View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4392_low_3 (Length: 534)

Name: NF4392_low_3
Description: NF4392
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4392_low_3
NF4392_low_3
[»] chr3 (87 HSPs)
chr3 (109-517)||(32431186-32431594)
chr3 (86-231)||(10770493-10770638)
chr3 (86-231)||(36314301-36314446)
chr3 (86-231)||(48322380-48322525)
chr3 (397-517)||(32424098-32424218)
chr3 (86-197)||(36314581-36314692)
chr3 (86-197)||(48322660-48322771)
chr3 (86-197)||(10770774-10770885)
chr3 (86-224)||(37778558-37778696)
chr3 (86-224)||(47551496-47551634)
chr3 (90-197)||(8041623-8041730)
chr3 (86-210)||(11910702-11910826)
chr3 (86-210)||(52032438-52032562)
chr3 (90-197)||(54466430-54466537)
chr3 (86-224)||(40788705-40788843)
chr3 (106-231)||(19740946-19741071)
chr3 (102-231)||(23457998-23458127)
chr3 (87-224)||(29118823-29118960)
chr3 (102-197)||(2796198-2796293)
chr3 (102-197)||(9294272-9294367)
chr3 (85-210)||(32306723-32306848)
chr3 (90-231)||(54466672-54466813)
chr3 (86-210)||(3469203-3469327)
chr3 (86-210)||(3469499-3469623)
chr3 (86-210)||(10294570-10294694)
chr3 (86-210)||(13948783-13948907)
chr3 (86-210)||(52032141-52032265)
chr3 (101-224)||(35643869-35643992)
chr3 (102-197)||(42342810-42342905)
chr3 (86-224)||(29685944-29686082)
chr3 (90-195)||(8041901-8042006)
chr3 (102-231)||(23458259-23458388)
chr3 (86-203)||(33506256-33506373)
chr3 (102-194)||(19741209-19741301)
chr3 (86-210)||(32306427-32306551)
chr3 (105-197)||(33689693-33689785)
chr3 (102-210)||(36417707-36417815)
chr3 (101-224)||(9368588-9368711)
chr3 (102-229)||(36417970-36418097)
chr3 (102-197)||(40033770-40033865)
chr3 (121-210)||(10307674-10307763)
chr3 (106-202)||(1079530-1079626)
chr3 (106-194)||(4323519-4323607)
chr3 (86-210)||(10294858-10294982)
chr3 (86-210)||(41421975-41422099)
chr3 (106-197)||(23276297-23276388)
chr3 (86-197)||(33156308-33156419)
chr3 (102-197)||(51994200-51994295)
chr3 (92-202)||(21186004-21186114)
chr3 (102-220)||(40758401-40758519)
chr3 (104-210)||(53757024-53757130)
chr3 (108-197)||(9367766-9367855)
chr3 (90-195)||(47921473-47921578)
chr3 (86-210)||(3596112-3596236)
chr3 (102-210)||(26463651-26463759)
chr3 (86-210)||(29686239-29686363)
chr3 (105-197)||(46474837-46474929)
chr3 (106-197)||(25107236-25107327)
chr3 (102-229)||(33689401-33689527)
chr3 (86-201)||(42855615-42855730)
chr3 (102-229)||(46475063-46475189)
chr3 (102-220)||(42343022-42343140)
chr3 (106-195)||(25108411-25108500)
chr3 (106-195)||(41558198-41558287)
chr3 (121-194)||(43384321-43384394)
chr3 (86-210)||(29118530-29118665)
chr3 (102-197)||(40758166-40758258)
chr3 (106-197)||(4322615-4322705)
chr3 (102-229)||(43384565-43384692)
chr3 (104-194)||(41558029-41558119)
chr3 (106-195)||(3849054-3849143)
chr3 (92-197)||(6956257-6956362)
chr3 (102-194)||(40506104-40506197)
chr3 (121-210)||(43998183-43998272)
chr3 (105-152)||(51993986-51994033)
chr3 (102-142)||(34142587-34142627)
chr3 (86-194)||(40788423-40788531)
chr3 (101-197)||(43608796-43608892)
chr3 (106-197)||(3850441-3850532)
chr3 (86-157)||(33506181-33506252)
chr3 (102-161)||(36150546-36150605)
chr3 (156-190)||(8741314-8741348)
chr3 (92-166)||(33154886-33154960)
chr3 (92-210)||(47856396-47856514)
chr3 (105-195)||(53756766-53756856)
chr3 (174-231)||(55052370-55052427)
chr3 (92-224)||(47857532-47857664)
[»] chr5 (103 HSPs)
chr5 (86-197)||(41930519-41930630)
chr5 (86-197)||(6758148-6758259)
chr5 (86-231)||(41930765-41930910)
chr5 (94-231)||(6757876-6758013)
chr5 (102-231)||(3528892-3529021)
chr5 (102-229)||(186701-186828)
chr5 (90-197)||(297297-297404)
chr5 (90-197)||(1505974-1506081)
chr5 (102-197)||(13962883-13962978)
chr5 (102-229)||(14194442-14194569)
chr5 (90-197)||(31482685-31482792)
chr5 (90-231)||(297021-297162)
chr5 (90-231)||(1506216-1506357)
chr5 (102-231)||(11761997-11762126)
chr5 (90-231)||(31482409-31482550)
chr5 (102-231)||(35512167-35512296)
chr5 (86-210)||(33871342-33871466)
chr5 (102-197)||(3529156-3529251)
chr5 (102-197)||(5993908-5994003)
chr5 (102-197)||(39453319-39453414)
chr5 (16-78)||(13658070-13658132)
chr5 (107-229)||(21265167-21265289)
chr5 (102-195)||(11761768-11761861)
chr5 (102-231)||(28770888-28771017)
chr5 (86-210)||(17544347-17544471)
chr5 (105-229)||(28269444-28269568)
chr5 (101-196)||(5256327-5256421)
chr5 (102-197)||(24547439-24547534)
chr5 (102-197)||(27587167-27587262)
chr5 (102-229)||(39453581-39453708)
chr5 (86-224)||(8875452-8875590)
chr5 (92-202)||(24141461-24141571)
chr5 (107-197)||(35920498-35920588)
chr5 (102-231)||(27587395-27587524)
chr5 (102-210)||(8322705-8322813)
chr5 (86-210)||(20152784-20152908)
chr5 (102-229)||(6150702-6150829)
chr5 (102-229)||(17202681-17202808)
chr5 (102-197)||(32242261-32242356)
chr5 (102-197)||(38475313-38475408)
chr5 (102-229)||(43159096-43159223)
chr5 (102-220)||(35512405-35512523)
chr5 (102-231)||(32242522-32242650)
chr5 (102-194)||(19892625-19892717)
chr5 (86-210)||(21287956-21288080)
chr5 (86-210)||(33871637-33871761)
chr5 (102-197)||(6150473-6150568)
chr5 (102-197)||(14194737-14194831)
chr5 (102-193)||(16082996-16083087)
chr5 (102-197)||(16157169-16157264)
chr5 (102-197)||(20814449-20814544)
chr5 (105-231)||(6301823-6301949)
chr5 (102-196)||(17202418-17202512)
chr5 (86-210)||(20153217-20153338)
chr5 (102-231)||(5024038-5024167)
chr5 (102-231)||(5024298-5024427)
chr5 (102-231)||(5994169-5994298)
chr5 (105-190)||(13362549-13362634)
chr5 (104-229)||(16156876-16157001)
chr5 (102-219)||(19892327-19892444)
chr5 (105-210)||(22298564-22298669)
chr5 (109-210)||(35920254-35920355)
chr5 (102-231)||(38442347-38442476)
chr5 (102-197)||(18247105-18247198)
chr5 (107-231)||(38475057-38475181)
chr5 (102-229)||(11047719-11047845)
chr5 (102-195)||(18670221-18670311)
chr5 (102-197)||(20840552-20840647)
chr5 (102-197)||(28771152-28771247)
chr5 (102-229)||(29646381-29646508)
chr5 (105-210)||(5255040-5255144)
chr5 (121-210)||(17544086-17544175)
chr5 (102-231)||(19517887-19518016)
chr5 (106-195)||(37991222-37991311)
chr5 (116-231)||(6301576-6301691)
chr5 (102-229)||(20814155-20814281)
chr5 (104-197)||(186440-186533)
chr5 (89-158)||(8875618-8875687)
chr5 (102-231)||(11740706-11740835)
chr5 (102-166)||(24547196-24547260)
chr5 (105-197)||(38442090-38442182)
chr5 (121-197)||(42063292-42063368)
chr5 (102-197)||(29646676-29646770)
chr5 (106-189)||(42265758-42265841)
chr5 (102-220)||(13963120-13963238)
chr5 (102-188)||(20840760-20840846)
chr5 (146-231)||(13362290-13362375)
chr5 (102-194)||(21265458-21265551)
chr5 (106-195)||(42067840-42067929)
chr5 (103-194)||(11047458-11047548)
chr5 (102-202)||(11741826-11741926)
chr5 (106-194)||(21257478-21257566)
chr5 (102-189)||(5835748-5835835)
chr5 (106-197)||(37992602-37992693)
chr5 (86-184)||(3656743-3656841)
chr5 (137-227)||(21287797-21287887)
chr5 (144-210)||(27937114-27937180)
chr5 (92-230)||(40150095-40150233)
chr5 (102-231)||(16083223-16083352)
chr5 (102-183)||(18247404-18247485)
chr5 (92-185)||(40148907-40149000)
chr5 (145-197)||(8322466-8322518)
chr5 (137-197)||(28269702-28269762)
[»] chr4 (136 HSPs)
chr4 (86-197)||(9400802-9400913)
chr4 (86-197)||(27934535-27934646)
chr4 (86-231)||(9400522-9400667)
chr4 (86-197)||(33247556-33247667)
chr4 (86-231)||(4982729-4982874)
chr4 (86-197)||(4983009-4983120)
chr4 (94-197)||(22566810-22566913)
chr4 (96-231)||(33247287-33247421)
chr4 (86-224)||(10408174-10408312)
chr4 (90-197)||(42738314-42738421)
chr4 (86-224)||(54858563-54858701)
chr4 (90-231)||(9144773-9144914)
chr4 (86-203)||(27069216-27069333)
chr4 (90-231)||(32950391-32950532)
chr4 (90-231)||(38012419-38012560)
chr4 (102-231)||(46661194-46661323)
chr4 (102-203)||(49879226-49879327)
chr4 (90-197)||(9145049-9145156)
chr4 (102-197)||(44967352-44967447)
chr4 (86-224)||(27068913-27069051)
chr4 (86-224)||(52573231-52573369)
chr4 (86-203)||(27149302-27149418)
chr4 (90-231)||(34837081-34837222)
chr4 (102-231)||(37248485-37248614)
chr4 (90-231)||(42738038-42738179)
chr4 (102-231)||(50418687-50418816)
chr4 (86-210)||(3032585-3032709)
chr4 (90-194)||(32950149-32950253)
chr4 (86-210)||(45463076-45463200)
chr4 (102-210)||(51692820-51692928)
chr4 (86-210)||(54858859-54858983)
chr4 (102-197)||(24711130-24711225)
chr4 (90-197)||(34837357-34837464)
chr4 (103-194)||(37248256-37248347)
chr4 (102-231)||(7452083-7452212)
chr4 (102-231)||(13058262-13058391)
chr4 (86-159)||(22567107-22567180)
chr4 (102-231)||(43155548-43155677)
chr4 (90-195)||(51203616-51203721)
chr4 (86-210)||(10407892-10408016)
chr4 (86-210)||(27891587-27891711)
chr4 (90-194)||(38012177-38012281)
chr4 (86-210)||(45463372-45463496)
chr4 (102-197)||(7451853-7451948)
chr4 (102-233)||(14802013-14802144)
chr4 (102-197)||(24349693-24349788)
chr4 (102-229)||(37976172-37976299)
chr4 (102-197)||(50418951-50419046)
chr4 (102-223)||(24350720-24350841)
chr4 (102-231)||(35028017-35028146)
chr4 (102-231)||(44967088-44967217)
chr4 (86-210)||(11523952-11524076)
chr4 (102-194)||(18831368-18831460)
chr4 (86-210)||(22717942-22718066)
chr4 (86-210)||(22987150-22987274)
chr4 (91-159)||(27934839-27934907)
chr4 (86-210)||(51859705-51859829)
chr4 (102-197)||(10781798-10781893)
chr4 (102-197)||(13058056-13058151)
chr4 (102-197)||(23613328-23613423)
chr4 (102-197)||(34765694-34765789)
chr4 (105-223)||(1179088-1179206)
chr4 (102-223)||(10780732-10780853)
chr4 (102-223)||(10974341-10974462)
chr4 (102-231)||(24711360-24711489)
chr4 (102-231)||(39539198-39539327)
chr4 (86-210)||(5818074-5818198)
chr4 (98-190)||(6237141-6237233)
chr4 (86-210)||(39667075-39667199)
chr4 (109-197)||(43155810-43155898)
chr4 (86-210)||(50504124-50504248)
chr4 (106-194)||(50750910-50750998)
chr4 (102-197)||(5368966-5369061)
chr4 (86-197)||(16605605-16605716)
chr4 (92-231)||(30642426-30642565)
chr4 (102-197)||(49879490-49879585)
chr4 (102-197)||(51692572-51692667)
chr4 (105-195)||(52909275-52909365)
chr4 (102-231)||(23613558-23613687)
chr4 (102-231)||(34765399-34765528)
chr4 (102-231)||(36008863-36008992)
chr4 (102-210)||(18831618-18831726)
chr4 (102-197)||(14801755-14801850)
chr4 (102-197)||(53701831-53701926)
chr4 (98-196)||(6236846-6236943)
chr4 (86-200)||(52573537-52573651)
chr4 (92-201)||(11446279-11446388)
chr4 (102-231)||(15507692-15507821)
chr4 (116-197)||(36009127-36009208)
chr4 (147-224)||(51859471-51859548)
chr4 (109-194)||(54087012-54087097)
chr4 (101-202)||(54713648-54713748)
chr4 (102-194)||(15507990-15508081)
chr4 (109-197)||(16005864-16005952)
chr4 (86-210)||(39701208-39701332)
chr4 (102-197)||(17356236-17356331)
chr4 (102-197)||(24411377-24411472)
chr4 (107-194)||(37976470-37976557)
chr4 (86-197)||(50751812-50751922)
chr4 (102-229)||(54086714-54086841)
chr4 (106-197)||(55867428-55867519)
chr4 (86-224)||(50503828-50503966)
chr4 (108-197)||(147344-147433)
chr4 (106-195)||(148071-148160)
chr4 (109-194)||(11448046-11448131)
chr4 (102-231)||(17355944-17356073)
chr4 (121-197)||(40388420-40388496)
chr4 (102-210)||(52909554-52909662)
chr4 (116-203)||(5369175-5369262)
chr4 (107-202)||(8438305-8438399)
chr4 (106-193)||(40387490-40387577)
chr4 (106-197)||(41582470-41582561)
chr4 (121-203)||(22718245-22718327)
chr4 (109-203)||(22923164-22923258)
chr4 (109-203)||(22927817-22927911)
chr4 (109-203)||(22984096-22984190)
chr4 (121-203)||(22986889-22986971)
chr4 (109-203)||(22997684-22997778)
chr4 (104-210)||(39700930-39701036)
chr4 (102-231)||(53129786-53129915)
chr4 (104-197)||(54435411-54435504)
chr4 (102-190)||(11108161-11108249)
chr4 (101-197)||(32063650-32063746)
chr4 (102-194)||(35028315-35028407)
chr4 (105-193)||(35508558-35508646)
chr4 (163-210)||(1178123-1178170)
chr4 (120-231)||(8439504-8439615)
chr4 (106-197)||(41583545-41583636)
chr4 (126-224)||(9731497-9731595)
chr4 (108-197)||(30641545-30641632)
chr4 (92-210)||(32062598-32062715)
chr4 (86-156)||(39666773-39666843)
chr4 (105-231)||(53129528-53129654)
chr4 (174-231)||(53702092-53702149)
chr4 (136-197)||(56014778-56014839)
chr4 (104-152)||(16006152-16006200)
[»] chr8 (92 HSPs)
chr8 (86-231)||(11674943-11675088)
chr8 (86-197)||(11674698-11674809)
chr8 (86-197)||(36325237-36325348)
chr8 (86-219)||(36325495-36325628)
chr8 (86-195)||(23505055-23505164)
chr8 (86-195)||(23507741-23507850)
chr8 (90-197)||(38845582-38845689)
chr8 (86-224)||(10445620-10445758)
chr8 (101-224)||(2535837-2535960)
chr8 (86-224)||(15230216-15230354)
chr8 (102-231)||(1425072-1425201)
chr8 (90-231)||(2266741-2266882)
chr8 (90-231)||(44406864-44407005)
chr8 (86-210)||(234039-234163)
chr8 (86-210)||(710450-710574)
chr8 (86-210)||(747662-747786)
chr8 (86-210)||(871557-871681)
chr8 (86-210)||(15229934-15230058)
chr8 (90-197)||(2266499-2266606)
chr8 (90-197)||(3041739-3041846)
chr8 (102-197)||(23663828-23663923)
chr8 (102-197)||(23698558-23698653)
chr8 (102-197)||(39071695-39071790)
chr8 (90-197)||(40775933-40776040)
chr8 (90-197)||(44407140-44407247)
chr8 (86-200)||(7983431-7983545)
chr8 (102-220)||(12272937-12273055)
chr8 (103-197)||(35449892-35449986)
chr8 (102-220)||(38862854-38862972)
chr8 (86-224)||(44664511-44664649)
chr8 (102-195)||(8316904-8316997)
chr8 (90-231)||(38845306-38845447)
chr8 (86-210)||(35634398-35634522)
chr8 (86-210)||(37542227-37542351)
chr8 (86-218)||(44664799-44664931)
chr8 (102-197)||(16388840-16388935)
chr8 (102-197)||(20386744-20386839)
chr8 (86-209)||(25124566-25124689)
chr8 (102-220)||(8316672-8316790)
chr8 (105-231)||(36928756-36928882)
chr8 (90-231)||(3041463-3041604)
chr8 (102-203)||(12198969-12199070)
chr8 (102-203)||(12443397-12443498)
chr8 (102-195)||(40318280-40318373)
chr8 (90-231)||(40775657-40775798)
chr8 (102-197)||(12273167-12273262)
chr8 (102-197)||(20385587-20385682)
chr8 (104-231)||(22915410-22915537)
chr8 (102-229)||(40317983-40318110)
chr8 (86-224)||(25124848-25124986)
chr8 (102-231)||(13186339-13186468)
chr8 (102-231)||(23663564-23663693)
chr8 (102-231)||(38955952-38956081)
chr8 (86-194)||(6471693-6471801)
chr8 (86-210)||(8997988-8998112)
chr8 (86-210)||(41353872-41353996)
chr8 (86-210)||(42945413-42945537)
chr8 (102-197)||(1425336-1425430)
chr8 (102-197)||(4405974-4406069)
chr8 (102-220)||(23698327-23698446)
chr8 (109-224)||(34177257-34177372)
chr8 (102-221)||(39071932-39072050)
chr8 (127-210)||(42945158-42945241)
chr8 (102-231)||(34685538-34685666)
chr8 (102-194)||(13186079-13186171)
chr8 (102-197)||(31608827-31608922)
chr8 (102-197)||(4994971-4995065)
chr8 (102-197)||(22915672-22915767)
chr8 (102-197)||(30712031-30712125)
chr8 (102-197)||(30719808-30719902)
chr8 (102-197)||(36928495-36928590)
chr8 (102-203)||(34061636-34061737)
chr8 (86-166)||(8997859-8997939)
chr8 (86-194)||(21432696-21432804)
chr8 (102-209)||(35756884-35756992)
chr8 (86-166)||(38003749-38003829)
chr8 (102-187)||(42803542-42803627)
chr8 (86-194)||(41353577-41353685)
chr8 (102-197)||(38955722-38955817)
chr8 (137-224)||(39474600-39474686)
chr8 (104-202)||(7294122-7294220)
chr8 (121-210)||(6471989-6472078)
chr8 (106-202)||(8746347-8746443)
chr8 (102-210)||(37542524-37542632)
chr8 (102-157)||(34060508-34060563)
chr8 (92-186)||(10749833-10749927)
chr8 (109-203)||(43181460-43181554)
chr8 (105-210)||(4994679-4994784)
chr8 (102-231)||(7295207-7295336)
chr8 (109-210)||(36186127-36186228)
chr8 (106-197)||(35756606-35756696)
chr8 (102-197)||(36186381-36186473)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (86-197)||(21252-21363)
scaffold0205 (86-190)||(21012-21116)
[»] chr7 (96 HSPs)
chr7 (86-197)||(32680878-32680989)
chr7 (86-231)||(32680598-32680743)
chr7 (90-197)||(30948443-30948550)
chr7 (86-210)||(32068099-32068223)
chr7 (86-210)||(42618210-42618334)
chr7 (102-197)||(10935813-10935908)
chr7 (90-197)||(34928933-34929040)
chr7 (90-197)||(39686817-39686924)
chr7 (92-202)||(18086298-18086408)
chr7 (102-231)||(27991988-27992117)
chr7 (90-231)||(34928657-34928798)
chr7 (92-224)||(18087625-18087757)
chr7 (86-210)||(25453131-25453255)
chr7 (86-210)||(32934647-32934771)
chr7 (102-197)||(6253490-6253585)
chr7 (102-197)||(17102039-17102134)
chr7 (102-197)||(28469322-28469417)
chr7 (86-224)||(32068381-32068519)
chr7 (90-231)||(30948167-30948308)
chr7 (102-230)||(17102270-17102398)
chr7 (86-210)||(23058432-23058556)
chr7 (86-194)||(28890582-28890690)
chr7 (86-210)||(32934351-32934475)
chr7 (103-231)||(39686554-39686682)
chr7 (86-210)||(42617914-42618038)
chr7 (86-210)||(43266565-43266689)
chr7 (102-229)||(2640197-2640324)
chr7 (102-197)||(32299019-32299114)
chr7 (102-197)||(42731438-42731533)
chr7 (86-224)||(25628481-25628619)
chr7 (103-224)||(32688505-32688626)
chr7 (86-218)||(22081850-22081982)
chr7 (86-210)||(33828273-33828397)
chr7 (86-210)||(46204424-46204548)
chr7 (102-197)||(6571032-6571127)
chr7 (104-231)||(17885649-17885776)
chr7 (106-197)||(20426644-20426735)
chr7 (102-197)||(22871591-22871686)
chr7 (102-197)||(27991758-27991853)
chr7 (102-217)||(28469029-28469144)
chr7 (104-210)||(48788824-48788930)
chr7 (86-210)||(10600248-10600372)
chr7 (105-197)||(23181308-23181400)
chr7 (102-210)||(24389086-24389194)
chr7 (86-210)||(25453427-25453551)
chr7 (86-210)||(25628777-25628901)
chr7 (86-210)||(43266269-43266393)
chr7 (102-197)||(5457221-5457316)
chr7 (102-217)||(10936088-10936203)
chr7 (102-189)||(16803967-16804054)
chr7 (102-197)||(19204508-19204603)
chr7 (102-197)||(27396909-27397004)
chr7 (102-229)||(42731701-42731828)
chr7 (86-224)||(23058714-23058852)
chr7 (92-202)||(32687406-32687516)
chr7 (102-231)||(6253720-6253849)
chr7 (101-198)||(18855967-18856064)
chr7 (106-210)||(3914439-3914542)
chr7 (86-210)||(22081563-22081686)
chr7 (86-210)||(27138240-27138364)
chr7 (102-194)||(45010921-45011013)
chr7 (104-190)||(13386068-13386154)
chr7 (109-194)||(2640495-2640580)
chr7 (102-195)||(40380000-40380093)
chr7 (92-203)||(13050088-13050200)
chr7 (102-197)||(40379788-40379883)
chr7 (86-210)||(46205608-46205732)
chr7 (106-197)||(13384525-13384616)
chr7 (102-197)||(24388838-24388933)
chr7 (86-224)||(39274873-39275012)
chr7 (133-231)||(22871358-22871456)
chr7 (102-220)||(27396648-27396766)
chr7 (102-219)||(17886782-17886899)
chr7 (102-231)||(32053162-32053291)
chr7 (117-202)||(33808357-33808442)
chr7 (102-203)||(42019616-42019717)
chr7 (102-195)||(42362469-42362562)
chr7 (160-220)||(6571239-6571299)
chr7 (102-194)||(42019914-42020006)
chr7 (88-159)||(10600031-10600102)
chr7 (101-224)||(13044690-13044813)
chr7 (102-197)||(37656871-37656966)
chr7 (102-231)||(19204738-19204867)
chr7 (108-197)||(32053457-32053546)
chr7 (116-197)||(43124466-43124547)
chr7 (92-156)||(23608817-23608881)
chr7 (102-220)||(32298796-32298907)
chr7 (108-231)||(12229352-12229475)
chr7 (102-197)||(18670177-18670272)
chr7 (110-224)||(5455854-5455968)
chr7 (174-231)||(3914229-3914286)
chr7 (105-194)||(47945379-47945468)
chr7 (105-194)||(47950809-47950898)
chr7 (102-130)||(29141557-29141585)
chr7 (174-210)||(37657151-37657187)
chr7 (101-157)||(43123193-43123249)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (86-197)||(14196898-14197009)
chr6 (86-231)||(14196618-14196763)
chr6 (86-195)||(25485956-25486065)
chr6 (86-197)||(25486209-25486320)
chr6 (102-197)||(30337468-30337563)
chr6 (102-231)||(33517814-33517943)
chr6 (86-218)||(22502777-22502909)
chr6 (86-210)||(31407177-31407301)
chr6 (90-197)||(363113-363220)
chr6 (98-197)||(28000668-28000767)
chr6 (102-231)||(17734215-17734344)
chr6 (121-218)||(22367463-22367560)
chr6 (102-231)||(30337698-30337827)
chr6 (86-210)||(7160807-7160931)
chr6 (86-194)||(32593493-32593601)
chr6 (102-229)||(30726041-30726168)
chr6 (90-231)||(362877-363018)
chr6 (86-210)||(6517506-6517629)
chr6 (86-210)||(7905246-7905370)
chr6 (102-197)||(33517553-33517648)
chr6 (86-224)||(22503059-22503197)
chr6 (102-231)||(3059536-3059665)
chr6 (90-231)||(28000392-28000533)
chr6 (102-231)||(30804141-30804270)
chr6 (102-210)||(12080937-12081045)
chr6 (86-210)||(21836329-21836453)
chr6 (102-197)||(12080655-12080750)
chr6 (102-197)||(21628027-21628122)
chr6 (103-190)||(22372978-22373065)
chr6 (86-224)||(7905528-7905666)
chr6 (102-195)||(681044-681137)
chr6 (104-197)||(30725781-30725873)
chr6 (102-219)||(33647243-33647360)
chr6 (86-210)||(31406881-31407005)
chr6 (106-197)||(13379796-13379887)
chr6 (86-201)||(21836035-21836149)
chr6 (106-197)||(26463202-26463293)
chr6 (102-195)||(679885-679978)
chr6 (101-210)||(7161103-7161212)
chr6 (102-231)||(11434821-11434950)
chr6 (102-195)||(15115358-15115451)
chr6 (118-231)||(21627748-21627861)
chr6 (106-198)||(8089466-8089558)
chr6 (102-197)||(3059276-3059371)
chr6 (102-197)||(30803880-30803975)
chr6 (101-197)||(15116546-15116642)
chr6 (86-194)||(15913551-15913659)
chr6 (102-197)||(8090241-8090336)
chr6 (109-220)||(11393095-11393206)
chr6 (106-197)||(20651961-20652052)
chr6 (106-195)||(20651033-20651122)
chr6 (102-194)||(33646982-33647074)
chr6 (102-197)||(17734477-17734572)
chr6 (174-224)||(11435956-11436006)
chr6 (117-194)||(11392872-11392949)
chr6 (92-197)||(28498339-28498444)
chr6 (109-197)||(24210557-24210645)
chr6 (92-191)||(141060-141159)
chr6 (92-191)||(149081-149180)
chr6 (106-160)||(26464550-26464604)
chr6 (86-166)||(10781150-10781230)
chr6 (102-190)||(12408492-12408580)
[»] chr1 (106 HSPs)
chr1 (86-231)||(24905170-24905315)
chr1 (86-231)||(28011617-28011762)
chr1 (86-197)||(24905450-24905560)
chr1 (110-197)||(28011390-28011477)
chr1 (86-210)||(17188957-17189081)
chr1 (90-197)||(33442877-33442984)
chr1 (86-224)||(49955350-49955488)
chr1 (86-210)||(37929421-37929545)
chr1 (102-197)||(6367581-6367676)
chr1 (102-229)||(34464468-34464595)
chr1 (86-224)||(40714447-40714585)
chr1 (102-231)||(6367842-6367971)
chr1 (102-231)||(26024672-26024801)
chr1 (86-210)||(20760804-20760928)
chr1 (86-210)||(40714742-40714866)
chr1 (90-197)||(31514600-31514707)
chr1 (102-231)||(183240-183369)
chr1 (102-231)||(1103741-1103870)
chr1 (102-231)||(13914087-13914216)
chr1 (86-187)||(17189173-17189274)
chr1 (102-231)||(30711607-30711736)
chr1 (90-231)||(33442601-33442742)
chr1 (102-219)||(47999142-47999259)
chr1 (102-231)||(49723006-49723135)
chr1 (90-231)||(52134317-52134458)
chr1 (86-210)||(12905958-12906082)
chr1 (86-210)||(31050953-31051077)
chr1 (86-210)||(35040913-35041037)
chr1 (102-210)||(35473650-35473758)
chr1 (102-210)||(37578211-37578319)
chr1 (86-210)||(49955646-49955770)
chr1 (105-197)||(1103481-1103575)
chr1 (102-197)||(13914381-13914476)
chr1 (102-197)||(25647903-25647998)
chr1 (102-197)||(35152362-35152457)
chr1 (90-197)||(52134075-52134182)
chr1 (107-220)||(4960800-4960913)
chr1 (102-231)||(7820973-7821102)
chr1 (104-197)||(26024444-26024537)
chr1 (102-231)||(43759102-43759231)
chr1 (102-197)||(23209641-23209736)
chr1 (102-197)||(14878990-14879085)
chr1 (102-197)||(19017943-19018038)
chr1 (104-231)||(32917540-32917667)
chr1 (102-197)||(34464763-34464858)
chr1 (102-197)||(40772526-40772621)
chr1 (102-229)||(48779401-48779528)
chr1 (90-231)||(4716475-4716616)
chr1 (102-231)||(24009821-24009950)
chr1 (90-231)||(31514325-31514466)
chr1 (102-231)||(40210389-40210518)
chr1 (102-210)||(17661871-17661978)
chr1 (101-197)||(17691237-17691333)
chr1 (102-194)||(37578509-37578601)
chr1 (104-196)||(41098754-41098846)
chr1 (102-210)||(41099034-41099142)
chr1 (102-197)||(17662164-17662259)
chr1 (102-197)||(34849030-34849125)
chr1 (102-197)||(34850379-34850474)
chr1 (102-197)||(42248492-42248587)
chr1 (102-197)||(47999406-47999501)
chr1 (102-196)||(17692500-17692594)
chr1 (86-224)||(28324808-28324945)
chr1 (86-192)||(30326499-30326605)
chr1 (86-224)||(31058342-31058480)
chr1 (86-200)||(32558416-32558530)
chr1 (86-224)||(45750127-45750265)
chr1 (116-197)||(183505-183586)
chr1 (102-231)||(1841739-1841867)
chr1 (86-203)||(8898520-8898637)
chr1 (109-194)||(46163056-46163141)
chr1 (86-210)||(8898816-8898940)
chr1 (102-210)||(24009594-24009702)
chr1 (102-210)||(36694301-36694409)
chr1 (102-194)||(36694565-36694657)
chr1 (102-210)||(36710402-36710510)
chr1 (102-194)||(36710666-36710758)
chr1 (105-197)||(40210684-40210776)
chr1 (102-197)||(30711346-30711441)
chr1 (86-224)||(7371293-7371431)
chr1 (117-194)||(1841493-1841570)
chr1 (121-194)||(4716754-4716826)
chr1 (102-231)||(32917279-32917408)
chr1 (105-197)||(4960562-4960654)
chr1 (101-197)||(5734028-5734123)
chr1 (86-210)||(45749845-45749969)
chr1 (118-197)||(5735025-5735104)
chr1 (102-197)||(19515838-19515933)
chr1 (106-197)||(46899084-46899175)
chr1 (105-231)||(7821234-7821359)
chr1 (102-231)||(19017648-19017777)
chr1 (108-197)||(32132329-32132418)
chr1 (86-210)||(28325103-28325226)
chr1 (86-197)||(44523450-44523561)
chr1 (121-195)||(32133239-32133313)
chr1 (109-202)||(48692323-48692416)
chr1 (102-158)||(35152683-35152739)
chr1 (86-149)||(7371529-7371592)
chr1 (174-229)||(14879253-14879308)
chr1 (174-229)||(35152625-35152680)
chr1 (106-197)||(46899914-46900005)
chr1 (116-210)||(19322925-19323019)
chr1 (118-210)||(19323193-19323285)
chr1 (86-142)||(25885360-25885416)
chr1 (102-158)||(40772812-40772868)
chr1 (102-158)||(42533043-42533099)
[»] chr2 (72 HSPs)
chr2 (86-197)||(14900766-14900875)
chr2 (90-231)||(1695747-1695888)
chr2 (102-231)||(6658127-6658256)
chr2 (90-197)||(33739710-33739817)
chr2 (102-197)||(44714075-44714170)
chr2 (90-231)||(13995680-13995821)
chr2 (90-231)||(41248566-41248707)
chr2 (86-210)||(15604342-15604466)
chr2 (86-210)||(15604638-15604762)
chr2 (86-210)||(28226043-28226167)
chr2 (90-197)||(13995956-13996063)
chr2 (90-197)||(33062333-33062440)
chr2 (90-231)||(33062057-33062198)
chr2 (90-231)||(33739952-33740093)
chr2 (86-194)||(11830367-11830475)
chr2 (102-210)||(13692521-13692629)
chr2 (102-210)||(36755389-36755497)
chr2 (90-197)||(1696023-1696130)
chr2 (102-197)||(15848107-15848202)
chr2 (90-197)||(41248842-41248949)
chr2 (86-224)||(8710753-8710891)
chr2 (102-231)||(10713003-10713132)
chr2 (102-231)||(16099304-16099433)
chr2 (102-231)||(37895366-37895495)
chr2 (86-210)||(8342190-8342314)
chr2 (102-197)||(11163337-11163432)
chr2 (102-197)||(39498329-39498424)
chr2 (105-231)||(11163076-11163202)
chr2 (86-159)||(14900499-14900572)
chr2 (86-210)||(41588357-41588481)
chr2 (106-197)||(25230125-25230216)
chr2 (102-229)||(36480000-36480127)
chr2 (102-197)||(45556131-45556226)
chr2 (104-194)||(22051310-22051400)
chr2 (102-220)||(36382418-36382536)
chr2 (104-197)||(16099076-16099169)
chr2 (102-231)||(34448075-34448204)
chr2 (102-202)||(6588702-6588802)
chr2 (102-197)||(6657897-6657992)
chr2 (102-197)||(36382180-36382275)
chr2 (102-229)||(39423797-39423924)
chr2 (106-197)||(44045316-44045407)
chr2 (106-228)||(25231131-25231253)
chr2 (102-228)||(39498562-39498688)
chr2 (102-220)||(44713814-44713932)
chr2 (92-197)||(202670-202775)
chr2 (102-231)||(15848368-15848497)
chr2 (102-197)||(2318178-2318272)
chr2 (86-197)||(6573050-6573160)
chr2 (102-197)||(37895661-37895756)
chr2 (102-197)||(39423534-39423629)
chr2 (105-195)||(36479740-36479830)
chr2 (104-229)||(9076349-9076474)
chr2 (109-194)||(36755119-36755204)
chr2 (86-197)||(6573546-6573657)
chr2 (86-210)||(8342478-8342602)
chr2 (102-202)||(30729640-30729740)
chr2 (102-210)||(45556348-45556456)
chr2 (102-197)||(10712742-10712837)
chr2 (102-195)||(3555269-3555362)
chr2 (102-191)||(3556329-3556418)
chr2 (121-197)||(25892432-25892508)
chr2 (92-224)||(39936534-39936665)
chr2 (86-210)||(41587238-41587361)
chr2 (116-193)||(28230057-28230134)
chr2 (104-191)||(6307038-6307125)
chr2 (92-191)||(6589679-6589778)
chr2 (102-197)||(21370516-21370611)
chr2 (106-197)||(44044137-44044228)
chr2 (92-190)||(28228679-28228777)
chr2 (116-197)||(3653394-3653474)
chr2 (177-229)||(22051088-22051140)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (90-231)||(141601-141742)
scaffold0024 (90-197)||(141877-141984)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (86-210)||(2396-2520)
[»] scaffold0559 (2 HSPs)
scaffold0559 (90-197)||(1240-1347)
scaffold0559 (124-231)||(1482-1590)
[»] scaffold0388 (2 HSPs)
scaffold0388 (86-224)||(12524-12662)
scaffold0388 (138-194)||(12295-12351)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (86-224)||(12065-12203)
[»] scaffold0707 (1 HSPs)
scaffold0707 (102-203)||(6387-6488)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (102-219)||(69257-69374)
scaffold0031 (102-197)||(68984-69079)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (86-210)||(923-1047)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (102-197)||(139691-139786)
scaffold0020 (102-231)||(139921-140050)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (86-210)||(222088-222212)
scaffold0006 (86-201)||(221794-221908)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (102-197)||(1788-1883)
scaffold0007 (102-203)||(2049-2150)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (102-233)||(37583-37714)
scaffold0005 (102-197)||(37877-37972)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (86-224)||(11425-11563)
scaffold0328 (86-210)||(11143-11267)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (92-223)||(239839-239970)
[»] scaffold0775 (2 HSPs)
scaffold0775 (108-202)||(4987-5081)
scaffold0775 (102-224)||(6265-6387)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (101-193)||(19875-19967)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (102-161)||(14740-14799)
scaffold0075 (105-231)||(14451-14577)
[»] scaffold0295 (1 HSPs)
scaffold0295 (163-231)||(2423-2491)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 109 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 32431594 - 32431186
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagctta 208  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32431594 aattaggggtcatttaaaaattggtccctgcaatcgttaatcctgacaaattagccttgcaaagtttaaccatttaaaatttcgtcccttgacccgctta 32431495  T
Q  209 ataattgccacatcattaatttgtgtaaatttagtcattttaaattattatcgtattttgatgtaaatttctaatagtttaatcattttaaattattatc 308  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431494 atgattgccacgtcattaatttgtgtaaatttggtcattttaaattattatcgtattttgatgtaaatttctaatagtttaatcattttaaattattatc 32431395  T
Q  309 gaattttgatgtaaatttgtgtatgagagtattatttctatcatatataatttcatattcaaatatgataccagcccttaattaaagagttgttggaatt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431394 gaattttgatgtaaatttgtgtatcagagtattatttctatcatatgtaatttcacattccaatatgataccagcccttaattaaagagttgttggaatt 32431295  T
Q  409 tacagctaggaggcccttcatgggatgtaggattgggaagaagggactcaatcacagctagtaggtctgatgccaataactcaattcctgcacccttttt 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431294 tacagctaggaggcccttcatgggatgtaggcttgggaagaagggactcaatcacagctagtaggtctgatgccaataactcaattcctgcacccttttt 32431195  T
Q  509 caatctaag 517  Q
    |||||||||    
T  32431194 caatctaag 32431186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 10770493 - 10770638
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10770493 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 10770592  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  10770593 aatttggtccttggaccaacttaatcactgccacatcactaatttg 10770638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 36314301 - 36314446
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36314301 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 36314400  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  36314401 aatttggtccttggaccaacttaatcactgccacgtcactaatttg 36314446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 48322380 - 48322525
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48322380 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagacatcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 48322479  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  48322480 aatttggtccttggaccaacttaatcactgccacgtcactaatttg 48322525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 397 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 32424218 - 32424098
Alignment:
Q  397 gttgttggaatttacagctaggaggcccttcatgggatgtaggattgggaagaagggactcaatcacagctagtaggtctgatgccaataactcaattcc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32424218 gttgttggaatttacagctaggaggcccttcatggaatgtaggcttgggaagaagggattcaatcacagctagtagatctgatgccaataactcaattcc 32424119  T
Q  497 tgcaccctttttcaatctaag 517  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  32424118 tgcaccatttctcaatctaag 32424098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36314692 - 36314581
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36314692 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgttaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 36314593  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  36314592 aatttcgtccct 36314581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48322771 - 48322660
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48322771 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgttaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 48322672  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  48322671 aatttcgtccct 48322660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10770885 - 10770774
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10770885 ttaatgatgtgattagtccttacaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgttaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 10770786  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  10770785 aatttcgtccct 10770774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37778696 - 37778558
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  37778696 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaattgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 37778597  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  37778596 aatttcatcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 37778558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 47551496 - 47551634
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  47551496 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagatgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatactggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 47551595  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  47551596 aatttcatcctttgaccaacttaatcactgccacatcat 47551634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Original strand, 8041623 - 8041730
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  8041623 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 8041722  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  8041723 tcgtccct 8041730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 11910702 - 11910826
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  11910702 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacgtcatttaaaaattaatccctgtaatcgctaatcctagcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 11910801  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  11910802 aatttcgtcctttgaccaacttaat 11910826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52032562 - 52032438
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || |  ||||||||||||    
T  52032562 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatatacccttgcattgtttaatcatttaa 52032463  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  52032462 aatttcttcctttgaccaacttaat 52032438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Original strand, 54466430 - 54466537
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  54466430 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgttaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 54466529  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  54466530 tcgtccct 54466537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40788843 - 40788705
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || |  |||||| |||||    
T  40788843 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttactcttgcattgtttaatcttttaa 40788744  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  40788743 aatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 40788705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 231
Target Start/End: Original strand, 19740946 - 19741071
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagc 205  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||      
T  19740946 tgcaattagggatcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaat 19741045  T
Q  206 ttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  19741046 ttaatcattgccacgtcactaatttg 19741071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 23457998 - 23458127
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23457998 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaataattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 23458097  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  23458098 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 23458127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29118960 - 29118823
Alignment:
Q  87 taatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaa 186  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | || || |  |||||||||||||    
T  29118960 taatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtcactgtaatcgctaatcctggcaatttaccattgcattgtttaatcatttaaa 29118861  T
Q  187 atttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  29118860 atttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 29118823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 2796198 - 2796293
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  2796198 tccttgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 2796293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9294367 - 9294272
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  9294367 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctataatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 9294272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32306848 - 32306723
Alignment:
Q  85 attaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcattta 184  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||    
T  32306848 attaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtcaatgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcattta 32306749  T
Q  185 aaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  32306748 aaatttcgtcatttgaccaacttaat 32306723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54466813 - 54466672
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  54466813 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattggtaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 54466714  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  54466713 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 54466672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 3469203 - 3469327
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  3469203 ttaatgatgtgtttcgtctttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtaatcactaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 3469302  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  3469303 aatttcgtcctttgaccaacttaat 3469327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3469623 - 3469499
