View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4382-Insertion-5 (Length: 1047)

Name: NF4382-Insertion-5
Description: NF4382
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4382-Insertion-5
NF4382-Insertion-5
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (8-1039)||(13861280-13862311)
chr6 (9-928)||(14085252-14086171)
chr6 (9-913)||(13891580-13892484)
chr6 (9-608)||(13932933-13933532)
chr6 (9-913)||(14111061-14111965)
chr6 (9-925)||(13873864-13874780)
chr6 (257-928)||(14015913-14016584)
chr6 (9-913)||(13471573-13472477)
chr6 (429-1039)||(14026199-14026806)
chr6 (9-314)||(14025866-14026171)
chr6 (9-385)||(14047915-14048291)
chr6 (429-788)||(14048298-14048658)
chr6 (643-913)||(13942283-13942553)
chr6 (9-179)||(14015737-14015907)
chr6 (876-1041)||(14016685-14016847)
chr6 (876-1039)||(14112081-14112241)
chr6 (876-1039)||(13942669-13942829)
chr6 (876-1039)||(13471297-13471457)
chr6 (876-1039)||(14086272-14086432)
chr6 (9-107)||(13928924-13929022)
chr6 (876-1038)||(13891305-13891464)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 602; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 602; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 13862311 - 13861280
Alignment:
Q  8 taatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13862311 taatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggtggcacccaattttcgttaaatctcaatgctag 13862212  T
Q  108 tgaattgtctgacaagtctaaatcctttgacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagttcaaacccatccgtagtgtc 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13862211 tgaattgcctgacaagtctaaatcctttaacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagttcgaacccatccgtagtgtc 13862112  T
Q  208 cttagtttggttggaaatcgaatatcttcaaggatcttcccgtttagcctatttttagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcag 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  13862111 cttagtttggttggaaatcgaatatcttcatatatcttcccgcttagcctatttttagaaatatcaaatatttccaaaagggagaatattgagagatcgg 13862012  T
Q  308 gtagtgtaccattgatttggttactgtttagatctaatgcttggagtgagtatctagaacatacagataagtgatggattaatacttgaagctcaccact 407  Q
    || |||| ||||||||||| |||  | ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13862011 gttgtgtcccattgatttgattaaagcttagatctaattctcggagtgagtatcttgcacatttaggtaagtgatcgattattacttgaagctcaccact 13861912  T
Q  408 gaaactgttattggacattttcaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatccccccttccaaagagtttgatgcaatggatgaa 507  Q
    ||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||    ||    
T  13861911 gaatctgtttttggacagggtcaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatgcccccttctaaagagtttgatctgatgtcgaaa 13861812  T
Q  508 ctctccaactgaaatgggaagctacaaccttcaggaatctttccactcagcttattaccagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggt 607  Q
       |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13861811 tattccaactgaaatggcaagctactaccttcaggaatctttccacttagttgattagaagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggt 13861712  T
Q  608 cgggtaaagttccagtgatttcattattaccgatatctaacacttggagtgagtttctaacacaaccactagacaaattatgaagaattgtttgaatgtt 707  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||     
T  13861711 cgggcaaagttccagcgatttcattataactgatatctaacacttggagtgagtttctaacacaaccactagacaaattttgaagaattatttgaaggtc 13861612  T
Q  708 ttctgtgaaactgttt---ccaaacagttttaaagaacgtaaggtgcatatattcatgaaggatttaaacacctcacccttcaaaaaattacccttcagg 804  Q
    |||||| ||| |||||   | |  ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||    |||    
T  13861611 ttctgttaaattgttttgacgactcagatctaaagaacttaaggtgcatacattcatgaaggatttaaacaccccacccttcaatctattacctgatagg 13861512  T
Q  805 tagagtccctcaagagacttcatcactatgccatagtcaattgatggaggagcctccaagaagtttaaagaaaggtcaagctcaacaagattggaactta 904  Q
       |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13861511 ccaagtctctcaagagaattcatcactatgccatagtcaattgatggaggagcctccaagtggttgaaagaaaggtcaagctcaacaagattggaactta 13861412  T
Q  905 tgtttgacacccactcgaatatcaaagatgacataaaagttattttcagaggagatcaaggatagaaaggagaattggaaaagctgaacttgggattgac 1004  Q
    ||||||||| | ||  ||||||||  |||||||  |||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13861411 tgtttgacaacaacgggaatatcatggatgaca-caaagttgttcacaga-gagatcaaggatagaaa-gagaattggaaaagttgaactt-ggattgac 13861316  T
Q  1005 tcaatgaatggat-aaatgatcagaaaggccacaat 1039  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13861315 tcaatgaatggataaaatgatcagaaaggtcacaat 13861280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 928
Target Start/End: Original strand, 14085252 - 14086171
Alignment:
Q  9 aatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctagt 108  Q
