View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4367-Insertion-1 (Length: 901)

Name: NF4367-Insertion-1
Description: NF4367
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4367-Insertion-1
NF4367-Insertion-1
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (192-901)||(33574623-33575331)
chr5 (189-901)||(15532200-15532911)
chr5 (191-901)||(15542384-15543093)
chr5 (288-901)||(26712439-26713052)
chr5 (288-901)||(26982177-26982790)
chr5 (189-862)||(34405422-34406094)
chr5 (188-862)||(14616428-14617100)
chr5 (188-862)||(22159317-22159993)
chr5 (186-861)||(7649939-7650611)
chr5 (539-853)||(11989166-11989480)
chr5 (191-432)||(11988864-11989108)
chr5 (189-294)||(26711464-26711567)
chr5 (189-294)||(26981201-26981304)
chr5 (605-710)||(23993447-23993552)
chr5 (503-562)||(13371932-13371991)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (189-901)||(22626312-22627023)
chr3 (189-901)||(11138570-11139279)
chr3 (189-901)||(39563510-39564216)
chr3 (356-856)||(13979070-13979565)
chr3 (260-857)||(35365957-35366549)
chr3 (493-855)||(47411772-47412125)
chr3 (375-544)||(46731386-46731555)
chr3 (251-299)||(20536397-20536445)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (189-901)||(31527924-31528635)
chr2 (199-901)||(31626082-31626784)
chr2 (197-901)||(40017513-40018216)
chr2 (260-785)||(16294550-16295073)
chr2 (189-901)||(13709607-13710315)
chr2 (189-841)||(23673345-23673995)
chr2 (188-901)||(36326460-36327172)
chr2 (390-860)||(32575887-32576355)
chr2 (589-650)||(8426783-8426844)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (189-899)||(13017189-13017898)
chr6 (189-901)||(22221259-22221967)
chr6 (189-901)||(22247094-22247802)
chr6 (189-862)||(14790192-14790864)
chr6 (260-862)||(14795220-14795821)
chr6 (186-863)||(1838046-1838723)
chr6 (356-862)||(32704421-32704925)
chr6 (339-863)||(19664815-19665337)
chr6 (314-860)||(20527286-20527832)
chr6 (320-858)||(16883254-16883791)
chr6 (300-535)||(30978321-30978557)
chr6 (531-901)||(32426904-32427271)
chr6 (396-803)||(12983586-12983994)
chr6 (396-785)||(12980699-12981089)
chr6 (613-862)||(15534662-15534912)
chr6 (389-860)||(7769588-7770070)
chr6 (260-569)||(15534923-15535230)
chr6 (499-621)||(15538036-15538158)
chr6 (779-863)||(15537856-15537940)
chr6 (357-450)||(27649087-27649180)
chr6 (260-431)||(15540574-15540744)
chr6 (663-729)||(15537971-15538037)
chr6 (375-450)||(32427286-32427362)
chr6 (320-386)||(11183966-11184032)
chr6 (669-710)||(2330478-2330519)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (189-901)||(12171517-12172218)
chr4 (260-862)||(647274-647875)
chr4 (260-862)||(650546-651148)
chr4 (339-901)||(26062841-26063403)
chr4 (381-860)||(26060163-26060641)
chr4 (189-860)||(2541461-2542128)
chr4 (385-446)||(11649429-11649490)
chr4 (543-578)||(6031606-6031641)
chr4 (669-710)||(13978982-13979023)
chr4 (669-710)||(56089543-56089584)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (189-901)||(23759609-23760319)
chr7 (197-901)||(11279027-11279728)
chr7 (187-901)||(33312529-33313241)
chr7 (197-888)||(46846320-46847007)
chr7 (197-901)||(294400-295098)
chr7 (197-867)||(36222317-36222984)
chr7 (189-862)||(17866353-17867025)
chr7 (189-862)||(6966721-6967393)
chr7 (297-862)||(17863202-17863766)
chr7 (189-901)||(24782941-24783654)
chr7 (323-860)||(23107566-23108100)
chr7 (387-860)||(36843135-36843607)
chr7 (370-860)||(9765373-9765867)
chr7 (260-857)||(3861977-3862562)
chr7 (662-860)||(23313673-23313871)
chr7 (312-578)||(23313382-23313648)
chr7 (714-863)||(35773054-35773204)
chr7 (541-710)||(2719269-2719438)
chr7 (543-578)||(27796692-27796727)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (189-692)||(9606-10109)
scaffold0440 (837-901)||(9544-9608)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (189-750)||(24185-24743)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (375-901)||(7177-7703)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (375-901)||(2226-2754)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (189-862)||(13492836-13493508)
chr1 (189-901)||(13495523-13496232)
chr1 (260-901)||(32505931-32506563)
chr1 (387-901)||(27282305-27282817)
chr1 (312-851)||(34065929-34066468)
chr1 (190-901)||(1936163-1936873)
chr1 (311-901)||(16190299-16190886)
chr1 (260-695)||(39545983-39546417)
chr1 (463-857)||(23990361-23990754)
chr1 (502-777)||(22104683-22104956)
chr1 (389-821)||(21152871-21153301)
chr1 (470-696)||(22453415-22453641)
chr1 (396-821)||(22456699-22457123)
chr1 (189-526)||(10764829-10765165)
chr1 (388-721)||(15297047-15297378)
chr1 (747-862)||(10759695-10759810)
chr1 (71-169)||(14484115-14484213)
chr1 (71-168)||(14505370-14505467)
chr1 (71-169)||(14469118-14469216)
chr1 (396-509)||(49147825-49147936)
chr1 (313-386)||(8435285-8435358)
chr1 (762-803)||(49147740-49147781)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (197-860)||(12575308-12575969)
chr8 (375-860)||(13096606-13097081)
chr8 (375-850)||(44007889-44008356)
chr8 (312-669)||(41778864-41779213)
chr8 (71-189)||(17029190-17029308)
chr8 (71-189)||(17559626-17559744)
chr8 (260-450)||(14418450-14418639)
chr8 (747-832)||(41779233-41779318)
chr8 (385-446)||(41836418-41836479)
chr8 (587-629)||(14418355-14418397)
chr8 (7-73)||(17029100-17029166)
chr8 (7-73)||(17559536-17559602)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (385-901)||(2799-3317)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (375-860)||(5995-6479)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (547-862)||(1-316)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (260-450)||(79-268)
scaffold0363 (587-629)||(321-363)
[»] scaffold0400 (1 HSPs)
scaffold0400 (71-168)||(7793-7890)
[»] scaffold0365 (1 HSPs)
scaffold0365 (71-168)||(8437-8534)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (669-710)||(7086-7127)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 618; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 618; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 192 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 33575331 - 33574623
Alignment:
Q  192 tagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33575331 tagaaatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaa-aattcgttttcacgaggactgtatttaacttctatttagcaattttattattaaaa 33575233  T
Q  292 aggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagag 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33575232 aggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagag 33575133  T
Q  392 aagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaactta 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33575132 aagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaattacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaactta 33575033  T
Q  492 gtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgt 591  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  33575032 gtaattctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaatgt 33574933  T
Q  592 taatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtca 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33574932 taatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagttagggttagtggtca 33574833  T
Q  692 ttcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaac 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574832 ttcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaac 33574733  T
Q  792 taaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactc 891  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33574732 taaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactc 33574633  T
Q  892 atagctaaag 901  Q
    ||||||||||    
T  33574632 atagctaaag 33574623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Original strand, 15532200 - 15532911
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532200 tgatagatatttggcatgtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaa-aattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 15532298  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggttttta-gaaaattg 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15532299 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattg 15532398  T
Q  388 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15532399 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaa 15532498  T
Q  488 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaa 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  15532499 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtatta-acga 15532597  T
Q  588 acgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtg 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532598 acgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtg 15532697  T
Q  688 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataa 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  15532698 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataa 15532797  T
Q  788 aaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtt 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15532798 aaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatctcatgaattaaccacaaaagaattagtt 15532897  T
Q  888 actcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||    
T  15532898 actcatagctaaag 15532911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 191 - 901
Target Start/End: Original strand, 15542384 - 15543093
Alignment:
Q  191 atagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaa 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15542384 atagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaa-aattcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttaacaatttcattattaaa 15542482  T
Q  291 aaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggttttta-gaaaattgag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15542483 aaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgag 15542582  T
Q  390 agaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaact 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15542583 agaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaact 15542682  T
Q  490 tagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaac 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  15542683 tagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttgatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtatta-acgaac 15542781  T
Q  590 gttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggt 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542782 gttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggt 15542881  T
Q  690 cattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaa 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  15542882 cattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataaaa 15542981  T
Q  790 actaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttac 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15542982 actaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatctcatgaattaaccacaaaagaattagttac 15543081  T
Q  890 tcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||    
T  15543082 tcatagctaaag 15543093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 288 - 901
Target Start/End: Original strand, 26712439 - 26713052
Alignment:
Q  288 aaaaaggatgtataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactga-ttaaaaacaataaagaattggtttttagaaaat 385  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||    
T  26712439 aaaaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctagacagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttt-agaaaat 26712537  T
Q  386 -tgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggat 484  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26712538 ctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaatt-caatcaatgattatttagtttcacgacagat 26712636  T
Q  485 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaca 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26712637 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaa 26712736  T
Q  585 caaacgttaatccctatatcataacctaataatga---tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccaggg 681  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26712737 agaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccaggg 26712836  T
Q  682 ttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatat 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26712837 ttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatat 26712936  T
Q  782 gaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaa 881  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||    
T  26712937 gaataaagactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggtt-ccgtaggattacatcagatttatctcaggaattaaccacaa---aa 26713032  T
Q  882 ttagttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26713033 ttagttactcatagctaaag 26713052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 288 - 901
Target Start/End: Original strand, 26982177 - 26982790
Alignment:
Q  288 aaaaaggatgtataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactga-ttaaaaacaataaagaattggtttttagaaaat 385  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||    
T  26982177 aaaaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctagacagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttt-agaaaat 26982275  T
Q  386 -tgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggat 484  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26982276 ctgagagaagaatggttaagtctttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaatt-caatcaatgattatttagtttcacgacagat 26982374  T
Q  485 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaca 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26982375 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaa 26982474  T
Q  585 caaacgttaatccctatatcataacctaataatga---tctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccaggg 681  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26982475 agaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccaggg 26982574  T
Q  682 ttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatat 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26982575 ttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatat 26982674  T
Q  782 gaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaa 881  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||    
T  26982675 gaataaagactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggtt-ccgtaggattacatcagatttatctcaggaattaaccacaa---aa 26982770  T
Q  882 ttagttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26982771 ttagttactcatagctaaag 26982790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 34406094 - 34405422
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||  || | | ||||| ||| || |||| ||  |||| |||||||  |||||||| |||| |    
T  34406094 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 34405995  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt- 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| |||| |||     
T  34405994 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgttgt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttcagaatatta 34405897  T
Q  387 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  34405896 gagagaagtatggttaagaccttcaaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagatta 34405798  T
Q  487 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca 586  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |      
T  34405797 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctcctcgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggttttaaaag 34405698  T
Q  587 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagt 686  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  34405697 aacgttaatccctatctcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagt 34405598  T
Q  687 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaata 786  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||     
T  34405597 ggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaatt 34405498  T
Q  787 aaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 862  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405497 aaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 34405422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 188 - 862
Target Start/End: Original strand, 14616428 - 14617100
Alignment:
Q  188 atgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatt 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| |||  ||||||| ||| |  |||| ||  |||| |||||||  |||||||| ||||     
T  14616428 atgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatc 14616526  T
Q  288 aaaaaggatgtataaatttatattggtg-cccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 386  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | ||| |||| |||| |||    
T  14616527 aaaaaggatgtatgaatttatattgattaccctaggaagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttgattttaagaatatt 14616624  T
Q  387 -gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 485  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  14616625 agagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctaatt-caatcaatgattatctagtttaacgacagatt 14616723  T
Q  486 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacac 585  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||       
T  14616724 aacaaagtaattctacccaatctcttgacctataattctccccgcaagtgacaagcccttaatctcttgagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaca 14616823  T
Q  586 aaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttag 685  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  14616824 aaacgttaatccatatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccatggttag 14616923  T
Q  686 tggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaat 785  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||  |||||||||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  14616924 tggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtattcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaat 14617023  T
Q  786 aaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 862  Q
     ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14617024 taaaactagactttcattgatatttaaaggagttcaacaaactagggttctcataggattacatcatattcatctca 14617100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 188 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 22159993 - 22159317
Alignment:
Q  188 atgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatt 287  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  22159993 atgatagatatttgacaagtgtaccaaattcgatcgaagtaataaaa-aatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttctttgtc 22159895  T
Q  288 aaaaaggatgtata--aatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttag-taacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaa 384  Q
    ||||||||||||||  || ||  |  | ||||| |||||||||  ||| |||   |||  |||||  |   ||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  22159894 aaaaaggatgtatattaaattcaaaggttgccctaggcagttggattggtttttataaagtaaacgtaaataaaacaataaa-aattggttttaagaata 22159796  T
Q  385 tt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacgga 483  Q
    || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  || | |||||||||  | |||||||||| ||| |||||  ||||  ||    
T  22159795 ttagagagaaatatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaaatcgcactcctagtt-caatcaatgactatctagttcaacgataga 22159697  T
Q  484 ttaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattac 583  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22159696 ttaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccacaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtttta- 22159598  T
Q  584 aca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggt 682  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  22159597 acagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagtttgattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagccagggt 22159498  T
Q  683 tagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaac-atacataaggcattaaacacaaggtaatat 781  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  22159497 taatggtcattcaatctctaacatcaatttgtatattcataaagctatggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcattaaacacaaagtaatat 22159398  T
Q  782 gaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 862  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22159397 gaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcggattcatctca 22159317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 186 - 861
Target Start/End: Original strand, 7649939 - 7650611
Alignment:
Q  186 taatgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcatta 285  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||  ||||||| | | |  |||| ||  |||| ||||||| | ||||||| |||    
T  7649939 taatgatagagatttgacaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttcttta 7650037  T
Q  286 ttaaaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaa 384  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | ||| |||| |||| |    
T  7650038 tcaaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttgcttttaagaata 7650135  T
Q  385 tt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacgga 483  Q
