View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4494-Insertion-4 (Length: 664)

Name: NF4494-Insertion-4
Description: NF4494
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4494-Insertion-4
NF4494-Insertion-4
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (15-635)||(30774750-30775372)
chr4 (101-445)||(35132040-35132387)
chr4 (100-429)||(9336145-9336476)
chr4 (543-633)||(35132476-35132566)
chr4 (202-317)||(23596953-23597068)
chr4 (161-310)||(23588108-23588257)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (100-638)||(16662037-16662577)
chr2 (100-633)||(16657567-16658102)
chr2 (130-635)||(14703021-14703528)
chr2 (103-635)||(7541812-7542346)
chr2 (101-458)||(11998992-11999350)
chr2 (101-458)||(12258806-12259165)
chr2 (32-635)||(43624927-43625532)
chr2 (109-458)||(12245631-12245982)
chr2 (220-458)||(12234392-12234632)
chr2 (579-633)||(12234753-12234807)
chr2 (554-635)||(12245454-12245535)
chr2 (554-635)||(12258629-12258710)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (43-635)||(8585754-8586348)
chr7 (43-598)||(8616204-8616764)
chr7 (132-635)||(27830923-27831428)
chr7 (101-634)||(6789096-6789631)
chr7 (99-630)||(10494427-10494960)
chr7 (100-638)||(8658946-8659486)
chr7 (171-517)||(17267593-17267941)
chr7 (100-445)||(8545216-8545563)
chr7 (100-635)||(8654033-8654570)
chr7 (171-517)||(17259895-17260243)
chr7 (102-403)||(8575911-8576214)
chr7 (121-421)||(8537640-8537942)
chr7 (100-432)||(8609500-8609834)
chr7 (97-311)||(8666999-8667213)
chr7 (146-324)||(29582202-29582380)
chr7 (254-399)||(8383160-8383307)
chr7 (100-458)||(3146847-3147207)
chr7 (102-439)||(8581285-8581624)
chr7 (173-403)||(8569967-8570199)
chr7 (100-328)||(29578029-29578257)
chr7 (198-421)||(8601655-8601880)
chr7 (101-328)||(8590222-8590449)
chr7 (109-635)||(8646469-8646997)
chr7 (265-634)||(1301208-1301579)
chr7 (103-403)||(7878013-7878315)
chr7 (94-218)||(13333835-13333959)
chr7 (374-633)||(13333506-13333765)
chr7 (543-633)||(3147292-3147382)
chr7 (543-615)||(8636411-8636483)
chr7 (545-633)||(8667449-8667537)
chr7 (46-188)||(8558912-8559054)
chr7 (362-432)||(8664907-8664977)
chr7 (146-236)||(27846555-27846645)
chr7 (161-310)||(8102311-8102460)
chr7 (554-638)||(8559372-8559456)
chr7 (544-615)||(7877801-7877872)
chr7 (482-517)||(8576293-8576328)
chr7 (591-635)||(8628608-8628652)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (100-635)||(4678606-4679142)
chr1 (102-633)||(15594619-15595152)
chr1 (121-328)||(34467145-34467352)
chr1 (104-236)||(52549395-52549527)
chr1 (379-417)||(34467051-34467089)
chr1 (362-403)||(52549292-52549333)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (100-636)||(43744399-43744937)
chr8 (149-435)||(12528136-12528424)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (100-635)||(28219501-28220038)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 548; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 635
Target Start/End: Original strand, 30774750 - 30775372
Alignment:
15 agcagtaccatatccttttgtcatcttcacaggtagagaagtattcctaggaattaccacatccatggtgcctcgattcactgaaataccaagcgacaaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
30774750 agcagtaccatatccttttgtcatcttcacaggtagagaagtattcctaggaattaccacatccatggtgtcttgattcactgaaataccaagtgacaaa 30774849  T
115 ggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
30774850 ggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagcaactgcctcatcaggat 30774949  T
215 tgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30774950 tgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctac 30775049  T
315 actactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtc--tatacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtg 412  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
30775050 actactcttgtctacctttgaatcagtaagacaactctcaacagtctgtatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgagtg 30775149  T
413 attgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttc 512  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30775150 attgatgaagaaaagtcaatgtcttgaaataaattatctatctcaacaaatgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttc 30775249  T
513 tcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
30775250 tcaactgtctcaaagctcttggattcccggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtaattcaacattctgttatcaaagtcctc 30775349  T
613 tcccccgatgtgagtgtttccag 635  Q
    |||||||||||||||||||||||    
30775350 tcccccgatgtgagtgtttccag 30775372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 101 - 445
Target Start/End: Original strand, 35132040 - 35132387
Alignment:
101 taccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaac 200  Q
    ||||||| |||||||| || |||||  | | ||||||||||||  |||| || ||||||| |||||| | ||||||||| || |||||||| | ||  ||    
35132040 taccaagagacaaaggtgtaacatcctgtaacaccaactttggaacattttttatgcctttactcaacaaagcagcctgaactgctgccccataagctac 35132139  T
201 tgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaaga 300  Q
     |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
35132140 agcctcatcggggttaatgctcttgcacaactccttccctttgaaaaagttttgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagaccctccaacaaga 35132239  T
301 acaatatcatctacac-tactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctca 397  Q
    |||| ||||||||| | | |||||||||| ||| | |||| | | ||||||||  || || |  |||||||  |||||||||||   ||| |||||||||    
35132240 acaacatcatctacccttgctcttgtccatcttagcatcaatgagacaactctctacggtattcatacactcattaaaaaggtctgcattcatttcctca 35132339  T
398 aacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaa 445  Q
    |||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
35132340 aacttggcgcgattgattgatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaa 35132387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9336476 - 9336145
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||| || | || ||    
9336476 ataccaagtgacaatggggtaacatctcgtagcaccaagttgggcgcattcttaaagccttcactcaaaatagcagcttgaacagctgcaccataagcaa 9336377  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 299  Q
    | |||||||| || ||||| | | || | || |||||||| ||||| || |   |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
9336376 cagcctcatctgggttgatacccatgaataattccttccccttgaaaaattctagcaatagttcttgcactttcggaatcctagacgagccacccacaag 9336277  T
300 aacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctca 397  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  | |||||||||  | | |||  | | |||| | |  |||||||  || |||| |||||| || | |||||||    
9336276 aacaatatcatcaatattactcttgtatatctttgaatccctgagacaggtgtcaacaatattcatacactcattgaaaaagtccatgttaagttcctca 9336177  T
398 aacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtc 429  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||    
9336176 aatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtc 9336145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 543 - 633
Target Start/End: Original strand, 35132476 - 35132566
Alignment:
543 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttcc 633  Q
    ||||||| || ||||||||  |||| || || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
35132476 taatgtctactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcaccattctgttatcaaagtcctctccaccgagatgagtgtttcc 35132566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23597068 - 23596953
Alignment:
202 gcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaa 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||   |||| ||||  || || |||||||||||||  || || || |||||||    
23597068 gcctcatcagggttgatgctcttacaaagttccttcccattgaagaaatcttgcaaaagttgttgaaccttgggaatcctagtcgatccgccaacaagaa 23596969  T
302 caatatcatctacact 317  Q
    ||| |||||| |||||    
23596968 caacatcatcaacact 23596953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23588257 - 23588108
Alignment:
161 cactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatag 260  Q
    ||||||| | |||||| ||||| |||||||| |  | ||| || ||||| || ||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||   |||| ||    
23588257 cactcaaaatagcagcttggacggctgccccatatgcaacagcttcatcggggttgatgctcttacaaagctcctttccattgaagaaatcttgcaaaag 23588158  T
261 ttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcat 310  Q
    ||  || || |||||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||    
23588157 ttgttgaaccttgggaatcctagtggatccaccaacaagaacaacatcat 23588108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 100 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 16662577 - 16662037
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | || ||    
16662577 ataccaagtgacaatggggtaacgtctcgcagcaccaagtttggaacatccttaatgccttcactcaacacagcagcttgcacagctgccccataagcaa 16662478  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 299  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
16662477 cagcctcatcagggttgatgctcttgcacaactccttcccattgaagaagttacgcaataattcctgcacttttggaatcctagacgagcccccgacaag 16662378  T
300 aacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctca 397  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||   ||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
