View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4497-Insertion-4 (Length: 959)

Name: NF4497-Insertion-4
Description: NF4497
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4497-Insertion-4
NF4497-Insertion-4
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (8-454)||(10870364-10870811)
chr3 (527-793)||(10870025-10870291)
chr3 (686-866)||(40272812-40272993)
chr3 (686-865)||(22609743-22609921)
chr3 (686-866)||(13628790-13628974)
chr3 (681-866)||(13730602-13730790)
chr3 (686-866)||(1217066-1217245)
chr3 (686-866)||(16735417-16735597)
chr3 (686-866)||(39203492-39203671)
chr3 (686-864)||(8247688-8247870)
chr3 (699-866)||(26869696-26869863)
chr3 (687-866)||(29366720-29366902)
chr3 (685-847)||(46421054-46421219)
chr3 (686-866)||(5173719-5173902)
chr3 (686-853)||(6411835-6412002)
chr3 (686-866)||(52926219-52926391)
chr3 (690-865)||(22122918-22123092)
chr3 (695-853)||(34420656-34420815)
chr3 (685-866)||(12914035-12914217)
chr3 (686-853)||(26573104-26573271)
chr3 (686-808)||(7696945-7697066)
chr3 (686-816)||(4495714-4495845)
chr3 (687-866)||(25517170-25517353)
chr3 (686-849)||(9607179-9607345)
chr3 (718-866)||(516417-516569)
chr3 (750-866)||(54484730-54484848)
chr3 (713-862)||(7942993-7943143)
chr3 (686-813)||(45620881-45621009)
chr3 (739-868)||(31592878-31593006)
chr3 (695-866)||(53996565-53996737)
chr3 (712-827)||(30928186-30928302)
chr3 (695-853)||(45948851-45949012)
chr3 (721-850)||(33926094-33926224)
chr3 (738-866)||(10795423-10795554)
chr3 (695-853)||(25944455-25944614)
chr3 (686-842)||(12525386-12525540)
chr3 (742-868)||(14986989-14987118)
chr3 (708-853)||(19731000-19731146)
chr3 (708-853)||(19751576-19751722)
chr3 (725-849)||(54374362-54374488)
chr3 (695-853)||(44403568-44403727)
chr3 (721-841)||(45139502-45139624)
chr3 (756-835)||(47624088-47624167)
chr3 (721-816)||(54032609-54032705)
chr3 (756-866)||(45786214-45786327)
chr3 (693-853)||(33235513-33235675)
chr3 (759-866)||(15797271-15797377)
chr3 (695-776)||(35417902-35417982)
chr3 (712-800)||(39211992-39212081)
chr3 (753-866)||(49013473-49013589)
chr3 (708-776)||(53062036-53062104)
chr3 (697-853)||(829455-829611)
chr3 (689-806)||(21874999-21875111)
chr3 (742-842)||(55401208-55401310)
chr3 (773-866)||(34771364-34771457)
chr3 (48-116)||(10858101-10858169)
chr3 (689-776)||(26782345-26782432)
chr3 (729-817)||(52428526-52428616)
chr3 (736-841)||(9276284-9276395)
chr3 (708-850)||(28904941-28905084)
chr3 (684-816)||(43956510-43956642)
chr3 (716-820)||(8410913-8411016)
chr3 (772-864)||(353351-353445)
chr3 (743-852)||(43114882-43114994)
chr3 (697-819)||(29106537-29106659)
chr3 (749-853)||(31904869-31904975)
chr3 (710-813)||(1121277-1121382)
chr3 (686-764)||(4537007-4537085)
chr3 (686-725)||(9276250-9276289)
chr3 (701-776)||(11461732-11461807)
chr3 (803-866)||(24851301-24851364)
chr3 (748-866)||(50624953-50625072)
chr3 (749-814)||(31672732-31672798)
chr3 (707-776)||(9627712-9627781)
chr3 (689-726)||(23871418-23871455)
chr3 (752-809)||(31831241-31831297)
chr3 (806-866)||(30452892-30452952)
chr3 (811-866)||(10484616-10484671)
chr3 (695-821)||(21330291-21330418)
chr3 (806-868)||(14266370-14266431)
chr3 (756-801)||(8325066-8325111)
chr3 (685-730)||(39430464-39430509)
[»] chr4 (97 HSPs)
chr4 (686-866)||(5648213-5648393)
chr4 (686-865)||(6430627-6430806)
chr4 (686-866)||(30639334-30639514)
chr4 (686-866)||(48598825-48599004)
chr4 (686-867)||(20224938-20225118)
chr4 (685-866)||(47528530-47528710)
chr4 (686-866)||(5306660-5306844)
chr4 (705-853)||(40915802-40915950)
chr4 (685-866)||(11054148-11054328)
chr4 (693-866)||(16408601-16408777)
chr4 (689-866)||(16911519-16911699)
chr4 (685-866)||(23501746-23501924)
chr4 (685-863)||(21646917-21647098)
chr4 (705-866)||(44363130-44363294)
chr4 (685-852)||(37494804-37494972)
chr4 (686-868)||(55766464-55766647)
chr4 (712-866)||(54175043-54175200)
chr4 (691-866)||(30352580-30352767)
chr4 (707-866)||(47443928-47444092)
chr4 (689-850)||(14983791-14983953)
chr4 (710-866)||(9832313-9832468)
chr4 (690-815)||(14590795-14590922)
chr4 (712-827)||(17043433-17043549)
chr4 (724-864)||(29207900-29208039)
chr4 (686-853)||(55830734-55830902)
chr4 (708-866)||(35567146-35567305)
chr4 (689-866)||(54730206-54730387)
chr4 (684-866)||(13256399-13256580)
chr4 (689-790)||(17315375-17315476)
chr4 (715-855)||(41018805-41018945)
chr4 (707-853)||(19027823-19027970)
chr4 (697-865)||(8473621-8473790)
chr4 (686-868)||(20405047-20405226)
chr4 (710-853)||(30690189-30690340)
chr4 (696-853)||(30496335-30496491)
chr4 (695-813)||(487187-487306)
chr4 (715-842)||(7385500-7385628)
chr4 (749-866)||(20639658-20639777)
chr4 (686-847)||(10660358-10660521)
chr4 (686-847)||(10874503-10874666)
chr4 (718-842)||(25463108-25463233)
chr4 (713-862)||(39077800-39077948)
chr4 (697-827)||(47441569-47441699)
chr4 (698-848)||(49938611-49938759)
chr4 (687-823)||(54966977-54967112)
chr4 (710-842)||(32478815-32478942)
chr4 (685-853)||(20908649-20908819)
chr4 (717-850)||(32629285-32629418)
chr4 (708-848)||(39029078-39029220)
chr4 (697-791)||(42164224-42164317)
chr4 (710-866)||(23580208-23580365)
chr4 (752-842)||(49796818-49796908)
chr4 (696-821)||(25343152-25343279)
chr4 (750-865)||(7909281-7909397)
chr4 (695-827)||(30581504-30581638)
chr4 (756-853)||(51865051-51865149)
chr4 (720-866)||(7038041-7038187)
chr4 (695-853)||(36589708-36589866)
chr4 (695-814)||(49938490-49938610)
chr4 (744-861)||(21489099-21489218)
chr4 (752-866)||(25629069-25629184)
chr4 (708-790)||(43035224-43035307)
chr4 (744-853)||(9987847-9987957)
chr4 (709-827)||(3580879-3580994)
chr4 (689-762)||(5313099-5313172)
chr4 (695-776)||(54640430-54640510)
chr4 (695-801)||(51420537-51420644)
chr4 (736-842)||(10277781-10277886)
chr4 (695-772)||(12257688-12257764)
chr4 (780-866)||(20225123-20225211)
chr4 (772-866)||(36816384-36816479)
chr4 (804-866)||(38755908-38755970)
chr4 (772-832)||(4222062-4222122)
chr4 (689-729)||(18969698-18969738)
chr4 (687-763)||(20373898-20373974)
chr4 (695-775)||(41549346-41549425)
chr4 (695-759)||(50856344-50856407)
chr4 (803-866)||(11394924-11394987)
chr4 (803-866)||(11404651-11404714)
chr4 (795-866)||(38786673-38786744)
chr4 (741-826)||(17079691-17079777)
chr4 (804-866)||(33836487-33836549)
chr4 (707-827)||(44357195-44357317)
chr4 (723-812)||(10379997-10380086)
chr4 (780-865)||(12711450-12711535)
chr4 (805-866)||(32484307-32484368)
chr4 (805-866)||(40553937-40553998)
chr4 (773-850)||(16494259-16494338)
chr4 (802-866)||(47482850-47482914)
chr4 (710-800)||(6966070-6966160)
chr4 (804-866)||(25388249-25388311)
chr4 (686-740)||(29879624-29879678)
chr4 (772-825)||(35894502-35894556)
chr4 (710-776)||(7227710-7227776)
chr4 (816-866)||(35532077-35532127)
chr4 (804-866)||(50555656-50555718)
chr4 (805-866)||(44718641-44718702)
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (685-866)||(8455316-8455498)
chr2 (687-868)||(10543653-10543837)
chr2 (684-827)||(12023958-12024101)
chr2 (686-866)||(14530272-14530455)
chr2 (686-866)||(9671134-9671314)
chr2 (686-866)||(21779261-21779440)
chr2 (688-866)||(11514392-11514570)
chr2 (686-872)||(25079711-25079899)
chr2 (689-866)||(25249738-25249915)
chr2 (687-866)||(24200623-24200805)
chr2 (686-835)||(22371011-22371158)
chr2 (686-866)||(23397720-23397899)
chr2 (688-853)||(19977727-19977893)
chr2 (688-866)||(17896215-17896395)
chr2 (692-866)||(27573581-27573755)
chr2 (686-866)||(5840982-5841165)
chr2 (682-853)||(7214484-7214658)
chr2 (723-866)||(14444720-14444863)
chr2 (723-866)||(10546153-10546298)
chr2 (703-866)||(17623535-17623699)
chr2 (703-866)||(17667973-17668137)
chr2 (687-866)||(14544018-14544201)
chr2 (695-855)||(99276-99434)
chr2 (696-853)||(24860001-24860157)
chr2 (710-827)||(5450263-5450382)
chr2 (687-842)||(32781312-32781467)
chr2 (686-853)||(26684633-26684803)
chr2 (698-866)||(39914306-39914475)
chr2 (748-866)||(36871509-36871626)
chr2 (686-801)||(17705449-17705565)
chr2 (708-866)||(21377074-21377232)
chr2 (717-850)||(25641487-25641620)
chr2 (695-850)||(4516367-4516522)
chr2 (708-842)||(33795261-33795396)
chr2 (695-842)||(17380261-17380407)
chr2 (695-866)||(44643486-44643658)
chr2 (708-827)||(23145737-23145857)
chr2 (708-827)||(23557527-23557647)
chr2 (707-866)||(40416871-40417031)
chr2 (710-849)||(31158456-31158598)
chr2 (709-866)||(4795730-4795890)
chr2 (752-868)||(40762232-40762349)
chr2 (695-847)||(44521392-44521544)
chr2 (704-785)||(44604826-44604907)
chr2 (709-863)||(45235820-45235976)
chr2 (721-853)||(19614981-19615115)
chr2 (772-854)||(24890452-24890534)
chr2 (708-801)||(29419950-29420048)
chr2 (733-850)||(13245111-13245220)
chr2 (772-868)||(25632550-25632646)
chr2 (747-853)||(30826052-30826157)
chr2 (717-853)||(31821356-31821491)
chr2 (726-810)||(2003592-2003678)
chr2 (695-836)||(15296436-15296580)
chr2 (686-732)||(39189556-39189602)
chr2 (721-853)||(44449396-44449529)
chr2 (728-853)||(17471544-17471672)
chr2 (687-776)||(17472926-17473015)
chr2 (695-763)||(35017781-35017849)
chr2 (685-735)||(27466262-27466312)
chr2 (690-776)||(4852305-4852388)
chr2 (805-865)||(40579750-40579810)
chr2 (731-821)||(12315697-12315787)
chr2 (787-866)||(23488537-23488618)
chr2 (747-809)||(30864474-30864536)
chr2 (709-770)||(34752759-34752820)
chr2 (806-866)||(34080176-34080236)
chr2 (806-852)||(34766330-34766376)
chr2 (812-868)||(3633706-3633762)
chr2 (765-853)||(39499243-39499331)
chr2 (774-866)||(19185743-19185837)
chr2 (805-864)||(41409936-41409995)
chr2 (682-728)||(39499353-39499399)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (686-866)||(30454097-30454276)
chr8 (681-865)||(45071214-45071398)
chr8 (684-866)||(12670250-12670431)
chr8 (686-866)||(13160656-13160836)
chr8 (686-866)||(28817626-28817807)
chr8 (686-866)||(36720750-36720931)
chr8 (684-866)||(35261631-35261814)
chr8 (686-866)||(39460994-39461177)
chr8 (683-866)||(44530100-44530284)
chr8 (684-868)||(29521683-29521868)
chr8 (685-866)||(7136527-7136711)
chr8 (686-866)||(17823530-17823711)
chr8 (684-853)||(20284082-20284256)
chr8 (686-862)||(18164764-18164940)
chr8 (684-853)||(21070710-21070885)
chr8 (685-866)||(26954085-26954270)
chr8 (686-853)||(2626473-2626644)
chr8 (686-842)||(20869524-20869677)
chr8 (686-866)||(6760777-6760959)
chr8 (695-864)||(44781506-44781677)
chr8 (691-866)||(8897764-8897940)
chr8 (701-866)||(12625858-12626025)
chr8 (690-866)||(25250480-25250659)
chr8 (695-868)||(28407379-28407540)
chr8 (709-842)||(24365083-24365218)
chr8 (685-847)||(24245404-24245565)
chr8 (695-865)||(42083699-42083870)
chr8 (708-841)||(22598133-22598267)
chr8 (718-825)||(23000260-23000365)
chr8 (714-866)||(31457155-31457307)
chr8 (687-823)||(11748254-11748393)
chr8 (695-853)||(8483951-8484109)
chr8 (738-842)||(5135313-5135418)
chr8 (749-853)||(29877111-29877216)
chr8 (711-827)||(35105902-35106020)
chr8 (731-853)||(389642-389767)
chr8 (695-827)||(14018007-14018140)
chr8 (741-853)||(5689640-5689753)
chr8 (708-842)||(11000973-11001109)
chr8 (749-866)||(10857845-10857964)
chr8 (687-853)||(44742531-44742698)
chr8 (695-776)||(30962864-30962944)
chr8 (686-866)||(40604906-40605086)
chr8 (750-866)||(20869941-20870060)
chr8 (753-866)||(19729363-19729475)
chr8 (743-853)||(17250888-17251001)
chr8 (792-866)||(26102578-26102652)
chr8 (756-822)||(43942348-43942417)
chr8 (758-866)||(16225045-16225156)
chr8 (686-729)||(23286431-23286474)
chr8 (687-761)||(27634983-27635058)
chr8 (803-866)||(35107311-35107374)
chr8 (758-816)||(23286375-23286432)
chr8 (780-853)||(26457778-26457849)
chr8 (688-760)||(31454144-31454216)
chr8 (710-852)||(36918102-36918245)
chr8 (802-852)||(18595909-18595959)
chr8 (685-723)||(42840862-42840900)
chr8 (788-866)||(16013511-16013591)
chr8 (805-865)||(36486567-36486627)
chr8 (806-853)||(27507985-27508032)
chr8 (723-776)||(3377507-3377560)
chr8 (817-866)||(27468092-27468141)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (686-866)||(41014273-41014453)
chr5 (686-866)||(38879535-38879718)
chr5 (686-866)||(24448844-24449025)
chr5 (685-866)||(8169984-8170164)
chr5 (689-866)||(43334159-43334339)
chr5 (686-866)||(35710267-35710446)
chr5 (689-866)||(4619104-4619284)
chr5 (689-852)||(27328709-27328875)
chr5 (719-866)||(32703411-32703557)
chr5 (685-866)||(1565384-1565566)
chr5 (695-855)||(19142954-19143113)
chr5 (687-842)||(2838733-2838889)
chr5 (686-796)||(37024626-37024735)
chr5 (686-842)||(22600408-22600565)
chr5 (695-853)||(208940-209098)
chr5 (689-866)||(22861669-22861844)
chr5 (686-801)||(22187239-22187355)
chr5 (695-853)||(39301087-39301245)
chr5 (687-853)||(43574553-43574728)
chr5 (692-862)||(30006285-30006456)
chr5 (686-776)||(23974735-23974824)
chr5 (716-853)||(1850624-1850761)
chr5 (697-865)||(12006329-12006500)
chr5 (708-850)||(28516449-28516593)
chr5 (717-842)||(22907888-22908014)
chr5 (756-853)||(7097773-7097870)
chr5 (741-866)||(13801767-13801895)
chr5 (747-863)||(7368413-7368528)
chr5 (757-866)||(16880647-16880757)
chr5 (691-800)||(31299591-31299700)
chr5 (751-865)||(20135623-20135740)
chr5 (709-866)||(3771318-3771474)
chr5 (715-842)||(1405170-1405298)
chr5 (752-866)||(29334415-29334531)
chr5 (710-855)||(24323717-24323862)
chr5 (710-855)||(24360341-24360486)
chr5 (710-866)||(24313572-24313732)
chr5 (710-866)||(24355909-24356069)
chr5 (791-866)||(16957374-16957449)
chr5 (712-822)||(34074606-34074717)
chr5 (707-827)||(18698586-18698705)
chr5 (780-866)||(34154814-34154900)
chr5 (747-852)||(5873336-5873441)
chr5 (709-853)||(31694121-31694266)
chr5 (695-846)||(10634175-10634317)
chr5 (724-853)||(42924843-42924977)
chr5 (727-789)||(22025538-22025601)
chr5 (695-758)||(39079875-39079937)
chr5 (736-822)||(41425952-41426039)
chr5 (697-762)||(17419879-17419944)
chr5 (685-742)||(19438702-19438759)
chr5 (802-863)||(21784335-21784396)
chr5 (750-866)||(12575660-12575779)
chr5 (708-826)||(24903736-24903855)
chr5 (791-853)||(39079764-39079827)
chr5 (804-868)||(25622533-25622597)
chr5 (791-866)||(37225961-37226037)
chr5 (782-825)||(12477161-12477205)
chr5 (793-847)||(10306493-10306548)
chr5 (815-866)||(32354211-32354262)
chr5 (686-724)||(41956886-41956924)
chr5 (707-748)||(31362454-31362495)
chr5 (781-823)||(11657742-11657785)
chr5 (807-866)||(16028624-16028683)
chr5 (781-853)||(3176770-3176839)
chr5 (715-761)||(9794465-9794511)
chr5 (787-853)||(13774921-13774987)
chr5 (710-739)||(28208235-28208264)
[»] chr1 (99 HSPs)
chr1 (686-866)||(34725098-34725277)
chr1 (685-853)||(32632570-32632738)
chr1 (686-866)||(14617015-14617196)
chr1 (686-866)||(46247953-46248134)
chr1 (686-866)||(27201624-27201807)
chr1 (685-866)||(18944619-18944804)
chr1 (685-866)||(10668196-10668385)
chr1 (692-866)||(30395726-30395903)
chr1 (686-863)||(46991781-46991959)
chr1 (685-866)||(20004090-20004274)
chr1 (685-866)||(38478282-38478462)
chr1 (686-866)||(27474258-27474438)
chr1 (685-853)||(47214487-47214654)
chr1 (686-866)||(41319806-41319987)
chr1 (683-827)||(22930108-22930251)
chr1 (689-852)||(23768334-23768498)
chr1 (692-866)||(12126837-12127010)
chr1 (691-863)||(45402077-45402251)
chr1 (705-862)||(6925096-6925254)
chr1 (685-862)||(45812541-45812717)
chr1 (690-866)||(19414420-19414595)
chr1 (686-866)||(8197020-8197201)
chr1 (696-827)||(18724584-18724715)
chr1 (696-842)||(11596501-11596646)
chr1 (691-866)||(18741957-18742137)
chr1 (695-853)||(2435799-2435958)
chr1 (692-866)||(9939443-9939622)
chr1 (686-837)||(19932782-19932933)
chr1 (723-866)||(35253187-35253329)
chr1 (696-817)||(33222971-33223093)
chr1 (708-853)||(35117778-35117927)
chr1 (725-866)||(35005139-35005283)
chr1 (709-842)||(25468287-25468421)
chr1 (696-842)||(20036208-20036355)
chr1 (686-842)||(44485133-44485289)
chr1 (695-853)||(19701557-19701716)
chr1 (695-866)||(6983811-6983980)
chr1 (695-866)||(50811926-50812098)
chr1 (684-812)||(4430080-4430209)
chr1 (695-821)||(17470390-17470517)
chr1 (750-866)||(31382214-31382330)
chr1 (695-853)||(15511161-15511322)
chr1 (720-866)||(19974074-19974221)
chr1 (695-812)||(22327086-22327204)
chr1 (686-761)||(34714600-34714675)
chr1 (772-866)||(4349702-4349796)
chr1 (695-853)||(10378748-10378896)
chr1 (689-776)||(25290143-25290232)
chr1 (695-842)||(27136675-27136823)
chr1 (690-849)||(18335305-18335465)
chr1 (719-866)||(31272381-31272522)
chr1 (695-853)||(35019217-35019374)
chr1 (695-801)||(50760291-50760397)
chr1 (688-753)||(40424721-40424786)
chr1 (741-853)||(22324925-22325038)
chr1 (687-809)||(24564322-24564445)
chr1 (695-776)||(2435984-2436064)
chr1 (751-866)||(23796507-23796623)
chr1 (695-821)||(23371111-23371236)
chr1 (740-842)||(30682845-30682946)
chr1 (725-853)||(45264412-45264542)
chr1 (687-773)||(21723642-21723727)
chr1 (695-789)||(25554800-25554893)
chr1 (743-853)||(31442402-31442515)
chr1 (709-853)||(39214971-39215117)
chr1 (772-866)||(42304207-42304303)
chr1 (695-776)||(52910204-52910284)
chr1 (761-866)||(1517311-1517418)
chr1 (700-773)||(22151495-22151568)
chr1 (789-853)||(4249456-4249520)
chr1 (789-853)||(4249780-4249844)
chr1 (789-853)||(4250104-4250168)
chr1 (687-798)||(18335914-18336026)
chr1 (760-866)||(20999850-20999957)
chr1 (697-811)||(34679274-34679388)
chr1 (780-842)||(15505636-15505698)
chr1 (761-823)||(21910692-21910754)
chr1 (684-776)||(10163734-10163826)
chr1 (710-816)||(19656155-19656263)
chr1 (774-866)||(43768205-43768297)
chr1 (802-866)||(50606497-50606561)
chr1 (702-796)||(14987989-14988084)
chr1 (690-757)||(21006125-21006192)
chr1 (753-836)||(21723728-21723811)
chr1 (785-851)||(4430014-4430080)
chr1 (719-761)||(43768168-43768210)
chr1 (751-827)||(34148999-34149076)
chr1 (713-854)||(49722585-49722726)
chr1 (750-797)||(44745854-44745900)
chr1 (749-842)||(20169113-20169207)
chr1 (806-855)||(33594142-33594191)
chr1 (780-850)||(6358193-6358264)
chr1 (693-740)||(28894658-28894704)
chr1 (807-854)||(37299573-37299620)
chr1 (219-286)||(44420563-44420630)
chr1 (803-853)||(4587576-4587626)
chr1 (803-853)||(30555210-30555260)
chr1 (772-853)||(46859130-46859212)
chr1 (697-750)||(49546024-49546076)
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (685-866)||(21172009-21172189)
chr7 (686-866)||(32758215-32758394)
chr7 (686-866)||(2541019-2541201)
chr7 (693-866)||(10693073-10693245)
chr7 (686-866)||(48735122-48735302)
chr7 (685-866)||(42798622-42798804)
chr7 (686-866)||(42805478-42805661)
chr7 (692-866)||(40463837-40464011)
chr7 (686-866)||(34626208-34626388)
chr7 (706-853)||(33871923-33872070)
chr7 (685-866)||(43557425-43557610)
chr7 (693-865)||(11617589-11617762)
chr7 (686-866)||(47716413-47716596)
chr7 (684-827)||(46354146-46354292)
chr7 (694-866)||(27629596-27629769)
chr7 (685-822)||(47077899-47078035)
chr7 (714-866)||(42391100-42391251)
chr7 (684-866)||(22698967-22699153)
chr7 (686-853)||(35334829-35334995)
chr7 (686-821)||(42476827-42476961)
chr7 (697-866)||(19426890-19427059)
chr7 (697-828)||(19265781-19265911)
chr7 (733-866)||(7879639-7879773)
chr7 (685-855)||(13805056-13805224)
chr7 (695-852)||(23419688-23419845)
chr7 (731-864)||(18512455-18512588)
chr7 (695-830)||(28362181-28362316)
chr7 (686-786)||(42495916-42496016)
chr7 (690-853)||(14732834-14732999)
chr7 (708-865)||(29907393-29907552)
chr7 (687-789)||(18326989-18327091)
chr7 (687-852)||(8148960-8149126)
chr7 (695-846)||(48123504-48123655)
chr7 (686-823)||(28078175-28078312)
chr7 (729-866)||(31591109-31591245)
chr7 (695-842)||(19266414-19266561)
chr7 (686-816)||(2662985-2663112)
chr7 (695-865)||(3469176-3469350)
chr7 (698-866)||(39123857-39124030)
chr7 (687-819)||(5180202-5180337)
chr7 (708-823)||(14099049-14099165)
chr7 (708-823)||(14409066-14409182)
chr7 (711-825)||(11741774-11741887)
chr7 (718-853)||(18747472-18747609)
chr7 (709-830)||(6736867-6736987)
chr7 (686-774)||(7193039-7193127)
chr7 (686-801)||(12473258-12473374)
chr7 (691-776)||(7794597-7794682)
chr7 (757-866)||(35787269-35787378)
chr7 (707-821)||(7644931-7645047)
chr7 (723-866)||(38262196-38262340)
chr7 (751-847)||(38604546-38604642)
chr7 (708-853)||(16341254-16341401)
chr7 (695-847)||(44123641-44123792)
chr7 (715-822)||(32233179-32233286)
chr7 (744-837)||(1408469-1408563)
chr7 (723-866)||(23231550-23231692)
chr7 (692-801)||(1423975-1424085)
chr7 (686-776)||(21447544-21447634)
chr7 (689-866)||(25198679-25198861)
chr7 (736-836)||(15108427-15108527)
chr7 (707-850)||(22065563-22065706)
chr7 (695-851)||(42101899-42102056)
chr7 (736-853)||(21566439-21566558)
chr7 (783-866)||(27889316-27889399)
chr7 (730-821)||(35203437-35203531)
chr7 (763-854)||(21139760-21139851)
chr7 (689-740)||(29140487-29140538)
chr7 (694-776)||(5814433-5814515)
chr7 (774-841)||(33500556-33500625)
chr7 (784-853)||(36267830-36267900)
chr7 (783-868)||(45018921-45019010)
chr7 (829-866)||(18327090-18327127)
chr7 (687-736)||(45019007-45019056)
chr7 (708-772)||(1524281-1524345)
chr7 (702-742)||(28685259-28685299)
chr7 (772-830)||(17048851-17048910)
chr7 (251-286)||(21454616-21454651)
chr7 (791-866)||(23618977-23619052)
chr7 (808-866)||(11888414-11888472)
chr7 (710-751)||(11458380-11458421)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (686-866)||(1346918-1347097)
chr6 (686-866)||(1354757-1354936)
chr6 (686-866)||(29355855-29356039)
chr6 (696-866)||(12221914-12222088)
chr6 (686-866)||(9161077-9161259)
chr6 (688-853)||(3815090-3815256)
chr6 (686-866)||(1941809-1941990)
chr6 (686-864)||(15866041-15866218)
chr6 (691-866)||(2166410-2166587)
chr6 (691-866)||(2178043-2178220)
chr6 (686-805)||(8409197-8409317)
chr6 (695-854)||(7947383-7947543)
chr6 (685-866)||(23930127-23930308)
chr6 (684-827)||(6024185-6024331)
chr6 (686-776)||(14975171-14975261)
chr6 (687-811)||(13905034-13905158)
chr6 (681-816)||(20400616-20400752)
chr6 (718-864)||(23240826-23240971)
chr6 (710-822)||(28007604-28007717)
chr6 (697-842)||(14553477-14553624)
chr6 (696-850)||(24097545-24097696)
chr6 (750-866)||(26097178-26097293)
chr6 (695-852)||(12889390-12889548)
chr6 (737-853)||(33138838-33138955)
chr6 (685-839)||(24734586-24734752)
chr6 (750-866)||(25557743-25557858)
chr6 (689-776)||(12063424-12063511)
chr6 (686-842)||(22967125-22967287)
chr6 (686-842)||(23821106-23821268)
chr6 (742-849)||(32579436-32579543)
chr6 (717-866)||(18277193-18277343)
chr6 (685-768)||(33922927-33923010)
chr6 (698-866)||(3116129-3116299)
chr6 (724-866)||(17432332-17432483)
chr6 (689-866)||(32728157-32728334)
chr6 (731-864)||(15865859-15865992)
chr6 (804-866)||(6808468-6808530)
chr6 (702-761)||(8417442-8417501)
chr6 (708-822)||(2755466-2755583)
chr6 (787-866)||(12885967-12886048)
chr6 (710-819)||(32068074-32068182)
chr6 (794-866)||(13267788-13267860)
chr6 (704-801)||(27855502-27855601)
chr6 (695-823)||(11849019-11849146)
chr6 (696-742)||(19649292-19649338)
chr6 (754-867)||(13628255-13628370)
chr6 (747-852)||(19340843-19340949)
chr6 (804-866)||(12892082-12892144)
chr6 (789-866)||(383760-383837)
chr6 (724-796)||(17448316-17448389)
chr6 (714-793)||(4136590-4136670)
chr6 (769-820)||(18254556-18254607)
chr6 (756-819)||(9671131-9671196)
chr6 (801-866)||(10734905-10734970)
[»] scaffold0258 (2 HSPs)
scaffold0258 (683-866)||(13024-13207)
scaffold0258 (687-729)||(17507-17549)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (686-866)||(30533-30712)
[»] scaffold0057 (5 HSPs)
scaffold0057 (695-866)||(46794-46966)
scaffold0057 (686-852)||(24786-24948)
scaffold0057 (745-866)||(43672-43793)
scaffold0057 (695-755)||(46995-47054)
scaffold0057 (780-852)||(46721-46794)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (689-864)||(10052-10226)
scaffold0187 (689-864)||(20380-20554)
scaffold0187 (686-751)||(8899-8964)
scaffold0187 (686-751)||(19227-19292)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (693-866)||(11093-11264)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (695-866)||(10773-10945)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (691-866)||(58936-59114)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (694-853)||(1600-1758)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (690-815)||(226456-226583)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (691-827)||(4117-4256)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (686-835)||(35048-35200)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (694-868)||(72865-73034)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (741-866)||(48634-48758)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (686-760)||(83829-83903)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (723-866)||(3537-3679)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (695-842)||(23567-23710)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (690-778)||(43085-43175)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (687-763)||(24619-24695)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (685-778)||(8847-8937)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (780-866)||(24133-24219)
[»] scaffold0867 (1 HSPs)
scaffold0867 (736-850)||(3685-3798)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (760-842)||(58653-58742)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (708-816)||(32906-33016)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10870811 - 10870364
Alignment:
Q  8 caaattgaggaaatcattcacataccttcagtataagcataggcatcccatatactaggacctctaccaccctccttgctagcaccttctatctagaaac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870811 caaattgaggaaatcattcacataccttcagtataagcataggcatcccatatactaggacctctaccaccctccttgctagcaccttctatctagaaac 10870712  T
Q  108 aagcaacaagttatagtttcagaaaaaactgaattcacttggatcgatc----cacataccaataccattactgattagaccaccggttaaaaacaaaga 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10870711 aagcaaaaagttatagtttcagaaaaaactaaattaacttggatctatctatccacataccaataccattactcattagaccaccggttaaaaacaaaga 10870612  T
Q  204 ttagttttgcctacaaaaaaggcctagcagcgcagcttgctgctcggttgccttccactcatgtgtacttttttgtatgtatacaatgatttatttcaaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||  ||||||||||||||||    
T  10870611 ttagttttgcctacaaaaaaggcctagcagcgcagcttgctgctcggttgccttccactcatgtgtattttttt---tgtatgtaatgatttatttcaaa 10870515  T
Q  304 aatgaagtcatttataagtctagaatttgtaattaacttttacaaaattataggaccaacaacagaataatttaacatagaaaaccatggatatgttaga 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870514 aatgaagtcatttataagtctagaatttgtaattaacttttacaaaattataggatcaacaacagaataatttaacatagaaaaccatggatatgttaga 10870415  T
Q  404 ataacatagaagtgatcgtctaagtcatgtgatatcaatgtatcgttgatg 454  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870414 ataacatagaagtgaccgtctaagtcatgtgatatcaatgtatcgttgatg 10870364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 527 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 10870291 - 10870025
Alignment:
Q  527 tctgcattcttttcacaacaaagcaataaataatcaacggtaaattttcaatttcaagatcaagataaatgatctctagcttcatgcactccaaacatta 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10870291 tctgcattcttttcacaacaaagcaataaataatcaacggtaaattttcaatttcaagatcaagataaatgatctctagcttcatgcactccaagcatta 10870192  T
Q  627 gtgaccaatgcatcaatacccgacagttcaaatttcaagcttgctattttggaattatagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870191 gtgaccaatgcatcaatacccgacagttcaaatttcaagcttgctgttttggaattatagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt 10870092  T
Q  727 gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10870091 gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgta 10870025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 40272993 - 40272812
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  40272993 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 40272894  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  40272893 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40272812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 686 - 865
Target Start/End: Original strand, 22609743 - 22609921
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22609743 gaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 22609841  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  22609842 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 22609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 13628974 - 13628790
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa-aaacaaggta 783  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13628974 gaggggtaaccttggcacaactggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggta 13628875  T
Q  784 aggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  13628874 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13628790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 681 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 13730790 - 13730602
Alignment:
Q  681 ttatagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaa 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  13730790 ttatagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacag 13730691  T
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  13730690 ggtaaggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13730602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 1217066 - 1217245
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1217066 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 1217164  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  1217165 gctgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1217245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 16735417 - 16735597
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  16735417 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaag 16735516  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  16735517 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgcccttt 16735597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 39203492 - 39203671
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39203492 gaggggtaaccttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 39203590  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  39203591 gttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 39203671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 686 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 8247870 - 8247688
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8247870 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 8247771  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt-agtgcactgagttgccct 864  Q
    || ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  8247770 ggttgcgtacaatacaccaataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcactgggttgccct 8247688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 699 - 866
Target Start/End: Original strand, 26869696 - 26869863
Alignment:
Q  699 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaata 798  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26869696 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 26869795  T
Q  799 cacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  26869796 caccaaatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttt 26869863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 687 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 29366902 - 29366720
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  29366902 aggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaag 29366803  T
Q  786 gctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29366802 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgcccttt 29366720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 685 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 46421219 - 46421054
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggta 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46421219 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 46421120  T
Q  784 aggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  46421119 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 46421054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 5173902 - 5173719
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5173902 gaggggtaaccttggcgcaactcgtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaaagtaa 5173803  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || ||| | ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  5173802 ggttgcatgcaatacaccaaaaatggtggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 5173719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 686 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 6412002 - 6411835
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6412002 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 6411903  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6411902 gctgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcac 6411835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 52926391 - 52926219
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||    
T  52926391 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--------gtaag 52926300  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||    
T  52926299 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgcccttt 52926219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 690 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 22123092 - 22122918
Alignment:
Q  690 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctg 789  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22123092 ggtaaccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaacagggtaaggctg 22122994  T
Q  790 cgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| | |||||||| | |||||||||    
T  22122993 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgccctt 22122918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 34420815 - 34420656
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34420815 ccttggcgcaacag-taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 34420717  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  34420716 ccatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcac 34420656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 12914217 - 12914035
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggta 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12914217 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 12914118  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||| || | ||||| | ||||||||||    
T  12914117 aggcggcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgcccttt 12914035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 686 - 853
Target Start/End: Original strand, 26573104 - 26573271
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  26573104 gagggggacccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaa 26573202  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||    
T  26573203 ggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcac 26573271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 686 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 7697066 - 7696945
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  7697066 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaacagggtaag 7696968  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatgg 808  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  7696967 gctgcgtacaatacaccaaatgg 7696945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 686 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 4495845 - 4495714
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| |||||    
T  4495845 gaggggtaaccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaa 4495746  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccc 816  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4495745 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 4495714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 687 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 25517353 - 25517170
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagt--cctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggt 782  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | | |   |||||||||| |||||||||||||||  |||| |    
T  25517353 agggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagat 25517254  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  25517253 atggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgcccttt 25517170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 686 - 849
Target Start/End: Original strand, 9607179 - 9607345
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  9607179 gaggggtaaccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaa 9607278  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagt 849  Q
    ||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||| ||||  |  |||||||||| ||||||    
T  9607279 ggctgcgtagaatacaccaataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 9607345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 718 - 866
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516569
Alignment:
Q  718 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaata---cacaaaatggtggga 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||   || ||||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  814 ccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 516569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 750 - 866
Target Start/End: Original strand, 54484730 - 54484848
Alignment:
Q  750 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--acaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  54484730 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 54484829  T
Q  848 gtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  54484830 gtgcaccgggttgcccttt 54484848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943143
Alignment:
Q  713 agttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgg 811  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatcaaatggtgg 7943092  T
