View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4496_low_14 (Length: 210)

Name: NF4496_low_14
Description: NF4496
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4496_low_14
NF4496_low_14
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (1-203)||(75-277)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (1-203)||(24890-25091)
scaffold0158 (1-134)||(25212-25344)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (26-203)||(3230-3407)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (1-203)||(228-430)
scaffold0310 (127-203)||(6603-6679)
scaffold0310 (1-91)||(6522-6612)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (1-203)||(7284174-7284376)
chr7 (1-160)||(11287390-11287550)
chr7 (1-156)||(15822545-15822701)
chr7 (4-156)||(39046740-39046893)
chr7 (1-167)||(16570119-16570287)
chr7 (1-167)||(16595375-16595543)
chr7 (1-167)||(13274753-13274921)
chr7 (1-167)||(49047787-49047955)
chr7 (1-156)||(12758965-12759120)
chr7 (1-151)||(26070378-26070529)
chr7 (1-151)||(26094165-26094316)
chr7 (25-156)||(45452304-45452435)
chr7 (1-160)||(12248234-12248395)
chr7 (1-181)||(126366-126548)
chr7 (1-160)||(111391-111550)
chr7 (1-151)||(3049565-3049716)
chr7 (1-172)||(12369954-12370127)
chr7 (1-160)||(3894998-3895158)
chr7 (7-168)||(17224058-17224220)
chr7 (1-156)||(47289758-47289914)
chr7 (1-156)||(35094794-35094949)
chr7 (1-160)||(2028893-2029054)
chr7 (1-151)||(2190308-2190460)
chr7 (1-172)||(32494168-32494341)
chr7 (1-151)||(42056411-42056563)
chr7 (1-156)||(143622-143772)
chr7 (15-176)||(13377485-13377648)
chr7 (1-156)||(44865204-44865363)
chr7 (50-203)||(14272049-14272203)
chr7 (25-175)||(16915066-16915217)
chr7 (25-175)||(48356602-48356753)
chr7 (25-175)||(34241326-34241477)
chr7 (7-128)||(31501179-31501300)
chr7 (27-176)||(4484683-4484834)
chr7 (25-175)||(9611266-9611416)
chr7 (25-175)||(9838838-9838988)
chr7 (1-111)||(13863043-13863154)
chr7 (6-176)||(4446168-4446340)
chr7 (79-168)||(1937200-1937290)
chr7 (7-151)||(20583674-20583819)
chr7 (2-116)||(13321033-13321148)
chr7 (7-95)||(16919598-16919686)
chr7 (24-111)||(25124153-25124238)
chr7 (97-176)||(14935319-14935400)
chr7 (97-176)||(15362912-15362993)
chr7 (7-108)||(46474027-46474128)
chr7 (7-111)||(9723927-9724031)
chr7 (7-111)||(17947712-17947816)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-203)||(21442-21645)
scaffold0120 (1-203)||(31141-31344)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (1-203)||(33341812-33342014)
chr3 (5-203)||(7853913-7854111)
chr3 (1-203)||(54685423-54685625)
chr3 (56-203)||(19946629-19946776)
chr3 (1-156)||(14298399-14298554)
chr3 (1-156)||(14304026-14304181)
chr3 (1-156)||(35123674-35123829)
chr3 (1-151)||(53898569-53898719)
chr3 (1-156)||(19570802-19570957)
chr3 (1-144)||(50112165-50112309)
chr3 (1-156)||(14295415-14295572)
chr3 (1-156)||(22144386-22144542)
chr3 (1-156)||(13817492-13817645)
chr3 (1-151)||(12349653-12349809)
chr3 (1-148)||(16996173-16996321)
chr3 (1-167)||(17139474-17139642)
chr3 (7-160)||(11329081-11329235)
chr3 (1-160)||(14528125-14528286)
chr3 (1-172)||(17523003-17523176)
chr3 (1-156)||(6154445-6154600)
chr3 (1-128)||(12349844-12349970)
chr3 (13-203)||(47784873-47785064)
chr3 (1-181)||(30152893-30153075)
chr3 (7-150)||(16182065-16182209)
chr3 (1-160)||(54423986-54424145)
chr3 (1-160)||(3992522-3992683)
chr3 (1-156)||(14301042-14301199)
chr3 (4-168)||(17956109-17956274)
chr3 (1-156)||(317622-317778)
chr3 (1-156)||(6146860-6147015)
chr3 (1-151)||(14059326-14059478)
chr3 (12-123)||(8631801-8631912)
chr3 (1-150)||(17100636-17100786)
chr3 (1-150)||(17101321-17101471)
chr3 (1-126)||(17938582-17938707)
chr3 (1-160)||(55440962-55441123)
chr3 (1-151)||(38167896-38168047)
chr3 (1-151)||(2844172-2844324)
chr3 (1-172)||(45581591-45581764)
chr3 (1-151)||(53771022-53771174)
chr3 (1-160)||(23492346-23492506)
chr3 (7-176)||(12488846-12489017)
chr3 (1-124)||(16261463-16261586)
chr3 (13-160)||(12560362-12560510)
chr3 (1-160)||(54038246-54038406)
chr3 (1-126)||(16880131-16880257)
chr3 (1-151)||(19260953-19261104)
chr3 (25-175)||(38811146-38811297)
chr3 (122-203)||(9303343-9303425)
chr3 (26-167)||(15876034-15876176)
chr3 (25-181)||(12952915-12953073)
chr3 (7-166)||(17191511-17191668)
chr3 (13-166)||(17204667-17204821)
chr3 (7-151)||(3576558-3576703)
chr3 (1-128)||(11061119-11061247)
chr3 (25-176)||(1990759-1990912)
chr3 (1-167)||(3578057-3578222)
chr3 (1-167)||(9590867-9591035)
chr3 (1-57)||(34439457-34439513)
chr3 (29-175)||(34559857-34560004)
chr3 (7-167)||(39656492-39656653)
chr3 (25-175)||(17960451-17960602)
chr3 (87-151)||(28558188-28558253)
chr3 (1-151)||(14080491-14080643)
chr3 (56-168)||(16934151-16934263)
chr3 (25-176)||(6228763-6228916)
chr3 (7-151)||(14814885-14815030)
chr3 (24-151)||(51961276-51961402)
chr3 (12-176)||(33369033-33369199)
chr3 (164-200)||(8901257-8901293)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-203)||(18583264-18583450)
chr6 (1-156)||(31628245-31628401)
chr6 (56-203)||(18823565-18823712)
chr6 (56-203)||(18839420-18839567)
chr6 (1-150)||(18432626-18432776)
chr6 (1-150)||(16086001-16086150)
chr6 (1-144)||(32898779-32898923)
chr6 (1-168)||(35015279-35015447)
chr6 (1-156)||(22440911-22441067)
chr6 (1-151)||(26089718-26089868)
chr6 (1-156)||(16106499-16106649)
chr6 (7-181)||(18398890-18399065)
chr6 (7-168)||(18381803-18381965)
chr6 (5-156)||(25744331-25744483)
chr6 (1-156)||(13014823-13014979)
chr6 (1-160)||(18002618-18002777)
chr6 (1-151)||(23994904-23995056)
chr6 (5-160)||(18777119-18777275)
chr6 (1-168)||(19983413-19983581)
chr6 (25-151)||(25367375-25367502)
chr6 (1-160)||(15742342-15742505)
chr6 (7-175)||(22361885-22362054)
chr6 (56-203)||(4991002-4991150)
chr6 (1-141)||(18570271-18570412)
chr6 (82-203)||(17083373-17083496)
chr6 (13-160)||(28195219-28195367)
chr6 (25-175)||(25919571-25919722)
chr6 (1-151)||(33324675-33324827)
chr6 (1-151)||(35136125-35136277)
chr6 (7-168)||(21623133-21623295)
chr6 (25-172)||(25651197-25651346)
chr6 (25-164)||(33538507-33538647)
chr6 (1-151)||(16887905-16888057)
chr6 (2-126)||(35009569-35009692)
chr6 (7-176)||(34966823-34966994)
chr6 (1-111)||(15079821-15079932)
chr6 (25-151)||(19854137-19854264)
chr6 (94-151)||(15740211-15740269)
chr6 (25-176)||(29605406-29605559)
chr6 (25-167)||(18629746-18629892)
chr6 (4-70)||(29665938-29666004)
chr6 (58-151)||(19629314-19629406)
chr6 (2-66)||(27740907-27740971)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (1-168)||(34395222-34395390)
chr4 (1-156)||(16732146-16732302)
chr4 (4-156)||(23270051-23270204)
chr4 (1-156)||(44055892-44056048)
chr4 (4-181)||(55376714-55376893)
chr4 (5-128)||(45458973-45459096)
chr4 (1-156)||(53704847-53705003)
chr4 (1-141)||(21959577-21959718)
chr4 (1-150)||(820030-820177)
chr4 (1-151)||(13809623-13809775)
chr4 (1-181)||(14951713-14951895)
chr4 (1-156)||(30457880-30458036)
chr4 (1-156)||(53907813-53907966)
chr4 (1-151)||(12837314-12837464)
chr4 (1-151)||(30232610-30232761)
chr4 (5-168)||(25119333-25119498)
chr4 (25-160)||(18494466-18494602)
chr4 (1-144)||(44346816-44346960)
chr4 (1-168)||(5682649-5682817)
chr4 (1-151)||(15272434-15272586)
chr4 (56-203)||(16522748-16522896)
chr4 (27-167)||(27960938-27961078)
chr4 (1-112)||(8872585-8872699)
chr4 (7-176)||(15044784-15044955)
chr4 (56-203)||(9295624-9295772)
chr4 (15-176)||(15109477-15109640)
chr4 (25-203)||(7185982-7186159)
chr4 (7-168)||(41166066-41166228)
chr4 (7-128)||(52265628-52265749)
chr4 (25-175)||(19821914-19822065)
chr4 (25-175)||(37957163-37957314)
chr4 (25-175)||(7964849-7965000)
chr4 (27-175)||(18276392-18276541)
chr4 (33-168)||(14901197-14901333)
chr4 (26-176)||(41256508-41256660)
chr4 (2-76)||(10104380-10104454)
chr4 (6-167)||(40905053-40905214)
chr4 (2-111)||(15675219-15675328)
chr4 (84-168)||(47535243-47535328)
chr4 (26-176)||(15013421-15013573)
chr4 (1-111)||(31115653-31115763)
chr4 (7-128)||(38764715-38764836)
chr4 (7-76)||(47535185-47535254)
chr4 (7-111)||(18238277-18238381)
chr4 (1-76)||(40885683-40885758)
chr4 (25-111)||(54398406-54398492)
chr4 (7-111)||(13590194-13590298)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-167)||(9903-10070)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (1-156)||(20573306-20573461)
chr8 (1-156)||(41246635-41246791)
chr8 (1-160)||(41506931-41507091)
chr8 (1-172)||(20481565-20481738)
chr8 (1-156)||(19993168-19993324)
chr8 (1-151)||(21680984-21681136)
chr8 (1-167)||(39446879-39447046)
chr8 (1-151)||(22234917-22235068)
chr8 (13-175)||(38533607-38533770)
chr8 (7-144)||(20647949-20648087)
chr8 (1-144)||(20654019-20654163)
chr8 (1-128)||(37611675-37611801)
chr8 (5-160)||(274416-274572)
chr8 (5-160)||(641277-641433)
chr8 (5-160)||(827083-827239)
chr8 (1-168)||(24716984-24717152)
chr8 (58-156)||(20567329-20567427)
chr8 (58-156)||(20573522-20573620)
chr8 (1-172)||(16039003-16039176)
chr8 (7-175)||(22735958-22736127)
chr8 (7-168)||(23837163-23837325)
chr8 (72-156)||(20567184-20567268)
chr8 (25-175)||(5854572-5854723)
chr8 (1-141)||(39115267-39115408)
chr8 (7-168)||(21198272-21198434)
chr8 (25-175)||(26011452-26011603)
chr8 (25-175)||(15933256-15933407)
chr8 (52-156)||(25122513-25122618)
chr8 (25-176)||(33528383-33528534)
chr8 (7-66)||(20561751-20561810)
chr8 (32-156)||(15969796-15969920)
chr8 (79-181)||(29759893-29759997)
chr8 (7-176)||(18261591-18261762)
chr8 (25-176)||(23226214-23226368)
chr8 (25-167)||(27233205-27233348)
chr8 (29-176)||(23149736-23149886)
chr8 (1-124)||(24385874-24385988)
chr8 (13-167)||(33611179-33611334)
chr8 (51-168)||(31194488-31194606)
chr8 (82-168)||(17285232-17285319)
chr8 (25-151)||(38635786-38635913)
chr8 (1-176)||(23158118-23158294)
chr8 (7-101)||(29306450-29306544)
chr8 (7-56)||(22981351-22981400)
chr8 (25-126)||(23151971-23152072)
chr8 (7-111)||(45559057-45559161)
chr8 (7-77)||(22497329-22497399)
chr8 (99-168)||(24929018-24929087)
chr8 (59-168)||(3431461-3431570)
chr8 (25-176)||(18041670-18041823)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (1-202)||(11583982-11584187)
chr5 (1-181)||(1168318-1168500)
chr5 (1-156)||(11337300-11337455)
chr5 (1-172)||(20712036-20712209)
chr5 (1-160)||(2031783-2031943)
chr5 (1-149)||(21397073-21397225)
chr5 (1-128)||(24183246-24183370)
chr5 (1-167)||(19405503-19405671)
chr5 (1-156)||(28261498-28261654)
chr5 (1-181)||(11342635-11342818)
chr5 (1-156)||(24475560-24475711)
chr5 (5-125)||(21906729-21906846)
chr5 (7-175)||(7728378-7728547)
chr5 (1-160)||(21650668-21650828)
chr5 (1-156)||(4865239-4865396)
chr5 (32-156)||(23466434-23466559)
chr5 (13-176)||(23493875-23494040)
chr5 (5-156)||(21646857-21647009)
chr5 (1-160)||(21204898-21205059)
chr5 (56-203)||(109010-109158)
chr5 (56-203)||(16105573-16105721)
chr5 (7-176)||(3673818-3673989)
chr5 (25-175)||(21616974-21617125)
chr5 (7-159)||(19862183-19862336)
chr5 (7-176)||(5450963-5451134)
chr5 (1-167)||(16595474-16595641)
chr5 (7-176)||(432419-432590)
chr5 (25-175)||(21222746-21222897)
chr5 (25-176)||(6456580-6456733)
chr5 (1-176)||(23981629-23981806)
chr5 (83-175)||(32966343-32966436)
chr5 (25-167)||(29917931-29918074)
chr5 (164-202)||(24225596-24225634)
chr5 (25-175)||(37983325-37983473)
chr5 (15-70)||(28902255-28902310)
chr5 (15-70)||(28938650-28938705)
chr5 (2-67)||(22053963-22054028)
chr5 (5-67)||(18531200-18531262)
chr5 (25-109)||(16835437-16835521)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (1-156)||(35522433-35522588)
chr1 (1-156)||(21718206-21718361)
chr1 (1-156)||(49967628-49967783)
chr1 (1-151)||(22403224-22403375)
chr1 (28-167)||(51627805-51627945)
chr1 (25-128)||(9784238-9784341)
chr1 (1-156)||(41212046-41212205)
chr1 (1-181)||(15861548-15861728)
chr1 (1-181)||(22366970-22367151)
chr1 (1-160)||(21859984-21860144)
chr1 (1-160)||(27329869-27330026)
chr1 (1-172)||(35054716-35054889)
chr1 (1-163)||(44035093-44035255)
chr1 (7-168)||(20177140-20177302)
chr1 (32-175)||(27674755-27674898)
chr1 (13-175)||(37233986-37234149)
chr1 (25-175)||(17608886-17609037)
chr1 (92-174)||(22829629-22829712)
chr1 (1-75)||(9784178-9784249)
chr1 (25-168)||(13376978-13377122)
chr1 (31-175)||(38033818-38033962)
chr1 (49-175)||(19603055-19603182)
chr1 (50-168)||(41229102-41229221)
chr1 (26-167)||(21194980-21195122)
chr1 (49-150)||(36356455-36356557)
chr1 (1-128)||(22143474-22143602)
chr1 (15-70)||(16645976-16646031)
chr1 (49-175)||(20955601-20955728)
chr1 (15-70)||(16656702-16656757)
chr1 (2-67)||(20445747-20445812)
chr1 (2-67)||(20531512-20531577)
chr1 (25-176)||(8538048-8538200)
chr1 (25-176)||(8603287-8603439)
chr1 (56-168)||(21650217-21650329)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-156)||(254928-255084)
scaffold0011 (1-156)||(261534-261690)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (1-150)||(1300-1450)
scaffold0359 (1-156)||(11768-11921)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (1-156)||(271148-271303)
chr2 (5-156)||(4448251-4448402)
chr2 (1-156)||(32465835-32465991)
chr2 (1-168)||(25601989-25602157)
chr2 (7-203)||(19433452-19433649)
chr2 (1-156)||(28974026-28974182)
chr2 (1-156)||(23836819-23836975)
chr2 (1-167)||(22579975-22580140)
chr2 (1-172)||(25876033-25876206)
chr2 (1-172)||(36890799-36890972)
chr2 (1-167)||(24571405-24571572)
chr2 (41-156)||(27261783-27261899)
chr2 (1-168)||(22274688-22274855)
chr2 (7-203)||(43645824-43646020)
chr2 (31-175)||(3385-3529)
chr2 (1-168)||(22283921-22284088)
chr2 (4-160)||(9653021-9653179)
chr2 (4-156)||(6879414-6879567)
chr2 (4-148)||(21274174-21274319)
chr2 (56-203)||(25212977-25213126)
chr2 (7-172)||(67952-68119)
chr2 (121-203)||(24826961-24827044)
chr2 (7-162)||(25305416-25305573)
chr2 (25-176)||(24884643-24884795)
chr2 (25-175)||(722353-722504)
chr2 (7-156)||(31146301-31146450)
chr2 (25-172)||(23821743-23821892)
chr2 (25-172)||(23830822-23830971)
chr2 (2-126)||(25265520-25265643)
chr2 (1-166)||(19666495-19666662)
chr2 (25-128)||(24294661-24294764)
chr2 (1-151)||(19669222-19669374)
chr2 (13-75)||(22775331-22775393)
chr2 (13-75)||(22780709-22780771)
chr2 (2-67)||(24341519-24341584)
chr2 (7-176)||(9636701-9636872)
chr2 (25-111)||(24560869-24560955)
chr2 (2-126)||(36982571-36982694)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (7-156)||(60784-60933)
scaffold0001 (1-156)||(70736-70892)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (1-156)||(936-1092)
scaffold0673 (1-156)||(6959-7118)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-149)||(11822-11970)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (1-156)||(132364-132520)
scaffold0021 (1-160)||(11660-11821)
scaffold0021 (5-120)||(88289-88404)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-168)||(253103-253271)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-156)||(22668-22824)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (1-156)||(690-846)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (1-156)||(5360-5516)
scaffold0480 (1-160)||(8995-9156)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (5-160)||(118081-118237)
scaffold0035 (7-160)||(109582-109736)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-156)||(11682-11837)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (1-160)||(8960-9120)
[»] scaffold0195 (3 HSPs)
scaffold0195 (1-156)||(632-788)
scaffold0195 (2-126)||(19216-19339)
scaffold0195 (2-126)||(21300-21423)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-149)||(7556-7702)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (1-144)||(85321-85465)
scaffold0014 (1-160)||(159275-159433)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (7-203)||(28466-28663)
scaffold0150 (153-203)||(21637-21687)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-168)||(4906-5074)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-144)||(38287-38431)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (1-181)||(1332-1514)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (1-156)||(32180-32336)
scaffold0091 (1-156)||(41967-42123)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (1-151)||(3-154)
scaffold0160 (60-160)||(3492-3593)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (1-156)||(14854-15007)
scaffold0083 (79-156)||(14194-14272)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-156)||(112659-112812)
scaffold0022 (7-167)||(109556-109717)
scaffold0022 (13-175)||(103048-103211)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (1-168)||(6205-6373)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (1-160)||(17526-17686)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-168)||(31402-31570)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (1-167)||(33841-34008)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-168)||(41274-41442)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (1-144)||(164204-164348)
scaffold0016 (1-168)||(162300-162469)
scaffold0016 (1-168)||(166386-166547)
scaffold0016 (61-168)||(116687-116795)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-160)||(94948-95108)
scaffold0037 (1-160)||(24842-25002)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (24-167)||(31010-31154)
scaffold0031 (1-93)||(70654-70747)
scaffold0031 (13-175)||(97324-97487)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (26-168)||(30056-30199)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-160)||(1100-1261)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (1-160)||(13508-13669)
scaffold0251 (1-151)||(21482-21634)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (1-160)||(14921-15082)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (1-160)||(55553-55714)
scaffold0032 (28-175)||(93913-94061)
scaffold0032 (58-151)||(104793-104887)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-151)||(6665-6816)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (1-172)||(15585-15761)
scaffold0077 (7-176)||(6500-6671)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (1-160)||(1889-2049)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-144)||(3308-3453)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (1-160)||(9629-9789)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (1-160)||(12642-12802)
scaffold0039 (27-160)||(19049-19183)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-151)||(79846-79997)
scaffold0034 (1-128)||(46171-46298)
scaffold0034 (1-128)||(40664-40791)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (7-160)||(10094-10248)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-156)||(48124-48280)
scaffold0068 (1-156)||(61572-61728)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-172)||(146561-146734)
scaffold0025 (2-67)||(8917-8982)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (1-163)||(573-736)
scaffold0342 (1-172)||(5900-6074)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (7-168)||(76967-77129)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (1-160)||(193610-193770)
scaffold0004 (1-151)||(186648-186799)
scaffold0004 (27-176)||(27453-27604)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (56-203)||(130486-130634)
scaffold0028 (2-70)||(89584-89652)
scaffold0028 (1-151)||(79521-79673)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (58-160)||(24368-24471)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (7-172)||(270-436)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (25-175)||(69415-69566)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (7-168)||(35444-35605)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (7-128)||(33668-33789)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (13-175)||(2483-2646)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (1-151)||(150-301)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (7-176)||(2436-2607)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (25-175)||(43936-44087)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (55-160)||(7807-7913)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (7-172)||(6622-6788)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (1-156)||(7987-8144)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (5-68)||(4351-4414)
scaffold0740 (83-156)||(4284-4358)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (1-160)||(4536-4697)
scaffold0447 (1-160)||(9150-9311)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (25-175)||(197391-197545)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (25-175)||(30978-31129)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (25-176)||(2411-2564)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (25-148)||(7163-7287)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (26-151)||(10644-10770)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-160)||(7144-7306)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (143-200)||(12990-13048)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-149)||(70419-70569)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (13-176)||(107967-108130)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (25-151)||(21981-22108)
scaffold0165 (7-151)||(29946-30091)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (5-126)||(41658-41778)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (2-126)||(13516-13639)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (163-203)||(12694-12734)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (7-176)||(7795-7966)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (168-203)||(3392-3427)
scaffold0090 (82-150)||(3318-3387)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (111-168)||(1364-1422)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (27-160)||(11067-11201)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (90-160)||(22715-22786)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (28-176)||(7358-7508)
scaffold0253 (28-176)||(16783-16933)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (56-172)||(5758-5875)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (25-176)||(22560-22713)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (2-70)||(51312-51380)


Alignment Details
Target: scaffold1867 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 277 - 75
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  277 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 178  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgctgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 78  T
Q  201 tgt 203  Q
    |||    
T  77 tgt 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25091 - 24890
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25091 atgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattc 24992  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24991 atggcttgggtt-gcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 24893  T
Q  201 tgt 203  Q
    |||    
T  24892 tgt 24890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25344 - 25212
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25344 atgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattc 25245  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtt 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25244 atggcttggg-ttgcatgattcatgattgttgtt 25212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3230
Alignment:
Q  26 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 3308  T
Q  126 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3307 attgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 228 - 430
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  228 atgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 327  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  328 atagcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagcttttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 427  T
Q  201 tgt 203  Q
    |||    
T  428 tgt 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 203
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6679
Alignment:
Q  127 ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603 ttgttgttgagaattgagttgttcttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 6679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 6522 - 6612
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttga 91  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6522 atgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttattgatatgtcttgttgttga 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 7284174 - 7284376
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7284174 atgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataattc 7284273  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  7284274 atggcttgagtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgttaaatgggttgataatggagaagtttgattttgacga 7284373  T
Q  201 tgt 203  Q
    |||    
T  7284374 tgt 7284376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11287550 - 11287390
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11287550 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 11287451  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11287450 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11287390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 15822545 - 15822701
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15822545 atgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattc 15822644  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15822645 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 15822701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046893
Alignment:
Q  4 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 39046839  T
Q  104 gcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39046840 gcttgggtttgcataattcttgatctgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 39046893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 16570119 - 16570287
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| || ||||||||||    
T  16570119 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataatt 16570218  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16570219 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16570287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16595543 - 16595375
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| || ||||||||||    
T  16595543 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataatt 16595444  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16595443 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16595375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13274921 - 13274753
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||    
T  13274921 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgatt 13274822  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  13274821 catggctttggtatgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 13274753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 49047787 - 49047955
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||| ||||||||    
T  49047787 atgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataatt 49047886  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  49047887 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaacgagatgttgttggtagtttggtaaaa 49047955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12759120 - 12758965
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||    
