatcacaccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 34405638  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
     ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34405637 ggatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 34405538  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  34405537 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatcctaaaag 34405459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 42515002 - 42515387
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||    
T  42515002 tgtaacgtctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 42515101  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  42515102 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattt 42515201  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||  ||| |||| |||    |||||||    
T  42515202 tctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacataccaggaactttttcggtaagcg 42515301  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||  ||||| | |||||||    
T  42515302 tgcgggtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgtgatgttaca 42515387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 2193256 - 2193551
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2193256 aatcacaccggaatgagagggttcctgagaccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 2193355  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2193356 agatgcatcttctattcggtagctcatttcataggaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 2193455  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2193456 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgagatgttaca 2193551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 432 - 714
Target Start/End: Original strand, 28495854 - 28496136
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  28495854 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaactgttgggtactacctatatcaaca 28495953  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  28495954 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctattgggaagtttc 28496053  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28496054 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaaacagt 28496136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 432 - 726
Target Start/End: Original strand, 2189144 - 2189438
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2189144 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggctgtgcaggtgtgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggcactacctatatcaaca 2189243  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2189244 agatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgagtgacctaccgggaagtttc 2189343  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttac 726  Q
    |  ||||||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2189344 ccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgtgttgatttgtggggacagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttac 2189438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 446 - 709
Target Start/End: Original strand, 42515558 - 42515821
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42515558 gagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 42515657  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| |  |||||||||||    
T  42515658 ttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctacatggaaattttccggtaagcgtgcg 42515757  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaa 709  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42515758 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaa 42515821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 446 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 6719206 - 6718926
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6719206 gagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 6719107  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  | |||||| |||||  |||||||||||    
T  6719106 ttcggtagctcattccataagaactccagagttaagcgtgcttgacttggagtaa-tttgggatgggtgacatatcgggaactttcccggtaagcgtgcg 6719008  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||| | |||||||    
T  6719007 agtgaggacaaaacacactgaaaagaatcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 6718926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 446 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 28495740 - 28495467
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28495740 gagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgttgagttttacctatatcaacaagatgcatcttctt 28495641  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||||||||    
T  28495640 ttaggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggga-----------aagcgtgcg 28495552  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagtt 730  Q
    |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28495551 agtgaggacaaaacccgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcgatgttacagtt 28495467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 459 - 728
Target Start/End: Original strand, 2465951 - 2466219
Alignment:
Q  459 aggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgt 558  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  2465951 aggccatgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagttgcatcttcttttcggtagctcat 2466050  T
Q  559 tccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaa 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||    
T  2466051 tccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcatgcaagtgaggacaaaa 2466150  T
Q  659 tactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacag 728  Q
     || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| || ||||  ||||| | ||||||||    
T  2466151 cacgctgaaaagactcgtgttagtttgtagg-tcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacag 2466219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 342 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 11517624 - 11517386
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  11517624 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggttgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 11517525  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11517524 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatgg-tgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 11517426  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaag 581  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11517425 acttttcggtagctcattccataagaactccgcagttaag 11517386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 472 - 652
Target Start/End: Original strand, 2465773 - 2465953
Alignment:
Q  472 atgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactc 571  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2465773 atgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactc 2465872  T
Q  572 cacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgagg 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  2465873 cacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaaatttcccggtaagcatgcgagtgagg 2465953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 522 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 13122561 - 13122365
Alignment:
Q  522 tatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaacc 621  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13122561 tatattaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgatttggagcaattttgggatgggtgacctacc 13122462  T
Q  622 gggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgagga-taaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13122461 gggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcctgaaagcagtctg 13122365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 342 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 5406823 - 5406451
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| | |||||||| ||||||| ||    
T  5406823 tgtaacgcctccgcttcgtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggtggagagtggtccggctcatgaca-gcttctaagcaaaactgaatcacatcg 5406725  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  || ||||||||||| |   ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5406724 gaatgatagggatcctaaagtcgtgccggtatgggactgcatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcatct 5406625  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaag-tttcctagtaagc 640  Q
    | |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | || ||| ||||| |  || |    
T  5406624 tatttttggttgcccaaaccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatggatgactttctggaaagttttccgaaaaaac 5406525  T
Q  641 gtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| |||| |  || | ||||||||| ||||||||    
T  5406524 gtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaacactcgtgttggtctgtgaggacaattggcaatccttaaagcagt 5406451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 528 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 7646528 - 7646329
Alignment:
Q  528 aacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaag 627  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7646528 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaag 7646429  T
Q  628 tttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||   ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  7646428 tttctcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 7646329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 432 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 35474267 - 35474013
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||   |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  35474267 aatcacaccggaatgagagggatccttaggtcgtgtaggtatgagactacatggttgaagaaagacttataagaattgtttagtactacttatatcaaca 35474168  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||  |||||||| ||||    
T  35474167 agatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacgtaccgggaattttc 35474068  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
       ||||| ||||||||||||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  35474067 tcggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaatgacttgtgttggtttgt 35474013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 427 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 2611803 - 2611535
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  2611803 aactgaatcacatcggaatgagaggggtcctgaggtcatgtaggtatgagactatatggtggaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctataa 2611704  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | || |||||||||||| |||||| |    
T  2611703 caacaagatgcatcttctttttggtagcccattctataagaactccatagttaagcgtgctttacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggta 2611604  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
           | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  2611603 -------actaagcgtgcgagtgaggacaaaacactctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 2611535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 29039166 - 29038871
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| ||||  ||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29039166 aatcacatcggaatgagaggcatcctgaggccgtgtagatatgtgactacatggttgaatggaggcttacaagaattgtttggtactacctatatcaaca 29039067  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    | |||||||||||||||| ||   | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29039066 acatgcatcttctttttgataatccattccataagaactctacatttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggtaagtttc 29038967  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||  ||||| | |||||||    
T  29038966 ccggtaagcgtgtgactgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 29038871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 446 - 686
Target Start/End: Original strand, 679831 - 680071
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  679831 gagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggagtacatggctgaaggaaggcttataagaattgtt-ggtactacctatatcaacaagatgcatattctt 679929  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||   |||| | ||||    
T  679930 tttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctgccgggaagtttcgcggtaaacatgcg 680029  T
Q  646 agtgagga-taaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    |||||| |  |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  680030 agtgagaacaaaaacacgctgaaaagactcatgttggtttgt 680071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 446 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 6747730 - 6747457
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6747730 gagagggatcctgaggccgtgtaggtatgatactacatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 6747631  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    |||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | | | || |||||||||||| | ||||||||||        || ||||    
T  6747630 tttggtagcctattccataaaaactccacagttaagcgtgcttgacttatcgtagtctttggatgggtgacctatcgggaagttt--------gcttgcg 6747539  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||| |||| |   |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||| | |||||||    
T  6747538 agtgaggacaaaacaagttgaaaagacttgtgttggtttgtagggtcagtcggcaatgcttaaagcagtctgggatgttaca 6747457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 446 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 22529367 - 22529111
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| |||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22529367 gagagggatcctgaggtcatgtaagtatgggcctacatggttgaaggaaggcttataagaaatgtttggtactatctatataaacaagatgcatcttctt 22529268  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||  ||| ||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||| || | ||||||||   ||||||||| |    
T  22529267 ttcagtaactcattacaaaagaacttcacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgacctactgagaagtttctcggtaagcgtgtg 22529168  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||    
T  22529167 agtgaggacaaaatacgctgaaaagactcatgttggtttgtagggtcagtcgacaat 22529111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 531 - 727
Target Start/End: Original strand, 7646514 - 7646710
Alignment:
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7646514 aagatgcatcttgttttcggtaactcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagttt 7646613  T
Q  631 cctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
     |   |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||  ||||| | |||||||    
T  7646614 tccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttggtttgtggggttagtcgacaatcctaaaagtcgtctgggatgttaca 7646710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 432 - 639
Target Start/End: Original strand, 46425741 - 46425947
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  46425741 aatcacatcggaatgagagggatcctgagaccatgtaggtatgggactacatggttgaaataaggcttataagaattgtttggtattacctatatcaaca 46425840  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||| | || ||||||||    
T  46425841 agatgcatcttcttttcggtatcttattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgaccta-cgagaagtttc 46425939  T
Q  632 ctagtaag 639  Q
    || |||||    
T  46425940 ctcgtaag 46425947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 549 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 43776319 - 43776179
Alignment:
Q  549 ggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagt 648  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| | ||||||||||||| |    
T  43776319 ggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctgcggggaagttttccagtaagcgtgcgaat 43776220  T
Q  649 gaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 689  Q
    || || |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43776219 gaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 43776179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 470 - 712
Target Start/End: Original strand, 25182399 - 25182641
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||    
T  25182399 gtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttattttcggtaactcattccataagaac 25182498  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaa 669  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||| | | || ||||||  ||||  | ||||||||||  |  |||||| |||||||||  |||| || || ||||    
T  25182499 ttcacagttaagtgtgtttgacttggagtagtctttggatggaggaccttctgggaagtttctcaaaaagcgttcgagtgagggcaaaacacgctaaaaa 25182598  T
Q  670 gactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagca 712  Q
     |||||| |||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||    
T  25182599 aactcgtattgggttgtggggtcaatcgaaaatcctaaaagca 25182641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 468 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 29357566 - 29357348
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||    
T  29357566 aggtatgggactgcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactaactatatcaacaagatgcatcttcttttcgatagcccgtttcataaga 29357467  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctag-taagcgtgcgagtgaggataaaatactctga 666  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||| ||| | | ||  ||||| |||||  |||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| | |||  ||  |||    
T  29357466 actacacagttaaccgtgtttgacttagagtagtcttaagatggatgaccttccggtaag-ttcctcgaaaagcgtgcgagtgagaacaaagcacgttga 29357368  T
Q  667 aaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29357367 aaagactcgtgttggtttgt 29357348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 356 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 13124923 - 13124761
Alignment:
Q  356 ttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatc 455  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| |  |||  ||||||||||    
T  13124923 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtctggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcatattggaatgagagggatc 13124824  T
Q  456 ctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtact 518  Q
     | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13124823 ttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtgtggtact 13124761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 445 - 708
Target Start/End: Original strand, 11372464 - 11372719
Alignment:
Q  445 cgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttct 544  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||| || |    
T  11372464 cgagagggttcccaaggccatgtaggtatgaaattgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctgtaccaacatgatgcatgttat 11372563  T
Q  545 ttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgc 644  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||  | |||||||  ||||||||||||||| |||||   ||| ||||||| |  | || |        
T  11372564 ttttggtagctcaaaccataagaactccaaagttaagcacgtttgacttatagcaattttgggatgagtgac---ccgagaagttttccggaaatc---- 11372656  T
Q  645 gagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaa 708  Q
     |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||    
T  11372657 -agtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcactcagcaatcctgaa 11372719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 473 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 31406689 - 31406452
Alignment:
Q  473 tgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactcc 572  Q
    |||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  31406689 tgggactgaatggttgaaagatgacttattagaattgtttggtgttacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccgtttcataagaactcc 31406590  T
Q  573 acagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagac 672  Q
    |||||||||||||||    |||||| | | || ||||||||| ||   |  || ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  31406589 acagttaagcgtgct----ttggagtagtctttggatgggtggcc-ttctagacgtttcttagaaagcgtgtgagtgaggacaaaacatgctgaaaagac 31406495  T
Q  673 tcgtgttggtttgt--gggctcagtcggcaatcctgaaagcag 713  Q
      ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  31406494 atgtgttggtttgtagggtgtcagtcggtaatcctgaaagcag 31406452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 471 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 35527228 - 35527102
Alignment:
Q  471 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaact 570  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||  | ||||||| |||||    
T  35527228 tatgggactggttggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgcatattcttttcagtagtccattccataggaact 35527129  T
Q  571 ccacagttaagcgtgcttgacttggag 597  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35527128 ccacagttaagcatgcttgacttggag 35527102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 471 - 617
Target Start/End: Original strand, 1628755 - 1628898
Alignment:
Q  471 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaact 570  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||    
T  1628755 tatgggattgcatggttgaagaaaggcttataa---ttgtttggtactatcgatatcaacaagatgcatcttcttttttgaagcccataccataagaact 1628851  T
Q  571 ccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1628852 ccatagttaagtgtatttggcttggagcaattttgggatgggtgacc 1628898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 546 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 3305380 - 3305224
Alignment:
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  3305380 tttggtagctcattacataaaaacttcacagttaagcgtgcttgatttggagtagtctttggatgggtgacctaccggaaagtttcctggtaagagtgcg 3305281  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||| | |||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  3305280 agtgagaacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtaggatcagtcagcaat 3305224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 26421868 - 26421753
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  26421868 gtatgagactgcatggttgaagtaaggctcataagaattgttaggtactccctataccaacaagatgaatcttcttttcggtagcccattccataagaac 26421769  T
Q  570 tccacagttaagcgtg 585  Q
    | ||||||||||||||    
T  26421768 tacacagttaagcgtg 26421753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 431 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 36015558 - 36015404
Alignment:
Q  431 aaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaac 530  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||  || | ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36015558 aaatcacaccggaatgagagggatcccaaggcagtgcaagtatgagactccatggttgaaggaaagcttaaaagaattgtttggtactacatatatcaac 36015459  T
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtg 585  Q
    ||||||| |||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36015458 aagatgcctcttcttttaaatagcccattccataagaacttcacagttaaacgtg 36015404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 467 - 616
Target Start/End: Original strand, 20966086 - 20966235
Alignment:
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||    
T  20966086 taggtatgagactgcatgattgaaggatgacttataagaattattttgtaatacctataccaacaagatgtatattattttcggtagctcattccataag 20966185  T
Q  567 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 616  Q
    |||| ||||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20966186 aacttcacagttaaacatgcatgacttgtatcaattttgggatgggtgac 20966235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 459 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 26421424 - 26421287
Alignment:
Q  459 aggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgt 558  Q
    |||| ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||  | |    
T  26421424 aggccatgtaggtatgggtcagtatggttgaaggaagacttataagaattgcttgatactacctatatcaacaagatgcatatttttttcggtagtccat 26421325  T
Q  559 tccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgga 596  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  26421324 tccataagaactccacagttaaacgtgtttgaattgga 26421287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 612 - 713
Target Start/End: Original strand, 43233137 - 43233238
Alignment:
Q  612 gtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagc 711  Q
    |||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43233137 gtgacctaccgagaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagc 43233236  T
Q  712 ag 713  Q
    ||    
T  43233237 ag 43233238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 432 - 553
Target Start/End: Original strand, 43233413 - 43233534
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | ||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43233413 aatcacaccgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgtgactgtatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaaca 43233512  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtag 553  Q
    ||||||||||| |||| |||||    
T  43233513 agatgcatctttttttcggtag 43233534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 476 - 616
Target Start/End: Original strand, 9623252 - 9623391
Alignment:
Q  476 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccaca 575  Q
    |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  9623252 gactccatggtagaaggagtacttataagaattgtttgataccacctatatcaacaagatgcatcttctttc-ggtagttcattctataagaactccaca 9623350  T
Q  576 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 616  Q
    |||||||||| ||||||||||  | | || |||||||||||    
T  9623351 gttaagcgtgtttgacttggactagtctttggatgggtgac 9623391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Original strand, 15815807 - 15815938
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatta 306  Q
    |||||||||| ||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||| |||    
T  15815807 ttttattccactgcgatgttt---gaaaaaaattatttatgcatgcttggtgatttattgaagaagtaacatctaaattctttatatgattgtatcttta 15815903  T
Q  307 gcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15815904 gcgtaatttattgcttttagagtttagggtattac 15815938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 465 - 585
Target Start/End: Original strand, 16192352 - 16192472
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16192352 tgtaggtataggaattcatgattgaatgaaggattataagaattgtttggtattacctacatcaacaagatgcatcttcgttttggtagcccattccata 16192451  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtg 585  Q
    ||||||  ||||| |||||||    
T  16192452 agaactatacagtgaagcgtg 16192472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 432 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 26957703 - 26957603
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26957703 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggctgtgtaggtatggaactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 26957604  T
Q  532 a 532  Q
    |    
T  26957603 a 26957603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 476 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 31743926 - 31743834
Alignment:
Q  476 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaa 568  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  31743926 gactgcatggttgaaggaatgcttataagaatggtttggtgctatctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaa 31743834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 341
Target Start/End: Original strand, 26150596 - 26150694
Alignment:
Q  243 ttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  26150596 ttatgcatgcttggtgatttattgaagaagtaacatataaattctttatatggttgtatcattagcgtaatttatcgcttttaaagtttaaggtgttac 26150694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 446 - 611
Target Start/End: Original strand, 11372913 - 11373074
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |  ||||| ||||||||||  |||||||    
T  11372913 gagagggttcctaaggccatgtaggtatgagattgcatggttgaatgaagacttgtaagaattgtttcatagtatctataccaacaagatgagtcttctt 11373012  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 611  Q
    ||| |||||     ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    ||||||||||||||    
T  11373013 tttcgtagcctaaaccataagaactacacaattaagtgtgcttgactt----caattttgggatgg 11373074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 341
Target Start/End: Original strand, 20913899 - 20914031
Alignment:
Q  206 tttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatt 305  Q
    ||||||||||  ||| |||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    |||||||    
T  20913899 tttttattccgttgcgatgtttggagaaaa---ttatttatacatgcttggtgaattattgaagaagtaacatctaaattctttatatggttatatcatt 20913995  T
