View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4532-Insertion-2 (Length: 652)

Name: NF4532-Insertion-2
Description: NF4532
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4532-Insertion-2
NF4532-Insertion-2
[»] chr1 (128 HSPs)
chr1 (8-652)||(38925465-38926085)
chr1 (112-644)||(13214834-13215375)
chr1 (99-652)||(39462258-39462816)
chr1 (99-652)||(15823286-15823843)
chr1 (156-652)||(41646717-41647217)
chr1 (98-649)||(10399815-10400370)
chr1 (99-649)||(51749778-51750333)
chr1 (99-649)||(28840418-28840973)
chr1 (98-652)||(3579601-3580160)
chr1 (98-649)||(13761576-13762130)
chr1 (156-652)||(28207052-28207550)
chr1 (98-649)||(51752103-51752657)
chr1 (98-649)||(20302197-20302752)
chr1 (98-649)||(28842232-28842788)
chr1 (225-647)||(6822881-6823306)
chr1 (229-652)||(14097953-14098380)
chr1 (300-652)||(17324620-17324976)
chr1 (99-632)||(47451405-47451919)
chr1 (304-652)||(18307054-18307406)
chr1 (300-652)||(6995684-6996040)
chr1 (301-652)||(12302489-12302849)
chr1 (300-652)||(47906205-47906567)
chr1 (303-652)||(50307529-50307884)
chr1 (345-649)||(15294821-15295128)
chr1 (303-652)||(50076656-50077009)
chr1 (303-647)||(2617460-2617808)
chr1 (345-652)||(16428640-16428951)
chr1 (300-646)||(24325597-24325954)
chr1 (305-649)||(39932017-39932368)
chr1 (300-652)||(28998237-28998593)
chr1 (300-652)||(29003953-29004309)
chr1 (300-649)||(31735508-31735865)
chr1 (303-652)||(18839531-18839885)
chr1 (132-557)||(6823656-6824091)
chr1 (300-649)||(2510312-2510668)
chr1 (300-652)||(2949216-2949571)
chr1 (324-652)||(31424999-31425335)
chr1 (303-652)||(50078804-50079158)
chr1 (304-652)||(25251258-25251611)
chr1 (303-652)||(11457459-11457812)
chr1 (277-649)||(16226085-16226461)
chr1 (350-649)||(46431693-46431996)
chr1 (303-652)||(31489859-31490209)
chr1 (303-652)||(17186111-17186465)
chr1 (300-652)||(27336924-27337282)
chr1 (301-652)||(9241069-9241425)
chr1 (304-652)||(17318838-17319184)
chr1 (301-652)||(6756469-6756825)
chr1 (345-652)||(25127859-25128170)
chr1 (277-649)||(47179627-47180006)
chr1 (292-649)||(20291390-20291750)
chr1 (305-600)||(21948225-21948526)
chr1 (300-652)||(27339115-27339474)
chr1 (345-651)||(4131360-4131673)
chr1 (303-652)||(50248554-50248909)
chr1 (277-649)||(47177276-47177655)
chr1 (300-649)||(9463231-9463590)
chr1 (300-649)||(9459404-9459763)
chr1 (303-652)||(17324009-17324359)
chr1 (299-645)||(31422851-31423215)
chr1 (300-573)||(48665112-48665393)
chr1 (351-651)||(40133937-40134241)
chr1 (349-652)||(16432396-16432693)
chr1 (277-637)||(42922151-42922514)
chr1 (98-635)||(30790401-30790936)
chr1 (449-652)||(16429048-16429255)
chr1 (425-647)||(25248540-25248766)
chr1 (303-652)||(14183574-14183923)
chr1 (299-640)||(49495206-49495540)
chr1 (382-652)||(15669376-15669648)
chr1 (301-610)||(8347298-8347608)
chr1 (438-652)||(6115086-6115304)
chr1 (454-637)||(23785935-23786121)
chr1 (299-572)||(18800640-18800910)
chr1 (450-649)||(51757623-51757824)
chr1 (425-649)||(16231630-16231856)
chr1 (340-652)||(8349035-8349347)
chr1 (499-652)||(23816027-23816183)
chr1 (309-572)||(13125525-13125787)
chr1 (437-637)||(16561545-16561751)
chr1 (99-216)||(49687301-49687418)
chr1 (440-610)||(30738653-30738830)
chr1 (440-612)||(155788-155963)
chr1 (440-652)||(26613223-26613440)
chr1 (309-547)||(26520205-26520449)
chr1 (381-652)||(28279292-28279566)
chr1 (384-637)||(27916525-27916780)
chr1 (275-397)||(16231517-16231640)
chr1 (98-216)||(6822774-6822893)
chr1 (583-649)||(13358800-13358867)
chr1 (530-637)||(15916562-15916674)
chr1 (98-246)||(47177077-47177224)
chr1 (304-397)||(25248756-25248850)
chr1 (98-166)||(47179427-47179495)
chr1 (246-315)||(49687427-49687496)
chr1 (98-166)||(14098443-14098511)
chr1 (458-640)||(21353342-21353525)
chr1 (447-608)||(43104248-43104414)
chr1 (98-246)||(16225886-16226034)
chr1 (440-572)||(14353047-14353178)
chr1 (440-515)||(26332613-26332688)
chr1 (455-517)||(4144804-4144865)
chr1 (458-640)||(2393277-2393461)
chr1 (455-517)||(2232597-2232658)
chr1 (455-517)||(14997040-14997101)
chr1 (99-164)||(20291280-20291345)
chr1 (608-649)||(13447260-13447301)
chr1 (382-482)||(26332719-26332814)
chr1 (458-517)||(2401342-2401400)
chr1 (458-517)||(9526469-9526527)
chr1 (135-206)||(14098382-14098453)
chr1 (458-517)||(25134074-25134132)
chr1 (99-239)||(23783238-23783378)
chr1 (99-145)||(41646681-41646727)
chr1 (299-337)||(43104099-43104137)
chr1 (566-634)||(13598402-13598471)
chr1 (104-145)||(28207540-28207581)
chr1 (302-334)||(23783494-23783526)
chr1 (277-333)||(27916415-27916471)
chr1 (440-550)||(49959129-49959241)
chr1 (458-517)||(9521718-9521776)
chr1 (300-331)||(46432037-46432068)
chr1 (454-496)||(10115880-10115922)
chr1 (132-166)||(16231374-16231408)
chr1 (277-331)||(26613549-26613603)
chr1 (278-331)||(49958963-49959016)
chr1 (566-636)||(9526578-9526650)
chr1 (99-147)||(13461344-13461392)
[»] chr4 (151 HSPs)
chr4 (98-652)||(48486112-48486670)
chr4 (153-652)||(24880299-24880803)
chr4 (98-652)||(36919566-36920126)
chr4 (99-652)||(36921475-36922033)
chr4 (152-652)||(24878836-24879341)
chr4 (99-652)||(619430-619986)
chr4 (103-652)||(24888594-24889147)
chr4 (101-649)||(22802719-22803270)
chr4 (101-652)||(40091397-40091952)
chr4 (102-649)||(5198217-5198768)
chr4 (212-649)||(47274634-47275073)
chr4 (103-649)||(37089357-37089910)
chr4 (98-649)||(22044376-22044931)
chr4 (98-649)||(38408992-38409552)
chr4 (101-649)||(51015042-51015593)
chr4 (99-649)||(31849584-31850138)
chr4 (99-573)||(5637529-5638006)
chr4 (99-649)||(9148054-9148600)
chr4 (225-652)||(22800844-22801274)
chr4 (98-573)||(3824634-3825113)
chr4 (206-649)||(22046671-22047116)
chr4 (98-649)||(11006222-11006782)
chr4 (225-649)||(11434875-11435302)
chr4 (301-652)||(40637070-40637425)
chr4 (303-652)||(38928159-38928513)
chr4 (98-649)||(9174131-9174685)
chr4 (301-649)||(14633316-14633666)
chr4 (98-649)||(18846922-18847500)
chr4 (301-649)||(8631404-8631760)
chr4 (226-649)||(7941240-7941671)
chr4 (303-652)||(19095880-19096234)
chr4 (300-649)||(24348209-24348566)
chr4 (303-652)||(12395827-12396180)
chr4 (304-652)||(33415470-33415821)
chr4 (303-652)||(12400789-12401142)
chr4 (300-640)||(14787423-14787771)
chr4 (304-652)||(37313047-37313400)
chr4 (301-649)||(6764835-6765192)
chr4 (301-647)||(47868397-47868747)
chr4 (301-652)||(36378288-36378644)
chr4 (300-652)||(17662227-17662576)
chr4 (300-649)||(44599823-44600176)
chr4 (301-649)||(2484858-2485210)
chr4 (301-652)||(16453305-16453661)
chr4 (275-649)||(16934128-16934506)
chr4 (307-637)||(41997494-41997828)
chr4 (104-559)||(52942537-52943002)
chr4 (304-630)||(56030443-56030770)
chr4 (291-647)||(9176461-9176821)
chr4 (275-649)||(11008553-11008933)
chr4 (275-649)||(16931774-16932152)
chr4 (377-649)||(26085962-26086236)
chr4 (351-637)||(22134615-22134901)
chr4 (345-649)||(18709149-18709455)
chr4 (300-637)||(22132389-22132737)
chr4 (309-652)||(19322701-19323046)
chr4 (345-649)||(22780358-22780665)
chr4 (345-649)||(22782723-22783030)
chr4 (304-614)||(13543953-13544272)
chr4 (380-652)||(36380425-36380701)
chr4 (300-649)||(53405122-53405481)
chr4 (209-652)||(8756233-8756679)
chr4 (417-652)||(16455354-16455591)
chr4 (303-637)||(18409344-18409681)
chr4 (300-630)||(47210756-47211084)
chr4 (389-652)||(27499130-27499393)
chr4 (303-637)||(18537470-18537806)
chr4 (447-652)||(2891434-2891643)
chr4 (452-652)||(13547302-13547505)
chr4 (303-532)||(3937314-3937543)
chr4 (303-522)||(6132871-6133090)
chr4 (481-651)||(4215483-4215656)
chr4 (384-637)||(38890221-38890476)
chr4 (303-637)||(18534828-18535164)
chr4 (299-599)||(15032584-15032875)
chr4 (499-649)||(5635461-5635614)
chr4 (498-649)||(11437557-11437710)
chr4 (392-652)||(30136640-30136901)
chr4 (505-652)||(5101130-5101279)
chr4 (439-637)||(12102221-12102425)
chr4 (303-465)||(24446756-24446914)
chr4 (303-465)||(38270158-38270321)
chr4 (384-637)||(28453767-28454020)
chr4 (439-637)||(31983524-31983727)
chr4 (300-440)||(5100992-5101133)
chr4 (440-652)||(25357772-25357994)
chr4 (455-637)||(16185831-16186018)
chr4 (454-610)||(3982200-3982362)
chr4 (277-570)||(40999017-40999308)
chr4 (384-637)||(9863791-9864049)
chr4 (440-572)||(47150959-47151092)
chr4 (303-421)||(2891314-2891434)
chr4 (552-652)||(47563009-47563112)
chr4 (99-282)||(9176852-9177035)
chr4 (524-652)||(24446636-24446754)
chr4 (99-216)||(7941133-7941251)
chr4 (99-216)||(11434769-11434887)
chr4 (384-628)||(10112952-10113198)
chr4 (571-640)||(14789422-14789494)
chr4 (98-246)||(16932213-16932361)
chr4 (440-599)||(9022438-9022603)
chr4 (458-637)||(31300427-31300608)
chr4 (596-652)||(52942470-52942526)
chr4 (566-652)||(6133101-6133188)
chr4 (526-641)||(49088791-49088911)
chr4 (98-166)||(22780885-22780953)
chr4 (99-166)||(16934647-16934714)
chr4 (99-166)||(22783250-22783317)
chr4 (132-216)||(22801262-22801346)
chr4 (455-650)||(5336764-5336964)
chr4 (458-640)||(15316961-15317145)
chr4 (599-652)||(3937256-3937309)
chr4 (581-634)||(54867188-54867241)
chr4 (202-298)||(11008932-11009028)
chr4 (458-637)||(16489352-16489533)
chr4 (458-517)||(25699752-25699810)
chr4 (455-517)||(4570094-4570155)
chr4 (455-517)||(7050378-7050439)
chr4 (455-517)||(11853549-11853610)
chr4 (299-337)||(25357631-25357669)
chr4 (458-640)||(8529270-8529455)
chr4 (98-166)||(22048508-22048576)
chr4 (454-568)||(54906737-54906852)
chr4 (616-651)||(3824593-3824628)
chr4 (458-517)||(4556180-4556238)
chr4 (458-517)||(4558314-4558372)
chr4 (458-517)||(18586969-18587027)
chr4 (277-331)||(52043737-52043791)
chr4 (455-517)||(55822265-55822326)
chr4 (418-482)||(10114443-10114505)
chr4 (566-640)||(4884986-4885062)
chr4 (458-640)||(16688934-16689119)
chr4 (300-332)||(22134936-22134968)
chr4 (566-634)||(31985658-31985726)
chr4 (458-517)||(15831144-15831202)
chr4 (454-517)||(29609591-29609654)
chr4 (492-527)||(38270120-38270155)
chr4 (458-517)||(47566496-47566554)
chr4 (299-337)||(16186138-16186176)
chr4 (455-513)||(16638827-16638884)
chr4 (566-634)||(10047383-10047452)
chr4 (300-329)||(18709480-18709509)
chr4 (275-332)||(22780687-22780744)
chr4 (275-332)||(22783052-22783109)
chr4 (566-634)||(39245998-39246067)
chr4 (461-516)||(3760105-3760161)
chr4 (458-490)||(4884877-4884909)
chr4 (586-640)||(18587098-18587154)
chr4 (299-331)||(28453681-28453713)
chr4 (566-640)||(36769591-36769667)
chr4 (586-652)||(55822396-55822464)
[»] chr5 (149 HSPs)
chr5 (98-652)||(21947769-21948323)
chr5 (103-649)||(4236374-4236922)
chr5 (99-649)||(38881845-38882399)
chr5 (99-650)||(16775897-16776452)
chr5 (225-649)||(25921458-25921886)
chr5 (243-652)||(2818317-2818731)
chr5 (225-649)||(2174785-2175212)
chr5 (98-652)||(36402310-36402846)
chr5 (225-652)||(6756360-6756789)
chr5 (305-652)||(18511194-18511547)
chr5 (301-642)||(10529091-10529436)
chr5 (98-652)||(12555905-12556442)
chr5 (301-652)||(39854426-39854780)
chr5 (345-649)||(25804012-25804318)
chr5 (301-652)||(40221464-40221820)
chr5 (345-652)||(16092181-16092492)
chr5 (300-652)||(26097674-26098028)
chr5 (303-652)||(1189589-1189949)
chr5 (303-652)||(24126800-24127153)
chr5 (303-652)||(25904047-25904400)
chr5 (303-652)||(17072827-17073181)
chr5 (300-649)||(18468948-18469303)
chr5 (275-649)||(31544996-31545374)
chr5 (202-649)||(21684437-21684897)
chr5 (349-651)||(6745060-6745364)
chr5 (304-649)||(18466625-18466978)
chr5 (305-652)||(18509300-18509652)
chr5 (275-649)||(31542651-31543028)
chr5 (306-652)||(10474305-10474655)
chr5 (227-652)||(31465971-31466389)
chr5 (300-648)||(18596588-18596939)
chr5 (301-651)||(17818475-17818826)
chr5 (303-652)||(31472594-31472948)
chr5 (99-440)||(20507659-20508001)
chr5 (300-649)||(27910386-27910744)
chr5 (300-649)||(27912471-27912830)
chr5 (380-652)||(658338-658610)
chr5 (302-637)||(31179368-31179707)
chr5 (345-649)||(34477038-34477346)
chr5 (301-651)||(6747246-6747600)
chr5 (345-649)||(34479403-34479711)
chr5 (301-640)||(37705774-37706117)
chr5 (303-652)||(695833-696175)
chr5 (303-652)||(39397975-39398327)
chr5 (311-652)||(2954368-2954713)
chr5 (436-652)||(20505825-20506042)
chr5 (345-649)||(15552232-15552539)
chr5 (303-572)||(34530731-34531001)
chr5 (310-652)||(21288715-21289058)
chr5 (425-652)||(41585726-41585956)
chr5 (300-649)||(10586780-10587126)
chr5 (420-652)||(2723964-2724190)
chr5 (303-516)||(20042994-20043208)
chr5 (437-649)||(39798126-39798341)
chr5 (425-649)||(4410090-4410316)
chr5 (308-637)||(6661181-6661512)
chr5 (303-520)||(20044954-20045172)
chr5 (454-641)||(10749796-10749986)
chr5 (439-644)||(36208656-36208865)
chr5 (454-641)||(10757273-10757462)
chr5 (454-649)||(23665140-23665337)
chr5 (454-649)||(23793250-23793447)
chr5 (300-509)||(26098379-26098589)
chr5 (454-649)||(15354560-15354757)
chr5 (454-649)||(15356836-15357033)
chr5 (98-235)||(20504316-20504453)
chr5 (454-649)||(3373122-3373320)
chr5 (345-652)||(20053834-20054134)
chr5 (454-649)||(38960117-38960314)
chr5 (382-652)||(9020246-9020517)
chr5 (461-649)||(23741844-23742034)
chr5 (400-572)||(17413232-17413402)
chr5 (440-637)||(15143547-15143750)
chr5 (98-216)||(659712-659829)
chr5 (99-216)||(2818729-2818847)
chr5 (98-216)||(31466379-31466497)
chr5 (484-573)||(42770936-42771025)
chr5 (546-652)||(26098270-26098380)
chr5 (227-329)||(39797956-39798058)
chr5 (99-193)||(18186493-18186587)
chr5 (455-637)||(15445263-15445453)
chr5 (458-572)||(4897828-4897943)
chr5 (101-216)||(6756257-6756372)
chr5 (98-298)||(31544797-31544997)
chr5 (98-246)||(34477485-34477633)
chr5 (572-652)||(20043206-20043287)
chr5 (299-526)||(42770714-42770934)
chr5 (98-166)||(34479905-34479973)
chr5 (440-637)||(34033563-34033768)
chr5 (98-163)||(21684905-21684970)
chr5 (454-638)||(23667415-23667601)
chr5 (99-216)||(25921874-25921992)
chr5 (301-397)||(4409999-4410100)
chr5 (99-216)||(2174680-2174797)
chr5 (99-282)||(31542442-31542625)
chr5 (99-190)||(39797849-39797940)
chr5 (440-598)||(2144599-2144763)
chr5 (400-517)||(4754198-4754312)
chr5 (99-158)||(661227-661286)
chr5 (454-512)||(29748443-29748502)
chr5 (455-517)||(1170811-1170872)
chr5 (455-517)||(31782578-31782639)
chr5 (455-517)||(35385573-35385634)
chr5 (99-246)||(10749505-10749652)
chr5 (455-516)||(16093413-16093473)
chr5 (278-331)||(29748260-29748313)
chr5 (303-374)||(36208524-36208597)
chr5 (275-331)||(34477379-34477435)
chr5 (458-517)||(25452498-25452556)
chr5 (455-517)||(2298122-2298183)
chr5 (300-334)||(3373345-3373379)
chr5 (455-517)||(10627364-10627425)
chr5 (98-246)||(10756959-10757107)
chr5 (98-246)||(15354918-15355066)
chr5 (98-246)||(15357194-15357342)
chr5 (98-147)||(31179885-31179934)
chr5 (300-397)||(41585946-41586044)
chr5 (460-517)||(25445501-25445557)
chr5 (299-331)||(2144899-2144931)
chr5 (302-334)||(10757207-10757239)
chr5 (302-334)||(15354786-15354818)
chr5 (302-334)||(15357062-15357094)
chr5 (302-334)||(23665081-23665113)
chr5 (302-334)||(23793474-23793506)
chr5 (454-517)||(32520533-32520597)
chr5 (275-331)||(34479740-34479796)
chr5 (440-572)||(35430259-35430394)
chr5 (302-334)||(38960346-38960378)
chr5 (98-153)||(38960550-38960605)
chr5 (566-640)||(42238372-42238448)
chr5 (300-331)||(15552176-15552207)
chr5 (300-331)||(25803957-25803988)
chr5 (458-517)||(28786407-28786465)
chr5 (455-517)||(1240428-1240489)
chr5 (566-650)||(26406451-26406536)
chr5 (154-215)||(659869-659929)
chr5 (129-178)||(10282269-10282318)
chr5 (566-634)||(17003984-17004053)
chr5 (98-246)||(23667108-23667256)
chr5 (302-334)||(10749730-10749762)
chr5 (528-572)||(20045210-20045254)
chr5 (586-640)||(22672966-22673022)
chr5 (99-166)||(23664834-23664901)
chr5 (202-246)||(23664937-23664981)
chr5 (302-334)||(23667356-23667388)
chr5 (302-334)||(23742069-23742101)
chr5 (202-246)||(23793606-23793650)
chr5 (99-166)||(23793686-23793753)
chr5 (586-640)||(25445628-25445684)
[»] chr7 (136 HSPs)
chr7 (99-652)||(27306214-27306767)
chr7 (99-652)||(31435028-31435586)
chr7 (98-649)||(35378-35933)
chr7 (99-649)||(3878322-3878881)
chr7 (98-649)||(44313-44868)
chr7 (99-647)||(25542281-25542830)
chr7 (225-647)||(1049283-1049708)
chr7 (303-652)||(20137091-20137444)
chr7 (225-649)||(40836728-40837156)
chr7 (303-652)||(44724533-44724886)
chr7 (300-652)||(13099456-13099814)
chr7 (300-649)||(38393933-38394290)
chr7 (300-652)||(443546-443903)
chr7 (303-652)||(24748548-24748902)
chr7 (301-649)||(48457601-48457957)
chr7 (300-652)||(42330979-42331337)
chr7 (303-652)||(4295916-4296271)
chr7 (305-649)||(7470007-7470359)
chr7 (345-652)||(20626035-20626345)
chr7 (345-652)||(20629926-20630236)
chr7 (345-652)||(20642345-20642655)
chr7 (305-649)||(7471965-7472317)
chr7 (336-652)||(21592125-21592444)
chr7 (303-652)||(11355212-11355565)
chr7 (300-649)||(20299405-20299764)
chr7 (347-649)||(40946327-40946632)
chr7 (99-466)||(18567363-18567731)
chr7 (304-652)||(21990106-21990457)
chr7 (300-649)||(18345488-18345845)
chr7 (279-649)||(31155896-31156271)
chr7 (300-648)||(3035668-3036027)
chr7 (303-652)||(21678020-21678371)
chr7 (303-652)||(21679981-21680337)
chr7 (304-650)||(37412109-37412462)
chr7 (300-649)||(20297309-20297666)
chr7 (98-541)||(26804344-26804765)
chr7 (345-649)||(1849978-1850285)
chr7 (303-652)||(39145968-39146322)
chr7 (300-647)||(28485513-28485867)
chr7 (303-652)||(9680768-9681127)
chr7 (345-647)||(1046912-1047216)
chr7 (300-649)||(28487500-28487857)
chr7 (303-652)||(42223110-42223465)
chr7 (304-652)||(9679009-9679366)
chr7 (309-652)||(24258423-24258775)
chr7 (418-649)||(7092198-7092431)
chr7 (303-652)||(25276095-25276437)
chr7 (300-649)||(43253502-43253862)
chr7 (300-649)||(7351637-7351996)
chr7 (300-573)||(11757175-11757455)
chr7 (300-649)||(7349262-7349617)
chr7 (287-572)||(22251611-22251893)
chr7 (354-640)||(27832631-27832916)
chr7 (299-595)||(22828672-22828972)
chr7 (418-649)||(7094445-7094678)
chr7 (299-599)||(20091583-20091880)
chr7 (299-572)||(7188493-7188763)
chr7 (426-649)||(38396713-38396938)
chr7 (305-599)||(24817389-24817682)
chr7 (377-652)||(24813480-24813755)
chr7 (454-637)||(2935374-2935560)
chr7 (454-649)||(22137184-22137381)
chr7 (454-649)||(40552211-40552408)
chr7 (202-495)||(22392326-22392608)
chr7 (454-649)||(22108173-22108370)
chr7 (454-649)||(40549933-40550130)
chr7 (454-637)||(1606486-1606671)
chr7 (454-637)||(9027191-9027376)
chr7 (502-652)||(22393876-22394030)
chr7 (304-637)||(24465503-24465829)
chr7 (493-640)||(26295592-26295743)
chr7 (299-637)||(6332176-6332514)