16662377 aacaatatcatgtacaccccccttgtccatctttgaatccacaaaacaactctcaacaatcttcatacactcgttaaaaaggcccatattgatttcttca 16662278  T
398 aacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcct 497  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | |   |||||| ||| ||||||| |   ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||    
16662277 aacttgacacgagtgagtgatgtagagaagtcaatgtcctcgtataaataatcaatctcaatagcggtgaccaatttgaaagagagtgtccttttcgcct 16662178  T
498 tttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattct 597  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||||| ||||||||||  |  || || ||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
16662177 tttcacaagaagttctcaacctcctcaaggctcttggattcctagtgatatccactttgttcttcctattaaattctttcacaaagtagttcaacattct 16662078  T
598 gttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaag 638  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
16662077 gttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccagaag 16662037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 100 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 16658102 - 16657567
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| || ||    
16658102 ataccaagcgacaatggggtaacatctctcaacaccaaatctgggacattcttaaagccttcactcaaaatagcagcttgaacagctgcaccgtaagcaa 16658003  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 299  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || |   ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
16658002 cagcttcatccgggttgatacttttgcataaatccttgcccttgaaaaagtcttgcaatagatcctgcactttgggaatcctagatgagccacccacaag 16657903  T
300 aacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctca 397  Q
    |||||  ||||| | |  ||   ||| || ||||||||||  || |||| ||| |||||| |  |||||||  || ||||| |||||||| |||||||||    
16657902 aacaacgtcatcaatatcaccaatgtgcatctttgaatcacgaagacaattctcaacagttttcatacactcattgaaaagatccatattaatttcctca 16657803  T
398 aacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcct 497  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||    || ||||||||||| ||||||     
16657802 aacttggcacgggtgattgatgaagaaaagtcaattccctgaaataaagaatctacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccc 16657703  T
498 tttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattct 597  Q
    | ||||||||||||||||||   ||||| |||||||  |  |   | |||||||| || |||||| | | ||| ||||||||||||||||||| | ||||    
16657702 tctcacatgcagttctcaacctcctcaaggctcttgagttcccacttatgtccaccttattcttcttttgaaactcctctacaaagtagttcaccgttct 16657603  T
598 gttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttcc 633  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
16657602 gttatcaaagtcctctcccccaaggtgagtgtttcc 16657567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 635
Target Start/End: Original strand, 14703021 - 14703528
Alignment:
130 agcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcaca 229  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| | | |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | ||  || || |||||||| || ||||| |||||||    
14703021 agcaccaacttcggaacattcttgacgtcttcactcaacaaagcagcctgaacagctgccccataagctacagcttcatcagggttaatgctgttgcaca 14703120  T
230 aatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccac 329  Q
    | |||||||| | ||| || |   | |||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
14703121 actccttcccctggaaaaagtcctgtaataattgctgtactttgggaatccgagaagacccaccgacaagaacaacatcatctactctactcttgtccat 14703220  T
330 ctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaag 427  Q
    ||| | |||| ||| |||||||| |||| |||  | |||||  ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |   | |||| ||||||||||||    
14703221 cttagcatcaataagacaactctcaacaatcttcacacactcattaaaaaagtccatattcatttcttcaaacttggccctattgatcgatgaagaaaag 14703320  T
428 tcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaag 527  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | | | || ||  | ||| || ||||| ||||||||| | || || || ||||||||    || || |    
14703321 tcaatgcattgaaataaagcatctacctcaatagtggcgacaacttggaaagaaagtgttctttttgccctctcgcaagcggttctcaagctccttaagg 14703420  T
528 ctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagt 627  Q
    || ||||||  |   |||||||||   |||| ||  |||| || || |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
14703421 cttttggatttccactaatgtccaatctgttttttctcttgaactcttgaacaaagtagttcaccattctgttatcgaagtcctctcccccgaggtgagt 14703520  T
628 gtttccag 635  Q
    ||||||||    
14703521 gtttccag 14703528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 635
Target Start/End: Original strand, 7541812 - 7542346
Alignment:
103 ccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactg 202  Q
    ||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||| | || ||| |    
7541812 ccaagagacaaaggtgtaacatcctgcagcaccaactttggagcgttcttaacgcctccactcaacaatgcagcctgaacagctgccccataagcaacag 7541911  T
203 cctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaac 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |     ||||| |  || ||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||    
7541912 cctcatcaggattaatgctcttgcacaagtcctttccattgaaaaagtcctttaatagctgatgtactatgggaatcctcgaagacccgccgacaaggac 7542011  T
303 aatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtc--tatacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaac 400  Q
    || ||||||||   | ||||||||||  || | |||| ||| ||| ||   |||| ||   ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||    
7542012 aacatcatctatcatgctcttgtccatattagcatcaataagacagcttccaacaatcgtcatacactcgttaaaaagatccatattcatctcctcaaac 7542111  T
401 ttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcctttt 500  Q
    ||| |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | | |  | ||    ||| || ||||  ||||||||| | |    
7542112 ttggccctattgatcgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaagaatctacctcaatagtggcaacaacaaggaaagaaagtgatctttttgccctct 7542211  T
501 cacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgtt 600  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| ||| ||||||  |   |||||||||| ||||||||  |||| || || | |||||||||||||  |||||| ||    
7542212 cacaagcagttctcaacctcctcaaggcttttggattcccactaatgtccactttgttctttctcttgaactcttgtacaaagtagttcgccattctatt 7542311  T
601 atcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccag 635  Q
    ||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||    
7542312 atcaaagtcttctccaccaaggtgagtgttgccag 7542346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 458
Target Start/End: Original strand, 11998992 - 11999350
Alignment:
101 taccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaac 200  Q
    ||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||| |||||  |||||||||   |||||||||| | |||||| || ||||||||||| | ||  ||    
11998992 taccaagagacaaaggagtaacatcctgcaacaccaaatttggaacattcttaacatcttcactcaacaaagcagcttgaacagctgccccataagctac 11999091  T
201 tgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaaga 300  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || | | | ||||| |  || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||     
11999092 agcctcatcagggttaatgctcttgcacaactccttcccgttgaaaaagtcatgtaatagctgttggactttggga-tcctagaagatccaccaacaagt 11999190  T
301 acaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaa 398  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||| |  |||| ||| || | ||| | ||||||||    
11999191 acaacatcatctatagtactcttgtccatctttgcatccataatacaactctcaacagtctttatacaatcattaagaagatctaaattcaattcctcaa 11999290  T
399 acttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaa 458  Q
    ||||  |  || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||    
11999291 actttgcccgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacctcaa 11999350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 12259165 - 12258806
Alignment:
101 taccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaac 200  Q
    ||||||| |||||||| || |||||  ||||| ||||||||||  ||||||  ||  ||||||| || | ||||||||| | ||| |||||   ||  ||    
12259165 taccaagagacaaaggtgtaacatcctgcagctccaactttggaacattctggatatcttcacttaacaaagcagcctgaatagccgccccaaaagctac 12259066  T
201 tgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaaga 300  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||   | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||     
12259065 agcctcatcaggattaatgctcttgcacaactctttccccttgaaaaaatcctgtaatagctgctgcactttgagaatcctagaagacccacctacaagg 12258966  T
301 acaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaa 398  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||   || | ||| |||| |||||||| ||||||||  || || |  || ||||| |||| ||| ||||||||||    
12258965 acaacatcatctacattactcttgtccgtgttagcatccgtaagacaactctcaacagtcttcatgcattcattgaaaagttccaaatttatttcctcaa 12258866  T
399 acttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaa 458  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||| |||||||| | | |||||  |||||||||||    
12258865 acttggcacgattgattgatgcagaaaaatcaatgccatcacataaagaatctatctcaa 12258806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 635
Target Start/End: Original strand, 43624927 - 43625532
