View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4400-Insertion-1 (Length: 1100)

Name: NF4400-Insertion-1
Description: NF4400
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4400-Insertion-1
NF4400-Insertion-1
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (7-1095)||(55954396-55955490)
chr4 (308-949)||(55958254-55958897)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (208-796)||(41795369-41795957)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (350-922)||(12425073-12425642)
chr6 (308-921)||(12268044-12268654)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (606-881)||(7154150-7154428)
chr5 (712-881)||(7141380-7141549)
chr5 (807-874)||(7131663-7131730)
chr5 (554-677)||(7141587-7141710)
chr5 (606-640)||(41465802-41465836)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 981; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 981; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 1095
Target Start/End: Original strand, 55954396 - 55955490
Alignment:
Q  7 aatatattggatgatctcaaatagaataaagtgctgacaatgaatttttgttacaagtgctgacgataattttttgaagggaataatcaaataggaaaat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55954396 aatatattggatgatctcaaatagaataaagtgctgacaatgaatttttgttacaagtgctgacgataattttttgaagggaataatcaaataggaaaat 55954495  T
Q  107 gctatgattagcaaagaagggaaatgatatgtatagcggnnnnnnntgcacgaatccatcacgataagt----attttagttacctgcttacctgatttt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  55954496 gctatgattagcaaagaagggaaatgatatgtatagcggaaaaaaatgcacgaatccatcacgataagtgtatattttagttacctgcttacctgatttt 55954595  T
Q  203 tgttaattccggacatttgccactgagtcattttaactataatacatgtttcgtgatggtttcacgatttttgttctcgtgataaataacatcgctgaat 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55954596 tgttaattccggacatctgccactgagtcattttaactataatacatgtttcgtgatggtttcacgatttttgtcctcgtgataaataacatcgctgaat 55954695  T
Q  303 caatgtggagttggaatcaaatacaggccatttcccctagccgctgcagctccaaaggcttcagtcatatccaagtcctctggtttcattccattaggaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55954696 caatgtggagttggaatcaaatacaggccatttctcctagccgctgcagctccaaaggcttcagtcatatccaagtcctctggtttcattccattaggaa 55954795  T
Q  403 gttcccaattgaagtgatacaacaatgcagccagaggaagctcaatattagctaagccaagcgaaattcccggacacattcttcttcctcccccaaaagg 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55954796 gttcccaattgaagtgatacaacaatgcagccagaggaagctcaatattagctaagccaagcgaaattcccggacacattcttcttcctcccccaaaagg 55954895  T
Q  503 catgtaatcaaagctattattattgttcaatttattaaaatcaaaaccagtactatcattaaacctttcaggtataaacttctttgcatcataccaatgt 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55954896 catgtaatcaaagctattattattgttcaatttattaaaatcaaaaccagtactatcattaaacctttcaggtataaacttctttgcatcataccaatgt 55954995  T
Q  603 ttgggatctcttccaattgcccatgcatttactatcacgctagtctttattggtatttcatatccatctatgttgcacgcttccctgcattctcttggaa 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55954996 ttgggatctcttccaattgcccatgcatttactatcacgctagtctttattggtatttcatatccatctatgttgcaagcttccctgcattctcttggaa 55955095  T
Q  703 gcaaagtaaaaggtgggtgtaacctcatggtttctttgatcactgacttcaagtaactaagttcatgtagatcactctcatatattctctttttcccttt 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55955096 gcaaagtaaaaggtgggtgtaacctcatggtttctttgatcactgacttcaagtaactaagttcatgtagatcactctcatatattctctttttcccttt 55955195  T
Q  803 aacagcttctcttatttcggattgtgctttcttcatcactcttgagtttttcatcaactctgacatagcccactctattactgttgctgaagtatcactc 902  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55955196 aacagcttctcttatttcggattgtgctttcttcatcactcttgagtttttcatcaactctgacatagcccactctattactgttgctgaagtatcactc 55955295  T
Q  903 ccagcagcgaacatatcctgctcatttccacatatactatgttaaaacaacttatcaccttaacaac-aaaaatcacatgatgcatt-nnnnnnnctcaa 1000  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||    
T  55955296 ccagcagcgaacatatcctgctcatttccacatatactatgttaaaacaacttatcaccttaacaacaaaaaatcacatgatgcattaaaaaaaactcaa 55955395  T
