View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4405-Insertion-9 (Length: 797)

Name: NF4405-Insertion-9
Description: NF4405
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4405-Insertion-9
NF4405-Insertion-9
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (8-797)||(20015880-20016667)
chr3 (10-797)||(20036282-20037072)
chr3 (10-797)||(19955727-19956523)
chr3 (13-744)||(19811935-19812669)
chr3 (8-797)||(19838034-19838832)
chr3 (10-786)||(20045775-20046548)
chr3 (10-797)||(19848639-19849435)
chr3 (10-791)||(19950776-19951554)
chr3 (9-769)||(26646661-26647412)
chr3 (10-790)||(19818209-19818992)
chr3 (380-797)||(26653174-26653587)
chr3 (349-581)||(24839869-24840101)
chr3 (375-733)||(30914660-30915018)
chr3 (378-581)||(19853532-19853735)
chr3 (358-740)||(19989522-19989904)
chr3 (555-789)||(17114910-17115144)
chr3 (10-321)||(19989174-19989485)
chr3 (356-578)||(19858070-19858292)
chr3 (348-582)||(19943710-19943940)
chr3 (632-797)||(19858343-19858508)
chr3 (612-784)||(19832123-19832295)
chr3 (58-269)||(19853212-19853423)
chr3 (631-791)||(19943987-19944147)
chr3 (424-592)||(19971677-19971845)
chr3 (631-787)||(24839666-24839822)
chr3 (22-256)||(19857734-19857969)
chr3 (631-744)||(19853764-19853877)
chr3 (142-236)||(20005225-20005319)
chr3 (142-224)||(19943503-19943585)
chr3 (142-224)||(24840226-24840308)
chr3 (22-224)||(26651697-26651899)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (379-797)||(9815058-9815473)
chr5 (376-784)||(26354619-26355027)
chr5 (10-257)||(9814689-9814936)
chr5 (10-255)||(26355148-26355393)
chr5 (142-314)||(38435286-38435465)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (22-797)||(1716875-1717656)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (175-786)||(6397429-6398039)
chr4 (275-707)||(6398178-6398610)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (376-581)||(22689550-22689755)
chr8 (457-588)||(22651781-22651912)
chr8 (116-451)||(22652113-22652448)
chr8 (378-517)||(22685642-22685778)
chr8 (631-767)||(22689385-22689521)
chr8 (631-790)||(11544343-11544502)
chr8 (378-577)||(11564033-11564232)
chr8 (547-593)||(22685591-22685637)
chr8 (631-688)||(11563916-11563973)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (390-769)||(12497241-12497616)
chr7 (390-769)||(12521106-12521481)
chr7 (390-601)||(12581424-12581632)
chr7 (390-786)||(12579781-12580167)
chr7 (491-786)||(12495685-12495972)
chr7 (390-786)||(12519486-12519878)
chr7 (288-393)||(12581117-12581222)
chr7 (288-394)||(12496933-12497039)
chr7 (288-394)||(12520798-12520904)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 767; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 767; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 20016667 - 20015880
Alignment:
Q  8 acaaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016667 acaaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaacaaagtatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcat 20016568  T
Q  108 actgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016567 actgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggag 20016468  T
Q  208 gatattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20016467 gatattatggttttgggtggttaccctgtcattggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagag--gtagaaaacaaattgatccttg 20016370  T
Q  308 caagacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016369 caagacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatt 20016270  T
Q  408 tcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcct 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016269 tcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcct 20016170  T
Q  508 attgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgata 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016169 attgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgata 20016070  T
Q  608 ggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaa 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016069 ggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaa 20015970  T
Q  708 tcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagctattgatga 797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015969 tcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagctattgatga 20015880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 10 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 20037072 - 20036282
Alignment:
Q  10 aaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatac 109  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||    
T  20037072 aaatgggtttcttgggttcataaacttaaacaaaactatgaatctgtgtggaagaaagttggaatctttgatgctattatggccactaagtgttacatac 20036973  T
Q  110 tgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggagga 209  Q
      | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| ||| |||||||||    
T  20036972 ataaagatcaaaacttgctatatggggttgtggagaaatggtgttccaagacaaatacatttgtgttttcctttggtgaagcaacagtcattttggagga 20036873  T
Q  210 tattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgca 309  Q
    ||| |||||| | || ||||| |||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||  | |||||| |||| | ||| | ||  | ||| |||||    
T  20036872 tatcatggttctaggaggttatcctgttcttggtgatcctgttttcacttcacttcatgaccaagaaatgaaagagattgaagaaaagctcatcattgca 20036773  T
Q  310 agacagcaacttactaatcggaaaca---acgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcat 406  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||   | ||   ||   |||||||   ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20036772 agacaacaacttactaatgcgaaacatggaggtgtggctagcacatcatactggatggatattttcattgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcat 20036673  T
Q  407 ttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcc 506  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||     
T  20036672 ttcttgctacttggttgtcactttttgtttttcctcataaaaactatttggtgaaaagttctttgtttcctattgctgtatatcttgctagaggaaatcg 20036573  T
Q  507 tattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgat 606  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20036572 tattgctttagcacctgctgttttagctagtctatataaggatttaactttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatgtcatgttggtggtgat 20036473  T
Q  607 aggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatca 706  Q
    ||   ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  20036472 agacttcctttagaagttactcttgaatcacccttttacttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaaatttacaaccacaacccatgttgttga 20036373  T
Q  707 atcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagctattgatga 797  Q
    | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  20036372 accatggggacccttttttgtttaggtggcataaggttaagcccttgatgattgacaatgttaggatggcattagactcggctatggatga 20036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 10 - 797
Target Start/End: Original strand, 19955727 - 19956523
Alignment:
Q  10 aaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatac 109  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||| |||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||   ||| |    
T  19955727 aaatgggtttcttgggttcataaacttaaacaaaagtatgaatctgtttggaggaaagttggaatctttgatgctataatgagtactaaatgctacattc 19955826  T
Q  110 tgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggagga 209  Q
      | |||| |||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||    
T  19955827 ataaaaataaaaacttgctatttggagttgttgagaaatggtgttgtgagacaaatacatttgtgtttccatttggtgaggcaacaatcactttggaaga 19955926  T
Q  210 tattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgca 309  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||| |  | |  |||||  | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  19955927 tgtcatggttttggggggttaccctgtcattggtgattctgttttcaccgaagtcaaagaccaagaaatgagagaggtggaaaacaaattgatacttaca 19956026  T
Q  310 agacagcaacttacta---atcggaaacaacg---tcacgcgtaca---catcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatg 400  Q
      | ||||||||||||   ||  ||||||| |   | |  |||  |   ||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19956027 ttaaagcaacttactactgatgtgaaacaaggaggtaattcgtctagaacatcactatggatggatattttcattgataaaggtagtgaaattgaacatg 19956126  T
Q  401 aagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacg 500  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||| |    
T  19956127 aagcttttcttgctacttggttgtcaatttttgttttccctcataaatattcttccgtgaaaagttatttgtttcctattgttgttcatcttgctagagg 19956226  T
Q  501 aaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggt 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19956227 aaatcctattgctttggcaccagctgttttagctagcatatataaggatttaactttgttaaagaaaaaaacagttgatttgtcaaaatatcctgtgggt 19956326  T