    || |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||  ||    
T  7650136 ttagagagaagtatggttaagacatttgaatcctacgaagttcttctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagtttaaagataga 7650234  T
Q  484 ttaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattac 583  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||     
T  7650235 ttaacaaggtaattctactcaatctctttacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttgagtgaattcgaaatcgctggaggttttaa 7650334  T
Q  584 acaaacgttaatccctatatc---------ataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaa 674  Q
       || |||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||    
T  7650335 tagaaggttaatccctatgtcataacctaaataacctaataatgatctatctctagcttgattttttaggttaaacttattacctagttctgagtcaaaa 7650434  T
Q  675 gccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaag 774  Q
    ||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  ||||||||| ||     
T  7650435 gc---ggttagtggttattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacataaa 7650531  T
Q  775 gtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctc 861  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||      ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  7650532 gtaacatgaataaagactagactttcattgatatt------agttcaacaaattagggtt-ccataaaattacatcaaattcatctc 7650611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 539 - 853
Target Start/End: Original strand, 11989166 - 11989480
Alignment:
Q  539 accccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgatta 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11989166 accccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaatagaacgttaatctctatgttaaaacctaataatgatctatctctaacttgatta 11989265  T
Q  639 cttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaata 738  Q
    | ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  11989266 cataggttaaacctaatacctagatcagagtcaaaagcgaaggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgtatattcataaagctagggttagta 11989365  T
Q  739 gtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttccca 838  Q
    ||| ||  |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11989366 gtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaataaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttccca 11989465  T
Q  839 taggattacatcaga 853  Q
    ||  |||||||||||    
T  11989466 taaaattacatcaga 11989480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 432
Target Start/End: Original strand, 11988864 - 11989108
Alignment:
Q  191 atagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttcta--cttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |  | || ||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  11988864 atagatatttgacaagtgaatcaaattcaatcgaagtaataaat-aattcgtttccacgagaaccgttcttaacttctatacttagcaatttcattagta 11988962  T
Q  289 aaaaggatgtata--aatttatattggtgcccgaggcagttgagttgattta-gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaat 385  Q
    | ||||| |||||  || ||  || ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||| |||||||    
T  11988963 ataaggacgtatattaaattcaat-ggtcccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacagattaaaaacgataaaagattgatttt-agaaaat 11989060  T
Q  386 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctat 432  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11989061 tagagagaagtaaggttaagaccttcgaatcctccaaagttctcctat 11989108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 294
Target Start/End: Original strand, 26711464 - 26711567
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  26711464 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaa-aattcgtttccacgaggactgtatt-aacttctacttagcaatttcattatca 26711561  T
Q  289 aaaagg 294  Q
    ||||||    
T  26711562 aaaagg 26711567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 294
Target Start/End: Original strand, 26981201 - 26981304
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  26981201 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaattgaagtaataaaa-aattcgtttccacgaggactgtatt-aacttctacttagcaatttcattatca 26981298  T
Q  289 aaaagg 294  Q
    ||||||    
T  26981299 aaaagg 26981304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 710
Target Start/End: Original strand, 23993447 - 23993552
Alignment:
Q  605 ataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatg 704  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||  ||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  23993447 ataacctaataattgtctatctctagcttaatttcttaggttaaccatatttcctagatcagattcaaaagtcatggctagtggtcattcaagttctaag 23993546  T
Q  705 atcaat 710  Q
    ||||||    
T  23993547 atcaat 23993552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 13371991 - 13371932
Alignment:
Q  503 caatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatt 562  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13371991 caatctcttgacttagaactctcccctaaagtcacaatcccttaatctcttaagtgaatt 13371932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 610; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 610; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Original strand, 22626312 - 22627023
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626312 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaa-agttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 22626410  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22626411 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggattt-agaaaattga 22626509  T
Q  389 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626510 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 22626609  T
Q  489 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaa 588  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22626610 ttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaa 22626709  T
Q  589 cgttaatccctatatcataacctaataatgatct-atctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtg 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626710 cgttaatccctatatcataacctaataatgatcttatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtg 22626809  T
Q  688 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataa 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22626810 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataa 22626909  T
Q  788 aaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtt 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22626910 aaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagtt 22627009  T
Q  888 actcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||    
T  22627010 actcatagctaaag 22627023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Original strand, 11138570 - 11139279
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11138570 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaa-agttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 11138668  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  11138669 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaatatagaattggattc-agaaaattga 11138767  T
Q  389 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11138768 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 11138867  T
Q  489 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaa 588  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  11138868 ttagtaattctatccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattcgaaaccataggaggtattaaacgaa 11138967  T
Q  589 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtgg 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11138968 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattactgaggttaaacctatta-ctatttcagagttaaaagccagggttagtgg 11139066  T
Q  689 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaa 788  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11139067 ccattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtttatcataaacatacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataaa 11139166  T
Q  789 aactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtta 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11139167 aactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaagaattaaccacaaaagaattagtta 11139266  T
Q  889 ctcatagctaaag 901  Q
    |||| ||||||||    
T  11139267 ctcaaagctaaag 11139279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Original strand, 39563510 - 39564216
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39563510 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcaaagtaataaaa-aattcgtttccacgaggactgtatt-aacttctacttagcaatttcattataa 39563607  T
Q  289 aaaaggatgtataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactga-ttaaaaacaataaagaattggtttttagaaaat- 385  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||     
T  39563608 aaaaggatgtgtaaaatttatattagtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaacaaaattaaaaatagtaaaagattggtttt-agaaaatc 39563706  T
Q  386 tgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 485  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39563707 tgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctccgacgctctcctatgataatttgcactcctaatt-caatcaatggttatttagtttcacgacagatt 39563805  T
Q  486 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacac 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  39563806 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtattaaaa 39563905  T
Q  586 aaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttag 685  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  39563906 gaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcaga-ttaaaagtcagggttag 39564004  T
Q  686 tggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaat 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39564005 tggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcaatgataaacatacataaagcattaaacacaaggtaatatgaat 39564104  T
Q  786 aaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattag 885  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||    
T  39564105 aaagactaaactttcattaatgttcaaaggagttcaacaaattagggtt-tcgtaggattacatcagatttatctcaggaattaaccacaa---aattag 39564200  T
Q  886 ttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||||    
T  39564201 ttactcatagctaaag 39564216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 356 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 13979565 - 13979070
Alignment:
Q  356 aaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatac 454  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | |    
T  13979565 aaaacaataaa-agttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcc-aagttc 13979468  T
Q  455 aatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctta 554  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13979467 aaacaatgattatttagtttcatgacagattaacttagtaactctatccaatcccttgacctagaattctccccgcaagtgacaacctcttaatctctta 13979368  T
Q  555 agtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctat 654  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  13979367 agtgaattcgaaatcgttcgaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctccaacttgattacttaagttaaaactat 13979268  T
Q  655 tacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacata 754  Q
    |||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||  ||   |||    
T  13979267 tacctagttcagagtcgaaagtcagggtcagtggtcattcaatctctacgatcaatttgcat-ttcataaagctagggtcagtagtcgatgata---ata 13979172  T
Q  755 cataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagat 854  Q
    |  ||  ||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13979171 cgaaaaacattaaacaaaaagtaatatgaaaaaagactaaactttcatttaaattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataagattacctcagat 13979072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 260 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 35366549 - 35365957
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgat-ttagtaacataaactgattaaaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||| |||||| | || |||||||||||||  ||||     
T  35366549 ttaacttctacttagcaatttcattat-aaaaaggatgtattaaattttag-gttgccctaggcagtcgagttggtatttgtaacataaactgtgtaaag 35366452  T
Q  359 acaataaagaattggtttttagaaaat--tgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaa 456  Q
    ||  |||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||||||||  |||| |||||||  | | ||| ||| |  ||||||||| ||  ||| |||    
T  35366451 acggtaaa-agttggtttt-agaaattaatgagaaaaatatggttaagatcttcaaatcctctaatgttcttctacggtaatttgcacccc--aattcaa 35366356  T
Q  457 tcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaag 556  Q
    |||||| | || || ||| |||||  ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35366355 tcaatgttcatataatttaacgacaaattaacaagataattctactcaatctcttgacctagaactctctccgcgagtgacaatcccttaatctcttaag 35366256  T
Q  557 tgaattcgaaaccattggaggtattacacaaac-gttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctatt 655  Q
    ||||||| | ||  |||||||| ||| |||  | |||||||| |   ||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35366255 tgaattcaagactcttggaggtttta-acagtccgttaatccatgagtcatagcctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaacctatt 35366157  T
Q  656 acctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatac 755  Q
    |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||| |||| |||||  | ||||| | || ||||| ||  ||||||||     
T  35366156 acctagatcagagtcaaaagccaaggctagtggtcattcaagttttaagatcaatttgcacattcacgatgctagtgctagtagtcaataataaacata- 35366058  T
Q  756 ataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttca-acaaattagggttcccataggattacatcagat 854  Q
    | |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| || |||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  35366057 aaacaacattaaacacaaggtaatatgaat-taaactagtctttcattaatattcaagagagttcatacaaatta-ggtttccatagagttacatcagat 35365960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 493 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 47412125 - 47411772
Alignment:
Q  493 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaac-gt 591  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||  || ||| ||| | ||| |||  | ||    
T  47412125 taattctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaa--------tctcttaagtgaattcgggactattagagatttta-acagtctgt 47412035  T
Q  592 taatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtca 691  Q
    ||||| ||   ||| || ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  47412034 taatctctgagtcacaatctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaaggcaggactagtgatca 47411935  T
Q  692 ttcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaac 791  Q
    ||||| ||||| ||||||| | ||||||||  ||| ||| | || ||||| ||  |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  47411934 ttcaagttctaagatcaattttcatattcaagaagttagtgctagtagtcaataataaacatacaaacaacattaaacacaaggtaatatgaat-taaac 47411836  T
Q  792 taaactttcattgatgttcaaaggagttca-acaaattagggttcccataggattacatcagatt 855  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  47411835 tagactttcattgatattcaagggagttcatacatatta-ggtttccataaaattacatcagatt 47411772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 375 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 46731555 - 46731386
Alignment:
Q  375 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 473  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  46731555 ttttagaaaattagagagatgtaaggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagtt 46731457  T
Q  474 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccct 544  Q
      |||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  46731456 caacgacatattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctggagttctccccgcaagtaacaacccct 46731386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 299
Target Start/End: Original strand, 20536397 - 20536445
Alignment:
Q  251 ggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536397 ggactgtatttaacttctacttagaaatttcattattaaaaaggatgta 20536445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 598; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 31528635 - 31527924
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528635 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaa-aatttgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 31528537  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggttttta-gaaaattg 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31528536 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattg 31528437  T
Q  388 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31528436 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctctaaagctctcctgtggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacagattaa 31528337  T
Q  488 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaa 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  31528336 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccaatggaggtatta-acga 31528238  T
Q  588 acgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtg 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528237 acgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtg 31528138  T
Q  688 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataa 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31528137 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaataagaataa 31528038  T
Q  788 aaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtt 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31528037 aaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagtt 31527938  T
Q  888 actcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||    
T  31527937 actcatagctaaag 31527924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 199 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 31626784 - 31626082
Alignment:
Q  199 ttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgt 298  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31626784 ttggtaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaa--attcgtttcaatgaggactgtatt-aacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgt 31626688  T
Q  299 ataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactga-ttaaaaacaataaagaattggtttttagaaaat-tgagagaagt 395  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||     
T  31626687 gtaaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaaaggaattaaaaataataaaggattggtttt-agaaaatctgagagaaga 31626589  T
Q  396 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 495  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31626588 atggttaagtcattcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaattattatttagtttcacgacagattaacttagtaa 31626490  T
Q  496 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaat 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||    
T  31626489 ttctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcgttggaggtattaaaagaacgttaat 31626390  T
Q  596 ccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattca 695  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31626389 ccttatgttataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattca 31626290  T
Q  696 atttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaata--aaaacta 793  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |  | ||    
T  31626289 atttctataatcaatatgtatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaaacattaaacacagggtaatatgaatagtaggatta 31626190  T
Q  794 aactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcat 893  Q
     |     ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31626189 catcaatatgtatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatctcaagaattaaccacaaaagaattagttactcat 31626090  T
Q  894 agctaaag 901  Q
    ||||||||    
T  31626089 agctaaag 31626082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 40018216 - 40017513
Alignment:
Q  197 atttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| | || ||| || |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  40018216 atttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaa-aatttgttttcacaaggagtgcatttaacttcgacttggcaatttttttattaaaaaggat 40018118  T
Q  297 gtataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagt 395  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||    |||||||||||||||    
T  40018117 gtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattt-gtaacataaacggattaaaaacaataagagactggtttaagaaaaattgagagaagt 40018019  T
Q  396 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattattta---gtttcacgacggattaacttag 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   |||| ||||| |||||||| ||    
T  40018018 atggttaagaccttcgaatcctccgaaactctcctatggtaatttgcactcctaatt-caaccaatgattatttataagttttacgacagattaactcag 40017920  T
Q  493 taattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgtt 592  Q
    || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||    
T  40017919 tacttctccccaatcctttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccc-ttattctcttaagtgaattcgaaactgttggaggtattaaaagaacgtt 40017821  T
Q  593 aatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcat 692  Q
    ||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  40017820 aattcatatgtcatgacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcaaagtcaaaagccagggtcagtggtcat 40017721  T
