View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4437_low_17 (Length: 241)

Name: NF4437_low_17
Description: NF4437
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4437_low_17
NF4437_low_17
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (57-227)||(3465304-3465483)
chr1 (57-227)||(28598140-28598319)
chr1 (51-227)||(1187653-1187838)
chr1 (57-227)||(28574128-28574307)
chr1 (57-227)||(13654166-13654345)
chr1 (51-227)||(44524216-44524397)
chr1 (116-227)||(48366245-48366357)
chr1 (52-227)||(43358577-43358763)
chr1 (51-227)||(16051031-16051216)
chr1 (115-227)||(29681487-29681600)
chr1 (52-221)||(10186783-10186954)
chr1 (51-181)||(35624842-35624981)
chr1 (118-227)||(19310726-19310834)
chr1 (160-227)||(3468010-3468077)
chr1 (51-220)||(17415386-17415564)
chr1 (119-182)||(3696543-3696605)
chr1 (1-36)||(10841898-10841933)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (52-227)||(20752312-20752496)
chr6 (57-227)||(21275604-21275783)
chr6 (51-225)||(24509024-24509207)
chr6 (51-225)||(24509528-24509711)
chr6 (116-227)||(21936874-21936985)
chr6 (118-225)||(21937471-21937578)
chr6 (58-227)||(2889048-2889222)
chr6 (58-227)||(2887326-2887500)
chr6 (115-226)||(11183361-11183472)
chr6 (1-42)||(24323697-24323738)
chr6 (51-115)||(12909454-12909518)
chr6 (1-33)||(24212567-24212599)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (57-227)||(14318809-14318988)
chr8 (57-227)||(26982070-26982249)
chr8 (51-227)||(18608822-18609007)
chr8 (57-227)||(14315105-14315284)
chr8 (57-227)||(34108060-34108239)
chr8 (116-227)||(26987183-26987294)
chr8 (115-227)||(10341151-10341263)
chr8 (57-225)||(43957045-43957222)
chr8 (115-225)||(25953355-25953465)
chr8 (61-227)||(18884899-18885074)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (57-227)||(12856620-12856799)
chr7 (57-227)||(14610195-14610374)
chr7 (57-227)||(26050852-26051031)
chr7 (57-227)||(26060211-26060390)
chr7 (57-227)||(26055965-26056144)
chr7 (57-227)||(26065324-26065503)
chr7 (116-227)||(12851573-12851684)
chr7 (57-223)||(35352489-35352664)
chr7 (115-227)||(37460035-37460147)
chr7 (58-224)||(4181578-4181753)
chr7 (115-227)||(5436724-5436837)
chr7 (115-227)||(11056523-11056635)
chr7 (57-157)||(14615261-14615370)
chr7 (57-110)||(12851505-12851558)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (57-227)||(39903676-39903855)
chr5 (57-227)||(39908789-39908968)
chr5 (57-227)||(9872618-9872797)
chr5 (57-227)||(9877733-9877912)
chr5 (116-227)||(35369085-35369196)
chr5 (116-225)||(13556501-13556610)
chr5 (51-227)||(43378262-43378447)
chr5 (51-227)||(2022788-2022974)
chr5 (115-227)||(25183996-25184108)
chr5 (115-227)||(4555551-4555663)
chr5 (1-41)||(16076424-16076464)
chr5 (51-110)||(35369222-35369284)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (57-227)||(35095859-35096038)
chr4 (51-227)||(32429477-32429663)
chr4 (116-227)||(35090814-35090925)
chr4 (52-227)||(3424894-3425078)
chr4 (57-227)||(3415346-3415525)
chr4 (51-227)||(34279685-34279870)
chr4 (51-225)||(47071234-47071416)
chr4 (55-224)||(54859354-54859531)
chr4 (115-221)||(30020050-30020157)
chr4 (115-206)||(14646483-14646574)
chr4 (116-227)||(34128431-34128542)
chr4 (57-227)||(18716317-18716499)
chr4 (118-227)||(18670743-18670850)
chr4 (118-227)||(18737060-18737172)
chr4 (155-191)||(46641401-46641437)
chr4 (1-34)||(6459952-6459985)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (57-227)||(4049638-4049817)
chr3 (57-227)||(5458206-5458385)
chr3 (57-227)||(5481682-5481861)
chr3 (57-227)||(6853146-6853325)
chr3 (57-227)||(8458142-8458321)
chr3 (57-227)||(10673132-10673311)
chr3 (57-227)||(10678247-10678426)
chr3 (57-227)||(1302439-1302618)
chr3 (57-227)||(8464581-8464760)
chr3 (57-227)||(10591489-10591668)
chr3 (57-227)||(31081701-31081880)
chr3 (57-227)||(4054772-4054951)
chr3 (57-227)||(6858249-6858428)
chr3 (57-227)||(31076596-31076775)
chr3 (57-225)||(33702796-33702973)
chr3 (57-215)||(10586388-10586555)
chr3 (57-227)||(33703131-33703309)
chr3 (116-227)||(29827328-29827439)
chr3 (118-227)||(18024342-18024450)
chr3 (115-223)||(20890958-20891065)
chr3 (118-227)||(3187648-3187756)
chr3 (115-227)||(49784391-49784506)
chr3 (64-110)||(49784324-49784370)
chr3 (2-34)||(11508512-11508544)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (57-227)||(17720720-17720899)
chr2 (57-227)||(45120217-45120396)
chr2 (57-227)||(14917576-14917755)
chr2 (116-227)||(30283635-30283746)
chr2 (52-213)||(16284262-16284433)
chr2 (52-225)||(42780009-42780192)
chr2 (57-172)||(39196121-39196245)
chr2 (1-42)||(40967399-40967440)
chr2 (1-33)||(36359315-36359347)
[»] scaffold0223 (2 HSPs)
scaffold0223 (116-227)||(2213-2324)
scaffold0223 (57-152)||(7246-7350)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (57-227)||(143927-144106)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (115-206)||(170716-170807)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (57-177)||(16438-16567)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 3465304 - 3465483
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  3465304 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgtccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 3465403  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3465404 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 3465483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 28598140 - 28598319
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28598140 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 28598239  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28598240 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 28598319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Original strand, 1187653 - 1187838
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgat 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||  |||||||| |||||| ||||         |||||||||||||||||||||| ||     
T  1187653 gttatgcatgtaaaactcaaagtgcatggggttgccacactaacctttaggtttgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggaaagac 1187752  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1187753 cagcgaatctccttcatgatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacaatattttacaga 1187838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 28574128 - 28574307
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28574128 catgtaaaacttaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 28574227  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28574228 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 28574307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 13654166 - 13654345
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||| | | | ||||    
T  13654166 catgtaaaattcaaagcgcatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcga 13654265  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13654266 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 13654345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44524397 - 44524216
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgat 141  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  44524397 gttatgcatgcaaaactcaaagcgcatggggttgtcacactaacatttag-ttcgattcgcccccatcaataactgtatattggatgcaataggaatgat 44524299  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44524298 cgacgaatccccttcggaatactatgagttccttgatgtgtattgcacaacca---caagcgtatctcctaacagtattttacaga 44524216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48366357 - 48366245
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaata-ggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaac 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  48366357 tgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttgaggatactatgaggtccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctccaaac 48366258  T
Q  215 aatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||    
T  48366257 aatattttacaga 48366245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 43358577 - 43358763
Alignment:
Q  52 ttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatc 142  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||| |||||||||||||| | ||||         ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  43358577 ttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggttgccacactaacatttaggttcgatttgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagtgacc 43358676  T
Q  143 agcgaatccccttcaggatactat--gagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
     ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  43358677 ggcgaatccccttcagaatactatatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaaacatatctcctaacaattttttacaga 43358763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Original strand, 16051031 - 16051216
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgat 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || |||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         |||||||| ||||||| | ||||||     
T  16051031 gttatgcatgtaaaactcagagcgcacggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatatttgatgcaaaatgaatgac 16051130  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16051131 tagcgaatacccttcaagatactatgagttccttgatgtgtattgcacagccacaccaagcgtatttcctaacagtattttacaga 16051216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Original strand, 29681487 - 29681600
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaata-ggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29681487 ctgtatattggatgcaataaggaatgaccggcaaatccctttgaggatactatgaggtccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaa 29681586  T
Q  214 caatattttacaga 227  Q
    ||||||||||||||    
T  29681587 caatattttacaga 29681600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10186954 - 10186783
Alignment:
Q  52 ttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatc 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  10186954 ttatacatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataattgtatattggatgcaatagaaatgacc 10186855  T
Q  143 agcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattt 221  Q
    || ||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10186854 agtgaatcc-------gatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaaacgtatctcctaacaatattt 10186783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 181
Target Start/End: Original strand, 35624842 - 35624981
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgat 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||| |||     
T  35624842 gttatgcatgtaaaactcaaagcgcgtggggttgtcatactaacctttaggttcgattcgcccccaccaacaactgtatattggatgcaataggagtgac 35624941  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtg 181  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35624942 cggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtg 35624981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Original strand, 19310726 - 19310834
Alignment:
Q  118 tatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |    
T  19310726 tatattggatgcaataggaatgaccagcgaatcccctt-agtatattatgagttccttgacgtgtattgcacaaccgcaccaagcatatctcctaatagt 19310824  T
Q  218 attttacaga 227  Q
     |||||||||    
T  19310825 gttttacaga 19310834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 3468010 - 3468077
Alignment:
Q  160 atactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3468010 atactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 3468077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17415564 - 17415386
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgat 141  Q
    ||||| || |||||| ||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||         ||||||||||||| |||||||||||     
T  17415564 gttatgcacgtaaaaatcaaagtgtatggggttgtcacactaacatttaggttcgatttgcccccaccaataattgtatattggatgaaataggaatgac 17415465  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatatt 220  Q
    || | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  17415464 catcaaatcctcttcaggatactattagtttcttgatgtgtattgcataatcacaccaatcatatctcttaacaatatt 17415386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3696605 - 3696543
Alignment:
Q  119 atattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgt 182  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3696605 atattggatgcaatag-aatgatcaataaatctccttcaagatactatgaattccttgatgtgt 3696543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 10841933 - 10841898
Alignment:
Q  1 tatgcattgtccatatcaaccgagttaagctcacaa 36  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10841933 tatgcattgtccatatcaactgagttaagctcacaa 10841898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20752496 - 20752312
Alignment:
Q  52 ttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatc 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| |    
T  20752496 ttatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgccatactaacctttaggttcgattcgcccccacaaataactgtatattggatgcaataggaatgacc 20752397  T
Q  143 agcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20752396 ggcgaatccccttcaggatactacgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 20752312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 21275604 - 21275783
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21275604 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 21275703  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21275704 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 21275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24509207 - 24509024
