View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4445_low_82 (Length: 292)

Name: NF4445_low_82
Description: NF4445
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4445_low_82
NF4445_low_82
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (187-285)||(28372114-28372211)
chr5 (187-284)||(37600041-37600137)
chr5 (187-284)||(38146451-38146547)
chr5 (187-284)||(19510412-19510508)
chr5 (187-284)||(22338962-22339058)
chr5 (187-284)||(33473964-33474060)
chr5 (189-284)||(22335432-22335526)
chr5 (187-284)||(22120624-22120720)
chr5 (187-284)||(23113435-23113531)
chr5 (187-284)||(41878684-41878780)
chr5 (19-89)||(23113267-23113337)
chr5 (19-89)||(22335692-22335762)
chr5 (19-89)||(22339222-22339292)
chr5 (19-89)||(28371880-28371950)
chr5 (19-89)||(37599873-37599943)
chr5 (187-284)||(15238150-15238246)
chr5 (190-284)||(24768598-24768691)
chr5 (19-89)||(41878516-41878586)
chr5 (19-89)||(42959609-42959679)
chr5 (187-284)||(20294464-20294560)
chr5 (19-79)||(9775005-9775065)
chr5 (187-271)||(18354760-18354843)
chr5 (187-274)||(19474205-19474291)
chr5 (187-284)||(10751767-10751863)
chr5 (187-284)||(20912285-20912381)
chr5 (209-284)||(22108503-22108577)
chr5 (187-274)||(40727432-40727517)
chr5 (27-89)||(38146291-38146353)
chr5 (187-284)||(11219505-11219601)
chr5 (187-284)||(11224091-11224187)
chr5 (187-284)||(11227913-11228009)
chr5 (187-284)||(11226107-11226203)
chr5 (187-284)||(11229903-11229999)
chr5 (187-242)||(22749152-22749207)
chr5 (187-279)||(36459503-36459594)
chr5 (19-64)||(22469389-22469434)
chr5 (56-89)||(22749305-22749338)
chr5 (19-60)||(17874734-17874775)
chr5 (56-89)||(19510606-19510639)
chr5 (19-63)||(23537939-23537983)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (187-284)||(109551-109647)
scaffold0026 (19-83)||(145517-145581)
scaffold0026 (56-89)||(109745-109778)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (187-284)||(224175-224271)
scaffold0012 (19-64)||(223972-224017)
scaffold0012 (53-89)||(224041-224077)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (187-284)||(10897929-10898025)
chr7 (187-284)||(14420737-14420833)
chr7 (187-284)||(18871247-18871343)
chr7 (190-284)||(15166200-15166293)
chr7 (187-284)||(146450-146546)
chr7 (187-284)||(834078-834174)
chr7 (187-284)||(1199258-1199354)
chr7 (187-284)||(16004954-16005050)
chr7 (187-284)||(41283595-41283691)
chr7 (187-284)||(18606285-18606384)
chr7 (187-284)||(838166-838262)
chr7 (187-284)||(1203346-1203442)
chr7 (187-284)||(11660232-11660328)
chr7 (187-284)||(13891580-13891676)
chr7 (187-284)||(16110008-16110104)
chr7 (187-284)||(10607353-10607449)
chr7 (187-284)||(13891963-13892059)
chr7 (187-284)||(16582371-16582467)
chr7 (190-274)||(11302267-11302350)
chr7 (19-89)||(146644-146714)
chr7 (187-284)||(7520248-7520345)
chr7 (19-89)||(10897761-10897831)
chr7 (19-89)||(18871441-18871511)
chr7 (187-284)||(39268346-39268442)
chr7 (19-86)||(29795310-29795377)
chr7 (19-86)||(29799129-29799196)
chr7 (187-284)||(39721145-39721242)
chr7 (187-284)||(9752540-9752636)
chr7 (187-284)||(15083175-15083272)
chr7 (187-284)||(31675-31771)
chr7 (187-284)||(72404-72500)
chr7 (187-284)||(76513-76609)
chr7 (187-284)||(2531365-2531460)
chr7 (187-284)||(12706155-12706251)
chr7 (187-284)||(12713490-12713586)
chr7 (187-284)||(12722148-12722244)
chr7 (187-284)||(16908542-16908638)
chr7 (187-284)||(18277944-18278040)
chr7 (187-284)||(18281908-18282004)
chr7 (187-284)||(18424185-18424281)
chr7 (187-284)||(2833514-2833610)
chr7 (187-284)||(12717237-12717333)
chr7 (19-79)||(23666406-23666466)
chr7 (187-274)||(26291116-26291203)
chr7 (19-89)||(18606481-18606552)
chr7 (187-242)||(20486733-20486788)
chr7 (187-270)||(45171533-45171615)
chr7 (187-279)||(15213003-15213094)
chr7 (187-243)||(25928404-25928460)
chr7 (207-284)||(9752644-9752720)
chr7 (187-243)||(1860054-1860110)
chr7 (187-243)||(13919445-13919501)
chr7 (19-64)||(11660486-11660531)
chr7 (19-64)||(6373448-6373493)
chr7 (19-64)||(13254928-13254973)
chr7 (19-64)||(14565257-14565302)
chr7 (19-64)||(48742808-48742853)
chr7 (19-64)||(837925-837970)
chr7 (19-64)||(1203105-1203150)
chr7 (56-89)||(16005148-16005181)
chr7 (19-64)||(16109872-16109917)
chr7 (19-64)||(37728398-37728443)
chr7 (53-89)||(11660426-11660462)
chr7 (187-233)||(16185524-16185570)
chr7 (207-243)||(9752728-9752764)
chr7 (207-243)||(39268450-39268486)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (187-284)||(15533169-15533265)
chr4 (187-284)||(18211554-18211650)
chr4 (187-284)||(24048417-24048513)
chr4 (187-284)||(36036902-36036998)
chr4 (187-284)||(28384801-28384897)
chr4 (187-284)||(30145733-30145829)
chr4 (187-284)||(49549115-49549212)
chr4 (19-89)||(15533363-15533433)
chr4 (19-89)||(36037096-36037166)
chr4 (187-284)||(17052478-17052574)
chr4 (187-284)||(22634959-22635055)
chr4 (187-284)||(20158480-20158576)
chr4 (187-284)||(20163931-20164027)
chr4 (187-284)||(13813865-13813961)
chr4 (187-284)||(13818353-13818449)
chr4 (20-89)||(18211769-18211838)
chr4 (187-269)||(12422908-12422989)
chr4 (187-284)||(4562806-4562902)
chr4 (187-284)||(5758488-5758584)
chr4 (187-284)||(9555019-9555115)
chr4 (187-284)||(14759024-14759120)
chr4 (187-284)||(14955792-14955888)
chr4 (187-284)||(15223496-15223592)
chr4 (187-284)||(20161156-20161252)
chr4 (207-284)||(24048521-24048597)
chr4 (187-284)||(33740786-33740882)
chr4 (19-89)||(49548947-49549017)
chr4 (187-284)||(12486221-12486317)
chr4 (187-284)||(23996999-23997094)
chr4 (187-284)||(25688392-25688488)
chr4 (187-271)||(17807017-17807100)
chr4 (189-284)||(38106897-38106990)
chr4 (19-89)||(30145928-30145998)
chr4 (207-284)||(13818457-13818533)
chr4 (187-243)||(631780-631836)
chr4 (187-233)||(10711825-10711871)
chr4 (187-233)||(10925595-10925641)
chr4 (19-64)||(24048214-24048259)
chr4 (187-233)||(27532752-27532798)
chr4 (190-243)||(14047308-14047361)
chr4 (201-270)||(40906323-40906391)
chr4 (19-64)||(17142491-17142536)
chr4 (201-270)||(38106798-38106866)
chr4 (207-243)||(22635063-22635099)
chr4 (53-89)||(24048283-24048319)
chr4 (19-63)||(4832137-4832181)
chr4 (19-63)||(4835432-4835476)
chr4 (207-243)||(13813969-13814005)
chr4 (207-243)||(13818541-13818577)
chr4 (53-89)||(17142431-17142467)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (187-284)||(14764828-14764924)
chr3 (187-284)||(3801920-3802016)
chr3 (187-284)||(23372576-23372672)
chr3 (187-284)||(51299483-51299579)
chr3 (187-284)||(54519547-54519643)
chr3 (187-284)||(41084-41180)
chr3 (187-284)||(9532208-9532304)
chr3 (187-284)||(10834974-10835070)
chr3 (187-284)||(13435768-13435864)
chr3 (187-284)||(18899400-18899499)
chr3 (187-284)||(20249882-20249978)
chr3 (187-284)||(29545971-29546067)
chr3 (187-284)||(12853396-12853492)
chr3 (19-89)||(9532402-9532472)
chr3 (19-89)||(12304318-12304388)
chr3 (187-284)||(16795453-16795549)
chr3 (19-89)||(3802114-3802184)
chr3 (19-89)||(14764660-14764730)
chr3 (19-89)||(23372408-23372478)
chr3 (19-89)||(29545782-29545852)
chr3 (19-89)||(51299677-51299747)
chr3 (187-284)||(8928900-8928996)
chr3 (187-284)||(11301698-11301794)
chr3 (187-284)||(5219797-5219893)
chr3 (187-284)||(19774148-19774244)
chr3 (187-284)||(38312890-38312985)
chr3 (187-284)||(7108188-7108284)
chr3 (187-284)||(7112123-7112219)
chr3 (187-284)||(11068563-11068659)
chr3 (187-284)||(11167126-11167222)
chr3 (187-271)||(12304136-12304220)
chr3 (187-271)||(16326074-16326158)
chr3 (187-284)||(22320079-22320175)
chr3 (187-284)||(22335134-22335230)
chr3 (187-284)||(28948411-28948507)
chr3 (187-284)||(55021326-55021422)
chr3 (187-274)||(11853666-11853752)
chr3 (187-284)||(14497898-14497993)
chr3 (187-284)||(30064334-30064431)
chr3 (19-89)||(54519741-54519811)
chr3 (187-284)||(4108822-4108918)
chr3 (187-284)||(4112671-4112767)
chr3 (187-284)||(14664375-14664471)
chr3 (187-284)||(14667539-14667635)
chr3 (187-284)||(15616127-15616223)
chr3 (187-242)||(14670017-14670072)
chr3 (187-242)||(14681541-14681596)
chr3 (187-284)||(12337206-12337302)
chr3 (187-284)||(16751934-16752030)
chr3 (187-279)||(11912382-11912473)
chr3 (187-274)||(18933388-18933475)
chr3 (187-270)||(15963461-15963543)
chr3 (187-270)||(15967385-15967467)
chr3 (187-270)||(15971309-15971391)
chr3 (187-243)||(15463868-15463924)
chr3 (201-284)||(15564801-15564883)
chr3 (187-233)||(4590193-4590239)
chr3 (187-233)||(8491765-8491811)
chr3 (189-279)||(16840238-16840327)
chr3 (187-233)||(17318542-17318588)
chr3 (19-64)||(10834805-10834850)
chr3 (187-243)||(23173287-23173343)
chr3 (201-270)||(15555602-15555670)
chr3 (19-64)||(16613693-16613738)
chr3 (19-64)||(18899636-18899681)
chr3 (19-64)||(22045515-22045560)
chr3 (189-233)||(14068097-14068141)
chr3 (250-284)||(17348822-17348856)
chr3 (19-64)||(13026994-13027039)
chr3 (19-64)||(16613796-16613841)
chr3 (56-89)||(20249751-20249784)
chr3 (19-64)||(22045412-22045457)
chr3 (19-64)||(34853202-34853247)
chr3 (20-64)||(17548881-17548925)
chr3 (56-89)||(10834877-10834910)
chr3 (53-86)||(18899579-18899612)
chr3 (56-89)||(38312738-38312771)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (187-284)||(10686279-10686375)
chr2 (187-284)||(19663590-19663686)
chr2 (187-284)||(20260207-20260303)
chr2 (187-284)||(9240624-9240720)
chr2 (187-284)||(6481734-6481830)
chr2 (187-284)||(6485201-6485297)
chr2 (187-284)||(37378986-37379082)
chr2 (187-284)||(21074540-21074636)
chr2 (19-89)||(20260401-20260471)
chr2 (19-89)||(10686154-10686224)
chr2 (19-89)||(6262078-6262148)
chr2 (19-89)||(19663356-19663426)
chr2 (187-284)||(10103329-10103425)
chr2 (187-284)||(12902639-12902735)
chr2 (187-284)||(24630080-24630176)
chr2 (187-284)||(24645101-24645197)
chr2 (187-284)||(24647044-24647140)
chr2 (187-284)||(24647877-24647973)
chr2 (187-284)||(30346690-30346786)
chr2 (187-274)||(27381026-27381112)
chr2 (187-274)||(27384996-27385082)
chr2 (187-284)||(27600321-27600417)
chr2 (187-284)||(31343867-31343963)
chr2 (187-243)||(9783984-9784040)
chr2 (187-270)||(41532475-41532557)
chr2 (19-89)||(21074372-21074442)
chr2 (19-64)||(9240836-9240881)
chr2 (19-64)||(22702617-22702662)
chr2 (19-64)||(26895850-26895895)
chr2 (56-89)||(6481928-6481961)
chr2 (56-89)||(6485395-6485428)
chr2 (19-60)||(22500530-22500571)
chr2 (19-60)||(22508464-22508505)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (190-284)||(8729645-8729738)
chr8 (187-284)||(11774246-11774342)
chr8 (187-284)||(363218-363314)
chr8 (187-284)||(8415009-8415105)
chr8 (187-284)||(27942718-27942814)
chr8 (187-284)||(23427776-23427872)
chr8 (187-284)||(21409850-21409947)
chr8 (187-284)||(21804342-21804439)
chr8 (187-284)||(14399125-14399221)
chr8 (187-284)||(21829493-21829589)
chr8 (187-284)||(21974216-21974312)
chr8 (187-284)||(43250152-43250248)
chr8 (187-269)||(44385866-44385947)
chr8 (187-284)||(21978326-21978422)
chr8 (187-284)||(22110551-22110647)
chr8 (187-243)||(23913255-23913311)
chr8 (187-270)||(18864137-18864219)
chr8 (187-270)||(30941597-30941679)
chr8 (187-273)||(21328527-21328612)
chr8 (187-233)||(21386159-21386205)
chr8 (187-233)||(21968025-21968071)
chr8 (187-233)||(21980865-21980911)
chr8 (187-233)||(21985848-21985894)
chr8 (187-233)||(22000811-22000857)
chr8 (19-64)||(20459295-20459340)
chr8 (190-279)||(42560917-42561005)
chr8 (187-233)||(22009229-22009275)
chr8 (56-89)||(44475843-44475876)
chr8 (56-89)||(44479105-44479138)
[»] scaffold1427 (2 HSPs)
scaffold1427 (187-284)||(150-246)
scaffold1427 (19-55)||(357-393)
[»] scaffold0544 (3 HSPs)
scaffold0544 (187-284)||(3549-3645)
scaffold0544 (19-89)||(3381-3451)
scaffold0544 (223-284)||(1-61)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (187-284)||(4475745-4475841)
chr6 (187-284)||(12941171-12941267)
chr6 (187-284)||(23955319-23955415)
chr6 (187-284)||(27222782-27222878)
chr6 (187-284)||(28290927-28291023)
chr6 (19-89)||(12941365-12941435)
chr6 (187-284)||(22075423-22075519)
chr6 (19-85)||(4475944-4476010)
chr6 (187-284)||(14470831-14470927)
chr6 (187-284)||(23537931-23538027)
chr6 (187-284)||(27416560-27416656)
chr6 (189-284)||(31479497-31479591)
chr6 (187-284)||(8242362-8242458)
chr6 (187-284)||(11565351-11565447)
chr6 (187-284)||(11716973-11717069)
chr6 (187-284)||(12620366-12620462)
chr6 (187-284)||(23988253-23988349)
chr6 (187-284)||(27555490-27555585)
chr6 (187-284)||(23400627-23400724)
chr6 (187-284)||(16758665-16758761)
chr6 (187-284)||(22947617-22947713)
chr6 (187-284)||(22951573-22951669)
chr6 (187-284)||(23870061-23870157)
chr6 (187-284)||(23874017-23874113)
chr6 (187-270)||(23393605-23393687)
chr6 (187-270)||(23413513-23413595)
chr6 (187-284)||(22861705-22861801)
chr6 (187-261)||(19869160-19869233)
chr6 (187-279)||(1254114-1254205)
chr6 (187-279)||(34297805-34297896)
chr6 (189-243)||(2076276-2076330)
chr6 (187-233)||(18918613-18918659)
chr6 (187-274)||(16622797-16622881)
chr6 (19-78)||(221295-221354)
chr6 (19-64)||(23351639-23351684)
chr6 (19-64)||(25621440-25621485)
chr6 (187-284)||(25737842-25737938)
chr6 (187-233)||(18953516-18953562)
chr6 (56-89)||(27222976-27223009)
chr6 (207-243)||(23537887-23537923)
chr6 (19-64)||(14981046-14981091)
chr6 (19-64)||(29849052-29849097)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (187-284)||(32649017-32649113)
chr1 (187-284)||(16370875-16370971)
chr1 (189-284)||(29533837-29533931)
chr1 (190-284)||(20439188-20439281)
chr1 (187-284)||(22132131-22132227)
chr1 (187-284)||(33795983-33796079)
chr1 (187-284)||(1009212-1009308)
chr1 (187-284)||(1926828-1926924)
chr1 (187-284)||(16376848-16376944)
chr1 (187-284)||(20925842-20925938)
chr1 (187-274)||(20230171-20230258)
chr1 (187-284)||(41389697-41389793)
chr1 (187-243)||(41801311-41801367)
chr1 (187-284)||(39245203-39245297)
chr1 (187-284)||(39248758-39248852)
chr1 (187-284)||(52634218-52634314)
chr1 (187-233)||(21406253-21406299)
chr1 (21-64)||(13883088-13883131)
chr1 (56-89)||(16371069-16371102)
chr1 (53-89)||(28311709-28311745)
chr1 (19-62)||(29534096-29534139)
chr1 (19-64)||(19209033-19209078)
chr1 (28-64)||(28311769-28311805)
chr1 (53-89)||(29533997-29534033)
