View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4512-Insertion-2 (Length: 817)

Name: NF4512-Insertion-2
Description: NF4512
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4512-Insertion-2
NF4512-Insertion-2
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (248-644)||(26318373-26318769)
chr5 (60-257)||(26316723-26316920)
chr5 (119-552)||(12686169-12686595)
chr5 (119-552)||(12692271-12692697)
chr5 (133-309)||(32096965-32097141)
chr5 (133-306)||(32094164-32094337)
chr5 (676-817)||(26318801-26318935)
chr5 (119-552)||(30772025-30772453)
chr5 (134-401)||(30384383-30384652)
chr5 (121-271)||(24054350-24054502)
chr5 (119-552)||(28525376-28525800)
chr5 (119-335)||(28531472-28531686)
chr5 (119-555)||(19059754-19060190)
chr5 (119-270)||(19066097-19066249)
chr5 (122-316)||(26509823-26510013)
chr5 (119-257)||(16215164-16215302)
chr5 (119-435)||(7389538-7389848)
chr5 (119-249)||(14610188-14610320)
chr5 (142-271)||(41297293-41297423)
chr5 (449-555)||(20499880-20499982)
chr5 (247-316)||(33753372-33753441)
chr5 (247-316)||(33849006-33849075)
chr5 (190-257)||(28542269-28542336)
chr5 (181-254)||(37896350-37896423)
chr5 (565-640)||(14609768-14609843)
chr5 (354-535)||(19066331-19066511)
chr5 (195-271)||(20500154-20500231)
chr5 (551-640)||(30384817-30384906)
chr5 (565-640)||(7389995-7390070)
chr5 (565-640)||(20499775-20499850)
chr5 (367-552)||(28531714-28531896)
chr5 (449-552)||(32097338-32097439)
chr5 (565-640)||(41296916-41296991)
chr5 (578-640)||(12686639-12686701)
chr5 (578-640)||(12692741-12692803)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (119-552)||(28420949-28421375)
chr7 (119-552)||(3817301-3817725)
chr7 (132-640)||(43539632-43540141)
chr7 (119-552)||(351532-351955)
chr7 (123-552)||(3811163-3811583)
chr7 (119-271)||(20238967-20239120)
chr7 (142-271)||(339387-339517)
chr7 (132-271)||(35148007-35148148)
chr7 (119-306)||(5849506-5849695)
chr7 (119-271)||(12804016-12804169)
chr7 (133-268)||(42767299-42767435)
chr7 (186-306)||(26383607-26383728)
chr7 (133-271)||(5979178-5979317)
chr7 (152-289)||(30219269-30219407)
chr7 (367-552)||(5849275-5849457)
chr7 (174-281)||(22741970-22742076)
chr7 (178-338)||(18666545-18666702)
chr7 (367-552)||(339126-339307)
chr7 (551-640)||(22742363-22742452)
chr7 (565-640)||(339018-339093)
chr7 (565-640)||(351424-351499)
chr7 (367-489)||(26380890-26381011)
chr7 (565-640)||(26383306-26383381)
chr7 (419-549)||(26383417-26383543)
chr7 (578-640)||(28421419-28421481)
chr7 (551-640)||(8824448-8824536)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (119-552)||(10244324-10244751)
chr3 (119-552)||(10760640-10761065)
chr3 (119-552)||(11839715-11840142)
chr3 (119-552)||(10238202-10238629)
chr3 (122-338)||(46656633-46656850)
chr3 (150-495)||(8331586-8331925)
chr3 (142-495)||(38455563-38455911)
chr3 (119-552)||(49151357-49151781)
chr3 (119-552)||(49157424-49157848)
chr3 (142-552)||(42191233-42191637)
chr3 (142-552)||(42197175-42197579)
chr3 (142-495)||(38449076-38449424)
chr3 (134-495)||(17055798-17056153)
chr3 (119-271)||(10766861-10767014)
chr3 (119-271)||(11846053-11846206)
chr3 (119-495)||(30051092-30051462)
chr3 (119-271)||(53069044-53069198)
chr3 (119-257)||(48128037-48128175)
chr3 (119-257)||(55003402-55003540)
chr3 (133-287)||(28964868-28965020)
chr3 (133-271)||(17593286-17593425)
chr3 (189-281)||(12108728-12108820)
chr3 (180-283)||(34300501-34300605)
chr3 (119-271)||(13445077-13445220)
chr3 (367-552)||(26429649-26429834)
chr3 (447-552)||(28964625-28964726)
chr3 (367-552)||(10769201-10769384)
chr3 (565-640)||(30051548-30051623)
chr3 (565-640)||(53071699-53071774)
chr3 (565-640)||(10761098-10761173)
chr3 (565-640)||(10769417-10769492)
chr3 (150-213)||(24643573-24643636)
chr3 (565-640)||(28964517-28964592)
chr3 (565-640)||(38449511-38449586)
chr3 (578-640)||(11840186-11840248)
chr3 (578-640)||(26429878-26429940)
chr3 (578-640)||(42191681-42191743)
chr3 (578-640)||(42197623-42197685)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (119-552)||(34739731-34740155)
chr1 (136-552)||(25387511-25387919)
chr1 (123-552)||(25381529-25381952)
chr1 (119-306)||(44409993-44410179)
chr1 (119-335)||(50306145-50306358)
chr1 (119-552)||(31057789-31058213)
chr1 (119-271)||(1078240-1078393)
chr1 (152-271)||(31051561-31051680)
chr1 (119-271)||(24926745-24926897)
chr1 (119-271)||(24963692-24963845)
chr1 (161-283)||(12183616-12183738)
chr1 (142-310)||(38151988-38152151)
chr1 (119-288)||(27955166-27955329)
chr1 (168-552)||(8092885-8093260)
chr1 (367-552)||(31051289-31051472)
chr1 (565-640)||(27954798-27954873)
chr1 (449-552)||(50305940-50306041)
chr1 (354-555)||(24926980-24927177)
chr1 (576-640)||(24964163-24964227)
chr1 (565-637)||(33458357-33458429)
chr1 (354-436)||(24963928-24964011)
chr1 (569-640)||(44409637-44409708)
chr1 (578-640)||(1077881-1077943)
chr1 (578-640)||(25275507-25275569)
chr1 (578-640)||(25381996-25382058)
chr1 (578-640)||(25387963-25388025)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (119-355)||(38362-38597)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (119-552)||(8650793-8651218)
chr6 (119-271)||(32035276-32035429)
chr6 (119-268)||(21782743-21782893)
chr6 (133-306)||(21770562-21770734)
chr6 (119-552)||(4580311-4580738)
chr6 (119-269)||(8662771-8662922)
chr6 (134-495)||(31756220-31756580)
chr6 (133-552)||(25353954-25354366)
chr6 (168-306)||(21783348-21783485)
chr6 (168-306)||(21789571-21789708)
chr6 (153-552)||(25343368-25343759)
chr6 (119-435)||(17581491-17581795)
chr6 (119-271)||(21190856-21191009)
chr6 (133-306)||(21197025-21197197)
chr6 (119-240)||(18778631-18778753)
chr6 (174-269)||(6097999-6098091)
chr6 (135-256)||(34603337-34603457)
chr6 (135-256)||(34724614-34724734)
chr6 (565-640)||(21771012-21771087)
chr6 (203-278)||(1106222-1106299)
chr6 (565-640)||(30906028-30906103)
chr6 (578-640)||(4580782-4580844)
chr6 (447-552)||(21197354-21197455)
chr6 (578-640)||(25343264-25343326)
chr6 (578-640)||(25353850-25353912)
chr6 (579-640)||(21191332-21191393)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (133-496)||(1198-1555)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (119-552)||(32896755-32897182)
chr8 (119-271)||(9935295-9935448)
chr8 (119-552)||(32890631-32891058)
chr8 (119-552)||(36818715-36819140)
chr8 (115-306)||(22219702-22219896)
chr8 (119-271)||(7771248-7771401)
chr8 (152-552)||(5542183-5542575)
chr8 (119-271)||(14417957-14418107)
chr8 (133-283)||(42993008-42993158)
chr8 (119-271)||(14799406-14799558)
chr8 (132-271)||(39735555-39735695)
chr8 (119-306)||(1882741-1882933)
chr8 (133-552)||(10705583-10705998)
chr8 (190-268)||(10700049-10700127)
chr8 (367-552)||(22219959-22220142)
chr8 (551-640)||(42033434-42033523)
chr8 (367-495)||(42033600-42033728)
chr8 (576-640)||(9934920-9934984)
chr8 (132-212)||(39727323-39727403)
chr8 (565-640)||(10705475-10705550)
chr8 (565-640)||(14417598-14417673)
chr8 (578-640)||(42993460-42993522)
chr8 (565-640)||(10699666-10699741)
chr8 (367-469)||(14417765-14417868)
chr8 (565-640)||(39727732-39727807)
chr8 (578-640)||(5542622-5542684)
chr8 (134-220)||(24250171-24250257)
chr8 (578-640)||(32896649-32896711)
chr8 (578-640)||(36818609-36818671)
chr8 (154-211)||(31399062-31399119)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (119-552)||(28682935-28683359)
chr2 (119-552)||(36750157-36750584)
chr2 (119-271)||(35090639-35090792)
chr2 (142-552)||(13455842-13456246)
chr2 (142-552)||(13461783-13462187)
chr2 (110-271)||(35084657-35084819)
chr2 (133-283)||(31002381-31002532)
chr2 (133-283)||(31008359-31008510)
chr2 (119-271)||(13149676-13149828)
chr2 (133-271)||(30965344-30965483)
chr2 (119-271)||(44716794-44716948)
chr2 (119-306)||(11048543-11048731)
chr2 (119-323)||(29833175-29833377)
chr2 (135-236)||(35438715-35438816)
chr2 (142-269)||(23343579-23343707)
chr2 (367-552)||(35084911-35085096)
chr2 (565-640)||(7771634-7771709)
chr2 (565-640)||(28683392-28683467)
chr2 (369-474)||(30965146-30965253)
chr2 (565-640)||(35439818-35439893)
chr2 (565-640)||(44717253-44717328)
chr2 (578-640)||(13455736-13455798)
chr2 (578-640)||(13461677-13461739)
chr2 (578-640)||(23283880-23283942)
chr2 (578-640)||(35085140-35085202)
chr2 (578-640)||(35091113-35091175)
chr2 (367-436)||(35438937-35439007)
chr2 (578-640)||(36750051-36750113)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (119-335)||(5490-5704)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (133-531)||(33458271-33458662)
chr4 (142-552)||(24287730-24288133)
chr4 (136-271)||(10733253-10733389)
chr4 (136-271)||(10739346-10739482)
chr4 (136-271)||(10947022-10947158)
chr4 (136-271)||(10953115-10953251)
chr4 (119-306)||(26963331-26963517)
chr4 (145-287)||(3769568-3769710)
chr4 (119-555)||(6257195-6257622)
chr4 (119-271)||(50168610-50168762)
chr4 (119-552)||(48160704-48161125)
chr4 (119-552)||(48166923-48167344)
chr4 (132-333)||(49976548-49976743)
chr4 (154-268)||(33461418-33461532)
chr4 (194-325)||(44831677-44831806)
chr4 (226-322)||(31986748-31986844)
chr4 (150-253)||(9237398-9237501)
chr4 (119-205)||(4632870-4632956)
chr4 (119-229)||(26956819-26956929)
chr4 (551-640)||(50426884-50426973)
chr4 (139-311)||(19686338-19686510)
chr4 (565-640)||(6257652-6257727)
chr4 (447-552)||(26971869-26971969)
chr4 (565-640)||(26972002-26972077)
chr4 (551-640)||(17627208-17627297)
chr4 (367-495)||(33461624-33461752)
chr4 (551-640)||(44832048-44832137)
chr4 (197-241)||(4632438-4632482)
chr4 (119-217)||(55473135-55473230)
chr4 (565-640)||(10733797-10733872)
chr4 (565-640)||(10739784-10739859)
chr4 (565-640)||(10947566-10947641)
chr4 (565-640)||(10953553-10953628)
chr4 (170-237)||(50427427-50427493)
chr4 (578-640)||(4632012-4632074)
[»] scaffold0208 (4 HSPs)
scaffold0208 (142-552)||(6265-6670)
scaffold0208 (142-552)||(12138-12543)
scaffold0208 (578-640)||(6159-6221)
scaffold0208 (578-640)||(12032-12094)
[»] scaffold0363 (3 HSPs)
scaffold0363 (119-271)||(612-762)
scaffold0363 (565-640)||(1046-1121)
scaffold0363 (367-469)||(851-954)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (148-266)||(5945-6063)
scaffold0185 (579-640)||(5604-5665)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (119-552)||(172880-173304)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (548-640)||(700-792)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 248 - 644
Target Start/End: Original strand, 26318373 - 26318769
Alignment:
Q  248 aataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatccgaaatac 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26318373 aataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaacgatctgaaacagagagaggagatgatctaatctgaaatac 26318472  T
Q  348 aacaaaggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttgggagaagagagagtttgtcttttctgat 447  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  26318473 aacaaaggttagcggcaattgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttctcttcagatgggagaagagagagtttgtcgtttccgat 26318572  T
Q  448 atattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccat 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26318573 atattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagacattcactcaaattgagtccat 26318672  T
Q  548 atcaattatctaaatgaaaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataattaaggg 644  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26318673 atcaattatctaaataaaaatctaatatctttattaattaatttaatcactaatcaattaagtctcagaattgatagataactaatataattaaggg 26318769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 60 - 257
Target Start/End: Original strand, 26316723 - 26316920
Alignment:
Q  60 gtatgttgcttaatatatttctttatttggatggtggctagttgtcgagttattgttagaatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttc 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26316723 gtatgttccttaatatatttctttatttggatggtggctagttgtcgagttattgttagaatttaggtctacataaaaacatatttcataaaacatgttc 26316822  T
Q  160 aataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26316823 aataattttaaattaatagtggaagcaaaaaaaacattgaacattaatatgattggatctaggacatgtttgatttatctacggtattaataattagg 26316920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 12686169 - 12686595
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12686169 aatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 12686268  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  12686269 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 12686365  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  12686366 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 12686460  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||| | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  12686461 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata-tttgatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 12686558  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  12686559 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 12686595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 12692271 - 12692697
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12692271 aatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 12692370  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  12692371 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 12692467  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  12692468 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 12692562  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||| | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  12692563 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata-tttgatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 12692660  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  12692661 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 12692697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 133 - 309
Target Start/End: Original strand, 32096965 - 32097141
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  32096965 taaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttga 32097064  T
Q  233 tttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatga 309  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||  | | |||||||||||||||||    
T  32097065 tttatcaaggatattaagaattaggtattaggattacctgaataaagctttcatagcagtcctctcaacaacaatga 32097141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 306
Target Start/End: Original strand, 32094164 - 32094337
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| |||| || | |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  32094164 taaaaacagattttataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttga 32094263  T
Q  233 tttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  | | ||||||||||||||    
T  32094264 tttatcaaggatattaagaattaggtattaggaatacctgaataaagctttcatagcagccctctcaacaacaa 32094337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 676 - 817
Target Start/End: Original strand, 26318801 - 26318935
Alignment:
Q  676 atgctagtatattggtatgcatcctcttcctacttcccaaacaaaacnnnnnnnnnctttcgcaagtgaagccatattcaatcggtcaaactttacacct 775  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26318801 atgctagtatattggtatacatcctcttcctacttcccaaacaaaa------aaaactttcgca-gtgaagccatattcaatcagtcaaactttacacct 26318893  T
Q  776 taatgtattttacaagatgaatcttttgtcttcgtatttgag 817  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26318894 taatatattttacaagatgaatcttttgtcttcatatttgag 26318935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 30772453 - 30772025
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaa-cattgaacatgaatatgattggat 217  Q
    ||||||| |||  ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| ||||    
T  30772453 aatttagttcttaataaaaataaatttcataaaacatgttcaataattatgaataaacagtggaagcaaacaaaaacaatgaacatgattatgatcggat 30772354  T
Q  218 ctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaa 316  Q
    | || || ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||| ||| ||| | | ||||||||||||||| | |   ||    
T  30772353 cgacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggattacctggataaagtttttatggcagccctctcaacaacaataaac---aa 30772257  T
Q  317 cagagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaa-ggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttca 415  Q
     ||| ||  | |||||||| |    | | |||||||| |||||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||    
T  30772256 gaga-aggtgtgatgatctga---aacacacaacaaagggttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttca 30772161  T
Q  416 g-ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
    | | |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||   ||||||    
T  30772160 gatggggagaagagagagtttgtcgtgtctgatatattgtggaccatagtctcttctatattg-gatgatcatcaggg-tttttcattattctgttaatg 30772063  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    |  |||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30772062 ggtcatccagacatccactcatattgagtccatatcaa 30772025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 401
Target Start/End: Original strand, 30384383 - 30384652
Alignment:
Q  134 aaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgat 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  30384383 aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacacgattatgatcggatcta-gacatgtctgat 30384481  T
Q  234 ttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatga 332  Q
    ||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||    |||||  || ||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  30384482 ttatcaaggatattaagaataagggtattaagaatacctggatgaagctttcgtgacaactctctcgccatcaacgatctaaaacaaggagaggagatga 30384581  T
Q  333 tctaatccgaa--atacaacaaaggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttatacc 401  Q
    ||||||| |||  | |||||| || |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30384582 tctaatctgaaacacacaacatagcttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatacc 30384652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24054502 - 24054350
Alignment:
Q  121 tttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatcta 220  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24054502 tttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatctatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatcta 24054403  T
Q  221 cgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg--tattaggaatacct 271  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  24054402 cgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggatattaggaatacct 24054350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 28525376 - 28525800
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28525376 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 28525475  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  28525476 tacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 28525572  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || || || ||    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||  | ||| | |||||    
T  28525573 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcag 28525667  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  28525668 atggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 28525765  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  28525766 gccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 28525800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 335