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgat 141  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| || || |||||  ||||||||||||||| ||||         | ||||||||||||||||||||||||    
T  24509207 gttatgcatgtaaaactcaaaacgcatggggttgccatactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataggaatgat 24509108  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttaca 225  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24509107 cggcgaatccccttcataatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttaca 24509024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 225
Target Start/End: Original strand, 24509528 - 24509711
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgat 141  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| || || |||||  ||||||||||||||| ||||         | ||||||||||||||||||||||||    
T  24509528 gttatgcatgtaaaactcaaatcgcatggggttgccatactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataggaatgat 24509627  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttaca 225  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  24509628 cggcgaatccccttcataatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacaccatgcgtatctcctaacagtattttaca 24509711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21936985 - 21936874
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  21936985 tgtatattagatgcaataggaatggtcggagaatccccttcagaatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcgagtgtatctcctaata 21936886  T
Q  216 atattttacaga 227  Q
    ||||||||||||    
T  21936885 atattttacaga 21936874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 225
Target Start/End: Original strand, 21937471 - 21937578
Alignment:
Q  118 tatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21937471 tatattggatgcaataggaatgaccggcgaatcccctttaggatactatgagttccttgttgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcgtaacaat 21937570  T
Q  218 attttaca 225  Q
    ||| ||||    
T  21937571 attataca 21937578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 2889048 - 2889222
Alignment:
Q  58 atgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccctgta----tattggatgcaata-ggaatgatcagcgaatccc 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  2889048 atgtaaaactcaaagcgcatggggttgtcacactaacatttaggttcgattcgcccccaccaattttattggatgcaataaggaatgaccggcgaatcct 2889147  T
Q  153 cttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||   |||||| ||||| |||||||||||    
T  2889148 cttcacgatactatgaattccttcacgtgtattgcacaaccacaccaaatatatctcttaacactattttacaga 2889222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 2887326 - 2887500
Alignment:
Q  58 atgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccctgta----tattggatgcaata-ggaatgatcagcgaatccc 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |    |||||||||||||| ||||||| |  |||||||     
T  2887326 atgtaaaactcaaagcgcatggggttgtcacactaacatttaggttcgattcgcccccaccaattttattggatgcaataaggaatgaccgacgaatcct 2887425  T
Q  153 cttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||   |||||| ||||| |||||||||||    
T  2887426 cttcacgatactatgaattccttcacgtgtattgcacaaccacaccaaatatatctcttaacactattttacaga 2887500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11183472 - 11183361
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaac 214  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  11183472 ctgtatattggatgtgatgggaatgatcagtgaatcccattcaagatattatgagttccttgatgtgtattacacaaccacaccaaatgtatctcctaac 11183373  T
Q  215 aatattttacag 226  Q
    | ||||||||||    
T  11183372 agtattttacag 11183361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 24323738 - 24323697
Alignment:
Q  1 tatgcattgtccatatcaaccgagttaagctcacaatgactt 42  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24323738 tatgcattgtccaaattaaccgagttaagctcacaatgactt 24323697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 115
Target Start/End: Original strand, 12909454 - 12909518
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc 115  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  12909454 gttatgcatgtaaacttcaaagcgcatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgccccc 12909518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 24212567 - 24212599
Alignment:
Q  1 tatgcattgtccatatcaaccgagttaagctca 33  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24212567 tatgcattgtccatatcaactgagttaagctca 24212599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14318988 - 14318809
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14318988 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 14318889  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14318888 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 14318809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26982249 - 26982070
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26982249 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 26982150  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26982149 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 26982070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18609007 - 18608822
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgat 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||| ||||         ||||||||||||| |||||||||||     
T  18609007 gttatgcatgtaaaactcaaagcacatggggttgccacactaacctttaggttcaattcgcccccaccaataattgtatattggatgaaataggaatgac 18608908  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18608907 cagtaaatccccttcaggataatatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 18608822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14315284 - 14315105
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  14315284 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaatagaaatgaccggcga 14315185  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14315184 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 14315105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 34108060 - 34108239
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  34108060 catgtaaaaatcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 34108159  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34108160 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 34108239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26987294 - 26987183
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26987294 tgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaaca 26987195  T
Q  216 atattttacaga 227  Q
     |||||||||||    
T  26987194 gtattttacaga 26987183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10341263 - 10341151
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10341263 ctgtatattggatgcaataggagtgatcggcgaatccccttcatgatactatgagttccttgacgtgtattgcacaactacaccaagcgtatctcctaac 10341164  T