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  3469623 ttaatgatctgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagttcctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 3469524  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||    
T  3469523 aattccgtcctttgaccaacttaat 3469499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 10294570 - 10294694
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  | |  ||||||||||||    
T  10294570 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaattgctaatcatgacaatttacccttgtattgtttaatcatttaa 10294669  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| || |||| ||||||    
T  10294670 aatttcgtcctttaaccaacttaat 10294694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 13948783 - 13948907
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||   || |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  13948783 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcatcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 13948882  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  13948883 aatttcgtcctttgaccaacttaat 13948907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 52032141 - 52032265
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  52032141 ttaatgatgtgttttgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattaatccttgtaatcgctaatcctagcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 52032240  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  52032241 aatttcgtcctttgaccaacttaat 52032265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Original strand, 35643869 - 35643992
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttga 200  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35643869 gtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccgtgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcctttga 35643968  T
Q  201 ccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    | | |||||| | |||||| ||||    
T  35643969 caaacttaatcactgccacgtcat 35643992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 42342810 - 42342905
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  42342810 tccttacaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtaattgctagtcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 42342905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 29685944 - 29686082
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  29685944 ttaatgatgtatttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctgacaatttatccttgcattgtttaatcatttaa 29686043  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||| | ||||||| ||| || | |||||| ||||    
T  29686044 aatttcgttctttgaccaacttgatcactgccacgtcat 29686082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8042006 - 8041901
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  8042006 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaatattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 8041907  T
Q  190 tcgtcc 195  Q
    | ||||    
T  8041906 tggtcc 8041901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23458388 - 23458259
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||   |    
T  23458388 tccttgcaattatgggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatccttgcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccctctcc 23458289  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |  |||||| | |||||||||| |||||||    
T  23458288 ccacttaatcactgccacatcactaatttg 23458259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33506373 - 33506256
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||    
T  33506373 ttaatgatgtgtttcgtcctttcaattaggcgttatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttactcttacattgtttaatcatttaa 33506274  T
Q  186 aatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  33506273 aattttgtcctttgacca 33506256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19741301 - 19741209
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  | |  |||||||||||||||||||||    
T  19741301 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcttggcaatttacccttgtattgtttaatcatttaaaatttcgtc 19741209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 32306427 - 32306551
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| || | |||||| ||||||| || ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  32306427 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagttcatgtaatcgctaatcttgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 32306526  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  32306527 aatttcgtcctttgaccaacttaat 32306551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33689785 - 33689693
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  33689785 ttgcaattaggggtcgtttaaaaattggttcatgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattatttaatcatttaaaatttcgtccct 33689693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 36417707 - 36417815
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36417707 tccttgtaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 36417806  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
     | ||||||    
T  36417807 aaacttaat 36417815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9368711 - 9368588
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||| |||  |||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |    
T  9368711 gtccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcattaatccttgcaaattactcttacattgtttaatcatttaaaatttcgttccttaa 9368612  T
Q  201 ccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    ||  |||||| |||||||| ||||    
T  9368611 cccacttaatgattgccacgtcat 9368588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36418097 - 36417970
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36418097 tccttgtaattaggggtcgtttaaaaattggttcctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 36417998  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
     | |||||| | |||||| ||| |||||    
T  36417997 aaacttaatcactgccacgtcactaatt 36417970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40033865 - 40033770
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  40033865 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtttctataattgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 40033770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10307763 - 10307674
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10307763 tttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaat 10307674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1079626 - 1079530
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 202  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||   |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1079626 tgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggcaaattagccttgcaaagtttaatcttttaaaatttcgtcccatgacc 1079530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4323607 - 4323519
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||| ||||||    
T  4323607 tgcaattaggcgtcgtttaaaaattcgtccctgtaatcgctaatcctggcaaattaaccttgcattgtttaatcatttaaaaattcgtc 4323519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10294982 - 10294858
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||  |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  10294982 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaatcagacgtaatttaaaaattagttcctgtaatcgctaatcctcgcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 10294883  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||    
T  10294882 aatttcgttttttgaccaacttaat 10294858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 41421975 - 41422099
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||  ||||||||| || |||||||| | ||||| || ||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  41421975 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcagttaaaaattagttcctgtaatcgttaatcttgacaatttacccttacattgtttaatcatttaa 41422074  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  41422075 aatttcgtcatttgaccaacttaat 41422099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23276388 - 23276297
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  23276388 tgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcccggcaaattacccctacaaacgttaatcatttaaaattttgtccct 23276297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33156419 - 33156308
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| | ||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  33156419 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtcattgtaatcgttaatcttggcaatttaccctttcattgtttaatcatttaa 33156320  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  33156319 aatttcgtccct 33156308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 51994295 - 51994200
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  51994295 tccttgcaattagggatcgtttaaaaattggtccttgtaatcgctaattctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 51994200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21186114 - 21186004
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||| || | |||||| | |||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||    
T  21186114 atgtgttttgtccatgcaattaggggtcatttaaaaattggtacatgtaatcgttaatcctggcaaattacccttgcaaaccttaatcatttaaaatttc 21186015  T
Q  192 gtcccttgacc 202  Q
    |||||||||||    
T  21186014 gtcccttgacc 21186004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40758519 - 40758401
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40758519 tccttgcaattaggggtcatttaaaaattggtctatgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 40758420  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
    || |||||| | |||||||    
T  40758419 caacttaatcactgccaca 40758401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 53757130 - 53757024
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  53757130 cttgcaattagaagtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactaaccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttaacca 53757031  T
Q  204 gcttaat 210  Q
     ||||||    
T  53757030 acttaat 53757024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 197
Target Start/End: Original strand, 9367766 - 9367855
Alignment:
Q  108 caattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9367766 caattaggggtcgtttaaaaaatggtctctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaattattaatcatttaaaatttcgtccct 9367855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Original strand, 47921473 - 47921578
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  47921473 tgatgtgtttaacccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgttaatcttggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 47921572  T
Q  190 tcgtcc 195  Q
    | ||||    
T  47921573 tggtcc 47921578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 3596112 - 3596236
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||| | || || |  ||||||||||||    
T  3596112 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtgatttaaaaattagtcaatgtaatcgctaatcctgacaatttacctttgcattatttaatcatttaa 3596211  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||    
T  3596212 aatttcgttctttgaccaacttaat 3596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 26463651 - 26463759
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||| | | ||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26463651 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattgatccttgtattcggtaatccttgcaaattagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 26463750  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  26463751 caacttaat 26463759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29686363 - 29686239
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  29686363 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcattttaaaattagtcattgtaatcactaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 29686264  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    ||||| |||  ||||||| ||||||    
T  29686263 aattttgtcatttgaccaacttaat 29686239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 197
Target Start/End: Original strand, 46474837 - 46474929
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| | || || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  46474837 ttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcttggcaatttaccattgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 46474929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 25107236 - 25107327
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| ||  || | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25107236 tgcaattaggggtcatttaaaaattggtctctctaatcgctaatcctggcaaattgcccctgcaaatgttaatcatttaaaatttcgtccct 25107327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Original strand, 33689401 - 33689527
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | |||||| || ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33689401 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtca-tgtattcgctaattcttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaattttgtcctttgac 33689499  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  33689500 caacttaatcactgccacgtcactaatt 33689527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42855730 - 42855615
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| || |  ||||||||||||    
T  42855730 ttaatgatgtgtttagcccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcattctttaatcatttaa 42855631  T
Q  186 aatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| ||| |||||    
T  42855630 aatttcatcctttgac 42855615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46475189 - 46475063
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  | | |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  46475189 tccttacaattaggggtcgtttaaaaattgatac-tgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 46475091  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  46475090 caacttaatcactgccacgtcactaatt 46475063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42343140 - 42343022
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||| | |||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42343140 tccttgtaattaagggtcgtttaaaaattgatccatgtattcgctaatctttgcaaattagtcttgcaatgattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 42343041  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
    || |||||| | |||||||    
T  42343040 caacttaatcagtgccaca 42343022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25108500 - 25108411
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |  || | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  25108500 tgcaattaggggtcatttaaaatttggtccctgtaattgctaatcctggcaaactgtccctgcaaacgttaatcatttaaaatttcgtcc 25108411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41558287 - 41558198
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||| |||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41558287 tgcaattaggggtcgtttaaaaattaatccatgtattcgctaatccttgcaaattagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcc 41558198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 194
Target Start/End: Original strand, 43384321 - 43384394
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  43384321 tttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 43384394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 29118530 - 29118665
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttaca----------attgtt 175  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||          ||||||    
T  29118530 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattatgcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaattctggcaatttacccttgcattgtccttgcattgtt 29118629  T
Q  176 -aatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29118630 taatcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaat 29118665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 40758166 - 40758258
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||| ||   || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  40758166 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaatcct-gcaatttaccc--gcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 40758258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 4322615 - 4322705
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |  |||||||||||||| |||||||||    
T  4322615 tgcaattaggcgtcgtttaaaaattcgtcc-tgtaatcgctaatcctgacaaattaaccttgcattgtttaatcatttaaaaattcgtccct 4322705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43384692 - 43384565
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||| || || | | ||||||| ||||  ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43384692 tccttgcaattaggaatcgtttaaaaatttgtctctatattcgttaatccttgcaaactagccttgcaatcattagtcatttaaaatttcgtcctttgac 43384593  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  43384592 caacttaatcactgccacgtcactaatt 43384565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 194
Target Start/End: Original strand, 41558029 - 41558119
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || | |||| | ||||||||| |||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41558029 cttgcaattatgggtcgtttaaaaattggtacttgtattcgctaatccttgcacattaaccttgcaattattaatcatttaaaatttcgtc 41558119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Original strand, 3849054 - 3849143
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||  ||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3849054 tgcaattaggagtcgtttaaaaattggtccctgtattcgttaatccttgcaaactagccctgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcc 3849143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 197
Target Start/End: Original strand, 6956257 - 6956362
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| ||||||||| | || |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||| |||| |||   | ||||||||||||||||    
T  6956257 atgtgtttcgtccctgcaattagggatcatttaaaaattagtccctataatcgttaatcctggcaaattacccttgcaaacttaaatcatttaaaatttc 6956356  T
Q  192 gtccct 197  Q
    ||||||    
T  6956357 gtccct 6956362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40506197 - 40506104
Alignment:
Q  102 tccttgcaatta-gaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| || || |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  40506197 tccttgcaattatggggtcatttaaaagttggttcctgtaatcgttaatcctgacaatttacccttacattatttaatcatttaaaatttcgtc 40506104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 210
Target Start/End: Original strand, 43998183 - 43998272
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  43998183 tttaaaaattagtccttgtaatcgttaattctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcatttgaccaacttaat 43998272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 152
Target Start/End: Original strand, 51993986 - 51994033
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcct 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  51993986 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatcct 51994033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34142627 - 34142587
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaat 142  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  34142627 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaat 34142587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 40788423 - 40788531
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||   ||  |||||||||| |||||| |||| |||||| ||| ||||||| | || || |  ||||||||||||    
T  40788423 ttaatgatgtgtttcttccttgcaattaagcgttatttaaaaattagtccctctaatcgctaattctgacaatttacctttgcattatttaatcatttaa 40788522  T
Q  186 aatttcgtc 194  Q
    |||||||||    
T  40788523 aatttcgtc 40788531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43608892 - 43608796
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | || ||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  43608892 gtccctgcaattagggatcatttaaaaattggtctctgtaatcgttaatcctcgtaaattaaccttgcaaagtttaatcatttaaaatttcgtccct 43608796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3850532 - 3850441
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| | ||  ||||  | ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3850532 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgataatccttggaaactagctctgcaatcattaatcgtttaaaatttcgtccct 3850441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 157
Target Start/End: Original strand, 33506181 - 33506252
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaa 157  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||| |||| |||||| |||||||    
T  33506181 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagttcctataatcgctaattctggcaa 33506252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 161
Target Start/End: Original strand, 36150546 - 36150605
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaattta 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||| |||||||| |||||||    
T  36150546 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttatatttgttaatcctgacaattta 36150605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8741348 - 8741314
Alignment:
Q  156 aatttagccttacaattgttaatcatttaaaattt 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8741348 aatttagccttgcaattgttaatcatttaaaattt 8741314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 166
Target Start/End: Original strand, 33154886 - 33154960
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagcctt 166  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||    
T  33154886 atgtgtttcgtccatgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctgacaaattatcctt 33154960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 210
Target Start/End: Original strand, 47856396 - 47856514
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| ||||||||   |||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||| |||  ||| |||   |||||||||||||||||     
T  47856396 atgtgtttcgtccctgcaattaagcgtcgtttaaaaattggtccttgtaatcgttaatcctgacaaattactcttgcaaagtttaatcatttaaaatttt 47856495  T
Q  192 gtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||  ||||||| ||||||    
T  47856496 gtcatttgaccaacttaat 47856514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 53756766 - 53756856
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | | |||||| | ||||| | | |||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  53756766 ttgcaattaggggtcgtttaaaaattgattcatgtaatcgttaatcttagtaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcc 53756856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 55052370 - 55052427
Alignment:
Q  174 ttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  55052370 ttaatcatttaaaatttagtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcactaatttg 55052427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47857664 - 47857532
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| || ||||||  ||||||||||||||  ||  |||||| | |||| |||| || ||| |||| |||   ||||||||||||||||||    
T  47857664 atgtgtttcgtccctgtaattaggtgtcgtttaaaaattgatctttgtaatcgttaattctggtaaattatccttgcaaagtttaatcatttaaaatttc 47857565  T
Q  192 gtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  47857564 gtcatttgaccaacttaatcaatgccacgtcat 47857532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 103)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Original strand, 41930519 - 41930630
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41930519 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaatttgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 41930618  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  41930619 aatttcgtccct 41930630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6758259 - 6758148
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6758259 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgttaattctggcaatttaaccttgcaattgttaatcatttaa 6758160  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  6758159 aatttcgtccct 6758148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41930910 - 41930765
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41930910 ttaatgatgtgattagtccttgtaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatccttgcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 41930811  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | | |||| ||| |||||||    
T  41930810 aatttggtccttggaccaacttaatcactaccacgtcactaatttg 41930765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 231
Target Start/End: Original strand, 6757876 - 6758013
Alignment:
Q  94 gtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgt 193  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6757876 gtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaatttgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagtctcgcaattgttaatcatttaaaatttggt 6757975  T
Q  194 cccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || | ||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  6757976 ccttggaccaacttaatcactgccacgtcactaatttg 6758013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 3528892 - 3529021
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3528892 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtatttgctaatccttgcaaactagccttgcaatcgttaatcatttaaaatttagtcctttgac 3528991  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  3528992 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 3529021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 186828 - 186701
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  186828 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattggtccctgtatttgctaatctttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 186729  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| |||| ||| ||| |||||    
T  186728 caacttaatcattgtcacgtcactaatt 186701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 297404 - 297297
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  297404 tgatgtgtttagcccttgtaattaggcgacatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 297305  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  297304 tcgtccct 297297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Original strand, 1505974 - 1506081
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  1505974 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 1506073  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  1506074 tcgtccct 1506081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 13962883 - 13962978
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  13962883 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaattgctaatcctggtaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 13962978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Original strand, 14194442 - 14194569
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14194442 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 14194541  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||||||| |||||    
T  14194542 caacttaatcactgccacatcactaatt 14194569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31482792 - 31482685
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  31482792 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaatttgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 31482693  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  31482692 tcgtccct 31482685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 297021 - 297162
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  297021 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggtattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 297120  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||||||| |||||||    
T  297121 tggtccttggaccaaattaatcactgccacatcactaatttg 297162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1506357 - 1506216
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  1506357 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 1506258  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  1506257 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 1506216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11762126 - 11761997
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11762126 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 11762027  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  11762026 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 11761997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 31482409 - 31482550
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  31482409 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 31482508  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  31482509 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 31482550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 35512167 - 35512296
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||   |    
T  35512167 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccctctcc 35512266  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |  |||||| | |||||||||| |||||||    
T  35512267 ccacttaatcactgccacatcactaatttg 35512296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 33871342 - 33871466
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  33871342 ttaatgatgtgttttgtccttgcaattaagtgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaattctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 33871441  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  33871442 aatttcgtcctttgaccaacttaat 33871466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3529251 - 3529156
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  3529251 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggcaatttacccctacattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 3529156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 5993908 - 5994003
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  5993908 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaattctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 5994003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 39453319 - 39453414
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  39453319 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 39453414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13658132 - 13658070
Alignment:
Q  16 ccatgtcctcatctcctataaattaaacaagaacactcttataactcattttatttgaataaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13658132 ccatgtcctcatctcctataaattaaacaagaacactcgtataactcattttatttgaataaa 13658070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Original strand, 21265167 - 21265289
Alignment:
Q  107 gcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21265167 gcaattagaggtcgtttaaaaattggtccatgtatttgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaattatttaaaatttcgtcctttgaccaact 21265266  T
Q  207 taataattgccacatcattaatt 229  Q
    |||| | |||||| ||| |||||    
T  21265267 taatcactgccacgtcactaatt 21265289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 11761768 - 11761861
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||    
T  11761768 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcc 11761861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 28770888 - 28771017
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||  || |||||||||||||| |||  |||||    
T  28770888 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttacaatcattgatcatttaaaatttagtcatttgac 28770987  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  28770988 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 28771017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17544471 - 17544347
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  17544471 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagttcctgtaatcgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 17544372  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  17544371 aattttgtcctttgaccaacttaat 17544347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 229
Target Start/End: Original strand, 28269444 - 28269568
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  28269444 ttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtcccagtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaa 28269543  T
Q  205 cttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||    
T  28269544 cttaatcactgccacgtcactaatt 28269568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5256421 - 5256327
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccc 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5256421 gtccttgcaattag-ggtcgtttaaaaattggtcaatgtaatgactaatccttgcaaattagccttacatttgttaatcatttaaaatttcgtccc 5256327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24547534 - 24547439
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  24547534 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttataatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 24547439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 27587167 - 27587262
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||    ||||||||||||||||||||||||    
T  27587167 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccctgcatcgtttaatcatttaaaatttcgtccct 27587262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39453708 - 39453581
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39453708 tccttgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtattcgctaatctttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 39453609  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  39453608 caacttaatcactgccacgtcactaatt 39453581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 8875452 - 8875590
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| || |  ||||||||||||    
T  8875452 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaagcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgttaatcctggcaatttacacttgcattgtttaatcatttaa 8875551  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  8875552 aatttcgttctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 8875590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 24141461 - 24141571
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  24141461 atgtgtttcgtccctgcaattagacgtcatttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggcaaattagccttgcaaagtttaatcatttaaaatttc 24141560  T
Q  192 gtcccttgacc 202  Q
     ||||||||||    
T  24141561 atcccttgacc 24141571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35920588 - 35920498
Alignment:
Q  107 gcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  35920588 gcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctgacaatttatccttccattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 35920498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27587524 - 27587395
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27587524 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 27587425  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | ||| || ||| |||||||    
T  27587424 caacttaatcactgctacgtcactaatttg 27587395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8322813 - 8322705
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8322813 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccccgtattcgttaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 8322714  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  8322713 caacttaat 8322705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 20152784 - 20152908
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  20152784 ttaatgatgtgtttcgtccatgcaattaagcgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctggaaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 20152883  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  20152884 aatttcgtcctttgaccaacttaat 20152908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6150829 - 6150702
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| | ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6150829 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattagtccatgtattcgttaatctttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 6150730  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  6150729 caacttaatcactgccacgtcactaatt 6150702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17202808 - 17202681
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  17202808 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaatcggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcatttgac 17202709  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  17202708 caacttaatcactgccacgtcactaatt 17202681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 32242261 - 32242356
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32242261 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattgatccctgtaatagctaatcatggcaatttactcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 32242356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38475408 - 38475313
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  38475408 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtaatcgttaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 38475313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43159223 - 43159096
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | |||||||||  |||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43159223 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtcgttgtattcgctaatccttacaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 43159124  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  43159123 caacttaatcactgccacgtcactaatt 43159096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35512523 - 35512405
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  35512523 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgccaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcatttgac 35512424  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
     | |||||| | |||||||    
T  35512423 taacttaatcactgccaca 35512405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32242650 - 32242522
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32242650 tccttgcaattaggggttgtttaaaaattagtcc-tgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaattttgtcctttgac 32242552  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  32242551 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 32242522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19892717 - 19892625
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||  ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  19892717 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgttaatcctaacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 19892625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21288080 - 21287956
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||  | |||| || |  ||||||||||||    
T  21288080 ttaatgatgtgttttgtccttgtaattagacgtcgtttaaaaattaatccatgtaatcgctaatcatggcaatacacccttgcattgtttaatcatttaa 21287981  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  21287980 aatttcttcctttgaccaacttaat 21287956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33871761 - 33871637