Q  306 agcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    |   ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20913996 actgtaatttatcacttttagagtttagggtgttac 20914031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 476 - 689
Target Start/End: Original strand, 37672204 - 37672417
Alignment:
Q  476 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccaca 575  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||| |||||||||| ||| |  || |||||||| | ||||    
T  37672204 gactgcatggttgcaaaaaggtttataataattgtttggtactacttgtaccaacaagatgcaacttctttttgttagttgatttcataagaaatacaca 37672303  T
Q  576 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcg 675  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||   ||||| ||||  | ||||| ||||   | ||   || |||||||||||||||||  |||||| || ||    
T  37672304 gttaagcgtgtttgactttgaacaattttataatgggcgaccttctgggaaatttctcggaaaatatgtgagtgaggataaaatacgttgaaaatacccg 37672403  T
Q  676 tgttggtttgtggg 689  Q
    ||||||||| ||||    
T  37672404 tgttggtttatggg 37672417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 635 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 6748019 - 6747952
Alignment:
Q  635 gtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6748019 gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaat 6747952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 668 - 727
Target Start/End: Original strand, 43776321 - 43776380
Alignment:
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43776321 aagactcgtgttggtttgtggggttagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 43776380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 7461424 - 7461344
Alignment:
Q  504 gaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtg 585  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  7461424 gaattgtttgatactaactatataaacaagatacatcttctttttggtagttcatt-cataagaactctacagttaagcgtg 7461344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 623 - 727
Target Start/End: Original strand, 36422573 - 36422677
Alignment:
Q  623 ggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtg 722  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || |||| | |||| | ||    
T  36422573 ggaagtttcccggcaagtgtgcgagtgaggacaaaacacactgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctaaaagtaatctgggatg 36422672  T
Q  723 ttaca 727  Q
    |||||    
T  36422673 ttaca 36422677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 341
Target Start/End: Original strand, 15002924 - 15003022
Alignment:
Q  243 ttatgcatgcttggtgattta-ttgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15002924 ttatgcatgcttggtaatttaattgaagatgtaacatctaaattattgatatgtt-gtatcattgacgtaatttatcgcttttagtgtttagggtgttac 15003022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 3305440 - 3305374
Alignment:
Q  450 gggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggta 516  Q
    |||||||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3305440 gggatcctgaggccgtgtaagtatgggactacatggttgaatgaaggcttatgagaattgtttggta 3305374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 37671864 - 37671726
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    ||||| |||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||    ||||||| | ||| || |||| |||     
T  37671864 gtatgtgactgcattgtggaatgaagatttataaaaattgtt-ggtactacctatgccaacaagatacat----tttttggcaactcatttcatatgaaa 37671770  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggt 613  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37671769 tccacatttaagcgtgcttgaattggagcaattttgtgatgggt 37671726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 341
Target Start/End: Original strand, 868238 - 868335
Alignment:
Q  244 tatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  868238 tatgcatgtctgatgaattattgaagaagtaacatctaaattctttatatgattgtatcatttgcgtaagttatcgcttttagagtttagggtattac 868335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 341
Target Start/End: Original strand, 1229515 - 1229612
Alignment:
Q  244 tatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1229515 tatgcatgtctgatgaattattgaagaagtaacatctaaattctttatatgattgtatcatttgcgtaagttatcgcttttagagtttagggtattac 1229612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 479 - 553
Target Start/End: Original strand, 6585655 - 6585731
Alignment:
Q  479 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaac--aagatgcatcttctttttggtag 553  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  6585655 tgcatgattgaaagaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaagatacatcttccttttggtag 6585731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 16811959 - 16811906
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtact 518  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16811959 tgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattgttttgtact 16811906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 682 - 727
Target Start/End: Original strand, 18833633 - 18833678
Alignment:
Q  682 tttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18833633 tttgtgggatcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttaca 18833678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 332
Target Start/End: Original strand, 26009187 - 26009283
Alignment:
Q  238 attatttatgcatgctt--ggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaattta 332  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||||   ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  26009187 attatttatacatgcttttggtgaattattgaagaagcaacatctaaattctttatatgattgtatcattaacgtaatttatcgcttttagagttta 26009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 664 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 26419149 - 26419104
Alignment:
Q  664 tgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaa 709  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26419149 tgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaa 26419104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 338
Target Start/End: Original strand, 16463766 - 16463834
Alignment:
Q  270 aagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgt 338  Q
    |||||||||||| |||||| |||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16463766 aagtaacatctaaattctttatatgattgtatcgttagcgtaatttatcgcttttagaaattagggtgt 16463834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 529
Target Start/End: Original strand, 2490077 - 2490136
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaa 529  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  2490077 gtatgtgactgcatgattgaaggaatgcttataagaagtgtttgttactacctatatcaa 2490136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 641 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 7461319 - 7461258
Alignment:
Q  641 gtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  7461319 gtgcgagtgaagataaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtgggatcaatcgacaat 7461258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Original strand, 9129388 - 9129452
Alignment:
Q  239 ttatttatgcatg-cttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatc 302  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  9129388 ttatttatgcatatcttgatgatttattgaagaagtaacatttaaattcttgatatgcccgtatc 9129452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 36015407 - 36015342
Alignment:
Q  640 cgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcct 705  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||    
T  36015407 cgtgtgagtgaggacaaaatacgctaaaaagactcgtgttagtttgtagagttagtcggcaatcct 36015342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 340 - 717
Target Start/End: Original strand, 30966142 - 30966519
Alignment:
Q  340 actgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacac 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| ||     
T  30966142 actgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcat 30966241  T
Q  440 cggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcat 539  Q
    ||||  |||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30966242 cggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 30966341  T
Q  540 cttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaag 639  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  30966342 cttcttttcggtatctcattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggaccaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaag 30966441  T
Q  640 cgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    | |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30966442 catgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 30966519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 30966600 - 30966985
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| || ||    
T  30966600 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcgcatcg 30966699  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30966700 gaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 30966799  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||    
T  30966800 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttctcggtaagcg 30966899  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30966900 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggagtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 30966985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 342 - 728
Target Start/End: Original strand, 24818236 - 24818621
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  24818236 tgtaacgcctgcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcg 24818335  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24818336 gaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 24818435  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24818436 ttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt-ggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcg 24818534  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacag 728  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| | | ||||||||    
T  24818535 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtagtcggggatgttacag 24818621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 5400053 - 5399668
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||    
T  5400053 tgtaacgcctccgcttggtgagcatgtaatgcctgaggctgatgagggcagggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 5399954  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||| | |||   || | |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5399953 gaatgagagggatcttgaggtcgtgcaagtatgggagtgtatggtttaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 5399854  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||    
T  5399853 tcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggtgacctaccaggaagttttccggtaagcg 5399754  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||| | |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  5399753 tgcgagtgagaacaaaacacgctggaaagacttgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 5399668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 427 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 25338148 - 25337848
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25338148 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatat 25338049  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25338048 caacaagatgcatcttcttttcgatagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 25337949  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttac 726  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  25337948 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgagatgttac 25337849  T
Q  727 a 727  Q
    |    
T  25337848 a 25337848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 342 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 29259856 - 29259504
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||||| ||    
T  29259856 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaagactgaatcacatcg 29259757  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| || |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29259756 gaatgagagggatcctgagaccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttattaaaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatct 29259657  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||     
T  29259656 tcttttcggtagctcatttcataagaacttcatagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagca 29259557  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcag 694  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29259556 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcag 29259504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 468 - 727
Target Start/End: Original strand, 33771037 - 33771296
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  33771037 aggtatgggactgcagggttgaagaaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataaga 33771136  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  33771137 actccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacactgaa 33771236  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  33771237 aagactcgtgttggtttgtggggtcagccggcaattctgaaagcaatctgggatgttaca 33771296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 432 - 729
Target Start/End: Original strand, 33174958 - 33175253
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33174958 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 33175057  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||  ||||||||||| ||||||||  |||    
T  33175058 agatgcatcttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtg-ttgacttggagtattcttatgatgggtgacctaccgggaa-attc 33175155  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagt 729  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33175156 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttagtttgtagggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacagt 33175253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 431 - 682
Target Start/End: Original strand, 8256525 - 8256776
Alignment:
Q  431 aaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaac 530  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8256525 aaatcacgccggaatgagagggatcttgaagccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 8256624  T
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  8256625 aagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctgctgggaagttt 8256724  T
Q  631 cctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggt 682  Q
     |   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8256725 tccgataagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagactcatgttggt 8256776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 446 - 686
Target Start/End: Original strand, 16379407 - 16379647
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16379407 gagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatacgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 16379506  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||    
T  16379507 tttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtaatctttggatgggtgacctaccgggaagtttcactgtaagcgtgcg 16379606  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16379607 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 16379647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 433 - 702
Target Start/End: Original strand, 16378938 - 16379207
Alignment:
Q  433 atcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaa 532  Q
    |||||||||||  ||||||||| |  ||||  || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16378938 atcacaccggaatgagagggattccgaggccgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagtcttatacgaattgtttgatactacctatatcaacaa 16379037  T
Q  533 gatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcc 632  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| | ||||||||||||    
T  16379038 gatgcatcttctttttggtagcacattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctatcgggaagtttcc 16379137  T
Q  633 tagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
      ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  16379138 gggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 16379207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 427 - 658
Target Start/End: Original strand, 41754284 - 41754515
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| || | ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41754284 aactgaatcacaccggaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatat 41754383  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  41754384 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccggaaa 41754483  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaa 658  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  41754484 gtttcccggtaaacgtgcgagtgaggacaaaa 41754515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 432 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 25434202 - 25433932
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||    
T  25434202 aatcacaccggaatgagagggatcctgaggccgtgctggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatacaacctttatcaaca 25434103  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||| |||||||||     
T  25434102 agatgcatctcctttctggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtggtctttggatgggtgaccaacagggaagtttt 25434003  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    || ||||||||| |||| |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25434002 ctggtaagcgtgtgagtaaggacaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaat 25433932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 427 - 727
Target Start/End: Original strand, 1912520 - 1912819
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1912520 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggttatgtaggtatgagactacatggttgaaagtagatttataagaattgtttggtactacctatat 1912619  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||| ||| ||||||||    
T  1912620 caacaagatgcatcttctttt-ggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttggagtactctttggatgggttacctaccgggaa 1912718  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttac 726  Q
    |||||   ||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||  ||||| | ||||||    
T  1912719 gtttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtagagtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttac 1912818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 479 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 30963362 - 30963127
Alignment:
Q  479 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagtt 578  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    |||||||| || ||||||    
T  30963362 tgcatgattgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaagatgcatcttatttttggtagcccaaatcataagaattcaacagtt 30963263  T
Q  579 aagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgt 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  30963262 aagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgagtgaccttcttggaagtttctcggaaagcgtgcgagtgaggataaaatacgttgaaaagactcgtgt 30963163  T
Q  679 tggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  30963162 tggtttgtgaggtcaatcggcaatcatgaaagcagt 30963127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 432 - 610
Target Start/End: Original strand, 29804682 - 29804860
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29804682 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggcaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 29804781  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatg 610  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29804782 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatg 29804860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 465 - 631
Target Start/End: Original strand, 11388221 - 11388386
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11388221 tgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccata 11388319  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  11388320 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactaggaagtttc 11388386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 451 - 728
Target Start/End: Original strand, 1707060 - 1707337
Alignment:
Q  451 ggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttgg 550  Q
    ||||||| || || |||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1707060 ggatcctgagactgtgtaggtatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttgg 1707159  T
Q  551 tagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtga 650  Q
    |||| | |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | | || |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1707160 tagcccatctcataagaactccacagttaagagtgtttgacttgaagtagtctttggatgggtgacctaccaggaagtttcccggtaagcgtgcgagtga 1707259  T
Q  651 ggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacag 728  Q
      | |||| || || |||||| ||| |||| ||| | || |||||||||||| || ||||  ||||| | ||||||||    
T  1707260 atacaaaacacgctaaaaagattcgcgttgatttatagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttacag 1707337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 538 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 32377756 - 32377577
Alignment:
Q  538 atcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagta 637  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |  |||    
T  32377756 atcttgttttcggtagctcattccaaaagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccggaaagttttccggta 32377657  T
Q  638 agcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32377656 agcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaaactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctg 32377577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 564 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 32377921 - 32377758
Alignment:
Q  564 aagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactc 663  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| || |    
T  32377921 aagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgatctactgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgc 32377822  T
Q  664 tgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32377821 tgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 32377758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 432 - 702
Target Start/End: Original strand, 33174505 - 33174772
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33174505 aatcacatcggaatgagagggatcctgatgccgtgtaggtatgggactaca--gttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 33174602  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||  ||||||||  |||    
T  33174603 agatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacataccgggaa-attc 33174701  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |  |||||||||||||| |||| |||| |  ||  |||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||    
T  33174702 ccggtaagcgtgcgagttaggaaaaaacatgctagaaagacccgtgtttgtttgtagggtcagtcgacaat 33174772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 470 - 683
Target Start/End: Original strand, 15619936 - 15620149
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | | |  |||||||||||    
T  15619936 gtatgagactgcatagttgaaggcaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttctttttggaaacccaatccataagaac 15620035  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaa 669  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||    
T  15620036 tccacaattaagcgtgcttgactttgagtagtctttggatgggtgacctactgggaagtttctcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaactcgctgaaaa 15620135  T
Q  670 gactcgtgttggtt 683  Q
    ||||||||||||||    
T  15620136 gactcgtgttggtt 15620149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 489 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 30961972 - 30961732
Alignment:
Q  489 aaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgctt 588  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30961972 aaggaagtcttataagatttgattggtactacctatatcaacaagatgcatatttttttcggtagccgaaaccataagaactccacagttaaacgtgctt 30961873  T
Q  589 gacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgg 688  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  30961872 gacttagagcaattttgggatgggtgaccttctgggtagtttctcagaaagcgtgcgagtgaggacaaaacacagtgaaaagacttgtgttagtttgtgg 30961773  T
Q  689 gctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagt 729  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  30961772 ggtcaatcggcaatcatgaaaggagtctttggtgttacagt 30961732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 465 - 631
Target Start/End: Original strand, 11394568 - 11394732
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  11394568 tgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttaaaa-aattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcta-ttccata 11394665  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  11394666 agaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactaggaagtttc 11394732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 479 - 727
Target Start/End: Original strand, 15639781 - 15640029
Alignment:
Q  479 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagtt 578  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| | | |  |||| |||||||||||| ||    
T  15639781 tgcatagttgaaggcacgcttataggaattgtttggtactacctatatcaacaacatacatcttctttttggaaacccaatccacaagaactccacaatt 15639880  T
Q  579 aagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgt 678  Q
    ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  15639881 aagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctactgggaagtttctcgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcagaaaagactcgtgt 15639980  T
Q  679 tggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||| || || |||||||||||| || ||||  ||||| | |||||||    
T  15639981 tggttggtagggtcagtcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 15640029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 479 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 30963819 - 30963569
Alignment:
Q  479 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagtt 578  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||| ||||||||||||    
T  30963819 tgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtatggttctacctatatcaacaagatgcatcttctttctggtagcccaaaccataataactccacagtt 30963720  T
Q  579 aagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgt 678  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||  |  ||||||||    | || |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |    
T  30963719 aagcgtgcttgacttggcggagttttgggataggtgaccttctaggaagtttgtcggaaaccgtgcgagtgaggacaaaacacagtgaaaagactcgttt 30963620  T
Q  679 tggtttgtgggctcagtcggca--atcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||  |||||||||    
T  30963619 tggtttgtgggatcagtcggcactttcctgaaagaagtcttgggtgttaca 30963569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 446 - 729
Target Start/End: Original strand, 83031 - 83314
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||  | || ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  83031 gagagggatcctgagattgtgcaggtatgagactacatggttgaaggtatgcttataagaatcgtttggtactacctataccaacaagatgaatcttttt 83130  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||  ||||||    ||| | |||   || ||| |||||    
T  83131 tttggtagctcattccataagaactctacagttaagcgtgtttgatttggaacaattttgtgatatgtgacctttagggtaatttttcagaaagtgtgcg 83230  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagt 729  Q
    |||||||| |||| ||  ||| ||||||  |||||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||| | |||||||||    
T  83231 agtgaggacaaaacacgttgataagacttatgttggtttgtggggttattcggcaatcatgaaagtagtctgagatgttacagt 83314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 432 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 18099024 - 18098874
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18099024 aatcacatcggaatgagaggaatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 18098925  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagc 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18098924 agatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccatagttaagc 18098874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 432 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 27883072 - 27882818
