View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4499-Insertion-5 (Length: 853)

Name: NF4499-Insertion-5
Description: NF4499
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4499-Insertion-5
NF4499-Insertion-5
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (450-853)||(1225120-1225523)
chr8 (8-408)||(1224696-1225100)
chr8 (463-851)||(27910982-27911367)
chr8 (463-851)||(27957401-27957786)
chr8 (496-853)||(30480482-30480838)
chr8 (449-853)||(14419169-14419574)
chr8 (450-852)||(27106877-27107279)
chr8 (494-853)||(41384743-41385100)
chr8 (494-847)||(32339303-32339659)
chr8 (494-853)||(14807749-14808117)
chr8 (494-847)||(27829295-27829646)
chr8 (494-853)||(15072708-15073067)
chr8 (494-853)||(28251546-28251904)
chr8 (494-847)||(27826984-27827335)
chr8 (494-847)||(4424016-4424368)
chr8 (494-853)||(41382671-41383018)
chr8 (494-847)||(3874004-3874360)
chr8 (494-846)||(15067979-15068330)
chr8 (536-847)||(22684638-22684951)
chr8 (494-848)||(13858469-13858821)
chr8 (468-847)||(18810681-18811057)
chr8 (494-847)||(28283206-28283562)
chr8 (497-852)||(36865538-36865892)
chr8 (536-840)||(608774-609077)
chr8 (494-847)||(15809213-15809568)
chr8 (496-852)||(25952521-25952876)
chr8 (496-852)||(5372156-5372512)
chr8 (495-847)||(44720842-44721193)
chr8 (468-847)||(18812866-18813231)
chr8 (449-852)||(15185694-15186093)
chr8 (544-847)||(43079650-43079952)
chr8 (536-847)||(43082013-43082323)
chr8 (496-731)||(14477276-14477511)
chr8 (496-710)||(33541509-33541723)
chr8 (494-820)||(24873193-24873524)
chr8 (449-673)||(26775154-26775378)
chr8 (494-847)||(43530122-43530465)
chr8 (452-692)||(5622877-5623117)
chr8 (496-852)||(21482322-21482665)
chr8 (586-853)||(15956051-15956314)
chr8 (449-795)||(31162165-31162508)
chr8 (527-822)||(21480545-21480828)
chr8 (496-657)||(35872557-35872713)
chr8 (526-838)||(3005624-3005932)
chr8 (524-710)||(37214321-37214517)
chr8 (372-544)||(14419784-14419956)
chr8 (619-768)||(181622-181772)
chr8 (494-593)||(3886156-3886255)
chr8 (494-607)||(12517248-12517363)
chr8 (702-852)||(2468110-2468259)
chr8 (734-853)||(33541389-33541507)
chr8 (631-795)||(31035252-31035416)
chr8 (552-764)||(31573794-31574000)
chr8 (494-591)||(181535-181632)
chr8 (457-668)||(31035029-31035238)
chr8 (634-795)||(31578314-31578476)
chr8 (718-853)||(35872432-35872553)
chr8 (494-676)||(2468261-2468435)
chr8 (777-853)||(37214243-37214319)
chr8 (649-710)||(30423212-30423273)
chr8 (634-710)||(17847661-17847739)
chr8 (649-710)||(13985200-13985262)
chr8 (766-853)||(14477519-14477607)
chr8 (634-710)||(33839044-33839120)
chr8 (469-539)||(6375962-6376032)
chr8 (649-687)||(9021251-9021289)
chr8 (634-710)||(13985933-13986011)
chr8 (649-687)||(16752666-16752704)
chr8 (649-687)||(16757411-16757449)
chr8 (649-687)||(17799568-17799606)
chr8 (790-847)||(28228656-28228714)
chr8 (649-687)||(28327908-28327946)
chr8 (649-687)||(28895502-28895540)
chr8 (816-853)||(181798-181835)
chr8 (748-851)||(6376239-6376343)
chr8 (109-174)||(33358293-33358358)
[»] chr3 (137 HSPs)
chr3 (260-852)||(39715158-39715744)
chr3 (496-853)||(43423440-43423796)
chr3 (496-853)||(3314608-3314965)
chr3 (496-853)||(1626660-1627016)
chr3 (493-853)||(4308258-4308617)
chr3 (497-853)||(43421392-43421747)
chr3 (494-853)||(1313332-1313689)
chr3 (494-853)||(51943293-51943650)
chr3 (494-853)||(45882861-45883220)
chr3 (494-853)||(53917641-53917999)
chr3 (496-853)||(28101979-28102335)
chr3 (496-853)||(880428-880785)
chr3 (449-853)||(36011703-36012107)
chr3 (493-853)||(43228212-43228571)
chr3 (494-853)||(24979629-24979988)
chr3 (536-851)||(42990268-42990582)
chr3 (494-853)||(53915473-53915831)
chr3 (452-849)||(5926746-5927142)
chr3 (449-847)||(11170281-11170678)
chr3 (536-853)||(27101158-27101474)
chr3 (536-853)||(30005805-30006121)
chr3 (494-853)||(12267952-12268301)
chr3 (449-853)||(32264015-32264423)
chr3 (536-847)||(38890004-38890314)
chr3 (494-853)||(48361648-48362005)
chr3 (497-847)||(10956010-10956359)
chr3 (493-847)||(51726990-51727342)
chr3 (495-849)||(18099151-18099504)
chr3 (497-847)||(10958306-10958655)
chr3 (449-853)||(53468430-53468836)
chr3 (449-853)||(18096877-18097281)
chr3 (495-847)||(3859451-3859801)
chr3 (493-853)||(43226007-43226363)
chr3 (494-847)||(4103879-4104234)
chr3 (494-853)||(18162586-18162943)
chr3 (536-847)||(25533406-25533716)
chr3 (536-853)||(9604584-9604899)
chr3 (502-789)||(6561740-6562028)
chr3 (449-847)||(5191530-5191925)
chr3 (497-853)||(51674743-51675087)
chr3 (496-853)||(47148872-47149233)
chr3 (495-847)||(22114288-22114639)
chr3 (536-847)||(10084372-10084682)
chr3 (496-822)||(889781-890104)
chr3 (494-847)||(458202-458558)
chr3 (494-847)||(746673-747031)
chr3 (494-847)||(26720470-26720821)
chr3 (496-853)||(54691551-54691906)
chr3 (494-847)||(455825-456181)
chr3 (494-850)||(28761407-28761763)
chr3 (495-847)||(5522610-5522949)
chr3 (495-847)||(6063429-6063782)
chr3 (548-847)||(25388882-25389179)
chr3 (536-847)||(38210334-38210644)
chr3 (495-847)||(6065779-6066131)
chr3 (536-794)||(29956650-29956907)
chr3 (536-847)||(10621513-10621823)
chr3 (452-737)||(35777301-35777587)
chr3 (494-835)||(10191305-10191648)
chr3 (576-847)||(1321483-1321753)
chr3 (494-853)||(32219017-32219365)
chr3 (495-847)||(50493922-50494273)
chr3 (496-727)||(28100143-28100374)
chr3 (496-832)||(53591119-53591442)
chr3 (585-852)||(6484372-6484639)
chr3 (493-830)||(35917944-35918285)
chr3 (536-851)||(42992250-42992548)
chr3 (496-735)||(28180948-28181185)
chr3 (494-853)||(15780782-15781159)
chr3 (583-847)||(7606571-7606831)
chr3 (449-852)||(23633336-23633732)
chr3 (562-847)||(28413014-28413299)
chr3 (497-853)||(27635635-27635959)
chr3 (623-853)||(25688137-25688367)
chr3 (535-853)||(4666488-4666794)
chr3 (496-853)||(31151271-31151625)
chr3 (449-720)||(28137415-28137676)
chr3 (449-749)||(23636903-23637200)
chr3 (620-853)||(6231849-6232080)
chr3 (449-780)||(54884033-54884362)
chr3 (633-849)||(5886261-5886474)
chr3 (633-849)||(5899734-5899947)
chr3 (460-793)||(13420222-13420541)
chr3 (526-852)||(17795224-17795538)
chr3 (526-852)||(19103664-19103978)
chr3 (636-847)||(11168165-11168375)
chr3 (474-820)||(53597143-53597485)
chr3 (543-797)||(561809-562058)
chr3 (537-664)||(41849117-41849244)
chr3 (496-626)||(47701798-47701928)
chr3 (650-853)||(3306839-3307040)
chr3 (495-640)||(11163073-11163218)
chr3 (699-849)||(47701652-47701801)
chr3 (451-560)||(6484264-6484373)
chr3 (497-625)||(6231374-6231502)
chr3 (579-795)||(25635391-25635604)
chr3 (497-615)||(3306724-3306842)
chr3 (544-822)||(36871308-36871583)
chr3 (572-749)||(1673975-1674149)
chr3 (469-710)||(4560403-4560625)
chr3 (494-676)||(24177201-24177380)
chr3 (259-359)||(6484074-6484175)
chr3 (757-853)||(41849243-41849339)
chr3 (678-794)||(24181486-24181602)
chr3 (551-708)||(13419864-13420015)
chr3 (766-847)||(35919098-35919179)
chr3 (494-569)||(1321363-1321438)
chr3 (634-795)||(1620496-1620657)
chr3 (715-850)||(25634030-25634164)
chr3 (634-780)||(14634491-14634638)
chr3 (579-676)||(25633930-25634024)
chr3 (778-847)||(53894040-53894109)
chr3 (453-590)||(1618896-1619036)
chr3 (634-710)||(7768632-7768708)
chr3 (634-710)||(11066652-11066730)
chr3 (616-657)||(7606832-7606873)
chr3 (649-710)||(27544273-27544333)
chr3 (109-154)||(49068725-49068770)
chr3 (612-674)||(31021300-31021361)
chr3 (659-710)||(4535624-4535674)
chr3 (661-795)||(11007558-11007683)
chr3 (819-853)||(880217-880251)
chr3 (649-687)||(6303310-6303348)
chr3 (536-570)||(6719356-6719390)
chr3 (649-687)||(10094218-10094256)
chr3 (649-687)||(10100235-10100273)
chr3 (649-687)||(10201098-10201136)
chr3 (649-687)||(16462203-16462241)
chr3 (649-687)||(22626128-22626166)
chr3 (652-710)||(27762108-27762165)
chr3 (811-853)||(28181242-28181284)
chr3 (113-155)||(33840158-33840200)
chr3 (788-838)||(46173481-46173531)
chr3 (649-687)||(47883026-47883064)
chr3 (463-512)||(1620710-1620759)
chr3 (649-710)||(16996875-16996935)
chr3 (802-851)||(42992615-42992664)
[»] chr5 (92 HSPs)
chr5 (260-849)||(17818475-17819057)
chr5 (260-838)||(37705774-37706355)
chr5 (496-853)||(25904047-25904403)
chr5 (496-852)||(17072827-17073183)
chr5 (449-853)||(21947924-21948326)
chr5 (449-853)||(10474302-10474706)
chr5 (494-853)||(2818314-2818673)
chr5 (493-853)||(39854425-39854783)
chr5 (498-853)||(18511191-18511547)
chr5 (496-852)||(24126800-24127155)
chr5 (494-847)||(25921458-25921810)
chr5 (493-840)||(10529091-10529437)
chr5 (494-853)||(12555902-12556260)
chr5 (496-853)||(31472591-31472948)
chr5 (490-853)||(40221460-40221823)
chr5 (498-853)||(18509297-18509652)
chr5 (496-847)||(2174863-2175212)
chr5 (536-847)||(25804009-25804318)
chr5 (449-853)||(36402307-36402709)
chr5 (494-847)||(4236571-4236922)
chr5 (452-851)||(39397974-39398372)
chr5 (495-847)||(38882048-38882399)
chr5 (536-849)||(6747290-6747600)
chr5 (536-853)||(16092178-16092495)
chr5 (494-846)||(18596589-18596939)
chr5 (536-849)||(6745053-6745364)
chr5 (494-853)||(6756436-6756792)
chr5 (496-853)||(1189586-1189949)
chr5 (494-848)||(16776099-16776452)
chr5 (494-853)||(26097675-26098031)
chr5 (497-847)||(18466625-18466978)
chr5 (496-852)||(695833-696177)
chr5 (504-853)||(2954368-2954716)
chr5 (495-835)||(31179368-31179707)
chr5 (495-847)||(31545023-31545374)
chr5 (536-847)||(34477038-34477349)
chr5 (494-847)||(18468949-18469303)
chr5 (536-847)||(21684437-21684746)
chr5 (494-847)||(27910387-27910744)
chr5 (494-847)||(27912472-27912830)
chr5 (495-847)||(31542678-31543028)
chr5 (536-847)||(34479403-34479714)
chr5 (574-853)||(658335-658610)
chr5 (536-847)||(15552229-15552539)
chr5 (496-767)||(34530731-34531001)
chr5 (619-851)||(41585725-41585956)
chr5 (495-853)||(31465968-31466314)
chr5 (496-710)||(20042994-20043208)
chr5 (527-852)||(21288739-21289060)
chr5 (494-847)||(10586781-10587126)
chr5 (630-852)||(20505823-20506042)
chr5 (496-710)||(20044954-20045168)
chr5 (614-853)||(2723964-2724193)
chr5 (501-835)||(6661181-6661512)
chr5 (494-703)||(26098379-26098588)
chr5 (631-847)||(39798126-39798341)
chr5 (619-847)||(4410090-4410316)
chr5 (517-851)||(9020187-9020518)
chr5 (496-852)||(36208524-36208874)
chr5 (648-839)||(10749796-10749986)
chr5 (494-634)||(20507659-20507799)
chr5 (648-847)||(38960117-38960314)
chr5 (648-847)||(15354560-15354757)
chr5 (539-852)||(20053834-20054136)
chr5 (648-847)||(23665140-23665337)
chr5 (648-847)||(23793250-23793447)
chr5 (648-847)||(3373122-3373320)
chr5 (648-839)||(10757273-10757462)
chr5 (648-847)||(15356836-15357033)
chr5 (665-847)||(23741844-23742023)
chr5 (494-591)||(41585946-41586043)
chr5 (463-720)||(42770685-42770934)
chr5 (552-821)||(17413176-17413441)
chr5 (747-853)||(26098267-26098374)
chr5 (493-592)||(4409998-4410101)
chr5 (552-798)||(2144596-2144840)
chr5 (634-779)||(15143547-15143693)
chr5 (449-546)||(2723863-2723961)
chr5 (678-768)||(42770936-42771025)
chr5 (552-710)||(4754159-4754311)
chr5 (769-852)||(20043206-20043289)
chr5 (552-706)||(29748352-29748502)
chr5 (634-847)||(35430259-35430476)
chr5 (659-808)||(4897835-4897985)
chr5 (649-710)||(31782579-31782639)
chr5 (634-690)||(34033711-34033768)
chr5 (649-687)||(1170811-1170849)
chr5 (649-687)||(2298145-2298183)
chr5 (649-691)||(10627364-10627406)
chr5 (603-710)||(15224890-15224997)
chr5 (648-836)||(23667415-23667601)
chr5 (649-687)||(35385596-35385634)
[»] chr4 (120 HSPs)
chr4 (258-853)||(16453070-16453664)
chr4 (452-853)||(38928156-38928557)
chr4 (496-852)||(19095880-19096236)
chr4 (494-853)||(48486315-48486673)
chr4 (450-853)||(36378244-36378647)
chr4 (494-853)||(40091394-40091752)
chr4 (497-853)||(33415467-33415821)
chr4 (493-853)||(40637069-40637428)
chr4 (494-853)||(22800841-22801199)
chr4 (494-853)||(24878985-24879344)
chr4 (494-853)||(22802713-22803071)
chr4 (494-853)||(24880447-24880806)
chr4 (494-853)||(24888792-24889150)
chr4 (493-847)||(14633315-14633666)
chr4 (449-847)||(22044376-22044771)
chr4 (449-847)||(22046671-22047066)
chr4 (496-853)||(12395824-12396180)
chr4 (497-822)||(56030443-56030764)
chr4 (494-847)||(5198416-5198768)
chr4 (496-853)||(12400786-12401142)
chr4 (494-847)||(47274723-47275073)
chr4 (494-847)||(9148247-9148600)
chr4 (536-847)||(8631404-8631714)
chr4 (495-847)||(37089357-37089710)
chr4 (494-847)||(51015242-51015593)
chr4 (494-847)||(24348210-24348566)
chr4 (493-845)||(47868396-47868747)
chr4 (494-852)||(619428-619784)
chr4 (495-847)||(11434952-11435302)
chr4 (494-853)||(36921472-36921832)
chr4 (494-838)||(14787423-14787770)
chr4 (497-850)||(37313047-37313400)
chr4 (494-853)||(36919563-36919924)
chr4 (493-847)||(2484858-2485211)
chr4 (493-847)||(6764834-6765192)
chr4 (495-847)||(18847150-18847500)
chr4 (536-847)||(11006222-11006532)
chr4 (494-847)||(38409195-38409552)
chr4 (494-847)||(31849584-31849936)
chr4 (494-853)||(17662224-17662575)
chr4 (564-847)||(26085962-26086243)
chr4 (536-847)||(11008553-11008861)
chr4 (494-847)||(44599823-44600175)
chr4 (495-847)||(7941316-7941671)
chr4 (502-852)||(19322701-19323048)
chr4 (449-847)||(9174131-9174528)
chr4 (495-847)||(16934128-16934479)
chr4 (500-835)||(41997494-41997828)
chr4 (498-845)||(9176461-9176807)
chr4 (497-781)||(13543953-13544241)
chr4 (536-847)||(22782723-22783033)
chr4 (536-847)||(18709149-18709458)
chr4 (536-835)||(22132389-22132684)
chr4 (494-773)||(5637524-5637806)
chr4 (495-847)||(16931774-16932125)
chr4 (536-847)||(22780358-22780668)
chr4 (536-773)||(3824629-3824863)
chr4 (536-835)||(22134615-22134909)
chr4 (496-815)||(18409364-18409681)
chr4 (496-852)||(18537454-18537806)
chr4 (574-853)||(36380425-36380704)
chr4 (494-822)||(47210762-47211083)
chr4 (496-726)||(3937314-3937543)
chr4 (494-847)||(53405123-53405481)
chr4 (611-850)||(16455354-16455591)
chr4 (496-716)||(6132871-6133090)
chr4 (494-794)||(8756289-8756587)
chr4 (494-749)||(52942541-52942784)
chr4 (646-853)||(13547302-13547508)
chr4 (581-853)||(27499128-27499396)
chr4 (449-657)||(38270160-38270369)
chr4 (522-749)||(18534915-18535138)
chr4 (496-657)||(24446758-24446914)
chr4 (640-853)||(2891433-2891646)
chr4 (469-824)||(15032555-15032898)
chr4 (260-567)||(16455049-16455356)
chr4 (578-852)||(38890205-38890476)
chr4 (586-852)||(30136640-30136903)
chr4 (675-849)||(4215483-4215656)
chr4 (494-634)||(5100993-5101133)
chr4 (469-835)||(12102061-12102425)
chr4 (695-847)||(5635461-5635612)
chr4 (496-615)||(2891314-2891434)
chr4 (695-847)||(11437560-11437710)
chr4 (699-851)||(5101130-5101280)
chr4 (497-781)||(28453686-28453965)
chr4 (637-851)||(3982156-3982374)
chr4 (503-711)||(10112876-10113081)
chr4 (746-853)||(47563008-47563115)
chr4 (450-541)||(36380326-36380417)
chr4 (502-795)||(9863712-9864006)
chr4 (469-852)||(16185815-16186199)
chr4 (457-853)||(25357595-25357997)
chr4 (633-795)||(31983564-31983727)
chr4 (492-710)||(40999072-40999286)
chr4 (720-839)||(49088791-49088911)
chr4 (718-853)||(24446633-24446754)
chr4 (552-806)||(9022362-9022613)
chr4 (634-749)||(47150976-47151092)
chr4 (578-691)||(10114412-10114520)
chr4 (802-853)||(52942467-52942518)
chr4 (790-852)||(3937254-3937316)
chr4 (767-853)||(6133105-6133191)
chr4 (767-838)||(14789422-14789495)
chr4 (649-848)||(5336764-5336964)
chr4 (552-627)||(54906631-54906702)
chr4 (634-748)||(54906722-54906839)
chr4 (788-824)||(37229729-37229765)
chr4 (649-687)||(7050401-7050439)
chr4 (649-687)||(11853549-11853587)
chr4 (652-710)||(16489352-16489409)
chr4 (652-710)||(25699752-25699809)
chr4 (109-151)||(36363642-36363684)
chr4 (652-710)||(47566496-47566553)
chr4 (649-687)||(55822265-55822303)
chr4 (812-849)||(3824593-3824630)
chr4 (649-710)||(4570094-4570154)
chr4 (109-142)||(13215495-13215528)
chr4 (115-180)||(23884676-23884741)
chr4 (268-316)||(36378063-36378112)
[»] chr1 (107 HSPs)
chr1 (268-853)||(6756245-6756828)
chr1 (390-853)||(18306945-18307409)
chr1 (449-852)||(9241067-9241470)
chr1 (496-852)||(50307527-50307884)
chr1 (493-853)||(12302486-12302850)
chr1 (494-853)||(6995681-6996039)
chr1 (494-853)||(17324617-17324975)
chr1 (496-853)||(11457456-11457812)
chr1 (494-853)||(2949213-2949570)
chr1 (494-853)||(14097950-14098309)
chr1 (494-853)||(41646862-41647220)
chr1 (452-853)||(16428553-16428954)
chr1 (494-852)||(28998235-28998592)
chr1 (494-852)||(29003951-29004308)
chr1 (494-853)||(28207049-28207405)
chr1 (494-853)||(38925462-38925817)
chr1 (495-847)||(51749982-51750333)
chr1 (449-853)||(18839483-18839888)
chr1 (494-853)||(47906206-47906570)
chr1 (495-847)||(10399815-10400166)
chr1 (496-853)||(50076653-50077009)
chr1 (496-852)||(17186109-17186465)
chr1 (496-852)||(31489859-31490211)
chr1 (494-853)||(15823488-15823846)
chr1 (495-845)||(6822958-6823306)
chr1 (494-842)||(13215023-13215375)
chr1 (496-853)||(50078801-50079158)
chr1 (450-853)||(25251255-25251659)
chr1 (517-853)||(31424996-31425335)
chr1 (494-853)||(39462461-39462819)
chr1 (496-845)||(2617460-2617808)
chr1 (449-853)||(50248551-50248957)
chr1 (536-847)||(15294821-15295131)
chr1 (459-776)||(31422930-31423248)
chr1 (494-847)||(28840620-28840973)
chr1 (497-853)||(17318838-17319187)
chr1 (495-847)||(20302402-20302752)
chr1 (495-847)||(13761780-13762130)
chr1 (494-847)||(31735508-31735864)
chr1 (536-847)||(39932057-39932368)
chr1 (536-853)||(25127856-25128173)
chr1 (494-847)||(28842435-28842788)
chr1 (494-847)||(2510312-2510667)
chr1 (494-853)||(27336921-27337281)
chr1 (494-853)||(27339112-27339473)
chr1 (494-853)||(3579598-3579957)
chr1 (522-849)||(4131360-4131692)
chr1 (544-847)||(46431693-46431996)
chr1 (536-844)||(24325648-24325954)
chr1 (496-849)||(40133879-40134241)
chr1 (495-847)||(16226110-16226461)
chr1 (495-847)||(20291400-20291750)
chr1 (494-822)||(47451590-47451911)
chr1 (495-847)||(51752308-51752657)
chr1 (536-795)||(21948227-21948484)
chr1 (494-847)||(9459404-9459762)
chr1 (494-847)||(9463231-9463589)
chr1 (496-853)||(17324009-17324362)
chr1 (494-779)||(48665113-48665404)
chr1 (536-847)||(47179697-47180006)
chr1 (536-847)||(47177346-47177655)
chr1 (455-852)||(42922136-42922530)
chr1 (543-853)||(16432396-16432696)
chr1 (495-749)||(6823827-6824089)
chr1 (496-850)||(14183574-14183923)
chr1 (463-783)||(8347323-8347639)
chr1 (449-795)||(18800611-18800953)
chr1 (466-852)||(49495192-49495566)
chr1 (637-853)||(16429042-16429258)
chr1 (619-845)||(25248540-25248766)
chr1 (463-767)||(8349119-8349419)
chr1 (463-795)||(15669432-15669762)
chr1 (619-847)||(16231630-16231856)
chr1 (644-847)||(51757623-51757824)
chr1 (632-853)||(6115083-6115304)
chr1 (648-835)||(23785935-23786121)
chr1 (695-852)||(23816029-23816185)
chr1 (517-852)||(13125439-13125772)
chr1 (502-739)||(26520207-26520449)
chr1 (517-591)||(25248756-25248830)
chr1 (634-852)||(30738609-30738830)
chr1 (494-767)||(30790468-30790733)
chr1 (634-852)||(26613221-26613440)
chr1 (552-820)||(27916500-27916765)
chr1 (459-547)||(16431008-16431096)
chr1 (575-767)||(28279292-28279480)
chr1 (758-847)||(13358778-13358867)
chr1 (495-592)||(16231544-16231641)
chr1 (634-710)||(155788-155864)
chr1 (631-767)||(16561545-16561681)
chr1 (260-338)||(18306836-18306914)
chr1 (634-808)||(14353047-14353220)
chr1 (552-676)||(26332719-26332836)
chr1 (528-568)||(6115344-6115384)
chr1 (634-709)||(26332613-26332688)
chr1 (724-852)||(15916562-15916690)
chr1 (109-155)||(34620613-34620659)
chr1 (449-536)||(43104055-43104143)
chr1 (638-710)||(43104245-43104317)
chr1 (649-710)||(4144805-4144865)
chr1 (517-653)||(13127813-13127944)
chr1 (806-847)||(13447260-13447301)
chr1 (649-710)||(14997040-14997100)
chr1 (319-375)||(14996716-14996772)
chr1 (649-687)||(2232597-2232635)
chr1 (779-853)||(31422841-31422915)
chr1 (634-710)||(49959129-49959207)
[»] chr7 (105 HSPs)
chr7 (496-853)||(4295913-4296271)
chr7 (496-853)||(44724533-44724889)
chr7 (494-853)||(13099453-13099813)
chr7 (516-853)||(21592122-21592458)
chr7 (452-853)||(20137088-20137488)
chr7 (452-852)||(11355168-11355567)
chr7 (494-853)||(31435025-31435384)
chr7 (496-852)||(24748548-24748904)
chr7 (469-853)||(39145965-39146349)
chr7 (494-852)||(42330977-42331336)
chr7 (497-853)||(21990106-21990460)
chr7 (494-847)||(38393934-38394290)
chr7 (452-853)||(42223066-42223468)
chr7 (496-853)||(21679981-21680340)
chr7 (494-847)||(35581-35933)
chr7 (493-847)||(48457600-48457957)
chr7 (494-853)||(443547-443906)
chr7 (494-853)||(27306211-27306566)
chr7 (497-853)||(37412104-37412462)
chr7 (495-845)||(1049283-1049631)
chr7 (496-853)||(9680768-9681130)
chr7 (536-850)||(20626032-20626345)
chr7 (536-850)||(20629923-20630236)
chr7 (536-850)||(20642342-20642655)
chr7 (496-853)||(21678020-21678374)
chr7 (494-847)||(44516-44868)
chr7 (498-847)||(7471965-7472317)
chr7 (494-847)||(20299406-20299764)
chr7 (495-847)||(40836728-40837078)
chr7 (498-847)||(7470007-7470359)
chr7 (536-847)||(1849975-1850285)
chr7 (536-847)||(3878571-3878881)
chr7 (536-847)||(20297356-20297666)
chr7 (536-847)||(28487547-28487857)
chr7 (502-853)||(24258423-24258778)
chr7 (536-845)||(1046912-1047219)
chr7 (497-853)||(9679009-9679369)
chr7 (494-846)||(3035669-3036027)
chr7 (494-847)||(18345489-18345845)
chr7 (494-847)||(31155896-31156248)
chr7 (494-845)||(28485514-28485867)
chr7 (541-847)||(40946327-40946632)
chr7 (536-847)||(7351637-7351947)
chr7 (546-847)||(43253502-43253801)
chr7 (495-845)||(25542484-25542830)
chr7 (496-813)||(27832651-27832969)
chr7 (494-773)||(11757176-11757460)
chr7 (449-792)||(22828672-22829016)
chr7 (452-779)||(25276050-25276378)
chr7 (494-820)||(7349285-7349616)
chr7 (612-847)||(7092198-7092431)
chr7 (465-822)||(24817362-24817714)
chr7 (527-732)||(26804554-26804762)
chr7 (612-847)||(7094445-7094678)
chr7 (495-767)||(22251611-22251878)
chr7 (452-792)||(7188452-7188789)
chr7 (449-795)||(20091584-20091924)
chr7 (494-657)||(18567565-18567728)
chr7 (620-847)||(38396713-38396938)
chr7 (571-853)||(24813477-24813755)
chr7 (497-822)||(24465503-24465816)
chr7 (648-835)||(2935374-2935560)
chr7 (648-847)||(22137184-22137381)
chr7 (648-847)||(40552211-40552408)
chr7 (648-847)||(22108173-22108370)
chr7 (648-847)||(40549933-40550130)
chr7 (648-835)||(1606486-1606671)
chr7 (494-689)||(22392425-22392608)
chr7 (648-835)||(9027191-9027376)
chr7 (696-852)||(22393876-22394032)
chr7 (695-838)||(26295600-26295743)
chr7 (552-690)||(11081522-11081654)
chr7 (634-711)||(16297145-16297222)
chr7 (469-780)||(6332153-6332458)
chr7 (552-710)||(6048885-6049038)
chr7 (571-710)||(11084409-11084543)
chr7 (542-603)||(38396316-38396377)
chr7 (672-767)||(6348912-6349006)
chr7 (498-591)||(7092414-7092512)
chr7 (786-847)||(11759370-11759431)
chr7 (536-591)||(7094662-7094717)
chr7 (802-853)||(26804769-26804820)
chr7 (496-710)||(26210500-26210709)
chr7 (612-690)||(12310157-12310234)
chr7 (109-153)||(43952501-43952545)
chr7 (497-564)||(3677235-3677301)
chr7 (649-692)||(21369642-21369685)
chr7 (494-619)||(30906264-30906387)
chr7 (637-691)||(40281518-40281572)
chr7 (633-687)||(2120881-2120937)
chr7 (517-627)||(6348793-6348903)
chr7 (805-852)||(25276392-25276439)
chr7 (649-687)||(3320194-3320232)
chr7 (649-687)||(3324942-3324980)
chr7 (649-687)||(7069780-7069818)
chr7 (649-687)||(7074787-7074825)
chr7 (649-687)||(15541139-15541177)
chr7 (649-687)||(25351353-25351391)
chr7 (649-687)||(25357047-25357085)
chr7 (649-687)||(25405393-25405431)
chr7 (649-687)||(25410130-25410168)
chr7 (649-687)||(42006663-42006701)
chr7 (111-153)||(47356598-47356640)
chr7 (767-847)||(6067183-6067264)
chr7 (812-853)||(22251564-22251605)
[»] chr6 (80 HSPs)
chr6 (449-852)||(13057125-13057529)
chr6 (483-851)||(3390345-3390713)
chr6 (449-853)||(3629844-3630247)
chr6 (494-853)||(9019903-9020261)
chr6 (449-852)||(25477205-25477616)
chr6 (496-853)||(3233704-3234065)
chr6 (495-853)||(11983008-11983365)
chr6 (493-847)||(28241306-28241659)
chr6 (496-852)||(13039733-13040089)
chr6 (494-853)||(30728803-30729165)
chr6 (450-853)||(3631918-3632320)
chr6 (493-847)||(1230234-1230587)
chr6 (494-847)||(14507161-14507512)
chr6 (536-847)||(30967220-30967530)
chr6 (503-847)||(14458752-14459093)
chr6 (495-852)||(15541120-15541476)
chr6 (494-840)||(15532674-15533018)
chr6 (536-847)||(4816216-4816526)
chr6 (536-847)||(19704552-19704864)
chr6 (494-853)||(32279974-32280332)
chr6 (494-789)||(15530166-15530459)
chr6 (536-849)||(26065005-26065312)
chr6 (536-849)||(26084974-26085281)
chr6 (494-847)||(2628871-2629227)
chr6 (536-837)||(20915351-20915651)
chr6 (494-845)||(30034590-30034944)
chr6 (452-853)||(24338427-24338828)
chr6 (494-847)||(12195500-12195852)
chr6 (449-853)||(12161537-12161937)
chr6 (495-725)||(19227514-19227744)
chr6 (536-847)||(26932546-26932857)
chr6 (496-767)||(22490618-22490889)
chr6 (465-852)||(15719595-15719977)
chr6 (496-852)||(14466312-14466658)
chr6 (637-853)||(1069697-1069913)
chr6 (616-835)||(5273213-5273431)
chr6 (494-795)||(3027890-3028187)
chr6 (457-822)||(16455434-16455798)
chr6 (496-644)||(32447502-32447651)
chr6 (502-765)||(17012029-17012287)
chr6 (633-852)||(12186051-12186271)
chr6 (494-852)||(15367013-15367365)
chr6 (494-641)||(1072067-1072214)
chr6 (648-847)||(26066109-26066307)
chr6 (494-625)||(17852519-17852650)
chr6 (648-847)||(29754694-29754892)
chr6 (648-847)||(33308988-33309185)
chr6 (648-847)||(26068380-26068578)
chr6 (648-847)||(33311257-33311454)
chr6 (450-645)||(13870608-13870803)
chr6 (494-616)||(8995456-8995578)
chr6 (632-835)||(26945258-26945463)
chr6 (494-655)||(15346368-15346517)
chr6 (453-608)||(10584061-10584212)
chr6 (695-852)||(15346525-15346680)
chr6 (750-853)||(10584227-10584331)
chr6 (496-852)||(19696420-19696775)
chr6 (552-822)||(22857962-22858228)
chr6 (634-709)||(11138423-11138499)
chr6 (612-793)||(20526902-20527081)
chr6 (711-852)||(25465571-25465711)
chr6 (635-768)||(28037794-28037927)
chr6 (493-568)||(12186330-12186407)
chr6 (634-767)||(25078623-25078755)
chr6 (494-590)||(12937437-12937535)
chr6 (634-690)||(7542525-7542581)
chr6 (659-710)||(5165937-5165987)
chr6 (557-627)||(17904566-17904632)
chr6 (494-568)||(25466433-25466507)
chr6 (649-687)||(3577658-3577696)
chr6 (649-687)||(13878727-13878765)
chr6 (649-687)||(13883475-13883513)
chr6 (649-687)||(16785919-16785957)
chr6 (652-710)||(22351974-22352031)
chr6 (649-687)||(26887368-26887406)
chr6 (496-568)||(26945127-26945201)
chr6 (649-687)||(31248858-31248896)
chr6 (649-687)||(35201470-35201508)
chr6 (471-524)||(28038012-28038065)
chr6 (716-808)||(30445723-30445815)
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (496-849)||(19007560-19007912)
chr2 (494-853)||(40032032-40032395)
chr2 (494-853)||(42923488-42923848)
chr2 (452-853)||(17848321-17848716)
chr2 (449-853)||(6264127-6264527)
chr2 (494-853)||(22287315-22287673)
chr2 (452-853)||(28196513-28196911)
chr2 (496-853)||(11739538-11739895)
chr2 (496-853)||(17849037-17849393)
chr2 (494-853)||(21520672-21521032)
chr2 (494-853)||(6258796-6259152)
chr2 (493-847)||(45279969-45280323)
chr2 (449-847)||(13910030-13910426)
chr2 (495-847)||(27104718-27105067)
chr2 (496-853)||(14837193-14837544)
chr2 (495-847)||(19504331-19504681)
chr2 (497-847)||(19501996-19502345)
chr2 (494-847)||(23452222-23452578)
chr2 (494-847)||(42064433-42064785)
chr2 (494-847)||(42452701-42453050)
chr2 (494-853)||(43623559-43623905)
chr2 (504-851)||(34979558-34979906)
chr2 (496-853)||(44289046-44289403)
chr2 (449-749)||(15539557-15539858)
chr2 (499-853)||(3022086-3022448)
chr2 (449-852)||(22874015-22874406)
chr2 (495-847)||(24162208-24162548)
chr2 (536-847)||(35215571-35215881)
chr2 (536-809)||(45239000-45239271)
chr2 (536-847)||(35217948-35218258)
chr2 (496-836)||(31732772-31733100)
chr2 (496-835)||(11578104-11578439)
chr2 (626-853)||(5375325-5375550)
chr2 (494-853)||(18800292-18800639)
chr2 (586-852)||(28459170-28459435)
chr2 (496-673)||(22163106-22163282)
chr2 (494-649)||(22407591-22407746)
chr2 (552-822)||(20146617-20146884)
chr2 (536-676)||(38020162-38020302)
chr2 (695-853)||(22407433-22407590)
chr2 (648-847)||(36558849-36559047)
chr2 (648-847)||(36561126-36561324)
chr2 (494-795)||(17897282-17897579)
chr2 (463-835)||(37962938-37963295)
chr2 (648-847)||(45332166-45332364)
chr2 (711-853)||(22707730-22707873)
chr2 (494-852)||(35107218-35107571)
chr2 (536-631)||(5377629-5377724)
chr2 (747-853)||(22163001-22163107)
chr2 (716-853)||(23870956-23871092)
chr2 (632-852)||(40699429-40699650)
chr2 (497-590)||(38020064-38020157)
chr2 (702-822)||(7462957-7463077)
chr2 (612-762)||(27136195-27136343)
chr2 (619-718)||(38414194-38414291)
chr2 (552-710)||(43139356-43139508)
chr2 (494-567)||(12342673-12342747)
chr2 (649-781)||(20589763-20589896)
chr2 (633-709)||(26345661-26345738)
chr2 (635-691)||(27583479-27583535)
chr2 (469-709)||(35028473-35028707)
chr2 (634-710)||(17921754-17921832)
chr2 (634-709)||(7502975-7503052)
chr2 (808-853)||(15539508-15539553)
chr2 (649-710)||(28458950-28459011)
chr2 (449-544)||(40699182-40699278)
chr2 (268-365)||(22873832-22873932)
chr2 (649-710)||(2740941-2741001)
chr2 (633-767)||(15693958-15694094)
chr2 (552-596)||(41304624-41304667)
chr2 (109-155)||(752145-752191)
chr2 (649-687)||(2736205-2736243)
chr2 (648-709)||(10942634-10942696)
chr2 (648-709)||(10948503-10948565)
chr2 (649-687)||(17462436-17462474)
chr2 (649-687)||(20054909-20054947)
chr2 (649-687)||(22712660-22712698)
chr2 (649-687)||(22717369-22717407)
chr2 (634-710)||(30720733-30720811)
chr2 (634-710)||(34575231-34575308)
chr2 (694-732)||(38020310-38020348)
chr2 (649-687)||(39686983-39687021)
chr2 (649-687)||(45567409-45567447)
chr2 (455-539)||(20147040-20147125)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (452-853)||(79768-80168)
scaffold0004 (649-687)||(188386-188424)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (493-847)||(41468-41821)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (493-847)||(183626-183977)
scaffold0005 (494-838)||(51960-52307)
scaffold0005 (767-838)||(50235-50308)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (498-853)||(79140-79494)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (494-847)||(3948-4298)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (449-847)||(69277-69676)
scaffold0025 (449-647)||(73207-73408)
scaffold0025 (608-657)||(73161-73210)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (494-853)||(11452-11810)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (536-853)||(14363-14677)
scaffold0131 (449-853)||(14925-15326)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (495-847)||(6151-6502)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (536-847)||(29164-29473)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (495-847)||(2832-3182)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (496-853)||(85184-85540)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (536-847)||(34-344)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (537-795)||(2036-2292)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (455-852)||(15801-16195)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (610-847)||(1438-1673)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (496-723)||(35593-35819)
scaffold0011 (767-853)||(35817-35903)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (517-852)||(1622-1946)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (517-767)||(16716-16961)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (648-847)||(22221-22418)
scaffold0140 (648-847)||(24496-24693)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (502-767)||(4773-5034)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (493-664)||(993-1169)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (778-845)||(4666-4733)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (802-844)||(1439-1481)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (649-687)||(224819-224857)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 450 - 853
Target Start/End: Original strand, 1225120 - 1225523
Alignment:
Q  450 agaaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225120 agaaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggc 1225219  T
Q  550 tgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1225220 tgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttggga 1225319  T
Q  650 aacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225320 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 1225419  T
Q  750 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1225420 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 1225519  T
Q  850 cttc 853  Q
    ||||    
T  1225520 cttc 1225523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 8 - 408
Target Start/End: Original strand, 1224696 - 1225100
Alignment:
Q  8 catttttatatgcaaaatgttaacaaatgttcttaagaaacttgctaaaaattataaagaagaaatccacacatttaaacttaaaaaagtannnnnnnnn 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  1224696 catttttatatggaaaatgttaacaaatgcttttaagaaacttgctaaaaattataaagaagaaatccacacatttaaacttaaaaaagtattttttttt 1224795  T
Q  108 nctacataaaacttaccaattatttctattttaaaaaccttaacaagtatctaa-----aagatacttgttatcaagacctttttatatttagggggcaa 202  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1224796 -ctacataaaacttaccaattatttttattttaaaaaccttaacaagtatcttatcttaaagatacttgttatcaagacctttttatatttagggggcaa 1224894  T
Q  203 tgctagcaatcgcctcttttagcaaggcacattgtactttgtatttactttgcatggtgttgcagaagtgactcaatattggagtttgaagtgcaaaatc 302  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1224895 tgctagtaattgccttttttagcaaggcacattgtactttgtatttactttgcatggtgttgtagaagtgattcaatattggagtttgaagtgcaaaatc 1224994  T
Q  303 atgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttctggagttcggggcccgattttggctgcgtttgggaggcttcttgttctggaaaaatcggcgcc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1224995 atgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttctggagtttggggcccgattttggctgcctttgggaggcttcttgttctggaaaaatcggcgcc 1225094  T
Q  403 cgattt 408  Q
    ||||||    
T  1225095 cgattt 1225100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 463 - 851
Target Start/End: Original strand, 27910982 - 27911367
Alignment:
Q  463 tgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtt 562  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910982 tgggccagatttgttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtt 27911081  T
Q  563 tagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataagga 662  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27911082 tagaagg-caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 27911180  T
Q  663 ttgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactc 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  27911181 ttgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctc-tattgtaaagttactc 27911279  T
Q  763 atcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 851  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| || | || |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  27911280 atcatatagtgaaacggagggttgctctctccc-cagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctct 27911367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 463 - 851
Target Start/End: Original strand, 27957401 - 27957786
Alignment:
Q  463 tgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtt 562  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957401 tgggccagatttgttccaattttatgggagatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtt 27957500  T
Q  563 tagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataagga 662  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27957501 tagaagg-caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 27957599  T
Q  663 ttgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactc 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  27957600 ttgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctc-tattgtaaagttactc 27957698  T
Q  763 atcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 851  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| || | || |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  27957699 atcatatagtgaaacggagggttgctctctccc-cagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctct 27957786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480482
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggc 30480639  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  30480638 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctccc 30480540  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480539 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 30480482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 14419574 - 14419169
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agattt-gttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 546  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419574 cagaaacatatttttgggctgagattttgttccaattt-atgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 14419476  T
Q  547 ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14419475 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttg 14419376  T
Q  647 ggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || ||     
T  14419375 ggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtc- 14419277  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14419276 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 14419177  T
Q  846 ctctcttc 853  Q
    ||||||||    
T  14419176 ctctcttc 14419169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 450 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 27107279 - 27106877
Alignment:
Q  450 agaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg 548  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27107279 agaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagaggggg 27107180  T
Q  549 ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 648  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27107179 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggg 27107080  T
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttt 748  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||    
T  27107079 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctc-tt 27106981  T
Q  749 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || | |||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||    
T  27106980 ttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttttc 27106881  T
Q  849 tctt 852  Q
    ||||    
T  27106880 tctt 27106877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 41384743 - 41385100
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41384743 tacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgta 41384841  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384842 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 41384941  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41384942 gctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 41385040  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41385041 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttctctcttc 41385100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 32339303 - 32339659
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32339303 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 32339402  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339403 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 32339502  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  32339503 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 32339601  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  32339602 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttct 32339659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 14807749 - 14808117
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14807749 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 14807848  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  14807849 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 14807948  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggg---------- 783  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||              
T  14807949 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 14808047  T
Q  784 ccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808048 cccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14808117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 27829295 - 27829646
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27829295 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 27829394  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  27829395 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 27829494  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  27829495 accttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 27829592  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27829593 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27829646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 15072708 - 15073067
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15072708 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgta 15072807  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaaga-gattgg 692  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  15072808 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgg 15072907  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  15072908 gactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctct 15073006  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15073007 cccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 15073067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 28251904 - 28251546
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28251904 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 28251805  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  28251804 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28251705  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  28251704 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 28251606  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251605 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 28251546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 27826984 - 27827335
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27826984 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 27827083  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||     
T  27827084 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctggg 27827183  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  27827184 accttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 27827281  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27827282 ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27827335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 4424016 - 4424368
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||| ||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4424016 tacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4424115  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424116 tagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 4424215  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  4424216 gctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatc-ttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 4424314  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4424315 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 41382671 - 41383018
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41382671 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgta 41382770  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||           || | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41382771 tagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggg 41382859  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41382860 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctttt-gtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 41382958  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382959 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 41383018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 3874004 - 3874360
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3874004 tacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtt 3874103  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||      
T  3874104 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggc 3874203  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  3874204 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 3874302  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3874303 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3874360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 494 - 846
Target Start/End: Original strand, 15067979 - 15068330
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15067979 tacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgta 15068078  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||      
T  15068079 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgag 15068178  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  15068179 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctc 15068277  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    || || | ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  15068278 ccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22684951 - 22684638
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22684951 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggtt 22684852  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc- 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  22684851 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22684752  T
Q  735 --attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaa 832  Q
      |||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22684751 atattgatttctc-tattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22684653  T
Q  833 attcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||    
T  22684652 attcttttgtgttct 22684638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 494 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 13858821 - 13858469
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13858821 tacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 13858722  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  13858721 tagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggg 13858622  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  13858621 gctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctct 13858524  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    ||| || | ||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  13858523 cccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattc-tttgtgttctc 13858469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 468 - 847
Target Start/End: Original strand, 18810681 - 18811057
Alignment:
Q  468 cagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 566  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810681 cagatttgttacaaattttaagggaa--acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttaga 18810778  T
Q  567 aagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattga 666  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18810779 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18810878  T
Q  667 gtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca 766  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||  |||||||||    
T  18810879 gtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacaatactcatca 18810976  T
Q  767 tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18810977 tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18811057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 28283562 - 28283206
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28283562 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggg 28283463  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28283462 tttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 28283363  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgc 787  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  28283362 attggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 28283265  T
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28283264 tctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 497 - 852
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865892
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||| |    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcc 36865833  T
Q  795 ctc-atagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | | | | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  36865834 cccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttctgtctt 36865892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 536 - 840
Target Start/End: Original strand, 608774 - 609077
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608774 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 608873  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  608874 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 608973  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  608974 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 609072  T
Q  836 ctttt 840  Q
    |||||    
T  609073 ctttt 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 15809213 - 15809568
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15809213 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 15809312  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  15809313 tgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaac 15809411  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  15809412 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 15809510  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15809511 tcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15809568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952876
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| |    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagac 25952719  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
     |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25952720 attgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 25952818  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25952819 cccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 25952876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372156
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct-c 793  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |    
T  5372313 tttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatct-tttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctcc 5372215  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    || || | |||||||||||||||||||||   |||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  5372214 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgttctttctt 5372156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 44720842 - 44721193
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
T  44720842 acttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtat 44720941  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  44720942 agagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 44721041  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||| || ||||||||    
T  44721042 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctc 44721139  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  44721140 ccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 44721193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 468 - 847
Target Start/End: Original strand, 18812866 - 18813231
Alignment:
Q  468 cagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 566  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18812866 cagatttgttacaaattttaagggaa--acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttaga 18812963  T
Q  567 aagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattga 666  Q
    ||| |||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18812964 aaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18813052  T
Q  667 gtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca 766  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||  |||||||||    
T  18813053 gtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacaatactcatca 18813150  T
Q  767 tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||| |  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18813151 tatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 449 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 15186093 - 15185694
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  15186093 cagaaacgtattttcgggcctagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtg 15185994  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
     |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15185993 actgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgt 15185894  T
Q  648 gaaacactataaggattgagt--ctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctc 745  Q
     ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  15185893 aaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctc 15185801  T
Q  746 tttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgt 844  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  15185800 ttttt-taaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgt 15185702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 544 - 847
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079952
Alignment:
Q  544 gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  644 ttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacat 742  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--at 43079847  T
Q  743 ctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgt 842  Q
     ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  43079848 ttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgt 43079947  T
Q  843 gttct 847  Q
    |||||    
T  43079948 gttct 43079952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082323
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 43082212  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  43082213 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 43082310  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
    |  ||||||||||    
T  43082311 ttctttgtgttct 43082323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 496 - 731
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477511
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
     |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaa 731  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14477476 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 14477511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 496 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541509
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggac 33541524  T
Q  696 tttgggtagaattag 710  Q
    ||| |||||||||||    
T  33541523 ttttggtagaattag 33541509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 494 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 24873524 - 24873193
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24873524 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 24873425  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaaga 686  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24873424 tttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaaga 24873325  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccg 786  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |    
T  24873324 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 24873227  T
Q  787 ctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaa 820  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||    
T  24873226 ctctctcccccatactaggtcagattggaccgaa 24873193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 449 - 673
Target Start/End: Original strand, 26775154 - 26775378
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg 548  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26775154 cagaaacgtatttttgagctatatttgttacaattttatgagggttacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagaggggg 26775253  T
Q  549 ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 648  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26775254 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgga 26775353  T
Q  649 aaacactataaggattgagtctctt 673  Q
    ||||||||| || ||||||||||||    
T  26775354 aaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 43530122 - 43530465
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||                
T  43530122 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------ 43530209  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||      
T  43530210 -gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggc 43530308  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||     
T  43530309 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctg 43530407  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43530408 tctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43530465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 452 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 5623117 - 5622877
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggccagattt-gttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||| | | | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5623117 aaacatatttttgggcctaattttgttccaattt-atgagtgattcttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggct 5623019  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 650  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5623018 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaa 5622919  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5622918 acattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482665
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 21482413  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  21482510 tttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcc 21482608  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |  |||||||||||||    
T  21482609 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 21482665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 586 - 853
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956314
Alignment:
Q  586 ggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaag 685  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  686 agattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggc 784  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggt 15956245  T
Q  785 cgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
      |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15956246 ttctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttc 15956314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 449 - 795
Target Start/End: Original strand, 31162165 - 31162508
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  31162165 cagaaacatatttttgagctgagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggg 31162264  T
Q  548 gctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 646  Q
    ||| ||| ||| |||||||||| | | |||||||  ||| ||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  31162265 gctaaaaacaaaggtttagaaaca-agcaacaaat-tagtgtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttg 31162359  T
Q  647 ggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  31162360 ggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctc- 31162458  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  31162459 ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctccc 31162508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 527 - 822
Target Start/End: Original strand, 21480545 - 21480828
Alignment:
Q  527 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 626  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |    
T  21480545 gtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggtt 21480635  T
Q  627 ttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattct 726  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21480636 t---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattct 21480732  T
Q  727 tgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaact 822  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||    
T  21480733 tgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaact 21480828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 496 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872557
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||| |    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 35872619  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 657  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 35872557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 526 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 3005932 - 3005624
Alignment:
Q  526 tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagg 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||| |||||||| |||||   |||||||| ||||    
T  3005932 tgtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaaca-aataacaaa-ctagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagg 3005836  T