chr1 (53-89)||(32649229-32649265)
[»] scaffold0337 (2 HSPs)
scaffold0337 (187-279)||(10854-10945)
scaffold0337 (19-89)||(10689-10756)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (190-284)||(37568-37661)
scaffold0124 (187-284)||(25600-25696)
scaffold0124 (56-89)||(37478-37511)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (187-284)||(5192-5288)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (187-284)||(33887-33983)
scaffold0080 (187-237)||(28468-28518)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (190-284)||(8775-8868)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (187-284)||(853-949)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (187-274)||(14804-14890)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (187-284)||(5563-5659)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (187-284)||(18773-18869)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (187-284)||(70705-70801)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (190-284)||(11095-11188)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (187-284)||(11001-11097)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (187-284)||(60358-60454)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (187-284)||(11727-11823)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (187-284)||(5775-5871)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (187-284)||(34160-34256)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (187-284)||(68588-68684)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (187-243)||(6993-7049)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (187-243)||(74364-74420)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (187-270)||(15607-15689)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (187-284)||(6353-6448)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (187-279)||(4076-4167)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (187-271)||(8540-8623)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (187-234)||(37235-37282)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (199-284)||(115390-115473)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (187-235)||(10765-10813)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (187-233)||(3974-4020)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (187-233)||(23970-24016)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (187-233)||(62872-62918)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (187-233)||(37230-37276)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (19-64)||(4700-4745)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (19-64)||(20-65)
scaffold0335 (19-64)||(9099-9144)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (19-64)||(20849-20894)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (19-64)||(1476-1521)
[»] scaffold2170 (1 HSPs)
scaffold2170 (27-64)||(965-1002)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (19-64)||(1840-1885)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (19-64)||(954-999)
scaffold0188 (19-64)||(3484-3529)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (19-64)||(1175-1220)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (224-284)||(641-700)
scaffold1873 (207-235)||(605-633)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (20-64)||(145659-145703)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (19-62)||(41633-41676)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (213-243)||(21390-21420)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (19-64)||(21958-22003)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (187-279)||(163600-163691)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 187 - 285
Target Start/End: Original strand, 28372114 - 28372211
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28372114 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtc 28372211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 37600041 - 37600137
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37600041 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 37600137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 38146451 - 38146547
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38146451 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 38146547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19510508 - 19510412
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19510508 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 19510412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22339058 - 22338962
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22339058 acttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaataatgatgt 22338962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 33473964 - 33474060
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33473964 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 33474060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22335526 - 22335432
Alignment:
Q  189 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22335526 ttgatgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaataatgatgt 22335432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 22120624 - 22120720
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120624 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 22120720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 23113435 - 23113531
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23113435 acttgatgatgattgtgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 23113531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 41878684 - 41878780
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41878684 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttatttatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 41878780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 23113267 - 23113337
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23113267 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 23113337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22335762 - 22335692
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22335762 attatgttgtgtcgtttataatattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 22335692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22339292 - 22339222
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22339292 attatgttgtgtcgtttataatattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 22339222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 28371880 - 28371950
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28371880 attatgttgtgtcgtttataatattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 28371950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 37599873 - 37599943
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37599873 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgaagactgtt 37599943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 15238150 - 15238246
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15238150 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15238246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 284
Target Start/End: Original strand, 24768598 - 24768691
Alignment:
Q  190 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  24768598 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattaatattatgaattaatgatgt 24768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 41878516 - 41878586
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41878516 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgataatgattacgaagttatgatgactgtt 41878586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 42959679 - 42959609
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42959679 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatatttattatgatgttatgatgactgtt 42959609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20294560 - 20294464
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20294560 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 20294464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9775065 - 9775005
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttat 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9775065 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattatgatgttat 9775005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18354843 - 18354760
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattat 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18354843 acttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattat 18354760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Original strand, 19474205 - 19474291
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19474205 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaa 19474291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10751863 - 10751767
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10751863 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaaatgataatgagatg-gttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 10751767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 20912285 - 20912381
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  20912285 acttgatgatgtgtatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatg-tttgatgaataattattgttatgaattaatgatgt 20912381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 22108503 - 22108577
Alignment:
Q  209 ttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22108503 ttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22108577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Original strand, 40727432 - 40727517
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40727432 acttgatgatg-ttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgataaagagatg-tttgatgaataattattattatgaa 40727517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Original strand, 38146291 - 38146353
Alignment:
Q  27 gtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38146291 gtgtcgtttatattattatgtgaagatttttatgatattgattacgatgtcatgatgactgtt 38146353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11219601 - 11219505
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11219601 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11219505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11224187 - 11224091
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11224187 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11224091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11228009 - 11227913
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11228009 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11227913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11226203 - 11226107
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11226203 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatg-tttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11226107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11229999 - 11229903
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||| || ||||| ||| | |||||||    
T  11229999 acttgatgatgtttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatg-tttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11229903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22749207 - 22749152
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  22749207 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcctatattcatgagttgttaat 22749152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36459594 - 36459503
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgat 279  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36459594 acttaatgatgattatgttaagttgataagttgttccttattcatgttttgctaatgagatg-gttgatgaataattattgttatgaattgat 36459503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22469434 - 22469389
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22469434 attatgttgtgttgtttatattactatgagaagatgtttatgatat 22469389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22749338 - 22749305
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22749338 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 22749305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17874775 - 17874734
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatg 60  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17874775 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgattatg 17874734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19510639 - 19510606
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19510639 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 19510606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23537983 - 23537939
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgata 63  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23537983 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatctttatgata 23537939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 109647 - 109551
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109647 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 109551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 145581 - 145517
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatg 83  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  145581 attatgttgtgttgtttatgttattataagatgatgtttatgatatggattatgatgttatgatg 145517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 109778 - 109745
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  109778 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 109745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 224175 - 224271
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224175 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 224271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 223972 - 224017
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  223972 attatgttgtgtcgtttatatttttatgagaagatgtttatgatat 224017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 89