    |||||| ||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| || |||||||||    
T  14085252 aatccatttaggaaatgttgaaccaagtttgcaggatcccaatcctataatgcccagttgaaaaggcgggacccatttttcggcaaaacttaatgctagt 14085351  T
Q  109 gaattgtctgacaagtctaaatcctttgacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagttcaaacccatccgtagtgtcc 208  Q
     ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||  ||  ||||||||||||||    
T  14085352 aaattgtaagacaagtctaactcctctagcattgacataccagaaaaatggaagtcagagatcacaccatttaaagagtttgaatgcatccgtagtgtcc 14085451  T
Q  209 ttagtttggttggaaatcgaatatcttcaaggatcttcccgtttagcctatttttagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcagg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14085452 ttagtttggttggaaatcgaatatctttaagtatcttcccatttagtctattttcagaaatatcaaatatttccaaaaaggagaatattgacagatcagg 14085551  T
Q  309 tagtgtaccattgatttggttactgtttagatctaatgcttggagtgagtatctagaacatacagataagtgatggattaatacttgaagctcaccactg 408  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14085552 tagtgtgccattgatttgattactgcttagatctaattgttgaagtgaatatctagcacatccagatatgtgatggattaatacttgaagctcaccattg 14085651  T
Q  409 aaactgttattggacattttcaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatccccccttccaaagagtttgatgcaatggatgaac 508  Q
    |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14085652 aaactgttataggacagatccaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatccccctttccaaagagtttgatgcaatggataaac 14085751  T
Q  509 tctccaactgaaatgggaagctacaaccttcaggaatctttccactcagcttattaccagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggtc 608  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  14085752 tctccaactgaaatggcaagctactaccttcaggaatctttccactcagcttattttcagaaaggtccaatgttttcaatgatgtgaatgcggaaaggtc 14085851  T
Q  609 gggtaaagttccagtgatttcattattaccgatatctaacacttggagtgagtttctaacacaaccactagacaaattatgaagaattgtttgaatgttt 708  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  14085852 gggtaaagttccagtgattccattataactgaggtctaacacttgaagtgagtttctgacacaaccactagacaaattttgaagaattgtttgaaggtct 14085951  T
Q  709 tctgtgaaactgtttccaaacagttttaaagaacgtaaggtgcatatattcatgaaggatttaaacacctcacccttcaaaaaattacccttcaggtaga 808  Q
    ||| ||||| |||||     ||  | |||||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||| |  ||   ||||      ||||  |    
T  14085952 tctatgaaattgtttgtttgcaagtctaaagagcgtagggtgcatacattcataagggatttaaagaccccaccttctaatctattattagataggtcaa 14086051  T
Q  809 gtccctcaagagacttcatcactatgccatagtcaattgatggaggagcctccaagaagtttaaagaaaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtt 908  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||  ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14086052 gttcctcaagagacttcataactatgccatagtcatatgatggaggatccttcaagtggttaaatgaaatgtcaagcttaacaagattggaacttatgtt 14086151  T
Q  909 tgacacccactcgaatatca 928  Q
    ||||||| | | ||||||||    
T  14086152 tgacaccaattggaatatca 14086171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 13892484 - 13891580
Alignment:
Q  9 aatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctagt 108  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |  |||||||| |||||||    
T  13892484 aatccagttaggaaatgtaggaccaagtttgcaggatctcaatcctatagtgtccaattgaaaaggagggacccaattttggggaaatctcattgctagt 13892385  T
Q  109 gaattgtctgacaagtctaaatcctttgacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagttcaaacccatccgtagtgtcc 208  Q
    ||||||  |||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||| || |||| |  |||||||    
T  13892384 gaattgcttgacaaggataattcctctaacattgacataccagaaaaatggaagtcagagatcacaccacttaaagagttcgaatccatgctcagtgtcc 13892285  T
Q  209 ttagtttggttggaaatcgaatatcttcaaggatcttcccgtttagcctatttttagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcagg 308  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13892284 ttagtgtagttggaaatcgaatatcttcaaatatctttccgtttagtctattttcagaaatatcaaatatttccaaagatgagaatatcgagagatcagg 13892185  T
Q  309 tagtgtaccattgatttggttactgtttagatctaatgcttggagtgagtatctagaacatacagataagtgatggattaatacttgaagctcaccactg 408  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13892184 tagtgtgccattgatttgattaccgcttagatctaattgttggagtgagtatctagcacatatagataagtgatggattgttacttgaagctcaccactg 13892085  T
Q  409 aaactgttattggacattttcaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatccccccttccaaagagtttgatgcaatggatgaac 508  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||| ||     
T  13892084 aatctgttattggacatatccaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaattcccccttctaaagagtttgatttgatggataaat 13891985  T