Q  693 tcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaact 792  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40017720 tcaatctctacgatcaatttgcatattcataaagatagggtcagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagact 40017621  T
Q  793 aaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactca 892  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40017620 aaactttcattgaaattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcatattcatctcaag-cttaaccacaaaagaattagttactca 40017522  T
Q  893 tagctaaag 901  Q
    ||| |||||    
T  40017521 tagttaaag 40017513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 260 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 16295073 - 16294550
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaa 358  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  16295073 ttaatttctactcagcaatttcgttatcgaaa-ggatgtataaaatttatattgatgccctaggcagttgagttgattttgtatcataaaccgattaaaa 16294975  T
Q  359 acaa-taaagaattggtttttagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaat 457  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |  |||    
T  16294974 acaaataaaga-ttagttttcagaaaattgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagttt-aat 16294877  T
Q  458 caatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagt 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16294876 caatgattatttagtttcacgacagattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagt 16294777  T
Q  558 gaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattac 657  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16294776 gaattcgaaaccgttggaggtattaaagaa-cgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattac 16294678  T
Q  658 ctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacat 757  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||     
T  16294677 atagttcagagttaaaagccagagttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacac 16294578  T
Q  758 aaggcattaaacacaaggtaatatgaat 785  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  16294577 aaagcattaaacacaaggtaatatgaat 16294550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 13710315 - 13709607
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||   |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13710315 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaa--attcgtttttacgagaactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 13710218  T
Q  289 aaaaggatgtataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt- 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||     
T  13710217 aaaaggatgtataaaatttatattgatgcctgaggaagttgagttgagtt-gtaacataaacggattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattt 13710120  T
Q  387 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaa-gctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 485  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  |  |||||||||| |||||  || || ||||    
T  13710119 gagagaagtatggttaagaccttcaaatcatctgaaagctctcctatgataatttgcactcctaattt-aggcaatgattatctagttcaacaacagatt 13710021  T
Q  486 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacac 585  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||       
T  13710020 aacaaagtaattctacccgatctcttgacccataattctcccctcaagtgacaaccccataatctctttagtgaattcgaaatcgttggaggttttaaca 13709921  T
Q  586 aaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttag 685  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  13709920 aaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatatctagcttgattacttgggttaaacttatcacctaggtcagagtcaaaatccagggttag 13709821  T
Q  686 tggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaat 785  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  13709820 tggtcattcaatctctaagatcaatttacatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaat 13709721  T
Q  786 aaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattag 885  Q
     |||| || |||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13709720 taaaattagactttcattgatattc-ttgaagttcaacaaattagggttcacataggattacatcagattcatctca-gaattaaccacaagagaattag 13709623  T
Q  886 ttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||||    
T  13709622 ttactcatagctaaag 13709607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 189 - 841
Target Start/End: Original strand, 23673345 - 23673995
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| |||  ||||||| ||| |  |||| ||  |||| ||||||| | ||||||| |||| |    
T  23673345 tgatagagatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatca 23673443  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttg--atttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 386  Q
    |||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||||||  |||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  23673444 aaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttggattggcattt-gtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttt-agaaaatt 23673540  T
Q  387 -gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 485  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||  |||    
T  23673541 agagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagtttaacgacaaatt 23673639  T
Q  486 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacac 585  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||    
T  23673640 aacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacagttggaggtttta-ac 23673738  T
Q  586 a-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggtta 684  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  23673739 agaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagtcagggata 23673838  T
Q  685 gtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaa 784  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||    
T  23673839 gtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaa 23673938  T
Q  785 taaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccatag 841  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23673939 ttaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattaaggttcccatag 23673995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 188 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 36327172 - 36326460
Alignment:
Q  188 atgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatt 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||| |||  ||||||| ||| |  |||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||     
T  36327172 atgatagatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactctgcaatttctttatc 36327074  T
Q  288 aaaaaggatgtat-aaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgat-ttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaat 385  Q
    ||||| ||||||| ||||| | | |  ||||| ||| ||||   ||| | || |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  36327073 aaaaaagatgtattaaattcaaagt--tgccctaggaagttagattggtatttgtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttt-agaaaat 36326977  T
Q  386 t-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggat 484  Q
    | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||| ||||  |||    
T  36326976 tagagagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctaatttaacgatagat 36326878  T
Q  485 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattc----gaaaccattggaggtat 580  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||  ||||||||||    
T  36326877 taacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaagtgacaactccttaatctcttaagtgaattaatttgaaactgttggaggtat 36326778  T
Q  581 tacaca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccag 679  Q
    || ||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  36326777 ta-acagaacgttaatccctgtgtcatagcctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcaaagtcaaaagccag 36326679  T
Q  680 ggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaat 779  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||  ||| || |||||||||| || |||||    
T  36326678 ggttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaac--acaaaaagcattaaacataaagtaat 36326581  T
Q  780 atgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaag 879  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  36326580 atgaattaaaactagactttcattgatattcaaatgagttcaacaaactagggttcccataggattacatcagattcatctcaag-cttaaccacaaaag 36326482  T
Q  880 aattagttactcatagctaaag 901  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  36326481 aattagttactcatagataaag 36326460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 390 - 860
Target Start/End: Original strand, 32575887 - 32576355
Alignment:
Q  390 agaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaact 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32575887 agaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagctctcctatgataatttgcactcctagtt-caaaaaatgattatttagtttcacgacagattaact 32575985  T
Q  490 tagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaac 589  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||| |  |||    
T  32575986 tagtaactctaccaaatcccttgacctagaattctccccacaagtgacaaccccttaatctcttgactgaattcgaaattgttggaggtattaaaagaac 32576085  T
Q  590 gttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggt 689  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||| |    
T  32576086 gttaatccctatgtcgtaacctaataaagatctatctttagcttgattatttaggttaaacatattacctagttcatagtcaaaagacagggtcagtgat 32576185  T
Q  690 cattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaa 789  Q
    |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||| ||  ||||||| || || ||||| |||| || |||||||| |||||     
T  32576186 cattcaatctatacgatcaatttgcatattcataaagttaggatcagtagtcaatgataaacatgcaaaaagcatt-aacaaaaagtaatatggataaag 32576284  T
Q  790 actaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32576285 actaaactttcattgaaattcaaaggagttcaacaaattagggttcctataggattacatcatattcatct 32576355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 589 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 8426844 - 8426783
Alignment:
Q  589 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaac 650  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8426844 cgttaatccctaaatcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaac 8426783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 899
Target Start/End: Original strand, 13017189 - 13017898
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017189 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaa-agttcgtttccacgaggactatatttaacttctacttagcaatttcattatta 13017287  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggttttt-agaaaattg 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13017288 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttcagaaaattg 13017387  T
Q  388 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017388 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatatgatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 13017487  T
Q  488 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaa 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13017488 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtatta-acga 13017586  T
Q  588 acgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtg 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13017587 acgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaagagccagggttagtg 13017686  T
Q  688 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataa 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13017687 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataacgctagggttaatagtctatcataaacgtacataaggcattaagcacaaagtaatatgaataa 13017786  T
Q  788 aaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtt 887  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13017787 aaactaaactttcatttatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagtt 13017886  T
Q  888 actcatagctaa 899  Q
    ||||||||||||    
T  13017887 actcatagctaa 13017898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 22221967 - 22221259
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||  || | ||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22221967 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaata-aattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattatta 22221869  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga 388  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221868 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga 22221771  T
Q  389 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 488  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22221770 gagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggattaac 22221671  T
Q  489 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaa 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  22221670 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaacaaa 22221571  T
Q  589 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtgg 688  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  22221570 cgttaatccatatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattaccttttttagatttaaaagccagggttagtgg 22221471  T
Q  689 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaa 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221470 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaa 22221371  T
Q  789 aactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtta 888  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22221370 aactaaactttcattgatgttcaaaagagttcaacaaattagggtt-ccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagtta 22221272  T
Q  889 ctcatagctaaag 901  Q
    |||||||| ||||    
T  22221271 ctcatagcgaaag 22221259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 22247802 - 22247094
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||  || | ||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22247802 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaata-aattcgtttccacgaggactatatttagcttctactaagcaatttcattatta 22247704  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga 388  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247703 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaactaattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga 22247606  T
Q  389 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 488  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22247605 gagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcttaaatacaatcaatgattatttagtatcacgacggattaac 22247506  T
Q  489 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaa 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  22247505 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctcaagtgaattcgaaaccattagaggaattaaacaaa 22247406  T
Q  589 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtgg 688  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22247405 cgttaatccatatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtgg 22247306  T
Q  689 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaa 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247305 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctatggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaa 22247206  T
Q  789 aactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtta 888  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22247205 aaccaaactttcattgatgttcaaaagagttcaacaaattagggtt-ccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagtta 22247107  T
Q  889 ctcatagctaaag 901  Q
    |||||||| ||||    
T  22247106 ctcatagcgaaag 22247094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 14790864 - 14790192
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||  || | | ||||| ||| |  |||| ||  |||| |||||||  |||||||| |||| |    
T  14790864 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 14790765  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt- 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| |||| |||     
T  14790764 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttcagaatatta 14790667  T
Q  387 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  14790666 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagatta 14790568  T
Q  487 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca 586  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |      
T  14790567 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaag 14790468  T
Q  587 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagt 686  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  14790467 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagt 14790368  T
Q  687 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaata 786  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||     
T  14790367 ggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaatt 14790268  T
Q  787 aaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 862  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14790267 aaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 14790192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 260 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 14795821 - 14795220
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaa 358  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |   |||    
T  14795821 ttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaa 14795723  T
Q  359 acaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaat 457  Q
    |||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||     
T  14795722 acaataaa-agttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caag 14795625  T
Q  458 caatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagt 557  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14795624 caatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagt 14795525  T
Q  558 gaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattac 657  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14795524 gaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattac 14795425  T
Q  658 ctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacat 757  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||     
T  14795424 ctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaa 14795325  T
Q  758 aaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattca 857  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14795324 aaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattca 14795225  T
Q  858 tctca 862  Q
    |||||    
T  14795224 tctca 14795220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 186 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 1838723 - 1838046
Alignment:
Q  186 taatgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcatta 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||  ||||||| ||| || |||| ||  |||| |||||||  |||||||| |||    
T  1838723 taatgatagagatttggcaagtgaaccaaaatt-atcgaagtaataaataaattcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttta 1838625  T
Q  286 ttaaaaaggatgtataaatttatattggtgc--ccgaggcagttgagttgatttag-taacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaa 382  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |    || || ||||||  ||| |||   |||  |||||  | |||||  |||||| | |||||||| ||||    
T  1838624 tcaaaaaggatgtataaatttatattgatttttcctagacagttggattggtttttataaagtaaacgtaataaaag-aataaa-agttggttttaagaa 1838527  T
Q  383 aatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacg 481  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||  |||||     
T  1838526 tattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgt-aattcgcactcctagtt-caatcaacgattatttagttcaacgaca 1838429  T
Q  482 gattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtatt 581  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  1838428 gattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaactccttaatctcttaagtgaatttgaaaccattggagatttt 1838329  T
Q  582 acaca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagg 680  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  1838328 a-acataacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagatcagagtcaaaagtcagg 1838230  T
Q  681 gttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaac-atacataaggcattaaacacaaggtaat 779  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||    
T  1838229 gttagtggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaat 1838130  T
Q  780 atgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcag 863  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1838129 atgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaataaattagggttcccataggattacatcagattcatctcag 1838046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 356 - 862
Target Start/End: Original strand, 32704421 - 32704925
Alignment:
Q  356 aaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatac 454  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |    
T  32704421 aaaacaataaa-agttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-c 32704518  T
Q  455 aatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctctta 554  Q
    || |||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32704519 aagcaatgattatctagtttaacgacagattaacagagtaattctacccaatctcttgaaatagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctctta 32704618  T
Q  555 agtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctat 654  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  32704619 agtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctatcttgattacttaggttaaacttat 32704718  T