Alignment:
32 ttgtcatcttcacaggtagagaagtattcctaggaattaccacatccatggtgcctcgattcactgaaataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcag 131  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||   ||||  ||   | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
43624927 ttgtcttcttgacaggtacagaagtattcctaggaatcaccacactcatgacacctcccttgtttaagataccaagtgacaaaggggtaacatctcgcag 43625026  T
132 caccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaa 231  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||||| || ||||| | |||  |     
43625027 caccaattttggaacattcttaatgcctttactcaaaatagcagcctggacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggtttatgctttcgcatgat 43625126  T
232 tccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccacct 331  Q
    |||||||| ||||| || |   |||| || |  |  ||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||| ||| |  | |  ||||||||||| ||    
43625127 tccttccccttgaaaaactcctgcaacagctgttttacttttggaattctagaggagccgccaacaaggacaacatcgtggatagcactcttgtccaact 43625226  T
332 ttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtc 429  Q
    | | |||| ||| ||||||||||||||| |  | ||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||||| | |||||    
43625227 tggcatcaataagacaactcttaacagttttcaaacactcgttgaaaagatccatatttatttcatcaaatttggcacgagtgattgatgaaaagaagtc 43625326  T
430 aatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagct 529  Q
    ||| ||  | ||||||  ||||| ||||| | |  |||   |    || || |||||||||||| |  | || ||||| |||||||||  ||| |  |||    
43625327 aataccacggaataaagaatctacctcaatagtgctgaacgaagcaaaagacagtgtcctttttcctctctcgcatgccgttctcaaccttcttatggct 43625426  T
530 cttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgt 629  Q
    ||||  |  |   |||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||    
43625427 cttgagtttccaataatatccacattgttcttcttctcaaattcttctgcaaagtagttcaccattctatcatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgt 43625526  T
630 ttccag 635  Q
    ||||||    
43625527 ttccag 43625532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 12245982 - 12245631
Alignment:
109 gacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcat 208  Q
    |||||||| || |||||  ||| |||||| |||||  |||||||||   ||| |||||| | |||||| || ||||||||||| | || ||| ||||| |    
12245982 gacaaaggagtaacatcctgcaacaccaaatttggaacattcttaacatctttactcaacaaagcagcttgaacagctgccccataagcaacagcctcgt 12245883  T
209 caggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatc 308  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |   | ||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||    
12245882 cagggttaatgctcttgcacaattccttcccgttgaaaaagtcctgtaatagctgttggactttgggaatcctagaagatccaccaacaagtacaaaatc 12245783  T
309 atctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgaca 406  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||  ||||| |  |||| ||| || | ||| | ||||||||||||  |     
12245782 atctatagtactcttgtccatctttgcatccataatacaactctcaacagtctttatacaatcattaagaagatctaaattcaattcctcaaactttgcc 12245683  T
407 tgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaa 458  Q
     || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||    
12245682 cgattgatggatgaagaaaaatcaatgccttgaaataaagaatctacctcaa 12245631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 458
Target Start/End: Original strand, 12234392 - 12234632
Alignment:
220 ctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactac 319  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || | ||| ||||  ||||| || ||||    
12234392 ctcttgcacagctccttccccttgaaaaaatcctgcaatagttgctgcactttgggaatcctagaggacccgccaataaggacaacttcatccaccctac 12234491  T
320 tcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattga 417  Q
    | ||||||| ||| | |||| ||| |||||||| |||| |||  |||||||   ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |   | |||| ||    
12234492 ttttgtccatcttagcatcactaagacaactctcaacaatcttcatacactcaataagaagatccatattcatttcctcaaacttggccctattgatcga 12234591  T
418 tgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaa 458  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||| |||||    
12234592 tgaagaaaaatcaatgccttcaaataaagaatctacctcaa 12234632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 633
Target Start/End: Original strand, 12234753 - 12234807
Alignment:
579 caaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttcc 633  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
12234753 caaggtagtttaccattctgttatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttcc 12234807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12245535 - 12245454
Alignment:
554 ttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccag 635  Q
    ||||||||  |||| || |||| | |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || | ||||||||||||||    
12245535 ttgttctttctcttgaactcctgtgcaaagtagtttaccattctattatcaaaatcctctcctccaaggtgagtgtttccag 12245454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 12258710 - 12258629
Alignment:
554 ttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccag 635  Q
    ||||||||  |||| || || |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||    
12258710 ttgttctttctcttgaactcttctacaaagtaactcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgcgtgtttccag 12258629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 8586348 - 8585754
Alignment:
43 acaggtagagaagtattcctaggaattaccacatccatggtgcctcgattcactgaaataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttg 142  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||  |  ||| ||   |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
8586348 acaggtacagtagtattcctaggaataaccacagccataatatctccatggcctgagataccaagtgacagaggggtaacatctcgcagcaccaagtttg 8586249  T
143 gggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccatt 242  Q
    |  | ||||||| | ||| || ||  | || |||||| || || |||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
8586248 gaactttcttaaagtctttacacagcaaagaagcctgaactgcagccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcataaatctttcccatt 8586149  T
243 gaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagta 342  Q
    |||||| | || |||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| || | ||| ||||| |||    
8586148 gaagaagtcactcaatagttcctgtactttgggaattctggacgagccaccgacaaggacaatatcgtctacaccattcttctctatcttagaatcggta 8586049  T
343 aaacaactcttaacag--tctatacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaa 440  Q
    | |||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || | ||| | |     
8586048 agacaactctcaacagtatttatacactcattaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacacgcgtgattgatgaagagaaatcgacgccctcac 8585949  T
441 ataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcg 540  Q
    |||||| ||| || |||| | | ||||  || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |        
8585948 ataaataatcaatttcaatagtagtgaccaatttgaaagaaagtgtcctttttgccttttcacatgccgttcttaaccgcctcaaagctcttgggttctt 8585849  T
541 ggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccag 635  Q
     ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||    
8585848 agtaatatccacattgttctttctcttaaattcctcaacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcccctcccccaaggtgagtatttccag 8585754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 598
Target Start/End: Original strand, 8616204 - 8616764
Alignment:
43 acaggtagagaagtattcctaggaattaccacatccatggtgcctcgattcactgaaataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttg 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||  |  |||  || ||| | |||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| ||||    
8616204 acaggtacagaagtattcctaggaatcaccacactcataatatctcctttgactaagataccaagtgacagaggggtaacatctcgcagcgccaagtttg 8616303  T
143 gggcattcttaatgccttcact---caatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttccc 239  Q
    |  ||||||||| | ||  | |   ||| | ||||||||| || ||||||||   || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
8616304 gaacattcttaaagtctgtagtacccaacaaagcagcctgaactgctgccccactagcaacagcctcatcaggattgatgttcttgcacaaatccttccc 8616403  T
240 attgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatca 339  Q
    || ||| || | || |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||    
8616404 atcgaaaaagtcactcaatagttcctgcactttaggaatcctagacgagccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttctctatcttagaatca 8616503  T
340 gtaaaacaactcttaacagtc--tatacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgcctt 437  Q
     |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||| |    
8616504 ttaaaacaactctcaacagtctttatacactcgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttaacacgagtgattgatgaagagaaatcgatgccct 8616603  T
438 gaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatc 537  Q
     | |||||| ||| ||||||| | | ||||  || ||||| || ||  ||| ||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||| | |||||| |     
8616604 cacataaataatcaatctcaatagtagtgaccaatttgaatgaaagcatccgtttcgccttttcgcatgcagttttcaaccgcctcaacgatcttgggtt 8616703  T
538 gcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctg 598  Q
     |  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