Q  601 ggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgt 700  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19956327 ggtgatagatatccttcagaacttactcttcaatcacccttttacttggttcaaatttgggtgtgggaaaggttcaaaaatttacagccacaacccatgt 19956426  T
Q  701 tgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagctattgatga 797  Q
    || | || |||    ||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  19956427 tgttgaaccataggaacccttttttgtttaggtggcataaggttaagcccttgatagttgacaatgttaggatggcattagactcggctatggatga 19956523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 744
Target Start/End: Original strand, 19811935 - 19812669
Alignment:
Q  13 tgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatactga 112  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  19811935 tgggttagatgggttgatgagcttaaaccaaagtatgaatctttgtggaagaaagctagaatctttgatgctattatgagtaccaagtgtcacatactca 19812034  T
Q  113 gaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatat 212  Q
     ||||| ||| ||||| | || |||||  ||||||||||||| | |||| || || ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  19812035 aaaatctaaaattgctctttggggttgttgagaaatggtgttgtgagactaacacctttgtttttccatttggtgaagcaactatcactttggaggatat 19812134  T
Q  213 tatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgcaaga 312  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| |||| | |  | || |||||  | ||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||    
T  19812135 tatggttttggggggttaccctatcattggtgatcctatttttaccaaagttcaagaccaagaaatgagagaggtggaaaagaagctcatccttgcaaga 19812234  T
Q  313 cagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttg 412  Q
    | | ||| |    |  | ||| || || | ||   ||||||||  |||||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19812235 cggaaaccttggcagagtaaaaaaggtaaggctaccacatcaaaatggatcaatattttcgttggtaaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttg 19812334  T
Q  413 ctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgc 512  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  19812335 ctacttggttgtcaatttttgtttttcctcataaata---tttggtgaaaaagtctttgtttccgatcgctattcttcttgctagagggtatcctattgc 19812431  T
Q  513 tttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgataggtat 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |    
T  19812432 tttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcctgttggtggtgatagattt 19812531  T
Q  613 cctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaac------ccatgttgatca 706  Q
    || || ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||      | ||||||||||    
T  19812532 cccttggagattactcttcaatcacccttttacttggttcaaatttgggtttgggagaggttcaaaaatttgcaaccacaacaacaaactatgttgatca 19812631  T
Q  707 atcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggtt 744  Q
    | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19812632 accatggcgacccttttttgtttaggtggcataaggtt 19812669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 797
Target Start/End: Original strand, 19838034 - 19838832
Alignment:
Q  8 acaaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||| || || ||   |||    
T  19838034 acaaatgggtttgttgggttgataagcttaaaccaaagtatgaatctgtttggaggaaagttggaatctttgatgctataatgagtactaaatgctacat 19838133  T
Q  108 actgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggag 207  Q
     |  | |||| |||||||| ||| ||| ||||  ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||     
T  19838134 tcataaaaataaaaacttgttatttgaagttgttgagaaatggtgctgtgagaccaatacatttgtgtttccatttggtgaggcaacaatcactttggaa 19838233  T
Q  208 gatattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttg 307  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||| |  | |  |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  19838234 gatgtcatggttttggggggttaccctgtcattggtgattctgttttcaccgaagtcaaagaccaagaaatgagagaggtggaaaacaaattgatcctta 19838333  T
Q  308 caagacagcaacttacta---atcggaaacaacg---tcacgcgtaca---catcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaaca 398  Q
    ||  | ||||||||||||   ||  ||||||| |   | |  |||  |   ||||| | ||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||    
T  19838334 cattaaagcaacttactactgatgtgaaacaaggaggtaattcgtctagaacatcactatggatggatattttcatcgataaaggtagcgaaattgaaca 19838433  T
Q  399 tgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctaga 498  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||| ||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  19838434 tgaagcttttctagctacttggttgtcaatttttgtttttcctaatcaacactcttgcgtgaaaagctttttgtttccaattgttgttcatcttgctaga 19838533  T
Q  499 cgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgg 598  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  19838534 ggaaattctattgctttggcaccagctgttttagctagcatatataatgatttaactttgttaaagaaaaaaacagttgatttgtcaaaacatcctgttg 19838633  T
Q  599 gtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccat 698  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19838634 gttgtgatacatatcctttagaagttactcttcaatcacccttttacttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaaatttacaaccacaaccaat 19838733  T
Q  699 gttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagctattgatga 797  Q
    |||| | || || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||| |||||    
T  19838734 gttgttgaaccagggggacccttttttgtttaggtggcataaagttaaggccttgataattgacaatattaggatggctttagactcggctatggatga 19838832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 786
Target Start/End: Original strand, 20045775 - 20046548
Alignment:
Q  10 aaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatac 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | || ||||||||   |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | | |||||| |||| |    
T  20045775 aaatgggttagttggcttgataaactcaaaccaaaatttgaatcggtgtggaaggaagttggaatctttgaagctattatgaactcaaagtgttgcattc 20045874  T
Q  110 tgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggagga 209  Q
    | | |||||| ||||| ||| | | ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||| |||| |||  | ||||| || ||||||||    
T  20045875 ttaaaaatcagaacttactacaaggggttgtggagaaatggtgttgtgatacaaatacatttatttttccctttggtgagacaacaataaccttggagga 20045974  T
Q  210 tattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgca 309  Q
    ||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |  | || |||||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||| || |    
T  20045975 tatcattgttttgggaggttaccctatcattggcgatcatgttttcaccaaagttaaagaccaagaaatgagagaggtggaaaataaattgatccatgaa 20046074  T
Q  310 agacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttc 409  Q
    ||  |||| ||||| ||| ||||  |  |||| || ||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  20046075 aggaagcagcttacaaataggaacgatggtcatgcttacacatcattatggatggatatgttcatcgataaaggtagtgaaattgaacacgaagccttcc 20046174  T
Q  410 ttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctat 509  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |   |   ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  20046175 ttactacttggttgtcaatttttgtttttcctcataaaaa---tatggtgaaaaattgtttgttttctattgctattaatcttgctagaggaaatccaat 20046271  T
Q  510 tgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgatagg 609  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||  || |||||||||||     
T  20046272 tgctttggcacctgctgttttgggtagcatatataaggatttaagtttatttaagaacacaattattgatctgttaaaatatccggttggtggtgataga 20046371  T
Q  610 tatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatc 709  Q
    | |||| | ||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20046372 tttcctgttgaatttactattctatcacccttttatttggttcaagtttgggtgtgggagaggttcgcaaaattaccaccacaacccatgttgatcaatc 20046471  T
Q  710 atgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactca 786  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  20046472 ccagcgaccctttattgtttaggtggcataaggttcacgcattgaaaattgataatgttaagttggcattagactca 20046548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 10 - 797
Target Start/End: Original strand, 19848639 - 19849435
Alignment:
Q  10 aaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatac 109  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||   | ||     
T  19848639 aaatgggtttcttgggttcataaacttaaacaaaactatgaatctgtgtggaagaaagttggaatctttgatgctattatggccactaagtgctacttaa 19848738  T
Q  110 tgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggagga 209  Q
      | ||||||||||||||||  || ||| |  |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19848739 ataaaaatcaaaacttgctagttggggtagttgagaaatggtgtcctaatacaaatacctttgtgttttcctttggtgaagcaacaatcactttggagga 19848838  T
Q  210 tattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgca 309  Q
    ||| |||||| | || ||||| |||||  | || |||||||||||||  |||||| | |||  | |||||| |||| | ||| | ||  | ||| |||||    
T  19848839 tatcatggttctagggggttatcctgttcttggtgatcctgttttcacttcacttcatgaccaagaaatgaaagagattgaagaaaagctcatcattgca 19848938  T