Q  812 gaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcc 862  Q
    || ||||| || |||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7943093 gatccctttccagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcc 7943143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 686 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 45621009 - 45620881
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaaacaaggta 783  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  45621009 gagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 45620911  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtggga 813  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45620910 aggctgcgtacaatacaccaattggtggga 45620881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 739 - 868
Target Start/End: Original strand, 31592878 - 31593006
Alignment:
Q  739 acgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcg 838  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||    
T  31592878 acgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggactccttcccggaccctgcatatgcg 31592976  T
Q  839 ggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    |||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31592977 ggagctctagtgcaccgggttgccctttgc 31593006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 695 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 53996737 - 53996565
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  53996737 ccttggcgctac-ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgctta 53996639  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||| |||||||||| | | ||||||||    
T  53996638 caatacaccaaaatggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 53996565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 712 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 30928302 - 30928186
Alignment:
Q  712 aagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtg 810  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| || ||| |    
T  30928302 aagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaattggcg 30928203  T
Q  811 ggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||||||||||||    
T  30928202 ggaccccttcccggacc 30928186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 45949012 - 45948851
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaa---aggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taaggctgc 790  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  45949012 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttttcatgtgactgaaggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgc 45948914  T
Q  791 gtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  45948913 atacaatacaccaattggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 45948851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 721 - 850
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926224
Alignment:
Q  721 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggacccctt 819  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccataatggtgggacccctt 33926193  T
Q  820 cccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    || ||||| ||  |||||| ||| |||||||    
T  33926194 cctggaccctgcatatgcgagagctttagtg 33926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 738 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 10795554 - 10795423
Alignment:
Q  738 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgta 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  10795554 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgta 10795455  T
Q  835 tgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||| || |||||||   ||||||||||    
T  10795454 tgcgggagcttcagtgcaccaggttgcccttt 10795423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Original strand, 25944455 - 25944614
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  || ||||||| |||    
T  25944455 ccttggcgcaacag-taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagta 25944553  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| ||||    
T  25944554 caatacaccaaaatggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcac 25944614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Original strand, 12525386 - 12525540
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12525386 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgt---catatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaa 12525482  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||| |  | ||  ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  12525483 ggctgcgaagtacaccaaaaatggtgggacaccttcctagaccctgtgtatacgggag 12525540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 742 - 868
Target Start/End: Original strand, 14986989 - 14987118
Alignment:
Q  742 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaa--atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcg 838  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  14986989 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcg 14987088  T
Q  839 ggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||    
T  14987089 ggagctttagtgcaccgggtttccctttgc 14987118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 708 - 853
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731146
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19731099  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  19731100 ggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcac 19731146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 708 - 853
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751722
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19751675  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  19751676 ggtgggaccctttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcac 19751722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 725 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 54374488 - 54374362
Alignment:
Q  725 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggaccccttccc 822  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  54374488 gtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaaaatggtgggaccccttccc 54374389  T
Q  823 ggaccttgtgtatgcgggaggtttagt 849  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  54374388 ggaccctgcatatgcgggagctttagt 54374362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 44403727 - 44403568
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  44403727 ccttggtgcaac-ggtaaagttattgtcacgtggctaaaaggtcacaggttaaagtcctgggaatagcctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcgga 44403629  T
Q  794 caata-cacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | || ||||||||||    
T  44403628 gaataccacaaaatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcac 44403568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 721 - 841
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139502
Alignment:
Q  721 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggacccc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  818 ttcccggaccttgtgtatgcggga 841  Q
    ||||| |||| || ||||||||||    
T  45139524 ttcccagacc-tgcgtatgcggga 45139502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 756 - 835
Target Start/End: Original strand, 47624088 - 47624167
Alignment:
Q  756 aaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtat 835  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47624088 aaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgtgtat 47624167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 721 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032609
Alignment:
Q  721 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccc 816  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccgaatggtgggaccc 54032609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 756 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 45786327 - 45786214
Alignment:
Q  756 aaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| |||||||||    
T  45786327 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgca 45786228  T
Q  853 ctgagttgcccttt 866  Q
    | | ||||||||||    
T  45786227 ccgggttgcccttt 45786214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 693 - 853
Target Start/End: Original strand, 33235513 - 33235675
Alignment:
Q  693 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac-tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctg 789  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || || ||| |||||||||||||||||  || |||||| |||    
T  33235513 aaccttgatgcagctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactg 33235612  T
Q  790 cgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  33235613 tgtacaatacactaaatggtgggacccc-tcgcagaccttacgtatgcggaagctttagtgcac 33235675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 759 - 866
Target Start/End: Original strand, 15797271 - 15797377
Alignment:
Q  759 cagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagt 858  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||||| | ||    
T  15797271 cagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggt 15797369  T
Q  859 tgcccttt 866  Q
    ||||||||    
T  15797370 tgcccttt 15797377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 695 - 776
Target Start/End: Original strand, 35417902 - 35417982
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35417902 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 35417982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 712 - 800
Target Start/End: Original strand, 39211992 - 39212081
Alignment:
Q  712 aagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa-aacaaggtaaggctgcgtacaataca 800  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39211992 aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaataca 39212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 753 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 49013589 - 49013473
Alignment:
Q  753 tggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagt 849  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  || ||||||| ||||||    
T  49013589 tggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagt 49013490  T
Q  850 gcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| | ||||||||||    
T  49013489 gcaccgggttgcccttt 49013473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 708 - 776
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062104
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaa 53062104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 697 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 829611 - 829455
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa-aacaaggtaaggctgcgtaca 795  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  | || |||||||| || |||||| |||||||| |||| ||||  |||| | ||||||||    
T  829611 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaagacc-cgagttcaagttctagaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtaca 829514  T
Q  796 atacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  829513 atacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 829455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 689 - 806
Target Start/End: Original strand, 21874999 - 21875111
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaagg 786  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||    
T  21874999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-------acgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaagg 21875091  T
Q  787 ctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  21875092 ctgcgtacaatacactaaat 21875111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 742 - 842
Target Start/End: Original strand, 55401208 - 55401310
Alignment:
Q  742 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgg 839  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  55401208 ggttcaagtcctgtaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaaaatggtgggaccccttctcggaccttccgtatgcgg 55401307  T
Q  840 gag 842  Q
    |||    
T  55401308 gag 55401310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 773 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 34771457 - 34771364
Alignment:
Q  773 aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | | ||||||||    
T  34771457 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttt 34771364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10858169 - 10858101
Alignment:
Q  48 aggcatcccatatactaggacctctaccaccctccttgctagcaccttctatctagaaacaagcaacaa 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10858169 aggcatcccatatacaaggacctctgccaccctcattgctagcaccttctatctagaaataagcaacaa 10858101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 689 - 776
Target Start/End: Original strand, 26782345 - 26782432
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  26782345 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaaa 26782432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 729 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 52428616 - 52428526
Alignment:
Q  729 ctgaaaggtcacgggttcaagtc-ctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacccc 817  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  52428616 ctgaaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatagtggaacccc 52428526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 736 - 841
Target Start/End: Original strand, 9276284 - 9276395
Alignment:
Q  736 gtcacgggttcaagtcctggaaaca------gcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggacct 828  Q
    |||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||     
T  9276284 gtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt-ggaccctttcccggaccc 9276382  T
Q  829 tgtgtatgcggga 841  Q
    || ||||||||||    
T  9276383 tgcgtatgcggga 9276395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 708 - 850
Target Start/End: Original strand, 28904941 - 28905084
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--aacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaa 805  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  28904941 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaagtcacatgtttaagtccagggaacagtctcttgtgtaaaataacaaggtaagactgtgtacattacaccaaa 28905040  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    |  |||||||| |||||||||| || ||| ||||||  |||||||    
T  28905041 t-atgggaccctttcccggaccctgcgtaagcgggaactttagtg 28905084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 684 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 43956642 - 43956510
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggt- 782  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||        
T  43956642 tagagggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgttacttgactgaaaagtccggggttcatgttctggaaacagcctcatgtgtaaaaaaaaacac 43956544  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccc 816  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  43956543 aaggctacgcacaatacaccaaatggtgggaccc 43956510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 716 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410913
Alignment:
Q  716 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacc 815  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctcgtgt-aaaaaacagggtaaggctgctcacaatacaccaactggtgggacc 8410918  T
Q  816 ccttc 820  Q
     ||||    
T  8410917 tcttc 8410913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 772 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 353445 - 353351
Alignment:
Q  772 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaa--atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccct 864  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  353445 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 743 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 43114994 - 43114882
Alignment:
Q  743 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaaacaaggtaa-ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccgga-ccttgtgtatgcg 838  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || |||||||    
T  43114994 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaaatggtggga-cccttcctggacccctgcgtatgcg 43114896  T
Q  839 ggaggtttagtgca 852  Q
    |||| |||||||||    
T  43114895 ggagctttagtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 697 - 819
Target Start/End: Original strand, 29106537 - 29106659
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taaggctgcgtaca 795  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||    
T  29106537 ttggcgcaac-ggtaaaaatgttgtcatgtggctcaaagatcacgggtacaagtcttgaaaacaacctcttgtgtaaaaaataggataaggttacgtaca 29106635  T
Q  796 atacacaaaatggtgggacccctt 819  Q
    |||||| |||| |||||| |||||    
T  29106636 atacaccaaattgtgggatccctt 29106659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 749 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 31904975 - 31904869
Alignment:
Q  749 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtggga-ccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  || |||||||| |||    
T  31904975 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacaccaaatggtgggacccccttcccagatcttacgtgtgcgggagcttt 31904876  T
Q  847 agtgcac 853  Q
    |||||||    
T  31904875 agtgcac 31904869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 710 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 1121382 - 1121277
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa-aaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatg 807  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  1121382 taaatttgttgtccggtggctgaaaggtcacgtgtttaagtcctggaaacaacttcttgtgtaagaaataaggtgagactgcgtacaatacaccaaaatg 1121283  T
Q  808 gtggga 813  Q
    | ||||    
T  1121282 gcggga 1121277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 686 - 764
Target Start/End: Original strand, 4537007 - 4537085
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcct 764  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  4537007 gaggggtaaccttggcataatcggtaatgttgtggtcatgtgattgaaaggtcacgggtttaagttttggaaacagcct 4537085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 686 - 725
Target Start/End: Original strand, 9276250 - 9276289
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatg 725  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9276250 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatg 9276289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 701 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 11461807 - 11461732
Alignment:
Q  701 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||| |||| ||||||| || || |||||||||||    
T  11461807 cgcaactggtaaagttgttgtcatatgacaggaaggttacaggtttaagttctggaaatagtcttttgtgtaaaaa 11461732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 803 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24851364 - 24851301
Alignment:
Q  803 aaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  24851364 aaatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 24851301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 748 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 50625072 - 50624953
Alignment:
Q  748 agtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||| |  ||||||||| |||||| || || || ||| | ||||| |||    
T  50625072 agtcctagaaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatttggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagcttt 50624973  T
Q  847 agtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| | | ||||||||    
T  50624972 agtgcaccgggctgcccttt 50624953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 749 - 814
Target Start/End: Original strand, 31672732 - 31672798
Alignment:
Q  749 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggac 814  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31672732 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacaaggcaagagtgcgtacaatacaccaaatggtgggac 31672798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 707 - 776
Target Start/End: Original strand, 9627712 - 9627781
Alignment:
Q  707 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9627712 tggtaacgttggtgtcacgtgactgaaagggtatgggtttaagtcctagaaacagactcttgtgtaaaaa 9627781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 689 - 726
Target Start/End: Original strand, 23871418 - 23871455
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt 726  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23871418 gggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgt 23871455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 809
Target Start/End: Original strand, 31831241 - 31831297
Alignment:
Q  752 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggt 809  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31831241 ctggaaacagcctcttgtgt-aaaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggt 31831297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 806 - 866
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452952
Alignment:
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30452952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 811 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 10484671 - 10484616
Alignment:
Q  811 ggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  10484671 ggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10484616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 695 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 21330418 - 21330291
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaa---ggtaaggctgcg 791  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||  ||| |||||| || |||| ||||||| ||   |||||||| ||     
T  21330418 ccttggcgcaa-tggtaaagtggttgtcatgtgacttaaa-gtcacagtttcaatccctagaaacaaccacttgcgtaaaaaaaatagggtaaggccgca 21330321  T
Q  792 tacaatacacaaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  21330320 tacaatacaccaaattgcgggaccctttcc 21330291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 806 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 14266431 - 14266370
Alignment:
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    ||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14266431 tggtgggaccc-ttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgccctttgc 14266370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 8325111 - 8325066
Alignment:
Q  756 aaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac 801  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8325111 aaacaacctcttatgtaaaatcaaggtgaggctgcgtacaatacac 8325066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 685 - 730
Target Start/End: Original strand, 39430464 - 39430509
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact 730  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39430464 agaggggtaactttgacgcaactggtaaagttgctgtcatctgact 39430509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 97)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 5648213 - 5648393
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5648213 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 5648312  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  5648313 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgcccttt 5648393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 686 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 6430806 - 6430627
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6430806 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 6430707  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||    
T  6430706 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctt 6430627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 30639334 - 30639514
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30639334 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgtaaaaacagggtaag 30639433  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30639434 gctgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 30639514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 48599004 - 48598825
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  48599004 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 48598906  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||||||| | ||||||||||    
T  48598905 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48598825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 686 - 867
Target Start/End: Original strand, 20224938 - 20225118
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  20224938 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaacagggtaag 20225036  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttg 867  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | |||||||||||    
T  20225037 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttg 20225118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 47528710 - 47528530
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47528710 agaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 47528612  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  47528611 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 47528530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 5306844 - 5306660
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5306844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatcagggtaag 5306745  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatg----cgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||| |||| ||||| | ||||||||||    
T  5306744 gttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgcccttt 5306660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 705 - 853
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915950
Alignment:
Q  705 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 40915901  T
Q  805 atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  40915902 atggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcac 40915950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 11054328 - 11054148
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  11054328 agaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgt-aaaacagggtaa 11054230  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  11054229 gactgcgtacaatacaccaaatggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 11054148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 693 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 16408777 - 16408601
Alignment:
Q  693 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcg 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  16408777 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 16408678  T
Q  792 tacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  16408677 tacaatacaccaataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 16408601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 689 - 866
Target Start/End: Original strand, 16911519 - 16911699
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggc 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  16911519 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggc 16911618  T
Q  788 tgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  16911619 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgcccttt 16911699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Original strand, 23501746 - 23501924
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggta 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23501746 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc------acagcctcttgtgtaaaaaacagggta 23501839  T
Q  784 aggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  23501840 aggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 23501924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 685 - 863
Target Start/End: Original strand, 21646917 - 21647098
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggta 783  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  21646917 agagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggta 21647016  T
Q  784 aggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccc 863  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  21647017 aggctgcgtacaatataccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 21647098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 705 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363130
Alignment:
Q  705 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac-- 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||      
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  802 aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 44363130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 685 - 852
Target Start/End: Original strand, 37494804 - 37494972
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggta 783  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  37494804 agaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 37494903  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  37494904 aggttgcatacaatataccaaatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 686 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 55766647 - 55766464
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggg-ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||  ||||| |||||    
T  55766647 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgtgtaaacagggtaa 55766548  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||    
T  55766547 ggctgcgtacaatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgccctttgc 55766464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 712 - 866
Target Start/End: Original strand, 54175043 - 54175200
Alignment:
Q  712 aagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa-cagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggt 809  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54175043 aagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggt 54175142  T
Q  810 gggacccctt-cccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | | ||||||||    
T  54175143 gggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 54175200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 691 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 30352767 - 30352580
Alignment:
Q  691 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta------aaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||      |||||| |||||    
T  30352767 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaa 30352668  T
Q  785 g----gctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  30352667 gtaaagctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgcccttt 30352580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 707 - 866
Target Start/End: Original strand, 47443928 - 47444092
Alignment:
Q  707 tggtaaagttgttgtcatgtgactga----aaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacac 801  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47443928 tggtaaagttgttctcatgtgaccgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacac 47444027  T
Q  802 aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  47444028 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagcttcagtgcactgggttgcccttt 47444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 689 - 850
Target Start/End: Original strand, 14983791 - 14983953
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggc 787  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||     
T  14983791 gggtaaccttggcagaactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggt 14983890  T
Q  788 tgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  14983891 tgcctacaatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtg 14983953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 710 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832313
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggt 809  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 9832370  T
Q  810 gggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| |||  | |||||||| | ||||||||||    
T  9832369 gggaccccttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgcccttt 9832313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 690 - 815
Target Start/End: Original strand, 14590795 - 14590922
Alignment:
Q  690 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaaggc 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  14590795 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggc 14590894  T
Q  788 tgcgtacaatacacaaaatggtgggacc 815  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  14590895 tgcatacaatacatcaaatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 712 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 17043549 - 17043433
Alignment:
Q  712 aagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtg 810  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17043549 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 17043450  T
Q  811 ggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||||||| ||||    
T  17043449 ggaccccttcccagacc 17043433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 724 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 29208039 - 29207900
Alignment:
Q  724 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccg 823  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29208039 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 29207941  T
Q  824 gaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccct 864  Q
    |||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  29207940 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 29207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 686 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 55830902 - 55830734
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg-gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  55830902 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgtgtaaacagggtaa 55830803  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  55830802 tgctgcgtacaatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcac 55830734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 708 - 866
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567305
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacaccaaat 35567245  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||| | | ||||||||    
T  35567246 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 35567305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 689 - 866
Target Start/End: Original strand, 54730206 - 54730387
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaca-agg-taagg 786  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  54730206 gggtaactttggcgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaataggataagg 54730305  T
Q  787 ctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| |||||||  | |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  54730306 ctgcgtataatacaccaataatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgaattacccttt 54730387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 684 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 13256580 - 13256399
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggt 782  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||| |||    
T  13256580 tagaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctgg----agcctcttgtgtaaaaaacagggt 13256485  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||  |  | |||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  13256484 aaggctgcgtacaatacaccaataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13256399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 689 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 17315476 - 17315375
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggct 788  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17315476 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaacaaggtaaggct 17315377  T
Q  789 gc 790  Q
    ||    
T  17315376 gc 17315375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 715 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018805
Alignment:
Q  715 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggac 814  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaattagggtaaggctacgtacaatacaccaaatagtgggac 41018846  T
Q  815 cccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactg 855  Q
    |||||||| ||||||| |||||  || | ||||||||||||    
T  41018845 cccttcccagaccttgcgtatggaggggctttagtgcactg 41018805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 707 - 853
Target Start/End: Original strand, 19027823 - 19027970
Alignment:
Q  707 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaa 805  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  19027823 tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 19027922  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||||||| || |||  || ||||| ||||| ||||||||||    
T  19027923 tggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgcac 19027970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 697 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 8473790 - 8473621
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaa 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  8473790 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-ttaacagggtaaggctgcatacaa 8473692  T
Q  797 tacacaaaatggtgggacccctt-cccgga-ccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||  |||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  8473691 tacaccaaatggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 8473621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 686 - 868