8616704 cctagtaatatccacattgttcttcctcttaaaatcctcaacaaagtagttcaacattctg 8616764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 132 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 27831428 - 27830923
Alignment:
132 caccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaa 231  Q
    |||||| |||||  ||||| ||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
27831428 caccaagtttggaacattcataatgtcatcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccaaaagcaacagcctcatcaggattgatgctcttgcacaaa 27831329  T
232 tccttcccattgaagaaattacgc-aatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccacc 330  Q
    ||||| || ||||| ||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |    
27831328 tcctttcccttgaa-aaagtccgccaatagctgctgcactttgggaatccttgaagagccaccaacaaggacaacatcatctatactactcttgtccatc 27831230  T
331 tttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagt 428  Q
    || || ||||| | |||||||| ||||||||  ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||   |||| | ||||    
27831229 ttagagtcagtgagacaactctcaacagtctccatacattcattgaaaaggtccatattgatttcctcaaactttgcacgagtgatcattgaaaagaagt 27831130  T
429 caatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagc 528  Q
    ||||||| | ||||||   ||||||||||| | | |||  ||     || |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |   ||||| ||    
27831129 caatgccctcaaataaggcatctatctcaatagtagtgtcaacagaaaaagagagtgtcctttttgccttctcacattaggttctcagcctcctcaaggc 27831030  T
529 tcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtg 628  Q
    |||||| |  |   ||||||||||  | |||||| |||| ||  |||| ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || | |||||||    
27831029 tcttgggttcccactaatgtccactcttttcttcttcttgaacacctccacaaaatagttcaccatcctattatcaaagtcctctccaccaaggtgagtg 27830930  T
629 tttccag 635  Q
    |||||||    
27830929 tttccag 27830923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 101 - 634
Target Start/End: Original strand, 6789096 - 6789631
Alignment:
101 taccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaac 200  Q
    ||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| |||||  || |||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| || |||    
6789096 taccaagagacaacggtgtaacatcttgcagcaccaagtttggaacactcttagagccttcgctcaacaaagcagcctggacagctgcaccgtaagcaac 6789195  T
201 tgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaaga 300  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |  |   |||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
6789196 agcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatcctttcccatgaaaacttcttgcaatagttgttgcactttgggaattctagaagacccaccaacaagg 6789295  T
301 acaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaa 398  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |  |||  || |||||||| ||| ||||  |||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
6789296 acaacatcatttacaatactcttgtccatcttagcgtcaacaagacaactctcaacggtcttcatacactcattaaaaatatccatattgatttcctcaa 6789395  T
399 acttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcctt 498  Q
    ||||| |  |||| | |||||||   ||||| ||||| |||||||||   |||| ||||| | | ||||  |     || ||||||  |||||| ||| |    
6789396 acttggcccgagtaagtgatgaaatgaagtcgatgccctgaaataaagagtctacctcaatagtagtgacgacaacaaaagagagtacccttttggccct 6789495  T
499 ttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctg 598  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| || || ||||  |  |  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | || || |    
6789496 ttcacacgcagttctcaaccttcttaaggcccttgagtttccagtaatatccactttgttcttcctcttaaactcctctgcaaagtagtttaccaatcgg 6789595  T
599 ttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttcca 634  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
6789596 ttatcaaagtcctctcctccgaggtgagtgtttcca 6789631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 10494960 - 10494427
Alignment:
99 aataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaa 198  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | || |    
10494960 aataccaagtgacaatggggtaacatctcgtagcaccaagttcgggacattcttaaagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataagca 10494861  T
199 actgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaa 298  Q
    || |||||||| || ||||| | | || | || |||||||| ||||| || |   ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
10494860 acagcctcatctgggttgatacgcatgaataattccttccccttgaaaaattctagcaatagatcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacaa 10494761  T
299 gaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctc 396  Q
    ||||||||||||| | |  | ||||||  | |||||||||  | | |||||| | |||| | |  ||||||| | | |||| ||| ||||| ||||||||    
10494760 gaacaatatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatccctgagacaactgtcaacaatattcatacactcgatgaaaaagtctatattaatttcctc 10494661  T
397 aaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcc 496  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||||||| || ||   |||||||  ||| | ||||||  | |||| |||    || |||||| |||||||||||    
10494660 aaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatcgacctcaacggtggtgacaaaagaaaaagagagtatcctttttgcc 10494561  T
497 ttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattc 596  Q
     | ||||| ||||||||||||   || || | | ||||||  |   | ||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||| || |||| |||||    
10494560 ctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttggattcccactgatgtccacgttattcttctttttgaactcctcaacaaaataattcaccattc 10494461  T
597 tgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtt 630  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
10494460 tgttatcgaagtcctctcccccaaggtgagtgtt 10494427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 638
Target Start/End: Original strand, 8658946 - 8659486
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||  || || | |||||| || | |||||| || | || ||    
8658946 ataccaagtgacaatggggtaacatcttgcagcaccaagtttgggacattcttaaagcctttgcttaaaacagcagcttgaagagctgcaccataagcaa 8659045  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 299  Q
    | |||||||| || ||||| |||||| | ||| |||||     ||| |  |   ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
8659046 cagcctcatctgggttgatactcttgtataaaaccttctttgggaaaaggtcttgcaatagatcttgcactttgggaatcctagacgaaccacccacaag 8659145  T
300 aacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctca 397  Q
    ||||||||| || | |  |||| | |  |  ||||||||  ||| |||||||| |||||| |  |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||    
8659146 aacaatatcgtcaatatcactcatctgtatttttgaatcgctaagacaactctcaacagttttcatacactcattaaaaagatccatattcatttcctca 8659245  T
398 aacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcct 497  Q
    ||| || || |||||||| ||||| | ||||| || || |||||||||  ||| | ||||||| | |||| |||    || ||||||||||| ||||||     
8659246 aacctggcacgagtgattaatgaacagaagtctattccctgaaataaagaatcgacctcaacagtggtgacaaaagcaaaagagagtgtcctctttgccc 8659345  T
498 tttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattct 597  Q
    | ||||| ||||||||||||   || || | | |||| |  |   |||||||||| || |||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||||    
8659346 tctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccactaatgtccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattct 8659445  T
598 gttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaag 638  Q
    | |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
8659446 gctatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttccagaag 8659486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 171 - 517
Target Start/End: Original strand, 17267593 - 17267941
Alignment:
171 agcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcact 270  Q
    ||||||||| ||||| || || | || ||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||    
17267593 agcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatacttttgcataattccttccccttgaagaagttctgcaatagttgctgcact 17267692  T
271 ttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacact 368  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || || |||||||| | ||| | |||| ||| |||  ||| |||| |||  || ||||    
17267693 ttcggaatcctagaagacccaccaacaaggacaacatcatcaactctgctcttgtcaatcttagcatcactaagacacttctcaacaatctccatgcact 17267792  T
369 tgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgag 468  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||  || | |||||||   |||| ||||||| | || |     
17267793 catcaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaatcaacacccttaaataaagcgtctacctcaacattggtcac 17267892  T
469 aaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaac 517  Q
    | |   ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
17267893 agaggcgaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaac 17267941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 445
Target Start/End: Original strand, 8545216 - 8545563
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||||| || |||||||||  | |||||||||||||||||| || | || ||    