Target Start/End: Original strand, 224041 - 224077
Alignment:
Q  53 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224041 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 224077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 10897929 - 10898025
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897929 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttt-atgaataattattattatgaaatgatgatgt 10898025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14420833 - 14420737
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14420833 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 14420737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18871343 - 18871247
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18871343 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18871247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15166293 - 15166200
Alignment:
Q  190 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15166293 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 15166200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 146546 - 146450
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146546 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctactcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 834078 - 834174
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  834078 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 834174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 1199258 - 1199354
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1199258 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 1199354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16005050 - 16004954
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16005050 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-ttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 16004954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41283691 - 41283595
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41283691 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgt 41283595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18606384 - 18606285
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaata---attattattatgaaatgatgatg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  18606384 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattattatgaaatgatgatg 18606286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 838166 - 838262
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  838166 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 838262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 1203346 - 1203442
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1203346 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 1203442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11660328 - 11660232
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11660328 acttgatgatggttatgttaagttggtaagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaaattatgatgt 11660232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13891676 - 13891580
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13891676 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13891580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 16110008 - 16110104
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16110008 acttgatgatggttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgctaatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 16110104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 10607353 - 10607449
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10607353 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10607449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13892059 - 13891963
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13892059 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttttgcatgaattgctaatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13891963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16582467 - 16582371
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16582467 acttgatgatggttatgataagttgataagttgtctttttttcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 16582371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11302350 - 11302267
Alignment:
Q  190 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11302350 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtaatgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaa 11302267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 146714 - 146644
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146714 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 146644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 7520248 - 7520345
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaat-aattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7520248 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 7520345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 10897761 - 10897831
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10897761 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 10897831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18871511 - 18871441
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18871511 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 18871441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 39268346 - 39268442
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39268346 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 39268442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 29795377 - 29795310
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgact 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29795377 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttataatattgattacgatgttatgatgact 29795310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 29799196 - 29799129
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgact 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29799196 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttataatattgattacgatgttatgatgact 29799129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39721242 - 39721145
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39721242 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39721145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 9752540 - 9752636
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9752540 acttggtgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 9752636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15083272 - 15083175
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaag-ttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15083272 acttgatgatggttatgttaaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15083175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31771 - 31675
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31771 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 72404 - 72500
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  72404 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 72500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 76513 - 76609
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  76513 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 76609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 2531365 - 2531460
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2531365 acttgatgatg-ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataaagagatgtttt-atgaataattattattatgaattaatgatgt 2531460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 12706155 - 12706251
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12706155 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12706251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12713586 - 12713490
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12713586 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12713490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12722244 - 12722148
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12722244 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12722148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 16908542 - 16908638
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16908542 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16908638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18278040 - 18277944
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18278040 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18277944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18282004 - 18281908
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18282004 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18281908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18424281 - 18424185
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18424281 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatg-gttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18424185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 2833514 - 2833610
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2833514 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatg-ttcaatgaataattattattatgaattaatgatgt 2833610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12717333 - 12717237
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12717333 acttgctgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12717237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 23666406 - 23666466
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttat 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23666406 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattaatatgttat 23666466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26291203 - 26291116
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26291203 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatg-tttgacgaataattattattatgaa 26291116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18606552 - 18606481
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgat-attgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18606552 attatgttatgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgataattgattatgatgttatgatgactgtt 18606481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20486788 - 20486733
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20486788 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 20486733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 45171533 - 45171615
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  45171533 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattatta 45171615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15213094 - 15213003
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15213094 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatg-gttgatgaataattattgttatgaattgat 15213003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 25928404 - 25928460
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25928404 actttatgatggttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgctaatg 25928460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 284
Target Start/End: Original strand, 9752644 - 9752720
Alignment:
Q  207 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9752644 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgttt-gatgaataattattattatgaattgatgatgt 9752720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 1860054 - 1860110
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1860054 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 1860110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 13919445 - 13919501
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919445 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 13919501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11660531 - 11660486
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11660531 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 11660486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 6373448 - 6373493
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6373448 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 6373493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13254973 - 13254928
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254973 attatgtggtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 13254928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14565302 - 14565257
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14565302 attatgttgtgtcatttatattattatgagaagatgtttatgatat 14565257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 48742853 - 48742808
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48742853 attatgtcgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 48742808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 837925 - 837970
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  837925 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 837970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 1203105 - 1203150
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1203105 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 1203150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16005181 - 16005148
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16005181 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 16005148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 16109872 - 16109917
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16109872 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 16109917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 37728398 - 37728443
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37728398 attatgttgtgttgtttatattattatgagaatatgtttatgatat 37728443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 11660462 - 11660426
Alignment:
Q  53 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11660462 tgtttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 11660426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16185570 - 16185524
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16185570 acttgatgagggtcatgttaagttgataagtcgtcttctattcatga 16185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 243
Target Start/End: Original strand, 9752728 - 9752764
Alignment:
Q  207 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9752728 agttgataagttatcttttattcatgaattgataatg 9752764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 243
Target Start/End: Original strand, 39268450 - 39268486
Alignment:
Q  207 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39268450 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatg 39268486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15533265 - 15533169
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533265 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 15533169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18211650 - 18211554
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18211650 acttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18211554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 24048417 - 24048513
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048417 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36036998 - 36036902
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36036998 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttcatgaataattattattatgaaatgatgatgt 36036902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28384897 - 28384801
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28384897 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgaggaataattattattatgaaatgatgatgt 28384801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30145829 - 30145733
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30145829 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 30145733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 49549115 - 49549212
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataa-gttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49549115 acttgatgatggttatgttaagttgataccgttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 49549212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15533433 - 15533363
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533433 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 15533363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 36037166 - 36037096
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36037166 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 36037096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 17052478 - 17052574
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17052478 acttgatgatgattatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 17052574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 22634959 - 22635055
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22634959 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22635055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 20158480 - 20158576
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20158480 acttgatgatgcttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20158576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 20163931 - 20164027
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20163931 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20164027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 13813865 - 13813961
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13813865 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttttgttcatgaatttataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13813961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 13818353 - 13818449
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13818353 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgcattttattcatgaatttataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13818449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 18211838 - 18211769
Alignment:
Q  20 ttatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18211838 ttatgttgtgtcgtctatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 18211769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12422989 - 12422908
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  12422989 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattatt 12422908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 4562806 - 4562902
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4562806 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4562902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 5758488 - 5758584
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5758488 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 5758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9555115 - 9555019
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9555115 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 9555019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 14759024 - 14759120
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14759024 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14759120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 14955792 - 14955888
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14955792 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14955888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15223592 - 15223496
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15223592 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatg-gttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15223496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 20161156 - 20161252
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20161156 acttgataatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 284
Target Start/End: Original strand, 24048521 - 24048597
Alignment:
Q  207 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048521 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgttaatgaaatgttt-gatgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33740882 - 33740786
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33740882 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 33740786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 49548947 - 49549017
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  49548947 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgataatgattacgaagttatgatgattgtt 49549017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12486317 - 12486221
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12486317 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12486221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 23996999 - 23997094
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23996999 acttgatgatggttatgt-aagttgataagttctcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataatcattattatgaattaatgatgt 23997094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25688488 - 25688392
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25688488 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 25688392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17807100 - 17807017
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattat 271  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17807100 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattat 17807017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38106990 - 38106897
Alignment:
Q  189 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  38106990 ttgatgatgtttatgttaagttgataaattgtctttcattcatgagttgctaat-gaatg-tttgatgaagaattattattatgaattaatgatgt 38106897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 30145998 - 30145928
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30145998 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatattgattataatgttatgatgactgtt 30145928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 284
Target Start/End: Original strand, 13818457 - 13818533
Alignment:
Q  207 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13818457 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgttt-gatgaataattattattatgaattgatgatgt 13818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 631780 - 631836
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  631780 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattctattcatgagttgctaatg 631836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10711871 - 10711825
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10711871 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10711825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10925641 - 10925595
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10925641 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10925595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 24048214 - 24048259
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048214 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 24048259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27532798 - 27532752
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27532798 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgccttctattcatga 27532752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14047361 - 14047308
Alignment:
Q  190 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  14047361 tgatgatgattatgttaagttgataagttgtattttattcatgagttgttaatg 14047308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40906391 - 40906323
Alignment:
Q  201 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  40906391 atgttaagttgttaagttgtcttctattcataagttgctaatgaaatgtttt-atgaagaattattatta 40906323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 17142536 - 17142491
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17142536 attatgttgtcttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 17142491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 38106866 - 38106798
Alignment:
Q  201 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  38106866 atgttaagttgttaagttgtcttctatttatgagttgctaatgagatgtttt-atgaagaattattatta 38106798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 243
Target Start/End: Original strand, 22635063 - 22635099
Alignment:
Q  207 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22635063 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 22635099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 89
Target Start/End: Original strand, 24048283 - 24048319
Alignment:
Q  53 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24048283 tgtttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 24048319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 4832137 - 4832181
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgata 63  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4832137 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatctttatgata 4832181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 4835432 - 4835476
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgata 63  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4835432 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatctttatgata 4835476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 243
Target Start/End: Original strand, 13813969 - 13814005
Alignment:
Q  207 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13813969 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatg 13814005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 243
Target Start/End: Original strand, 13818541 - 13818577
Alignment:
Q  207 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13818541 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatg 13818577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 17142467 - 17142431
Alignment:
Q  53 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17142467 tgtttatgatattgattataatgttatgatgactgtt 17142431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 14764828 - 14764924
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764828 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 14764924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3802016 - 3801920
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3802016 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 3801920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 23372576 - 23372672
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23372576 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 23372672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51299579 - 51299483
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51299579 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 51299483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54519643 - 54519547
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54519643 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 54519547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41180 - 41084
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgaggaataattattattatgaaatgatgatgt 41084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9532304 - 9532208
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9532304 acttgatgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 9532208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 10834974 - 10835070
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834974 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttctaatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10835070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13435864 - 13435768
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13435864 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18899499 - 18899400