Target Start/End: Original strand, 20405047 - 20405226
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggta 783  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  20405047 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggg-------cctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 20405139  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaa--atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    ||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  20405140 agattgcgtacaatacactaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgccctttgc 20405226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 710 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 30690340 - 30690189
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--------aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac 801  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30690340 taaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 30690241  T
Q  802 aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  30690240 caattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 30690189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 696 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 30496491 - 30496335
Alignment:
Q  696 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtaca 795  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||    
T  30496491 cttggcgcaactgtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaacac-gggtaaggctgcataca 30496393  T
Q  796 atacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||  |||| ||||||||||    
T  30496392 atacaccaaatggggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgcac 30496335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 695 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 487306 - 487187
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  487306 ccttggcgtaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgta 487208  T
Q  794 caatacac-aaaatggtggga 813  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  487207 caatacactaaaatggtggga 487187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 715 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385500
Alignment:
Q  715 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtggga 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatggtggga 7385529  T
Q  814 ccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7385528 ccctttcccggaccctgtgtatgcgggag 7385500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 749 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 20639777 - 20639658
Alignment:
Q  749 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  20639777 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 20639678  T
Q  847 agtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  20639677 agtgcaccgggttgcccttt 20639658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 686 - 847
Target Start/End: Original strand, 10660358 - 10660521
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||     
T  10660358 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10660457  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||    
T  10660458 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaagacc-tgcgtatgcgggagcttta 10660521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 686 - 847
Target Start/End: Original strand, 10874503 - 10874666
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||     
T  10874503 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10874602  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||    
T  10874603 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaagacc-tgcgtatgcgggagcttta 10874666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 718 - 842
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463233
Alignment:
Q  718 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccc 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacaccaaatggtgggaccc 25463207  T
Q  817 cttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  25463208 cttcccggaccctgcatatgcgggag 25463233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 713 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077800
Alignment:
Q  713 agttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtggg 812  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggttgcgtacaatataccaaatggtgag 39077850  T
Q  813 accccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcc 862  Q
    ||  ||| ||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||    
T  39077849 acatctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 39077800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 697 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 47441699 - 47441569
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtaca 795  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| |||||    
T  47441699 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgtaca 47441601  T
Q  796 atacacaaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  47441600 atacaccaaatggttggaccccttcccggacc 47441569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 698 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 49938759 - 49938611
Alignment:
Q  698 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaat 797  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   | |||||||    
T  49938759 tggcgcaacggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacggggtaag---gtgtacaat 49938663  T
Q  798 aca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttag 848  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||| |||||    
T  49938662 acaccaaaatggtgggaccccttcccataccctgcatatgcgggagctttag 49938611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 687 - 823
Target Start/End: Original strand, 54966977 - 54967112
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  54966977 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 54967075  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccg 823  Q
    | ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  54967076 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccg 54967112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 710 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478815
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggt 809  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||     ||||||| |||||||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaacagggtaaggctg-----aatacaccaaatggt 32478848  T
Q  810 gggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  32478847 gggaccccttcccggacccagcgtatgcgggag 32478815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 685 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 20908819 - 20908649
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag-gtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaac-aaggt 782  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||  ||||||||| |||||||| | |||| | ||||||  |||||    
T  20908819 agagggggagccttggcacaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggt 20908721  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  20908720 aaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 20908649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 717 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629285
Alignment:
Q  717 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggacc 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgtaaaaaaacagggtaaggccgcctac-atacaccaaattggcgggacc 32629320  T
Q  816 ccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  32629319 ccttcccggaccttgcgtatgtgggagttttagtg 32629285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 708 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029078
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac-aaaa 805  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacgaaaa 39029121  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttag 848  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  39029120 tggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagctttag 39029078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 697 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 42164317 - 42164224
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcg 791  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42164317 ttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcg 42164224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 710 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580208
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatg 807  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||  ||||| |||||||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaaaatg 23580266  T
Q  808 gtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | | |||||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  23580265 gcgagaccccttcttggacc-tgtgtatgtgggagctttagtgcaccgagctgcccttt 23580208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 752 - 842
Target Start/End: Original strand, 49796818 - 49796908
Alignment:
Q  752 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  49796818 ctggaaacagcctcttgtgttaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggag 49796908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 696 - 821
Target Start/End: Original strand, 25343152 - 25343279
Alignment:
Q  696 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25343152 cttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 25343250  T
Q  795 aatacac--aaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  25343251 aatacaccaaaaagggttggaccccttcc 25343279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 750 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 7909397 - 7909281
Alignment:
Q  750 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgc-gggaggtttag 848  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| |||||    
T  7909397 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggggagctttag 7909298  T
Q  849 tgcactgagttgccctt 865  Q
    ||||  | |||||||||    
T  7909297 tgcatcgggttgccctt 7909281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 695 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 30581638 - 30581504
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaaacaaggtaaggctgcgt 792  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| || ||    
T  30581638 ccttggcgcaac-gctaaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgt 30581540  T
Q  793 acaataca-caaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30581539 acaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggacc 30581504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 756 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 51865149 - 51865051
Alignment:
Q  756 aaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  51865149 aaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgcac 51865051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 720 - 866
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038187
Alignment:
Q  720 gtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggacccc 817  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcct-gaaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaaaatggtggggcacc 7038139  T
Q  818 ttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | |||||||| || |||| | |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7038140 tacccggaccctgcgtatac-ggagctttagtgcactgggttgcccttt 7038187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Original strand, 36589708 - 36589866
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||   |    
T  36589708 ccttggcgcaac-ggtaaagttgatgtcacatgactgaaacgtc-caggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttga 36589805  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||    
T  36589806 cagtacaccaaaatggtgggaccccttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtgcac 36589866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 695 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 49938610 - 49938490
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  49938610 ccttggcgcaacggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacagattcaagtcttggaagcagcgtattgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtcc 49938511  T
Q  795 aataca-caaaatggtgggac 814  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  49938510 aattcatcaaaatggtgggac 49938490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 744 - 861
Target Start/End: Original strand, 21489099 - 21489218
Alignment:
Q  744 ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaag-gtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcggga 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  21489099 ttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggga 21489198  T
Q  842 ggtttagtgcactgagttgc 861  Q
    | ||| |||||||| |||||    
T  21489199 gctttcgtgcactgggttgc 21489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 866
Target Start/End: Original strand, 25629069 - 25629184
Alignment:
Q  752 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||    
T  25629069 ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttagtg 25629168  T
Q  851 cactgagttgcccttt 866  Q
    ||| | ||||||||||    
T  25629169 caccgggttgcccttt 25629184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 708 - 790
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035307
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa-aaacaaggtaaggctgc 790  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaaggctgc 43035307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 744 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 9987957 - 9987847
Alignment:
Q  744 ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa-aacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  9987957 ttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggag 9987858  T
Q  843 gtttagtgcac 853  Q
     |||| |||||    
T  9987857 ctttaatgcac 9987847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 709 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580879
Alignment:
Q  709 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatg 807  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||| |||||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagt-ctggaaa---cctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacaccaaatg 3580899  T
Q  808 gtgggaccccttcccggacc 827  Q
     | |||||||||||||||||    
T  3580898 ctaggaccccttcccggacc 3580879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 689 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 5313172 - 5313099
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagc 762  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5313172 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaattcctgaaaacagc 5313099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 695 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 54640510 - 54640430
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54640510 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaa 54640430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 695 - 801
Target Start/End: Original strand, 51420537 - 51420644
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtca-cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgt 792  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  51420537 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggt 51420635  T
Q  793 acaatacac 801  Q
    |||||||||    
T  51420636 acaatacac 51420644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 736 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 10277886 - 10277781
Alignment:
Q  736 gtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtat 835  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||  |||    
T  10277886 gtcacgggttcaaatccttgaaacagcctcttgtataaaat-aggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgaaaccccttcccagaccctgcatat 10277788  T
Q  836 gcgggag 842  Q
    |||||||    
T  10277787 gcgggag 10277781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 695 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 12257764 - 12257688
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta 772  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  12257764 ccttgacgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaaatcctagaaacagcgtcttgtgta 12257688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 780 - 866
Target Start/End: Original strand, 20225123 - 20225211
Alignment:
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacacaaa--atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  20225123 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 20225211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 772 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 36816479 - 36816384
Alignment:
Q  772 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  36816479 aaaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaaggtgggactccttcctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttt 36816384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 804 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 38755970 - 38755908
Alignment:
Q  804 aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  38755970 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 38755908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 772 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 4222122 - 4222062
Alignment:
Q  772 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtg 832  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  4222122 aaaaacaaagtaaggctgcgtagaatacacaaattggtgggaccccttcccgaatcttgtg 4222062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 689 - 729
Target Start/End: Original strand, 18969698 - 18969738
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969698 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 18969738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 687 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 20373974 - 20373898
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcc 763  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||    
T  20373974 aggggtaactttggcgcaactggtcaagttgttctcatatgactgaaatgtcacatgttcaattccttgaaacagcc 20373898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 695 - 775
Target Start/End: Original strand, 41549346 - 41549425
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 775  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41549346 ccttggcgcaaa-ggtaaagttgttgacacatgattgaaatgtcacgggttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaa 41549425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 695 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 50856407 - 50856344
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac 759  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50856407 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgattgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaac 50856344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 803 - 866
Target Start/End: Original strand, 11394924 - 11394987
Alignment:
Q  803 aaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  11394924 aaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 11394987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 803 - 866
Target Start/End: Original strand, 11404651 - 11404714
Alignment:
Q  803 aaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  11404651 aaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 11404714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 795 - 866
Target Start/End: Original strand, 38786673 - 38786744
Alignment:
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  38786673 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 38786744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 741 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 17079777 - 17079691
Alignment:
Q  741 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggac 826  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  17079777 gggttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgctaaatggtgggaccctttcctggac 17079691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 804 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 33836549 - 33836487
Alignment:
Q  804 aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  33836549 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgcccttt 33836487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 707 - 827
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357317
Alignment:
Q  707 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa-aaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaa 804  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| |  ||||| |  ||||||||||| ||||    
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaaa 44357294  T
Q  805 atggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||| |||||| |||||| ||||    
T  44357295 atggcgggacctcttcccagacc 44357317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 723 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 10380086 - 10379997
Alignment:
Q  723 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtggg 812  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | | |||   |||||||||||||| |||| |||||    
T  10380086 atgtgactgaaaggtcacttgttcaagtcctacaaacaacctcttgtgtaaaaataggataaaattgcgtacaatacaccaaatagtggg 10379997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 780 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 12711535 - 12711450
Alignment:
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| | |||||||| |  ||||||||||  ||||||||||    
T  12711535 ggtaagactgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttctcagacctagcgtatgcggaaactttagtgcacccagttgccctt 12711450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 805 - 866
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484368
Alignment:
Q  805 atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 32484368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 805 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553937
Alignment:
Q  805 atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40553937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 773 - 850
Target Start/End: Original strand, 16494259 - 16494338
Alignment:
Q  773 aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  16494259 aaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccctttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtg 16494338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 802 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 47482914 - 47482850
Alignment:
Q  802 aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||    
T  47482914 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaacgagctgcccttt 47482850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 710 - 800
Target Start/End: Original strand, 6966070 - 6966160
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca 800  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||| | |||||| || | ||| |||| || |||||||||||||    
T  6966070 taaagttgttgtcacatgagtgatagttcacgggttcaagtcttggaaacaacttcttgtatatatacagggtatggttgcgtacaataca 6966160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 804 - 866
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388311
Alignment:
Q  804 aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgcccttt 25388311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 686 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 29879678 - 29879624
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcac 740  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29879678 gaggggtaacattggtgcaactgataaagttgttgtcatgtgactagaaggtcac 29879624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 772 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 35894556 - 35894502
Alignment:
Q  772 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccgga 825  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35894556 aaaaacacggtaagtgtgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgga 35894502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 710 - 776
Target Start/End: Original strand, 7227710 - 7227776
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | | ||||||| || ||||||| ||||    
T  7227710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgagttcaaattcaggaaacaaccgcttgtgttaaaa 7227776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 816 - 866
Target Start/End: Original strand, 35532077 - 35532127
Alignment:
Q  816 ccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  35532077 ccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 35532127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 804 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 50555718 - 50555656
Alignment:
Q  804 aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| | | ||||||||    
T  50555718 aatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagttttagtgcaccgggctgcccttt 50555656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 805 - 866
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718702
Alignment:
Q  805 atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagcacaccgggttgcccttt 44718702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 8455498 - 8455316
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggta 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8455498 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggta 8455399  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  8455398 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgcccttt 8455316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 687 - 868
Target Start/End: Original strand, 10543653 - 10543837
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10543653 aggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 10543752  T
Q  786 gctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  10543753 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttgc 10543837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 684 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 12024101 - 12023958
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggta 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12024101 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggta 12024002  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12024001 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccctcccggacc 12023958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 14530272 - 14530455
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  14530272 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaa 14530371  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  14530372 ggctacgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 14530455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 9671134 - 9671314
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9671134 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 9671232  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  9671233 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 9671314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 21779440 - 21779261
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21779440 gaggggtaaccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 21779342  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  21779341 gttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 21779261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 688 - 866
Target Start/End: Original strand, 11514392 - 11514570
Alignment:
Q  688 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaagg 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11514392 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaagg 11514491  T
Q  787 ctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  11514492 ctgcgtacaatacaccaaatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 11514570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 686 - 872
Target Start/End: Complemental strand, 25079899 - 25079711
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaaacaaggta 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  25079899 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaaggta 25079800  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgctgtt 872  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  25079799 aggatgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgccctttgttgtt 25079711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 689 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 25249915 - 25249738
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggct 788  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  25249915 gggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgtacaaacagggtaaggct 25249816  T
Q  789 gcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  25249815 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgcccttt 25249738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 687 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24200805 - 24200623
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24200805 aggggtaaccttgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24200706  T
Q  786 gctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  24200705 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 24200623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 686 - 835
Target Start/End: Original strand, 22371011 - 22371158
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  22371011 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctc--gtgtaaaaacagggtaag 22371108  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtat 835  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22371109 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgtgtat 22371158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 23397720 - 23397899
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  23397720 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaatagggtaag 23397818  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  23397819 gctacgtacaatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 23397899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 688 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 19977893 - 19977727
Alignment:
Q  688 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taagg 786  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||    
T  19977893 ggggtaaccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataagg 19977794  T
Q  787 ctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19977793 ttgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcac 19977727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 688 - 866
Target Start/End: Original strand, 17896215 - 17896395
Alignment:
Q  688 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| | ||||||    
T  17896215 ggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaag 17896314  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  17896315 gctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgcccttt 17896395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 692 - 866
Target Start/End: Original strand, 27573581 - 27573755
Alignment:
Q  692 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcg 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27573581 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgtataaacatggtaaggctgcg 27573680  T
Q  792 tacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  |||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  27573681 tacaatacaccaaatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 27573755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 5840982 - 5841165
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||    
T  5840982 gaggggtaaccttggtgcaaatgataaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 5841081  T
Q  785 ggctgcgtacaataca-caa-aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5841082 ggatgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 5841165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 682 - 853
Target Start/End: Original strand, 7214484 - 7214658
Alignment:
Q  682 tatagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaag 780  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  7214484 tatagaggggtaactttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagg 7214583  T
Q  781 gtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||  || ||||||| ||| ||||||||||    
T  7214584 gtaaggctgcgtacaatacacaaaaaatggtgagatcccttctcggacactgcgtatgcgagagttttagtgcac 7214658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 723 - 866
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444863
Alignment:
Q  723 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttccc 822  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacgatacaccaaatggtgggaccccttccc 14444819  T
Q  823 ggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  14444820 ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 14444863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 723 - 866
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546298
Alignment:
Q  723 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttc 820  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttc 10546252  T
Q  821 ccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  10546253 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 703 - 866
Target Start/End: Original strand, 17623535 - 17623699
Alignment:
Q  703 caactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacac 801  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17623535 caactggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17623634  T
Q  802 aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
     ||||||||| ||||||||||| | | || ||||| || || |||||||||||| ||||||||||    
T  17623635 caaatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgcccttt 17623699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 703 - 866
Target Start/End: Original strand, 17667973 - 17668137
Alignment:
Q  703 caactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacac 801  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17667973 caactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17668072  T
Q  802 aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
     ||||||||| |||||||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  17668073 caaatggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17668137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 687 - 866
Target Start/End: Original strand, 14544018 - 14544201
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  14544018 aggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaa 14544117  T
Q  785 ggctgcgtacaata--cacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | |||||| |||||  || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  14544118 gactgcgtgcaataaccaaaaaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaagttgcccttt 14544201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 695 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 99434 - 99276
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  99434 ccttggcgcaacag-taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgt-aaaaaacatggcaaggctgcgtac 99337  T
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactg 855  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  99336 aatacaccaaatggtggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagctttagtgtactg 99276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 24860157 - 24860001
Alignment:
Q  696 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtaca 795  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24860157 cttggcgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaacatggt-aggctgcgtaca 24860059  T
Q  796 atacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  24860058 atacaccaaatggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 24860001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 710 - 827
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450382
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatg 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaagg 5450362  T
Q  808 gtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  5450363 gtgggaccccttcctggacc 5450382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 32781467 - 32781312
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaag 785  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  32781467 agggggaaccttggcgcaa-tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 32781369  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32781368 actgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggag 32781312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 686 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 26684803 - 26684633
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacag-cctcttgtgt--aaaaacaaggt 782  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||||| | |||    
T  26684803 gaggggtaactttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggt 26684704  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  26684703 aaggctgcgtacaatatactaaatggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcac 26684633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 698 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 39914475 - 39914306