Q  1001 atcttacataagatac-agaattaaaagagtttattcaggatcacccatcatttctatctacgcacctagtccgaaatgagtttataaaaaggtag 1095  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55955396 atcttacat-agatacaagaattgaaagagtttattcagaatcacccatcatttctatctacgcacctagtccgaaatgagtttataaaaaggtag 55955490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 308 - 949
Target Start/End: Original strand, 55958254 - 55958897
Alignment:
Q  308 tggagttggaatcaaatacaggccatttcccctagccgctgcagctccaaaggcttcagtcatatccaagtcctctggtttcattccattaggaagttcc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55958254 tggagttggaatcaaatacaggttgtttctcctagccacaacagctccaaaggcttcagtcatatccaagtcctctggtttcattccattaggaagttcc 55958353  T
Q  408 caattgaagtgatacaacaatgcagccagaggaagctcaatattagctaagccaagcgaaattcccggacacattcttcttcctcccccaaaaggcatgt 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  55958354 caattgaagtgatacaataatgcagcaagaggaagctcaatattagctaagccaaacaaaattcctggacacattcttcttcctcctccaaaagggatgt 55958453  T
Q  508 aatcaaagctattattattg---ttcaatttattaaaatcaaaaccagtactatcattaaacctttcaggtataaacttctttgcatcataccaatgttt 604  Q
    | |||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||||||    |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  55958454 attcaaagttattattattactattcactttattaaaatcaaaatatttactgtcatgaaacctctcaggtataaacttctctgcatcataccaatattt 55958553  T
Q  605 gggatctcttccaattgcccatgcatttactatcacgctagtctttattggtatttcatatccatctatgttgcacgcttccctgcattctcttggaagc 704  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  55958554 gggatctcttcacattgcccaagcatttactaacacattagtctttattggtatttcatatccacctatgttgcatgcttccctgcattctcttataagc 55958653  T
Q  705 aaagtaaaaggtgggtgtaacctcatggtttctttgatcactgacttcaagtaactaagttcatgtagatcactctcatatattctctttttccctttaa 804  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  55958654 aaagtagcaggtggatgtaacctcatagtttctttgatcactgaattcaagtaactaagttcttgtagatcactctcatatgttctctttttacctttaa 55958753  T
Q  805 cagcttctcttatttcggattgtgctttcttcatcactcttgagtttttcatcaactctgacatagcccactctattactgttgctgaagtatcactccc 904  Q
      | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||||||||| ||    
T  55958754 aggtttctcttatttcagattgtgccttcttcatcactcttgggtttttcatcaactctgacattgcccagtctattgttcctgctgaagtatcacttcc 55958853  T
Q  905 agcagcgaacatatcctgctcatttccacatatactatgttaaaa 949  Q
     ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  55958854 ggca-caaacatgtcctgttcaattccacatacattatgttaaaa 55958897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 208 - 796
Target Start/End: Original strand, 41795369 - 41795957
Alignment:
Q  208 attccggacatttgccactgagtcattttaactataatacatgtttcgtgatggtttcacgatttttgttctcgtgataaataacatcgctgaatcaatg 307  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||   |||  |||||||| | ||||||||||||||    
T  41795369 attccggacttttgccat--agtcattttaaccataacacatgcttcatgatggtttcacaaatttttccctcacgataaatagcgtcgctgaatcaatg 41795466  T
Q  308 tggagttggaatcaaatacaggccatttcccctagccgctgcagctccaaaggcttcagtcatatccaagtcctctggtttcattccattaggaagttcc 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41795467 tggagtaggaatcaaatacaggccatttctcctagccgttgcagctcccaaggattcagtcttatctaagtcgtctggtttcattccattaggaagttcc 41795566  T
Q  408 caattgaagtgatacaacaatgcagccagaggaagctcaatattagctaagccaagcgaaattcccggacacattcttcttcctcccccaaaaggcatgt 507  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||    
T  41795567 caattgaagtgatgcaacaatgcagctagaggaagctcaatgttagctaagccaagcgaaattcccggacacattcttcttccttccctagaagggatgt 41795666  T
Q  508 aatcaaagctattattattgttcaatttattaaaatcaaaaccagtactatcattaaacctttcaggtataaacttctttgcatcataccaatgtttggg 607  Q
    | |||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||||| |  |||| || | |||||| | | ||||||| || | ||||||||| |||| ||||||    
T  41795667 attcaaagttattattactattcactttattaaattcaaaatctttactgtcctgaaacctcttatgtataaaattatctgcatcatatcaatatttggg 41795766  T