chr7 (478-572)||(6348912-6349006)
chr7 (377-652)||(11081540-11081817)
chr7 (440-637)||(16297018-16297222)
chr7 (99-190)||(1049722-1049813)
chr7 (440-517)||(11084467-11084544)
chr7 (583-649)||(11759364-11759431)
chr7 (98-246)||(1047356-1047504)
chr7 (488-610)||(6046633-6046759)
chr7 (597-652)||(26804762-26804817)
chr7 (409-572)||(6048932-6049094)
chr7 (447-546)||(40281468-40281568)
chr7 (249-329)||(45366446-45366526)
chr7 (455-640)||(25351353-25351539)
chr7 (455-640)||(25357047-25357233)
chr7 (455-640)||(25410130-25410318)
chr7 (99-216)||(40837144-40837261)
chr7 (455-517)||(21369642-21369703)
chr7 (348-409)||(38396316-38396377)
chr7 (440-517)||(26210631-26210710)
chr7 (458-640)||(44512520-44512704)
chr7 (455-517)||(2120899-2120960)
chr7 (455-517)||(3320171-3320232)
chr7 (455-517)||(3324919-3324980)
chr7 (455-649)||(7069780-7069975)
chr7 (455-517)||(7074787-7074848)
chr7 (455-517)||(25405393-25405454)
chr7 (455-517)||(42006663-42006724)
chr7 (99-246)||(2935070-2935217)
chr7 (99-246)||(9027540-9027687)
chr7 (305-397)||(7094662-7094759)
chr7 (300-350)||(1606421-1606472)
chr7 (458-517)||(30246973-30247031)
chr7 (455-517)||(8378625-8378686)
chr7 (455-517)||(15541116-15541177)
chr7 (98-246)||(22136877-22137025)
chr7 (299-360)||(30906327-30906389)
chr7 (98-246)||(40551904-40552052)
chr7 (566-631)||(55955-56020)
chr7 (464-649)||(6067183-6067373)
chr7 (455-496)||(12310157-12310198)
chr7 (616-649)||(22251570-22251603)
chr7 (302-334)||(2935306-2935338)
chr7 (566-640)||(7464513-7464589)
chr7 (302-334)||(9027408-9027440)
chr7 (302-334)||(22108114-22108146)
chr7 (302-334)||(22137125-22137157)
chr7 (566-640)||(34546874-34546950)
chr7 (302-334)||(40549874-40549906)
chr7 (302-334)||(40552152-40552184)
chr7 (458-506)||(44143997-44144045)
chr7 (97-246)||(22107865-22108014)
chr7 (458-517)||(34546984-34547042)
chr7 (300-331)||(38396237-38396268)
chr7 (97-246)||(40549625-40549774)
chr7 (202-329)||(42006420-42006545)
chr7 (99-137)||(42006316-42006354)
chr7 (275-332)||(1047238-1047295)
chr7 (586-634)||(9190052-9190101)
chr7 (98-147)||(22392291-22392340)
chr7 (571-638)||(42006780-42006849)
chr7 (566-634)||(46516334-46516403)
chr7 (586-640)||(2075247-2075303)
chr7 (583-634)||(20284093-20284145)
chr7 (583-634)||(33332491-33332543)
[»] chr3 (182 HSPs)
chr3 (98-651)||(18099151-18099708)
chr3 (99-652)||(32264018-32264580)
chr3 (100-649)||(5191374-5191925)
chr3 (98-649)||(10956010-10956564)
chr3 (202-652)||(45882762-45883217)
chr3 (98-649)||(22114288-22114843)
chr3 (98-652)||(18096880-18097423)
chr3 (98-649)||(26720267-26720821)
chr3 (98-649)||(5522610-5523153)
chr3 (99-652)||(48361651-48362186)
chr3 (225-649)||(11170250-11170678)
chr3 (301-652)||(4308261-4308616)
chr3 (225-652)||(18162510-18162940)
chr3 (202-649)||(3859351-3859801)
chr3 (202-649)||(10958306-10958757)
chr3 (275-649)||(38889935-38890314)
chr3 (300-652)||(1313331-1313686)
chr3 (225-649)||(10084372-10084804)
chr3 (225-652)||(24979553-24979985)
chr3 (98-652)||(32218835-32219362)
chr3 (303-652)||(1626663-1627016)
chr3 (303-652)||(43423443-43423796)
chr3 (300-652)||(53915476-53915832)
chr3 (300-652)||(53917644-53918000)
chr3 (301-652)||(43228213-43228568)
chr3 (304-652)||(43421395-43421747)
chr3 (303-652)||(3314608-3314962)
chr3 (345-652)||(42990271-42990581)
chr3 (252-652)||(12267955-12268350)
chr3 (301-649)||(51726990-51727341)
chr3 (303-652)||(28101982-28102335)
chr3 (301-652)||(27101161-27101520)
chr3 (303-652)||(880431-880785)
chr3 (345-652)||(30005808-30006118)
chr3 (300-649)||(25533355-25533716)
chr3 (301-652)||(43226008-43226360)
chr3 (300-652)||(51943292-51943647)
chr3 (225-637)||(10191305-10191724)
chr3 (300-649)||(4103879-4104235)
chr3 (345-652)||(9604587-9604896)
chr3 (303-651)||(5926746-5927097)
chr3 (259-649)||(6065779-6066174)
chr3 (266-652)||(15780747-15781156)
chr3 (301-652)||(39715392-39715742)
chr3 (275-649)||(6063429-6063809)
chr3 (303-652)||(53468433-53468788)
chr3 (300-649)||(746672-747031)
chr3 (303-652)||(36011751-36012104)
chr3 (309-572)||(6561740-6562005)
chr3 (225-543)||(35777268-35777587)
chr3 (275-649)||(50493895-50494273)
chr3 (345-652)||(47148875-47149185)
chr3 (382-649)||(1321483-1321753)
chr3 (300-649)||(458201-458558)
chr3 (299-652)||(28761407-28761765)
chr3 (354-649)||(25388882-25389179)
chr3 (304-652)||(51674746-51675087)
chr3 (300-649)||(455824-456181)
chr3 (301-632)||(35917944-35918284)
chr3 (345-649)||(10621513-10621820)
chr3 (299-652)||(23633380-23633730)
chr3 (303-634)||(53591119-53591442)
chr3 (345-597)||(29956653-29956907)
chr3 (276-649)||(38210265-38210644)
chr3 (391-652)||(6484372-6484637)
chr3 (387-649)||(7606571-7606833)
chr3 (370-649)||(28413014-28413297)
chr3 (303-626)||(889779-890104)
chr3 (303-652)||(54691554-54691906)
chr3 (429-652)||(25688140-25688367)
chr3 (399-652)||(4666535-4666791)
chr3 (300-652)||(42992203-42992547)
chr3 (99-482)||(24176999-24177380)
chr3 (303-533)||(28100143-28100374)
chr3 (303-652)||(31151271-31151622)
chr3 (426-652)||(6231849-6232077)
chr3 (226-445)||(11162997-11163217)
chr3 (99-378)||(1321161-1321441)
chr3 (439-651)||(5886261-5886474)
chr3 (439-651)||(5899734-5899947)
chr3 (304-652)||(27635638-27635959)
chr3 (303-538)||(28180948-28181182)
chr3 (442-649)||(11168165-11168375)
chr3 (418-652)||(17795301-17795536)
chr3 (418-652)||(19103741-19103976)
chr3 (299-555)||(23636947-23637200)
chr3 (389-610)||(13420208-13420428)
chr3 (299-572)||(53597161-53597430)
chr3 (303-572)||(54884081-54884348)
chr3 (389-637)||(561769-562020)
chr3 (303-526)||(28137415-28137628)
chr3 (456-652)||(3306839-3307037)
chr3 (389-637)||(25635395-25635644)
chr3 (505-651)||(47701652-47701801)
chr3 (378-637)||(1673975-1674227)
chr3 (350-637)||(36871295-36871583)
chr3 (345-470)||(41849119-41849244)
chr3 (484-637)||(24181486-24181644)
chr3 (303-432)||(47701798-47701928)
chr3 (521-652)||(25634030-25634164)
chr3 (422-572)||(4560355-4560497)
chr3 (304-431)||(6231374-6231502)
chr3 (440-573)||(14634504-14634638)
chr3 (440-610)||(1620483-1620657)
chr3 (571-652)||(41849254-41849336)
chr3 (571-649)||(35919098-35919177)
chr3 (304-421)||(3306724-3306842)
chr3 (96-166)||(38210064-38210134)
chr3 (583-649)||(53894040-53894107)
chr3 (98-166)||(7606896-7606964)
chr3 (458-640)||(29913949-29914132)
chr3 (99-166)||(50493676-50493743)
chr3 (99-166)||(53896687-53896754)
chr3 (99-190)||(11162891-11162982)
chr3 (372-514)||(13419878-13420015)
chr3 (458-640)||(47878165-47878350)
chr3 (274-333)||(13893288-13893347)
chr3 (248-331)||(46966940-46967023)
chr3 (594-652)||(42992605-42992663)
chr3 (440-517)||(7768632-7768709)
chr3 (103-228)||(10192401-10192525)
chr3 (98-166)||(11170144-11170212)
chr3 (440-517)||(11066652-11066731)
chr3 (458-517)||(27762107-27762165)
chr3 (455-517)||(10094195-10094256)
chr3 (455-517)||(10201075-10201136)
chr3 (455-517)||(16462203-16462264)
chr3 (455-517)||(22626105-22626166)
chr3 (389-482)||(25633934-25634024)
chr3 (455-517)||(47883003-47883064)
chr3 (275-356)||(53896475-53896557)
chr3 (467-572)||(11007587-11007683)
chr3 (99-216)||(38889757-38889875)
chr3 (275-331)||(5886181-5886237)
chr3 (275-331)||(5899656-5899712)
chr3 (275-331)||(6719416-6719472)
chr3 (99-216)||(6719532-6719651)
chr3 (103-219)||(10085490-10085605)
chr3 (275-331)||(25388794-25388850)
chr3 (99-166)||(35777163-35777230)
chr3 (458-636)||(54188512-54188692)
chr3 (458-517)||(54193229-54193287)
chr3 (463-517)||(4535622-4535675)
chr3 (277-387)||(4560513-4560625)
chr3 (98-163)||(6063942-6064007)
chr3 (455-517)||(10100212-10100273)
chr3 (455-517)||(10208121-10208182)
chr3 (455-517)||(11079517-11079578)
chr3 (455-517)||(16996875-16996936)
chr3 (98-147)||(25388617-25388666)
chr3 (455-517)||(27544273-27544334)
chr3 (471-649)||(46966633-46966816)
chr3 (98-298)||(5899456-5899657)
chr3 (422-467)||(7606828-7606873)
chr3 (566-652)||(10612762-10612848)
chr3 (573-626)||(28181185-28181238)
chr3 (455-503)||(6303310-6303358)
chr3 (458-640)||(10897008-10897193)
chr3 (418-480)||(31021300-31021361)
chr3 (300-331)||(10621847-10621878)
chr3 (458-517)||(20031439-20031497)
chr3 (300-331)||(42990203-42990234)
chr3 (618-652)||(8183114-8183148)
chr3 (277-331)||(26762863-26762917)
chr3 (566-634)||(1736319-1736388)
chr3 (99-147)||(3859317-3859365)
chr3 (99-147)||(6066243-6066291)
chr3 (225-282)||(6719487-6719544)
chr3 (566-634)||(18552897-18552966)
chr3 (439-517)||(23941821-23941902)
chr3 (566-634)||(30709804-30709873)
chr3 (304-333)||(31021450-31021479)
chr3 (225-282)||(38889863-38889920)
chr3 (301-364)||(6484307-6484371)
chr3 (455-503)||(7418064-7418112)
chr3 (566-640)||(10595028-10595104)
chr3 (299-331)||(13419796-13419828)
chr3 (93-145)||(18162399-18162451)
chr3 (455-515)||(38002869-38002928)
chr3 (99-147)||(45882659-45882707)
chr3 (303-331)||(47149205-47149233)
chr3 (566-640)||(48390296-48390372)
[»] chr2 (119 HSPs)
chr2 (102-652)||(6258799-6259351)
chr2 (97-652)||(40032035-40032588)
chr2 (98-652)||(21520675-21521235)
chr2 (98-649)||(19501996-19502551)
chr2 (98-649)||(27104514-27105067)
chr2 (99-649)||(42064231-42064785)
chr2 (210-652)||(22287318-22287764)
chr2 (104-652)||(6264130-6264658)
chr2 (99-649)||(19504331-19504884)
chr2 (98-649)||(24162208-24162753)
chr2 (202-649)||(13910030-13910480)
chr2 (303-651)||(19007560-19007912)
chr2 (98-652)||(43623562-43624086)
chr2 (300-652)||(42923491-42923849)
chr2 (301-649)||(45279969-45280322)
chr2 (300-649)||(42452700-42453050)
chr2 (303-652)||(28196557-28196908)
chr2 (300-649)||(23452222-23452579)
chr2 (303-652)||(11739541-11739895)
chr2 (99-455)||(22407591-22407948)
chr2 (311-652)||(34979559-34979906)
chr2 (303-652)||(17849037-17849390)
chr2 (303-652)||(17848365-17848713)
chr2 (303-652)||(14837193-14837541)
chr2 (303-652)||(44289049-44289403)
chr2 (303-638)||(31732772-31733100)
chr2 (304-559)||(15539553-15539809)
chr2 (306-652)||(3022086-3022445)
chr2 (274-652)||(18800295-18800666)
chr2 (345-649)||(35215571-35215878)
chr2 (345-649)||(35217948-35218255)
chr2 (432-652)||(5375328-5375550)
chr2 (345-611)||(45239000-45239268)
chr2 (303-637)||(11578104-11578439)
chr2 (392-652)||(28459172-28459435)
chr2 (454-649)||(36558849-36559047)
chr2 (454-649)||(36561126-36561324)
chr2 (389-652)||(22874141-22874404)
chr2 (495-652)||(22407436-22407596)
chr2 (299-637)||(17897242-17897581)
chr2 (299-637)||(20146604-20146946)
chr2 (303-479)||(22163106-22163282)
chr2 (454-649)||(45332166-45332364)
chr2 (345-539)||(38020165-38020349)
chr2 (263-652)||(35107180-35107569)
chr2 (438-637)||(40699429-40699634)
chr2 (518-652)||(22707733-22707872)
chr2 (418-567)||(27136195-27136343)
chr2 (455-572)||(20589763-20589881)
chr2 (548-652)||(22163004-22163111)
chr2 (425-524)||(38414194-38414291)
chr2 (301-437)||(5377629-5377770)
chr2 (508-631)||(7462950-7463077)
chr2 (517-652)||(23870951-23871089)
chr2 (299-637)||(37962938-37963266)
chr2 (454-572)||(15693974-15694094)
chr2 (98-216)||(18800702-18800820)
chr2 (400-572)||(43139395-43139564)
chr2 (454-610)||(17921769-17921927)
chr2 (455-517)||(28458949-28459011)
chr2 (377-599)||(35028574-35028795)
chr2 (455-517)||(2740941-2741002)
chr2 (439-515)||(26345661-26345738)
chr2 (274-331)||(28462593-28462650)
chr2 (441-497)||(27583479-27583535)
chr2 (440-517)||(34575230-34575308)
chr2 (455-517)||(2736205-2736266)
chr2 (454-515)||(10942634-10942696)
chr2 (454-515)||(10948503-10948565)
chr2 (610-652)||(15539511-15539553)
chr2 (455-517)||(17462436-17462497)
chr2 (455-517)||(20054886-20054947)
chr2 (455-517)||(22712637-22712698)
chr2 (455-517)||(22717346-22717407)
chr2 (98-246)||(36559211-36559359)
chr2 (455-517)||(39686983-39687044)
chr2 (455-517)||(45567409-45567470)
chr2 (299-363)||(12342684-12342749)
chr2 (304-396)||(38020064-38020157)
chr2 (478-569)||(13828411-13828503)
chr2 (458-640)||(17943540-17943723)
chr2 (458-640)||(27517633-27517818)
chr2 (99-166)||(45332608-45332675)
chr2 (458-517)||(12781342-12781400)
chr2 (458-517)||(17932637-17932695)
chr2 (458-517)||(30478997-30479055)
chr2 (454-566)||(30720684-30720796)
chr2 (571-640)||(38191129-38191200)
chr2 (278-333)||(45156946-45157001)
chr2 (454-515)||(7502990-7503052)
chr2 (277-331)||(35028473-35028527)
chr2 (99-239)||(36561537-36561677)
chr2 (304-337)||(20147049-20147082)
chr2 (444-515)||(41303155-41303228)
chr2 (302-334)||(36559079-36559111)
chr2 (302-334)||(36561356-36561388)
chr2 (302-334)||(45332396-45332428)
chr2 (549-634)||(14699016-14699100)
chr2 (300-331)||(35215903-35215934)
chr2 (458-517)||(37170873-37170931)
chr2 (596-634)||(17057369-17057407)
chr2 (596-634)||(17085352-17085390)
chr2 (464-517)||(27248021-27248075)
chr2 (455-517)||(39680045-39680106)
chr2 (299-337)||(40699226-40699264)
chr2 (300-329)||(35218286-35218315)
chr2 (129-178)||(42269930-42269979)
chr2 (591-640)||(42288105-42288154)
chr2 (455-487)||(20050172-20050204)
chr2 (586-640)||(20054759-20054815)
chr2 (303-331)||(20589581-20589609)
chr2 (566-634)||(21629948-21630016)
chr2 (586-640)||(30479126-30479182)
chr2 (277-329)||(33603818-33603870)
chr2 (458-490)||(33674552-33674584)
chr2 (131-183)||(34681824-34681876)
chr2 (566-610)||(37170778-37170822)
chr2 (455-503)||(38190997-38191045)
chr2 (566-636)||(39680156-39680228)
[»] chr8 (101 HSPs)
chr8 (98-652)||(15072505-15073064)
chr8 (98-648)||(15067776-15068330)
chr8 (103-652)||(14807552-14808114)
chr8 (98-649)||(27829092-27829646)
chr8 (98-649)||(27826781-27827335)
chr8 (202-652)||(28251549-28252002)
chr8 (225-649)||(4423940-4424368)
chr8 (300-649)||(32339302-32339659)
chr8 (299-652)||(27911011-27911366)
chr8 (299-652)||(27957430-27957785)
chr8 (299-652)||(14419172-14419530)
chr8 (303-652)||(27106879-27107232)
chr8 (303-652)||(30480485-30480838)
chr8 (301-652)||(1225164-1225520)
chr8 (275-649)||(18810680-18811057)
chr8 (345-642)||(608777-609077)
chr8 (300-649)||(3874003-3874360)
chr8 (300-649)||(15809212-15809568)
chr8 (300-649)||(28283206-28283563)
chr8 (300-652)||(41384742-41385097)
chr8 (275-649)||(44720815-44721193)
chr8 (299-650)||(13858469-13858823)
chr8 (345-649)||(22684638-22684948)
chr8 (304-649)||(36865538-36865887)
chr8 (303-649)||(5372161-5372512)
chr8 (300-652)||(41382670-41383015)
chr8 (303-652)||(25952521-25952874)
chr8 (350-649)||(43079650-43079952)
chr8 (279-649)||(43530099-43530465)
chr8 (275-649)||(18812865-18813231)
chr8 (345-649)||(43082016-43082323)
chr8 (303-652)||(33541392-33541723)
chr8 (300-637)||(24873178-24873525)
chr8 (303-548)||(14477276-14477522)
chr8 (299-652)||(15185696-15186049)
chr8 (99-413)||(12517248-12517565)
chr8 (392-652)||(15956051-15956311)
chr8 (303-637)||(21482322-21482649)
chr8 (299-637)||(31162209-31162551)
chr8 (389-628)||(21480593-21480832)
chr8 (393-640)||(3005624-3005872)
chr8 (303-498)||(5622877-5623073)
chr8 (301-479)||(26775199-26775378)
chr8 (425-599)||(181622-181798)
chr8 (225-402)||(3886153-3886334)
chr8 (303-465)||(35872555-35872713)
chr8 (223-482)||(2468261-2468513)
chr8 (440-637)||(31578273-31578476)
chr8 (390-520)||(37214317-37214438)
chr8 (437-637)||(31035252-31035459)
chr8 (400-569)||(31573794-31573961)
chr8 (98-298)||(44720616-44720816)
chr8 (508-637)||(2468126-2468259)
chr8 (524-652)||(35872435-35872553)
chr8 (454-610)||(17847677-17847830)
chr8 (98-246)||(18812667-18812815)
chr8 (99-216)||(4423835-4423952)
chr8 (585-652)||(37214246-37214314)
chr8 (300-397)||(181534-181632)
chr8 (99-166)||(18810483-18810550)
chr8 (455-553)||(13985163-13985262)
chr8 (103-189)||(28252036-28252122)
chr8 (276-331)||(17847501-17847556)
chr8 (96-166)||(43079344-43079414)
chr8 (377-474)||(31035144-31035238)
chr8 (455-652)||(6376141-6376342)
chr8 (454-572)||(3895972-3896092)
chr8 (571-649)||(14477521-14477601)
chr8 (522-635)||(16833769-16833886)
chr8 (455-517)||(9021228-9021289)
chr8 (455-517)||(16752643-16752704)
chr8 (455-517)||(16757388-16757449)
chr8 (455-517)||(28327908-28327969)
chr8 (455-517)||(28895502-28895563)
chr8 (455-517)||(30423212-30423274)
chr8 (98-166)||(43081721-43081789)
chr8 (458-517)||(590797-590855)
chr8 (277-337)||(6375962-6376023)
chr8 (458-517)||(33032657-33032715)
chr8 (340-387)||(37214460-37214507)
chr8 (618-652)||(181798-181832)
chr8 (455-517)||(4812608-4812669)
chr8 (440-516)||(13985933-13986011)
chr8 (455-517)||(28332631-28332692)
chr8 (458-515)||(29554908-29554964)
chr8 (566-640)||(17799418-17799494)
chr8 (263-331)||(31035028-31035095)
chr8 (458-517)||(3276347-3276405)
chr8 (455-490)||(17799571-17799606)
chr8 (458-517)||(25684646-25684704)
chr8 (455-517)||(2267144-2267205)
chr8 (129-178)||(26402717-26402766)
chr8 (454-517)||(33839043-33839105)
chr8 (302-331)||(43079585-43079614)
chr8 (302-331)||(43081957-43081986)
chr8 (586-636)||(4812486-4812538)
chr8 (586-640)||(9021101-9021157)
chr8 (129-177)||(9765385-9765433)
chr8 (596-640)||(10930193-10930237)
chr8 (591-631)||(18106084-18106124)
chr8 (586-640)||(23179555-23179611)
[»] chr6 (119 HSPs)
chr6 (99-652)||(9019702-9020258)
chr6 (97-652)||(11983011-11983568)
chr6 (99-649)||(14507161-14507716)
chr6 (225-652)||(32279898-32280329)
chr6 (209-652)||(15541122-15541569)
chr6 (182-652)||(30728806-30729284)
chr6 (99-592)||(15530166-15530661)
chr6 (182-642)||(15532674-15533137)
chr6 (303-652)||(13057173-13057527)
chr6 (301-649)||(28241306-28241658)
chr6 (301-649)||(1230234-1230586)
chr6 (303-652)||(3629847-3630199)
chr6 (299-652)||(3390354-3390712)
chr6 (310-649)||(14458752-14459093)
chr6 (303-652)||(13039733-13040087)
chr6 (305-652)||(3631921-3632271)
chr6 (97-531)||(19227514-19227950)
chr6 (303-652)||(25477253-25477614)
chr6 (345-649)||(4816216-4816523)
chr6 (300-649)||(30967174-30967530)
chr6 (300-647)||(30034590-30034945)
chr6 (275-639)||(20915351-20915721)
chr6 (300-649)||(2628871-2629228)
chr6 (301-651)||(26064958-26065312)
chr6 (301-651)||(26084927-26085281)
chr6 (303-652)||(3233707-3234065)
chr6 (300-649)||(12195500-12195853)
chr6 (348-649)||(19704552-19704858)
chr6 (303-652)||(24338430-24338783)
chr6 (99-422)||(8995255-8995578)
chr6 (303-652)||(12161540-12161889)
chr6 (345-649)||(26932546-26932854)
chr6 (99-445)||(1072069-1072395)
chr6 (447-652)||(1069700-1069909)
chr6 (303-572)||(22490618-22490889)
chr6 (299-637)||(3027848-3028189)
chr6 (422-637)||(5273213-5273431)
chr6 (400-652)||(14466399-14466656)
chr6 (389-637)||(15719712-15719961)
chr6 (454-649)||(26066109-26066307)