Q  655 tacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacata 754  Q
    ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||    
T  32704719 tacttagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacata 32704818  T
Q  755 cataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagat 854  Q
    || ||  ||||||||| || ||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32704819 caaaaaacattaaacataaagtaat-tgacttaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagat 32704917  T
Q  855 tcatctca 862  Q
    ||||||||    
T  32704918 tcatctca 32704925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 339 - 863
Target Start/End: Original strand, 19664815 - 19665337
Alignment:
Q  339 gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaa 437  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  19664815 gtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggttta-agaaaattagagagatgtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaa 19664913  T
Q  438 tttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgac 537  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  19664914 tttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagtt-cacgacagattaacaaagtaactctacccaatatcttgacctagagttctccccgcaagtaac 19665011  T
Q  538 aaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgatt 637  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19665012 atccccttaatctcttaagtgaattcgaaatcattggagattttaatagaacgttaatccctatgtcataacctaata-tgatctatctctatcttgatt 19665110  T
Q  638 acttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaat 737  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19665111 acttaggttaaacctattacctagatcagaattaaaagtcagggttagtgatcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttagt 19665210  T
Q  738 agtctatcgtaaac-atacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcc 836  Q
    |||| ||  ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19665211 agtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaatgagttcaacaaattagggttcc 19665310  T
Q  837 cataggattacatcagattcatctcag 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19665311 cataggattacatcagattcatctcag 19665337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 314 - 860
Target Start/End: Original strand, 20527286 - 20527832
Alignment:
Q  314 tgcccgaggcagttgagttgattta-gtaacataaac-tgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttc 410  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||| | | ||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20527286 tgccctaggcagttgaattgatttttgtaacgtaaacataaataaaaacaataaa-agttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagaccttc 20527384  T
Q  411 gaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctct 510  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||  | ||| | ||||||||||||    
T  20527385 gaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctaacttcacgacagattaacaaattaactttacccaatctct 20527483  T
Q  511 tgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaatccctatatcataac 609  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||     
T  20527484 tgacctagaattctccccgcaagtaacaaccc-ttaatctcttaagtgaatttgaaaccgttggaggtttta-acagaacgttaatccctatgtcataat 20527581  T
Q  610 ctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaa 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  20527582 ctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaaaatcaa 20527681  T
Q  710 tatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgtt 809  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||| | || |||||||||||| ||    
T  20527682 tttgcatattcataaagctagggttaggagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaatataaagtaatatgaataaagattagactttcattgatatt 20527781  T
Q  810 caaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20527782 caaaggagttcaacacattaaggttcccataaaattacatcagattcatct 20527832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 320 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 16883791 - 16883254
Alignment:
Q  320 aggcagttgagttgattta-gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcct 417  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16883791 aggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacattcgaatcct 16883693  T
Q  418 ccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgaccta 517  Q
     ||||| |||||||||  |||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||  |||||||  |||||||  | |||  ||||||||||||||||||||    
T  16883692 tcgaagttctcctatggtaatttgcactactaatt-caaacaatgattatctatgttcacgaaagattaacacaataaccctacccaatctcttgaccta 16883594  T
Q  518 gaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaatccctatatcataacctaataa 616  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||    
T  16883593 gaattctccccacaagtggcaaccccttaatctcttatgtgaattcaaaaccgttggaggtttta-acagaacattaatccctatg-catcacctaataa 16883496  T
Q  617 tgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcat 716  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  16883495 tgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagtcaaaagtgagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcat 16883396  T
Q  717 attcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaagga 816  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||| | || |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  16883395 attcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaagataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaagga 16883296  T
Q  817 gttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcat 858  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16883295 gttcaacaaattagggttctcataaaattacatcagattcat 16883254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 300 - 535
Target Start/End: Original strand, 30978321 - 30978557
Alignment:
Q  300 taaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggttttta-gaaaattgagagaagtatg 398  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30978321 taaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaattgagagaagtatg 30978420  T
Q  399 gttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978421 gttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattc 30978520  T
Q  499 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978521 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 30978557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 531 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 32427271 - 32426904
Alignment:
Q  531 aagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctcta 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32427271 aagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtatta-acagaatgttaatccctatgtcataacataataatgatctatctcta 32427173  T
Q  630 gcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagcta 729  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  | |||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| || |||||| |    
T  32427172 gattgattacttaggttaaacttattacctagatcag--tcaaaatccagagttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatactcctaaagcca 32427075  T
Q  730 gggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaatta 829  Q
    |||||| | ||| ||  |||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32427074 gggttagtggtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaacta 32426975  T
Q  830 gggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaag 901  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32426974 gggttctcataggattatatcatattcatctcaag-cttaaccacaaaagaattagttactcctagctaaag 32426904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 396 - 803
Target Start/End: Original strand, 12983586 - 12983994
Alignment:
Q  396 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 495  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||  | ||||||||| |  | |||||| ||||| |||||||  |||||    
T  12983586 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatctgtaccccta--ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaa 12983683  T
Q  496 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaa 594  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||   ||||||    
T  12983684 ttctacccaatctcttgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtttta-acagtccgttaa 12983782  T
Q  595 tccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattc 694  Q
    ||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12983783 tccatgtgtcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattc 12983882  T
Q  695 aatttctatgatcaatatgcatattcataaa-gctagggttaatagtc--tatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaac 791  Q
    || ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| | || || ||  |||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12983883 aagttctaagatcagtttgcatattcaaaaacgctagtgctagtactcaatataataaacatacagacagcattaaacacaaggtaatatgaattaaaac 12983982  T
Q  792 taaactttcatt 803  Q
    || |||| ||||    
T  12983983 tagacttccatt 12983994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 396 - 785
Target Start/End: Original strand, 12980699 - 12981089
Alignment:
Q  396 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 495  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||  | ||||||||| |  | |||||| ||||| |||||||  |||||    
T  12980699 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatgaaaatttgtaccccta--ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaa 12980796  T
Q  496 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaa 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||   ||||||    
T  12980797 ttctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccgcttaatctcttaagtgaattcgaaattgttggaggtttta-acagtccgttaa 12980895  T
Q  595 tccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattc 694  Q
    ||| |   ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12980896 tccatgagtcataacctaatacttttctatctctagcttaattacttaggttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcagggctagtggtcattc 12980995  T
Q  695 aatttctatgatcaatatgcatattcataaa-gctagggttaatagtc--tatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaat 785  Q
    || ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| | || |||||  |||  |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  12980996 aagttctaagatcagtttgcatattcaaaaacgctagtgctagtagtcaatataataaacatacagacaacattaaacacaaggtaatatgaat 12981089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 613 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 15534912 - 15534662
Alignment:
Q  613 ataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatat 712  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||  |||||| |    
T  15534912 ataatgatctatcactagcttgattacttatgttaaacctattaccaagatcagagttaaaagtcaagtttagtggtcactcaatctctaacatcaattt 15534813  T
Q  713 gcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaaca-tacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttca 811  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  15534812 tcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattca 15534713  T
Q  812 aaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 862  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534712 aaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 15534662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 389 - 860
Target Start/End: Original strand, 7769588 - 7770070
Alignment:
Q  389 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 488  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||    
T  7769588 gagaaatatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttatatggtaatttgcac-cctcaattcaatcaatgttcatttagtttaacgacatattaac 7769686  T
Q  489 ttagtaattctacccaatctcttgacctag----aattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaag---tgaattcgaaaccattggaggtatt 581  Q
      ||||||||||| |||||| |||||||||    ||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||   ||||||||||| | |||||||| ||    
T  7769687 aaagtaattctactcaatcttttgacctagctataattctctctgcaagtgctaaccccttaatctcttcagtgatgaattcgaaatctttggaggtttt 7769786  T
Q  582 acaca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagc---- 676  Q
    | |||   |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||| | ||||||        
T  7769787 a-acagtccgttaatccctaaatcataacctaataattgtctatctctaacttaattacttaggttaaacatatttcctagatcagattcaaaagccatg 7769885  T
Q  677 cagggttagtggtcattcaatttctat--gatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaag 774  Q
    || || |||||||||||||| ||||||  ||| ||| | || |||||  | ||||| | || ||||  ||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  7769886 catggctagtggtcattcaagttctataagataaatttacacattcaagatgctagtgctagtagttaatcataaacatacatatgtcattaaacacaag 7769985  T
Q  775 gtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttca-acaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
    | |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||   ||| | ||||||||||||||||||    
T  7769986 gaaatatgaat-taaactagactttcattgatattcaagggagttcatacaaatta-ggtattcatggaattacatcagattcatct 7770070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 260 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 15535230 - 15534923
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaa 359  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||||    
T  15535230 ttaacttctactcagccatttctttataaaaaaggatgtattaaattcaag-gttgccctaggcagttgagttgattttgtaaaacaaatagattaaaaa 15535132  T
Q  360 caataaagaattggtttttagaaaattga-gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatc 458  Q
    |||||||   |||||||| | |||||| | | || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||| | |||||    
T  15535131 caataaaagtttggtttt-acaaaattaaagtgatgtatggttaagaccttcaaatcctccgaagttttcctatggtaatttgcattcctaatt-caatc 15535034  T
Q  459 aatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtg 558  Q
    ||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15535033 aatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaactctaaccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacctcttaatctcttaagtg 15534934  T
Q  559 aattcgaaacc 569  Q
    |||||||||||    
T  15534933 aattcgaaacc 15534923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 499 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 15538158 - 15538036
Alignment:
Q  499 tacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaatcc 597  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15538158 tacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaacaccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtttta-acagaacgttaatcc 15538060  T
Q  598 ctatatcataacctaataatgatc 621  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  15538059 ctatgtcataacttaataatgatc 15538036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 779 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 15537940 - 15537856
Alignment:
Q  779 tatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcag 863  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15537940 tatgaataaaaattagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatatgattacatcaaattcatctcag 15537856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 357 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 27649180 - 27649087
Alignment:
Q  357 aaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaa 450  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||    
T  27649180 aaacaataaa-agttggttttaagaaaattagagcgaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcacttctaa 27649087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15540744 - 15540574
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaa 359  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| || ||  |  | | ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||    
T  15540744 ttaacttctactcagcaatttctatatcaaaaaggatgtattaaattcaag-gtttccctaggcagttgagttgattttctaaaataaagggattaaaaa 15540646  T
Q  360 caataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctccta 431  Q
    ||||||| | ||   ||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15540645 caataaa-agtttagttttagaaaattaaagagatttatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctccta 15540574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 15538037 - 15537971
Alignment:
Q  663 tcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagcta 729  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  15538037 tcagagttaaaagcaagggttagtgatcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaaacta 15537971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 375 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 32427362 - 32427286
Alignment:
Q  375 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaa 450  Q
    |||||||||||| |||||| || || ||||| |||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  32427362 ttttagaaaattagagagatgtttgattaagacctttgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaa 32427286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 386
Target Start/End: Original strand, 11183966 - 11184032
Alignment:
Q  320 aggcagttgagttga-tttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 386  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11183966 aggcagttgagttgatttttgtaacataaacgtaataaaaacaataaa-agttggtttttagaaaatt 11184032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 669 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 2330519 - 2330478
Alignment:
Q  669 ttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaat 710  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2330519 ttaaaagctagggttagtagtcattcaatttctaagatcaat 2330478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 567; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 12172218 - 12171517
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172218 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaagatcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 12172119  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||          
T  12172118 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagatttggtttctagaa------ 12172025  T
Q  389 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 488  Q
         |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172024 -----gtatggttaagtccttggaatcttccgaagctcgcctatggtaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 12171930  T
Q  489 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaa 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  12171929 ttagtaattctacccaatctcttgacctacaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaa 12171830  T
Q  589 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtgg 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12171829 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattaagaattaaaagccagggttagtgg 12171730  T
Q  689 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaa 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171729 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaa 12171630  T
Q  789 aactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtta 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12171629 aactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaatttgggttccaatagggttacatcagattcatctcagaaattaaccacaaaagaattagtta 12171530  T
Q  889 ctcatagctaaag 901  Q
    |||||||||||||    
T  12171529 ctcatagctaaag 12171517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 260 - 862
Target Start/End: Original strand, 647274 - 647875
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaa 358  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  |   |||    
T  647274 ttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcatttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaa 647372  T
Q  359 acaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaat 457  Q
    |||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||     
T  647373 acaataaa-agttggttttcagaatattagagagaagtatggttaagatcttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caag 647470  T
Q  458 caatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagt 557  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  647471 caatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagt 647570  T
Q  558 gaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattac 657  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  647571 gaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattac 647670  T
Q  658 ctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacat 757  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||     
T  647671 ctagatcagagtcaaaagccagggttagtggccatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaa 647770  T
Q  758 aaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattca 857  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  647771 aaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattca 647870  T
Q  858 tctca 862  Q
    |||||    
T  647871 tctca 647875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 260 - 862
Target Start/End: Original strand, 650546 - 651148
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaa 358  Q
    |||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||  |   |||    