Q  608 atctcttccaattgcccatgcatttactatcacgctagtctttattggtatttcatatccatctatgttgcacgcttccctgcattctcttggaagcaaa 707  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41795767 atctcttccgattgcccatgcatttactatcacactagtctttataggtatttcatatccacctatgttgcacgcttccctgcattctcttggaagcaaa 41795866  T
Q  708 gtaaaaggtgggtgtaac--ctcatggtttctttgatcactgacttcaagtaactaagttcatgtagatcactctcatatattctcttttt 796  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41795867 gtaaaaggtggatgtaacctctcattgtttctttgatcactgactttaagtaaccaagttcatgtagatcactctcatatattctcttttt 41795957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 350 - 922
Target Start/End: Original strand, 12425073 - 12425642
Alignment:
Q  350 agctccaaaggcttcagtcatatccaagtcctctggtttcattccattaggaagttcccaattgaagtgatacaacaatgcagccagaggaagctcaata 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| || ||| | |||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12425073 agctccaaagacttcagtcatatctaagtcctcttctttcatttcattaggaattttccagtcgaagtggtaaagtaatgcagccagaggaagctcaata 12425172  T
Q  450 ttagctaagccaagcgaaattcccggacacattcttcttcctcccccaaaaggcatgtaatcaaagctattattattgttcaatttattaaaatcaaaac 549  Q
    || || ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  || | ||||||||||| |||   || |||||||||||||||||    
T  12425173 tttgccaagccaaacaaaattcctggacacattcttcttcctcctccaaaagggaaatactgaaagctattatcatt---cactttattaaaatcaaaac 12425269  T
Q  550 cagtactatcattaaacctttcaggtataaacttctttgcatcataccaatgtttgggatctcttccaattgcccatgcatttactatcacgctagtctt 649  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||    
T  12425270 cagtactatcatgaaacctctccggtataaacttctcagcatcagaccaatgttcgggatctcttccaattgcccatgcatttaatattaagttagtttt 12425369  T
Q  650 tattggtatttcatatccatctatgttgcacgcttccctgcattctcttggaagcaaagtaaaaggtgggtgtaacctcatggtttctttgatcactgac 749  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  12425370 taaaggtatttcatatccacctatgttgcacgcttccctgcattctctcatgagcaatgtagcaggtgggtgtaacctcagggtttctttgatcactaac 12425469  T
Q  750 ttcaagtaactaagttcatgtagatcactctcatatattctctttttccctttaacagcttctcttatttcggattgtgctttcttcatcactcttgagt 849  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||    
T  12425470 ttcaagtacccaagtttatgtagatcactctcatatattctcttcttacctttaacagcttctcttatttcagcttgtgccttcttcatcactcttgggt 12425569  T
Q  850 ttttcatcaactctgacatagcccactctattactgttgctgaagtatcactcccagcagcgaacatatcctg 922  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || | ||||| |||||    
T  12425570 ttttcattaactctgacatagcccactctattgttattgctgaagtatcactcccaccaccaaacatgtcctg 12425642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 308 - 921
Target Start/End: Complemental strand, 12268654 - 12268044
Alignment:
Q  308 tggagttggaatcaaatacaggccatttcccctagccgctgcagctccaaaggcttcagtcatatccaagtcctctggtttcattccattaggaagttcc 407  Q
    |||||||||||||||| |||||   |||  ||||| | | | ||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| || |    
T  12268654 tggagttggaatcaaaaacaggttgtttttcctagacaccgtagctccatattcttcagtcatatcaaagtcttctgctttcatttcattaggaattttc 12268555  T
Q  408 caattgaagtgatacaacaatgcagccagaggaagctcaatattagctaagccaagcgaaattcccggacacattcttcttcctcccccaaaaggcatgt 507  Q
    || | |||||| || |  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12268554 cagtcgaagtggtaaagtaaggcagccagaggaagctcaatatttgctaaaccaaacaaaactcctggacacattcttcttcctcctccaaaagggatgt 12268455  T
Q  508 aatcaaagctattattattgttcaatttattaaaatcaaaaccagtactatcattaaacctttcaggtataaacttctttgcatcataccaatgtttggg 607  Q
    | | ||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  12268454 actgaaagctattatcatt---cactttattaaaatcaaaaccagtattatcatgaaacctctcaggtataaacttctctgcatcagaccaatgattggg 12268358  T
Q  608 atctcttccaattgcccatgcatttactatcacgctagtctttattggtatttcatatccatctatgttgcacgcttccctgcattctcttggaagcaaa 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |      
T  12268357 atctcttccaattgcccatgcatttaatattaaattagtctttataggtatttcatatcctcctatgttgcatgcttccctgcattctcttgtaagtatt 12268258  T