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgc---taatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18899499 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatg 18899401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 20249882 - 20249978
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20249882 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaat-attcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 20249978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 29545971 - 29546067
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545971 acttgatgatggttgtgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgctaatggaa-ggtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 29546067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 12853396 - 12853492
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12853396 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 12853492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 9532472 - 9532402
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9532472 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 9532402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 12304388 - 12304318
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12304388 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 12304318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16795549 - 16795453
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16795549 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 16795453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3802184 - 3802114
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802184 attatgtcgtgtcgtttacattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 3802114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 14764660 - 14764730
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14764660 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 14764730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 23372408 - 23372478
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23372408 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 23372478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 29545782 - 29545852
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545782 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 29545852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 51299747 - 51299677
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51299747 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 51299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 8928900 - 8928996
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8928900 acttgatggtggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatggactgctaatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 8928996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 11301698 - 11301794
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11301698 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 11301794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5219893 - 5219797
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5219893 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 5219797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19774244 - 19774148
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19774244 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 19774148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 38312890 - 38312985
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat-ggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38312890 acttgatgatggttatgttaagtttataagttgtcttttattcatgaa-tgctaatgggaatg-ttcgatgaat-attattattatgaaatgatgatgt 38312985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7108284 - 7108188
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7108284 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 7108188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7112219 - 7112123
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7112219 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 7112123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11068659 - 11068563
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11068659 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11068563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 11167126 - 11167222
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11167126 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11167222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12304220 - 12304136
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataat-tattattat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  12304220 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaattgctgatggaatg-tttgatgaattatatattattat 12304136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Original strand, 16326074 - 16326158
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataat-tattattat 271  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  16326074 acttgatgagggttatgtcaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaattatatattattat 16326158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22320175 - 22320079
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22320175 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22320079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22335230 - 22335134
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22335230 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22335134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28948507 - 28948411
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28948507 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 28948411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 55021422 - 55021326
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  55021422 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 55021326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11853752 - 11853666
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11853752 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcacgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattatgaa 11853666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14497993 - 14497898
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14497993 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg--ttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14497898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30064431 - 30064334
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30064431 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatg-tttgacgaataattattattatgaattaatgatgt 30064334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 54519811 - 54519741
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  54519811 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgataatgattacgaagttatgatgactgtt 54519741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 4108822 - 4108918
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4108822 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagat-atttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4108918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 4112671 - 4112767
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4112671 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagat-atttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14664471 - 14664375
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  14664471 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattatatttatgaattaatgatgt 14664375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14667635 - 14667539
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  14667635 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattatatttatgaattaatgatgt 14667539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15616223 - 15616127
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15616223 acttgaagatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15616127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14670072 - 14670017
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14670072 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14670017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14681596 - 14681541
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14681596 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14681541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12337302 - 12337206
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgga-atgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12337302 acttgatgatgtttatgttaaattgata-gttgtcttttattcatgaattgataattgagatgttt-gatgaataagtattattatgaattgatgatgt 12337206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 16751934 - 16752030
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16751934 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttatcttttattcatcaaatgataatgagatg-gttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16752030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11912473 - 11912382
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11912473 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatg-gttgatgaataattattgttatgaattgat 11912382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Original strand, 18933388 - 18933475
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18933388 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtattttattcatgaattaataatgagatg-tttgacgaataattattattatgaa 18933475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15963543 - 15963461
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  15963543 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattatta 15963461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15967467 - 15967385
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  15967467 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattatta 15967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15971391 - 15971309
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  15971391 acttgatgatgtttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattatta 15971309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15463924 - 15463868
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15463924 acttgatgacgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 15463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15564883 - 15564801
Alignment:
Q  201 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15564883 atgttaagttgatgtgttgtcttctgttcatgagttgctaatgaaatgtttt-atgaagaattattattatgaattgatgatgt 15564801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 4590193 - 4590239
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4590193 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 4590239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 8491765 - 8491811
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8491765 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 8491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 279
Target Start/End: Original strand, 16840238 - 16840327
Alignment:
Q  189 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  || | ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16840238 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagat-tcttgctgaataattattgttatgaattgat 16840327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 17318542 - 17318588
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17318542 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 17318588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 10834805 - 10834850
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10834805 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 10834850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23173343 - 23173287
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  23173343 acttgatgatagttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagttgttaatg 23173287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15555670 - 15555602
Alignment:
Q  201 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  15555670 atgttaagttgttaagttgtcttatattcatgagttgctaatgagatg-tttgatgaagaattattatta 15555602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16613738 - 16613693
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16613738 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 16613693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18899681 - 18899636
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18899681 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 18899636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 22045515 - 22045560
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22045515 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 22045560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 14068097 - 14068141
Alignment:
Q  189 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14068097 ttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 14068141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 284
Target Start/End: Original strand, 17348822 - 17348856
Alignment:
Q  250 tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17348822 tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 17348856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 13026994 - 13027039
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13026994 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 13027039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16613841 - 16613796
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16613841 attatgttgtgttgtttatattattatgggaagatgtttatgatat 16613796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Original strand, 20249751 - 20249784
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249751 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 20249784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 22045412 - 22045457