Q  509 tctccaactgaaatgggaagctacaaccttcaggaatctttccactcagcttattaccagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggtc 608  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||  | |||   || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13891984 tctccaactgaaatggcaagctacttccttcaagaatttttccactcaattgatttaaagtaagatccaatgttttcaatgatgtgaatgcagaaaggtc 13891885  T
Q  609 gggtaaagttccagtgatttcattattaccgatatctaacacttggagtgagtttctaacacaaccactagacaaattatgaagaattgtttgaatgttt 708  Q
    |||||    |||||||||| ||||   ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || |    
T  13891884 gggtagtcctccagtgattccattccaaccaaggtctaacacttgaagtgagtttctaacacatccaccagacaaattgtgaataattgattgaaggtct 13891785  T
Q  709 tctgtgaaactgtttccaaacagttttaaagaacgtaaggtgcatatattcatgaaggatttaaacacctcacccttcaaaaaattacccttcaggtaga 808  Q
    ||||| ||| |||||  |  ||    ||||||  ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||  |   |||||  |    
T  13891784 tctgttaaattgttttgactcaaacctaaagattgtatggtacatacattcatgaagaatttaaacaccccacccttcaatctattttctgacaggtcaa 13891685  T
Q  809 gtccctcaagagacttcatcactatgccatagtcaattgatggaggagcctccaagaagtttaaagaaaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtt 908  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13891684 gtacctcaagagacttcatcactaagccatagacattggatggaggagcctccaagaagtttaaagaaaggtcaagtttaacaagattggaacttatgtt 13891585  T
Q  909 tgaca 913  Q
    |||||    
T  13891584 tgaca 13891580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 608
Target Start/End: Original strand, 13932933 - 13933532
Alignment:
Q  9 aatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctagt 108  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||| |||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13932933 aatccatttaggaaatgtaagaccaagtttgcttgatctcaatcctatactgttcagttgaaaaggtgggacccaattttcagtaaatctcaatgctagt 13933032  T
Q  109 gaattgtctgacaagtctaaatcctttgacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagttcaaacccatccgtagtgtcc 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||    
T  13933033 gaattgtctgacaagtctaattcctttaacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagtttgaactcatttgtagtgtcc 13933132  T
Q  209 ttagtttggttggaaatcgaatatcttcaaggatcttcccgtttagcctatttttagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcagg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933133 ttagtttggttggaaatcgaatatcttcagatatcttcccgtttaggctattttcagaaatatcgaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcagg 13933232  T
Q  309 tagtgtaccattgatttggttactgtttagatctaatgcttggagtgagtatctagaacatacagataagtgatggattaatacttgaagctcaccactg 408  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13933233 tagtgtgccattgattttattactgcttagatctaattcttggagtgagtatctagcacatctagataagtgatggattattacttgaagctcaccactg 13933332  T
Q  409 aaactgttattggacattttcaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatccccccttccaaagagtttgatgcaatggatgaac 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||  |||||| ||     
T  13933333 aaactgttattggacattttcaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgatttaggaattaccccttctaaagtgtttgatgtgatggataaat 13933432  T
Q  509 tctccaactgaaatgggaagctacaaccttcaggaatctttccactcagcttattaccagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggtc 608  Q
      ||||||||| |||| | ||||| |||  |||| |||| |||||| || | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13933433 gttccaactgatatggcaggctactacccccagggatctctccacttagttgattggaagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatgcagaaaggtc 13933532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 913
Target Start/End: Original strand, 14111061 - 14111965
Alignment:
Q  9 aatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctagt 108  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||| |||| |||| |||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  14111061 aatccatttaggaaatgtaagaccaagtttgcatgatctcaatcctataatgtgaagttgaaatggcgggacccagttttcagtaaatgtcaatgctagt 14111160  T
Q  109 gaattgtctgacaagtctaaatcctttgacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagttcaaacccatccgtagtgtcc 208  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  14111161 gaattgtcagacaagtctaattcctttaacatcgacataccagaaaaatgaaattcagatatcactccactcatagagttcgaacccatctgtaatgtcc 14111260  T
Q  209 ttagtttggttggaaatcgaatatcttcaaggatcttcccgtttagcctatttttagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcagg 308  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14111261 ttagtttggctggaaattgaatatcttcagctatcttcccacttagcttattttcagaaatatcaaatatctccaaaaatgggaatattgagagatcagg 14111360  T
Q  309 tagtgtaccattgatttggttactgtttagatctaatgcttggagtgagtatctagaacatacagataagtgatggattaatacttgaagctcaccactg 408  Q