Alignment:
Q  698 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaaacaaggtaaggctgcgtaca 795  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| || |||||    
T  39914475 tggcgcatctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtaca 39914376  T
Q  796 atacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  39914375 atacaccgaatggtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 39914306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 748 - 866
Target Start/End: Original strand, 36871509 - 36871626
Alignment:
Q  748 agtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  36871509 agtcctggaaacagcctcttgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggacc-tgcgtatgcgggagcttta 36871607  T
Q  848 gtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  36871608 gtgcaccgggttgcccttt 36871626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 686 - 801
Target Start/End: Original strand, 17705449 - 17705565
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa-aacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||    
T  17705449 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaa 17705548  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac 801  Q
    ||||| |||||||||||    
T  17705549 ggctgtgtacaatacac 17705565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 708 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377074
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcaccaaat 21377133  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  21377132 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagcttt-gtgcaccgagctgcccttt 21377074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 717 - 850
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641620
Alignment:
Q  717 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccc 816  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgtgaaaacagggtaaagttgcgtacaatacaccaaattgtgggaccc 25641586  T
Q  817 cttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    ||||||| | | || ||||||| ||| |||||||    
T  25641587 cttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtg 25641620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 695 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 4516522 - 4516367
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  4516522 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgta 4516424  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  4516423 caatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtg 4516367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 708 - 842
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795396
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtac-aatacacaaaa 805  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||   |    
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacac-cta 33795359  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33795360 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggag 33795396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 695 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 17380407 - 17380261
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || || |    
T  17380407 ccttggcgcaa-tggcgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaacagggtaaggttgtgtgc 17380309  T
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || | |||||||||    
T  17380308 aatacaccaaatgatggaaccccttcctggaccctgcggatgcgggag 17380261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 695 - 866
Target Start/End: Original strand, 44643486 - 44643658
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgt 792  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||  |||||||  ||  ||||||||||||    
T  44643486 ccttggcgcaa-tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgt 44643584  T
Q  793 acaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||| | | ||||||||    
T  44643585 acaatgtaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgcccttt 44643658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 708 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145737
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || |    
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23145758  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  23145757 ggtgggaccctttcccggacc 23145737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 708 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557527
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || |    
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23557548  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  23557547 ggtgggaccctttcccggacc 23557527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 707 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416871
Alignment:
Q  707 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaa 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||     
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || |||||||| ||   ||||| ||  |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  40416931 tgatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 40416871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 710 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158456
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaat 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||| ||||||| ||  |||||    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagt 849  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  31158498 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagt 31158456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 709 - 866
Target Start/End: Original strand, 4795730 - 4795890
Alignment:
Q  709 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacac-aaaa 805  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||| || |||||||||| || |||||||  |||| | || |||||| |||||||| ||||    
T  4795730 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaagtcacttgttgaagtcttgaaaacagcctcatgcgtaaaaaaacaagattagactgcgtgcaatacaccaaaa 4795829  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||    
T  4795830 tggtgggaccttttcccggaccttgtgtatgccgaagctttagtgcagtgggttgcccttt 4795890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 752 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 40762349 - 40762232
Alignment:
Q  752 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  40762349 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttagtg 40762250  T
Q  851 cactgagttgccctttgc 868  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  40762249 caccgggttgccctttgc 40762232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 695 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 44521544 - 44521392
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  44521544 ccttggcggaac-ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcata 44521446  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
     ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||  ||| |||||| ||||    
T  44521445 taatacaccaaatggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagcttta 44521392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 704 - 785
Target Start/End: Original strand, 44604826 - 44604907
Alignment:
Q  704 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44604826 aactgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaag 44604907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 709 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 45235976 - 45235820
Alignment:
Q  709 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--aacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  || | ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  45235976 gtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgtaatacacaaaat 45235877  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccc 863  Q
    ||||||||||||| || |||| |  |||||| |||| ||||||| ||  ||||||||    
T  45235876 ggtgggaccccttaccagaccctacgtatgcaggagctttagtgtaccaagttgccc 45235820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 721 - 853
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615115
Alignment:
Q  721 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggacccc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| ||  | ||| || |||||||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  818 ttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 19615115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 772 - 854
Target Start/End: Original strand, 24890452 - 24890534
Alignment:
Q  772 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcact 854  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||    
T  24890452 aaaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcact 24890534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 708 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419950
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaag-----gtaaggctgcgtacaatacac 801  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||     |||||||||||||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacac 29419950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 733 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 13245220 - 13245111
Alignment:
Q  733 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtg 832  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      
T  13245220 aaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt--------ggtaaggctgcgtacattacactaaatggtgggaccccttcccggaccatgca 13245129  T
Q  833 tatgcgggaggtttagtg 850  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  13245128 tatacgggagctttagtg 13245111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 772 - 868
Target Start/End: Original strand, 25632550 - 25632646
Alignment:
Q  772 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  25632550 aaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttgc 25632646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 747 - 853
Target Start/End: Original strand, 30826052 - 30826157
Alignment:
Q  747 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |   |||||||||| |||    
T  30826052 aagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggt-ggaacccttcccagaccctacatatgcgggagcttt 30826150  T
Q  847 agtgcac 853  Q
    |||||||    
T  30826151 agtgcac 30826157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 717 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 31821491 - 31821356
Alignment:
Q  717 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacc 815  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||   ||||||||||  ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  31821491 gttgttatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcgtagaaacagccg--tgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtacaatacaccaaatgatgggacc 31821394  T
Q  816 ccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||| ||| | | |||||||||||||| |||| |||||    
T  31821393 cctttccgaaacctgtgtatgcgggagctttaatgcac 31821356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 726 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 2003678 - 2003592
Alignment:
Q  726 tgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtg 810  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  2003678 tgactgaaaggtcacgggtacaagtcctggaaacagccccttgcgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaacaaatggtg 2003592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 695 - 836
Target Start/End: Complemental strand, 15296580 - 15296436
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacg--ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcg 791  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15296580 ccttggcggaac-ggtaaagttgttgttacatggctgaaagatcatgtgggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcg 15296482  T
Q  792 tacaataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatg 836  Q
    ||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||| || |||||    
T  15296481 tacaatataccaaaatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatg 15296436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 686 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 39189602 - 39189556
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189602 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga 39189556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 721 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 44449529 - 44449396
Alignment:
Q  721 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggacccct 818  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  44449529 tcatgtaactgaaaggtcacgagttcaa-tcctaaaaacaacctcttgaatgaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaaatagtgggacccct 44449431  T
Q  819 tcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||| || || || ||||| |||| |||||    
T  44449430 tcccggaccctgcgtttgtgggagttttaatgcac 44449396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 728 - 853
Target Start/End: Original strand, 17471544 - 17471672
Alignment:
Q  728 actgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggaccccttcccgg 824  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| |    
T  17471544 actgaaatgtcacaggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaatgatgagaccccttccctg 17471643  T
Q  825 accttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  17471644 accctgcctatgcgggagttttagtgcac 17471672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 687 - 776
Target Start/End: Original strand, 17472926 - 17473015
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  17472926 aggggtaaccttgacgcaactaataaagttgttgtcaaatgattgaaaggtcacgggttcaggtcttagaaatagcctattgtgtaaaaa 17473015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 695 - 763
Target Start/End: Original strand, 35017781 - 35017849
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact-gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcc 763  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35017781 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaaggtcacgggtttaagtcctgaaaacagcc 35017849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 685 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 27466312 - 27466262
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 735  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27466312 agaggcgtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 27466262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 690 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 4852388 - 4852305
Alignment:
Q  690 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  4852388 ggtaaccttggtgcaactggcaaagttgt---catgtgaccgaaaagtcaggggttcaagtcctgcaaacagtctcttgtgaaaaaa 4852305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 805 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579750
Alignment:
Q  805 atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 40579750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 731 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 12315787 - 12315697
Alignment:
Q  731 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  12315787 gaaaggtcacgagttcaagtcatggaaacagcttcttattaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccaaatagtgagactccttcc 12315697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 787 - 866
Target Start/End: Original strand, 23488537 - 23488618
Alignment:
Q  787 ctgcgtacaatacacaaaa--tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||    
T  23488537 ctgcgtgcaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggttgctcttt 23488618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 747 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 30864536 - 30864474
Alignment:
Q  747 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggt 809  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  30864536 aagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaagggtgcgtacaatataccaaatggt 30864474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 709 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 34752820 - 34752759
Alignment:
Q  709 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg 770  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34752820 gtaaacttgttatcatgtgactgaaaggtcacgaattcaagttctggaaacaacctcttgtg 34752759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 866
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080236
Alignment:
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgcccttt 34080236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 806 - 852
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766376
Alignment:
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 34766376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 812 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 3633762 - 3633706
Alignment:
Q  812 gaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    ||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3633762 gaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttgc 3633706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 765 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 39499331 - 39499243
Alignment:
Q  765 cttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||  || | | || ||||||||||| ||||||||||    
T  39499331 cttgtataaaaatagggtaaagctgcgtacaatacatcaaatggtgggatcccttttcgaatcctgcgtatgcgggagctttagtgcac 39499243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 774 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 19185837 - 19185743
Alignment:
Q  774 aaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaa--tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||    
T  19185837 aaacatggtaaagttgcgtacaatgcacaaaaaatggtggaaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtacatcgagttacccttt 19185743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 805 - 864
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41409995
Alignment:
Q  805 atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccct 864  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccct 41409995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 682 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 39499399 - 39499353
Alignment:
Q  682 tatagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga 728  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39499399 tatagagcagtaatcttggcgcaactggtaaagttgttatcatgtga 39499353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 30454276 - 30454097
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30454276 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacaaggtaag 30454178  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  30454177 gctgcgtacgatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30454097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 681 - 865
Target Start/End: Original strand, 45071214 - 45071398
Alignment:
Q  681 ttatagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaag 780  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45071214 ttatagaggggtaaccttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagg 45071313  T
Q  781 gtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  45071314 gtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 45071398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 684 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 12670431 - 12670250
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggta 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12670431 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggta 12670333  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||| ||||||    
T  12670332 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttacccttt 12670250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 13160656 - 13160836
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13160656 gaggggtaacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 13160755  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | | ||||||||||    
T  13160756 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgcccttt 13160836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 28817807 - 28817626
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28817807 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 28817708  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  28817707 ggctgcgtacaatacacccaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 28817626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 36720750 - 36720931
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36720750 gaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 36720849  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||   ||||||||||    
T  36720850 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgcccttt 36720931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 684 - 866
Target Start/End: Original strand, 35261631 - 35261814
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggt 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  35261631 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggt 35261730  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  35261731 aaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 35261814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 39461177 - 39460994
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  39461177 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaa 39461078  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  39461077 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 39460994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 683 - 866
Target Start/End: Original strand, 44530100 - 44530284
Alignment:
Q  683 atagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaagg 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  44530100 atagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 44530199  T
Q  782 taaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  44530200 taaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgaccttt 44530284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 684 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 29521868 - 29521683
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggt 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  29521868 tagaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggt 29521769  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||    
T  29521768 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgctctttgc 29521683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 7136711 - 7136527
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggta 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  7136711 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggta 7136612  T
Q  784 aggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  7136611 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 7136527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 17823530 - 17823711
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taa 784  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17823530 gaggggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggataa 17823629  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  17823630 gactgcgtaaaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17823711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 684 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 20284256 - 20284082
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaa---g 780  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |    
T  20284256 tagagcggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagg 20284157  T
Q  781 gtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  20284156 gtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcac 20284082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 686 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 18164940 - 18164764
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18164940 gaggggtaatcttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 18164841  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcc 862  Q
    | |||||||||||||| ||| | || ||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  18164840 gttgcgtacaatacaccaaaggatgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 18164764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 684 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 21070885 - 21070710
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaa---- 779  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||        
T  21070885 tagagcggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaag 21070786  T
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21070785 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcac 21070710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Original strand, 26954085 - 26954270
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggt 782  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  26954085 agaggggtaactttggcgtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggt 26954184  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26954185 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 26954270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 686 - 853
Target Start/End: Original strand, 2626473 - 2626644
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt----aaaaacaagg 781  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||    
T  2626473 gaggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacaggg 2626572  T
Q  782 taaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||||| || |||||||    
T  2626573 taagactgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcac 2626644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 20869677 - 20869524
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20869677 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 20869579  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  20869578 gctgtgtacaatacaccaa--ggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 20869524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 6760777 - 6760959
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6760777 gaggggtaac-ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 6760875  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  6760876 ggcttcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 6760959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 695 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 44781677 - 44781506
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  44781677 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgta 44781579  T
Q  794 caatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccct 864  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  44781578 caatacaccaaaaatgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgtgctgccct 44781506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 691 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 8897940 - 8897764
Alignment:
Q  691 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctg 789  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||| | |||||||||     
T  8897940 gtaaccctggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggcta 8897841  T
Q  790 cgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||   ||||||||||    
T  8897840 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgcccttt 8897764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 701 - 866
Target Start/End: Original strand, 12625858 - 12626025
Alignment:
Q  701 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgtacaata 798  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||| |||| |||||||    
T  12625858 cgcaactggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaata 12625957  T
Q  799 cacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  12625958 caccaaatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 690 - 866
Target Start/End: Original strand, 25250480 - 25250659
Alignment:
Q  690 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggct 788  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||    
T  25250480 ggtaaccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggtatggct 25250579  T
Q  789 gcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  25250580 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgcccttt 25250659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 695 - 868
Target Start/End: Original strand, 28407379 - 28407540
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            
T  28407379 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaagg-------- 28407470  T
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
        ||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  28407471 ----caccaaatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgccctttgc 28407540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 709 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365083
Alignment:
Q  709 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaaat 24365119  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  24365118 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggag 24365083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 685 - 847
Target Start/End: Original strand, 24245404 - 24245565
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||   |||| |||||    
T  24245404 agaggggtaaccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-gtctcttatgt---aacagggtaa 24245499  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac---aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    | || |||||||| |||   ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  24245500 gactacgtacaatgcaccaaaaaattgtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttta 24245565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 695 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 42083870 - 42083699
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggt-aaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||||    
T  42083870 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgta 42083772  T
Q  794 caatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    || || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||||||| || | |||||||    
T  42083771 cagtataccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgcattgggctgccctt 42083699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 708 - 841
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598267
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| || |    
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacaccaatt 22598232  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcggga 841  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22598233 ggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga 22598267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 718 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000260
Alignment:
Q  718 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacccc 817  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacacggtaaggttccatacaatacaccaaatggtgggacccc 23000268  T
Q  818 ttcccgga 825  Q
    ||||||||    
T  23000267 ttcccgga 23000260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 714 - 866
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457307
Alignment:
Q  714 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtggga 813  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgtaaaaataggaaaaggctgcgtacaatacatcaaatggtagga 31457254  T
Q  814 ccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||| | |||||||| |  |||||||||    
T  31457255 ccccttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 31457307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 687 - 823
Target Start/End: Original strand, 11748254 - 11748393
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaag 785  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  11748254 aggggtaactttggtgcaactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaag 11748353  T
Q  786 gctgcgtaca--atacacaaaatggtgggaccccttcccg 823  Q
     | |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11748354 acagcgtacaatatacaaaaaatggtaggaccccttcccg 11748393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 8484109 - 8483951
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  8484109 ccttggcgcaac-ggtaaagcggttgccacgtgacttaaatgtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgta 8484011  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  8484010 caatacaccaattggtgggaccccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagggcac 8483951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 738 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 5135418 - 5135313
Alignment:
Q  738 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatg 836  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5135418 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatg 5135319  T
Q  837 cgggag 842  Q
    | ||||    
T  5135318 caggag 5135313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 749 - 853
Target Start/End: Original strand, 29877111 - 29877216
Alignment:
Q  749 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||    
T  29877111 gtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgtta 29877210  T
Q  848 gtgcac 853  Q
    ||||||    
T  29877211 gtgcac 29877216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 711 - 827
Target Start/End: Original strand, 35105902 - 35106020
Alignment:
Q  711 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatgg 808  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  35105902 aaagttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacaccagaatgg 35106001  T
Q  809 tgggaccccttcccggacc 827  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  35106002 tgggacctcttcctggacc 35106020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 731 - 853
Target Start/End: Original strand, 389642 - 389767
Alignment:
Q  731 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  389642 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatgatgggatccctttcctgacc 389741  T
Q  828 ttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     || ||||||| ||| ||||||||||    
T  389742 ctgcgtatgcgagagctttagtgcac 389767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 695 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 14018140 - 14018007
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| || |||||||    
T  14018140 ccttggcgcaac-ggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgta 14018042  T
Q  794 caatacac-aaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||    
T  14018041 caatacactaaattggtgggaccacttcctggacc 14018007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 741 - 853
Target Start/End: Original strand, 5689640 - 5689753
Alignment:
Q  741 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgg 839  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||    
T  5689640 gggttcaagtcttgtaaatagcctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccatgcgtatgtgg 5689739  T
Q  840 gaggtttagtgcac 853  Q
    ||| ||||||||||    
T  5689740 gagctttagtgcac 5689753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 708 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000973
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaa 805  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||  ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacaccaaa 11001010  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||    
T  11001009 tggtgggacccctacccgaaccctgtttatgcaggag 11000973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 749 - 866
Target Start/End: Original strand, 10857845 - 10857964
Alignment:
Q  749 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  10857845 gtccaggaaaccgcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaattggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagcttt 10857944  T
Q  847 agtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  10857945 agtgcaccgggttgcccttt 10857964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 687 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 44742698 - 44742531
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||| | |||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||    
T  44742698 agggggaaccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaag 44742600  T
Q  786 gctgcgtacaataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |  | |||||||||  |||||||||    
T  44742599 gctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcttggaccctacggatgcgggagcattagtgcac 44742531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 695 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 30962944 - 30962864
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30962944 ccttggcgcaac-ggaaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 30962864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 40605086 - 40604906
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taa 784  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | | ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||   || |||    