chr6 (439-652)||(12186053-12186271)
chr6 (454-649)||(26068380-26068578)
chr6 (454-649)||(29754694-29754892)
chr6 (454-649)||(33308988-33309185)
chr6 (385-652)||(15367097-15367363)
chr6 (454-649)||(33311257-33311454)
chr6 (384-637)||(16455421-16455676)
chr6 (309-570)||(17012029-17012287)
chr6 (438-637)||(26945258-26945463)
chr6 (303-450)||(32447502-32447651)
chr6 (277-637)||(19696394-19696759)
chr6 (498-637)||(15346522-15346664)
chr6 (300-431)||(17852518-17852650)
chr6 (441-573)||(28037794-28037927)
chr6 (440-652)||(25078540-25078755)
chr6 (409-637)||(22857949-22858181)
chr6 (566-652)||(10584241-10584328)
chr6 (310-451)||(13870608-13870749)
chr6 (455-609)||(12937219-12937376)
chr6 (418-596)||(20526902-20527081)
chr6 (202-303)||(24192630-24192731)
chr6 (99-192)||(32279794-32279886)
chr6 (98-246)||(33308684-33308832)
chr6 (98-246)||(33310953-33311101)
chr6 (202-303)||(24191533-24191634)
chr6 (518-652)||(25465573-25465710)
chr6 (454-568)||(7542452-7542567)
chr6 (440-515)||(11138423-11138499)
chr6 (458-640)||(17694846-17695030)
chr6 (499-572)||(30445699-30445773)
chr6 (455-609)||(12911471-12911629)
chr6 (566-640)||(3577484-3577559)
chr6 (156-282)||(4816624-4816749)
chr6 (463-517)||(5165936-5165989)
chr6 (455-517)||(13878727-13878788)
chr6 (455-517)||(13883475-13883536)
chr6 (455-517)||(16785919-16785980)
chr6 (455-517)||(26887345-26887406)
chr6 (455-517)||(31248835-31248896)
chr6 (455-517)||(35201447-35201508)
chr6 (98-166)||(26066544-26066612)
chr6 (99-246)||(26068735-26068882)
chr6 (99-246)||(29755132-29755279)
chr6 (275-331)||(4816552-4816608)
chr6 (99-147)||(15541631-15541679)
chr6 (99-147)||(24191620-24191668)
chr6 (99-147)||(24192717-24192765)
chr6 (455-517)||(3577636-3577696)
chr6 (277-333)||(12911754-12911812)
chr6 (566-640)||(13467461-13467536)
chr6 (299-468)||(15346366-15346524)
chr6 (458-517)||(17036058-17036116)
chr6 (275-334)||(26068603-26068662)
chr6 (277-319)||(12937517-12937559)
chr6 (522-572)||(28078261-28078310)
chr6 (277-334)||(26066332-26066389)
chr6 (566-640)||(25941781-25941857)
chr6 (302-334)||(29755000-29755032)
chr6 (302-334)||(33308932-33308964)
chr6 (302-334)||(33311201-33311233)
chr6 (462-517)||(12166267-12166321)
chr6 (277-331)||(12186376-12186431)
chr6 (263-330)||(16455732-16455799)
chr6 (458-517)||(22351973-22352031)
chr6 (299-337)||(28038006-28038044)
chr6 (528-572)||(3833481-3833526)
chr6 (303-387)||(14466312-14466397)
chr6 (98-147)||(15533172-15533221)
chr6 (458-515)||(19701985-19702041)
chr6 (461-517)||(25941650-25941704)
chr6 (458-538)||(26643179-26643259)
chr6 (458-538)||(26749145-26749225)
chr6 (458-517)||(13467585-13467642)
chr6 (299-331)||(15367011-15367043)
chr6 (586-640)||(22342795-22342851)
chr6 (566-634)||(22963704-22963772)
chr6 (566-634)||(23824621-23824689)
chr6 (566-652)||(30443533-30443621)
chr6 (586-636)||(35201325-35201377)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (98-649)||(69277-69834)
scaffold0025 (226-453)||(73207-73438)
scaffold0025 (98-189)||(73454-73545)
scaffold0025 (414-464)||(73160-73210)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (100-652)||(14768-15323)
scaffold0131 (345-652)||(14366-14674)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (212-649)||(3859-4298)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (98-649)||(2628-3182)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (301-649)||(183626-183976)
scaffold0005 (300-640)||(51959-52307)
scaffold0005 (571-640)||(50236-50308)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (301-649)||(41468-41820)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (300-652)||(79135-79491)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (300-652)||(11455-11811)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (202-649)||(29013-29473)
scaffold0068 (98-163)||(28940-29005)
[»] scaffold0472 (2 HSPs)
scaffold0472 (302-649)||(6151-6502)
scaffold0472 (99-166)||(5927-5994)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (303-652)||(79812-80165)
scaffold0004 (455-517)||(188363-188424)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (345-649)||(37-344)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (416-649)||(1438-1673)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (284-600)||(1969-2294)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (303-652)||(85184-85537)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (277-637)||(15817-16180)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (354-529)||(35644-35819)
scaffold0011 (571-652)||(35818-35900)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (312-637)||(1638-1958)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (299-572)||(16716-16986)
[»] scaffold0140 (6 HSPs)
scaffold0140 (454-649)||(22221-22418)
scaffold0140 (454-649)||(24496-24693)
scaffold0140 (98-246)||(21914-22062)
scaffold0140 (98-246)||(24189-24337)
scaffold0140 (302-334)||(22162-22194)
scaffold0140 (302-334)||(24437-24469)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (301-470)||(993-1168)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (450-572)||(4911-5034)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (583-647)||(4666-4731)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (455-569)||(57497-57613)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (600-646)||(1439-1485)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (99-246)||(12907-13054)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (455-517)||(224819-224880)
scaffold0006 (566-634)||(5687-5756)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (458-517)||(16328-16386)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (129-178)||(11288-11337)
[»] scaffold0209 (2 HSPs)
scaffold0209 (586-640)||(16980-17036)
scaffold0209 (458-490)||(17133-17165)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 445; Significance: 0; HSPs: 128)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 38926085 - 38925465
Alignment:
Q  8 aaagatgccacaaagtgtacggcatgtgcatgtgcctggtgcacaatttgtgagtgttaaaaacactaaaataccaatttcaattcatacttgtgagagt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  38926085 aaagatgccacaaagtgtacggcaggtgcatgtgcctggtgcacaatttgtgagtgttaaaaactccaaaataccaatttcaattcata----tgagagt 38925990  T
Q  108 taacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttatcgtg 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||    
T  38925989 taacttaaaatcaggttccgcagaaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagacaagttactggattttttgtg 38925890  T
Q  208 gcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatactttt 307  Q
    |||||||                     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925889 gcacgat---------------------ggggcgttggcagcgaacaacagaagtgtatttttgggtgcagatttattccaaattttaagcgatactttt 38925811  T
Q  308 actataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38925810 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 38925711  T
Q  407 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38925710 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 38925611  T
Q  507 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactag 606  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38925610 gtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtaaaacggagggctgctctctccccagactag 38925511  T
Q  607 gtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38925510 gtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 38925465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 644
Target Start/End: Original strand, 13214834 - 13215375
Alignment:
Q  112 ttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttatcgtggcac 211  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  13214834 ttaaaatcaggttatgcaaaaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaagtcactggatttttcgtggcat 13214933  T
Q  212 gatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttacta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13214934 gatgggattgcaacgtggcacgatggtgtgttggcagcaaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacta 13215033  T
Q  312 taaatatagaccttgtatcaaagtaacttt-gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtc 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13215034 taaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 13215133  T
Q  411 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13215134 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 13215233  T
Q  511 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccaga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  13215234 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaga 13215333  T
Q  603 ctaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 644  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13215334 ctaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 652
Target Start/End: Original strand, 39462258 - 39462816
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39462258 tgtgagagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtgacacaatggttgggcaacgtggcacgattagaggtttcagttttgaggcaagtcagtgga 39462357  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtattttt-ggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  39462358 tttttcgtggcacgatgggattgcaatgtggcacgatggtgcgcttgcagtgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 39462457  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  39462458 taatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggttt 39462557  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39462558 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 39462657  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  39462658 gggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctc 39462757  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462758 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39462816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 652
Target Start/End: Original strand, 15823286 - 15823843
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  || | ||    
T  15823286 tgtgagagttaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactaga 15823385  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15823386 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctagcagcaaataacagaaacatatttttggatgcagatttgttccaaattttaagc 15823485  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15823486 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 15823585  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  15823586 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctg 15823685  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||    
T  15823686 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctct 15823785  T
Q  596 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823786 cccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 15823843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 156 - 652
Target Start/End: Original strand, 41646717 - 41647217
Alignment:
Q  156 cgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaa 255  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||    
T  41646717 cgtggcacgattagaggtttcagttttgaggcaagtcactggatttttcgtggcacggtgggattgcaacgtggcacgatggtgcactggcagcgaataa 41646816  T
Q  256 cagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagaggggg 354  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  41646817 cagaaacatatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggggg 41646916  T
Q  355 ctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttggg 454  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||    
T  41646917 ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttggg 41647016  T
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 554  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41647017 aaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttt 41647116  T
Q  555 tgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41647117 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctct 41647216  T
Q  652 c 652  Q
    |    
T  41647217 c 41647217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 10400370 - 10399815
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  || |||    
T  10400370 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactgg 10400271  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |  ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10400270 aaatatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 10400171  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||  || |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||    
T  10400170 cgaaactttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 10400071  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10400070 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 10399971  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||    
T  10399970 gggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 10399871  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399870 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10399815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 649
Target Start/End: Original strand, 51749778 - 51750333
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt--gaggcaagtcatt 195  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||||||||  |||||||| || |    
T  51749778 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaa-tcgtggcacgatggttgggcaacgtggtacgatg-gaggtttcagttttttgaggcaaggcact 51749875  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttta 295  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51749876 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatagtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaatttta 51749975  T
Q  296 agcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  51749976 agcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 51750075  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  51750076 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 51750175  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  51750176 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 51750275  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750276 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51750333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 99 - 649
Target Start/End: Original strand, 28840418 - 28840973
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||    
T  28840418 tgtgaaagttaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttaggcaaggtactgga 28840517  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  28840518 aaaattgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagc 28840617  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |  || |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  28840618 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtt 28840717  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  28840718 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 28840817  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||    
T  28840818 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 28840916  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840917 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28840973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3580160 - 3579601
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3580160 ttgtgggagttaacttaaaatcaggttatgcaggaatcgtggcacgattgcagggcaacgtgacacaattggatgtttcagttatgaggcaagtcattgg 3580061  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | || ||| ||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||    
T  3580060 aaaaatcgtggtacggtgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctggcggcgaatatcataaacgtattttagagtgcaaatttgttccaaattttaag 3579961  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaac-tttgacatagaggggg--ctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3579960 cgatacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggt 3579861  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  3579860 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagaga 3579761  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca-tagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |  ||||||    
T  3579760 ttggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagtgaaacggatgattgctct 3579661  T
Q  594 ctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3579660 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 3579601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 13761576 - 13762130
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt-gaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||| || |    
T  13761576 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcact 13761673  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttta 295  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| || |||||||||| | | |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13761674 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgcggcacgatggtgtgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaatttta 13761773  T
Q  296 agcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  13761774 agcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggt 13761873  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  13761874 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagt 13761973  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||| |||    
T  13761974 ctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctc 13762072  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13762073 tctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13762130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 156 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 28207550 - 28207052
Alignment:
Q  156 cgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaa 255  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  28207550 cgtggcacgattggaggtttcaactttgaggcaagtcattggatttttcatggcacgatggggtcacaacgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataa 28207451  T
Q  256 cagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagaggggg 354  Q
    || ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  28207450 cataaacgtttttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagaggggg 28207351  T
Q  355 ctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttggg 454  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  28207350 ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttggg 28207251  T
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 554  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  28207250 aaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttt 28207151  T
Q  555 tgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207150 tgtaacgttactcatcatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28207052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 51752103 - 51752657
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt--gaggcaagtcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||| ||     
T  51752103 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagttttttgaggcaaggcac 51752200  T
Q  195 tggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttt 294  Q
    ||||   ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  51752201 tggaaaaatcgtggcacgatggggccgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaatttt 51752300  T
Q  295 aagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattaggg 393  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  51752301 aagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattaggg 51752400  T
Q  394 tttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 493  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  51752401 cttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattag-attgagtctcttggttacgggaagag 51752499  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgct 591  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||  ||| |  | |||||||||    
T  51752500 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgct 51752598  T
Q  592 ctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752599 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 20302197 - 20302752
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt--gaggcaagtcat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||| ||     
T  20302197 ttgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaa-tcgcggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagttttttgaggcaaggcac 20302294  T
Q  195 tggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttt 294  Q
    ||||   || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  20302295 tggaaaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcatatttgttccaaatttt 20302394  T
Q  295 aagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattaggg 393  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20302395 aagtgaaacttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 20302494  T
Q  394 tttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20302495 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 20302594  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgct 591  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || ||| || ||    
T  20302595 actaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactact 20302693  T
Q  592 ctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20302694 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 20302752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 28842232 - 28842788
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | |||    
T  28842232 ttgtgaaagttaacttaaaatcaggatctgtaggaatcgtggcacgatggcaaggctacgtggcacgattggaggtttcagtttttaggcaaggtactgg 28842331  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||    
T  28842332 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtcctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaag 28842431  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28842432 cgatacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 28842531  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  28842532 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagagg 28842631  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||  ||    
T  28842632 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatc 28842730  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28842731 tctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttct 28842788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 225 - 647
Target Start/End: Original strand, 6822881 - 6823306
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  6822881 cgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatagaaatgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagacct 6822980  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6822981 tgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa 6823080  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6823081 -actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggag 6823179  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccg 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6823180 acttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 6823279  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6823280 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 229 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14098380 - 14097953
Alignment:
Q  229 gcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgta 328  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14098380 gcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagattg-ttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgta 14098282  T
Q  329 tcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacact 427  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14098281 tcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacact 14098182  T
Q  428 agggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 527  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14098181 agagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagactt 14098082  T
Q  528 attcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaac 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  14098081 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaac 14097982  T
Q  624 tgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14097981 tgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 14097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 17324976 - 17324620
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaactttgac-atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||   |||  ||| |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||     
T  17324976 atacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgt 17324877  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17324876 atagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 17324777  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  17324776 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 17324677  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324676 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17324620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 99 - 632
Target Start/End: Original strand, 47451405 - 47451919
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||        |    
T  47451405 tgtgagagttaacttcaaatcagattttgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaatgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaa--------a 47451496  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
    | ||          ||| ||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  47451497 tatac---------atgagatcgcatcgtggcacgatggtgcgctgacagcgaataacagaaacgtattttttggtgcagatttgttccaaatattaagc 47451587  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47451588 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttg 47451687  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47451688 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tgtttaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 47451781  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  47451782 gggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctct 47451881  T
Q  596 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaac 632  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47451882 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 304 - 652
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307406
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18307254 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccc 18307353  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18307354 agactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctc 18307406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 6996040 - 6995684
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  6996040 atacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 6995941  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6995940 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgg 6995841  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 596  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6995840 ggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 6995741  T
Q  597 c-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6995740 ctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6995684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12302849 - 12302489
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaa--cttt---gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||    || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  12302849 tacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggt 12302750  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12302749 ttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 12302650  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  12302649 ttgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 12302550  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302549 tctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 12302489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Original strand, 47906205 - 47906567
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |      ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || |    
T  47906205 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatg 47906304  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 492  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47906305 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 47906404  T
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgc 590  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||    
T  47906405 gattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 47906504  T
Q  591 tctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906505 tctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 47906567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307529
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  402 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 50307685  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50307684 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 50307585  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattc-ttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50307584 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttctctc 50307529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15295128 - 15294821
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15295128 atagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgat 15295029  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15295028 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattg 15294929  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15294928 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 15294829  T
Q  642 tgtgttct 649  Q
    ||||||||    
T  15294828 tgtgttct 15294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076656
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||  |||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaa 50076810  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | | ||||||||||||    
T  50076809 tttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 50076710  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076709 cagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 50076656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 303 - 647
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617808
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2617659  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc- 598  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||     
T  2617660 tttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccct 2617759  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  2617760 cagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtt 2617808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Original strand, 16428640 - 16428951
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16428640 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgat 16428739  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16428740 tcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattg 16428839  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatca---tagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16428840 atatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctt 16428939  T
Q  641 ttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||    
T  16428940 ttgtgttctctc 16428951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 300 - 646
Target Start/End: Original strand, 24325597 - 24325954
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |        ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  24325597 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaacta 24325695  T
Q  391 gggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325696 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 24325795  T
Q  491 aagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggct 588  Q
     ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  24325796 gaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggct 24325895  T
Q  589 gctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 646  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325896 gctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 305 - 649
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932368
Alignment:
Q  305 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||    
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagac 39932216  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct--cc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||||||  ||    
T  39932217 tttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttccc 39932316  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39932317 ccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 39932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 28998593 - 28998237
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||||||     
T  28998593 atacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgt 28998494  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28998493 atagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgg 28998394  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||| || |||||     
T  28998393 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctc 28998294  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998293 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28998237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 29004309 - 29003953
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||||||     
T  29004309 atacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgt 29004210  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  29004209 atagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgg 29004110  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||| || |||||     
T  29004109 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctc 29004010  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004009 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 29003953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 31735865 - 31735508
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgac----atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||     |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31735865 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 31735766  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||     
T  31735765 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagagg 31735666  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  31735665 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 31735566  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735565 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31735508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839885
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagac 18839730  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||||||| | ||    
T  18839731 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttccc 18839830  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18839831 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttctctc 18839885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 132 - 557
Target Start/End: Original strand, 6823656 - 6824091
Alignment:
Q  132 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt--gaggcaagtcattggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtgg 229  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||| || ||||   ||||||||| |||||| | ||| |||||    
T  6823656 aatcatggcacgatggttgggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggggtcgcatcgtgg 6823754  T
Q  230 cacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtat 329  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  6823755 cacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtat 6823854  T
Q  330 caaagtaa-ctttgacatagagggg-gctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacact 427  Q
    || || || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6823855 cagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacact 6823954  T
Q  428 agggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgg 520  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||       ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6823955 agggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgg 6824054  T
Q  521 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 557  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6824055 cagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 2510668 - 2510312
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  2510668 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggt 2510569  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  2510568 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaga 2510469  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  2510468 tttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctc 2510370  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510369 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 2949571 - 2949216
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| |||  || || | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||| |||||     
T  2949571 atacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgt 2949472  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  2949471 atagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattgg 2949372  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 596  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  2949371 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 2949272  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949271 ccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 2949216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 324 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31424999
Alignment:
Q  324 ttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttgg-aaca 421  Q
    ||||||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  422 aacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagt---ctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggc 518  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  519 gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaattta 615  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctccccatactaggtcaatttg 31425036  T
Q  616 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425035 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 31424999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078804
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggac 50078959  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||| |||  | ||||||||||| ||    
T  50078958 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctccc 50078859  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  50078858 ccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctctc 50078804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 304 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251258
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcccc 25251312  T
Q  600 -agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25251311 aatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 25251258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457459
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||  |||| | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||      
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattggggg 11457613  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||| |||    
T  11457612 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctcccc 11457513  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11457512 cagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11457459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 277 - 649
Target Start/End: Original strand, 16226085 - 16226461
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaag 375  Q
    |||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||||     
T  16226085 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaa 16226184  T
Q  376 gcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agt 474  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16226185 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 16226284  T
Q  475 ctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata- 573  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||     
T  16226285 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatat 16226383  T
Q  574 -gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
     ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16226384 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 16226461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 350 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431693
Alignment:
Q  350 gggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttacc 449  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  450 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 46431797  T
Q  550 tcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct---ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 644  Q
    || ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431796 tc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 46431698  T
Q  645 gttct 649  Q
    |||||    
T  46431697 gttct 46431693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490209
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||    
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  31490057 tttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctcccccc 31490156  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31490157 agactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 31490209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186111
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| || || | |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaac 17186266  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||| || |||| || |||||||||| ||    
T  17186265 tttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctccc 17186166  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17186165 ccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 17186111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 27337282 - 27336924
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27337282 atacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27337183  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  27337182 ttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagagg 27337084  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  27337083 ctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 27336985  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336984 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27336924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 9241425 - 9241069
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagaggggg-ctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | || | |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  9241425 tacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaag-gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 9241327  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9241326 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 9241227  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||    
T  9241226 ggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 9241127  T
Q  596 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  9241126 cccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctc 9241069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 304 - 652
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319184
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggact 17319031  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  17319032 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccct 17319131  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319132 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17319184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Original strand, 6756469 - 6756825
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| | |||| ||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6756469 tacttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6756568  T
Q  400 tagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |||||||    
T  6756569 tagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattgg 6756666  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | | |||||||||    
T  6756667 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctct 6756766  T
Q  596 --ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
      ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6756767 ccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctc 6756825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Original strand, 25127859 - 25128170
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25127859 atagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgat 25127958  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25127959 tcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattg 25128058  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25128059 atatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaattctt 25128158  T
Q  641 ttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||    
T  25128159 ttgtgttctctc 25128170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 277 - 649
Target Start/End: Original strand, 47179627 - 47180006
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcag 371  Q
    |||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  47179627 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 47179726  T
Q  372 aaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg 471  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47179727 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 47179826  T
Q  472 -agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 570  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  47179827 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc 47179925  T
Q  571 ata--gtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||  ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47179926 atatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47180006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 292 - 649
Target Start/End: Original strand, 20291390 - 20291750
Alignment:
Q  292 tttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt-gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatta 390  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| || |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  20291390 tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 20291489  T
Q  391 gggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20291490 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 20291589  T
Q  491 aagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggct 588  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||  |||||| | || |||| |    
T  20291590 gagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggtt 20291688  T
Q  589 gctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20291689 gttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttct 20291750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 305 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948225
Alignment:
Q  305 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||    
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctggg 21948328  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  21948327 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 21948228  T
Q  598 cca 600  Q
    |||    
T  21948227 cca 21948225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 27339474 - 27339115
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  27339474 atacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggt 27339375  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||     
T  27339374 ttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagagg 27339275  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||| ||    
T  27339274 ctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatc 27339176  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27339175 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27339115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 345 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 4131673 - 4131360
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131673 atagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 4131574  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4131573 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattg 4131475  T
Q  545 ata----tctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaat 636  Q
    |||    |||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||    
T  4131474 atatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaacaaat 4131375  T
Q  637 tcttttgtgttctct 651  Q
    |||||||||||||||    
T  4131374 tcttttgtgttctct 4131360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248554
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||| ||||||||||  ||| | |||| ||||||||||| || | |||  |||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagac 50248710  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctg--ctctctcc 597  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  | || ||  ||||||||    
T  50248709 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcc 50248610  T
Q  598 cc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50248609 cctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 50248554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 277 - 649
Target Start/End: Original strand, 47177276 - 47177655
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcag 371  Q
    |||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  47177276 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 47177375  T
Q  372 aaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg 471  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  47177376 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgg 47177475  T
Q  472 -agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 570  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  47177476 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc 47177574  T
Q  571 ata--gtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||  ||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47177575 atatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47177655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 9463590 - 9463231
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |      ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9463590 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 9463491  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaa 491  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9463490 gtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaag 9463391  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctg 589  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  9463390 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 9463292  T
Q  590 ctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9463291 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9463231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 9459763 - 9459404
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |      ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  9459763 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagg 9459664  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaa 491  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9459663 gtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaag 9459564  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctg 589  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  9459563 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 9459465  T
Q  590 ctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9459464 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9459404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324359
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| | |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |  | |||  |||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaac 17324206  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  17324207 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccc 17324306  T
Q  599 ca-gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  17324307 catgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 17324359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 299 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 31423215 - 31422851
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  31423215 gatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttta 31423116  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaac-aaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
     ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31423115 tatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagatt 31423016  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---------------agtgaaacg 581  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||                |||||||     
T  31423015 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaaca 31422916  T
Q  582 aagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 645  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31422915 gagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 300 - 573
Target Start/End: Original strand, 48665112 - 48665393