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  33871761 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgccatttaaaaattagtctctgtaatcagtaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 33871662  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  33871661 aatttcgtcatttgaccaacttaat 33871637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 6150473 - 6150568
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||| |||||||| ||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6150473 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggttcatgtaatcactaatcctgacaatttagtcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 6150568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14194831 - 14194737
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  14194831 tccttgtaattaggggtcgtttaaaaattgg-ccatgtaattactaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 14194737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 193
Target Start/End: Original strand, 16082996 - 16083087
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgt 193  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  16082996 tccttccaattaggggttgtttaaaaattagtccctgtaatcgataatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgt 16083087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16157264 - 16157169
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16157264 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctataatcgttaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 16157169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20814544 - 20814449
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||| || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  20814544 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtcactgtaatcgctaatcctagcaatttacacttgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 20814449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6301949 - 6301823
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6301949 ttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtattcgttaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaa 6301850  T
Q  205 cttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
     ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  6301849 tttaatcactgccacgtcactaatttg 6301823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Original strand, 17202418 - 17202512
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccc 196  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||| ||||||||||||||||||    
T  17202418 tccttccaattaggggtcgtttaaaaattggtcactgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaagcatttaaaatttcgtccc 17202512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20153338 - 20153217
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||   |||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  20153338 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggtgtcatttaaaaattagtccttgtaatcgctaatc---gcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 20153242  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  20153241 aatttcatcctttgaccaacttaat 20153217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 5024038 - 5024167
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  | | |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||   |||||||||||||||| |||| |||||    
T  5024038 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattgatacatgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcactaatcatttaaaattttgtcctttgac 5024137  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  5024138 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 5024167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5024427 - 5024298
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||| | || || |  |||||||||||||||||||| |||   |    
T  5024427 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtcattgtaatcgctaatcctgacaatttaccattgcattgtttaatcatttaaaatttcgttcctctcc 5024328  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |  |||||| | |||||||||| |||||||    
T  5024327 ccacttaatcactgccacatcactaatttg 5024298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5994298 - 5994169
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| || | |||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  5994298 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggttcatgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 5994199  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||  ||| |||||||    
T  5994198 caacttaatcactgccatgtcactaatttg 5994169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13362634 - 13362549
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaattt 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||    
T  13362634 ttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtaatcgctaatcatggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaattt 13362549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Original strand, 16156876 - 16157001
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | | ||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16156876 cttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctatgtattcgttaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgacca 16156975  T
Q  204 gcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
     |||||| | |||||| ||| |||||    
T  16156976 acttaatcactgccacgtcactaatt 16157001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Original strand, 19892327 - 19892444
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||| ||||  |||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||     
T  19892327 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgttaatccttgcaaactagccttgtaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgat 19892426  T
Q  202 cagcttaataattgccac 219  Q
    || |||||| | ||||||    
T  19892427 caacttaatcactgccac 19892444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 22298564 - 22298669
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  22298564 ttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcggggcaatttacccttacattgtttaatcatttaaaatttcatcctttgaccaa 22298663  T
Q  205 cttaat 210  Q
    ||||||    
T  22298664 cttaat 22298669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Original strand, 35920254 - 35920355
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagctta 208  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35920254 aattagggatcgtttaaaaattggtcaatgtattcgctaatccttgcaaattagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaactta 35920353  T
Q  209 at 210  Q
    ||    
T  35920354 at 35920355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38442476 - 38442347
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||| | | ||||||| ||||  ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38442476 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaatgggttcttgtattcgttaatccttgcaaactagccttgcaatcattaaccatttaaaatttcgtcctttgac 38442377  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | || ||||||| |||||||    
T  38442376 caacttaatcactgtcacatcactaatttg 38442347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 18247105 - 18247198
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||||| |||| || |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  18247105 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaat--tggcaatttacccttgcattatttaatcatttagaatttcgtccct 18247198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 231
Target Start/End: Original strand, 38475057 - 38475181
Alignment:
Q  107 gcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagct 206  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  38475057 gcaattaaaggtcatttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactaaccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcatttgaccaact 38475156  T
Q  207 taataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |||| | |||||| ||| |||||||    
T  38475157 taatcactgccacgtcactaatttg 38475181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11047845 - 11047719
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||| |  |||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11047845 tccttgcaagtaggggtcgtttaaaaattggtca-tgtattcactaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 11047747  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  11047746 caacttaatcactgccacgtcactaatt 11047719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 18670221 - 18670311
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  18670221 tccttgcaagtaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatc---gcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcc 18670311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 20840552 - 20840647
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||| |||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20840552 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtacctgtaatcgttaatcctagcaatttacccttgcattgtttaatgatttaaaattttgtccct 20840647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28771247 - 28771152
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| || |  | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  28771247 tccttgtaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaatcttggcaatttacccctgtattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 28771152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Original strand, 29646381 - 29646508
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||| |||||    
T  29646381 tccttgtaattaggggtcttttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactagccttccaatcattaatcatttaaaattttatcctttgac 29646480  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  29646481 caacttaatcactgccacgtcactaatt 29646508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 5255040 - 5255144
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || | |||||| ||||||||| |||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||  |||||||     
T  5255040 ttgcaattagaggttgtttgaaaattggttcatgtaatcgctaatcct-gcaaattaaccttgcatttattaatcatttaaaatttcgtcatttgaccaa 5255138  T
Q  205 cttaat 210  Q
    ||||||    
T  5255139 cttaat 5255144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 210
Target Start/End: Original strand, 17544086 - 17544175
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || |  ||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  17544086 tttaaaaattagtccctgtaattgctaatcctgacaatttactcttgcattgtttaatcatttaaaattttgtcatttgaccaacttaat 17544175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19518016 - 19517887
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||| | ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  |||||    
T  19518016 tccttgcaattaggggtagtttaaaaattagtccatgtattcgctaatctttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaattttgtcttttgac 19517917  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||  ||| |||||||    
T  19517916 caacttaatcactgccatgtcactaatttg 19517887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Original strand, 37991222 - 37991311
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  37991222 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgttaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttcaaatttcgtcc 37991311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Original strand, 6301576 - 6301691
Alignment:
Q  116 ggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattg 215  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||    
T  6301576 ggtcgtttaaaaattggtccttgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaattatttaaaatttcgtcctttgaccaatttaatcactg 6301675  T
Q  216 ccacatcattaatttg 231  Q
    |||| ||| |||||||    
T  6301676 ccacgtcactaatttg 6301691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Original strand, 20814155 - 20814281
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| ||||  |||  || ||||  |||||||||||||||||||||| || ||    
T  20814155 tccttacaattagaggtcgtttaaaaattggtct-tgtattcgctaatccttgcaaactagtattgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttaac 20814253  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  20814254 caacttaatcactgccacgtcactaatt 20814281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Original strand, 186440 - 186533
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||||| | |||| |||| |||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  186440 cttgaaattaggggtcgtttaaaaattagtcattgtaatcgttaattctggaaatttaaccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 186533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8875687 - 8875618
Alignment:
Q  89 atgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaat 158  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  8875687 atgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgttaatcctggcaat 8875618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 11740706 - 11740835
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | || | ||||||||| ||||  ||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11740706 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattgatccatatattcgctaatccttgcaaactagccttgcattctttaatcatttaaaattttgtcctttgac 11740805  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |   ||||| | || ||| |||||||||||    
T  11740806 ccagttaatgactgtcacgtcattaatttg 11740835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 166
Target Start/End: Original strand, 24547196 - 24547260
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagcctt 166  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  24547196 tccttgcaattaggggtcgttaaaaaattggtccctgtaatcgctaatccttgcaaactagcctt 24547260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 197
Target Start/End: Original strand, 38442090 - 38442182
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||  ||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  38442090 ttgcaattaggggttatttaaaaattggtcattgtaatcgctaatcctgacaatttactcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 38442182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 42063292 - 42063368
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||  || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42063292 tttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcctggcaaattgcccctgcaaatgttaatcatttaaaattttgtccct 42063368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29646770 - 29646676
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| || || | |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  29646770 tccttgtaattaggagtcgtttaaaa-ttggtgcatgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 29646676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 42265758 - 42265841
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| || |  ||||| ||||||||||    
T  42265758 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcattctttaatgatttaaaatt 42265841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13963238 - 13963120
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| |||  |||| | | ||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||    
T  13963238 tccttgtaattatgggtcgtttaaaaattggtctatgtattcgttaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgttctttgac 13963139  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
    || |||||| | |||||||    
T  13963138 caacttaatcactgccaca 13963120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20840846 - 20840760
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaat 188  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  20840846 tccttacaattaggggtcgtttaaaaattggtaactgtaatcgctaatcctagcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaat 20840760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Original strand, 13362290 - 13362375
Alignment:
Q  146 taatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  13362290 taatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctctgaccaacttaatcactgccacgtcactaatttg 13362375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21265551 - 21265458
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaa-tttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||| |||| || |  ||||| |||||||||||||||    
T  21265551 tccttacaattaagggtcgtttaaaaattggttcctgtaatcgctaatcgtggcaattttacccttgcattgtttaattatttaaaatttcgtc 21265458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 42067929 - 42067840
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |  || | |||   ||||||||||||||||||||||    
T  42067929 tgcaattaggggtcatttaaaatttggtccctgtaattgataatcctggcaaactgcccctgcaaactttaatcatttaaaatttcgtcc 42067840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 194
Target Start/End: Original strand, 11047458 - 11047548
Alignment:
Q  103 ccttgcaattagaggtc-gtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  11047458 ccttgcaattaggagtcagtttaaaaatt-gtccc-gtaatcgctaatcttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 11047548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11741926 - 11741826
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||  ||| ||||| | ||||||| | ||||  ||||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11741926 tccttgtaattaggggtcatttaaaaatcggtctctgtattcgctaatctttgcaaactagccttgcattctttaatcatttaaaatttcgtcctttgac 11741827  T
Q  202 c 202  Q
    |    
T  11741826 c 11741826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21257566 - 21257478
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||| ||||  ||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||    
T  21257566 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggacactgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcgatcattaatcatttaaaaattcgtc 21257478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5835835 - 5835748
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  5835835 tccttgcaattaggagttgtttaaaaattggtttctgtattcgctaatccttgcaaattagccttgcaacatttaatcatttaaaatt 5835748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37992693 - 37992602
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   || || || ||||||||| | ||||  ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  37992693 tgcaattaggggtcgtttaaaaatcgatctctctatttgctaatctttgcaaactagccttgcaatcattaatcgtttaaaatttcgtccct 37992602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3656841 - 3656743
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcattta 184  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||| |||||| |||  |||||| |||| || |  |||||||||||    
T  3656841 ttaatgatgtgtttcgaccttgcaattagacgtcatttaaaaattagtctttgtaatcgctaattctgataatttatccttgcattgtttaatcattta 3656743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Original strand, 21287797 - 21287887
Alignment:
Q  137 tgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaa 227  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||  | |  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | | |||| |||||||    
T  21287797 tgtaatcgctaattctggcaatttacccttgtattgtttaatcatttaaaatttcgtcatttgaccaacttaatcactaccacgtcattaa 21287887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 210
Target Start/End: Original strand, 27937114 - 27937180
Alignment:
Q  144 gctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  27937114 gctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcatttgaccaacttaat 27937180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40150233 - 40150095
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||| | || ||| |||| |||   |||||||||||| | ||     
T  40150233 atgtgtttcgtccttgcaattaggggtcattttaaaattggtccctgtaatcgttaatcctagaaaattaccctttcaaagtttaatcatttaagaattg 40150134  T
Q  192 gtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaattt 230  Q
    ||||||  |||   ||||| | |||||||||| ||||||    
T  40150133 gtccctcaacctaattaatcactgccacatcactaattt 40150095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16083352 - 16083223
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| || | | || | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||   |||||    
T  16083352 tccttgcaattaaggatcgtttaaaaattggttcatatattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgttatttgac 16083253  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||  ||| |||||||    
T  16083252 caacttaatcactgccatgtcactaatttg 16083223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18247485 - 18247404
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcattt 183  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||||||||    
T  18247485 tccttgcaattaggggtcgtttaaaatttggtctctgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcattt 18247404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 185
Target Start/End: Original strand, 40148907 - 40149000
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| | ||||||| |||| ||| |||| |||   ||||||||||||    
T  40148907 atgtgtttcgtccctgcaattagagctcatttaaaaattggtccatgtaatcgttaatcctagcaaattaccctttcaaagtttaatcatttaa 40149000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 197
Target Start/End: Original strand, 8322466 - 8322518
Alignment:
Q  145 ctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  8322466 ctaatcttggcaatttatccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 8322518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28269762 - 28269702
Alignment:
Q  137 tgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  28269762 tgtaattgctaatcataacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 28269702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 136)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9400913 - 9400802
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9400913 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 9400814  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||    
T  9400813 aatttcatccct 9400802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Original strand, 27934535 - 27934646
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27934535 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggggtcgtttaaaaatttgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 27934634  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  27934635 aatttcgtccct 27934646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 9400522 - 9400667
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9400522 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggtgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 9400621  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | || ||| ||| |||||||    
T  9400622 aatttggtccttggaccaacttaatcactgtcacgtcactaatttg 9400667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33247667 - 33247556
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33247667 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagggatcgtttaaaaatccgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 33247568  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||    
T  33247567 aatttcatccct 33247556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 4982729 - 4982874
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4982729 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagacgtaatttaaaaattcgtccatgtaattgctaatcttggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 4982828  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | |||| | ||| |||||||    
T  4982829 aatttggtccttggaccaacttaatcactgcctcgtcactaatttg 4982874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4983120 - 4983009
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4983120 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcgtttaaaaattcatccttgtaattgctaatcctcgcaatttagccttgcaattattaatcatttaa 4983021  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  4983020 aatttcgtccct 4983009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 197
Target Start/End: Original strand, 22566810 - 22566913
Alignment:
Q  94 gtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgt 193  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22566810 gtgattagtccttgtaattagggatcgtttaaaaattcgttcctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaaaatttcat 22566909  T
Q  194 ccct 197  Q
    ||||    
T  22566910 ccct 22566913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 231
Target Start/End: Original strand, 33247287 - 33247421
Alignment:
Q  96 gattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33247287 gattaatccttgcaattaggtgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcattt-aaatttggtcc 33247385  T
Q  196 cttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
     | ||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  33247386 ttggaccaacttaatcactgccacgtcactaatttg 33247421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10408312 - 10408174
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  10408312 ttaatgttgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 10408213  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  10408212 aatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacatcat 10408174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42738421 - 42738314
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  42738421 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 42738322  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  42738321 tcgtccct 42738314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 54858563 - 54858701
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  54858563 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 54858662  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  54858663 aatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 54858701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 9144773 - 9144914
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  9144773 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 9144872  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  9144873 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 9144914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27069333 - 27069216
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  27069333 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaattgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 27069234  T
Q  186 aatttcgtcccttgacca 203  Q
    |||||||||  |||||||    
T  27069233 aatttcgtcttttgacca 27069216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32950532 - 32950391
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  32950532 tgatgtgtttagcccttgcaattaggtggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 32950433  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||||||| |||||||    
T  32950432 tggtccttggaccaaattaatcactgccacatcactaatttg 32950391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38012560 - 38012419
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  38012560 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 38012461  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| |||||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  38012460 tggtcctttgaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 38012419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46661323 - 46661194
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  46661323 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtatttactaatcctcgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 46661224  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  46661223 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 46661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Original strand, 49879226 - 49879327
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  49879226 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaattgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 49879325  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  49879326 ca 49879327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9145156 - 9145049
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  9145156 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaatgcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 9145057  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  9145056 tcgtccct 9145049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44967447 - 44967352
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44967447 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 44967352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 27068913 - 27069051
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  27068913 ttaaggatgtgtttcgtccttgcaattaggcatcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 27069012  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  27069013 aatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 27069051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 52573231 - 52573369
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||    
T  52573231 ttaatgatgtgtttcgtctttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtacctgtaatcgctaatcctggcaatttactcttacattgtttaatcatttaa 52573330  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  52573331 aatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 52573369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27149418 - 27149302
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  27149418 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaa-ttagtccctgtaattgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 27149320  T
Q  186 aatttcgtcccttgacca 203  Q
    |||||||||| |||||||    
T  27149319 aatttcgtcctttgacca 27149302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 34837081 - 34837222
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  34837081 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 34837180  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  34837181 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 34837222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37248614 - 37248485
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37248614 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcattttaaatttcgtcctttgac 37248515  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||  ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  37248514 caatttaatcattgccacgtcactaatttg 37248485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 42738038 - 42738179
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  42738038 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgttaatcctggcattttaaccttgcaattgttaatcgtttaaaatt 42738137  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  42738138 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 42738179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 50418687 - 50418816
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50418687 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 50418786  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  50418787 caatttaatcactgccacgtcactaatttg 50418816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 3032585 - 3032709
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  3032585 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccttgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 3032684  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  3032685 aatttcgtcatttgaccaacttaat 3032709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 194
Target Start/End: Original strand, 32950149 - 32950253
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  32950149 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtcccagtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 32950248  T
Q  190 tcgtc 194  Q
    |||||    
T  32950249 tcgtc 32950253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 45463076 - 45463200
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  45463076 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 45463175  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  45463176 aatttcgtcatttgaccaacttaat 45463200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51692928 - 51692820
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  51692928 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 51692829  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  51692828 caacttaat 51692820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54858983 - 54858859
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  54858983 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 54858884  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  54858883 aatttcgtcctttgaccaacttaat 54858859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 24711130 - 24711225
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  24711130 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttaccgttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 24711225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34837464 - 34837357
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  34837464 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtctctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 34837365  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  34837364 tcgtccct 34837357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 194
Target Start/End: Original strand, 37248256 - 37248347
Alignment:
Q  103 ccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  37248256 ccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 37248347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7452212 - 7452083
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7452212 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 7452113  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  7452112 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 7452083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13058391 - 13058262
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13058391 tccttgcaataaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 13058292  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  13058291 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 13058262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22567180 - 22567107
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22567180 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatccttgcaatt 22567107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 43155548 - 43155677
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||||    
T  43155548 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcgttaatcatttaaaatttagtcatttgac 43155647  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  43155648 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 43155677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Original strand, 51203616 - 51203721
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  51203616 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 51203715  T
Q  190 tcgtcc 195  Q
    | ||||    
T  51203716 tggtcc 51203721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 10407892 - 10408016
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  10407892 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggagtcatttaaaaattactccctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 10407991  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  10407992 aatttcgtcctttgatcaacttaat 10408016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 27891587 - 27891711
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  27891587 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacattatttaaaaattagtccctgtaatcgctaattttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 27891686  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  27891687 aatttcgtcctttgaccaacttaat 27891711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 194
Target Start/End: Original strand, 38012177 - 38012281
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| | || ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  38012177 tgatgtgttcagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 38012276  T
Q  190 tcgtc 194  Q
    |||||    
T  38012277 tcgtc 38012281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45463496 - 45463372
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |  ||||||||||||    
T  45463496 ttaatgatatgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaattgctaatcctggcaatctacccttgcattgtttaatcatttaa 45463397  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    ||||| || | ||||||| ||||||    
T  45463396 aattttgttctttgaccaacttaat 45463372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 7451853 - 7451948
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  7451853 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 7451948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14802144 - 14802013
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||| || ||||  ||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14802144 tccttgcaattagagatcgtttaaaaattggtccttgtattcgctaattctagcaaactattcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 14802045  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttgtg 233  Q
    || |||||| | |||||||||| |||||||||    
T  14802044 caacttaatcactgccacatcactaatttgtg 14802013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 24349693 - 24349788
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24349693 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtccct 24349788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Original strand, 37976172 - 37976299
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||| | ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37976172 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaactggttcctgtattcgctaatctttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 37976271  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| |||||||| ||| |||||    
T  37976272 caacttaatcattgccacgtcactaatt 37976299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50419046 - 50418951
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  50419046 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctctaatcgctaatcctggcaatctacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 50418951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24350841 - 24350720
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||  |||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24350841 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgcattcgctaatccttgcaaactagctttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 24350742  T
Q  202 cagcttaataattgccacatca 223  Q
    | | ||||| | ||||||||||    
T  24350741 ccgattaatgactgccacatca 24350720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 35028017 - 35028146