T  40605086 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggataa 40604987  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||   ||| |  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  40604986 ggttgcgtacaatacactaaatgat-ggatcccttccgaaaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgaattgcccttt 40604906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 750 - 866
Target Start/End: Original strand, 20869941 - 20870060
Alignment:
Q  750 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaa--atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||| |||    
T  20869941 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagcttt 20870040  T
Q  847 agtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  20870041 agtgcaccgggttgcccttt 20870060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 753 - 866
Target Start/End: Original strand, 19729363 - 19729475
Alignment:
Q  753 tggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| | |||||||    
T  19729363 tggaaacagtctcttatgtaaaa-cagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagctctagtgca 19729461  T
Q  853 ctgagttgcccttt 866  Q
    |||  |||||||||    
T  19729462 ctggattgcccttt 19729475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 743 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 17251001 - 17250888
Alignment:
Q  743 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgg 839  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||| || |||||  |    
T  17251001 gttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaag 17250902  T
Q  840 gaggtttagtgcac 853  Q
    ||| ||||||||||    
T  17250901 gagctttagtgcac 17250888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 792 - 866
Target Start/End: Original strand, 26102578 - 26102652
Alignment:
Q  792 tacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  26102578 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 26102652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 756 - 822
Target Start/End: Original strand, 43942348 - 43942417
Alignment:
Q  756 aaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttccc 822  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43942348 aaacagcctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttccc 43942417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 758 - 866
Target Start/End: Original strand, 16225045 - 16225156
Alignment:
Q  758 acagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaa--atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcact 854  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||     
T  16225045 acagcctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 16225144  T
Q  855 gagttgcccttt 866  Q
    | |||| |||||    
T  16225145 gggttgtccttt 16225156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 686 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 23286474 - 23286431
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 729  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286474 gaggggtaaccttgtcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 23286431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 761
Target Start/End: Original strand, 27634983 - 27635058
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtc-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacag 761  Q
    ||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27634983 aggggtagccttggcggaaccagtaaagttgttttttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacag 27635058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 803 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 35107374 - 35107311
Alignment:
Q  803 aaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||    
T  35107374 aaatggtgggaccccttcccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgcccttt 35107311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 758 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 23286432 - 23286375
Alignment:
Q  758 acagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccc 816  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23286432 acagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaagctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 23286375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 780 - 853
Target Start/End: Original strand, 26457778 - 26457849
Alignment:
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  26457778 ggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggacccct--cctgaccttgcgtatgagggagctttagtgcac 26457849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 688 - 760
Target Start/End: Original strand, 31454144 - 31454216
Alignment:
Q  688 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaca 760  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||| |||||    
T  31454144 ggggtaatcttggcgcaaccggtatagttgttgtcatgtggttgaaaggtcacatgttcatgtcctgaaaaca 31454216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 710 - 852
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918245
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatgg 808  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||||||  |||||||| |||||||||   |||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatag 36918201  T
Q  809 tgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    | |||  |||||||  ||| | |||||||| ||| |||| ||||    
T  36918202 taggattccttcccaaaccctatgtatgcgagagctttaatgca 36918245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 802 - 852
Target Start/End: Original strand, 18595909 - 18595959
Alignment:
Q  802 aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18595909 aaaatgataggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagttttagtgca 18595959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 685 - 723
Target Start/End: Original strand, 42840862 - 42840900
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtca 723  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42840862 agaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtca 42840900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 788 - 866
Target Start/End: Original strand, 16013511 - 16013591
Alignment:
Q  788 tgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  16013511 tgcgtacaatacactaaaaatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggttgtccttt 16013591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 805 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 36486627 - 36486567
Alignment:
Q  805 atggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | | |||||||||    
T  36486627 atggtgggacctcttcccggaccttgcgtatgcaggagctttagtgccccgggttgccctt 36486567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 806 - 853
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508032
Alignment:
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  27507985 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 27508032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 723 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 3377560 - 3377507
Alignment:
Q  723 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  3377560 atgtgactcaaaggtcacgaattcaattcttggaaatagcctcttgtgtaaaaa 3377507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 817 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 27468141 - 27468092
Alignment:
Q  817 cttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  27468141 cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 27468092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 41014273 - 41014453
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41014273 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 41014372  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  41014373 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 41014453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 38879535 - 38879718
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  38879535 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaa 38879634  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  38879635 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 38879718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 24448844 - 24449025
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||    
T  24448844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 24448943  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  24448944 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 24449025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 8170164 - 8169984
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  8170164 agagggctaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgt-aaaacagggtaa 8170066  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||| | ||||||||||    
T  8170065 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgcccttt 8169984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 689 - 866
Target Start/End: Original strand, 43334159 - 43334339
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaagg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  43334159 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaagg 43334258  T
Q  787 ctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  43334259 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcg-atgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 43334339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 35710267 - 35710446
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  35710267 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaatagggtaag 35710365  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  35710366 gctgcgttcaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 35710446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 689 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 4619284 - 4619104
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggc 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4619284 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 4619185  T
Q  788 tgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  4619184 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 4619104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 689 - 852
Target Start/End: Original strand, 27328709 - 27328875
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggc 787  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27328709 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 27328808  T
Q  788 tgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  27328809 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgca 27328875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 719 - 866
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703557
Alignment:
Q  719 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacccct 818  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccct 32703509  T
Q  819 tcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  32703510 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 32703557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Original strand, 1565384 - 1565566
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggt 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||   |    
T  1565384 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatatt 1565483  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||  |||| |||| | ||||||||| | ||||||||||    
T  1565484 aaggctgcgtacaatgcaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtggga-gcttagtgcaccgggttgcccttt 1565566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 695 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 19143113 - 19142954
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19143113 ccttggcgcaa-tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtac 19143015  T
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactg 855  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  19143014 agtacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcactg 19142954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 687 - 842
Target Start/End: Original strand, 2838733 - 2838889
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2838733 aggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgtaaaaacagggtaag 2838832  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  2838833 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggag 2838889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 686 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 37024735 - 37024626
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37024735 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 37024637  T
Q  786 gctgcgtacaa 796  Q
    |||||||||||    
T  37024636 gctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Original strand, 22600408 - 22600565
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||| |||||    
T  22600408 gaggggtaaccttgacgtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggtaa 22600507  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||    
T  22600508 ggctgtgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggag 22600565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 209098 - 208940
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  209098 ccttggcgcagc-ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcattc 209000  T
Q  795 aataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||| ||||||||||    
T  208999 aatacaccaaaatggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcac 208940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 689 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 22861844 - 22861669
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggct 788  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  22861844 gggtaaccttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgt-aaaacaa-gtaagact 22861747  T
Q  789 gcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||  ||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||| | |||||||| || |||||||||    
T  22861746 gctcacaatacatcaaatggtgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgaattgcccttt 22861669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 686 - 801
Target Start/End: Original strand, 22187239 - 22187355
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  22187239 gaggggtaactttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgataa 22187338  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac 801  Q
    | |||||||||||||||    
T  22187339 gactgcgtacaatacac 22187355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Original strand, 39301087 - 39301245
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  39301087 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgta 39301185  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||||||||    
T  39301186 taatgcaccaaaaaggtgggaccccttcccggaccctccgtatgtggga-gtttagtgcac 39301245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 687 - 853
Target Start/End: Original strand, 43574553 - 43574728
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcac---------gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaa 776  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  43574553 aggggtagccttggcgcaa-tgataaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacttcggtcacgtgttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaa 43574651  T
Q  777 caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  43574652 cagggtaaggctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagagcac 43574728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 692 - 862
Target Start/End: Original strand, 30006285 - 30006456
Alignment:
Q  692 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa-aacaaggtaaggctgc 790  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||     
T  30006285 taacattggcgcaactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgt 30006384  T
Q  791 gtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcc 862  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  30006385 gtacattacactaaatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 30006456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 686 - 776
Target Start/End: Original strand, 23974735 - 23974824
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23974735 gaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa 23974824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 716 - 853
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850761
Alignment:
Q  716 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacc 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgtaaaaacagaataagggtgcgtacaatacatcaaatggtgggacc 1850723  T
Q  816 ccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     ||||| ||||| || | |||||| || ||||||||||    
T  1850724 acttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcac 1850761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 697 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 12006500 - 12006329
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcac-gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||    
T  12006500 ttggcgcaactgctcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagt-ctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggctccatac 12006402  T
Q  795 aatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  12006401 aatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctt 12006329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 708 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516449
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaa 805  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatcaaaa 28516494  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || | |||| |||| |||||||    
T  28516493 tggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtg 28516449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 717 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907888
Alignment:
Q  717 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccc 816  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaaggttgcatacaatacaccaaatggtgggaccc 22907915  T
Q  817 ct-tcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    || |||| ||| |||||| ||| ||||    
T  22907914 ctctcccagacattgtgtgtgcaggag 22907888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 756 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 7097870 - 7097773
Alignment:
Q  756 aaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  7097870 aaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 7097773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 741 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801767
Alignment:
Q  741 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgc 837  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 13801796  T
Q  838 gggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | ||| |||||||||| | ||||||||||    
T  13801795 gagagctttagtgcaccgggttgcccttt 13801767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 747 - 863
Target Start/End: Original strand, 7368413 - 7368528
Alignment:
Q  747 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| | |    
T  7368413 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctct 7368511  T
Q  847 agtgcactgagttgccc 863  Q
    ||||||| | |||||||    
T  7368512 agtgcaccgggttgccc 7368528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 757 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 16880757 - 16880647
Alignment:
Q  757 aacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactg 855  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |    
T  16880757 aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 16880658  T
Q  856 agttgcccttt 866  Q
     ||| ||||||    
T  16880657 ggtttcccttt 16880647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 691 - 800
Target Start/End: Original strand, 31299591 - 31299700
Alignment:
Q  691 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgc 790  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||  ||||    
T  31299591 gtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttacaggtcactagttcaagtcctagaaacagcctcttgtattaaaacagtgtaaaactgc 31299690  T
Q  791 gtacaataca 800  Q
    ||||||||||    
T  31299691 gtacaataca 31299700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 751 - 865
Target Start/End: Original strand, 20135623 - 20135740
Alignment:
Q  751 cctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| || |    
T  20135623 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagcttca 20135722  T
Q  848 gtgcactgagttgccctt 865  Q
    |||||| | |||||||||    
T  20135723 gtgcaccgggttgccctt 20135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 709 - 866
Target Start/End: Original strand, 3771318 - 3771474
Alignment:
Q  709 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatgg 808  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| || | ||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| || |||    
T  3771318 gtaatgttgttctcacgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcatgtaaacagtctgt-gtaaaaaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaattgg 3771416  T
Q  809 tgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| | | ||||||||    
T  3771417 tgggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 3771474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 715 - 842
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405298
Alignment:
Q  715 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaag-gtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtggga 813  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  || |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacaccaaatggtggga 1405269  T
Q  814 ccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||| |||| | ||| ||  ||||||||||    
T  1405270 ccctttcctgaaccctgcatatgcgggag 1405298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 752 - 866
Target Start/End: Original strand, 29334415 - 29334531
Alignment:
Q  752 ctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagt 849  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||  |||| |    
T  29334415 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccagaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaat 29334514  T
Q  850 gcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| | | ||||||||    
T  29334515 gcaccgggctgcccttt 29334531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 710 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 24323862 - 24323717
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatgg 808  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||| | |||| |    
T  24323862 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24323763  T
Q  809 tgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactg 855  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  24323762 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagcttt-gtgcactg 24323717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 710 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 24360486 - 24360341
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatgg 808  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||| | |||| |    
T  24360486 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24360387  T
Q  809 tgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactg 855  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  24360386 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagcttt-gtgcactg 24360341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 710 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24313732 - 24313572
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-agcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaat 806  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | || ||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  24313732 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaaaat 24313633  T
Q  807 ggtgggaccccttcccgg-accttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| | || |||||||||| | | ||||||||    
T  24313632 ggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgcccttt 24313572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 710 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24356069 - 24355909
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-agcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaat 806  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | || ||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  24356069 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaaaat 24355970  T
Q  807 ggtgggaccccttcccgg-accttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| | || |||||||||| | | ||||||||    
T  24355969 ggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgcccttt 24355909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 791 - 866
Target Start/End: Original strand, 16957374 - 16957449
Alignment:
Q  791 gtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  16957374 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 16957449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 712 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 34074717 - 34074606
Alignment:
Q  712 aagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtg 810  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||      
T  34074717 aagttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacaccaaatggca 34074618  T
Q  811 ggaccccttccc 822  Q
    || |||||||||    
T  34074617 gggccccttccc 34074606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 707 - 827
Target Start/End: Original strand, 18698586 - 18698705
Alignment:
Q  707 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaata-cacaaaa 805  Q
    ||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||    
T  18698586 tggtaaaatggttgtcacgtgattgaacggtcacgggttcaagtactgaaaacagcctct--tgtaaaaacaaggtacggctgcatacaatatgtcaaaa 18698683  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  18698684 tggcgggactccttcccggacc 18698705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 780 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 34154900 - 34154814
Alignment:
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || | |||||||| | ||||||||||    
T  34154900 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgcccttt 34154814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 747 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 5873441 - 5873336
Alignment:
Q  747 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||| |||    
T  5873441 aagtcgtggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggctaagtacactacaccaattggtgggactcctccccggacactgcgtatgcgggagcttt 5873342  T
Q  847 agtgca 852  Q
    ||||||    
T  5873341 agtgca 5873336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 709 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 31694266 - 31694121
Alignment:
Q  709 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taaggctgcgtacaatacacaaaatg 807  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| || ||| || | || |||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||  | ||    
T  31694266 gtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcataggttcaagtcttgaaaaaagtcactcgtgtaaaaaataggctaaagctgcatacaatacacctattg 31694167  T
Q  808 gtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31694166 atgggactccttcccagaccttgcgtatgcgggagatttagtgcac 31694121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 695 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 10634317 - 10634175
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| || |||||||||  |||    
T  10634317 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaaggctcggta 10634219  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
     |||||||         |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  10634218 aaatacac---------ggaccccttcccagaccatgtgtatgcaggaggttt 10634175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 724 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 42924977 - 42924843
Alignment:
Q  724 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttc 820  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||    
T  42924977 tgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttc 42924878  T
Q  821 ccgg--accttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    || |  ||| || |||||||| || ||||||||||    
T  42924877 ccagacaccctgcgtatgcggaagctttagtgcac 42924843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 727 - 789
Target Start/End: Original strand, 22025538 - 22025601
Alignment:
Q  727 gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctg 789  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22025538 gactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 22025601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 695 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 39079937 - 39079875
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 758  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39079937 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagtcttggaaa 39079875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 736 - 822
Target Start/End: Original strand, 41425952 - 41426039
Alignment:
Q  736 gtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttccc 822  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41425952 gtcacgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttccc 41426039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 697 - 762
Target Start/End: Original strand, 17419879 - 17419944
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagc 762  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17419879 ttggcgtaactggtaaaattgttgtaatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcctggaaacagc 17419944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 685 - 742
Target Start/End: Original strand, 19438702 - 19438759
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg 742  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  19438702 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactaaaagatcacgg 19438759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 802 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 21784396 - 21784335
Alignment:
Q  802 aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccc 863  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21784396 aaaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggaggtttagtgcaccgagttgccc 21784335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 750 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 12575779 - 12575660
Alignment:
Q  750 tcctggaaacagcctcttgtgtaaa--aacaaggtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||    
T  12575779 tcctggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagcttt 12575680  T
Q  847 agtgcactgagttgcccttt 866  Q
     |||||| | | ||||||||    
T  12575679 ggtgcaccgggctgcccttt 12575660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 708 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 24903855 - 24903736
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||  || ||||||| ||| || |    
T  24903855 ggtaaatttgttgtcacgtgactgaaaagtcatgggcacaagtcctgaaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagattgtgtacaatccaccaatt 24903756  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggac 826  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  24903755 ggtgagaccccttcccggac 24903736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 791 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 39079827 - 39079764
Alignment:
Q  791 gtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  39079827 gtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccatgtgtatacgggagttttagtgcac 39079764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 804 - 868
Target Start/End: Original strand, 25622533 - 25622597
Alignment:
Q  804 aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  25622533 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttgc 25622597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 791 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 37226037 - 37225961
Alignment:
Q  791 gtacaataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  37226037 gtacaatacaacaaaatggtgggaccccttcccgaaccatgcgtatgccagaggtttagtgcactggattgcccttt 37225961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 782 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 12477205 - 12477161
Alignment:
Q  782 taaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccgga 825  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12477205 taaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgga 12477161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 793 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10306548 - 10306493
Alignment:
Q  793 acaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10306548 acaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 10306493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 815 - 866
Target Start/End: Original strand, 32354211 - 32354262
Alignment:
Q  815 cccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  32354211 cccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 32354262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 686 - 724
Target Start/End: Original strand, 41956886 - 41956924
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcat 724  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41956886 gaggggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcat 41956924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 707 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 31362495 - 31362454
Alignment:
Q  707 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaa 748  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31362495 tggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaa 31362454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 781 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 11657785 - 11657742
Alignment:
Q  781 gtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccg 823  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11657785 gtaaggctgcatacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccg 11657742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 807 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028624
Alignment:
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 16028624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 781 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 3176839 - 3176770
Alignment:
Q  781 gtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||   |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  3176839 gtaaggttgcgtacaatacaccaactggtgggaccc---cccggactctgtgtatgccggagctttagtgcac 3176770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 715 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 9794511 - 9794465
Alignment:
Q  715 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacag 761  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9794511 ttgttgtcatgtgatcaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag 9794465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 787 - 853
Target Start/End: Original strand, 13774921 - 13774987
Alignment:
Q  787 ctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  13774921 ctgcgcacaatacaccaaatggcaggatccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 13774987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 710 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 28208264 - 28208235
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtca 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28208264 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtca 28208235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 99)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 34725277 - 34725098
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34725277 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 34725179  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  34725178 gctgcgtacaatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 34725098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 685 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 32632738 - 32632570
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32632738 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 32632639  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||| || |||||||    
T  32632638 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcac 32632570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 14617015 - 14617196
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa-aacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14617015 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggtaa 14617114  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  14617115 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 14617196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 46248134 - 46247953
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  46248134 gaggggtaaccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46248035  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  46248034 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttt 46247953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 27201624 - 27201807