T  650546 ttaatttctactcggcaatttctatatcaaaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcatttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaa 650644  T
Q  359 acaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaat 457  Q
    |||||||| | |||||||| | || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||     
T  650645 acaataaa-agttggttttcataatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caag 650742  T
Q  458 caatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagt 557  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  650743 caatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagt 650842  T
Q  558 gaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattac 657  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  650843 gaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattac 650942  T
Q  658 ctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacat 757  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |  | ||  ||||||||||     
T  650943 ctagatcagagtcaaaagccagggttagtggccatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagttagggttaggaaacaatgataaacatacaa 651042  T
Q  758 aaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaatta-gggttcccataggattacatcagattc 856  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  651043 aaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattaggggttcccataggattacatcagattc 651142  T
Q  857 atctca 862  Q
    ||||||    
T  651143 atctca 651148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 339 - 901
Target Start/End: Original strand, 26062841 - 26063403
Alignment:
Q  339 gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt---gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgac 435  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||      
T  26062841 gtaaaataaacggattaaaaacaataaaagtttggtttt-agaaaattagagagagatgtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggt 26062939  T
Q  436 aatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtg 535  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26062940 aatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagta 26063038  T
Q  536 acaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttg 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26063039 acaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtttta-acagaacgtttatccatatgtcataacctaataatgatcaatctctagcttg 26063137  T
Q  635 attacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggtt 734  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26063138 attacttaggttaa-cctattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggtt 26063236  T
Q  735 aatagtctatcgtaaaca-tacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggt 833  Q
    | ||||| ||  |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  26063237 attagtcgatgataaacaatacaaaaagcattaaacacaaagtaatatgaataaaaactagactttcattgacattcaaaggagttcaacaaatcagggt 26063336  T
Q  834 tcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||   | ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  26063337 tcccatatgattacattagattcatctcagtc-tcaaccacaaagaaattagttactcatatctaaag 26063403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 381 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 26060641 - 26060163
Alignment:
Q  381 aaaattgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgac 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| |||     
T  26060641 aaaattgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagcttcccgat 26060543  T
Q  481 ggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtat 580  Q
     |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26060542 agattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagaattctccctgcaaataacaaccccttaatgtcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttt 26060443  T
Q  581 tacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagg 680  Q
    ||    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||| || |    
T  26060442 taatagaacgttaatccctatgtcataacctaataatggtctatctctagcttgattacttaagttaaacatattacctagatcagagtcaaaagtcatg 26060343  T
Q  681 gttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaata 780  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  26060342 gttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgtatattcatgaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaata 26060243  T
Q  781 tgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||  |||| |||| ||||||||    
T  26060242 tgaataaaatctagacttttattgatattcaaaagagttcaacaaactaggattctcatacaattatatcatattcatct 26060163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 189 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 2542128 - 2541461
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||  ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2542128 tgatagatatttggcaagtgtaccaaagtcaatcgaagtaataaat-aattcgtatccacgaggactgtatttaacttctactgagcaatttcattatta 2542030  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattg 387  Q
    |||||||||||| || ||  | |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||     
T  2542029 aaaaggatgtattaaatt-caatggtgccctaggcagttgagtttattcttgtaacataaacggattaaaaacaataaaatataggttttttgaaaatt- 2541932  T
Q  388 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 487  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||| |||||| | | ||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  2541931 aaagaggtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcttatggtaatttgtactcct-atttcaagcaatgattatctagttaaacgacagattaa 2541833  T
Q  488 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca- 586  Q
    |  ||||||| || |||||||||||||||| |||||| | || || | |||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||| |||     
T  2541832 caaagtaattttatccaatctcttgacctaaaattcttctcggaaataacaatccattaatctcttaaatgaattcaaaaccattgaaggtttta-acag 2541734  T
Q  587 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagt 686  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  2541733 tccgttaatccctatatcataacctaataattgtctatctctagcttaattacttaggttaaacattccacctagttcagagttaaaagccggtgttagt 2541634  T
Q  687 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaata 786  Q
    ||||| |||| ||||| |||||   |||| | | || ||||||||  |  ||||| ||  |||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  2541633 ggtcaatcaagttctaagatcagcctgcaaacttatcaagctaggacttgtagtcaataataaacatacgaaaatcattaaacacaagataatatgaata 2541534  T
Q  787 aaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
    ||||||| ||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2541533 aaaactagacttttattgat-atgaaaggaattcaacaaattagagttcccataagattacattagattcatct 2541461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 446
Target Start/End: Original strand, 11649429 - 11649490
Alignment:
Q  385 ttgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactc 446  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  11649429 ttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 11649490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6031641 - 6031606
Alignment:
Q  543 cttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggt 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6031641 cttaatctcttaagtgaattcgaaaccattagaggt 6031606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 669 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 13979023 - 13978982
Alignment:
Q  669 ttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaat 710  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13979023 ttaaaagctagggttagtggtcattcaattcctaagatcaat 13978982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 669 - 710
Target Start/End: Original strand, 56089543 - 56089584
Alignment:
Q  669 ttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaat 710  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  56089543 ttaaaagctagggttagtggtcattcaattcctaagatcaat 56089584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 558; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Original strand, 23759609 - 23760319
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23759609 tgatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaa-agttcgtttctacgaggactgtatttaacttctacttagcaaattcatt-tta 23759706  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggttttta-gaaaattg 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23759707 aaaaggatgtataaatttatattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttaagaaaatcg 23759806  T
Q  388 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23759807 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccaaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacgatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 23759906  T
Q  488 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaa 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  23759907 cttagtaattctacccaatctcttgccctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaaccattggaggtatta-acga 23760005  T
Q  588 acgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtg 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23760006 acgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcggagttaaaagccagggttagtg 23760105  T
Q  688 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataa 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  23760106 gtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcacgacgctaggattaatagtctatcataaacgtacataaggtactaagcacaaagtaatatgaataa 23760205  T
Q  788 aaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtt 887  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23760206 aaactaaactttcattaatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagtt 23760305  T
Q  888 actcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||    
T  23760306 actcatagctaaag 23760319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 11279728 - 11279027
Alignment:
Q  197 atttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279728 atttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaa--atttgtttccacaaggactatatttaatttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 11279631  T
Q  297 gtataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaac-aataaagaattggtttttagaaaattgagagaag 394  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11279630 gtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaactgattaaaaacgaataaaga-ttggtttttagaagattgagagaag 11279532  T
Q  395 tatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagta 494  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||  ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11279531 tatggttaagtccttcgaatctttcgaagttctcctctggtaatttgcactcctagtt-caataaatgattatttagtttcacgacagattaacttagta 11279433  T
Q  495 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaa 594  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |  ||||||||    
T  11279432 attctacccaatctcttgacctaggattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatctgaaaccgttggaggtatta-atgaacgttaa 11279334  T
Q  595 tccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattc 694  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279333 tctctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagttaaaagccagggttagtggtcattc 11279234  T
Q  695 aatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaa 794  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11279233 aatttctatgatcaatatgcatgttcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaagcacaaggtaatatgaataaagactaa 11279134  T
Q  795 actttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcata 894  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11279133 actttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatctcacgaattaaccacaaaagaattagttactcata 11279034  T
Q  895 gctaaag 901  Q
    | |||||    
T  11279033 ggtaaag 11279027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 187 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 33313241 - 33312529
Alignment:
Q  187 aatgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattat 286  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33313241 aatgatagatatttgagaagtgaaacaaattcaatcgaagtaataaaa--attcgtttctacgaggactgtatt-aacttctacttagcaatttcattat 33313145  T
Q  287 taaaaaggatgtataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactga-ttaaaaacaataaagaattggtttttagaaaa 384  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  33313144 taaaaaggatgtgtaaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttgtaacataaacggaattaaaaataataaaggattggtttt-agaaaa 33313046  T
Q  385 t-tgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacgga 483  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33313045 tctgagagaaaaatggttaagtccttcgaatcctctgaagctctcctatggtaatttgctttcctaatt-caatcaatgattatttagtttcacgacgaa 33312947  T
Q  484 ttaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattac 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||     
T  33312946 ttaacttagtaattctacccaatcttttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaaatgaattcgaaaccggcggaggtattaa 33312847  T
Q  584 acaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggtt 683  Q
    |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33312846 aagaacgttaatccatatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacatattacctagttcagagttaaaagtcagggtt 33312747  T
Q  684 agtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatga 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33312746 agtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatga 33312647  T
Q  784 ataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaatt 883  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33312646 ataaagactaaattttcattaatgttcaatggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaatt 33312547  T
Q  884 agttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33312546 agttactcatagctaaag 33312529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 888
Target Start/End: Original strand, 46846320 - 46847007
Alignment:
Q  197 atttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 296  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||  ||  |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46846320 atttggcaagtgaatcagattcaatcgaagtaataaaaatat--gtttccacgaggactgtatttaatttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 46846417  T
Q  297 gtataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaa-caataaagaattggtttttagaaaattgagagaag 394  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46846418 gtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgaattcttattataaactgactaaaaaacaataaaagattggtttttagaaaattgagagaag 46846517  T
Q  395 tatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagta 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  46846518 tatggttaagtccttcgaatcctccgaagttcttctatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatttagtttcacgacagattaacctaata 46846616  T
Q  495 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaa 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |  | ||||||    
T  46846617 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaactgaattcgaaaacgttggaggttttaaaagatcgttaa 46846716  T
Q  595 tccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattc 694  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  46846717 tccctatgtcataacctaataataatctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacttagttcagagttaaaagtcagggttagtgatcattc 46846816  T
Q  695 aatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaa 794  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46846817 aatttccatgatcaatatgcatgttc---aagctagggttaatagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaataaagactaa 46846913  T
Q  795 actttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagtta 888  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46846914 actttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccatagggttacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagtta 46847007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 295098 - 294400
Alignment:
Q  197 atttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295098 atttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaa-aatttgtgtccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 295000  T
Q  297 gta-taaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagt 395  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  294999 gtaataaatttatattgatgcccgaggcagt--agttgtttt-gtaacataagctggttaaaagcaaataaggattggtttt-agaaaattgagagaagt 294904  T
Q  396 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 495  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||  ||||| |||||||  |||||    
T  294903 atggttaagtctttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaa-tgcaatcaatgattatctaattcaacgacagattaacaaagtaa 294805  T
Q  496 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaat 595  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||   ||||||||||    
T  294804 ttatacccaatctcttgaactagaattctccccataagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggatgttttaacaaaacgttaat 294705  T
Q  596 ccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattca 695  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  294704 ccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattca 294605  T
Q  696 atttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaa 795  Q
    || |||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||| |||| || |    
T  294604 atctctaagatcaatttgcatattcataaaactagagttaatagttcatgataaacatacaataagcattaaacataaagtaatatgaattaaaattata 294505  T
Q  796 ctttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatag 895  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  294504 ctttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataggattacatcagattcatctcagg-attaaccacaagagaattagttactcatag 294406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 197 - 867
Target Start/End: Original strand, 36222317 - 36222984
Alignment:
Q  197 atttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 296  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| || |  ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36222317 atttggcaaatgaaccaaattcaattgaagtaataaaa--attcgttaccacgaggattgtatttaatttctacgtagcaatttcattattaaaaaggat 36222414  T
Q  297 gtataaa-tttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattgagagaagt 395  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36222415 gtataaaatttatattggtgccctaggcagttgagttgattttctaacataaactgattaaaaacaaagaaagattggtttttagaagattgagagaagt 36222514  T
Q  396 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  36222515 atggttaagtccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattttcactcctagtt-caatcaatgattatttagtttcactacaaattaacttagtaa 36222613  T
Q  496 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaat 595  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | || |||||||    
T  36222614 ttttacctaatctcttgacctagaattctcc-----agtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaagtatttaagaa-cgttaat 36222707  T
Q  596 ccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattca 695  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36222708 ctctatgtcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaatctattagctagttcagagttaaaagcgagggttagtggtcattca 36222807  T
Q  696 atttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaa-taaaaactaa 794  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36222808 atttccatgatcaatatgcatgttcataaagctagggctagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacacaaggtaatatgaattaaagactaa 36222907  T
Q  795 actttcat------tgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaat 867  Q
    ||||||||      |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36222908 actttcattgaatatgatattcaaa-gagttcaacaaattaggattcccatagg-ttacatcagattcacctcaggaat 36222984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 862
Target Start/End: Original strand, 17866353 - 17867025
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||  || | | ||||| ||| |  |||| ||  |||| |||||||  |||||||| |||| |    
T  17866353 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 17866452  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt- 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| |||| |||     
T  17866453 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagctgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttcagaatatta 17866550  T
Q  387 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 486  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  17866551 gagagaagtatggtttagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagatta 17866649  T
Q  487 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca 586  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |      
T  17866650 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaag 17866749  T
Q  587 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagt 686  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  17866750 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagt 17866849  T
Q  687 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaata 786  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||     
T  17866850 ggtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaatt 17866949  T