    |||||| || || ||||| |||    |||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14111361 tagtgtgccgttaatttgattaaatcttagatttaattgttggagtgaatatctagcacatctagataagtgatggattattacttgaagctcaccactg 14111460  T
Q  409 aaactgttattggacattttcaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatccccccttccaaagagtttgatgcaatggatgaac 508  Q
    |||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  | | |||||  ||     
T  14111461 aaaccgttattagacaagtccaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaattcctccttctaaagagtttctttcgatggagaaag 14111560  T
Q  509 tctccaactgaaatgggaagctacaaccttcaggaatctttccactcagcttattaccagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggtc 608  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||  | |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14111561 tctccaactgaaatggcaaggtagtaacttcaggaatctttccactcaattgattggaagaaagatgcaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggtc 14111660  T
Q  609 gggtaaagttccagtgatttcattattaccgatatctaacacttggagtgagtttctaacacaaccactagacaaattatgaagaattgtttgaatgttt 708  Q
     ||||  |||||||||||| ||||   ||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |    
T  14111661 aggtagtgttccagtgattccattgaaactaaggtctaacacttgaagtgagtttctaacacaaccactagacaaattgtgaataattgattgaaggtct 14111760  T
Q  709 tctgtgaaactgtttccaaacagttttaaagaacgtaaggtgcatatattcatgaaggatttaaacacctcacccttcaaaaaattacccttcaggtaga 808  Q
    || ||||    |||       |  | ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||   ||||      |  |  |    
T  14111761 tcagtgacttcgttgaatttaatatctaaagaacgtaaggcacataaattcacgaaggatttaaagaccccatcctgcaatctattaattgataaatcaa 14111860  T
Q  809 gtccctcaagagacttcatcactatgccatagtcaattgatggaggagcctccaagaagtttaaagaaaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtt 908  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14111861 gtctctcaagatgcttcatcactatgccatagtcacttgatggaggagcctccaagttgttgacagaaaggtcaagctcaacaagattataacttatgtt 14111960  T
Q  909 tgaca 913  Q
    |||||    
T  14111961 tgaca 14111965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 13874780 - 13873864
Alignment:
Q  9 aatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctagt 108  Q
    |||||| || ||||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  13874780 aatccattttggaaatgtaagaccaagtttgcaagatcccaatcctatagtttgcaactgaaaaggcgggacccagttttcggtaaatctcaatactagt 13874681  T
Q  109 gaattgtctgacaagtctaaatcctttgacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagttcaaacccatccgtagtgtcc 208  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||  || |||||||||||||||    
T  13874680 gaattgtcagacaagtctaattcctttaacattgacataccagaaaaatggaattcagagatcacaccatgtaaagagtttgaatccatccgtagtgtcc 13874581  T
Q  209 ttagtttggttggaaatcgaatatcttcaaggatcttcccgtttagcctatttttagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcagg 308  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13874580 ttagtttagttggaaaccgaatatcttcatgtatctccccgtttagcttatttttagaaatatcaaatatttccaagaatgagaatattgagagatcagg 13874481  T
Q  309 tagtgtaccattgatttggttactgtttagatctaatgcttggagtgagtatctagaacatacagataagtgatggattaatacttgaagctcaccactg 408  Q
    |||||| ||||||||||| |||    | | || ||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13874480 tagtgttccattgatttgattaaatctcaaatataattgttggagtgagtatctagcacatctagataaatgatggattattacttgaagctcatcactg 13874381  T
Q  409 aaactgttattggacattttcaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatccccccttccaaagagtttgatgcaatggatgaac 508  Q
    ||||| ||  | |  |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  || || |||||||||| |||||||||  ||     
T  13874380 aaactattgcttgtaagatccaatgacttcaacttacatgcattcatccaaaacgattttggaattcttccatctaaagagtttgctgcaatggaaaaat 13874281  T
Q  509 tctccaactgaaatgggaagctacaaccttcaggaatctttccactcagcttattaccagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggtc 608  Q
      ||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  13874280 cttccatttgacatggcaagctactaccttcaggaatctttccactcagtagattattagaaagatccaaaaattttaatgatgtgaacatagaaagatc 13874181  T
Q  609 gggtaaagttccagtgatttcattattaccgatatctaacacttggagtgagtttctaacacaaccactagacaaattatgaagaattgtttgaatgttt 708  Q
     |||| |||||||||||||| | ||  |   | || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |    
T  13874180 aggtacagttccagtgattttactagaataaagatttaaccattgaagtgagtttctaacacaaccactagacaaatcatgaataattgattgaaggcct 13874081  T
Q  709 tctgtgaaactgtttccaaacagttttaaagaacgtaaggtgcatatattcatgaaggatttaaacacctcacccttcaaaaaattacccttcaggtaga 808  Q
    |  |||||| |||||  |  ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||  |||       ||||  |    
T  13874080 tgggtgaaattgtttaaattcagatctaaagaacgtaaggtgcatatatttctgatggatttaaacatcccacccttcaaactattttgtgataggtcaa 13873981  T