Q  625 gtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttatt 724  Q
    ||| ||   ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3005835 gttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 3005739  T
Q  725 cttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca-atttggaccgaact 822  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| || |  ||||||  |||||||||||||    
T  3005738 cttgtaatccattgatatctc-ttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaact 3005640  T
Q  823 agatcaacaaattctt 838  Q
     | | |||||||||||    
T  3005639 gggtaaacaaattctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 524 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 37214517 - 37214321
Alignment:
Q  524 agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaact-------------------agggtttgtaaagagtttgtc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                   |||||||||| ||||||||||    
T  37214517 agtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtc 37214418  T
Q  605 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtag 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37214417 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtag 37214327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 372 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14419956 - 14419784
Alignment:
Q  372 ggaggcttcttgttctggaaaaatcggcgcccgatttggtaaattcggggcctgattttgcgtaacagnnnnnnnnncagaaacatattttt-gggccag 470  Q
    ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||         || |||||||||||| |||||||    
T  14419956 ggaggcttctgattcgtgaaaaatcggcgcccgatttggtaaatttggggcccgattttgcgtg-cagtttttttttcataaacatattttttgggccag 14419858  T
Q  471 atttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagag 544  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14419857 atttgctacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagag 14419784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 619 - 768
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactata-aggattgagtctcttggttacg--ggaagagattggagctttgggtagaattagacggg 715  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||  |||||||||||||||| |||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  716 agacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcata 768  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc--tttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 494 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 3886255 - 3886156
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3886255 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 3886156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 494 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 12517363 - 12517248
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||||||| |||||    ||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12517363 tacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 12517264  T
Q  592 taaagagtttgtctct 607  Q
    || |||||||||||||    
T  12517263 tatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 702 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468110
Alignment:
Q  702 tagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcata 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| | || |    
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccaga 2468161  T
Q  801 gtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
     ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |  |||||||||||||    
T  2468160 ttaggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 2468110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 734 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541389
Alignment:
Q  734 cattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaa 833  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||| | | |||| ||     
T  33541507 cattgatatctctttt-gtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaat 33541409  T
Q  834 ttcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33541408 ttcttttgtgttctctcttc 33541389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 631 - 795
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035416
Alignment:
Q  631 gggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| || |||||||||||   |||| |||||||||| |   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  730 aactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||| | |||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc--tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31035416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 552 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 31574000 - 31573794
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||    
T  31574000 aaacaaaggtttagaa-gccaacacgaaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 31573907  T
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttt 750  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  31573906 cactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctc-tttt 31573808  T
Q  751 gtaacgttactcat 764  Q
    |||| |||||||||    
T  31573807 gtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 494 - 591
Target Start/End: Original strand, 181535 - 181632
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  181535 tacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 457 - 668
Target Start/End: Original strand, 31035029 - 31035238
Alignment:
Q  457 tatttttgggc-cagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgaga--tagagggggctga 552  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||  || |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |  ||||    
T  31035029 tatttttgggctcagatttgttccaattttttagga--tatttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctga 31035125  T
Q  553 aa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    || ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  31035126 aaacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 31035221  T
Q  652 cactataaggattgagt 668  Q
    ||| || ||||||||||    
T  31035222 caccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 634 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578314
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  733 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
       |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||    
T  31578376 cttttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccc 31578314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 718 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872432
Alignment:
Q  718 acttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggacc 817  Q
    ||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             |||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctctttt-gtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggacc 35872468  T
Q  818 gaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872467 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 35872432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 494 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 2468435 - 2468261
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg-- 591  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||        ||  |||||| ||||||      
T  2468435 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttaga--------aatcaaactacggtttgta 2468344  T
Q  592 --taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggt 676  Q
      || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2468343 tatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 777 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214243
Alignment:
Q  777 cggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||| ||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttctcttc 37214243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423273
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattag 30423273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 634 - 710
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847739
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg--gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 17847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985200
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattag 13985200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 766 - 853
Target Start/End: Original strand, 14477519 - 14477607
Alignment:
Q  766 atatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaacta-gatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| | || || | |||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14477519 atatagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctttcttc 14477607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 634 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839044
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattag 33839044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 469 - 539
Target Start/End: Original strand, 6375962 - 6376032
Alignment:
Q  469 agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga 539  Q
    |||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||    
T  6375962 agatttattccaattttatgcgggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021251
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 9021251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 634 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752666
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16752666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757411
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16757411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799568
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17799568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 790 - 847
Target Start/End: Original strand, 28228656 - 28228714
Alignment:
Q  790 tctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  28228656 tctcccccaaagtaggtcaatattggaccgaactaggtaaacacattcttttgtgttct 28228714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327946
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28327946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895540
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28895540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 816 - 853
Target Start/End: Original strand, 181798 - 181835
Alignment:
Q  816 ccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  181798 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 181835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 748 - 851
Target Start/End: Original strand, 6376239 - 6376343
Alignment:
Q  748 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||   | |||||||| || ||||||    
T  6376239 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt-ttgtgtgtt 6376337  T
Q  846 ctctct 851  Q
    ||||||    
T  6376338 ctctct 6376343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 174
Target Start/End: Original strand, 33358293 - 33358358
Alignment:
Q  109 ctacataaaacttaccaattatttctattttaaaaaccttaacaagtatctaaaagatacttgtta 174  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||||    
T  33358293 ctacataaaactaaccgattatttctgttttaaaatctttaacaaataccataaagatacttgtta 33358358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 137)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 260 - 852
Target Start/End: Original strand, 39715158 - 39715744
Alignment:
Q  260 tgttgcagaagtgactcaatattggagtttgaagtgcaaaatcatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttctggagttcggggcccgattt 359  Q
    ||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39715158 tgttgtagaagtgacttaaaattgaagtttggagtgcaaaatcatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttgtggagttcggggcccgattt 39715257  T
Q  360 tggctgcgtttgggaggcttcttgttctggaaaaatcggcgcccgatttggtaaattcggggcctgattttgcgtaacagnnnnnnnnn-cagaaacata 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||          || |||||||    
T  39715258 tggctgcctttgggaggcttctgattcgaataaaatcggcgcccgatttggtaaatttggggcccgattttgcgtg-cagttttttttttcaaaaacata 39715356  T
Q  459 tttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaag 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  39715357 tttttgggccagatttgttacaatttcatgggagttacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataag 39715455  T
Q  559 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactata 658  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  39715456 ggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactatt 39715555  T
Q  659 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgtt 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  39715556 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctc-ttttgtaaagtt 39715654  T
Q  759 actcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    |||||||  |||||||||| || ||  |  ||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39715655 actcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctcccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 39715744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423440
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  43423596 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccc 43423498  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423497 tgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 43423440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314965
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 3314807  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3314808 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 3314906  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314907 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626660
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1626816 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgc 1626718  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     || | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1626717 ccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1626660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 493 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 4308617 - 4308258
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4308617 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4308518  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4308517 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 4308418  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4308417 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct 4308319  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308318 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 4308258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 497 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421392
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctcccc 43421449  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421448 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 43421392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 1313332 - 1313689
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  1313332 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgta 1313430  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  1313431 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggg 1313530  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1313531 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 1313629  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313630 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1313689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 51943293 - 51943650
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51943293 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 51943392  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  51943393 tagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 51943492  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  51943493 gctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 51943590  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51943591 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 51943650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 45882861 - 45883220
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45882861 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 45882960  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  45882961 tagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 45883060  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  45883061 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 45883159  T
Q  794 cctc-atagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || | | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883160 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 45883220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 53917999 - 53917641
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53917999 tacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 53917900  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53917899 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 53917800  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53917799 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 53917701  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917700 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 53917641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28101979
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 28102136  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  28102135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccc 28102037  T
Q  796 tcatag-taggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102036 -caaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 28101979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880428
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  596 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattgggg 880586  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  880585 ctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcc 880487  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |  | | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  880486 cctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 880428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Original strand, 36011703 - 36012107
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36011703 cagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggg 36011802  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36011803 gctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgg 36011902  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  36011903 gaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-t 36012001  T
Q  748 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36012002 tttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttcttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 36012101  T
Q  848 ctcttc 853  Q
    ||||||    
T  36012102 ctcttc 36012107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 493 - 853
Target Start/End: Original strand, 43228212 - 43228571
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  43228212 ttactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgt 43228311  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  43228312 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43228411  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  43228412 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 43228510  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228511 cccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 43228571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 24979629 - 24979988
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||| ||||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979629 tactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 24979728  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  24979729 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgag 24979828  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24979829 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatct-tttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctct 24979927  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979928 cccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 24979988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 536 - 851
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990582
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 42990467  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42990468 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42990566  T
Q  836 cttttgtgttctctct 851  Q
    ||||||||||||||||    
T  42990567 cttttgtgttctctct 42990582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 53915831 - 53915473
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  53915831 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgta 53915732  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53915731 tagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 53915632  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  53915631 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctc 53915533  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915532 ccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 53915473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 452 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 5927142 - 5926746
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||| | || | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5927142 aaacatattttacggcctagatttgttccaagtttattgaagattcttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggct 5927043  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 650  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5927042 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaa 5926943  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttt 750  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || || ||||    
T  5926942 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatc-tttt 5926844  T
Q  751 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  5926843 gtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttctct 5926746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 449 - 847
Target Start/End: Original strand, 11170281 - 11170678
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggc-cagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 546  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||   |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  11170281 cagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaa--acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggg 11170378  T
Q  547 ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11170379 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttg 11170478  T
Q  647 ggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     
T  11170479 ggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 11170577  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  11170578 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgttttc 11170677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 536 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 27101474 - 27101158
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27101474 gagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 27101375  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  27101374 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 27101275  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27101274 ttgatatctc-ttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 27101176  T
Q  836 cttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27101175 cttttgtgttctctcttc 27101158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 536 - 853
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006121
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30006005 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 30006103  T
Q  836 cttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30006104 cttttgtgttctctcttc 30006121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 12268301 - 12267952
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaa-ctagggtttgt 592  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12268301 tacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgt 12268202  T
Q  593 aaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268201 atagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 12268102  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12268101 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc------------ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctc 12268014  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||| || | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268013 tcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 12267952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 32264423 - 32264015
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggc-cagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaa----ccttgagatag 542  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||    | |||||||||    
T  32264423 cagaaacatatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcga--tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatag 32264326  T
Q  543 agggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 642  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264325 agggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 32264226  T
Q  643 cttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacat 742  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32264225 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatat 32264126  T
Q  743 ctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttg 841  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  32264125 ctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttg 32264027  T
Q  842 tgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||    
T  32264026 tgttctctcttc 32264015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 38890004 - 38890314
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38890004 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 38890103  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  38890104 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 38890203  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38890204 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 38890302  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  38890303 cttttgtgttct 38890314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 48362005 - 48361648
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48362005 tacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 48361907  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  48361906 tagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggg 48361807  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  48361806 gcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctc 48361708  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48361707 ccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 48361648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10956359 - 10956010
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10956359 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10956260  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||    
T  10956259 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 10956160  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||      
T  10956159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccac 10956061  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10956060 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10956010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 493 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 51727342 - 51726990
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  51727342 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgt 51727243  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  51727242 atagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctga 51727144  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  51727143 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctct 51727045  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51727044 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51726990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 495 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 18099504 - 18099151
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18099504 acttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 18099406  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  18099405 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 18099306  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18099305 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 18099207  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    ||  | | ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18099206 ccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 18099151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10958655 - 10958306
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10958655 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10958556  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||   ||    
T  10958555 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacact 10958456  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  10958455 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-ttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 10958357  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  10958356 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttct 10958306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 53468836 - 53468430
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  53468836 cagaaacatattttcgggcctagatttgttccatttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggg 53468737  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  53468736 gctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgg 53468638  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  53468637 gaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-t 53468539  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctct--ctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgt 844  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |||  | | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  53468538 tttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 53468439  T
Q  845 tctctcttc 853  Q
    |||||||||    
T  53468438 tctctcttc 53468430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 18097281 - 18096877
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggc-cagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt-gagatagagg 545  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||   ||||||||  |||||| |  ||||||||||    
T  18097281 cagaaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcgag--acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagg 18097184  T
Q  546 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 645  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097183 gggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 18097084  T
Q  646 gggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctc 745  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  || |    
T  18097083 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttc-c 18096985  T
Q  746 tttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  18096984 cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgtt 18096885  T
Q  846 ctctcttc 853  Q
    ||||||||    
T  18096884 ctctcttc 18096877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 3859451 - 3859801
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  3859451 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3859550  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||       
T  3859551 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 3859650  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  3859651 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattg--atttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctcc 3859748  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3859749 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 493 - 853
Target Start/End: Original strand, 43226007 - 43226363
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  43226007 ttactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgt 43226105  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  43226106 atagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 43226205  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  43226206 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 43226304  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||  | | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  43226305 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctcttc 43226363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 4104234 - 4103879
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4104234 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4104135  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  4104134 tgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 4104035  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||     
T  4104034 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgcta 4103937  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4103936 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4103879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 18162586 - 18162943
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatca-gtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||| | |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18162586 tacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 18162683  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162684 atagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 18162783  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18162784 gactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 18162883  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | |||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18162884 cccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctcttc 18162943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 25533406 - 25533716
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25533406 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 25533505  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25533506 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25533605  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  25533606 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 25533704  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  25533705 cttttgtgttct 25533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 536 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604584
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggtt 9604801  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9604800 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 9604701  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9604700 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaatt 9604602  T
Q  836 cttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9604601 cttttgtgttctctcttc 9604584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 502 - 789
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562028
Alignment:
Q  502 ctataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagttt 601  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  602 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggg 701  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6561939  T
Q  702 tagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  6561940 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 449 - 847
Target Start/End: Original strand, 5191530 - 5191925
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggc-cagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 546  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||   |||||||   | |||| | |||||||||||    
T  5191530 cagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagggaa--acttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagaggg 5191627  T
Q  547 ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5191628 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg 5191727  T
Q  647 ggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  || |||    
T  5191728 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattg--atttct 5191825  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5191826 ctttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 5191924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 497 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674743
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
           | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |    
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||     
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccc 51674800  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51674799 cataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 51674743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148872
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 590  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||  ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  591 gtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcacctt-ggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 47149035  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  47149034 tgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctc 47148936  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||| || | || |||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  47148935 tctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttctctcttc 47148872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22114639 - 22114288
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  22114639 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtat 22114540  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||      
T  22114539 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 22114440  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||    
T  22114439 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctcc 22114341  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || |  | || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22114340 cccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22114288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10084682 - 10084372
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10084682 gagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 10084583  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |     
T  10084582 gattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccg 10084483  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10084482 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10084384  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
     |||||||||||    
T  10084383 attttgtgttct 10084372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 496 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889781
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||  || |||||||||||| |    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtata 890007  T
Q  596 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttgggg 889908  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  889907 ctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcc 889809  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaact 822  Q
    | || | |||||||||||||||||||||    
T  889808 cgcagactaggtcaatttggaccgaact 889781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 458202 - 458558
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  458202 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 458301  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  458302 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 458401  T
Q  689 ttggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgct 788  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||    
T  458402 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 458499  T
Q  789 ctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||| || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||   ||||||||||    
T  458500 ctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 458558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 746673 - 747031
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  746673 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaggg 746772  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaaga 686  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  746773 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 746872  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccg 786  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |    
T  746873 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactg 746970  T
Q  787 ctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  746971 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 747031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 26720470 - 26720821
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26720470 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 26720569  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||     
T  26720570 tagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctggg 26720668  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | ||||||||    
T  26720669 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctc 26720767  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||  | | ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  26720768 ccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttct 26720821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691551
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||| | ||    
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggc 54691708  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  54691707 tttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctc-ttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctccc 54691609  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
      | | || ||||||||| || ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||    
T  54691608 ctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgttttctcttc 54691551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 455825 - 456181
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  455825 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 455924  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  455925 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 456024  T
Q  689 ttggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgct 788  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||    
T  456025 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 456122  T
Q  789 ctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||| || | ||||||   |||||||||||| | |||||||||   ||||||||||    
T  456123 ctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 456181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 494 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 28761763 - 28761407
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28761763 tacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 28761664  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     | |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||      
T  28761663 tatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgag 28761565  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
     |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  28761564 actttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctct 28761466  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaa-tttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| || | |||||||| |||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  28761465 cccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttctctc 28761407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 5522949 - 5522610
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  5522949 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-- 5522852  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
             ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||      
T  5522851 ---------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 5522761  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  5522760 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 5522663  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5522662 cgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 6063782 - 6063429
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6063782 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6063683  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    | ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6063682 atagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 6063583  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  6063582 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 6063485  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| || | |||||||  |||||||||||| | || |||||||  ||||||||||    
T  6063484 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttct 6063429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 548 - 847
Target Start/End: Original strand, 25388882 - 25389179
Alignment:
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25388882 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-g 25388980  T
Q  648 gaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  || |||    
T  25388981 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattg--atttct 25389078  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  25389079 ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 25389178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 38210334 - 38210644
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38210334 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 38210433  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38210434 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 38210533  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||| || |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  38210534 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 38210631  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
       ||||||||||    
T  38210632 atctttgtgttct 38210644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 6066131 - 6065779
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6066131 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6066032  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066031 tagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 6065932  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||    
T  6065931 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctct 6065834  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||  | | |||||||  |||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  6065833 cccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 6065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 536 - 794
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956907
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29956850 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621513
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10621624  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | ||| |||  |||||||||||| | |||||||||    
T  10621623 attg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaat 10621526  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
    |  ||||||||||    
T  10621525 ttctttgtgttct 10621513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 452 - 737
Target Start/End: Original strand, 35777301 - 35777587
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggc-cagatttgttaca-attttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggc 549  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |  ||  |||||||||||||||||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  35777301 aaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagcaag--acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc 35777398  T
Q  550 tgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 649  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35777399 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 35777498  T
Q  650 aacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcatt 737  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35777499 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 494 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 10191648 - 10191305
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| | | |||| ||    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10191648 tacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtt 10191549  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||      
T  10191548 tttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggc 10191449  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  10191448 tgga-ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 10191351  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10191350 tctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 576 - 847
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321753
Alignment:
Q  576 acaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttgg 675  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  676 ttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaa 775  Q
    |||| |||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgga 1321681  T
Q  776 acggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1321682 tcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1321753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 32219017 - 32219365
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||| | |||||||||||   ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||            
T  32219017 tactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-------- 32219108  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  32219109 ---agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattggg 32219205  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
     ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32219206 actttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatct-tttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctct 32219304  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | | || | || | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219305 ctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 32219365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 50493922 - 50494273
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||  | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  50493922 actttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 50494021  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  50494022 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattggg 50494121  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  50494122 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 50494219  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||   ||||||||||    
T  50494220 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 50494273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 496 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattctt 727  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28100174 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 496 - 832
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591442
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||         
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt----- 53591213  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |       
T  53591214 ------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggat 53591307  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  53591308 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctc-atttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctctccc 53591406  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaa 832  Q
     || | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53591407 -cagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 585 - 852
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484639
Alignment:
Q  585 gggtttgtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacggga 683  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  684 agagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggg 783  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatct-tttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 6484570  T
Q  784 ccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484571 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 6484639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 493 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 35918285 - 35917944
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35918285 ttactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 35918186  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaaga 686  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  35918185 atagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaaga 35918086  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccg 786  Q
    || |||   ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  35918085 gactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctg 35917987  T
Q  787 ctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaac 830  Q
    |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  35917986 ctctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 536 - 851
Target Start/End: Original strand, 42992250 - 42992548
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42992250 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 42992349  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||               ||||||||||||||||    
T  42992350 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagtgga-ctttgggtag---------------ttattcttgtaactca 42992433  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42992434 ttgatttctc-ttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42992532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 496 - 735
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181185
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  28181146 tttggatagaattaggcgggagacgtattcttataactca 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 15780782 - 15781159
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15780782 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 15780881  T
Q  594 aagagtt-----------tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacggg 682  Q
     ||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15780882 tagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacggg 15780981  T
Q  683 aagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct---ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 778  Q
    |||||  ||   |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || | |   |||||||| |||| | |||| ||||||| ||||    
T  15780982 aagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacg 15781081  T
Q  779 gaggg---ccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     ||||   | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15781082 aagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttc 15781159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 583 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7606831 - 7606571
Alignment:
Q  583 tagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacggg 682  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7606831 tagggtttgta--gagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 7606734  T
Q  683 aagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagg 782  Q
    |||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  7606733 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattg--atttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagg 7606636  T
Q  783 gccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7606635 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7606571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 449 - 852
Target Start/End: Original strand, 23633336 - 23633732
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  23633336 cagaaacgtattttcgagcctagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagg 23633435  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    ||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  ||    
T  23633436 gctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gg 23633529  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||      
T  23633530 gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-- 23633627  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || | ||||||||||| ||||||| | | | |||||||||||||||||||    
T  23633628 tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttc 23633726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 562 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413014
Alignment:
Q  562 ttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataagg 661  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  662 attg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttac 760  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaac 28413102  T
Q  761 tcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaa-ttcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28413101 tcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttct 28413014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 497 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635635
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||| ||||||||   ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||                   |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||            ||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt-------------------gggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ct 27635791  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27635790 ttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctttt-gtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 27635692  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635691 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27635635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 623 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688137
Alignment:
Q  623 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagactta 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  723 ttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaact 822  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  823 agatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgttctctcttc 25688137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 535 - 853
Target Start/End: Original strand, 4666488 - 4666794
Alignment:
Q  535 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 634  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||           |||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  4666488 tgagatagagggggctgaaagaagggtctagtaagacaacaacaaaaatagggtttgt-----------ctcttgacaacagacactagggtttgagggt 4666576  T
Q  635 tgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggaga--cttattcttgtaac 732  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||     
T  4666577 tgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaat 4666676  T
Q  733 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 831  Q
     |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||   | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4666677 ccattgatatctctttt-gtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctcccc---agactaggtcaatttggaccgaactggatcaaca 4666772  T
Q  832 aattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4666773 aattcttttgtgttctctcttc 4666794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151625