Q  787 aaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 862  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17866950 aaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 17867025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 6967393 - 6966721
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||  || | | ||||| ||| |  |||| ||  |||| |||||||  |||||||| |||| |    
T  6967393 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 6967294  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt- 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| |||| |||     
T  6967293 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttcagaatatta 6967196  T
Q  387 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  6967195 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgatagatta 6967097  T
Q  487 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca 586  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |      
T  6967096 acaaagtaattctacccaatctcttaacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaag 6966997  T
Q  587 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagt 686  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6966996 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagt 6966897  T
Q  687 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaata 786  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||     
T  6966896 ggtcatttaatctctaagatcagtttgaatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaatt 6966797  T
Q  787 aaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 862  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6966796 aaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 6966721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 297 - 862
Target Start/End: Original strand, 17863202 - 17863766
Alignment:
Q  297 gtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaag 394  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  17863202 gtataaatttatattgattgccctaggcagttgagctgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttcagaatattagagagaag 17863299  T
Q  395 tatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagta 494  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||    
T  17863300 tatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagattaacaaagta 17863398  T
Q  495 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaa 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||    
T  17863399 attctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaa 17863498  T
Q  595 tccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattc 694  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17863499 tccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttagtggtcattt 17863598  T
Q  695 aatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaa 794  Q
    ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| |||||||     
T  17863599 aatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactag 17863698  T
Q  795 actttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 862  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17863699 actttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 17863766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 24783654 - 24782941
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcatt-att 287  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||  |||| || ||| |  |||| ||  |||| |||||||  |||||||| || ||     
T  24783654 tgatagagatttgacaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttcttttatc 24783556  T
Q  288 aaaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |   ||||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  24783555 aaaaaggatgtataaatttatattgattgtccaaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacttaaataaaacaataaa-agttggttttaagaatatt 24783458  T
Q  387 -gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 485  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||| |||||| ||||  ||||    
T  24783457 agagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcatatggtaattttcattcctaatt-caatcaatgattatctagtttaacgagagatt 24783359  T
Q  486 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacac 585  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||    
T  24783358 aacaaagtaattatacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggagatttta-ac 24783260  T
Q  586 a-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgatta---cttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccaggg 681  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24783259 agaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatatatctctagcttgattattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccaggg 24783160  T
Q  682 ttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatat 781  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || |||| ||||| || |||||||    
T  24783159 ttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctatggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcatcaaacataaagtaatat 24783060  T
Q  782 gaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaa 881  Q
    | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||  |    
T  24783059 ggattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactacggttcccataggattacatcagattcatcttaag-cttaaccacaaaaaga 24782961  T
Q  882 ttagttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  24782960 ttagttactcataactaaag 24782941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 323 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 23108100 - 23107566
Alignment:
Q  323 cagttgagttgat-ttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccg 420  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  23108100 cagttgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaaatgtggttaagaccttcgaatcatccg 23108002  T
Q  421 aagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaa 520  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||    
T  23108001 aagctctcctatggtaatttgcactcctagtt-caaacaatgattatttagtttcacaacagattaacttagtaactctacccaattccttgagctataa 23107903  T
Q  521 ttctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgat 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23107902 ttctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaattgtttgaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgat 23107803  T
Q  621 ctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattc 720  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  23107802 ctatctctaacttgattacttaggttaaacctattacctagttcagagtcaaaagtctgggtcagtggtcattcaatctctactatcaatttgcatattc 23107703  T
Q  721 ataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttc 820  Q
    |||| | |||||||||||||| ||  ||||||| || || |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23107702 ataacgttagggttaatagtcgatgataaacatgcaaaaagcattaaacaaaaagtaatatgaataaagactaaactttcattgaaattcaaaggagttc 23107603  T
Q  821 aacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
    |||||   |||||| | ||| |||||||||| ||||||||    
T  23107602 aacaa---agggtttctataagattacatcaaattcatct 23107566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 387 - 860
Target Start/End: Original strand, 36843135 - 36843607
Alignment:
Q  387 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 486  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  36843135 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaattcgcactcctactt-caatcaatgattatctagttcaacgacagatta 36843233  T
Q  487 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca 586  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36843234 acaaattaactctacccaatctcttgacctagagttctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtttta-aca 36843332  T
Q  587 -aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttag 685  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  36843333 gaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccaggattag 36843432  T
Q  686 tggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaac-atacataaggcattaaacacaaggtaatatgaa 784  Q
    |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  36843433 tggtcattcaatctctaacatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatgataaacaatataaaaagcattaaacacaaagtaatatgaa 36843532  T
Q  785 taaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  36843533 taaaaactagactttcattgacattcaaa-gagttcaacaaattagagttcccacaagattacatcaaattcatct 36843607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 370 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 9765867 - 9765373
Alignment:
Q  370 ttggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatt 468  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||     
T  9765867 ttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatc 9765769  T
Q  469 tagtttcacga---------cggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtga 559  Q
    |||||||||||         | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  9765768 tagtttcacgagtttcacggcagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctataattctccctgcaagtaaaatacccttaatctcttaagtga 9765669  T
Q  560 attcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacct 659  Q
    ||||||||||||| ||||| |||   |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9765668 attcgaaaccattagaggttttaacaaaacattagtccttatgtcataacctaataatcatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattacct 9765569  T
Q  660 aattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataa 759  Q
    |   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||      ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||    
T  9765568 agaccagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaat-----cgatcaatttgcatatccataaagctagggttaatagtcgatggtaaacatgcaaaa 9765474  T
Q  760 ggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatc 859  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9765473 cgcattaaacataaagtaatatgaataaaaactagacttttattcatattcaaagaagttcaacaaattagggttctcataggattacatcatattcatc 9765374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 260 - 857
Target Start/End: Original strand, 3861977 - 3862562
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgattta--gtaacataaactgattaaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  || | ||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  3861977 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaa-ggatgtattaaattcaat-gatgccctaggcagttcaattgattttttgtaacataaactgattaaa 3862074  T
Q  358 aacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaa 456  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||        ||||||||| ||| |||    
T  3862075 aacaataaaagattgg-ttttataaaattagagagaagtatgattaagaccttcgaatccttcgaagttctccta--------tgcactcct-aattcaa 3862164  T
Q  457 tcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccc----ttaatctct 552  Q
      ||||||||| |||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  3862165 gaaatgattatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaattaatgtct 3862264  T
Q  553 taagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacct 652  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| || |||  |   | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  3862265 taagtgaattcaaaactgttggaagttttaaccgtcctttaatccctatatcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacac 3862364  T
Q  653 attacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaaca 752  Q
    |  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||| || || | |||| ||| ||       ||| || ||||| ||  ||||||    
T  3862365 accacctagttcagagtttaaagccagggttagtggtcaattaagttctaagaccagtctgcaaatttat-------gggctagtagtcaataataaaca 3862457  T
Q  753 tacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcag 852  Q
    |||| || |||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  3862458 tacacaaagcattaaaaacaagatgatataaataaaaactagactttcattgatatttaaaggagttcaacaaattagggttctcataagattacattag 3862557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 662 - 860
Target Start/End: Original strand, 23313673 - 23313871
Alignment:
Q  662 ttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataagg 761  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| || |    
T  23313673 ttcagagtcaaaagccaaggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggtttgtagtcgatgataaacatacaaaaag 23313772  T
Q  762 cattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23313773 cattaaacataaagtaacatgaataaagactagactttcattgatattcaaaggagtttaacaaattagagttcccataagattacatcggattcatct 23313871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 312 - 578
Target Start/End: Original strand, 23313382 - 23313648
Alignment:
Q  312 ggtgcccgaggcagttgagttgattta-gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtcctt 409  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23313382 ggtgccctaggtagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagaatggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacctt 23313480  T
Q  410 cgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctc 509  Q
     ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||| ||||| ||  ||||||   |||| |||||||||||||    
T  23313481 tgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactactaatt-caaacaatgattatctaggttcacaacatattaacactgtaactctacccaatctc 23313579  T
Q  510 ttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggt 578  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  23313580 ttggcctagaattctccccgcaagtggaaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggt 23313648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 714 - 863
Target Start/End: Original strand, 35773054 - 35773204
Alignment:
Q  714 catattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaaca-tacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaa 812  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  ||  |||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  35773054 catattcataaagttagggttagtagttgatgataaacaatacaaaaagcatttaacacaaagtaatatgaataaaaactaaactttcattgacattcaa 35773153  T
Q  813 aggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcag 863  Q
    | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  35773154 atgagttcaacaaattagagttcttataggattacataagattcatctcag 35773204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 541 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 2719438 - 2719269
Alignment:
Q  541 cccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattact 640  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||     | ||||||||  || |||||||| ||| |||  |||||||||||||| |||| |    
T  2719438 cccttaatctcttaagtgaattcaaaaccgttggaggtttttatagatcgttaatctataaatcataacttaacaattgtctatctctagcttaattaat 2719339  T
Q  641 taggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaat 710  Q
    || ||||| |  ||||| ||  ||||| | |||  | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2719338 taagttaatcggattacttagatcagattcaaacactagggctagtagtcattcaaattctatgatcaat 2719269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27796727 - 27796692
Alignment:
Q  543 cttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggt 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27796727 cttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggt 27796692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 10109 - 9606
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10109 tgatagaaatttggcaagtgaatcaaattcgatcgaagtaataaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 10010  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10009 aaaaggatgtataaatttatattggtcccctaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaataattggtttttagaaaattga 9910  T
Q  389 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9909 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggcaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 9810  T
Q  489 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaa 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9809 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaaacgaa 9710  T
Q  589 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtgg 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9709 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctttagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtgg 9610  T
Q  689 tcat 692  Q
    ||||    
T  9609 tcat 9606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 837 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 9608 - 9544
Alignment:
Q  837 cataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9608 cataggattacatcagattcatctcaggaattaaccacaaaagaattagttactcatagctaaag 9544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 750
Target Start/End: Original strand, 24185 - 24743
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||  || | |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24185 tgatagaaatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaata-aatttgtttccacgaggactgtatttaacttctactcaacaatttcattatta 24283  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga 388  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24284 aaaaggatgtataaattattattggtgccctaggcagttgagttgatttagtaa--taaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga 24381  T
Q  389 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 488  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24382 gagaagcatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctaaatacaataaatgattatttagtatcacgacggattaac 24481  T
Q  489 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaa 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  24482 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttatgtgaattcgaaaccattggaggaattaaataaa 24581  T
Q  589 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtgg 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24582 cgttaatccctatatcataacctaataatgatatatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctggttcagagttaaaagccagggttagtgg 24681  T
Q  689 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaa 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24682 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctatggttaatagtctatcataaa 24743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 375 - 901
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7703
Alignment:
Q  375 ttttagaaaat-tgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 473  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7177 ttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaatttgtactcctaatt-caatcaatgattatttagtt 7275  T
Q  474 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattg 573  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7276 tcacgacagattaacttagtaattctattcaatctcttgacttagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttg 7375  T
Q  574 gaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaa 673  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  7376 gaggtattaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagctttattacttaggttaaacctattacctagttctgagtaaaa 7475  T
Q  674 agccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaa 773  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  7476 agccagggttagtggtcaatcaaattctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtcgatgataaacatacataaagcattaaactcaa 7575  T
Q  774 ggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacga 873  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7576 agtaatatgaataaaaactaaactttcatttatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatctcaggaattaacca 7675  T
Q  874 caaaagaattagttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7676 caaaagaattagttactcataactaaag 7703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 375 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 2754 - 2226
Alignment:
Q  375 ttttagaaaat-tgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 473  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2754 ttttagaaaatctgagagaagaatggttaagtccttcgaatcctctgatactctcctatggtaacttgcactcctaatt-caatcaatgattatttagtt 2656  T
Q  474 tcacgacggattaacttagtaat--tctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccat 571  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  2655 tcacgacagattaacttagtaatattctactcaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaacccctaaatctcttaagtgaattcgaaaccgt 2556  T
Q  572 tggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagtta 671  Q
    ||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  2555 tggaggtattaaaagaacgttgatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtcaaacctattacctagttcagagtaa 2456  T
Q  672 aaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacac 771  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  2455 aaagccagggttagtggtcatttattttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagttgatgataaacatacataaagcattaaacac 2356  T
Q  772 aaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaac 871  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2355 aaagtaatatgaataaagactaaactttcattgaagttcaaaggagttcaacaaattagggttcccgtaggattacatcagattcatcttaggaattaac 2256  T
Q  872 gacaaaagaattagttactcatagctaaag 901  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2255 cacaaaagaattagttactcatagctaaag 2226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 189 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 13493508 - 13492836