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| ||||  || | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |    
T  27883072 aatcacaccgaaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgagactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtattatctatatcaata 27882973  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||| || | |||||||     
T  27882972 agatgcatcttcttttttgtaggccgttccataagaactccacaattaagcgtgtttgacttggagtagtctttggataggtgacctactgagaagtttt 27882873  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
       ||||| |||| ||| |||| |||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  27882872 tcggtaagtgtgcaagtcaggacaaaacacgctgaaaagaatcttgttggtttgt 27882818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 431 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 38899059 - 38898867
Alignment:
Q  431 aaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaac 530  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||| | ||||  |||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38899059 aaatcacatcggaaggagagtgatcttgaggccgtgtaggtatcagactacatggttgaaggagagcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 38898960  T
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgg 623  Q
    ||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||| ||||||| |||||    
T  38898959 aagatgcattttctttttggtaacacatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttagagtagtctttggataggtgacctaccgg 38898867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 476 - 710
Target Start/End: Original strand, 13191018 - 13191252
Alignment:
Q  476 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccaca 575  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||| |    
T  13191018 gactgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatcttctttttggtagtccattttataagaactccata 13191117  T
Q  576 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcg 675  Q
    |||| | |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||  | || |||||||  |  ||||||| || || ||| |||| || || |||||||| |    
T  13191118 gttatgtgtgcttgacttgaagaaattttgagataggtgaccttctggaaagtttctcaaaaagcgtgtgaatgcggacaaaacacgctaaaaagactag 13191217  T
Q  676 tgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    ||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||    
T  13191218 tgttggtttatggagtcagtcgacaatcttgaaag 13191252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 470 - 586
Target Start/End: Original strand, 20502061 - 20502176
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  20502061 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactttctatatcaacaagatgcttctt-tttttggtagcccatttcataagaac 20502159  T
Q  570 tccacagttaagcgtgc 586  Q
    | |||| |||| |||||    
T  20502160 ttcacaattaaacgtgc 20502176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 422 - 712
Target Start/End: Original strand, 1953145 - 1953434
Alignment:
Q  422 ggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcc 521  Q
    ||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||| | |   || ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  1953145 ggcaaaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacctataagaattgtttggtactacc 1953244  T
Q  522 tatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaacc 621  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||  ||| ||  ||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||| |||        
T  1953245 tatatcaactagatgcatcttctttttggtagtccaaaccataattacttcatggttaagcatgcttaactttgcgctattttgggatgggttacctttt 1953344  T
Q  622 gggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagca 712  Q
     |||||| ||  || |||  |||||||||||| |||||||  |||||| |||| |||||| | ||||  || |||||||||| ||||||||    
T  1953345 aggaagtatctcagaaagtatgcgagtgaggacaaaatac-gtgaaaaaactcatgttggatggtggagtcggtcggcaatcatgaaagca 1953434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 484 - 710
Target Start/End: Original strand, 8073944 - 8074170
Alignment:
Q  484 ggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcg 583  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||||| || |||||     
T  8073944 ggttgaagggagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcatcttctttcttgtagcccatttcataagaactccatagataagcc 8074043  T
Q  584 tgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtt 683  Q
    | ||||||||||   |||||||||||| ||||||  || | |||||||     ||| ||| || |||| | |||| ||  |||||| ||| ||||| |||    
T  8074044 ttcttgacttggttaaattttgggatgagtgaccttccagaaagtttctcgaaaagtgtgtgattgagaacaaaacacgatgaaaaaacttgtgtttgtt 8074143  T
Q  684 tgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  8074144 tgtgggatcagtcgacaatcttgaaag 8074170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 20509503 - 20509391
Alignment:
Q  16 ggtgagttgcttgaggaaagctcggagcttcctcg-------ctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtctta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20509503 ggtgagttgcttgaggaaagctcagagcttcctcgtttacggctttttcggagtctagtgtgtcgactctgattaggatgtctttctgtttggagtctta 20509404  T
Q  109 tgactagttgttg 121  Q
    |||||| ||||||    
T  20509403 tgactatttgttg 20509391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 481 - 711
Target Start/End: Original strand, 16542034 - 16542263
Alignment:
Q  481 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatc-ttctttttggtagctcgttccataagaactccacagtta 579  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16542034 catggttgaaggaagacttataataattgttttgtactacctatatcaacaagatgtatcttttttttttatagctcattccataaaaactctacagtta 16542133  T
Q  580 agcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgtt 679  Q
    |  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||  | ||  ||||||||| | | |||| ||| ||| |||  |||| | ||| ||| || |||||||    
T  16542134 aatgtgtttgacttggagcaattttaggatgagtgctctactaggaagtttcttggaaagcttgcaagtaagg--aaaacattctaaaatgattcgtgtt 16542231  T
Q  680 ggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagc 711  Q
    ||||||| || | ||||| ||||| |||||||    
T  16542232 ggtttgtaggatgagtcgacaatcttgaaagc 16542263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 432 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18448064 - 18447954
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  18448064 aatcacatcggaatgatagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaagtaagacttataagaattgtttggtactacttgtatcaaca 18447965  T
Q  532 agatgcatctt 542  Q
    |||||||||||    
T  18447964 agatgcatctt 18447954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28772342 - 28772213
Alignment:
Q  209 ttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagc 308  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||| |||||| |||||| |||||   |||||||||||    
T  28772342 ttattccactgcgatgttttgagaaaa---ttatttatgcatgtttggtgaattactggcgaagtagcatctaaattctttatatgattgtatcattagc 28772246  T
Q  309 ataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  28772245 gtaatttattgcttttagactttaggatgttac 28772213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 467 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 8181462 - 8181254
Alignment:
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctc----gttcca 562  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||     |||||    
T  8181462 taggtatgggactttgtggttgaaggaagacttttaagaattgtttggtactacctatatcaacaaga-----------tttggtagctcatatattcca 8181374  T
Q  563 taagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatact 662  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   |  ||||| | |  | |||||||||||| || ||||||||| |   ||| ||||| |||||||| |||| ||     
T  8181373 taaaaactccacagttaagcgtgc---atctggagtagtcgttggatgggtgacctactgggaagttttccgataaacgtgcaagtgaggacaaaacacg 8181277  T
Q  663 ctgaaaagactcgtgttggtttg 685  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8181276 ctgaaaagactcgtgttggtttg 8181254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 341
Target Start/End: Original strand, 30622013 - 30622112
Alignment:
Q  242 tttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |   ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  30622013 tttatgaatgcttggtgaattattgaagaagtaacatctaaattctttatacgattgtatcattagcgtaatttatcgctttcagagtttaggttgttac 30622112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 341
Target Start/End: Original strand, 30624634 - 30624733
Alignment:
Q  242 tttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |   ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  30624634 tttatgaatgcttggtgaattattgaagaagtaacatctaaattctttatacgattgtatcattagcgtaatttatcgctttcagagtttaggttgttac 30624733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 340
Target Start/End: Original strand, 24533882 - 24533984
Alignment:
Q  238 attatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtg 337  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||||    | |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  24533882 attatttatgcatgcttggtgaattattcaagaagtaacatctaaattctttatatgattttgtcattagcgtaatttatcgtttttagagtttagtgtg 24533981  T
Q  338 tta 340  Q
    |||    
T  24533982 tta 24533984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 663 - 727
Target Start/End: Original strand, 29804878 - 29804942
Alignment:
Q  663 ctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  29804878 ctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 29804942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 483 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 36924519 - 36924452
Alignment:
Q  483 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgc--ctatatcaacaagatgcatcttcttttt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  36924519 tggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtattacttatatatcaacaagatgcatcttcttttt 36924452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 341
Target Start/End: Original strand, 30667766 - 30667865
Alignment:
Q  242 tttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |   ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30667766 tttattcatgcttgatgaattattgaagaagtaacatcgaaattctttatacgattgtatcattagcgtaatttatcgcttttaaagtttagggtgttac 30667865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 593
Target Start/End: Original strand, 37552606 - 37552726
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    |||||||||||||||||  || || | |||||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||| |||||||||||| ||| | |||| ||||||     
T  37552606 gtatgggactgcatggtcaaacga-gacttataagaattgtttggtactacatata-caaaatgatgc-tcttctttttggcagcgcattccgtaagaat 37552702  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgactt 593  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  37552703 tccacagttaagcatgcttgactt 37552726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 626 - 710
Target Start/End: Original strand, 11389677 - 11389761
Alignment:
Q  626 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  11389677 agtttcctggtaagcatgcgagtgagaataaaacatgctgaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaag 11389761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 626 - 710
Target Start/End: Original strand, 11406338 - 11406422
Alignment:
Q  626 agtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  11406338 agtttcctggtaagcatgcgagtgagaataaaacatgctgaaaaaactcatgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaag 11406422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 558 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 18876005 - 18875874
Alignment:
Q  558 ttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaa 657  Q
    |||||||| ||||| |||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |  | |  ||||||| |   || |||||||||||||| |||    
T  18876005 ttccataaaaactcaacaacttagcgtgcttgattttgagcaattttgggatgggtgatcttctgaaaagtttcttgaaaatcgtgcgagtgaggacaaa 18875906  T
Q  658 atactctgaaaagactcgtgttggtttgtggg 689  Q
    | || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18875905 acacactgtaaagacacgtgttggtttgtggg 18875874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 640 - 702
Target Start/End: Original strand, 20502172 - 20502234
Alignment:
Q  640 cgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  20502172 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttagtttgtagggtcagtcggcaat 20502234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24300936 - 24300834
Alignment:
Q  238 attatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtg 337  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||   ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24300936 attatttatgcattgttgatgaattattgaagaagtaacatctaaattttgtatatgattgtatcattaacctaatttatcgcttttagagtttaggatg 24300837  T
Q  338 tta 340  Q
    |||    
T  24300836 tta 24300834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 341
Target Start/End: Original strand, 30665338 - 30665442
Alignment:
Q  242 tttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcat-----tagcataatttatcgcttttagaatttagggt 336  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |   |||||||     |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  30665338 tttatgcatgcttggtgaattattgaagaagtaacatctaaattctttatacgattgtatcattagcgtagcgtaattaatcgcatttagagtttagggt 30665437  T
Q  337 gttac 341  Q
    |||||    
T  30665438 gttac 30665442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 624 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 36924435 - 36924373
Alignment:
Q  624 gaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  36924435 gaagttttctggttagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgt 36924373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22574898 - 22574853
Alignment:
Q  296 ccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22574898 ccgtatcattagcgtaatttatcgctttgagagtttagggtgttac 22574853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 482 - 554
Target Start/End: Original strand, 9909142 - 9909214
Alignment:
Q  482 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagc 554  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||  |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  9909142 atggttgaaggagggtttataatgattaattggtactacctataccaacaagattcaacttctttttggtagc 9909214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26864905 - 26864841
Alignment:
Q  489 aaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag 553  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  26864905 aaggaaggcttgtaagaactctttggtactacctacatcgacaagatgcatcttccatttggtag 26864841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30963498 - 30963429
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttgg 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||| ||  | |||||||||||||||    
T  30963498 tgtaacgcctacgcttggtgggcatgtaacgcctgacaccggcgagggaggaaaatggtccggctcttgg 30963429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 105630 - 106015
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  105630 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggggagtggtctggttcctggcatgcttctaggcaaaactaaatcacatcg 105729  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||||  |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  105730 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggaactgcagggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaaaatgcatct 105829  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  105830 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgtgtgacctaccgagaagtttcctggtaagcg 105929  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  105930 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttatagggtcagtcggcaattctgaaagcagtctgagatgttaca 106015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 3887293 - 3886908
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  3887293 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccagctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacatcg 3887194  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||| |||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3887193 gaatgagagtgatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatatgaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatct 3887094  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  3887093 tcttttcggtaactcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctactgggaagtttcccagtaagcg 3886994  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3886993 tgcgagtgaggacaaaacacgctgacaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 3886908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 342 - 717
Target Start/End: Original strand, 2474315 - 2474690
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  2474315 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 2474414  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||| ||||||||||   |  || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2474415 gaatgagagagatcctaaggtcgtacagatatgggactgcatggttgaaggaagacttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 2474514  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||     
T  2474515 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgagatgggtgacctaccggaaagtttcccggtaagca 2474614  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2474615 tgcgagtgaggaaaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctg 2474690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 3886837 - 3886452
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| | | ||||||| ||| |||| | ||||||| ||    
T  3886837 tgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggaatggtccggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcg 3886738  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| |||   |  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3886737 gaatgagagggatcctgaggtcgtacaagtatgggactgcatggtagaaggaatgcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 3886638  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3886637 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacgtggagcaatttttggatgggtgacctaccgggaagtttcccagtaagcg 3886538  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  3886537 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcattctgggatgttaca 3886452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 342 - 705
Target Start/End: Original strand, 22556446 - 22556810
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  22556446 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctaatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 22556545  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22556546 gaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 22556645  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||    
T  22556646 tcttttcggtagctcattctttaagaacttcacagttaagcgtggctgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccaggaagtttctcggtaagcg 22556745  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctg-aaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcct 705  Q
    |||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  22556746 tgcgagtgaggacaaaacacgctgtaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatcct 22556810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 340 - 714
Target Start/End: Original strand, 2473867 - 2474231
Alignment:
Q  340 actgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacac 439  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||  ||| |||||| |||||||     
T  2473867 actgtaacacctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaagctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttttaggaaaaactgaatcacat 2473966  T
Q  440 cggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcat 539  Q
    ||||  ||||||||||||||||   |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2473967 cggaatgagagggatcctaaggtcgtacaggcatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcat 2474066  T
Q  540 cttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaag 639  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||  |||||    
T  2474067 cttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc----------tatcccggtaag 2474156  T
Q  640 cgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2474157 cgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagt 2474231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 337 - 731
Target Start/End: Original strand, 188985 - 189367
Alignment:
Q  337 gttactgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatca 436  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||| |||  |||||||||| |||            |||||||||| |||||    
T  188985 gttagtgtaacgcctccgcttggtgggcatataacacccgaggctgatgaggacgggaagtggtccggttct------------aggcaaaactgaatca 189072  T
Q  437 caccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatg 536  Q
    || ||||  |||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  189073 catcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatg 189172  T
Q  537 catcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagt 636  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||    
T  189173 tatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcccggt 189272  T
Q  637 aagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagtta 731  Q
    || |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  189273 aaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtgggatcagtccgcaatcctgaaagtagtctgggatgttacagtta 189367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 446 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 8642166 - 8641886
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8642166 gagagggatcctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 8642067  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||    
T  8642066 ttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttaagatgggtgaccta-cgggaagtttctcggtaagcgtgcg 8641968  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8641967 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 8641886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 357 - 708
Target Start/End: Original strand, 22556894 - 22557246
Alignment:
Q  357 tggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcc 456  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||| | ||     
T  22556894 tggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttcttggcaaaactgaatcacatcggaatgagagagttca 22556993  T
Q  457 taaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctc 556  Q
    | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22556994 tgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactaccaatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctc 22557093  T
Q  557 gttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataa 656  Q
     |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  22557094 attctttaagaacttcacagttaagcgtgcctgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaa 22557193  T
Q  657 aatactctg-aaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaa 708  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  22557194 aacacgctgtaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatcctgaa 22557246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 34371612 - 34371907
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||  |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34371612 aatcacaccggaatgagagggttcccaaggccgtacaggtgtgggactgcatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaaca 34371711  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34371712 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacaccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 34371811  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34371812 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34371907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 446 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 17445587 - 17445323
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17445587 gagagggatcctgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 17445488  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
     | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  17445487 atcggtagctcattccataagaaatccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcg 17445388  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17445387 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaag 17445323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 343 - 686
Target Start/End: Original strand, 1821817 - 1822160
Alignment:
Q  343 gtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccgg 442  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  | ||| ||| |||    
T  1821817 gtaatgcctctgcttggtgggcatgtaacgtctgaggctgacgagggtggggagtggtccggctcatggcatgcttctaggcaaagttgaattacatcgg 1821916  T
Q  443 agcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatctt 542  Q
    |  ||||| |||| |||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1821917 aatgagagagatcttaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 1822016  T
Q  543 ctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgt 642  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  1822017 ctttttggtagcccattccataagaactccacatttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgt 1822116  T
Q  643 gcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    | || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1822117 gtgaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 1822160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 432 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 15513159 - 15512873
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaag--gcttataagaattgtttggtactgcctatatcaa 529  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  15513159 aatcacatcggaatgagagggatcattaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatatgcttataagaattgtt-ggtactaccaatatcaa 15513061  T
Q  530 caagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtt 629  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15513060 caagatgcatcttctttttggtatctcattccataagaactccacaattaaacgtgcttgacttgaagcaattttgggatggatgacctaccgggaagtt 15512961  T
Q  630 tcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15512960 tcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 15512873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 42788792 - 42788497
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||  ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42788792 aatcacaacggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggattgggactacatggttgaaagaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 42788693  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42788692 agatgcatcttcttttcggtagctcattccacaagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggataggtgacctaccgggaagtttc 42788593  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
       |||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42788592 tcggtaagcttgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggagtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 42788497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 470 - 717
Target Start/End: Original strand, 34372106 - 34372353
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34372106 gtatgggactacatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaac 34372205  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaa 669  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  34372206 ttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggattggtgacctaccgggaagttttccgataagcgtgcgagtgaggaaaaaacacgctgaaaa 34372305  T
Q  670 gactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
     |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34372306 tactcgtgttggtttatggcgtcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 34372353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 2193816 - 2194099
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||| |||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2193816 aatcacgccggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 2193915  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             