Q  215 aatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||    
T  10341163 aatattttacaga 10341151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43957222 - 43957045
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  43957222 catgtaaaattcaaagcgtatggggttgtcacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 43957123  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttaca 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  43957122 atccccttcaggattctatgagttctttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtgttttaca 43957045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25953465 - 25953355
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaac 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25953465 ctgtataatggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcagggtactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacacctagcgtatctcctaac 25953366  T
Q  215 aatattttaca 225  Q
    | |||| ||||    
T  25953365 agtattgtaca 25953355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 227
Target Start/End: Original strand, 18884899 - 18885074
Alignment:
Q  61 taaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatcc 151  Q
    ||||||||||| |  |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||         |||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||    
T  18884899 taaaactcaaaacgtatggggttgccacactaacatttaggttcgattcgcccccaccaattactgtagattggattcaatgggaatgaccagtgaaccc 18884998  T
Q  152 ccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  18884999 ccttcaggatactttaagttccttgatgtgtattgcacaatcacaccaagcatatctcttaacaggattttacaga 18885074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 12856620 - 12856799
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12856620 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 12856719  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12856720 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 12856799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 14610195 - 14610374
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14610195 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccagcga 14610294  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14610295 atccccttcaggatactatgagtttcttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 14610374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 26050852 - 26051031
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26050852 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 26050951  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26050952 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 26051031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 26060211 - 26060390
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26060211 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 26060310  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26060311 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 26060390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 26055965 - 26056144
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  ||| || || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26055965 catgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 26056064  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26056065 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 26056144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 26065324 - 26065503
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  ||| || || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26065324 catgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 26065423  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26065424 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 26065503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Original strand, 12851573 - 12851684
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12851573 tgtatattggatgcaataggaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaaca 12851672  T
Q  216 atattttacaga 227  Q
     |||||||||||    
T  12851673 gtattttacaga 12851684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35352664 - 35352489
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  ||||||||| ||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35352664 catgtaaaactcaaagcgcatggggttaccacactaacctttaggttcaattcgcccccaccaataattgtatattggatgcaataggaatgaccagcga 35352565  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatatttta 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  35352564 atcctcttcaggatactatgagttccatgatgtgtattgcacaaccacatcaagagtaactcctaacagtatttta 35352489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37460147 - 37460035
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37460147 ctgtatattggatgcaataagaatgaccgatgaatccacttcatgatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcttaac 37460048  T
Q  215 aatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||    
T  37460047 aatattttacaga 37460035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4181753 - 4181578
Alignment:
Q  58 atgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaa 148  Q
    |||||||| |||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||         | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  4181753 atgtaaaattcaaagcgtatggggttgtcacactaacctttaggttcgattcttccccaccaataactctatattggatgcaattggaatgaccagagaa 4181654  T
Q  149 tccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttac 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4181653 tccccttcatgatactatgagttccttgacatgtattgcacaaccacatcaagcgtatctactaacagtattttac 4181578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5436837 - 5436724
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaata-ggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5436837 ctgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaattcccttgaggatactatgaggtccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaa 5436738  T
Q  214 caatattttacaga 227  Q
    ||||||||||||||    
T  5436737 caatattttacaga 5436724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Original strand, 11056523 - 11056635
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||     
T  11056523 ctgtatattggatgcaatatgaatgaccgacgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtgttgcacaatcacaccaaacgtatctcctaat 11056622  T
Q  215 aatattttacaga 227  Q
    | |||||||||||    
T  11056623 agtattttacaga 11056635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 157
Target Start/End: Original strand, 14615261 - 14615370
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14615261 catgtaaaactcaaagcgtatggggtttccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 14615360  T