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||  || | | ||||| ||| |  |||| ||  |||| |||||||  |||||||| |||| |    
T  13493508 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 13493409  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt- 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| |||| |||     
T  13493408 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttcagaatatta 13493311  T
Q  387 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  13493310 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagatta 13493212  T
Q  487 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca 586  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  13493211 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcatgtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtttta-aca 13493113  T
Q  587 -aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttag 685  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13493112 gaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagccagggttag 13493013  T
Q  686 tggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaat 785  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  13493012 tggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaat 13492913  T
Q  786 aaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctca 862  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  13492912 taaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataagattacatcaaatttatctca 13492836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 189 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 13496232 - 13495523
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||  ||||||| ||| |  |||| ||  |||| |||||||  |||||||| |||| |    
T  13496232 tgatagagatttgacaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 13496134  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt- 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||| ||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | ||| |||| |||| |||     
T  13496133 aaaaggatgtataaatttatattgattgtcctaggcagttgaattgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttgattttaagaatatta 13496036  T
Q  387 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 486  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  13496035 gagagaagtatggttaagacctttgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctactttaacgacagatta 13495937  T
Q  487 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca 586  Q
    |   ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||        
T  13495936 agaaagtaattatatccaatctcttgacctagaattctacccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttagcag 13495837  T
Q  587 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagt 686  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  13495836 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaagctagggttagt 13495737  T
Q  687 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaata 786  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||| || |||||||||||     
T  13495736 ggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaatt 13495637  T
Q  787 aaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagt 886  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||   ||||||    
T  13495636 aaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaacaaactagggttcccataggattacatcatatttatctcaag-tttaaccacaaagagattagt 13495538  T
Q  887 tactcatagctaaag 901  Q
    |||||||| ||||||    
T  13495537 tactcataactaaag 13495523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 260 - 901
Target Start/End: Original strand, 32505931 - 32506563
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaa 359  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||      |||  ||||||||||  ||||||||    
T  32505931 ttaacttctactcgacaatttctttatcaaaaaggatgtataaatttatattgatgcgtgaggcagttg------ttttctaacataaacgaattaaaaa 32506024  T
Q  360 caataaagaattggtttttagaaaattg-agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatc 458  Q
    ||||||| | |||||||| |||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |    
T  32506025 caataaa-agttggttttaagaatattatagagaagtgtggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagc 32506122  T
Q  459 aatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtg 558  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32506123 aatgattatctagtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtg 32506222  T
Q  559 aattcgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattac 657  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32506223 aattcgaaaccgttggaggtatta-acagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgacctatctctagcttgattacttaagttaaacttattac 32506321  T
Q  658 ctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacat 757  Q
    |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||     
T  32506322 ctagatcagagtcaaaagtcagggttagtggtcattcaatctctaagatcgatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaa 32506421  T
Q  758 aaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttc--aaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagatt 855  Q
    ||  ||||||||| || |||||||   | ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32506422 aaaacattaaacataaagtaatat---ttaaaactagactttcattgatattcaaaaaggagttcaacaaactagggttcccataggattacatcagatt 32506518  T
Q  856 catctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32506519 catctcaag-cttaatcacaaaagaattagttactcatagctaaag 32506563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 387 - 901
Target Start/End: Original strand, 27282305 - 27282817
Alignment:
Q  387 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 486  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  27282305 gagagaagtatggttaagactttcgaattctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagttcaacgaccgatta 27282403  T
Q  487 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca 586  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |      
T  27282404 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggttttaaaag 27282503  T
Q  587 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagt 686  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  27282504 aacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagtcaaaatccagggttagt 27282603  T
Q  687 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaata 786  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| || | |||||||| || |||||||||||     
T  27282604 ggtcattcaatctctaagatcaattttcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaagatacaaaaaggattaaacataaagtaatatgaatt 27282703  T
Q  787 aaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagt 886  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||    
T  27282704 aaaactagactttcattgatattcaaaggtgttcaacaaattagggttcccataggattatatcagattcatctcagg-attaaccacaaagagattagt 27282802  T
Q  887 tactcatagctaaag 901  Q
    |||||||||||||||    
T  27282803 tactcatagctaaag 27282817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 312 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 34066468 - 34065929
Alignment:
Q  312 ggtgcccgaggcagttgagttgattta-gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtcctt 409  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34066468 ggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaagtatggttaagacctt 34066370  T
Q  410 cgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctc 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  34066369 cgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcctaatt-caatcaatgattatctagtttaacgatagattaacaaagtaattctacccaatctc 34066271  T
Q  510 ttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaatccctatatcataa 608  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||    
T  34066270 ttgaccttgaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtttta-acagaacgttaatctctatgtcataa 34066172  T
Q  609 cctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatca 708  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  34066171 cctaataatgatctatctctaacttgattacttaggttaaacttattacctaggtcagagtcaaaagccagggttagtggtcatttaatctctaagatca 34066072  T
Q  709 atatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgt 808  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| || |||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |    
T  34066071 atttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacgtacaaaaagcattaaacataacgtaatatgaattaaaactagattttcattgatat 34065972  T
Q  809 tcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatca 851  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34065971 tcaaaaaagttcaacaaattaggattcccataagattacatca 34065929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 190 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 1936873 - 1936163
Alignment:
Q  190 gatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaa 289  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||| ||||| ||  |||  |  ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1936873 gatagatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaatgaat-aattcatttccacaatgaccattgttaacttctacttggcaatttcattagtaa 1936775  T
Q  290 aaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatt-tagtaacataaactga-ttaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 386  Q
     || ||||||| || ||  || ||| | || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||  ||||   |||||||| ||||||||    
T  1936774 taacgatgtattaaattcaatgggttgacctaggcagttgagttgattgttgtatcataaactgaattaaaaacggtaaaattttggtttt-agaaaatt 1936676  T
Q  387 -gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatt 485  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||||  ||||    
T  1936675 agagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatctagcttcacgaaagatt 1936577  T
Q  486 aacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacac 585  Q
    |||  ||||| |||||| ||||||||||  || | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||| |     
T  1936576 aacaaagtaactctaccaaatctcttgatttatagttctccccgcaagtaacaatcccttaatctcttaagtgaatttgaaa-cgtttgaggttttaaaa 1936478  T
Q  586 aaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttag 685  Q
     || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||| | |  ||||||| ||||||    
T  1936477 gaatgttattccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcatgattacttaggttaaacttattacctggatcaaattcgaaagccatggttag 1936378  T
Q  686 tggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaat 785  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  1936377 tggtcatttaatctctaagatcaattttcatattcataaagttagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatatgaat 1936278  T
Q  786 aaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattag 885  Q
     ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | |  | ||| |||||   |||||    
T  1936277 taaaactagacttccattgatattcaaaggagttcaacaaattatggttcccataagattacatgagattcatct-aagtctcaaccacaaagagattag 1936179  T
Q  886 ttactcatagctaaag 901  Q
    ||||||||||||||||    
T  1936178 ttactcatagctaaag 1936163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 311 - 901
Target Start/End: Original strand, 16190299 - 16190886
Alignment:
Q  311 tggtgcccgaggcagttgagttgat-ttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga-gagaagtatggttaagtcct 408  Q
    |||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  16190299 tggtgccctaggaaattgagttgatgtttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaga-ttggtttt-agaaaattaaagagaagtatggttaagacct 16190396  T
Q  409 tcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaat-tctacccaatc 507  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||  | |||| | |||||||||    
T  16190397 tcgaatcctccgaagttctcctatgataatttgcactcttaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacaaattaacaaaataatatatacccaatc 16190495  T
Q  508 tcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaat----ctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatat 603  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||           |||||||| |    
T  16190496 tcttgacccataattctccccacgagtgacaaccccttaattaatctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggtttta-----------atccctatgt 16190584  T
Q  604 cataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctat 703  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||     
T  16190585 cataacctaatattgatctatctctaacttgattacttaggttaaacttattacctagatcagagttaaaagccaaggttagtggtcatccaatctctag 16190684  T
Q  704 gatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcatt 803  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  16190685 gatcaatttgcatattcataaagctaaggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacataaagtaatataaattaaaactagactttcatt 16190784  T
Q  804 gatgttc-----aaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaagaattagttactcatagcta 898  Q
    ||| |||     |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || | ||| |||||   |||||||||| |||||||    
T  16190785 gatattcaaattaaaggagttcaacaaattagggttcctataagattacatcagattcatct-aagactcaaccacaaatagattagttacttatagcta 16190883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 260 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 39546417 - 39545983
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgattta-gtaacataaactgattaaaa 358  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  ||| |||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||  ||| |||  ||||| |||||  |   |||    
T  39546417 ttaacttttactcagcaatttcattatcgaaa-ggatgtattaaattcaattgttgccctaggcagttggattggtttttgtaacgtaaacgcaaataaa 39546319  T
Q  359 acaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaat 457  Q
    |||||||| | |||||||| | || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | |||     
T  39546318 acaataaa-agttggttttaaaaatattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcatatggtaatttgcactcctaatt-caag 39546221  T
Q  458 caatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagt 557  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39546220 caatgattatctagtttcacgacagattaacaaagtaactctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtaacaaccccttaatctcttaagt 39546121  T
Q  558 gaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattac 657  Q
    |||||||||| | |||||||| |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39546120 gaattcgaaatcgttggaggttttaatagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaagttaaacttattac 39546021  T
Q  658 ctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattca 695  Q
    |||  ||||||| |||| |||  |||||| ||||||||    
T  39546020 ctagatcagagtcaaaatccattgttagttgtcattca 39545983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 463 - 857
Target Start/End: Original strand, 23990361 - 23990754
Alignment:
Q  463 attatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatt 562  Q
    ||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23990361 attatctagttcaacgacagattaacaaagtaattctacccaatcacttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaaactcttaagtgaatt 23990460  T
Q  563 cgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaa 661  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  23990461 cgaaaccgttggaggtttta-acagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatcaatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctag 23990559  T
Q  662 ttcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttct--at--gatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacat 757  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||||||||     ||| ||||| ||  ||||||||||     
T  23990560 atcagagtcaaaagccagggttagtggtcattcaatctcttaattagatcaatttgcatattcataaagc-----ttagtagtcaatgataaacatacaa 23990654  T
Q  758 aaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattca 857  Q
    ||  |||| || | ||  |||| ||||| ||||||| |||||| |  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23990655 aaaacattgaagataatataatgtgaattaaaactagactttcttaaatattcagaggagttcaacaaattagtgttcccataagattaaatcagattca 23990754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 502 - 777
Target Start/End: Original strand, 22104683 - 22104956
Alignment:
Q  502 ccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctat 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  22104683 ccaatctcttgacctagaattctccccgtaagtgacagacc-ttaatctcttaagtgaattcaaaatcgttggaggtattaaagaa-cgttaatccctat 22104780  T
Q  602 atcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttct 701  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  22104781 gtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacatagttcagagttaaaaaccagaattagtggtcattcaatttct 22104880  T
Q  702 atgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggta 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  22104881 atgatcaatatgcatattcataaagctagagttagtagtcgatgataaacctacacaaaacattaaacacaaggta 22104956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 389 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 21153301 - 21152871
Alignment:
Q  389 gagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaac 488  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||   |||  ||||||||| || || | ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||    
T  21153301 gagaaatatggttaagaccttcgaatcctccgatgctcttaaatggtaatttgcacccccaatt-caatcaatgttcatttagtttaacgacagattaac 21153203  T
Q  489 ttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaa 588  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||          
T  21153202 acagtaattctactcaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaatttgaaacctttggaggttttaatagtc 21153103  T
Q  589 cgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtgg 688  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21153102 cgttaatccctaaatcataacctaataactgtctatctctagcttaattacttaggttaaatatattccctagatcagagtcaaaagtcagggctagtgg 21153003  T
Q  689 tcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaa 788  Q
    |||||||| ||||| | ||||| | || |||||  | ||||| | || ||||| ||| |||||||| | |   ||||||||| |||| |||||||||  |    
T  21153002 tcattcaagttctaagttcaatttacacattcaagatgctagtgctagtagtcaatcataaacatataaacaacattaaacagaaggaaatatgaat-ta 21152904  T
Q  789 aactaaactttcattgatgttcaaaggagttca 821  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21152903 aactagactttcattgatattcaagggagttca 21152871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 470 - 696
Target Start/End: Original strand, 22453415 - 22453641
Alignment:
Q  470 agtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaacc 569  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22453415 agtttaacgacagattaacaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaact 22453514  T
Q  570 attggaggtattacaca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagag 668  Q
     |||||||| ||| |||   ||||||||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22453515 gttggaggtttta-acagtccgttaatccatgagtcataacctaataattttctatctctagcttaattacttaggttaaacctattacctaaatcagag 22453613  T
Q  669 ttaaaagccagggttagtggtcattcaa 696  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22453614 tcaaaagccagggctagtggtcattcaa 22453641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 396 - 821
Target Start/End: Original strand, 22456699 - 22457123
Alignment:
Q  396 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 495  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||  | ||||||||| |  | |||||| ||||| || ||||  |||||    
T  22456699 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtaccccta--ttcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagactaacaaagtaa 22456796  T
Q  496 ttctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca-aacgttaa 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||   ||||||    
T  22456797 ttctacccaatctcttgacctagaattctctccgcaagtgacaa-ctcttaatctcttaagtgaattcgaaactgttggaggtttta-acagtccgttaa 22456894  T
Q  595 tccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattc 694  Q
    ||| |   |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  22456895 tccatgagtcataacctaataattttctatctcttgcttaattacttaggttaaacctattacctaaaacagagtcaaaagtcagggctagtggtcattc 22456994  T
Q  695 aatttctatgatcaatatgcatattcataaa-gctagggttaatagtc--tatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaac 791  Q
    || ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||| | || |||||  |||  |||||||||| |   |||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  22456995 aagttctaagatcagtttgcatattcaaaaacgctagtgctagtagtcaatataataaacatacaaacaacattgaaca-aaggtaatatgaattaaaac 22457093  T
Q  792 taaactttcattgatgttcaaaggagttca 821  Q
    || |||| |||| |  ||||| ||||||||    
T  22457094 tagacttccattaaaattcaagggagttca 22457123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10765165 - 10764829
Alignment:
Q  189 tgatagaaatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattatta 288  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||  || | | ||||| ||| |  |||| ||  |||| |||||||  |||||||| |||| |    
T  10765165 tgatagatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatca 10765066  T
Q  289 aaaaggatgtataaatttatattggt-gcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt- 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |   ||||||||||| | |||||||| |||| |||     