T  12759120 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataattc 12759021  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  12759020 atggcttgggtttgcaggatttatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 12758965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 26070378 - 26070529
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||| ||||    
T  26070378 atgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattc 26070477  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26070478 atggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26070529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 26094165 - 26094316
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||| ||||    
T  26094165 atgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattc 26094264  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26094265 atggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26094316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 156
Target Start/End: Original strand, 45452304 - 45452435
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45452304 tgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcat 45452403  T
Q  125 gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45452404 gatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 45452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 12248234 - 12248395
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||| |||||||||     
T  12248234 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataatg 12248333  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12248334 catgacttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 12248395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 126548 - 126366
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  |||||  |||||||||| || |    
T  126548 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatgatgatac 126449  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg-taaaatgggttgataatga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  126448 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggagaaaatgggttgattatga 126366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 111391 - 111550
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||    
T  111391 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 111490  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  111491 atggcttgggtatgcatgattcaaatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 111550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3049716 - 3049565
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  3049716 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattc 3049617  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  3049616 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 3049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 12369954 - 12370127
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||||||  || || ||||    
T  12369954 atgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtgcataattattc 12370053  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || | |||||| || |||||||||    
T  12370054 atggcttaggtatgcatgattcatgatttgttattgagaaataagttgtagttgttggtttggtgaaaatgggt 12370127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3895158 - 3894998
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  3895158 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 3895059  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  3895058 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 3894998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 17224058 - 17224220
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  17224058 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggct 17224157  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17224158 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 17224220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47289914 - 47289758
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  || || ||||||||| ||||||||||||    
T  47289914 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcatgttgatgatgataattc 47289815  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  47289814 atggcttgtg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 47289758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35094949 - 35094794
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||||||||||| || || |||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||    
T  35094949 atgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaa-tgttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgataaatc 35094851  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35094850 atggcttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 35094794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2029054 - 2028893
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  2029054 atgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 2028955  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  2028954 atgacttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 2028893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 2190308 - 2190460
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  2190308 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 2190407  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2190408 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2190460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 32494168 - 32494341
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| |  ||||| |  |||||||||||||    
T  32494168 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatgattgatgataattc 32494267  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  32494268 atggcttgtgtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 32494341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 42056411 - 42056563
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || || || |  ||| ||||||    
T  42056411 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatattatgaatgctaattc 42056510  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  42056511 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 42056563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 143772 - 143622
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||      || ||||||||||| ||||||||||    
T  143772 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgt------taagtcatgttgttaatgataattc 143679  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  143678 atggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13377648 - 13377485
Alignment:
Q  15 aattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttg 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  13377648 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtt 13377549  T
Q  115 catgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  13377548 cataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 13377485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44865363 - 44865204
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataa 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||    
T  44865363 atgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgttgttaagtcatgtagtttatgataa 44865264  T
Q  98 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  44865263 ttcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 44865204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 203
Target Start/End: Original strand, 14272049 - 14272203
Alignment:
Q  50 tcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 148  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||  | || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  14272049 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgattagatgatgagaaatgagttgt 14272148  T
Q  149 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  14272149 tggtggtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagttttattttaatgatgt 14272203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 16915066 - 16915217
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  16915066 tgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 16915165  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16915166 gatttgatgaagagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 16915217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 48356753 - 48356602
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  48356753 tgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 48356654  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48356653 gatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 48356602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 34241326 - 34241477
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||| |||||| || |  |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | ||||    
T  34241326 tgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgataagtgacattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcat 34241425  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  34241426 gatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaagggttga 34241477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31501300 - 31501179
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  || |||||| |||| ||||||||||    
T  31501300 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatattgttgttgatgattcatggct 31501201  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    ||||| | ||||| ||||||||    
T  31501200 tgggtgttcatgagtcatgatt 31501179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4484834 - 4484683
Alignment:
Q  27 ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  4484834 ttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcatgaatcatga 4484735  T
Q  127 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
     ||| || |||||||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  4484734 tttgatgatgagaaataagttgttgtgcttggttttgtaaaaatgggttgat 4484683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9611416 - 9611266
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||| ||| ||| | ||| | ||||    
T  9611416 tgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgactt-ggtgttcataaatcat 9611318  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || ||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9611317 gatttgatgatgaaagttgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 9611266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9838988 - 9838838
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||| ||| ||| | ||| | ||||    
T  9838988 tgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgactt-ggtgttcataaatcat 9838890  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || ||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9838889 gatttgatgatgaaagttgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 9838838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 13863043 - 13863154
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| || || || |||||| | || ||     
T  13863043 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttgttgctaagtgatattgttgttaatgatg 13863142  T
Q  100 catggcttgggt 111  Q
    ||||||||||||    
T  13863143 catggcttgggt 13863154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4446340 - 4446168
Alignment:
Q  6 caattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatga-taattcatgg 104  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||| || || ||| | ||||||||    
T  4446340 caattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtt-aattgatgttgttgttgataagagatgctgatgttgaatgattcatgg 4446242  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||||||| | ||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  4446241 cttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgtgaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 4446168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 168
Target Start/End: Original strand, 1937200 - 1937290
Alignment:
Q  79 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||    
T  1937200 gtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcataattttttgttgagaaatggattattgttggtggttttgtgaaat 1937290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 20583674 - 20583819
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||    
T  20583674 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgattcatggct 20583773  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  20583774 tgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgt 20583819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13321148 - 13321033
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttg-ttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| || ||| ||  | ||||||||| |||| | ||    
T  13321148 tgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatc 13321049  T
Q  101 atggcttgggtttgca 116  Q
    ||| ||||||||||||    
T  13321048 atgacttgggtttgca 13321033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16919686 - 16919598
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgat 95  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || || | ||||||||||||| ||| || || || |||||| ||||    
T  16919686 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcgtgtttaattgatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgat 16919598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 25124238 - 25124153
Alignment:
Q  24 ttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  25124238 ttgttgttgttga-ttgtgatgaatt-catgcttaattgatgttgttgttgatatgagatgttgttgttgatgattcatggcatgggt 25124153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14935400 - 14935319
Alignment:
Q  97 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14935400 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 14935319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15362993 - 15362912
Alignment:
Q  97 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15362993 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 15362912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 46474128 - 46474027
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  46474128 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 46474029  T
Q  107 tg 108  Q
    ||    
T  46474028 tg 46474027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Original strand, 9723927 - 9724031
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| || |  || || ||| |||| |||||| |||    
T  9723927 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattattgttgatgattcatagct 9724026  T
Q  107 tgggt 111  Q
    |||||    
T  9724027 tgggt 9724031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Original strand, 17947712 - 17947816
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  17947712 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 17947811  T
Q  107 tgggt 111  Q
    |||||    
T  17947812 tgggt 17947816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21645 - 21442
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21645 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 21546  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21545 atggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttaagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatg 21446  T
Q  200 atgt 203  Q
    ||||    
T  21445 atgt 21442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31344 - 31141
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31344 atgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 31245  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31244 atggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaaaaagtttgattttgatg 31145  T
Q  200 atgt 203  Q
    ||||    
T  31144 atgt 31141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33342014 - 33341812
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||    
T  33342014 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 33341915  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33341914 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatta 33341815  T
Q  201 tgt 203  Q
    |||    
T  33341814 tgt 33341812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7854111 - 7853913
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  7854111 tcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatgg 7854012  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854011 cttgggtttgcatgaatcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7853913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 54685423 - 54685625
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||    
T  54685423 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 54685522  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685523 atggcttggatttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgctgttgctggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 54685622  T
Q  201 tgt 203  Q
    |||    
T  54685623 tgt 54685625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19946776 - 19946629
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggt 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19946776 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggt 19946677  T
Q  156 ggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19946676 ggttttgtaaaatgggttgataatatagaagtttgattttgatgatgt 19946629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14298554 - 14298399
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14298554 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattc 14298455  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14298454 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14298399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14304181 - 14304026
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14304181 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattc 14304082  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14304081 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14304026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35123829 - 35123674
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35123829 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 35123730  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35123729 atggtttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35123674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 53898569 - 53898719
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53898569 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatgtcatgttgttggtgataattc 53898668  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  53898669 atggcttgggtttgcaagattcatgatttatgttgagaaatgagatgttgt 53898719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 19570802 - 19570957
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19570802 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 19570901  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19570902 atggcttgagtttgcataattcttggttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19570957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 50112165 - 50112309
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  50112165 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 50112264  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  50112265 atggcttgagtttgcatgattcatggtttgtttttgagaaatgag 50112309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14295572 - 14295415
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||||    
T  14295572 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataatt 14295473  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14295472 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14295415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22144386 - 22144542
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |    
T  22144386 atgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagccatgttgttgatgataatac 22144485  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22144486 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 22144542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13817645 - 13817492
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |   ||||||||||||||||||||||    
T  13817645 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttta---gtcatgttgttgatgataattc 13817549  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13817548 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 13817492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 12349653 - 12349809
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  12349653 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgataaatc 12349752  T
Q  101 atggcttg-----ggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||     |||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  12349753 atggcttggccatggtttgcatgattcataatttgatgatgagaaataagttgttgt 12349809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 16996173 - 16996321
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  16996173 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 16996272  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgt 148  Q
    |||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  16996273 atggcttgagtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagttgt 16996321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17139642 - 17139474
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||    
T  17139642 atgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatt 17139543  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  17139542 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgcgaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 17139474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329235
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 11329180  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11329181 tgggtatgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagttt 11329235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 14528125 - 14528286
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||    
T  14528125 atgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggtaatt 14528224  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14528225 catggcttgggtatgaatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 14528286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 17523003 - 17523176
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtca-tgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||||||    
T  17523003 atgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataatt 17523102  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||    
T  17523103 catggcttgggtttgcatgatttatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggt 17523176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 6154445 - 6154600
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6154445 atgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgttgatgataattc 6154544  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6154545 atggcttggg-ttgcatgattcataattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6154600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 12349844 - 12349970
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12349844 atgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 12349943  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12349944 atggcttggg-ttgcatgattcatgatt 12349970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 47784873 - 47785064
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||   |||| ||| ||||||||||| ||| || || ||||||||| | || |||||||||||||||     
T  47784873 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtagtaagaaacatgttcagttgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtg 47784972  T
Q  113 tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47784973 ttcataattcatgatttgttggtgagaaatgagttgttgttggtgattctgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 47785064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30153075 - 30152893
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| ||      
T  30153075 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatat 30152976  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  30152975 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 30152893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Original strand, 16182065 - 16182209
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16182065 aattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgataattcatggct 16182164  T
Q  107 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 150  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  16182165 tgggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttg 16182209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 54424145 - 54423986
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||||| |||||| ||||    
T  54424145 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattattc 54424046  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  54424045 atggcttgggtatgcatgattcatgatttgttatgagaaataagttgttgttgttggttt 54423986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3992683 - 3992522
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  3992683 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 3992584  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  3992583 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 3992522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14301199 - 14301042
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||| |||    
T  14301199 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattatt 14301100  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14301099 catgtctttggtttgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14301042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 17956109 - 17956274
Alignment:
Q  4 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| || ||||    
T  17956109 ctcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatg 17956208  T
Q  104 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17956209 acttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 17956274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 317622 - 317778
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  317622 atgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 317721  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||| ||||| || |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  317722 atggcttgagtttgtataattcttggtttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 317778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 6146860 - 6147015
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| || |||||||||||||| |||||||    
T  6146860 atgctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgataataattc 6146959  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6146960 atggcttgggttt-catgattcatgattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6147015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 14059326 - 14059478
Alignment:
Q  1 atgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14059326 atgctcaatttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtgatgttgttgatgataatt 14059425  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14059426 catggcttgggtttgcataattcatgatctgttgatgagaaatgagatgttgt 14059478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8631912 - 8631801