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  35028017 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggttcctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcttttgac 35028116  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| |  ||||| ||| |||||||    
T  35028117 caacttaatcaccgccacgtcactaatttg 35028146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 44967088 - 44967217
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||  |||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44967088 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatccttacaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 44967187  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  44967188 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 44967217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 11523952 - 11524076
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| || |||| || |  ||||||||||||    
T  11523952 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgttaatcctggcaatatacccttgcattgtttaatcatttaa 11524051  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  11524052 aatttcgtcatttgaccaacttaat 11524076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Original strand, 18831368 - 18831460
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  18831368 tccttacaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggtaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 18831460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 22717942 - 22718066
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||| || |||| |  |  ||||||||||||    
T  22717942 ttaatgatgtgtttcgtccttacaattagacgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcctgacaatatacccttgctttgtttaatcatttaa 22718041  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  22718042 aatttcgtcctttgaccaacttaat 22718066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22987274 - 22987150
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||| || |||| |  |  ||||||||||||    
T  22987274 ttaatgatgtgtttcgtccttacaattagacgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcctgacaatatacccttgctttgtttaatcatttaa 22987175  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  22987174 aatttcgtcctttgaccaacttaat 22987150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27934907 - 27934839
Alignment:
Q  91 gatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27934907 gatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatccttgcaatt 27934839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 51859829 - 51859705
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||||    
T  51859829 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacgtaatttaaaaattagtctttgtaatcgctaatcctggcaatttatccttgtattgtttaatcatttaa 51859730  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  51859729 aatttcgtcctttgatcaacttaat 51859705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10781893 - 10781798
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10781893 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtccct 10781798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 13058056 - 13058151
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  13058056 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcctggtaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 13058151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 23613328 - 23613423
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23613328 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaatcttggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 23613423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34765789 - 34765694
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  34765789 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggttcatgtaatcgctaatcctggcaatttacctttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 34765694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1179206 - 1179088
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| || ||||     
T  1179206 ttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcctttaaccaa 1179107  T
Q  205 cttaataattgccacatca 223  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  1179106 cttaatcactgccacatca 1179088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Original strand, 10780732 - 10780853
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10780732 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgcattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcctttgac 10780831  T
Q  202 cagcttaataattgccacatca 223  Q
    | | ||||| | ||||||||||    
T  10780832 ccgattaatgactgccacatca 10780853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Original strand, 10974341 - 10974462
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10974341 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgcattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcctttgac 10974440  T
Q  202 cagcttaataattgccacatca 223  Q
    | | ||||| | ||||||||||    
T  10974441 ccgattaatgactgccacatca 10974462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24711489 - 24711360
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || | ||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  24711489 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtcatcgttaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcatttgac 24711390  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  24711389 caatttaatcactgccacgtcactaatttg 24711360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39539327 - 39539198
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||  |||||| | |||| || |||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39539327 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtcaatgtaatcgttaattcttgcaaattagccttgcattctttaatcatttaaaatttcgtcctttgac 39539228  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |   ||||| | ||||||||||||||||||    
T  39539227 ccagttaatgactgccacatcattaatttg 39539198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5818198 - 5818074
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||| ||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  5818198 ttaatgatgtgtttcgtctttgtaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgttaatcctgtcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 5818099  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  5818098 aatttcatcctttgaccaacttaat 5818074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6237233 - 6237141
Alignment:
Q  98 ttagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaattt 190  Q
    ||||| ||| |||||||  ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6237233 ttagttcttacaattaggcgtcatttaaaatttagtctctgtaattgctaatcctgagaatttacccttacaattgttaatcatttaaaattt 6237141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39667199 - 39667075
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||| |||| || |  ||||||||||||    
T  39667199 ttaatgatgtgtttcgtccttgtaattacgggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggtaaattacccttgcattgtttaatcatttaa 39667100  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  39667099 aatttcgtcttttgaccaacttaat 39667075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43155898 - 43155810
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  43155898 aattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggcaatttatccctgcattatttaatcatttaaaatttcgtccct 43155810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50504248 - 50504124
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  50504248 ttaatgatgtgtttcgtccttgtaattaggcgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgttaatccaggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 50504149  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||    
T  50504148 aatttcgtcctttgacaaacttaat 50504124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 194
Target Start/End: Original strand, 50750910 - 50750998
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||| ||||||    
T  50750910 tgcaattaggcgtcgtttaaaaattcgtccctgtaatcgctaatcctggcaaattaaccttgcattgtttaatcatttaaaaattcgtc 50750998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 5368966 - 5369061
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5368966 tccttgcaattagggatcgtttaaaaattggtccttgtaatcgctaatcctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 5369061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Original strand, 16605605 - 16605716
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |  || |||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  16605605 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggtgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgtcaaacctgccaatttacccttgcattgattaatcatttaa 16605704  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  16605705 aatttcgtccct 16605716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30642565 - 30642426
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||  |||||| | ||||||| |||| |||| ||| |||   ||||||||||||||||||    
T  30642565 atgtgtttcgtccctgcaattatgggtcatttaaaaattcatcattgtaatcgttaatcctagcaaattagtcttgcaaagtttaatcatttaaaatttc 30642466  T
Q  192 gtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||    
T  30642465 gtcccttgacccacttaatgactgccacgtcattaatttg 30642426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 49879585 - 49879490
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  49879585 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaactgatctctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 49879490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 51692572 - 51692667
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  51692572 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattgatctatgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcacttaaaatttcgtccct 51692667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 52909275 - 52909365
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  52909275 ttgcaattaggggtcgttcaaaaattggtcactgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcc 52909365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23613687 - 23613558
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||| |||| ||| ||||   |||||||||||||||| || | |||||    
T  23613687 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattgatccctgtattcgctaatccttgcaaattagtcttgcaatcactaatcatttaaaatttagttctttgac 23613588  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | | |||| ||| |||||||    
T  23613587 caacttaatcactaccacgtcactaatttg 23613558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 34765399 - 34765528
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||     
T  34765399 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaatcggtccttgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgat 34765498  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | || ||| ||| |||||||    
T  34765499 caacttaatcactgtcacgtcactaatttg 34765528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 36008863 - 36008992
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36008863 tccttgtaattagggatcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatcattgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 36008962  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | | |||| ||| |||||||    
T  36008963 caacttaatcactaccacgtcactaatttg 36008992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18831726 - 18831618
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||| ||  |||||    
T  18831726 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatcattgcaaactaaccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcatttgac 18831627  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  18831626 caacttaat 18831618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 14801755 - 14801850
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||  | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  14801755 tccttgcaattaggagtcgtttaaaaattggtctttgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgtattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 14801850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 53701831 - 53701926
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  53701831 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattgatctctgtaatctctaatcctgacaatttatccttgcattgtttaatcatttaaaatttcttccct 53701926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 196
Target Start/End: Original strand, 6236846 - 6236943
Alignment:
Q  98 ttagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccc 196  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||  |||||| | |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6236846 ttagtccttgcaattagacgtcatttaaaatttagtct-tgtaatcgttaatcccgggaatttacccttgcaattgttaatcatttaaaatttggtccc 6236943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 52573651 - 52573537
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||  |||||||| |||||||| | || || |  ||||||||||||    
T  52573651 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtaatcactaatcctagcaatttaccattgcattgtttaatcatttaa 52573552  T
Q  186 aatttcgtcccttga 200  Q
    |||| ||||| ||||    
T  52573551 aattccgtcctttga 52573537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 201
Target Start/End: Original strand, 11446279 - 11446388
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| || | || ||| | |||||||||||| ||| |||| |||   |||||| |||||||||||    
T  11446279 atgtgtttcgtccctgcaattagaggtcatttaaaaattggttcatggaatcgttaatcctggcaaattacccttgcaaagtttaatcttttaaaatttc 11446378  T
Q  192 gtcccttgac 201  Q
    ||||||||||    
T  11446379 gtcccttgac 11446388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 15507692 - 15507821
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||||  ||| | | ||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  15507692 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccctatattcgctaatccttgcaaactagtcgtgcaatcattattcatttcaaatttcgtcctttgac 15507791  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  15507792 caacttaatcattgtcacgtcactaatttg 15507821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36009208 - 36009127
Alignment:
Q  116 ggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  36009208 ggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggaaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 36009127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 224
Target Start/End: Original strand, 51859471 - 51859548
Alignment:
Q  147 aatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    ||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  51859471 aatcctggcaatttacccttgcattatttaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacatcat 51859548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 54087097 - 54087012
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  54087097 aattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcatgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 54087012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Original strand, 54713648 - 54713748
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttga 200  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  || ||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  54713648 gtccttgcaattgg-ggtcgtttaaaaattaatctctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttga 54713746  T
Q  201 cc 202  Q
    ||    
T  54713747 cc 54713748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15508081 - 15507990
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| | || ||    |||||||||||||||||||||    
T  15508081 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaatt-gtccttgtaatcgctaatcctgacaatttaccattgcatggtttaatcatttaaaatttcgtc 15507990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 197
Target Start/End: Original strand, 16005864 - 16005952
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| || |  | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  16005864 aattaggggtcgtttaaaaattaatccctgtaatcgctaattctggcaatttatccatgtattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 16005952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39701332 - 39701208
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| | ||||| || ||||||| | || || |  ||||||||||||    
T  39701332 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctatgtaatcgttaatcttgacaatttacctttgcattgtttaatcatttaa 39701233  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  39701232 aatttcgtcatttgaccaacttaat 39701208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17356331 - 17356236
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||| || |  || |||||||||||||||||||||    
T  17356331 tccttccaattacgggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatcttggcaatttactcttgcattgtttgatcatttaaaatttcgtccct 17356236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 24411377 - 24411472
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||  |||||||||    
T  24411377 tcctagcaattaggggtagtttaaaaattggtccctgtaatcgctaaccctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaagattcgtccct 24411472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37976557 - 37976470
Alignment:
Q  107 gcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||| | || || |  |||||||||||||||||||||    
T  37976557 gcaattaggggtcgtttaaaaattgatccctgtaatcgctaattctgacaatttatcattgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 37976470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50751922 - 50751812
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| ||   || |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |  ||||||||||||    
T  50751922 ttaatgatgtgtttcacccctgcaattaggcgtcgtttaaaaattcgt-cctgtaatcgctaatcctgacaaattaaccttgcattgtttaatcatttaa 50751824  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    || |||||||||    
T  50751823 aaattcgtccct 50751812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Original strand, 54086714 - 54086841
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||   ||  ||| |||  |||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54086714 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatccttcaaagctagtcttgtaatcattaatcatttaaaattttgtcctttgac 54086813  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  54086814 caacttaatcactgccacgtcactaatt 54086841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55867519 - 55867428
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||  || |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  55867519 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtaatcgttaatccttgcaaactacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 55867428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 50503828 - 50503966
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||   || |||||||||  |||| |||||| | ||||| | |||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  50503828 ttaatgatgtgtttcgtcctcgcaattaggcatcatttaaaaatcagtccatgtaatcgttaatcttagcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 50503927  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  50503928 aattccgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 50503966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 197
Target Start/End: Original strand, 147344 - 147433
Alignment:
Q  108 caattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  147344 caattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaataatttaaaattttgtccct 147433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 148160 - 148071
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | | ||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  148160 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctttattcgttaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcc 148071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11448131 - 11448046
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||||| |||| ||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  11448131 aattaggggtcgtttaaaaattgatctctgtaatcgctaatccttgcaaattacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 11448046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 17355944 - 17356073
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||  ||| ||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  17355944 tccttgcaattaggagtcgtttaaaaattggttgctgtattcgctaatctttgcaaactagtcttgcattcattaatcatttaaaatttcgtcatttgac 17356043  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  17356044 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 17356073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40388496 - 40388420
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40388496 tttaaaaattggtccctctaatcgctaatcctggcaaattgccccaacaaaagttaatcatttaaaatttcgtccct 40388420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52909662 - 52909554
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||| |||  |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  52909662 tccttgcaattatggatcatttaaaaattggtctatgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaattatttaaaatttcgtcctttgac 52909563  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  52909562 caacttaat 52909554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5369262 - 5369175
Alignment:
Q  116 ggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5369262 ggtcgtttaaaaattggtccctgcattcgttaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgacca 5369175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 202
Target Start/End: Original strand, 8438305 - 8438399
Alignment:
Q  107 gcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 202  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||| | |||||||||||| |||  ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8438305 gcaattaggggtcatttaaaaattggtca-tgtaatcgttaatcctggcaaattactcttgcaaaccttaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 8438399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 193
Target Start/End: Original strand, 40387490 - 40387577
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgt 193  Q
    ||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  || | |||  |||||||||||||||||||||    
T  40387490 tgcaattaggggccatttaaaaattggtccctgtattcgctaatcctggcaaattgcccctgcaaaagttaatcatttaaaatttcgt 40387577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 41582470 - 41582561
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| || |||| |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||  || | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41582470 tgcaatcaggggtcatttaaaaattggtccctctaatcgttaatcctggcaaattgcccctgcaaaagttaatcatttaaaatttcgtccct 41582561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22718327 - 22718245
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22718327 tttaaaaattactctctgtaattgttaatcctggcaatttactcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcatttgacca 22718245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Original strand, 22923164 - 22923258
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||  ||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22923164 aattagacgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgttaatcctgacaatttactcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcatttgacca 22923258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Original strand, 22927817 - 22927911
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||  ||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22927817 aattagacgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgttaatcctgacaatttactcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcatttgacca 22927911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Original strand, 22984096 - 22984190
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||  ||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22984096 aattagacgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgttaatcctgacaatttactcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcatttgacca 22984190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Original strand, 22986889 - 22986971
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22986889 tttaaaaattactctctgtaattgttaatcctggcaatttactcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcatttgacca 22986971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Original strand, 22997684 - 22997778
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||  ||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22997684 aattagacgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgttaatcctgacaatttactcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcatttgacca 22997778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 39700930 - 39701036
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||| |  ||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  39700930 cttgcaattaggcgttatttaaaaattaatccatgtaatcgctaatcctgacaatatacccttacattatttaattatttaaaatttcatcctttgacca 39701029  T
Q  204 gcttaat 210  Q
     ||||||    
T  39701030 acttaat 39701036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53129915 - 53129786
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||| |||||||| |||  || |  || ||| |||||||||||||||||   |    
T  53129915 tccttgcaatcaggggtcgtttaaaaattgatcctcgtaatcgctaatccttgcaatttaccctcgcattgtttcatcgtttaaaatttcgtccctctcc 53129816  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |  |||||| | |||||||||| |||||||    
T  53129815 ccacttaatcactgccacatcactaatttg 53129786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 54435504 - 54435411
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||| |  |||||| |||| ||||| || || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  54435504 cttgcaattaggtgtcgtttaaaaattgatccatgtaatcgtcaatccttgcaaattagcattgcatttgataattatttaaaatttcgtccct 54435411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11108249 - 11108161
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaattt 190  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  11108249 tccttgcaattagggatcgtttaaaaattgatccttgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaattt 11108161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32063746 - 32063650
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||| | |||| ||||||| ||| |||| |||   |||||||||||||||| |||||||    
T  32063746 gtccctgcaattaggggtcatttaaaaattggtttctgtaatcgttaatactggcaaattacccttgcaaagtttaatcatttaaaattccgtccct 32063650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35028407 - 35028315
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||| | |  | ||||||||| |||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  35028407 tccttgcaattaggggtattttaaaaattggtccatatgttcgctaatccttgcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 35028315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35508646 - 35508558
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgt 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| | |||| ||  ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  35508646 ttgcaattaggggtcgtttaaaaattaatccttgtaatcgttaattctaacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgt 35508558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 1178123 - 1178170
Alignment:
Q  163 ccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1178123 ccttgcaattattaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaat 1178170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8439615 - 8439504
Alignment:
Q  120 gtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccac 219  Q
    |||||||||||  ||  |||||| | ||||||| |||| ||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||    
T  8439615 gtttaaaaattgatcattgtaatcgttaatcctagcaaattatccttgcaaacattaatcatttaaaatttcgtcccttgacccacttaatcaccgccac 8439516  T
Q  220 atcattaatttg 231  Q
     ||| |||||||    
T  8439515 gtcagtaatttg 8439504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41583636 - 41583545
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||  |  ||||| | |||||||||||||| ||  || | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41583636 tgcaattaggggtcatttaaaaattgatttctgtattcgctaatcctggcaaattgcccctgcaaaagttaatcatttaaaatttcgtccct 41583545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9731595 - 9731497
Alignment:
Q  126 aaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||  | |  |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| | |||||| ||||    
T  9731595 aaattagttcctgtaatcgctaatcctgacaatttatccttgtattgtttaatcatttaaaatttcgttctttgactaacttaatcactgccacgtcat 9731497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 197
Target Start/End: Original strand, 30641545 - 30641632
Alignment:
Q  108 caattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||  |||||| | ||||||| |||| ||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  30641545 caattaggggtcatttaaaaatttgtc--tgtaatcgttaatccttgcaaattaccattacaaagtttaatcatttaaaatttcgtccct 30641632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 210
Target Start/End: Original strand, 32062598 - 32062715
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| || |||||| |||| |||||||||| |||| |||||    |||||||| ||| ||||||||  ||   ||||||||||||||||||    
T  32062598 atgtgtttggtccctgaaattaggggtcatttaaaaattggtccttgtaaacattaatcctgacaaattagccttgtaaaatttaatcatttaaaatttc 32062697  T
Q  192 gtcccttgaccagcttaat 210  Q
    || |||||||| |||||||    
T  32062698 gt-ccttgacccgcttaat 32062715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 156
Target Start/End: Original strand, 39666773 - 39666843
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggca 156  Q
    ||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  39666773 ttaatgatgtgtttcgtctttgtaattagaagtcatttaaaaattagtcaatgtaatcgctaatcctggca 39666843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 53129528 - 53129654
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    |||||||||| | ||||||||||| | |  | |||| |||||||||||  |||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||     
T  53129528 ttgcaattagggatcgtttaaaaaattggtcatgtatttgctaatccttacaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgttctttgaccaa 53129627  T
Q  205 cttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |||||| | ||| || ||| |||||||    
T  53129628 cttaatcactgcaacttcactaatttg 53129654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53702149 - 53702092
Alignment:
Q  174 ttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  53702149 ttaatcatttaaaatttcgtcatttgaccaacttaatcaatgccacgtcactaatttg 53702092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 197
Target Start/End: Original strand, 56014778 - 56014839
Alignment:
Q  136 ctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  56014778 ctgtaatcgctaatcctggcaaattgcccctgcaaacgttaatcatttaaaatttcgtccct 56014839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16006200 - 16006152
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcct 152  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  16006200 cttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatcct 16006152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 92)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11675088 - 11674943
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11675088 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 11674989  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  11674988 aatttggtccttggaccaacttaatcactgccacgtcactaatttg 11674943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Original strand, 11674698 - 11674809
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11674698 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgttaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 11674797  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  11674798 aatttcgtccct 11674809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Original strand, 36325237 - 36325348
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36325237 ttaatgatgtgattagtccttacaattaggggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgttaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 36325336  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  36325337 aatttcgtccct 36325348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36325628 - 36325495
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36325628 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtctctgtaattgttaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 36325529  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccac 219  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | ||||||    
T  36325528 aatttggtccttggaccaacttaatcactgccac 36325495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 195
Target Start/End: Original strand, 23505055 - 23505164
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23505055 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtccatgtaattgctaatcttggcaatttacccttgcaattgttaatcatttaa 23505154  T
Q  186 aatttcgtcc 195  Q
    ||||| ||||    
T  23505155 aatttggtcc 23505164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23507850 - 23507741
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23507850 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaatacgtccctgtaattgctaatccttgcaatttacccttgcaattgttaatcatttaa 23507751  T
Q  186 aatttcgtcc 195  Q
    ||||| ||||    
T  23507750 aatttggtcc 23507741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38845689 - 38845582
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  38845689 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 38845590  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  38845589 tcgtccct 38845582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10445758 - 10445620
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  10445758 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggtgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 10445659  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  10445658 aatttcgtcttttgaccaacttaatcactgccacgtcat 10445620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2535960 - 2535837
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttga 200  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  2535960 gtccctgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggcaaattacccttacaaagtttaatcatttaaaatttcgtcccttga 2535861  T
Q  201 ccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    ||  |||||| | |||||||||||    
T  2535860 cccacttaatgactgccacatcat 2535837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15230354 - 15230216
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  15230354 ttaatgatgtgttttgtccttgcaattaggtgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcttgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 15230255  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  15230254 aatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 15230216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 1425072 - 1425201
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1425072 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcactaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 1425171  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  1425172 caacttaatcattgccacgtcactaatttg 1425201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2266882 - 2266741
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  2266882 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 2266783  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |  ||| |||||||  ||||| | | |||||||| |||||||    
T  2266782 tgatcctttgaccaaattaatcacttccacatcactaatttg 2266741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 44406864 - 44407005
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  44406864 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 44406963  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  44406964 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 44407005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 234163 - 234039
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  234163 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcatcatttaaaaattagtccctgtaattgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 234064  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  234063 aatttcgtcctttgatcaacttaat 234039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 710574 - 710450
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  710574 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcatcatttaaaaattagtccctgtaattgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 710475  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  710474 aatttcgtcctttgatcaacttaat 710450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 747786 - 747662
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  747786 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcatcatttaaaaattagtccctgtaattgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 747687  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  747686 aatttcgtcctttgatcaacttaat 747662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 871681 - 871557
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  871681 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcatcatttaaaaattagtccctgtaattgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 871582  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  871581 aatttcgtcctttgatcaacttaat 871557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 15229934 - 15230058
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||||    
T  15229934 ttaatgatgtgttttgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttggattgtttaatcatttaa 15230033  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  15230034 aatttcgtcctttgatcaacttaat 15230058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Original strand, 2266499 - 2266606
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  2266499 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtctctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 2266598  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  2266599 tcgtccct 2266606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3041846 - 3041739
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  3041846 tgatgtgtttagctcttgcaattaggcggcatttaaaaactcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 3041747  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  3041746 tcgtccct 3041739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23663923 - 23663828
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23663923 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 23663828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23698653 - 23698558
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23698653 tccttgtaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 23698558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 39071695 - 39071790