Target Start/End: Original strand, 28531472 - 28531686
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28531472 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 28531571  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  28531572 tacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 28531668  T
Q  318 agagagaggagatgatct 335  Q
    | ||||||||||||||||    
T  28531669 aaagagaggagatgatct 28531686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 555
Target Start/End: Original strand, 19059754 - 19060190
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||  ||| ||||| | ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||    
T  19059754 aatttaggtcttaataaaaacatatttcataaaacgtattcaacgattataaatcattaggggaagcaaacaaaatattaaacatgaatataaacggatc 19059853  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct--taatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaa 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||    ||||||||||| || | | |||||| ||||||| |||         
T  19059854 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattagaaatacctggagatgaagctttggtggcagccctctcgacaacaacgat----- 19059948  T
Q  316 acagagagaggagatgatct-aatccgaaat--acaaca--aaggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttat 410  Q
      | |||||| || |||||| || |  | ||  ||| ||  | |||||| |||   ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||  ||||| |    
T  19059949 --aaagagagaaggtgatctgaaacaaacatccacatcaacacggttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacttttatgcctcaagttct 19060046  T
Q  411 tttca-gttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcat 509  Q
     ||||  | |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | |    
T  19060047 cttcatatcgggagaagagagagtttgtcgtgtctgatgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgt 19060144  T
Q  510 taatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaatta 555  Q
    ||||||  |||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19060145 taatgggacatccagacatccactcatattgagtccatatccatta 19060190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 270
Target Start/End: Original strand, 19066097 - 19066249
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||||    
T  19066097 aatttaagtcttaataaaaacatatttcataaaccatgttcaacgattataaatcattagcggaagcaaacaaaacattaagcatgaatatgaacggatc 19066196  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacc 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19066197 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattatggtattaggaatacc 19066249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26510013 - 26509823
Alignment:
Q  122 ttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctac 221  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||   |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||   | ||||    
T  26510013 ttaggcctaaataaaaacagatttcataaaacatgttcaatcattatgaa---atagtggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatataaactac 26509917  T
Q  222 gacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaa 316  Q
    ||| | ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  26509916 gacatatttgattcatcaaga-tattaagaattaggtattaggaatatatgaatgaagctttgatgacagtcctctcaacatcaacgatctgaaa 26509823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 257
Target Start/End: Original strand, 16215164 - 16215302
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16215164 aatttaggtctttataaaaacagatttcataacacatattcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatttaacatgattatgattggatc 16215263  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg 257  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16215264 tacgaaatgtttgatttatcaaggatattaaaaattagg 16215302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 435
Target Start/End: Original strand, 7389538 - 7389848
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7389538 aatttaggtcttaatataaacaaatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 7389637  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
     ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||||  |  | |  |||||| |||||| |||   || |    
T  7389638 cacgacatgtttgatttatcaaga-tattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagccgctctctcatcaacaacgat---aacc 7389733  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  7389734 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 7389828  T
Q  417 -ttgggagaagagagagttt 435  Q
     | |||||||||||||||||    
T  7389829 atggggagaagagagagttt 7389848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14610320 - 14610188
Alignment:
Q  119 aatttaggtct--acataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattgga 216  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| |||    
T  14610320 aatttaggtcttaacaaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaattaatagcggaagcaaataaaccattgaacatgattatgatcgga 14610221  T
Q  217 tctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaa 249  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14610220 tttacgacatgtttgatttatcaaggatattaa 14610188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41297423 - 41297293
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | ||| |||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41297423 atttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 41297324  T
Q  242 ggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    | ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  41297323 gatataaagaattagggtattaggaatacct 41297293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 449 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 20499982 - 20499880
Alignment:
Q  449 tattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccata 548  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  20499982 tattggggaccatagcctcttatttattg-gatgaccattagggttttc-cattatttcgttaatgggccatccagacatccactca--ttgagtccata 20499887  T
Q  549 tcaatta 555  Q
    |||||||    
T  20499886 tcaatta 20499880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 316
Target Start/End: Original strand, 33753372 - 33753441
Alignment:
Q  247 taataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  33753372 taataattaggtattaggaataccttgatgaagttttgatgacagtcctctcaacaacaacgatatgaaa 33753441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 316
Target Start/End: Original strand, 33849006 - 33849075
Alignment:
Q  247 taataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  33849006 taataattaggtattaggaataccttgatgaagttttgatgacagtcctctcaacaacaacgatatgaaa 33849075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28542336 - 28542269
Alignment:
Q  190 aaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg 257  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28542336 aaaacattgaacatgattatgatcgaaactacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagg 28542269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 37896350 - 37896423
Alignment:
Q  181 gaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatt 254  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||    
T  37896350 gaagtaaataaaatgttgaacatgattatgatcggatctacgacatgattgatttatcaagaatattaataatt 37896423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14609843 - 14609768
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||    
T  14609843 aaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataagtaactaatataatta 14609768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 535
Target Start/End: Original strand, 19066331 - 19066511
Alignment:
Q  354 ggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatatt 452  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| | || | | ||||    
T  19066331 ggttagcggcagctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtccggtgtatt 19066430  T
Q  453 ggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactca 535  Q
    ||||| || | ||| || |||| || ||||  |||||||| |||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||    
T  19066431 ggggaccacaacctattttatattg-gatggtcattaggg-ttttccattatttcgttaatgggtcatccagacatccactca 19066511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20500231 - 20500154
Alignment:
Q  195 attgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattag-gtattaggaatacct 271  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  20500231 attgaacatgattatgatcggatctacgacatacttgatttatcaaggatactaagaattagagtattagaaatacct 20500154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 551 - 640
Target Start/End: Original strand, 30384817 - 30384906
Alignment:
Q  551 aattatctaaatgaaaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| |  ||||| |||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||| || | || ||||| ||| ||||||||||||    
T  30384817 aattatctaattagaaatccaatagccttattacttaatttaatcactaatcaattaaggctcacaactgataaatagctaatataatta 30384906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 7389995 - 7390070
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  7389995 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataatta 7390070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 20499850 - 20499775
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  20499850 aaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatcaattaagactcacaattgataaatagctaatataatta 20499775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 552
Target Start/End: Original strand, 28531714 - 28531896
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttggg-agaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcc 465  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||  | ||| | ||||| |||| ||||||||||||||| | | |  | |||||||| || |||||||    
T  28531714 tgatttgattcttcctcaaccagtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggagaccatagcc 28531813  T
Q  466 tcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  28531814 tcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 28531896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 552
Target Start/End: Original strand, 32097338 - 32097439
Alignment:
Q  449 tattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccata 548  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||    
T  32097338 tattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattagggtttcc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccata 32097435  T
Q  549 tcaa 552  Q
    ||||    
T  32097436 tcaa 32097439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 41296991 - 41296916
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  41296991 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 41296916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 12686639 - 12686701
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  12686639 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 12686701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 12692741 - 12692803
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  12692741 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 12692803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 103; Significance: 8e-51; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 28420949 - 28421375
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28420949 aatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 28421048  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  28421049 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 28421145  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  28421146 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 28421240  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||| | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  28421241 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 28421338  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28421339 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 28421375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 3817301 - 3817725
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3817301 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 3817400  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | |   ||||||| |||||| |||   || |    
T  3817401 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgat---aacc 3817497  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | |||||| |||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  3817498 aaagagagaagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcag 3817592  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  3817593 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 3817690  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  3817691 gccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 3817725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 43540141 - 43539632
Alignment:
Q  132 ataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttg 231  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||    
T  43540141 ataaaaacagatttcatagaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttg 43540042  T
Q  232 atttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagat 330  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||   ||||| ||||||||| |    
T  43540041 atttatcaagaatattaaaaattagggtattatgaatacctggatgaagctttgataacaatcctctcaacaacaacgat---aaacaaagagaggaggt 43539945  T
Q  331 gatctaatccgaaatacaacaaa---ggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttg----ggag 423  Q
    ||  | ||| |||| |||  |||   |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||  ||||| | ||||| ||    ||||    
T  43539944 ga--tgatctgaaacacacaaaatatggttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctaaagttctcttcagatgggaaggag 43539847  T
Q  424 aagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatcta 523  Q
    ||||||||||||| | |    | ||||||||||| |||| |||||| |||| || | |||||||||||| |||| | ||||| | |||||||  |||| |    
T  43539846 aagagagagtttgccgtgcacggtatattggggaccataacctcttttatattg-ggtgaccattaggg-ttttccgttattccgttaatgggtcatcca 43539749  T
Q  524 gccatccactcaaattgagtccatatcaattatctaaa---tgaaaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattg 620  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||   |  |||||||| | | |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | || ||    
T  43539748 gacatccactc--attgagtccatatcaattaattaaatattataaatctaa-aaccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaaatg 43539652  T
Q  621 atagataactaatataatta 640  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  43539651 ataaataattaatataatta 43539632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 351955 - 351532
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  351955 aatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 351856  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||    |||    
T  351855 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat----aac 351760  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
      | ||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  351759 caaaagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 351665  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| || ||||||    
T  351664 atggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccagtaatgg 351567  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  351566 gccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 351532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 552
Target Start/End: Original strand, 3811163 - 3811583
Alignment:
Q  123 taggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacg 222  Q
    |||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3811163 taggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacg 3811262  T
Q  223 acgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagag 321  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | |   ||||||| |||||| |||   ||  | ||    
T  3811263 acatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgat---aacaaaag 3811359  T
Q  322 agaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttg 419  Q
    |||| |||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||  ||||| | ||||| | |    
T  3811360 agagaagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 3811454  T
Q  420 ggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggacca 519  Q
    ||||||||||||||||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||    
T  3811455 ggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattaggg-tttcccattattccgttaatgggcca 3811552  T
Q  520 tctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    ||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  3811553 tccggacatccactc--attgagtccatatcaa 3811583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20239120 - 20238967
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20239120 aatttaggtcttaatataaacaaatttcataaaacatgttcaacaatcatacatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 20239021  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20239020 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 20238967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 339517 - 339387
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  339517 atttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 339418  T
Q  242 ggtattaataattagg-tattaggaatacct 271  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  339417 gatattaagaattaggctattaggaatacct 339387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 271
Target Start/End: Original strand, 35148007 - 35148148
Alignment:
Q  132 ataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttg 231  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||    
T  35148007 ataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacacgtttg 35148106  T
Q  232 atttatcaagggtattaataatta--ggtattaggaatacct 271  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  35148107 atttatcaaggatattaagaattaggggtattaggaatacct 35148148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5849695 - 5849506
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaac-atgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggat 217  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||  ||||||||| ||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  5849695 aatttaggtcttaataaaaacaaattttataaaattatgttcaatgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacataaatatgaacggat 5849596  T
Q  218 ctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  5849595 ctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattaggatattaggaatacctggatgaagctttaatgacagctctctcaacaacaa 5849506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12804169 - 12804016
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  12804169 aatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaagcaaaacattgaacatgaacatgaacggatc 12804070  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  12804069 tacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattagggtattaagaatacct 12804016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 268
