View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4384-Insertion-1 (Length: 1089)

Name: NF4384-Insertion-1
Description: NF4384
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4384-Insertion-1
NF4384-Insertion-1
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (12-972)||(15664320-15665281)
chr7 (12-972)||(15676155-15677115)
chr7 (42-943)||(16172666-16173561)
chr7 (109-943)||(14606007-14606841)
chr7 (109-943)||(16025184-16026018)
chr7 (46-640)||(17848934-17849528)
chr7 (47-640)||(16103295-16103888)
chr7 (44-640)||(17825208-17825804)
chr7 (763-972)||(15670503-15670713)
chr7 (830-943)||(16102989-16103102)
chr7 (107-290)||(31103387-31103570)
chr7 (47-290)||(31216177-31216420)
chr7 (164-284)||(31058949-31059069)
chr7 (164-290)||(31184467-31184593)
chr7 (110-283)||(31140753-31140926)
chr7 (110-283)||(31159585-31159758)
chr7 (110-283)||(31241688-31241861)
chr7 (820-927)||(17848656-17848763)
chr7 (707-773)||(17825868-17825934)
chr7 (511-616)||(31103055-31103160)
[»] scaffold0289 (3 HSPs)
scaffold0289 (5-887)||(13472-14354)
scaffold0289 (142-887)||(4776-5521)
scaffold0289 (590-972)||(17766-18149)
[»] scaffold0400 (3 HSPs)
scaffold0400 (43-640)||(6894-7491)
scaffold0400 (44-625)||(13209-13790)
scaffold0400 (842-943)||(6600-6701)
[»] scaffold0365 (3 HSPs)
scaffold0365 (43-640)||(7538-8135)
scaffold0365 (44-625)||(13852-14433)
scaffold0365 (842-943)||(7244-7345)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (44-628)||(15037437-15038021)
chr1 (44-640)||(14531855-14532451)
chr1 (44-628)||(15032870-15033454)
chr1 (44-628)||(15011418-15012002)
chr1 (49-640)||(14521739-14522330)
chr1 (44-628)||(15002525-15003109)
chr1 (45-640)||(14468209-14468807)
chr1 (49-628)||(15017533-15018112)
chr1 (45-640)||(14483157-14483755)
chr1 (106-640)||(14504388-14504922)
chr1 (44-415)||(15041218-15041591)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (45-224)||(17028662-17028841)
chr8 (45-224)||(17559098-17559277)
chr8 (511-635)||(17027300-17027424)
chr8 (511-635)||(17557792-17557916)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (365-402)||(37027411-37027448)
chr5 (560-627)||(37027186-37027253)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 762; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 762; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 972
Target Start/End: Original strand, 15664320 - 15665281
Alignment:
Q  12 tatcatatttcataaatagtacagagaaataaaattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15664320 tatcatatttcataaatagtacatagaaatgaaatgaacctggagaagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattaggattaag 15664419  T
Q  112 aagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaa 211  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15664420 aagcttagccgttccaaagtctgagacacaagccacatattctaaatccagaagaatattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggggtgcaa 15664519  T
Q  212 tcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15664520 tcatggtgcatatagcataaagcattcgctatatctttaataacattcaccctctttttccaaccaaatgcaattgcttcttcatcatcattcaaaatct 15664619  T
Q  312 tttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15664620 tttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgtgtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttc 15664719  T
Q  412 tgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaattttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggac 511  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| |||  ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15664720 tgtcagaacttggatctcatttgcaaaacattttagatcagaattctccgcattcgttactgaatggagttttttaacagcaactacttgacctgtgggc 15664819  T
Q  512 aactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15664820 aactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctgctccaatgagatgcttgtcatcaaactcttccgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcc 15664919  T
Q  612 catcaaaactccatattgtaaatacatttctaggagcaatgttgtttcctccaacctggttgtttcttgtggttgacatttggcataaatgggatgagaa 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15664920 catcaaaactccatattgtaaatacatttttaggagcaatgttgtttcctccaacctggttaattcttgtggttgacatttggcataaatgagatgagaa 15665019  T
Q  712 tttgaaacaaacaaatgctagcattagagttcctggtgcaagaggcaaaactatcaataagatcactttcttaatctcatggttatgagaacccctgctt 811  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15665020 tttgaaacaaacaaatgctagcattagagttcctggtgcaaaaggcaaaactatcaataagatcactttcttaatcttatggttatgagaacccctgctt 15665119  T
Q  812 ggttttatgcaagactccaagccagaaacattaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgtttggaa 911  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15665120 ggatttatgcaagactccaagccagatacattaccgcacaagcctgtattatttctcaaaacttcaatggtagcgtcattgaatgctcgcatgtttggaa 15665219  T
Q  912 gtggaccctcgaattgattatatgatatatc-acatttgacaaactaatcatctgatcaaag 972  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15665220 gtggaccctcgaattggttatatgatatatcaacatttgacaaactaatcatctgatcaaag 15665281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 972
Target Start/End: Original strand, 15676155 - 15677115
Alignment:
Q  12 tatcatatttcataaatagtacagagaaataaaattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaag 111  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||  |||||||| ||| ||    
T  15676155 tatcatatttcataattagttcaaagaacttaaattaacctggagcagcatatccataggtacctgcaaatgatgtcaagttggttgaattaggatttag 15676254  T
Q  112 aagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaa 211  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15676255 aagcttagctattccaaagtctgagacacgagccacatattctaaatccagtaggatattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaa 15676354  T
Q  212 tcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatct 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15676355 tcatggtgcatatagtataaagcattagctacatctttaataacattcacccgcttattccaatcaaatgtaattacttcttcatcatctttcaaaatct 15676454  T
Q  312 tttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15676455 tttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgggagtgtgaacaatatccatatag-ttcacaatgttacgatgctgaatttc 15676553  T
Q  412 tgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaattttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggac 511  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||  |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    |    
T  15676554 tgtcagagcttgaatctcatttgcgaaacagtttagatcaaaattttcctcatttgttactgaatggaattttttaacagcaactacttgacctgaatgc 15676653  T
Q  512 aactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcc 611  Q
    || | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15676654 aaatctgctttgtaaacttttccttgcgctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttatgtggcttcaattatgttctcatacaccattttcc 15676753  T
Q  612 catcaaaactccatattgtaaatacatttctaggagcaatgttgtttcctccaacctggttgtttcttgtggttgacatttggcataaatgggatgagaa 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||   |||  |||| ||    
T  15676754 catcaaaactccatattgtaaatacatttttaggagcaacgatgtttcctccatcctggttgtctcttgtggttgacggttggcaccgatgatatgaaaa 15676853  T
Q  712 tttgaaacaaacaaatgctagcattagagttcctggtgcaagaggcaaaactatcaataagatcactttcttaatctcatggttatgagaacccctgctt 811  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  |||||  | ||||||    
T  15676854 tttgaaacaaatgaatgctataattagaattcctagtgcaagagataaaactatcaataagatcaatttattaatcttatgatagtgagactcactgctt 15676953  T
Q  812 ggttttatgcaagactccaagccagaaacattaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgtttggaa 911  Q
    |   || ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15676954 gagattttgcaagggttcaaaccagaaacattaccgcacaagcctatattatttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgtttggaa 15677053  T
Q  912 gtggaccctcgaattgattatatgatatatc-acatttgacaaactaatcatctgatcaaag 972  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15677054 gtggaccctccaattggttatatgaaatatcaacaaaggacaaactaatcatctgatcaaag 15677115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 42 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 16173561 - 16172666
Alignment:
Q  42 aaaattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      | |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16173561 aaaattaacctggagcagcatatccaaatgtgcatgcaaatgaagtcgaggaagttaaattaggatcaagaagcttagctgttccaaagtcagagacatg 16173462  T
Q  142 agccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagct 241  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16173461 agccacacattcggaatccagaagaatattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggcgagcaatcatggtgcatatagcataaagcattagct 16173362  T