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggg 31151466  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactca-tcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
     |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  31151467 actttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctc-ttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctct 31151563  T
Q  793 ccctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | |||||||  ||||| | ||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  31151564 cccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctcttc 31151625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 449 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 28137676 - 28137415
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28137676 cagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggg 28137577  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28137576 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgg 28137488  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagact 720  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28137487 gaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 449 - 749
Target Start/End: Original strand, 23636903 - 23637200
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23636903 cagaaacatatttttcggcctagatttgtttcaattttatgagggataattttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggag 23637002  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||     
T  23637003 gctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttga 23637098  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23637099 gaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 23637198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 620 - 853
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232080
Alignment:
Q  620 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagac 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattgg-gatttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  720 ttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccg 818  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||| |  | |||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagctactcatcattacagtg-aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccg 6232045  T
Q  819 aactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232046 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6232080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 449 - 780
Target Start/End: Original strand, 54884033 - 54884362
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |  | | ||||||| |||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  54884033 cagaaacgtattttcgggcctaaatttgttccaattttattgaggattcttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagaggga 54884132  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  54884133 gctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttgg 54884230  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |    
T  54884231 aaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctc-t 54884328  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgga 780  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  54884329 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 54884362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 633 - 849
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886474
Alignment:
Q  633 gttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  733 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaa 832  Q
     |||||  || | | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5886360 ccattg--atttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5886457  T
Q  833 attcttttgtgttctct 849  Q
    |||||||||||||||||    
T  5886458 attcttttgtgttctct 5886474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 633 - 849
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899947
Alignment:
Q  633 gttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  733 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaa 832  Q
     |||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5899833 ccattg--atttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5899930  T
Q  833 attcttttgtgttctct 849  Q
    |||||||||||||||||    
T  5899931 attcttttgtgttctct 5899947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 460 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 13420541 - 13420222
Alignment:
Q  460 ttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg 559  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13420541 ttttgggctggatttgtttcaattttatgaaggatacttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagg 13420442  T
Q  560 gtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataa 659  Q
    |||||          ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  13420441 gttta----------aatcaaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactatta 13420356  T
Q  660 ggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgtta 759  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  13420355 ggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagtta 13420257  T
Q  760 ctcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||| | |||| || ||||||| || ||||||||    
T  13420256 ctcattattataatggaacggagagctgctctctc 13420222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 526 - 852
Target Start/End: Original strand, 17795224 - 17795538
Alignment:
Q  526 tgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 625  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||          ||||||| || |||| |||||||| || || | ||||||||||||||    
T  17795224 tgtaaacctggagatagatggggttgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactaggg 17795314  T
Q  626 tttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattc 725  Q
    ||   |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17795315 tt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattc 17795411  T
Q  726 ttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactag 824  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||  | | |||||||||||| |||||| |||    
T  17795412 ttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattag 17795510  T
Q  825 atcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||    
T  17795511 gtaaacaaattctcttgtgttctctctt 17795538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 526 - 852
Target Start/End: Original strand, 19103664 - 19103978
Alignment:
Q  526 tgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 625  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||          ||||||| || |||| |||||||| || || | ||||||||||||||    
T  19103664 tgtaaacctggagatagatggggttgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactaggg 19103754  T
Q  626 tttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattc 725  Q
    ||   |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19103755 tt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattc 19103851  T
Q  726 ttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactag 824  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||  | | |||||||||||| |||||| |||    
T  19103852 ttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattag 19103950  T
Q  825 atcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||    
T  19103951 gtaaacaaattctcttgtgttctctctt 19103978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 636 - 847
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168375
Alignment:
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  11168265 ttgatttctctttt-gtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaatt 11168363  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  11168364 cttttgtgttct 11168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 474 - 820
Target Start/End: Original strand, 53597143 - 53597485
Alignment:
Q  474 tgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaa 573  Q
    |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||    
T  53597143 tgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga-ggggatgaaacaagggttta-taagtcaa 53597240  T
Q  574 caacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctctt 673  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53597241 caagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaa--gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 53597337  T
Q  674 ggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagt 772  Q
    ||| | | ||| ||||||    |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53597338 ggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttc-ttttgtaaagttactcatcattatagt 53597436  T
Q  773 gaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaa 820  Q
    | || ||||||  |||||||||| || | ||||||| | ||||||||||    
T  53597437 ggaatggagggttgctctctcccacaaactaggtcagtattggaccgaa 53597485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 543 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 562058 - 561809
Alignment:
Q  543 agggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 642  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||    
T  562058 agggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacatgaaa-ctagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcac 561964  T
Q  643 cttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacat 742  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  561963 attgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatat 561864  T
Q  743 ctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctc 797  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  561863 ct-tttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctc 561809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 537 - 664
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  537 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  637 attcaccttgggaaacactataaggatt 664  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 496 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggt 626  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 650 - 853
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307040
Alignment:
Q  650 aacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  750 tgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||   | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3306939 -gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctc 3307035  T
Q  849 tcttc 853  Q
    |||||    
T  3307036 tcttc 3307040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 495 - 640
Target Start/End: Original strand, 11163073 - 11163218
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||| ||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11163073 acttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11163172  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163173 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 699 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701652
Alignment:
Q  699 gggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctca 798  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccca 47701703  T
Q  799 tagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
     | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  47701702 gattaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctct 47701652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 451 - 560
Target Start/End: Original strand, 6484264 - 6484373
Alignment:
Q  451 gaaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484264 gaaacatatttttggggcagatttgttacatttttatgggagttacttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 6484363  T
Q  551 gaaacaaggg 560  Q
    ||||||||||    
T  6484364 gaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 497 - 625
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactaggg 625  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 579 - 795
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635604
Alignment:
Q  579 aaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggtta 678  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  679 cgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaac 777  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatct-attttgtaaagttactcatcattatggtgaaac 25635586  T
Q  778 ggagggccgctctctccc 795  Q
     |||||  ||||||||||    
T  25635587 agagggttgctctctccc 25635604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 497 - 615
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  597 agtttgtctctttggaaca 615  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 544 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871308
Alignment:
Q  544 gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 643  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcacc 36871488  T
Q  644 ttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgacat 742  Q
    |||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |   | ||||||||||||| ||| | |||  ||    
T  36871487 ttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttat 36871388  T
Q  743 ctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaact 822  Q
    |||  ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||| | ||||||||||||    
T  36871387 ctc--tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaact 36871308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 572 - 749
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674149
Alignment:
Q  572 aacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctc 671  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  672 ttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    ||| | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtctttt 1674149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 469 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 4560625 - 4560403
Alignment:
Q  469 agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 568  Q
    |||||| || |||||||| | | | |||||| ||||||| |||||    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4560625 agatttattccaattttacgagggatactttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaa 4560526  T
Q  569 gacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagt 668  Q
    |  ||||||||||||||           |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  4560525 ggtaacaacaaaactag-----------agtttgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagc 4560445  T
Q  669 ctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4560444 ctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattag 4560403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 494 - 676
Target Start/End: Original strand, 24177201 - 24177380
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  24177201 tacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttagat-gtcaacaagaaaactagggtttgt 24177299  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggt 676  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24177300 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 359
Target Start/End: Original strand, 6484074 - 6484175
Alignment:
Q  259 gtgttgcagaagtgactcaatattggagtttgaagtgcaaaa-tcatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttctggagttcggggcccgat 357  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6484074 gtgttgtagaagtgactcaaaattggagtttggagtgcaaaaatgacgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttgtggagttcggggcccgat 6484173  T
Q  358 tt 359  Q
    ||    
T  6484174 tt 6484175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 757 - 853
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849339
Alignment:
Q  757 ttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 41849339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 678 - 794
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181602
Alignment:
Q  678 acgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaa 776  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 24181584  T
Q  777 cggagggccgctctctcc 794  Q
    |||| | | |||||||||    
T  24181585 cggatgactgctctctcc 24181602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 551 - 708
Target Start/End: Original strand, 13419864 - 13420015
Alignment:
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 650  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  13419864 gaaacaaaggttta-aaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaa 13419957  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatt 708  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||||    
T  13419958 acactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 766 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919098
Alignment:
Q  766 atatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 494 - 569
Target Start/End: Original strand, 1321363 - 1321438
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 569  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321363 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 1321438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 634 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620496
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |   | || ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  733 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
     | |||| |||||  |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1620557 cctttgatatctc--tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 1620496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 715 - 850
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634164
Alignment:
Q  715 gagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttg 813  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||  || | |||| |||||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttg 25634128  T
Q  814 gaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     |||||||||| | |||||||| || |||||||||||    
T  25634129 caccgaactaggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 25634164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 634 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634491
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||||||   |||||||||| |||| |   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  733 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacgga 780  Q
     | |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  14634538 cctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcataatagtggaacgga 14634491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 579 - 676
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  579 aaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggt 676  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 778 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 53894109 - 53894040
Alignment:
Q  778 ggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  53894109 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 53894040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 453 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 1619036 - 1618896
Alignment:
Q  453 aacatattttt--gggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt--gagatagaggggg 548  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| | | |||||| |||||||||||||   ||||| ||  |||||||||  |||| ||||||||    
T  1619036 aacatatttttatgggctagatttgttccaattttatgagggatactttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagaggggg 1618937  T
Q  549 ctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 590  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  1618936 ctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaac-aaactagggttt 1618896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 634 - 710
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768708
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||   | |||||| ||||| ||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattag 7768708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 634 - 710
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066730
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattag 11066730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606832
Alignment:
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 657  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactat 7606832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544333
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattag 27544333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 154
Target Start/End: Original strand, 49068725 - 49068770
Alignment:
Q  109 ctacataaaacttaccaattatttctattttaaaaaccttaacaag 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  49068725 ctacataaaacttatcaattatttctattttaaaatccttatcaag 49068770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 612 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  612 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttg 674  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 659 - 710
Target Start/End: Original strand, 4535624 - 4535674
Alignment:
Q  659 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  4535624 aggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg-gaattgggtagaattag 4535674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 661 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007558
Alignment:
Q  661 gattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttac 760  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||          | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctc-ttttgtaaagttac 11007594  T
Q  761 tcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    |||||| ||||||| || || ||||  |||||||||    
T  11007593 tcatcattatagtggaatggggggctcctctctccc 11007558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 819 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 880251 - 880217
Alignment:
Q  819 aactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  880251 aactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 880217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303348
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 6303348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 536 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 6719390 - 6719356
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaga 570  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6719390 gagatagagggggctgaaataagggtttagaaaga 6719356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094218
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10094218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100235
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10100235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201098
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10201098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462241
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16462241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626128
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22626128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 652 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762108
Alignment:
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgg-gacttgggtagaattag 27762108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 811 - 853
Target Start/End: Original strand, 28181242 - 28181284
Alignment:
Q  811 ttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28181242 ttggaccgaactaggtcaacaaattctcctgtgttctctcttc 28181284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33840200 - 33840158
Alignment:
Q  113 ataaaacttaccaattatttctattttaaaaaccttaacaagt 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33840200 ataaaacttatcaattatttctattttaaaatccttaataagt 33840158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 788 - 838
Target Start/End: Original strand, 46173481 - 46173531
Alignment:
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctt 838  Q
    |||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  46173481 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactagatcaacaatttctt 46173531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883026
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 47883026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1620759 - 1620710
Alignment:
Q  463 tgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatata 512  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  1620759 tgggctagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatata 1620710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16996935
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattgg-gatttgggtagaattag 16996935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 802 - 851
Target Start/End: Original strand, 42992615 - 42992664
Alignment:
Q  802 taggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 851  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||    
T  42992615 taggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattctctct 42992664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 92)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 260 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 17819057 - 17818475
Alignment:
Q  260 tgttgcagaagtgactcaatattggagtttgaagtgcaaaatcatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttctggagttcggggcccgattt 359  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17819057 tgttgtagaagtgactcaaaatcggagtttggagtgcaaaatcatgtttgctggaagacccaaagtcggcgtccgatttgtggagtttggggcccgattt 17818958  T
Q  360 tggctgcgtttgggaggcttcttgttctgg-aaaaatcggcgcccgatttggtaaattcggggcctgattttgcgtaacagnnnnnnnnncagaaacata 458  Q
    ||||||| | | ||||   | |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||          ||||| |||    
T  17818957 tggctgcctgttggagcagt-ttgttgcgacaaaaatcggcgcccgatttggtaaattcggggcctgattttgcgtg-cagtttttttt--agaaatata 17818862  T
Q  459 tttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaag 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17818861 tttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttgttataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaag 17818763  T
Q  559 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactata 658  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  17818762 agtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactatt 17818663  T
Q  659 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgtt 758  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||    
T  17818662 aagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagtt 17818564  T
Q  759 actcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||   |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17818563 actcatcatacagtggaacagagggc--ttctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17818475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 260 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 37706355 - 37705774
Alignment:
Q  260 tgttgcagaagtgactcaatattggagtttgaagtgcaaaatcatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttctggagttcggggcccgattt 359  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37706355 tgttgtagaagtgactcaaaattggagtttggagtgcaaaatcatgtttgctggaagacccaaaatcagtgcccgatttgtggagttcggggcccaattt 37706256  T
Q  360 tggctgcgtttgggaggcttcttgttctgg-aaaaatcggcgcccgatttggtaaattcggggcctgattttgcgtaacagnnnnnnnnnc-----agaa 453  Q
    ||||||| | | ||||   | |||||  |  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||   ||         |     ||||    
T  37706255 tggctgcctgttggagcagt-ttgttgcgacaaaaatcagcgcccgatttgctaaattcagggcccgattttgcgtgt-agtttttttttctttccagaa 37706158  T
Q  454 acatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 553  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706157 acatatttttgggtcagattttttacaattttatgggagttacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 37706058  T
Q  554 acaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 653  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37706057 ataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 37705958  T
Q  654 ctataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgta 753  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  37705957 ctattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgta 37705859  T
Q  754 acgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctt 838  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37705858 aggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904403
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggc 25904246  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  25904247 tttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-tattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctccc 25904345  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25904346 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 25904403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073183
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggc 17073026  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17073027 tttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcc 17073125  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | || | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||    
T  17073126 cccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgctttctctctt 17073183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Original strand, 21947924 - 21948326
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggc-cagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 546  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  21947924 cagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcga--tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagaggg 21948021  T
Q  547 ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 646  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948022 g-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 21948120  T
Q  647 ggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||     
T  21948121 ggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctc- 21948219  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21948220 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 21948319  T
Q  847 tctcttc 853  Q
    |||||||    
T  21948320 tctcttc 21948326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 10474706 - 10474302
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10474706 cagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattctcttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggg 10474607  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10474606 gctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgg 10474507  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |    
T  10474506 gaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctc-t 10474408  T
Q  748 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10474407 tttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10474308  T
Q  848 ctcttc 853  Q
    ||||||    
T  10474307 ctcttc 10474302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 2818673 - 2818314
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2818673 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgta 2818574  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg-ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  2818573 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgg 2818474  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2818473 gactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctct 2818375  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818374 cccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2818314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 493 - 853
Target Start/End: Original strand, 39854425 - 39854783
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39854425 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 39854523  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  39854524 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgg 39854623  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  39854624 aactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 39854722  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854723 cccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39854783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 498 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511191
Alignment:
Q  498 tttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 18511448  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18511447 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 18511348  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18511347 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 18511249  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
      | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511248 ctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 18511191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127155
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24127000 tttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24127098  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
     || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  24127099 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 24127155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 25921810 - 25921458
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921810 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 25921711  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  25921710 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 25921611  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  25921610 actctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctc 25921512  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25921511 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25921458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 493 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 10529437 - 10529091
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |    
T  10529437 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattttt 10529338  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529337 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 10529238  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  10529237 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctct 10529139  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctttt 840  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10529138 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 12556260 - 12555902
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12556260 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 12556161  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12556160 tagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattgga 12556061  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||    
T  12556060 g-ttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctc 12555962  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12555961 ccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttc 12555902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472591
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 31472749  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||| ||||||||||| |||||  | | ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  31472748 ttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcc 31472650  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472649 cccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 31472591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 490 - 853
Target Start/End: Original strand, 40221460 - 40221823
Alignment:
Q  490 gagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40221460 gagttacttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 40221559  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40221560 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagat 40221659  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgct 788  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||    
T  40221660 tgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgct 40221758  T
Q  789 ctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40221759 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctcttc 40221823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 498 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509297
Alignment:
Q  498 tttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggact 18509453  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  18509452 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatct-attttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccc 18509354  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     | | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509353 tagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 18509297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 496 - 847
Target Start/End: Original strand, 2174863 - 2175212
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2174863 cttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 2174962  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||  |    
T  2174963 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2175062  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  2175063 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 2175160  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2175161 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804318
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25804208  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  25804209 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaatt 25804306  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  25804307 cttttgtgttct 25804318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 36402709 - 36402307
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggc-cagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36402709 cagaaacgtatttttgggtgcagatttgttcaaattttaagcga--tacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggg 36402612  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402611 gctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 36402512  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |    
T  36402511 aaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctc-t 36402413  T
Q  748 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||| || | ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36402412 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 36402313  T
Q  848 ctcttc 853  Q
    ||||||    
T  36402312 ctcttc 36402307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 4236571 - 4236922
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4236571 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4236670  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  4236671 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 4236770  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  4236771 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 4236869  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  4236870 ccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttct 4236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 452 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 39398372 - 39397974
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | |||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  39398372 aaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ct 39398274  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39398273 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttggga 39398175  T
Q  650 aacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  39398174 aacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttt 39398076  T
Q  750 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    ||| |||||||  || ||||||| ||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  39398075 tgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttctct 39397976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 38882048 - 38882399
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38882048 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 38882147  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  38882148 tagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 38882247  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  38882248 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 38882345  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |  || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38882346 ctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 536 - 849
Target Start/End: Original strand, 6747290 - 6747600
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6747290 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggtt 6747388  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6747389 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 6747488  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6747489 ttg--atttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 6747586  T
Q  836 cttttgtgttctct 849  Q
    ||||||||||||||    
T  6747587 cttttgtgttctct 6747600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 536 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092178
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16092296  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||   | | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  16092295 ttgagatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaat 16092197  T
Q  835 tcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16092196 tcttttgtgttctctcttc 16092178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 494 - 846
Target Start/End: Original strand, 18596589 - 18596939
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18596589 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgta 18596686  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18596687 tagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 18596786  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  18596787 actttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct 18596885  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  || | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  18596886 cctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 536 - 849
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745364
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 6745251  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6745252 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 6745350  T
Q  836 cttttgtgttctct 849  Q
    ||||||||||||||    
T  6745351 cttttgtgttctct 6745364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 6756436 - 6756792
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6756436 tacttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgta 6756535  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  6756536 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgag 6756635  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  6756636 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatct-tttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctct 6756731  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6756732 cccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctcttc 6756792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189586
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 590  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  591 gtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  691 ggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctc 1189651  T
Q  790 tctcc-ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||| | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189650 tctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1189586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 494 - 848
Target Start/End: Original strand, 16776099 - 16776452
Alignment:
Q  494 tacttttactataaa-tataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16776099 tacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 16776198  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16776199 atagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 16776298  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||    
T  16776299 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatttctc-ttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatct 16776396  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    ||| || | || | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16776397 cccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 16776452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 26097675 - 26098031
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  26097675 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgga 26097774  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |   |||     
T  26097775 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctggg 26097873  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  26097874 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctc 26097971  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |  || | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097972 ctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 26098031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466978
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgg 18466824  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || |||||||    
T  18466825 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctct 18466923  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  18466924 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 18466978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696177
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta-- 695930  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  695931 ---------tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 696020  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  696021 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 696119  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | || |  |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  696120 cccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt 696177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 504 - 853
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954716
Alignment:
Q  504 ataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgt 603  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  604 ctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggt 702  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  703 agaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagt 802  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || | |    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc--tttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaact 2954665  T
Q  803 aggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2954666 aggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2954716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 495 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 31179707 - 31179368
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31179707 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31179608  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31179607 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31179508  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  31179507 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt--catttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 31179410  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    || || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  31179409 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 31545023 - 31545374
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31545023 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31545122  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  31545123 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattggg 31545222  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  31545223 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 31545320  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  31545321 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31545374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477038
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaact 733  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||     
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  734 cattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaa 833  Q
    ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34477149 cattgatttctcttt--gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 34477052  T
Q  834 ttcttttgtgttct 847  Q
    |||| |||||||||    
T  34477051 ttctcttgtgttct 34477038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 18468949 - 18469303
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||   ||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18468949 tacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 18469048  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  18469049 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 18469148  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| || || ||||    
T  18469149 tgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctc 18469247  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||  || | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  18469248 tctcc--cagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttct 18469303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 21684746 - 21684437
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  21684746 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 21684647  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21684646 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 21684547  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21684546 ttg--atttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 21684449  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    | ||||||||||    
T  21684448 cgtttgtgttct 21684437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 27910387 - 27910744
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||| ||||      ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  27910387 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactaggg 27910485  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27910486 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 27910585  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgc 787  Q
      ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||    
T  27910586 gctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgc 27910684  T
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27910685 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 27912472 - 27912830
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27912472 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 27912571  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27912572 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 27912671  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgc 787  Q
      ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  | ||    
T  27912672 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgc 27912770  T
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27912771 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27912830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 31542678 - 31543028
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31542678 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31542777  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31542778 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31542877  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  31542878 actttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattg--atttctctttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 31542974  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  31542975 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31543028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479403
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaact 733  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||     
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  734 cattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaa 833  Q
    ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34479514 cattgatttctcttt--gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 34479417  T
Q  834 ttcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||||    
T  34479416 ttcttttgtgttct 34479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 574 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658335
Alignment:
Q  574 caacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctctt 673  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  674 ggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtg 773  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaacgttactcatcatatagtg 658412  T
Q  774 aaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||| ||| |||||| ||   | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  658411 aaacggatggctgctctcccc---agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 658335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552539
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 15552428  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  15552429 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 15552526  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
    |  ||||||||||    
T  15552527 ttctttgtgttct 15552539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 496 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530731
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat 767  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  34530801 tttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttgctcatcat 34530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 619 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585725
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggaga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  719 cttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccg 818  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctc-ttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 41585758  T
Q  819 aactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 851  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41585757 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 41585725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 495 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 31466314 - 31465968
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||   ||| ||||||||||||||||||     
T  31466314 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtat 31466215  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  31466214 agagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 31466115  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||          ||||| |||||| ||    
T  31466114 ctttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatct-attttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctcacc 31466027  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31466026 cccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattctctcttc 31465968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 496 - 710
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 20043193  T
Q  696 tttgggtagaattag 710  Q
    ||||| |||||||||    
T  20043194 tttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 527 - 852
Target Start/End: Original strand, 21288739 - 21289060
Alignment:
Q  527 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 626  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288739 gtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 21288838  T
Q  627 t------tgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagact 720  Q
    |      |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||  ||||||| |    
T  21288839 tagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagatt 21288937  T
Q  721 tattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaa 820  Q
    | ||||||||||||||          ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||| |||||||    
T  21288938 ttttcttgtaactcatc---------ttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaa 21289028  T
Q  821 ctagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21289029 ctgggtcaacaaattcttttgttttctctctt 21289060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 10586781 - 10587126
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 590  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||| |||    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||         
T  10586781 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag----- 10586875  T
Q  591 gtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
          ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  10586876 ------agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagat 10586969  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    ||   |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  10586970 tgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 10587067  T
Q  790 tct-ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10587068 tctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10587126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 630 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505823
Alignment:
Q  630 agggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgt 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  730 aactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaa 829  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20505942 aacacattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 20505846  T
Q  830 caaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20505845 caaattcttttgtgttctctctt 20505823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 496 - 710
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045168
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  696 tttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||||    
T  20045154 tttgggtagaattag 20045168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 614 - 853
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724193
Alignment:
Q  614 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacg 713  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| ||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  714 ggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttg 813  Q
    || || ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 2724153  T
Q  814 gaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2724154 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2724193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 501 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661181
Alignment:
Q  501 actataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtt 600  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  601 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgg 700  Q
    ||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    |||||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgg 6661317  T
Q  701 gtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcat 799  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||| | | |||||||||||||     
T  6661316 gtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcag 6661218  T
Q  800 agtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6661217 actaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 494 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 26098588 - 26098379
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  26098588 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgta 26098489  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26098488 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattggg 26098389  T
Q  694 gctttgggta 703  Q
    | ||||||||    
T  26098388 gttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 631 - 847
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798341
Alignment:
Q  631 gggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgta 730  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  731 actcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaac 830  Q
    || ||||||  |||| |||| ||| | |||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||| || | || ||||||||||| |||||| | |||||    