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  27201624 gaggggtaaccttagcgtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggtaa 27201723  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  27201724 ggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 27201807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Original strand, 18944619 - 18944804
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggta 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18944619 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 18944718  T
Q  784 aggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag-gtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  18944719 aggctgcgtacaatacaccaacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 18944804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Original strand, 10668196 - 10668385
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt-----gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaaca 778  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10668196 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaca 10668295  T
Q  779 aggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  10668296 aggtaaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10668385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 692 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 30395903 - 30395726
Alignment:
Q  692 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgc 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30395903 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 30395804  T
Q  791 gtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30395803 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 30395726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 686 - 863
Target Start/End: Original strand, 46991781 - 46991959
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  46991781 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46991880  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccc 863  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| | |||||||    
T  46991881 ggctgtgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgccc 46991959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 20004274 - 20004090
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggta 783  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20004274 agaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggta 20004175  T
Q  784 aggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  20004174 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 20004090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 38478462 - 38478282
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38478462 agaggggtaaccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 38478364  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  38478363 ggctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 38478282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 27474258 - 27474438
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||     
T  27474258 gaggggtaaccttagctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggcaaa 27474357  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  27474358 gctgcgtacaatacactgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 27474438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 685 - 853
Target Start/End: Original strand, 47214487 - 47214654
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||    
T  47214487 agaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgt-ttaaaacagggtaa 47214585  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| | ||||||||    
T  47214586 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 47214654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 41319987 - 41319806
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  41319987 gaggggtaaccttgacacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 41319888  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |   |||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  41319887 ggctgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgcccttt 41319806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 683 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 22930251 - 22930108
Alignment:
Q  683 atagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggt 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22930251 atagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaacagggt 22930152  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22930151 aaggttgtg-acaatacaccaaatggtgggaccccttcctggacc 22930108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 689 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 23768498 - 23768334
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggc 787  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23768498 gggtaacctcgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 23768399  T
Q  788 tgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||    
T  23768398 tgcgtacaatacaccaaatggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 23768334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 692 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 12127010 - 12126837
Alignment:
Q  692 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcg 791  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12127010 taaccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcg 12126912  T
Q  792 tacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  12126911 tacaatacaccaaattgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcactgcgttgcccttt 12126837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 691 - 863
Target Start/End: Original strand, 45402077 - 45402251
Alignment:
Q  691 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggt--aag-gc 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |    
T  45402077 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggttcaagttc 45402175  T
Q  788 tgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccc 863  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  45402176 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 45402251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 705 - 862
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925254
Alignment:
Q  705 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaa 803  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||      
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacaccg 6925195  T
Q  804 aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcc 862  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6925196 aatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgagttgcc 6925254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 685 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 45812717 - 45812541
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||    
T  45812717 agaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgt-aaaagagggtaa 45812619  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcc 862  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||    
T  45812618 ggctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 45812541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 690 - 866
Target Start/End: Original strand, 19414420 - 19414595
Alignment:
Q  690 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctg 789  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  19414420 ggtaaccttggcgtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgt-aaaacaggttaaggctg 19414518  T
Q  790 cgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  19414519 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 19414595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 8197020 - 8197201
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  8197020 gaggggtaaccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggtaa 8197119  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||||  |||| ||||||| || | ||||||||||    
T  8197120 ggctacgtacagtacaccaaatggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgcccttt 8197201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 18724715 - 18724584
Alignment:
Q  696 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  18724715 cttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtac 18724617  T
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  18724616 aatacaccaaatcttgggaccccttcccggacc 18724584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 842
Target Start/End: Original strand, 11596501 - 11596646
Alignment:
Q  696 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtaca 795  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  11596501 cttggcgcaac-ggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtata 11596599  T
Q  796 atacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  11596600 atacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggag 11596646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 691 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 18742137 - 18741957
Alignment:
Q  691 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcct-ggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaaggc 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| || |||| |  ||||||| ||||||||    
T  18742137 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggc 18742038  T
Q  788 tgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  18742037 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtttcccttt 18741957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 2435958 - 2435799
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  2435958 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgta 2435860  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |  | ||||||||| ||||||||||    
T  2435859 caatacaccaaaatggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcac 2435799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 692 - 866
Target Start/End: Original strand, 9939443 - 9939622
Alignment:
Q  692 taaccttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa-aaacaaggtaaggctg 789  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| ||    
T  9939443 taaccttggcgcaaccggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttg 9939542  T
Q  790 cgtacaatacac--aaaatggtggga-ccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  9939543 cgtgcaatacaccaaaaatggtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 9939622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 686 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 19932933 - 19932782
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  19932933 gaggggttaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagt--tggatacaacct-ttgtgtaaaaaacagggtaa 19932837  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgc 837  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19932836 ggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgc 19932782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 723 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253187
Alignment:
Q  723 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttccc 822  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 35253231  T
Q  823 ggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||| ||  |||||||||| | |||||||| |  |||||||||    
T  35253230 ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 35253187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 817
Target Start/End: Original strand, 33222971 - 33223093
Alignment:
Q  696 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtaca 795  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  33222971 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggaaaggttgcgtaca 33223070  T
Q  796 ataca-caaaatggtgggacccc 817  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  33223071 atacaccaaaatggtgggacccc 33223093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 708 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117778
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaa 804  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  805 atggtgggaccccttcccggaccttgtgt-atgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||| ||||||||||    
T  35117827 atgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcac 35117778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 725 - 866
Target Start/End: Original strand, 35005139 - 35005283
Alignment:
Q  725 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35005139 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcc 35005238  T
Q  822 cggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  35005239 cggaccctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgcccttt 35005283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 709 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468287
Alignment:
Q  709 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatg 807  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatg 25468322  T
Q  808 gtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    || ||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  25468321 gttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggag 25468287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 696 - 842
Target Start/End: Original strand, 20036208 - 20036355
Alignment:
Q  696 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaa--ggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||  ||||||  |||||     
T  20036208 cttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgtt 20036306  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  20036307 caatacaccaaatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggag 20036355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 44485289 - 44485133
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaa 784  Q
    |||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||    
T  44485289 gagggggagccttggcgcaacag-taaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaa 44485191  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  44485190 ggctgcgtacaatacaccaaatggttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggag 44485133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Original strand, 19701557 - 19701716
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||    
T  19701557 ccttggcgcaacag-taaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggta 19701655  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  19701656 caatacaccaaaatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 19701716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 695 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 6983980 - 6983811
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||  |||||||    
T  6983980 ccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcgtat-aaaaaacagggtaagtatgcgtac 6983883  T
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||| ||| |||||| | | ||||||||    
T  6983882 aatacaccaaatggtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgcccttt 6983811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 695 - 866
Target Start/End: Original strand, 50811926 - 50812098
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaaggctgcgt 792  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  50811926 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgt 50812024  T
Q  793 acaataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  50812025 acaatacaccaaaatggt-ggaccccttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcactgggctgcccttt 50812098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 684 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 4430209 - 4430080
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggt 782  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  4430209 tagagggttaatcttggcgcagctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggt 4430110  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtggg 812  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4430109 aagactgcgtacaatacaccaaatggtggg 4430080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 695 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 17470517 - 17470390
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17470517 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 17470419  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  17470418 caatacaccaaaatagtgggacccgttcc 17470390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 750 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 31382330 - 31382214
Alignment:
Q  750 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagt 849  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||| |    
T  31382330 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagctttact 31382231  T
Q  850 gcactgagttgcccttt 866  Q
    | || | ||||||||||    
T  31382230 gtaccgggttgcccttt 31382214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 15511322 - 15511161
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcg-- 791  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||      
T  15511322 ccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgga 15511224  T
Q  792 tacaataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||||    
T  15511223 tacaatacaccaaaatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcac 15511161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 720 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 19974221 - 19974074
Alignment:
Q  720 gtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggacccct 818  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  19974221 gtcacgtgactgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgtaaaaatagggcaaggttgcgtacaatacaccaaaatgatgggacccat 19974122  T
Q  819 tcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| | | ||||||||    
T  19974121 tcccggactctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgcccttt 19974074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 695 - 812
Target Start/End: Original strand, 22327086 - 22327204
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  22327086 ccttggcgcaac-ggcaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgta 22327184  T
Q  794 caataca-caaaatggtggg 812  Q
    | || || ||||||||||||    
T  22327185 cgatgcaccaaaatggtggg 22327204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 686 - 761
Target Start/End: Original strand, 34714600 - 34714675
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacag 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34714600 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacag 34714675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 772 - 866
Target Start/End: Original strand, 4349702 - 4349796
Alignment:
Q  772 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  4349702 aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 4349796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 10378896 - 10378748
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||  |||||| |||||||||||||||    
T  10378896 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggttacgggttcaagtcctggaaa---------gtgagaaaacagggtaaggctgcgtac 10378807  T
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  10378806 aatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcac 10378748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 689 - 776
Target Start/End: Original strand, 25290143 - 25290232
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaa--acagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  25290143 gggtaaccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaa 25290232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 695 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 27136823 - 27136675
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || |||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27136823 ccttggcacaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgta 27136725  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  27136724 caatacaccaaaatggtgggaccccttcctagatcatgtgtatgcgggag 27136675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 690 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 18335465 - 18335305
Alignment:
Q  690 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggct 788  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||| | |    
T  18335465 ggtaaccttggcgcaagtgataaagtttttgtcatgtgtctgaaaggtcacaagttaaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaaattagggtaaagtt 18335366  T
Q  789 gcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagt 849  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  18335365 gcgtacaatacatcaaatgatgggaccctttcctagaccatgtgtatacgggagctttagt 18335305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 719 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272381
Alignment:
Q  719 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacccct 818  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||          
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacatggtaaggctgcgtacagcacatcaaatggtggg------ 31272429  T
Q  819 tcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  31272428 ttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtggactgggctgcccttt 31272381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Original strand, 35019217 - 35019374
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||   ||||||||| ||    
T  35019217 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcata 35019315  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||    
T  35019316 caatacaccaattggtgggacccc-tcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcac 35019374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 695 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 50760397 - 50760291
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  50760397 ccttggcgcaaa-ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgta 50760299  T
Q  794 caatacac 801  Q
     |||||||    
T  50760298 taatacac 50760291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 688 - 753
Target Start/End: Original strand, 40424721 - 40424786
Alignment:
Q  688 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcct 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40424721 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagtcct 40424786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 741 - 853
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325038
Alignment:
Q  741 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcg 838  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||| |||| |||| || |||||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgtccc-gaccctgcgtatgcg 22325023  T
Q  839 ggaggtttagtgcac 853  Q
    |||| ||||||||||    
T  22325024 ggagctttagtgcac 22325038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 687 - 809
Target Start/End: Original strand, 24564322 - 24564445
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  24564322 aggggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24564421  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggt 809  Q
    | |||||||||| ||| |||||||    
T  24564422 ggtgcgtacaattcaccaaatggt 24564445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 695 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 2436064 - 2435984
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2436064 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaaa 2435984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 751 - 866
Target Start/End: Original strand, 23796507 - 23796623
Alignment:
Q  751 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagt 849  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||| |||| ||||||    
T  23796507 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttagt 23796606  T
Q  850 gcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| | | ||||||||    
T  23796607 gcaccgggctgcccttt 23796623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 695 - 821
Target Start/End: Original strand, 23371111 - 23371236
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||   || |||| || ||||    
T  23371111 ccttggcgcaacag-taaagttgttttcgcatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaacgggcaaggttgtgtac 23371209  T
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23371210 aatacaccaaatgctgggaccccttcc 23371236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 740 - 842
Target Start/End: Original strand, 30682845 - 30682946
Alignment:
Q  740 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgg 839  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30682845 cgggttcaaatcctgaaaatagcctcttgtgtaaaaacaaggtaagattgtgtac-atacaacaaatggtgggaccccttcccggaccgtgcgtatgcgg 30682943  T
Q  840 gag 842  Q
    |||    
T  30682944 gag 30682946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 725 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 45264542 - 45264412
Alignment:
Q  725 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg-taaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggaccccttccc 822  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  45264542 gtgattgaaaggtcacatgttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaaaatggtgggaccccttctc 45264443  T
Q  823 ggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     |||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  45264442 agaccctgcatatgcgggagctttagtgcac 45264412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 687 - 773
Target Start/End: Original strand, 21723642 - 21723727
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa 773  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21723642 aggggtaaccttcgcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggatggttacaagttc-agtcctggaaacagcctcttgtgtaa 21723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 695 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 25554893 - 25554800
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctg 789  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  25554893 ccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactaaaaggccacgtgtttaagtcctggaaacaacctcttgtgtagaaacacggtagggctg 25554800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 743 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 31442515 - 31442402
Alignment:
Q  743 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgg 839  Q
    ||||||||| | |||||||||| || ||||||||  || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  31442515 gttcaagtcttagaaacagccttttatgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgg 31442416  T
Q  840 gaggtttagtgcac 853  Q
    ||| ||| ||||||    
T  31442415 gagctttggtgcac 31442402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 709 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214971
Alignment:
Q  709 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaata-cacaaaat 806  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||   ||||||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattccaaaat 39215018  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||| |||||||||  ||| || ||||| || || ||||||||||    
T  39215017 ggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcac 39214971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 772 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 42304303 - 42304207
Alignment:
Q  772 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaa--tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  42304303 aaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgcccttt 42304207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 695 - 776
Target Start/End: Original strand, 52910204 - 52910284
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  52910204 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaa 52910284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 761 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 1517418 - 1517311
Alignment:
Q  761 gcctcttgtgt--aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagt 858  Q
    |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| || |||||| |||| |||||||||| | ||    
T  1517418 gcctcttgtgttaaaaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggt 1517319  T
Q  859 tgcccttt 866  Q
    ||||||||    
T  1517318 tgcccttt 1517311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 700 - 773
Target Start/End: Original strand, 22151495 - 22151568
Alignment:
Q  700 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa 773  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22151495 gcgcaactgataaagttgttgtcatctgactgtaaggtcataggttcaagttctggaaacagcctcttatgtaa 22151568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 789 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 4249520 - 4249456
Alignment:
Q  789 gcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4249520 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcac 4249456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 789 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 4249844 - 4249780
Alignment:
Q  789 gcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4249844 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcac 4249780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 789 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 4250168 - 4250104
Alignment:
Q  789 gcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4250168 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcac 4250104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 687 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 18336026 - 18335914
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa-aacaaggtaag 785  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||| ||| |  || |||| |||| |||| ||||||    
T  18336026 aggggtaatcttggcgcaagtgataaagttgttgccatgtgtctgaaaggtcacatgttcaagttctgaaaataatctattgtttaaagaacagggtaag 18335927  T
Q  786 gctgcgtacaata 798  Q
    |||||||||||||    
T  18335926 gctgcgtacaata 18335914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 760 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 20999957 - 20999850
Alignment:
Q  760 agcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagt 858  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||| || ||| ||||||| |||||||||| | |     
T  20999957 agccacttgtgtaaaaaacaaggcaaggctgcgtacaatacaccaaatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggc 20999858  T
Q  859 tgcccttt 866  Q
    ||||||||    
T  20999857 tgcccttt 20999850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 697 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 34679388 - 34679274
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtaca 795  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||     
T  34679388 ttggcgcaac-ggtaaagttattgtcatgtgactgaaatatcacatgttccattcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtact 34679290  T
Q  796 atacacaaaatggtgg 811  Q
    |||||  |||||||||    
T  34679289 atacatcaaatggtgg 34679274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 780 - 842
Target Start/End: Original strand, 15505636 - 15505698
Alignment:
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15505636 ggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggag 15505698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 761 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 21910754 - 21910692
Alignment:
Q  761 gcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccg 823  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21910754 gcctcttatgtaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 21910692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 684 - 776
Target Start/End: Original strand, 10163734 - 10163826
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||  ||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10163734 tagaggggtaacattggcgcaactgataaagttgttgtcatgtggctaaaatgttacaagtttaagttctgaaaacaacctcttatgtaaaaa 10163826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 710 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 19656263 - 19656155
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatg 807  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||    
T  19656263 taaagttgttgtcgcgtgactcaaaggtcactagctcaaggcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaacgctatgtacaatacaccaaaatg 19656164  T
Q  808 gtgggaccc 816  Q
    || ||||||    
T  19656163 gtaggaccc 19656155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 774 - 866
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768297
Alignment:
Q  774 aaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| |||| ||||| | | ||||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgcccttt 43768297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 802 - 866
Target Start/End: Original strand, 50606497 - 50606561
Alignment:
Q  802 aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  50606497 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 50606561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 702 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 14988084 - 14987989
Alignment:
Q  702 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaa 796  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||  |||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14988084 gcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaagtcacaagttcaagtcctgaaaacagtatcttatgtaaaatacaggataaggctgcgtacaa 14987989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 690 - 757
Target Start/End: Original strand, 21006125 - 21006192
Alignment:
Q  690 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaa 757  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  21006125 ggtaaccttgacgcaaccggtaaaattgttgtcatgcgactgaaaggtcaaaggttcaagtactggaa 21006192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 753 - 836
Target Start/End: Original strand, 21723728 - 21723811
Alignment:
Q  753 tggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatg 836  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||  |||||||||| || |||||    
T  21723728 tggaaacagcctcttgtataaaaatagggtaaggctgagtacaatacaccaaatggtagaaccttttcccggaccctgcgtatg 21723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 785 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 4430080 - 4430014
Alignment:
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgc 851  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  4430080 ggctgcgtacaatacaccaaatggtggaacccctttctggatcctgtgtatgcgggagctttagtgc 4430014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 719 - 761
Target Start/End: Original strand, 43768168 - 43768210
Alignment:
Q  719 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacag 761  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43768168 tgtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacag 43768210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 751 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 34149076 - 34148999
Alignment:
Q  751 cctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||    
T  34149076 cctggaaacagcctcttgtgtagaaaatagggtaaggttgcgtacaaaagaccaaatggtgagaccccttcctggacc 34148999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 713 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 49722726 - 49722585
Alignment:
Q  713 agttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtggg 812  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  || || | ||||||  ||||||||||| |   | ||||||     
T  49722726 agttgttgtcacgtgaatgaaaggtcacgggtttaagtcatgtaaacaacctcttgtaaaataatagggtaagattgcgtacaatatattgattggtgga 49722627  T
Q  813 accccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcact 854  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| || || |||| ||||||    
T  49722626 accccttcccaaaccttgcgtatgtggcagctttaatgcact 49722585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 750 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 44745900 - 44745854
Alignment:
Q  750 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaat 797  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44745900 tcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacaaggtaaagctgcgtacaat 44745854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 749 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 20169207 - 20169113
Alignment:
Q  749 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaa-ggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  20169207 gtcctgaaaacaccctcttgtgtaaaaaaaaaggtaagactgtgtacaataccccaatcggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggag 20169113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 33594191 - 33594142
Alignment:
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactg 855  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  33594191 tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactg 33594142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 780 - 850
Target Start/End: Original strand, 6358193 - 6358264
Alignment:
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||  |||||||    
T  6358193 ggtaaagctgcgtacaaaacaccaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcaggatctttagtg 6358264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 693 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 28894704 - 28894658
Alignment:
Q  693 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcac 740  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28894704 aaccttggcgcaacag-taaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcac 28894658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 807 - 854