Q  148 atccccttca 157  Q
    ||||||||||    
T  14615361 atccccttca 14615370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 110
Target Start/End: Original strand, 12851505 - 12851558
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcg 110  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  12851505 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcg 12851558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 39903676 - 39903855
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  39903676 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 39903775  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39903776 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 39903855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 39908789 - 39908968
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  39908789 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 39908888  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39908889 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 39908968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9872797 - 9872618
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9872797 catgtaaaactcaaagtgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 9872698  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9872697 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 9872618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9877912 - 9877733
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    ||||||||||||||||   |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9877912 catgtaaaactcaaagtgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 9877813  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9877812 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 9877733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35369196 - 35369085
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  35369196 tgtatattggatgcaataggaatgaccagcgaatccccctcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaata 35369097  T
Q  216 atattttacaga 227  Q
     |||||||||||    
T  35369096 gtattttacaga 35369085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13556610 - 13556501
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13556610 tgtatattggatgcaataggaatgatcgacgaatcccctttaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacc 13556511  T
Q  216 atattttaca 225  Q
     |||||||||    
T  13556510 gtattttaca 13556501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Original strand, 43378262 - 43378447
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgat 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||         |||||||| |||||||| |||||||     
T  43378262 gttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgtcacactaacatttaggttcgatttacccccaccaataattgtatatttgatgcaattggaatgac 43378361  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
     || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43378362 aagtgaatccccttcaggatattattagttccttgacgtgtattgcacaatcacattaagcgtatctcctaacagtattttacaga 43378447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Original strand, 2022788 - 2022974
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaata-ggaatga 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || || || |||||  ||||||||| ||||| ||||         |||||||| ||||||||| |||||||    
T  2022788 gttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgaggttgccatactaacctttaggttccattcgcccccaccaataactgtatatttgatgcaataaggaatga 2022887  T
Q  141 tcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2022888 ccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccaaaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 2022974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Original strand, 25183996 - 25184108
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  25183996 ctgtatattggatgcaataggagttaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtttattgcacaaccataccaagcgtatctccaaac 25184095  T
Q  215 aatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||    
T  25184096 aatattttacaga 25184108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Original strand, 4555551 - 4555663
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||| || |||| |||| || |||||| ||||||||||||||| || |||| ||| | ||| || ||||    
T  4555551 ctgtatattggatgcaataggaatgaccaacaaattcctttcaagatattacgagttcattgatgtgtattgcaaaatcacaccaaacatatttcttaac 4555650  T
Q  215 aatattttacaga 227  Q
    | |||||||||||    
T  4555651 attattttacaga 4555663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 16076464 - 16076424
Alignment:
Q  1 tatgcattgtccatatcaaccgagttaagctcacaatgact 41  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16076464 tatgcattgtccatatcagctgagttaagctcacaatgact 16076424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 35369284 - 35369222
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacat---gggggtgtcacactaatatttaggttcgattcg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  35369284 gttatgcatgtaaaactcaaagcgcatatgggggttgccacactaatctttaggttcgattcg 35369222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 35095859 - 35096038
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35095859 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 35095958  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35095959 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 35096038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32429663 - 32429477
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaata-ggaatga 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||| |||||||    
T  32429663 gttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataaggaatga 32429564  T
Q  141 tcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32429563 ccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacacaaagcgtatctcctaacagtattttacaga 32429477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Original strand, 35090814 - 35090925
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35090814 tgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaaca 35090913  T
Q  216 atattttacaga 227  Q
     |||||||||||    
T  35090914 gtattttacaga 35090925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3425078 - 3424894
Alignment:
Q  52 ttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatc 142  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||         || |||||||||||||||||||||| |    
T  3425078 ttatgcatgcaaaactcaaagcgcatgggattgtcacactaacctttaggttcgattctcccccaccaataactgaatattggatgcaataggaatgaac 3424979  T
Q  143 agcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3424978 agcgaatctcctttaggatactatgagttcattgatgtgtattgcacaaccacaccaaccgtatctcctaacagtattttacaga 3424894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3415525 - 3415346
