View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4490_low_6 (Length: 274)

Name: NF4490_low_6
Description: NF4490
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4490_low_6
NF4490_low_6
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (2-265)||(16376366-16376629)
chr6 (2-265)||(16383690-16383953)
chr6 (2-265)||(10488699-10488962)
chr6 (2-265)||(16556132-16556395)
chr6 (2-265)||(16632688-16632951)
chr6 (1-265)||(22225730-22225994)
chr6 (1-265)||(1556005-1556269)
chr6 (1-265)||(19610018-19610282)
chr6 (1-185)||(16231972-16232156)
chr6 (1-185)||(18086815-18086999)
chr6 (1-185)||(13620786-13620970)
chr6 (1-185)||(23977849-23978033)
chr6 (5-127)||(19299375-19299497)
chr6 (7-196)||(29665942-29666131)
chr6 (178-265)||(33314387-33314474)
chr6 (1-91)||(22251558-22251648)
chr6 (1-145)||(29869768-29869911)
chr6 (82-243)||(27740860-27741021)
chr6 (7-128)||(14626124-14626243)
chr6 (7-144)||(15862592-15862728)
chr6 (7-158)||(35009445-35009595)
chr6 (7-144)||(1657754-1657890)
chr6 (1-97)||(1650093-1650189)
chr6 (7-39)||(19629556-19629588)
chr6 (1-97)||(25175731-25175827)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (2-265)||(1467732-1467995)
chr3 (1-265)||(49232436-49232700)
chr3 (1-265)||(25058739-25059003)
chr3 (1-265)||(12902082-12902346)
chr3 (8-261)||(5228317-5228570)
chr3 (1-232)||(22275242-22275473)
chr3 (3-232)||(15468334-15468563)
chr3 (1-265)||(12264784-12265049)
chr3 (1-185)||(18911073-18911257)
chr3 (5-168)||(12811938-12812101)
chr3 (1-265)||(44228985-44229249)
chr3 (1-191)||(54651531-54651721)
chr3 (143-265)||(18897133-18897255)
chr3 (1-95)||(18897036-18897130)
chr3 (7-243)||(11986172-11986408)
chr3 (1-126)||(16821280-16821403)
chr3 (55-183)||(17912536-17912662)
chr3 (7-128)||(51158024-51158143)
chr3 (1-97)||(55316387-55316483)
chr3 (1-127)||(15614973-15615097)
chr3 (7-97)||(15859030-15859120)
chr3 (1-154)||(15936627-15936779)
chr3 (1-97)||(13839061-13839157)
chr3 (55-154)||(15938523-15938621)
chr3 (1-97)||(41270243-41270339)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (2-265)||(11231331-11231594)
chr2 (2-265)||(22513178-22513441)
chr2 (2-265)||(28775800-28776063)
chr2 (2-265)||(24685774-24686037)
chr2 (1-265)||(12728392-12728656)
chr2 (1-265)||(34824475-34824739)
chr2 (1-265)||(16935593-16935857)
chr2 (1-265)||(17006253-17006517)
chr2 (1-265)||(23778037-23778301)
chr2 (1-185)||(12635860-12636044)
chr2 (1-185)||(8943926-8944110)
chr2 (1-185)||(42177961-42178145)
chr2 (1-185)||(3798595-3798779)
chr2 (1-185)||(12641634-12641818)
chr2 (1-265)||(21141895-21142159)
chr2 (1-145)||(23774257-23774400)
chr2 (1-145)||(5888622-5888765)
chr2 (1-128)||(7507844-7507969)
chr2 (7-158)||(25265396-25265546)
chr2 (7-128)||(462876-462995)
chr2 (55-214)||(24341443-24341601)
chr2 (1-97)||(19886649-19886745)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (1-265)||(15950783-15951047)
chr7 (2-265)||(7822728-7822991)
chr7 (2-265)||(7830039-7830302)
chr7 (2-265)||(27101630-27101893)
chr7 (2-265)||(27108978-27109241)
chr7 (2-265)||(27176433-27176696)
chr7 (2-265)||(38783722-38783985)
chr7 (1-265)||(15760106-15760370)
chr7 (1-185)||(18980013-18980197)
chr7 (1-185)||(14250890-14251074)
chr7 (1-185)||(15927648-15927832)
chr7 (1-185)||(13758450-13758634)
chr7 (1-132)||(48622658-48622788)
chr7 (7-241)||(13321038-13321273)
chr7 (1-145)||(10000362-10000505)
chr7 (1-145)||(16418618-16418761)
chr7 (1-127)||(13572816-13572940)
chr7 (1-128)||(16478950-16479075)
chr7 (1-146)||(13911012-13911156)
chr7 (7-128)||(47481037-47481156)
chr7 (1-97)||(2437625-2437721)
chr7 (16-97)||(10989577-10989658)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (2-265)||(31309-31572)
scaffold0107 (1-265)||(39646-39910)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (2-265)||(39103-39366)
scaffold0076 (17-127)||(43137-43245)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (2-265)||(271353-271616)
chr8 (2-265)||(644304-644567)
chr8 (2-265)||(830039-830302)
chr8 (2-265)||(22088787-22089050)
chr8 (1-265)||(22006250-22006514)
chr8 (2-265)||(15319152-15319415)
chr8 (2-265)||(15499521-15499784)
chr8 (4-265)||(13662260-13662521)
chr8 (1-185)||(13720920-13721104)
chr8 (1-265)||(16195230-16195495)
chr8 (1-185)||(16873043-16873227)
chr8 (1-127)||(21844560-21844684)
chr8 (1-127)||(21851953-21852077)
chr8 (1-128)||(6774246-6774371)
chr8 (1-128)||(24549120-24549245)
chr8 (7-144)||(17345690-17345826)
chr8 (2-146)||(16674381-16674524)
chr8 (1-97)||(30120890-30120986)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (2-265)||(35582036-35582299)
chr5 (2-265)||(21932374-21932637)
chr5 (2-265)||(21938544-21938807)
chr5 (2-265)||(22883077-22883340)
chr5 (2-265)||(36989763-36990026)
chr5 (1-265)||(1219512-1219776)
chr5 (1-265)||(7425324-7425588)
chr5 (1-232)||(17471580-17471811)
chr5 (1-185)||(10777962-10778146)
chr5 (1-185)||(23514641-23514825)
chr5 (1-265)||(35791090-35791355)
chr5 (1-265)||(11212057-11212321)
chr5 (7-241)||(32950717-32950952)
chr5 (1-145)||(23328678-23328821)
chr5 (1-145)||(24616282-24616425)
chr5 (1-145)||(24712658-24712801)
chr5 (1-145)||(24745676-24745819)
chr5 (1-127)||(27009981-27010105)
chr5 (1-97)||(43443383-43443479)
chr5 (1-128)||(29188272-29188397)
chr5 (1-97)||(18777980-18778076)
chr5 (10-144)||(34939398-34939531)
chr5 (7-196)||(18531073-18531261)
chr5 (218-265)||(23328558-23328605)
chr5 (55-128)||(23507103-23507174)
chr5 (218-263)||(24616165-24616210)
chr5 (218-263)||(24712541-24712586)
chr5 (218-263)||(24745559-24745604)
chr5 (1-97)||(12542-12638)
chr5 (1-97)||(25426796-25426892)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (2-265)||(17004638-17004901)
chr1 (1-265)||(18059750-18060014)
chr1 (2-265)||(38055084-38055347)
chr1 (1-260)||(46523394-46523653)
chr1 (1-185)||(17148647-17148831)
chr1 (5-127)||(19962495-19962617)
chr1 (1-145)||(7640926-7641069)
chr1 (1-145)||(22035568-22035711)
chr1 (1-128)||(22227947-22228072)
chr1 (1-128)||(22232644-22232769)
chr1 (1-97)||(5072376-5072472)
chr1 (1-128)||(2116393-2116518)
chr1 (7-128)||(20913168-20913287)
chr1 (7-128)||(20931483-20931602)
chr1 (55-128)||(45051561-45051632)
chr1 (1-97)||(18601106-18601202)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-265)||(153999-154263)
scaffold0023 (7-97)||(48765-48855)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (1-265)||(18168970-18169234)
chr4 (1-265)||(19020486-19020750)
chr4 (1-265)||(15287237-15287501)
chr4 (1-265)||(15294346-15294610)
chr4 (1-185)||(7132057-7132241)
chr4 (1-265)||(17145649-17145913)
chr4 (1-265)||(18248218-18248482)
chr4 (1-185)||(20000803-20000987)
chr4 (3-144)||(22738390-22738531)
chr4 (49-265)||(8374508-8374724)
chr4 (1-145)||(26339140-26339283)
chr4 (32-196)||(40885585-40885748)
chr4 (1-130)||(22352056-22352184)
chr4 (1-126)||(10644360-10644483)
chr4 (1-51)||(8378365-8378415)
chr4 (7-214)||(15675095-15675301)
chr4 (55-214)||(31115680-31115838)
chr4 (55-196)||(10104304-10104444)
chr4 (59-146)||(13048279-13048365)
chr4 (224-265)||(22738269-22738310)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-265)||(29162-29426)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-265)||(1567-1831)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (1-265)||(10331-10595)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (16-265)||(3-252)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-265)||(2392-2656)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-265)||(34150-34414)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (1-185)||(1506-1690)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (1-265)||(54416-54680)
scaffold0066 (1-214)||(45081-45294)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (1-265)||(7448-7712)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-245)||(53895-54138)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (7-243)||(56105-56341)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (1-245)||(3434-3677)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-128)||(5204-5329)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (1-145)||(6718-6861)
scaffold0183 (218-265)||(6598-6645)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-97)||(3890-3986)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-145)||(7330-7473)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (58-145)||(23797-23884)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-125)||(177-299)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-183)||(3045-3226)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (7-130)||(3324-3447)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (1-128)||(9337-9462)
scaffold0215 (1-128)||(16235-16360)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (7-243)||(13528-13763)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (7-97)||(41815-41905)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (7-128)||(3588-3707)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (7-151)||(962-1105)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (7-128)||(36919-37038)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (1-97)||(1292-1388)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-127)||(64511-64640)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (1-127)||(5668-5792)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-128)||(13313-13438)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (7-98)||(12279-12370)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (7-180)||(8934-9106)
scaffold0025 (7-128)||(148859-148978)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (7-97)||(540-630)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (7-97)||(6070-6160)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (7-97)||(34466-34556)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (7-97)||(89460-89550)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (7-128)||(19344-19463)
scaffold0195 (7-128)||(21428-21547)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (7-158)||(8186-8336)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 16376366 - 16376629
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16376366 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 16376465  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376466 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 16376565  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376566 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16376629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 16383690 - 16383953
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16383690 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 16383789  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383790 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 16383889  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383890 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16383953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10488962 - 10488699
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10488962 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 10488863  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488862 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 10488763  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488762 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10488699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 16556132 - 16556395
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16556132 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 16556231  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556232 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 16556331  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556332 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16556395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 16632688 - 16632951
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16632688 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 16632787  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632788 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 16632887  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632888 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16632951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 22225730 - 22225994
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22225730 atgaacaattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttca 22225829  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225830 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 22225929  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225930 attgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22225994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1556269 - 1556005