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  39071695 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 39071790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40776040 - 40775933
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  40776040 tgatgtgtttaacccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctgacattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 40775941  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  40775940 tcgtccct 40775933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44407247 - 44407140
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  44407247 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcatccctgtaattgctaatcctagcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 44407148  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  44407147 tcgtccct 44407140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 200
Target Start/End: Original strand, 7983431 - 7983545
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  7983431 ttaattatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 7983530  T
Q  186 aatttcgtcccttga 200  Q
    |||||||||| ||||    
T  7983531 aatttcgtcctttga 7983545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Original strand, 12272937 - 12273055
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12272937 tccttgcaattagggatcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatccttgcaaactagccttgcaattattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 12273036  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
    ||  ||||| | |||||||    
T  12273037 caatttaatcactgccaca 12273055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35449986 - 35449892
Alignment:
Q  103 ccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35449986 ccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccatgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 35449892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38862972 - 38862854
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38862972 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 38862873  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
    || |||||| | |||||||    
T  38862872 caacttaatcactgccaca 38862854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 44664511 - 44664649
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  44664511 ttaattatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgttaatcctggcaatttaaccttgcattgtttaatcatttaa 44664610  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  44664611 aatttcgtcatttgaccaacttaatcactgccacgtcat 44664649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8316997 - 8316904
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  8316997 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcc 8316904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 38845306 - 38845447
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  38845306 tgatgtgtttaacccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 38845405  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  38845406 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 38845447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35634522 - 35634398
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  35634522 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaagcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 35634423  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| || |||| ||||||    
T  35634422 aatttcgtcctttaaccaacttaat 35634398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 37542227 - 37542351
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  37542227 ttaatgatgtgtttcgtctttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctttaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 37542326  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||    
T  37542327 aatttcgttctttgaccaacttaat 37542351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44664931 - 44664799
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  44664931 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 44664832  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgcca 218  Q
    ||||||||   ||||||| |||||| |||||||    
T  44664831 aatttcgttatttgaccaacttaatcattgcca 44664799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16388935 - 16388840
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  16388935 tccttgcaattaggggtcatttaaaaattggttcatgtaattgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 16388840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20386839 - 20386744
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20386839 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagcctcgcaattattaatcatttaaaatttcgtccct 20386744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Original strand, 25124566 - 25124689
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  25124566 ttaatgatgtatttcgttcttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 25124665  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaa 209  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  25124666 aatttcgtcctttgaccaacttaa 25124689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Original strand, 8316672 - 8316790
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8316672 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgttaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 8316771  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
    || |||||| | |||||||    
T  8316772 caacttaatcactgccaca 8316790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36928882 - 36928756
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  36928882 ttgcaattagatatcgtttaaaaattggtctatgtatttgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaa 36928783  T
Q  205 cttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  36928782 cttaatcactgccacgtcactaatttg 36928756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 3041463 - 3041604
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| |||||||||||   | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  3041463 tgatgtgtttagcccttgcaattaagcggcatttaaaaattcgtccatgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 3041562  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  3041563 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 3041604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Original strand, 12198969 - 12199070
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12198969 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctataatcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 12199068  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  12199069 ca 12199070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Original strand, 12443397 - 12443498
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12443397 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctataatcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 12443496  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  12443497 ca 12443498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40318373 - 40318280
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  40318373 tccttgcaattaggggttgtttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcc 40318280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 40775657 - 40775798
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  40775657 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgttcctgtaattgttaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 40775756  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  40775757 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 40775798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12273262 - 12273167
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12273262 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcccgtcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 12273167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 20385587 - 20385682
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20385587 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtccct 20385682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 22915410 - 22915537
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  22915410 cttgcaattagagatcatttaaaaattggtccatgtaatcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttacaatttcgtcttttgacca 22915509  T
Q  204 gcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
      ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  22915510 atttaatcattgccacgtcactaatttg 22915537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Original strand, 40317983 - 40318110
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||  |||||    
T  40317983 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaatttgtctctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaattgcgtcatttgac 40318082  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  40318083 caacttaatcactgccacgtcactaatt 40318110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25124986 - 25124848
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  25124986 ttaatcatgtgtttcgtccttgcaattaggtgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgctaattctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 25124887  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||| ||| |||| || |||||| | |||||| ||||    
T  25124886 aatttcatcctttgaacaacttaatcactgccacgtcat 25124848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13186468 - 13186339
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  13186468 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggttcatgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcatttgac 13186369  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  13186368 caagttaatcactgccacgtcactaatttg 13186339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 23663564 - 23663693
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| | ||  || ||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23663564 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgttaatccttggaaactaaccttgaaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 23663663  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  23663664 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 23663693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38956081 - 38955952
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| ||||     
T  38956081 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgtaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgat 38955982  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | || ||| ||| |||||||    
T  38955981 caacttaatcactgtcacgtcactaatttg 38955952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 6471693 - 6471801
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  6471693 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaatgagtctctataatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 6471792  T
Q  186 aatttcgtc 194  Q
    |||||||||    
T  6471793 aatttcgtc 6471801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8998112 - 8997988
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| || | |||||| ||||||| || ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  8998112 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagttcatgtaatcgctaatcatgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 8998013  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||    
T  8998012 aattccgtcctttgaccaacttaat 8997988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41353996 - 41353872
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||  || |  ||||||||||||    
T  41353996 ttaatgatgtgtttcgtccttataattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcactaatcctgacaatttaccctagcattatttaatcatttaa 41353897  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  41353896 aatttcgtcctttgaccaacttaat 41353872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42945537 - 42945413
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||  ||| || |  ||||||||||||    
T  42945537 ttaatgatgtgtttcgttcttgcaattaggcgtcatttaaaaattagttcctgtaatcgctaatcctgacaatttactcttgcattgtttaatcatttaa 42945438  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  42945437 aatttcgtcatttgaccaacttaat 42945413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1425430 - 1425336
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  1425430 tccttgtaattagaggtcgtttaaaaattggt-cctgtaatcactaatcctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 1425336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4406069 - 4405974
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4406069 tccttgtaattaggggttgtttaaaaattggtccatgtatttgttaatccttgcaatttacccttgcaatgtttaatcatttaaaatttcgtccct 4405974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Original strand, 23698327 - 23698446
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagagg-tcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttga 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23698327 tccttgcaattagggggtcgtttaaaaattagtccctgtaatcgctaattcttgcaaactagccttgcaatcattaatcagttaaaatttcgtcctttga 23698426  T
Q  201 ccagcttaataattgccaca 220  Q
    |||  ||||| | |||||||    
T  23698427 ccaatttaatcactgccaca 23698446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34177372 - 34177257
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagctta 208  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| | ||  ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  34177372 aattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtattcgctaatccttgtaaactagccttgcattctttaatcatttaaaatttcgtcccttgacccactta 34177273  T
Q  209 ataattgccacatcat 224  Q
    || | |||||||||||    
T  34177272 atgactgccacatcat 34177257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39072050 - 39071932
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39072050 tccttgcaatcaagggtcgtttaaaaattggtccctgtattcg-taatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 39071952  T
Q  202 cagcttaataattgccacat 221  Q
    || |||||| | ||||||||    
T  39071951 caacttaatcactgccacat 39071932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Original strand, 42945158 - 42945241
Alignment:
Q  127 aattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42945158 aattagtccctgtaattgctaatcctgacaatttacccttatattgtttaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaat 42945241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34685666 - 34685538
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  34685666 tccttgcaattagggatcgtttaaaaattggtct-tgtattcgctaatccttgcaaactagccttacaatcattaatcatttaaaatttcgtcatttgac 34685568  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | || ||| ||| |||||||    
T  34685567 caacttaatcactgtcacgtcactaatttg 34685538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Original strand, 13186079 - 13186171
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  13186079 tccttgcaattagggatcgtttaaaaattggttcatgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 13186171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31608922 - 31608827
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgt-taatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31608922 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaatttacccttgc-attgtctaatcatttaaaatttcgtccct 31608827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4995065 - 4994971
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| |||||||||||||    
T  4995065 tccttgcaattaggggtcatttaaaaattggtcc-tgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttcaaatttcgtccct 4994971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22915767 - 22915672
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  |||||||||||||||| |||||||    
T  22915767 tccttgcaactagggatcgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaatcttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaattccgtccct 22915672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30712125 - 30712031
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30712125 tccttgcgattaggggccgtttaaaaattggtcc-tgtatttgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtccct 30712031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30719902 - 30719808
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30719902 tccttgcgattaggggccgtttaaaaattggtcc-tgtatttgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtccct 30719808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 36928495 - 36928590
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  36928495 tcctttcaattaagggtcgtttaaaaattggtctatgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 36928590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34061737 - 34061636
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||| |||| ||  |||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34061737 tccttgcaattagacgtcgtttaaaaattgatccatgtattcgctaatccttgcaaattgcccttgcattctttaatcatttaaaatttcgtcctttgac 34061638  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  34061637 ca 34061636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 166
Target Start/End: Original strand, 8997859 - 8997939
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagcctt 166  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  8997859 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgcaatcgctaatcctgacaatttaccctt 8997939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 21432696 - 21432804
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||  |||||  || ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  21432696 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacgtcatataaaaattagtctctgtaatcactaattttgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 21432795  T
Q  186 aatttcgtc 194  Q
    |||||||||    
T  21432796 aatttcgtc 21432804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35756992 - 35756884
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagagg-tcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttga 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35756992 tccttgcaattagggggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgttaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttga 35756893  T
Q  201 ccagcttaa 209  Q
    ||| |||||    
T  35756892 ccaacttaa 35756884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38003829 - 38003749
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagcctt 166  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38003829 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagtcgtaatttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctggcaatttaccctt 38003749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42803627 - 42803542
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaa 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  | |||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||||    
T  42803627 tccttgcaattagaagtcgtttaaaaattggtccctataatcaccaatcgtggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaa 42803542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 41353577 - 41353685
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||| || || |||||| |||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||||  ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  41353577 ttaatgatatgtttcgtccttacaattaggcgtcatttaaaaattagtttctgtaatcgctaatcctaacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 41353676  T
Q  186 aatttcgtc 194  Q
    |||||||||    
T  41353677 aatttcgtc 41353685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 38955722 - 38955817
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||| || | || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  38955722 tccttgcaattggggatcgtttaaaaattggtcattgtaatcgctaatcctggtaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcatccct 38955817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 224
Target Start/End: Original strand, 39474600 - 39474686
Alignment:
Q  137 tgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  39474600 tgtaatcgctaatcttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgt-ctttgaccaacttaatcactgccacatcat 39474686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Original strand, 7294122 - 7294220
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || || || | ||||||||| | ||  ||||||| || |  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7294122 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattgatctctatattcgctaatccttgtaaactagccttgcattctttaatcatttaaaatttcatcctttgacc 7294220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6472078 - 6471989
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| || | |||||| || ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  6472078 tttaaaaattagttcatgtaatcgccaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaattttgtcctttgaccaacttaat 6471989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 202
Target Start/End: Original strand, 8746347 - 8746443
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 202  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| | ||||| || ||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8746347 tgcaattaggggtcatttaaaaatcggtcactgtaatcgttaatcgtgacaaattacccttgcaaaccttaatcatttaaaatttcgtcacttgacc 8746443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37542632 - 37542524
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||| |||||||  ||| |||||||||| || ||||| || | |||| |||  |||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37542632 tccttacaattaggcgtcatttaaaaattggttcctgttatcgttaattctgataatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcctttgac 37542533  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  37542532 caacttaat 37542524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 157
Target Start/End: Original strand, 34060508 - 34060563
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaa 157  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  34060508 tccttgcaattaaacgtcgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaatccttgcaa 34060563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10749927 - 10749833
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaa 186  Q
    ||||| || |||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||| ||| |||| |||  |||||||| |||||    
T  10749927 atgtgtttcgtccttgcaattagggatcatttaaaaattggtccatgtaatcgttaatcctgtcaaattacccttgcaaacgttaatcacttaaa 10749833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43181554 - 43181460
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||| || ||| | ||||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43181554 aattagggatcgtttaaaaattgatccatgcaatcgttaatccttgtaaattagccttacattgtttaatcatttaaaatttcgttcctcgacca 43181460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 4994679 - 4994784
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    |||||||||| | | |||||||||||  || ||||| | ||||||||| | ||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||     
T  4994679 ttgcaattagggattgtttaaaaattgatctctgtattcgctaatccttggaaactagccttgcaatcattaattatttaaaatttcgtcttttgaccaa 4994778  T
Q  205 cttaat 210  Q
    ||||||    
T  4994779 cttaat 4994784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7295336 - 7295207
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| || |  |||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  7295336 tccttgcaattatggatcgtttaaaaatcggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcattctttaatcgtttaaaatttcatcctttgac 7295237  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |   | ||| | |||||| |||||||||||    
T  7295236 ccagtcaatgactgccacgtcattaatttg 7295207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Original strand, 36186127 - 36186228
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagctta 208  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||  |||  || ||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  36186127 aattaggggtcttttaaaatttggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagtattgcaatcattaattatttaaaatttcgtcttttgaccaactta 36186226  T
Q  209 at 210  Q
    ||    
T  36186227 at 36186228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 35756606 - 35756696
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgtt-aatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||||  ||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35756606 tgcaattaggggtcatttaaaaattggtct-tataatcactaatcctgacaatttatccttg-aattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 35756696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36186473 - 36186381
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| || |||  | |||| |||||||||| ||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  36186473 tccttgcaattaagggtcgtttaaaa-ttggtc--tataatcgctaatcctgacaatttacctttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 36186381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21363 - 21252
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21363 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcatggcaatttagtcttgcaattgttaatcatttaa 21264  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    |||| |||||||    
T  21263 aattccgtccct 21252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 190
Target Start/End: Original strand, 21012 - 21116
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21012 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatccttgcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 21111  T
Q  186 aattt 190  Q
    |||||    
T  21112 aattt 21116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 96)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32680989 - 32680878
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32680989 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcgtttaaaaattcgtccatgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 32680890  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  32680889 aatttcgtccct 32680878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 32680598 - 32680743
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32680598 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgttcctgtaattgctaatcctgacaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 32680697  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  32680698 aatttggtccttggaccaacttaatcactgccacgtcactaatttg 32680743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30948550 - 30948443
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  30948550 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 30948451  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  30948450 tcgtccct 30948443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 32068099 - 32068223
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  32068099 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacgtcatttaaaaattagtccttgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 32068198  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||    
T  32068199 aatttcgtactttgaccaacttaat 32068223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42618334 - 42618210
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  42618334 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagttcctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 42618235  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  42618234 aatttcgtcctttgaccaacttaat 42618210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 10935813 - 10935908
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10935813 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 10935908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34929040 - 34928933
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  34929040 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 34928941  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  34928940 tcgtccct 34928933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39686924 - 39686817
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  39686924 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 39686825  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  39686824 tcgtccct 39686817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 18086298 - 18086408
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  18086298 atgtgtttagtccttgcaattaggagtcgtttaaaaattggtccctgtaaacgataatccttgcaaattagccttgcaattattaatcacttaaaatttc 18086397  T
Q  192 gtcccttgacc 202  Q
    |||||||||||    
T  18086398 gtcccttgacc 18086408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27992117 - 27991988
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27992117 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 27992018  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  27992017 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 27991988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 34928657 - 34928798
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  34928657 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 34928756  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  34928757 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 34928798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18087757 - 18087625
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  18087757 atgtgtttagtccttgcaattaggggtcatttaaaaattggtcactgtaatcgctaatccttgcaaaatagccttgcaattattaatcatttaaaatttt 18087658  T
Q  192 gtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    ||||||| |||  |||||| | |||||| ||||    
T  18087657 gtcccttaacccacttaatgactgccacgtcat 18087625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 25453131 - 25453255
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  25453131 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctataatcgctaatcctgacaatttacccttgcattatttaatcatttaa 25453230  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  25453231 aatttcgtcctttgaccaacttaat 25453255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 32934771 - 32934647
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| |  ||||||||||||    
T  32934771 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctgacaatttactcttacattgtttaatcatttaa 32934672  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  32934671 aatttcgtcatttgaccaacttaat 32934647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 6253490 - 6253585
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6253490 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 6253585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 17102039 - 17102134
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  17102039 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 17102134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28469417 - 28469322
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  28469417 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 28469322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32068519 - 32068381
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  32068519 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggagtcatttaaaaattaatccctgtaatcgctaatcctgccaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 32068420  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  32068419 aatttcgtcatttgaccaacttaatcactgccacgtcat 32068381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 30948167 - 30948308
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  30948167 tgatgtgtttaacccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 30948266  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  30948267 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 30948308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17102398 - 17102270
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17102398 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatcctagcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 17102299  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaattt 230  Q
    || |||||| | |||||| ||| ||||||    
T  17102298 caacttaatcactgccacgtcactaattt 17102270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 23058432 - 23058556
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || | || || |  ||||||||||||    
T  23058432 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaagagtcatttaaaaattagtccctgtaattactaatcctggcaatataccattgcattgtttaatcatttaa 23058531  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  23058532 aatttcgtcctttgaccaacttaat 23058556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 28890582 - 28890690
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  28890582 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacgtcatttaaaaattagtccttgtaatcgctaatcctagcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 28890681  T
Q  186 aatttcgtc 194  Q
    |||||||||    
T  28890682 aatttcgtc 28890690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 32934351 - 32934475
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  32934351 ttaatgatgtgtttcatccttgcaattaggtgtcatttaaaaattagtcgctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 32934450  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  32934451 aatttcgtcctttgaccaacttaat 32934475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Original strand, 39686554 - 39686682
Alignment:
Q  103 ccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 202  Q
    ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||    
T  39686554 ccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatttggtccttggacc 39686653  T
Q  203 agcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  39686654 aaattaatcactgccacgtcactaatttg 39686682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 42617914 - 42618038
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  42617914 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctttaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 42618013  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  42618014 aatttcgtcctttgatcaacttaat 42618038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43266689 - 43266565
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  43266689 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaattctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 43266590  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  43266589 aatttcgtcctttgaccaacttaat 43266565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Original strand, 2640197 - 2640324
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2640197 tccttacaattaggggtcgtttaaaaattggtacctgtattcgctaatccttgcaaattagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 2640296  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  2640297 caacttaatcactgccacgtcactaatt 2640324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32299114 - 32299019
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||| ||||||||||||||    
T  32299114 tccttgcaattaggagtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcattgaaaatttcgtccct 32299019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 42731438 - 42731533
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  42731438 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtaatcgctaatcctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 42731533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 25628481 - 25628619
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  25628481 ttaatgatgtgtttcgtgcttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtcattgtaatcgataatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 25628580  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  25628581 aatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 25628619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32688626 - 32688505
Alignment:
Q  103 ccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 202  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32688626 ccttgcaattaggggtcatttaaaatttggtccttgtaatcgctaatcctgacaaattgcccttgcaaatattaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 32688527  T
Q  203 agcttaataattgccacatcat 224  Q
      |||||||| |||||| ||||    
T  32688526 cacttaataactgccacgtcat 32688505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22081982 - 22081850
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||| || || |||||||||||||   ||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  22081982 ttaatgatttgtttcgtccttgcaattatgcgtcatttaaaaattagtttctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 22081883  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgcca 218  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  22081882 aatttcgtcatttgaccaacttaatcattgcca 22081850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33828397 - 33828273
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  33828397 ttaatgatgagtttcgtccttgcaattaggtgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 33828298  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  33828297 aatttcgtcatttgaccaacttaat 33828273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 46204424 - 46204548
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| | || || |  || |||||||||    
T  46204424 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaaacctgacaatttaccattgcattattttatcatttaa 46204523  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  46204524 aatttcgtccattgaccaacttaat 46204548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 6571032 - 6571127
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  6571032 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 6571127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Original strand, 17885649 - 17885776
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17885649 cttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattctctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgaccc 17885748  T
Q  204 gcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
      ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  17885749 agttaatcactgccacgtcactaatttg 17885776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20426735 - 20426644
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  20426735 tgcaattagaggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatcctggcattttaccctcacaaagtttaatcatttaaaatttagtccct 20426644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22871686 - 22871591
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  22871686 tccttgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatagctaatccttgcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcttccct 22871591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 27991758 - 27991853
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  27991758 tccttgcaattaggggtcgtttagaaattgatccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 27991853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 217