Q  708 gtaaaaggtgggtgtaacctcatggtttctttgatcactgacttcaagtaactaagttcatgtagatcactctcatatattctctttttccctttaacag 807  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||||  |     
T  12268257 gcaccaggtgggtgtaacctcagggtttctttgatcactgacttcaagtaactaagttcatgcaaatcactttcataaattctcttcttacctttacaaa 12268158  T
Q  808 cttctcttatttcggattgtgctttcttcatcactcttgagtttttcatcaactctgacatagcccactctattactgttgctgaagtatcactcccagc 907  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||| || |    
T  12268157 cttctcttatttcagcttgtgctttcatcctcactctagggtttttcattaactctgacatagcccaatctattgttattgctgaagaatcactcgcacc 12268058  T
Q  908 agcgaacatatcct 921  Q
    ||| ||||| ||||    
T  12268057 agcaaacatgtcct 12268044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 606 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 7154428 - 7154150
Alignment:
Q  606 ggatctcttccaattgcccatgcatttactatcacgctagtctttattggtatttcatatccatctatgttgcacgcttccctgcattctcttggaagca 705  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||  |||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |  |||  |||||||||| || | ||    
T  7154428 ggatctcttgccactgcccatgcatttatcatcactttagtattttttggtatttcataaccatctatgatggtcaattcagtgcattctctagggacca 7154329  T
Q  706 a---agtaaaaggtgggtgtaacctcatggtttctttgatcactgacttcaagtaactaagttcatgtagatcactctcatatattctctttttcccttt 802  Q
    |   ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||||   ||| ||||| | || || |||||    
T  7154328 ataaaggtgaaggtgggtgtaacctcattgtttctttgatcactaacttaaagtaagttagttcatttagatcagattcagatattattttctttccttt 7154229  T
Q  803 aacagcttctcttatttcggattgtgctttcttcatcactcttgagtttttcatcaactctgacatagcccactctatt 881  Q
     |  |||||||||| ||| | ||||||||| |   |||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7154228 gaatgcttctcttagttcagcttgtgctttttctctcacacttggatttttcatcatttctgacatagcccactctatt 7154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 712 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 7141549 - 7141380
Alignment:
Q  712 aaggtgggtgtaacctcatggtttctttgatcactgacttcaagtaactaagttcatgtagatcactctcatatattctctttttccctttaacagcttc 811  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||  | || |||| | |||||||||   |  || || || |  ||||     
T  7141549 aaggtgggtgtaacctcaatgtttctttgatcactaactttaagtaacttagtttctctacatcagtttcatatattagttccttaccattgaatgcttg 7141450  T
Q  812 tcttatttcggattgtgctttcttcatcactcttgagtttttcatcaactctgacatagcccactctatt 881  Q
    ||||| ||| | |||||| |||| | |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  7141449 tcttaattcagcttgtgccttctccctcactcttggatttttcatcatttctgacatagcccattctatt 7141380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 807 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 7131730 - 7131663
Alignment:
Q  807 gcttctcttatttcggattgtgctttcttcatcactcttgagtttttcatcaactctgacatagccca 874  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||    
T  7131730 gcttctcttatttcagcttgtgccttgttcatcacacttgggtttttcatcagttctgacatggccca 7131663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 554 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 7141710 - 7141587
Alignment:
Q  554 actatcattaaacctttcaggtataaacttctttgcatcataccaatgtttgggatctcttccaattgcccatgcatttactatcacgctagtctttatt 653  Q
    |||||||| |||||| || || |||||| |||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |  ||  |||| ||| ||    
T  7141710 actatcatcaaacctctctggaataaacctctcagcatcattccaatatttaggatctcttcctattgcccacgcatttataaagactgtagtatttttt 7141611  T
Q  654 ggtatttcatatccatctatgttg 677  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||    
T  7141610 ggtatatcatacccatctattttg 7141587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 41465836 - 41465802
Alignment:
Q  606 ggatctcttccaattgcccatgcatttactatcac 640  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41465836 ggatctcttccaatcgcccatgcatttactatcac 41465802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University