T  2193916 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccg--------- 2194006  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
       ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  2194007 ---gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 2194099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 432 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 21886292 - 21886065
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21886292 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacatatatcaaca 21886193  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21886192 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaaagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 21886093  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaat 659  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  21886092 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaat 21886065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 432 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 10927549 - 10927277
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10927549 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 10927450  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||     
T  10927449 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccgaccgggaagtttt 10927350  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcc 704  Q
       ||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||    
T  10927349 tcggtaagcgtgtgaatgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcggtcgacaatcc 10927277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 432 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 27646981 - 27646727
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27646981 aatcacatcggaatgagagggatcctagggccgtgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctataacaaca 27646882  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || | |||||||||| |||||||||||||    
T  27646881 agatgcatcttctttttggtagcccatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgtcttggagtagtctttgcatgggtgacctaccgggaagtttc 27646782  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    | | ||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  27646781 ccaataaacgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcatgttggtttgt 27646727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 34867790 - 34868073
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34867790 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 34867889  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||             
T  34867890 agatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccatagttaagcgtgcttaactttgagcaattttgggataggtgacttaccg--------- 34867980  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
       |||||||||| ||| |||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34867981 ---gtaagcgtgcaagtaaggacaaaacacgctaaaaagactcgtgttgatttgtgggatccgtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 34868073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 432 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 8391467 - 8391203
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| || ||||  |||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8391467 aatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtgtaggcatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtact-cctgtatcaaca 8391369  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8391368 agatgcatcttcttttcggtagctaattccataagaactccatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 8391269  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcg 697  Q
        ||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8391268 tcgataaacgtgcgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcg 8391203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 446 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 10927078 - 10926871
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10927078 gagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcct 10926979  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10926978 tttggtagtccattccataagaactccacagttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcgtgtg 10926879  T
Q  646 agtgagga 653  Q
    ||||||||    
T  10926878 agtgagga 10926871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 432 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 20039620 - 20039367
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20039620 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtataggactacatagttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20039521  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | | || |||| ||||||| |  ||||||||||    
T  20039520 agatgcattttc-ttttggtagcccattccataagaactctacagttaagtgtgcttgacttagagtagtctttggattggtgacctattgggaagtttc 20039422  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  20039421 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcatgttggtttgt 20039367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 468 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 18750306 - 18750078
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  18750306 aggtttggaactgcatggttgaaggaaggattataacaattgtttggtactacctataccaaaaagatgcatcttcttttcggtagcttattccataaga 18750207  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||| || |||||    
T  18750206 actccataattaatcgtacttgacttggagcaattttaggatgggtgaccttctaggaagttttttagaaagtgtgcgagtgaggacaaaacacactgaa 18750107  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtc 696  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18750106 aagactcgagttggtttgtggggtcagtc 18750078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 465 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 29680213 - 29679983
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  29680213 tgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataag-------tggtaatacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattacata 29680121  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactct 664  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||  ||| |||||||||   ||||||||| | |||||| |||| || ||    
T  29680120 agaactccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtctttggatgggtgaccttccgagaagtttcccgataagcgtgcaaatgaggacaaaacacgct 29680021  T
Q  665 gaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29680020 gaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcggcaat 29679983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 30684792 - 30684407
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||  ||||| |  ||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  30684792 tgtaatgcctctgcttggtggtcatgtaacgtccgagactgacaagggcaggtagtggtccgactcctggcatgcttataggcaaaaccaaatcacatcg 30684693  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||| |||||||| ||| | || | |||||| ||  ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  30684692 gaatgagggggatcctgaggttgtgcaagtatggaacatcattgttgaagggaggcttatatgaattgtttggtactatctataaaaacaagatgcatct 30684593  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||     |||||    
T  30684592 tcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacagttaagcgtgctcaacttggagcaattttgggatgggtgaccttctgaaaagtttctcgaaaagcg 30684493  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||| |||| ||||||  || ||||||||| | ||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||| || | |||||||    
T  30684492 tgcgagtaaggacaaaatatactaaaaagactcatattgatttgtggggtcaatcgtcaatcctaaaaacagtatgagatgttaca 30684407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 446 - 727
Target Start/End: Original strand, 39146953 - 39147227
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  39146953 gagagggatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtagacttataagaattgtttgatactacttatattaacaagatgcatcttctt 39147052  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |  ||||||||||| || |||||       ||||||||||||    
T  39147053 tttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtcgtatgatgggtgacctactgggaa-------agtaagcgtgcg 39147145  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    || ||||| |||| || ||  |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || ||||  ||||| | |||||||    
T  39147146 agagaggacaaaaaacgctagaaagactcatgttggtttgtagggtcaatcggcaatgcttaaagtcgtctgggatgttaca 39147227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 431 - 705
Target Start/End: Original strand, 18304430 - 18304704
Alignment:
Q  431 aaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaac 530  Q
    |||||||| ||||  |||| ||||||| |||   ||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  18304430 aaatcacaacggaatgagaaggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggatgatgaaaagcttatataaattgtttggtactacctatatcaac 18304529  T
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    | |||||||    
T  18304530 aagatgcatattcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcatgtttgacttggagcaattttgtgatgggtgaccttttgagaagttt 18304629  T
Q  631 cctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcct 705  Q
    |  || ||  ||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||    
T  18304630 cacagaaattgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaacaaactcgtgttgatttctggggtcagatggcaatcct 18304704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 486 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 20858633 - 20858390
Alignment:
Q  486 ttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtg 585  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||    
T  20858633 ttgaagaaaggcttataagaattgtttggtattttctatatcaacaagatgcttcttcttttctgtagctcattccataagaactccatagttaaggttg 20858534  T
Q  586 cttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttg 685  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||| ||   |||| ||| |||||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  20858533 cttgacttggagcaactttgggat-ggtgaccttctgggaagttttctgaaaagcatgctagtgaggacaaaacacgctgaaaatactcgtgttgatttg 20858435  T
Q  686 tgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagtt 730  Q
    |  | ||||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  20858434 ttaggtcagtcgacaatcctgaaagaagtttgggatgttacagtt 20858390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 512 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 11757347 - 11757145
Alignment:
Q  512 tggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 611  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||    
T  11757347 tggtactacttatatcaacaaaatgcatcttcttttcggtagttcaatccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttacagcaatttcgagatgg 11757248  T
Q  612 gtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagc 711  Q
    |||||| |||||||| |||    ||||||||| |||||||||  |||| | || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  11757247 gtgacctaccgggaaatttttcggtaagcgtgtgagtgaggacgaaatccgcttaaaagactcttgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctaaaagc 11757148  T
Q  712 agt 714  Q
    |||    
T  11757147 agt 11757145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 342 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 30720041 - 30719767
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||    ||||||||| ||| ||  | ||||   ||||||||  ||||||| |     
T  30720041 tgtaacgcctccacttggtgggcatgtaacgtccgagactgacaagggcatgtagtggtccgactcctgacacgcttattggcaaaaccgaatcacatca 30719942  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||| | || | |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  30719941 gaatgagagggatcctgaggttgtgcaagtatgggacatcattgttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctataaaaacaagatgcatct 30719842  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 616  Q
    |||||| ||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30719841 tcttttcggtaggtcaaaccataagaactccacaattaagcgtgctcaacttggagcaattttgggacgggtgac 30719767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 482 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 24182341 - 24182114
Alignment:
Q  482 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaag 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |   |||||| ||||  |||||||||    
T  24182341 atggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactatctataccaacaagatgcatcttc-tttcggtaccccaaaccataataacttaacagttaag 24182243  T
Q  582 cgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttgg 681  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    |||||||   | ||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||    
T  24182242 cgtggttgacttggagcaattttgggatgggtgaccttctaaaaagtttctcggaaagtgtgcgagtgaggataaaacacgttgaaaagattcgtgttgg 24182143  T
Q  682 tttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  24182142 tttgtggggttagtcgacaatcctgaaag 24182114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 446 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 16370840 - 16370673
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||    
T  16370840 gagagggttcctgatgccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagacgtatcttctt 16370741  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 616  Q
    |||||||||    |  || ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16370740 tttggtagc---ctaaatcagaaccccgcagttaagcatgtttgacttggagcaattttgggatgggtgac 16370673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22975221 - 22975076
Alignment:
Q  367 gtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatg 466  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  ||    
T  22975221 gtaacgcccgaggctgatgagggcgaggagtggtccagctcttggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtg 22975122  T
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttt 512  Q
     ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22975121 caggtatgtgactgcatggttgaagaaaagcttataagaattgttt 22975076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19266370 - 19266253
Alignment:
Q  222 atgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgct 321  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  19266370 atgttttgagaaagtttttatttatgcatgattgatgagttattgaagaagtaacatctagattcttgatatg-ccgtataattagcgtaatttatcgct 19266272  T
Q  322 tttagaatttagggtgtta 340  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  19266271 ttgagagtttagggtgtta 19266253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 481 - 611
Target Start/End: Original strand, 42429194 - 42429324
Alignment:
Q  481 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||| || ||||||    
T  42429194 catggttgaaggaggacttataagaattgtttggtactacctttatcaacaatatgcatattcttttccgtagcccgttacataagaacttcatagttaa 42429293  T
Q  581 gcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 611  Q
    | |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  42429294 gggtgcttgacttaaagcaattttggaatgg 42429324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 239 - 341
Target Start/End: Original strand, 22433460 - 22433562
Alignment:
Q  239 ttatttatgcatgcttggtgattta-ttgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtg 337  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22433460 ttatttatgcatgttttgtgatttaattgaagatgtaacatctagattcttgatatg-ccgtatcattagcgtaatttatcgctttgagagtttagggtg 22433558  T
Q  338 ttac 341  Q
    ||||    
T  22433559 ttac 22433562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 465 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 32574770 - 32574632
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||  |||||||||| |   | |||    
T  32574770 tgtaggtatgagactgcacggttaaag-aaggcttataggaattgtttggtactacctatacaaacaaaatgcatctttcttttggtagcccaaactata 32574672  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 604  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32574671 ataacttcatagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 32574632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 686
Target Start/End: Original strand, 1880120 - 1880330
Alignment:
Q  471 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaact 570  Q
    |||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||   ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    ||||| |||||||    
T  1880120 tatgtgactgcatggttgaaggaagt----taagaattgtccagtacttcctatattaacaa-atgcatattctttttggtagtctattccacaagaact 1880214  T
Q  571 ccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaag 670  Q
    | |||||||||||||| ||| |||| | ||| || |||| | ||||  ||  ||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  1880215 ctacagttaagcgtgcatgagttggtgtaatatttggatagatgacttactaggaagttttatggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgctgaaaag 1880314  T
Q  671 actcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||||||||||||||    
T  1880315 actcgtgttggtttgt 1880330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 481 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 4673568 - 4673466
Alignment:
Q  481 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  4673568 catgattgaaggaagtcttataagaattatttggtagcacctgtatcaacaagatgcatattctttttggtatttcattccataagaactccacagttaa 4673469  T
Q  581 gcg 583  Q
    |||    
T  4673468 gcg 4673466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39606656 - 39606549
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatta 306  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39606656 ttttattccgctgcgatgttttgagaaa----ttgttcatgcatgcttggtgatttattgaagaagtaacatctagattcttgatatgatcgtatcatta 39606561  T
Q  307 gcataatttatc 318  Q
    || |||||||||    
T  39606560 gcgtaatttatc 39606549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 562 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 30720276 - 30720111
Alignment:
Q  562 ataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaata 660  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |  | ||| ||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |    
T  30720276 ataagaactctacagttaatcgtgcttgacttggaacaattttgggatggatgactttcttgaaagctttccgaa-aagcgtgcgagcgaggacaaaaca 30720178  T
Q  661 ctctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  30720177 cgctgaaaagactcctgttggtttgtggagtcaatcgacaatcttgaaagcagtctgggatgttaca 30720111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 562 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 30685027 - 30684862
Alignment:
Q  562 ataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatac 661  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||   |  | |||||| |    |||||||| || ||||| |||| ||    
T  30685027 ataagaactctacggttaagtgtgcttgacttggaacaattttgagatggatgactttcttgaaagttttccgaaaagcgtgcaagcgaggacaaaacac 30684928  T
Q  662 tctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| || | |||||||    
T  30684927 gctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcttgaaagcagtttgagatgttaca 30684862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 468 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 4658102 - 4657956
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  4658102 aggtatgagacttcatggttgaacgaaga-ttataagacttgtttgatactacctataacaacaacatgcatcttctttttggtagtccattccataaga 4658004  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgac 616  Q
    ||| ||||||| | | |||||||||| ||   ||||||| |||||||||    
T  4658003 acttcacagtt-atcatgcttgacttagatatattttggaatgggtgac 4657956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22910882 - 22910812
Alignment:
Q  271 agtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22910882 agtaacatctagattcttgacatgcgcgtatcattagcgtaatttatcgcttttagagtttagggtgttac 22910812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 470 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 5066999 - 5066872
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    || ||||| |||    
T  5066999 gtatgagactgtatgattaaaggaaaacttataagaattgtttggtattatctatatcaacaagatgcattttctttttggtagtctatttcataaaaac 5066900  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggag 597  Q
    |||||| |||| |||| ||| |||||||    
T  5066899 tccacaattaaacgtgtttgccttggag 5066872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 532 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 5785954 - 5785901
Alignment:
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtg 585  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5785954 agatgcatcatctttttggtagctcgttccgtaagaactccacagttaagcgtg 5785901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 11160794 - 11160713
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttcttt 546  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  11160794 tgtaggtatgacactacatagttgaaggaaggcttataataattgtttggtactatctatgtcaacaagatgcatattcttt 11160713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 2058763 - 2058508
Alignment:
Q  471 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac- 569  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||   |||| | ||||||||||||     
T  2058763 tatgagactggatgattgaaggaagacttatatgaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcaaattctgttaaatagcacattccataagaact 2058664  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaa 669  Q
    |  | | |   |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||| |||    || |||| ||||||| | |||||||  ||||||    
T  2058663 ttgagact---ggatgcttgacttggagcaattttgggatgagtgaccttctaagaagtctcccgaaaaacgtgtgagtgagtacaaaatacattgaaaa 2058567  T
Q  670 gactcgtgttggtttgt-gggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
     ||||||||| |||||| ||| ||| | | |||||||||||||||| || | |||||||    
T  2058566 aactcgtgttagtttgtgggggtcaatagacaatcctgaaagcagtttgagatgttaca 2058508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 663 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 21884000 - 21883946
Alignment:
Q  663 ctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21884000 ctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcttgaaagcagtctg 21883946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 617
Target Start/End: Original strand, 4102924 - 4102981
Alignment:
Q  560 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4102924 ccataagaacttcacagttaaacgtgcttgacttggagcaattttgagatgagtgacc 4102981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 120
Target Start/End: Original strand, 22433263 - 22433381
Alignment:
Q  9 ttgcttgggtgagttg-cttgaggaaagctcggagcttcctcgcttttt------cggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttgg 101  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||      || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  22433263 ttgctttggtgagttggcttgaggatagcttggagctacctcgttttttttctttcgaagtctagtgtgtcggctctaattaggacgtctttatgttttg 22433362  T
Q  102 agtcttatgactagttgtt 120  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  22433363 agtcttttgactatttgtt 22433381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 43356729 - 43356600
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||||  |||  | ||| |||| |    
T  43356729 aggtatgagactgcatgattga-ggatgacttataagaattgtttggtacaacctaaaccaacaatatgcatcttctttttattagacctttctataaaa 43356631  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagc 598  Q
    |||||| | |||| |||| ||| ||||||||    
T  43356630 actccataattaaacgtgtttggcttggagc 43356600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 635 - 684
Target Start/End: Original strand, 187761 - 187810
Alignment:
Q  635 gtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggttt 684  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  187761 gtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttt 187810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 561 - 686
Target Start/End: Original strand, 8366595 - 8366719
Alignment:
Q  561 cataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaata 660  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| || | | || |||||||||||| || ||||||||| | | |||||| | |||||| || |||| |    
T  8366595 cataagaactctatagttaagcgtgtttgatttgaagtagtatttggatgggtgacctactgggaagttttccaataagcg-gtgagtgacgacaaaaca 8366693  T
Q  661 ctctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    |  |||||||||||||||||||||||    
T  8366694 cgttgaaaagactcgtgttggtttgt 8366719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 38063800 - 38063725
Alignment:
Q  606 ggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggt 682  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38063800 ggatgggtgacctactgggaagttttccggtaagcgtgcgaatgaggacaaaatacgctgaaaa-actcgtgttggt 38063725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 19266538 - 19266491
Alignment:
Q  73 ggctctgattaggatgtctttatgtttggagtcttatgactagttgtt 120  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19266538 ggctctgattatgacgtctttatgtttggagtcttatgactatttgtt 19266491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22652836 - 22652738
Alignment:
Q  243 ttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||||||||||| |||  |  |  |||||||||| |||||| ||||    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22652836 ttatgcatgcttggtgaattagaggcggtgtaacatctaaattctttatataattgtatcagtagcgtaatttatcgcttttagagtttagggtgttac 22652738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 558 - 615
Target Start/End: Original strand, 5785971 - 5786028
Alignment:
Q  558 ttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtga 615  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5785971 ttccataagaactctacgcttaagcgtgtttgacttggagcaattttaggatgagtga 5786028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 509 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 39801531 - 39801498
Alignment:
Q  509 gtttggtactgcctatatcaacaagatgcatctt 542  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39801531 gtttggtactacctatatcaacaagatgcatctt 39801498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 342 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 107699 - 107309
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  107699 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccgaggctgatgaggacggggagtggtccggttcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 107600  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||||||| || ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  107599 gaatgagagggattctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactaccaatatcaacaagatgcatct 107500  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  107499 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacgtaccgggaagtttcccggtaagcg 107400  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagttac 732  Q
    |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  107399 tgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggctattctgaaagcagtctgggatgttacacttac 107309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 342 - 728
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10595
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  10210 tgtaacgcctgcgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggtggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggtaaaactgaatcacatcg 10309  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10310 gaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatct 10409  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10410 ttttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt-ggatgggtgacctaccgggaagtttcctggtaagcg 10508  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacag 728  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| | | ||||||||    
T  10509 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagtagtcggggatgttacag 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 50055 - 49957
Alignment:
Q  244 tatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataa-tttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50055 tatgcatgtctggtgaattattgaagaagtaacatctaaattctttatatgactgtatcatttgcgtaattttatcgcttttagagtttatggtgttac 49957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 31284512 - 31284127
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  31284512 tgtaacgcctccgcttagtgggcatgtatcgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccgactcctggcatgcttctaggcaaaactgaatcacatcg 31284413  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||| | |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31284412 gaatgagagggatcttgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 31284313  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    |||||    