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggc------tgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || | ||||||||||       ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  48665112 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 48665211  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cgggaaa 491  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  48665212 gtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaag 48665311  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 573  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665312 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 48665393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 351 - 651
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134241
Alignment:
Q  351 ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttacct 450  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  451 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 550  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40134037 tgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 40134136  T
Q  551 cttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 646  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  40134137 cttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgt 40134236  T
Q  647 tctct 651  Q
    |||||    
T  40134237 tctct 40134241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 349 - 652
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432693
Alignment:
Q  349 agggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttac 448  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||           ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  449 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 548  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatat 16432584  T
Q  549 ctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc--agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttg 643  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16432585 ctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 16432684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 277 - 637
Target Start/End: Original strand, 42922151 - 42922514
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaa 374  Q
    |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | || | |||||||||| ||||| ||| ||| ||||     
T  42922151 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa- 42922249  T
Q  375 ggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagt 474  Q
    | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42922250 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 42922346  T
Q  475 ctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat-- 572  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  42922347 ctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 42922446  T
Q  573 -agtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
     |||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  42922447 gagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 98 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 30790936 - 30790401
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||| |||| | || | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  30790936 ttgtgagagctaacttaaaaccaggttctggagaaatcgtgacacgtttgcagagcaatgtggcacgattggatgtttcagttatgaagcaagtcactgg 30790837  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   | |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||  | ||| |||| ||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  30790836 aaaaaacgtggcacgatgggatcgcaatgtggcacgatggtgcgctggaggggaaaaacataaacgtatttttcagtgcagatttgttccaaattttaag 30790737  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctg-aaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||  |  ||| |||||||    
T  30790736 cgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggtt 30790639  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    |   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30790638 t---tagagatt-tctctaagagggagacactagggtt--gtggttgatttaccttgggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagat 30790546  T
Q  496 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgct 591  Q
     | ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| || | | | |||||    
T  30790545 ggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgct 30790446  T
Q  592 ctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaa 635  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||    
T  30790445 ctcttcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 449 - 652
Target Start/End: Original strand, 16429048 - 16429255
Alignment:
Q  449 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16429048 cttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatat 16429147  T
Q  549 ctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 644  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16429148 ctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgt 16429247  T
Q  645 gttctctc 652  Q
    ||||||||    
T  16429248 gttctctc 16429255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 425 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  425 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 524  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  525 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccg 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183574
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||   ||| ||||||||| |||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtata 14183827  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | |     
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaat 14183730  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  14183729 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc 14183630  T
Q  598 ccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  14183629 ccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtggtctctc 14183574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 299 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 49495540 - 49495206
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| | |||   |||        |||||||||    
T  49495540 gatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatcaaac--------tagggtttg 49495449  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
    |||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| || ||||||    
T  49495448 catatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattg 49495353  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||    
T  49495352 gggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctc 49495253  T
Q  595 tcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  49495252 tccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 382 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669376
Alignment:
Q  382 acaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 481  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15669552  T
Q  482 ttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaa 578  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||   |||||| |    
T  15669551 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgga 15669452  T
Q  579 acgaagggctgctctctcccc-agactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  15669451 acggatggctgctctctccccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctc 15669376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 301 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 8347608 - 8347298
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||| |||| |||||||||     
T  8347608 tacttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgt 8347511  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||     
T  8347510 atagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattga 8347414  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||| |||| |||| |||||| |    
T  8347413 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctcttt 8347314  T
Q  596 cccc-agactaggtca 610  Q
    |||| |||||||||||    
T  8347313 cccctagactaggtca 8347298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 438 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115086
Alignment:
Q  438 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 537  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  538 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaaca 633  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  634 aattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  6115104 aattattttgtgttctctc 6115086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 454 - 637
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786121
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 23786033  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  23786034 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 18800910 - 18800640
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| | |||||||||||||  ||| |||| | |||||| |||| || ||||||    
T  18800910 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttg 18800812  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||     
T  18800811 tatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagattt 18800715  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18800714 gaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 18800640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 450 - 649
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757824
Alignment:
Q  450 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  550 tcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 646  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||  ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51757723 tcttt-gtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51757821  T
Q  647 tct 649  Q
    |||    
T  51757822 tct 51757824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 425 - 649
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231856
Alignment:
Q  425 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccg 620  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||    
T  16231829 aact-ggtcaacaaatatctttgtgttct 16231856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 340 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 8349347 - 8349035
Alignment:
Q  340 ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 439  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||    
T  8349347 ttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gg 8349252  T
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 539  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  8349251 tttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaact 8349152  T
Q  540 cattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctcccca-gactaggtcaattt-agaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||   |||| || |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  8349151 cattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaa 8349052  T
Q  635 attcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| || |||||||||||    
T  8349051 att-ttgtgtgttctctc 8349035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 499 - 652
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816183
Alignment:
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatag--tgaaacgaagggctgctctctc 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || | || |||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  597 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 23816183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 309 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125525
Alignment:
Q  309 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc-atagagtt 406  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||   |||| | | |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||  ||| |||||||||  ||||||||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  407 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgg 506  Q
    || ||||| |  ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgg 13125592  T
Q  507 gtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13125591 gtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 13125525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 437 - 637
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561751
Alignment:
Q  437 gggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  536 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtca 630  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||| || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  631 acaaatt 637  Q
    |||||||    
T  16561745 acaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 49687301 - 49687418
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  49687301 tgtgagagttaacttaaaatcaggttatgtagaaatcgtggcatgatggctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagttttgaggcaagtcactgga 49687400  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgg 216  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  49687401 tttttcgtggcacgatgg 49687418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 440 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738653
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 538  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc-----atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtca 610  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||     ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtca 30738653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 440 - 612
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 538  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat 612  Q
    |  ||| |||||| ||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 440 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613223
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 538  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||| | |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaaca 633  Q
    || ||||||||||||||| || |||||   |||| |||||| |||  || ||| |||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  634 aattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| || |||||||||||    
T  26613240 aatt-ttgtgtgttctctc 26613223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 309 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520205
Alignment:
Q  309 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagaggggg-ctgaaa-caagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagt 405  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||| | |||||| |||| ||||||||  |||||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  406 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg------gttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||||||| ||||||||    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattggg 26520254  T
Q  500 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 547  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26520253 actttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata 26520205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 652
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279566
Alignment:
Q  381 aacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctctt 479  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||   |||||||||||||||| |  | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttg--tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  480 ggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagt 575  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||   |||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 28279486  T
Q  576 gaaacgaagggctgctctctcccc--agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||   || | || ||| |||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  28279487 ggaattgagagttgttctttccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctc 28279566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 384 - 637
Target Start/End: Original strand, 27916525 - 27916780
Alignment:
Q  384 aaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 483  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  27916525 aaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtc 27916619  T
Q  484 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtga 577  Q
    ||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||     
T  27916620 acatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcgttatagtgg 27916718  T
Q  578 aacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||    
T  27916719 aacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 397
Target Start/End: Original strand, 16231517 - 16231640
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaag-taactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaa 373  Q
    |||||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  16231517 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaa 16231616  T
Q  374 aggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    | ||||||| |||| |||||||||    
T  16231617 aagcaacaagaaaactagggtttg 16231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Original strand, 6822774 - 6822893
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag--ttttgaggcaagtcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||| ||     
T  6822774 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacga-tggaggtttcagttttttgaggcaaggcac 6822871  T
Q  195 tggatttatcgtggcacgatgg 216  Q
    ||||   |||||||||||||||    
T  6822872 tggaaaaatcgtggcacgatgg 6822893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 583 - 649
Target Start/End: Original strand, 13358800 - 13358867
Alignment:
Q  583 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358800 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13358867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 530 - 637
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  530 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaa-tttagaccgaact 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  625 gggtcaacaaatt 637  Q
    |||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 47177077 - 47177224