T  10765065 aaaaggatgtataaatttatattgattgccctaggcagttgagttgtttt-gtaacataaacgtaaataaaacaataaa-agttggttttcagaatatta 10764968  T
Q  387 gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggatta 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  10764967 gagagaagtatggttaagaccttcgaatcctctgaagttctcctatggtaacttgcactcctaatt-caagcaatgattatctagtttaacgacagatta 10764869  T
Q  487 acttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctcc 526  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10764868 acaaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctcc 10764829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 388 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 15297378 - 15297047
Alignment:
Q  388 agagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaa 487  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||| | | |  ||||||||| ||  ||| ||||||||  | || |||||| ||||| ||||||    
T  15297378 agagaaatatgattaagaccttcgaatcctccgatgttcttccacggtaatttgcacccc--aattcaatcaatattcatctagtttaacgacagattaa 15297281  T
Q  488 cttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacaca- 586  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| |||     
T  15297280 caaagtaattctacccaatctcttgacctagaattctctctgcaagtgacaacccttaaatctcttaagtgaatttgaaactgttggaggtttta-acag 15297182  T
Q  587 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagt 686  Q
      ||||||||| |   |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||| | ||||    
T  15297181 tccgttaatccatgagtcataacctaataattttctatctctaacttaattacttaggttaaaactattacctagatcagattcaaaagccagagctagt 15297082  T
Q  687 ggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattca 721  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15297081 ggtcattcaagttctaagatcaatttgcatattca 15297047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 747 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 10759810 - 10759695
Alignment:
Q  747 taaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 846  Q
    |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10759810 taaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 10759711  T
Q  847 catcagattcatctca 862  Q
    ||||||||||||||||    
T  10759710 catcagattcatctca 10759695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 169
Target Start/End: Original strand, 14484115 - 14484213
Alignment:
Q  71 aattataaggattgcatgtcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggccaaaatttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatcttc 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14484115 aattataaggattgcatttcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggagcaagtttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatcttc 14484213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Original strand, 14505370 - 14505467
Alignment:
Q  71 aattataaggattgcatgtcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggccaaaatttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatctt 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14505370 aattataaggattgcatttcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggagcaagtttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatctt 14505467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 169
Target Start/End: Original strand, 14469118 - 14469216
Alignment:
Q  71 aattataaggattgcatgtcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggccaaaatttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatcttc 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14469118 aattataaggattgcatttcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggagcaagtttgcaaggagatcgcaatatcaaagtcatcttc 14469216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 49147936 - 49147825
Alignment:
Q  396 atggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaa 495  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || |||  || ||||||||| |  | |||||| ||||| |||||||  |||||    
T  49147936 atggtcaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggaaatttgtacccct--attcaatcaatgttcgtctagtttaacgacagattaacaaagtaa 49147839  T
Q  496 ttctacccaatctc 509  Q
    ||||||||||||||    
T  49147838 ttctacccaatctc 49147825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8435358 - 8435285
Alignment:
Q  313 gtgcccgaggcagttgagttga-tttagtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt 386  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8435358 gtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaacataataaaaacaataaa-agttggtttttagaaaatt 8435285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 762 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 49147781 - 49147740
Alignment:
Q  762 cattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcatt 803  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  49147781 cattaaacacaaggtaatatgaattaaaactagacttccatt 49147740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 197 - 860
Target Start/End: Original strand, 12575308 - 12575969
Alignment:
Q  197 atttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaacaaaagaattcgtttcctcagggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggat 296  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||| ||| |  |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  12575308 atttggcaagtgtaccaaattcaatcgaagtaataaat-aattcgtatccacgaggactgttgttaacttctactcaacaagttcattattaaaaaggat 12575406  T
Q  297 gtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgattta-gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaag 394  Q
    |||| || ||  || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12575407 gtattaaattcaat-ggtgccctaggcagttgagttgatttttgtaacataaattgattaaaaacaataaaagattggtttt-agaaaattagagagaag 12575504  T
Q  395 tatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagta 494  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||  ||||    
T  12575505 tatggttaagaccattgaatcctccgaagttttcttatggtaatttgcactcctaatt-caagcaatgataatctagtttaacgacagattaacaaagta 12575603  T
Q  495 attctacccaatctcttga-cctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaa-acgtt 592  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  12575604 attctacctaatctcttaaacctagaattctccccgcaagtaacaaccc-ttaatctcttaagtgaattagaaaccattggaggtttta-acaatacgtt 12575701  T
Q  593 aatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcat 692  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12575702 aatccttatatcataacctaataatgatctatctctaacttgattacttatgttaaacctattaccttgatcaaagtcaaaagccaaggttagtagtcat 12575801  T
Q  693 tcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaact 792  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||  ||  |||| ||||| || || || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12575802 tcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagttagggctagttgttgatgataaagatacaaaaagcgttgaacacaaagtaatatgaataaaaact 12575901  T
Q  793 aaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12575902 agactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcctataggattacatcagattcatct 12575969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 375 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 13097081 - 13096606
Alignment:
Q  375 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 473  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |  || |||||||||| |||||    
T  13097081 ttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaagttatcctatgt-aatttgcactcctaattt-aagcaatgattatctagtt 13096984  T
Q  474 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattg 573  Q
      | ||  |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |    
T  13096983 caatgaaagattaacaaagtaattctacccaatctcttggcctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatgtcttaagtgaatttgaaaccgtgg 13096884  T
Q  574 gaggtattacaca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaa 672  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  13096883 gaggtttta-acagaacgtaaatccctatgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttagcttaaacttattacctaggtcagagttaa 13096785  T
Q  673 aa-gccagg-gttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaaca 770  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| || |||||||||     
T  13096784 aaggccaggagttagtgatcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggatagtagtcgatgataaacataca-aaagcattaaac- 13096687  T
Q  771 caaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
             || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13096686 ---------atcaattaaaactagactttcattgatattcaaaggagttcaataaatcagggttcccataggattacatcaggttcatct 13096606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 375 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 44008356 - 44007889
Alignment:
Q  375 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 473  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  44008356 ttttagaaaattagaaagaattatggttatgaccttcgaatcctccgaagctcgcctttggtaatctgcactcctagtt-caaacaatgattatttagtt 44008258  T
Q  474 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattg 573  Q
    ||||||  |||||     |||| |||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | |||    
T  44008257 tcacgatagatta-----gtaactctaccaaatccctcgacctagaattctccc-gcaagtgacaactccttaatctcataagtgaatttgaaatcgttg 44008164  T
Q  574 gaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaa 673  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||    
T  44008163 gaggtattaaaagaacgttaatccctgtgtcgtaacctaacaatgatctatttctagcttgattagttaggttaaacttattacctagttcagaatcaaa 44008064  T
Q  674 agccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacacaa 773  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| | || |||||||||| |     
T  44008063 agccagagtcagtgttcattcaatctctacggtcaatttgcattttcataaagctagggtcaatagtcgatgataaacata-aaaaagcattaaacaaag 44007965  T
Q  774 ggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatc 850  Q
     |||||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  44007964 agtaataagaataaagactaaactttaattgaaattcaaaggagttcaacaaattaagg-aaccataggattacatc 44007889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 312 - 669
Target Start/End: Original strand, 41778864 - 41779213
Alignment:
Q  312 ggtgcccgaggcagttgagttgattta-gtaacataaactgattaaaaacaataaagaattggtttttagaaaattga-gagaagtatggttaagtcctt 409  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||  |||| |||  |||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  41778864 ggtgccctaggcagttgaattgatttttgtaacataaacgaattaaaaacaataaaagattgattt--agaagattaaagagaagtatggttaagacctt 41778961  T
Q  410 cgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggattaacttagtaattctacccaatctc 509  Q
    | |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||  ||| | ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||    
T  41778962 caaatcttccgaagttctcctatgctaatttgcactagtaatt-caaacaatgattatctaggttcacgacagattaacacaataactctacccaatctc 41779060  T
Q  510 ttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataac 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    |  | |||     | || ||||||||| |||||||    
T  41779061 ttgacctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatatcttaagtgaattcaaaacca----aaatgtta---ttatgtcaatccctatgtcataac 41779153  T
Q  610 ctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41779154 ctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacttattacctagttcagagt 41779213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Original strand, 17029190 - 17029308
Alignment:
Q  71 aattataaggattgcatgtcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggccaaaatttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatcttcg 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17029190 aattataaggattgcatggcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggcccaaatttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatcttcg 17029289  T
Q  171 agttaattatgtacataat 189  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17029290 agttaattatgtacataat 17029308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Original strand, 17559626 - 17559744
Alignment:
Q  71 aattataaggattgcatgtcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggccaaaatttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatcttcg 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17559626 aattataaggattgcatggcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggcccaaatttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatcttcg 17559725  T
Q  171 agttaattatgtacataat 189  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17559726 agttaattatgtacataat 17559744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 14418639 - 14418450
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaa 359  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| | | || ||  || | ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||    
T  14418639 ttaactacaacttagcaatttctttatcaaaaaggatatgttaaattcaatggttgccctaggcagttgagttggtttt-taacataaacaaattaaaaa 14418541  T
Q  360 caataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaa 450  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  14418540 caataaa-agttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaa 14418450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 747 - 832
Target Start/End: Original strand, 41779233 - 41779318
Alignment:
Q  747 taaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattaggg 832  Q
    |||||||||| || |||||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41779233 taaacatacaaaaagcattaaacataaagtaacatggataaagactaaactttcattgatatttaaaggagttcaacaaattaggg 41779318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 446
Target Start/End: Original strand, 41836418 - 41836479
Alignment:
Q  385 ttgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactc 446  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  41836418 ttgagagaagcatggttaagaccttcgaatcctccgaagttctcctatggtaatttgcactc 41836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 14418397 - 14418355
Alignment:
Q  587 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctcta 629  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14418397 aacgttaatccctatatcataatctaataatgatctatctcta 14418355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 17029100 - 17029166
Alignment:
Q  7 aggcctgagtagtgatcctatgtcattcactgctatgttagatcaacgcctcgcttgtcctactaat 73  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  17029100 aggcctgactagtgatgctatgtcgttgactgctatgttagatcaacacctcgcttttcttactaat 17029166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 73
Target Start/End: Original strand, 17559536 - 17559602
Alignment:
Q  7 aggcctgagtagtgatcctatgtcattcactgctatgttagatcaacgcctcgcttgtcctactaat 73  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  17559536 aggcctgactagtgatgctatgtcgttgactgctatgttagatcaacacctcgcttttcttactaat 17559602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 385 - 901
Target Start/End: Original strand, 2799 - 3317
Alignment:
Q  385 ttgagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtttcacgacggat 484  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  2799 ttgagagaagtatcgttaagacctttgaatcctccgaagctctcctatggtaatttgcactcctagtt-caatcaatgattatatagtttcacgaaagat 2897  T
Q  485 taacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattaca 584  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  2898 taaggtagtaattctaccaaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaactattggaggtattaaa 2997  T
Q  585 caaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaaaagccagggtta 684  Q
      ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  2998 agaacgttaatccttgtgtcataatctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacgtattacctagttcagagttgaaagccatggtta 3097  T
Q  685 gtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcat-aaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacaca---aggtaata 780  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  |||||||||||   | ||||||    
T  3098 gtgttcattcaaattctgtgatcaatttgcatattcataaaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaaacattaaacacaaagaagtaata 3197  T
Q  781 tgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatctcaggaattaacgacaaaaga 880  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3198 tgagtaaagactaaactttcatttaaattcaaatgagttcaacaaattaggatttccataagattacataagattcatctcaggaa-taaccacaaaaga 3296  T
Q  881 attagttactcatagctaaag 901  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3297 attagttactcatagctaaag 3317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 375 - 860
Target Start/End: Original strand, 5995 - 6479
Alignment:
Q  375 ttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaaatacaatcaatgattatttagtt 473  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||| |    
T  5995 ttttagaaaattagagagaagtatggttaagaccttcgaatcctccgaggttctcctatggtaatttgcactactaatt-caaacaatgattatctaggt 6093  T
Q  474 tcacgacggattaacttagtaattctacccaatctcttgacctagaattctccccgcaagtgacaaccccttaatctcttaagtgaattcgaaaccattg 573  Q
    ||||||| |||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6094 tcacgacagattaacacaataactctacccaatctcttgatctagaattctccccgcaagtggcaaccccttaatctcttaagtgaattcaaaatcattg 6193  T
Q  574 gaggtattacaca-aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggttaaacctattacctaattcagagttaa 672  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  6194 gaggtttta-acagaacgttaaaccctatgtcataacctaataatgatctatctctaggttgattacttagattaaacttattacctagttcagagtcaa 6292  T
Q  673 aagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcgtaaacatacataaggcattaaacaca 772  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||| |    
T  6293 aagtcagggttagtggtcattcaatctctaagatcaatttgcatattcataaagctagggttagtagtcgatgataaacatacaaaaagcattaaacata 6392  T
Q  773 aggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggattacatcagattcatct 860  Q
    | |||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6393 aagtaacatgaataaacact-gactttcattgatattcaaaggagttcaacaaattaaggttcccataagattacatcagattcatct 6479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 547 - 862
Target Start/End: Original strand, 1 - 316
Alignment:
Q  547 atctcttaagtgaattcgaaaccattggaggtattacacaaacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtt 646  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 atctcttaagtgaattcgaaaccgttggaggttttaaaagaacgttaatccctatgtcataacctaataatgatctatctctagcttgattacttaggtt 100  T
Q  647 aaacctattacctaattcagagttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaatatgcatattcataaagctagggttaatagtctatcg 746  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||      
T  101 aaacttattacctagatcagagtcaaaaaccagggttagtagtcatttaatctctaagatcagtttgcatattcataaagctagggttagtagtcaatga 200  T
Q  747 taaacatacataaggcattaaacacaaggtaatatgaataaaaactaaactttcattgatgttcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 846  Q
    |||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 taaacatacaaaaagcataaaacataaagtaatatgaattaaaactagactttcaatgatattcaaaggagttcaacaaattagggttcccataggatta 300  T
Q  847 catcagattcatctca 862  Q
    ||||||||||||||||    
T  301 catcagattcatctca 316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 68; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 450
Target Start/End: Original strand, 79 - 268
Alignment:
Q  260 ttaacttctacttagcaatttcattattaaaaaggatgtataaatttatattggtgcccgaggcagttgagttgatttagtaacataaactgattaaaaa 359  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||| | | || ||  || | ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||||    
T  79 ttaactacaacttagcaatttctttatcaaaaaggatatgttaaattcaatggttgccctaggcagttgagttggtttt-taacataaacaaattaaaaa 177  T
Q  360 caataaagaattggtttttagaaaatt-gagagaagtatggttaagtccttcgaatcctccgaagctctcctatgacaatttgcactcctaa 450  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  178 caataaa-agttggttttaagaatattagagagaagtatggttaagacattcgaatcctccgaatttctcctatgataatttgcactcctaa 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 629
Target Start/End: Original strand, 321 - 363
Alignment:
Q  587 aacgttaatccctatatcataacctaataatgatctatctcta 629  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  321 aacgttaatccctatatcataatctaataatgatctatctcta 363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Original strand, 7793 - 7890
Alignment:
Q  71 aattataaggattgcatgtcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggccaaaatttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatctt 168  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7793 aattttaaggattgcaattcattgcttaagtgagagaacacatgatcgccctacaatggggcaagtttgcaaggagattgtaatgtcaaagtcatctt 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Original strand, 8437 - 8534
Alignment:
Q  71 aattataaggattgcatgtcattgcttaactgagagcccacatagtcgccctacaatggccaaaatttgcaaggagattgcaatatcaaagtcatctt 168  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8437 aattttaaggattgcaattcattgcttaagtgagagaacacatgatcgccctacaatggggcaagtttgcaaggagattgtaatgtcaaagtcatctt 8534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 669 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 7127 - 7086
Alignment:
Q  669 ttaaaagccagggttagtggtcattcaatttctatgatcaat 710  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7127 ttaaaagctagggttagtagtcattcaatttctaagatcaat 7086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University