8545216 ataccaagtgacaaaggggtaacatctcgtagcaccatgtttgggacattcttattgtcttcactcagcaaagcagcctggacagctgcaccataagcaa 8545315  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 299  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || || || |   | ||||| |    |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
8545316 cagcctcatcagggttaatgctcttgcataattccttccccttaaaaaactcctgtaatagctgtctcactttaggaatcctagaagaaccgccaacaag 8545415  T
300 aacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaaca--gtctatacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctca 397  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||  || |||||  ||||||  ||| |||||||| | ||| ||||||||||| | || ||||    
8545416 gacaacatcatctacactacccttgtccatcttagcatcaacaagacaacaattaacagtgtccatacacttttcaaagaggtccatattcaattgctca 8545515  T
398 aacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaa 445  Q
    |||||| |  |||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||    
8545516 aacttggcccgagtgatgcatgaacaaaagtcaataccttgatataaa 8545563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 635
Target Start/End: Original strand, 8654033 - 8654570
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||| || || |  | ||    
8654033 ataccaagtgacaatggggtaacatcacgtagcaccaagttggggacattcttaaagtcttcactcaaaatagcagcctgaacagcagcgccatatgcaa 8654132  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 299  Q
      |||||||| || |||||  || |  ||||| ||||||| ||||| || |   ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
8654133 tagcctcatctgggttgatattcataaacaaagccttccccttgaaaaactctagcaatagatcctgcactttgggaatcctagacgagccacccacgag 8654232  T
300 aacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctca 397  Q
     |||| |||||| | |  | ||||||  | |||||||||  | | |||||| | |||| | |  |||||||  || |||| ||||||||| |||||||||    
8654233 tacaacatcatcaatatcattcttgtatatctttgaatctctgagacaactgtcaacaatattgatacactcattgaaaaagtccatattaatttcctca 8654332  T
398 aacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcct 497  Q
    || ||  || |||||||||||||||||||||| || ||   |||||||  ||||| ||||||| | |||| |||  | || |||||| |||||||||||     
8654333 aatttagcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacctcaacagtggtgacaaaagtaaaagagagtatcctttttgccc 8654432  T
498 tttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattct 597  Q
    | ||||| ||||||||||||   || || | | |||| |  | | |||| ||||| || |||||| | || || |||||||||||||||| || ||||||    
8654433 tctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttaccgctaatttccactttattcttctttttgaactcctctacaaagtagtacaccattct 8654532  T
598 gttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccag 635  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
8654533 gttatcaaagtcttctccccctaggtgcgtgtttccag 8654570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 517
Target Start/End: Original strand, 17259895 - 17260243
Alignment:
171 agcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcact 270  Q
    ||||||||| ||||| || || | || ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||   ||||||||| |||||||    
17259895 agcagcctgaacagcagcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgcataattccttacccttgaagaaatcctgcaatagttgctgcact 17259994  T
271 ttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacact 368  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |  || |||||||| | |||   |||| ||| |||  ||| |||| |||  || ||||    
17259995 ttcggaatcctagaagatccaccaacaaggacaacatcatcaattctgctcttgtcaatcttaccatcactaagacacttctcaacaatctccatgcact 17260094  T
369 tgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgag 468  Q
      | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||  || | |||||||   |||| ||||||| | || |     
17260095 cataaaaaaggtccatattgatttcttcaaacttggcacgagtgattgacgaagaaaaattaacacccttaaataaagcgtctacctcaacattggtcac 17260194  T
469 aaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaac 517  Q
    | |    || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
17260195 agaggcaaaagaaagtgtcctttttgctttttcacatgcagttctcaac 17260243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 403
Target Start/End: Original strand, 8575911 - 8576214
Alignment:
102 accaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaact 201  Q
    ||||| |||||| || || |||||||| | |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| | || || | || |||     
8575911 accaaacgacaacggtgtaacatctcgtaacaccaagtttggaacattcttactgccttcactcaacaaagcagcttggacaacagcaccataagcaaca 8576010  T
202 gcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaa 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |  |   | ||||| |    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
8576011 gcctcatcagggttgatgctcttacataattccttccccttgaaaacctcctgtaatagctgtctcactttaggaatcctagaagaaccaccaacaagga 8576110  T
302 caatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaa 399  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| || |||| | |||||||| |  |||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||    
8576111 caacatcatctacactattcttgtccatcttagcatcagcaagacaaatattaacagtattcatacacttttcaaagaggttcatattcatttcctcaaa 8576210  T
400 cttg 403  Q
    ||||    
8576211 cttg 8576214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 421
Target Start/End: Original strand, 8537640 - 8537942
Alignment:
121 acatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgc 220  Q
    ||||||||||||||||| || ||  || ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| || || | || ||| || |||||||| |||||||    
8537640 acatctcgcagcaccaagttcggaacagtcttaatgcctccgctcaacaaagcagcctggacagcagcaccataagcaacagcttcatcagggttgatgc 8537739  T
221 tcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactact 320  Q
    | ||  | | |||||||||  |||| || ||  |||  ||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||| | ||||||    
8537740 ttttaaaaatatccttccccctgaaaaagttttgcagcagactctgcactttgggaatcctagaagagccaccaactagtacaacatcatccatactact 8537839  T
321 cttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgat 418  Q
      |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||| |||||||| |||| || |||||||||| |  |||||||||||    
8537840 actgtccatcttagcatcattaaaacaactcttaacagttttcatacacttttcaaagaggtccatgttgagttgctcaaacttggcccgagtgattgat 8537939  T
419 gaa 421  Q
    |||    
8537940 gaa 8537942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 432
Target Start/End: Original strand, 8609500 - 8609834
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |    || |||||||||| ||| | ||||||||||||||| || || | || ||    
8609500 ataccaagtgacaaaggtgtaacatctcgcagcaccaagtttggaactgatttgatgccttcacccaacaaagcagcctggacagcagcaccataagcaa 8609599  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 299  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |   ||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
8609600 ccgcctcatcagggttgatgctcatacacaaatcctttccattgaaaaagtcttgcagtagctgcttcactttcggaatcctagaagaacctccaacaag 8609699  T
300 aacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctca 397  Q
    ||||| |||||||||  |  |||| ||||  |  | |||||||| ||| || | ||| ||||  |||||||| | ||| |||||||| || | || ||||    
8609700 aacaacatcatctacggttttcttatccatttcagcatcagtaagacatctttcaaccgtctccatacacttttcaaagaggtccatgttaagttgctca 8609799  T
398 aacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaat 432  Q
    |||||  || |||||||||||||| |||| |||||    
8609800 aacttcgcacgagtgattgatgaacaaaaatcaat 8609834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 311
Target Start/End: Original strand, 8666999 - 8667213
Alignment:
97 gaaataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgag 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | ||    
8666999 gaaataccaagtgacaaaggggtcacatctcgtagcaccaagttggggacattcttacagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccataag 8667098  T
197 aaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgac 296  Q
     ||| ||||| || || ||||| | | || | || |||||||| |||||  | |   ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
8667099 caacagcctcgtctgggttgatacccatgaataattccttccccttgaaatattctagcaattgttcctgcactttgggaatcctagacgagccaccgac 8667198  T
297 aagaacaatatcatc 311  Q
    ||| |||| ||||||    
8667199 aagtacaacatcatc 8667213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29582380 - 29582202
Alignment:
146 cattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaa 245  Q
    |||||| |||||||||| |||  | ||||||||| |||||||| || | || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
29582380 cattctcaatgccttcaatcagcaaagcagcctgcacagctgcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcatgcacaaatccttccccttgaa 29582281  T
246 gaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttg 324  Q
     || |   ||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||||||||||    
29582280 aaattcttgcaatagctgatgcactttgggaattctagaagagccaccaataaggacgatatcatctacactactcttg 29582202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 8383307 - 8383160
Alignment:
254 gcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactctt 353  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||| ||||     
8383307 gcaatagctcttgcactttgggaatcctcgaagaaccaccgatgagaacaacatcatctacactactcttgttcatcttagcatcagtaagacagctctc 8383208  T
354 aacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaa 399  Q