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556269 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 1556170  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  1556169 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 1556070  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556069 attgttaactgatgttattgtgagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 1556005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19610282 - 19610018
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19610282 atgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 19610183  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||    
T  19610182 aagtatgtataaatgttaagttataaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtagttcatattccattgatgttgtt 19610083  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610082 attgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 19610018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16232156 - 16231972
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232156 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 16232057  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16232056 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 16231972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 18086815 - 18086999
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086815 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 18086914  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18086915 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18086999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 13620786 - 13620970
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13620786 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttca 13620885  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13620886 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13620970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23978033 - 23977849
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23978033 atgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 23977934  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23977933 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 23977849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19299497 - 19299375
Alignment:
Q  5 acaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19299497 acaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagt 19299398  T
Q  105 atgtataaatgttaagttatgaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19299397 atgtataaatgttaagttatgaa 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29666131 - 29665942
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29666131 aattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 29666032  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 196  Q
    | |||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||| |||| || ||| |  |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  29666031 gcataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgt 29665942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 265
Target Start/End: Original strand, 33314387 - 33314474
Alignment:
Q  178 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33314387 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 33314474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22251558 - 22251648
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaatta 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22251558 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 29869768 - 29869911
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29869768 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 29869866  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  29869867 atgtatgtataagtgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 29869911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740860
Alignment:
Q  82 ggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattc 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| || ||  |  ||||| |||||| ||||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattc 27740922  T
Q  182 atattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtat 243  Q
    || ||| ||| ||||||||  | ||| |||||| | ||||   ||||||||| |||||||||    
T  27740921 atgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtat 27740860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 14626124 - 14626243
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  14626124 aattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 14626221  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  14626222 gtaaaaatgataagttatgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15862728 - 15862592
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||  ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||    
T  15862728 aattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattat 15862631  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 144  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15862630 gtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 15862592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 35009445 - 35009595
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||  ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   || |||    
T  35009445 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 35009542  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgtt 158  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  35009543 gtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt 35009595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Original strand, 1657754 - 1657890
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||    ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||    
T  1657754 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattat 1657851  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 144  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1657852 gtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 1657890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 1650093 - 1650189
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||| ||||| || ||  ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1650093 atgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1650189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 19629588 - 19629556
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtg 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19629588 aattgttgttaaattcgtgctcttgttgtggtg 19629556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 25175827 - 25175731
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25175827 atgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 25175731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 1467732 - 1467995
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1467732 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 1467831  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467832 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 1467931  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467932 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1467995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 49232700 - 49232436
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232700 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 49232601  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49232600 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggtt 49232501  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232500 attgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 49232436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25059003 - 25058739
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25059003 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 25058904  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  25058903 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 25058804  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25058803 attgttaacttatgctattgtgagtgaatcatgatttgagtatacttaattgtgaattgatgatg 25058739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 12902082 - 12902346
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902082 atgaataatttttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 12902181  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  12902182 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 12902281  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12902282 attattaactgatactattgtgagtgaatcatgatttggatatacttaattgtggattaatgatg 12902346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5228570 - 5228317
Alignment:
Q  8 attgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5228570 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatg 5228471  T
Q  108 tataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgtta 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5228470 tataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgaggtgtaattcatattccattgatgttgttattgtta 5228371  T
Q  208 actgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgat 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5228370 actgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtgaattgat 5228317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22275473 - 22275242
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275473 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 22275374  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  22275373 aagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 22275274  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcat 232  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  22275273 attgttaactgatgttattgtgaatgaatcat 22275242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Original strand, 15468334 - 15468563
Alignment:
Q  3 gaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaa 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15468334 gaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaa 15468433  T
Q  103 gtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttat 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  15468434 gtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttat 15468533  T
Q  203 tgttaactgatgctattgtaagtgaatcat 232  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  15468534 tgttaactgatgttattgtgaatgaatcat 15468563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 12264784 - 12265049
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264784 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 12264883  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  12264884 aagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgt 12264983  T
Q  200 tattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |  | |||||||||| | ||||  |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12264984 tgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18911257 - 18911073
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911257 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 18911158  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18911157 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12812101 - 12811938
Alignment:
Q  5 acaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12812101 acaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagt 12812002  T
Q  105 atgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812001 atgtataaatgttaagttatgaatttatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 12811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44229249 - 44228985
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44229249 atgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttca 44229150  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  44229149 aagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttatt 44229050  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
      | |||||||||| | ||||  |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44229049 gctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 44228985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 54651721 - 54651531
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| ||    