T  39798226 acccattgatttctc-ttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaac 39798324  T
Q  831 aaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||||    
T  39798325 aaattcttttgtgttct 39798341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 619 - 847
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410316
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggaga 718  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  719 cttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccg 818  Q
    ||||||||||||||  ||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||| || |||||||||| || | |||||||  ||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 4410287  T
Q  819 aactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4410288 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 517 - 851
Target Start/End: Original strand, 9020187 - 9020518
Alignment:
Q  517 ttgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaac 614  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| |  || |||| |||||| ||||||||||| ||||||   ||||| | |||    
T  9020187 ttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggttt-gggaggcaac-acaaaagtagggtttgtatagagtt--gctcttggcaac 9020282  T
Q  615 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgg 714  Q
    |||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9020283 aaacactagggttgaa--gttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgg 9020380  T
Q  715 gagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtc-aattt 812  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||  || | ||||||   |||    
T  9020381 aagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgtttt 9020479  T
Q  813 ggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 851  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9020480 ggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttctctct 9020518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208874
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tag 36208620  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||| || |||||  |    | | |||||||||   |  |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  36208621 agagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgaga 36208717  T
Q  695 ctttgggtagaattagacggg-agacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
    ||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |    
T  36208718 ctttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctcttt 36208816  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  36208817 ccc-catactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgt-ttctctctt 36208874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 648 - 839
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749986
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttct 10749893  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttt 839  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10749894 ctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10749986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 494 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20507799 - 20507659
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  20507799 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgta 20507700  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 634  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20507699 tagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960117
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  38960215 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 38960118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354560
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15354658 tt--gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 15354561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 539 - 852
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054136
Alignment:
Q  539 atagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 638  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||| |||| || | |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaagg-caacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  639 tcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattg 738  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||  ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  739 acatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaattc 836  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||   | |||||||||    
T  20054022 atatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattc 20054120  T
Q  837 ttttgtgttctctctt 852  Q
    ||||||||||||||||    
T  20054121 ttttgtgttctctctt 20054136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665337
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  23665239 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 23665336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793250
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  23793348 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 23793251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373122
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattga-gtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttct 3373223  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
     |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  3373222 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 3373123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 648 - 839
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757462
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttt 839  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  10757372 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattcttt 10757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356836
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||| |  | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15356934 tt--gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 15356837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 665 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 23742023 - 23741844
Alignment:
Q  665 gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcat 764  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  23742023 gagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt--gtaacgttactcat 23741927  T
Q  765 catatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || |||||| | |||||||| ||||||| || || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  23741926 caaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23741844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 494 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 41586043 - 41585946
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  41586043 tacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 463 - 720
Target Start/End: Original strand, 42770685 - 42770934
Alignment:
Q  463 tgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggt 561  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42770685 tgggccagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggt 42770783  T
Q  562 ttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataagg 661  Q
    || | ||| |||| |||||| || ||||| || ||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||    
T  42770784 tt-ggaaggcaac-acaaaatta-ggtttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttcattcaccatgggaa--actattagg 42770875  T
Q  662 attgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagact 720  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42770876 actgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 552 - 821
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413176
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    |||||||||||||||| | || ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaagg-cagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttt 750  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||| |||||||||| |   | | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  17413347 cactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctc-tttt 17413249  T
Q  751 gtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaac 821  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||    
T  17413248 gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 747 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 26098374 - 26098267
Alignment:
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct-ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  26098374 ttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttatgtt 26098275  T
Q  846 ctctcttc 853  Q
    ||||||||    
T  26098274 ctctcttc 26098267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 493 - 592
Target Start/End: Original strand, 4409998 - 4410101
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggt 588  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4409998 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 4410097  T
Q  589 ttgt 592  Q
    ||||    
T  4410098 ttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 552 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144596
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttgg-ga 649  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||| ||    
T  2144840 aaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggaga 2144747  T
Q  650 aacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt--ggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |   | ||||| ||||||||||| | ||   || |||    
T  2144746 aacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcagga-ctttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaac-cttttttatatct 2144649  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctca 798  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2144648 ctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctca 2144596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 634 - 779
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143693
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  733 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgg 779  Q
     | |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15143647 cctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg 15143693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 449 - 546
Target Start/End: Original strand, 2723863 - 2723961
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 546  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |  | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2723863 cagaaacgtattttcgggcctagatttgttccaagtttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 678 - 768
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  678 acgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcata 768  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 710
Target Start/End: Original strand, 4754159 - 4754311
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||    
T  4754159 aaacaagggttta-aaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaa 4754252  T
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||| || |||||| |||||||| || |||||||||||   |||||| |||||||||    
T  4754253 cactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattag 4754311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 769 - 852
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043289
Alignment:
Q  769 tagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 20043289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 706
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748502
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaa 650  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||| |||    
T  29748352 aaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaa 29748445  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ggagctttgggtagaa 706  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  29748446 acactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 634 - 847
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430476
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgta 730  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||   ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 35430358  T
Q  731 actc-attgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatc 827  Q
    | ||  |||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||  || ||||| | | ||||||||| | |||||| ||||| |||     
T  35430359 attcttttgatatctc--tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaaagctcctatctcctttagagtaggtcagtattggactgaactggata 35430456  T
Q  828 aacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  35430457 aacaaattctcttgtgttct 35430476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 659 - 808
Target Start/End: Original strand, 4897835 - 4897985
Alignment:
Q  659 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagac-gggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgt 757  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||   |||| ||||| | |||||| ||    
T  4897835 aggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctc-tattgtaaagt 4897933  T
Q  758 tactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca 808  Q
    ||||||||| ||||| | ||| | |||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  4897934 tactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtca 4897985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782579
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgg-gaattgggtagaattag 31782579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033711
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagatt 34033711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170849
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 1170849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298145
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2298145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 691
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627406
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 10627406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 603 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224890
Alignment:
Q  603 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttgg 700  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  | | |||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgg 15224900  T
Q  701 gtagaattag 710  Q
    ||| ||||||    
T  15224899 gtaaaattag 15224890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 648 - 836
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667601
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||| | ||||||||||  ||||||  |||||||| ||  | || ||| |||| ||| |||||  || |||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaac-tatgcttgcaacccattg--atttct 23667511  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattc 836  Q
     |||||||||| |||||||| ||| || | |||||||| ||||||| || || | |||| ||  |||||||||||| |  ||||||||||    
T  23667512 ctttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385596
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35385596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 120)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 258 - 853
Target Start/End: Original strand, 16453070 - 16453664
Alignment:
Q  258 ggtgttgcagaagtgactcaatattggagtttgaagtgcaaaatcatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttctggagttcggggcccgat 357  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16453070 ggtgttgtggaagtgattcaaaattggagtttggagtgcaaaaccatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcctgatttatggagttcggggcccgat 16453169  T
Q  358 tttggctgcgtttgggaggcttcttgttctgg-aaaaatcggcgcccgatttggtaaattcggggcctgattttgcgtaacagnnnnnnnnncagaaaca 456  Q
    ||||||||| | | | ||   | |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||         ||||||||    
T  16453170 tttggctgcctgttgaagcagt-ttgttgcgacaaaaatcggcgcccgatttggtaaatttggggcccgattttgcttgacagttttttt--cagaaaca 16453266  T
Q  457 tatttt-tgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaac 555  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16453267 tattttttgggccaaatttgttacaattttatgggagttacttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaac 16453366  T
Q  556 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 655  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453367 aagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 16453466  T
Q  656 ataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaac 755  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||     
T  16453467 attaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaag 16453565  T
Q  756 gttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| || | |||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16453566 gttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctcttc 16453664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 452 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 38928557 - 38928156
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggccagattt-gttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | | | |||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  38928557 aaacgtatttttgggcctgattttgttccaattt-atgagggattcttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggct 38928459  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 649  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928458 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 38928359  T
Q  650 aacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38928358 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctc-ttt 38928260  T
Q  750 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38928259 tgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 38928160  T
Q  850 cttc 853  Q
    ||||    
T  38928159 cttc 38928156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096236
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  596 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag 19096079  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19096080 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctcc 19096178  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | || | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19096179 cccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 19096236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 48486315 - 48486673
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  48486315 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 48486414  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48486415 tagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 48486514  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  48486515 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 48486613  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48486614 ccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgttttctcttc 48486673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 450 - 853
Target Start/End: Original strand, 36378244 - 36378647
Alignment:
Q  450 agaaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggc 549  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  36378244 agaaacgtatttttgggccagatttgttacaattttatgagggttacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggc 36378343  T
Q  550 tgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 649  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  36378344 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaa 36378443  T
Q  650 aacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  36378444 aacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-tct 36378542  T
Q  750 tgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||    
T  36378543 tgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctc 36378642  T
Q  849 tcttc 853  Q
    |||||    
T  36378643 tcttc 36378647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 40091752 - 40091394
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  40091752 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtt 40091653  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  40091652 tagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 40091553  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40091552 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 40091454  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091453 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 40091394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 497 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415467
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33415721 agtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 33415623  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33415622 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccct 33415524  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33415523 caggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttc 33415467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 493 - 853
Target Start/End: Original strand, 40637069 - 40637428
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40637069 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 40637168  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  40637169 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattga 40637268  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  40637269 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctct 40637367  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637368 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 40637428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 22801199 - 22800841
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22801199 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 22801100  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||      
T  22801099 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgag 22801000  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  22800999 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctc 22800901  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800900 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22800841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 24878985 - 24879344
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878985 tacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 24879084  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24879085 tagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 24879184  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24879185 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 24879284  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24879285 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 24879344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 22803071 - 22802713
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22803071 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 22802972  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  22802971 tagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 22802872  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||    
T  22802871 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctc 22802773  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22802772 ccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 22802713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 24880447 - 24880806
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24880447 tacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 24880546  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24880547 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 24880646  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24880647 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 24880746  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24880747 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 24880806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 24888792 - 24889150
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24888792 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgta 24888891  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  24888892 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactagg 24888991  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24888992 actttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctc 24889090  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24889091 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 24889150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 493 - 847
Target Start/End: Original strand, 14633315 - 14633666
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14633315 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt 14633413  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14633414 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgg 14633512  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14633513 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 14633611  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14633612 ccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14633666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 449 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22044771 - 22044376
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggccagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  22044771 cagaaacatatttttagtgcagatttgttccaaattttaagcga--tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggg 22044674  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22044673 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgg 22044574  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  || |||     
T  22044573 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattg--atttctc 22044476  T
Q  748 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22044475 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22044376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 449 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22047066 - 22046671
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggccagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||| | ||||||||||||    
T  22047066 cagaaacatatttttagtgcagatttgttccaaattttaagcga--tacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggg 22046969  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22046968 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 22046869  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||     
T  22046868 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctc 22046771  T
Q  748 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22046770 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22046671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395824
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12395981  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12395980 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccc 12395882  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     || | ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12395881 ccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttc 12395824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 497 - 822
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030764
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagct 56030642  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||     
T  56030643 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttc-ttttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccc 56030738  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaact 822  Q
     | | |||||||||||||||||||||    
T  56030739 tagactaggtcaatttggaccgaact 56030764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 5198416 - 5198768
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5198416 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgta 5198515  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  5198516 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggg 5198615  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  5198616 gctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 5198714  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  5198715 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 5198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400786
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12400943  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12400942 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccc 12400844  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     || | ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12400843 ccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttc 12400786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 47274723 - 47275073
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47274723 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 47274822  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  47274823 ta-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctggg 47274921  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47274922 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 47275020  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  47275021 cc-cagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 47275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 9148247 - 9148600
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9148247 tacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttg 9148346  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9148347 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 9148446  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9148447 ggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 9148544  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9148545 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9148600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 8631714 - 8631404
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8631714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 8631615  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8631614 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 8631515  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8631514 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 8631416  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  8631415 cttttgtgttct 8631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 37089710 - 37089357
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacct---tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37089710 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 37089611  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  37089610 tatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctg 37089511  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  37089510 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 37089413  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37089412 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 37089357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 51015242 - 51015593
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51015242 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 51015341  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  51015342 tagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 51015441  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  51015442 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctc 51015539  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51015540 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 24348210 - 24348566
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||   ||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24348210 tacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtt 24348309  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  24348310 tgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 24348409  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  24348410 tgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 24348508  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24348509 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24348566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 493 - 845
Target Start/End: Original strand, 47868396 - 47868747
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47868396 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 47868495  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  47868496 atagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 47868595  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  47868596 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctct 47868694  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47868695 cccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgtt 47868747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 494 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 619784 - 619428
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  619784 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgca 619685  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||     
T  619684 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattggg 619585  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  619584 tctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctc 619486  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  619485 cc-ctaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt 619428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 11434952 - 11435302
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11434952 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11435051  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  | |      
T  11435052 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctagga 11435151  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11435152 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 11435249  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11435250 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 36921832 - 36921472
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36921832 tacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 36921734  T
Q  592 taaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36921733 tatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 36921634  T
Q  691 ggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctct 790  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  36921633 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 36921535  T
Q  791 ctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||| || | ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921534 ctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 36921472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 494 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 14787770 - 14787423
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||   ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14787770 tacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 14787671  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787670 tatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 14787571  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc--cgctc 789  Q
       |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  14787570 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 14787472  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctt 838  Q
    |||||| || | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  14787471 tctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 14787423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 497 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313047
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  37313200 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccc 37313102  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
     || | || ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37313101 ccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttctctc 37313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 36919924 - 36919563
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttga--gatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36919924 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 36919825  T
Q  592 taaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
     | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36919824 gataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 36919725  T
Q  691 ggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctct 790  Q
    ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||| |||||    
T  36919724 gggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctct 36919626  T
Q  791 ctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919625 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 36919563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 493 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 2485211 - 2484858
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2485211 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 2485112  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2485111 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 2485012  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
    |  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  2485011 ggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 2484914  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2484913 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttct 2484858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 493 - 847
Target Start/End: Original strand, 6764834 - 6765192
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6764834 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6764933  T
Q  593 aaagagtttgtctcttt-----ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    | |||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6764934 atagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagag 6765033  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgc 787  Q
      |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||    
T  6765034 gctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgc 6765132  T
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6765133 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6765192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 18847150 - 18847500
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18847150 acttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 18847249  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18847250 agagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattggg 18847349  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  18847350 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 18847447  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18847448 cc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 11006532 - 11006222
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11006532 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11006433  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11006432 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11006333  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11006332 attg--atttctctttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaat 11006235  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||    
T  11006234 tcttttgtgttct 11006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 38409195 - 38409552
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||      |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38409195 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactaggg 38409294  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409295 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 38409394  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgc 787  Q
      |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  38409395 gctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgc 38409492  T
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  38409493 tctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttct 38409552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 31849936 - 31849584
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31849936 tacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 31849837  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacact-agggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||     
T  31849836 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctga 31849737  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31849736 gactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 31849639  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31849638 cccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31849584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 17662575 - 17662224
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17662575 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 17662476  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||           ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17662475 tgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagac 17662387  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  17662386 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 17662288  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662287 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17662224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 564 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 26086243 - 26085962
Alignment:
Q  564 agaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggat 663  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26086243 agaaaaacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 26086144  T
Q  664 tgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactca 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   | ||| ||||||||| ||||||    
T  26086143 tgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--ttttctctttgtaacgatactca 26086046  T
Q  764 tcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||| | |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  26086045 tcatatagtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 26085962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 11008861 - 11008553
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11008861 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 11008762  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11008761 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11008662  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    |||||    | | ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11008661 attga----tttctttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 11008566  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||    
T  11008565 tcttttgtgttct 11008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 44600175 - 44599823
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44600175 tacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 44600076  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600075 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 44599976  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  44599975 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 44599878  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||   ||||||||||    
T  44599877 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 44599823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 7941316 - 7941671
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7941316 acttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 7941415  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaa--cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    | ||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  7941416 atagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct 7941515  T
Q  691 ggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctct 790  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  7941516 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 7941614  T
Q  791 ctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7941615 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7941671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 502 - 852
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323048
Alignment:
Q  502 ctataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagttt 601  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  602 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggg 701  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T
Q  702 tagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcata 800  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| || |    
T  19322897 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccaga 19322995  T
Q  801 gtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
     |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19322996 ctaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttctctctt 19323048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 449 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 9174528 - 9174131
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggc-cagatttgttacaatttt-atgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 546  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | |  ||  |||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| | |||||||||||    
T  9174528 cagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagtttttaagcaag--acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagaggg 9174431  T
Q  547 ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  9174430 ggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttg 9174331  T
Q  647 ggaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctc 745  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  9174330 ggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattg--atttc 9174233  T
Q  746 tttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| | ||||| || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||    
T  9174232 tctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgtt 9174133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 16934479 - 16934128
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  16934479 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16934380  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  16934379 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 16934280  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  16934279 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 16934182  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  16934181 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16934128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 500 - 835
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997828
Alignment:
Q  500 tactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagt 599  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  600 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttg 699  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    ||||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttg 41997693  T
Q  700 ggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggccgctctctccctca 798  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41997694 ggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctc-ttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctccc-ca 41997791  T
Q  799 tagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
     | ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41997792 gactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 498 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 9176807 - 9176461
Alignment:
Q  498 tttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaaga 597  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||  | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  9176807 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaa 9176708  T
Q  598 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  9176707 gtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagact 9176608  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||     
T  9176607 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 9176510  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaactaga-tcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  9176509 cagactaggtcaatttggaccgaac-agagtcaacaaatttctttgtgtt 9176461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 497 - 781
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544241
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  592 taaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  691 ggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggag 781  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13544152 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggag 13544241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782723
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22782834  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22782833 attg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaat 22782736  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
       ||||||||||    
T  22782735 atctttgtgttct 22782723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709149
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 18709259  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  18709258 ttg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 18709161  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
      ||||||||||    
T  18709160 tctttgtgttct 18709149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 536 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 22132684 - 22132389
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  22132684 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggtt 22132587  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22132586 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22132487  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22132486 ttg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 494 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 5637806 - 5637524
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| || | |||| ||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5637806 tacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 5637707  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  5637706 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 5637607  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtg 773  Q
    |||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5637606 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 16932125 - 16931774
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  16932125 acttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16932026  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  16932025 agagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgag 16931926  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  16931925 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 16931828  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  16931827 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16931774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780358
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22780469  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  22780468 attg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22780371  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
       ||||||||||    
T  22780370 atctttgtgttct 22780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 536 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 3824863 - 3824629
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3824863 gagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggtt 3824766  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3824765 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3824666  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtg 773  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3824665 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtg 3824629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 536 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134615
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22134712  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22134711 ttg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 496 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409364
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||   |    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  18409482 ttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctcc 18409385  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttgga 815  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  18409384 ctcagactaggtcaatttgga 18409364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537454
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||     
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||       
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 18537612  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18537611 cttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 18537513  T
Q  794 cctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    || |||| |||||||  ||| ||||||||| | | |||||||| || || ||||||||||    
T  18537512 ccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgcgttctctctt 18537454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 574 - 853
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380704
Alignment:
Q  574 caacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctctt 673  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  674 ggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagt 772  Q
    |||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatc-ttttgtaaagttactcatcattatagt 36380623  T
Q  773 gaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | ||| ||| || |||||||||| || | |||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  36380624 ggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttc 36380704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 494 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 47211083 - 47210762
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47211083 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 47210984  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |            |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47210983 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagag 47210896  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgc 787  Q
      |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  47210895 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgc 47210797  T
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaact 822  Q
    |||||||| || | ||| |||||||||||||||||    
T  47210796 tctctcccccaaactagatcaatttggaccgaact 47210762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 496 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattct 726  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3937344 tttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 53405123 - 53405481
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 590  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||| |||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53405123 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 53405222  T
Q  591 gtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  53405223 gtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggct 53405321  T
Q  691 ggagctttgggtagaattagacgggaga------cttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc 784  Q
    |   |||| ||||||||||  |||||||      |||||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  53405322 gagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagc 53405420  T
Q  785 cgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
     |  ||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53405421 tg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttct 53405481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 611 - 850
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455591
Alignment:
Q  611 gaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  711 acgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaa 809  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||| || | ||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaa 16455552  T
Q  810 tttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||    
T  16455553 tttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 16455591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 496 - 716
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  696 tttgggtagaattagacggga 716  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  6133070 tttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 494 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 8756587 - 8756289
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||| |||||    
T  8756587 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttgt 8756489  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctctt-ggttacgggaagagattg 691  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8756488 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattg 8756392  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctct 790  Q
       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||  |||||    
T  8756391 agactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctct 8756293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 494 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 52942784 - 52942541
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtat--cagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||  |||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52942784 tactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 52942686  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||             
T  52942685 tatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg--------- 52942595  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  52942594 ----tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 52942541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 646 - 853
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547508
Alignment:
Q  646 gggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctc 745  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  746 tttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  13547402 -ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgtt 13547500  T
Q  846 ctctcttc 853  Q
    ||||||||    
T  13547501 ctctcttc 13547508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 581 - 853
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499396
Alignment:
Q  581 actagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacg 680  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  681 ggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgg 779  Q
      |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    | | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||     
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaac---ctaatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatattgaaacga 27499323  T
Q  780 agggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499324 agggctgctctttccc-cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27499396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 449 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 38270369 - 38270160
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  38270369 cagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagag 38270270  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270269 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 38270170  T
Q  648 gaaacactat 657  Q
     |||||||||    
T  38270169 aaaacactat 38270160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 522 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 18535138 - 18534915
Alignment:
Q  522 tcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacac 620  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  18535138 tcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacac 18535042  T