    ||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||    
8383207 aacagtctccatacacttttcaaataggtccatattgagttgctcaaa 8383160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 458
Target Start/End: Original strand, 3146847 - 3147207
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||| ||| |||||| |||||  |||| |||| | |||||||||| | |||||| || |||||||| || | || ||    
3146847 ataccaagagacaaaggagcaacatcttgcaccaccaagtttggaacatttttaaagtcttcactcaacaaagcagcttgcacagctgcaccataagcaa 3146946  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattac-gcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaa 298  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |||| || |||||| |  || ||||| | |||||||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
3146947 cggcctcatcagggttgatgctgttacacagatgcttccc-tgcaaaaaattcctgcaatagttgttgcacttttggaattctagacgagccaccgacaa 3147045  T
299 gaacaatatcatctacactactcttgtccacctttga-atcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcct 395  Q
    | || | ||||| || |  ||| |||||||  || || |||||  ||||||||||||||||| |  | |||||   | ||||| ||||||||||||||||    
3147046 ggacgacatcatgtatagcacttttgtccat-ttcgacatcagcgaaacaactcttaacagtttccaaacactcagtgaaaagatccatattgatttcct 3147144  T
396 caaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaa 458  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | |||||||  || |||||||||  |||||||||||    
3147145 caaacttggcacgagtgattgatgaaaataagtcaaatccctgaaataaagaatctatctcaa 3147207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 439
Target Start/End: Original strand, 8581285 - 8581624
Alignment:
102 accaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaact 201  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||  | ||| |||||  || |||||||||||||||| |  | ||||||||| | ||| || || | || |||     
8581285 accaagtgacaatggtgtaacatctcgcaaaatcaagtttggaacactcttaatgccttcactaaccaaagcagcctgaatagcagcaccataagcaaca 8581384  T
202 gcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaa 301  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | ||| || |   | ||||| |    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
8581385 gcctcatcagggttgatgctcttgcataattccttcccctggaaaaactcctgtaatagctgtctcactttaggaatcctagaagaaccaccaacaagga 8581484  T
302 caatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaaca--gtctatacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaa 399  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||| ||| | ||| | || |||||| ||||||  ||| |||||||| | ||| |||| |||||| |||| ||||||    
8581485 caacatcatctacactacccctgtccatcttagcatcggcaagacaactattaacagtgtccatacacttttcaaagaggttcatattcatttgctcaaa 8581584  T
400 cttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttga 439  Q
    |||| |  |||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    
8581585 cttggcccgagttattgacgaatagaagtcaataccttga 8581624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 403
Target Start/End: Original strand, 8569967 - 8570199
Alignment:
173 cagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcacttt 272  Q
    ||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | ||| || |   | ||||| | |  ||||||    
8569967 cagcctgaatagctgcaccgtaagcaacagcctcatcagggttaatgctgttgcataattccttcccctggaaaaactcttgtaatagctgcctcacttt 8570066  T
273 gggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacag--tctatacacttg 370  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||| || |||||| |||||||  || ||||||||     
8570067 aggaatcctagaagaaccaccaacaaggacaacatcatctacactattcttttccatcttagcatcagcaagacaactattaacagtttccatacacttt 8570166  T
371 ttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttg 403  Q
    | ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
8570167 tcaaagaggttcatattcatttcctcaaacttg 8570199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29578257 - 29578029
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||| || | || ||    
29578257 ataccaagcgacaagggtgtaatatctcgcaagaccaaatttggaacattcttaatgccatcaatcaacaaagcagcctgcacagctgcaccataagcaa 29578158  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 299  Q
    | ||||| ||||| || |||||| ||||||||||| | || ||||| || |   ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
29578157 cagcctcgtcagggtttatgctcatgcacaaatccctacccttgaaaaagtcttgcaatagtttccgcactttgggaattctagatgaacctccaacaag 29578058  T
300 aacaatatcatctacactactcttgtcca 328  Q
     ||||| |||| |||  |||||| |||||    
29578057 gacaatttcatgtaccatactctggtcca 29578029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 421
Target Start/End: Original strand, 8601655 - 8601880
Alignment:
198 aactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgaca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||| |||||| || |    || || ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||    
8601655 aactgcctcatcaggattgatgctcacgcaaatgtccttccaattgaaaaattctttcagtaattgttgcactttgggaatcctagaagaaccgccaaca 8601754  T
298 agaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacag--tctatacacttgttaaaaaggtccatattgatttcct 395  Q
    || |||  |||||| ||||||||||| || | ||  | |||| ||| |||||| | |||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||    
8601755 aggacagcatcatccacactactcttttcgatctgagcatcactaagacaactttcaacagtctctatacacttcttaaagaggtccacattgagttgct 8601854  T
396 caaacttgacatgagtgattgatgaa 421  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
8601855 caaacttggcccgagtgattgatgaa 8601880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 328
Target Start/End: Original strand, 8590222 - 8590449
Alignment:
101 taccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaac 200  Q
    ||||||| ||||| || || |||||| | |||||||| || ||  |||||||||| || ||||  |  | |||||| || |||||||| || | || |||    
8590222 taccaagagacaatggagtaacatcttgtagcaccaaattaggaacattcttaatcccatcacaaagcaaagcagcttgaacagctgcaccataagcaac 8590321  T
201 tgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaaga 300  Q
     |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||  | || || |   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
8590322 agcctcatctggattgatgctattgtaaagatccttccccataaaaaagtcttgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagaaccaccaacaagt 8590421  T
301 acaatatcatctacactactcttgtcca 328  Q
    |||| |||||||||| |  |||||||||    
8590422 acaacatcatctacaatgttcttgtcca 8590449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 635
Target Start/End: Original strand, 8646469 - 8646997
Alignment:
109 gacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcat 208  Q
    ||||| |||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| || ||||| || | || ||| ||| |||    
8646469 gacaatggggtgacatcttgaaacaccaagtttggagcattcttaaagccatcacataataaagcagcctgaacggctgcgccataagcaacggccacat 8646568  T
209 caggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatc 308  Q
    |||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||| || |    ||  |  |  || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||    
8646569 cagggttgatgctctcgcataattccttctcattgaaaaactccttcagcatctgttgtacttttggaattctagaggagccaccaacaagaacaacatc 8646668  T
309 atctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgaca 406  Q
    ||  | |  ||||||||||| ||| | |||| ||  |||||||| |||||| |  | ||| | | | || || |||||||||||| | ||||| ||| ||    
8646669 atggatagaactcttgtccatcttggcatcattatgacaactctcaacagtttccaaacattcgatgaacagatccatattgattgcgtcaaatttggca 8646768  T
407 tgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatg 506  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||  |||||  ||||   | |||  | |    || || ||||||||||||||  | || ||||    
8646769 cgagtgattgatgaaataaagtcaatgccattaaataaagaatctaattcaatggtggtgcaagaagcaaaagatagtgtcctttttgctctctcgcatg 8646868  T
507 cagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaa 606  Q
    | |||||||||   || || |||||||  |  |  ||||||||||| ||||||||| | |||||||| | | |||||| || || ||||||  |||||||    
8646869 ccgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttgttaaattcttgtgcaaagtggtccaccattctactatcaaa 8646968  T
607 gtcctctcccccgatgtgagtgtttccag 635  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||    
8646969 gtcctctcctccgaggtgagtgtttccag 8646997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 634
Target Start/End: Original strand, 1301208 - 1301579
Alignment:
265 tgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtctat- 363  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |  |||| ||   |  ||||||||  ||| |||||||| ||| || | |     
1301208 tgcactttgggaatcctagacgagccacccacaagaacaatatcatcgatatcactcatgcatatttttgaatcgctaagacaactctcaacggtttttg 1301307  T
364 -acacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaat 462  Q
     |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||| || || |||||||||  ||| | ||||||  |    
1301308 tacactcattaaaaagatccatattaatttcctcaaacttggcacgagtgattaatgaacagaagtcgattccctgaaataaagaatcgacctcaacggt 1301407  T
463 tgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttc 562  Q
     ||||  ||    || |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||   || || | | |  | |  |   |||||||||| || ||||||    