T  54651721 atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgca 54651622  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  54651621 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccatt 54651531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 265
Target Start/End: Original strand, 18897133 - 18897255
Alignment:
Q  143 tgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggta 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18897133 tgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggta 18897232  T
Q  243 tacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18897233 tacttaattgtggattgatgatg 18897255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 18897036 - 18897130
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18897036 atgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 11986172 - 11986408
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11986172 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtat 11986271  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgtt 206  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| || |  |||| |||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | |  | ||    
T  11986272 gtattaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatagtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgttgatgctatt 11986371  T
Q  207 aactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtat 243  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11986372 aactgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtat 11986408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16821403 - 16821280
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||  | ||| | |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  16821403 atgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 16821305  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatga 126  Q
    || |||||| |||||||||| |||||    
T  16821304 aa-tatgtaaaaatgttaagctatga 16821280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 183
Target Start/End: Original strand, 17912536 - 17912662
Alignment:
Q  55 tgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgat 153  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||  |||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  17912536 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatg-aatttgat 17912632  T
Q  154 atgttttgattgaaatgagatgtgattcat 183  Q
    ||||| |  ||||| |||| | ||||||||    
T  17912633 atgttgtagttgaattgagctatgattcat 17912662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 51158024 - 51158143
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  51158024 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 51158121  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  51158122 gtaaaaatgataagttgtgaaa 51158143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 55316483 - 55316387
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  55316483 atgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 55316387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15615097 - 15614973
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  || || ||| |||||||| |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| ||||    
T  15615097 atgaacaattcatgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatg-ttca 15614999  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaa 127  Q
    || |||||| ||||| |||||| ||||    
T  15614998 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaa 15614973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Original strand, 15859030 - 15859120
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15859030 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15859120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 15936627 - 15936779
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||   ||||  || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  15936627 atgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 15936725  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgata 154  Q
    || | |||| ||||| |||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||||||    
T  15936726 aa-tgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgata 15936779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13839157 - 13839061
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  13839157 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 13839061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 154
Target Start/End: Original strand, 15938523 - 15938621
Alignment:
Q  55 tgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgat 153  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||| |||||| || ||||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  15938523 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgat 15938620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 41270339 - 41270243
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  41270339 atgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgtt 41270243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 11231331 - 11231594
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11231331 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 11231430  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231431 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 11231530  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231531 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 11231594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 22513178 - 22513441
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22513178 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 22513277  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513278 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 22513377  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513378 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22513441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 28775800 - 28776063
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28775800 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 28775899  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775900 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 28775999  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28776000 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 28776063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 24685774 - 24686037
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24685774 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 24685873  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685874 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 24685973  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24685974 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttaggtatacttaattgtggattgatgatg 24686037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12728656 - 12728392
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728656 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 12728557  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12728556 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggtt 12728457  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728456 attgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 12728392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34824739 - 34824475
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824739 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 34824640  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34824639 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggtt 34824540  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824539 attgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 34824475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16935857 - 16935593
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16935857 atgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttca 16935758  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16935757 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggtt 16935658  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935657 attgttaaatgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16935593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17006517 - 17006253
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17006517 atgaacaattgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttca 17006418  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17006417 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggtt 17006318  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006317 attgttaaatgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17006253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 23778037 - 23778301
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23778037 atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttca 23778136  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  23778137 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 23778236  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778237 attgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23778301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 12635860 - 12636044
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12635860 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 12635959  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12635960 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 12636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 8944110 - 8943926
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8944110 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttca 8944011  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8944010 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 8943926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 42177961 - 42178145
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42177961 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttca 42178060  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42178061 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 42178145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 3798595 - 3798779
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3798595 atgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 3798694  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  3798695 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 3798779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 12641634 - 12641818
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12641634 atgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttca 12641733  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  12641734 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 12641818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21142159 - 21141895
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21142159 atgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttca 21142060  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  21142059 aagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttatt 21141960  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
      | |||||||||| | ||||  |||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21141959 gctattaactgatgttgttgtgggtgaattacgacttgggtatacataattatggattgatgatg 21141895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23774400 - 23774257
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23774400 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 23774302  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23774301 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23774257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 5888622 - 5888765
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5888622 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 5888720  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5888721 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 5888765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 7507844 - 7507969
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  7507844 atgaataattattgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 7507942  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||  ||||||||||||    
T  7507943 aa-tatgtaaaaataataagttatgaaa 7507969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 25265396 - 25265546
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || || || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   || |||    