Q  621 tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagact 720  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||    
T  18535041 tagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 18534944  T
Q  721 tattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18534943 tattcttgtaacccattgatatctctttt 18534915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 496 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446758
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||| |    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 24446820  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 657  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 24446758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 640 - 853
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891646
Alignment:
Q  640 caccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattga 739  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  740 catctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctt 838  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | | |||||||||| || | |||  ||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  2891533 tatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2891631  T
Q  839 ttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||||||||||    
T  2891632 ttgtgttctctcttc 2891646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 469 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 15032898 - 15032555
Alignment:
Q  469 agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 568  Q
    ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||   | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15032898 agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttag-aa 15032800  T
Q  569 gacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagt 668  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||          ||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  15032799 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tga-ggttgattcatatttggaaacactattaggattgagt 15032712  T
Q  669 ctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-t 767  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  15032711 ctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatt 15032613  T
Q  768 atagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactag 824  Q
    | |||| |||| || || |||||||||| || | ||||||| | ||||||||||||||    
T  15032612 acagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtcagtattggaccgaactag 15032555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 260 - 567
Target Start/End: Original strand, 16455049 - 16455356
Alignment:
Q  260 tgttgcagaagtgactcaatattggagtttgaagtgcaaaatcatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttctggagttcggggcccgattt 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16455049 tgttgtagaagtgactcaatatttgagtttggagtgcaaaatcatgtttgctggaagaccgaaaatcggcgcccgatctatggagttcgaggcccgattt 16455148  T
Q  360 tggctgcgtttgggaggcttcttgtt-ctggaaaaatcggcgcccgatttggtaaattcggggcctgattttgcgtaacagnnnnnnnnncagaaacat- 457  Q
    ||||||| | | ||| ||   ||||| |   |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||         |||||| ||     
T  16455149 tggctgcatgttgga-gcagtttgttgcgacaaaaatcgacacccaatttggtaaatgcggggcccaattttgcatgacag-ttttttttcagaaatata 16455246  T
Q  458 atttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16455247 atttttgggccagatttgttacaatttaatggtagttacttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaa 16455346  T
Q  558 gggtttagaa 567  Q
    ||||||||||    
T  16455347 gggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 578 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890205
Alignment:
Q  578 aaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggtt 677  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  678 acgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaa 776  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 38890281  T
Q  777 cggagggccgctctctccctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | |||||| ||||||||||  | | |||||||  ||||||||||||| | | |||||||| |  |||||||||||||    
T  38890280 cagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 38890205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 586 - 852
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136903
Alignment:
Q  586 ggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaag 685  Q
    |||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  686 agattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggc 784  Q
    | ||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctc-ttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggc 30136835  T
Q  785 cgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
     |||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30136836 tgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctctt 30136903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 675 - 849
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215656
Alignment:
Q  675 gttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtga 774  Q
    ||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaacgttactcatcatatagtgg 4215581  T
Q  775 aacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    |||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4215582 aacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 4215656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 494 - 634
Target Start/End: Original strand, 5100993 - 5101133
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5100993 tacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 5101092  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 634  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101093 tagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 469 - 835
Target Start/End: Original strand, 12102061 - 12102425
Alignment:
Q  469 agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttaga 566  Q
    ||||||||| ||||||| | ||  || |||||||||||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12102061 agatttgttccaattttttagggatttcttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttaga 12102160  T
Q  567 aagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattga 666  Q
    || | ||||||||| ||||||||| || |||| || |||||  |    | | |||||||||   |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12102161 aaca-aacaacaaa-ctagggttt-tagagagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacactattaggattga 12102254  T
Q  667 gtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc 765  Q
    || ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  12102255 gtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccactgatatctc-ttttgtaaagttactcatc 12102353  T
Q  766 a-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  12102354 attatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 695 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 5635612 - 5635461
Alignment:
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  5635612 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 5635514  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5635513 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 496 - 615
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891434
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgta-tcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  595 agagtttgtctctttggaaca 615  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 695 - 847
Target Start/End: Original strand, 11437560 - 11437710
Alignment:
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11437560 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt--gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 11437657  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11437658 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 699 - 851
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101280
Alignment:
Q  699 gggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctca 798  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtctttt-gtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctccc-ca 5101227  T
Q  799 tagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 851  Q
     | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5101228 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 5101280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 497 - 781
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28453965
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgca- 28453782  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
     ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  28453783 -gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggag 781  Q
    | ||||||||||||||   | ||||| ||||||||||    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 28453965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 637 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982156
Alignment:
Q  637 attcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaact 733  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  734 cattgacatctctttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaaca 831  Q
    | |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || | ||||    
T  3982274 ctttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaacaaggtaaaca 3982176  T
Q  832 aattcttttgtgttctctct 851  Q
    | || |  ||||||||||||    
T  3982175 atttttcatgtgttctctct 3982156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 503 - 711
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113081
Alignment:
Q  503 tataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtt 600  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  601 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttac-gggaagagattggagctttg 699  Q
    || ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||    
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttg 10113069  T
Q  700 ggtagaattaga 711  Q
    ||||||||||||    
T  10113070 ggtagaattaga 10113081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 746 - 853
Target Start/End: Original strand, 47563008 - 47563115
Alignment:
Q  746 tttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47563008 tttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 47563107  T
Q  846 ctctcttc 853  Q
    ||||||||    
T  47563108 ctctcttc 47563115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 541
Target Start/End: Original strand, 36380326 - 36380417
Alignment:
Q  450 agaaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagata 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||    
T  36380326 agaaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgagggttacttttactataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagata 36380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 502 - 795
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9864006
Alignment:
Q  502 ctataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatag-agggggctgaaa--caagggtttagaaagacaacaacaaaa-ctagggtttgtaaaga 597  Q
    ||||||||||||   |||||||||   |||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  ||    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttagaa-gccaaaaacaaaaactagggtttgta--ga 9863808  T
Q  598 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctt 697  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||    
T  9863809 gtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactt 9863905  T
Q  698 tgggtagaatt-agacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca----tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
    ||||||||||| ||   | ||||| |||||||||||   |||| |||||  ||||||| |||||||||||    ||||||| ||||||| || |||||||    
T  9863906 tgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc--tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctct 9864003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 469 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 16186199 - 16185815
Alignment:
Q  469 agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaa 567  Q
    ||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16186199 agatttgttccaattttaggagggatacttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaa 16186100  T
Q  568 agacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg---agggttgattcaccttg--ggaaacactataagga 662  Q
    | | |||||| |||||||||||  || |||| || |||||  |    | |||||| |||| |    |  |||||||||||||    ||||||| | ||||    
T  16186099 aca-aacaac-aaactagggtt--tagagagatt-tctctaagcgggagacactaaggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttagga 16186005  T
Q  663 ttgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttact 761  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |   | ||||||||||||| ||| | |||| || ||  ||||||| ||||||    
T  16186004 ttgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc--tttgtaaagttact 16185907  T
Q  762 catca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| || | |||||||  ||||||||||||| | | |||||||| |  |||||||||||||    
T  16185906 catcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 16185815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 457 - 853
Target Start/End: Original strand, 25357595 - 25357997
Alignment:
Q  457 tatttttgggc-cagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagag-----ggggct 550  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||||     ||||||    
T  25357595 tatttttgggctcagatttgttccaattttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggct 25357694  T
Q  551 gaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttggg 648  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  | ||| ||| |||   ||| | |  |||||||||| |||   |||||||||||||||    
T  25357695 gaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttagagaga-tttctctaagtgggaga--cactagggttgtga---ttgattcaccttggg 25357786  T
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgg----gtagaatt-agacgggagacttattcttgtaactcattgacatc 743  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||     ||||||| ||   | ||||||||||||||||| | |||| |||    
T  25357787 aaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatc 25357886  T
Q  744 tctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacaaattcttttg 841  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  || ||||||||||  | | ||||||| | ||||||| |||| | | |||||||| || ||    
T  25357887 tc-ttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaatttttgtg 25357985  T
Q  842 tgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||    
T  25357986 tgttctctcttc 25357997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 633 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  633 gttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaa 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||| |   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  732 ctcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    | | |||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatct-tttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 40999286 - 40999072
Alignment:
Q  492 gttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 590  Q
    |||| ||||||||||||||||    || |||||| |||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||    
T  40999286 gttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagac-gtcaacaagaaaactaggggtt 40999189  T
Q  591 gtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||| |||||||| |||||   ||||||||||||| || |||  ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  40999188 gtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatc 40999092  T
Q  691 ggagctttgggtagaattag 710  Q
    |   ||||||||||||||||    
T  40999091 gagactttgggtagaattag 40999072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 720 - 839
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  720 ttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct-ccctcatagtaggtcaatttggaccg 818  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |  |||||| ||| || | ||||||||||||| |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  819 aactagatcaacaaattcttt 839  Q
    |||| | ||||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 718 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446633
Alignment:
Q  718 acttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggacc 817  Q
    ||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             |||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctctttt-gtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggacc 24446669  T
Q  818 gaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446668 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 24446633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 552 - 806
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022613
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaa 650  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaa-ctc-attgacatctctt 747  Q
    ||| ||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| |   | ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||      
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctc-- 9022553  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggt 806  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  9022554 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccccatattaggt 9022613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 634 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150976
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||    |||||||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  733 tcattgacatctctttt 749  Q
     | |||| |||||||||    
T  47150992 cctttgatatctctttt 47150976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 691
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114520
Alignment:
Q  578 aaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggtt 677  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtc 10114506  T
Q  678 acgggaagagattg 691  Q
    |||  |||||||||    
T  10114507 acgataagagattg 10114520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 802 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 52942518 - 52942467
Alignment:
Q  802 taggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942518 taggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 52942467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 790 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 3937316 - 3937254
Alignment:
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3937316 tctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctctt 3937254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 767 - 853
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133191
Alignment:
Q  767 tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||| |||||| | | |||||||| | || | |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6133191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 767 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 14789495 - 14789422
Alignment:
Q  767 tatagtgaaacggagggccgctctctc--cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctt 838  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  || || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14789495 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336764
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||  |  | | |||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgg-gacttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    | |  || |  | |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  5336865 tgt-aaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgtt 5336767  T
Q  846 ctc 848  Q
    |||    
T  5336766 ctc 5336764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 627
Target Start/End: Original strand, 54906631 - 54906702
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 627  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||    
T  54906631 aaacaagggcttagaa-gccaacaataaaactagggtttgtaaag---ttttctctttgcaacaaacactagggtt 54906702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 748
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906839
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgta 730  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||  || |||| |||||||||| |   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  731 actcattgacatctcttt 748  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  54906822 actctttgatatctcttt 54906839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 788 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 37229765 - 37229729
Alignment:
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactag 824  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37229765 tctctccctcatagtaggtcaagttggaccgaactag 37229729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050401
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7050401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853587
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 11853587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 652 - 710
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489409
Alignment:
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgg-gacttgggtagaattag 16489409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 652 - 710
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699809
Alignment:
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattag 25699809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 151
Target Start/End: Original strand, 36363642 - 36363684
Alignment:
Q  109 ctacataaaacttaccaattatttctattttaaaaaccttaac 151  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  36363642 ctacataaatcttaccaattatttctattttagaatccttaac 36363684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 652 - 710
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566553
Alignment:
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagactgga-atttgggtagaattag 47566553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822303
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 55822303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 812 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824593
Alignment:
Q  812 tggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 3824593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570154
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgg-gacttgggtagaattag 4570154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 142
Target Start/End: Original strand, 13215495 - 13215528
Alignment:
Q  109 ctacataaaacttaccaattatttctattttaaa 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13215495 ctacataaaatttaccaattatttctattttaaa 13215528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23884741 - 23884676
Alignment:
Q  115 aaaacttaccaattatttctattttaaaaaccttaacaagtatctaaaagatacttgttatcaaga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||  ||||  |||||||| |||||    
T  23884741 aaaacttaccaattatttctattttaaaatctttaactagtgtcctaaaggcacttgttaacaaga 23884676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 316
Target Start/End: Original strand, 36378063 - 36378112
Alignment:
Q  268 aagtgactcaatattggagtttgaagtg-caaaatcatgtttgctggaag 316  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  36378063 aagtgactcaaaattggagtttgaagtgtcaaattgatgtttgctggaag 36378112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 107)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 268 - 853
Target Start/End: Original strand, 6756245 - 6756828
Alignment:
Q  268 aagtgactcaatattggagtttgaagtgcaaaatcatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttctggagttcggggcccgattttggctgcg 367  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |     
T  6756245 aagtgactcaaaattggagtttggagtgcaaaattatatttgctggaagacccaaaatcgacgtccgatttgtggagttcggggaccgattttggctact 6756344  T
Q  368 tttgggaggcttcttgttctgg-aaaaatcggcgcccgatttggtaaattcggggcctgattttgcgtaacagnnnnnnnnncagaaacatatttttggg 466  Q
    | | ||||   | ||||| ||  |||||||||||||||| | |   ||||||||||| ||||||||||  |||         ||||||||||||||||||    
T  6756345 tgttggagcagt-ttgttgtgacaaaaatcggcgcccgaatagaggaattcggggcccgattttgcgtg-cagtatttttt-cagaaacatatttttggg 6756441  T
Q  467 ccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6756442 ccagatttgttacaattttatgagagttacttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttaga 6756541  T
Q  567 aagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattg 665  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6756542 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6756641  T
Q  666 agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc 765  Q
    ||  ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  6756642 ag--tcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctc-ttttgtaaagttactcatc 6756738  T
Q  766 a-tatagtgaaacggagggccgctctct-ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | |||||||||||||| | | ||||||| ||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6756739 attatagtgaaacggaagactgctctctccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctcttc 6756828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 390 - 853
Target Start/End: Original strand, 18306945 - 18307409
Alignment:
Q  390 aaaaatcggcgcccgatttggtaaattcggggcctgattttgcgtaacagnnnnnnnnn--cagaaacatatttttgggccagatttgttacaattttat 487  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||            || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18306945 aaaaatcggcgtccgatttggtaaatttggagcctgattttgcataacaactttttttcttcaaaaacatatttttggaccagctttgttacaattttat 18307044  T
Q  488 gggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18307045 gggagctatttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 18307144  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307145 tttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 18307244  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccg 786  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  18307245 attggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctg 18307343  T
Q  787 ctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307344 ctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 18307409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 449 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 9241470 - 9241067
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg 548  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9241470 cagaaacgtatttttgggtcagatttgttccaattttatgggggttacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg 9241371  T
Q  549 -ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241370 gctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 9241272  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9241271 aaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-t 9241173  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||    
T  9241172 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttc 9241073  T
Q  847 tctctt 852  Q
    ||||||    
T  9241072 tctctt 9241067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307527
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  596 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 50307685  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50307684 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 50307586  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattc-ttttgtgttctctctt 852  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50307585 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttctctctt 50307527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 493 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 12302850 - 12302486
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12302850 ttacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactaggg 12302751  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302750 tttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 12302651  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgc 787  Q
    |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12302650 attgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc 12302552  T
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302551 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 12302486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 6996039 - 6995681
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||| |||||||||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6996039 tacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6995940  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6995939 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 6995840  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6995839 gctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 6995741  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6995740 ctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6995681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 17324975 - 17324617
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| | ||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  17324975 tacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgta 17324876  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17324875 tagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 17324776  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17324775 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 17324677  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324676 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17324617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457456
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||  |||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattggggg 11457613  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  11457612 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctccc 11457514  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457513 ccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 11457456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 2949570 - 2949213
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2949570 tacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 2949471  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  2949470 tagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggg 2949371  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2949370 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 2949272  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949271 cc-ccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2949213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 14098309 - 14097950
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14098309 tactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgta 14098210  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14098209 tagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattaga 14098110  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14098109 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 14098010  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098009 ccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14097950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 41646862 - 41647220
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41646862 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 41646961  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  41646962 tagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcg 41647061  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41647062 actttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 41647160  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | ||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41647161 catcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 41647220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 452 - 853
Target Start/End: Original strand, 16428553 - 16428954
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg 551  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||  | | |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  16428553 aaacgtattttcgagccagatttgttcgaattttataagggatacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctg 16428652  T
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16428653 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaa 16428752  T
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttg 751  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16428753 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttg 16428851  T
Q  752 taacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16428852 taaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 16428951  T
Q  851 ttc 853  Q
    |||    
T  16428952 ttc 16428954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 494 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 28998592 - 28998235
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28998592 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 28998493  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  28998492 tagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 28998393  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||    
T  28998392 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctc 28998294  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28998293 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 28998235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 494 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 29004308 - 29003951
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29004308 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 29004209  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29004208 tagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 29004109  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||    
T  29004108 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctc 29004010  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29004009 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 29003951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 28207405 - 28207049
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28207405 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtg 28207306  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  28207305 taaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggg 28207206  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||||  || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28207205 gctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctc 28207109  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207108 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 28207049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 38925817 - 38925462
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38925817 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 38925718  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38925717 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 38925618  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38925617 actttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctctctc 38925521  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925520 cc-cagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 38925462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 51749982 - 51750333
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  51749982 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51750081  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||      
T  51750082 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 51750181  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  51750182 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 51750280  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51750281 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51750333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Original strand, 18839483 - 18839888
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||| |  | | ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  18839483 cagaaacgtattttcgggcctagatttgttatagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggg 18839582  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  18839583 gctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgg 18839682  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  18839683 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-t 18839781  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  18839782 tttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttc 18839881  T
Q  847 tctcttc 853  Q
    |||||||    
T  18839882 tctcttc 18839888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 47906206 - 47906570
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  47906206 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatgg 47906305  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906306 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 47906405  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgc 787  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  47906406 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 47906504  T
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||| || | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906505 tctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 47906570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 10400166 - 10399815
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  10400166 actttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 10400067  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10400066 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 10399967  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  10399966 ctttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 10399868  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10399867 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10399815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076653
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaa 50076810  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||    
T  50076809 tttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 50076711  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076710 c-cagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 50076653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186109
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaac 17186266  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||    
T  17186265 tttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctc-ttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcc 17186167  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | || | ||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  17186166 cccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 17186109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490211
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||   |    
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  31490057 tttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-ccc 31490154  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
     || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31490155 ccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 31490211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 15823488 - 15823846
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15823488 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 15823587  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  15823588 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 15823687  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15823688 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-tattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctc 15823786  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823787 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 15823846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 495 - 845
Target Start/End: Original strand, 6822958 - 6823306
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||  ||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6822958 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6823057  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  6823058 agagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggg 6823156  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  6823157 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 6823255  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6823256 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 494 - 842
Target Start/End: Original strand, 13215023 - 13215375
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13215023 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 13215122  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13215123 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggg 13215222  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct---ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | |   ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  13215223 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctc 13215322  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgt 842  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  13215323 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078801
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggac 50078959  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  50078958 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcc 50078860  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  50078859 cccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctctcttc 50078801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 450 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 25251659 - 25251255
Alignment:
Q  450 agaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg 548  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| | || |  |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25251659 agaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaagatttttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggg 25251560  T
Q  549 ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 648  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25251559 ctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttagg 25251460  T
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttt 748  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| || || ||    
T  25251459 aaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatc-tt 25251361  T
Q  749 ttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25251360 ttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25251261  T
Q  848 ctcttc 853  Q
    ||||||    
T  25251260 ctcttc 25251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 517 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31424996
Alignment:
Q  517 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttgg-aaca 615  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgag---tctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagac 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  713 gggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatt 811  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctccc-catactaggtcaatt 31425038  T
Q  812 tggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425037 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 31424996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 39462461 - 39462819
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  39462461 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgta 39462560  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39462561 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 39462660  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39462661 actttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctc-ttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctc 39462759  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462760 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39462819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 496 - 845
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617808
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2617659  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  2617660 tttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 2617758  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||    
T  2617759 tcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtt 2617808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 50248957 - 50248551
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||| || |||||| |  | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50248957 cagaaacatatttacgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggga 50248858  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50248857 gctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgg 50248758  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  50248757 gaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctc-t 50248659  T
Q  748 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccg--ctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |  |||||||||  | | ||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  50248658 tttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgtt 50248559  T
Q  846 ctctcttc 853  Q
    ||||||||    
T  50248558 ctctcttc 50248551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294821
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  15295031 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaaccca 15294932  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15294931 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 15294833  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  15294832 cttttgtgttct 15294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 459 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 31423248 - 31422930
Alignment:
Q  459 tttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaag 558  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423248 tttttgggtcagatttgttccaattttatgggagatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaag 31423149  T
Q  559 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 657  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31423148 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactat 31423049  T
Q  658 aaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgt 757  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  31423048 tagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctc-ttttgtaaggt 31422950  T
Q  758 tactcatca-tatagtgaaa 776  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  31422949 tactcatcattatagtgaaa 31422930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 28840620 - 28840973
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28840620 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttg 28840719  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  28840720 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 28840819  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  28840820 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 28840917  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28840918 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28840973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 497 - 853
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319187
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggact 17319031  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17319032 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctc-ttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccc 17319130  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319131 t-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17319187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 20302402 - 20302752
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20302402 acttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20302501  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |      
T  20302502 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactagga 20302601  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |  ||||||||    
T  20302602 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctcc 20302699  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20302700 cccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 20302752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 13761780 - 13762130
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  13761780 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtat 13761879  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||       
T  13761880 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtga 13761979  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  13761980 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctcc 13762077  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13762078 cccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13762130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 31735864 - 31735508
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacct----tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31735864 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 31735765  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||      
T  31735764 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggc 31735665  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  31735664 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 31735566  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31735565 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31735508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 39932057 - 39932368
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39932057 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 39932156  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  39932157 gattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaaccca 39932256  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc-tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  39932257 ttgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaat 39932355  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||    
T  39932356 tcttttgtgttct 39932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 536 - 853
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128173
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattca 25128055  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  25128056 ttgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaat 25128154  T
Q  835 tcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25128155 tcttttgtgttctctcttc 25128173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 28842435 - 28842788
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28842435 tacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 28842534  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  28842535 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctg 28842634  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||    
T  28842635 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctc 28842732  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| || | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28842733 tcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttct 28842788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 2510667 - 2510312
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  2510667 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtt 2510568  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2510567 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagat 2510468  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    | |  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2510467 ttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctc-tcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctc 2510370  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2510369 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 27337281 - 27336921
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27337281 tacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27337182  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    | || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||      
T  27337181 tttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggc 27337083  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    ||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  27337082 tgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 27336985  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336984 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27336921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 27339473 - 27339112
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27339473 tacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtt 27339374  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||      
T  27339373 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggc 27339274  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    ||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  27339273 tgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatc 27339176  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339175 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27339112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 3579957 - 3579598
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg--ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  3579957 tacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttg 3579858  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3579857 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattg 3579758  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |   ||||||    
T  3579757 gggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctc 3579660  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||  | | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3579659 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 3579598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 522 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 4131692 - 4131360
Alignment:
Q  522 tcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaaca 619  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4131692 tcagagtaaaccttgagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 4131593  T
Q  620 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagac 719  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| || || ||    
T  4131592 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgga-ctttgggtagaattaggcgagaaac 4131494  T
Q  720 ttattcttgtaactcattgacatctct---ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttgga 815  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |   |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  4131493 ttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 4131394  T
Q  816 ccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4131393 ctgaactatgtcaacaaattcttttgtgttctct 4131360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 544 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431693
Alignment:
Q  544 gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  644 ttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatc 743  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  46431896 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--att 46431799  T
Q  744 tctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct--ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttg 841  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46431798 tctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 46431699  T
Q  842 tgttct 847  Q
    ||||||    
T  46431698 tgttct 46431693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 536 - 844
Target Start/End: Original strand, 24325648 - 24325954
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24325648 gagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 24325746  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24325747 gattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 24325846  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| || | || |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  24325847 ttgatttctc-ttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaatt 24325945  T
Q  836 cttttgtgt 844  Q
    |||||||||    
T  24325946 cttttgtgt 24325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 496 - 849
Target Start/End: Original strand, 40133879 - 40134241
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg---------gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagg 586  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||         |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  40133879 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaatcttgagatataggggctgaaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaag 40133978  T
Q  587 gtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaaga 686  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40133979 gtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaaga 40134078  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggcc 785  Q
    |||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  40134079 gattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggct 40134177  T
Q  786 gctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40134178 gctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgttctct 40134241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 16226110 - 16226461
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  16226110 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 16226209  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16226210 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 16226309  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  16226310 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 16226407  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||   ||||||||||    
T  16226408 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 16226461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291750
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| || | |||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20291499  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |      
T  20291500 agagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactagga 20291599  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||  | |||||||    
T  20291600 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctcc 20291697  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  20291698 cccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttct 20291750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 494 - 822
Target Start/End: Original strand, 47451590 - 47451911
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  47451590 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgta 47451689  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         | ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47451690 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt------ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 47451783  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||    
T  47451784 gctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctc 47451882  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaact 822  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||    
T  47451883 ccccatactaggtcaatttggaccgaact 47451911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 51752308 - 51752657
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||     
T  51752308 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtat 51752407  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||       
T  51752408 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 51752506  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  51752507 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcc 51752604  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51752605 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 536 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 21948484 - 21948227
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21948484 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 21948385  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21948384 gattcacctt-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 21948286  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21948285 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 21948227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 9459762 - 9459404