1301408 ggtgactaaagcaaaagagagtgtcctttttgccctctcacacgcaattctcaacctccttaaggatttctggttaccactaatgtccactttattcttc 1301507  T
563 gtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttcca 634  Q
     |  | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||||||    
1301508 tttctgaactcctctacaaagtagctcaccattctattatcaaagtcctctcctccaaggtgagtatttcca 1301579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7878315 - 7878013
Alignment:
103 ccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactg 202  Q
    ||||| ||||| || || |||||| ||| |||||| || ||  |||||||||| || ||||  |  ||||||||||| |||||||| || | || ||| |    
7878315 ccaagagacaatggagtaacatcttgcaacaccaaattaggaacattcttaataccatcacaaagcagagcagcctgaacagctgcaccataagcaacag 7878216  T
203 cctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaac 302  Q
    | ||||| || ||||||||  |||| | ||||||||| || || || |   ||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||    
7878215 cttcatccgggttgatgctactgcaaatatccttccccttaaaaaagtcctgcaatagctgctgcactttgagaatcctagatgatccaccaacaagtac 7878116  T
303 aatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagt--ctatacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaac 400  Q
    || |||||||||| |  ||||||||| | | | |||||||| ||||||||| ||| |  | | ||| || | |||||| |||||||||| || |||||||    
7878115 aacatcatctacattgttcttgtccatcatagcatcagtaagacaactcttgacaatcgccaaacaattttcaaaaagatccatattgagttgctcaaac 7878016  T
401 ttg 403  Q
    |||    
7878015 ttg 7878013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13333959 - 13333835
Alignment:
94 actgaaataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgt 193  Q
    |||||||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||| || ||| || |||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |    
13333959 actgaaataccaagtgataatgggataacatctcgtagcaccaagttcgggacagtcttaaagccttcactcaaaatagcagcctgaacagctgcaccat 13333860  T
194 gagaaactgcctcatcaggattgat 218  Q
     || ||| |||||||| || |||||    
13333859 aagcaacagcctcatctgggttgat 13333835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 13333765 - 13333506
Alignment:
374 aaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaact 473  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || ||   |||||||  |||||  |||||| | |||| |||      
13333765 aaaaagtctatattaatttcctcaaatttggcacgagtgattgatgaagaaaagtcgattcccataaataaagcatctacttcaacagtggtgacaaaag 13333666  T
474 tgaaggagagtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattc 573  Q
      ||||||||| |||||||| || | ||||| ||||||||||||   || || | | |||| |  |   | || || ||||| |||||| | || || ||    
13333665 aaaaggagagtatccttttttccctctcacaggcagttctcaacctccttaaggattttgggttcccactgatatcgacgttattcttctttttgaactc 13333566  T
574 ctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttcc 633  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||    
13333565 ctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcttctcccccaaggtgagtgtttcc 13333506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 543 - 633
Target Start/End: Original strand, 3147292 - 3147382
Alignment:
543 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttcc 633  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| |||  | |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
3147292 taatgtctaccttgttcttcttcttaaactcccgtgcaaagtagttcaccatcctattatcaaagtcctctcccccaaggtgggtgtttcc 3147382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 8636483 - 8636411
Alignment:
543 taatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcc 615  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||    
8636483 taatgtctaccttgttcttcctcttgatttcctctacaaaatattccaccattctgttatcaaagtcctctcc 8636411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 633
Target Start/End: Original strand, 8667449 - 8667537
Alignment:
545 atgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttcc 633  Q
    |||||||| || |||||| | || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||    
8667449 atgtccactttattcttcttttttaactcctcaacaaaatagttcaccattctgttatcgaagtcctcgcccccaaggtgagtgtttcc 8667537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 188
Target Start/End: Original strand, 8558912 - 8559054
Alignment:
46 ggtagagaagtattcctaggaattaccacatccatggtgcctcgattcactgaaataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttgggg 145  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||  |  |||   |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||      
8558912 ggtacagaagtattcctaggaatcaccacactcataatatctccggtcacttcaataccaagggacaaaggggtaacatctctcagcaccatgtttggaa 8559011  T
146 cattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgc 188  Q
    |||||||| || ||||||| |  | | ||||||||||||||||    
8559012 cattcttagtgtcttcactaagcaaaacagcctggacagctgc 8559054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 432
Target Start/End: Original strand, 8664907 - 8664977
Alignment:
362 atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaat 432  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||| |||| |||||    
8664907 atacactttgtaaaaaggtccatattgatttcctcaaacctcgcacgagttattgatgaacaaaattcaat 8664977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27846645 - 27846555
Alignment:
146 cattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatcctt 236  Q
    ||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||| ||   || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
27846645 cattcttaatgtcatcactcaacaaagcagcctgcacagctgctccaaaagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgtacatatcctt 27846555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 310
Target Start/End: Original strand, 8102311 - 8102460
Alignment:
161 cactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatag 260  Q
    ||||||| | |||||| || ||||| || || | || ||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |   |||| ||    
8102311 cactcaagatagcagcttgaacagcggcaccataagcaacagcctcgtcggggttgatgcttttgcatagctccttaccattgaagaagtcttgcaacag 8102410  T
261 ttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcat 310  Q
    || ||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
8102411 ttgctgaactttgggaatcctagttgaaccaccaacaagaacaacatcat 8102460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 554 - 638
Target Start/End: Original strand, 8559372 - 8559456
Alignment:
554 ttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccagaag 638  Q
    ||||||||| ||| ||| || | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||    
8559372 ttgttcttcctctcaaactcttttacaaagtgtttcaccattctgttatcaaagtcctctcctccgaggtgtgtgtctccggaag 8559456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 544 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 7877872 - 7877801
Alignment:
544 aatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgttatcaaagtcctctcc 615  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| |||   || || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
7877872 aatgtccactttattcttcctcttaaactccatcactaaatggttcaacattctgttatcaaagtcctctcc 7877801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 517
Target Start/End: Original strand, 8576293 - 8576328
Alignment:
482 agtgtcctttttgccttttcacatgcagttctcaac 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
8576293 agtgtcctttttgccttttcacaagcagttctcaac 8576328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 591 - 635
Target Start/End: Original strand, 8628608 - 8628652
Alignment:
591 acattctgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccag 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||    
8628608 acattctgttatcaaagtcctctccaccaaggtgagtatttccag 8628652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 4679142 - 4678606
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||  ||||| ||||| | |||||| |||| |||||| || | || ||    
4679142 ataccaagtgacaatggggtaacatctcgcagcacaaaattcgggacattcttaaaaccttcgctcaaaatagcagcttggatagctgcaccataagcaa 4679043  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaag 299  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || || || |   ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
4679042 cagcctcatctgggttgatactcttgcacaaatccttccgcttaaaaaagtcttgcaatagatcctgcactttgggaatcctcgatgaaccacccacaag 4678943  T
300 aacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctca 397  Q
    ||||| |||||| | | |||||  |  || |||||||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
4678942 aacaacatcatcaatattactcccgcgcatctttgaatcactaagacaactcttaacagtttccatacactcgttgaaaaggtccatattaatttcctca 4678843  T
398 aacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcct 497  Q
    |||||| || |||| || |||||||||||||| || || |||||||||  ||||| ||||||| | |||| |||   ||| ||||||||||| ||||||     
4678842 aacttggcacgagtaatagatgaagaaaagtctattccctgaaataaagaatcta-ctcaacagtggtgacaaaggcgaaagagagtgtcctctttgccc 4678744  T
498 tttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattct 597  Q
    | || || ||||||||||||   || || | | |||  |      |||||||||| || |||||| | || || ||||||||||||||||||| ||||||    
4678743 tctcgcaggcagttctcaacctccttaagggttttgcgttcttactaatgtccacattattcttctttttgaactcctctacaaagtagttcaccattct 4678644  T