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22045412 attatgttgtgttgtttatattattatgggaagatgtttatgatat 22045457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 34853202 - 34853247
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34853202 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 34853247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Original strand, 17548881 - 17548925
Alignment:
Q  20 ttatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17548881 ttatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 17548925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Original strand, 10834877 - 10834910
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10834877 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 10834910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18899612 - 18899579
Alignment:
Q  53 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgact 86  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18899612 tgtttgtgatattgattacgatgttatgatgact 18899579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Original strand, 38312738 - 38312771
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38312738 ttatgatatggattacgatgttatgatgactgtt 38312771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 10686279 - 10686375
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686279 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10686375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 19663590 - 19663686
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663590 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 19663686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20260303 - 20260207
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260303 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 20260207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9240720 - 9240624
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240720 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 9240624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6481830 - 6481734
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6481830 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 6481734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6485297 - 6485201
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6485297 acttgatgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 6485201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37379082 - 37378986
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37379082 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgt 37378986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 21074540 - 21074636
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21074540 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaaaaaaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 21074636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 20260471 - 20260401
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260471 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 20260401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 10686154 - 10686224
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686154 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatatttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 10686224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 6262078 - 6262148
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6262078 attatgttgtgtcgtttataatattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 6262148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 19663356 - 19663426
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19663356 attatgttgtgtcgtttataatattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 19663426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 10103329 - 10103425
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10103329 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 10103425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 12902639 - 12902735
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12902639 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12902735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 24630080 - 24630176
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24630080 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24645197 - 24645101
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24645197 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24645101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24647140 - 24647044
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24647140 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24647044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24647973 - 24647877
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24647973 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24647877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 30346690 - 30346786
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  30346690 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 30346786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Original strand, 27381026 - 27381112
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27381026 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaa 27381112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Original strand, 27384996 - 27385082
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27384996 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaa 27385082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27600417 - 27600321
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  27600417 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattgttatgaattaatgatgt 27600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31343963 - 31343867
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31343963 acttgatgatgtatatgttaagttgataagctgtcttttattcatgaattgataaagagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31343867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9784040 - 9783984
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9784040 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 9783984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 41532475 - 41532557
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  41532475 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattatta 41532557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 21074372 - 21074442
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21074372 attatgttgtgtcatttatattattatgagaatatgtttatgatattgattataatgttatgatgactgtt 21074442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9240881 - 9240836
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240881 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 9240836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22702662 - 22702617
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22702662 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 22702617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 26895895 - 26895850
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26895895 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 26895850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 6481961 - 6481928
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6481961 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 6481928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 6485428 - 6485395
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6485428 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 6485395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22500571 - 22500530
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatg 60  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22500571 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgattatg 22500530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22508505 - 22508464
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatg 60  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22508505 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgattatg 22508464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 284
Target Start/End: Original strand, 8729645 - 8729738
Alignment:
Q  190 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8729645 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8729738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11774342 - 11774246
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11774342 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 11774246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 363314 - 363218
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  363314 acttgttgatggttatgttaagatgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 363218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 8415009 - 8415105
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8415009 acttgattagggttattttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8415105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 27942718 - 27942814
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27942718 acttgatgatggttatgataagttaataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 27942814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23427872 - 23427776
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23427872 acttaatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaaatg-tttgatgaataattattattataaattgatgatgt 23427776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21409947 - 21409850
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21409947 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21409850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21804439 - 21804342
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21804439 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21804342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 14399125 - 14399221
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  14399125 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattacgaattaatgatgt 14399221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 21829493 - 21829589
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21829493 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21829589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 21974216 - 21974312
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21974216 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21974312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43250248 - 43250152
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43250248 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 43250152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 269
Target Start/End: Original strand, 44385866 - 44385947
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatt 269  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  44385866 acttgatgatgattatgttaacttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattatt 44385947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 21978326 - 21978422
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21978326 acttgatgatgtttatgttatattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21978422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22110647 - 22110551
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22110647 acttgatgatttttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23913311 - 23913255
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23913311 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 23913255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 18864137 - 18864219
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  18864137 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattatta 18864219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 30941597 - 30941679
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  30941597 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcataaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattatta 30941679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21328612 - 21328527
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  21328612 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatg-cttgttgaataattattgttatga 21328527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21386205 - 21386159
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21386205 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 21968025 - 21968071
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21968025 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21968071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 21980865 - 21980911
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21980865 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21980911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 21985848 - 21985894
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21985848 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21985894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 22000811 - 22000857
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22000811 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 22000857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20459340 - 20459295
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20459340 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 20459295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Original strand, 42560917 - 42561005
Alignment:
Q  190 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgat 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  42560917 tgatggtggttatgttaagttgacaagttgttccttattcatgcattgctaatgagatg-gttgatgaataattattgttatgaattgat 42561005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 22009229 - 22009275