Target Start/End: Original strand, 42767299 - 42767435
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||    
T  42767299 taaaaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttga 42767398  T
Q  233 tttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaata 268  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  42767399 tttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 42767435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26383728 - 26383607
Alignment:
Q  186 aaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttg 284  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26383728 aaacaaaatattgaacatgatcatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagcatactaagaattagggtattaggaataccttgatgaagctttg 26383629  T
Q  285 atgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    ||| | | ||||||||||||||    
T  26383628 atggcagccctctcaacaacaa 26383607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 271
Target Start/End: Original strand, 5979178 - 5979317
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| || |||  ||||| ||||| | ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5979178 taaaaacagatttcataatacatgttgaacaatcgtaaatcaatagcgaaagcaaacaaactattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttga 5979277  T
Q  233 tttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    ||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5979278 tttattaaggatgttaagaattagggtattaggaatacct 5979317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 289
Target Start/End: Original strand, 30219269 - 30219407
Alignment:
Q  152 acatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaata 251  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |    
T  30219269 acatgttcaataattatgaatcattagcggaatcaaacaaaacgttgaacatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttattaaagatattaaga 30219368  T
Q  252 atta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgac 289  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || ||||||| |||||    
T  30219369 attatggtattaggaatatctggataaagctttcatgac 30219407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 367 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 5849457 - 5849275
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttggg-agaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcc 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| | | |  | ||||||| ||| |||||||    
T  5849457 tgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttatcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgtacggtatattgaggaccatagcc 5849358  T
Q  466 tcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    |||| |||| || ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||    ||||||||||  |||||||||||||||    
T  5849357 tcttttatattg-gatgaccattaaggtttct-cattattccgttaatggaccatccgaacatccactca--ttgagtccatatcaa 5849275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 281
Target Start/End: Original strand, 22741970 - 22742076
Alignment:
Q  174 aatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaatacctta 273  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||||||      
T  22741970 aatagcggaagcaaactgaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattgaggattaggtattaggaatacctgg 22742068  T
Q  274 atgaagct 281  Q
    ||||||||    
T  22742069 atgaagct 22742076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Original strand, 18666545 - 18666702
Alignment:
Q  178 gtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatga 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||    ||||    
T  18666545 gtggaagcaaacaaaacattgaacttgattatgatcagat-tacgacatgtttgatttagcaatgatattaataattagacattaggaatacacacatga 18666643  T
Q  278 agctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaat 338  Q
    |||| |||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||  ||||  ||||||||||||    
T  18666644 agctctgatgacaaccctctcaccaacaacgatatgaaacatggaga--agatgatctaat 18666702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 339307 - 339126
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttggg-agaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcc 465  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| | |  | ||||||||||| |||  ||    
T  339307 tgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatgacc 339208  T
Q  466 tcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||  |||  ||||||| || |||||| |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  339207 tcttttatattg-gatggccattagg--tttcccattattccagtaatgggccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 339126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 551 - 640
Target Start/End: Original strand, 22742363 - 22742452
Alignment:
Q  551 aattatctaaatgaaaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | | |||||| ||||||||||||||||    
T  22742363 aattatctaattagaaatctaatagccttattacttaattttatcactaatcaactaaggctcacagttgataaataactaatataatta 22742452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 339093 - 339018
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  339093 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctgacaattgataaatagctaatataatta 339018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 351499 - 351424
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  351499 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctgacaattgataaatagctaatataatta 351424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 26381011 - 26380890
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagtt-gggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcc 465  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||  ||||| | ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| ||||| |    
T  26381011 tgatttggttcttcctcaactgctacctttatgcctaaagttttcttcagatcgggagaagagagagtttgtcgtgtctgatgtactggggaccatag-c 26380913  T
Q  466 tcttatatagtgtgatgaccatta 489  Q
    |||| |||| || |||||||||||    
T  26380912 tcttttatattg-gatgaccatta 26380890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 26383381 - 26383306
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  26383381 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 26383306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 26383543 - 26383417
Alignment:
Q  419 gggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggacc 518  Q
    |||||||||||||||||| | | || | | |||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||  |    
T  26383543 gggagaagagagagtttgccgtgtccggtgtattagggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattaggg-tttcccattattccattaatgggtc 26383446  T
Q  519 atctagccatccactcaaattgagtccatat 549  Q
    |||  | |||||||||  |||||||||||||    
T  26383445 atccggacatccactc--attgagtccatat 26383417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 28421419 - 28421481
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  28421419 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 28421481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 551 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 8824536 - 8824448
Alignment:
Q  551 aattatctaaatgaaaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||   ||| |||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  8824536 aattatctaaaagaaa-tctaatatccttattacctaattcgatcattaatcaattaagcctcacaattgataaatagctaatataatta 8824448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 10244324 - 10244751
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10244324 aatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 10244423  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | ||| | ||||||| |||||| |||   || |    
T  10244424 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaagacagccctctcatcaacaacgat---aacc 10244520  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | |||||||||||||| |     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||    
T  10244521 aaagagaggagatgatat-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcag 10244615  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||| | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  10244616 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatg 10244713  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  10244714 ggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 10244751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 10760640 - 10761065
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10760640 aatttaggtcttattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatc 10760739  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  10760740 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 10760836  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  10760837 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcag 10760931  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||||| | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||  |||||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  10760932 atggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggtcattaggg-tttcccattattccgttaatg 10761029  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10761030 ggccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 10761065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 11839715 - 11840142
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11839715 aatttaggtcttaatataaacagatttcatgatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 11839814  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  11839815 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 11839911  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  11839912 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 11840006  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||| | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  11840007 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatg 11840104  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  11840105 ggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 11840142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 10238202 - 10238629
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  10238202 aatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcagatc 10238301  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | ||| | ||||||| |||||| |||   || |    
T  10238302 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaagacagccctctcatcaacaacgat---aacc 10238398  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | |||||||| ||||| |     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||    
T  10238399 aaagagaggatatgatat-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcag 10238493  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||| | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  10238494 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatg 10238591  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  10238592 ggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 10238629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46656850 - 46656633
Alignment:
Q  122 ttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctac 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||| |||||||| || || | |||||| ||||||||    
T  46656850 ttaggtctaaataaaaacatatttcataaaacatgttcaataaatatgaattaatagctgaagtaaataaaacattcaatataattatgatcggatctac 46656751  T
Q  222 gacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacaga 320  Q
    ||  ||||||||||||||| | |||| | ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||| |||||      
T  46656750 gatatgtttgatttatcaatgatattgagaatgagggtattagaaatacctgaatgaagctttcatgacaaccctctcaacaacaacgatctaaaacaag 46656651  T
Q  321 gagaggagatgatctaat 338  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  46656650 gagaggagatgatataat 46656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 8331925 - 8331586
Alignment:
Q  150 aaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaa 249  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8331925 aaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaa 8331826  T
Q  250 taattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatccgaaataca 348  Q
     ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||  |||||| |||   || || ||||||||||||||||||    | | |||    
T  8331825 gaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcgtcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatctaa---aacacaca 8331732  T
Q  349 acaaaggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagtttgtcttttctgat 447  Q
    | | | ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | |    |    
T  8331731 ataga-gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacagt 8331633  T
Q  448 atattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttt 495  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  8331632 gtattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattagggttt 8331586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 495
Target Start/End: Original strand, 38455563 - 38455911
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  38455563 atttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaag 38455662  T
Q  242 ggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatcc 340  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||   | | | ||||||| |||||| |||   || || ||||||||||||||||         
T  38455663 gatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcgaggcagccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatct----- 38455754  T
Q  341 gaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttgt 437  Q
    |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||     
T  38455755 gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgc 38455854  T
Q  438 cttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttt 495  Q
    | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  38455855 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattagggttt 38455911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 49151781 - 49151357
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49151781 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 49151682  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  49151681 tacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 49151585  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| ||    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||  | ||| | |||||    
T  49151584 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcag 49151490  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  49151489 atggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 49151392  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  49151391 gccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 49151357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 49157848 - 49157424
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49157848 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 49157749  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  49157748 tacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 49157652  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| ||    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||  | ||| | |||||    
T  49157651 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcag 49157557  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  49157556 atggggagaagagagagtttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 49157459  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  49157458 gccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 49157424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 552
Target Start/End: Original strand, 42191233 - 42191637
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42191233 atttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 42191332  T
Q  242 ggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatcc 340  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| ||||||  ||   || || ||||||||||||||||         
T  42191333 ggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactat---aaccaaagagaggagatgatct----- 42191424  T
Q  341 gaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttgt 437  Q
    |||| |||  | || ||||| ||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||     
T  42191425 gaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgc 42191524  T
Q  438 cttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaa 537  Q
    | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||      
T  42191525 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatg 42191622  T
Q  538 ttgagtccatatcaa 552  Q
    |||||||||||||||    
T  42191623 ttgagtccatatcaa 42191637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 552
Target Start/End: Original strand, 42197175 - 42197579
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42197175 atttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 42197274  T
Q  242 ggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatcc 340  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| ||||||  ||   || || ||||||||||||||||         
T  42197275 ggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactat---aaccaaagagaggagatgatct----- 42197366  T
Q  341 gaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttgt 437  Q
    |||| |||  | || ||||| ||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||     
T  42197367 gaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgc 42197466  T
Q  438 cttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaa 537  Q
    | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||      
T  42197467 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatg 42197564  T
Q  538 ttgagtccatatcaa 552  Q
    |||||||||||||||    
T  42197565 ttgagtccatatcaa 42197579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 495
Target Start/End: Original strand, 38449076 - 38449424
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  38449076 atttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaag 38449175  T
Q  242 ggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatcc 340  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||  || || ||||   | | | ||||||| |||||| |||   || || ||||||||||||||||         
T  38449176 gatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcgaggcagccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatct----- 38449267  T
Q  341 gaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttgt 437  Q
    |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||     
T  38449268 gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgc 38449367  T
Q  438 cttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttt 495  Q
    | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  38449368 cgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattagggttt 38449424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 495
Target Start/End: Original strand, 17055798 - 17056153
Alignment:
Q  134 aaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgat 233  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17055798 aaaaacagttttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgat 17055897  T
Q  234 ttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatga 332  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||  | | ||||| | |||||| | |   || || ||| |||||||||    
T  17055898 ttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacaacggt---aaccaaagataggagatga 17055994  T
Q  333 tctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagag 430  Q
    |||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  17055995 tct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagag 17056089  T
Q  431 agtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttt 495  Q
    |||||| | | |  ||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  17056090 agtttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatgtccattagggttt 17056153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 10766861 - 10767014
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  10766861 aatttaggtcttattaaaaacaaatttcataatacatgttcaacaattataaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgaccggatc 10766960  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10766961 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 10767014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 11846053 - 11846206
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  || |||||| |||| || | |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11846053 aatttaggtcttaattaaaacagattttataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 11846152  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11846153 tacgacatgtttgatttatcaagtatattaagaattagggtattaggaatacct 11846206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 495
Target Start/End: Original strand, 30051092 - 30051462
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||    
T  30051092 aatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattataatcagatc 30051191  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| || || | ||||| | | ||||  ||   || |    
T  30051192 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcattacagccctctaatcgacaacaat---aacc 30051288  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| | |   ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  30051289 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcgacggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 30051383  T
Q  417 ttggg-agaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttt 495  Q
     |||| ||||||||||||||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  30051384 atgggcagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattagggttt 30051462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 53069044 - 53069198
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  53069044 aatttaggtcttaataaaaacagattttataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 53069143  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta--ggtattaggaatacct 271  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||    
T  53069144 tatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatcaggggtattaagaatacct 53069198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 257
Target Start/End: Original strand, 48128037 - 48128175
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  48128037 aatttaggtctcaataaaaacagatttcatgaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaaacaaacaaaacattgaacatgattatgatcggttc 48128136  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg 257  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  48128137 tacgacatgtttgatttattaagaatattaagaattagg 48128175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 257
Target Start/End: Original strand, 55003402 - 55003540
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  55003402 aatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatc 55003501  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg 257  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  55003502 tacgacatgtttaatttatcaagtatattaagaattagg 55003540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28965020 - 28964868
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||    ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  28965020 taaaaacagatttcataaaacatgttcaacaatg---aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttga 28964924  T
Q  233 tttatcaagggtattaataattaggtattaggaatacct-taatgaagctttgatg 287  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||  |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  28964923 tttatcaaagatatcaatagttagaaattaggaatacctggattgaagctttgatg 28964868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 271
Target Start/End: Original strand, 17593286 - 17593425
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||| ||||||||| | | |||||||| |||  ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  17593286 taaaaatatatttcataatagatgttcaacaatcgtaaatcaatcgcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttaa 17593385  T
Q  233 tttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17593386 tttatcaagaatattaagaattagggtattaggaatacct 17593425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 281
Target Start/End: Original strand, 12108728 - 12108820
Alignment:
Q  189 caaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagct 281  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12108728 caaaacattgaatatgattatgatttgatctaagacatgtttgatttatcaaggatattaacaattaggtattaagaatacctgaatgaagct 12108820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34300605 - 34300501
Alignment:
Q  180 ggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaa 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  34300605 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttataaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaattaa 34300506  T
Q  279 gcttt 283  Q
    |||||    
T  34300505 gcttt 34300501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13445220 - 13445077
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||          ||||| |||||    
T  13445220 aatttaggtctaaataaaaatagatttgatagaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacatt----------atgatcggatc 13445131  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13445130 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 13445077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 552
Target Start/End: Original strand, 26429649 - 26429834
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttggg-agaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagc 464  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||| | | |  | ||||||||||| ||||||    
T  26429649 tgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagc 26429748  T
Q  465 ctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  26429749 ctcttttatactg-gatgaccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagcccatatcaa 26429834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 28964726 - 28964625
Alignment:
Q  447 tatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtcca 546  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||    
T  28964726 tatattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattaggg-tttctcattattccgttaatggaccatccggacatccactc--attgagtcca 28964631  T
Q  547 tatcaa 552  Q
    ||||||    
T  28964630 tatcaa 28964625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 552
Target Start/End: Original strand, 10769201 - 10769384
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttggg-agaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagc 464  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||| | | |  | ||||||||||| ||||||    
T  10769201 tgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagc 10769300  T
Q  465 ctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    ||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10769301 ctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 10769384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 30051548 - 30051623
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  30051548 aaatctaatatctttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 30051623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 53071699 - 53071774
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  53071699 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaataactaatataatta 53071774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 10761098 - 10761173
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10761098 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 10761173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 10769417 - 10769492
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10769417 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 10769492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 24643573 - 24643636
Alignment:
Q  150 aaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgatt 213  Q
    |||||||||||| | || | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24643573 aaacatgttcaacatttatgaatcaatagcggaagtaaataaaacattgaacatgattatgatt 24643636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 28964592 - 28964517
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||| ||| ||| ||||||||||||    
T  28964592 aaatctaataactttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaatttataaatagctaatataatta 28964517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 38449511 - 38449586
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  38449511 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataatta 38449586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 11840186 - 11840248
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  11840186 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 11840248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 26429878 - 26429940
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  26429878 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 26429940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 42191681 - 42191743
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  42191681 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 42191743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 42197623 - 42197685
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  42197623 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 42197685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 34740155 - 34739731
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34740155 aatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcatcaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 34740056  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  34740055 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 34739959  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | |||||| | |||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  34739958 aaagagagaaaatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 34739864  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     |||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||| || |||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  34739863 attgggagaagagagagtttgtcgtgtacggtatattggggaccacagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 34739766  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  34739765 gccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 34739731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 136 - 552
Target Start/End: Original strand, 25387511 - 25387919
Alignment:
Q  136 aaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgattt 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || | | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25387511 aaacagatttcataaaacatgttcaacaaatatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 25387610  T
Q  236 atcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatc 334  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |  || | ||||||| |||||| |||   || || |||||||||||||||    
T  25387611 atcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttaaaaacagccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatc 25387707  T
Q  335 taatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagag 432  Q
    |     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  25387708 t-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 25387802  T
Q  433 t-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatcca 531  Q
    | ||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||  | ||||||    
T  25387803 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccattaatgggccatccggacatcca 25387900  T
Q  532 ctcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    |||  ||| ||||||||||||    
T  25387901 ctc--attaagtccatatcaa 25387919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 123 - 552
Target Start/End: Original strand, 25381529 - 25381952
Alignment:
Q  123 taggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacg 222  Q
    |||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| || | | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25381529 taggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacg 25381628  T
Q  223 acgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagag 321  Q
    |  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||  | || | ||||||| |||||| |||   || || ||    
T  25381629 aaatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgat---aaccaaag 25381725  T
Q  322 agaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttg 419  Q
    ||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | |    
T  25381726 agaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 25381820  T
Q  420 ggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggacc 518  Q
    |||||||||||||| ||| | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||    
T  25381821 ggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccattaatgggcc 25381918  T
Q  519 atctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    |||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  25381919 atccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 25381952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44410179 - 44409993
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  44410179 aatttaggtcttactaaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatc 44410080  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  44410079 tacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta-gtattaggaatacctggataaagcttttatggcagccctctcaacaacaa 44409993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 50306358 - 50306145
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  50306358 aatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattataatcggatc 50306259  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  50306258 tacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 50306163  T
Q  318 agagagaggagatgatct 335  Q
    | ||||||||||||||||    
T  50306162 aaagagaggagatgatct 50306145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 31058213 - 31057789
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31058213 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 31058114  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||| |  || || ||||  |  |   ||||||| |||||| |||   || |    
T  31058113 tacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaagaatacttggataaaacttttgtagcaaccctctcatcaacaacgat---aacc 31058018  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaaggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag- 416  Q
    | ||||||||||||||||||    | | |||| | | ||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||     
T  31058017 aaagagaggagatgatctaa---aacacacaataga-gttagcggcgactgatttggttcttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcaga 31057922  T
Q  417 ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
    | ||||||||||||||| ||||| | |  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  31057921 tggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggatcatagcctcttttatattgt-atggccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 31057824  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
      ||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  31057823 gtcatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 31057789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1078393 - 1078240
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1078393 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattattaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 1078294  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  1078293 tacgacatgtttgatttaccaagaatattaagaattagggtattaagaatacct 1078240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31051680 - 31051561
Alignment:
Q  152 acatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaata 251  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |    
T  31051680 acatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaaga 31051582  T
Q  252 atta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  31051581 attagggtattaagaatacct 31051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 24926745 - 24926897
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  24926745 aatttaggtcttaataaaaacagatt-cataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacattaatatgaacggatc 24926843  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatt-aggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  24926844 tacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattaacgtattaggaatacct 24926897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 24963692 - 24963845
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||  | | | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  24963692 aatttagatcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacgaatatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacggatc 24963791  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatt-aggtattaggaatacct 271  Q
    |||| | ||||||||||||||||  || ||| |||| | |||||||||||||||    
T  24963792 tacgccatgtttgatttatcaagaatagtaagaattaaagtattaggaatacct 24963845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 283
Target Start/End: Original strand, 12183616 - 12183738
Alignment:
Q  161 ataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattag-gta 259  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| | |||    
T  12183616 ataattatgaatcaatagtggaagcaaacaaaatattgaacataattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaatttgagta 12183714  T
Q  260 ttaggaataccttaatgaagcttt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  12183715 ttaggaatacctgaataaagcttt 12183738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 310
Target Start/End: Original strand, 38151988 - 38152151
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||||||  |      |||||||||| |||||||||||||||     
T  38151988 atttcataaaacatgttcaacaattattaatcaacagcggaagcaaacaaaatattgaacatgatca------gatctacgacatgtttgatttatcaaa 38152081  T