T  25265396 aattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 25265493  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgtt 158  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  25265494 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt 25265546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 462995 - 462876
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  462995 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 462898  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  462897 gtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 24341443 - 24341601
Alignment:
Q  55 tgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgat 153  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||   || |||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| |    
T  24341443 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgct 24341540  T
Q  154 atgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatg 214  Q
    | ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||  || ||||||| |||||    
T  24341541 aagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatg 24341601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 19886649 - 19886745
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19886649 atgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 19886745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 15950783 - 15951047
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950783 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 15950882  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15950883 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtgatt 15950982  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950983 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15951047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7822991 - 7822728
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7822991 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 7822892  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822891 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 7822792  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822791 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7822728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7830302 - 7830039
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7830302 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 7830203  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830202 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 7830103  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830102 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 27101630 - 27101893
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27101630 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 27101729  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101730 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 27101829  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101830 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27101893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 27108978 - 27109241
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27108978 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 27109077  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109078 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 27109177  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109178 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27109241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27176696 - 27176433
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27176696 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 27176597  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176596 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 27176497  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176496 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27176433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 38783722 - 38783985
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38783722 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 38783821  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783822 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 38783921  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783922 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38783985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 15760106 - 15760370
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760106 atgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 15760205  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  15760206 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 15760305  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760306 attgttaactgatgttattgtgagtgaataatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 15760370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 18980013 - 18980197
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980013 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 18980112  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18980113 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18980197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 14250890 - 14251074
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14250890 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttca 14250989  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14250990 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 14251074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15927832 - 15927648
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15927832 atgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttca 15927733  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15927732 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 15927648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 13758634 - 13758450
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13758634 atgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 13758535  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  13758534 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 13758450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 48622658 - 48622788
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48622658 atgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttca 48622756  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 132  Q
    ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  48622757 aagcatgcataattgttaagttgtgaaattat 48622788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13321273 - 13321038
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13321273 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtat 13321174  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgtt--ttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattg 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| || |||  ||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||  || |||    
T  13321173 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattg-ttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttg 13321075  T
Q  205 ttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggt 241  Q
    |||| ||||| | ||||   |||||||||| ||||||    
T  13321074 ttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggt 13321038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 10000362 - 10000505
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || || | ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10000362 atgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 10000460  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10000461 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattgatga 10000505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16418761 - 16418618
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16418761 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 16418663  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  16418662 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 16418618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13572940 - 13572816
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||      
T  13572940 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgttt-- 13572843  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaa 127  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||    
T  13572842 aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 13572816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16478950 - 16479075
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| | || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  16478950 atgaacaattcatgttagattcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 16479048  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16479049 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16479075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 13911012 - 13911156
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||| |||| || ||| ||  | ||| |||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  13911012 atgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 13911110  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatgcttaattgatgaa 146  Q
     | |||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13911111 ta-tatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaa 13911156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 47481037 - 47481156
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||    
T  47481037 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tat 47481134  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  47481135 gtaaaaatgataagttgtgaaa 47481156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2437721 - 2437625
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2437721 atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 2437625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10989658 - 10989577
Alignment:
Q  16 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10989658 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 10989577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31572 - 31309
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31572 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 31473  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 31373  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31372 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 31309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39910 - 39646
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39910 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatttttgtgggtgaaattacatgtttca 39811  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||    
T  39810 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatgttattcatatttcattgatgttgtt 39711  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39710 attgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39366 - 39103
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39366 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 39267  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39266 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 39167  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39166 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 43245 - 43137
Alignment:
Q  17 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgt 116  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  43245 aaattcgtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgt 43148  T
Q  117 taagttatgaa 127  Q
    |||||||||||    
T  43147 taagttatgaa 43137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 271353 - 271616
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  271353 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 271452  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271453 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 271552  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271553 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 271616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 644567 - 644304
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  644567 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 644468  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644467 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 644368  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644367 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 644304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 830302 - 830039