Q  310 agacagcaacttactaatcggaaaca---acgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcat 406  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||   | ||   ||   |||||||   ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19848939 agacaacaacttactaatgcgaaacatggaggtgtggctagcacatcatactggatggatattttcattgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcat 19849038  T
Q  407 ttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcc 506  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||     
T  19849039 ttcttgctacttggttgtcactttttgtttttcctcataaaaactatttggtgaaaagttctttgtttcctattgctgtatatcttgctagaggaaatcg 19849138  T
Q  507 tattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgat 606  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19849139 tattgctttagcacctgctgttttagctagtctatataaggatttaactttgtttaagaaaacaatcactgatttgtcaaaatgtcatgttggtggtgat 19849238  T
Q  607 aggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaatttt------acaaccacaacccatgt 700  Q
    || | ||| || ||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      ||| |||||| ||||||    
T  19849239 agatttcccttggagattactcttaaatcacccttttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaaatttgcaaccacagccacaaaccatgt 19849338  T
Q  701 tgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagctattgatga 797  Q
    ||| ||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  19849339 tgaccaaccatggggatcctttattgtttagatggcataaggttcaggccttgaaaattgacaatgttaggttggcattagactcggctatggatga 19849435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 791
Target Start/End: Original strand, 19950776 - 19951554
Alignment:
Q  10 aaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatac 109  Q
    |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| || ||  |    ||||    
T  19950776 aaatgggaatgttggtttgagcagcttaaaccaaagtatgaatctgtgtggaagaaagctggaatctttgatgctattatgagtactaaaagcataatac 19950875  T
Q  110 tgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggagga 209  Q
      | |||||| |||||||| | || |||||  |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  19950876 ataaaaatcataacttgctttttggggttgttgagaaatggtgtactgagaccaatacatttgtgtttccatttggtgaggcaactatcactttggagga 19950975  T
Q  210 tattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgca 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||  ||||| ||||   | |||||| |||||| ||| | ||  | ||| |||||    
T  19950976 tgttatggttttggggggttaccctgttcttggtgatcctgttttcattacacttcaagatcaagaaatgaaagaggttgaagaaaagctcatcattgca 19951075  T
Q  310 agacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtaca-catcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcattt 408  Q
    ||||||  |||| ||||    |||  | ||   || || | || || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19951076 agacagacactttctaagactaaaacaggtatggc-tagagcaacattatggatggatattttcactgataaaggtagtgaaattgaacatgaagccttc 19951174  T
Q  409 cttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatccta 508  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||  | |     ||||  |||| || | | || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19951175 cttgttacttggttgtcactttttgtttttcctaataataaattg---gtgaggagttattcgctacctattgctattcatcttgctagaggaaatccta 19951271  T
Q  509 ttgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgatag 608  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19951272 ttgctttggctccagctgttttagctagcatatataaggatttaactttgtttaaaaaagcaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgatag 19951371  T
Q  609 gtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaat 708  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| ||     
T  19951372 atatcctttagaacttactcttcaatcacccttttacttggttcaaatttggatttgggagaggtttaaaaatttacaaccacaacccatgccgataaac 19951471  T
Q  709 catgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagctat 791  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| |||  || |||||| | | ||||||||| |||||||    
T  19951472 catggagacccttttttgtttaggtggcataaggttaagcccttgagaatccacgatgttaggttagcattagacgcagctat 19951554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 769
Target Start/End: Original strand, 26646661 - 26647412
Alignment:
Q  9 caaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcata 108  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||  ||  ||||| | ||||||||| | ||||| |||||||| || || ||| |||| | ||| ||||||    
T  26646661 caaatgggttagatgggttgatcaacttaaactcaaatatgaaacagtgtggaagaaagttggcatctttgaagcaataatgggcacaaggtgccgcata 26646760  T
Q  109 ctgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggagg 208  Q
    |  | ||||||  |||||||||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||| |||||| || | |||| |||||| || || ||||||||||    
T  26646761 cataaaaatcatgacttgctatatggggtagttgagaaatggtgttgtgagacaaatacctttgtgattgcctttggtgaagcaactattactttggagg 26646860  T
Q  209 atattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgc 308  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  26646861 atatcatggttttggggggttatcctattattggggatcctgttttcatttcacttgaagaccaagaaatgagagaggtggaaaagaaactcatccttgc 26646960  T
Q  309 aagacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcattt 408  Q
    |||| ||||||||  |||      |||  || | ||    ||| || | ||||| ||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26646961 aagagagcaactttgtaa------acacggtaaggctagaacaccattatggatcgatagtttcatggataaaggtagtgaaattgaacatgaagcattc 26647054  T
Q  409 cttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatccta 508  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||  | |   ||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  26647055 ctttctacttggttgtcagtttatgtttttcctcatctaaa---tttggtgaaaagttgtttgtttcctattgctgttcatcttgctagagggaatccaa 26647151  T
Q  509 ttgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgatag 608  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |  ||  |||||||||||    
T  26647152 ttgctttggcaccggctgttttagctagcttatataaggatttaagtttgtttaagaaaacacttgttgatttgaaaaaaatttctgatggtggtgatag 26647251  T
Q  609 gtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaat 708  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||     
T  26647252 atatcctttggaagttactcttcaatcacccttttacttggttcaaatttgggtgtgggaaaggttcaaaaatttacaaccacaacccaatttgatcaac 26647351  T
Q  709 catgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgtta 769  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||    
T  26647352 caaggagaccctttgttgtttaggtggcataaggttaagatcttgaaaattgacagtgtta 26647412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 790
Target Start/End: Original strand, 19818209 - 19818992
Alignment:
Q  10 aaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatac 109  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| || || ||   ||| |    
T  19818209 aaatggtttagttgggttgatgaacttaaaccaaagtatgaatctgtgtggaagaaagctagaatctttgatgctattatgagtactaaatgctacattc 19818308  T
Q  110 tgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggagga 209  Q
      | ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| | |||| || || ||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  19818309 ataaaaatcaaaacttgctatttggggttgttgagaaatggtgttgtgagactaacacctttgtttttccatttggtgaggcaactatcactttggagga 19818408  T
Q  210 tattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgca 309  Q
    | | || |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||  | || ||||   | ||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||    
T  19818409 tgtcatagttttggggggttatcctatcattggtgatcctgttttcatcaaagttaaagatcaagaaatgagagaggttgaaaagaagctcatcattgca 19818508  T
Q  310 agacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttc 409  Q
    |||||| ||| |    |    || |||  | | ||   ||||||||  |||||||| || ||   || ||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  19818509 agacagaaaccttggcagactaatcaagctaaggctaccacatcaaaatggatggaaatttttattggtaaaggtaccgaaattgaacatgaagcttttc 19818608  T
Q  410 ttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctat 509  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||  |   ||  ||||||| || | |||||||  ||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  19818609 ttgctacttggttatcaatttttgtttttcctcataagaa---tttggtgaaaaattatctgtttcctgttgctgttaatcttgctagagggaatcctat 19818705  T
Q  510 tgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgatagg 609  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||     
T  19818706 tgctttggcaccggctgttttggctaacatttataaagatttaagtttgtttaagaaaaaaatagttgatttgtcaaaatattctgttggtggtgataga 19818805  T
Q  610 tatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaa------ccacaacccatgttga 703  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||      |||||| |||||||||    
T  19818806 tttcctttagaacttactcttcaatcacccttttatttggttcaaatatgggtgtgggagaggttcaaaaatatgcaaccactgccacaaaccatgttga 19818905  T