Q  242 ggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgat 310  Q
      |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  38152082 catattaagaattagggtattaggaatacctgaatgaaactttgatgacaatcctctcaacaacaatgat 38152151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27955329 - 27955166
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27955329 aatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgtttaataatcataa-tcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 27955231  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatga 288  Q
    ||| || ||||||||     |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| ||||    
T  27955230 tacaacatgtttgat-----aaggatataaataataaggtattaggaagacctggataaagctttcatga 27955166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 552
Target Start/End: Original strand, 8092885 - 8093260
Alignment:
Q  168 taaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataa-ttaggtattaggaa 266  Q
    ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||    
T  8092885 taaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggtatgaggaa 8092984  T
Q  267 taccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaa--aggttagtggca 364  Q
    |||||  || |||||||  |  | | ||||||| |||||| |||   || || ||||| ||||||||||     |||| | |||||  ||||||| |||     
T  8092985 tacctggataaagcttttgtagcagtcctctcatcaacaacgat---aaccaaagagatgagatgatct-----gaaaca-aacaactaggttagcggcg 8093075  T
Q  365 aatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatag 463  Q
      ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| | | |  | ||||||||||| |||||    
T  8093076 gctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgttcggtatattggggaccatag 8093175  T
Q  464 cctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    |||||| |||| | |||||| | |||||| |||  ||||||| | |||||||  ||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  8093176 cctcttttata-tttgatgatcgttaggg-tttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 8093260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 31051472 - 31051289
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttggg-agaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagc 464  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||| | |  | ||||||||||| ||||||    
T  31051472 tgatttggttcttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagc 31051373  T
Q  465 ctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    ||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  31051372 ctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 31051289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27954873 - 27954798
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  27954873 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagcctcacaattgataaataactaatataatta 27954798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 449 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 50306041 - 50305940
Alignment:
Q  449 tattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccata 548  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||    
T  50306041 tattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattagggtttcc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccata 50305944  T
Q  549 tcaa 552  Q
    ||||    
T  50305943 tcaa 50305940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 354 - 555
Target Start/End: Original strand, 24926980 - 24927177
Alignment:
Q  354 ggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatatt 452  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||  ||||| | ||||| | |||||||||||||||||  |   | ||   ||||    
T  24926980 ggttagtggcagctgatttggttcttcctcaaccggtacctatatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttccacgtatggagtatt 24927079  T
Q  453 ggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    ||| | ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| ||||| || |||||||    |||||||||||||| |    
T  24927080 gggaaccatagcctcttttatattg-gatgaccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccagacatccac---cattgagtccatatcca 24927174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 576 - 640
Target Start/End: Original strand, 24964163 - 24964227
Alignment:
Q  576 ctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  24964163 ctttattacttaatttgatcactaatcaattaaggcttcaaattgataaatagctaatataatta 24964227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 565 - 637
Target Start/End: Original strand, 33458357 - 33458429
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataa 637  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||    
T  33458357 aaatctaatagcattattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataaccaatataa 33458429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 436
Target Start/End: Original strand, 24963928 - 24964011
Alignment:
Q  354 ggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagtttg 436  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||  | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  24963928 ggttagtggaaactgatttggttcttcctcaaccagtacatttatgcctcaagtcctcttcagatggggagaagagagagtttg 24964011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 44409708 - 44409637
Alignment:
Q  569 ctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  44409708 ctaatagccttattacctaatttaatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 44409637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 1077943 - 1077881
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  1077943 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 1077881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 25275507 - 25275569
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  25275507 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 25275569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 25381996 - 25382058
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  25381996 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 25382058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 25387963 - 25388025
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||||    
T  25387963 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataaataatataatta 25388025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38597 - 38362
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||||  || |||||| || ||||||| | ||||||||||| |||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||    
T  38597 aatttaggattaaataaaaccagatttcataagacatgttcaatcattagaaatcaacagtggaagcaaacaaaacattgaacatagttatgatcggatc 38498  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaaca 318  Q
    ||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   | |||||||||||||||||| |||||    
T  38497 tacaacatgtttg-tttatcaagaatattaataattaggtattaggaatacctggatgaagctttgacgacaatcatctcaacaacaatgatctaaaaca 38399  T
Q  319 gagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaagg 355  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  38398 aggagaggagattatctaatctgaaatacaataaagg 38362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 8650793 - 8651218
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8650793 aatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 8650892  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  8650893 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 8650989  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  8650990 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 8651084  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  8651085 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattaggg-tttcccattattccgttaatg 8651182  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | |||||  | |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  8651183 ggccatccggacatccactc--attaagtccatatcaa 8651218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 32035276 - 32035429
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32035276 aatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 32035375  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32035376 tacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacct 32035429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 268
Target Start/End: Original strand, 21782743 - 21782893
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21782743 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 21782842  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaata 268  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  21782843 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 21782893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 133 - 306
Target Start/End: Original strand, 21770562 - 21770734
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  21770562 taaaaacagatttcataatacatgatcaacaatcgtaaattaatagaggaagtaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttga 21770661  T
Q  233 tttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  21770662 tttatcaaggatatcaagaatta-gtattaggaatatctgaataaagcttttatggcagccctctcaacaacaa 21770734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 4580311 - 4580738
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| || | | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4580311 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 4580410  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||  | ||   ||||||| |||||| |||   || |    
T  4580411 tacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacaaccctctcatcaacaacgat---aacc 4580507  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| ||   | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  4580508 aaagagaggagatgatct-----gaaacacgcaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 4580602  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||| | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  4580603 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccattaatg 4580700  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    |  ||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  4580701 ggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 4580738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 119 - 269
Target Start/End: Original strand, 8662771 - 8662922
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8662771 aatttagctcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 8662870  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaatac 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8662871 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatac 8662922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 495
Target Start/End: Original strand, 31756220 - 31756580
Alignment:
Q  134 aaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgat 233  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| || |  ||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||     
T  31756220 aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacaacggaagcaaataaaacattgaacatgattataatcggatctacgacatgtttgaa 31756319  T
Q  234 ttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatga 332  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||  ||  |||||| ||||| | |||||||||| |||  ||   | ||||||||||||| |||    
T  31756320 ttatcaaggatattaagaattagggtattatgaatatctggatagagctttcatgacagccctctcaacagcaaccat---acacagagagaggaggtga 31756416  T
Q  333 tctaatccgaaatacaaca---aaggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagag 428  Q
      | ||| |||| |||  |   | |||||| |||   ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||| | ||||| | ||||||||||    
T  31756417 --tgatctgaaacacacaatatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaacaggtacctttatacctcaagttctcttcagatggggagaagag 31756514  T
Q  429 agagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttt 495  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  31756515 agagtttgtcgtgtttgatatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattagggttt 31756580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 25354366 - 25353954
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  25354366 taaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaagcattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttga 25354267  T
Q  233 tttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatg 331  Q
    |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||  |  | | ||||||| |||||| |||   || || ||||||||||||    
T  25354266 tttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatg 25354171  T
Q  332 atctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagaga 429  Q
    ||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | |||||||||||    
T  25354170 atct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 25354076  T
Q  430 gagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccat 528  Q
    |||| ||||| | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||| | |||  ||||||| | ||||||| |||||  |  ||    
T  25354075 gagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata-ttagatgaccattagag-tttcccattattccgttaatgggccatccggatat 25353978  T
Q  529 ccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    |||||||  |||||||||||||||    
T  25353977 ccactcatgttgagtccatatcaa 25353954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 306
Target Start/End: Original strand, 21783348 - 21783485
Alignment:
Q  168 taaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaat 267  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  21783348 taaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta-gtattaggaat 21783446  T
Q  268 accttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |   ||||||||||||||    
T  21783447 acctgaataaagcttttatggcacccctctcaacaacaa 21783485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 306
Target Start/End: Original strand, 21789571 - 21789708
Alignment:
Q  168 taaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaat 267  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  21789571 taaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta-gtattaggaat 21789669  T
Q  268 accttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |   ||||||||||||||    
T  21789670 acctgaataaagcttttatggcacccctctcaacaacaa 21789708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 25343759 - 25343368
Alignment:
Q  153 catgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataa 252  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||    
T  25343759 catgttcaacaatcgtaaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatttttgatttatcaa-gatattaagaa 25343661  T
Q  253 ttag-gtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatccgaaatacaaca 351  Q
    |||| |||||||||||||||  || |||||||  |  | | ||| ||| |||||| |||   || || ||||||||||||||||     |||| |||  |    
T  25343660 ttagagtattaggaatacctagataaagcttttgtagcagccctttcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatct-----gaaacacacaa 25343569  T
Q  352 aag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgata 448  Q
     || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| | |  | |     
T  25343568 tagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtg 25343469  T
Q  449 tattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccata 548  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||    ||||||||||  |||||||||||    
T  25343468 tattgggga-catagcctcttttatattg-gatgaccattaggg-tttcccattattccgttaatggaccatccgaacatccactcatgttgagtccata 25343372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17581795 - 17581491
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  17581795 aatttagatctaaataaaaacataattcataaaacatgttcaactattatgaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattattataggatc 17581696  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||| ||||         ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||| | ||||||||||||||  |   || |     
T  17581695 tacgacatgtttgatttaccaag---------aattagggtattaggaatacctggataaagctttcatgacagccctctcaacaacaacaa--cgacaa 17581607  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaaggttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag- 416  Q
     |||||||||| |||||| |  |   | ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||  ||||| | |||||     
T  17581606 ggagagaggaggtgatctgaagc---aaacatcaacggttagtggcagctgatttggttcttcctcaacttgtacatttatgcctcaagttctcttcaga 17581510  T
Q  417 ttgggagaagagagagttt 435  Q
    | |||||||||||||||||    
T  17581509 tggggagaagagagagttt 17581491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 21190856 - 21191009
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||   || ||||| ||||||| ||| |||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21190856 aatttaggtcttattataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 21190955  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||  | ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21190956 tacgatatatttgatttatcaaagatattaagaattagggtattagaaatacct 21191009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 306
Target Start/End: Original strand, 21197025 - 21197197
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||| || |||||||    
T  21197025 taaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacaacatgtttga 21197124  T
Q  233 tttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||  || || |||| ||| | | ||||||||||||||    
T  21197125 tttatcaaggatatcaagaatta-gtattatgaatacctggataaatcttttatggcagccctctcaacaacaa 21197197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18778753 - 18778631
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaa-catgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggat 217  Q
    |||||||||||  || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  18778753 aatttaggtcttaattaaaacaaatttcataaaaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacgttgaacataattatgatcggat 18778654  T
Q  218 ctacgacgtgtttgatttatcaa 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  18778653 ctacgacgtatttgatttatcaa 18778631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6098091 - 6097999
Alignment:
Q  174 aatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatac 269  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  6098091 aatagcggaagtagacaaaacattgaacatgaa---gaacggatctacgacgtgtttgatttatcaa-gatgttaagaattagggtattaggaatac 6097999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 256
Target Start/End: Original strand, 34603337 - 34603457
Alignment:
Q  135 aaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatt 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||  || |||| | ||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| | | |||||||||    
T  34603337 aaaacatatttaataaaacatgtgtaacaattatgaataaatagcg-aagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatt 34603435  T
Q  235 tatcaagggtattaataattag 256  Q
    |||||||| |||||| ||||||    
T  34603436 tatcaaggatattaacaattag 34603457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 256
Target Start/End: Original strand, 34724614 - 34724734
Alignment:
Q  135 aaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatt 234  Q