Q  242 acatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |    
T  16173361 acatctttaatgacattcacccgctttttccaattaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctctacaaactcat 16173262  T
Q  342 aaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaa 441  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| |    
T  16173261 aaaccaaaaatgacaactgtgaatgtgagcaaaatccatacagattcacaatattacgatgtcgaatttcagtcaaagcttggatctcatttgtgaaaga 16173162  T
Q  442 ttttaga-tcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgc 540  Q
    |||| || | || |||||||  |||||    ||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16173161 ttttggactgag-attttcctcatttgaaactggatggagctttttcacagcaactacttgacctgtgtgtaactctgctttgtaaacacttccttgccc 16173063  T
Q  541 tcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacattt 640  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||| ||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  16173062 tccaactccaataagatatttgtcatcaaaatcttgtgtggcttccaagatgttctcgtagaccatttttccatcgaaattccatattgtaaaaacattt 16172963  T
Q  641 ctaggagcaatgttgtttcctccaacctggttgtttcttgtggttgacatttggcataaatgggatgagaatttgaaacaaacaaatgctagcattagag 740  Q
      |||  ||||  |||| ||||| |||||||| | || | |||||||  | ||| | | |||  || |||||||||||||   |  ||||||||||||||    
T  16172962 tgaggtacaataatgttccctcctacctggttttctcctatggttgatgtatggtagagatgatataagaatttgaaaca---agttgctagcattagag 16172866  T
Q  741 ttcctggtgcaagaggcaaaactatcaataagatcactttcttaatctcatggttatgagaacccctgcttggttttatgcaagactccaagccagaaac 840  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||   |  ||||| ||||||| | | | | | ||    || || ||| ||| ||||| |||||||||||| |     
T  16172865 ttcctagtacaagaggtaaaactatcaat---agtacttttttaatcttacgatcaggcgatttacttctcggtgttaagcaaggctccaagccagagat 16172769  T
Q  841 attaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgtttggaagtggaccctcgaattgattatatgatata 940  Q
    |||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  16172768 attaccacacaagccattattatttctcaacacttcaatggtagcgctactgaaagctcggatgttggggagtggaccttccaattggttatatgatata 16172669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 109 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 14606841 - 14606007
Alignment:
Q  109 aagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14606841 aagaagcttagctgttccaaagtcagagacatgacccacacattccgaatccagaagaatattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggcgag 14606742  T
Q  209 caatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaa 308  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14606741 caatcatgatgcatgtagcataaagcattggctacatctttaatgacattcaccctcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaa 14606642  T
Q  309 tcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaat 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  14606641 tcttttccaaactacctttctctacaaactcataaaccaaaaatgacaactgtgaatgtgagcaaaatccatacaacttcacaatattacgatgtcgaat 14606542  T
Q  409 ttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaattttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtg 508  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||  | |||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14606541 ttcggtcagagcttggatctcatttgtgaatgattttagatttggattttctccatttgctactgaatggagctttttcacagcaactacttgacctgtg 14606442  T
Q  509 gacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattt 608  Q
      ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||  | ||    
T  14606441 tgcaactttgctttgtagacacttccatgccctccaactccaatgagatgtttttcatcaaaatcttctgtggcttccaaaatgttctcatacaaaaatt 14606342  T
Q  609 tcccatcaaaactccatattgtaaatacatttctaggagcaatgttgtttcctccaacctggttgtttcttgtggttgacatttggcataaatgggatga 708  Q
    | ||||||||  |||||||||||| |||||||   ||  || || |||| ||||||||||| || |   | ||||||||  ||||| | | |||   |||    
T  14606341 ttccatcaaagttccatattgtaagtacattttgtggtacactgatgttccctccaacctgattttcattggtggttgatctttggaagagatgatgtga 14606242  T
Q  709 gaatttgaaacaaacaaatgctagcattagagttc---ctggtgcaagaggcaaaactatcaataagatcactttcttaatctcatggttatgagaaccc 805  Q
    ||||||||| ||||  || ||||| | ||||||||   | | | |||  || |||||||||||||||   ||||||||    | ||| | ||||||  |     
T  14606241 gaatttgaagcaaaataaggctagaactagagttccaacagctacaaagggtaaaactatcaataag---actttcttcgaatgatgatgatgagattca 14606145  T
Q  806 ctgcttggttttatgcaagactccaagccagaaacattaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgt 905  Q
     |||||| | ||| ||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| || |    
T  14606144 atgcttgatattaggcagggctctaagccagagacattaccacacaagcctttattatttctcaccacttcaattgtagcgttgctgaaagctcgaatat 14606045  T
Q  906 ttggaagtggaccctcgaattgattatatgatatatca 943  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14606044 tggggagtggaccctccaattggttatatgatatatca 14606007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 109 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 16026018 - 16025184
Alignment:
Q  109 aagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16026018 aagaagcttagctgttccaaagtcagagacatgacccacacattccgaatccagaagaatattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggcgag 16025919  T
Q  209 caatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaa 308  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16025918 caatcatgatgcatgtagcataaagcattggctacatctttaatgacattcaccctcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaa 16025819  T
Q  309 tcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaat 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||    
T  16025818 tcttttccaaactacctttctctacaaactcataaaccaaaaatgacaactgtgaatgtgagcaaaatccatacaacttcacaatattacgatgtcgaat 16025719  T
Q  409 ttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaattttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtg 508  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||  | |||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16025718 ttcggtcagagcttggatctcatttgtgaatgattttagatttggattttctccatttgctactgaatggagctttttcacagcaactacttgacctgtg 16025619  T
Q  509 gacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattt 608  Q
      ||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||  | ||    
T  16025618 tgcaactttgctttgtagacacttccatgccctccaactccaatgagatgtttttcatcaaaatcttctgtggcttccaaaatgttctcatacaaaaatt 16025519  T
Q  609 tcccatcaaaactccatattgtaaatacatttctaggagcaatgttgtttcctccaacctggttgtttcttgtggttgacatttggcataaatgggatga 708  Q
    | ||||||||  |||||||||||| |||||||   ||  || || |||| ||||||||||| || |   | ||||||||  ||||| | | |||   |||    
T  16025518 ttccatcaaagttccatattgtaagtacattttgtggtacactgatgttccctccaacctgattttcattggtggttgatctttggaagagatgatgtga 16025419  T
Q  709 gaatttgaaacaaacaaatgctagcattagagttc---ctggtgcaagaggcaaaactatcaataagatcactttcttaatctcatggttatgagaaccc 805  Q
    ||||||||| ||||  || ||||| | ||||||||   | | | |||  || |||||||||||||||   ||||||||    | ||| | ||||||  |     
T  16025418 gaatttgaagcaaaataaggctagaactagagttccaacagctacaaagggtaaaactatcaataag---actttcttcgaatgatgatgatgagattca 16025322  T
Q  806 ctgcttggttttatgcaagactccaagccagaaacattaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgt 905  Q
     |||||| | ||  ||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| || |    
T  16025321 atgcttgatgttgggcagggctctaagccagagacattaccacacaagcctttattatttctcaccacttcaattgtagcgttgctgaaagctcgaatat 16025222  T
Q  906 ttggaagtggaccctcgaattgattatatgatatatca 943  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16025221 tggggagtggaccctccaattggttatatgatatatca 16025184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 46 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 17849528 - 17848934
Alignment:
Q  46 ttaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagcc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  17849528 ttaacctggagcagcatatccaatggttcctgcaaatgaggtccaattggttgaatcaggatttagaagtttagctattccaaagtcagagacatgagct 17849429  T
Q  146 acatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctacat 245  Q
    |||||||| || || || || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||||    
T  17849428 acatattccaagtctagaagtatattcttgcttgatatatctcgatgaacaatcggaggtgagcaatgatgatgcatataacatagagcattagctacat 17849329  T
Q  246 ctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaaac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || | ||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  17849328 ctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttgatcatcatctttcaaaatgttatctacacttccttttcccatgaaatcgtaaac 17849229  T
Q  346 caaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaatttt 445  Q