Target Start/End: Original strand, 28469029 - 28469144
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || | ||||||| | ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28469029 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttatattcgctaatctttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 28469128  T
Q  202 cagcttaataattgcc 217  Q
    || |||||| ||||||    
T  28469129 caacttaatcattgcc 28469144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 210
Target Start/End: Original strand, 48788824 - 48788930
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  48788824 cttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcatttgacca 48788923  T
Q  204 gcttaat 210  Q
     ||||||    
T  48788924 acttaat 48788930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10600372 - 10600248
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||| ||    
T  10600372 ttaatgatgtgtttcgtcattgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccttgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcattcaa 10600273  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  10600272 aattttgtcctttgaccaacttaat 10600248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23181400 - 23181308
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23181400 ttgcaattaggggtcgtttaaatattggtccatgtaatcgctaatcttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 23181308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24389194 - 24389086
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  |||| || ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24389194 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactagcattgcaatcattaatcatttaaaattttgtcctttgac 24389095  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  24389094 caacttaat 24389086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25453551 - 25453427
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||| ||| |||||   ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  25453551 ttaatgatgtgtttcgtctttgtaattaagcgtcatttaaaaattagtccctgaaatcgctaatcctagcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 25453452  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
     ||||||||| ||||||||||||||    
T  25453451 catttcgtcctttgaccagcttaat 25453427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25628901 - 25628777
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||   ||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  25628901 ttaatgatgtgtctcgtccttgcaattatgcgtcatttaaaaattagtctatgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 25628802  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  25628801 aatttcgtcctttgaccaacttaat 25628777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 43266269 - 43266393
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  43266269 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgttaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 43266368  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||| ||  ||||||| ||||||    
T  43266369 aatttcatcatttgaccaacttaat 43266393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5457316 - 5457221
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||| |||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5457316 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtattcgttaatccttgcaaattaccctttcaatgtttaatcatttaaaatttcgtccct 5457221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10936203 - 10936088
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||      
T  10936203 tccttgcaattaggggttgtttaaaaattggtccttgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgga 10936104  T
Q  202 cagcttaataattgcc 217  Q
    || |||||| ||||||    
T  10936103 caacttaatcattgcc 10936088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16804054 - 16803967
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||    
T  16804054 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgccaatcctagcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatt 16803967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 19204508 - 19204603
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19204508 tccttgaaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaattctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 19204603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27397004 - 27396909
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |  | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  27397004 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctgacaattcaccactgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 27396909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42731828 - 42731701
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||   ||||||||| ||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42731828 tccttgtaattaggggtcgtttaaaaattgatccctatatccgctaatccttgcaagctagctttgcaattattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 42731729  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  42731728 caacttaatcactgccacgtcactaatt 42731701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23058852 - 23058714
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |  ||| ||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||| |||  || |  ||||||||||||    
T  23058852 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattcggcgtcatttaaaaattaatccttgtaatcgttaatcctggcaatttaccctcgcattgtttaatcatttaa 23058753  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  23058752 aatttcgtcatttgaccaacttaattactgccacgtcat 23058714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 202
Target Start/End: Original strand, 32687406 - 32687516
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  32687406 atgtgttttgtccttgtaattaggggtcatttaaaatttggtccctgtaatcgttaatcctggcaaattgcccttgcaaatattaatcatttaaaatttc 32687505  T
Q  192 gtcccttgacc 202  Q
    || ||||||||    
T  32687506 gttccttgacc 32687516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6253849 - 6253720
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||   || ||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6253849 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtattcgctaatccttgcaaacaagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 6253750  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | || ||| ||| |||||||    
T  6253749 caacttaatcactgtcacgtcactaatttg 6253720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18856064 - 18855967
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccctt 198  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18856064 gtccctgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcttggcaaattacccttgcaaagtttaatcatttaaaatttcgtccctt 18855967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3914542 - 3914439
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagc 205  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  3914542 tgcaattagaggtcgtttaaaa-ttggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcatttgaccaac 3914444  T
Q  206 ttaat 210  Q
    |||||    
T  3914443 ttaat 3914439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 22081563 - 22081686
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  22081563 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattatgcgtcatttaaaaattagtcc-tctaatcgctaatgctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 22081661  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  22081662 aatttcgtcctttgatcaacttaat 22081686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27138364 - 27138240
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| ||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  27138364 ttaatgatgtgtttcgtcctttcaatcaggcgtcatttaaaaattagtccttgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 27138265  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||| | | ||||||| ||||||    
T  27138264 aatttctttctttgaccaacttaat 27138240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45011013 - 45010921
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | ||||||||| |||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  45011013 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggttcatgtattcgctaatccttgcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 45010921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13386154 - 13386068
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaattt 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  13386154 cttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctatattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatgtttaatcatttaaaattt 13386068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2640580 - 2640495
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||| ||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  2640580 aattaggggtcgtttaaaaattggcctctgtaatcgctaattctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 2640495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40380093 - 40380000
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| | || |||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40380093 tccttgcaattaggagtcgtttaaaaattggtccatgtattcgccaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcc 40380000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13050200 - 13050088
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattg-ttaatcatttaaaattt 190  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |     
T  13050200 atgtgtttcgtccttgcaattaggcgtaattttaaatttcgtccctgtaatcgttaatcctggtaatttacccttgcaattgtttaatcatttaaaaatc 13050101  T
Q  191 cgtcccttgacca 203  Q
    ||||| |||||||    
T  13050100 cgtccattgacca 13050088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 40379788 - 40379883
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattg-ttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| |||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40379788 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctttgtattcgctaatccttgcaattta-cctttgtattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 40379883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46205732 - 46205608
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||  | || |||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||| ||| |||| || |  ||||||||||||    
T  46205732 ttaatgatgtgtttcgttcttgcaattaatgatcatttaaagattggttcctgtaatcgttaatcctgacaaattacccttgcattgtttaatcatttaa 46205633  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  46205632 aatttcgtcctttgaccaacttaat 46205608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 13384525 - 13384616
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||  || |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13384525 tgcaattaagggtcgcttaaaatttggtccctgtaatcgctaatcctagcaaactacccttgcaaacgttaatcatttaaaatttcgtccct 13384616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 24388838 - 24388933
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||  | |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24388838 tccttgcaattatgggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatcatggcaatttacccttgtattgtttaatcacttaaaatttcgtccct 24388933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 39274873 - 39275012
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |  ||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||| | || || |  ||||||||||||    
T  39274873 ttaatgatgtgttttgtccttgcaatttggcgttatttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctagtaatttacctttgcattgtttaatcatttaa 39274972  T
Q  186 aatttcgtcc-cttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  39274973 aatttcgtccttttgaccaacttaatcactgccacgtcat 39275012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 22871358 - 22871456
Alignment:
Q  133 tccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||   || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  22871358 tccctgtaatcgctaatccttgcaaaccagtcttgcaattattaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaatttaatcactgccacgtcactaatttg 22871456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Original strand, 27396648 - 27396766
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||| ||  |||||    
T  27396648 tccttgtaattaggggccgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcatttgac 27396747  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
    || |||||| | |||||||    
T  27396748 caacttaatcactgccaca 27396766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17886899 - 17886782
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||  ||| |||| | | ||||||| ||||  || |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17886899 tccttgcaattagggatcatttaaaaattgatccatgtattcgttaatccttgcaaactacccttgcaaatattaatcatttaaaatttcgtcccttgac 17886800  T
Q  202 cagcttaataattgccac 219  Q
    |  |||||| | ||||||    
T  17886799 ccacttaatcactgccac 17886782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 32053162 - 32053291
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||  |||||| ||   | ||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||  |||||    
T  32053162 tccttgtaattatgggtcgtttaaaaatcggtccctatatacgataatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcttttgac 32053261  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||||||| |||||||    
T  32053262 caacttaatcactgccacatcactaatttg 32053291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 202
Target Start/End: Original strand, 33808357 - 33808442
Alignment:
Q  117 gtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 202  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||| |||| ||| || |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33808357 gtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatccttgcaaattagtcttgcattctttaatcatttaaaatttcgtccattgacc 33808442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Original strand, 42019616 - 42019717
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  |||| ||  |||  |||||||||||||||||||| | |||||    
T  42019616 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactagctttgtaatcattaatcatttaaaatttcgttctttgac 42019715  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  42019716 ca 42019717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 42362469 - 42362562
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||| | | ||||||| |||| ||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  42362469 tccttgcaattaggtgtcgtttaaaaattggtccttgtattcgttaatccttgcaaattacccttgcattctttaatcatttaaaatttcgtcc 42362562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6571299 - 6571239
Alignment:
Q  160 tagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccaca 220  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  6571299 tagccttgcaattattaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccaca 6571239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42020006 - 42019914
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||||  ||| || |  ||||| |||||||||||||||    
T  42020006 tccttgcaattaggggttgtttaaaaattggttcctataatcgctaatcttggcaatttactcttgcattgtttaattatttaaaatttcgtc 42019914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Original strand, 10600031 - 10600102
Alignment:
Q  88 aatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatt 159  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  10600031 aatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctataatcgttaatcctggcaatt 10600102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Original strand, 13044690 - 13044813
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttga 200  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| | || || |  |||||||||||||| |||||||||| |    
T  13044690 gtccttgcaattaggcgccatttaaaatttcgtcccagtaatcgctactcctgacaatttaccattgcattgtttaatcatttaaaaattcgtcccttaa 13044789  T
Q  201 ccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    | | |||||| | ||||| |||||    
T  13044790 caaacttaatcactgccaaatcat 13044813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 37656871 - 37656966
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||| || |  ||| | ||||||||||||||||||    
T  37656871 tccttgcaattaggaatcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcctcgcaatttacgcttgcattgtttatttatttaaaatttcgtccct 37656966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19204867 - 19204738
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||  |||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||  |||||    
T  19204867 tccttacaattaggggtggtttaaaaattggttcatgtaatcgctaatccttgcaaactagctttgcaatcattaattatttaaaatttcatcatttgac 19204768  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  19204767 caatttaatcactgccacgtcactaatttg 19204738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32053546 - 32053457
Alignment:
Q  108 caattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||| | ||||||||||||| || ||| |||| | ||||||| |||||||| | || || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32053546 caattagggatcgtttaaaaattggttcctataatcgttaatcctagcaatttatcattgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 32053457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43124547 - 43124466
Alignment:
Q  116 ggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||  || |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  43124547 ggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgctaatccttacaaactacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 43124466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 156
Target Start/End: Original strand, 23608817 - 23608881
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggca 156  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  23608817 atgtgtttagtccttgcaaataggggtcatttaaaaattggtccctgtatttcttaatcctggca 23608881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Original strand, 32298796 - 32298907
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| |       |||||||||||||||||||  |||||    
T  32298796 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaactggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgc-------aatcatttaaaatttcgtcatttgac 32298888  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
    || |||||| | |||||||    
T  32298889 caacttaatcactgccaca 32298907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12229475 - 12229352
Alignment:
Q  108 caattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagctt 207  Q
    |||||||||||  ||||||| ||  | ||| |||||| |||||||| ||| |||  ||| |||   ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||    
T  12229475 caattagaggttatttaaaatttgattcctataattgttaatcctgacaaattattcttgcaaagtttaatcattaaaaatttcgtcccttaacccactt 12229376  T
Q  208 aataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||| | |||||| |||||||||||    
T  12229375 aatgactgccacgtcattaatttg 12229352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18670272 - 18670177
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||| |||||||  |||  |||   ||||||| ||||||||| ||||||    
T  18670272 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaaatggtccctgtattcgttaatccttgcaatttgccctcccaaagtttaatcacttaaaatttggtccct 18670177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 224
Target Start/End: Original strand, 5455854 - 5455968
Alignment:
Q  110 attagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaa 209  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||  ||  |||| |||   |||||||||||||||||| |||||  |||  |||||    
T  5455854 attaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattctctaatccttgcatattgtcctttcaaagtttaatcatttaaaatttcatccctacacccacttaa 5455953  T
Q  210 taattgccacatcat 224  Q
    | | |||||||||||    
T  5455954 ttactgccacatcat 5455968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 3914229 - 3914286
Alignment:
Q  174 ttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  3914229 ttaatcatttaaaatttcgtccctcttccaacttaatcactgccacatcactaatttg 3914286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 194
Target Start/End: Original strand, 47945379 - 47945468
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| || | |||| | ||||||||| ||||  |||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  47945379 ttgcaattggggatcgtttaaaaattggttcatgtattcgctaatccttgcaaactagcattgcaatcattaatcatttaaaatttcgtc 47945468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 194
Target Start/End: Original strand, 47950809 - 47950898
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| || | |||| | ||||||||| ||||  |||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  47950809 ttgcaattggggatcgtttaaaaattggttcatgtattcgctaatccttgcaaactagcattgcaatcattaatcatttaaaatttcgtc 47950898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 29141585 - 29141557
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaatt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29141585 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaatt 29141557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37657187 - 37657151
Alignment:
Q  174 ttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37657187 ttaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaat 37657151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 157
Target Start/End: Original strand, 43123193 - 43123249
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaa 157  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||    
T  43123193 gtccctgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcactaatccttgcaa 43123249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14197009 - 14196898
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14197009 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 14196910  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||| ||||    
T  14196909 aatttcgcccct 14196898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 14196618 - 14196763
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14196618 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaattctggcaatttagctttgcaattgttaatcatttaa 14196717  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | || ||| ||| |||||||    
T  14196718 aatttggtccttggaccaacttaatcactgtcacgtcactaatttg 14196763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 195
Target Start/End: Original strand, 25485956 - 25486065
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25485956 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaagcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 25486055  T
Q  186 aatttcgtcc 195  Q
    ||||| ||||    
T  25486056 aatttggtcc 25486065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25486320 - 25486209
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25486320 ttaatgatatggttagtccttgcaactaagcgtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcccggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 25486221  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  25486220 aatttcgtccct 25486209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 30337468 - 30337563
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  30337468 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattggttaatcatttaaaatttcgtccct 30337563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33517943 - 33517814
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33517943 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaagtagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 33517844  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  33517843 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 33517814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Original strand, 22502777 - 22502909
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  22502777 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccttgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 22502876  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgcca 218  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  22502877 aatttcgtcctttgaccaacttaataactgcca 22502909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31407301 - 31407177
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  31407301 ttaatgatgtgcttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 31407202  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  31407201 aatttcgtcctttgaccaacttaat 31407177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 363220 - 363113
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  363220 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 363121  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  363120 tcgtccct 363113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28000767 - 28000668
Alignment:
Q  98 ttagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28000767 ttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaatttgtctctgtaattgctaattctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 28000668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 17734215 - 17734344
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17734215 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggttcttgtaattgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 17734314  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  17734315 caatttaatcactgccacgtcactaatttg 17734344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 218
Target Start/End: Original strand, 22367463 - 22367560
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgcca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||    
T  22367463 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatttggtcctttgaccaaattaatgattgcca 22367560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30337827 - 30337698
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30337827 tccttgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 30337728  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  30337727 caatttaatcactgccacgtcactaatttg 30337698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 7160807 - 7160931
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| || |  ||||||||||||    
T  7160807 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctggcaatttactcttgcattgtttaatcatttaa 7160906  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  7160907 aatttcgtcctttgaccaacttaat 7160931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 32593493 - 32593601
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  32593493 ttaatgatgtgtttagtcctttcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctataatcgctaatcctgacaatttacccttgcatttgttaatcatttaa 32593592  T
Q  186 aatttcgtc 194  Q
    |||||||||    
T  32593593 aatttcgtc 32593601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30726168 - 30726041
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30726168 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgaaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 30726069  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  30726068 caacttaatcactgccacgtcactaatt 30726041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 362877 - 363018
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  362877 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgttaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 362976  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  362977 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 363018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 6517506 - 6517629
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  6517506 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctttgtaatcgctaatcctggcaattta-ccttgcattgtttaatcatttaa 6517604  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  6517605 aatttcgtcctttgaccaacttaat 6517629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 7905246 - 7905370
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  7905246 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccttgtaatcgttaatcctggcaatttacccttgcattatttaatcatttaa 7905345  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  7905346 aatttcgtcatttgaccaacttaat 7905370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 33517553 - 33517648
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  33517553 tccttgtaattagggatcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 33517648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22503197 - 22503059
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  22503197 ttaataatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccttgtaatcgctaatcctggcaatttatccttgcattgtttaatcatttaa 22503098  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    | |||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  22503097 attttcgtcatttgaccaacttaatcactgccacgtcat 22503059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3059665 - 3059536
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||  |||||    
T  3059665 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcttttgac 3059566  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||  ||| |||||||    
T  3059565 caacttaatcactgccatgtcactaatttg 3059536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 28000392 - 28000533
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  28000392 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctttaattgctaatcctgtcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 28000491  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  28000492 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 28000533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30804270 - 30804141
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | |||||| || ||||  |||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30804270 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattgatccctgtattcgctaattcttgcaaactagcgttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 30804171  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  30804170 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 30804141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12081045 - 12080937
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12081045 tccttgcaattaggagtcgtttaaaaatttgtccctgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 12080946  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  12080945 caacttaat 12080937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21836453 - 21836329
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  ||| |||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  21836453 ttaatgatgtgtttcatccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagttcttgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 21836354  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  21836353 aatttcgtcctttgaccaacttaat 21836329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 12080655 - 12080750
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12080655 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattgctccctgtaatcgctaatcatggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 12080750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21628122 - 21628027
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  21628122 tccttgcaattaggggtcgcttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 21628027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22373065 - 22372978
Alignment:
Q  103 ccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaattt 190  Q
    ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | |||||||||||||||||||||||    
T  22373065 ccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaatcctgcaattgttaatcatttaaaattt 22372978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7905666 - 7905528
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| || |  |||||||||| |    
T  7905666 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggtgtcatttataaatttgtccctataatcgctaattctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttca 7905567  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  7905566 aatttcgtcatttgaccaacttaatcactgccacgtcat 7905528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 681137 - 681044
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  681137 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcc 681044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Original strand, 30725781 - 30725873
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  30725781 cttgcaattag-ggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcctgccaatttacccttgcactgtttaatcatttaaaatttcgtccct 30725873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33647360 - 33647243
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33647360 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactaaccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 33647261  T
Q  202 cagcttaataattgccac 219  Q
     | |||||| | ||||||    
T  33647260 aaacttaatcactgccac 33647243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 31406881 - 31407005
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||  |||| || |  ||||||||||||    
T  31406881 ttaataatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgttaatcctggtaatttgtccttgcattatttaatcatttaa 31406980  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||    
T  31406981 aatttcgtcctttgacaaacttaat 31407005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13379887 - 13379796
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13379887 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaattcttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtccct 13379796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 21836035 - 21836149
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  21836035 ttaatgatgtgtttcgttcttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtct-tgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 21836133  T
Q  186 aatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||| |||||    
T  21836134 aatttcgtcctttgac 21836149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 26463202 - 26463293
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  26463202 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgttaatcctggcaaattacccttgcaaagtttaatcatttaaaatttcgtccct 26463293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 679885 - 679978
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  679885 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcc 679978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7161212 - 7161103
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttga 200  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||  ||||    
T  7161212 gtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctataatcactaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcatttga 7161113  T
Q  201 ccagcttaat 210  Q
    ||| ||||||    
T  7161112 ccaacttaat 7161103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 11434821 - 11434950
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| | ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11434821 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatcgttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 11434920  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |   ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  11434921 ccagttaatcactgccacgtcactaatttg 11434950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 15115358 - 15115451
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||| |||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||    
T  15115358 tccttgcaattagagatcgtttaaaaattggtccctataatcgttaatccttgcaaattagccttgcaaagtttaatcatttaaaatttagtcc 15115451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Original strand, 21627748 - 21627861
Alignment:
Q  118 tcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgcc 217  Q
    |||||||||||||  ||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||    
T  21627748 tcgtttaaaaattgatccatgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaatcactgcc 21627847  T
Q  218 acatcattaatttg 231  Q
    || ||| |||||||    
T  21627848 acgtcactaatttg 21627861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 198
Target Start/End: Original strand, 8089466 - 8089558
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccctt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||| ||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||    
T  8089466 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctataatcgttaatccttgcaaattacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccctt 8089558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 3059276 - 3059371
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  3059276 tccttgcaattaagggtcgtttaaaatattgtccatgtaatcgctaatcctagcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 3059371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 30803880 - 30803975
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||  ||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  30803880 tccttgcaactaggtgtcgtttaaaaattgatctatgtaatcgttaatcctggcaatttacccttacattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 30803975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15116642 - 15116546
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||    
T  15116642 gtccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtcctcgtaatcgctaatccttgcaaactagccttgcaaagtttaatcatttaaaaattggtccct 15116546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 15913551 - 15913659
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||||  ||| |||||||||| |||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  15913551 ttaatgatgtgtttcgttattgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctttgtaattgctaattctggtaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 15913650  T
Q  186 aatttcgtc 194  Q
    |||||||||    
T  15913651 aatttcgtc 15913659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8090336 - 8090241
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||| |||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  8090336 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtattcactaatccttgcaaattacccttgcaaagtttaatcatttaaaatttggtccct 8090241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11393206 - 11393095
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagctta 208  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  11393206 aattaggggtcgtttaaaaattggtccccgtattcgctaatccttgcaaactagacttgcaatcattaatcatttcaaatttcgtcatttgaccaactta 11393107  T
Q  209 ataattgccaca 220  Q
    || | |||||||    
T  11393106 atcactgccaca 11393095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20652052 - 20651961
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |  |||||||| ||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20652052 tgcaattatgggtcgtttaaaaattgatccctgtattcactaatccttgcaaaccagccttgcaatcgttaatcatttaaaatttcgtccct 20651961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Original strand, 20651033 - 20651122