Alignment:
Q  12 gtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8631912 gtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggt 8631813  T
Q  112 ttgcatgattca 123  Q
    ||||||||||||    
T  8631812 ttgcatgattca 8631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17100786 - 17100636
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  17100786 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattc 17100687  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17100686 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17100636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17101471 - 17101321
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  17101471 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattc 17101372  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17101371 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17101321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17938707 - 17938582
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17938707 atgcttaattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcattc 17938608  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17938607 atggcttgggtttacatgattcatga 17938582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 55440962 - 55441123
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||    
T  55440962 atgctcaactggttgaattatactatgttgtggttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataatt 55441061  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  55441062 catgacttgggtatgcataattcatgattttttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 55441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 38168047 - 38167896
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  38168047 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattc 38167948  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  38167947 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 38167896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2844324 - 2844172
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  2844324 atgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 2844225  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2844224 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2844172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 45581764 - 45581591
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||    
T  45581764 atgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 45581665  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  45581664 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 45581591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 53771174 - 53771022
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |  ||| ||||||    
T  53771174 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattc 53771075  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  53771074 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 53771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23492506 - 23492346
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  23492506 atgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 23492407  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  23492406 atggcttgggtatgcatgattcatagtttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 23492346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 12488846 - 12489017
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  12488846 aattgatgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 12488945  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||  || || ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  12488946 tgggtgttcataattcatgatttaatgatgggaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 12489017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16261586 - 16261463
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  16261586 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 16261487  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16261486 atggcttgggtatgcatgattcat 16261463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560510
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||| |||| |||||| ||||||||||     
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggta 12560461  T
Q  113 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12560462 tgcatgattcatgatttgatgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 12560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 54038246 - 54038406
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||    
T  54038246 atgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgataattc 54038345  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||| | ||||||    
T  54038346 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttaagaaataaattgttgttgttggttt 54038406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16880257 - 16880131
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaa-ttatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| || || ||||||| ||||||||||    
T  16880257 atgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataatt 16880158  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16880157 catggcttgggtgtgcataattcatga 16880131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 19260953 - 19261104
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||||| |  ||| ||||||    
T  19260953 atgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgttatgaatgttaattc 19261052  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  19261053 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttatgaaataagttgttgt 19261104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 38811146 - 38811297
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||| ||||||||| || | || |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38811146 tgttgatgttgaattatgctgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcat 38811245  T
Q  125 g-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    |  ||| || | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38811246 gttttgatgatcagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38811297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Original strand, 9303343 - 9303425
Alignment:
Q  122 catgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9303343 catgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaacgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15876176 - 15876034
Alignment:
Q  26 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  15876176 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttaggtattcataattcatg 15876077  T
Q  126 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  15876076 atttgtggatgagaaatgagttggtgttggtagtttggtaaaa 15876034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12953073 - 12952915
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  12953073 tgttgttgttgaattgtgatgagatttatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 12952974  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 181  Q
    || ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12952973 gatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgattatga 12952915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17191668 - 17191511
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| | ||| || || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  17191668 aattgatgaattatgttatgttgttgctgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgctgttgctaagtaatgttgttgttgatgattcatggct 17191569  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 166  Q
    || || | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17191568 tgagtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtt---ggtggttttgtaaa 17191511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17204821 - 17204667
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||| |  ||||| | ||| ||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||||||||||||||     
T  17204821 tgaattatgctatattgttgttgaattgtgataggaatcatgtttaatggatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtg 17204722  T
Q  113 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 166  Q
    |  || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17204721 tttataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttagtggttttgtaaa 17204667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 3576558 - 3576703
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||| ||| || || || |||| | |||| ||||||||||    
T  3576558 aattgatggattatgctatgttgttgttgaattgtgataagagtcatgtttgattgatgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggct 3576657  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3576658 tgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgt 3576703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 11061119 - 11061247
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||  || || || || |||||| |||| |||    
T  11061119 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttggtgctaagtgatattgttgttgatgatt 11061218  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  11061219 catggcttgggtgttcataattcatgatt 11061247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1990912 - 1990759
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt-tgcatgattca 123  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||| | || |||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||| || | ||| | |||    
T  1990912 tgttgttgttgaactgtgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaatca 1990813  T
Q  124 tgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 176  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1990812 tgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgat 1990759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3578222 - 3578057
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||| |||| |||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| | || |    
T  3578222 atgctcaactggttgaattacgctatgttgtggttgaattgcgataagtttcatgatcaattgat-ttgttgttgctaagtcatgttgttgattaaaaat 3578124  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
      |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||| |||| ||| ||||||    
T  3578123 --tggcttaggtatgcatgattcatgatttgttgtggaggaatgagaggttgttggtgttttggtaaaa 3578057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 9590867 - 9591035
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||    
T  9590867 atgctcaatttgttgaattatgctatgttgttgttgagttctgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgatt 9590966  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||| ||||||| | |||  ||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9590967 catgacttgggtgttcatagttcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaa 9591035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 34439457 - 34439513
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatc 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34439457 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 34560004 - 34559857
Alignment:
Q  29 gttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-t 127  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||| | |    
T  34560004 gttgttgaattatgatgagattcatgttcgattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatt 34559905  T
Q  128 tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34559904 tgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 34559857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39656653 - 39656492
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||| ||| || || || |||||| |||| |||||||| |    
T  39656653 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagattcatgttcaattgatgtggttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtt 39656554  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    | ||  | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||    
T  39656553 taggggttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgaaaaa 39656492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 17960451 - 17960602
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||| ||||||||| || | || |||||  |||||||||||  ||  || || || ||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  17960451 tgttgatgttgaattatgctgagattcatattcaattgatgtgtttgctgctaagtgatgttgttattaataattcatgacttgggtgtgcataattcat 17960550  T
Q  125 gatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  17960551 gatttgttgatgggaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 17960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28558253 - 28558188
Alignment:
Q  87 gttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  28558253 gttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgt 28558188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14080643 - 14080491
Alignment:
Q  1 atgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| |||  | || ||||||||| |||| |||    
T  14080643 atgctcaattgggtgaattgtgctatattgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgcgaagtaatgttgttgttgatgatt 14080544  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
     | ||||||||| | ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  14080543 tacggcttgggtattcataattcatgatttggtgatgagaaatgagttgttgt 14080491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Original strand, 16934151 - 16934263
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggt 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |  | |||||||||| | || ||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||  |||||||| || |||||| |||    
T  16934151 tcaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtattcataaatcatgattgtttgtgagaaataagatgttgttggt 16934250  T
Q  156 ggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||| ||||    
T  16934251 ggttttgtgaaat 16934263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 6228763 - 6228916
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||| ||||| ||||  |  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  6228763 tgttgttgtcgaattatgatgtggatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagaaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 6228862  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    || ||| || |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  6228863 gatttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 6228916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 14814885 - 14815030
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| ||||  ||||||||     
T  14814885 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgtttcatggcc 14814984  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    || || | ||||| |||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  14814985 tgcgtgttcatgaatcataatttgatgatgagaaataagttgttgt 14815030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 151
Target Start/End: Original strand, 51961276 - 51961402
Alignment:
Q  24 ttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattca 123  Q
    ||||||||||||| ||||||| | || |||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||  | |||    
T  51961276 ttgttgttgttga-ttgtgatgaatt-catgcttaattgatgttgttgttgatatgagatgttgttgttgatgattcatggtttgggtgttcacaaatca 51961373  T
Q  124 tga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||| ||| || ||||| ||||||||||||    
T  51961374 tgatttgatgatgagatatgagttgttgt 51961402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 33369033 - 33369199
Alignment:
Q  12 gtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 111  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | |||||||||| || ||| || |  || |||||| |||  ||||||| |||||||    
T  33369033 gtgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgtttttgttgttaaggaatattgttgttgacgattcatgacttgggt 33369132  T
Q  112 ttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
     | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  33369133 gttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 33369199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8901293 - 8901257
Alignment:
Q  164 aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 200  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8901293 aaaatgggttgaaaatggagaagtttgattttgatga 8901257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18583450 - 18583264
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||    
T  18583450 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgtt----------------gttgatgataattc 18583367  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583366 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 18583267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31628401 - 31628245
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31628401 atgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 31628302  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  31628301 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 31628245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Original strand, 18823565 - 18823712
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggt 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  18823565 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggt 18823664  T
Q  156 ggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18823665 ggttttgtaaaatggcttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 18823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Original strand, 18839420 - 18839567
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggt 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  18839420 tcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggt 18839519  T
Q  156 ggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18839520 ggttttgtaaaatgagttgaaaaagaagaagtttgattttgatgatgt 18839567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18432776 - 18432626
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18432776 atgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataattc 18432677  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 150  Q
    ||||||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||| |||||    
T  18432676 atggcttgggtttgcatgattaatggtttattgttgaaaaatgagatgttg 18432626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16086150 - 16086001
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16086150 atgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattc 16086051  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttg 150  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  16086050 atgacttgggtttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttg 16086001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32898923 - 32898779
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||     
T  32898923 atgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatta 32898824  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32898823 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 32898779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 35015279 - 35015447
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| || |    
T  35015279 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatac 35015378  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35015379 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 35015447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22441067 - 22440911
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22441067 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 22440968  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  22440967 atggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 22440911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26089868 - 26089718
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  26089868 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 26089769  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  26089768 atggtttgggtatgcatgattcataattgttgttgtgaaataagttgttgt 26089718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16106649 - 16106499
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16106649 atgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattc 16106550  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||| |     ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16106549 atgac-----tttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttgttggtg 16106499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398890
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 18398966  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 181  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18398965 tgggtgtgcataattcatgaattgtgataagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgattatga 18398890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 18381803 - 18381965
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  18381803 aattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 18381902  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18381903 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 18381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744483
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgg 25744430  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25744431 cttgggtttgcataattcttggtttgttgtagagaaatgagatgttgttggtg 25744483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 13014823 - 13014979
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||||||||||    
T  13014823 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgataattc 13014922  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  13014923 gtggcttggg-ttgcatgattcttgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 13014979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 18002618 - 18002777
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || | ||| | |||| ||||||    
T  18002618 atgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaattc 18002717  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18002718 atggcttgggtatgcatgattcatacttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18002777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23995056 - 23994904
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |  ||| ||||||    
T  23995056 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattc 23994957  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23994956 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 23994904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18777275 - 18777119
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||||||    
T  18777275 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 18777176  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18777175 cttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18777119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 19983413 - 19983581
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| | | | | ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| || |    
T  19983413 atgctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatac 19983512  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19983513 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 19983581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 151
Target Start/End: Original strand, 25367375 - 25367502
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25367375 tgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattcat 25367474  T
Q  125 g-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25367475 gaattgttgatgagaaatgagatgttgt 25367502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 15742342 - 15742505
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat---gtcatgttgttgatgataa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | |   || ||||| |  ||| |||    
T  15742342 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 15742441  T
Q  98 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  15742442 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgctggttt 15742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 22361885 - 22362054
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||    
T  22361885 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 22361984  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  22361985 tgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaattgagttgttgttgttagttttgtaaaatgggttga 22362054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4991150 - 4991002
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcgg 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| || | |  |||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4991150 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgatcatgaattttggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 4991051  T
Q  155 tggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4991050 tggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 4991002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18570412 - 18570271
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  18570412 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 18570313  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 141  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  18570312 atggcctgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaat 18570271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Original strand, 17083373 - 17083496
Alignment:
Q  82 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataat 179  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || | |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||    
T  17083373 atgttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgattagaaatgagttgttgttgttgtttttgtgaaaatgggttgataat 17083472  T
Q  180 gaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17083473 gaagaagtttgattttgatgatgt 17083496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 28195219 - 28195367
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataag-tttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 111  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28195219 tgaattatgccatgatgttgttgaattgtgatgagattttatgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgagt 28195318  T
Q  112 ttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  28195319 ttgcataatt-atgatttattgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 28195367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25919722 - 25919571
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  25919722 tgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatatgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcat 25919623  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || |||||| ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  25919622 gatttgttgatgaaaaatgagttattgttggtgactttgtaaaatgagttga 25919571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 33324827 - 33324675
Alignment:
Q  1 atgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||| |||    
T  33324827 atgctcaattggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgatt 33324728  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  33324727 catggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 33324675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 35136125 - 35136277