Q  704 tcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagcta 790  Q
    | || |||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  19818906 taaaccatggagacccttttttgtttaggtggcatgatgttcaggccttggaaattgacaatgttaggatggcattagactcggcta 19818992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 380 - 797
Target Start/End: Original strand, 26653174 - 26653587
Alignment:
Q  380 aaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgat 479  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | | |     |||||||||| ||||||| | ||    
T  26653174 aaggtagtgaaattgaacatgatgcattccttgcagcttggttgtcaatttttgtttttcctcatatagaatta---gtgaaaagttctttgttttctat 26653270  T
Q  480 tgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgat 579  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||| |    
T  26653271 tgctgttcatcttgctagaggaaatcctattgctttggcaccagctgttttagctagtatatataaggacttgactttgtttaagaaaacaattgttggt 26653370  T
Q  580 ttgtcaaaatatcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaa 679  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||  || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26653371 ttgtcaaaatattatgttggtggtgatagatttcctttggaagttaatctacgatcacccttttacttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcacaa 26653470  T
Q  680 ttttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcatt 779  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||  | | |||| ||||||| | | |||||||    
T  26653471 atttgcaaccacaacccaagttgatcaatagtgaagaccattcattgttgaggtggcataaggtt-atgcccttataatttacaatgtgaggttggcatt 26653569  T
Q  780 agactcagctattgatga 797  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  26653570 agactcagcaattgatga 26653587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 349 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 24840101 - 24839869
Alignment:
Q  349 acatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaat 448  Q
    |||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24840101 acatcagtgtggatggatattttcatcgataaaggtagtgaagttgagcatgaagcatttcttgctacttggttgtcaatttttgttttccctcataaat 24840002  T
Q  449 actcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaaga 548  Q
    |||||   |||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  24840001 actctctagtgaaatgttctttgtttcctgttgctgttcatctagctagagggaatcctatttctttggcacctgctgttttggctagcttatataacga 24839902  T
Q  549 tttaagtttgtttaagaaaacaattgttgattt 581  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24839901 tttaaggttgtttaagaacacaattgttgattt 24839869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 375 - 733
Target Start/End: Original strand, 30914660 - 30915018
Alignment:
Q  375 tgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgttt 474  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |   ||  |||||||||| |||||||    
T  30914660 tgataaagttagtgaaattgaacatgaagcattccttactacttggttgtcaatttttgttttccctcacaaaga---tttggtgaaaagttttttgttt 30914756  T
Q  475 ccgattgc---tattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaa 571  Q
    || |||||   |||||||||||||||| | ||   | |||| || ||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30914757 cctattgcgcctattcatcttgctagagggaacattgttgcattagcaccaaaaaaattggctagcatatacaaagatttaagtttgtttaagaaaacaa 30914856  T
Q  572 ttgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagag 671  Q
    | |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| | || ||||| ||||| |||||| || | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30914857 tagttggtttgtcaaaatatcaagttggtggtgatagatgtcctatggaggttactcttcactcaccctttgacttggtacaaatttgggtttgggagag 30914956  T
Q  672 gttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggt 733  Q
    ||| |||| ||| ||||| ||  | ||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  30914957 gttaaaaaatttgcaaccgcatactatgtttatcaaccagggagacccttcattgtttaggt 30915018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 378 - 581
Target Start/End: Original strand, 19853532 - 19853735
Alignment:
Q  378 taaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccg 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |   |||||||| | |||||||||     
T  19853532 taaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggttgtctatttttgtttttcctcatagatactttattgtgaaaagatctttgtttcct 19853631  T
Q  478 attgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttg 577  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19853632 attgctattcgtcttgctagaggtaatactattgctttggcacctgctgttttggctagcttatataacgatttgagtttgtttaagaaaaaaattgttg 19853731  T
Q  578 attt 581  Q
    ||||    
T  19853732 attt 19853735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 358 - 740
Target Start/End: Original strand, 19989522 - 19989904
Alignment:
Q  358 tggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttcc- 456  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||| | || |       
T  19989522 tggatggatgttttcattgataaaggtaatgaacttgaacatgaagcatttcttgctacttggttgtcaatttttgttcatccttataaa-agtcgtgtt 19989620  T
Q  457 gtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtt 556  Q
    ||||| |||| ||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||  | ||||| |||||| |||    
T  19989621 gtgaatagttctttctttcgtgttgctattcatcttgctagaggaaatcctattgcattagcacctgcagttttggctagtttgtataaggatttaggtt 19989720  T
Q  557 tgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaat 656  Q
    |  ||||||| | | | ||| |||||||||||  || ||| |||||||||||   |||  | || | ||  |||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  19989721 tacttaagaacatattagttaatttgtcaaaacttcctgttggtggtgatagacttcccatggaggctattcttcaatcacccttttacttggttcaagt 19989820  T
Q  657 ttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataa 740  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19989821 ttgggtttgggagaggttcaaaaatttacaaccacaacccatgctgatcaactatgaagacccttttttgtttaggtggcataa 19989904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 555 - 789
Target Start/End: Original strand, 17114910 - 17115144
Alignment:
Q  555 tttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaa 654  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||   ||||||||| | ||||||||||||| | | || |   ||| |||| |||||||||    
T  17114910 tttgtttaagaaaactattattgatttgtcaaaaaatcctgtttatggtgatagatttcctttagaagttgctcgtcgaatgcccttttacttggttcaa 17115009  T
Q  655 atttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttga 754  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  17115010 atttggatgtgggagaggttcaaaaatttacaaccacaatccatgttgatcaaccatggagaccctttattgtttaggtggcatagggttcaggccgtga 17115109  T
Q  755 aaattgacaatgttatggtggcattagactcagct 789  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| ||||    
T  17115110 aaattgacaatgttaagctagcattagacttagct 17115144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 321
Target Start/End: Original strand, 19989174 - 19989485
Alignment:
Q  10 aaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatac 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||     
T  19989174 aaatgggtttattgggttgatcaacttaaacccaaatttgaatatgtgtggaagaaagttggcatctttgaagctattatgagtaccaagtgttgcataa 19989273  T
Q  110 tgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggagga 209  Q
     || | |||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||| ||    
T  19989274 agaaagatcataacttgctatttggggttgttgagaaatggtgttgtgagacaaacacatttgtttttccatttggtgaggcaactatcactttggaaga 19989373  T
Q  210 tattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgca 309  Q
    | |||||||||| || ||||||||| |  | || ||||||||||||||  ||||| |||||  | |||||| |||||| |||||  |||||||||||| |    
T  19989374 tgttatggttttagggggttaccctattcttggtgatcctgttttcattacacttcaagaccaagaaatgaaagaggtggaaaaggaattgatccttgaa 19989473  T
Q  310 agacagcaactt 321  Q
    ||||||||||||    
T  19989474 agacagcaactt 19989485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 356 - 578
Target Start/End: Original strand, 19858070 - 19858292
Alignment:
Q  356 tgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttc 455  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| |      
T  19858070 tgtggatggatattttcatcgataaaggtagtgaaattgagcatgaagcatttcttgctacttggttgtcaatttttgtttttcctaatagatactttaa 19858169  T
Q  456 cgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagt 555  Q
     |||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  19858170 tgtgaaaagatctttgtttcctattgctattggtcttgctagaggaaatactatcgctttggcacctgctgttttggctagcttatataacgatttgagt 19858269  T
Q  556 ttgtttaagaaaacaattgttga 578  Q
    ||||||||||||  |||||||||    
T  19858270 ttgtttaagaaacaaattgttga 19858292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 348 - 582
Target Start/End: Original strand, 19943710 - 19943940
Alignment:
Q  348 cacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaa 447  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |    