    |||||| || ||  |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  17849228 caaaaatgagaatcgtgaatgcaaacaaaatccatacagcttcacaatgttacgatgtcgaatttctatcaaagcttggatctcacttgtgaaagatttt 17849129  T
Q  446 agatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctccta 545  Q
    ||    |||| |||   || | ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17849128 aggctggaatcttcttcatctattactgaatggagttttttcacagccactacttgacctgtgtccaacacggctttgtaaacacttccctgccctccta 17849029  T
Q  546 ctccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacattt 640  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17849028 ctccgatgagatgtttatcatcaaaatcttctgtggcttcaataatactctcatacaccatttttccatcaaaactccatatggtaaatagattt 17848934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 47 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16103888 - 16103295
Alignment:
Q  47 taacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagcca 146  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |  |   | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103888 taacctggagcagcatatccaaatgtgcatgcaaatgaggttgagctagttaaattaagatcaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagcca 16103789  T
Q  147 catattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatc 246  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16103788 catattctaaatccagaagaatattcttgcttgatatatctctgtgaacaattggaggcgagcaatcatgatgcatgtagcataaagcattagctacatc 16103689  T
Q  247 tttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaaacc 346  Q
    ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  16103688 tttaaggacattcactctcttgttccaatcaaacgcaattgcttcttcatcatccttcaaaattttctccaaactacctttctctacgaactcataaacc 16103589  T
Q  347 aaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaatttta 446  Q
    ||||| || || || || ||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||| | |||||| || ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  16103588 aaaaatgaaaactgagaatgtgagcaaaatccatgcaacttcacaatattacgatgtctaatttcggttagagcttggatttcatttgtgaaagatttta 16103489  T
Q  447 gatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctac 546  Q
    |||  | |||||| | |||||    ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||    
T  16103488 gattgggattttcaccatttgccactgaatggagctttttcacagcaactacttggcccgtgtgcaactttgctttgtagacacttccatgccccccaac 16103389  T
Q  547 tccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacattt 640  Q
     ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16103388 accaattagatgtttctcatcaaaatcttctgtggcttccacaatgttttcaaacacaatttttccatcaaagttccatattgtaaatacattt 16103295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 44 - 640
Target Start/End: Original strand, 17825208 - 17825804
Alignment:
Q  44 aattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgag 143  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  17825208 aatttacctggtgcagcatatccaatggttcctgcaaatgaggtccaattggttgaatcaggattaagaagcttagctattccaaagtcagagacatgag 17825307  T
Q  144 ccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctac 243  Q
    |||||||||| ||||  || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| ||||||     
T  17825308 ccacatattccaaatttagaagtatattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatgatgatgcatataacatacagcattagctat 17825407  T
Q  244 atctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaa 343  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || | ||| |||||  ||||| | |||||     
T  17825408 atctttaatggcattcaccctcttattccagtcaaatgcaattgcttcatcataatctttcaaaatgttatctacacttccttttcccatgtattcgtag 17825507  T
Q  344 accaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaatt 443  Q
    |||||||| || |   | || ||  ||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  17825508 accaaaaatgagactcgagaatgcaaacaaaatccatgcagttttacaatgttacgatgtcgaatttctgtcagtgcttggatctcacttgtgaaagatt 17825607  T
Q  444 ttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcc 543  Q
    |||| |  ||||||||   || |  | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17825608 ttaggtttgaattttcttcatatactattgaatggagctttttaacagcaactacttgacctgtgtctaattctgctttgtaaacacttccatgccctcc 17825707  T
Q  544 tactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacattt 640  Q
     ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17825708 aactccgatgagatgtttatcatcaaaatcgtctgtggcttgaataatattctcatacaccattttgtcatcaaaactccatatggtaaatagattt 17825804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 763 - 972
Target Start/End: Original strand, 15670503 - 15670713
Alignment:
Q  763 tatcaataagatcactttcttaatctcatggttatgagaacccctgcttggttttatgcaagactccaagccagaaacattaccgcacaagcctggatta 862  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| || |||||||   || | ||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15670503 tatcaataagatcaatttcttaatcttatgataatgagacccactgcttgagattttccaagggttcaaaccagaaacattaccgcacaagcctatatta 15670602  T
Q  863 tttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgtttggaagtggaccctcgaattgattatatgatatatc-acatttgacaaactaatca 961  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||   |||||||||||||    
T  15670603 tttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgtttggaagtggaccctccaattggttatatgaaatatcaacaaaggacaaactaatca 15670702  T
Q  962 tctgatcaaag 972  Q
    |||||||||||    
T  15670703 tctgatcaaag 15670713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 830 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 16103102 - 16102989
Alignment:
Q  830 aagccagaaacattaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgtttggaagtggaccctcgaattgat 929  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  16103102 aagccagagacattaccacacaagtctttattatttctcaacacttcgattgtagcgtttctgaaagctcgaatgttggggagtggaccctccaattggt 16103003  T
Q  930 tatatgatatatca 943  Q
    ||||||||||||||    
T  16103002 tatatgatatatca 16102989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31103570 - 31103387
Alignment:
Q  107 ttaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtg 206  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||| || | ||  || |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  31103570 ttaagaaacttagctgtcccaaagtcggagacatgagcttcatagtcaagattgagaagaatattcttgctcgatatatcacgatgaataataggaggtg 31103471  T
Q  207 agcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgctt 290  Q
    |||||||||| ||||  ||| | |||||| | || ||| ||||||  |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31103470 agcaatcatgatgcaagtaggacaaagcattggcgacacctttaacaacattcaccctcttttcccaatcaaatgcaatggctt 31103387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31216420 - 31216177
Alignment:
Q  47 taacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagcca 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||  || |||| ||| ||||||||||| || || |   ||||      
T  31216420 taacctggagctgcatatccatatgtgcctgcaaatgcggtccagctgcttgaatcaggctttagaaacttggctgttccaaaatctgaaagttgagctt 31216321  T
Q  147 catattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatc 246  Q
    |||||  || |||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||  ||| ||| |    
T  31216320 catatgatatatccaagagaacattcttgcttgatatgtcacggtgaactattggaggtatgcagtcatgatgcatgtaggacaaagcatcagccacacc 31216221  T
Q  247 tttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgctt 290  Q
    | |||  | |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31216220 tctaacaatattcaccctcttttcccaatcaaatgcaatggctt 31216177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31059069 - 31058949
Alignment:
Q  164 agaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcaccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||| ||||  ||| | |||||| | || ||| ||||||  ||||||||||    
T  31059069 agaacattcttgcttgatatatcgcgatgaattataggaggcgagcaatcatgatgcaagtaggacaaagcattggccacacctttaacaacattcaccc 31058970  T
Q  264 gcttattccaatcaaatgcaa 284  Q
     ||| | ||||||||||||||    
T  31058969 tcttttcccaatcaaatgcaa 31058949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31184593 - 31184467
Alignment:
Q  164 agaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcaccc 263  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||| | |||||| | || ||| ||||||  ||||||||||    
T  31184593 agaacatttttactcgatatatcacgatgaacaataggaggtgagcaatcgtgatgcaagtaggacaaagcattggcgacacctttaacaacattcaccc 31184494  T
Q  264 gcttattccaatcaaatgcaattgctt 290  Q
     ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  31184493 tcttttcccaatcaaatgcaatggctt 31184467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31140926 - 31140753
Alignment:
Q  110 agaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagc 209  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||  ||||  |||| || | ||  || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || |    