Alignment:
Q  1 atgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||| |||    
T  35136125 atgctcaattggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgatt 35136224  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  35136225 catggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 35136277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21623295 - 21623133
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||| ||| || || |||||| || | || | ||||||||    
T  21623295 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttgctaagtgatgttgatgttaatgagtcatggct 21623196  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21623195 tgggtattcataattcatgatttgtggatgaaaaatgagttgttgttggtagtttggtaaaat 21623133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25651346 - 25651197
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  25651346 tgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 25651247  T
Q  125 gatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    |||| | || |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  25651246 gattggatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 25651197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 164
Target Start/End: Original strand, 33538507 - 33538647
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | ||||    
T  33538507 tgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttattgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcat 33538606  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta 164  Q
    || ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33538607 gatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgta 33538647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 16887905 - 16888057
Alignment:
Q  1 atgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| ||||| |   ||||| ||||| ||| | || |||    
T  16887905 atgctcaattgggtgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgattttgttgtcactatgtgatgttattgttaatgatt 16888004  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  16888005 catggcttgggtatacataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 16888057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 35009569 - 35009692
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  35009569 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 35009668  T
Q  102 tggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||    
T  35009669 ttgcttgggtatgcat-attcatga 35009692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34966994 - 34966823
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  34966994 aattgttgaattatgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 34966895  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||  || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  34966894 tgggtgttcataaatcatgagttcgtgatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggttgat 34966823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 15079821 - 15079932
Alignment:
Q  1 atgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||| ||||| ||| || || ||||||||| |||| |||    
T  15079821 atgctcaattgggtgaattatgctatattgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatattgttattgctaagtgatgttgttgttgatgatt 15079920  T
Q  100 catggcttgggt 111  Q
    ||||| ||||||    
T  15079921 catggtttgggt 15079932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19854264 - 19854137
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||| | ||||    
T  19854264 tgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcat 19854165  T
Q  125 g-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||    
T  19854164 gaattgatgatgagaaatgagttgttgt 19854137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15740269 - 15740211
Alignment:
Q  94 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15740269 ataattcatggtttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgt 15740211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29605559 - 29605406
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| ||||  |  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||||| |||||| ||||| | ||||    
T  29605559 tgttgttgttgaattatgatgtgaatcatgcttaattgatgttgttgttgctaagaaatattgttgttgatgattcatggtttgggtgtgcataaatcat 29605460  T
Q  125 g-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    | |||| |  |||||||| ||||||| | | ||||||||| |||||||||||||    
T  29605459 gaattgataatgagaaataagttgttcttgttggttttgtaaaaatgggttgat 29605406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Original strand, 18629746 - 18629892
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat---gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgatt 121  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| | |   || || |||||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |    
T  18629746 tgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaat 18629845  T
Q  122 catgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  18629846 catgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtaaaa 18629892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 29666004 - 29665938
Alignment:
Q  4 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 70  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||||||||| || |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  29666004 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgtt 29665938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19629406 - 19629314
Alignment:
Q  58 aattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||||| ||| |  | |||||||||| | || ||| ||||||||||| | |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19629406 aattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggcttgggtgttcatatatcatgattgttggtgagaaatgagttgttgt 19629314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 27740971 - 27740907
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 66  Q
    ||||||||||||||||| |||   || |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  27740971 tgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgt 27740907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34395390 - 34395222
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34395390 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattc 34395291  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  34395290 atggcttgagtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 34395222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16732302 - 16732146
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16732302 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 16732203  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16732202 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 16732146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 23270051 - 23270204
Alignment:
Q  4 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23270051 ctcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 23270150  T
Q  104 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  23270151 gcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 23270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44056048 - 44055892
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | ||||||||||||||||||||    
T  44056048 atgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataattc 44055949  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44055948 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 44055892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 55376714 - 55376893
Alignment:
Q  4 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  55376714 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgataattcatg 55376813  T
Q  104 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  55376814 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgatgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 55376893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 128
Target Start/End: Original strand, 45458973 - 45459096
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45458973 tcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatccatgg 45459072  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45459073 cttgggtttgcatgattcatgatt 45459096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 53704847 - 53705003
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  53704847 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 53704946  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53704947 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53705003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 21959577 - 21959718
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  21959577 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 21959676  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaat 141  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21959677 atggcttgggcttgcatgattcatagtttgtggttgagaaat 21959718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 820030 - 820177
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  820030 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 820126  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttg 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||    
T  820127 atggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttg 820177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 13809623 - 13809775
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  13809623 atgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataatt 13809722  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13809723 catggcttggatatgcatgattcatgattggttgttgagaaatgagatgttgt 13809775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14951895 - 14951713
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| ||||||||||| ||      
T  14951895 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatttagtcatattgttgatgatgatat 14951796  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  14951795 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 14951713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30458036 - 30457880
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  30458036 atgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattc 30457937  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  30457936 atggcttggg-ttgcataattcattattttgttatagagaaatgagatgttgttggtg 30457880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 53907813 - 53907966
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  53907813 atgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaat---tgttgttgttgattagtcatgttgttgatgataattc 53907909  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53907910 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53907966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 12837314 - 12837464
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  12837314 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattc 12837413  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  12837414 atggcttgggtatgcatgattcatgatttgttg-tgagaaataagttgttgt 12837464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 30232610 - 30232761
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  30232610 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattc 30232709  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  30232710 atggcttgggtatgcattattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 30232761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Original strand, 25119333 - 25119498
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| |||||||| || || |||||    
T  25119333 tcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgataatgatacatgg 25119432  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25119433 cttgggtttgcatgattcataattttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25119498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Original strand, 18494466 - 18494602
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18494466 tgttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaactcatggcttgggtatgcatgattcat 18494565  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18494566 gacttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 18494602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44346960 - 44346816
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |  || |||| ||||||||||||||    
T  44346960 atgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataattc 44346861  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 144  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  44346860 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 44346816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 5682649 - 5682817
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt-tttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | | | ||||||| |||  ||| |||| ||||||||||| ||     
T  5682649 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttttat-tcatattgttgatgatgata 5682747  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5682748 tatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 5682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 15272434 - 15272586
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |  ||| ||||||    
T  15272434 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattc 15272533  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  15272534 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 15272586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16522896 - 16522748
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcgg 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16522896 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 16522797  T
Q  155 tggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16522796 tggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16522748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27961078 - 27960938
Alignment:
Q  27 ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27961078 ttgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtatgcatgatt-atga 27960980  T
Q  127 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
     || ||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||    
T  27960979 tttattgttgagaaatgagatattgttggtagtttggtaaaa 27960938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 8872585 - 8872699
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat---gtcatgttgttgatgataa 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||    
T  8872585 atgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataa 8872684  T
Q  98 ttcatggcttgggtt 112  Q
     ||||||||||||||    
T  8872685 ctcatggcttgggtt 8872699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15044955 - 15044784
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15044955 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 15044856  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15044855 tgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15044784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9295772 - 9295624
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcgg 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9295772 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 9295673  T
Q  155 tggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9295672 tggttatgtaaaatgagttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9295624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Original strand, 15109477 - 15109640
Alignment:
Q  15 aattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttg 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  15109477 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtt 15109576  T
Q  115 catgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15109577 cataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15109640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 7185982 - 7186159
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| || |  || || ||| |||| ||||||||||||||| |  || | ||||    
T  7185982 tgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatcat 7186081  T
Q  125 gatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7186082 gatttgatgatgagatatgagttgttgt---tgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7186159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 41166066 - 41166228
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||| | ||||||||    
T  41166066 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggct 41166165  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||| | ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41166166 tgggtattcataacttatgatttgttgatgagaaatgagttgttgtgggtggttttgtgaaat 41166228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265749
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || || ||| || |||| ||||||||||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggct 52265727  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    ||||| | ||| ||||||||||    
T  52265728 tgggtgttcataattcatgatt 52265749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 19821914 - 19822065
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||| |||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  19821914 tgttattgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcat 19822013  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || |||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||    
T  19822014 gatttgttgatgagaaatgagttgtttttggtgactttgtaaaatgagttga 19822065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 37957163 - 37957314
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||| ||||||||| || | || |||||| ||||||||||| |||  || || || ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  37957163 tgttgatgttgaattatgctgagattcatgttcaattgatgtggttgctgctaagtgatgttgttattgataattcacggcttgggtgtgcataattcat 37957262  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37957263 gatttgttgatgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 37957314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 7964849 - 7965000
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||| ||||| ||| || || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| | ||||    
T  7964849 tgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgattttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcat 7964948  T
Q  125 gatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    |||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7964949 gatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 7965000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18276541 - 18276392
Alignment:
Q  27 ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||  | || || |||||| |||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  18276541 ttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttgggtgttcataaatcatga 18276442  T
Q  127 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
     |||  | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18276441 tttgacgatgagtattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 18276392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14901333 - 14901197
Alignment:
Q  33 ttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgtt 131  Q
    |||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||| ||| || || ||| ||||| |||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  14901333 ttgaattgtggtaagaatcatattcaattgatgttgttgttgctaagtgatgctgttgttgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgat 14901234  T
Q  132 gttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14901233 gatgagaaatgggttgttgttggtggttttgtaaaat 14901197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 176
Target Start/End: Original strand, 41256508 - 41256660
Alignment:
Q  26 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||    
T  41256508 gttgttgttgaattgtgatgagaaccatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatg 41256607  T
Q  126 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    | ||| || |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  41256608 atttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttataaaaatgggttgat 41256660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Original strand, 10104380 - 10104454
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 76  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10104380 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttgat 10104454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 167
Target Start/End: Original strand, 40905053 - 40905214
Alignment:
Q  6 caattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggc 105  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| | || ||||    
T  40905053 caattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatg-ttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgactcgtggc 40905151  T
Q  106 ttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  40905152 ttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtaaaa 40905214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 111
Target Start/End: Original strand, 15675219 - 15675328
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| || ||| ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  15675219 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 15675318  T
Q  102 tggcttgggt 111  Q
    | ||||||||    
T  15675319 ttgcttgggt 15675328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Original strand, 47535243 - 47535328
Alignment:
Q  84 gttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47535243 gttgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttaatgagaaatgagttgttgttgatggttttgtaaaat 47535328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 176
Target Start/End: Original strand, 15013421 - 15013573
Alignment:
Q  26 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||| ||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  15013421 gttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 15013520  T
Q  126 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    | ||| || |||||||||| ||||||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  15013521 atttgatgatgagaaatgacttgttgttgtttgttttataaaaatgggttgat 15013573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 31115763 - 31115653
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| || ||| ||  | ||||||||| |||| | ||    
T  31115763 atgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatc 31115664  T
Q  101 atggcttgggt 111  Q
    || ||||||||    
T  31115663 attgcttgggt 31115653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38764836 - 38764715
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||    
T  38764836 aattgttgaattatgcgatgttgttgttcaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggct 38764737  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    ||||| | ||| | ||||||||    
T  38764736 tgggtgttcataaatcatgatt 38764715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 47535185 - 47535254
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 76  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  47535185 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagaatcatgttcaattgacgttgttgttgat 47535254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Original strand, 18238277 - 18238381
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  18238277 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 18238376  T
Q  107 tgggt 111  Q
    |||||    
T  18238377 tgggt 18238381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 40885683 - 40885758
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgat 76  Q
    |||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40885683 atgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttgat 40885758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 54398492 - 54398406
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 111  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||||||||||||    
T  54398492 tgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggt 54398406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Original strand, 13590194 - 13590298
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| || |  || || ||| |||| |||||| |||    
T  13590194 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattattgttgatgattcatagct 13590293  T
Q  107 tgggt 111  Q
    |||||    
T  13590294 tgggt 13590298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10070 - 9903
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10070 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattattc 9971  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  9970 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 9903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 20573306 - 20573461
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573306 atgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 20573405  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573406 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41246791 - 41246635
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41246791 atgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 41246692  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41246691 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 41246635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 41506931 - 41507091
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  41506931 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattc 41507030  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  41507031 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 41507091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20481738 - 20481565
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  20481738 atgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattc 20481639  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20481638 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20481565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 19993168 - 19993324
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19993168 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 19993267  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19993268 atggctagggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19993324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21681136 - 21680984
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaa-ttatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21681136 atgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataatt 21681037  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  21681036 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtggagaaataagatgttgt 21680984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 39446879 - 39447046
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||    
T  39446879 atgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataatt 39446978  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  39446979 catggcttgggtatgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 39447046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 22234917 - 22235068