    ||||||||||| || ||||||||  || |||| | ||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| | | |||||||||    
T  34724614 aaaacatatttaataaaacatgtgtaacaattatgaataaatagcg-aagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatt 34724712  T
Q  235 tatcaagggtattaataattag 256  Q
    |||||||| |||||| ||||||    
T  34724713 tatcaaggatattaacaattag 34724734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 21771012 - 21771087
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  21771012 aaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 21771087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1106299 - 1106222
Alignment:
Q  203 tgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatt--aggtattaggaataccttaatgaa 278  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  1106299 tgaacatgatcggatctacaacatgtttgattcatcaagaatattaataattcaaggtattaggaatacctcaatgaa 1106222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 30906028 - 30906103
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| || |||| || ||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  30906028 aaatctaatagccttattactttatttggttactaatcaactaaggctcacaattgataaataactaatataatta 30906103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 4580782 - 4580844
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  4580782 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 4580844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 552
Target Start/End: Original strand, 21197354 - 21197455
Alignment:
Q  447 tatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtcca 546  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||  ||||||| | ||||||| |||||  | |||||||||  ||||||||||    
T  21197354 tatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccatta-ggttttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc--attgagtcca 21197449  T
Q  547 tatcaa 552  Q
    ||||||    
T  21197450 tatcaa 21197455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 25343326 - 25343264
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  25343326 ttattacttaatttaatcactaatcaattaaggttcacaattgataaatagctaatataatta 25343264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 25353912 - 25353850
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  25353912 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 25353850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Original strand, 21191332 - 21191393
Alignment:
Q  579 tattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  21191332 tattacttaatttgatcactaatcaattaaggctctaaattgataaataactaatataatta 21191393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 496
Target Start/End: Original strand, 1198 - 1555
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||    
T  1198 taaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaaaggcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgatatgtttga 1297  T
Q  233 tttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatg 331  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | |   ||||||| |||||| |||   || || ||||||||||||    
T  1298 tttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatg 1394  T
Q  332 atctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagaga 429  Q
    ||||     |||| |||  | || ||||| ||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||| | ||||| | |||||||||||    
T  1395 atct-----gaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 1489  T
Q  430 gagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggtttt 496  Q
    |||||||   | | |||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| |||||||| ||||    
T  1490 gagtttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggatttt 1555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 32897182 - 32896755
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32897182 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 32897083  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | |||   ||||||| ||||||  ||   || |    
T  32897082 tacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagacaaccctctcatcaacaacaat---aacc 32896986  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||| ||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  32896985 aaagagatgagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 32896891  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  32896890 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatg 32896793  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  32896792 ggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 32896755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9935448 - 9935295
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  9935448 aatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatc 9935349  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9935348 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 9935295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 32891058 - 32890631
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32891058 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 32890959  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | |   ||||||| ||||||  ||   || |    
T  32890958 tacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacaat---aacc 32890862  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||| ||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  32890861 aaagagatgagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 32890767  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  32890766 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatg 32890669  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  32890668 ggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 32890631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 36819140 - 36818715
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| || |||| | |||||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  36819140 aatttaggtcttaatataaacaaatctcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagtggaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatc 36819041  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||  |  | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  36819040 tacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagccgccctctcatcaacaacgat---aacc 36818945  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| |  ||||    
T  36818944 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcatcag 36818850  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||  ||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  36818849 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata-tttgatagccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 36818752  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  36818751 gccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 36818715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 306
Target Start/End: Original strand, 22219702 - 22219896
Alignment:
Q  115 ttagaatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaac-aaaacattgaacatgaatatgatt 213  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||  |||| |||  ||||| |||||||||| ||||||     
T  22219702 ttagaatttaggtcttaataaaaagagatttcataaaacatgttcaatagttatgaatcaatagcagaagaaaaagaaaactttgaacatgattatgatc 22219801  T
Q  214 ggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct-taatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  22219802 ggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggattgaagctttgatggcagccctctcaacaacaa 22219896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7771401 - 7771248
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7771401 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 7771302  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  7771301 tacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaagaatacct 7771248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 552
Target Start/End: Original strand, 5542183 - 5542575
Alignment:
Q  152 acatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaata 251  Q
    |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  5542183 acatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaaga 5542282  T
Q  252 atta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatccgaaatacaac 350  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || || |||| |||||||||||     |||| |||      
T  5542283 attagggtattaggaatacctagataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aaccaaagaggggagatgatct-----gaaacacaca 5542374  T
Q  351 aaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgat 447  Q
    | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||| | | |  | |    
T  5542375 atagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggt 5542474  T
Q  448 atattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccat 547  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||  ||||  | |||||||||  |||||||||||    
T  5542475 gtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactc--attgagtccat 5542570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14418107 - 14417957
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||   ||| | | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14418107 aatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgtt---taactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 14418011  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14418010 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 14417957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 283
Target Start/End: Original strand, 42993008 - 42993158
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  42993008 taaaaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttga 42993107  T
Q  233 tttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagcttt 283  Q
    |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  42993108 tttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaataccttgataaagcttt 42993158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 14799406 - 14799558
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14799406 aatttaggtcttaatataaacaaatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 14799505  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14799506 tacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacct 14799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 271
Target Start/End: Original strand, 39735555 - 39735695
Alignment:
Q  132 ataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttg 231  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  39735555 ataaaaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagtaaataaaatattgaacatgattatgattgtatctacgacatgtttg 39735654  T
Q  232 atttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    ||||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||    
T  39735655 atttatcaaagatattaagaactagggtataaggaatacct 39735695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 1882741 - 1882933
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacata-aaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggat 217  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1882741 aatttaggtcttaatataaaacagatttcatagaacatgttcaacaattaagaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacggat 1882840  T
Q  218 ct-acgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct--taatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    || | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||    |||||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  1882841 ctaatgacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctggagatgaagctttcatggcagccctctcaacaacaa 1882933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 10705998 - 10705583
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgatt------ggatctacgacgt 226  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| || |||  ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||| |    
T  10705998 taaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtaaatcaatagcgtaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattatgatcggatctacgacat 10705899  T
Q  227 gtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagag 325  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| |||||  || |||||||  |  | | ||||||| |||||| |||   || || ||||||    
T  10705898 gtttgatttatcaaga-tattaagaattagggtattaggattacctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagag 10705803  T
Q  326 gagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggag 423  Q
    ||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||| |||||  | |||||| | ||||| | |||||    
T  10705802 gagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatggcttaagttctcttcagatggggag 10705708  T
Q  424 aagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatct 522  Q
    |||||||||| ||||| | |  | |||||||| || ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||  ||| ||||||| | ||||||| |||||     
T  10705707 aagagagagtattgtcgtgtacggtatattggagaccatagcctcttttata-tttgatgactattaggg--tttccattattccgttaatgggccatcc 10705611  T
Q  523 agccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  10705610 ggacatccactc--attgagtccatatcaa 10705583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10700127 - 10700049
Alignment:
Q  190 aaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaata 268  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  10700127 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaata 10700049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 552
Target Start/End: Original strand, 22219959 - 22220142
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttggg-agaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagc 464  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||| | | |  | ||||||||||| ||||||    
T  22219959 tgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagc 22220058  T
Q  465 ctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22220059 ctcttttatattg-gatgaccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccattc--attgagtccatatcaa 22220142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 551 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 42033523 - 42033434
Alignment:
Q  551 aattatctaaatgaaaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  42033523 aattatctaattagaaatctaataaccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 42033434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 367 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 42033728 - 42033600
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttgg-gagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcc 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| | | |   || ||||||||| |||||||    
T  42033728 tgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaagagagagtttgccgtgtacaatgtattggggaccatagcc 42033629  T
Q  466 tcttatatagtgtgatgaccattagggttt 495  Q
    || | |||| || |||||||||||||||||    
T  42033628 tcctttatattg-gatgaccattagggttt 42033600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 9934984 - 9934920
Alignment:
Q  576 ctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  9934984 ctttattacttaatttgatcactaatcaattaagactcacaattgataaataactaatataatta 9934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Original strand, 39727323 - 39727403
Alignment:
Q  132 ataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgat 212  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39727323 ataaaaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaataacggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgat 39727403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 10705550 - 10705475
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10705550 aaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 10705475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14417673 - 14417598
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  14417673 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaataactaatataatta 14417598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 42993460 - 42993522
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  42993460 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataatta 42993522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 10699741 - 10699666
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | | |||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||    
T  10699741 aaatctaatagcctaattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataactagtataatta 10699666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14417868 - 14417765
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcc 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | |  | | ||||||||| |||||||    
T  14417868 tgatttggttcttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcc 14417769  T
Q  466 tctt 469  Q
    ||||    
T  14417768 tctt 14417765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 39727732 - 39727807
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  39727732 aaatttaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagtctcacaattgataaatagctaatataatta 39727807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 5542622 - 5542684
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  5542622 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctctaaattgataaataactaatataatta 5542684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24250257 - 24250171
Alignment:
Q  134 aaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatcta 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || || | | ||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||    
T  24250257 aaaaacatatttcataaaacatgttgaacaaatatgaatcaatagcggaaacaaacaaaatattgaacattattatgatcggatcta 24250171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 32896711 - 32896649
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  32896711 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 32896649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 36818671 - 36818609
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  36818671 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 36818609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Original strand, 31399062 - 31399119
Alignment:
Q  154 atgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatga 211  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  31399062 atgttcaataattatgaatcaatagtggaggcaaacaatacattgaacatgattatga 31399119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 28682935 - 28683359
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28682935 aatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 28683034  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | |||   ||||||| |||||| |||   || |    
T  28683035 tacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagacaaccctctcatcaacaacgat---aacc 28683131  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    |  |||||  ||||||||     |||| |||  | || ||||   ||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  28683132 aaggagagtggatgatct-----gaaacacacaatagagttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 28683226  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | |||||||    