T  31140926 agaaacttagccgttccaaagtcggagacttgagcttcatagtcaagattaagaaggacattcttgcttgatatatcacgatgaataataggaggagaac 31140827  T
Q  210 aatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgca 283  Q
    ||||||| ||||  ||| | |||||| | || ||| ||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  31140826 aatcatgatgcaagtaggacaaagcattggccacacctttaacaacattcaccctcttttcccaatcaaatgca 31140753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31159758 - 31159585
Alignment:
Q  110 agaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagc 209  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||  ||||  |||| || | ||  || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  31159758 agaaacttagccgttccaaagtcggagacttgagcttcatagtcaagattaagaaggacattcttgctcgatatatcacgatgaacaataggaggagaac 31159659  T
Q  210 aatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgca 283  Q
    ||||||| ||||  ||| | |||||| | || ||| ||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  31159658 aatcatgatgcaagtaggacaaagcattggccacacctttaacaacattcaccctcttttcccaatcaaatgca 31159585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31241861 - 31241688
Alignment:
Q  110 agaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagc 209  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||  ||||  |||| || | ||  || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  31241861 agaaacttagccgttccaaagtcggagacttgagcttcatagtcaagattaagaaggacattcttgctcgatatatcacgatgaacaataggaggagaac 31241762  T
Q  210 aatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgca 283  Q
    ||||||| ||||  ||| | |||||| | || ||| ||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  31241761 aatcatgatgcaagtaggacaaagcattggccacacctttaacaacattcaccctcttttcccaatcaaatgca 31241688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 820 - 927
Target Start/End: Complemental strand, 17848763 - 17848656
Alignment:
Q  820 gcaagactccaagccagaaacattaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgtttggaagtggaccc 919  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||  | || |||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| | ||||||||||  ||||||    
T  17848763 gcaaggctccaatccagaaacattaccacacagtcttgtattatttctcaaaacttcaatggttgctttattgaaagctggaatgtttggaaccggaccc 17848664  T
Q  920 tcgaattg 927  Q
    || |||||    
T  17848663 tctaattg 17848656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 707 - 773
Target Start/End: Original strand, 17825868 - 17825934
Alignment:
Q  707 gagaatttgaaacaaacaaatgctagcattagagttcctggtgcaagaggcaaaactatcaataaga 773  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||    
T  17825868 gagaatatgaaacaaactaatactagtattagagttccaattgcaagtggcaaaacaatcaataaga 17825934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 511 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 31103160 - 31103055
Alignment:
Q  511 caactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttc 610  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||||| |  || || |||||||| || || ||| ||| |||||||    
T  31103160 caactctgccttgtaaacatttccttgacttccaactccaatgagatatttgtcatcaaaattctcagtagcttcaatgatattttcaaacatcattttc 31103061  T
Q  611 ccatca 616  Q
    ||||||    
T  31103060 ccatca 31103055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 687; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 687; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 887
Target Start/End: Original strand, 13472 - 14354
Alignment:
Q  5 acaattttatcatatttcataaatagtacagagaaataaaattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattag 104  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13472 acaattttatcaaattttataaatagtacagagaaataaaattaacttggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattag 13571  T
Q  105 aattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggagg 204  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572 catcaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagaagaatattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggagg 13671  T
Q  205 tgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttc 304  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13672 ggtgcaatcatggtgcatatagcataaagcattcgctatatctttaataacattcaccctctttttccaaccaaatgcaattgcttcttcatcatctttc 13771  T
Q  305 aaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgcc 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13772 aaaatcttttccagactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaatatccatatagcttcacaatgttacaatgtc 13871  T
Q  405 gaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaattttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacc 504  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13872 gaatttctgtcaaagctttgatctcatttgcaaaacattttagatcagaattttccgcatttgttattgaatggagttttttaacagcaactacttgacc 13971  T
Q  505 tgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacacc 604  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13972 tgagggcaactctgctttgtaaacacttccttgcgctcctagtccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgtggcttcaataatgttctcatacacc 14071  T
Q  605 attttcccatcaaaactccatattgtaaatacatttctaggagcaatgttgtttcctccaacctggttgtttcttgtggttgacatttggcataaatggg 704  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||      
T  14072 attttcccatcaaaactccatatagtaaatacatttttaggagcaatgatgtttcctccaacctggttgtttcttgtgttcgacatttggcatagatgac 14171  T
Q  705 atgagaatttgaaacaaacaaatgctagcattagagttcctggtgcaagaggcaaaactatcaataagatcactttcttaatctcatggttatgagaacc 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14172 atgagaatttgaaacaaacaaatgctagcattagagttcctggtgcaagaggaaaaactatcaataagatcactttcttaatcttatggttatgagaacc 14271  T
Q  805 cctgcttggttttatgcaagactccaagccagaaacattaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgt 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14272 cctgcttggttttatgcaagactccaagccagaaacattaccacacaagcctgtattatttctcaacacttcaatggtagcgt 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289; HSP #2
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 142 - 887
Target Start/End: Original strand, 4776 - 5521
Alignment:
Q  142 agccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagct 241  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4776 agccacatattctaaatccagaagaatattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggggtgcaatcatggtgcatatagcataaagcattcgct 4875  T
Q  242 acatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgt 341  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4876 atatctttaataacattcaccctctttttccaaccaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccagactacctttctccatgaactcgt 4975  T
Q  342 aaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaa 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||  ||| |    
T  4976 aaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaatatccatatagcttcacaatgttacaatgtcgaatttctgtcaaagctttgatctcatttgcaaaaca 5075  T
Q  442 ttttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgct 541  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5076 ttttagatcagaattttccgcatttgttattgaatggagttttttaacagcaactacttgacctgagggcaactctgctttgtaaacacttccttgcgct 5175  T
Q  542 cctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacatttc 641  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  5176 cctagtccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgtggcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatatagtaaatacatttt 5275  T
Q  642 taggagcaatgttgtttcctccaacctggttgtttcttgtggttgacatttggcataaatgggatgagaatttgaaacaaacaaatgctagcattagagt 741  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5276 taggagcaatgatgtttcctccaacctggttgtttcttgtgttcgacatttggcatagatgacatgagaatttgaaacaaacaaatgctagcattagagt 5375  T
Q  742 tcctggtgcaagaggcaaaactatcaataagatcactttcttaatctcatggttatgagaacccctgcttggttttatgcaagactccaagccagaaaca 841  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5376 tcctggtgcaagaggaaaaactatcaataagatcactttcttaatcttatggttatgagaacccctgcttggttttatgcaagactccaagccagaaaca 5475  T
Q  842 ttaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgt 887  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5476 ttaccacacaagcctgtattatttctcaacacttcaatggtagcgt 5521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 590 - 972
Target Start/End: Original strand, 17766 - 18149
Alignment:
Q  590 atgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacatttctaggagcaatgttgtttcctccaacctggttgtttcttgtggttgaca 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17766 atgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacatttttaggagcaatgttgtttcctccaacctggttaattcttgtggttgaca 17865  T