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20651033 tgcaattagggatcgtttaaaaattggttcctgtattcgctaatccttgcaaaccagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcc 20651122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Original strand, 33646982 - 33647074
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| || ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  33646982 tccttacaattaagggtcgtttaaaaagtgatccctgtaatcgctaatcttgccaatttacccttgcattatttaatcatttaaaatttcgtc 33647074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17734572 - 17734477
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||  ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  17734572 tccttacaattatgggtcgtttaaaaattgatccatgtaatcgctaatcctatcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 17734477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11436006 - 11435956
Alignment:
Q  174 ttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  11436006 ttaatcatttaaaatttcgtcccttgacccacttaatcattgccacgtcat 11435956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Original strand, 11392872 - 11392949
Alignment:
Q  117 gtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||   |||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  11392872 gtcgtttaaaaattggtccttgtaatcgctaatcctaataatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 11392949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28498444 - 28498339
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| ||||||||| | || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  || |||  |||   |||||||||||||||||     
T  28498444 atgtgtttcgtccctgcaattagggctcatttaaaaattggtccttgtaatcgctaatcctggcaaactaccctcccaaagtttaatcatttaaaatttg 28498345  T
Q  192 gtccct 197  Q
    ||||||    
T  28498344 gtccct 28498339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 197
Target Start/End: Original strand, 24210557 - 24210645
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||| ||| |||| |||   |||||||||||||||||| |||||    
T  24210557 aattaggggtcatttaaaaattggtctctgtaattgttaatcatagcaaattacccttgcaaagtttaatcatttaaaatttcatccct 24210645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 141159 - 141060
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||| | ||||||| |||| |||  ||| |||   ||||||||||||||||||    
T  141159 atgtgtttcgtccttgcaattagatgttatttaaaaatttgttcctgtaatcgttaatccttgcaaattactcttgcaaaaattaatcatttaaaatttc 141060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 149180 - 149081
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||| | ||||||| |||| |||  ||| |||   ||||||||||||||||||    
T  149180 atgtgtttcgtccttgcaattagatgttatttaaaaatttgttcctgtaatcgttaatccttgcaaattactcttgcaaaaattaatcatttaaaatttc 149081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26464604 - 26464550
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaattt 160  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26464604 tgcaattaggggtcatttaaaaaatggtccctgtatttgttaatcctggcaattt 26464550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 166
Target Start/End: Original strand, 10781150 - 10781230
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagcctt 166  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||| | || || |||||||||| ||||    
T  10781150 ttaatgatgtgtttcgtccttacaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgcaatcgttattcgtggcaatttaccctt 10781230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12408580 - 12408492
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaattt 190  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| || |||| |||| | ||||||||| |||| ||| |||| |||   |||||||||||||||||    
T  12408580 tccttacaattaggggttgtttaaaagttggtccttgtattcgctaatccttgcaaattatccttgcaaagtttaatcatttaaaattt 12408492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 106)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 24905170 - 24905315
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24905170 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatccttgcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 24905269  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  24905270 aatttggtccttggaccaacttaatcactgccacgtcactaatttg 24905315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28011762 - 28011617
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28011762 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaa 28011663  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||| | || ||| ||| |||||||    
T  28011662 aatttggtccttggaccaacttaatcactgtcacgtcactaatttg 28011617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24905560 - 24905450
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24905560 ttaatgatgtgattagtccttgcaattatggatcgtttaaaaattcgtcc-tgtaattgctaatcctggcaatttagccctgcaattgttaatcatttaa 24905462  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  24905461 aatttcgtccct 24905450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 197
Target Start/End: Original strand, 28011390 - 28011477
Alignment:
Q  110 attagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28011390 attaggggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgcaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 28011477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 17188957 - 17189081
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  17188957 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattatttaatcatttaa 17189056  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  17189057 aatttcgtcatttgaccagcttaat 17189081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33442984 - 33442877
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  33442984 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 33442885  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  33442884 tcgtccct 33442877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 49955350 - 49955488
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  49955350 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcatcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 49955449  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  49955450 aattttgtcctttgaccaacttaatcactgccacatcat 49955488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 37929421 - 37929545
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  37929421 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgttatcgctaatcctgacaatttacccttacattatttaatcatttaa 37929520  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  37929521 aatttcgtcctttgaccaacttaat 37929545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 6367581 - 6367676
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6367581 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 6367676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Original strand, 34464468 - 34464595
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  34464468 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaatcttggcaatttacccttgcaatgtttaatcatttaaaatttcgtcatttgac 34464567  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  34464568 caacttaatcactgccacgtcactaatt 34464595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 40714447 - 40714585
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  40714447 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 40714546  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  40714547 aatttcgtcatttgaccaacttaatcactgccacgtcat 40714585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6367971 - 6367842
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6367971 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 6367872  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  6367871 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 6367842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26024801 - 26024672
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26024801 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 26024702  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    ||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  26024701 caatttaatcactgccacgtcactaatttg 26024672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20760928 - 20760804
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  20760928 ttaatgatgtgtttcgtccttacaattaggcgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 20760829  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  20760828 aatttcgtcctttgaccaacttaat 20760804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40714866 - 40714742
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||    
T  40714866 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcctggcaatttacctttgcattgtttaatcatttaa 40714767  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  40714766 aatttcgtcctttgaccaacttaat 40714742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31514707 - 31514600
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  31514707 tgatgtgtttagcccttacaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattattaatcatttaaaatt 31514608  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  31514607 tcgtccct 31514600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 183240 - 183369
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  183240 tccttacaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 183339  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  183340 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 183369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1103870 - 1103741
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1103870 tccttgcaattaaaggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 1103771  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||| | | |||||| ||| |||||||    
T  1103770 caacttattcactgccacgtcactaatttg 1103741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 13914087 - 13914216
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13914087 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattagtccatgtattcgctaatccttgcaaattagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 13914186  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | | |||| ||| |||||||    
T  13914187 caacttaatcactaccacgtcactaatttg 13914216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17189274 - 17189173
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  17189274 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 17189175  T
Q  186 aa 187  Q
    ||    
T  17189174 aa 17189173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30711736 - 30711607
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  30711736 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcatttgac 30711637  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  30711636 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 30711607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 33442601 - 33442742
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  33442601 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtctctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 33442700  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  33442701 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 33442742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Original strand, 47999142 - 47999259
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  47999142 tccttgcaattagggatcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 47999241  T
Q  202 cagcttaataattgccac 219  Q
    || |||||| ||||||||    
T  47999242 caacttaattattgccac 47999259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49723135 - 49723006
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  49723135 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactagcctttcaatcattaatcatttaaaatttcatcctttgac 49723036  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  49723035 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 49723006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52134458 - 52134317
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  52134458 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgttaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 52134359  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  52134358 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 52134317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12906082 - 12905958
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  || |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  12906082 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaatttgacatcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 12905983  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  12905982 aatttcgtcatttgaccaacttaat 12905958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 31050953 - 31051077
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | || || |  ||||||||||||    
T  31050953 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgttatttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctggcaatttacctttgcattgtttaatcatttaa 31051052  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  31051053 aatttcgtcctttgaccaacttaat 31051077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35041037 - 35040913
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  35041037 ttaatgatgtgtttcgtccttgtaattagccgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 35040938  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  35040937 aatttcgtcctttgaccaacttaat 35040913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 35473650 - 35473758
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||  |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  35473650 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaaactagccttgtaatcattaaacatttaaaattttgtcctttgac 35473749  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  35473750 caacttaat 35473758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 37578211 - 37578319
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||    
T  37578211 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttccaatcattaatcatttaaaatttcgttctttgac 37578310  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  37578311 caacttaat 37578319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 49955770 - 49955646
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  49955770 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctttgtaatcgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 49955671  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  49955670 aatttcgtcctttgaccaacttaat 49955646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 197
Target Start/End: Original strand, 1103481 - 1103575
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaat--tcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  1103481 ttgcaattagaggtcgtttaaaaatattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 1103575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13914476 - 13914381
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  13914476 tccttgcaattagaggttgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgtattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 13914381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 25647903 - 25647998
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  25647903 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggcaatttacccctgcattatttaatcatttaaaatttcgtccct 25647998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 35152362 - 35152457
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  35152362 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattggtccctataatcgctaatactgccaatttacccttacattgtttaatcatttaaaattttgtccct 35152457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Original strand, 52134075 - 52134182
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||| |||||||||    
T  52134075 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggtatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgtaattgttaatcgtttaaaatt 52134174  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  52134175 tcgtccct 52134182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4960913 - 4960800
Alignment:
Q  107 gcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagct 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  4960913 gcaattagaggtcgtttaaaaattggtccccgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgatcaact 4960814  T
Q  207 taataattgccaca 220  Q
    |||| | |||||||    
T  4960813 taatcactgccaca 4960800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 7820973 - 7821102
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7820973 tccttgcaattaggggtcctttaataattagtccctgtaatcgctaatccttacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcctttgac 7821072  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || | |||| | |||||| ||| |||||||    
T  7821073 caacgtaatcactgccacgtcactaatttg 7821102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Original strand, 26024444 - 26024537
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||| |||||||||    
T  26024444 cttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaagttcgtccct 26024537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43759231 - 43759102
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  43759231 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaatcggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcttcaatcatttaaaatttcgtcctttgac 43759132  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||  | || ||||||| |||||||    
T  43759131 caacttaaccactgtcacatcactaatttg 43759102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23209736 - 23209641
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgtt-aatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23209736 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgca-ttgttcaatcatttacaatttcgtccct 23209641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 14878990 - 14879085
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  14878990 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggttcatgtaatcgctaatcttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 14879085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19018038 - 19017943
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19018038 tccttgcaattacaggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatcctggcaatttacccttgcattatttaatcatttaaaattttgtccct 19017943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32917667 - 32917540
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32917667 cttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgttaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcctttgacca 32917568  T
Q  204 gcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
     |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  32917567 acttaatcattgccacgtcactaatttg 32917540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34464858 - 34464763
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  34464858 tccttgcaattaggggttgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaatcttggcaatttacccttgcaatgtttaatcatttaaaattttgtccct 34464763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 40772526 - 40772621
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  40772526 tccttgcaattatgggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctgacaatttactcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 40772621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48779528 - 48779401
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  48779528 tccttgcaattaggagtcgcttaaaaattagtccatgtatttgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 48779429  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  48779428 caacttaatcactgccacgtcactaatt 48779401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 4716475 - 4716616
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||   |||||||||||| |||||||||    
T  4716475 tgatgtgtttagcccttgcaattaggtggcatttaaaaattcgtccatgtaattgctaatcctgacattttaacccggcaattgttaatcgtttaaaatt 4716574  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  4716575 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 4716616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24009950 - 24009821
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||   |    
T  24009950 tccttgcaattagggatcgtttaaaaattggtcattgtaatcgccaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccctctcc 24009851  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |  |||||| | |||||||||| |||||||    
T  24009850 ccacttaatcactgccacatcactaatttg 24009821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 31514325 - 31514466
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  31514325 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgttcctgtaattgttaattctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 31514424  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  31514425 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 31514466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 40210389 - 40210518
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40210389 tccttgcaattagtggtcgtttaaaatttggtctttgtattcgctaatccttgcaaactagacttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 40210488  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | ||||||  ||||||||||    
T  40210489 caacttaatcactgccacgacattaatttg 40210518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 17661871 - 17661978
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  |||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17661871 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtcc-tgtattcgctaatccttgcaaactagcattgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 17661969  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  17661970 caacttaat 17661978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Original strand, 17691237 - 17691333
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  17691237 gtccttacaagtaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatccttgcaaattagtcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 17691333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37578601 - 37578509
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  37578601 tccttgcaattgggggtcgtttaaaaattggtttttgtaatcgctaatcctggcaatttacccttacattgattaatcatttaaaatttcgtc 37578509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 196
Target Start/End: Original strand, 41098754 - 41098846
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| |||||    
T  41098754 cttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaattttgtccc 41098846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41099142 - 41099034
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||  || |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  41099142 tccttacaattagtggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgctaatccttgcaaactaaccttacaatcattaatcatttaaaatttcgtcatttgac 41099043  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  41099042 caacttaat 41099034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17662259 - 17662164
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  17662259 tccttgcaatttggggtcgtttaaaaattggttcctttaatcgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 17662164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 34849030 - 34849125
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  34849030 tccttgcaattaggggtcttttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaattacccttgcaaaatttaatcatttaaaatttcgtccct 34849125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34850474 - 34850379
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||| |||   |||||||||||||||||| |||||    
T  34850474 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaattacccttgcaaaatttaatcatttaaaatttcatccct 34850379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 42248492 - 42248587
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | ||||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  42248492 tccttgcaattagtggtcgtttaaaaattggtctttgtagtcgctaatcgtggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 42248587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47999501 - 47999406
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || | || |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  47999501 tccttgtaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcttggcaatttacccctgcattatttaatcatttaaaatatcgtccct 47999406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17692594 - 17692500
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccc 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||| ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||    
T  17692594 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaatcggtccctgttatcgctaatccttgcaaattagctttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccc 17692500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 28324808 - 28324945
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| || || | |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  28324808 ttaatgatgtgtttcctccttgcaattaggcgtcgtttaaaa-ttagttcatgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattatttaatcatttaa 28324906  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  28324907 aatttcgtcttttgaccaacttaatcactgccacgtcat 28324945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 192
Target Start/End: Original strand, 30326499 - 30326605
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  30326499 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgctaattctggtaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 30326598  T
Q  186 aatttcg 192  Q
    |||||||    
T  30326599 aatttcg 30326605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31058480 - 31058342
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||| |||  |||||| | ||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  31058480 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacatcatttaaaaattagtcaatgtaatcgataatcttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 31058381  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    ||||||||   ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  31058380 aatttcgtattttgaccaacttaatcactgccacgtcat 31058342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32558530 - 32558416
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||||  |||||| ||||  |||  ||||||||||||    
T  32558530 ttaatgatgtgttttgtccttacaattagacgtcatttaaaaattagttcctataatcgctaatcctgataatttacccttgtaatgtttaatcatttaa 32558431  T
Q  186 aatttcgtcccttga 200  Q
    |||||||||| ||||    
T  32558430 aatttcgtcctttga 32558416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45750265 - 45750127
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||  ||| || |  ||||||||||||    
T  45750265 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctttgtaatcgctaatcctagcaatttactcttgcattgtttaatcatttaa 45750166  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||| ||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  45750165 aatttcatcatttgaccaacttaatcactgccacgtcat 45750127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 183586 - 183505
Alignment:
Q  116 ggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  183586 ggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctagcaatttacccctgcattatttaatcatttaaaatttcgtccct 183505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1841867 - 1841739
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||  |||| || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1841867 tccttgtaatgaggggtcgtttaaaaattgttccctgtattcgctaatccttgcaaactagc-ttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 1841769  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  1841768 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 1841739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 203
Target Start/End: Original strand, 8898520 - 8898637
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||  |||  | |  ||||||||||||    
T  8898520 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtcactgtaatcgctaattctggtaatttactcttgtattgtttaatcatttaa 8898619  T
Q  186 aatttcgtcccttgacca 203  Q
    |||||||||| |||||||    
T  8898620 aatttcgtcctttgacca 8898637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 194
Target Start/End: Original strand, 46163056 - 46163141
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  46163056 aattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 46163141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8898940 - 8898816
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||  ||||| ||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  8898940 ttaatgatgtgtttcgtccttgtaattaggcgtcatttaaaaattagtctctgtaatcactaatactgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 8898841  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  8898840 aatttcgtcatttgaccaacttaat 8898816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 24009594 - 24009702
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||| || |  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24009594 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccttgtattcactaatccttgccaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcctttgac 24009693  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  24009694 caacttaat 24009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 36694301 - 36694409
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  36694301 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctatgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgccctttgac 36694400  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  36694401 caacttaat 36694409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36694657 - 36694565
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  36694657 tccttgcaattaggtgttgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 36694565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Original strand, 36710402 - 36710510
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  36710402 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctatgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgccctttgac 36710501  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  36710502 caacttaat 36710510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36710758 - 36710666
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  36710758 tccttgcaattaggtgttgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 36710666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40210776 - 40210684
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  40210776 ttgcaattaggggccgtttaaaaattggtctttgtaatcgctaattctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 40210684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 30711346 - 30711441
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || || |||| ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  30711346 tccttgcaattaggggttgtttaaaaattgatctctataatcgctaatcctagcaatttatccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 30711441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Original strand, 7371293 - 7371431
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||| ||| || |||| |||||| |||| || |  ||||| ||||||    
T  7371293 ttaatgatatgtttcgtccttgcaattaggtgtcatttaaaaattagtttctgtaatcgctgattctggtaatttatccttgcattgtttaattatttaa 7371392  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  7371393 aatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 7371431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 194
Target Start/End: Original strand, 1841493 - 1841570
Alignment:
Q  117 gtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  1841493 gtcgtttaaaaattggtctccgtaatcgctaatcctgacaatttacccttacattgtttaatcatttaaaatttcgtc 1841570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4716826 - 4716754
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4716826 tttaaaaatttgtcc-tgaaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatttcgtc 4716754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 32917279 - 32917408
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||  ||| || |  ||||||||||||||||||||| ||   |    
T  32917279 tccttgcaattaggaatcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctgacagtttactcttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtctctctcc 32917378  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |  |||||| | |||||||||| |||||||    
T  32917379 ccacttaatcactgccacatcactaatttg 32917408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 197
Target Start/End: Original strand, 4960562 - 4960654
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||  |||| | ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  4960562 ttgcaattaggggtcgtttaaaaattgctctttgtattcgctaatccttgcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 4960654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 197
Target Start/End: Original strand, 5734028 - 5734123
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||| |||| ||| || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5734028 gtccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggt-catgtaatcgctaatccttgcaaattagtcttgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 5734123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 45749845 - 45749969
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| | |||||||| |||||||  ||| || |  ||||||||||||    
T  45749845 ttaatgatgtgtttcatccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtctttgtaatcgttaatcctgacaatttacacttgcattgtttaatcatttaa 45749944  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||    
T  45749945 aatttcgtcctttgacaaacttaat 45749969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5735104 - 5735025
Alignment:
Q  118 tcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| || | |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5735104 tcgtttaaaaattggttcatgtattcgctaatccttgcaaactagccttacaatcattaatcatttaaaatttcgtccct 5735025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 19515838 - 19515933
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| | |||| |||| |||||| |||| || |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  19515838 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctttgtaatcgttaattctggaaatttacccttgcattgtttaattatttaaaatttcgtccct 19515933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 46899084 - 46899175
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||| || ||||  |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  46899084 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaattcttgcaaactagctttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtccct 46899175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7821359 - 7821234
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| ||||  ||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  7821359 ttgcaattaaaggtcgtttaaaaattggtca-tgtattcgctaatccttgcaaactagccgtgcaatcattaatcatttataatttcgtcctttgaccaa 7821261  T
Q  205 cttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |||||| | || ||| ||| |||||||    
T  7821260 cttaatcactgtcacgtcactaatttg 7821234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 19017648 - 19017777
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  |  ||||| | |||||||||  |||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||    
T  19017648 tccttgcaattaggggttgtttaaaaattgatttctgtattcgctaatccttacaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgttcgttgac 19017747  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  19017748 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 19017777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 197
Target Start/End: Original strand, 32132329 - 32132418
Alignment:
Q  108 caattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| |||  |||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  32132329 caattagtggtcatttaaaaattcgtccatgtaatcgttaatccttgcaaattactcttacaaagtttaatcaattaaaatttcgtccct 32132418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28325226 - 28325103
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| | ||||  |||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  28325226 ttaatgatgtgtttcggccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtca-tgtaatcgttaattatggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 28325128  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||    
T  28325127 aatttcgtcttttgaccaacttaat 28325103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44523561 - 44523450
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||   || ||||||||||  |  || |||| ||||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  44523561 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcctcatttaaaaattaatatctataatcgctaatcatggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 44523462  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||    
T  44523461 aatttcatccct 44523450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 32133313 - 32133239
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||  |||   ||||||||||||||||||||||    
T  32133313 tttaaaaattcgtccttgtaatcgttaatcttggcaaattagcctcgcaaagtttaatcatttaaaatttcgtcc 32133239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48692416 - 48692323
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||| | | |||| || |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  48692416 aattagaggtcgtttaaaaattgatcattgtattcgttaattcttgcaaattagccttacaaacattaatcatttaaaattttgtctcttgacc 48692323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 35152739 - 35152683
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaat 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  35152739 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattagtctctgtattcgctaatccttgcaat 35152683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7371592 - 7371529
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaat 149  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  7371592 ttaacgatgtgtttcgtccttgcaattagacgtcatttaaaaattagtctctgtaatcgctaat 7371529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14879308 - 14879253
Alignment:
Q  174 ttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||| |||||    
T  14879308 ttaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcactaatt 14879253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35152680 - 35152625
Alignment:
Q  174 ttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||| |||||    
T  35152680 ttaatcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaatcactgtcacatcactaatt 35152625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 46900005 - 46899914