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | || |||| ||||||  |||||| || ||    
T  47177077 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacgactgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttttgggcaagacactg 47177174  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||   |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| ||||    
T  47177175 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 47177224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Original strand, 47179427 - 47179495
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47179427 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat 47179495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 315
Target Start/End: Original strand, 49687427 - 49687496
Alignment:
Q  246 cagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaa 315  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49687427 cagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaa 49687496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14098511 - 14098443
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14098511 ttgtgagagttaacttaaaatcagattctgcagaaatcgtggcacgatggctgagcaccgtggcacgat 14098443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353342
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 21353431  T
Q  557 taacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  |||||||   |||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 447 - 608
Target Start/End: Original strand, 43104248 - 43104414
Alignment:
Q  447 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttatt-cttgtaacccattg 544  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| | ||||  ||||||||||||||||||   || || || || |||||||||| |||    
T  43104248 accttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccctttg 43104347  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggt 608  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| || | |||||||  ||||||||||||    
T  43104348 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctcctcccagactaggt 43104414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 16225886 - 16226034
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  16225886 ttgtaagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggttgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 16225983  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  16225984 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 16226034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 572
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353178
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 537  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||||   || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  538 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    ||| |||| |  |||||||||| |||| |||||||    
T  14353146 ccctttgaaa--tcttttgtaaagttattcatcat 14353178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 515  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393277
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggactt-gggtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 2393367  T
Q  557 taacgttactcatc-----atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  ||||||      |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||    
T  2393366 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattctt 2393277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 20291280 - 20291345
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20291280 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaa-tcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacg 20291345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 608 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447260
Alignment:
Q  608 tcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13447260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 26332814 - 26332719
Alignment:
Q  382 acaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 481  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26332814 acaaaaatagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttgg 26332720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401342
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14098453 - 14098382
Alignment:
Q  135 cgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttatcgt 206  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  14098453 cgtggcacgatggttgagcaccgtggcacgattggaggtttcagctttgacgcaagtcactggatttttcgt 14098382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Original strand, 23783238 - 23783378
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || ||    
T  23783238 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 23783335  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatgggg 239  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  23783336 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgggg 23783378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 145
Target Start/End: Original strand, 41646681 - 41646727
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgat 145  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  41646681 tgtgagagttaacttaaaatcatgttctgcagaaatcgtggcacgat 41646727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 337
Target Start/End: Original strand, 43104099 - 43104137
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43104099 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaa 43104137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 13598471 - 13598402
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  13598471 tcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28207581 - 28207540
Alignment:
Q  104 gagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgat 145  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28207581 gagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggcacgat 28207540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 23783494 - 23783526
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783494 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 23783526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Original strand, 27916415 - 27916471
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 333  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27916415 agatttgttccaattttggagggatacttttactataaatatagacattgtatcaaa 27916471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 440 - 550
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959241
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 537  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||||| | |||||||| || |||||||   || ||| |||||| |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  538 cccattgatatct 550  Q
    ||| |||||||||    
T  49959229 ccctttgatatct 49959241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521776
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 46432068 - 46432037
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432068 atacttttactataaatatagaccttgtatca 46432037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 496
Target Start/End: Original strand, 10115880 - 10115922
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10115880 gaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaaaagatt 10115922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 166
Target Start/End: Original strand, 16231374 - 16231408
Alignment:
Q  132 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16231374 aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat 16231408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26613603 - 26613549
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||| |||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26613603 agatttgttccaatttttgagggattcttttgctataaatatagaccttgtatca 26613549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 331
Target Start/End: Original strand, 49958963 - 49959016
Alignment:
Q  278 gatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||| |||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49958963 gatttgttccaaattttgtgggatgcttttgctataaatatagaccttgtatca 49959016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 636
Target Start/End: Original strand, 9526578 - 9526650
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaat 636  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  9526578 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 9526650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13461392 - 13461344
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||    
T  13461392 tgtgagagttaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtgccacgatgg 13461344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 151)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Original strand, 48486112 - 48486670
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  48486112 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtcctgcagaaatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaagtcactgg 48486211  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  48486212 atttttcgtggcacgatggggtcacaatgtggcacaatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 48486311  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  48486312 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 48486411  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48486412 gtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 48486511  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  48486512 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctc 48486611  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48486612 tcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgttttctc 48486670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 153 - 652
Target Start/End: Original strand, 24880299 - 24880803
Alignment:
Q  153 caacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaa 252  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24880299 caacgtggcacgaatggaggtttcagttttgaggcaagtcactggatttttcgcggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaa 24880398  T
Q  253 caacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagg 351  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||||    
T  24880399 taacagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagg 24880498  T
Q  352 gggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttacctt 451  Q
    ||||  |||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24880499 gggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcacctt 24880598  T
Q  452 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880599 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 24880698  T
Q  552 ttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24880699 ttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgtt 24880798  T
Q  648 ctctc 652  Q
    |||||    
T  24880799 ctctc 24880803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 36920126 - 36919566
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||    
T  36920126 ttgtgagagttaacttaaaatcaggttctgca-aaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaattttgaggcaagtcactgg 36920028  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36920027 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaatagtagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 36919928  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36919927 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 36919828  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36919827 ttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 36919728  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgct 591  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||   | |||||||    
T  36919727 gctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgct 36919628  T
Q  592 ctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919627 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36919566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 36922033 - 36921475
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36922033 tgtgagagttaacttaaaatcaggttctgca-aaatcgtggtacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgaggcaagtcactgga 36921935  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36921934 aaaatcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgcattggcagcgaataacagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagc 36921835  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||    
T  36921834 gatacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 36921736  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  36921735 tgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 36921636  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||    
T  36921635 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctc 36921536  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921535 tctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36921475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 652
Target Start/End: Original strand, 24878836 - 24879341
Alignment:
Q  152 gcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcga 251  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  24878836 gcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgacgcaagtcactggatttttcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggtacgctggcatcga 24878935  T
Q  252 acaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagag 350  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||    
T  24878936 ataacagaaacgtatttttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagag 24879035  T
Q  351 ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttacct 450  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24879036 ggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcacct 24879135  T
Q  451 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879136 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 24879235  T
Q  551 cttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 646  Q
    ||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24879236 cttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgt 24879335  T
Q  647 tctctc 652  Q
    ||||||    
T  24879336 tctctc 24879341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 619986 - 619430
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | || ||| || ||||||| |  || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619986 tgtgagagttaacttaaaatcaggttatgtaggaattgtcgcacgattgaaggtcaacgtggcacaattggatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 619887  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |    
T  619886 tttttcgtggcacgatggggtcgcaacgtggcacaatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtagagattttttccaaattttaaac 619787  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||    
T  619786 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttg 619687  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  619686 catagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattg 619587  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||    
T  619586 ggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctct 619487  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  619486 cccctaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctc 619430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 103 - 652
Target Start/End: Original strand, 24888594 - 24889147
Alignment:
Q  103 agagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggattt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  || ||||       
T  24888594 agagttaacttaaaatcagatttctgcagaatt-gtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactggaaaa 24888692  T
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24888693 atcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcaat 24888792  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  24888793 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtat 24888892  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  24888893 agagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactagga 24888992  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  24888993 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 24889092  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24889093 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 24889147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 101 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22803270 - 22802719
Alignment:
Q  101 tgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| || ||||      
T  22803270 tgagagttaacttaaaatcaaatttctatagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaggaaaggcactggaaa 22803171  T
Q  201 tatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcga 300  Q
     |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22803170 aatcgtggctcgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtattttgag-tgcagatttgttccaaattttaagcga 22803072  T
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  22803071 tacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 22802972  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  22802971 tagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 22802872  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||| | |||||| |    
T  22802871 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctcc 22802772  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22802771 cccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 101 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 40091952 - 40091397
Alignment:
Q  101 tgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||| |||||||      
T  40091952 tgagagttaacttaaaatcaggttctgcaataatcgtggcacggtggttgggtaacgtggcacgattggagatttcagttttgaagtaagccattggaaa 40091853  T
Q  201 tatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcga 300  Q
     |||||| || |||||| | |||||||| |||||||| ||  || ||||||| |||  ||| ||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||    
T  40091852 aatcgtgccatgatggggtcgcaacgtgacacgatggtgcactgacagcgaataacgtaaacgtatttttcagtgcatatttgttccaaattttaagcga 40091753  T