T  31284312 tcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctgccgggaagttttccgacaagcg 31284213  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||| ||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  31284212 tgcgagtggggacaaaacacgccgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcatgaaagcaatctgggatgttaca 31284127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 368 - 729
Target Start/End: Original strand, 8067216 - 8067577
Alignment:
Q  368 taacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgt 467  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| | ||||||| ||||  |||||||| ||| ||||  ||     
T  8067216 taacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaagcaaaattgaatcacatcggaatgagagggaccctgaggccgtgc 8067315  T
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  8067316 aggtatgggattgcatggttgaaggccggcttataagaattgtttagtactacctatatcaacaagatgcatctttttttcggtagctcattccataaga 8067415  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  8067416 actccatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 8067515  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagt 729  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  8067516 aagactcgtgttggtttgtgaggtcaatcggcaatcctaaaagcagtctgggatgttacagt 8067577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 32227367 - 32227072
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  32227367 aatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaaca 32227268  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32227267 agatgcatcttctttttggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 32227168  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  32227167 ccggtaagtgtgcgagtgaggaaaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 32227072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 427 - 727
Target Start/End: Original strand, 28561741 - 28562040
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28561741 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 28561840  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  28561841 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggat-ggtgacctacggggaa 28561939  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttac 726  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || | ||||||    
T  28561940 gtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggtaatcttgaaagcagtatgagatgttac 28562039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 367 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 27187541 - 27187190
Alignment:
Q  367 gtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatg 466  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | | ||||| ||| |||| | |||||||  |||  |||||||||||| ||||| ||    
T  27187541 gtaacgcccgaggctgatgagggcggcaagtggtccggctcctagcaagcttctaggaaaaattgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtg 27187442  T
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
     | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  27187441 catgtatgggactgcatggttaaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcactaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataag 27187342  T
Q  567 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgagga-taaaatactctg 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||| || |||    
T  27187341 aactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcgtgcgagtgaggacaaaaacacgctg 27187242  T
Q  666 aaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  27187241 aaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaattctgaaaacagtctg 27187190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 16811381 - 16811674
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  16811381 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtttgggactccatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatttcaaca 16811480  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16811481 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 16811580  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |   ||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16811581 ccgataagcatgcgagtgaggacaaa--acgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16811674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 446 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 11180166 - 11179895
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11180166 gagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 11180067  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||| |    
T  11180066 ttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggatgtttcccggtaagtgtgtg 11179967  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11179966 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctg 11179895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 50347746 - 50348041
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||| |||||  |||||||||||| ||||  |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50347746 aatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtatgtatgagactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 50347845  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50347846 agatgcatcttctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgagaagtttc 50347945  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |   |||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  50347946 ccgataagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 50348041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 427 - 727
Target Start/End: Original strand, 39653159 - 39653459
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  39653159 aactgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgttggatactacctatat 39653258  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39653259 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccatgagaactccacagttaagtgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 39653358  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttac 726  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| | ||||||    
T  39653359 gtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctaaaagcagtctgggatgttac 39653458  T
Q  727 a 727  Q
    |    
T  39653459 a 39653459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 14813949 - 14814244
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  14813949 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgagactgcatggttaaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaata 14814048  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||    
T  14814049 agatgcatcttcttttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgtgatgggtgacctaccgaaaggtttc 14814148  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  14814149 ccggtaagcgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggttagtcggcaatactgaaagcagtctgggatgttaca 14814244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 476 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 13150656 - 13150405
Alignment:
Q  476 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccaca 575  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13150656 gactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccaca 13150557  T
Q  576 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcg 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  13150556 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 13150457  T
Q  676 tgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  13150456 tgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 13150405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 468 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 32386844 - 32386585
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  32386844 aggtatgggactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatcttcttttcagtagctaattccataaga 32386745  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| || || ||    
T  32386744 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacccaccggaaagtttcttggtaagcgtccgagtgaggacaaaacacgctaaa 32386645  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  32386644 aagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctgacgtgttaca 32386585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 432 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 13150245 - 13149960
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  13150245 aatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaaca 13150146  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13150145 agatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagtttc 13150046  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
       ||||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13150045 tcggtaagtgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctg 13149960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 432 - 729
Target Start/End: Original strand, 32227501 - 32227797
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||| |||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  32227501 aatcacgccggaatgagagggatc-tgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaaca 32227599  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32227600 agatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 32227699  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagt 729  Q
    |   |||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  32227700 ccgataagtgtgcgagtgaggaaaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttacagt 32227797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 14820154 - 14820449
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||| || |  |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14820154 aatcacaccgcaatgagagggttcctgagcccgtgtaggtatggggctgcacggctaaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaaca 14820253  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  14820254 agatgcatcttattttcggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggaacaattttgggatgggtgacctatcggaaagtttc 14820353  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  |||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14820354 ccggtaagcatgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 14820449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 16810925 - 16811220
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| |||    
T  16810925 aatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtagatatgggactgcatggttgatggaaggcttataagaattgttgcgtactaactatatctaca 16811024  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16811025 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaacttcacatttaagtgtgcttgacttgtagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 16811124  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  16811125 cccgtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaaaagattcgtgttggtttgtggggtcggtcggcaatcctgaaagcaatctgggatgttaca 16811220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Original strand, 25248021 - 25248407
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||| || ||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  25248021 tgtaacgcctccgcttgatgggttagtaacgcccgaggctaatgagggtggggagtggtcaggctcctggcatgcttataggcaaaactgaatcacatcg 25248120  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248121 gaatgagagggattctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttaaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 25248220  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||  ||||| ||||| |||||||||||||   |||||||    
T  25248221 tctttttggtagcccattccataataactccacggttcagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatggatgacctaccgggaagtttcacggtaagcg 25248320  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctg-aaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  25248321 tgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaaagactcgtgttgatttgtgaggttagtcgacaatcctaaaagcagtctgggatgttaca 25248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 427 - 702
Target Start/End: Original strand, 30529682 - 30529956
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30529682 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaagtaaggcttataagaattttttggtactacctatat 30529781  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| | | ||||    
T  30529782 caacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaacttcatagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgaccta-ctggaa 30529880  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || || |||||||| |||||||||||  || | ||||||||||    
T  30529881 gtttcccagtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctaaaaagacttgtgttggtttgcagggttagtcggcaat 30529956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 345 - 632
Target Start/End: Original strand, 41472214 - 41472500
Alignment:
Q  345 aacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggag 444  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||  || |||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| || |||||| ||| ||||||| ||||     
T  41472214 aacgcctctgattggtgggcatgtaacgcccaaggctgaagagggtggtgagtggtccggctcctggcatgcatctaggcaagactgaatcacatcggaa 41472313  T
Q  445 cgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttct 544  Q
     |||||||||||| |||   |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41472314 tgagagggatcctgaggtcgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaag-cttataagaattgtttggtactacatatatcaacaagatgcatcttct 41472412  T
Q  545 ttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcc 632  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41472413 tttcggtagatcattccataagaactccacggttaaacgtgcttgacttgaaacaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcc 41472500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 446 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 25230837 - 25230587
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25230837 gagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctt 25230738  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| || || |||||||||||  |||||||||||    
T  25230737 tttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgccctactgggaagtttcccggtaagcgtgcg 25230638  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtc 696  Q
    ||||||   |||| || ||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25230637 agtgagatcaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtc 25230587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 446 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 25238424 - 25238174
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25238424 gagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcattttctt 25238325  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| || || |||||||||||  |||||||||||    
T  25238324 tttggtagcccattccataagaactcaacaattaagcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgccctactgggaagtttcccggtaagcgtgcg 25238225  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtc 696  Q
    ||||||   |||| || ||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25238224 agtgagatcaaaacacgctggaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtc 25238174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 465 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 20885230 - 20884993
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20885230 tgtaggtatgtgactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatcttctttttagtagcacattccata 20885131  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactct 664  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| ||| |||| |||| || ||    
T  20885130 agaactccacaattaagcgtgcttgacttggagtagtatttggatgggtgacctaccgggaaatttcccgttaagcgtgcaagttaggacaaaacacgct 20885031  T
Q  665 gaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  20885030 gaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtctgcaat 20884993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 484 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 4067454 - 4067236
Alignment:
Q  484 ggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcg 583  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4067454 ggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcattacataagaactccacagttaagcg 4067355  T
Q  584 tgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtt 683  Q
    |||||||||||||| | | || |||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||    
T  4067354 tgcttgacttggagtagtctttggatggatgacctaccggaaagttttctggtaagcgtgcaagtgaggacaaaacacgctgaaaagaccagtgttggtt 4067255  T
Q  684 tgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  4067254 tgtagggtcagtcggcaat 4067236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 342 - 650
Target Start/End: Original strand, 41473907 - 41474215
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||  ||||| ||| ||||||| ||    
T  41473907 tgtaacgcctccgcttgatgggcatgtaacgcctgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctagcatgcttctcggcaagactgaatcacatcg 41474006  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
     |  |||||||||| | |||   |  ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |    
T  41474007 aaatgagagggatcttgaggtcgttcaggtatgtgactggatggttaaaggaagacttataagaattgtttgatacttcctatatcaacaagattgatat 41474106  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||||||| | || ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||| ||||| ||    
T  41474107 tctttttggtggatcattctataaaaactccacagtcaagcgtgcttgacttggaacaattttgggatgggtgacataccagaaagtttcccagtaatcg 41474206  T
Q  642 tgcgagtga 650  Q
    |||| ||||    
T  41474207 tgcgggtga 41474215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 431 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 25230395 - 25230124
Alignment:
Q  431 aaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaac 530  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25230395 aaatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaac 25230296  T
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||| | | ||||||||    
T  25230295 aagatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctatcaggaagttt 25230196  T
Q  631 cctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
     |  ||||||| ||||||||||| |||| ||  || ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  25230195 tccggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgttggaaagactagtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 25230124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 431 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 25237982 - 25237711
Alignment:
Q  431 aaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaac 530  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25237982 aaatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaac 25237883  T
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||| | | ||||||||    
T  25237882 aagatacatcttctttttggtagcccattcaataagaactccacagttatgcgtgcttgacttggagtagtcttatgatgggtgacctatcaggaagttt 25237783  T
Q  631 cctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
     |  ||||||| ||||||||||| |||| ||  || ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  25237782 tccggtaagcgagcgagtgaggacaaaacacgttggaaagactagtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 25237711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 476 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 25238786 - 25238576
Alignment:
Q  476 gactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccaca 575  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25238786 gactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactatctttatcaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccaca 25238687  T
Q  576 gttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcg 675  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||| | ||||||||||  | |||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  25238686 gttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggattggtgacctatcgggaagttttttggtaagcatgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcg 25238587  T
Q  676 tgttggtttgt 686  Q
    |||||||||||    
T  25238586 tgttggtttgt 25238576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 446 - 730
Target Start/End: Original strand, 37045049 - 37045330
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  37045049 gagagggatcctgaggccgtgtaggtgtgggactacatgaatgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaacaaggtgcatcttctt 37045148  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| |||||||   ||||   ||||| ||||    
T  37045149 tttggtaccctattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccggga---ttcccgataagcatgcg 37045245  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagtt 730  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||  ||||| | ||||||||||    
T  37045246 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttacagtt 37045330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 342 - 702
Target Start/End: Original strand, 7477102 - 7477461
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||| ||  ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| | | ||| |||||||||  ||||||| ||    
T  7477102 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccgactcctggca-gtttctaggcaaaacataatcacatcg 7477200  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||||| |   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  7477201 gaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatacatct 7477300  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||| |   |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | || |||||| |||||    ||||| ||||   | |||||    
T  7477301 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttagagtagtcttaggatggctgaccttatgggaaatttctcggaaagcg 7477400  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||||||| | |||  ||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  7477401 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 7477461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 446 - 617
Target Start/End: Original strand, 39640951 - 39641122
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    ||||| |||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39640951 gagagagatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagagttgtttggtactacctatatcaataagatgcatcttctt 39641050  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||    
T  39641051 tttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgtttgacttggagcagtctttggattggtgacc 39641122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 342 - 702
Target Start/End: Original strand, 7493792 - 7494151
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||| ||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||  |||   ||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  7493792 tgtaacgccttcgcttggtgggtatgtaatgctcgaggctgatgaggacggggagtggtccggcttctggcg-gcttctaggcaaaacataatcacatcg 7493890  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  ||||| |||||||| |   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7493891 gaatgagagagatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaacaagatgcatct 7493990  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||| |   |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   | || | |||| |||||  |  |||| |||||    |||||    
T  7493991 tcttttcggtagcccaaaccataagaactccacatttaagcatgcttgacttggagttgtcttagcatggctgaccttctaggaaatttcccgtaaagcg 7494090  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||||||| | |||  ||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  7494091 tgcgagtgagaacaaagcacgttgaaaagactcatgttggtatgtggggtcagtcgacaat 7494151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 459 - 617
Target Start/End: Original strand, 29224351 - 29224509
Alignment:
Q  459 aggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgt 558  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |      
T  29224351 aggccatgtagatatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcatcttcttttcggtagcccaa 29224450  T
Q  559 tccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29224451 accataagaacttcacaattaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 29224509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 432 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 25239223 - 25239070
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||||||||   ||||||||| || |||   |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25239223 aatcacaccggtatgagagggattctgaggtcgtgtaggtatgggactatatggttgaaggaacgcttataagaattttttggtactacctatatcaaca 25239124  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtg 585  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25239123 agatgcatcttctttttggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtg 25239070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 432 - 686
Target Start/End: Original strand, 2911095 - 2911338
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||  ||||  || |||||||||||  |||||||||| ||| | |||||| ||||||||| || | ||||||||||||    
T  2911095 aatcacacctgaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggaccacatggttgaaagaatggttataaaaattgtttgatattacctatatcaaca 2911194  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||           |||    
T  2911195 agatgcatattctttttggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgagtgacc-----------ttc 2911283  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
       ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  2911284 tcggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgttgaaaagactcgtgttggtttgt 2911338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 446 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 25802680 - 25802430
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25802680 gagagggatcatgtggccatgtaggtatgagactgcatggttaacggaaggctgataagaatggtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttctt 25802581  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    || | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||| ||||||||  |  |||||||||     ||| |||||    
T  25802580 ttcgatagcccattccataagaaatccacagttaagcgtgtttgacttggagtagtcttaggacgggtgaccttctaggaagtttctcgaaaagagtgcg 25802481  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtc 696  Q
    ||| |||  |||| || ||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  25802480 agtaaggtcaaaacacgctgaaaagacgtgtgttggtttgtagggtcagtc 25802430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 447 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 32797066 - 32796936
Alignment:
Q  447 agagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttcttt 546  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32797066 agagggatcctgagaccatgtaggtatgaaactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttt 32796967  T
Q  547 ttggtagctcgttccataagaactccacagt 577  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32796966 tttgtagcacattccataagaactccacagt 32796936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 465 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 25803117 - 25802965
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| |||| | | || ||||    
T  25803117 tgtaggtatgggactgcatggttgaagtaagacttgtaagaattgtttggtactacctataaaaacaagatgtatcttcttttcggtatcccatttcata 25803018  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||    
T  25803017 agaactccgtagttaagcgtgcttgacttggactagtcttaggatgggtgacc 25802965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 340 - 498
Target Start/End: Original strand, 12820552 - 12820710
Alignment:
Q  340 actgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacac 439  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||||     
T  12820552 actgtaacgctcccgcttggtgggcatgtaacgctcgaggctgatgagggcggggagtggtccggctccttgcatgcttctaggcaaaactgaatcacat 12820651  T
Q  440 cggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggct 498  Q