Q  690 tttggcataaatgggatgagaatttgaaacaaacaaatgctagcattagagttcctggtgcaagaggcaaaactatcaataagatcactttcttaatctc 789  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17866 tttggcataaatgagatgagaatttgaaacaaacaaatgctagcattagagttcctggtgcaaaaggcaaaactatcaataagatcactttcttaatctt 17965  T
Q  790 atggttatgagaacccctgcttggttttatgcaagactccaagccagaaacattaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgtta 889  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  17966 atggttatgagaacccctgcttggatttatgcaagactccaagccagatacattaccgcacaagcctgtattatttctcaaaacttcaatggtagcgtca 18065  T
Q  890 ttgaatgctcgcatgtttggaagtggaccctcgaattgattatatgatatatc-acatttgacaaactaatcatctgatcaaag 972  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18066 ttgaatgctcgcatgtttggaagtggaccctcgaattggttatatgatatatcaacatttgacaaactaatcatctgatcaaag 18149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400 (Bit Score: 182; Significance: 8e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0400
Description:

Target: scaffold0400; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 7491 - 6894
Alignment:
Q  43 aaattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||   ||||  | |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||    
T  7491 aaattaacctggagcagcatatccaaaggttcctacaaaacaggtccaattggaagaatcgggattaagaaacttggctgttccgaagtctgagacatga 7392  T
Q  143 gccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagcta 242  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||    
T  7391 gccacatattccaaatccaaaacaacattcttgctggatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaattgtgatgcatatagcataaagcattagcta 7292  T
Q  243 catctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgta 342  Q
    || |||||||| |||| |||| | |||||||||  ||   ||||||||  ||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||    
T  7291 cacctttaatggcatttaccctcctattccaattcaacttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactgcctttctccaagaactcata 7192  T
Q  343 aaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaat 442  Q
    ||||||||| ||      ||  ||||||||| | || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| || | | ||||||||||||||| ||||  |    
T  7191 aaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaatacccgtataacttcacaatgtttcgatgccggatttcagttaaagcttggatctcacttgcgaaagct 7092  T
Q  443 tttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctc 542  Q
    || ||||  ||  | || | ||||  |  ||| |||||||| || || || || ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||    
T  7091 ttcagattggacgtctctccattttgtaatgaatggagtttcttcaccgctacaacttgtcctgtggggaactctgctttgtaaacacttccgtgtcctc 6992  T
Q  543 ctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacattt 640  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  6991 ctatcccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcagttgcttcaacaatgttctcatacaccaattttccatcaaagctccatattgcaaatagattt 6894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 13790 - 13209
Alignment:
Q  44 aattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgag 143  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||   |||  |||||| | ||| || | ||| | |||||| ||||| |||||| |||    
T  13790 aattgacctggagctgcatatccaaaggtgcctgcaaaagaagtcatgttggatgaattgggatttaggaacttggatgttccgaagtctgagacatgag 13691  T
Q  144 ccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctac 243  Q
    | |||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||| |||| ||| ||||||     
T  13690 ctacatattccaaatccaaaataacattcttgctggatatatctcgatgaacaataggaggggaacaatcatgatgcagatagaataaggcattagctat 13591  T
Q  244 atctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaa 343  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||   |||| |||||  || |||||||| || | ||  ||||| |||||||  || || |||    
T  13590 atctttaatgatattcaccctcttattccaatcaaattcagcagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtacatgctacccttctccaaaaattcataa 13491  T
Q  344 accaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaatt 443  Q
    |||||||| ||     ||   ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |  ||||   ||    
T  13490 accaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaagccgtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcattattgaatgctt 13391  T
Q  444 ttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcc 543  Q
    | | || |||  ||||   || |  |  | | || ||||| || ||||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||    
T  13390 tcatattagacatttcttcatgttctaataaatgaagtttcttcacagctacaacttgacctgaaggcaactctgctttgtaaacatttccatgtcctcc 13291  T
Q  544 tactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccat 625  Q
     || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  13290 aaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttctgtggcttcgattatgttctcatataccatttttccatcaaagctccat 13209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0400; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 842 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 6701 - 6600
Alignment:
Q  842 ttaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgtttggaagtggaccctcgaattgattatatgatatat 941  Q
    ||||| |||||||||   |||||||| ||  ||||||||| ||| || ||||| ||| | |||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||    
T  6701 ttaccacacaagcctttgttatttcttaatgcttcaattggagcatttttgaaggctggaatgtttggaattggaccttcaaattggttgtatgatatat 6602  T
Q  942 ca 943  Q
    ||    
T  6601 ca 6600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365 (Bit Score: 182; Significance: 8e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0365
Description:

Target: scaffold0365; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 8135 - 7538
Alignment:
Q  43 aaattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||   ||||  | |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||    
T  8135 aaattaacctggagcagcatatccaaaggttcctacaaaacaggtccaattggaagaatcgggattaagaaacttggctgttccgaagtctgagacatga 8036  T
Q  143 gccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagcta 242  Q
    ||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||    
T  8035 gccacatattccaaatccaaaacaacattcttgctggatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaattgtgatgcatatagcataaagcattagcta 7936  T
Q  243 catctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgta 342  Q
    || |||||||| |||| |||| | |||||||||  ||   ||||||||  ||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||    
T  7935 cacctttaatggcatttaccctcctattccaattcaacttaattgcttggtcattgtctttcaaaatcttgtccacactgcctttctccaagaactcata 7836  T
Q  343 aaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaat 442  Q
    ||||||||| ||      ||  ||||||||| | || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| || | | ||||||||||||||| ||||  |    
T  7835 aaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaatacccgtataacttcacaatgtttcgatgccggatttcagttaaagcttggatctcacttgcgaaagct 7736  T
Q  443 tttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctc 542  Q
    || ||||  ||  | || | ||||  |  ||| |||||||| || || || || ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||    
T  7735 ttcagattggacgtctctccattttgtaatgaatggagtttcttcaccgctacaacttgtcctgtggggaactctgctttgtaaacacttccgtgtcctc 7636  T
Q  543 ctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacattt 640  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  7635 ctatcccaatgagatgcttgttgtcaaactcttcagttgcttcaacaatgttctcatacaccaattttccatcaaagctccatattgcaaatagattt 7538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 14433 - 13852
Alignment:
Q  44 aattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgag 143  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||   |||  |||||| | ||| || | ||| | |||||| ||||| |||||| |||    
T  14433 aattgacctggagctgcatatccaaaggtgcctgcaaaagaagtcatgttggatgaattgggatttaggaacttggatgttccgaagtctgagacatgag 14334  T
Q  144 ccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctac 243  Q
    | |||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||| |||| ||| ||||||     
T  14333 ctacatattccaaatccaaaataacattcttgctggatatatctcgatgaacaataggaggggaacaatcatgatgcagatagaataaggcattagctat 14234  T
Q  244 atctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaa 343  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||   |||| |||||  || |||||||| || | ||  ||||| |||||||  || || |||    
T  14233 atctttaatgatattcaccctcttattccaatcaaattcagcagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtacatgctacccttctccaaaaattcataa 14134  T
Q  344 accaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaatt 443  Q
    |||||||| ||     ||   ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |  ||||   ||    