Q  809 gtccctcaagagacttcatcactatgccatagtcaattgatggaggagcctccaagaagtttaaagaaaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtt 908  Q
    || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||| |||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13873980 gttcctcaagagacctcataactatgtcatagtcatatgatggagaatcctccaagaggttgttggaaaggtcaagcttaacaagattggaacttatgtt 13873881  T
Q  909 tgacacccactcgaata 925  Q
    ||| | ||||| |||||    
T  13873880 tgaaagccactggaata 13873864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 257 - 928
Target Start/End: Original strand, 14015913 - 14016584
Alignment:
Q  257 tatttttagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcaggtagtgtaccattgatttggttactgtttagatctaatgcttggagtga 356  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  14015913 tattttcagaaatatgaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcaggtagtgtgccattgattttattactgcttagatataattcttggagtga 14016012  T
Q  357 gtatctagaacatacagataagtgatggattaatacttgaagctcaccactgaaactgttattggacattttcaatgatttcaacttacatgcattcatc 456  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14016013 gtatctagcacatctagataagtgatggattaatacttgaagctcaccactgaaactgttattggacattttcaatgatttcaacttacatgcattcatc 14016112  T
Q  457 caaaatgattttggaatccccccttccaaagagtttgatgcaatggatgaactctccaactgaaatgggaagctacaaccttcaggaatctttccactca 556  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||   | |||| ||   |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14016113 caaaatgattttggaatttccccttctaaagtgtttgattggacggataaatattccaactgaaatggcaatctactaccttcaggaatctttccactca 14016212  T
Q  557 gcttattaccagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggtcgggtaaagttccagtgatttcattattaccgatatctaacacttggag 656  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||  ||||||||||| ||    
T  14016213 acttattataagaaagatccaatgtttgcaatgatgtgaatatagaaaggtcgggtatagttccagtgattccattagaacggaggtctaacacttgaag 14016312  T
Q  657 tgagtttctaacacaaccactagacaaattatgaagaattgtttgaatgttttctgtgaaactgtttccaaacagttttaaagaacgtaaggtgcatata 756  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||  ||||| || |||||||||| ||||| |    |  | ||||||||||||||  |||| |    
T  14016313 tgagtttctaacacaagtactagacaaatagtgaaaaattaattgaaggtcttctgtgaaattgttttcttcaatatctaaagaacgtaaggcacataaa 14016412  T
Q  757 ttcatgaaggatttaaacacctcacccttcaaaaaattacccttcaggtagagtccctcaagagacttcatcactatgccatagtcaattgatggaggag 856  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||   ||||      ||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||     
T  14016413 ttcatgaaggatttaaatgccacgcccttcaatttattatttgataggtcaagtacctgaagggacttcatcactatgccataaccatatgatggaagaa 14016512  T
Q  857 cctccaagaagtttaaagaaaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgacacccactcgaatatca 928  Q
    ||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  14016513 cctccaaaaggttgttagaaaggtcaagctcaataagattggaactcatgtttgacacccactgaaatatca 14016584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 13472477 - 13471573
Alignment:
Q  9 aatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctagt 108  Q
    |||||| || ||||||||| | || ||| |||| ||||||||  | ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  13472477 aatccatttgggaaatgtaagaccaagtttgcatgatcccaaatccatagtgtacagttggaaaggcgggacccagttttctgtaaatctcaatgccagt 13472378  T
Q  109 gaattgtctgacaagtctaaatcctttgacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagttcaaacccatccgtagtgtcc 208  Q
    || ||||| ||||| | |||||   || |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||  | |||||| |||||  ||    
T  13472377 gagttgtcagacaaatataaatatcttaacattgacataccagaaaaatggaagtcggagatcacgccattcaaagagtttgagcccatctgtagtagcc 13472278  T
Q  209 ttagtttggttggaaatcgaatatcttcaaggatcttcccgtttagcctatttttagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcagg 308  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13472277 ttagagtagttggaaatcgaatatcttcaaatatcttcccgttgagtctattttcagaaatatcgaatgtttccaaaaatgagaatattgaaagattagg 13472178  T
Q  309 tagtgtaccattgatttggttactgtttagatctaatgcttggagtgagtatctagaacatacagataagtgatggattaatacttgaagctcaccactg 408  Q
     ||||| || || ||||| |||    |||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13472177 cagtgtgccgttaatttgattaaatcttagatttaattgttggagtgaatatctagcacatctagataagtgatggattaagacttgaagctcaccacta 13472078  T
Q  409 aaactgttattggacattttcaatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatccccccttccaaagagtttgatgcaatggatgaac 508  Q
    |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || |  |||     
T  13472077 aaactgttgttggacaagtccaatgatttcaacttacaagcattcatccacaatgatttaggaattcccccttctaaagagtttgatctgat-gtggaat 13471979  T