    ||||  ||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12820652 cggaatgagagggattctaaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaagaaaggct 12820710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 479 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 26310088 - 26309878
Alignment:
Q  479 tgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagtt 578  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  26310088 tgcatggttgaaggacgatttataagaattttttgttactacatataccaaaaagatgcatcttctttatggtagctcattccattagaactcgacagtt 26309989  T
Q  579 aagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgt 678  Q
    ||  ||  |||||||  | |||||||||||||||||| |   | ||| ||||||| |  ||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||| |||    
T  26309988 aaatgtatttgacttaaaacaattttgggatgggtgatctttcaggatgtttcctggatagcgtgcaagtgaagacaaaatacactcaaaagactcatgt 26309889  T
Q  679 tggtttgtggg 689  Q
    |||||||||||    
T  26309888 tggtttgtggg 26309878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 521 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 53150869 - 53150683
Alignment:
Q  521 ctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaac 620  Q
    |||||| |||||||||||| || |||| ||||||   || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       
T  53150869 ctatattaacaagatgcatatttttttcggtagccaatttcataagaacttcacagttaaccgtgcttaacttggagcaattttgggatgggtgacctta 53150770  T
Q  621 cgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctga 707  Q
     | ||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||| |   ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  53150769 tgagaagtttcccaaaaagcgggcgagtgaggacaaaacatgttgaaaagactcatgttagtttgtggggtcagtcaacaatcctga 53150683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 222 - 341
Target Start/End: Original strand, 12782308 - 12782426
Alignment:
Q  222 atgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgct 321  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12782308 atgttttgaggaaattgttatttatgcatgtttggtgatttattgaaggtgtaacatctaaattcttgatat-tccgtatcattagcgtaaattatcgct 12782406  T
Q  322 tttagaatttagggtgttac 341  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  12782407 tttagagtttagagtgttac 12782426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 32388967 - 32388852
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||    
T  32388967 tgtaacgcctccgcttagtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaaaattgaatcacatcg 32388868  T
Q  442 gagcgagagggatcct 457  Q
    ||  ||||||||||||    
T  32388867 gaatgagagggatcct 32388852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8875268 - 8875170
Alignment:
Q  243 ttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8875268 ttatgcatgcttggtgaattattggtgaagtaacatctagattcttgatatgatcgtatcattagtgtaatttatcatttttagagtttagggtgttac 8875170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 500 - 709
Target Start/End: Original strand, 3899868 - 3900077
Alignment:
Q  500 ataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagca 599  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |  | | |    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  3899868 ataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcatctttttttcgacaacacaaatcataagaactccacaataaagcatgcttgacttggagca 3899967  T
Q  600 attttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggc 699  Q
    ||||||| ||||||||||  | || |||||||| |  ||||||| ||||  ||| |||| |   ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||    
T  3899968 attttggtatgggtgaccttctggaaagtttcccaaaaagcgtgtgagtatggacaaaacaaggtgaaaagactcgtgttgatctgtggggtcagtcagc 3900067  T
Q  700 aatcctgaaa 709  Q
    ||| ||||||    
T  3900068 aattctgaaa 3900077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 341
Target Start/End: Original strand, 16307307 - 16307424
Alignment:
Q  226 tttgagaaaactattatttatgca---tgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgctt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16307307 tttgagaaaactattatttatgcaatatgcttgctaatttattgaagatgtaacatctaaattctcgatatg-ccgtatcattagcgtaatttatcgctt 16307405  T
Q  323 ttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  16307406 ttagagtttatggtgttac 16307424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 341
Target Start/End: Original strand, 16308378 - 16308495
Alignment:
Q  226 tttgagaaaactattatttatgca---tgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgctt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16308378 tttgagaaaactattatttatgcaatatgcttgctaatttattgaagatgtaacatctaaattctggatatgtc-gtatcattagcgtaatttatcgctt 16308476  T
Q  323 ttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  16308477 ttagagtttatggtgttac 16308495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 340
Target Start/End: Original strand, 11834908 - 11835040
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatta 306  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||  |||||| |||    
T  11834908 ttttattccgctgcaatgttttga--aaattattatttatgcatgcttagtgatttattgaagaagtaacagctagattcctaatatgcacgtatcttta 11835005  T
Q  307 gcataatttat-cgcttttagaatttagggtgtta 340  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  11835006 gcgtaatttatccgcttttagagtttagagtgtta 11835040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 686
Target Start/End: Original strand, 15392570 - 15392764
Alignment:
Q  492 gaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||  ||||||||  |||||  |  |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15392570 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccatcagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15392669  T
Q  592 ttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  ||| |||| |||||||| | |  || ||||||  ||||||||||||||||    
T  15392670 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgaggacatagcacgctgaaagaactcgtgttggtttgt 15392764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 686
Target Start/End: Original strand, 15405606 - 15405800
Alignment:
Q  492 gaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||  ||||||||  |||||  |  |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15405606 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15405705  T
Q  592 ttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  ||| |||| |||||||| |||  || ||||||  || |||||||||||||    
T  15405706 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgaggacaaagcacgctgaaagaacccgtgttggtttgt 15405800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 492 - 630
Target Start/End: Original strand, 15417431 - 15417569
Alignment:
Q  492 gaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||  ||||||||  |||||  |  |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15417431 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15417530  T
Q  592 ttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  15417531 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttt 15417569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 468 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 31104070 - 31103933
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtag--ctcgttccataa 565  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||    
T  31104070 aggtatgagattgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttgatactatctataccaactagatgcattttctttttggtagctctcattccataa 31103971  T
Q  566 gaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattt 603  Q
    ||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||| |||||    
T  31103970 gaacttcacatttaagtgtctttgactttgagtaattt 31103933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 492 - 617
Target Start/End: Original strand, 15411015 - 15411140
Alignment:
Q  492 gaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||  ||||||||  |||||  |  |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15411015 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15411114  T
Q  592 ttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15411115 ttggatcaattttgggatgggtgacc 15411140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 634 - 727
Target Start/End: Original strand, 41473743 - 41473836
Alignment:
Q  634 agtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || | |||||||    
T  41473743 agtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgccaatcgtgaaagcagtatgagatgttaca 41473836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 686
Target Start/End: Original strand, 15388203 - 15388397
Alignment:
Q  492 gaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||  || |||||||||||  ||||||||  |||||  |  |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15388203 gaaggcttataagaattgtttcgtattaccagtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccatcagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15388302  T
Q  592 ttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaag-tttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||  ||| |||| |||||||| | |  || ||||||  ||||||||||||||||    
T  15388303 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttttccta-aaagtgtgcaagtgaggacatagcacgctgaaagaactcgtgttggtttgt 15388397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 630
Target Start/End: Original strand, 15377344 - 15377482
Alignment:
Q  492 gaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||  ||||||||  ||| |  |  |||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  15377344 gaaggcttataagaattgtttggtattactggtaccaacaagatgccacttcttttcagtacccaggaccattagaactccacagttaaatgtgcttgac 15377443  T
Q  592 ttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  15377444 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttt 15377482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 120
Target Start/End: Original strand, 12782092 - 12782159
Alignment:
Q  53 ttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtcttatgactagttgtt 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12782092 ttttcggagtctagtgtgtcggctctgattaggacatctttatgttttgagtcttatgactatttgtt 12782159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 615
Target Start/End: Original strand, 15376056 - 15376179
Alignment:
Q  492 gaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||||||  ||||||||  ||| |  |  |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15376056 gaaggcttataagaattgtttggtattacaggtaccaacaagatgccacttcttttcagtacccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 15376155  T
Q  592 ttggagcaattttgggatgggtga 615  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  15376156 ttggatcaattttgggatgggtga 15376179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 47518429 - 47518295
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||  || || ||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||| |    
T  47518429 aggtatggaattgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttgaaactatctctaccaacaagatgca---tttttttagtagctcattccataata 47518333  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttg 605  Q
    |||  ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  47518332 actttacaattaagtgagcttgatttggagcaattttg 47518295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16279845 - 16279749
Alignment:
Q  244 tatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||| | |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16279845 tatgcatgtttggtgaattattgaataagtaacatctaaattcgt-atatgattgtatcattagcgtaatttatcgcttttagagtttacggtgttac 16279749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 635 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 25239070 - 25239003
Alignment:
Q  635 gtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  25239070 gtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 25239003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 534 - 612
Target Start/End: Original strand, 15381232 - 15381310
Alignment:
Q  534 atgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggg 612  Q
    ||||| ||||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15381232 atgcaacttcttttaagtagccagtaccataagaactccacatttaagtgtgcttgacttggatcaattttgagatggg 15381310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 534 - 612
Target Start/End: Original strand, 15396467 - 15396545
Alignment:
Q  534 atgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggg 612  Q
    ||||| ||||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15396467 atgcaacttcttttaagtagccagtaccataagaactccacatttaagtgtgcttgacttggatcaattttgagatggg 15396545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 534 - 612
Target Start/End: Original strand, 15410603 - 15410681
Alignment:
Q  534 atgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggg 612  Q
    ||||| ||||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15410603 atgcaacttcttttaagtagccagtaccataagaactccacatttaagtgtgcttgacttggatcaattttgagatggg 15410681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 612
Target Start/End: Original strand, 15373670 - 15373748
Alignment:
Q  534 atgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggg 612  Q
    ||||| ||||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15373670 atgcaacttcttttaagtagccagtaccataagaactccacatttaggtgtgcttgacttggatcaattttgagatggg 15373748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 522 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 43736777 - 43736715
Alignment:
Q  522 tatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgt 584  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||    
T  43736777 tatatcaacaatatgcatcttcttgttggtagctcatttcataagaatttcactgttaagcgt 43736715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 341
Target Start/End: Original strand, 3295561 - 3295664
Alignment:
Q  238 attatttatgcatgcttggtgatttattga--tgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagca-taatttatcgcttttagaatttagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||  ||| |||||||||| ||| || |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  3295561 attatttatgcatgcttggtga---atagaagtgatgtaacatctaaattatttatatgatcgtatcattagctgtaatttatcgctttaagagtttagg 3295657  T
Q  335 gtgttac 341  Q
    |||||||    
T  3295658 gtgttac 3295664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 547
Target Start/End: Original strand, 3890046 - 3890093
Alignment:
Q  500 ataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttt 547  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3890046 ataagaattgtttgctactacatatatcaacaagatgcatcttttttt 3890093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13438022 - 13437939
Alignment:
Q  238 attatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgct 321  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||  ||||   |||| ||| || ||||||||||||    
T  13438022 attatttatgcgtgcttggtgaattattgaagatgtaacatctagatcctttgtatgattgtattatttgcgtaatttatcgct 13437939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 321
Target Start/End: Original strand, 10835872 - 10835953
Alignment:
Q  238 attatttatgcatgcttg-gtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgct 321  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||||    ||||||||||| ||||||||||||    
T  10835872 attatttatgcatgcttttgtgaattattgaagaggtaacatctaaattctttatatt---gtatcattagcgtaatttatcgct 10835953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 534 - 604
Target Start/End: Original strand, 15392157 - 15392227
Alignment:
Q  534 atgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 604  Q
    ||||| ||||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  15392157 atgcaacttcttttaagtagccagtaccataagaactccacatttaagtgtgcttgacatggatcaatttt 15392227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 534 - 612
Target Start/End: Original strand, 15417019 - 15417096
Alignment:
Q  534 atgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggg 612  Q
    ||||| ||||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  15417019 atgcaacttcttttaagtagccagtaccataagaactccacatttaagtgtgcttgactt-gatcaattttgagatggg 15417096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 637 - 727
Target Start/End: Original strand, 18318860 - 18318950
Alignment:
Q  637 aagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||||||||| | |||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||  || |||||||||| |||||  ||||| | |||||||    
T  18318860 aagcgtgcgagtgagaacaaaacacgctgaaaagattcgggttggtttgttgggacaatcggcaatccagaaagtcgtctgtgatgttaca 18318950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 645 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 25231030 - 25230989
Alignment:
Q  645 gagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25231030 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgt 25230989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20054682 - 20054387
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20054682 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20054583  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20054582 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20054483  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20054482 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20054387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20055138 - 20054843
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20055138 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20055039  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20055038 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20054939  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20054938 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20054843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20055594 - 20055299
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20055594 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20055495  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20055494 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20055395  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20055394 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20055299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20056050 - 20055755
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20056050 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20055951  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20055950 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20055851  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20055850 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20055755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20056506 - 20056211
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20056506 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20056407  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20056406 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20056307  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20056306 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20056211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20057409 - 20057114
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20057409 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20057310  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20057309 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20057210  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20057209 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20057114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 427 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20057870 - 20057570
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20057870 aactgaatcacaccgaaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 20057771  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20057770 caacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaa 20057671  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttac 726  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20057670 gtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttac 20057571  T
Q  727 a 727  Q
    |    
T  20057570 a 20057570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 35759844 - 35759459
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| | | ||||||| ||| |||| | ||||||| ||    
T  35759844 tgtaacgcctccacttggtgggtatgtaacgcccgaggctgatgacggcggggagtggtctggctcctagcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcg 35759745  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35759744 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 35759645  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    |||||||    
T  35759644 tcttttcggtagctcattccataagaacttcatagttaaacgtgcttgacttggagctattttgggattggtgacctaccgggaagtttttcggtaagcg 35759545  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35759544 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttttggggtcagtcggcaatcatgaaagtagtctggggtgttaca 35759459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20054226 - 20053931
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20054226 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 20054127  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  20054126 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactaggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttt 20054027  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20054026 ctggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20053931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 468 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20056926 - 20056667
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20056926 aggtatgggactgcagggttgaaggaaggcttatgagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 20056827  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  20056826 actccacagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaa 20056727  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20056726 aagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 20056667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 20845807 - 20845512
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20845807 aatcacaccggaatgagacggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgttactacctatatcaaca 20845708  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20845707 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 20845608  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20845607 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcttgaaagcagtctgagatgttaca 20845512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 432 - 729
Target Start/End: Original strand, 38340906 - 38341203
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38340906 aatcacaccggaatgagatggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 38341005  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  38341006 agatgcatcttcatttcggtagctcattccataagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctactgggaagtttc 38341105  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacagt 729  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38341106 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgcggaaaagactcgtgttggtttatggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttacagt 38341203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 52250206 - 52250501
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  52250206 aatcacaccggaatgagagggatcatgaggccttgtaggtatgggactacatggtcgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 52250305  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  52250306 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagtttc 52250405  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  52250406 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52250501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 16452079 - 16451784
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16452079 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 16451980  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  16451979 agatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttt 16451880  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    | | |||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16451879 ccaataagcgtgcgcgtgatgacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16451784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 16461232 - 16460937
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16461232 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 16461133  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  16461132 agatgcatcttcttttcggtagttcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttt 16461033  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    | | |||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16461032 ccaataagcgtgcgcgtgatgacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 16460937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 50003221 - 50002926
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50003221 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgcaggtataggactgcatggttaaagggagacttataataattgttgggtactacctatatcaaca 50003122  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  50003121 agatgcatcttcttttcagtagctcattccaaaagaacttcacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttttggatgggtgacctaccgggaagtttc 50003022  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  50003021 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcagcaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 50002926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 367 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 46693948 - 46693586
Alignment:
Q  367 gtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaacta-aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctat 465  Q
    ||||| || ||| |||||||||||   |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||||   |    
T  46693948 gtaacacccgaggctgatgagggctaggagtggtccgactcttgtcatgcttctaggcaaaagttgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgt 46693849  T
Q  466 gtaggtatgggactgc-atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    | | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||    
T  46693848 gcatgtatgggactgtgatggttgaaggaaggcttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtatctcatttcata 46693749  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactct 664  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| || ||    
T  46693748 ataactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccggaaagtttcccggtatgcgtgcgagtgaggacaaaacacgct 46693649  T
Q  665 gaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||    
T  46693648 gaaaagacccgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaagcagtttgggatgttaca 46693586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 432 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 50002853 - 50002575
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50002853 aatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 50002754  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  50002753 agatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaactccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgggatggatgacctaccgggaagttcc 50002654  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50002653 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctgaaag 50002575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 344 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 35761148 - 35760845
Alignment:
Q  344 taacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccgga 443  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||| | ||||||| ||||    
T  35761148 taacgcctccgcttggtgggtatgtaacgtccgaggctgatgagggtggcgagtggtctggctcctggcatgcttctaggaaaaattgaatcacatcgga 35761049  T
Q  444 gcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttc 543  Q
      |||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35761048 atgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc 35760949  T
Q  544 tttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtg 643  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  |||||||||    
T  35760948 tttttggtagctcattccatgagaactccgtagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtaacctatcgggaagtttcccggtaagcgtg 35760849  T