T  14133 accaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaagccgtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcattattgaatgctt 14034  T
Q  444 ttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcc 543  Q
    | | || |||  ||||   || |  |  | | || ||||| || ||||| || ||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||    
T  14033 tcatattagacatttcttcatgttctaataaatgaagtttcttcacagctacaacttgacctgaaggcaactctgctttgtaaacatttccatgtcctcc 13934  T
Q  544 tactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccat 625  Q
     || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  13933 aaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttctgtggcttcgattatgttctcatataccatttttccatcaaagctccat 13852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0365; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 842 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 7345 - 7244
Alignment:
Q  842 ttaccgcacaagcctggattatttctcaacacttcaattgtagcgttattgaatgctcgcatgtttggaagtggaccctcgaattgattatatgatatat 941  Q
    ||||| |||||||||   |||||||| ||  ||||||||| ||| || ||||| ||| | |||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||    
T  7345 ttaccacacaagcctttgttatttcttaatgcttcaattggagcatttttgaaggctggaatgtttggaattggaccttcaaattggttgtatgatatat 7246  T
Q  942 ca 943  Q
    ||    
T  7245 ca 7244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 7e-95; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 15038021 - 15037437
Alignment:
Q  44 aattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgag 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |  ||||  ||| || | ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  15038021 aattgacctggagcagcatatccaaaggtgcctgcaaaagaagacatattggatgagttgggatttagaaacttagatgttccaaagtctgagacatgag 15037922  T
Q  144 ccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctac 243  Q
    | |||||||| | |||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||     
T  15037921 ctacatattccatatccaaaataacattcttgctggatatatctcgatgaacaataggaggggaacaatcatgatgcagatagcataaagcattagctat 15037822  T
Q  244 atctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaa 343  Q
    ||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||   |||| |||||  || |||||||| || ||||  ||||| ||| ||| ||| || |||    
T  15037821 atccttaatgatattcactctcttattccaatcaaattcaccagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccatgctacccttcgccaagaattcataa 15037722  T
Q  344 accaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaatt 443  Q
    |||||||||||     ||   ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||    
T  15037721 accaaaaacgagtgtagtcgatgtgaacaaaacccatataacttaacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcatttgtgaaagatt 15037622  T
Q  444 ttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcc 543  Q
    | |||| |||  |||||  ||||  |  ||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||    
T  15037621 tcagattagacatttcctcattttgtaatgaatgaagtttcttcacagctacaacttgacctgtgggcaactctgctttgtaaacatttccatgtcctcc 15037522  T
Q  544 tactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatatt 628  Q
     || ||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15037521 aaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttcagtggcttcgataatgttctcatacaccattttgccatcaaagctccatatt 15037437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 640
Target Start/End: Original strand, 14531855 - 14532451
Alignment:
Q  44 aattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgag 143  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||  ||| || | ||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||| |||    
T  14531855 aattgacctggagctgcatatccaaaggtgcctgcaaaagaagtcatattggatgagttgggattcagaaacttggatgttccgaagtctgagacatgag 14531954  T
Q  144 ccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctac 243  Q
    | || ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||     
T  14531955 ctacgtattccaaatccaaaataacattcttgctggatatatctcgatgaacaataggaggtgagcagtcatgatgtagatagcataaagcattagctat 14532054  T
Q  244 atctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| |||||  || |||||||| || ||||  ||||| || |||| ||| || |||    
T  14532055 atctttaatgacattcaccctcctattccaatcaaattcagcagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccatgctacccttttccaagaattcataa 14532154  T
Q  344 accaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaatt 443  Q
    |||||||| ||     ||   ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||| ||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||   ||    
T  14532155 accaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaagccgtataacttcacaatattgcgatgtcgaatttctttcaaagcatggatctcatttgtgaatgctt 14532254  T
Q  444 ttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcc 543  Q
    | |||| |||  ||||   ||||  |  |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14532255 tcagattagacatttcttcattttgtaatgagtgaagtttcttcacagcaacaacttgacctgtaggcaactctgctttgtaaacacttccatgccctcc 14532354  T
Q  544 tactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacattt 640  Q
     || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  14532355 aaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttctgtggcttcgataatggtctcgtacaccatttttccatcaaagctccatattgcaaatagattt 14532451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 44 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 15033454 - 15032870
Alignment:
Q  44 aattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgag 143  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||  ||||  |||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  15033454 aattcacctggagcagtatatccaaaagtgcctgcaaaagaagtcatattggatgaattgggattgagaaacttagatgttccaaagtctgagacatgag 15033355  T
Q  144 ccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctac 243  Q
    | |||||||| |||||||  |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  15033354 ctacatattccaaatccaaaatgacattcttgctggatatatcgcgatgaacaattgaaggtgaacaatcatgatgcatatagcataaagcattagctat 15033255  T
Q  244 atctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaa 343  Q
    ||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||   |||| |||||  || ||||||||  | ||||  ||||| ||||||| ||| || |||    
T  15033254 atctttaataacatccaccctcctattccaatcaaattcaggagcttgttcattgtccttcaaaatgatgtccatgctacccttctccaagaattcataa 15033155  T
Q  344 accaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaatt 443  Q
    |||||||| ||     ||   ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||  ||    
T  15033154 accaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaacccgtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcatttgtgaaagctt 15033055  T
Q  444 ttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcc 543  Q
    | |||| ||   ||||   ||||  |  ||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||    
T  15033054 tcagattaggcatttcttcattttgtaatgaatgaagtttcttcacagctacaacttgacctgtgggcaactctgctttgtaaacacttccatgtcctcc 15032955  T
Q  544 tactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatatt 628  Q
     || |||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15032954 aaccccaaggagatgcttgtcgtcaaaatcttcagtggcttcgattatgttctcgtacaccattttgccatcaaagctccatatt 15032870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 15012002 - 15011418
Alignment:
Q  44 aattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgag 143  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||  |||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  15012002 aattgacctggagcggcatatccaaaggtgcctgcaaaagaagtcatattggatgaattgggatttagaaacttagatgttccaaagtctgagacatgag 15011903  T
Q  144 ccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctac 243  Q
    | |||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| ||| ||||||     
T  15011902 ctacatattccaaatccaaaataacattcttgctggatatatctcgatgaacaataggaggcgagcagtcatgatgcagatagaataaggcattagctat 15011803  T
Q  244 atctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaa 343  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||   |||| |||||  || |||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| || |||    
T  15011802 atctttaataatattcaccctcttattccaatcaaattcaccagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccaagctacccttctccaagaattcataa 15011703  T
Q  344 accaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaatt 443  Q
    |||||||| ||     ||   ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||  ||    
T  15011702 accaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaagccgtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcatttgtgaaagctt 15011603  T
Q  444 ttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcc 543  Q