Target Start/End: Original strand, 37299573 - 37299620
Alignment:
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcact 854  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  37299573 ggtgggaccccttcccggaccatgtgcatgcgagagctttagtgcact 37299620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 44420630 - 44420563
Alignment:
Q  219 aaaaaggcctagcagcgcagcttgctgctcggttgccttccactcatgtgtacttttttgtatgtata 286  Q
    |||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||    
T  44420630 aaaaaggcttagcggcgcagtttgttgctcgcttgccttccacccacgtgtaattttttgtatatata 44420563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 803 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 4587626 - 4587576
Alignment:
Q  803 aaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||    
T  4587626 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcac 4587576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 803 - 853
Target Start/End: Original strand, 30555210 - 30555260
Alignment:
Q  803 aaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||||||    
T  30555210 aaatggtgggaccccttcacggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcac 30555260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 772 - 853
Target Start/End: Original strand, 46859130 - 46859212
Alignment:
Q  772 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||  | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  46859130 aaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaatggtgggactcattttcaggccttgcgtatgtgggagttttagtgcac 46859212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 697 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 49546076 - 49546024
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagt 750  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||    
T  49546076 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtggctgaaaggttacaggttcaagt 49546024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 134; Significance: 3e-69; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 21172189 - 21172009
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21172189 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 21172091  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  21172090 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 21172009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 32758215 - 32758394
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32758215 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 32758313  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  32758314 gctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 32758394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 2541201 - 2541019
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggta 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2541201 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 2541102  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  2541101 aggctgcgtactatacaccaaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttcccttt 2541019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 693 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 10693245 - 10693073
Alignment:
Q  693 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgt 792  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  10693245 aaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaagagggtaaggctgcgt 10693147  T
Q  793 acaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  10693146 acaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgcccttt 10693073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 48735302 - 48735122
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcc-tggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  48735302 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgt-aaaacacggtaa 48735204  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  48735203 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48735122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Original strand, 42798622 - 42798804
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggta 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42798622 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggta 42798721  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| | |||||||  | ||||||||||    
T  42798722 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgcccttt 42798804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 42805478 - 42805661
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  42805478 gaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 42805577  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  42805578 ggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 42805661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 692 - 866
Target Start/End: Original strand, 40463837 - 40464011
Alignment:
Q  692 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcg 791  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40463837 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgtaaaaactgggtaaggctgcg 40463936  T
Q  792 tacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  40463937 tataatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgcccttt 40464011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 34626388 - 34626208
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34626388 gaggggtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaacagggtaag 34626289  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||    
T  34626288 gctgcgttcaatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgcccttt 34626208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 706 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871923
Alignment:
Q  706 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaa 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaa 33871971  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  33871970 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcac 33871923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Original strand, 43557425 - 43557610
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggta 783  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  43557425 agaggggtaaccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagta 43557524  T
Q  784 aggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag-gtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  43557525 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 43557610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 693 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 11617762 - 11617589
Alignment:
Q  693 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcg 791  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  11617762 aacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 11617663  T
Q  792 tacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||  |||||||||| | |||||||||    
T  11617662 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgccctt 11617589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 47716413 - 47716596
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  47716413 gaggggtaaccttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 47716512  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  47716513 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttt 47716596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 684 - 827
Target Start/End: Original strand, 46354146 - 46354292
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggt 782  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  46354146 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 46354245  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  46354246 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggacc 46354292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 694 - 866
Target Start/End: Original strand, 27629596 - 27629769
Alignment:
Q  694 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgt 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  27629596 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgt 27629695  T
Q  793 acaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| || || ||||||| | ||||||||||    
T  27629696 aaaatacaccaaatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgcccttt 27629769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 685 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 47078035 - 47077899
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||    
T  47078035 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaatagag-taa 47077937  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttccc 822  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47077936 agttgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttccc 47077899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 714 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391100
Alignment:
Q  714 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtggga 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 42391153  T
Q  814 ccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  42391152 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 42391100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 684 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 22699153 - 22698967
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggt 782  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||    
T  22699153 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 22699054  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccc-cttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||    
T  22699053 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 22698967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 686 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 35334995 - 35334829
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||    
T  35334995 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctcgtgt-aaaaaacagggtaag 35334897  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
     ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  35334896 actgtgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 35334829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 686 - 821
Target Start/End: Original strand, 42476827 - 42476961
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42476827 gaggggtaacattggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgt-aaaacaaggtaag 42476925  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42476926 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 42476961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 697 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 19427059 - 19426890
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtaca 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||    
T  19427059 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtaca 19426960  T
Q  796 atacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||  |||||| ||| || ||||||| | ||||||||||    
T  19426959 atacaccaaatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgcccttt 19426890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 697 - 828
Target Start/End: Original strand, 19265781 - 19265911
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaa 796  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19265781 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgtaaaaagagggtaaggctgcgtacaa 19265879  T
Q  797 tacacaaaatggtgggaccccttcccggacct 828  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19265880 tacaccaaatggtgggaccccttcccggacct 19265911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 733 - 866
Target Start/End: Original strand, 7879639 - 7879773
Alignment:
Q  733 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgt 831  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7879639 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgc 7879738  T
Q  832 gtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||    
T  7879739 gtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttt 7879773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 685 - 855
Target Start/End: Original strand, 13805056 - 13805224
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||    
T  13805056 agagggggagccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaacaggggtaa 13805154  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactg 855  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  13805155 ggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt-gtgcactg 13805224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 695 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 23419845 - 23419688
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  23419845 ccttggcgcaac-ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 23419747  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| | |||||||||    
T  23419746 caatacaccaaatggtgggaccccttcctagaccttgcgtgtgcgggggctttagtgca 23419688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 731 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 18512588 - 18512455
Alignment:
Q  731 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttg 830  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18512588 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctg 18512489  T
Q  831 tgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccct 864  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  18512488 cgtatgcgggagctttggtgcactgggttgccct 18512455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 695 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 28362316 - 28362181
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  28362316 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgta 28362218  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttg 830  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28362217 caatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccttg 28362181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 686 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 42496016 - 42495916
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42496016 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaacagggtaag 42495917  T
Q  786 g 786  Q
    |    
T  42495916 g 42495916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 690 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 14732999 - 14732834
Alignment:
Q  690 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggct 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||    
T  14732999 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggct 14732900  T
Q  789 gcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||| ||||||||  |||||||||  || |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  14732899 gcgt-caatacaccaaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcac 14732834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 708 - 865
Target Start/End: Original strand, 29907393 - 29907552
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgt--catgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaag-gtaaggctgcgtacaataca-caa 803  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| |||    
T  29907393 ggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacaccaa 29907492  T
Q  804 aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  29907493 aatggtgggaccccatcccggacc--ctgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29907552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 687 - 789
Target Start/End: Original strand, 18326989 - 18327091
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaagg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18326989 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaagg 18327088  T
Q  787 ctg 789  Q
    |||    
T  18327089 ctg 18327091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 687 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 8149126 - 8148960
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||| | |||||    
T  8149126 aggggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaa 8149027  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  8149026 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaga-cttgcgtatgcgagagttttagtgca 8148960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 695 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 48123655 - 48123504
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa-aacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||| ||    
T  48123655 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcata 48123557  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttt 846  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||    
T  48123556 caatacaccaaatggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggaggttt 48123504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 686 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 28078312 - 28078175
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||||||| ||||||    
T  28078312 gaggggtaaccctggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgtaaaaaaacagggtaag 28078213  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccg 823  Q
    | ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28078212 gttgcatgcaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 28078175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 729 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 31591245 - 31591109
Alignment:
Q  729 ctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggacct 828  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31591245 ctgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa-cagagtaaggctgcgtacaatacaataaatggtgggaccccttcccggacct 31591147  T
Q  829 tgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  31591146 tgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 31591109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 695 - 842
Target Start/End: Original strand, 19266414 - 19266561
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  19266414 ccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 19266512  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  19266513 caatacaccaaattgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggag 19266561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 686 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 2663112 - 2662985
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  2663112 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaatagggtaag 2663016  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccc 816  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2663015 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 2662985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 695 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 3469350 - 3469176
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta---aaaacaaggtaaggctgcg 791  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||||||||||   |||||| |||| || ||||    
T  3469350 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcg 3469252  T
Q  792 tacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctt 865  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  3469251 tacaatacaccaaaaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgcgctgggttgccctt 3469176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 698 - 866
Target Start/End: Original strand, 39123857 - 39124030
Alignment:
Q  698 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaca----aggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    ||| |||||||||||    
T  39123857 tggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaacagggtagggaaggctgcgta 39123955  T
Q  794 caatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||  || ||||||||    
T  39123956 aaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcaccaagctgcccttt 39124030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 687 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 5180337 - 5180202
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5180337 aggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaag 5180238  T
Q  786 gctgcgtacaatacac--aaaatggtgggacccctt 819  Q
     ||| |||||| ||||  |||||| | |||||||||    
T  5180237 actgtgtacaacacaccaaaaatgattggacccctt 5180202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 708 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099049
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14099066  T
Q  807 ggtgggaccccttcccg 823  Q
    |||||||||||||||||    
T  14099065 ggtgggaccccttcccg 14099049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 708 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409066
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14409083  T
Q  807 ggtgggaccccttcccg 823  Q
    |||||||||||||||||    
T  14409082 ggtgggaccccttcccg 14409066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 711 - 825
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741887
Alignment:
Q  711 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtg 810  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgt-aaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 11741872  T
Q  811 ggaccccttcccgga 825  Q
    ||| |||||||||||    
T  11741873 ggatcccttcccgga 11741887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 718 - 853
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747609
Alignment:
Q  718 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacc 815  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaattggtgggacc 18747571  T
Q  816 ccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  18747572 ccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 18747609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 709 - 830
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736987
Alignment:
Q  709 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatgg 808  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtataaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaaatgg 6736966  T
Q  809 tgggaccccttcccggaccttg 830  Q
    | ||| || |||||||||||||    
T  6736967 t-ggagcctttcccggaccttg 6736987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 686 - 774
Target Start/End: Original strand, 7193039 - 7193127
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa 774  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7193039 gaggggtaaccttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaa 7193127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 686 - 801
Target Start/End: Original strand, 12473258 - 12473374
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  12473258 gaggggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggtaa 12473357  T
Q  785 ggctgcgtacaatacac 801  Q
    || ||||||||||||||    
T  12473358 ggatgcgtacaatacac 12473374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 691 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 7794682 - 7794597
Alignment:
Q  691 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7794682 gtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaaa 7794597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 757 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 35787378 - 35787269
Alignment:
Q  757 aacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactga 856  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||| |     
T  35787378 aacagcctcttgtgtaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcaccgg 35787279  T
Q  857 gttgcccttt 866  Q
    ||||||||||    
T  35787278 gttgcccttt 35787269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 707 - 821
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645047
Alignment:
Q  707 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaa 804  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||| ||||    
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaaa 7645030  T
Q  805 atggtgggaccccttcc 821  Q
    || ||||||||||||||    
T  7645031 attgtgggaccccttcc 7645047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 723 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262196
Alignment:
Q  723 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacaccaaatgatgggaccccttcc 38262241  T
Q  822 cggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || ||  || ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||    
T  38262240 cgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 38262196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 751 - 847
Target Start/End: Original strand, 38604546 - 38604642
Alignment:
Q  751 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  38604546 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagcttta 38604642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 708 - 853
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341401
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaa 805  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacaccaaaa 16341353  T
Q  806 tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||| || ||||||||||||    |||||||||| ||| ||||||    
T  16341354 tggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcac 16341401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 695 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 44123792 - 44123641
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |      
T  44123792 ccttggtgcaac-ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggttgcatga 44123694  T
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggttta 847  Q
    ||||||| | ||  |||||||| ||| |||||  || |||||| |||| ||||    
T  44123693 aatacaccatataatgggacccgttctcggacactgcgtatgcaggagcttta 44123641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 715 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 32233286 - 32233179
Alignment:
Q  715 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggac 814  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||     
T  32233286 ttgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggcagcgtatattacaccaaatggtgggat 32233187  T
Q  815 cccttccc 822  Q
     |||||||    
T  32233186 tccttccc 32233179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 744 - 837
Target Start/End: Original strand, 1408469 - 1408563
Alignment:
Q  744 ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgc 837  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1408469 ttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagcaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgc 1408563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 723 - 866
Target Start/End: Original strand, 23231550 - 23231692
Alignment:
Q  723 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  23231550 atgtgactgaaaggtcacag--tagagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcc 23231647  T
Q  822 cggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || ||| || |||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  23231648 cgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccgagtttcccttt 23231692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 692 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 1424085 - 1423975
Alignment:
Q  692 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgc 790  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  1424085 taactttggcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgc 1423986  T
Q  791 gtacaatacac 801  Q
     |||| |||||    
T  1423985 atacactacac 1423975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 686 - 776
Target Start/End: Original strand, 21447544 - 21447634
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21447544 gaggggtaaccttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaa 21447634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 689 - 866
Target Start/End: Original strand, 25198679 - 25198861
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttc---aagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggta 783  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||   ||||| ||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  25198679 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggta 25198778  T
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || | ||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||| |  ||||| | ||| |||||||||| | ||||| ||||    
T  25198779 agaccgcgtataatgcactaaatggtaggatcccttcccagacccttcgtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcacttt 25198861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 736 - 836
Target Start/End: Complemental strand, 15108527 - 15108427
Alignment:
Q  736 gtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtat 835  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  15108527 gtcacgagttcaagtcctggaaacagtttcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacatcaaatagtgggatcccttcccaaaccctgtgtat 15108428  T
Q  836 g 836  Q
    |    
T  15108427 g 15108427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 707 - 850
Target Start/End: Original strand, 22065563 - 22065706
Alignment:
Q  707 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaat 806  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |  ||||    
T  22065563 tggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaagtcatgagttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaaatagggtaaagctgcatacaataaagcaaat 22065662  T
Q  807 ggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
     ||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||    
T  22065663 agtgagaccccttcccgaactatgtgtatgcaggagttttagtg 22065706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 695 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 42102056 - 42101899
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||  |||||||    
T  42102056 ccttggcacaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgta 42101958  T
Q  794 caatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgc 851  Q
    || ||| | ||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||    
T  42101957 cagtactctaaagtggtgggaccctttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 736 - 853
Target Start/End: Original strand, 21566439 - 21566558
Alignment:
Q  736 gtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgt 833  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |    
T  21566439 gtcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaaaatggtaggaccccttcccgaaccctgcat 21566538  T
Q  834 atgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  21566539 atgcgggagctttagtgcac 21566558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 783 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 27889399 - 27889316
Alignment:
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||    
T  27889399 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgcccttt 27889316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 730 - 821
Target Start/End: Original strand, 35203437 - 35203531
Alignment:
Q  730 tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  35203437 tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcc 35203531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 763 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 21139851 - 21139760
Alignment:
Q  763 ctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcact 854  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  21139851 ctcttgtgtaaaaacagagtaaggttggatacagtacaccaaatggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcact 21139760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 689 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 29140538 - 29140487
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcac 740  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29140538 gggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcac 29140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 694 - 776
Target Start/End: Original strand, 5814433 - 5814515
Alignment:
Q  694 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||||    
T  5814433 accttggcgcaatcggtaaagttgttgttatgtgattggaaagtcacgggttcaagttttggaaagaacctcttatgtaaaaa 5814515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 774 - 841
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500625
Alignment:
Q  774 aaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaa--tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcggga 841  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 33500625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 784 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 36267900 - 36267830
Alignment:
Q  784 aggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccc-cttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36267900 aggctgcgtacaatacaccaaatggttggacccatttcccgaaccctgtgtatgcgggagctttagtgcac 36267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 783 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 45019010 - 45018921
Alignment:
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaa----tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    |||||||||||||||| || |||    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  45019010 aaggctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgccctttgc 45018921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 829 - 866
Target Start/End: Original strand, 18327090 - 18327127
Alignment:
Q  829 tgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18327090 tgtgtatgcgggagctttagtgcactgagttgcccttt 18327127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 687 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 45019056 - 45019007
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaagg 736  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  45019056 aggggtaaccttggcgcaactggtaaaggtcctgtcatgtgactggaagg 45019007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 708 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 1524345 - 1524281
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta 772  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  1524345 ggtaaagtggttgtcacgagactgaaaggtcacaagttcaagtcttataaacagcctcttgtgta 1524281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 702 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 28685299 - 28685259
Alignment:
Q  702 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg 742  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28685299 gcaactgttaaagttgttgtcatgtgactgaaagatcacgg 28685259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 772 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 17048910 - 17048851
Alignment:
Q  772 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttg 830  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17048910 aaaaacagggtaaggttacgtacaatacaccaaaatggtggaaccccttcccggaacttg 17048851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21454651 - 21454616
Alignment:
Q  251 ttgccttccactcatgtgtacttttttgtatgtata 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21454651 ttgccttccactcatgtgtaattttttgtatgtata 21454616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 791 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 23619052 - 23618977
Alignment:
Q  791 gtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||| |||||||||  | ||||||||||    
T  23619052 gtacaatacatcaaatggtgggaccccttcgcagaccttgcgtttgcaggagctttagtgcagcgggttgcccttt 23618977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 808 - 866
Target Start/End: Original strand, 11888414 - 11888472
Alignment:
Q  808 gtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  11888414 gtgggacccctttctggaccctgtgtatgcaggagcttcagtgcactgggttgcccttt 11888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 710 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 11458421 - 11458380
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc 751  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11458421 taaagttattgtcatgtgactaaaaggtcacgagttcaagtc 11458380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 1346918 - 1347097
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  1346918 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgt-aaaacagggtaag 1347016  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  1347017 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1347097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 1354936 - 1354757
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1354936 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 1354838  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  1354837 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 29356039 - 29355855
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaag-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa-aaacaaggta 783  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29356039 gaggggtaaccttggcacaactggtaaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggta 29355940  T
Q  784 aggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  29355939 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 29355855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 12222088 - 12221914
Alignment:
Q  696 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12222088 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 12221989  T