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  22234917 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 22235016  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  22235017 atggattgggtttgcataattcttggtttgttgttgaggattgagatgttgt 22235068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38533770 - 38533607
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38533770 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtg 38533671  T
Q  113 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||    
T  38533670 tgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggagactttgtaaaatgggttga 38533607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Original strand, 20647949 - 20648087
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20647949 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatccatggct 20648048  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20648049 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20648087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 20654019 - 20654163
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  20654019 atgcttaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaattc 20654118  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 144  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20654119 attgcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37611801 - 37611675
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  37611801 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattc 37611702  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37611701 atggcttggg-ttgcataattcatgatt 37611675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 274572 - 274416
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||||||    
T  274572 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 274473  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  274472 cttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 274416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 641277 - 641433
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||||||    
T  641277 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 641376  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  641377 cttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 641433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 827083 - 827239
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||||||    
T  827083 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 827182  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  827183 cttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 827239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 24716984 - 24717152
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||  || |  ||||| ||||||||||| || |    
T  24716984 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgatac 24717083  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24717084 atggcttgggtttgcatgattcataatttgttgttgataaatggattgttgttggtggttttgtaaaat 24717152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Original strand, 20567329 - 20567427
Alignment:
Q  58 aattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567329 aattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 156
Target Start/End: Original strand, 20573522 - 20573620
Alignment:
Q  58 aattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573522 aattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 16039003 - 16039176
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| |||||     
T  16039003 atgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattt 16039102  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  16039103 atggcttggatatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 16039176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Original strand, 22735958 - 22736127
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| || ||||||||||||    
T  22735958 aattgatgaattatactatgttgttgttggattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttcttgctaactgatgttgttgttgttaattcatggct 22736057  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22736058 tgggtgtgcataattcatgaattgttgatgaaaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 22736127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837163
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 23837226  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23837225 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttggtggtggttttgtgaaat 23837163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 156
Target Start/End: Original strand, 20567184 - 20567268
Alignment:
Q  72 ttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567184 ttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5854723 - 5854572
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  5854723 tgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 5854624  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5854623 gatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 5854572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 39115408 - 39115267
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||    
T  39115408 atgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 39115309  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 141  Q
    ||| |||| || |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  39115308 atgacttgtgtatgcatgattcataatttattgttgagaaat 39115267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 21198272 - 21198434
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||| || | || ||||||||||    
T  21198272 aattgttgaattatgttatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgctgttaatgattcatggct 21198371  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21198372 tgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtggtttggtaaaat 21198434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26011603 - 26011452
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  26011603 tgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 26011504  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26011503 gatttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 26011452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15933407 - 15933256
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| |   | | ||||    
T  15933407 tgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttgtaaatcat 15933308  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || |||  | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15933307 gatttgaagatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 15933256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122513
Alignment:
Q  52 atgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgtt 149  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||    
T  25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgtt 25122520  T
Q  150 gtcggtg 156  Q
    || ||||    
T  25122519 gttggtg 25122513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33528534 - 33528383
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| || |  || || ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  33528534 tgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt-ttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 33528436  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 176  Q
    || ||| || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  33528435 gatttgatgatgagaaatgggttgttgttgttgattttgtaaaatgggttgat 33528383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Original strand, 20561751 - 20561810
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 66  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20561751 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 20561810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15969920 - 15969796
Alignment:
Q  32 gttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgtt 131  Q
    |||||||| || | || |||||| ||||||| ||| ||| ||| || || |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  15969920 gttgaattatgctgagattcatgttcaattggtgtagttgttgttaagtgatgttgctattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgattgta 15969821  T
Q  132 gttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||    
T  15969820 gaggagaaatgagttgttgttggtg 15969796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29759997 - 29759893
Alignment:
Q  79 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||    
T  29759997 gtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggtttgttgttggtgttttggtgtaaatgggttgat 29759898  T
Q  177 aatga 181  Q
     ||||    
T  29759897 tatga 29759893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 18261591 - 18261762
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  18261591 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 18261690  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||| || |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  18261691 tgggtgttcataaatcatgagttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 18261762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 23226214 - 23226368
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  23226214 tgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcat 23226313  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta--aaatgggttgat 176  Q
    || ||| |  |||||||||  ||||||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23226314 gatttgattatgagaaatggattgttgttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23226368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Original strand, 27233205 - 27233348
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  27233205 tgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 27233304  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    || ||| |  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  27233305 gatttgataatgagaaataagttgttgttgttggttttgtaaaa 27233348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23149886 - 23149736
Alignment:
Q  29 gttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-t 127  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||||| ||||| | |||| || ||| || || ||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||| |    
T  23149886 gttgttgaattatgatgagaatcatgttcaatagttgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatt 23149787  T
Q  128 tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta--aaatgggttgat 176  Q
    || || ||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23149786 tgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23149736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 24385874 - 24385988
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         | ||||||||| ||||||||| ||| || || || || | |||| ||||||    
T  24385874 atgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaattg---------taatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgattttatggatgctaattc 24385964  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  24385965 atggcttgggtatgcatgattcat 24385988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 33611179 - 33611334
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||   |||| | ||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||||||||||| ||     
T  33611179 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgttgagaaccatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgtgtg 33611278  T
Q  113 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    | ||| | |||||| ||| || ||||| || ||||||||| | |||||||||||||    
T  33611279 ttcataaatcatgatttgatgatgagatataagttgttgttgttggttttgtaaaa 33611334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 168
Target Start/End: Original strand, 31194488 - 31194606
Alignment:
Q  51 catgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgtt 149  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||  | || |||||| |||| |||||| ||||||||   |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  31194488 catgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgcacatgattcatgatttgttggtgaaaaatgagttgtt 31194587  T
Q  150 gtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    || ||||  ||||||||||    
T  31194588 gttggtgactttgtaaaat 31194606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17285319 - 17285232
Alignment:
Q  82 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17285319 atgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgacttgaggatgagaaatgagttgttgttggtagttttgcaaaat 17285232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 151
Target Start/End: Original strand, 38635786 - 38635913
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  38635786 tgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcat 38635885  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
     | |||||| |||||||  |||||||||    
T  38635886 aatttgttgatgagaaacaagttgttgt 38635913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23158294 - 23158118
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||| | ||||||| ||  || || ||||||||||||||   |    
T  23158294 atgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaatagttgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgat---t 23158198  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta--aaatgggttgat 176  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| ||| |  ||| |||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23158197 catggcttgggtgttcataattcatgatttgataatgaaaaatgagttgttcttgttggttttgtacgaaatgggttgat 23158118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29306544 - 29306450
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattca 101  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||||    
T  29306544 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 29306450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 22981400 - 22981351
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgat 56  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22981400 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgat 22981351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Original strand, 23151971 - 23152072
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||   | || |||||||||| |||| ||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  23151971 tgttgttgttgaattatgatgagaaccgtgttcaattgatgctgttgttgctatgtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcat 23152070  T
Q  125 ga 126  Q
    ||    
T  23152071 ga 23152072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 111
Target Start/End: Original strand, 45559057 - 45559161
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  45559057 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagggatattgttgttgatgattcatagct 45559156  T
Q  107 tgggt 111  Q
    |||||    
T  45559157 tgggt 45559161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 77
Target Start/End: Original strand, 22497329 - 22497399
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgata 77  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  22497329 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgata 22497399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 24929018 - 24929087
Alignment:
Q  99 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24929018 tcattgcttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 24929087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 168
Target Start/End: Original strand, 3431461 - 3431570
Alignment:
Q  59 attgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggt 158  Q
    |||||||||||| ||| |  | |||||||||| | || ||| ||||||||||| | |||   |||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||    
T  3431461 attgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgtttgtgagaaataagatgttgttggtggt 3431560  T
Q  159 tttgtaaaat 168  Q
    ||||| ||||    
T  3431561 tttgtgaaat 3431570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 18041670 - 18041823
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||| ||| | ||| | ||||    
T  18041670 tgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttaggtgttcataaatcat 18041769  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    || ||  || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  18041770 gagtttatgatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggttgat 18041823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11584187 - 11583982
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttg---aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataa 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| | |||||||||||    
T  11584187 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 11584088  T
Q  98 ttcatggcttgggttt-gcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttg 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11584087 ttcatggcttgggttttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttcgtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagtttgtttttg 11583988  T
Q  197 atgatg 202  Q
    ||||||    
T  11583987 atgatg 11583982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 1168318 - 1168500
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1168318 atgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 1168417  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  1168418 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 1168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 11337300 - 11337455
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  11337300 atgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattc 11337399  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11337400 atggcttgagtttacatgattcatgattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 11337455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20712209 - 20712036
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  20712209 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattc 20712110  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20712109 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20712036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2031943 - 2031783
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  2031943 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattc 2031844  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  2031843 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 2031783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21397225 - 21397073
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg---tttttgatatgtcatgttgttgatgataa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| || |||||||||||||||||||    
T  21397225 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttgttaagtcatgttgttgatgataa 21397126  T
Q  98 ttcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgtt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  21397125 ttcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgtt 21397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 24183246 - 24183370
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||     
T  24183246 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtca---tgttgatgataatta 24183342  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24183343 atggcttgggtttgcatgattcatgatt 24183370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19405671 - 19405503
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||    
T  19405671 atgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataatt 19405572  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  19405571 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 19405503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28261654 - 28261498
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  28261654 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataattc 28261555  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28261554 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 28261498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11342818 - 11342635
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt-tttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||| ||     
T  11342818 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgata 11342719  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 181  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  11342718 tatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgtcttggtgaaaatgggttgattatga 11342635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24475711 - 24475560
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| || |   ||||||||||||||||||||||    
T  24475711 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgttat--gtttcatgatcaattgttgttgttgttta---gtcatgttgttgatgataattc 24475617  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24475616 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 24475560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21906846 - 21906729
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21906846 tcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg---ttgttaagtcatgttgttgatgataattcatgg 21906750  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatg 125  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21906749 cttgggtttgcatgattcatg 21906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728378
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| || |||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgct 7728448  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  7728447 tgggtgtgcataattcatgaattgttggtgagagatgaggtgttgttggtgactttgaaaaatgggttga 7728378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21650828 - 21650668
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |  ||| ||||||    
T  21650828 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattc 21650729  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21650728 atggtttgggtatgcatgattcataatttgttgtggtgaaataagttgttgttgttggttt 21650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4865396 - 4865239
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataa-tt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||| |   |||||||||||||||||| ||    
T  4865396 atgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgataattt 4865297  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4865296 catggcttgggtttgcataattcttgaattgttgttgagagatgaggtgttgttggtg 4865239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23466559 - 23466434
Alignment:
Q  32 gttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23466559 gttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgatagttcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgt 23466460  T
Q  131 tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||| |||||  |||||| ||||    
T  23466459 tgttgaggaatgatatgttgttggtg 23466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493875
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtg 23493941  T
Q  113 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||| ||||||    
T  23493940 ttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgagttgat 23493875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Original strand, 21646857 - 21647009
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  21646857 tcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcatgatgttgatgataattcatgg 21646956  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||| || |||  | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21646957 cttgggtttgtataattattggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 21647009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21205059 - 21204898
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||| || || ||||| || ||  ||||||    
T  21205059 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttatttattctaattc 21204960  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21204959 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 21204898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Original strand, 109010 - 109158
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcgg 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  109010 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 109109  T
Q  155 tggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  109110 tggttttgtaaaatgggttgatagagaagaagtttgattttgatgatgt 109158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16105721 - 16105573
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcgg 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| || | | ||||||| ||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16105721 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggcttaggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 16105622  T
Q  155 tggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16105621 tggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16105573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673818
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  | || ||||||||| ||||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggct 3673890  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||||| | ||| | ||| || ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  3673889 tgggtgttcataaatcacgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 3673818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21617125 - 21616974
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| || | ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  21617125 tgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattcat 21617026  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21617025 gatttgatgatgagaagtgagctgttgtggttggttttgtaaaatgggttga 21616974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19862336 - 19862183
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||| || || || || ||| |||| ||||||| ||    
T  19862336 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgact 19862237  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtt 159  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  19862236 tgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtt 19862183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 5450963 - 5451134
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||| |||||    
T  5450963 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataaaattcatgttcaactgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcttggct 5451062  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||| |   ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  5451063 tggatgatcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 5451134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16595641 - 16595474
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||| | ||||||||||   ||||| ||||||||| || | || |||||| ||||||||||| | | ||| ||  | ||| ||||  |||||||||    
T  16595641 atgctcaaattgtgaattatgttatgttgatgttgaattatgttgagattcatgttcaattgatgtagatgttgttaaatgatgatgttattgataattc 16595542  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  16595541 atgacttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 16595474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 432590 - 432419