T  28683227 atggggagaagagagagtttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgg 28683324  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
     |||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  28683325 gccatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 28683359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 36750584 - 36750157
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  36750584 aatttaagtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 36750485  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||| ||  | | ||||| | |||||| |||   || |    
T  36750484 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgat---aacc 36750388  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||  ||||| | |||||    
T  36750387 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcag 36750293  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||||| | |  | | |||||| || ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  36750292 atggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggagaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatg 36750195  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  36750194 ggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 36750157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 35090639 - 35090792
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  35090639 aatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 35090738  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattag-gtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35090739 tacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacct 35090792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13456246 - 13455842
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13456246 atttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 13456147  T
Q  242 ggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatcc 340  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| ||||||  ||   || || ||||||||||||||||         
T  13456146 ggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactat---aaccaaagagaggagatgatct----- 13456055  T
Q  341 gaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttgt 437  Q
    |||| |||  | || ||||| ||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||     
T  13456054 gaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgc 13455955  T
Q  438 cttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaa 537  Q
    | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||      
T  13455954 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatg 13455857  T
Q  538 ttgagtccatatcaa 552  Q
    |||||||||||||||    
T  13455856 ttgagtccatatcaa 13455842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13462187 - 13461783
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13462187 atttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 13462088  T
Q  242 ggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatcc 340  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| ||||||  ||   || || ||||||||||||||||         
T  13462087 ggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactat---aaccaaagagaggagatgatct----- 13461996  T
Q  341 gaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttgt 437  Q
    |||| |||  | || ||||| ||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||     
T  13461995 gaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgc 13461896  T
Q  438 cttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaa 537  Q
    | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||      
T  13461895 cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatg 13461798  T
Q  538 ttgagtccatatcaa 552  Q
    |||||||||||||||    
T  13461797 ttgagtccatatcaa 13461783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 271
Target Start/End: Original strand, 35084657 - 35084819
Alignment:
Q  110 tattgttagaatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatat 209  Q
    |||||||  |||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  35084657 tattgttcaaatttaggtcttaatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattat 35084756  T
Q  210 gattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattag-gtattaggaatacct 271  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35084757 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacct 35084819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31002532 - 31002381
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  31002532 taaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttga 31002433  T
Q  233 tttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagcttt 283  Q
    |||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31002432 tttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttt 31002381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31008510 - 31008359
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  31008510 taaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttga 31008411  T
Q  233 tttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagcttt 283  Q
    |||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31008410 tttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttt 31008359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 13149676 - 13149828
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13149676 aatttaggtcttaatataaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 13149775  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  13149776 tacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaagaatacct 13149828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30965483 - 30965344
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  30965483 taaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttga 30965384  T
Q  233 tttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    ||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30965383 tttatcaattattttaagaattagggtattaggaatacct 30965344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 44716794 - 44716948
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaac-aaaacattgaacatgaatatgattggat 217  Q
    |||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||   || | ||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44716794 aatttaggtcttaataaaaacagatatcataaaacatgttcaacggttatcaatcaatagcggaagcaaaagaaaacattgaacatgattatgatcggat 44716893  T
Q  218 ctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  44716894 ctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 44716948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 11048543 - 11048731
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||   |||||| | ||||||| |||||||| ||| |||| | ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  11048543 aatttaggtcttattaaaaataaatttcataaaacatgtccaacaattatgaatcaatagctgaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattggata 11048642  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    |||| | |||||||| || ||||| |||||| ||||| || | ||||||||| |  || ||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  11048643 tacgtcatgtttgatgtaccaaggatattaagaattagggcactaggaatacttggataaagcttttatgacagccctctcgacaacaa 11048731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 29833377 - 29833175
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||||| || ||| ||| | ||||||| | ||||||| ||||||| | ||| ||||  ||||  ||| |||| ||||||||| | |||||| |||||    
T  29833377 aatttaggtataaatataaagagatttcataatacatgtttaataattgtgaatcaataacggaaacaaataaaatattgaacataattatgatcggatc 29833278  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaaca 318  Q
     || || ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||    
T  29833277 gacaacatgtttgatttatcaa-gataacaataattaggtattaagaatacctggatgaag-tttgatgacaaccctctcaacaacaacgatctgaatca 29833180  T
Q  319 gagag 323  Q
    |||||    
T  29833179 gagag 29833175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 236
Target Start/End: Original strand, 35438715 - 35438816
Alignment:
Q  135 aaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatt 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | || | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35438715 aaaacaaatttcataaaacatgttcaacagttatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatt 35438814  T
Q  235 ta 236  Q
    ||    
T  35438815 ta 35438816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23343707 - 23343579
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||   ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23343707 atttcataaaacatgttcaacgattacgaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacgaatctacgacatgtttgatttatcaag 23343608  T
Q  242 ggtattaataatt-aggtattaggaatac 269  Q
    | |||||| | ||  ||||||||||||||    
T  23343607 gatattaagagttggggtattaggaatac 23343579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 552
Target Start/End: Original strand, 35084911 - 35085096
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcagttggg-agaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagc 464  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||| | | |  | ||||||||||| ||||||    
T  35084911 tgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagc 35085010  T
Q  465 ctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    ||||| |||| || |||  ||||||||||||   ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  35085011 ctcttttatattg-gatagccattagggtttcc-cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 35085096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 7771634 - 7771709
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  7771634 aaatctaatagctttattacttaatttgatcagtaatcaactaagacttacaattgataaatagctaatataatta 7771709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 28683392 - 28683467
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| |  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  28683392 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaataactaatataatta 28683467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 30965253 - 30965146
Alignment:
Q  369 atttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcct 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||| | |  | ||||||||||| ||||||||    
T  30965253 atttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcct 30965154  T
Q  467 cttatata 474  Q
    ||| ||||    
T  30965153 cttttata 30965146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 35439818 - 35439893
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||| ||| || | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  35439818 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaatcaaggctcacaattgataaataacgaatataatta 35439893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 44717253 - 44717328
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  44717253 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataatta 44717328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 13455798 - 13455736
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  13455798 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 13455736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 13461739 - 13461677
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  13461739 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 13461677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 23283942 - 23283880
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  23283942 ttattacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaataactaatataatta 23283880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 35085140 - 35085202
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  35085140 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 35085202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Original strand, 35091113 - 35091175
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  35091113 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 35091175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 436
Target Start/End: Original strand, 35438937 - 35439007
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagtttg 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  35438937 tgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttg 35439007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 36750113 - 36750051
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  36750113 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 36750051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5704 - 5490
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  5704 aatttagctcttgatataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 5605  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  5604 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aacc 5508  T
Q  318 agagagaggagatgatct 335  Q
    | ||||||||||||||||    
T  5507 aaagagaggagatgatct 5490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 531
Target Start/End: Original strand, 33458271 - 33458662
Alignment:
Q  133 taaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttga 232  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||||| |||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  33458271 taaaaacagatttcataatatatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttga 33458370  T
Q  233 tttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatg 331  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||||  |  | | ||||||| |||||| |||   || || ||||| ||||||    
T  33458371 tttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcttagcagccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagatgagatg 33458467  T
Q  332 atctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagaga 429  Q
    ||||     |||| |||  | || ||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| | ||||| | |||||||||||    
T  33458468 atct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttctttctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagaga 33458562  T
Q  430 gagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatc 529  Q
     |||||||| | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||| || ||||    
T  33458563 aagtttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccgttaggg-tttcgcattatttcgttaatgggccatccagacatc 33458660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 24288133 - 24287730
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24288133 atttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgtatctacgacatgtttgatttatcaag 24288034  T
Q  242 ggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatcc 340  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||  || || |||| ||  | | ||||| | |||||| |||   || || ||||||||||||||||         
T  24288033 gttattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatct----- 24287942  T
Q  341 gaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttgt 437  Q
    |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||     
T  24287941 gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgc 24287842  T
Q  438 cttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaa 537  Q
    | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||      
T  24287841 cgtgtacggtgtattgggga-catagcctcttttatattg-gatgaccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatg 24287745  T
Q  538 ttgagtccatatcaa 552  Q
    |||||||||||||||    
T  24287744 ttgagtccatatcaa 24287730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Original strand, 10733253 - 10733389
Alignment:
Q  136 aaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgattt 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10733253 aaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 10733352  T
Q  236 atcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10733353 atcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 10733389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Original strand, 10739346 - 10739482
Alignment:
Q  136 aaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgattt 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10739346 aaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 10739445  T
Q  236 atcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10739446 atcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 10739482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Original strand, 10947022 - 10947158
Alignment:
Q  136 aaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgattt 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10947022 aaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 10947121  T
Q  236 atcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10947122 atcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 10947158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Original strand, 10953115 - 10953251
Alignment:
Q  136 aaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgattt 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10953115 aaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 10953214  T
Q  236 atcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10953215 atcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 10953251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 306
Target Start/End: Original strand, 26963331 - 26963517
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||    
T  26963331 aatttaggtcttaataaaaacaaatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatc 26963430  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaa 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||  || ||||||| |||   | ||||||||||||||    
T  26963431 tacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta-gtattaggaatacctggataaagcttttatggtagccctctcaacaacaa 26963517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3769710 - 3769568
Alignment:
Q  145 tcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggt 244  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | ||| |||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  3769710 tcataaaatatgttcaataattatgaatcaataatttaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttcattaatcaaggat 3769611  T
Q  245 attaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  3769610 attaataattaggtattaggaatacttgaatgaggctttgatg 3769568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 555
Target Start/End: Original strand, 6257195 - 6257622
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| ||| | ||||||| | |||||||||| |||  ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6257195 aatttaggtcttaatataaatagatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 6257294  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    ||| || ||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||||  |  | | ||||||| |||||| |||   || |    