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9459762 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactaggg 9459663  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaaga 686  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9459662 tttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9459563  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccg 786  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |    
T  9459562 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 9459465  T
Q  787 ctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  9459464 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9459404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 9463589 - 9463231
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9463589 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 9463490  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaaga 686  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9463489 tttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9463390  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccg 786  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |    
T  9463389 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 9463292  T
Q  787 ctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  9463291 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9463231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324362
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||| |||||||||||   |||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||  | ||| || |    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaac 17324206  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||||||    
T  17324207 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctcc 17324305  T
Q  795 ctcat-agtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  17324306 c-catgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgtgttctctcttc 17324362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 494 - 779
Target Start/End: Original strand, 48665113 - 48665404
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggc------tgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48665113 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 48665212  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggtta-cgggaaga 686  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48665213 tttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaaga 48665312  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgg 779  Q
    |  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48665313 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacgg 48665404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 47179697 - 47180006
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  47179697 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47179796  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  47179797 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 47179896  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  47179897 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc-cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 47179993  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
       ||||||||||    
T  47179994 atctttgtgttct 47180006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 47177346 - 47177655
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  47177346 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggtt 47177445  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggat-tgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  47177446 gattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaaccc 47177545  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  ||||| |||||| | |||||||||    
T  47177546 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc-cagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaat 47177642  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
       ||||||||||    
T  47177643 atctttgtgttct 47177655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 455 - 852
Target Start/End: Original strand, 42922136 - 42922530
Alignment:
Q  455 catatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 553  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42922136 catatttttgggctgagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaa 42922235  T
Q  554 acaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 653  Q
    | |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |    
T  42922236 ataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaa 42922331  T
Q  654 ctataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgta 753  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  42922332 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgta 42922430  T
Q  754 acgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 851  Q
    | ||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||| || |  | ||||||| | |||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||||    
T  42922431 aagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttatctct 42922529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 543 - 853
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432696
Alignment:
Q  543 agggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 642  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  643 cttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacat 742  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||| ||    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatat 16432584  T
Q  743 ctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctc-atagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctttt 840  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16432585 ctc-ttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 16432683  T
Q  841 gtgttctctcttc 853  Q
    |||||||||||||    
T  16432684 gtgttctctcttc 16432696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 495 - 749
Target Start/End: Original strand, 6823827 - 6824089
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||  ||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6823827 acttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6823926  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctctt-------ggttacgggaaga 686  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||       |||||||||||||    
T  6823927 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaaga 6824026  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  6824027 gattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 6824089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 496 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183574
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||| |    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caaca--caaactagggtttgtata 14183827  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaat 14183730  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  14183729 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 14183631  T
Q  795 ctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    | || | |||||||  ||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||    
T  14183630 cccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtggtctctc 14183574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 463 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 8347639 - 8347323
Alignment:
Q  463 tgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggt 561  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8347639 tgggtcagatttgttccaattttatgaggggtacttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggt 8347541  T
Q  562 ttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataagg 661  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  8347540 ttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatg 8347445  T
Q  662 attgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttact 761  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  8347444 attgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttact 8347346  T
Q  762 catca-tatagtgaaacggaggg 783  Q
    ||| | ||||||| |||||||||    
T  8347345 cattattatagtggaacggaggg 8347323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 449 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 18800953 - 18800611
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  18800953 cagaatcatatttttgggctgagattttttccaattttatgag-gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggg 18800855  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||     
T  18800854 gctgaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctga 18800759  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| |    
T  18800758 gaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctc-t 18800660  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||    
T  18800659 tttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctccc 18800611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 466 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 49495566 - 49495192
Alignment:
Q  466 gccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttag 565  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49495566 gccagatttgttcgaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttat 49495467  T
Q  566 aaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattg 665  Q
    |||          ||||||||||||| | | |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  49495466 aaatc--------aaactagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattg 49495379  T
Q  666 agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc 765  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  49495378 agtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatc 49495280  T
Q  766 a-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | |||||||||||| |||||   ||||||||  | | || |||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||| ||| |||||    
T  49495279 attatagtgaaacgaagggcttatctctccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattcttatgtattccctctt 49495192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 637 - 853
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429258
Alignment:
Q  637 attcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcat 736  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  737 tgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  16429142 tgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 16429240  T
Q  836 cttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16429241 cttttgtgttctctcttc 16429258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 619 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggaga 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  719 cttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggacc 817  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||||  | | ||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggacc 25248568  T
Q  818 gaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25248567 gaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 463 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 8349419 - 8349119
Alignment:
Q  463 tgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggt 561  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8349419 tgggtcagatttgttccaattttatgagggataattttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggt 8349320  T
Q  562 ttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataagg 661  Q
    |||||| | |||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  8349319 ttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattagg 8349224  T
Q  662 attgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttact 761  Q
    ||||||| |  |||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||    
T  8349223 attgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctc-ttttgttaagttact 8349125  T
Q  762 catcat 767  Q
    ||||||    
T  8349124 catcat 8349119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 463 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 15669762 - 15669432
Alignment:
Q  463 tgggccagatttgttacaattttatg-ggagttacttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagg 559  Q
    ||||||||||||||| || |||| || || | ||||||||||||||||| ||   ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||    
T  15669762 tgggccagatttgttccagttttttgaggggatacttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagg 15669663  T
Q  560 gtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataa 659  Q
    |||| | | | || || ||||| ||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15669662 gtttgggagg-cagca-caaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactatta 15669568  T
Q  660 ggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgtta 759  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | | |||| | ||    
T  15669567 ggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-tctcgtaaagcta 15669469  T
Q  760 ctcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  15669468 ctcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc 15669432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 619 - 847
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231856
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggag 717  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  718 acttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggacc 817  Q
    ||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggacc 16231827  T
Q  818 gaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| | |||||||||   ||||||||||    
T  16231828 gaact-ggtcaacaaatatctttgtgttct 16231856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 644 - 847
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757824
Alignment:
Q  644 ttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatc 743  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |  ||     
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcg--att 51757720  T
Q  744 tctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtg 843  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51757721 tctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtg 51757820  T
Q  844 ttct 847  Q
    ||||    
T  51757821 ttct 51757824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 632 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115083
Alignment:
Q  632 ggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaa 731  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  732 ctcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaac 830  Q
    |  ||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||    
T  6115204 ccaattgatatctc-ttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaac 6115106  T
Q  831 aaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  6115105 aaattattttgtgttctctcttc 6115083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 648 - 835
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786121
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttct 23786032  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  23786033 ctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 695 - 852
Target Start/End: Original strand, 23816029 - 23816185
Alignment:
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||||    
T  23816029 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt-gtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctcc 23816127  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23816128 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 23816185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 517 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 13125772 - 13125439
Alignment:
Q  517 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg-taaagagtttgtctctttggaaca 615  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| |  |||    
T  13125772 ttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgaca 13125675  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgg 714  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |   |    
T  13125674 aacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttg 13125577  T
Q  715 gagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-tt 812  Q
     ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||||| ||| | || ||||||| | |     
T  13125576 aagacttattcttgtaaccctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagtata 13125478  T
Q  813 ggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    |||||||||||| | |||||||| |  |||||||||||||    
T  13125477 ggaccgaactaggtaaacaaatt-tcatgtgttctctctt 13125439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 502 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520207
Alignment:
Q  502 ctataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagt 599  Q
    ||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  600 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttg------gttacgggaagagattgga 693  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||      || |||||||||||||||     
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattggg 26520254  T
Q  694 gctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattga 739  Q
     ||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26520253 actttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattga 26520207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 517 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 25248830 - 25248756
Alignment:
Q  517 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25248830 ttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 634 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738609
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||   |||||||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  733 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatca---tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatca 828  Q
     | ||||  |||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||||||| | ||||||| |||| | | |    
T  30738730 cctttgatgtctc-ttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaa 30738632  T
Q  829 acaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||||||| |  |||||||||||||    
T  30738631 acaaatt-tcgtgtgttctctctt 30738609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 494 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 30790733 - 30790468
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||      
T  30790733 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaaca-aacaataaa-ctagggtttt- 30790637  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
      |||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  30790636 --agagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagat-gg 30790544  T
Q  693 ag-ctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat 767  Q
    || ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30790543 agactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcat 30790468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 634 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613221
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  733 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaac 830  Q
     | |||| ||||| ||||| || |||||| |||| ||||||| ||| ||| ||  ||||||||| || | ||||||| | || ||||||||| | | |||    
T  26613340 cctttgatatctc-ttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaac 26613242  T
Q  831 aaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  26613241 aaatt-ttgtgtgttctctctt 26613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 552 - 820
Target Start/End: Original strand, 27916500 - 27916765
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    |||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||    
T  27916500 aaacaagggtttagaa-gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaa 27916593  T
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac--tcattgacatctcttt 748  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||  ||||||||||   |||||||| |||||| |   | ||||| |||||| ||||  || |||| |||||  |    
T  27916594 cactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctc--t 27916691  T
Q  749 ttgtaacgttactcatc-atatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaa 820  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||| | ||||||||||    
T  27916692 ttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 27916765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 459 - 547
Target Start/End: Original strand, 16431008 - 16431096
Alignment:
Q  459 tttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16431008 ttttcgggccagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 575 - 767
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279480
Alignment:
Q  575 aacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctctt 673  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  674 ggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat 767  Q
    ||| |||||||||||||||  |||| |||||||||| |   | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctc-ttttgtaaagttactcatcat 28279480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 758 - 847
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358867
Alignment:
Q  758 tactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13358867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 495 - 592
Target Start/End: Original strand, 16231544 - 16231641
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16231544 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 634 - 710
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155864
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattag 155864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 631 - 767
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561681
Alignment:
Q  631 gggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgt 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| || ||||||   |||||||||||| || |   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  730 aactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat 767  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16561645 aaccctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcat 16561681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 338
Target Start/End: Original strand, 18306836 - 18306914
Alignment:
Q  260 tgttgcagaagtgactcaatattggagtttgaagtgcaaaatcatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgattt 338  Q
    ||||| |||||||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18306836 tgttgtagaagtgactaaaaattgaagtttggattgcaaaatcatgtttgctagaagaccaaaaatcggcgcccgattt 18306914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 808
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353220
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaa 731  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  732 ctcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca 808  Q
    | | |||| |||   |||||||| |||| |||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||| || |||| ||||    
T  14353146 ccctttgaaatc---ttttgtaaagttattcatcattatagtggaacgaagagccactctctcccccaaagtatgtca 14353220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 26332836 - 26332719
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  26332836 aaacaagggtttagaa-gccaaca-caaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaa 26332744  T
Q  652 cactataaggattgagtctcttggt 676  Q
    |||||| |||||| |||||||||||    
T  26332743 cactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 528 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 6115384 - 6115344
Alignment:
Q  528 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115384 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 634 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta 709  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||   ||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 724 - 852
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916690
Alignment:
Q  724 tcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaa-tttggaccgaac 821  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctctttta-taaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaac 15916660  T
Q  822 tagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | | | |||||||| || || ||||||||||    
T  15916661 tgggtaaacaaatt-ttgtgcgttctctctt 15916690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34620659 - 34620613
Alignment:
Q  109 ctacataaaacttaccaattatttctattttaaaaaccttaacaagt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34620659 ctacataaaacttaccaattatttctattttagaatccttaacaagt 34620613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 536
Target Start/End: Original strand, 43104055 - 43104143
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttg 536  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || |||| || | | ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  43104055 cagaaacatatttttgggcttagatttgttccagttttttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttg 43104143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 638 - 710
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104317
Alignment:
Q  638 ttcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattag 43104317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144805
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgg-gacttgggtagaattag 4144805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 517 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 13127944 - 13127813
Alignment:
Q  517 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaa 616  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| || |||||||  || || | |||||    
T  13127944 ttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt-ccttttggcaacaa 13127848  T
Q  617 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 653  Q
    |||||||||||   || | ||||||||||||||||||    
T  13127847 acactagggtt--gggatagattcaccttgggaaaca 13127813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 806 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447260
Alignment:
Q  806 tcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13447260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997100
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagatt-gagacttgggtagaattag 14997100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 14996716 - 14996772
Alignment:
Q  319 ccaaaatcggcgcccgatttctggagttcggggcccgattttggctgcgtttgggag 375  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  14996716 ccaaaatcggcgcccgatttgtgcagttctgggcccgattttgcctgtttttgggag 14996772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232635
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2232635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 779 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 31422915 - 31422841
Alignment:
Q  779 gagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| | |||||||    
T  31422915 gagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtgatatctcttc 31422841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 634 - 710
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959207
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattag 49959207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 105)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295913
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtatt-gtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  595 agagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 4296072  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  4296071 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctc 4295973  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4295972 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctcttc 4295913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724889
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  |    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44724733 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 44724831  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724832 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 44724889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 13099813 - 13099453
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13099813 tacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 13099714  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13099713 tagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 13099614  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  13099613 gctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct 13099514  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099513 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 13099453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 516 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 21592458 - 21592122
Alignment:
Q  516 attgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaaca 615  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21592458 attgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaaca 21592359  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacggg 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  21592358 aacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtggg 21592259  T
Q  716 agacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttgga 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21592258 agacttattcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttgga 21592160  T
Q  816 ccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592159 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 21592122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 452 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 20137488 - 20137088
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggccagattt-gttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | | | |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20137488 aaacgtatttttgggcctgattttgttccaattt-atgagggattcttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggct 20137390  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 650  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137389 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 20137290  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttt 750  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  20137289 acactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-tttt 20137191  T
Q  751 gtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20137190 gtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 20137092  T
Q  850 cttc 853  Q
    ||||    
T  20137091 cttc 20137088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 452 - 852
Target Start/End: Original strand, 11355168 - 11355567
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggccagattt-gttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355168 aaacgtatttttgggcctgattttgttccaattt-atgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 11355266  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 650  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355267 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 11355366  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttt 750  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11355367 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatct-ttttt 11355465  T
Q  751 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||  | | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  11355466 gtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctc 11355565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 31435384 - 31435025
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31435384 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 31435285  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31435284 tagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga 31435185  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
     ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  31435184 actttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 31435086  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435085 cccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 31435025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748904
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 24748747  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24748748 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 24748846  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
      || | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24748847 tccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctctt 24748904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 469 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 39146349 - 39145965
Alignment:
Q  469 agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 568  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39146349 agatttgttccaattttattgaggattcttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagata 39146250  T
Q  569 gacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagt 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  39146249 gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagt 39146150  T
Q  669 ctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-t 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  39146149 ctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcatt 39146051  T
Q  768 atagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||||||| |||| ||||| | ||  | | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146050 atagtgaaacggggggctgctcttttccctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39145965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 494 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 42331336 - 42330977
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42331336 tacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgta 42331237  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggtt--acgggaagagattg 691  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42331236 tagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattg 42331137  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  42331136 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctc 42331038  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  42331037 tcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 42330977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 497 - 853
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990460
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 21990304  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||     
T  21990305 ttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccc 21990403  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990404 aagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 21990460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 38393934 - 38394290
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38393934 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 38394033  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  38394034 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 38394133  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  38394134 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 38394232  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38394233 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38394290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 452 - 853
Target Start/End: Original strand, 42223066 - 42223468
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggccagattt-gttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagg-gggc 549  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | |||     
T  42223066 aaacgtatttttgggcctgattttgttccaattt-atgagggtttcttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtggga 42223164  T
Q  550 tgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 648  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42223165 tgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga 42223264  T
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttt 748  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| |||  ||||| ||||| ||    
T  42223265 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctc-tt 42223363  T
Q  749 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  42223364 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctc 42223463  T
Q  849 tcttc 853  Q
    |||||    
T  42223464 tcttc 42223468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680340
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  21680181 tttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctctttt-gtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctccc 21680279  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaacta---gatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     || | ||||| |||||||||||||||    | ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21680280 ccagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctcttc 21680340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 35581 - 35933
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  35581 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtg 35680  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  35681 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 35780  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  35781 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctc 35879  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||  | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35880 ccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttct 35933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 493 - 847
Target Start/End: Original strand, 48457600 - 48457957
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggt 588  Q
    ||||||| |||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48457600 ttactttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48457699  T
Q  589 ttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  48457700 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 48457799  T
Q  689 ttggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgct 788  Q
     |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  48457800 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 48457898  T
Q  789 ctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48457899 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48457957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 443547 - 443906
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  443547 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 443646  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  443647 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattggg 443746  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  443747 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctctttta-taacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctc 443845  T
Q  794 cctcat-agtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || |   | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  443846 ccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 443906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 27306566 - 27306211
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27306566 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-ta 27306468  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  27306467 tagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 27306368  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27306367 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 27306269  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||  | | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  27306268 ccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctcttc 27306211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 497 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412104
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  597 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggac 37412263  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  37412262 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 37412163  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |  | | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37412162 cctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttctcccttc 37412104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 495 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 1049631 - 1049283
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1049631 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1049532  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||      
T  1049531 agagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 1049432  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  1049431 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 1049334  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1049333 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1049283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681130
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 590  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  591 gtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 9680967  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    ||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9680968 tgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctc 9681066  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9681067 tctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctcttc 9681130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 536 - 850
Target Start/End: Original strand, 20626032 - 20626345
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20626032 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20626131  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  20626132 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20626231  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20626232 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 20626330  T
Q  836 cttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||    
T  20626331 cttttgtgttctctc 20626345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 536 - 850
Target Start/End: Original strand, 20629923 - 20630236
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20629923 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20630022  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  20630023 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20630122  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20630123 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 20630221  T
Q  836 cttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||    
T  20630222 cttttgtgttctctc 20630236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 536 - 850
Target Start/End: Original strand, 20642342 - 20642655
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20642342 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggtt 20642441  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  20642442 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaaccca 20642541  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20642542 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 20642640  T
Q  836 cttttgtgttctctc 850  Q
    |||||||||||||||    
T  20642641 cttttgtgttctctc 20642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678374
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21678220 tttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatc-ttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctccc 21678318  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
      | | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  21678319 ctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattc--ttgtgttctctcttc 21678374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 44516 - 44868
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  44516 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtg 44615  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  44616 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttggg 44715  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||    
T  44716 actttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctc 44814  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44815 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 498 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471965
Alignment:
Q  498 tttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga 7472118  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  7472117 actttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctc 7472019  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7472018 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7471965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 20299406 - 20299764
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaaggg-tttagaaagacaacaacaaaactagggt 588  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20299406 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 20299505  T
Q  589 ttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299506 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20299605  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgc 787  Q
      |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||    
T  20299606 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgc 20299704  T
Q  788 tctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20299705 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 40837078 - 40836728
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||  | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  40837078 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40836979  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||       
T  40836978 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 40836879  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  40836878 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 40836781  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40836780 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40836728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 498 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470007
Alignment:
Q  498 tttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 7470160  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  7470159 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctc 7470061  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7470060 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850285
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1850174  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1850175 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1850273  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  1850274 cttttgtgttct 1850285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 3878571 - 3878881
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  3878571 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggtt 3878670  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3878671 gattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3878770  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3878771 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 3878869  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  3878870 cttttgtgttct 3878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 20297356 - 20297666
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20297356 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggtt 20297455  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  20297456 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaaccca 20297555  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  20297556 ttgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaatt 20297654  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  20297655 cttttgtgttct 20297666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 28487547 - 28487857
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||    
T  28487547 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggtt 28487646  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28487647 gattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28487746  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28487747 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 28487845  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  28487846 cttttgtgttct 28487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 502 - 853
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258778
Alignment:
Q  502 ctataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagttt 601  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 24258522  T
Q  602 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggg 701  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||     
T  24258523 gtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttgga 24258622  T
Q  702 tagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca----tatagtgaaacggagggccgctctctccctc 797  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| ||||||||  ||    
T  24258623 tagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttc 24258721  T
Q  798 atagtaggtcaatttggaccgaactagatcaac-aaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24258722 agactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttttgtgttctctcttc 24258778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 536 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1046912
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1047020  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1047019 ttg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1046922  T
Q  836 cttttgtgtt 845  Q
    ||||||||||    
T  1046921 cttttgtgtt 1046912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 497 - 853
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679369
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  592 taaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  691 ggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctct 790  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  9679208 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctct 9679306  T
Q  791 ctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||  | || | ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9679307 ctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 9679369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 494 - 846
Target Start/End: Original strand, 3035669 - 3036027
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3035669 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 3035768  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaaga--- 686  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       
T  3035769 tttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaga 3035868  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccg 786  Q
    |  |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| |  ||||||| |    
T  3035869 ggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt-gcaacgatactcatcatatagtggattggagggctg 3035967  T
Q  787 ctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3035968 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 3036027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 18345489 - 18345845
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgag----atagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  | ||| |||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18345489 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 18345588  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||      
T  18345589 tgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggc 18345688  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||    
T  18345689 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttc 18345787  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  18345788 tctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 18345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 31156248 - 31155896
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31156248 tacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 31156149  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31156148 tagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgg 31156049  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||    
T  31156048 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctct 31155951  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  31155950 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31155896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 494 - 845
Target Start/End: Original strand, 28485514 - 28485867
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28485514 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 28485613  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28485614 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagat 28485713  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    ||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||    
T  28485714 tggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctc 28485812  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28485813 tct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 28485867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 541 - 847
Target Start/End: Original strand, 40946327 - 40946632
Alignment:
Q  541 agagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||     
T  40946327 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgattt 40946426  T
Q  641 accttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgac 740  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||     
T  40946427 actttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 40946526  T
Q  741 atctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctttt 840  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40946527 ttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 40946625  T
Q  841 gtgttct 847  Q
    |||||||    
T  40946626 gtgttct 40946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7351947 - 7351637
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  7351947 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7351848  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7351847 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 7351748  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  7351747 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 7351650  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
    |  ||||||||||    
T  7351649 ttctttgtgttct 7351637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 546 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 43253801 - 43253502
Alignment:
Q  546 gggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 645  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43253801 gggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggttgattcacctt 43253703  T
Q  646 gggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctc 745  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43253702 gggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc 43253603  T
Q  746 tttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  43253602 -ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgtt 43253504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 495 - 845
Target Start/End: Original strand, 25542484 - 25542830
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  25542484 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat 25542582  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||      
T  25542583 agagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactggga 25542681  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||    
T  25542682 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcc 25542779  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    |  | | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25542780 cctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25542830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 496 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832651
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 27832770  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||    
T  27832769 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctc 27832671  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttg 813  Q
    || || | ||||||||||||    
T  27832670 ccccagactaggtcaatttg 27832651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 494 - 773
Target Start/End: Original strand, 11757176 - 11757460
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagagggggctgaaacaaggg-tttagaaagacaacaacaaaactagggt 588  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11757176 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggt 11757275  T
Q  589 ttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757276 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 11757375  T
Q  688 attggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtg 773  Q
      |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11757376 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtg 11757460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 449 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 22829016 - 22828672
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||| | | |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22829016 cagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttatgagggatacttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggg 22828917  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||  || |    
T  22828916 gctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattag 22828817  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  22828816 aaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-t 22828718  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
    |||||||  |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22828717 tttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 452 - 779
Target Start/End: Original strand, 25276050 - 25276378
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | ||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  25276050 aaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggct 25276149  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 650  Q
     ||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25276150 aaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaa 25276249  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttt 750  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  25276250 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctc-tttt 25276348  T
Q  751 gtaacgttactcatca-tatagtgaaacgg 779  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  25276349 gtaaagttactcatcattatagtggaacgg 25276378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 494 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 7349616 - 7349285
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaggg 587  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7349616 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 7349517  T
Q  588 tttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaaga 686  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7349516 tttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 7349417  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccg 786  Q
    |||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |    
T  7349416 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 7349319  T
Q  787 ctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaa 820  Q
    ||||||||| || | |||||||  ||||||||||    
T  7349318 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 612 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092198
Alignment:
Q  612 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaga 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  712 cgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatt 7092234  T
Q  812 tggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7092233 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 465 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 24817714 - 24817362