Q  509 t-ctccaactgaaatgggaagctacaaccttcaggaatctttccactcagcttattaccagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggt 607  Q
    |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||      
T  13471978 tgttccaactgaaatggcaagctactaccttcaggaatctttccactcagcttattataagaaagatccaatgttttcattgatgtgaatagagaaagac 13471879  T
Q  608 cgggtaaagttccagtgatttcattattaccgatatctaacacttggagtgagtttctaacacaaccactagacaaattatgaagaattgtttgaatgtt 707  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||||  | || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| | ||     
T  13471878 cgggtaaagttccagtgattccattccaaccgaggtttagcacttcaagtgaatttctaacacaaccactagacaaattgtgaataattaattgcaggtc 13471779  T
Q  708 ttctgtgaaactgtttccaaacagttttaaagaacgtaaggtgcatatattcatgaaggatttaaacacctcacccttcaaaaaattacccttcaggtag 807  Q
    ||| || ||| ||||| |   ||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||   ||||      ||||      
T  13471778 ttcagttaaattgttttcttccatatctaaagaacgtaaggcgcataaattcatgaaggatttaaatgccacacccttcaatttattatatgataggtca 13471679  T
Q  808 agtccctcaagagacttcatcactatgccatagtcaattgatggaggagcctccaagaagtttaaagaaaggtcaagctcaacaagattggaacttatgt 907  Q
    ||| ||| ||||||||  |||||| |||||||  ||  |||||| |||||||||| || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13471678 agtacctgaagagactgtatcactgtgccataaccatgtgatgggggagcctccaggaggtttccagcaaggttaagctcaacaagattggaacttatat 13471579  T
Q  908 ttgaca 913  Q
    ||||||    
T  13471578 ttgaca 13471573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 429 - 1039
Target Start/End: Original strand, 14026199 - 14026806
Alignment:
Q  429 caatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatccccccttccaaagagtttgatgcaatggatgaactctccaactgaaatgggaag 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| |||| | |    
T  14026199 caatgatttcaacttacatgcattcgtccaaaatgatttaggaattaccccttctaaagtgtttgatgcaatggataaatgttccaactgatatggcagg 14026298  T
Q  529 ctacaaccttcaggaatctttccactcagcttattaccagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggtcgggtaaagttccagtgattt 628  Q
    |||| |||  |||| |||| |||||| || | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||     
T  14026299 ctactacccccagggatctctccacttagttgattggaagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatgcagaaaggtcaggtagtgttccagtgattc 14026398  T
Q  629 cattattaccgatatctaacacttggagtgagtttctaacacaaccactagacaaattatgaagaattgtttgaatgttttctgtgaaactgtttccaaa 728  Q
      |||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||  | |||| ||||| ||||| || |    
T  14026399 tgttatcactgaggtctaacacttgaagtgagtttctaacacaacctccagacaaattgtgaagaactgtttgaagttcttctttgaaattgtttgcata 14026498  T
Q  729 cagttttaaagaacgtaaggtgcatatattcatgaaggatttaaacacctcacccttcaaaaaattacccttcaggtagagtccctcaagagacttcatc 828  Q
    ||    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||    |||       ||||  |   ||| ||| || ||||||    
T  14026499 caaaactaatgaacgtaaggtgcatacattcatgaaggacttaaacgccacacccttcagtttattgtatgataggtcaatctcctgaagcgagttcatc 14026598  T
Q  829 actatgccatagtcaattgatggaggagcctccaagaagtttaaagaaaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgacacccactcgaatatca 928  Q
    ||| |||||||  ||  |||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14026599 actgtgccataaccatatgatggaggatcctccaaaaggttcatagaaaggtcaagctttacaagattggaacttatgtttgacacccaatggaatatca 14026698  T
Q  929 aagatgacataaaagttattttcagaggagatcaaggatagaaaggagaattggaaaagctgaacttgggattgactcaatgaatggat-aaatgatcag 1027  Q
    | |||||    |||||  || |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14026699 aggatga-tgcaaagtggttatcaga-tagatcaaggatagaaagg-gaagtggaaaagttgaactt-ggattgactcaatgaatggataaaatgatcag 14026794  T
Q  1028 aaaggccacaat 1039  Q
    ||||||||||||    
T  14026795 aaaggccacaat 14026806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 314
Target Start/End: Original strand, 14025866 - 14026171
Alignment:
Q  9 aatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctagt 108  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||| |||    
T  14025866 aatccatttaggaaatgtaagaccaagtttgcatgatctcaatcctatattgtacagttgaaaaggtgggacccaattttcagtaaatgtcaatgcaagt 14025965  T
Q  109 gaattgtctgacaagtctaaatcctttgacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagttcaaacccatccgtagtgtcc 208  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |  |||| ||  ||| |||||| |||    
T  14025966 gaattgtcagacaagtctaattcctttaacattgacataccagaaaaatgaaattctgagatcacaccacttaaattgttcgaattcattcgtagtatcc 14026065  T
Q  209 ttagtttggttggaaatcgaatatcttcaaggatcttcccgtttagcctatttttagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcagg 308  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14026066 atagtgtagttggaaatcgaatatcttcaaatatcttcccgtttagtctattttcagaaatatcaaacatttccaaaaataagaatattgagagatcagg 14026165  T