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||  ||||||||| ||||| ||||         ||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  3415525 catgtaaaactcaaagcgcatgggattgccacactaacctttaggttcaattcgcccccaccaataactgtatattggatgtaataggaatgaccaacga 3415426  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  3415425 atctccttcaggatactatgagttcattgatgtgtattgcacaaccacaccaaccgtatctcctaatagtattttacaga 3415346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34279870 - 34279685
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgat 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||         ||||||||| |||||||||||||||     
T  34279870 gttatgcatgtaaaactcaaagcgcatgggattgtcacactaacctttagcttcgattcgcccccaccaataactgtatattgaatgcaataggaatgac 34279771  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |  ||| |||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34279770 cgacgattccccttcaaaatactatgagtttcttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 34279685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 225
Target Start/End: Original strand, 47071234 - 47071416
Alignment:
Q  51 gttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccct--------gtatattggatgcaataggaatgatc 142  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||  ||| |        ||||||| ||||||||| |||||| |    
T  47071234 gttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttaggttcgattcaccccatcaataattgtatatttgatgcaatatgaatgacc 47071333  T
Q  143 agcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttaca 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || || |||||||||    
T  47071334 agcgaatccccttcatgatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacaccaatcatatctcatatcagtattttaca 47071416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54859531 - 54859354
Alignment:
Q  55 tacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc--------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcg 146  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |||| |||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  54859531 tacatttaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttatgttcaattcgtcccaccaataattgtatattggatgcaataggaattaccagcg 54859432  T
Q  147 aatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttac 224  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  54859431 aaaccccttcatgataatatgagttccttgatgtgtattacacaactacaccaaacgtatctcctaacagtattttac 54859354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30020157 - 30020050
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaata-ggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  30020157 ctgtatattggatgcaataaggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcataaccacaccaaacgtatctcctaa 30020058  T
Q  214 caatattt 221  Q
    || |||||    
T  30020057 cagtattt 30020050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14646574 - 14646483
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14646574 ctgtatattggatgcaataggaatgacccgcgaatcccctttaggatactatgagttccttaatgtgtattgcagaaccacaccaagcgtat 14646483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34128542 - 34128431
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||     
T  34128542 tgtatattggatgcaaaaggaatgaccagcaaatctccttcaggatactatgagtttcatgaggtgtattgcacaaccacaccaaacatatctcctaacc 34128443  T
Q  216 atattttacaga 227  Q
    ||||||||||||    
T  34128442 atattttacaga 34128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 18716317 - 18716499
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaatag-gaatgatcagcg 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         | ||||||||||||||||  |||||| | |||    
T  18716317 catgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactatatattggatgcaataaagaatgaccggcg 18716416  T
Q  147 aatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaac--cacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  18716417 aatccccttcaggatactaagagttctttgacgtgtattgcacaaccacacaccaagcgtatcttctaatagtattttacaga 18716499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Original strand, 18670743 - 18670850
Alignment:
Q  118 tatattggatgcaata-ggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaa 216  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18670743 tatattgaatgcaataaggaatgaccggcgaatccc-ttcaggatactatgagttccttcatgt--attgcacaaccacaccaagtgtatctcctaacaa 18670839  T
Q  217 tattttacaga 227  Q
    |||||||||||    
T  18670840 tattttacaga 18670850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Original strand, 18737060 - 18737172
Alignment:
Q  118 tatattggatgcaatag-gaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaac--cacatcaagcgtatctcctaac 214  Q
    |||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||||     
T  18737060 tatattagatgcaataaagaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacacaccaagcgaatcttctaaa 18737159  T
Q  215 aatattttacaga 227  Q
    | |||||||||||    
T  18737160 agtattttacaga 18737172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 46641437 - 46641401
Alignment:
Q  155 tcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaa 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46641437 tcaggatattatgagttccttgatgtgtattgcacaa 46641401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 6459952 - 6459985
Alignment:
Q  1 tatgcattgtccatatcaaccgagttaagctcac 34  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6459952 tatgcattgtccatatcaactgagttaagctcac 6459985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 4049638 - 4049817
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4049638 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 4049737  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4049738 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 4049817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5458385 - 5458206
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5458385 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 5458286  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5458285 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 5458206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5481861 - 5481682
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5481861 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 5481762  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5481761 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 5481682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6853325 - 6853146