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  830302 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 830203  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830202 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 830103  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830102 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 22088787 - 22089050
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22088787 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaa 22088886  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088887 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 22088986  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088987 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22089050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 22006250 - 22006514
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006250 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 22006349  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22006350 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggtt 22006449  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22006450 attgttaactgatgttattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggactgatgatg 22006514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 15319152 - 15319415
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15319152 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcta 15319251  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15319252 agtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggtta 15319351  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319352 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15319415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 15499521 - 15499784
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15499521 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcta 15499620  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15499621 agtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggtta 15499720  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15499721 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15499784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Original strand, 13662260 - 13662521
Alignment:
Q  4 aacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaag 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662260 aacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaag 13662359  T
Q  104 tatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13662360 tatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttatt 13662459  T
Q  204 gttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13662460 gttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatg 13662521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 13720920 - 13721104
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13720920 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 13721019  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13721020 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13721104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16195495 - 16195230
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195495 atgaacaattgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 16195396  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  16195395 aagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgt 16195296  T
Q  200 tattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |  | |||||||||| | |||   |||||| |||| || ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  16195295 tgctattaactgatgttgttgagggtgaattatgacttaggtatatataattatggattgatgatg 16195230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 16873043 - 16873227
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16873043 atgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 16873142  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16873143 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 16873227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 21844560 - 21844684
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||      
T  21844560 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt-- 21844657  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaa 127  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21844658 aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 21851953 - 21852077
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||      
T  21851953 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgttt-- 21852050  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaa 127  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21852051 aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21852077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 6774246 - 6774371
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||| ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  6774246 atgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 6774344  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  6774345 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 6774371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24549245 - 24549120
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||| ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  24549245 atgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 24549147  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  24549146 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 24549120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17345826 - 17345690
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    ||||||||  |||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||    
T  17345826 aattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattat 17345729  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 144  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  17345728 gtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 17345690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Original strand, 16674381 - 16674524
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| ||||| || ||| || || ||| |||||| ||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||     
T  16674381 tgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcat 16674479  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaa-attatgcttaattgatgaa 146  Q
    | |||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  16674480 a-tatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattggtgaa 16674524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30120986 - 30120890
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||| ||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30120986 atgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 30120890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35582299 - 35582036
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35582299 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 35582200  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582199 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 35582100  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582099 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 35582036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 21932374 - 21932637
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21932374 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 21932473  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932474 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 21932573  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932574 ttgttaactgatgccattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 21938544 - 21938807
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21938544 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 21938643  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938644 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 21938743  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938744 ttgttaactgatgccattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21938807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 22883077 - 22883340
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22883077 tgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgtttcaa 22883176  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883177 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 22883276  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883277 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22883340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 36989763 - 36990026
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36989763 tgaacaattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 36989862  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989863 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 36989962  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989963 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 36990026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 1219512 - 1219776
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219512 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 1219611  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1219612 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatttcattgatgtggtt 1219711  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219712 attgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1219776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7425588 - 7425324
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425588 atgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 7425489  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  7425488 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 7425389  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7425388 attgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttggatatacttaattatggattgatgatg 7425324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 17471580 - 17471811
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471580 atgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 17471679  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  17471680 aagtatgtataaatgttaagtaatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattccattgatgttgtt 17471779  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcat 232  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  17471780 attgttaactgatgttattgtgaatgaatcat 17471811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 10777962 - 10778146
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777962 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 10778061  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10778062 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 10778146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23514825 - 23514641
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514825 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 23514726  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23514725 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 23514641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 35791090 - 35791355
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35791090 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttca 35791189  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-tttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  35791190 aagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgt 35791289  T
Q  200 tattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |  | |||||||||| | |||   |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35791290 tgctattaactgatgttgttgagggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 35791355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 11212057 - 11212321
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212057 atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 11212156  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  11212157 aagtgtgtataaatgttaagttatgaaattatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgtt 11212256  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