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||| |||||    
T  432590 aattgatgaattatactatgttgttgttggattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcctggct 432491  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||||| | ||| ||| |||| ||| |  |||||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||||    
T  432490 tgggtattcataatttatgatttgatcatgagaaataagttgttgttattggttttgtgagaatgggttgat 432419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 21222746 - 21222897
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| || || || |||||| |||| |||||||| ||| || | ||| | ||||    
T  21222746 tgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattaatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggattgagtgttcataaatcat 21222845  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || |||||| | |||||||||   ||||||||| ||| |||||||    
T  21222846 gacttgatgatgagaattcagttgttgttattggttttgtgaaaagggttga 21222897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6456733 - 6456580
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || | |||| |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  6456733 tgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcat 6456634  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta-aaatgggttgat 176  Q
    || ||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||| ||| ||||||||    
T  6456633 gatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgtttttgtacaaacgggttgat 6456580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 23981629 - 23981806
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||    
T  23981629 atgctcaaatggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 23981728  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    |||||||||||| | ||| | ||||||||  || || ||||| |||||||||   ||||||||| | |||||||||||    
T  23981729 catggcttgggtgttcataactcatgatttgtgatgtgaaataagttgttgttattggttttgtgagaatgggttgat 23981806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 175
Target Start/End: Original strand, 32966343 - 32966436
Alignment:
Q  83 tgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32966343 tgttgttattgataattcatggcttgagcgtgcataattcataattggttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 32966436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29918074 - 29917931
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | || |||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  29918074 tgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 29917975  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    || ||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||    
T  29917974 gatttgatgttgagaaataaattattgtcgttggttttgtaaaa 29917931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 202
Target Start/End: Original strand, 24225596 - 24225634
Alignment:
Q  164 aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24225596 aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 24225634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37983473 - 37983325
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||| |||||||||||| || ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||     
T  37983473 tgttattgttgaattgtaatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcag 37983374  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  37983373 gatttgatgatgaaaaatgagttgttgt---tggttttgtaaaatgggttga 37983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 28902310 - 28902255
Alignment:
Q  15 aattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 70  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  28902310 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgtt 28902255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 28938705 - 28938650
Alignment:
Q  15 aattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 70  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  28938705 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgtt 28938650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 22053963 - 22054028
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 67  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  22053963 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 22054028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Original strand, 18531200 - 18531262
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 67  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  18531200 tcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 18531262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Original strand, 16835437 - 16835521
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgg 109  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||| | |||| |||||||| ||| || |  ||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  16835437 tgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattaatgttgttgttgttaagagatgttgttgttgatgattcatagcttgg 16835521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 35522433 - 35522588
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35522433 atgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataattc 35522532  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35522533 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35522588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21718361 - 21718206
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21718361 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 21718262  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  21718261 atggcttgggtttgcatgattcatggttgttcttgagaaatgagatgttgttggtg 21718206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49967783 - 49967628
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  49967783 atgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 49967684  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  49967683 attgcttcggtttgcatgattcatggttgttgttgaggaatgagatgttgttggtg 49967628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 22403224 - 22403375
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22403224 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 22403323  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||    
T  22403324 atggcttgggttt-catgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgt 22403375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 51627805 - 51627945
Alignment:
Q  28 tgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga- 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  51627805 tgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatgat 51627904  T
Q  127 ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  51627905 ttgctgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 51627945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 9784238 - 9784341
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9784238 tgttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattcat 9784337  T
Q  125 gatt 128  Q
    ||||    
T  9784338 gatt 9784341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41212205 - 41212046
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat---gtcatgttgttgatgataa 97  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||    
T  41212205 atgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataa 41212106  T
Q  98 ttcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41212105 ttcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 41212046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 15861548 - 15861728
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |  |  ||||| ||||||||||| || |    
T  15861548 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtttgt--ttagtcatattgttgatgatgatgc 15861645  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 181  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  15861646 atgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 15861728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22367151 - 22366970
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| || |    
T  22367151 atgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatac 22367053  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 181  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  22367052 atgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 22366970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21860144 - 21859984
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| || |    
T  21860144 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatac 21860045  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21860044 atggctcgggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatgaattgttgttgttggttt 21859984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 27329869 - 27330026
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  27329869 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattc 27329968  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  27329969 atggcttgggtatgcatgattcataat--ttgttgtcaaataagttgttgttgttggttt 27330026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 35054889 - 35054716
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  35054889 atgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 35054790  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  35054789 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtggaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 35054716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 44035093 - 44035255
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||| | |     
T  44035093 atgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgatga-ta 44035191  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 163  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  44035192 atggcttgagtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 44035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20177302 - 20177140
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||   ||| | ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  20177302 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaaaagtcaagttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 20177203  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||| | | ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20177202 tggatattcataattcatgatttgttgaagagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 20177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27674898 - 27674755
Alignment:
Q  32 gttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgtt 131  Q
    |||||||| || | || |||||| ||||||| ||| ||| ||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  27674898 gttgaattatgctgagattcatgttcaattggtgtagttgttgttaagtgatgttgttattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgattttt 27674799  T
Q  132 gttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  27674798 gatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 27674755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 37233986 - 37234149
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||| |||||||     
T  37233986 tgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtg 37234085  T
Q  113 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    | ||| | |||||| ||| || ||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37234086 tccataaatcatgatttgatgatgaaaattgagtttttgtggttggttttgtaaaatgggttga 37234149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17609037 - 17608886
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  17609037 tgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 17608938  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| |  |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  17608937 gatttgattatgagaattgagttgttgttgttggttttggaaaatgggttga 17608886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 174
Target Start/End: Original strand, 22829629 - 22829712
Alignment:
Q  92 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22829629 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttg 22829712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 9784178 - 9784249
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttga 75  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9784178 atgcttaattggtgaattatgctttgt---tgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttga 9784249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 13376978 - 13377122
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| || | |   ||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| | |||||||||||| || | ||| ||||||    
T  13376978 tgttgttgttgaattatggtgaaagtcatgctcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcat 13377077  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  13377078 gatttgttgatgagaaatgaattgttgttggcggttttgtgaaat 13377122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 175
Target Start/End: Original strand, 38033818 - 38033962
Alignment:
Q  31 tgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgt 130  Q
    ||||||||| || | || |||||| |||||||||||  ||  || || || |||||| || || ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  38033818 tgttgaattatgttgagattcatgttcaattgatgtgattgctgctaagtgatgttgctgttgttaattcatggcttgggtgtgcatagttcacgattgt 38033917  T
Q  131 tgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38033918 tgatgagaaataagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38033962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19603182 - 19603055
Alignment:
Q  49 ttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttg 147  Q
    |||||| ||||||||||| |||  || || || |||| |||  |||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19603182 ttcatgttcaattgatgtagttgctgctaagtgatgtggttattgataattcatgacttgggtgtgaataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg 19603083  T
Q  148 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  19603082 ttgttggtgactttgtaaaatgggttga 19603055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 41229102 - 41229221
Alignment:
Q  50 tcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgt 148  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| | || |||||||||||| || | ||| |||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  41229102 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgt 41229201  T
Q  149 tgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||| ||| |||| |||||||    
T  41229202 tgttggtagtttggtaaaat 41229221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21195122 - 21194980
Alignment:
Q  26 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  21195122 gttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattaatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 21195023  T
Q  126 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    | ||| || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  21195022 atttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttataaaa 21194980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 150
Target Start/End: Original strand, 36356455 - 36356557
Alignment:
Q  49 ttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 147  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  36356455 ttcatgttcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgatgatttatggcttgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttg 36356554  T
Q  148 ttg 150  Q
    |||    
T  36356555 ttg 36356557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 22143474 - 22143602
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||||||||  || || || || |||||| |||| |||    
T  22143474 atgctcaaatggttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgctcaattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgatt 22143573  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  22143574 catggcttgggtattcataattcatgatt 22143602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 16646031 - 16645976
Alignment:
Q  15 aattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 70  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16646031 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgtt 16645976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 175
Target Start/End: Original strand, 20955601 - 20955728
Alignment:
Q  49 ttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 147  Q
    |||||| ||||||||||| |||  || || || ||||||||  |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  20955601 ttcatgttcaattgatgtagttgctgctaagtgatgttgttattgataattcatggcttcggtgtgaataattcgtgaattgttggtgtgaaatgagttg 20955700  T
Q  148 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    |||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  20955701 ttgtgggtgactttgtaaaaggggttga 20955728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 16656757 - 16656702
Alignment:
Q  15 aattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 70  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  16656757 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgtt 16656702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20445812 - 20445747
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 67  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  20445812 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgtt 20445747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20531577 - 20531512
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 67  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  20531577 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgtt 20531512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 8538048 - 8538200
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | | ||    
T  8538048 tgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaataat 8538147  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 176  Q
    || ||| || || ||||| ||||||||| | ||||||   |||||||||||||    
T  8538148 gatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggtttgtaaaaatgggttgat 8538200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 8603287 - 8603439
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | | ||    
T  8603287 tgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaataat 8603386  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 176  Q
    || ||| || || ||||| ||||||||| | ||||||   |||||||||||||    
T  8603387 gatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggtttgtaaaaatgggttgat 8603439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Original strand, 21650217 - 21650329
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggt 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |  | |||||||||| | || ||| ||||||||||| | |||   |||||||||||  |||||||| || |||||| |||    
T  21650217 tcaattgatgttgttgttgttgagacatgttgttgtttatgatttatggcttgggtgttcatatatcatgattgtttgtgagaaataagatgttgttggt 21650316  T
Q  156 ggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||| ||||    
T  21650317 ggttttgtgaaat 21650329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 125; Significance: 1e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 254928 - 255084
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  254928 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 255027  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  255028 atggcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 255084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 261534 - 261690
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  261534 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 261633  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  261634 atggcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1300
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1450 atgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattc 1351  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1350 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttg 1300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 11768 - 11921
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11768 atgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat---tgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 11864  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  11865 atggcttggg-ttgcataactcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 11921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 271303 - 271148
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  271303 atgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 271204  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  271203 atagcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaggaatgagatgttgttggtg 271148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Original strand, 4448251 - 4448402
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4448251 tcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 4448350  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4448351 cttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaaaaatgagatgttgttggtg 4448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32465991 - 32465835
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  32465991 atgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 32465892  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32465891 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32465835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25602157 - 25601989
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  25602157 atgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaatc 25602058  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25602057 atggcttaggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25601989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 19433452 - 19433649
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||    
T  19433452 aattgttgaattatgctatgttgttattgaattgttgtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggct 19433551  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19433552 tgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 19433649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28974182 - 28974026
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28974182 atgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 28974083  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28974082 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtg 28974026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 23836819 - 23836975
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  23836819 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcattttgttgatgataattc 23836918  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23836919 atgacttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 23836975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 22579975 - 22580140
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22579975 atgctcaattggttgaattatgctttgt---tgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataatt 22580071  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  22580072 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 22580140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 25876033 - 25876206
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  25876033 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgttgatgataattc 25876132  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  25876133 atggcttgggtttgcataattcttggcttgttattgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 25876206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 36890799 - 36890972
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || ||||||| |||||| ||||    
T  36890799 atgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattc 36890898  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  36890899 atggcttgggtatgcatgattcttgatttgttgttgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 36890972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 24571405 - 24571572
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| |    
T  24571405 atgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataact 24571504  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    ||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  24571505 cat-gcttggctatgtatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 24571572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27261899 - 27261783
Alignment:
Q  41 tgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27261899 tgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttaagaa 27261800  T
Q  140 atgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  27261799 atgagatgttgttggtg 27261783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22274855 - 22274688
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||  || |  ||||| ||||||||||| ||      
T  22274855 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgatag 22274756  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22274755 atggcttggg-ttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 22274688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43646020 - 43645824
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||  ||| ||||||| ||    
T  43646020 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgtcgatgattcatgact 43645921  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||| | ||| ||||||||||  || ||  |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43645920 tgggtgttcataattcatgatttgtgatgtcatttgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttggtaatgaaaaagtttgattttgatgatgt 43645824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 175
Target Start/End: Original strand, 3385 - 3529
Alignment:
Q  31 tgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgt 130  Q
    ||||||||| || | || |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  3385 tgttgaattatgcttaggttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattgt 3484  T
Q  131 tgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
     | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3485 agatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22284088 - 22283921
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||  || |  ||| | ||||||||||| || |    
T  22284088 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgttgatgatgatac 22283989  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22283988 atggcttgggtt-gcatgattcatgaattgctgttgagaaatgaattgttgttggtggttttgtgaaat 22283921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 9653021 - 9653179
Alignment:
Q  4 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| | |||| |||||||||    
T  9653021 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 9653120  T
Q  104 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9653121 gcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9653179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6879567 - 6879414
Alignment:
Q  4 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  6879567 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgttgatgataatacatg 6879468  T
Q  104 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
     |||||||||  || |||| | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6879467 tcttgggtttaaataattcttggtttgttgttgagaattgagatgttgttggtg 6879414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 148