598 gttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccag 635  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
4678643 gttatcaaagtcctctccacctaggtgagtgtttccag 4678606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 633
Target Start/End: Original strand, 15594619 - 15595152
Alignment:
102 accaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaact 201  Q
    |||||| |||||||| |  |||||| | | |||||| |||||  |||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| || | || |||     
15594619 accaagagacaaaggtgcaacatcttgtatcaccaagtttggaacatttttaaaaccttcactcaacaaagcagcctggacagctgcaccataagcaaca 15594718  T
202 gcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaa 301  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || | ||| ||||    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
15594719 gcctcatcagggttgatgctcatgcacaattcctttccctcgaaaaaatccttcaatagttgttgcactttgggaatcctagaagacccaccaacaatga 15594818  T
302 caatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaa 399  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | ||||  || |||||||| |||  |||  ||||| |  ||||||| |||||| |||||||| |||||    
15594819 caatatcatttacactactcttattcatcttagcatcatcaagacaactctcaactatcttcatacaatccttaaaaaagtccatgttgatttcttcaaa 15594918  T
400 cttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgccttt 499  Q
    ||||  | |||| |  |||||| | |||||||| || | |||||||  ||||| |||||   | |||| |    | || ||||||  |||||||||| ||    
15594919 cttggaacgagtaaccgatgaaaagaagtcaataccgttaaataaacaatctacctcaatggtagtgacagtagtaaaagagagtaccctttttgccctt 15595018  T
500 tcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattctgt 599  Q
    || || |||||||||||    ||||| || ||||| |  |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||| | ||||||||    
15595019 tcgcacgcagttctcaatctcctcaaggcccttgggttcccagtaatatccactttgttcttcgtcttgaattcctgcgcaaagtagttgaccattctgt 15595118  T
600 tatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttcc 633  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||    
15595119 tatcaaagtcctctcctccaaggtgagtgtttcc 15595152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34467352 - 34467145
Alignment:
121 acatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgc 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| |||| ||||| |||||| | |||||| || ||||||||  | | ||  || ||||||||||| |||||||    
34467352 acatctcgcagcaccaagtttggaacattgttaaagcctttactcaacaaagcagcttgcacagctgcgacataagcgacagcctcatcagggttgatgc 34467253  T
221 tcttgcacaaatccttcccattgaagaaattacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactact 320  Q
    | ||||| | |||||| |||||||| || |  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||  ||||||||    
34467252 tattgcatagatccttaccattgaaaaagtcccgcaatagctgctgcactttgggaatcctagaagagcccccgacaaggacagcatcatgcacactact 34467153  T
321 cttgtcca 328  Q
    | ||||||    
34467152 cgtgtcca 34467145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52549527 - 52549395
Alignment:
104 caagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgc 203  Q
    |||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| || | ||  ||  |    
52549527 caagagacaaaggtgtaacatcctgcagcaccaactttggaacattctgaatgccttcactcaacaatgcagcctgaacagctgcgccataagctacaac 52549428  T
204 ctcatcaggattgatgctcttgcacaaatcctt 236  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
52549427 ctcatcaggattaatgcccttgcacaactcctt 52549395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 379 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34467089 - 34467051
Alignment:
379 gtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
34467089 gtccatattgatttcctcaaacttggcacgagtgattga 34467051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 52549333 - 52549292
Alignment:
362 atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttg 403  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
52549333 atacactccttaaaaaggtccatattcatttcctcaaacttg 52549292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 636
Target Start/End: Original strand, 43744399 - 43744937
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||| |||||||||  |||||  | || |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||   || ||    
43744399 ataccaagagaaaaaggtgcaacatcttgcagcaccacgtttggaacttttttaaagccttcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccaatagcaa 43744498  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattac-gcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaa 298  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  || ||||| | |||||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
43744499 ctgcctcatcagggttaatgttcttacacaaatccttccc-tgcaaaaaattcctgcaatagttgttgtacttttggaatcctagaggagccaccaacaa 43744597  T
299 gaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctc 396  Q
    |||||| ||||| || |   |||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||| | |  | ||||| ||| || || |||||||||||||||||    
43744598 gaacaacatcatgtatagcgctcttgtccatcttggcatcagtaagacaactctcaacaattttcaaacactcgttgaagagatccatattgatttcctc 43744697  T
397 aaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcc 496  Q
    ||||||   | ||||||||| || | | || |||||||| | |||||||  ||||| ||||| | | |||| ||     || || | ||||||||||||     
43744698 aaacttagtacgagtgattgttgtaaagaaatcaatgccctcaaataaagaatctacctcaatagtggtgacaacagcaaaagataatgtcctttttgct 43744797  T
497 ttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattc 596  Q
     |||| ||||| |||||||||   || || |||||||| |  |  ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||| |    
43744798 ctttcgcatgctgttctcaacctccttaatgctcttgggtttccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcc 43744897  T
597 tgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccaga 636  Q
    | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
43744898 tattatcaaaatcctctcctccgaggtgagtgtttccaga 43744937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 149 - 435
Target Start/End: Original strand, 12528136 - 12528424
Alignment:
149 tcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaactgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaa 248  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| || || | || ||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||| || ||||| ||    
12528136 tcttcatgccttcactcaacaaagcagcctgaacagcggcaccataagcaacagcctcatcagggttgatgctcttgtataactccttgcccttgaaaaa 12528235  T
249 attacgcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaagaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaa 348  Q
     |   ||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||    
12528236 ctcctgcaatagctgcttcactttgggaatcctagacgagccaccaacaagtacaatatcatctacactactcttgtccatcttagcatcggtcaaacaa 12528335  T
349 ctcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctcaaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgcc 435  Q
    || | ||| ||||  |||||||| | ||| ||||||||||| | || ||| |||||| |  |||||||||||||  | |||||||||||    
12528336 ctttcaacggtctccatacacttttcaaagaggtccatattcagttgctcgaacttggctcgagtgattgatgagcagaagtcaatgcc 12528424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 635
Target Start/End: Original strand, 28219501 - 28220038
Alignment:
100 ataccaagcgacaaaggggtgacatctcgcagcaccaactttggggcattcttaatgccttcactcaatagagcagcctggacagctgccccgtgagaaa 199  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||  | || |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| || | || ||    
28219501 ataccaagagacaaaggtgtaacatcttgcagcaccaacttcggaacttttttaaagccttcactcaacaaagcagcctgcacagctgcaccataagcaa 28219600  T
200 ctgcctcatcaggattgatgctcttgcacaaatccttcccattgaagaaattac-gcaatagttcctgcactttgggaatcctagaagaaccaccgacaa 298  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||| | ||| |||||  || ||||| ||||| ||||| || || || ||||    
28219601 cagcctcatcagggttaatgctcttacacaattccttccc-tccaaaaaattcctgcagtagttgttgtacttttggaattctagaggagcctccaacaa 28219699  T
299 gaacaatatcatctacactactcttgtccacctttgaatcagtaaaacaactcttaacagtct--atacacttgttaaaaaggtccatattgatttcctc 396  Q
    |||||| ||| | ||||   ||||||||||  || | |||||| | ||| |||| |||||| |  | |||||  || ||||| |||||||||||||||||    
28219700 gaacaacatcgtgtacagccctcttgtccatattggcatcagtgagacacctctcaacagttttcaaacactcattgaaaagatccatattgatttcctc 28219799  T
397 aaacttgacatgagtgattgatgaagaaaagtcaatgccttgaaataaattatctatctcaacaattgtgagaaacttgaaggagagtgtcctttttgcc 496  Q
    ||||||  || |||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||  ||||| |||||   | | || ||     || || ||||||||||||||     
28219800 aaacttagcacgagtaattgatgaaaagaaatcaatgccttcaaataaagaatctacctcaatggtggcgacaacagcaaaagatagtgtcctttttgct 28219899  T
497 ttttcacatgcagttctcaactgtctcaaagctcttggatcgcgggtaatgtccacgttgttcttcgtcttaaattcctctacaaagtagttcaacattc 596  Q
     | |  || || |||||||||   || || |||||||  |  |  ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||| |    
28219900 ctcttgcacgctgttctcaacctccttaaggctcttgagtttccagtaatgtccaccttgttcttcttcttaaactcctctgcgaagtagttcaccatcc 28219999  T
597 tgttatcaaagtcctctcccccgatgtgagtgtttccag 635  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
28220000 tactatcaaagtcctctcccccgaggtgagtgtttccag 28220038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University