      | |||||||||| | ||||  ||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11212257 gctattaactgatgttgttgtgggtggattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 11212321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32950952 - 32950717
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32950952 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtat 32950853  T
Q  107 gtataaatgt-taagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgt 205  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||| || || |||| |||  |||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |  | |    
T  32950852 gtataaaggtcaaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgttgatgctat 32950753  T
Q  206 taactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggt 241  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||    
T  32950752 taactgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggt 32950717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23328821 - 23328678
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23328821 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 23328723  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23328722 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23328678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24616425 - 24616282
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24616425 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 24616327  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24616326 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24616282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24712801 - 24712658
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24712801 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 24712703  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24712702 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24712658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24745819 - 24745676
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24745819 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 24745721  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24745720 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 24745676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27010105 - 27009981
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||      
T  27010105 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgttt-- 27010008  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaa 127  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||    
T  27010007 aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 27009981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 43443383 - 43443479
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43443383 atgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 43443479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 29188272 - 29188397
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||| ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  29188272 atgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 29188370  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  29188371 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 29188397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 18777980 - 18778076
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18777980 atgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 18778076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34939531 - 34939398
Alignment:
Q  10 tgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgta 109  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || ||||||    
T  34939531 tgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgta 34939434  T
Q  110 taaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 144  Q
     |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  34939433 aaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 34939398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 196
Target Start/End: Original strand, 18531073 - 18531261
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   || |||    
T  18531073 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 18531170  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 196  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| || | ||||| |||| |||| || ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  18531171 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 18531261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23328605 - 23328558
Alignment:
Q  218 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328605 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23328558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23507174 - 23507103
Alignment:
Q  55 tgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  23507174 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 218 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24616210 - 24616165
Alignment:
Q  218 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatga 263  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24616210 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24616165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 218 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24712586 - 24712541
Alignment:
Q  218 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatga 263  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712586 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24712541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 218 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24745604 - 24745559
Alignment:
Q  218 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatga 263  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24745604 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24745559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12638 - 12542
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12638 atgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 12542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 25426892 - 25426796
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25426892 atgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 25426796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17004901 - 17004638
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17004901 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 17004802  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004801 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 17004702  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004701 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17004638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 18059750 - 18060014
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18059750 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttca 18059849  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18059850 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggtt 18059949  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059950 attgtcaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 18060014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 38055084 - 38055347
Alignment:
Q  2 tgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38055084 tgaacaattgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaa 38055183  T
Q  102 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055184 agtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggtta 38055283  T
Q  202 ttgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055284 ttgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38055347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46523653 - 46523394
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46523653 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 46523554  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  46523553 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 46523454  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattga 260  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46523453 attgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattga 46523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17148831 - 17148647
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148831 atgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 17148732  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17148731 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcatat 17148647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 19962495 - 19962617
Alignment:
Q  5 acaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19962495 acaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagt 19962594  T
Q  105 atgtataaatgttaagttatgaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19962595 atgtataaatgttaagttatgaa 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 7640926 - 7641069
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7640926 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 7641024  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7641025 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 7641069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22035711 - 22035568
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22035711 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 22035613  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  22035612 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 22035568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22228072 - 22227947
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  22228072 atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttca 22227974  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22227973 aa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22232769 - 22232644
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  22232769 atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttca 22232671  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232670 aa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 5072376 - 5072472
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5072376 atgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 5072472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2116518 - 2116393
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  || || ||||||||| || ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  2116518 atgaacaattcatgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 2116420  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  2116419 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 2116393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20913287 - 20913168
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  20913287 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tat 20913190  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20913189 gtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20931602 - 20931483
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  20931602 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tat 20931505  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20931504 gtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45051632 - 45051561
Alignment:
Q  55 tgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  45051632 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 45051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 18601106 - 18601202
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18601106 atgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18601202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 153999 - 154263
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  153999 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttca 154098  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  154099 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcatattccattgatgtggtt 154198  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154199 attgttaacttatgctattgtgggtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 154263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 48855 - 48765
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48855 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 48765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18169234 - 18168970