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  6853325 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 6853226  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6853225 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 6853146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 8458142 - 8458321
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8458142 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 8458241  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8458242 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 8458321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10673311 - 10673132
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10673311 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 10673212  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10673211 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 10673132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10678426 - 10678247
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10678426 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 10678327  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10678326 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 10678247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1302618 - 1302439
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  |||||||||||| || ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  1302618 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgatacgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 1302519  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1302518 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 1302439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 8464581 - 8464760
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| |||          ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8464581 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgccccaaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 8464680  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8464681 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 8464760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10591668 - 10591489
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10591668 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 10591569  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10591568 atccccttcaggatactatgagttcattgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 10591489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31081880 - 31081701
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31081880 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 31081781  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31081780 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaaacgtatctcctaacagtattttacaga 31081701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 4054772 - 4054951
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  4054772 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacga 4054871  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4054872 atccccttcaggatactatgagttccttaacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 4054951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6858428 - 6858249
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  6858428 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcaa 6858329  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6858328 atccccttcaagatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 6858249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31076775 - 31076596
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  31076775 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccgacga 31076676  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31076675 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaaacgtatctcctaacagtattttacaga 31076596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33702973 - 33702796
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  |||||||||||||||  |||         |||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  33702973 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgctcccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgactggcga 33702874  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33702873 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttaca 33702796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10586555 - 10586388
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  ||| || || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10586555 catgtaaaactcaaagcgtatgaggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 10586456  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10586455 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacgccaagcgtatctcctaaca 10586388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 33703131 - 33703309
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  33703131 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 33703230  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33703231 atccg-ttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaatagtattttacaga 33703309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Original strand, 29827328 - 29827439
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29827328 tgtatattggatgcaataggagcgaccggcgaatccccttcaagatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagggtatctcctaaca 29827427  T
Q  216 atattttacaga 227  Q
     |||||||||||    
T  29827428 gtattttacaga 29827439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18024450 - 18024342
Alignment:
Q  118 tatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaat 217  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  18024450 tatatttgatgcaataggaatgaccagcgaatatccttcaggatactatgagtt-ttttatgtgtattgcacaatcacaccaagcgtatctgttaacaat 18024352  T
Q  218 attttacaga 227  Q
    ||||||||||    
T  18024351 attttacaga 18024342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 223
Target Start/End: Original strand, 20890958 - 20891065
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaac 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  20890958 ctgtatattggatgcaatatgaatgactagtgaatccccttcag-atactatgagttccttgatgtgtattacacaatcacacaaagcgtatctcttaac 20891056  T
Q  215 aatatttta 223  Q
    | |||||||    
T  20891057 agtatttta 20891065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3187756 - 3187648
Alignment:
Q  118 tatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||| |||||||    
T  3187756 tatattggatgcaataggaatgactggcgaatccccttaaggatac-atgagtttcttgatgtgtattgcacaattacacaaagtgtatctcttaacaat 3187658  T
Q  218 attttacaga 227  Q
    ||||||||||    
T  3187657 attttacaga 3187648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Original strand, 49784391 - 49784506