    |  |||  |   ||||   ||||  |  |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||  | ||||||||||||| |||| ||  ||||    
T  15011602 tccgatttggcatttcttcattttgtaatgagtgaagtttcttcacagctacaacttgacctgtaggcagttctgctttgtaaacatttccatgtcctcc 15011503  T
Q  544 tactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatatt 628  Q
     || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15011502 aaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttctgtggcttcgattatgttctcatacaccattttgccatcaaagctccatatt 15011418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 640
Target Start/End: Original strand, 14521739 - 14522330
Alignment:
Q  49 acctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccaca 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |||   |||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||    
T  14521739 acctggagcagcatatccaaaggtgcctgcaaaagaagtcatattcgatgaattgggatttagaaacttagatgttccaaagtctgagacatgagctaca 14521838  T
Q  149 tattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctt 248  Q
     |||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||| |||||||| |||||| |||||    
T  14521839 cattccaaatccaaaataacattcttgctggatatatctcgatgaacaataggaggtgagcagtcatgatgtagatagaataaagcattagctatatctt 14521938  T
Q  249 taatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaa 348  Q
    |||||| |||||||| | || ||||||||||| || | |||| |||||  || |||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||    
T  14521939 taatgatattcaccctcctactccaatcaaattcactagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccaagctacccttctccaagaattcataaaccaa 14522038  T
Q  349 aaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaattttaga 448  Q
    ||| ||     ||   ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||| | |    ||||||| ||  |||  |||||||    
T  14522039 aaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaacccatataactttacaatgttgcgatgtcggatttctgtcaaagcactaatctcacctgcaaaagcttttaga 14522138  T
Q  449 tcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactc 548  Q
    | |||    || | ||||| |  ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||  |||| || |    
T  14522139 ttagatacatctccatttggtagtgaatggagtttcttcacagctaccacttgacctgttggcaactctgctttgtaaacacttccatgtactccaaccc 14522238  T
Q  549 caatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacattt 640  Q
    | ||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14522239 cgatgagattcttgttgtcaaaatcttctgtggcttcgatgatattctcatacaccatttttccatcaaagctccatattgtaaatagattt 14522330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 15003109 - 15002525
Alignment:
Q  44 aattaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgag 143  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||   ||||| | ||| |||| ||||| ||||||||| || |||||| |||    
T  15003109 aattgacctggagcagcatatccaaaggtgcctgcaaaagaagtcatattggacgaattgggatttagaaacttagatgttccaaaatctgagacatgag 15003010  T
Q  144 ccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctac 243  Q
    | |||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  15003009 ctacatattccaaatccaaaataacattcttgctggatatatctcgatgaacaataggaggggaacaatcatgatgcagatagcataaagcattagctac 15002910  T
Q  244 atctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaa 343  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    |||| |||||  || |||||||| || ||||  ||||| ||| ||| ||| || |||    
T  15002909 atctttaatgatattcaccctcttattccaatcaaattcgccagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccatgctacccttcgccaagaattcataa 15002810  T
Q  344 accaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaatt 443  Q
    |||||||| ||     ||   ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||  ||    
T  15002809 accaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaagccgtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatggatctcatttgtgaaagctt 15002710  T
Q  444 ttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcc 543  Q
    |   ||  |   ||||   ||||  |  |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| | ||  | ||||||||||||| |||| ||  ||||    
T  15002709 tcctatttggcatttcttcattttgtaatgagtgaagtttcttcacagctacaacttgacctgtaggcagttctgctttgtaaacatttccatgtcctcc 15002610  T
Q  544 tactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatatt 628  Q
     || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15002609 aaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttctgtggcttcgattatgttctcgtacaccatttttccatcaaagctccatatt 15002525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14468807 - 14468209
Alignment:
Q  45 attaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaat---gaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacg 141  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    ||||||||||||   | ||| | ||| |||| |||||||||||| || || |||||| |    
T  14468807 attaacctggagcagtgtatccaaaggtgcctacaaaattagaggtccaattggaagcattgggattgagaaacttagctgttccgaaatctgagacatg 14468708  T
Q  142 agccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagct 241  Q
    |||||||||||| |||||||  | || |||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||| |||  ||| |||||    
T  14468707 agccacatattccaaatccaaaacaatattcttactggatatatcgcgatgaacaattgatggtgagcgatcatgatgcatgtagtatagtgcattagct 14468608  T
Q  242 acatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgt 341  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||   | | ||||  ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| || |||| |||||| |    
T  14468607 acatccttaatgacattcaccctcctattccagtcaaacatagtagcttgctcatcttctttcaaaatcttgtccacgctacccttttccaagaactcat 14468508  T
Q  342 aaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaa 441  Q
    |||||||||| ||      ||  ||||||||| | ||  ||| |||||||||||| ||||| || |||||||| | | |||||||||||||||  ||       
T  14468507 aaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaataaccgcataacttcacaatgtttcgatgtcggatttctgttaaagcttggatctcacttgcaaatgc 14468408  T
Q  442 ttttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgct 541  Q
    ||| ||||  ||  |||| | ||||  |  ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||  ||    
T  14468407 tttcagattggacatttctccattttgtaatgaatggagtttcttcacagctacaacttgacctgtaggcaactctgctttgtaaacacttccatgtcct 14468308  T
Q  542 cctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacattt 640  Q
    || || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14468307 ccaaccccaatgagatgcttgttgtcaaactcttctgtggcttcaacaatgttttcatacacaatttttccatcaaaactccatattgaaaatagattt 14468209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 15018112 - 15017533
Alignment:
Q  49 acctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccaca 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  ||||  |||||| | ||| |||| ||||| ||||||||| || |||||| |||| |||    
T  15018112 acctggagcagcatatccaaaggtgcctgcaaaagaagtcatattggatgaattgggatttagaaacttagatgttccaaaatctgagacatgagctaca 15018013  T
Q  149 tattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctt 248  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  15018012 tattccaaatccaaaataacattcttgctggatatatctcgatgaactataggaggggaacaatcatgatgcagatagcataaggcattagctatatctt 15017913  T
Q  249 taatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaa 348  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||   |||| |||||  || ||||||||  | |||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||    
T  15017912 taataatattcaccctcttattccaatcaaattcagcagcttgttcattgtccttcaaaatgatgtccacactacccttctccaagaattcataaaccaa 15017813  T
Q  349 aaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaattttaga 448  Q
    ||| ||     ||   ||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | || |||||| ||||||||  ||| | |    
T  15017812 aaatgagtgtagtcgatgtaaacaaaacccgtataacttcacaatgttgcgatgtcgaatttctgtcaaagcatgaatctcatttgtgaaagctttcata 15017713  T
Q  449 tcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactc 548  Q
    | |||  ||||   ||||  |  | | || ||||| || ||||| || ||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| | ||  |||| || |    
T  15017712 ttagacatttcttcattttgtaataaatgaagtttcttcacagctacaacttgacctgaaggcaactctgctttgtaaacacttgcatgtcctccaaccc 15017613  T
Q  549 caatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatatt 628  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15017612 caatgagatgtttgttgtcaaaatcttccgtggcttcgattatgttctcatacaccattttgccatcaaagctccatatt 15017533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14483755 - 14483157
Alignment:
Q  45 attaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaat---gaggtccaattgtctgaatta---gaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagac 138  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    ||||||||||||   ||||||   | |||||||| |||||||||||| || || |||||    