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169234 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 18169135  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18169134 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggtt 18169035  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18169034 attgttaaataatgctattgtgagtgaatcatgatttggatatacttaattgtgaattgatgatg 18168970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19020750 - 19020486
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020750 atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 19020651  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  19020650 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 19020551  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19020550 attgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgagtatacttaattgtggattgatgatg 19020486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 15287237 - 15287501
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287237 atgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 15287336  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  15287337 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 15287436  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15287437 attgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15287501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 15294346 - 15294610
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294346 atgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 15294445  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  15294446 aagtatatataaatgttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 15294545  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294546 attgttaactgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15294610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 7132057 - 7132241
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132057 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 7132156  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7132157 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 7132241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 17145649 - 17145913
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17145649 atgaacaattgatgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 17145748  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  17145749 aagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgtt 17145848  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
      | |||||||||| | ||||  |||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  17145849 gctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattacggattgatgatg 17145913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18248482 - 18248218
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18248482 atgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttca 18248383  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  18248382 aagtatgtataaatgttaagatatgaaattatactcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgtt 18248283  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
      | |||||||||| | ||||  |||||| |||| || ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  18248282 gctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgactttggtatacataattatcgattgatgatg 18248218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20000987 - 20000803
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20000987 atgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttca 20000888  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20000887 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 20000803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22738531 - 22738390
Alignment:
Q  3 gaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaa 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738531 gaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaa 22738432  T
Q  103 gtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatg 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22738431 gtatgtataaatgttaagttgtgaaattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8374724 - 8374508
Alignment:
Q  49 tgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaat 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||| |    
T  8374724 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaatt 8374625  T
Q  149 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatactta 248  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  |||||| |||  |||||||||| ||    
T  8374624 ttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacata 8374525  T
Q  249 attgtggattgatgatg 265  Q
    ||| | |||||||||||    
T  8374524 attatcgattgatgatg 8374508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 26339283 - 26339140
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26339283 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 26339185  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    |  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  26339184 atctatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatga 26339140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 196
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885748
Alignment:
Q  32 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 131  Q
    |||||||||||| ||  | ||| ||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgtt-caaagtatgtataaatgtcaagttatgaaatta 40885683  T
Q  132 tgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 196  Q
    |||| ||||| |||| |||| || ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  40885684 tgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 40885748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 22352056 - 22352184
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| |||||| |||||||| | || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22352056 atgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 22352154  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 130  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22352155 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10644483 - 10644360
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  10644483 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttca 10644385  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatga 126  Q
    || |||||| ||||||||||||||||    
T  10644384 aa-tatgtaaaaatgttaagttatga 10644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 8378415 - 8378365
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgt 51  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8378415 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgt 8378365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Original strand, 15675095 - 15675301
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   || |||    
T  15675095 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 15675192  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgt 205  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| || ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||  || ||||    
T  15675193 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgt 15675292  T
Q  206 taactgatg 214  Q
    ||| |||||    
T  15675293 taattgatg 15675301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31115838 - 31115680
Alignment:
Q  55 tgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgat 153  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |  | |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||| |||  |    
T  31115838 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcc--attatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgctcaattggtgaattttcct 31115741  T
Q  154 atgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatg 214  Q
    | ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||  || ||||||| |||||    
T  31115740 aagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatg 31115680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 196
Target Start/End: Original strand, 10104304 - 10104444
Alignment:
Q  55 tgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgat 153  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| |    
T  10104304 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgct 10104401  T
Q  154 atgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 196  Q
    | ||| |  ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  10104402 aagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 10104444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 146
Target Start/End: Original strand, 13048279 - 13048365
Alignment:
Q  59 ttgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatgcttaattgatgaa 146  Q
    |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  13048279 ttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaa 13048365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22738310 - 22738269
Alignment:
Q  224 gtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22738310 gtgaattatgacttgggtatacttaattgtggattaatgatg 22738269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29426 - 29162
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29426 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggtgaaattacatgtttca 29327  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29326 aagtatgtgtaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggtt 29227  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29226 attgttaatttatgttattgttagtgaattatgatttggttatacttaattgtgtattgatgatg 29162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 1567 - 1831
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1567 atgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 1666  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||| |||| |||    
T  1667 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatataaaattgatgttgtt 1766  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1767 attgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 10331 - 10595
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10331 atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 10430  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  10431 aagtatgtataaatgctaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 10530  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10531 gttgttaactgatgctattgtgagggaatcatgacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 3 - 252
Alignment:
Q  16 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3 taaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatg 102  T
Q  116 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  103 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacattgatgtagttattgttaactgatgc 202  T
Q  216 tattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203 tattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2656 - 2392
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2656 atgaacaattgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 2557  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  2556 aagtatgtataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgtt 2457  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2456 attgttaactgatgttattgtgagtgaatcatggtttgggtatacttaattgtggattgatgatg 2392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 34150 - 34414
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34150 atgaaaaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 34249  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  34250 aagtatgtataaatgttaagttatgaagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccattaatgttgtt 34349  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
      | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34350 gctattaactgatgctattgtgagtgaatcatgacttgggtatactaaattatggattgatgatg 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 1506 - 1690
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1506 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttca 1605  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1606 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 54680 - 54416
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  54680 atgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttca 54581  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  54580 aagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgtt 54481  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
      | |||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  54480 gctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatatttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45294 - 45081