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22009229 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtgttctattcatga 22009275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44475876 - 44475843
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44475876 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 44475843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44479138 - 44479105
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44479138 ttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 44479105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 246 - 150
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  246 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgtaatgatgatgt 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 357
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgt 55  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  393 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgt 357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 3549 - 3645
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3549 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 3645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 3381 - 3451
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3381 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaaaatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 3451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 1 - 61
Alignment:
Q  223 tttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tttattcatgaattgctaatggaatgttt-gatgaataattattattatgaaatgatgatgt 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4475841 - 4475745
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4475841 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 4475745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12941267 - 12941171
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941267 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctgatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 12941171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23955415 - 23955319
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955415 acttgatgagggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 23955319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27222878 - 27222782
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27222878 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-ttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 27222782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 28290927 - 28291023
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28290927 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcataaattgctaattgaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 28291023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 12941435 - 12941365
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12941435 attatgtcatgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 12941365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 22075423 - 22075519
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22075423 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 22075519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 4476010 - 4475944
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgac 85  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4476010 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgac 4475944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14470927 - 14470831
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14470927 acttgatgatgtttatgttaggttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14470831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23538027 - 23537931
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23538027 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcccttattcgtgaattgttaatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 23537931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 27416560 - 27416656
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27416560 acttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 27416656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 284
Target Start/End: Original strand, 31479497 - 31479591
Alignment:
Q  189 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31479497 ttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31479591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8242458 - 8242362
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8242458 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 8242362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11565447 - 11565351
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11565447 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11565351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 11716973 - 11717069
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11716973 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11717069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 12620366 - 12620462
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12620366 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12620462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23988349 - 23988253
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23988349 acttgatgatgtttatattaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23988253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27555585 - 27555490
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27555585 acttgatgatgtttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgttt-gatgaataagtattattatgaattgatgatgt 27555490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23400724 - 23400627
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  23400724 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcctttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattataaagtaatgatgt 23400627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16758761 - 16758665
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16758761 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatagtgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22947713 - 22947617
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22947713 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22947617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22951669 - 22951573
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22951669 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22951573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23870157 - 23870061
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23870157 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23870061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23874113 - 23874017
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23874113 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23874017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23393687 - 23393605
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23393687 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattatta 23393605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23413595 - 23413513
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23413595 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattatta 23413513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22861801 - 22861705
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  22861801 acttggtgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattatgattatgaattaatgatgt 22861705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19869233 - 19869160
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataa 261  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  19869233 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataa 19869160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1254205 - 1254114
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1254205 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgttaatgagatg-gttgatgaataattattgttatgaattgat 1254114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 279
Target Start/End: Original strand, 34297805 - 34297896
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgat 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34297805 acttgctgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatg-gttgatgaataattattgttatgaattgat 34297896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2076330 - 2076276
Alignment:
Q  189 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2076330 ttgatgatgattatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgataatg 2076276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 18918613 - 18918659
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18918613 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 18918659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16622881 - 16622797
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16622881 acttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgagatg-tttgatgaatgattatcattatgaa 16622797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 221354 - 221295
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgtta 78  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  221354 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttaagatgttgactatgatgtta 221295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23351684 - 23351639
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23351684 attatgttgtgtcgtttatattattataagaagatgtttatgatat 23351639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 25621440 - 25621485
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25621440 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 25621485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25737938 - 25737842
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||  ||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  25737938 acttgatgatgattatgctaagttgataagttgtcccttattcatgtattgctaatgagatg-cttgctgaataattactgttatgaattgataatgt 25737842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 18953516 - 18953562
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18953516 acttgatgatgattatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 18953562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27223009 - 27222976
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27223009 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 27222976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23537923 - 23537887
Alignment:
Q  207 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23537923 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgctaatg 23537887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 14981046 - 14981091
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  14981046 attatgttgtgttgtttctattattatgggaagatgtttatgatat 14981091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 29849052 - 29849097
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29849052 attatgttgtgttgtctatattattatgataagatgtttatgatat 29849097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32649113 - 32649017
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32649113 acttgatgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 32649017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16370971 - 16370875
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16370971 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-ttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 16370875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29533931 - 29533837
Alignment:
Q  189 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29533931 ttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 29533837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 284
Target Start/End: Original strand, 20439188 - 20439281
Alignment:
Q  190 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20439188 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 20439281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 22132131 - 22132227
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22132131 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22132227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33796079 - 33795983
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33796079 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgatatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 33795983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1009308 - 1009212
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1009308 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 1009212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 1926828 - 1926924
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1926828 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 1926924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 16376848 - 16376944
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16376848 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16376944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 20925842 - 20925938
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20925842 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 20925938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Original strand, 20230171 - 20230258
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20230171 acttgatgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaa 20230258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 41389697 - 41389793
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41389697 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaaatgataatgagatg-gttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 41389793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 41801311 - 41801367