T  19943710 cacatcagtgtggatggatattttcatcgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggttgtcaa--tttgtttttcctcataga 19943807  T
Q  448 tactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaag 547  Q
    |||  |   |||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  19943808 tacaatgtggtgaaaagt--tctgtttcctattgctgttcatcttgctagagggattcctatggctttggcacctgctgttttggctagcttatataagg 19943905  T
Q  548 atttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttg 582  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19943906 atttgagtttgtttaagaaacaaattgttgatttg 19943940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 632 - 797
Target Start/End: Original strand, 19858343 - 19858508
Alignment:
Q  632 aatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttag 731  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  19858343 aatcacccttttacttgcttcaagtttgggtttgggaaaggttcaaaaatttagagccacaacccatgttgatcaagcatggagaacctttattgtttag 19858442  T
Q  732 gtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagctattgatga 797  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  19858443 gtggcataaggttaaggccttgaaagttgacaatgttaagttggcattagactcggctattgatga 19858508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 612 - 784
Target Start/End: Original strand, 19832123 - 19832295
Alignment:
Q  612 tcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcat 711  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||  |     
T  19832123 tcctttagaagttactcttcaatcacccttttacttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaaatttacatccacaacccatgttgttgaacaaa 19832222  T
Q  712 gaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagact 784  Q
    |  || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19832223 ggggaaccatttttgtttaggtggcataaggttaaggccttggtaattgacaatgttaggatggcattagact 19832295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 19853212 - 19853423
Alignment:
Q  58 tggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatactgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttcta 157  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||  || | ||||||||||| ||| || |||||  || ||||||||||||     
T  19853212 tggaagaaagttggaatctttgatgctattatgagtactaagagctgcataaagaaagatcaaaacttgttatgtggggttgttgacaaatggtgttctg 19853311  T
Q  158 agacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcat 257  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||||     
T  19853312 agaccaatacatttgtgttcccatttggtgaagcaacaataactttggaggatgttatggttttggggggttaccctatcattggtgatcctattttcaa 19853411  T
Q  258 ctcacttgaaga 269  Q
     |||||||||||    
T  19853412 atcacttgaaga 19853423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 631 - 791
Target Start/End: Original strand, 19943987 - 19944147
Alignment:
Q  631 caatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgttta 730  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||| ||| ||||| | ||||||| |    
T  19943987 caatcacccttttacctggttcaagtttgggtttgggaaaggttcaaaaatttgcagccacaaccaaagttgatcaataatggagaccatgtattgttga 19944086  T
Q  731 ggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagctat 791  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||    
T  19944087 ggtggcataatgttaaggccttgaaaattgacaatgtggggttggcattagattcagctat 19944147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 424 - 592
Target Start/End: Original strand, 19971677 - 19971845
Alignment:
Q  424 tcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccag 523  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |   |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | | |||| | ||| |||||||||||||||||     
T  19971677 tcaatttttgttttttctcatagatactttatagtgaaaagttctttgtttcctattgctattcatttggttagaggcaatactattgctttggcaccaa 19971776  T
Q  524 ctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatc 592  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  19971777 ctgttttggctagcttatataaggattgaactctgtttaagaaacaaattgttgatttgaaaaaatatc 19971845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 631 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 24839822 - 24839666
Alignment:
Q  631 caatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgttta 730  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||  |||| ||  ||||| | ||||||| |    
T  24839822 caatcacccttttacctggttcaagtttgggtttgggaaaggttcaaaaatttgcagccacaacccaagttgggcaataatcgagaccatgtattgttga 24839723  T
Q  731 ggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcag 787  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  24839722 ggtggcataatgttaaggccttgaaaattgacaatgtgaggttggcattagactcag 24839666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 256
Target Start/End: Original strand, 19857734 - 19857969
Alignment:
Q  22 tgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatactgagaaatcaaa 121  Q
    |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||||||| ||| || || || |||||| ||| | ||| ||    
T  19857734 tgggttgaccaacttcaaccaaaatatgaatctgtgtggaagaaagctgaaatttttgatgctattaggagtactaaatgccgcataatgaaagatccaa 19857833  T
Q  122 acttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaaga-caaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatattatggttt 220  Q
    ||||| | |||| |||||  || |||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||| | |||||| || ||||||    
T  19857834 acttggtttatggggttgttgacaaatggtgttctgagacccaatacattcgtgtttccctttggtgaagcaacaattactatagaggatgttgtggttt 19857933  T
Q  221 tgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttca 256  Q
    |||| |||||| || || | || |||||||||||||    
T  19857934 tggggggttactctctctttggtgatcctgttttca 19857969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 631 - 744
Target Start/End: Original strand, 19853764 - 19853877
Alignment:
Q  631 caatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgttta 730  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||| | |||||||||  ||| ||||| | ||||||| |    
T  19853764 caatcacccttttacttggtacaagcttgggtgtgggagagattcataaatttgcagccacaaccgaagttgatcaacaatggagaccatgtattgttga 19853863  T
Q  731 ggtggcataaggtt 744  Q
    ||||||||||||||    
T  19853864 ggtggcataaggtt 19853877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20005319 - 20005225
Alignment:
Q  142 gagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatattatggttttgggtggttaccctgt 236  Q
    ||||||||||||| | | ||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| |||||    
T  20005319 gagaaatggtgttgtgaaacaaacacctttgtgtttctatttggtgaagcaacaatcactttggaagatgtcattgttttggggggttatcctgt 20005225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Original strand, 19943503 - 19943585
Alignment:
Q  142 gagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatattatggttttggg 224  Q
    ||||||||||||| | | ||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  19943503 gagaaatggtgttgtgaaacaaacacctttgtgtttctatttggtgaagcaacaatcactttggaagatgtcattgttttggg 19943585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24840308 - 24840226
Alignment:
Q  142 gagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatattatggttttggg 224  Q
    ||||||||||||| | | ||||| || || ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  24840308 gagaaatggtgttgtgaaacaaacaccttcgtgtttctatttggtgaagcaacaatcactttggaggatgtcattgttttggg 24840226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Original strand, 26651697 - 26651899
Alignment:
Q  22 tgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatactgagaaatcaaa 121  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||  | |  || ||||||||  |||| ||||| || ||| | ||| || ||| |||||||     
T  26651697 tgggttgatcaacttaagcccaagtatgaatcagtgtggaaaaaagccggcatctttgaacctataatgagtactaagagccgcgtaatgaaaaatcaag 26651796  T
Q  122 acttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatattatggtttt 221  Q
    ||||| | |||| | || | ||||||||||||  | ||||||||   ||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| | || |||||    
T  26651797 acttggtttatgggatttctgagaaatggtgtagtgagacaaattgctttgtttttccttttggtgaggcaacaatcactttggaggatgtcattgtttt 26651896  T
Q  222 ggg 224  Q
    |||    
T  26651897 ggg 26651899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 379 - 797
Target Start/End: Original strand, 9815058 - 9815473
Alignment:
Q  379 aaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccga 478  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||   |||  |||||||||| ||||||| | |    
T  9815058 aaaggtagtgaaattgagcatgaagcgttcattgctacgtggttgtcaatctttgttttaactcataaat---ctttggtgaaaagttctttgttttcta 9815154  T
Q  479 ttgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttga 578  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9815155 ttgctattcatcttgctagaggaaattctattgctttggcaccagctgttttagctagtatttataacgatttaagtttgtttaagaaaacaatagttaa 9815254  T