Q  795 aatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag-gtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  12221988 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 12221914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 9161077 - 9161259
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9161077 gaggggtaaccttgacgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaag 9161176  T
Q  786 gctgcgtacaataca-caa-aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||   ||||||||||    
T  9161177 gctgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgcccttt 9161259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 688 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 3815256 - 3815090
Alignment:
Q  688 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaagg 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | |||| |     
T  3815256 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacga 3815157  T
Q  787 ctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||| || ||||||||||    
T  3815156 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcac 3815090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 1941809 - 1941990
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  1941809 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 1941908  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  1941909 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccatcctggatcttgtgtatgcgggagtttttgtgcaccgtgttgcccttt 1941990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 686 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 15866218 - 15866041
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  15866218 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaa 15866119  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccct 864  Q
     |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  15866118 agctgcgt--aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcactgagttgccct 15866041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 691 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 2166587 - 2166410
Alignment:
Q  691 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctg 789  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  2166587 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2166489  T
Q  790 cgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  2166488 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 2166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 691 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 2178220 - 2178043
Alignment:
Q  691 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctg 789  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  2178220 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2178122  T
Q  790 cgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  2178121 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 2178043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 686 - 805
Target Start/End: Original strand, 8409197 - 8409317
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  8409197 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 8409296  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaa 805  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  8409297 ggctgcgtacaatacgcaaaa 8409317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 695 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 7947543 - 7947383
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaagg-taaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7947543 ccttggcgcaac-ggtaaagttggtgttgcgtgactgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgta 7947445  T
Q  794 caatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcact 854  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7947444 caatacaccaaaatggtgggcccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcact 7947383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 685 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 23930308 - 23930127
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttc-aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggt 782  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| |    
T  23930308 agagaggtaaccttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagat 23930209  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |  | |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23930208 a--gttgcgtacaatacaccagatggtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 23930127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 684 - 827
Target Start/End: Original strand, 6024185 - 6024331
Alignment:
Q  684 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggt 782  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6024185 tagaggggtaattttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggt 6024284  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    ||| |||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||    
T  6024285 aagactgcgtacaatacaccaataatgatgggacctcttcccggacc 6024331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 686 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 14975261 - 14975171
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14975261 gagggataaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 14975171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 687 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 13905158 - 13905034
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaag 785  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  13905158 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 13905060  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgg 811  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13905059 gctgcatacaattcaccaaatggtgg 13905034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 681 - 816
Target Start/End: Original strand, 20400616 - 20400752
Alignment:
Q  681 ttatagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaa 779  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||     
T  20400616 ttatagagaggtaaccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacag 20400715  T
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccc 816  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  20400716 ggtaagactgcgtacagtacactaaatagcgggaccc 20400752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 718 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240826
Alignment:
Q  718 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacccc 817  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaattggtgggacccc 23240873  T
Q  818 ttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccct 864  Q
    |||  ||||  || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  23240872 ttctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctgccct 23240826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 710 - 822
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007717
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgac-tgaaa-ggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatg 807  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgt-aaaacagggtcaggctgcgtacaatacaccaaatg 28007702  T
Q  808 gtgggaccccttccc 822  Q
     ||||||||||||||    
T  28007703 ctgggaccccttccc 28007717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 697 - 842
Target Start/End: Original strand, 14553477 - 14553624
Alignment:
Q  697 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtaca 795  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||| |    
T  14553477 ttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtata 14553575  T
Q  796 atacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  14553576 atacaccaaaactggtgggaccccttcgtagaccctgtgtatgcgggag 14553624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 696 - 850
Target Start/End: Original strand, 24097545 - 24097696
Alignment:
Q  696 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtac 794  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  24097545 cttggcacaactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttac 24097644  T
Q  795 aatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtg 850  Q
    |    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||    
T  24097645 a----accaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtg 24097696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 750 - 866
Target Start/End: Original strand, 26097178 - 26097293
Alignment:
Q  750 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagt 849  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||    
T  26097178 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 26097276  T
Q  850 gcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| | ||||||||||    
T  26097277 gcaccgggttgcccttt 26097293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 695 - 852
Target Start/End: Original strand, 12889390 - 12889548
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg-taaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  12889390 ccttggcacaac-ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcata 12889488  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    ||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  12889489 caatacacctaaacgatgggacccctttccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgca 12889548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 737 - 853
Target Start/End: Original strand, 33138838 - 33138955
Alignment:
Q  737 tcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaag-gtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtat 835  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  33138838 tcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttccggaccctgtgtat 33138937  T
Q  836 gcgggaggtttagtgcac 853  Q
    || | || ||||||||||    
T  33138938 gcagtagctttagtgcac 33138955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 685 - 839
Target Start/End: Original strand, 24734586 - 24734752
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt----------aaa 774  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| ||||||||||          |||    
T  24734586 agagaggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaaaaaaaaa 24734685  T
Q  775 aacaaggtaaggctgcgtacaataca--caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgg 839  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  24734686 aacagggtaaggttgcgtacaatacaacaaaaaaggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgg 24734752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 750 - 866
Target Start/End: Original strand, 25557743 - 25557858
Alignment:
Q  750 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagt 849  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||    
T  25557743 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 25557841  T
Q  850 gcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| | ||||||||||    
T  25557842 gcaccgggttgcccttt 25557858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 689 - 776
Target Start/End: Original strand, 12063424 - 12063511
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa 776  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  12063424 gggtaaccttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaatagcctcttgtataaaaa 12063511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Original strand, 22967125 - 22967287
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | | ||||    
T  22967125 gaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaataggataag 22967224  T
Q  786 gctgc------gtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    |||||       |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||    
T  22967225 gctgcatacaaatacaatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 22967287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 686 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 23821268 - 23821106
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | | ||||    
T  23821268 gaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaataggataag 23821169  T
Q  786 gctgc------gtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    |||||       |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||    
T  23821168 gctgcatacaaatacaatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 23821106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 742 - 849
Target Start/End: Original strand, 32579436 - 32579543
Alignment:
Q  742 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcggga 841  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  32579436 ggttcaagtcctggaaacagcctctggtataaaaatacggtaagcctgcgtacaataccccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcggga 32579535  T
Q  842 ggtttagt 849  Q
    | ||||||    
T  32579536 gctttagt 32579543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 717 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 18277343 - 18277193
Alignment:
Q  717 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacc 815  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||  |||| |||||||||||||    
T  18277343 gttgtcctgtgactaaaaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacaccaaatggtgggacc 18277244  T
Q  816 ccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||  |||  |  ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||    
T  18277243 ccttcctagactctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgtccttt 18277193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 685 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 33923010 - 33922927
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttg 768  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  33923010 agaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagtcctagaaacgtcctcttg 33922927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 698 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 3116299 - 3116129
Alignment:
Q  698 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-------ctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgc 790  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |       ||||    
T  3116299 tggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgagttgcgactgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaatga-------ctgc 3116207  T
Q  791 gtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||    
T  3116206 gcacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccttgcgtatgcgggagctttagtacaccggattgcccttt 3116129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 724 - 866
Target Start/End: Original strand, 17432332 - 17432483
Alignment:
Q  724 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-------caaggtaaggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggac 814  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||        | |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||    
T  17432332 tgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagac 17432431  T
Q  815 cccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |  |||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  17432432 cttttcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17432483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 689 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 32728334 - 32728157
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggc 787  Q
    |||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |    
T  32728334 gggtaaccttggtggaacgagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagac 32728235  T
Q  788 tgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || |||||||| || |||| || || ||| ||||| |||| |  ||||||||||  ||||||||||   ||||||||||    
T  32728234 tgtgtacaatataccaaatagt-ggtccctttcccagaccctacgtatgcgggaactttagtgcaccatgttgcccttt 32728157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 731 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 15865992 - 15865859
Alignment:
Q  731 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggacct 828  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  15865992 gaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttacgtaaaaaaacagggtaaagctgcgta--atacaccaaatggtgggaccccttcctggaccc 15865895  T
Q  829 tgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccct 864  Q
    || || |||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  15865894 tgcgtttgcgtgatctatagtgcactgagttgccct 15865859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 804 - 866
Target Start/End: Original strand, 6808468 - 6808530
Alignment:
Q  804 aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  6808468 aatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 6808530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 702 - 761
Target Start/End: Original strand, 8417442 - 8417501
Alignment:
Q  702 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacag 761  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  8417442 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaacag 8417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 708 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755466
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac--aaa 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||||| |||||| |   ||||| | | ||||||||||||||||||||  |||    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  805 atggtgggaccccttccc 822  Q
    |||||||||  |||||||    
T  2755483 atggtgggagtccttccc 2755466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 787 - 866
Target Start/End: Original strand, 12885967 - 12886048
Alignment:
Q  787 ctgcgtacaatacacaaaa--tggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  12885967 ctgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12886048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 710 - 819
Target Start/End: Original strand, 32068074 - 32068182
Alignment:
Q  710 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatg 807  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||| | ||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  32068074 taaagttgttgtcacgtgaccgaaaggtcacatgttcaagtcttggaaa---cctcttgtgtaaaaaacaggataatgctgtttacaatacaccaaaatg 32068170  T
Q  808 gtgggacccctt 819  Q
    ||||||||||||    
T  32068171 gtgggacccctt 32068182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 794 - 866
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267860
Alignment:
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||    
T  13267788 caatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttt 13267860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 704 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 27855601 - 27855502
Alignment:
Q  704 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac 801  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| | ||||||| || |||||  ||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  27855601 aactggtaaagtttttgtcatgtgactgaaatgtcgcgagtttaagtcccgaaaacagcttcctgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgtataatacac 27855502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 695 - 823
Target Start/End: Original strand, 11849019 - 11849146
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg-taaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||| | |||  |    
T  11849019 ccttagcgcaac-ggtaaagttattgtcacgtgactgaaatgttt--ggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgttaaaaacaggataaagttgccca 11849115  T
Q  794 caataca-caaaatggtgggaccccttcccg 823  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11849116 caatacaccaaaatggtgggaccccttcccg 11849146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 696 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 19649338 - 19649292
Alignment:
Q  696 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg 742  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19649338 cttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaagatcacgg 19649292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 754 - 867
Target Start/End: Complemental strand, 13628370 - 13628255
Alignment:
Q  754 ggaaacagcctcttgtgtaaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgc 851  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||||||||||| |||| |   ||||||||||  |||  || ||||||||||| ||||||||    
T  13628370 ggaaacagcctcttgtttaaaaaaacaaggtaaaattgcgtacaatacactaaatagcaagaccccttcctagactctgcgtatgcgggagttttagtgc 13628271  T
Q  852 actgagttgccctttg 867  Q
    ||||  ||||||||||    
T  13628270 actggattgccctttg 13628255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 747 - 852
Target Start/End: Original strand, 19340843 - 19340949
Alignment:
Q  747 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggt 844  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||| || |    
T  19340843 aagtcctagaaccagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgca-acaatacaccaaaatgatgggaccccttcctggacccggcgtatgcggaagct 19340941  T
Q  845 ttagtgca 852  Q
    ||||||||    
T  19340942 ttagtgca 19340949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 804 - 866
Target Start/End: Original strand, 12892082 - 12892144
Alignment:
Q  804 aatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  12892082 aatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12892144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 789 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 383837 - 383760
Alignment:
Q  789 gcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| || ||| ||| | ||||||||||    
T  383837 gcgtacaatacaccaaattgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagcttcagtccaccgggttgcccttt 383760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 724 - 796
Target Start/End: Original strand, 17448316 - 17448389
Alignment:
Q  724 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaa 796  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17448316 tgtgattgaaaggtcacgggttcaagttttgaaaacaacattttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaa 17448389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 714 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 4136670 - 4136590
Alignment:
Q  714 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgta 793  Q
    ||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  4136670 gttgttgccacgtgactaaaatgtcacgggttcaagtcctaaaaacaacatcttgtgtaaaatacagggtaaggttgcgta 4136590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 769 - 820
Target Start/End: Original strand, 18254556 - 18254607
Alignment:
Q  769 tgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttc 820  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18254556 tgtaaaaacagggtaaagctgcatacaatacccaaaatagtgggaccccttc 18254607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 756 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 9671196 - 9671131
Alignment:
Q  756 aaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaatggtgggacccctt 819  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  9671196 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcctactttacatcaaaatggtaggacccctt 9671131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 801 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 10734970 - 10734905
Alignment:
Q  801 caaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||    
T  10734970 caaagtggtgggcccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtccaccgggctgcccttt 10734905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 132; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 683 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13024
Alignment:
Q  683 atagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggt 782  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13207 atagtggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaacaaggt 13108  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  13107 aaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgcccttt 13024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 687 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 17549 - 17507
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 729  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17549 aggggtaaccttaacgcaactgctaaagttgttgtcatgtgac 17507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 686 - 866
Target Start/End: Original strand, 30533 - 30712
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaag 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  30533 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtagg 30631  T
Q  786 gctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  30632 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 5)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 695 - 866
Target Start/End: Original strand, 46794 - 46966
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  46794 ccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgta 46893  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  46894 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 46966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 686 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 24948 - 24786
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24948 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtc-----aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 24854  T
Q  785 ggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||    
T  24853 ggctgcgtacaacacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 24786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 745 - 866
Target Start/End: Original strand, 43672 - 43793
Alignment:
Q  745 tcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggacccc-ttcccggaccttgtgtatgcgggagg 843  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||     
T  43672 tcaagttctggaaacagcgtcttgtgtaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggagc 43770  T
Q  844 tttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  43771 tctagtgcactgagttgcccttt 43793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 695 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 47054 - 46995
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgg 755  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47054 ccttggcgcaa-tagtaaagttgttgtcaggtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgg 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 780 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 46794 - 46721
Alignment:
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacac-aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgca 852  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  46794 ggtaaggatgcatacaatataccaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttaatgca 46721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 108; Significance: 1e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 689 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 10226 - 10052
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggct 788  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  10226 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagagtaagact 10128  T
Q  789 gcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccct 864  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |  ||||||| | ||||||||    
T  10127 gcgtacaatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 10052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 689 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20380
Alignment:
Q  689 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggct 788  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  20554 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagagtaagact 20456  T
Q  789 gcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccct 864  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |  ||||||| | ||||||||    
T  20455 gcgtacaatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 20380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 686 - 751
Target Start/End: Original strand, 8899 - 8964
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc 751  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899 gaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 8964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 686 - 751
Target Start/End: Original strand, 19227 - 19292
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc 751  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19227 gaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 106; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 693 - 866
Target Start/End: Original strand, 11093 - 11264
Alignment:
Q  693 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgt 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  11093 aaccttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacaaagtaaggctgctt 11190  T
Q  793 acaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||   ||||||||||    
T  11191 acaatacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 695 - 866
Target Start/End: Original strand, 10773 - 10945
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  10773 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtc 10872  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  10873 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgctcttt 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 691 - 866
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59114
Alignment:
Q  691 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctg 789  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||    
T  58936 gtaaccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactg 59035  T
Q  790 cgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  59036 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 59114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 694 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1600
Alignment:
Q  694 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| ||    
T  1758 accttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgt-aaaacaggataaggctgcata 1660  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcac 853  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||    
T  1659 caatacaccaaatgatgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcac 1600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 690 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 226583 - 226456
Alignment:
Q  690 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaaacaaggtaaggc 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  226583 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggc 226484  T
Q  788 tgcgtacaatacacaaaatggtgggacc 815  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  226483 tgcatacaatacatcaaatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 691 - 827
Target Start/End: Original strand, 4117 - 4256
Alignment:
Q  691 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctg 789  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  4117 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 4215  T
Q  790 cgtacaatacac---aaaatggtgggaccccttcccggacc 827  Q
    ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||    
T  4216 cgtacaatacaccaataattggtgggaccccttcccggacc 4256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 78; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 686 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 35200 - 35048
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttg-ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctct--tgtgtaaaaacaaggt 782  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||| |||    
T  35200 gagggataactttggtgcaactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggt 35101  T
Q  783 aaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtat 835  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  35100 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcctggatcttgcgtat 35048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 694 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 73034 - 72865
Alignment:
Q  694 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaca-gcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcg 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| || |||||||||||     
T  73034 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgt-------gtcacgggttcaagtcctagaaacaagtctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcc 72942  T
Q  792 tacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgccctttgc 868  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||    
T  72941 tacaatacaccaaatggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgccctttgc 72865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 741 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48634
Alignment:
Q  741 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcggg 840  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggg 48660  T
Q  841 aggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || | |||||||| | ||||||||||    
T  48659 agctctagtgcaccgggttgcccttt 48634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 686 - 760
Target Start/End: Original strand, 83829 - 83903
Alignment:
Q  686 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaca 760  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83829 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaaca 83903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 723 - 866
Target Start/End: Original strand, 3537 - 3679
Alignment:
Q  723 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcc 821  Q
    |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  3537 atgtgactgaaaggtcacag--tagagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcc 3634  T
Q  822 cggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    || ||| || |||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  3635 cgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccgagtttcccttt 3679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 695 - 842
Target Start/End: Original strand, 23567 - 23710
Alignment:
Q  695 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaaggctgcgta 793  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23567 ccttggcgcaac-ggtaaagttgt----atgtgactgaaagggtacgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgta 23661  T
Q  794 caatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  23662 caatgtagcaaatggtgggaccccttcccagaccttgagtatgtgggag 23710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 690 - 778
Target Start/End: Original strand, 43085 - 43175
Alignment:
Q  690 ggtaaccttggcgc--aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaca 778  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43085 ggtaaccttggcgcgcaactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaca 43175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 687 - 763
Target Start/End: Original strand, 24619 - 24695
Alignment:
Q  687 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcc 763  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24619 aggggtaaccttggcacaattgataaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcc 24695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 685 - 778
Target Start/End: Original strand, 8847 - 8937
Alignment:
Q  685 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaca 778  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8847 agaggggtaaccttgacgc---tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaaaca 8937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 780 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 24219 - 24133
Alignment:
Q  780 ggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggaggtttagtgcactgagttgcccttt 866  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||| |  |||||||||    
T  24219 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 24133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0867 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0867
Description:

Target: scaffold0867; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 736 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 3798 - 3685
Alignment:
Q  736 gtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtat 835  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || |  || ||||| |||    
T  3798 gtcatgggttcaagttctgaaaacaacc-cttgtgtaaatacaaggtaacgttgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttctcgatcttgtatat 3700  T
Q  836 gcgggaggtttagtg 850  Q
    ||||||| |||||||    
T  3699 gcgggagctttagtg 3685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 760 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 58742 - 58653
Alignment:
Q  760 agcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtaca-------atacacaaaatggtgggaccccttcccggaccttgtgtatgcgggag 842  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||       ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  58742 agcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgtatacaatacagtatacaccgaatggtgagaccccttctcggaccctgtgtatgcgggag 58653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 708 - 816
Target Start/End: Original strand, 32906 - 33016
Alignment:
Q  708 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca-caaaa 805  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||  |||| | |||||| ||| |||||||  ||||| |||  ||||||||| ||||     
T  32906 ggtatagttgttgccacgtgacttaaaggtcatgggttcaagtccgcgaaaaaacctcttctgtaaaaaacagagtaagactgtatacaatacaccaaat 33005  T
Q  806 tggtgggaccc 816  Q
    |||||||||||    
T  33006 tggtgggaccc 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University