Alignment:
Q  465 ggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24817714 ggccagatttgttacaattttatgagggatactttaa-tataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggttt 24817617  T
Q  564 agaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggat 663  Q
    |||| | |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || ||| |||||    
T  24817616 agaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggat 24817522  T
Q  664 tgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactca 763  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  24817521 tgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctc-ttttgtaaagttactca 24817423  T
Q  764 tca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca-atttggaccgaact 822  Q
    ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  24817422 tcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 527 - 732
Target Start/End: Original strand, 26804554 - 26804762
Alignment:
Q  527 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacac---tag 623  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  26804554 gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtag 26804653  T
Q  624 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26804654 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 26804753  T
Q  724 tcttgtaac 732  Q
    |||||||||    
T  26804754 tcttgtaac 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 612 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094445
Alignment:
Q  612 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaga 711  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  712 cgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatt 811  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 7094481  T
Q  812 tggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  7094480 tggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 7094445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 495 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251611
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    ||||||||||||||||||    ||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 22251779  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22251778 agagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 22251687  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct---ttttgtaacgttactcatcat 767  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  22251686 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcat 22251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 452 - 792
Target Start/End: Original strand, 7188452 - 7188789
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7188452 aaacgtatttttgggctgagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggct 7188551  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 650  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  7188552 gaaacaagggtttag-aagtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaa 7188647  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttt 750  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||| || || ||||    
T  7188648 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttc-tttt 7188746  T
Q  751 gtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  7188747 gtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctct 7188789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 449 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 20091924 - 20091584
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20091924 cagaaacgtattttcaggcctagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggg 20091825  T
Q  548 gctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 646  Q
    |||| |||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||| |||||||| || || | |||||| | |||||||   ||||||||||||||||    
T  20091824 gctgaaaacaagggtttcg-gaggcaac-acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggtt--ggggttgattcaccttg 20091730  T
Q  647 ggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  20091729 ggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc- 20091631  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20091630 ttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctccc 20091584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 494 - 657
Target Start/End: Original strand, 18567565 - 18567728
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18567565 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 18567664  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 657  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567665 tagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 18567728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 620 - 847
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396938
Alignment:
Q  620 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagac 719  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  720 ttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccga 819  Q
    ||||| ||||||| |||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattg--atttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccga 38396910  T
Q  820 actagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38396911 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 38396938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 571 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813477
Alignment:
Q  571 caacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtct 670  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  671 cttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tat 769  Q
    |||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctc-ctttgtaaagttactcatcattat 24813561  T
Q  770 agtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||| | |||| ||| ||| |||||| || | |||||||  ||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||||    
T  24813560 agtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctcttc 24813477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 497 - 822
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465816
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||  | | |||||||||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtc-ttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcc 24465788  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaact 822  Q
    | || | ||| ||||| || ||||||||    
T  24465789 cccagactagatcaatatgaaccgaact 24465816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 648 - 835
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935560
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttct 2935471  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  2935472 ctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137381
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22137283 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22137380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552408
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40552310 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 40552407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108370
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22108272 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22108369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550130
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40550032 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 40550129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 648 - 835
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606671
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  || |||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattg--atttct 1606582  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | ||| |||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  1606583 ctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 494 - 689
Target Start/End: Original strand, 22392425 - 22392608
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||||||||||||    
T  22392425 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgta 22392516  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
     ||| |||| || || | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22392517 tagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 648 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  9027277 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 696 - 852
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394032
Alignment:
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctcc 22393974  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    |  | | |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  22393975 cctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 22394032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 695 - 838
Target Start/End: Original strand, 26295600 - 26295743
Alignment:
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||    
T  26295600 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctc 26295698  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctt 838  Q
    |  || | ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  26295699 ctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 552 - 690
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081654
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagatt 11081654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 634 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297145
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaga 711  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaga 16297145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 469 - 780
Target Start/End: Original strand, 6332153 - 6332458
Alignment:
Q  469 agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 567  Q
    ||||||||| || |||| || | | |||||||||||||||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6332153 agatttgttccagttttttgagggatacttttactataaatataaaacttgtatcagagtaa-ccttgagagagagggggctggaaacaagggtttataa 6332251  T
Q  568 agacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgag 667  Q
    | | | ||||| | ||||||||| ||  ||||||  ||||| | ||||||||||||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||| | |||||||    
T  6332252 acata-caacaga-ctagggtttata--gagttta-ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgag 6332344  T
Q  668 tctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagac-gggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca 766  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||   |||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6332345 tctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctc-ttttgtaaagttactcatca 6332443  T
Q  767 -tatagtgaaacgga 780  Q
     ||||||| ||||||    
T  6332444 ttatagtggaacgga 6332458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 552 - 710
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049038
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaa 650  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |   |||||| | ||||||||||| |||||| || |||||||||||||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaat---tctcttggcaacaaacacta-ggtttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||   |||||| |||||||||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattag 6049038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 571 - 710
Target Start/End: Original strand, 11084409 - 11084543
Alignment:
Q  571 caacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtct 670  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||   ||||| | |||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11084409 caacaagaaaactagggtttgtagaaaatt---ctcttggcaacaaacaatagggtt-gaga-ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtct 11084503  T
Q  671 cttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  11084504 cttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattag 11084543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 542 - 603
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  542 gagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgt 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 672 - 767
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  672 ttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat 767  Q
    ||||| ||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctc-ttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  498 tttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaa-actagggtttg 591  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||| |||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 786 - 847
Target Start/End: Original strand, 11759370 - 11759431
Alignment:
Q  786 gctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11759370 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11759431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 536 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 7094717 - 7094662
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  7094717 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 802 - 853
Target Start/End: Original strand, 26804769 - 26804820
Alignment:
Q  802 taggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804769 taggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 26804820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 710
Target Start/End: Original strand, 26210500 - 26210709
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||     
T  26210500 cttttagtataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgagagag-gggggaggaaacaaggttttagaatc-caacctcaaaactagggtttgtag 26210597  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-g 691  Q
    ||| ||   ||||| | ||||| |||||||||| |||   |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  26210598 agaatt---ctcttggcaacaa-cactagggttgtga---ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcg 26210690  T
Q  692 gagctttgggtagaattag 710  Q
    |  |||| |||||||||||    
T  26210691 ggactttcggtagaattag 26210709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310157
Alignment:
Q  612 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Original strand, 43952501 - 43952545
Alignment:
Q  109 ctacataaaacttaccaattatttctattttaaaaaccttaacaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43952501 ctacataaaacttaccaattacttctattttaaaatccttaacaa 43952545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 497 - 564
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677301
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggttta 564  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 692
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369685
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 21369685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 30906387 - 30906264
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||| ||||||| ||||||    
T  30906387 tacttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaaca-aataac-aaactagagtttgt 30906290  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaaca 619  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||    
T  30906289 atagagtttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 637 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281518
Alignment:
Q  637 attcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattg 40281518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 633 - 687
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120937
Alignment:
Q  633 gttgattcaccttggg--aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2120937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 517 - 627
Target Start/End: Original strand, 6348793 - 6348903
Alignment:
Q  517 ttgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaac 614  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||  || || ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||    
T  6348793 ttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttag-aagtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagtttg-ctcttggcaac 6348890  T
Q  615 aaacactagggtt 627  Q
    ||||| |||||||    
T  6348891 aaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 805 - 852
Target Start/End: Original strand, 25276392 - 25276439
Alignment:
Q  805 gtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  25276392 gtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttctctctt 25276439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320194
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3320194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324942
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3324942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069818
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7069818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074825
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 7074825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541139
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351391
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25351391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357085
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25357085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405431
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25405431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410168
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 25410168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006701
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 42006701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 47356640 - 47356598
Alignment:
Q  111 acataaaacttaccaattatttctattttaaaaaccttaacaa 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47356640 acataaaatttaccaattatttctattttaaaatccgtaacaa 47356598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 767 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 6067264 - 6067183
Alignment:
Q  767 tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||| | | |||||||||| | |||||||    
T  6067264 tatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttct 6067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 812 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251564
Alignment:
Q  812 tggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 22251564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 80)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 449 - 852
Target Start/End: Original strand, 13057125 - 13057529
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |  | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057125 cagaaacgtattttcgggcctagatttgttccaattttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 13057224  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057225 gctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 13057324  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  13057325 gaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-t 13057423  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13057424 tttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttc 13057523  T
Q  847 tctctt 852  Q
    ||||||    
T  13057524 tctctt 13057529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 483 - 851
Target Start/End: Original strand, 3390345 - 3390713
Alignment:
Q  483 tttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaac 582  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3390345 tttatgagagatacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac 3390444  T
Q  583 tagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacggg 682  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  3390445 tagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaga 3390544  T
Q  683 aagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggag 781  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  3390545 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggag 3390643  T
Q  782 ggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 851  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||    
T  3390644 ggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtgatctctct 3390713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 3630247 - 3629844
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||| |  | | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3630247 cagaaacgtatttttgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggg 3630148  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630147 gctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 3630048  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  3630047 gaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctc-t 3629949  T
Q  748 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3629948 tttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctctccc-catactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3629850  T
Q  848 ctcttc 853  Q
    ||||||    
T  3629849 ctcttc 3629844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 9019903 - 9020261
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9019903 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9020002  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  9020003 tagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattggg 9020102  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9020103 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctc 9020201  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020202 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 9020261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 449 - 852
Target Start/End: Original strand, 25477205 - 25477616
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477205 cagaaacatattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 25477304  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477305 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 25477404  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  25477405 gaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-t 25477503  T
Q  748 tttgtaa-------cgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttt 839  Q
    |||||||       |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  25477504 tttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttt 25477603  T
Q  840 tgtgttctctctt 852  Q
    ||| |||||||||    
T  25477604 tgtattctctctt 25477616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233704
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  596 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3233866 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt-gtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcc 3233768  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactaga-----tcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | ||||||||||| |||||||||  |     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233767 cccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3233704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 495 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 11983365 - 11983008
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11983365 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 11983266  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||      
T  11983265 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 11983166  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11983165 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 11983067  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983066 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 11983008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 493 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 28241659 - 28241306
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28241659 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 28241560  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28241559 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 28241460  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28241459 gactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct 28241361  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28241360 cccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28241306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040089
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   |    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13039933 tttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 13040031  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    |  | | ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13040032 cctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 13040089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 30729165 - 30728803
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30729165 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgta 30729066  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||     
T  30729065 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggg 30728966  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct---ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctct 790  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |   |||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||    
T  30728965 gctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctct 30728866  T
Q  791 ctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30728865 ctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 30728803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 450 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 3632320 - 3631918
Alignment:
Q  450 agaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg 548  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3632320 agaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcgtttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggag 3632221  T
Q  549 ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 648  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3632220 ttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttggg 3632121  T
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttt 748  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  3632120 aaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctc-tt 3632022  T
Q  749 ttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  3632021 ttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgtcc--cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttat 3631924  T
Q  848 ctcttc 853  Q
    ||||||    
T  3631923 ctcttc 3631918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 493 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 1230587 - 1230234
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||  | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1230587 ttactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 1230488  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||  |||    
T  1230487 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgg 1230388  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  1230387 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctct 1230289  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1230288 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1230234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 14507512 - 14507161
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14507512 tacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 14507413  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  14507412 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 14507313  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14507312 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctc 14507215  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14507214 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14507161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 30967220 - 30967530
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30967220 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 30967319  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  30967320 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 30967419  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30967420 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 30967518  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  30967519 cttttgtgttct 30967530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 503 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458752
Alignment:
Q  503 tataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttg 602  Q
    |||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  603 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggt 702  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  703 agaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagt 802  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || | |    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 14458797  T
Q  803 aggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14458796 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14458752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 495 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 15541476 - 15541120
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  15541476 acttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtat 15541377  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||      
T  15541376 agagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattggga 15541277  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||||    
T  15541276 ctttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctctcc 15541178  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
      || | ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15541177 tccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 15541120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 494 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 15533018 - 15532674
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15533018 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgta 15532919  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  15532918 taaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattggg 15532819  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15532818 acttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctatc 15532720  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctttt 840  Q
    ||| | | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15532719 cct-agactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816216
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4816427  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4816426 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 4816327  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4816326 ttgatttctc-ttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 4816228  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||    
T  4816227 cttttgtgttct 4816216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 19704864 - 19704552
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||    
T  19704864 gagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggtt 19704765  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  19704764 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 19704665  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19704664 attgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 19704565  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
    | |||||||||||    
T  19704564 tattttgtgttct 19704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Original strand, 32279974 - 32280332
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||| ||||| ||||||   ||||||||  |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32279974 tacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgta 32280072  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32280073 tagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 32280172  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc-atatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
     |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  32280173 acttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctct 32280271  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32280272 cccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctcttc 32280332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 494 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 15530459 - 15530166
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15530459 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 15530360  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15530359 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 15530260  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15530259 gctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 536 - 849
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065312
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26065201  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26065202 ttgacttctc--tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26065298  T
Q  836 cttttgtgttctct 849  Q
     |||||||||||||    
T  26065299 attttgtgttctct 26065312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 536 - 849
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085281
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26085170  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26085171 ttgacttctc--tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26085267  T
Q  836 cttttgtgttctct 849  Q
     |||||||||||||    
T  26085268 attttgtgttctct 26085281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 2629227 - 2628871
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggt 588  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||   ||||| |||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2629227 tacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2629128  T
Q  589 ttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagaga 688  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629127 ttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 2629028  T
Q  689 ttggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgct 788  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||   | ||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  2629027 ttgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgct 2628930  T
Q  789 ctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  2628929 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 2628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 536 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 20915651 - 20915351
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20915651 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 20915552  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20915551 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 20915452  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20915451 attg--atttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20915354  T
Q  835 tct 837  Q
    |||    
T  20915353 tct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 494 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 30034944 - 30034590
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  30034944 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtt 30034845  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||      
T  30034844 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggc 30034745  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||    
T  30034744 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctc 30034646  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    |||||| || | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30034645 tctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 452 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 24338828 - 24338427
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| | || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338828 aaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaagattcttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 24338729  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacacta-gggtttgagggttgattcaccttggga 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  24338728 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaa 24338629  T
Q  650 aacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  24338628 aacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttt 24338530  T
Q  750 tgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| || | || |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||    
T  24338529 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatc 24338432  T
Q  849 tcttc 853  Q
    |||||    
T  24338431 tcttc 24338427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 12195852 - 12195500
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12195852 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 12195753  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195752 tagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 12195653  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  12195652 gactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 12195555  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||    
T  12195554 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttct 12195500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 12161937 - 12161537
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12161937 cagaaacatattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg 12161838  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12161837 -ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgg 12161741  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  12161740 gaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctc-t 12161642  T
Q  748 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||| | | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12161641 tttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctctccct-aaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttct 12161543  T
Q  848 ctcttc 853  Q
    ||||||    
T  12161542 ctcttc 12161537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 495 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 19227744 - 19227514
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19227744 acttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19227645  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||       
T  19227644 agagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 19227545  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattc 725  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19227544 ctttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 26932857 - 26932546
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  26932857 gagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggtt 26932758  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26932757 gattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26932658  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaa- 833  Q
    ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||     
T  26932657 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 26932560  T
Q  834 ttcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||||    
T  26932559 ttcttttgtgttct 26932546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 496 - 767
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490889
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 22490817  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat 767  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  22490818 ctttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 465 - 852
Target Start/End: Original strand, 15719595 - 15719977
Alignment:
Q  465 ggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatatagg-------tattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa 557  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||         |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719595 ggccatatttgttccaattttatgagggttacttttactataaatatatacattgtatattgtatcaatataaaccttgagatagagggggctgaaacaa 15719694  T
Q  558 gggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 657  Q
    |||||||||||          ||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||    
T  15719695 gggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactat 15719782  T
Q  658 aaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgt 757  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    
T  15719783 taggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagt 15719881  T
Q  758 tactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct-ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |  |||||||||||||    
T  15719882 tactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaatt-tcatgtgttctctctt 15719977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466658
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
     ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 14466500  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| | | ||| | ||    
T  14466501 gtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttc 14466599  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14466600 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctctt 14466658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 637 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069697
Alignment:
Q  637 attcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcat 736  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  737 tgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1069813 tgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaatt 1069715  T
Q  836 cttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  1069714 cttttatgttctctcttc 1069697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 616 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgg 714  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  715 gagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttgg 814  Q
    |||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 5273234  T
Q  815 accgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||||||| | ||||||||||    
T  5273233 accgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 494 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 3028187 - 3027890
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  3028187 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaagg-caaca-caaaactagggtttgt 3028090  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  3028089 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattga 3027993  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
      ||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||     
T  3027992 gactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctt 3027894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 457 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 16455798 - 16455434
Alignment:
Q  457 tatttttgggc-cagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaa 553  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||   || | ||| |||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||  ||||| |  |||||    
T  16455798 tatttttgggctcagatttgttccaatttttcagg-gatacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctgaa 16455701  T
Q  554 a-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac 652  Q
    | ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  16455700 aacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaac 16455605  T
Q  653 actataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgt 752  Q
    ||| | |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| ||||||    
T  16455604 actgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctc-ttttgt 16455506  T
Q  753 aacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaact 822  Q
    ||  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  16455505 aaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaact 16455434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 496 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 644  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 502 - 765
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012287
Alignment:
Q  502 ctataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtt 600  Q
    ||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  601 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgg 700  Q
    || ||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttg 17012223  T
Q  701 gtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc 765  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  17012224 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 633 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186051
Alignment:
Q  633 gttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaa 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  732 ctcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaac 830  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||| | | |||    
T  12186171 ctcattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaac 12186073  T
Q  831 aaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  12186072 aaattattttgtgttctctctt 12186051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 494 - 852
Target Start/End: Original strand, 15367013 - 15367365
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcag-------tgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagg 586  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||           ||| ||||    
T  15367013 tacttttactataaatatagacattgtatcagacatcggtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggcttataattc--------aaattagg 15367104  T
Q  587 gtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaaga 686  Q
    | |||||  | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15367105 ggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaaga 15367200  T
Q  687 gattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccg 786  Q
    ||||| | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  15367201 gattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctg 15367299  T
Q  787 ctctctc-cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||||||| || || | ||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||||    
T  15367300 ctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 15367365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 494 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 1072214 - 1072067
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1072214 tacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgta 1072115  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 641  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072114 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066109
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttct 26066210  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
     |||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  26066209 ctttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 26066110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 494 - 625
Target Start/End: Original strand, 17852519 - 17852650
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17852519 tacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgta 17852618  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 625  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17852619 tagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754694
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  29754792 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 29754695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309185
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  33309087 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 33309184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068380
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  26068478 tt--gtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 26068381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311454
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  || |||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattg--atttct 33311353  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  33311354 ctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttc 33311453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 450 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 13870803 - 13870608
Alignment:
Q  450 agaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg 548  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | |||||  ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  13870803 agaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattctttttatataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg- 13870705  T
Q  549 ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 645  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13870704 ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 494 - 616
Target Start/End: Original strand, 8995456 - 8995578
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8995456 tacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 8995555  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaa 616  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  8995556 tagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 632 - 835
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  632 ggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgta 730  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  731 actcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatca 828  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| ||| || | || ||||  ||||||||||||| | | |    
T  26945358 actcattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaa 26945456  T
Q  829 acaaatt 835  Q
    |||||||    
T  26945457 acaaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 494 - 655
Target Start/End: Original strand, 15346368 - 15346517
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |   |||||||||||||||    
T  15346368 tacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttaga--------attcaaactagggtttgta 15346459  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 655  Q
     | | |||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  15346460 taaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacact 15346517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 453 - 608
Target Start/End: Original strand, 10584061 - 10584212
Alignment:
Q  453 aacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg 551  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  10584061 aacatattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattcttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagg-----g 10584155  T
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctt 608  Q
    |||||| |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10584156 aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 695 - 852
Target Start/End: Original strand, 15346525 - 15346680
Alignment:
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  15346525 ctttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctatt-gtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctcc 15346623  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |  |||||||||||||    
T  15346624 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 15346680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 750 - 853
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584331
Alignment:
Q  750 tgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctc 848  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctc 10584326  T
Q  849 tcttc 853  Q
    |||||    
T  10584327 tcttc 10584331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 496 - 852
Target Start/End: Original strand, 19696420 - 19696775
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg--ggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||  |   ||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  19696420 cttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgt 19696517  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | |||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  |   |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || | |||||||||     
T  19696518 atagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattga 19696614  T
Q  693 agctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctct 790  Q
      |||||| |||||||| |   | ||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||  || |||||    
T  19696615 gactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctc-ttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctct 19696713  T
Q  791 ctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||| | || | ||||||| | |||||||||||| | | |||||||| |  |||||||||||||    
T  19696714 ctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 19696775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 552 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 22858228 - 22857962
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22858228 aaacaagggtttagaa-gctaacacaaaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaa 22858135  T
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaactc-attgacatctctttt 749  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||||   |||| |||||| ||| |   | ||||| ||||||||||| |  |||| || ||  ||    
T  22858134 cactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatc--tt 22858037  T
Q  750 tgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaact 822  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| || | ||||||| | ||||||||||||    
T  22858036 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaact 22857962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 634 - 709
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta 709  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 793
Target Start/End: Original strand, 20526902 - 20527081
Alignment:
Q  612 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-g 710  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||    |||| |||||||||| |    
T  20526902 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattagg 20526999  T
Q  711 acgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
       | ||||| |||||||||||   |||| |||||  ||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||    
T  20527000 tttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc--tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 711 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 25465711 - 25465571
Alignment:
Q  711 acgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaa 809  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| | |||| || ||||     
T  25465711 acgggagacttattcttgtacccctttgatatctc--tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcag 25465614  T
Q  810 t-ttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    | |||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||||    
T  25465613 tattggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 25465571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 635 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037794
Alignment:
Q  635 tgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggaga-cttattcttgtaact 733  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||| || ||||||   ||||||||||||||||     | | ||||||||||||||     
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  734 cattgacatctctttttgtaacgttactcatcata 768  Q
    | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcata 28037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 493 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 12186407 - 12186330
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 568  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12186407 ttacttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 634 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078623
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    |||||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||  ||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagatt-gagatttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  733 tcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat 767  Q
     | |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctc-ttttgtaaagttactcgtcat 25078623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 12937535 - 12937437
Alignment:
Q  494 tacttttactataaa--tataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  12937535 tacttttactataaatatatagacattgtatcagatgtaaaccttgagatacagaggggctgaaaacagggtttagaaaca-aacaa-aaaactagggtt 12937438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 634 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542525
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 690  Q
    ||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatt 7542525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 659 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 5165987 - 5165937
Alignment:
Q  659 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  5165987 aggattgagtctcttggtcacgggaagagattgg-gacttgggtagaattag 5165937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 17904632 - 17904566
Alignment:
Q  557 agggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 627  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  17904632 agggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgt--agagttt-tctctttgcaacaaacactaaggtt 17904566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 25466507 - 25466433
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 568  Q
    |||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  25466507 tacttttactataaatatagatcttttgtcagagtaaaccttgaggtaga-gaggctgaaaacaagggtttagaaa 25466433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577658
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 3577658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878765
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13878765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883513
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13883513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785957
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 16785957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 652 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351974
Alignment:
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggct-gagatttgggtagaattag 22351974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887368
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 26887368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 496 - 568
Target Start/End: Original strand, 26945127 - 26945201
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 568  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  26945127 cttttactataaatataaaccttgtatcaggtataaaccttgagatatagggggccgaaaacaagggtttagaaa 26945201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248858
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 31248858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201470
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 35201470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 471 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 28038065 - 28038012
Alignment:
Q  471 atttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatca 524  Q
    ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28038065 atttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatca 28038012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 716 - 808
Target Start/End: Original strand, 30445723 - 30445815
Alignment:
Q  716 agacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca 808  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||  |||| |||||||    
T  30445723 agactaattcttgtaaccctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccaccatactaggtca 30445815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 496 - 849
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007912
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19007760 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctccc 19007858  T
Q  796 tcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
     || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19007859 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 19007912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 40032395 - 40032032