Q  579 tttgtcaaaat-atcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaa 677  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9815255 tttgtcaaaattatc-tgttggtggtgatagatatcctttagaagttactcttcaatcacccttttacttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcca 9815353  T
Q  678 aattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggca 777  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  9815354 aaatttacagccagaacccatgttgatcaatcacggagaccctttattgtttaggtgacataaggttcaggccttgaaaattgacaatgttaagctggca 9815453  T
Q  778 ttagactcagctattgatga 797  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  9815454 ttagactcggctatggatga 9815473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 376 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 26355027 - 26354619
Alignment:
Q  376 gataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttc 475  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||| | |||||||||||||| |||   |||| |   |  |||||||||| ||||||||    
T  26355027 gataaaggtagtgaagttgaacatgaagcattcattgttgcttggttatcaatttttgtttttcctagaaaatgcatgttggtgaaaagttctttgtttc 26354928  T
Q  476 cgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgt 575  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  26354927 ctattgctattcatcttgctagaggaaattctattgctttggcaccggctgttttagctagcatatataaggatttaagcgtgtttaagaaaaccattgt 26354828  T
Q  576 tgatttgtcaaaat-atcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggtt 674  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26354827 tgatttgtcaaaattatc-tgttggtggtgatagatatcctttagaagttactcttcaatcaccgttttacttggttcaaatttgggtgtgggagaggtt 26354729  T
Q  675 caaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtg 774  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| | ||    
T  26354728 caaaaaattacaaccgcaacccatgttgatcaaccgtggagaccctttattgtttagatggcatagggtacaagccttgaaaattgacaatgttaagctg 26354629  T
Q  775 gcattagact 784  Q
    | ||||||||    
T  26354628 gaattagact 26354619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 257
Target Start/End: Original strand, 9814689 - 9814936
Alignment:
Q  10 aaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatac 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||     
T  9814689 aaatggatttattgggttgatcaacttaaaccaaagtatgaatctttgtggaagaaagtaggtatctttgatgctataatgagtaccaagtgccgcataa 9814788  T
Q  110 tgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggagga 209  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || || || | |||||||||    
T  9814789 tgaaagatcaaaacttgctatatggggttgttgagaaatggtgttgtaagacgaatacatttgtgtttccgtttggtgaggcgacgattagtttggagga 9814888  T
Q  210 tattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcat 257  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  9814889 tgttatggttttggggggttatcctgtcatcggtgatcctattttcat 9814936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26355393 - 26355148
Alignment:
Q  10 aaatgggtttgttgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgcatac 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||  ||||| | || |||||| | | ||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  26355393 aaatggggttgttgggttgatcaacttaagctcaaatatgaaccggtttggaagaaagctgggatttttgatgctataatgagtaccaaatgccgcatac 26355294  T
Q  110 tgagaaatcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggagga 209  Q
    ||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| ||| || ||  |   |||||||||    
T  26355293 tgaaaaatcaaaacttgctttacggggttgtggagaaatggtgttgtgagactaatacatttgtgtttccgtttggtgaggcgacggtaggtttggagga 26355194  T
Q  210 tattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttc 255  Q
    | |||||||| | || |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  26355193 tgttatggttcttgggggttaccctgtcattggtgatcctattttc 26355148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38435465 - 38435286
Alignment:
Q  142 gagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatattatggttttgggtggttaccctgtcatc- 240  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||     
T  38435465 gagaaatggtgttgtaagaccaatacatttgtgtttccacttggtgtagcaacaatcacttttgaagatatcatggttttggg-ggttatccacttatcc 38435367  T
Q  241 -------ggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgcaagaca 314  Q
           |  ||||||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  38435366 tatacttgatgatcctgttttcaccacagttgaagaccaagaaatgagagaggtggaaaagaaattgatacttgcaagaca 38435286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 797
Target Start/End: Original strand, 1716875 - 1717656
Alignment:
Q  22 tgggttgatcagcttaaaccaaagcatgaatctgtgtggaagcaggttggaatctttgatgctattatgagcaccaagtgtcgc---atactgagaaatc 118  Q
    ||||||||| | |||||||  || |||||| | ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    |||  || |||||    
T  1716875 tgggttgatgaacttaaactcaaacatgaaacagtgtggaagaaagttggcatctttgaagctataatgagcaccaagtgtcgtcgtataaagaaaaatc 1716974  T
Q  119 aaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatattatggt 218  Q
    |||||||| |||||| | |||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1716975 aaaacttgttatatgggattgttgaaaaatggtgttgtgagacaaatacatttgtgtttccttttggtgaagccacaatcactttggaggatattatggt 1717074  T
Q  219 tttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgcaagacagcaa 318  Q
    ||| || | |||||||||||| || |||||||||||| | || |||||||||  | |||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||| | |||    
T  1717075 tttaggggattaccctgtcattggtgatcctgttttcgtttcgcttgaagaccaagaaatgaaagagattgaagataaattgatccttgcaagagaacaa 1717174  T
Q  319 cttactaatcggaaacaa--cgtcacgcgta-cacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgcta 415  Q
    ||   | || ||||||||   |  | || ||  ||| || | ||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1717175 ct---ttataggaaacaaggaggtaggcctagaacaacattatggatggatgtttttgttgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgcta 1717271  T
Q  416 cttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgcttt 515  Q
    ||||| ||||  ||| |||||| |||||||||    |||  |||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1717272 cttggttgtcggtttatgtttttcctcataaa---gctttggtgaaaaaatctttgtttcctattgctgttcatcttgctagaggaaatcctattgcttt 1717368  T
Q  516 ggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgataggtatcct 615  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| | | ||    
T  1717369 ggcaccggctgttttagctagcatatataaggatttaactttgtttaagaaaacaatagttggtttgtcaaaatatcctgttggtggcgatagattttct 1717468  T
Q  616 ttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaac------ccatgttgatcaatc 709  Q
       || ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||      ||| | ||| ||| |    
T  1717469 aaggaggttagtcttcaatcacccttttacttggttcaaatttgggtgttgggaaggttcaaaagtttacaatcacaactaaaaaccacgatgaccaacc 1717568  T
Q  710 atgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagctattgatga 797  Q
    | | ||||||||| | ||||||||||| || |  | | |  |||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  1717569 acggagaccctttttggtttaggtggcgtatgagtaaagacttgaaaattgaagatgttaggttgacattagactcagctattgatga 1717656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 175 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 6398039 - 6397429
Alignment:
Q  175 tttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatattatggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaa 274  Q
    ||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  |||||| |||  || ||||||||||||| |  | || |||||  |     
T  6398039 tttccctttggtgaggcaacaataactttggaggatatcattgtcttgggggtctaccctatcactggggatcctgttttcacccaagttaaagaccaag 6397940  T
Q  275 aaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgcaagacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgc 374  Q
    ||||| || |||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| ||| ||||  || |||| || |||| |||| | |||||||||||||||      
T  6397939 aaatgtgataggtggaaaataaattgatcctagaaagaaagcaacttacaaataggaatgaaggtcatgcttacatatcattatggatggatatgttcat 6397840  T
Q  375 tgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagtt--gtttgt 472  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| || ||| |||| |||| |       ||||||||||  |||||     
T  6397839 cgataaaggtagtgaaattgaacatgaagccttccttgctacctggttgtcaatttgtgcttttcctcctaaaaaaatg---gtgaaaagttttgtttgc 6397743  T
Q  473 ttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaat 572  Q
    || | |||  | || |||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  6397742 tttctattaatgttaatcttgctagagaaaatccaattgctttggcaccatctgttttggctatcatatataaggatttatctttatttaagaaaacaat 6397643  T
Q  573 tgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagagg 672  Q
    | |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||  | || | | ||| |||| |||| ||||||  |||| ||||||||| |||||| |||| |||||    