Q  644 cgag 647  Q
    ||||    
T  35760848 cgag 35760845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 487 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 20060431 - 20060190
Alignment:
Q  487 tgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgc 586  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20060431 tgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagtgtgc 20060332  T
Q  587 ttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||    
T  20060331 ttgacttggatcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgatggaaagactcgtgttggtttgt 20060232  T
Q  687 gggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttacag 728  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20060231 ggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctggggtgttacag 20060190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 446 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 51373006 - 51372738
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  51373006 gagagggatcccgaggccatacaggtatgtgactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcgacaagatgcatcttatt 51372907  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    |||||||||||    
T  51372906 ttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgacctatcaggaagtttttcggtaagcgtgcg 51372807  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  51372806 agtgaggacaaaatccgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcttgaaagcagt 51372738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 450 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 43057193 - 43056941
Alignment:
Q  450 gggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttg 549  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43057193 gggatcctaaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaaggcttagaagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcg 43057094  T
Q  550 gtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtg 649  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   | || |||||||||||| || |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  43057093 gtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttagagtggtctttggatgggtgacctactgggaagtttcccggtaagcatgcgagtg 43056994  T
Q  650 aggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||| |||| || ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  43056993 aggacaaaacacactgaaaaaacttgtgttggtttgtagggtcagtcggcaat 43056941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 356 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 20061413 - 20061188
Alignment:
Q  356 ttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatc 455  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||| ||||||| | ||  ||||||||||    
T  20061413 ttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcaatcttctaggctaaactgaatcacatcagaatgagagggatc 20061314  T
Q  456 ctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagct 555  Q
    || |||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20061313 ctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagct 20061214  T
Q  556 cgttccataagaactccacagttaag 581  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  20061213 cattccataagaactccacagttaag 20061188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 530 - 727
Target Start/End: Original strand, 52250641 - 52250838
Alignment:
Q  530 caagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtt 629  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52250641 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 52250740  T
Q  630 tcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||  ||||| |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  52250741 tcccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52250838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 530 - 727
Target Start/End: Original strand, 52250978 - 52251175
Alignment:
Q  530 caagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtt 629  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52250978 caagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtt 52251077  T
Q  630 tcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||  ||||| |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  52251078 tcccggtaagtgtgcgagtgaagacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 52251175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 432 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 43057669 - 43057415
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43057669 aatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaaca 43057570  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | || |||| ||||||| || ||||||||||    
T  43057569 agatgcatcttcttttcggtagcccattccataagaactccacagttaagcgtgattgacttggagtggtctttggatcggtgacctactgggaagtttc 43057470  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    |  |||||| || ||||||| | |||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  43057469 ccggtaagcatgtgagtgagaacaaaacacgctaaaaagacttgtgttggtttgt 43057415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 342 - 580
Target Start/End: Original strand, 2328225 - 2328463
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||  |    
T  2328225 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacacccaaggctgatgagggcggagagtggtctggctcctggcatgcttttaggcaaaactgaatcacattg 2328324  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||  ||  | ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2328325 gaatgagagaaattatgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 2328424  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2328425 tctttttggtagcacattccataagaactccacagttaa 2328463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 432 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 50002431 - 50002246
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  50002431 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctttatcaaca 50002332  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50002331 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttgagtgtgcttgacttggagcaattttgggattggtgacc 50002246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 432 - 640
Target Start/End: Original strand, 12883524 - 12883732
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12883524 aatcacaccggaatgagatggatcccgaggctgtgcaggtatgggactgcatgattgaaggaatacttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 12883623  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  12883624 agatgcattttctttttggtagctcattccataaaaactccacagttaagtgtgtttgacttgaagtagtttttggatggatgacctactgggaagtttc 12883723  T
Q  632 ctagtaagc 640  Q
    | |||||||    
T  12883724 ccagtaagc 12883732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 465 - 597
Target Start/End: Original strand, 12728024 - 12728157
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggt-actgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccat 563  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  12728024 tgtaggtatgggacaacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggttactgcctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagcacattccat 12728123  T
Q  564 aagaactccacagttaagcgtgcttgacttggag 597  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12728124 aagaactccacagttaagcatgcttgacttggag 12728157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 350 - 613
Target Start/End: Original strand, 23180649 - 23180911
Alignment:
Q  350 ctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgaga 449  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | | ||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||| ||||  ||| |||| | |||||||  |||  ||||    
T  23180649 ctccgcttggtgggcatgtaacgctcgtggctgatgaaggcggggagtggtccgactcctagta-gcttataggaaaaattgaatcacattggaatgaga 23180747  T
Q  450 gggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttg 549  Q
    |||||| | | ||  |||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  23180748 gggatcttgaagccgtgtaggaatgggactacgtggttgaaggaatgattataagaattgcttggtactacctatatcaacaagatgtatcttctattcg 23180847  T
Q  550 gtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggt 613  Q
     |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23180848 ctagcccattccataagaattccacaattaagcgtgcttgacttggagaaattttgggatgggt 23180911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 468 - 713
Target Start/End: Original strand, 16907270 - 16907516
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  || |  | ||| | ||||    
T  16907270 aggtatgaaactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatacatcttcttttcagtggtccattctacaaga 16907369  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagt-gaggataaaatactctga 666  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    | |||||||| |   |||| ||| |||  |||| ||||||| |||     
T  16907370 actccatagttaagcgtgtttgacttggagcaattttgagatgggtgaccttttgagaagtttcttgaaaagcatgcaagtaaaggacaaaatacactgg 16907469  T
Q  667 aaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcag 713  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||    
T  16907470 aaagactcgtgttggtttgtggggtcagccaacaatccttaaagcag 16907516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 432 - 617
Target Start/End: Original strand, 2634924 - 2635109
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2634924 aatcacatcggaatgagagggatcatgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggataactcataagaattgtttggtactacctataccaaca 2635023  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||| ||||||    
T  2635024 agatgcatcttcttttcggtagctcattcaataagaactccacagttaagcgtgtttggcttggagtaatctttggatgagtgacc 2635109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 432 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 30873096 - 30872911
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || ||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30873096 aatcacaccggaatgagagggattctgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagacttttaagaattgtttgatactacctatatcaaca 30872997  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | | || ||||||||||||    
T  30872996 agatgcatcttctttttggtagtccattctataagaactccacaattaagcatgcttgacttgcagtagtctttggatgggtgacc 30872911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 446 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 31822795 - 31822630
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  31822795 gagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattatttggtactacatatatcaacaatatgcatcttctt 31822696  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgg 611  Q
    || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  31822695 ttcggtagctcaatccaaaagaactccacagttaagcgtttttgacttggaacaattttgggatgg 31822630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 446 - 632
Target Start/End: Original strand, 7548105 - 7548291
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  7548105 gagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatgattaaaggaagacttataaaaattgtttggtattaactatatcaacaagatgcatattctt 7548204  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcc 632  Q
    ||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  7548205 tttggtagcccatttgataagaactccacaattaagcgtacttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgagaagtttcc 7548291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Original strand, 18623919 - 18624036
Alignment:
Q  222 atgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgct 321  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18623919 atgtcttgagaaacttattatttatgcatgcttggtgatttattggcgaagtaacatctagattcttgatatgt-cgtatcattagcataatttatcgct 18624017  T
Q  322 tttagaatttagggtgtta 340  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  18624018 tttcgagtttagggtgtta 18624036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21416842 - 21416607
Alignment:
Q  106 ttatgact-agttgttgagatgagattttatacttggtgatgtattataattt-gagacatggttaattcgagatgttctactgattgtattggtgacga 203  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||| || ||||   |   |||| |     
T  21416842 ttatgactcagttgttaagatgagatttt-tatattgtgatgtattatgattttgagacatggctacttggagatgttttattgatcacagatgtgatgt 21416744  T
Q  204 tatttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatca 303  Q
    | ||||||||||  | | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21416743 tgtttttattccgctacgatgttttgagaaaattgttatttatgcatgcttggtaatttatcgaagaagtgacatcttgattcttgatatgt-cgtatca 21416645  T
Q  304 ttagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21416644 ttagcgtaatttatcgctttgagagtttagagtgttac 21416607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 470 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 16440687 - 16440547
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  16440687 gtatgggaatacatggttgaagaaagacttataagaactgtttgctactaccgataacaacaagatgcatattctttttggtagctcattctataataac 16440588  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatg 610  Q
    | || ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  16440587 ttcaaagttaagtgtgattgactcgaagcaattttgggatg 16440547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 432 - 596
Target Start/End: Original strand, 10820592 - 10820758
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  | ||||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  10820592 aatcacatcggagtgagagggattatgaggcggtgtatgtattggactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtactacctatatcaata 10820691  T
Q  532 agatgcatcttcttttt--ggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttgga 596  Q
    |||| |||||| |||||  | |  ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10820692 agatacatctttttttttcgatgactcatttcataagaaattcacagttaagcgtgcttgacttgga 10820758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 470 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 16410831 - 16410612
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||   ||| | ||||||    
T  16410831 gtatgggaatgcattgttgaaggaaagcttataagaattatttactactaccaataccaacaagatgcatcttgtttttggtagcctattctagaagaac 16410732  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaa 669  Q
    | || |||||| | || |||||||||||||| |||||||||  | ||   | | ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |   ||||||    
T  16410731 ttcaaagttaaacatgtttgacttggagcaagtttgggatgtttaacattctgagaagtttccaagaaagcgtacgagtgatgataaaacatgttgaaaa 16410632  T
Q  670 gactcgtgttggtttgtggg 689  Q
     ||| ||||| |||||||||    
T  16410631 aacttgtgttagtttgtggg 16410612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 341
Target Start/End: Original strand, 21199852 - 21199955
Alignment:
Q  238 attatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtg 337  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21199852 attatttatgcatctttggtgaattattgaagaagtaacatctaaattctttatgtgattgtatcattagcataatttatcgcttttagagtttagggtg 21199951  T
Q  338 ttac 341  Q
    ||||    
T  21199952 ttac 21199955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 465 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 843046 - 842905
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||||    
T  843046 tgtaggtatgtgtctgcatgattgaaggaagtcgtgtaagaattgtttggtactatccattccaacaagatgcatgttctttttgatagatcgtcacata 842947  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgg 606  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  842946 agaactcaacagttgaacgtgcttgactttgaacaattttgg 842905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 450 - 686
Target Start/End: Original strand, 2634484 - 2634720
Alignment:
Q  450 gggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttg 549  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||| || |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |    
T  2634484 gggatcctgaggttgtgtatgtatgagattgcatgattaaaggaaggcttgcaagaattgtttggtactagctatacaaacaagatgcatcttcttttcg 2634583  T
Q  550 gtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtg 649  Q
     |||    ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | | || |||||| ||||   | ||||||||| | |  |||| ||||| ||    
T  2634584 atagtctattcaataagaacttcactgttaaacgtgcttgacttggagtagtctttggatggatgacattctgggaagttttccaaaaagcatgcgaatg 2634683  T
Q  650 aggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||| ||  || |||||||||||| |||| ||||||    
T  2634684 aggatgaagcacgctgaaaagactcttgtttgtttgt 2634720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 639 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 35760003 - 35759915
Alignment:
Q  639 gcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  35760003 gcgtgcgagcgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcatgaaagcagtctgggatgttaca 35759915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 604 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 31823093 - 31822970
Alignment:
Q  604 tgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatc 703  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||   |||||| |||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  31823093 tgggatgggtgacctactgggaagtttctcggtaagcatgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcagcaatc 31822994  T
Q  704 ctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    | ||||||| |||| | |||||||    
T  31822993 cagaaagcattctgggatgttaca 31822970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 540 - 617
Target Start/End: Original strand, 8278065 - 8278142
Alignment:
Q  540 cttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||||||||||||  | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8278065 cttctttttggtagtccatttcataaagactccacagttaagcgtgcttgacttgaagcaattttgggatgggtgacc 8278142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 645 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 49996613 - 49996531
Alignment:
Q  645 gagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  49996613 gagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcttgttagtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcagtctgagatgttaca 49996531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 521 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 7230000 - 7229904
Alignment:
Q  521 ctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacc 617  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7230000 ctatatcaacacgaagcatcttcatttcggtagttcattacataagaactccatagataagcatgtttgacttggagcaattttaggattggtgacc 7229904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 501 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 31823161 - 31823097
Alignment:
Q  501 taagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataa 565  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31823161 taagaattatttggtactacctatatcaataaaatgcatcttctttttggtagctcattccataa 31823097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 467 - 605
Target Start/End: Original strand, 2739557 - 2739695
Alignment:
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
    |||||||| ||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||  |||    |||||||||    
T  2739557 taggtatgagactgtatggttaaggaaagacttataagaattgtttagcactacatatatcaacaatatgtatcttcttttttatagtctattccataag 2739656  T
Q  567 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttg 605  Q
    |||| ||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  2739657 aacttcatggttaagtgtgtttgactttgagcaattttg 2739695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 558 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 35010016 - 35009942
Alignment:
Q  558 ttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcc 632  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| |||| ||| |||||    
T  35010016 ttccataagaactccacggttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctaccgagaattttcc 35009942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 95
Target Start/End: Original strand, 18623815 - 18623909
Alignment:
Q  8 gttgcttgggtgagttgcttgaggaaagctcggagcttcctcgctt-------tttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttat 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||       ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18623815 gttgctttggtgagttgcttgaggatagctcagagcttccacgcttactgctttttcgaagtctagtgtgtcggctctgaataggatgtctttat 18623909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20406129 - 20406044
Alignment:
Q  257 tgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataattt-atcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||   |||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20406129 tgatttatttaagaagaaacatctaaattcttgatatgattgtatcatttgcgtaattttatcgcttttagagtttagggtgttac 20406044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 702
Target Start/End: Original strand, 7547791 - 7547907
Alignment:
Q  586 cttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttg 685  Q
    |||||||||||| | | || |||||||||||| ||||| ||||||     ||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||||| ||||    
T  7547791 cttgacttggagtagtgtttggatgggtgacctaccggaaagtttttcgataagcgtgcgagtaaggacaaaacacactgaaaagtctcgtgttgatttg 7547890  T
Q  686 tgggctcagtcggcaat 702  Q
    | || ||||||| ||||    
T  7547891 tagggtcagtcgacaat 7547907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 655 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 28181416 - 28181357
Alignment:
Q  655 aaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||    
T  28181416 aaaacactctgaaaagactcgtgttggtttgtggaggcagttgacaatcctgaaagcagt 28181357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 644 - 727
Target Start/End: Original strand, 39582553 - 39582636
Alignment:
Q  644 cgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || |||| ||| || | |||||||    
T  39582553 cgagtgaggacaaaacacgctgagaagactcgttttggtttgtaggatcagtcggcaatgcttaaagtagtttgggatgttaca 39582636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 604
Target Start/End: Original strand, 42066114 - 42066253
Alignment:
Q  465 tgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccata 564  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||| |||  || |||||||||||| |  |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||     |||||    
T  42066114 tgtatgtatgtgactccatggttgaagaaagacttgaaataattgtttggtattttctatactaacaaaatgtatcttctttttggtagcctaaaccata 42066213  T
Q  565 agaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttt 604  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  42066214 aaaacttcacggttaaacgtgcttgatttgaaacaatttt 42066253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21416916 - 21416862
Alignment:
Q  51 ctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtc 105  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  21416916 cttttttggattctagtgtgtcggctctgattatgacgtttttatgtttggagtc 21416862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 342 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 2446 - 2061
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||  | | ||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  2446 tgtaatgcctccgcttggtgggtatgtaacgcccgaggctgatgagggcggggagtggtccagcttctagcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 2347  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||| ||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2346 gaatgagaaggatcctaaggccgtgcaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 2247  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  2246 tcttttcggtagcttattccataagaactcaatagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttttccggtaagcg 2147  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||| | |||||||    
T  2146 tgcgagtgaggacaaaacacattgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaagttgtctgggatgttaca 2061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2606 - 2556
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcgg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  2606 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgagggcgg 2556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 424 - 727
Target Start/End: Original strand, 18958 - 19261
Alignment:
Q  424 caaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgccta 523  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18958 caaaactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactaccta 19057  T
Q  524 tatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgg 623  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19058 tatcaacaagattcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgg 19157  T
Q  624 gaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgt 723  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19158 gaagtttcccggtaagcgtgtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtctgggatgt 19257  T
Q  724 taca 727  Q
    ||||    
T  19258 taca 19261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 18339 - 18203
Alignment:
Q  360 tgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaa 459  Q
    |||||| |||||||  ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||  |    
T  18339 tgggcatgtaacgctcgaggcggatgagggcggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggcaacactgaatcacatcggaatgagagggatccaga 18240  T
Q  460 ggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaagg 496  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239 ggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagg 18203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 1220 - 1515
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1220 aatcacaccggaatgagacggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatataaaca 1319  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1320 agatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 1419  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1420 ccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggcgtcagtcgacaatcctgaaagcagtctgggatgttaca 1515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 342 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 162914 - 162541
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||| ||| ||| ||    
T  162914 tgtaacgcctcctcttggtggacatgtaatgcccgaggctgatgagggtggggagtggtctggctcctgacatgcttctaggcaaaactgaattacatcg 162815  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  162814 gaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcatct 162715  T
Q  542 tctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcg 641  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||    ||||||    
T  162714 tcttttcggtagctcattccataagaactccgcagttaagcgtgcttgacttggagcaactttgggatgagtgacctacctggaagtttcgcgataagcg 162615  T
Q  642 tgcgagtgaggataaaatactctg-aaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  162614 tgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagt 162541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 531 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 163181 - 162985
Alignment:
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  163181 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctatcgggaagttt 163082  T
Q  631 cctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |   |||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  163081 ctcggtaagcgttcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggccagtcggcaatcctgaaaacagtctgggatgttaca 162985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 528 - 727
Target Start/End: Original strand, 163167 - 163366
Alignment:
Q  528 aacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaag 627  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  163167 aacaagatgcatcttcttttcggtagctcattctttaagaattccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgagaag 163266  T
Q  628 tttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||  ||||| | |||||||    
T  163267 tttcccagtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtctgtcgacaatcctgaaagtcgtctgggatgttaca 163366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 446 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 69947 - 69666
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  69947 gagagggatcctaagactatgcaggtatgagactgcatcgttgaaggaatgcttataataattgtttggtactacctatatcaacatgatgcatcttttt 69848  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    ||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| | | || ||||||||||||  | |||||||||    | ||||||| |    