Target Start/End: Original strand, 21274174 - 21274319
Alignment:
Q  4 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| |||||||||    
T  21274174 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 21274273  T
Q  104 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgt 148  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21274274 gcttggg-tagcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgt 21274319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25213126 - 25212977
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa--tgagttgttgtcg 153  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |    
T  25213126 tcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaaatgagttgttggtg 25213027  T
Q  154 gtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25213026 gtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaaatttgattttgatgatgt 25212977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 67952
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| || | ||||||||||    
T  68119 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggct 68020  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    || || | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  68019 tgcgtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 67952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Original strand, 24826961 - 24827044
Alignment:
Q  121 tcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24826961 tcatgattgttgttgagaaaatgagctgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgatattgatgatgt 24827044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25305573 - 25305416
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttg-ttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggc 105  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| | | || || ||||||||| |||| |||||||||    
T  25305573 aattgttgaattatgctatgttgattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgtggctaagtgatgttgttgttgatgattcatggc 25305474  T
Q  106 ttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 162  Q
     ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25305473 ctgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtagttttg 25305416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24884795 - 24884643
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| ||    || |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | ||||    
T  24884795 tgttattgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcat 24884696  T
Q  125 gatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 176  Q
    |||| | ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24884695 gatttgatgaggagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgat 24884643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 722504 - 722353
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||| ||||||||| || | || |||||| |||||||| || |||  || || || ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  722504 tgttgatgttgaattatgctgagattcatgttcaattgaagtagttgctgctaagtgatgttgttattgataattcatggcttgggtgtgcataattcat 722405  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || || ||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  722404 gatttattgatgagatatgagttgttgttggtgactttgtaaaattggttga 722353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 31146301 - 31146450
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||  | ||| || || |||||||||||||||| |||||||     
T  31146301 aattgttgaattatgctatgt-gttgttgaattgtaataagattcctgttcaattgatgttactgttgctaagtgatgttgttgatgataaatcatggcc 31146399  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    | ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  31146400 taggtgtgcataattcatgaattgttggtgataaatgagttattgttggtg 31146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 172
Target Start/End: Original strand, 23821743 - 23821892
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  23821743 tgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcat 23821842  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    || ||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  23821843 gatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23821892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 172
Target Start/End: Original strand, 23830822 - 23830971
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  23830822 tgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcat 23830921  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    || ||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  23830922 gatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23830971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 25265520 - 25265643
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| | || | |||    
T  25265520 tgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatca 25265619  T
Q  102 tggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  25265620 tggcttgggtatgcat-attcatga 25265643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19666662 - 19666495
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| || || || |||| | |||| |||    
T  19666662 atgctcaaatggttgaattatgctatgttgttattgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgtcgttgatgatt 19666563  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 166  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||  ||| || |||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  19666562 catggcttgggtattcataattcatgttttgatgatgagaaatggattgttgttgttggttttgtaaa 19666495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 24294661 - 24294764
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||| ||||||||| || | || |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||    
T  24294661 tgttgatgttgaattatgctgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgatgattcatggcttgagtattcataattcat 24294760  T
Q  125 gatt 128  Q
    ||||    
T  24294761 gatt 24294764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 19669222 - 19669374
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||  |   |||| ||||||||||||||| ||| || || ||||| ||| |||| |||    
T  19669222 atgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgatt 19669321  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| | || || ||| ||||||||||||||    
T  19669322 catggcttgggtattcataattcatgaactgatgatgaaaaatgagttgttgt 19669374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Original strand, 22775331 - 22775393
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttga 75  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  22775331 tgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttga 22775393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Original strand, 22780709 - 22780771
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttga 75  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  22780709 tgaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttga 22780771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 24341519 - 24341584
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 67  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  24341519 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 24341584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9636872 - 9636701
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| | |    
T  9636872 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtt 9636773  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg-taaaatgggttgat 176  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||  || || ||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  9636772 tgggtattcataaatcatgagtttgtgatgtgaaataacttgttgttgttggttttgttaaaatgggttgat 9636701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 111
Target Start/End: Original strand, 24560869 - 24560955
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggt 111  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||| ||| ||||  || |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  24560869 tgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatattgttgttgatgattcatagcttgggt 24560955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 36982571 - 36982694
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| || ||| ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  36982571 tgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 36982670  T
Q  102 tggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    | | |||||| ||||| ||||||||    
T  36982671 ttgtttgggtatgcat-attcatga 36982694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 60933 - 60784
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  60933 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgact 60834  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  60833 tgggtttgcatgattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 60784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 70736 - 70892
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  70736 atgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 70835  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  70836 atgacttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 70892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 936 - 1092
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  936 atgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 1035  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1036 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 6959 - 7118
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat---gtcatgttgttgatgataa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |   |||||||||||||||||||    
T  6959 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataa 7058  T
Q  98 ttcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7059 ttcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 11822 - 11970
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11822 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 11921  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 149  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11922 atggcttgagtttgcatggttcatgattggtgttgagaaatgagatgtt 11970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 132364 - 132520
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  132364 atgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 132463  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  132464 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 132520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11821 - 11660
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||    
T  11821 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataatt 11722  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11721 catggcttggttatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 88404 - 88289
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || || ||||| | |||| |||||| |||    
T  88404 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaattcttgg 88305  T
Q  105 cttgggtttgcatgat 120  Q
    ||||||| ||||||||    
T  88304 cttgggtatgcatgat 88289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 253103 - 253271
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  253103 atgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataattc 253202  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  253203 aaggcttgggtttgcatgattcatgatttcttgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 253271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22824 - 22668
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22824 atgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataattc 22725  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22724 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgttgttggtg 22668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 690 - 846
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  690 atgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 789  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  790 atggcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 5360 - 5516
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5360 atgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 5459  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5460 atggtttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 5516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 8995 - 9156
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||    
T  8995 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatt 9094  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9095 catggcttaggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtcggtggttt 9156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 118081 - 118237
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  118081 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatgg 118180  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  118181 cttggggttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 118237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109736
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 109681  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  109682 tgggattgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 109736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 11682 - 11837
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11682 atgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattc 11781  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11782 atgacttgggtttgcataattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9120 - 8960
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9120 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 9021  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9020 atggcttgggtttgcttgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 632 - 788
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  632 atgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgataattc 731  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  732 atggcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19339 - 19216
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| ||  || ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  19339 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatca 19240  T
Q  102 tggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||    
T  19239 ttgcttgggtatgcat-attcatga 19216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21423 - 21300
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattca 101  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| ||  || ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  21423 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatca 21324  T
Q  102 tggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||    
T  21323 ttgcttgggtatgcat-attcatga 21300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 7702 - 7556
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7702 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 7603  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||    
T  7602 atggcttgggtttgcatgattc--gttggttgttgagaaatgagatgtt 7556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 85465 - 85321
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  85465 atgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 85366  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  85365 atggtttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgag 85321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 159433 - 159275
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |   || ||||||||||||||    
T  159433 atgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaag---tgatgttgatgataatt 159337  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
      |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  159336 tttggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 159275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28663 - 28466
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||||  | ||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| | || ||||||||||    
T  28663 aattgttgaattatggtatgttgttgttgaattgtagtaagaattatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggct 28564  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||| | ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28563 tgggtgttcataattcatgatttattggtgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21687 - 21637
Alignment:
Q  153 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21687 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 21637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5074 - 4906
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5074 atgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattc 4975  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4974 atggcttggttgttcataattcatgatttgctgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 4906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38431 - 38287
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  38431 atgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 38332  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 144  Q
    ||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38331 ataacttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 38287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1514 - 1332
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1514 atgctcaattgttgaattatgttatgtgattgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgataaatc 1415  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  1414 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32336 - 32180
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  32336 atgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 32237  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32236 atggcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 41967 - 42123
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  41967 atgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 42066  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42067 atggcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 42123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 154 - 3
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  154 atgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattc 55  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  54 atggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggattgttgt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3492
Alignment:
Q  60 ttgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggt 158  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||| ||||||    
T  3593 ttgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggaatgttgttggtggt 3494  T
Q  159 tt 160  Q
    ||    
T  3493 tt 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15007 - 14854
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |   ||||||||||||||||||||||    
T  15007 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttta---gtcatgttgttgatgataattc 14911  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14910 atggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14272 - 14194
Alignment:
Q  79 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14272 gtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 112659 - 112812
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||   |||||||||    
T  112659 atgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcatgttgt---tgataattc 112755  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  112756 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 109717 - 109556
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  109717 aattgttgaattttgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 109618  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  109617 tgggtatgcacgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 103048 - 103211
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  103048 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgttattgtttctaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtg 103147  T
Q  113 tgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  103148 tgcataattcatgaattgttggtgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 6205 - 6373
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  || || ||||||||||| || |    
T  6205 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatgatgatac 6304  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6305 atgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 6373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 17526 - 17686
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  17526 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 17625  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  17626 atggcttgggtatgcatgattcataatatgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 31402 - 31570
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| || |    
T  31402 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatac 31501  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  31502 atggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 31570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 33841 - 34008
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||    
T  33841 atgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataatt 33940  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  33941 catggcttgggtatgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 34008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41442 - 41274
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| ||||||||||| || |    
T  41442 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatac 41343  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  41342 atggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 41274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 164348 - 164204
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||    
T  164348 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaattc 164249  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 144  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  164248 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 164204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 162300 - 162469
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt-tttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||| ||     
T  162300 atgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgata 162399  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  162400 tatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 162469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 166386 - 166547
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||       ||||||||||| || |    
T  166386 atgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttaata-------ttgttgatgatgatac 166478  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  166479 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaaaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 166547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 168
Target Start/End: Original strand, 116687 - 116795
Alignment:
Q  61 tgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtt 159  Q
    |||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| |||||  ||||||| |||||||    
T  116687 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatggattgttgttggtggtt 116786  T
Q  160 ttgtaaaat 168  Q
    |||||||||    
T  116787 ttgtaaaat 116795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 95108 - 94948
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| | |||| ||||||    
T  95108 atgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgttatggatgctaattc 95009  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  95008 atggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 94948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 24842 - 25002
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  24842 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattc 24941  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
     |||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  24942 ttggcttgggtattcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 25002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31154 - 31010
Alignment:
Q  24 ttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattca 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31154 ttgtagttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggtatgcatgattca 31055  T
Q  124 tga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 167  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  31054 tgacttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 70747 - 70654
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatg 93  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  70747 atgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgctgatatatgatgttgttgatg 70654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 97324 - 97487
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| |||| || |||||| ||||||||| ||||| ||  ||  | || || ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  97324 tgaattatgctatgttggtgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatattgttgttactaattgatattattgttgatgattcatgccttgggtt 97423  T
Q  113 tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    | ||| | |||||||| | || | |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  97424 ttcataaatcatgatttgatgataagaattgagttgttgttattggttttgtaaaatgggttga 97487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30199 - 30056
Alignment:
Q  26 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 125  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30199 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 30100  T
Q  126 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  30099 atttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 30056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 1100 - 1261
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |  ||| ||||||    
T  1100 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattc 1199  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  1200 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgagaaataagttgttgttgttggttt 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 13508 - 13669
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  13508 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 13607  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  13608 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 13669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 21482 - 21634
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |  ||| ||||||    
T  21482 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattc 21581  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  21582 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 21634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15082 - 14921