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaata-ggaatgatcagcgaatccccttcaggatac--tatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcct 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  49784391 ctgtatattggatgcaataaggaatgactggcgaatccccttcaagatacactatgagttctttgacgtgtattgcacaaccataccaaacatatctcct 49784490  T
Q  212 aacaatattttacaga 227  Q
    ||||||||||| ||||    
T  49784491 aacaatattttccaga 49784506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 110
Target Start/End: Original strand, 49784324 - 49784370
Alignment:
Q  64 aactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcg 110  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49784324 aactcaaagcgcatggggttgtcaaactaacatttaggttcgattcg 49784370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 34
Target Start/End: Original strand, 11508512 - 11508544
Alignment:
Q  2 atgcattgtccatatcaaccgagttaagctcac 34  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11508512 atgcattgtccatatcaaccgagctaagctcac 11508544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17720899 - 17720720
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||| |||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  17720899 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacattaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 17720800  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17720799 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 17720720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 45120217 - 45120396
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||| ||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  45120217 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgactcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 45120316  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45120317 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 45120396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14917755 - 14917576
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| | ||         ||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  14917755 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcctccaccaataaatgtatattggatgcaatagaaatgaccggcga 14917656  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14917655 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 14917576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30283746 - 30283635
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  30283746 tgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaata 30283647  T
Q  216 atattttacaga 227  Q
     |||||||||||    
T  30283646 gtattttacaga 30283635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Original strand, 16284262 - 16284433
Alignment:
Q  52 ttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatc 142  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||   ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16284262 ttatgcatgtaaaactcaaagcgcatggggttgccacactaccttttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggaatgacc 16284361  T
Q  143 agcgaatcccctt-caggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaa 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16284362 agcgaatcccctttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgtacaaccacaccaagcgtatctcctaa 16284433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Original strand, 42780009 - 42780192
Alignment:
Q  52 ttatacatgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaatag-gaatgat 141  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||  ||||||     
T  42780009 ttatgcatgtaaaactcaaagcatatggggttaccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataacgaatgac 42780108  T
Q  142 cagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttaca 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  42780109 cggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaaatgtatctcctaacagtattttaca 42780192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 39196245 - 39196121
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  39196245 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 39196146  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39196145 atccccttcaggatactatgagttc 39196121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 40967399 - 40967440
Alignment:
Q  1 tatgcattgtccatatcaaccgagttaagctcacaatgactt 42  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40967399 tatgcattgtccttatcaactgagttaagctcacgatgactt 40967440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 36359347 - 36359315
Alignment:
Q  1 tatgcattgtccatatcaaccgagttaagctca 33  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36359347 tatgcattgtccaaatcaaccgagttaagctca 36359315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2324 - 2213
Alignment:
Q  116 tgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2324 tgtatattggatgcaataggaatgaccggcgaatccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaaca 2225  T
Q  216 atattttacaga 227  Q
     |||||||||||    
T  2224 gtattttacaga 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7350 - 7246
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7350 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 7251  T
Q  148 atccc 152  Q
    |||||    
T  7250 atccc 7246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 143927 - 144106
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||| | | | ||||    
T  143927 catgtaaaattcaaagcgcatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataactgtatattggatgcaataggagttaccggcga 144026  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtatctcctaacaatattttacaga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  144027 atccccttcaggatactatgagttccttgacgtgtattgcacaaccacaccaagcgtatctcctaacagtattttacaga 144106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 206
Target Start/End: Original strand, 170716 - 170807
Alignment:
Q  115 ctgtatattggatgcaataggaatgatcagcgaatccccttcaggatactatgagttccttgatgtgtattgcacaaccacatcaagcgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  170716 ctgtatattggatgcaataggaatgacccgcgaatcccctttaggatactatgagttccttaatgtgtattgcagaaccacaccaagcgtat 170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 177
Target Start/End: Original strand, 16438 - 16567
Alignment:
Q  57 catgtaaaactcaaagcacatgggggtgtcacactaatatttaggttcgattcgtcccc---------tgtatattggatgcaataggaatgatcagcga 147  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16438 catgtaaaactcaaagcgtatggggttgccacactaacctttaggttcgattcgcccccaccaataaatgtatattggatgcaataggaatgaccggcga 16537  T
Q  148 atccccttcaggatactatgagttccttga 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16538 atccccttcaggatactatgagttccttga 16567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University