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41801311 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 41801367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 39245203 - 39245297
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39245203 acttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39245297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 39248758 - 39248852
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39248758 acttgatgatgtttatgttaagttgataagt--tcttttattcatgaaatgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39248852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 52634314 - 52634218
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  52634314 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttattttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 52634218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21406299 - 21406253
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21406299 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21406253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 13883088 - 13883131
Alignment:
Q  21 tatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883088 tatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 13883131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16371102 - 16371069
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371102 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 16371069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 28311745 - 28311709
Alignment:
Q  53 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28311745 tgtttatgatattgattatgatgttatgatgactgtt 28311709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 29534139 - 29534096
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgat 62  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29534139 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgat 29534096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19209078 - 19209033
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19209078 attatgttgtgttgtctatattattataagaagatgtttatgatat 19209033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 28311805 - 28311769
Alignment:
Q  28 tgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28311805 tgtcctttatattattatgataagatgtttatgatat 28311769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 29534033 - 29533997
Alignment:
Q  53 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29534033 tgtttatgatattgattataatgttatgatgactgtt 29533997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 32649265 - 32649229
Alignment:
Q  53 tgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32649265 tgtttatgatattgattataatgttatgatgactgtt 32649229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 279
Target Start/End: Original strand, 10854 - 10945
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10854 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaaatgat 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 10689 - 10756
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689 attatgttgtgtcgtttatatt---atgagaagatgtttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 10756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 284
Target Start/End: Original strand, 37568 - 37661
Alignment:
Q  190 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37568 tgatgatggttatgttaagttgatacgttgtcttttattcatgtattgctaatggaatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 37661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 25600 - 25696
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25600 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgtgatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 25696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Original strand, 37478 - 37511
Alignment:
Q  56 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37478 ttatgatattgattacgatgttatgatgactgtt 37511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5288 - 5192
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5288 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtctattattcatgaaatgctaatggaatg-tttgatgaataattattatgatgaattgatgatgt 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33983 - 33887
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33983 acttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 33887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28518 - 28468
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28518 acttgatgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 28468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 284
Target Start/End: Original strand, 8775 - 8868
Alignment:
Q  190 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8775 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattataaaatgatgatgt 8868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 853 - 949
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  853 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14890 - 14804
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaa 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14890 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaa 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 5563 - 5659
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  5563 acttgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattgttattatgaattaatgatgt 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18869 - 18773
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  18869 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcatttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattgttattataaattgatgatgt 18773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 70801 - 70705
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  70801 acttgatgatgtttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 70705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 284
Target Start/End: Original strand, 11095 - 11188
Alignment:
Q  190 tgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  11095 tgatgatgtttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattaatattatgaattaatgatgt 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11097 - 11001
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11097 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 60358 - 60454
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  60358 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 60454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11727
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11823 acttgatgatgcttatgttaagttgatatgttgtcttttatacatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 11727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5871 - 5775
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5871 acttgatgatgtttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataattgagacgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 5775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 34160 - 34256
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34160 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 34256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 68588 - 68684
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  68588 acttgatggtgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-tttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 68684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 6993 - 7049
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6993 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatg 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Original strand, 74364 - 74420
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  74364 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgagttgctaatg 74420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 270
Target Start/End: Original strand, 15607 - 15689
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattatta 270  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  15607 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtattatta 15689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 6353 - 6448
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6353 acttgatgatgtttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg--ttgatgaataactattattatgaattaatgatgt 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4167 - 4076
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4167 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatg-gttgatgaataattattgttatgaattgat 4076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8540
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattat 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  8623 acttgatgatgtttatgttaagttaataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatg-tttgatgaatgattattattat 8540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Original strand, 37235 - 37282
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37235 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 37282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 284
Target Start/End: Original strand, 115390 - 115473
Alignment:
Q  199 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  115390 ttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatg-tttgatgaataagtatttttatgaattgatgatgt 115473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10813 - 10765
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10813 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaat 10765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4020 - 3974
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4020 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 23970 - 24016
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23970 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 24016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 62872 - 62918
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  62872 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 62918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 37230 - 37276
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37230 acttgatgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 37276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 4700 - 4745
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4700 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 4745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 65 - 20
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9144 - 9099
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9144 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 9099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20849
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20894 attatgttgtgtcgtttatattattatgagaaaatgtttatgatat 20849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1521 - 1476
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1521 attatgttgtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 1476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2170 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold2170
Description:

Target: scaffold2170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1002 - 965
Alignment:
Q  27 gtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1002 gtgttgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1885 - 1840
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1885 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 1840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 954 - 999
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  954 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 3484 - 3529
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3484 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 1175 - 1220
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1175 attatgttgtgttgtttatattattataagaagatgtttatgatat 1220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 700 - 641
Alignment:
Q  224 ttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 284  Q
    |||| ||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  700 ttatccatgaattgataatgagatgttt-gatgaataattattattatgaattgatgatgt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 605
Alignment:
Q  207 agttgataagttgtcttttattcatgaat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  633 agttgataagttgtcttttattcatgaat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 145703 - 145659
Alignment:
Q  20 ttatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145703 ttatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgatat 145659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 41633 - 41676
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgat 62  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41633 attatgttgtgttgtctatattattatgagaagatgtttatgat 41676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 243
Target Start/End: Original strand, 21390 - 21420
Alignment:
Q  213 taagttgtcttttattcatgaattgctaatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21390 taagttgtcttttattcatgaattgctaatg 21420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 21958 - 22003
Alignment:
Q  19 attatgtcgtgtcgtttatattattatgagaagatgtttatgatat 64  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21958 attatgttgtgttgtttatatttttatgggaagatgtttatgatat 22003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 279
Target Start/End: Original strand, 163600 - 163691
Alignment:
Q  187 acttgatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttgatgaataattattattatgaaatgat 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||  ||| |||||  |||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  163600 acttgatgagggttatgttaagttgataacttgttccttattcatgttttggtaatgagatg-cttgctgaataattattgttatgaattgat 163691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University