Q  309 tagtgt 314  Q
    ||||||    
T  14026166 tagtgt 14026171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 14047915 - 14048291
Alignment:
Q  9 aatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctagt 108  Q
    |||||| |||||||| ||| | || ||| |||| || |||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  14047915 aatccatttaggaaacgtaagaccaagtttgcatgaacccattcctatatcgtgcagttgaaaaggcgggacccagttttcggtaaatctcaatgctatt 14048014  T
Q  109 gaattgtctgacaagtctaaatcctttgacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccattcatagagttcaaacccatccgtagtgtcc 208  Q
    || ||||| ||||| | ||| |   || |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| | | ||||||| |||  |     ||| |||    
T  14048015 gagttgtcagacaaatataagtatcttaacattgacataccataaaaatggaagtcagagatcacaccacttaaagagttcgaacttaattccagtatcc 14048114  T
Q  209 ttagtttggttggaaatcgaatatcttcaaggatcttcccgtttagcctatttttagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagatcagg 308  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14048115 ttagtgtagttggaaatcgaatatcttcaaatatcttcccgtttagcctattttcagaaatatcaaatatttccaaaaatgagaatattgagagattagg 14048214  T
Q  309 tagtgtaccattgatttggttactgtttagatctaatgcttggagtgagtatctagaacatacagataagtgatgga 385  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14048215 tagtgtcccattaatttgattgctgcttagatctaattgttgaagtgaatatctagcacatccagataagtgatgga 14048291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 429 - 788
Target Start/End: Original strand, 14048298 - 14048658
Alignment:
Q  429 caatgatttcaacttacatgcattcatccaaaatgattttggaatccccccttccaaagagtttgatgcaatggatgaactctccaa-ctgaaatgggaa 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||| |  |||||| ||    
T  14048298 caatgatttcaacttacatgcattcatccaaattgattttggaattaccccttctaaagagtttgatgcaatggat-aactgttcaaacaaaaatggcaa 14048396  T
Q  528 gctacaaccttcaggaatctttccactcagcttattaccagaaagatccaatgttttcaatgatgtgaatatagaaaggtcgggtaaagttccagtgatt 627  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  14048397 gctaccaccttcagtaatttttccactcagcttattataagaaagatctaatgtttttaatgatgtaaatgtagaaaagtcggctaaatttccagtgatt 14048496  T
Q  628 tcattattaccgatatctaacacttggagtgagtttctaacacaaccactagacaaattatgaagaattgtttgaatgttttctgtgaaactgtttccaa 727  Q
    ||||||  || || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || || ||| | |||| |||||        
T  14048497 tcattaaaactgagatctaacacttgaaacgagtttctaacacaaccactagacaaattgtgaataattgattaaaggtcttcagggaaattgttttttt 14048596  T
Q  728 acagt-tttaaagaacgtaaggtgcatatattcatgaaggatttaaacacctcacccttcaa 788  Q
      | | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  14048597 ttaatatctaaagaacgtaaggcgcataaattcatgaaggatttaaatgccccacccttcaa 14048658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 643 - 913
Target Start/End: Original strand, 13942283 - 13942553
Alignment:
Q  643 tctaacacttggagtgagtttctaacacaaccactagacaaattatgaagaattgtttgaatgttttctgtgaaactgtttccaaacagttttaaagaac 742  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||    
T  13942283 tctaacacttgaagtgagtttctaacacaaccgctagacaaattgcgaagaattgtttgaaggtcttctgtgaaattgttttgaatcagatttaaagaac 13942382  T
Q  743 gtaaggtgcatatattcatgaaggatttaaacacctcacccttcaaaaaattacccttcaggtagagtccctcaagagacttcatcactatgccatagtc 842  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||   |||       ||||  |   ||| ||| || ||||||||| |||||||  |    
T  13942383 gtaaggtgcatacattcatgaaggatttaaatgccacacccttcaatttattgtatgataggtcaatctcctgaagcgagttcatcactgtgccataacc 13942482  T
Q  843 aattgatggaggagcctccaagaagtttaaagaaaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgaca 913  Q
    |  |||||||||| |||||||   |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13942483 atatgatggaggatcctccaaacggttctgagaaaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgaca 13942553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 14015737 - 14015907
Alignment:
Q  9 aatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctagt 108  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||| |||| |||| ||||||||||     |||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  14015737 aatccatttaggaaatgtaagaccaagtttgcatgatctcaatcctataccacgcagttgaaaaggtgggacccaattttcagtaaatgtcaatgctagt 14015836  T
Q  109 gaattgtctgacaagtctaaatcctttgacattgacataccagaaaaatgaaattcagagatcacaccatt 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||    
T  14015837 gaattgtctgacaagtctaattcctttaacattgacataccagcaaaatggaagtctgaaatcacaccatt 14015907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 876 - 1041
Target Start/End: Original strand, 14016685 - 14016847