T  6397642 tattgatttgtcgaaatatcttgttggtgatgataaatttcatgttgaatttactcttctatcacctttttacttggttcaagtttgggcgtggaagagg 6397543  T
Q  673 ttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatgg 772  Q
    |||| |  ||| |   ||||||| |||||||| |  ||   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| |     
T  6397542 ttcacacatttgcgttcacaacctatgttgattacccacatagaccctttattttttaggtggtataaggttcaggcctttaaaattgacaatattaagt 6397443  T
Q  773 tggcattagactca 786  Q
    |||||| |||||||    
T  6397442 tggcatgagactca 6397429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 707
Target Start/End: Original strand, 6398178 - 6398610
Alignment:
Q  275 aaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgcaagacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgc 374  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||  |||  || ||| | | |||||||   | ||||||||||||||       
T  6398178 aaatgagagaggtggaaaacaaattgatcctagaaagaaagaaacttaccaatacgaataaaggtcccacttacacatagttatggatggatatgtttat 6398277  T
Q  375 tgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgttt 474  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||| |||  |||| ||  |   ||||||||||||||||||    
T  6398278 ctataaaggtagtgaaattgaacatgaagccttccttgctaattggttgttaatttttgtttttcctagtaaa-acaatg--gtgaaaagttgtttgttt 6398374  T
Q  475 ccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagc--atatataaagatttaagtttgtttaag-aaaacaa 571  Q
     | |||||| || |||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||    
T  6398375 tctattgctgttaatctcgctagaggaaatccaatcggtttggcaccagctgttttagctagcatatatataaggatttaactttatttaagaaaaaaaa 6398474  T
Q  572 ttgttgatttgtcaaaatatcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagag 671  Q
    || ||||| |||||||||||||||| | || |||||| | |||| | ||| |||| ||    |||||  ||||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  6398475 ttattgatatgtcaaaatatcatgttgatgatgatagatttcctgttgaatttactctgttgtcacctttttacgtggttcaagtttaggtgtgggagag 6398574  T
Q  672 gttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaa 707  Q
    ||||| ||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  6398575 gttcacaaacttgcaaccacaactcatgttgatcaa 6398610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 376 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 22689755 - 22689550
Alignment:
Q  376 gataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttc 475  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    || || ||||||| |||||||     
T  22689755 gataatggtaatgaatttgaacatgaagcatttcttgctacttggttgtcaatttttgtttttcctcataaaaatatgtcggtcaaaagttctttgttta 22689656  T
Q  476 cgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgt 575  Q
    | ||| |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  22689655 ctatttctattcatctggctagaggcaatactattgctttggcacctgctgttttggctagcatatataaggatttgagtttgtttaagaaacaaattgt 22689556  T
Q  576 tgattt 581  Q
    ||||||    
T  22689555 tgattt 22689550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 457 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 22651912 - 22651781
Alignment:
Q  457 gtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtt 556  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  22651912 gtgaaaagttgtttgtttcctattgctgttcatcttgctagaggaaatcctattgcttttgcaccagctgttttggctagcatgtataaggatttaactt 22651813  T
Q  557 tgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaa 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22651812 tgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaa 22651781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 22652448 - 22652113
Alignment:
Q  116 atcaaaacttgctatatgaggttgcggagaaatggtgttctaagacaaatacatttgtgtttccatttgctgaagctacaatcactttggaggatattat 215  Q
    |||| |||||||||| || |||||  ||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||| ||| || || ||||| || || ||| ||||    
T  22652448 atcataacttgctatttggggttgttgagaaatggtgctgtgagacaaactcatttgtgtttccatttggtgaggcaactatcaccttagaagatgttat 22652349  T
Q  216 ggttttgggtggttaccctgtcatcggcgatcctgttttcatctcacttgaagacacaaaaatgagagaggtagaaaacaaattgatccttgcaagacag 315  Q
    | |||| |  |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||     
T  22652348 gattttagagggttaccctgttcttggtgatcctgttttcatctcacttgaagatgaaaagatgagagaggtggaaaagaagatgatccttgcaagacaa 22652249  T
Q  316 caacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtaca-catcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgct 414  Q
      | || ||| |  ||||||| |||| || || | || || | ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22652248 acaatttctactaagaaacaaagtcaggc-tagagcaacattatggatggatattttcatcgataaaggtagtgaaattgaacatgaagcgttccttgct 22652150  T
Q  415 acttggctgtcaatttttgttttccctcataaatact 451  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  22652149 acttggttgtcaatttttgtttttgctcatagatact 22652113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 378 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22685778 - 22685642
Alignment:
Q  378 taaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccg 477  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||     ||  ||||||| || | ||||||||    
T  22685778 taaaggtagtgaaattgagcatgaagcatttcttgctgcttggttgtcactttttgtttttcctcataaa---attttggtgaaaacttctatgtttccg 22685682  T
Q  478 attgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttgg 517  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22685681 attgctattcatcttgctagagggaatcctattgctttgg 22685642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 631 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 22689521 - 22689385
Alignment:
Q  631 caatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgttta 730  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||| | |||| || |    
T  22689521 caatcacccttttacttggttcaagtttgggtgtgggagaggttcaaaaatttgcaaccacggcccatgttgatcaatagtgaagaccatgtattattga 22689422  T
Q  731 ggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgt 767  Q
     |||||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  22689421 agtggcatttggttaatgctttgaaaattgacaatgt 22689385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 631 - 790
Target Start/End: Original strand, 11544343 - 11544502
Alignment:
Q  631 caatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaaccacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgttta 730  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||  ||| ||||| | || || | |    
T  11544343 caatcacccatttacttggttcaagtttgggtttgggagaggttcaaaaatttgcaaccaaaacccaagttgatcaacaatggagaccatgtactgatga 11544442  T
Q  731 ggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactcagcta 790  Q
    ||||||||  |||| |  | ||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||    
T  11544443 ggtggcatttggttaaacccttgaaaattgataatgtgaggttggcattagattcagcta 11544502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 378 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 11564232 - 11564033
Alignment:
Q  378 taaaggtagtgaaattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccg 477  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  || || | ||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |   | ||||||| |||||||||     
T  11564232 taaagctagtaaaattgaacatgaagcattcatttctgcatggctttccatttttgtttttcctcataaaagcttgttgatcaaaagttctttgtttcct 11564133  T
Q  478 attgctattcatcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttg 577  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  | ||  ||||| || ||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  11564132 attgctgttcatcttgctagaggaaaacctattgctttagcaccgtcggttctggcttgcttatataaggatttgcgtttgtttaaggagacaattgttg 11564033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 547 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22685637 - 22685591
Alignment:
Q  547 gatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaatatca 593  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22685637 gatttaagtttttttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaacatca 22685591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 631 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 11563973 - 11563916
Alignment:
Q  631 caatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaac 688  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  11563973 caatcacccatttacttggttaaagtttggctttgggagaggttcaaaaatttgcaac 11563916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 390 - 769
Target Start/End: Original strand, 12497241 - 12497616
Alignment:
Q  390 aattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcata-aatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattca 488  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || | |     |||| ||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  12497241 aattgaacatgaagccttccttgctacctggttgtcaatttttgtttttcctcatagaaaaatg----gtgataagttatttgttttctattgctattaa 12497336  T