T  14483755 attaacctggagcagtgtatccaaaggtgcctacaaaattagaggtccaattg---gaattatcgggattaagaaacttagctgttccgaaatctgagac 14483659  T
Q  139 acgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcacta 238  Q
    | ||||||||||||| |||||||  | || |||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||    
T  14483658 atgagccacatattccaaatccaaaacaatattcttactggatatatcgcgatgaactattgaaggtgagcgatcatgatgcatgtagtataaagcatta 14483559  T
Q  239 gctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaact 338  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | |||||||  ||||  || | ||||  ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  14483558 gctacatctttaatggcaatcaccctcctattccagccaaacacagtagcttgctcatcgtctttcaaaatcttatccagactacccttctccaagaact 14483459  T
Q  339 cgtaaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaa 438  Q
    | ||||||||||| ||      |   ||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||| || |||||||  | |  ||||||||||||||  ||    
T  14483458 cataaaccaaaaatgagtgcaatagatgtgaacaatacccgtataacttcacaatgtttcgatgtcggatttctgctaaaggttggatctcacttgcaaa 14483359  T
Q  439 aaattttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacctgtggacaactttgctttgtaaacacttccttgc 538  Q
    |  ||| ||||  ||  |||| | ||||  |  ||| |||||||| || ||||| || || || ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||     
T  14483358 agctttcagattggacatttctccattttgtaatgaatggagtttcttcacagctacaacctgtcctgtaggcaactctgctttgtaaacacttccatgt 14483259  T
Q  539 gctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatattgtaaatacat 638  Q
     |||| || ||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14483258 cctccaaccccaatgagatgcttgttgtcaaaatcttttgtggcttcgataatgttctcgtacaccatttttcaatcaaaactccatattgaaaatagat 14483159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 106 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14504922 - 14504388
Alignment:
Q  106 attaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggt 205  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||  | || |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14504922 attaagaaacttagctgttccgaaatccgagacatgagccacatattccaaatccaaaacaatattcttactcgatatatcgcgatgaacaattgcaggt 14504823  T
Q  206 gagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagctacatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttca 305  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||   | | ||||  ||||| |||||||    
T  14504822 gagcgatcatgatgcatgtagtataaagcattagctacatctttaatggatttcaccctcttattccaatcaaacatagtggcttgctcatcgtctttca 14504723  T
Q  306 aaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgtaaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccg 405  Q
    ||||||| |||| ||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||      ||  ||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||| ||    
T  14504722 aaatcttatccagactgcccttctccaagaactcataaaccaaaaatgagtgcaatggatgtgaacaatacccgtataacttcacaatgtttcgatgtcg 14504623  T
Q  406 aatttctgtcagaacttggatctcacttgtgaaaaattttagatcagaattttccctatttgttgttgagtggagttttttaacagcaactacttgacct 505  Q
      ||||||| | | |||  ||||||||||  |||  ||| | ||  ||  |||| | ||||  |  ||| |||||||| || ||||| || || || |||    
T  14504622 gctttctgttaaagcttttatctcacttgcaaaagctttcaaattggacatttctccattttgtaatgaatggagtttcttcacagctacaacctgtcct 14504523  T
Q  506 gtggacaactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacacca 605  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||| ||  |||| || || |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  14504522 gtaggcaactctgctttgtaaacacttccatgtcctccaaccccgatgagatgtttgttgtcaaactcttctgtggcttctacaatattttcatacacca 14504423  T
Q  606 ttttcccatcaaaactccatattgtaaatacattt 640  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14504422 tttttccatcaaaactccatattgaaaatagattt 14504388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15041591 - 15041218
Alignment:
Q  44 aattaacctggagcagcatatccataggtgc--ctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacg 141  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| || |||  ||||  |||||| | ||| | || ||||| |||||||||||| |||||| |    
T  15041591 aattcacctggtgcagcatatccaaaggtgcgcctgcaaaagaagtcatattggatgaattgggatttaaaaacttagatgttccaaagtctgagacatg 15041492  T
Q  142 agccacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatatagcataaagcactagct 241  Q
    ||| |||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || | ||||||||||||| |||||    
T  15041491 agctacatattccaaatccaaaataacattcttgctggatatatctcgatgaacaataggaggggaacaatcatgatgtagatagcataaagcattagct 15041392  T
Q  242 acatctttaatgacattcacccgcttattccaatcaaatgcaattgcttcttcatcatctttcaaaatcttttccaaactacctttctccatgaactcgt 341  Q
    | ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || | |||| |||||  || |||||||| || ||||  ||||| ||||||| ||| || |    
T  15041391 atatctttaatgacattcacccttctattccaatcaaattcactagcttgttcattgtccttcaaaatgttgtccatgctacccttctccaagaattcat 15041292  T
Q  342 aaaccaaaaacgacaagtgtgagtgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatgccgaatttctgtc 415  Q
    |||||||||| ||     ||   ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  15041291 aaaccaaaaatgagtgtagtcgatgtgaacaaaacccatataactttacaatgttgcgatgtcggatttctgtc 15041218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17028841 - 17028662
Alignment:
Q  45 attaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagc 144  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| | ||||||||||   ||||    |||||||| |||||||||||| || || |||||| ||||    
T  17028841 attaacctggagcagtgtatccaaaggtgcctacaaaagcggtccaattggaagaatcgagattaagaaacttagctgttccgaaatctgagacatgagc 17028742  T
Q  145 cacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatat 224  Q
     |||||||| |||||||  | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  17028741 aacatattccaaatccaaaacaacattcttactggatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatcatgcatat 17028662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17559277 - 17559098
Alignment:
Q  45 attaacctggagcagcatatccataggtgcctgcaaatgaggtccaattgtctgaattagaattaagaagcttagctgttccaaagtccgagacacgagc 144  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| | ||||||||||   ||||    |||||||| |||||||||||| || || |||||| ||||    
T  17559277 attaacctggagcagtgtatccaaaggtgcctacaaaagcggtccaattggaagaatcgagattaagaaacttagctgttccgaaatctgagacatgagc 17559178  T
Q  145 cacatattctaaatccagtagaacattcttgcttgatatatctcgatgaacaattggaggtgagcaatcatggtgcatat 224  Q
     |||||||| |||||||  | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  17559177 aacatattccaaatccaaaacaacattcttactggatatatcacgatgaacaattgaaggtgagcaatcatcatgcatat 17559098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 511 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 17027424 - 17027300
Alignment:
Q  511 caactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttc 610  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||  |||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17027424 caactctgcttggtaaacacttccatgacctccaaccccaatgagatacttgttgtcaaactcttcggtggcttcgataatgttctcatacaccattttt 17027325  T
Q  611 ccatcaaaactccatattgtaaata 635  Q
    |||||||| ||||||| || |||||    
T  17027324 ccatcaaagctccatactgcaaata 17027300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 511 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 17557916 - 17557792
Alignment:
Q  511 caactttgctttgtaaacacttccttgcgctcctactccaatgagatgcttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttc 610  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||  |||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17557916 caactctgcttggtaaacacttccatgacctccaaccccaatgagatacttgttgtcaaactcttcggtggcttcgataatgttctcatacaccattttt 17557817  T
Q  611 ccatcaaaactccatattgtaaata 635  Q
    |||||||| ||||||| || |||||    
T  17557816 ccatcaaagctccatactgcaaata 17557792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 37027448 - 37027411
Alignment:
Q  365 tgtgaacaaaatccatatagcttcacaatgttacgatg 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37027448 tgtgaacaaaatccatataacttcacaatgttacgatg 37027411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 560 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 37027253 - 37027186
Alignment:
Q  560 ttgtcatcaaactcttctgttgcttcaataatgttctcatacaccattttcccatcaaaactccatat 627  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  37027253 ttgtcatcaaaatcctctgtggcttcaatgatattttcataaaccatttttccatcataactccatat 37027186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University