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| |||  |||| | |||||| || ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  46900005 tgcaattaagggtcatttaaaaattggtcaatgtattcgctaattcttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtccct 46899914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 210
Target Start/End: Original strand, 19322925 - 19323019
Alignment:
Q  116 ggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||  || | || ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  19322925 ggtcgtttaaaaattcgttcatgtattcgctaatccttgcaaactaactttgcaatcattaatcatttaaaagttcgttctttgaccaacttaat 19323019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19323285 - 19323193
Alignment:
Q  118 tcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||  || | || ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  19323285 tcgtttaaaaattcgttcatgtattcgctaatccttgcaaactaactttgcaatcattaatcatttaaaagttcgttctttgaccaacttaat 19323193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25885416 - 25885360
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaat 142  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||    
T  25885416 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccttgtaat 25885360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 40772868 - 40772812
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaat 158  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  40772868 tccttgcaattaggggtcgtttgaaaatcggtccctgtattcgctaatccttgcaat 40772812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 158
Target Start/End: Original strand, 42533043 - 42533099
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaat 158  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||| |||||    
T  42533043 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattagtccatgtattcgttaatccttgcaat 42533099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 72)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14900875 - 14900766
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  14900875 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggggtcgtttaaaaatttgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttgta--tgttaatcatttaa 14900778  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||    
T  14900777 aatttcgtccct 14900766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 1695747 - 1695888
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  1695747 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 1695846  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| |||||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  1695847 tggtcctttgaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 1695888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6658256 - 6658127
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6658256 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttacaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 6658157  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  6658156 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 6658127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Original strand, 33739710 - 33739817
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  33739710 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 33739809  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  33739810 tcgtccct 33739817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44714170 - 44714075
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44714170 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattagtccctgtaattgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 44714075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 13995680 - 13995821
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  13995680 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 13995779  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| |||||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  13995780 tggtcctttgaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 13995821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 41248566 - 41248707
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  41248566 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcatccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 41248665  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| |||||||  ||||| | |||||||||| |||||||    
T  41248666 tggtcctttgaccaaattaatcactgccacatcactaatttg 41248707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 15604342 - 15604466
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  15604342 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggtgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 15604441  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  15604442 aatttcgtcctttgatcaacttaat 15604466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15604762 - 15604638
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  15604762 ttaatgatgtgttttgtccttgcaattaggtgtcatttaaaaactagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 15604663  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  15604662 aatttcgtcctttgaccaacttaat 15604638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28226167 - 28226043
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  28226167 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 28226068  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||    
T  28226067 aatttcgtactttgaccaacttaat 28226043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13996063 - 13995956
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  13996063 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 13995964  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  13995963 tcgtccct 13995956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33062440 - 33062333
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||| ||||    
T  33062440 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttataatt 33062341  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  33062340 tcgtccct 33062333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 33062057 - 33062198
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  33062057 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 33062156  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  33062157 tggtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 33062198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33740093 - 33739952
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  33740093 tgatgtgtttagcccttacaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 33739994  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||||||| |||||||    
T  33739993 tggtccttggaccaaattaatcactgccacatcactaatttg 33739952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 11830367 - 11830475
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  11830367 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacgtcatttaaaaattagtccctgtaattgctaatcctaacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 11830466  T
Q  186 aatttcgtc 194  Q
    |||||||||    
T  11830467 aatttcgtc 11830475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13692629 - 13692521
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13692629 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 13692530  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  13692529 caacttaat 13692521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36755497 - 36755389
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36755497 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctataatcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 36755398  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  36755397 caacttaat 36755389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1696130 - 1696023
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  1696130 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgttcctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 1696031  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  1696030 tcgtccct 1696023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 15848107 - 15848202
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  15848107 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggtaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 15848202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41248949 - 41248842
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  41248949 tgatgtgtttaacccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 41248850  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  41248849 tcgtccct 41248842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8710891 - 8710753
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  8710891 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 8710792  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || | |||||| ||||    
T  8710791 aatttcgtcctttgaccaactttatcactgccacgtcat 8710753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10713132 - 10713003
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10713132 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtttctgtattcgctaatccttgcaaattagccttgcaatcgttaatcatttaaaatgtcgtcctttgac 10713033  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  10713032 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 10713003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16099433 - 16099304
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16099433 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcactaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgac 16099334  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  16099333 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 16099304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Original strand, 37895366 - 37895495
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37895366 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcatcctttgac 37895465  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  37895466 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 37895495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 8342190 - 8342314
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  8342190 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaagcgtcatttaaaaattagtctatgtaattggtaatcctggcaatttatccttgcattgtttaatcatttaa 8342289  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  8342290 aatttcgtcctttgaccaacttaat 8342314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11163432 - 11163337
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  11163432 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacctctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 11163337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 39498329 - 39498424
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  39498329 tccttgtaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctggcaatttacccctacattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 39498424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 11163076 - 11163202
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  11163076 ttgcaattaaaggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttagtcctttgaccaa 11163175  T
Q  205 cttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  11163176 cttaatcactgccacgtcactaatttg 11163202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 159
Target Start/End: Original strand, 14900499 - 14900572
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14900499 ttaatgatgtgattagtccttgcaattaggcgtcattcaaaaattcgtccctgtaattgctaatccttgcaatt 14900572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41588481 - 41588357
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||||||||    
T  41588481 ttaataatgtgtttcgtccttacaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgctaattctggcaatttacacttacattgtttaatcatttaa 41588382  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  41588381 aatttcatcctttgaccaacttaat 41588357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 25230125 - 25230216
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25230125 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaattactaatcatttaaaatttcgtccct 25230216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36480127 - 36480000
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36480127 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccctatattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaataatttaaaatttcgtcctttgac 36480028  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  36480027 caacttaatcactgccacgtcactaatt 36480000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 45556131 - 45556226
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  45556131 tccttgcaattagggatcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttatccctgcattgtttaatcatttaaaattttgtccct 45556226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22051400 - 22051310
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  22051400 cttgcaattagaggttgtttaaaaattagtctctgtaatcgctaatcctagcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 22051310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36382536 - 36382418
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  36382536 tccttgcaattaagggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccatgcaaactagtcttgcaatcgttaatcatttaaaatttcgtcctttggc 36382437  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
    || |||||| | |||||||    
T  36382436 caacttaatcactgccaca 36382418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Original strand, 16099076 - 16099169
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  16099076 cttgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatcactaatcctggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 16099169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34448204 - 34448075
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || | | ||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34448204 tccttgcaattaggggttgtttaaaaattggtccctatattcgttaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 34448105  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  34448104 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 34448075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 202
Target Start/End: Original strand, 6588702 - 6588802
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6588702 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcattctttaatcatttaaaatttcgtcctttgac 6588801  T
Q  202 c 202  Q
    |    
T  6588802 c 6588802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 6657897 - 6657992
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6657897 tccttgcaatttggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcactaatcatggcaatttacccctgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 6657992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 36382180 - 36382275
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  36382180 tccttgcaattagggttcgtttaaaaattggtccctataatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcatccct 36382275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39423924 - 39423797
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||  ||| ||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39423924 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattgatccctatattcgctaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaattttgtcctttgac 39423825  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||    
T  39423824 caacttaatcactgccacgtcactaatt 39423797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44045407 - 44045316
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  44045407 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaattttgtccct 44045316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25231253 - 25231131
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagc 205  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||| ||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||| ||       
T  25231253 tgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatcctagcaaattacccttgcaaactttaatcatttaaaatttcgtcccttgtcccag 25231154  T
Q  206 ttaataattgccacatcattaat 228  Q
    ||||| | |||||| ||||||||    
T  25231153 ttaatgactgccacgtcattaat 25231131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39498688 - 39498562
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||| |||||    
T  39498688 tccttgcaattagggatcgtttaaaaattggtccatgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttaatcctttgac 39498589  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaat 228  Q
    || |||||| | |||||| ||| ||||    
T  39498588 caacttaatcactgccacgtcactaat 39498562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 220
Target Start/End: Original strand, 44713814 - 44713932
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44713814 tccttgtaattaagggtcgtttaaaaattggtcaatgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 44713913  T
Q  202 cagcttaataattgccaca 220  Q
    || |||||| | |||||||    
T  44713914 caacttaatcactgccaca 44713932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 202775 - 202670
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| || |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  202775 atgtgttttgtccctgtaattaggggtcatttaaaaattcgtccatgtaatcgttaatcctggcaaattagccttgcagagtttaatcatttaaaatttc 202676  T
Q  192 gtccct 197  Q
    ||||||    
T  202675 gtccct 202670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15848497 - 15848368
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||| | ||||||||| || |  || |||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15848497 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtttatgtattcgctaatccttgcgaactaaccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 15848398  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  15848397 caacttaatcactgccacgtcactaatttg 15848368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 2318178 - 2318272
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  2318178 tccttgcaattag-ggtagtttaaaaattggtctatgtaatcgctaattctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 2318272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Original strand, 6573050 - 6573160
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  6573050 ttaatgatgtgtttcgtccctgcaattaggcgtcatttaaaaatttgtccatgtaatcgctaatcttggcaattta-ccttgcattgtttaatcatttaa 6573148  T
Q  186 aatttcgtccct 197  Q
    || |||||||||    
T  6573149 aaattcgtccct 6573160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37895756 - 37895661
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||  ||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  37895756 tccttgcaattatgggtcgtttaaaaaatggttcccgtaatcgctaatcctggcaatttacacttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 37895661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 39423534 - 39423629
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||  | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  39423534 tccttgtaattacgggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgctaattctggcaatttatccttgtattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 39423629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Original strand, 36479740 - 36479830
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||| |||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  36479740 ttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccatgtaatcgctaatcttagcattttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtcc 36479830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9076474 - 9076349
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacca 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| | | ||||||| ||||  ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||  || ||||    
T  9076474 cttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctccgtattcgttaatccttgcaaactagtcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcatttaacca 9076375  T
Q  204 gcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
     |||||| | |||||||||| |||||    
T  9076374 acttaatcactgccacatcactaatt 9076349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 194
Target Start/End: Original strand, 36755119 - 36755204
Alignment:
Q  109 aattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||||  ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  36755119 aattagaggtcgtttaaaaattggttcatgtaaccgctaatcctaacaatttacccttacattgtttaatcatttaaaatttcgtc 36755204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 197
Target Start/End: Original strand, 6573546 - 6573657
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattg-ttaatcattta 184  Q
    ||||||||||| ||  ||| | |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  6573546 ttaatgatgtgtttcatccctccaattaggcgtcatttaaaaattcgtccatgtaatcgctaatcctggcaatttaccctt-gaattgtttaatcattta 6573644  T
Q  185 aaatttcgtccct 197  Q
    ||| || ||||||    
T  6573645 aaaatttgtccct 6573657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8342602 - 8342478
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||   |||||||| ||||||| |||| || |  ||||| ||||||    
T  8342602 ttaatgatgtgtttcgtccttacaattaggcgtcatttaaaaattagtctctgtaatcaataatcctgacaatttacccttgcattgtttaattatttaa 8342503  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    
T  8342502 aatttcgtcctttgaacaacttaat 8342478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 202
Target Start/End: Original strand, 30729640 - 30729740
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||| ||  |||| || |  |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30729640 tccttgcaattagacgtcgtttaaaaattggtccctatattcgctaatccttgcaaattgcccttgcattctttaatcgtttaaaatttcgtcctttgac 30729739  T
Q  202 c 202  Q
    |    
T  30729740 c 30729740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 45556456 - 45556348
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||| |||||    
T  45556456 tccttgtaattaggggtcgtttaaaaattggtcgctgtattcgctaatctttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttaatcctttgac 45556357  T
Q  202 cagcttaat 210  Q
    || ||||||    
T  45556356 caacttaat 45556348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 10712742 - 10712837
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | ||||   |||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  10712742 tccttgcaattagggttcgtttaaaaattggtccttataatcattaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcatccct 10712837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 3555269 - 3555362
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcc 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | | || ||||  ||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  3555269 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctgtattcgttattccttacaaattagccttgcattctttaatcatttaaaatttcgtcc 3555362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3556418 - 3556329
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||  ||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  3556418 tccttgcaattatgggtcgtttaaaaattggtctctgtaatcgttaatccttgcaaactagccttgcattctttaatcatttaaaatttc 3556329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 25892432 - 25892508
Alignment:
Q  121 tttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||| |||||||||    
T  25892432 tttaaaaatttgtccatgtaatcgctaatcctggcaaattacccttccattgtttaatcatttaaaaattcgtccct 25892508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39936665 - 39936534
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| |||||||||  || |||||||| || |||| |||||| | |||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||    
T  39936665 atgtgtttcgtccctgcaattaggcgtggtttaaaa-ttggtccttgtaatcgttaatcctggcaaattacccttgcaaagtttaatcatttaaaatttc 39936567  T
Q  192 gtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||| |||||||  ||||| | |||||| ||||    
T  39936566 gtcctttgaccaatttaatcaatgccacgtcat 39936534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 41587238 - 41587361
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||| |||| |||||| | ||||||||| || ||| |||| || |  ||||||||||||    
T  41587238 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaagagtcatttaaaaattggtcc-tgtaatcgttaatcctggaaaattacccttgcattgtttaatcatttaa 41587336  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||| ||| || |||| ||||||    
T  41587337 aatttcatcctttaaccaacttaat 41587361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28230134 - 28230057
Alignment:
Q  116 ggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgt 193  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  28230134 ggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcctagcaaattaccctttcaaagtttaatcatttaaaatttcgt 28230057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6307125 - 6307038
Alignment:
Q  104 cttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||  ||| |||| | | || |  ||||||||||||||||||    
T  6307125 cttgcaattagtggtcgtttaaaaattggtccctataatcgttaatccttacaaattagtcctgcattatttaatcatttaaaatttc 6307038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6589778 - 6589679
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || |||| ||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||    
T  6589778 atgtgtttcgtccctgcaattaagggtcatttaaaaattggtccatgtaatcgttaattctggcaaattacccttgcaaagtttaatcatttaaaatttc 6589679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21370611 - 21370516
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||| | | ||||||| ||||  |||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  21370611 tccttgtaattataggtcgtttaaaaattgatccatgtattcgttaatccttgcaaactagcattgcaatcattaataatttaaaatttcgtccct 21370516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 44044137 - 44044228
Alignment:
Q  106 tgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |  |||||||| | ||  || ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44044137 tgcaattaggggtggtttaaaaattggtccctgtattcactaatccttgaaaactaaccttgtaatcattaatcatttaaaatttcgtccct 44044228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 190
Target Start/End: Original strand, 28228679 - 28228777
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaattt 190  Q
    ||||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||  ||| |||   |||||||||| ||||||    
T  28228679 atgtgtttcgtccctgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatcgttaatcgtggcaaattactctttcaaagtttaatcatttgaaattt 28228777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3653474 - 3653394
Alignment:
Q  116 ggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  3653474 ggtcatttaaaaattggtccatgtaatcgttaatc-tggcaaattacccttgcaaagtttaatcatttaaaatttcgtccct 3653394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Original strand, 22051088 - 22051140
Alignment:
Q  177 atcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatt 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||| |||||    
T  22051088 atcatttaaaatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcactaatt 22051140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 231
Target Start/End: Original strand, 141601 - 141742
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  141601 tgatgtgtttagcccttgcaattagacggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaatt 141700  T
Q  190 tcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    | |||| | |||||  ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  141701 tagtccttggaccaaattaatcactgccacgtcactaatttg 141742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 141984 - 141877
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  141984 tgatgtgtttagcccttgcaattaggcggcatttaaaaattcatccctgtaattgctaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 141885  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  141884 tcgtccct 141877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 2396 - 2520
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  2396 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattagacgtcatttaaaaattaatccctgtaatcgctaatcctagcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 2495  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  2496 aatttcgtcctttgaccaacttaat 2520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0559
Description:

Target: scaffold0559; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 197
Target Start/End: Original strand, 1240 - 1347
Alignment:
Q  90 tgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatt 189  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  1240 tgatgtgtttaacccttgcaattaggcggcatttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctgacattttaaccctgcaattgttaatcatttaaaatt 1339  T
Q  190 tcgtccct 197  Q
    ||||||||    
T  1340 tcgtccct 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1590 - 1482
Alignment:
Q  124 aaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcattt-aaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatc 222  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||  ||||| | |||||| ||    
T  1590 aaaaattcgttcctgtaattgttaatcctggcattttaaccctgcaattgttaatcgtttaaaaatttggtccttggaccaaattaatcactgccacgtc 1491  T
Q  223 attaatttg 231  Q
    | |||||||    
T  1490 actaatttg 1482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12662 - 12524
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  12662 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccctgtaatcgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 12563  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||| | ||||||  |||||| | |||||| ||||    
T  12562 aatttcgttctttgacctacttaatcactgccacgtcat 12524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Original strand, 12295 - 12351
Alignment:
Q  138 gtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtc 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  12295 gtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtc 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12203 - 12065
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  12203 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaaacgtcatttaaaaattaatcccagtaatcgctaatcctagcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 12104  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  12103 aatttcgtcctttgaccaacttaatcactgccacgtcat 12065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6488 - 6387
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6488 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaagtagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 6389  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  6388 ca 6387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 69374 - 69257
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || ||    
T  69374 tccttgcaattagatgtcgtttaaaaattggtccctgtattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttaac 69275  T
Q  202 cagcttaataattgccac 219  Q
    || |||||| | ||||||    
T  69274 caacttaatcactgccac 69257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 68984 - 69079
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  68984 tccttgcaattaggggtcatttaaaaattggtccctgtaatcactaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 69079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 923 - 1047
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||   || |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  923 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcatcatttaaaaattagtccatgtaatcgctaatcttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 1022  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  1023 aatttcgtcctttgaccaacttaat 1047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 139691 - 139786
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattg-ttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  139691 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgtaatcgctaatcctggcaatttacccat-gaattgattaatcatttaaaatttcgtccct 139786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 140050 - 139921
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||| || ||||  ||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  140050 tccttgcaattaggggttgtttaaaaattggtccctgtattcactaattcttgcaaactagccttgcaatcattaattatttaaaatttagtcctttgac 139951  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    || |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  139950 caacttaataactgccacgtcactaatttg 139921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 222212 - 222088
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  222212 ttaatgatgtgtttcgtccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtacatgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 222113  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  222112 aatttcgtcctttgaccaacttaat 222088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Original strand, 221794 - 221908
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  221794 ttaatgatgtgtttcgttcttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtct-tgtaatcgctaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 221892  T
Q  186 aatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||||||| |||||    
T  221893 aatttcgtcctttgac 221908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 1788 - 1883
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  1788 tccttgcaattaggggtcgttaaaaaattggtccctgtaatcgctaatcttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 1883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2150 - 2049
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||  || |||| ||||  |||||||||||||||||||| | |||||    
T  2150 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtccctgaaattgctaatctttgcaaactatccttgcaatcattaatcatttaaaatttcgttctttgac 2051  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  2050 ca 2049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 233
Target Start/End: Original strand, 37583 - 37714
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||| || ||||  ||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37583 tccttgcaattagagatcgtttaaaaattggtccttgtattcgctaattctagcaaactattcttgcaatcattaatcatttaaaatttcgtcctttgac 37682  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcattaatttgtg 233  Q
    || |||||| | |||||||||| |||||||||    
T  37683 caacttaatcactgccacatcactaatttgtg 37714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37972 - 37877
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtccct 197  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||  | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  37972 tccttgcaattaggagtcgtttaaaaattggtctttgtaatcgctaatcctgacaatttacccttgtattgtttaatcatttaaaatttcgtccct 37877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11563 - 11425
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  11563 ttaatgatgtgtttcatccttgcaattaggcgtcatttaaaaattagtccatgtaatcgttaatcctggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 11464  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  11463 aatttcgtcttttgaccaacttaatcactgccacgtcat 11425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Original strand, 11143 - 11267
Alignment:
Q  86 ttaatgatgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaa 185  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| | |||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  11143 ttaatgatgtgtttcgtcgttgcaattagtcgtcatctaaaaattagtctctgtgatcgctaatcttggcaatttacccttgcattgtttaatcatttaa 11242  T
Q  186 aatttcgtcccttgaccagcttaat 210  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    
T  11243 aatttcgtcctttgaccaacttaat 11267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 239970 - 239839
Alignment:
Q  92 atgtgattagtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttc 191  Q
    ||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||   ||||||||||||||||||    
T  239970 atgtgtttcgtccttgcacttaggggtcatttaaaaattggttcctgtaatcgataatcctggcaaattacccttccaaagtttaatcatttaaaatttc 239871  T
Q  192 gtcccttgaccagcttaataattgccacatca 223  Q
    ||||||  |||  |||||| | ||||||||||    
T  239870 gtccctacacccacttaattactgccacatca 239839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0775 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0775
Description:

Target: scaffold0775; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 202
Target Start/End: Original strand, 4987 - 5081
Alignment:
Q  108 caattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgacc 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4987 caattaggggtcgtttaaaaattgatccctatattcgctaatccttgcaaactagccttgcaattattaatcatttaaaatttcgtcctttgacc 5081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0775; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6387 - 6265
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgac 201  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||| |||| | |||| | ||||||| |||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6387 tccttgaaattaggggtcacttaaaaattggtccttataatcgataatccttgcaaattacccttgcaatgtttaatcatttaaaatttcgttccttaac 6288  T
Q  202 cagcttaataattgccacatcat 224  Q
    |  |||||| | |||||| ||||    
T  6287 ccacttaatgactgccacgtcat 6265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 193
Target Start/End: Original strand, 19875 - 19967
Alignment:
Q  101 gtccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgt 193  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||| | || || |  ||||||||||||||||||||    
T  19875 gtccttgcaattatgggtcgtttaaaaattggtccctgtgatcgctaatccttgcaaattacctttgcattctttaatcatttaaaatttcgt 19967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14799 - 14740
Alignment:
Q  102 tccttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaattta 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  14799 tccttgcaattaggggtcgtttaaaaattggtctctctaatcgctaatcctggcaattta 14740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Original strand, 14451 - 14577
Alignment:
Q  105 ttgcaattagaggtcgtttaaaaattcgtccctgtaattgctaatcctggcaatttagccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccag 204  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||  | || | ||||||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||     
T  14451 ttgcaattaggagtcgtttaaaaattagtctatttattcgctaatccttgcaaactagccttgcaatcattaatcatttaaaattttgtcttttgaccaa 14550  T
Q  205 cttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||    
T  14551 cttaatcactgccacgtcactaatttg 14577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0295
Description:

Target: scaffold0295; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2491 - 2423
Alignment:
Q  163 ccttacaattgttaatcatttaaaatttcgtcccttgaccagcttaataattgccacatcattaatttg 231  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  2491 ccttgcaattattaatcatttaaaatttcgccctttgaccaacttaatcactgccacatcactaatttg 2423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University