T  6257295 tacaacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattaggatattaggaatacctggataaagctttcgtagcagccctctcatcaacaacgat---aacc 6257391  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | || |||||||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  6257392 aaagtgaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcag 6257486  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||| | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||    
T  6257487 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattaggg--tttccattattccgttaatg 6257583  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaatta 555  Q
    | |||||  |  ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  6257584 ggccatccggatatccactc--attgagcccatatcaatta 6257622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 50168762 - 50168610
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| ||| ||||| |||||| |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||     
T  50168762 aatttaggtcttaataaaaccagattacataaaacacgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgaata 50168663  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  50168662 tacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattaggtataaggaatacct 50168610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 48161125 - 48160704
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||| ||| ||||||||  ||    ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  48161125 aatttaggtcttaataaaaatagatttcataaaatatgttcaactatg---aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatc 48161029  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  | || | ||||||| |||||| |||   || |    
T  48161028 tacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgat---aacc 48160933  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| ||| | | ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  48160932 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcag 48160838  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  48160837 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata-tttgatggccattaggg-tttcccattattccgttaatg 48160740  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | |||||    |||||||||  ||||||||||||||||    
T  48160739 ggccatccgaacatccactc--attgagtccatatcaa 48160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 48167344 - 48166923
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||| ||| ||||||||  ||    ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  48167344 aatttaggtcttaataaaaatagatttcataaaatatgttcaactatg---aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatc 48167248  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  | || | ||||||| |||||| |||   || |    
T  48167247 tacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgat---aacc 48167152  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | ||||||||||||||||     |||| |||  | || ||||| ||| | | ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  48167151 aaagagaggagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcag 48167057  T
Q  417 -ttgggagaagagagagt-ttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatg 514  Q
     | ||||||||||||||| ||| | | |  | ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  48167056 atggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatg 48166959  T
Q  515 gaccatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | |||||    |||||||||  ||||||||||||||||    
T  48166958 ggccatccgaacatccactc--attgagtccatatcaa 48166923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 49976743 - 49976548
Alignment:
Q  132 ataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttg 231  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| | |||  |||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  49976743 ataaaaacaaatttcataaaacatattcaacaattatgaatcgatagcgaaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttg 49976644  T
Q  232 atttatcaagggtattaataattag-gtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagat 330  Q
    |||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||   ||||| ||||||||| |    
T  49976643 atttatcaagg---ataataattagagtattaggaatacc-agatgaagctttgataacactcctctcaacaacaacgat---aaacaaagagaggaggt 49976551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 268
Target Start/End: Original strand, 33461418 - 33461532
Alignment:
Q  154 atgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataat 253  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| |||    
T  33461418 atgttcaacaatcgtaaatcaatagtggaagcaaacaaaacattgaacatgattatggtcggatttacgacatgtttgatttatcaa-gatattaagaat 33461516  T
Q  254 ta-ggtattaggaata 268  Q
    || |||||||||||||    
T  33461517 tagggtattaggaata 33461532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 44831677 - 44831806
Alignment:
Q  194 cattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacggg 292  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || || ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||       
T  44831677 cattgaacatgaatatgatcgaatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaactagggtattaagaatacctagatgaagctttgataacaac 44831776  T
Q  293 cctctcaacaacaatgatctgaaacagagagag 325  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  44831777 cctctcaacaacaacgat---aaacagagagag 44831806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 322
Target Start/End: Original strand, 31986748 - 31986844
Alignment:
Q  226 tgtttgatttatcaagggtattaataattaggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagaga 322  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||    
T  31986748 tgtttgatttatcaaggataacaataattaggtattaggaatatctgaatgaagttttgatggcggccctttcaacaacaacgatatgaatcagaga 31986844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9237501 - 9237398
Alignment:
Q  150 aaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtattaa 249  Q
    ||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  9237501 aaacatgttcaatgattatgaatgaatagtcgaagcaaacagaacattgaatatgattatgctcggatttacgacatgtttgatttatcaagtatattaa 9237402  T
Q  250 taat 253  Q
    ||||    
T  9237401 taat 9237398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4632956 - 4632870
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatga 205  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4632956 aatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattattaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatga 4632870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Original strand, 26956819 - 26956929
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| | |||||  |||||    
T  26956819 aatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataagtatgaacggatc 26956918  T
Q  219 tacgacgtgtt 229  Q
    |||||| ||||    
T  26956919 tacgacatgtt 26956929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 551 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 50426973 - 50426884
Alignment:
Q  551 aattatctaaatgaaaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||||||||    
T  50426973 aattatctcattgaaaatttaataactttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacacttgataaataactaatataatta 50426884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 311
Target Start/End: Original strand, 19686338 - 19686510
Alignment:
Q  139 catatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatc 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||| | | ||| || |||||||| || || |||||| |||    
T  19686338 catatttcataaaacatgttcaataactataaatcaataacggaagcaaacaaaatattgaacgtaattatcatcggatctacaacatgcttgattaatc 19686437  T
Q  239 aagggtattaataatt-aggtattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatc 311  Q
    |||  |||||| ||||  ||||||| ||||| || ||  ||||||||||||| | | | |||||| ||||||||    
T  19686438 aagcatattaagaattcgggtattatgaata-ctgaacaaagctttgatgacagacatttcaacagcaatgatc 19686510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 6257652 - 6257727
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  6257652 aaatctaatagctttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 6257727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 552
Target Start/End: Original strand, 26971869 - 26971969
Alignment:
Q  447 tatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaaattgagtcca 546  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||| ||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  26971869 tatattggggaccatagtctcttttatattg-gatggccattagggtttc--cattattccgttaatggaccatccagacatccactc--attgagtcca 26971963  T
Q  547 tatcaa 552  Q
    ||||||    
T  26971964 tatcaa 26971969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 26972002 - 26972077
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  26972002 aaatctaatatccttatcacttaatttgatcactaatcaattaagactcacaattgataaatagctaatataatta 26972077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 551 - 640
Target Start/End: Original strand, 17627208 - 17627297
Alignment:
Q  551 aattatctaaatgaaaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| || ||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||| || || | ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17627208 aattatctaattggaaatctaataggcttattacttaatttaatcactaatcaattcagactcacaatcgataaatagctaatataatta 17627297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 495
Target Start/End: Original strand, 33461624 - 33461752
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcc 465  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||  | | |  | ||||||||||| |||||||    
T  33461624 tgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttcttttcagatggggagaagagagagtttaccgtgtacggtatattggggaccatagcc 33461723  T
Q  466 tcttatatagtgtgatgaccattagggttt 495  Q
    |||| |||| || ||||| ||| |||||||    
T  33461724 tcttttatattg-gatgatcatcagggttt 33461752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 551 - 640
Target Start/End: Original strand, 44832048 - 44832137
Alignment:
Q  551 aattatctaaatgaaaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| | |||||| |||||||  ||||||||||| ||||   || |||||||| ||||||||||||||||    
T  44832048 aattatctaattaaaaatcttataaccttattacttaatttgatcactaatcaactaagatctataattgataaataactaatataatta 44832137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4632482 - 4632438
Alignment:
Q  197 tgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaag 241  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4632482 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 4632438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 217
Target Start/End: Original strand, 55473135 - 55473230
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggat 217  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||   ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||    
T  55473135 aatttaggtcttaatagaaacaaatttcataaaatatgttcaataa---taaatcaatagcggaagcaaataaaatattgaatatgattatgattggat 55473230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 10733797 - 10733872
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10733797 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 10733872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 10739784 - 10739859
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10739784 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 10739859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 10947566 - 10947641
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10947566 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 10947641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 10953553 - 10953628
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10953553 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 10953628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50427493 - 50427427
Alignment:
Q  170 aattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttat 237  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  50427493 aattaatagtggaagcaatcaaaacattgaa-atgattatgatcggatgtacgacatgtttaatttat 50427427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 4632074 - 4632012
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  4632074 ttattacttaatttgattactaatcaattaagacttcaaattgataaataactaatataatta 4632012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 6670 - 6265
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattt-taaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaa 240  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||||||||||    
T  6670 atttcataaaccatgttcaacaatttatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgactgaatctacaacatgtttgatttatcaa 6571  T
Q  241 gggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatc 339  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || || ||||||||||||||||        
T  6570 ggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatct---- 6478  T
Q  340 cgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttg 436  Q
     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||    
T  6477 -gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattg 6379  T
Q  437 tcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaa 536  Q
     | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||     
T  6378 ccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat 6281  T
Q  537 attgagtccatatcaa 552  Q
     |||||||||||||||    
T  6280 gttgagtccatatcaa 6265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 12543 - 12138
Alignment:
Q  142 atttcattaaacatgttcaataattt-taaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaa 240  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  12543 atttcataaaccatattcaacaatttatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaa 12444  T
Q  241 gggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaacagagagaggagatgatctaatc 339  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||| ||  || ||||||| | | | | ||||||| |||||| |||   || || ||||||||||||||||        
T  12443 ggatattaagaattaggctattaggaatatctggataaagctttcaaggcagtcctctcatcaacaacgat---aaccaaagagaggagatgatct---- 12351  T
Q  340 cgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagt-ttg 436  Q
     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||    
T  12350 -gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattg 12252  T
Q  437 tcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatggaccatctagccatccactcaa 536  Q
     | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||  ||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||     
T  12251 ccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatggccattaggg-tttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat 12154  T
Q  537 attgagtccatatcaa 552  Q
     |||||||||||||||    
T  12153 gttgagtccatatcaa 12138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 6221 - 6159
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  6221 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctttaaattgataaataactaatataatta 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 12094 - 12032
Alignment:
Q  578 ttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  12094 ttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataatta 12032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 271
Target Start/End: Original strand, 612 - 762
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||   ||| | | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  612 aatttaggtcttaataaaaacagatttcataaaacatgtt---taactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatc 708  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataatta-ggtattaggaatacct 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  709 tacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacct 762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 1046 - 1121
Alignment:
Q  565 aaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  1046 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaataactaatataatta 1121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 469
Target Start/End: Original strand, 851 - 954
Alignment:
Q  367 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag-ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcc 465  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||| | ||||| | |||||||||||||||||| | | |  | | ||||||||| |||||||    
T  851 tgatttggttcttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcc 950  T
Q  466 tctt 469  Q
    ||||    
T  951 tctt 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6063 - 5945
Alignment:
Q  148 ttaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatctacgacgtgtttgatttatcaagggtatt 247  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||    
T  6063 ttaaacatgttcaataattattaatcaatagcggcattaaacaaaacattgaacatgaatatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaaaatatt 5964  T
Q  248 aataattaggtattaggaa 266  Q
    | |||||||||||||||||    
T  5963 attaattaggtattaggaa 5945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 5665 - 5604
Alignment:
Q  579 tattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  5665 tattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataatta 5604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 552
Target Start/End: Original strand, 172880 - 173304
Alignment:
Q  119 aatttaggtctacataaaaacatatttcattaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagtaaacaaaacattgaacatgaatatgattggatc 218  Q
    |||||||||||  ||| |||||  |||||| |||||||||| | |||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  172880 aatttaggtcttaatataaacaggtttcataaaacatgttctacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcggatc 172979  T
Q  219 tacgacgtgtttgatttatcaagggtattaataattagg-tattaggaataccttaatgaagctttgatgacgggcctctcaacaacaatgatctgaaac 317  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |  || ||||||| | ||  | ||||| | |||||| |||   || |    
T  172980 tacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaattaggatattaggaatacatggataaagctttcaagatagccctcttatcaacaacgat---aacc 173076  T
Q  318 agagagaggagatgatctaatccgaaatacaacaaag-gttagtggcaaatgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttattttcag 416  Q
    | |||||| |||||||||     |||| |||  | || ||||| |||   ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||  ||||| | |||||    
T  173077 aaagagagaagatgatct-----gaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcag 173171  T
Q  417 -ttgggagaagagagagtttgtcttttctgatatattggggatcatagcctcttatatagtgtgatgaccattagggttttttcattatttcattaatgg 515  Q
     | |||||||||||||||||| | | |  | | ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||| |    
T  173172 atggggagaagagagagtttgccgtatacggtgtattggggaccatagcctcttttatattg-gatgaccattaggg-tttcccattattccgttaatag 173269  T
Q  516 accatctagccatccactcaaattgagtccatatcaa 552  Q
    | ||||  | |||||||||  ||||||||||||||||    
T  173270 aacatccggacatccactc--attgagtccatatcaa 173304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 792 - 700
Alignment:
Q  548 atcaattatctaaatgaaaatctaatatctttattagttaatttagtcactaatcaattaagtcttagaattgatagataactaatataatta 640  Q
    ||||||||||| | |  |||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  792 atcaattatctgattttaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgataaataactaatataatta 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University