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  15082 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 14983  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  14982 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 55714 - 55553
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  55714 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 55615  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  55614 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 55553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 175
Target Start/End: Original strand, 93913 - 94061
Alignment:
Q  28 tgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga- 126  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||||     
T  93913 tgttgttaaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttattaataagtgatgttgttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgat 94012  T
Q  127 ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  94013 ttgttggtgagaaatgagatgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 94061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 151
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104887
Alignment:
Q  58 aattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgt 104887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 6665 - 6816
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  6665 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 6764  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  6765 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 6816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 15585 - 15761
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatat---gtcatgttgttgatgataa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | |   |||||||| | |||| |||    
T  15585 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttatagatgctaa 15684  T
Q  98 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  15685 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6671 - 6500
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | |||||||| |||| ||| || |  || |||||| |||| ||||||||||    
T  6671 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgatgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggct 6572  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    | ||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  6571 taggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 6500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2049 - 1889
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  2049 atgctcaattggttgaattatgctatgt-gttgttgatttgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataatt 1951  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  1950 cttggcttgagtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttagtggttt 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3308
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtg-aattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || || ||||||| |||| |||||    
T  3453 atgctcaattggtccaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaatt 3354  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 144  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3353 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgag 3308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 9629 - 9789
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || | ||| | |||| ||||||    
T  9629 atgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaattc 9728  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9729 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 12642 - 12802
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||    
T  12642 atgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 12741  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  12742 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 160
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19183
Alignment:
Q  27 ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataa 19148  T
Q  127 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  19149 tttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 19183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 79997 - 79846
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| |  ||||| | ||||||||||||||    
T  79997 atgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 79898  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  79897 atggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 79846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 46298 - 46171
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || || || |||||| |||| ||||    
T  46298 atgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgattc 46199  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  46198 atggcttgggtgttcataattcatgatt 46171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40791 - 40664
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||    
T  40791 atgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 40692  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  40691 atggcttgggtgttcataattcatgatt 40664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10248
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||||||||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 10193  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  10194 tgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgatggttt 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 48280 - 48124
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || || ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  48280 atgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattc 48181  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  48180 atggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 48124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 61728 - 61572
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || || ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  61728 atgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatgataattc 61629  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  61628 atggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 61572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 146734 - 146561
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |  ||| ||||||    
T  146734 atgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgcatgttaattc 146635  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  146634 atggcttgggtatgcatgattcataatttgtttttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 146561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8982 - 8917
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtt 67  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | || ||| ||||||||||||    
T  8982 tgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgtt 8917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 573 - 736
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  |  |   |||| ||||||||||| || |    
T  573 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatgatgatac 672  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 163  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  673 atggcttgggtttgcatgattaataatttgttgttgagaaatggattattgttggtggttttgt 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6074 - 5900
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaa-ttatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||    
T  6074 atgctcaattggttaaattatgctatgtggttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 5975  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 172  Q
    ||||||||| || | ||| || ||||| ||| || || ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  5974 catggcttgagtgttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 5900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 76967 - 77129
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||  |||| ||||||||||    
T  76967 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggct 77066  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  77067 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 77129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 193610 - 193770
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  193610 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 193708  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  193709 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgcgaaataagttgttgttgttggttt 193770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 186648 - 186799
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  186648 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatta-ttgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 186746  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  186747 atggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 186799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27604 - 27453
Alignment:
Q  27 ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||||||| | ||| | ||||||    
T  27604 ttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgatgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatga 27505  T
Q  127 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
     ||| || || ||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  27504 gttgatgatgtgaaatgagttgttgttgtcggttttgtaaaaatgggttgat 27453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 130634 - 130486
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcgg 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  130634 tcaattgatgttgttgttgttgagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttgg 130535  T
Q  155 tggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  130534 tggttttgtaaaatgggttaataaagaagaagtttgattttgatgatgt 130486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 70
Target Start/End: Original strand, 89584 - 89652
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 70  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  89584 tgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgtt 89652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 79673 - 79521
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||  |   |||| ||||||||||||||| ||| || || || || ||| |||| |||    
T  79673 atgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgatt 79574  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  79573 catggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 79521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 160
Target Start/End: Original strand, 24368 - 24471
Alignment:
Q  58 aattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  24368 aattgttgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtg 24467  T
Q  157 gttt 160  Q
    ||||    
T  24468 gttt 24471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 270
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || || ||||| ||| |||| ||||||| ||    
T  436 aattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgcct 337  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggt 172  Q
    |||||   ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  336 tgggtgctcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaactgggt 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 69566 - 69415
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  69566 tgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 69467  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  69466 gatttgatgatgagaattgaggtgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 69415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35605 - 35444
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||| || ||| || || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  35605 aattgttgatttatgctatgttgttgttgaaatgtggtaagagtcatgttcaattgatgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 35506  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35505 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg-tgttggtggttttgtaaaat 35444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33789 - 33668
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||    
T  33789 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 33690  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatgatt 128  Q
     |||| | ||| ||||||||||    
T  33689 agggtgttcataattcatgatt 33668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2646 - 2483
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||||||| ||||||     
T  2646 tgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtg 2547  T
Q  113 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    | ||| | |||||| ||| || |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  2546 ttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttgttggttttctaaaatgggttga 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 150 - 301
Alignment:
Q  1 atgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || || ||||| | |||| ||||||    
T  150 atgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattc 249  T
Q  101 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  250 atggcttgagtatgcatgattcataatttattgttgtgaaataagttgttgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 2436 - 2607
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  2436 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 2535  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||||  | ||| |||||||  ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  2536 tgggcgttcataattcatgttttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 43936 - 44087
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  43936 tgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcat 44035  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44036 gatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 44087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7913 - 7807
Alignment:
Q  55 atcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcg 153  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  7913 atcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttg 7814  T
Q  154 gtggttt 160  Q
    || ||||    
T  7813 gtagttt 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6788 - 6622
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| ||||||||||  || | ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||  |  || || ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  6788 aattgttgaattatgctatgctattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttactcctaagtgatgtttttgttgatgattcatggct 6689  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggt 172  Q
    |||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6688 tgggtggtcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaactgggt 6622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8144 - 7987
Alignment:
Q  1 atgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||    
T  8144 atgctcaattgggtgaattatgctatgttgttgtggaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgatt 8045  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    ||| |||||||| | ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  8044 catagcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttatcggtg 7987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 4414 - 4351
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttg 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4414 tcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4358 - 4284
Alignment:
Q  83 tgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 156  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4358 tgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4697 - 4536
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||    
T  4697 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 4598  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||| ||| || || ||||| ||||||||| | ||||||    
T  4597 catggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttt 4536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9311 - 9150
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||    
T  9311 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 9212  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||||||||||| | ||| || ||||| ||| || || ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9211 catggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttt 9150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 197391 - 197545
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||| |||| |||||||| |||||| | ||| | ||||    
T  197391 tgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtcttcataaatcat 197490  T
Q  125 g-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg---gttttgtaaaatgggttga 175  Q
    |  ||| || |||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||    
T  197491 gctttgatgatgagaattgagttgttgttgttgttagttttgtaaaatgggttga 197545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31129 - 30978
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||  ||||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||     
T  31129 tgttcttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatactgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcaa 31030  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 175  Q
    || ||| || |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  31029 gatttgatgatgagaattgagttgttgttgttgcttttgtaaaatgggttga 30978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2564 - 2411
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||| |    
T  2564 tgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcct 2465  T
Q  125 ga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
     | ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||    
T  2464 tatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaataggttgat 2411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 148
Target Start/End: Original strand, 7163 - 7287
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||  || || || || |||||| |||| |||||||||||| || | ||| ||||||    
T  7163 tgttgttattggattgtgataagaatcatgttcaattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcat 7262  T
Q  125 g-attgttgttgagaaatgagttgt 148  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  7263 gaattgttgatgagaaatgagttgt 7287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10770 - 10644
Alignment:
Q  26 gttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 125  Q
    |||||||| ||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  10770 gttgttgtcgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtttttgctaagtgatgttgttgttgatcattcatggcttgggtgttcataattcatg 10671  T
Q  126 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
     |||| || ||| |||||| |||||||    
T  10670 aattgatgatgaaaaatgaattgttgt 10644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7306 - 7144
Alignment:
Q  1 atgctcaattggt-gaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg-atgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataat 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||| |||||||| ||| || || || |||||| |||| ||    
T  7306 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 7207  T
Q  99 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    ||||||||||||| | ||| || ||||| ||| || || ||||| ||||||||| | ||||||    
T  7206 tcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgtgaaataagttgttgttgttggttt 7144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13048
Alignment:
Q  143 agttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 200  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12990 agttgttgttgatggttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 70419 - 70569
Alignment:
Q  1 atgctcaattgg-tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataatt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||| |||    
T  70419 atgctcaattgggtgaattatgttatattgttgttgaattatgatgaggaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgatt 70518  T
Q  100 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgtt 149  Q
    | |||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  70519 cttggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgggttgtt 70569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 108130 - 107967
Alignment:
Q  13 tgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 112  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |   ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| ||||||||     
T  108130 tgaattatgc-ttgttattgttgaattgtgatgaagatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggtg 108032  T
Q  113 tgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    | ||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  108031 ttcataaatcatgaattttgatgagaaataagttgttgttgttggttttttaaaaatgggttgat 107967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22108 - 21981
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||  |||||||| || || | ||||    
T  22108 tgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcacagcttgggtatgtataaatcat 22009  T
Q  125 g-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||    
T  22008 gaattgatgatgagaaatgagttgttgt 21981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 30091 - 29946
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  30091 aattgttgaattgtgctatgtttttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagcgatattgttgttgatgattcatagct 29992  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 151  Q
    |||||  | || | ||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  29991 tgggtacgtataaatcatgaattgatgatgagaaatgagttgttgt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41778 - 41658
Alignment:
Q  5 tcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 104  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| | |||| |    
T  41778 tcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattg 41679  T
Q  105 cttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||    
T  41678 cttgggtatgcat-attcatga 41658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13639 - 13516
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattca 101  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| | |||    
T  13639 tgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 13540  T
Q  102 tggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||    
T  13539 tgacttgggtatgcat-attcatga 13516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12694
Alignment:
Q  163 taaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12734 taaaatgggttgatagtgaagaagtttgattttgatgatgt 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Original strand, 7795 - 7966
Alignment:
Q  7 aattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 106  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||| || |  || |||||| |||| |||||| |||    
T  7795 aattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagct 7894  T
Q  107 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||  || || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  7895 tgggtgttcataaatcatgagtttgtgatgtgaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggttgat 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 203
Target Start/End: Original strand, 3392 - 3427
Alignment:
Q  168 tgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3392 tgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Original strand, 3318 - 3387
Alignment:
Q  82 atgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  3318 atgttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattttttattgtgaaatgagttgttg 3387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1364
Alignment:
Q  111 tttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1422 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11201 - 11067
Alignment:
Q  27 ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 126  Q
    ||||||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||| | |||   ||||||    
T  11201 ttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgtttatgattcatggcttaggtgttcatagatcatga 11102  T
Q  127 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
     ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  11101 tttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 11067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 22715 - 22786
Alignment:
Q  90 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 160  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  22715 gatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 22786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7508 - 7358
Alignment:
Q  28 tgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat 127  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || |||||| | || |||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  7508 tgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttggtgttgctaagagatattgttgctaatgattcatggcttgggtactcataaatcatgat 7409  T
Q  128 t-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    | | || |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  7408 ttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 7358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16933 - 16783
Alignment:
Q  28 tgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat 127  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || |||||| | || |||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  16933 tgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttggtgttgctaagagatattgttgctaatgattcatggcttgggtactcataaatcatgat 16834  T
Q  128 t-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    | | || |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  16833 ttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 16783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 172
Target Start/End: Original strand, 5758 - 5875
Alignment:
Q  56 tcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggt 155  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |  ||||||||| | || ||| ||| ||||||| | |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  5758 tcaattgatgttgttgttgctgagaaatgttgttgtttatgatttatgacttgggtgttcatatgtcatgattgttggtgagaaatgagatgttgttggt 5857  T
Q  156 ggttttgta-aaatgggt 172  Q
     |||||||| ||||||||    
T  5858 tgttttgtataaatgggt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Original strand, 22560 - 22713
Alignment:
Q  25 tgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtttttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 124  Q
    |||||||||||||||| |||  |  ||||| | ||||||||||||| ||| ||  | || |||||| |||  |||||| | |||||| | ||||| | ||    
T  22560 tgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaattgatattgttgttgaagattcatagtttgggtgttcatgaattat 22659  T
Q  125 gatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 176  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  22660 gatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 22713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 70
Target Start/End: Original strand, 51312 - 51380
Alignment:
Q  2 tgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 70  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||    
T  51312 tgctcaattggtgaattatgttatgtggttgatgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgtt 51380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University