Alignment:
Q  876 aaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgacacccactcgaatatcaaagatgacataaaagttattttcagaggagatcaaggatagaaagga 975  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||   ||| ||| || || ||| ||||||||||||||||| |    
T  14016685 aaggtcaagctcaacaagattagcacttatgtttgacacccaatggaatatcaaggatgatgcaaa-gttgttatcggag-agatcaaggatagaaag-a 14016781  T
Q  976 gaattggaaaagctgaacttgggattgactcaatgaatggat-aaatgatcagaaaggccacaatct 1041  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14016782 gaagtggaaaagttgaacttgg-attgactcaatgaatggataaaatgatcagaaaggccacaatct 14016847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 876 - 1039
Target Start/End: Original strand, 14112081 - 14112241
Alignment:
Q  876 aaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgacacccactcgaatatcaaagatgacataaaagttattttcagaggagatcaaggatagaaagga 975  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||   |||  ||||||||||| ||||| |    
T  14112081 aaggtcaagccttacaagattggaacttatgtttgacacccactcaaatatcaaagatgacgtaaa-gtagttcaaagaa-agatcaaggattgaaag-a 14112177  T
Q  976 gaattggaaaagctgaacttgggattgactcaatgaatggat-aaatgatcagaaaggccacaat 1039  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14112178 gaattggaaaagttgaacttgg-attgactcaatgaatggataaaatgatcagaaaggtcacaat 14112241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 876 - 1039
Target Start/End: Original strand, 13942669 - 13942829
Alignment:
Q  876 aaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgacacccactcgaatatcaaagatgacataaaagttattttcagaggagatcaaggatagaaagga 975  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||   ||| ||| ||   |||| ||||||||||||||||| |    
T  13942669 aaggtcaagctcaacaagattagaacttatgtttgacacccattggaatatcaaggatgatgcaaa-gttgttccaagag-agatcaaggatagaaag-a 13942765  T
Q  976 gaattggaaaagctgaacttgggattgactcaatgaatggat-aaatgatcagaaaggccacaat 1039  Q
    ||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13942766 gaagttgaaaagttgaacttgg-attgactcaatgaatggataaaatgatcagaaaggtcacaat 13942829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 876 - 1039
Target Start/End: Complemental strand, 13471457 - 13471297
Alignment:
Q  876 aaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgacacccactcgaatatcaaagatgacataaaagttattttcagag-gagatcaaggatagaaagg 974  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||| |||   | | ||| ||| ||||||||||||||||||     
T  13471457 aaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgacaccatatgaaatatcaatgatgacacaaa---tttgttccgagagagatcaaggatagaaag- 13471362  T
Q  975 agaattggaaaagctgaacttgggattgactcaatgaatggataaa-tgatcagaaaggccacaat 1039  Q
    |||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13471361 agaagtggaaaatttgaacttgg-attgactcaaggaatggacaaaatgatcagaaaggccacaat 13471297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 876 - 1039
Target Start/End: Original strand, 14086272 - 14086432
Alignment:
Q  876 aaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgacacccactcgaatatcaaagatgacataaaagttattttcagaggagatcaaggatagaaagga 975  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| | ||   ||| |||||| |||||||||| ||    
T  14086272 aaggtcaagcaaaacaagattggaacttatgtttgacacccactggaatatcaaagatga-agcaaagctgttccaaga-gagatcgaggatagaaa-ga 14086368  T
Q  976 gaattggaaaagctgaacttgggattgactcaatgaatggat-aaatgatcagaaaggccacaat 1039  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  14086369 gaagtggaaaagttgaactt-ggattgactcagggaatggatgaaatgataagaaaggtcacaat 14086432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Original strand, 13928924 - 13929022
Alignment:
Q  9 aatccacttaggaaatgtaggtccgagtatgcaggatcccaatcctatagtgtccagttgaaaaggcggcacccaattttcgttaaatctcaatgctag 107  Q
    |||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13928924 aatccatttaggaaatgtaagaccaagtttgcaggatctcaattccatagtgtccagttgaaaaggcgggacccaatcttcggtaaatctcaatgctag 13929022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 876 - 1038
Target Start/End: Complemental strand, 13891464 - 13891305
Alignment:
Q  876 aaggtcaagctcaacaagattggaacttatgtttgacacccactcgaatatcaaagatgacataaaagttattttcagaggagatcaaggatagaaagga 975  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||| ||   ||| ||||||||||||||||| ||    
T  13891464 aaggtcaagccttacaagattgggactaatgtttgacacccactggaatatcaaagatga-tgcgaagttgttcgaaga-gagatcaaggatagaaa-ga 13891368  T
Q  976 gaattggaaaagctgaacttgggattgactcaatgaatggat-aaatgatcagaaaggccacaa 1038  Q
    ||  |||||||  |||||||  |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13891367 gatgtggaaaaattgaactt-cgatttactcaaagaatggataaaatgatcagaaaggccacaa 13891305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University