Q  489 tcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaa 588  Q
    |||||||||| ||||||  ||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12497337 tcttgctagaagaaatcaaattactttgccgccagctgttttggctagcataaataacgatttaactttatttaagaaaacaattattgatctgtcaaaa 12497436  T
Q  589 tatcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaac 688  Q
     ||| | | |||| | |||  | | || | ||| ||||  |||  |||||  |||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||  ||  || ||||    
T  12497437 catcttattggtgataatatattttctgttgaatttacttttctctcacctttttacttggttcatgtttgggt-tgggagaggctcgcaaacttgcaac 12497535  T
Q  689 cacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgtta 769  Q
    |||||| |||||||||||| ||   ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  12497536 cacaactcatgttgatcaaccacatagaacatttattgttgaggtggcataaggttctggccttgaaaattggcaatgtta 12497616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 390 - 769
Target Start/End: Original strand, 12521106 - 12521481
Alignment:
Q  390 aattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcata-aatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattca 488  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || | |     |||| ||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  12521106 aattgaacatgaagccttccttgctacctggttgtcaatttttgtttttcctcatagaaaaatg----gtgataagttatttgttttctattgctattaa 12521201  T
Q  489 tcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaa 588  Q
    |||||||||| ||||||  ||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12521202 tcttgctagaagaaatcaaattactttgccgccagctgttttggctagcataaataacgatttaactttatttaagaaaacaattattgatctgtcaaaa 12521301  T
Q  589 tatcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaac 688  Q
     ||| | | |||| | |||  | | || | ||| ||||  |||  |||||  |||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||  ||  || ||||    
T  12521302 catcttattggtgataatatattttctgttgaatttacttttctctcacctttttacttggttcatgtttgggt-tgggagaggctcgcaaacttgcaac 12521400  T
Q  689 cacaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgtta 769  Q
    |||||| |||||||||||| ||   ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  12521401 cacaactcatgttgatcaaccacatagaacatttattgttgaggtggcataaggttctggccttgaaaattggcaatgtta 12521481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Original strand, 12581424 - 12581632
Alignment:
Q  390 aattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcata-aatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattca 488  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| || || | |     |||||||||| ||||||| | ||||||||| |    
T  12581424 aattgaacatgaagccttccttgctacttggttgtcaatttttgtttttcctcgtagaaaaatg----gtgaaaagttatttgttttctattgctattaa 12581519  T
Q  489 tcttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaa 588  Q
    |||||||||| ||||||  ||| ||||| | | | |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12581520 tcttgctagaagaaatcgaattactttgccgcaaactgttttggctagcataaataaggatttaactttatttaagaaaacaattattgatctgtcaaaa 12581619  T
Q  589 tatcatgtgggtg 601  Q
    |||| ||| ||||    
T  12581620 tatcttgttggtg 12581632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 12580167 - 12579781
Alignment:
Q  390 aattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcat 489  Q
    |||||||||||| || || |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |     |||| ||||||||||||| |  ||| | || ||    
T  12580167 aattgaacatgaggccttcctttttacttggttgtcaatttttgtttttcctcataaaaaatg----gtgacaagttgtttgttttctgttggtgttaat 12580072  T
Q  490 cttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaat 589  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||   ||  ||| |||||||||||| |||| |||||||  || |||||||||| ||      || |||||||||    
T  12580071 cttgctagaagaaatccaatttctttggtggcaattgttttggctagcataaataaggatttaacattatttaagaaaaaaaa-----atctgtcaaaat 12579977  T
Q  590 atcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaacc 689  Q
    ||| ||| |||| |||||  |||||| |  || |||| |||| ||||||  |||| |||| | || ||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||    
T  12579976 atcttgttggtgatgatatatatcctgtttaatttactcttccatcacctttttacttggcttaagtttggatacgggagaggttcacaaactatcaacc 12579877  T
Q  690 acaacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactca 786  Q
    ||| ||||| |||||||| |    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  12579876 aca-cccatattgatcaaccgcatagaccctttattgcttaggttgaataaggttcaggccttgcaaattgacaatgttaagtttgcattagactca 12579781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 491 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 12495972 - 12495685
Alignment:
Q  491 ttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaata 590  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||   ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |||| |||        ||||||||||    
T  12495972 ttgctagaagaaatccaattgctttggtggcagttgttttggctagcataaataaggatttaactttatttaataaaaaaatc-------tgtcaaaata 12495880  T
Q  591 tcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaacca 690  Q
    || ||| |||| |||||  |||||| |  || |||| |||  ||||||  ||||||||| | || ||||| |  |||||||||||| ||  |  ||||||    
T  12495879 tcttgttggtgatgatatatatcctatttaatttactcttatatcacctttttatttggcttaagtttggatacgggagaggttcacaaactatcaacca 12495780  T
Q  691 caacccatgttgatcaatcatgaagaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcattagactca 786  Q
    || |||||||| ||||| ||   ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  12495779 ca-cccatgttcatcaaccacatagaccctttattgcttaggttgaataaggttcaggccttgcaaattgacaatgttcagtttgcattagactca 12495685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 12519878 - 12519486
Alignment:
Q  390 aattgaacatgaagcatttcttgctacttggctgtcaatttttgttttccctcataaatactcttccgtgaaaagttgtttgtttccgattgctattcat 489  Q
    ||||||||||||||| || |||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |     |||| || |||||||||| |  ||| | || ||    
T  12519878 aattgaacatgaagccttccttttaacttggttgtcaatttttgtttttcctcataaaaaatg----gtgacaaattgtttgttttctgttggtgttaat 12519783  T
Q  490 cttgctagacgaaatcctattgctttggcaccagctgtcttggctagcatatataaagatttaagtttgtttaagaaaacaattgttgatttgtcaaaat 589  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||   ||| ||| |||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||| |||        |||||||||    
T  12519782 cttgctagaagaaatccaattgctttggtggcagttgttttggctagcataaataaggacttaactttatttaagaaaaaaatc-------tgtcaaaat 12519690  T
Q  590 atcatgtgggtggtgataggtatcctttagaagttacacttcaatcacccatttatttggttcaaatttgggtgtgggagaggttcaaaattttacaacc 689  Q
    ||| ||| |||  |||||  ||| || |  || |||| |||| ||||||  ||||||||| | || ||||| |  ||||||||||  ||| | | |||||    
T  12519689 atcttgtaggtaatgatatatattctgtttaatttactcttctatcacctttttatttgggttaagtttggatacgggagaggttacaaactat-caacc 12519591  T
Q  690 acaacccatgttgatcaatcatga---------agaccctttattgtttaggtggcataaggttcaggctttgaaaattgacaatgttatggtggcatta 780  Q
    ||| |||||||||||||  ||||          |||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||||    
T  12519590 aca-cccatgttgatcacccatggtaatgatatagactctttattgcttaggttgaataaggttcaggccttgcaaattgacaatgttaagtttgcatta 12519492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12581222 - 12581117
Alignment:
Q  288 agaaaacaaattgatccttgcaagacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagt 387  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||  || |||||   ||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||| |    
T  12581222 agaaagcaaattgatccttgaaagaaagcaacttacaaataggaatgaaggtcacaattacacatcattatggatggatatgttcaacgataaaggtaat 12581123  T
Q  388 gaaatt 393  Q
    ||||||    
T  12581122 gaaatt 12581117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12497039 - 12496933
Alignment:
Q  288 agaaaacaaattgatccttgcaagacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagt 387  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||  || |||||   ||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||| |    
T  12497039 agaaagcaaactgatccttcaaagaaagcaacttacaaataggaatgaaggtcacaattacacatcattatggatggatatgttcaacgataaaggtaat 12496940  T
Q  388 gaaattg 394  Q
    |||||||    
T  12496939 gaaattg 12496933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12520904 - 12520798
Alignment:
Q  288 agaaaacaaattgatccttgcaagacagcaacttactaatcggaaacaacgtcacgcgtacacatcaatgtggatggatatgttcgctgataaaggtagt 387  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||  || |||||   ||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||| |    
T  12520904 agaaagcaaactgatccttcaaagaaagcaacttacaaataggaatgaaggtcacaattacacatcattatggatggatatgttcaacgataaaggtaat 12520805  T
Q  388 gaaattg 394  Q
    |||||||    
T  12520804 gaaattg 12520798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University