T  69847 ttcattagctcattccataagaactccacagttatgcgggcttgactaggagtagtctttggatgggtgaccttcagggaagtttatgggaaagcgtgtg 69748  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||| || |||  || || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  69747 agtgatgacaaaccacgctaaaaagactcgtgttggtttgttggttcagtcggcaatcctgaaagcagtttgggatgttaca 69666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 162534 - 162483
Alignment:
Q  676 tgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||    
T  162534 tgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagcaatctgagatgttaca 162483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 468 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 2161 - 1919
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataaga 567  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2161 aggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataaga 2062  T
Q  568 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaa 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2061 actccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcgtgcgagtgaggacaaaatacgctgaa 1962  T
Q  668 aagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaag 710  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  1961 aagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatcctaaaag 1919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 446 - 716
Target Start/End: Original strand, 2756 - 3026
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2756 gagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatattctt 2855  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2856 ttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggagacctaccgggaagtttcccggtaagtgtgcg 2955  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtct 716  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2956 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcggcaatgctgaaagcagtct 3026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 432 - 717
Target Start/End: Original strand, 154757 - 155042
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  154757 aatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctgtatcaaca 154856  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  154857 agatgcatcttcttttcagtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttggaatgggtgacctaccgggaagtttc 154956  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
       ||||| |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  154957 tcggtaagtgtgctagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctg 155042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 635 - 727
Target Start/End: Original strand, 154505 - 154597
Alignment:
Q  635 gtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  154505 gtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgtggggtcagtcgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 154597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 432 - 702
Target Start/End: Original strand, 4561 - 4830
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4561 aatcacatcggaaggagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttagaagaattgtttggtactacctatatcaaca 4660  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4661 agatgcatcttcttttcggtagctcattttataagaactccacagttaagtgtgcttaacttggagcaa-tttgggatgggtgacctaccgggaagtttc 4759  T
Q  632 ctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |  ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  4760 ccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaat 4830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 432 - 727
Target Start/End: Original strand, 5016 - 5315
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggctt-----ataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||| |||||||    
T  5016 aatcacaccggaatgagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttaaaagagaagaattgtttggtactacctatat 5115  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  5116 taacaagatgcatcttcttttcggtagctcatttcataagaactccacagttaagcgtgcttaacttggagcaa-tttgggatgggtgacctacctggaa 5214  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttac 726  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || ||||  ||||| | ||||||    
T  5215 atttcccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtcgacaatgcttaaagtcgtctgggatgttac 5314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 367 - 714
Target Start/End: Original strand, 245021 - 245364
Alignment:
Q  367 gtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatg 466  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||  |||  | ||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||    
T  245021 gtaacgcccaaggctgatgagggcggggagtggtccggctcttggcatgcatctagaaaaatatgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatg 245120  T
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||     |||||||    
T  245121 taggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttc-tttcggtagcctaaaccataag 245219  T
Q  567 aactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctga 666  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||   | ||||||| ||||||||| |||| ||  |||    
T  245220 aactccaca---aagcgtgcttgacttagagcaattttgagatgggtgaccttctgggaagtttctcggaaagcgtgtgagtgaggacaaaacacggtga 245316  T
Q  667 aaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  245317 aaagactcgtgttggtttgcggggtcagtcggcaatcctgaaagcagt 245364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 367 - 591
Target Start/End: Original strand, 245450 - 245674
Alignment:
Q  367 gtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatg 466  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||| ||||||| |  |  || ||||||| | || |  ||    
T  245450 gtaacacccgaggctgatgagggcggggagtggtccggctcctggcttggttctaggaaaaactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtg 245549  T
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataag 566  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||     |||||||    
T  245550 taggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttcttttcagtagcctaaaccataag 245649  T
Q  567 aactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  245650 aactccacagttaagcgtgcttgac 245674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 560 - 715
Target Start/End: Original strand, 245676 - 245831
Alignment:
Q  560 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaat 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    ||||||||||   | ||| ||| ||||||||| ||||     
T  245676 ccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaatttcgagatgggtgatcttttgggaagtttctcggaaagtgtgtgagtgaggacaaaac 245775  T
Q  660 actctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtc 715  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  245776 acgttgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcgggaatcctgaaagcagtc 245831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 201336 - 201201
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgattta-ttgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatt 305  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  201336 ttttattccgctgcgatgttttgagatagttgttatttatgcatgtttggtggtttaattgaagatgtaacatctagattcttgatatgt-cgtatcatc 201238  T
Q  306 agcataatttatcgctttt-agaatttagggtgttac 341  Q
    ||| | ||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  201237 agcgtgatttatcgcttttaagggtttagggtgttac 201201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 520 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 13591 - 13396
Alignment:
Q  520 cctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaa 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  13591 cctatatcaacaagatgcatcttcttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgactttgagcaattttgggatgggtgaccta 13492  T
Q  620 ccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtc 715  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13491 ccgggaagtttctttgtaagcgtgcgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagcagtc 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 446 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 17730 - 17474
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  17730 gagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaggatgtatcttctt 17631  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcg 645  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||  | ||||||    |||||||||||    
T  17630 tttggtagctcaattcataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtactctttggatgggtgacctactcgaaagtttttcggtaagcgtgcg 17531  T
Q  646 agtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaat 702  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  17530 agtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggttcatagggtcagtcggcaat 17474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 427 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 18285 - 18027
Alignment:
Q  427 aactaaatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 526  Q
    |||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18285 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttgatactacctatat 18186  T
Q  527 caacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaa 626  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| |  || ||    
T  18185 caacaagatgcatctt-tttttggtagctaattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagtagtctttggatgggtgacctattggaaa 18087  T
Q  627 gtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||    |||| |||||||||||||| | || || |||||||||||||||||| |||||    
T  18086 gtttttcggtaaacgtgcgagtgaggacacaacacgctgaaaagactcgtgttgatttgt 18027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 531 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 14749 - 14553
Alignment:
Q  531 aagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14749 aagatgcatcttgttttcggtagctcattccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagttt 14650  T
Q  631 cctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  14649 cccggtaagtgtgcgagtgaggacaaaacatgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagccgacaatgctgaaagcagtctgggatgttaca 14553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 342 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 142510 - 142303
Alignment:
Q  342 tgtaacgcctccgcttggtgggcaggtaacgcctgagactgatgagggcggcgagtggtccggctcttggtatgcttcgaggcaaaactaaatcacaccg 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  142510 tgtaacgcctccgcttggtgggcatgtaacgcccgaggctgatgaggacggggagtggtccggctcctggcatgcttctaggaaaaactgaatcacatcg 142411  T
Q  442 gagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatct 541  Q
    ||  |||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  142410 gaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggacttcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatct 142311  T
Q  542 tctttttg 549  Q
    ||||||||    
T  142310 tctttttg 142303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 481 - 717
Target Start/End: Original strand, 2154 - 2381
Alignment:
Q  481 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaa 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  2154 catggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactccctatataaacaagatgcatcttctttttggtagcccattccttaagaactccacagttaa 2253  T
Q  581 gcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttg 680  Q
    || |||||||| ||||| | | ||  ||||||||||| |||         |   ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  2254 gcatgcttgacatggagtagtcttatgatgggtgacctacc---------ctcggtaagcgtgcgagtgaggagaaaacacgctgaaaagactcgtgttg 2344  T
Q  681 gtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    |||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2345 gtttgtaggatcagtcgacaatcctaaaagcagtctg 2381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 543 - 716
Target Start/End: Original strand, 421 - 594
Alignment:
Q  543 ctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgt 642  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |    
T  421 cttttcggtagctcattccataaaatctccatagttaagcgtgcttgacatggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccgataagcat 520  T
Q  643 gcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtct 716  Q
    | ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  521 gtgagtgaggacaaaacacgctgaaaagactcgtgttggtttgtggggtcagtcggcaatcctaaaagtagtct 594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 573 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 1706 - 1552
Alignment:
Q  573 acagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagtttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagac 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||| || || |||||||    
T  1706 acagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacctaccgggaagtttcccggtaagcatgtgagtgaggacaaaacacgctaaaaagac 1607  T
Q  673 tcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  1606 tcgtgttggtttgtggggtcagtcgataatcctgaaagcagtctgggatgttaca 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Original strand, 17590 - 17810
Alignment:
Q  116 ttgttgagatgagattttatacttggtgatgtattataatttga-gacatggttaattcgagatgttctactgattgtattggtgacgatatttttattc 214  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| | || ||||  | || |||||||| |||| | |||| | |||| ||| |||||||||    
T  17590 ttgttcagatgaaattttatatttggtgatgtagtatgattttaagatatggccacttggagatgttttactaaatgtagttgtgatgatgtttttattc 17689  T
Q  215 cagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatt 314  Q
       ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||    
T  17690 tgctgcgatgttttgagaaaattattatttatgcatgcttggtgatttattgaagaagtaacatctagattcttgatatgctcgtatcattcgcgtaatt 17789  T
Q  315 tatcgcttttagaatttaggg 335  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  17790 tatcgcttttagagtttaggg 17810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 341
Target Start/End: Original strand, 15818 - 15899
Alignment:
Q  260 tttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15818 tttattaaagaagtaacatatagattcttgatatgttcgtatcattagcgtaatttatcgcttttagagtttagggtgttac 15899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 49753 - 49609
Alignment:
Q  197 gtgacgatatttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtc 296  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  49753 gtgatgatgtttttattccgttgcgatgttttgagaaaattattatttatgtatgcttggtgatttattggccaagtaacatctagattcttgatatgtt 49654  T
Q  297 cgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49653 tgtatcattagtgtaatttatcgcttttagagtttagggtgttac 49609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 63201 - 63057
Alignment:
Q  197 gtgacgatatttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtc 296  Q
    |||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  63201 gtgatgatgtttttattccgttgcgatgttttgagaaaattattatttatgtatgcttggtgatttattggccaagtaacatctagattcttgatatgtt 63102  T
Q  297 cgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  63101 tgtatcattagtgtaatttatcgcttttagagtttagggtgttac 63057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 49920 - 49866
Alignment:
Q  50 gctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49920 gctttttcggagtctagtgtgtcagctcttattagtatgtctttatgtttggagt 49866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 63368 - 63314
Alignment:
Q  50 gctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  63368 gctttttcggagtctagtgtgtcagctcttattagtatgtctttatgtttggagt 63314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4916 - 4605
Alignment:
Q  50 gctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtctt-------------------atgact-agttgttgagatgaga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||| ||||||||||||||||    
T  4916 gctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtcttgtaactatttgttgtttttatgactcagttgttgagatgaga 4817  T
Q  130 ttttatacttggtgatgtattataattt-gagacatggttaattcgagatgttct-actgattgtattggtgacgatatttttattccagtgcaatgttt 227  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||| | | | |    | |  ||| | | ||| ||||||  ||| || |||    
T  4816 ttttata-ttggggatgtattatgattttgagacatggctacttagagatgtttttattaaacacagttttgatgttgtttatattccgctgcgattttt 4718  T
Q  228 tgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttaga 327  Q
    ||||| || | |||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4717 tgagagaattgttatttatgcgtgctttgtgacttattgaagaagtaacatctagattcttgatatg-ccgtatcattagcgtaatttatcgcttttcga 4619  T
Q  328 atttagggtgttac 341  Q
     |||||||||||||    
T  4618 gtttagggtgttac 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 432 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 4128 - 4006
Alignment:
Q  432 aatcacaccggagcgagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaaca 531  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||  ||||  || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4128 aatcacaccagaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctgtatcaaca 4029  T
Q  532 agatgcatcttctttttggtagc 554  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4028 agatgcatcttctttttggtagc 4006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 544
Target Start/End: Original strand, 23709 - 23785
Alignment:
Q  468 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttct 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23709 aggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcatcttct 23785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18558 - 18424
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaacta-ttatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatt 305  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  18558 ttttattccgctgcgatgttttgagaaaattagttatttatgcatgcttggtgatttattgaagatgtaacatttaaattcttgatatgatcgtatcatt 18459  T
Q  306 agcataatttatcgcttttagaatttagggtgtta 340  Q
    ||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  18458 agtttaatttatcgctttaagggtttagggtgtta 18424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18731 - 18669
Alignment:
Q  52 tttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtcttatgacta 114  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18731 ttttttggagtctggtgtgtcggctctgattaagacgtctttatgtttggagtattatgacta 18669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 239 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26479 - 26380
Alignment:
Q  239 ttatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgt 338  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26479 ttatttatgcatgcatg-tgatttattgaagaagtaacatctaaattcttgatatgtc-gtatcattagcataatttatcgtttttagagtttagggtgt 26382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 446 - 615
Target Start/End: Original strand, 26084 - 26251
Alignment:
Q  446 gagagggatcctaaggctatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctt 545  Q
    |||||||||||||||||  || |||| || |||| |||||||| |  | ||||||||  |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  26084 gagagggatcctaaggccgtgcaggtgtgagacttcatggttgcataatggcttatacaaattttttggtactacatatatcaacatgatgcatcttctt 26183  T
Q  546 tttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtga 615  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  26184 tttggtagctcattttataagaactc--cagttaagtgtgcttgacttggagtatttttaggatgagtga 26251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 467 - 548
Target Start/End: Original strand, 16071 - 16152
Alignment:
Q  467 taggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttcttttt 548  Q
    |||||||| || ||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  16071 taggtatgagattgcatagttgaatgatgacttgtaagaattgtttggtgctatctatatcaacatgatgcctctttttttt 16152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4953 - 4762
Alignment:
Q  117 tgttgagatgagattttatacttggtgatgtattataattt-gagacatggttaattcgagatgttctactgattgtattggtgacgatatttttattcc 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| || ||  ||||||| || | | |||| | |||| ||| ||||||||||    
T  4953 tgttgagatgagattttatatttggtgatgtagtatgattttgagacatggctacttacagatgttttaataaatgtagttgtgatgatgtttttattcc 4854  T
Q  216 agtgcaatgttttgagaaaacta-ttatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattag 307  Q
      ||| | |||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4853 gctgcgaagttt-gagaaaatttgttatttatgcatgtttggtgatttattgacgaattaacatctagacttttgatatgttcgtatcattag 4762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 470 - 618
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14927
Alignment:
Q  470 gtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaac 569  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||  || ||  ||||||||    
T  14779 gtataggactgcagtgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtaatacctatatcaataagatgcatcgtcttttcggtaattcattgaataagaac 14878  T
Q  570 tccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatgggtgacca 618  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||   | || |||||||||||||    
T  14879 ttcacagttaagcatgtttgacttggagtggtctttggatgggtgacca 14927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6665 - 6533
Alignment:
Q  207 ttttattccagtgcaatgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcatta 306  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| ||   ||||||||    
T  6665 ttttattccgctgcgatgttttgagaaagttgttatt-atgcatgcttggtgatttattgaagatgtaacatctaaattctggataggtta-tatcatta 6568  T
Q  307 gcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6567 gcgtaatttatcgcttttagaatttagggagttac 6533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0508 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0508
Description:

Target: scaffold0508; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5497 - 5381
Alignment:
Q  222 atgttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgct 321  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    |||||||||| | ||||||| ||    
T  5497 atgttttgagaaaa---ttatttatgcatgcttggtgatttattgaagaagtaacatctaaattctttatatgattatatcattagcgtgatttatcact 5401  T
Q  322 tttagaatttagggtgttac 341  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  5400 tttagagttcagggtgttac 5381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1191 - 1085
Alignment:
Q  233 aaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaattta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||| | ||    
T  1191 aaactattatttatgcatgcttggtggtttattgaagatgtaacatctaaattcttgatatg-ccgtttcattagcgtaatttatc-cctttagagtcta 1094  T
Q  333 gggtgttac 341  Q
    |||||||||    
T  1093 gggtgttac 1085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 1417 - 1357
Alignment:
Q  53 ttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtcttatgacta 114  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1417 ttttcggagtctactatgtcg-ctctgattaggatgtctttatgttttgagtcttatgacta 1357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1338 - 1285
Alignment:
Q  113 tagttgttgagatgagattttatacttggtgatgtattataat-ttgagacatgg 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1338 tagttgttgagatgagaatttata-ttggtgatgtattatgatattgagacatgg 1285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 341
Target Start/End: Original strand, 15196 - 15287
Alignment:
Q  249 atgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtgttac 341  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15196 atgcttggtgatttattgaagatgtaacatctaaattcttgatatg-ccgtatcattagtgtaatttatcgcttatagagtttagggtgttac 15287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 492 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 44807 - 44669
Alignment:
Q  492 gaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgac 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||  ||||||||  |||||  |  |||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  44807 gaaggcttataagaattgtttggtattaccggtaccaacaagatgccacttcttttcagtagccaggaccattagaactccaaagttaaatgtgcttgac 44708  T
Q  592 ttggagcaattttgggatgggtgaccaaccgggaagttt 630  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  44707 ttggatcaattttgggatgggtgaccttctgggaagttt 44669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 534 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 45219 - 45142
Alignment:
Q  534 atgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagcaattttgggatggg 612  Q
    ||||| ||||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  45219 atgcaacttcttttaagtagccagtaccataagaactccacatttaagtgtgcttgactt-gatcaattttgagatggg 45142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 500 - 617
Target Start/End: Original strand, 7009 - 7127
Alignment:
Q  500 ataagaattgtttggtactgcctat-atcaacaagatgcatcttctttttggtagctcgttccataagaactccacagttaagcgtgcttgacttggagc 598  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||  |   |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7009 ataagaattgtttggtactacatattaccaacaagatgcaccttttttttgacaatccaaaccataagaactccacagttaagcatgcttgacttggagc 7108  T
Q  599 aattttgggatgggtgacc 617  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7109 aattttggtatgggtgacc 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 341
Target Start/End: Original strand, 218387 - 218504
Alignment:
Q  224 gttttgagaaaactattatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttt 323  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||    
T  218387 gttttgagaaaattgctatttatgcatccttgatgatttattggcgaaatagcatctagattcttcatatgctcgtatcattagtgtgatttatcgcttt 218486  T
Q  324 tagaatttagggtgttac 341  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  218487 tagagtttaaggtgttac 218504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Original strand, 218205 - 218308
Alignment:
Q  25 cttgaggaaagctcggagcttcctcg-------ctttttcggagtctagtgtgttggctctgattaggatgtctttatgtttggagtcttatgactagtt 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  218205 cttgaggaaaactcggagcttcctcgtttgctgctttttcagagtctagtgtgtcggctctaattaggatgtctttctgtttggagtctcaggactattt 218304  T
Q  118 gttg 121  Q
    ||||    
T  218305 gttg 218308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 341
Target Start/End: Original strand, 627 - 730
Alignment:
Q  238 attatttatgcatgcttggtgatttattgatgaagtaacatctagattcttgatatgtccgtatcattagcataatttatcgcttttagaatttagggtg 337  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||| ||  || |||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  627 attatttatgcatgcttagcgaaatattgaagaagtaacatctaaatgatttatatgattgtatcattagcgtaatttattgcttttagagtttagggtg 726  T
Q  338 ttac 341  Q
    ||||    
T  727 ttac 730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 663 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 63022 - 62968
Alignment:
Q  663 ctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctg 717  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  63022 ctgaaaagactcgtattggtttgtggggtcagtcggcaatcctgaaagtagtctg 62968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 666 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 67275 - 67214
Alignment:
Q  666 aaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagtctgcggtgttaca 727  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  67275 aaaacacttgtgttggtttgtggggtcaatcggcaatcctgaaagcagtctgtgatgttaca 67214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 471 - 543
Target Start/End: Original strand, 45425 - 45497
Alignment:
Q  471 tatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaagatgcatcttc 543  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45425 tatgtgactacattgttgaaggaagacttatgagaattatttggtactacctatatcaacaagatgtatcttc 45497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 714
Target Start/End: Original strand, 6 - 57
Alignment:
Q  663 ctgaaaagactcgtgttggtttgtgggctcagtcggcaatcctgaaagcagt 714  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  6 ctgaaaagactcgtgttggtttgtagggtcagtaggcaatcctaaaagcagt 57  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 628 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 37263 - 37205
Alignment:
Q  628 tttcctagtaagcgtgcgagtgaggataaaatactctgaaaagactcgtgttggtttgt 686  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  37263 tttcctagtaaacgtgcgagtgagggaaaaacacgctgaaaagattcgtgttggtttgt 37205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University