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45294 atgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 45195  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  45194 aagtatgtataaatgtcaagttttgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgtt 45095  T
Q  201 attgttaactgatg 214  Q
      | ||||||||||    
T  45094 gctattaactgatg 45081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 7448 - 7712
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7448 atgaacaattattactaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttca 7547  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||    
T  7548 aagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttatt 7647  T
Q  201 attgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
     || |||||||||| | |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7648 gttattaactgatgttgttgtgagtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54138 - 53895
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54138 atgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttca 54040  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-atttgatatgtt-ttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtgg 198  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||  |||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||  | | || |||| |    
T  54039 aagcatgtataattgttaagttgtgaaattatacccaattggtgaatttttgatgtgttgttga--gaaataagatgtgattcatgct-ctttgatgttg 53943  T
Q  199 ttattgttaactgatg-ctattgtaagtgaatcatgatttgggtatac 245  Q
    || ||||||| |||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  53942 ttgttgttaattgatgattattgtgagtgaaccatgacttgggtatac 53895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 56105 - 56341
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  56105 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtat 56204  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgtt 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||| |||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | |  | ||    
T  56205 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgttgatgctatt 56304  T
Q  207 aactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtat 243  Q
    || ||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  56305 aattgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtat 56341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3677 - 3434
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3677 atgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacatg-ttca 3579  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-atttgatatgtt-ttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtgg 198  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||| ||||  |||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||  | | || |||| |    
T  3578 aagcatgtataattgttaagttgtgaaattatacccaattggtgaatttttgatgtgttgttga--gaaataagatgtgattcatgct-ctttgatgttg 3482  T
Q  199 ttattgttaactgatg-ctattgtaagtgaatcatgatttgggtatac 245  Q
    || |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  3481 ttgttgttaactgatgattattgtgagtgaaccatgacttgggtatac 3434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 5204 - 5329
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  5204 atgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 5302  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||    
T  5303 aa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6861 - 6718
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6861 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 6763  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  6762 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattaatga 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6645 - 6598
Alignment:
Q  218 ttgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 265  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6645 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3986 - 3890
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3986 atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7473 - 7330
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | || |||| ||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7473 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttca 7375  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7374 atgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 7330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 145
Target Start/End: Original strand, 23797 - 23884
Alignment:
Q  58 attgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23797 attgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 299 - 177
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||      
T  299 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt-- 202  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatg 125  Q
    || |||||| ||||| |||||||||    
T  201 aaatatgtaaaaatgataagttatg 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3226 - 3045
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | | | |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||       
T  3226 atgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--c 3129  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcat 183  Q
    || |||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| || ||| |  ||||| |||||| ||||||||    
T  3128 aattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcat 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3324
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||| || ||  ||  | ||| |||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtat 3348  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaatt 130  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  3347 gtataaatatcaagttatgaaatt 3324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 9337 - 9462
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  9337 atgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 9435  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  9436 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 9462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16235 - 16360
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  16235 atgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 16333  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  16334 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13763 - 13528
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || || || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   || |||    
T  13763 aattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 13666  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgt 205  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||| |||| |||||| |  ||||| |  |||| ||  ||| ||| ||| |||| ||| ||||    
T  13665 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgt 13566  T
Q  206 taactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtat 243  Q
    ||| ||||| | ||||   |||||||||| ||||||||    
T  13565 taattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtat 13528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 41905 - 41815
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41905 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 41815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 3588 - 3707
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  3588 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 3685  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  3686 gtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 962 - 1105
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  962 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 1059  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttg 151  Q
    ||| ||||  |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1060 gtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttg 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 36919 - 37038
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  36919 aattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 37016  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  37017 gtaaaaatgataagttgtgaaa 37038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1388
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1292 atgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 64511 - 64640
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaatt-----gatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg 95  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| ||||||     |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  64511 atgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatg 64610  T
Q  96 tttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 127  Q
    |||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  64611 ttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 64640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5792 - 5668
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||   || || || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||      
T  5792 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt-- 5695  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaa 127  Q
    || |||||| ||||| ||||| |||||    
T  5694 aaatatgtaaaaatgataagtcatgaa 5668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 13313 - 13438
Alignment:
Q  1 atgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 100  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||||  |||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  13313 atgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttca 13411  T
Q  101 aagtatgtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    || |||||| ||||| |||||| |||||    
T  13412 aa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 13438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12370 - 12279
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  12370 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgttt 12279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9106 - 8934
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   || |||    
T  9106 aattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattat 9009  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgatt 180  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| || ||| |  ||||| |||||| |||||    
T  9008 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgatt 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 148978 - 148859
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  148978 aattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 148881  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  148880 gtaaaaatgataagttgtgaaa 148859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Original strand, 540 - 630
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  540 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6160
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6070 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Original strand, 34466 - 34556
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34466 aattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 34556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Original strand, 89460 - 89550
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  89460 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 89550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19463 - 19344
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  19463 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 19366  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  19365 gtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21547 - 21428
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  21547 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 21450  T
Q  107 gtataaatgttaagttatgaaa 128  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  21449 gtaaaaatgataagttgtgaaa 21428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Original strand, 8186 - 8336
Alignment:
Q  7 aattgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| ||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||| |||   || |||    
T  8186 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggtt--caattat 8283  T
Q  107 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatttgatatgtt 158  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  8284 gtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University