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40032395 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 40032296  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |     
T  40032295 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttagg 40032196  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct---ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| |   ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40032195 actttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctc 40032096  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40032095 tctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttc 40032032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 42923848 - 42923488
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  42923848 tacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttg 42923749  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42923748 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattg 42923649  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42923648 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctc 42923550  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923549 tcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 42923488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 452 - 853
Target Start/End: Original strand, 17848321 - 17848716
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggccagattt-gttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | | | |||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  17848321 aaacgtatttttgggcctgattttgttccaattt-atgagggattcttttactataaatataggctttgtatcagt--aatccttgagatagagggggct 17848417  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 649  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17848418 caaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttggga 17848517  T
Q  650 aacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  17848518 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctc-ttt 17848612  T
Q  750 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17848613 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17848712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 6264527 - 6264127
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggc-cagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 546  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||  || |||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  6264527 cagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcga--tatttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagaggg 6264430  T
Q  547 ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 646  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264429 ggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 6264334  T
Q  647 ggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  6264333 ggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctc- 6264235  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6264234 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6264135  T
Q  846 ctctcttc 853  Q
    ||||||||    
T  6264134 ctctcttc 6264127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 22287673 - 22287315
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22287673 tacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 22287574  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  22287573 tagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgac 22287474  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22287473 acttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctc 22287375  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287374 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22287315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 452 - 853
Target Start/End: Original strand, 28196513 - 28196911
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggccagattt-gttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | | | ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28196513 aaacgtatttttgggcctgattttgttccaattt-atgagggattcttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggct 28196611  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 650  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28196612 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaa 28196711  T
Q  651 acactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttt 750  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  28196712 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctc-tttt 28196810  T
Q  751 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 850  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28196811 gtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28196908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739538
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctc-ttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 11739597  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739596 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 11739538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849393
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagac 17849236  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17849237 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctcc 17849334  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | |||| |||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17849335 cacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17849393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 21521032 - 21520672
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21521032 tacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttg 21520933  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |     
T  21520932 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggcta 21520833  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21520832 ggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctc 21520734  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520733 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 21520672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 6259152 - 6258796
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6259152 tacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgta 6259053  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  6259052 tagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggg 6258955  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  6258954 gctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct 6258856  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258855 ccc-catactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6258796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 493 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 45280323 - 45279969
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaga-caacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||| ||||||||||||    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45280323 ttactttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttg 45280224  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  45280223 tatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 45280124  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctc 791  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  45280123 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 45280025  T
Q  792 tccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||| || | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45280024 tcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45279969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 449 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 13910426 - 13910030
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggc-cagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 546  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||    
T  13910426 cagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagggaa--acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggg 13910329  T
Q  547 ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 646  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13910328 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttg 13910229  T
Q  647 ggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  13910228 ggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttct 13910131  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| | | || ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13910130 ctttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 13910031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 27104718 - 27105067
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27104718 acttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 27104817  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||      
T  27104818 agagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 27104916  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27104917 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 27105014  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27105015 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27105067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837544
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||   |    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gggaagagattgagac 14837386  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcc 14837485  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837486 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 19504681 - 19504331
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19504681 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19504582  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||      
T  19504581 agagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagaggctggga 19504483  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||    
T  19504482 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcc 19504384  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19504383 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19504331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 497 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19501996
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  597 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 696  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19502146  T
Q  697 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccct 796  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||     
T  19502145 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccc 19502047  T
Q  797 catagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19502046 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19501996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 23452578 - 23452222
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 589  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23452578 tacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 23452479  T
Q  590 tgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagat 689  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  23452478 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 23452379  T
Q  690 tggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
    |||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| ||||    
T  23452378 tgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctc 23452280  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23452279 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23452222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 42064433 - 42064785
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42064433 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 42064532  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  42064533 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 42064632  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  42064633 actttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 42064730  T
Q  794 cctcatagtaggtc-aatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42064731 ccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 42452701 - 42453050
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42452701 tacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 42452800  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     | ||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  42452801 taaagtttgtctc--tgtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 42452898  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  42452899 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 42452997  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42452998 cc-cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42453050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 43623905 - 43623559
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43623905 tacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 43623806  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||            |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  43623805 tagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43623718  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  43623717 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 43623619  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623618 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 43623559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 504 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979558
Alignment:
Q  504 ataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgt 603  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  604 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggta 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  704 gaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctct-ctccctcatag 801  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||  |||| | ||| || |     
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctc-ttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaac 34979608  T
Q  802 taggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 851  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34979607 taggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 34979558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289046
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggac 44289204  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    || |||||||||||   || | ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||  ||||| |||    
T  44289203 ttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctc-ttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcc 44289105  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289104 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 44289046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 449 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 15539858 - 15539557
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg 547  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||| |  | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15539858 cagaaacgtattttcgggcctagatttgttccagttttattgaggattgttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggg 15539759  T
Q  548 gctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 647  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539758 gttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 15539659  T
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  15539658 gaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatctt 15539559  T
Q  748 tt 749  Q
    ||    
T  15539558 tt 15539557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 499 - 853
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022448
Alignment:
Q  499 ttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagag 598  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  599 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagcttt 698  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggtttt 3022285  T
Q  699 gggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca----------tatagtgaaacggagggccgct 788  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||| ||| |||||||||||          |||| |||||| || ||| |||    
T  3022286 aggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc--tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgct 3022383  T
Q  789 ctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022384 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3022448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 449 - 852
Target Start/End: Original strand, 22874015 - 22874406
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggg 548  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  22874015 cagaaacgtatttttgggccagatttgtttcaattttatgagggttacttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagaggggg 22874114  T
Q  549 ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 648  Q
    ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||     
T  22874115 ctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttgga 22874202  T
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttt 748  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||    
T  22874203 aaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctc-tt 22874301  T
Q  749 ttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||    
T  22874302 ttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttct 22874401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 24162548 - 24162208
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24162548 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 24162449  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 694  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |          |||      
T  24162448 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tggga 24162359  T
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||    
T  24162358 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctcc 24162261  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    | |  | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  24162260 cccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 24162208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 35215881 - 35215571
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  35215881 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35215782  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35215781 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactc 35215682  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  35215681 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35215584  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
       ||||||||||    
T  35215583 atctttgtgttct 35215571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 536 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239000
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggt 634  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagacttt--ctctttggcaacaaacactagggtttgagggt 45239174  T
Q  635 tgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |    
T  45239173 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaaccc 45239074  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaa 809  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||    
T  45239073 attgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35217948
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
     |||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  35218058 gttg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35217961  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
       ||||||||||    
T  35217960 atctttgtgttct 35217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 496 - 836
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732772
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||            ||||  |    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggac 31732913  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  31732912 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcc 31732814  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattc 836  Q
    | || | |||||||||||||||||| || | | |||||||||    
T  31732813 cccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 496 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578104
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    || ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||    
T  11578244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcc 11578146  T
Q  795 ctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    | || | ||| |||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  11578145 cccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 626 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375325
Alignment:
Q  626 tttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattc 725  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  726 ttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactaga 825  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |     
T  5375451 ttgtaacccattgatatctctttt-gtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 5375353  T
Q  826 tcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375352 tcaacaaattcttttgtgttctctcttc 5375325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 18800639 - 18800292
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||          || ||||||||||||    
T  18800639 tacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgta 18800548  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  18800547 tagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggg 18800452  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  18800451 gctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctct 18800353  T
Q  793 ccctcatagtaggtca-atttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||| || |  ||||||  |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18800352 ccc-cagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttc 18800292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 586 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459170
Alignment:
Q  586 ggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaag 685  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  686 agattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggc 784  Q
    || |||| ||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttt-taaagttactcatcattatagtgaaacggagggc 28459237  T
Q  785 cgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
      |||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28459236 ttctctctacct-agactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctctt 28459170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 496 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctctt 673  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 494 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22407746 - 22407591
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22407746 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 22407647  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 649  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407646 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 552 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 20146884 - 20146617
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||    
T  20146884 aaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 20146789  T
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttg 751  Q
    || ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  20146788 caatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctc-ttttg 20146690  T
Q  752 taacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaact 822  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||    
T  20146689 taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcagactaagtcagtattggaccgaact 20146617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 536 - 676
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020302
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggt 676  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 695 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 22407590 - 22407433
Alignment:
Q  695 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22407590 cttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 22407492  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407491 cccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22407433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558849
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttct 36558950  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  36558949 ctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 36558850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561126
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttct 36561227  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  36561226 ctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 36561127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 494 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 17897579 - 17897282
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctga-aacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  17897579 tacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttg 17897482  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || |||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||    
T  17897481 tatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattg 17897386  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctct 790  Q
        |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||    
T  17897385 agattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatct-attttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctct 17897287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 463 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 37963295 - 37962938
Alignment:
Q  463 tgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtt 562  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37963295 tgggccagatttgttccaattttatgatggatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtt 37963196  T
Q  563 tagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataagga 662  Q
    ||||        ||  ||||||||||||||  | |||||| |||||   ||||||||| | ||||   | |||||||| |||| | ||||| |||   ||    
T  37963195 taga--------aatcaaactagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgaga 37963108  T
Q  663 ttgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactc 762  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    | ||||||||| |||| ||    
T  37963107 ttgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattga----tttttttgtaaagttattc 37963012  T
Q  763 atca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||| ||||||||||| | || | | |||||| | || | ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  37963011 atcattatagtgaaacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332166
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  || |||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattg--atttct 45332267  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||   |||||||||    
T  45332266 ctttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttc 45332167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 711 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 22707873 - 22707730
Alignment:
Q  711 acgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc-cctc-atagtaggtca 808  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| | | |||||||    
T  22707873 acgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtca 22707775  T
Q  809 atttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22707774 atttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22707730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 494 - 852
Target Start/End: Original strand, 35107218 - 35107571
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||| |  || |||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  35107218 tacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgt 35107315  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  35107316 atagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgt 35107409  T
Q  693 agctttgggtagaattaga--cgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctc 789  Q
      |||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||  | ||    
T  35107410 gactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaac-ctttgttatctc-ttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttc 35107507  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    |||  | || | ||||||| | |||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  35107508 tctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctctt 35107571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 536 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 5377724 - 5377629
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 631  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5377724 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 747 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 22163107 - 22163001
Alignment:
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22163107 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 22163008  T
Q  847 tctcttc 853  Q
    |||||||    
T  22163007 tctcttc 22163001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 716 - 853
Target Start/End: Original strand, 23870956 - 23871092
Alignment:
Q  716 agacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttgga 815  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  23870956 agacttattcttgtaacccattaatatctcttta-gtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatttgga 23871054  T
Q  816 ccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
     | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23871055 tcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctcttc 23871092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 632 - 852
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699650
Alignment:
Q  632 ggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgta 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||| |   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  731 actcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatca 828  Q
    |  | |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||| |||| || | ||||||| | || ||||||||||| | |    
T  40699529 atcctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaa 40699627  T
Q  829 acaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||||||| |  |||||||||||||    
T  40699628 acaaatt-tcgtgtgttctctctt 40699650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 497 - 590
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  497 ttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 590  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 702 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462957
Alignment:
Q  702 tagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatag 801  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||||||| || |     
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-ttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 7462979  T
Q  802 taggtcaa-tttggaccgaact 822  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  7462978 taggtcaattttggaccgaact 7462957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 612 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 27136343 - 27136195
Alignment:
Q  612 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaga 711  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||     
T  27136343 aacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattagg 27136246  T
Q  712 cg-ggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactc 762  Q
       |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27136245 tttggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 619 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  619 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggaga 718  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 552 - 710
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139508
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 651  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  43139356 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  652 cactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||| |||||||||||    
T  43139450 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattag 43139508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 494 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 12342747 - 12342673
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaa 567  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342747 tacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 649 - 781
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589896
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacg-ggagacttattcttgtaactcattgacatctctt 747  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctc-t 20589861  T
Q  748 tttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggag 781  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20589862 tttgtgaagttactcatcattatagtgtaacggag 20589896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 633 - 709
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  633 gttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttgggtagaatta 709  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 635 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  635 tgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 469 - 709
Target Start/End: Original strand, 35028473 - 35028707
Alignment:
Q  469 agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaaca-agggtttaga 566  Q
    ||||||||| ||||||| | || | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||||| |  | |||| | ||||||||||    
T  35028473 agatttgttccaattttttagg-gatacttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttgaattagagagc-cggaaaaacagggtttaga 35028570  T
Q  567 aagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattga 666  Q
    |   |||||| |||| | |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||| ||||||||| | ||||||    
T  35028571 atc-caacaataaaatttgggtttgta--gagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattga 35028664  T
Q  667 gtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta 709  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  35028665 gtctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 634 - 710
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921832
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattag 17921832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 634 - 709
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttgggtagaatta 709  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 808 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539508
Alignment:
Q  808 aatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 15539508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458950
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattag 28458950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 544
Target Start/End: Original strand, 40699182 - 40699278
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagag 544  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  40699182 cagaatcatatttttgggctgagatttgttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 365
Target Start/End: Original strand, 22873832 - 22873932
Alignment:
Q  268 aagtgactcaatattggagttt-gaagtgc--aaaatcatgtttgctggaagacccaaaatcggcgcccgatttctgg-agttcggggcccgattttggc 363  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||  ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  22873832 aagtgactcaaaattggagttttggagtgctgaaattgatgtttgttggaagacc-aaaatcggcgcccgatctgtgggagttcggggctcgattttggc 22873930  T
Q  364 tg 365  Q
    ||    
T  22873931 tg 22873932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 649 - 710
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741001
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattag 710  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgg-gacttgggtagaattag 2741001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 633 - 767
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  633 gttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttggagctttgggtagaatta-gacgggagacttattcttgt 729  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  730 aactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat 767  Q
    |||   |||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 552 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 41304667 - 41304624
Alignment:
Q  552 aaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 596  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41304667 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtaaag 41304624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 752191 - 752145
Alignment:
Q  109 ctacataaaacttaccaattatttctattttaaaaaccttaacaagt 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  752191 ctacataaaactaaccaattatttctattttagaattcttaacaagt 752145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736243
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2736243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 648 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ggagctttgggtagaatta 709  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 648 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ggagctttgggtagaatta 709  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462474
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17462474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054909
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 20054909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712660
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22712660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717369
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22717369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 634 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720733
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag-ctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattag 30720733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 634 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575231
Alignment:
Q  634 ttgattcaccttgg-gaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ggagctttgggtagaattag 710  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattag 34575231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 694 - 732
Target Start/End: Original strand, 38020310 - 38020348
Alignment:
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaac 732  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38020310 gctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 38020348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687021
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 39687021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567447
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 45567447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 455 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 20147125 - 20147040
Alignment:
Q  455 catatttttgggc-cagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga 539  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |   || |||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||    
T  20147125 catatttttgggctcaaatttgttccaattttatgaggaatatttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 252; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 452 - 853
Target Start/End: Original strand, 79768 - 80168
Alignment:
Q  452 aaacatatttttgggccagattt-gttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 550  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| | | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79768 aaacgtatttttgggcctgattttgttccaattt-atgagggattcttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggct 79866  T
Q  551 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  79867 gaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttggga 79966  T
Q  650 aacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 749  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  79967 aacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctc-ttt 80064  T
Q  750 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctct 849  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  80065 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctct 80164  T
Q  850 cttc 853  Q
    ||||    
T  80165 cttc 80168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188386
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 188386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 493 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 41821 - 41468
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41821 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 41722  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  41721 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 41622  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41621 gactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct 41523  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||| || | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41522 cccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 493 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 183977 - 183626
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  183977 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt 183879  T
Q  593 aaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  183878 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgg 183780  T
Q  693 agctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctct 792  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  183779 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 183681  T
Q  793 ccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  183680 ccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 494 - 838
Target Start/End: Original strand, 51960 - 52307
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 591  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||   ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  51960 tacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 52059  T
Q  592 taaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 691  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52060 tatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 52159  T
Q  692 gagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc--cgctc 789  Q
       |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  52160 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 52258  T
Q  790 tctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctt 838  Q
    |||||| || | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  52259 tctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 52307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 767 - 838
Target Start/End: Original strand, 50235 - 50308
Alignment:
Q  767 tatagtgaaacggagggccgctctctc--cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattctt 838  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  || || | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  50235 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 498 - 853
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79494
Alignment:
Q  498 tttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaaga 597  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  598 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctt 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatt 79339  T
Q  698 tgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctc 797  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  79340 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 79438  T
Q  798 atagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | | |||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  79439 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 79494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 494 - 847
Target Start/End: Original strand, 3948 - 4298
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3948 tacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4047  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  4048 ta-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctggg 4146  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4147 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 4245  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  4246 cc-cagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 449 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 69676 - 69277
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggccagatttgttac-aattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaacctt----gagataga 543  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||   || |||||| | |||| ||    ||||||||    
T  69676 cagaaacatattttgggtgcagatttgttccaaattttaagcga--tacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagataga 69579  T
Q  544 gggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69578 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 69479  T
Q  644 ttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatc 743  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||     
T  69478 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--att 69381  T
Q  744 tctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtg 843  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  69380 tctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 69281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 449 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 73408 - 73207
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggccagatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgaga----tagag 544  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||    |||||||  | |||| ||||||    |||||    
T  73408 cagaaacatattttgggtgcagatttgttccaaattt-taagagatacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagag 73310  T
Q  545 ggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73309 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 73210  T
Q  645 tgg 647  Q
    |||    
T  73209 tgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 608 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73161
Alignment:
Q  608 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 657  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 73161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 494 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 11810 - 11452
Alignment:
Q  494 tacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 593  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11810 tacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgta 11711  T
Q  594 aagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11710 tagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 11611  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||    
T  11610 actttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctc 11512  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    || || | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11511 ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 11452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 536 - 853
Target Start/End: Complemental strand, 14677 - 14363
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14677 gagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggtt 14578  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14577 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 14478  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14477 ttgatatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14379  T
Q  836 cttttgtgttctctcttc 853  Q
    |  |||||||||||||||    
T  14378 c--ttgtgttctctcttc 14363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 449 - 853
Target Start/End: Original strand, 14925 - 15326
Alignment:
Q  449 cagaaacatatttttgggc-cagatttgttacaa-ttttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 546  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  14925 cagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcga--tacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggg 15022  T
Q  547 ggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 646  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15023 ggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttg 15122  T
Q  647 ggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  15123 ggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc- 15221  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||    
T  15222 ttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattc--ttgtgttc 15319  T
Q  847 tctcttc 853  Q
    |||||||    
T  15320 tctcttc 15326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6502
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||     
T  6151 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtat 6250  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgga 693  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6251 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattggg 6350  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||    
T  6351 actttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctc 6448  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    || || | |||||||  ||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||    
T  6449 ccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttct 6502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 29164 - 29473
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  29164 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggtt 29263  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactca 735  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29264 gattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactca 29363  T
Q  736 ttgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaatt 835  Q
    |||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29364 ttg--atttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 29461  T
Q  836 cttttgtgttct 847  Q
    | ||||||||||    
T  29462 cgtttgtgttct 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 495 - 847
Target Start/End: Original strand, 2832 - 3182
Alignment:
Q  495 acttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 594  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  2832 acttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2931  T
Q  595 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaaga-gattgga 693  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  2932 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttgga 3031  T
Q  694 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctc 793  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||    
T  3032 -ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctc 3128  T
Q  794 cctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||  | | |||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||    
T  3129 cccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttct 3182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 175; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 496 - 853
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85540
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgac 85382  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctcc 794  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||    
T  85383 tttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-tttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 85481  T
Q  795 ctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    | || | |||||||||||| || |||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  85482 cccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttctctcttc 85540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 174; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 536 - 847
Target Start/End: Original strand, 34 - 344
Alignment:
Q  536 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  636 gattcaccttgggaaacactataaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  735 attgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaat 834  Q
    ||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  234 attg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 331  T
Q  835 tcttttgtgttct 847  Q
    |  ||||||||||    
T  332 ttctttgtgttct 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 155; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 537 - 795
Target Start/End: Original strand, 2036 - 2292
Alignment:
Q  537 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 636  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  2036 agatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttg 2134  T
Q  637 attcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcat 736  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  2135 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccat 2234  T
Q  737 tgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccc 795  Q
    | |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  2235 taatttctc-ttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactctctccc 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 455 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 16195 - 15801
Alignment:
Q  455 catatttttgggcc-agatttgttacaattttatgggagttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaa 553  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16195 catatttttgggctgagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaa 16096  T
Q  554 acaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 653  Q
    | |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |    
T  16095 ataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaa 16000  T
Q  654 ctataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgta 753  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15999 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgta 15901  T
Q  754 acgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctct 851  Q
    | ||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||| || |  | ||||||| | |||||||||||| | | |||||||| || |||||| |||||    
T  15900 aagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttatctct 15802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 610 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1438
Alignment:
Q  610 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaatta 709  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  710 gacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaa 809  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || | ||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 1476  T
Q  810 tttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 847  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1475 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 496 - 723
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  496 cttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  596 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||  |    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35791  T
Q  696 tttgggtagaattagacgggagacttat 723  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35792 tttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 767 - 853
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35903
Alignment:
Q  767 tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 853  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 35903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 517 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 1946 - 1622
Alignment:
Q  517 ttgtatcag-tgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaaca 615  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||          ||||    
T  1946 ttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttc---------aaca 1857  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacggg 715  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  1856 aacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 1759  T
Q  716 agacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtca-atttg 813  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||  |||     
T  1758 agagttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatactaggtcagttttt 1660  T
Q  814 gaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 852  Q
    ||||||||| | | |||||||| |  |||||||||||||    
T  1659 gaccgaactgggtaaacaaatt-tcgtgtgttctctctt 1622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 517 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 16961 - 16716
Alignment:
Q  517 ttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaaca 615  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  16961 ttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaaca 16865  T
Q  616 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacggg 715  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |  |    
T  16864 aacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccag 16767  T
Q  716 agacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat 767  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16766 agacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 98; Significance: 8e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22418
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22320 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 22417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 648 - 847
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24693
Alignment:
Q  648 gaaacactataaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 746  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  747 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgttc 846  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| || | |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  24595 tt--gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttc 24692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 502 - 767
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5034
Alignment:
Q  502 ctataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtt 600  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  | | ||||||| ||||||||| || || |||    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaagta-agcaacaaa-ctagggtttatatagcgtt 4870  T
Q  601 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttgg 700  Q
    | |||||  | |||||||||||| ||| |||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||| |    
T  4871 t-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttg 4967  T
Q  701 gtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcat 767  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  4968 gtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcat 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 85; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 493 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 993
Alignment:
Q  493 ttacttttactataaatataggtattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 592  Q
    ||||||| |||||||||||||   ||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1169 ttactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 1070  T
Q  593 aaagagtttgtctc-----tttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactataaggatt 664  Q
    | ||||||||||||     |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||    
T  1069 atagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 778 - 845
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4666
Alignment:
Q  778 ggagggccgctctctccctcatagtaggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgtt 845  Q
    ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 802 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 1481 - 1439
Alignment:
Q  802 taggtcaatttggaccgaactagatcaacaaattcttttgtgt 844  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1481 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 649 - 687
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224857
Alignment:
Q  649 aaacactataaggattgagtctcttggttacgggaagag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University