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| |||      
T  40091752 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtt 40091653  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  40091652 tagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 40091553  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  40091552 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 40091453  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091452 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 40091397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 102 - 649
Target Start/End: Original strand, 5198217 - 5198768
Alignment:
Q  102 gagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggattt 201  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||| |||| || || ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||  |  ||||       
T  5198217 gagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcatgacatgattgctgggcaacgtggcacgattggagatttcaagtttgaggcaaagctctggaaaa 5198316  T
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5198317 atcgtggcacgatgggatcacatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgat 5198416  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  5198417 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtat 5198516  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  5198517 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggg 5198616  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||    
T  5198617 ctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 5198716  T
Q  599 c-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5198717 ccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 5198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 212 - 649
Target Start/End: Original strand, 47274634 - 47275073
Alignment:
Q  212 gatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttacta 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  47274634 gatggaattgcaacgtggcacgatggtgcgatggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttacta 47274733  T
Q  312 taaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtc 410  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  47274734 taaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtc 47274832  T
Q  411 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtag 510  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  47274833 tctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtag 47274932  T
Q  511 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggt 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47274933 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccagactaggt 47275032  T
Q  609 caatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47275033 caatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 47275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 103 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 37089910 - 37089357
Alignment:
Q  103 agagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttg-aggcaagtcattggatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||  || || ||||      
T  37089910 agagttaacttaaaatcagatttctgcagaa-tcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgagatgttttagttttttaggtgaggcactggaaa 37089812  T
Q  201 tatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcga 300  Q
     |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  37089811 aatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagcaa 37089712  T
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaactttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37089711 aacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 37089612  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |    
T  37089611 gtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggct 37089512  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  37089511 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 37089413  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089412 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 37089357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22044931 - 22044376
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt---gaggcaagtcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  || |||||| ||||   |||||||| ||     
T  22044931 ttgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatg-gaggtttcattttttttgaggcaaggcac 22044833  T
Q  195 tggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttt 294  Q
    ||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  22044832 tggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagggaaaaacagaaacatatttttag-tgcagatttgttccaaatttt 22044734  T
Q  295 aagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattaggg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22044733 aagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 22044634  T
Q  394 tttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22044633 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 22044534  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgct 591  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||    
T  22044533 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 22044435  T
Q  592 ctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044434 ctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22044376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 38408992 - 38409552
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||  ||||||||||  || ||    
T  38408992 ttgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaa-tcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactg 38409090  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  38409091 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcggcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaa 38409190  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |      ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| |    
T  38409191 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaact 38409290  T
Q  390 agggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409291 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 38409390  T
Q  490 aaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggc 587  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||    
T  38409391 agaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggc 38409489  T
Q  588 tgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38409490 tgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttct 38409552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 101 - 649
Target Start/End: Original strand, 51015042 - 51015593
Alignment:
Q  101 tgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttg-aggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||| || ||||    
T  51015042 tgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaa-tcgtggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 51015139  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  51015140 aaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagc 51015239  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  51015240 gatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 51015339  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  51015340 tatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 51015439  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || ||| |||||||||    
T  51015440 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctct 51015538  T
Q  596 ccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015539 ccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 99 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 31850138 - 31849584
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| || ||||    
T  31850138 tgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaattgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttggggcaaggcactgga 31850039  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  31850038 aaaatcttggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagc 31849939  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaag-taactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||  ||||  || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31849938 gatacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 31849839  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacact-agggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |    
T  31849838 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggct 31849739  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||||||    
T  31849738 gagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 31849640  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849639 tcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31849584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 99 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5638006 - 5637529
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||    
T  5638006 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagttttgaggcaaggcactgga 5637908  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       ||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  5637907 aaaatcatgtcacgatgggatcgcatcgtggcatgatggtgagctggcagcgaaaaacagaaacgtattttggg-tgcagatttgttccaaattttaagc 5637809  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattaggg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| |    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5637808 gatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 5637709  T
Q  394 tttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5637708 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 5637609  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 573  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5637608 gctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 5637529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 99 - 649
Target Start/End: Original strand, 9148054 - 9148600
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | |   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||||||  || ||||    
T  9148054 tgtgagagttaacttaaaatcaagatcttcaggaatcgtggtacgattgctgggcaacgtggcgcgattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactgga 9148153  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||        |||| || |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  9148154 aaaatcgtggcacgatggggttgcatcgtggcacgatgg--------cagcaaataacagaaacgtattttggg-tgcagatttgttccaaattttaagc 9148244  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||| |  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  9148245 gatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatt 9148344  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  9148345 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 9148444  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  9148445 tgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 9148543  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148544 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9148600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 225 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 22801274 - 22800844
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| || |||||||| |||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801274 cgtggcacgatggtgcgccggcagcaaataacagaaacgtattttgag-tgcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 22801176  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22801175 tgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 22801076  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  22801075 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 22800976  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccg 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22800975 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 22800876  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22800875 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22800844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 98 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 3825113 - 3824634
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||    
T  3825113 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtgacacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgaggcaaagcactg 3825015  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||   ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3825014 gaaaaatcatggcacaatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcgacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaa 3824915  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa--ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatta 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |    ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||| ||    
T  3824914 gcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaacagg--tttagaaaagcaacaacaaaacta 3824817  T
Q  391 gggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3824816 gggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaa 3824717  T
Q  491 aagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 573  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3824716 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 3824634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 206 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22047116 - 22046671
Alignment:
Q  206 tggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatactt 305  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||| ||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22047116 tggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagggaaaaacagaaacatatttttag-tgcagatttgttccaaattttaagcgatactt 22047018  T
Q  306 ttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagag 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22047017 ttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 22046918  T
Q  405 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggacttt 504  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  22046917 tttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 22046818  T
Q  505 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cag 601  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||||| |||    
T  22046817 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcag 22046719  T
Q  602 actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046718 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22046671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 11006782 - 11006222
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc--gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttg-aggcaagtcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| ||||  ||||||| ||     
T  11006782 ttgtgagagttaacttaaaatcaggttttatgcagaa-tcgtggcacgatcgctgggcaacgtggcacgatg-gaggtttcaattttttaggcaaggcac 11006685  T
Q  195 tggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttt 294  Q
    ||||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||| || || |||||    
T  11006684 tggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagatttt 11006585  T
Q  295 aagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt-----gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatt 389  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||      || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  11006584 aagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagactattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 11006485  T
Q  390 agggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggg 488  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11006484 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 11006385  T
Q  489 aaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaaggg 586  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||  |||||| | || ||||    
T  11006384 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggatcggaggg 11006286  T
Q  587 ctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11006285 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 11006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 225 - 649
Target Start/End: Original strand, 11434875 - 11435302
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11434875 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 11434974  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11434975 tgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa 11435074  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11435075 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggag 11435174  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccg 620  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11435175 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 11435273  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435274 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Original strand, 40637070 - 40637425
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  40637070 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 40637169  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  40637170 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgag 40637269  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| |    
T  40637270 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 40637369  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637370 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 40637425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928159
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  402 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggg 38928314  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  38928313 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctccc 38928214  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928213 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 38928159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 9174685 - 9174131
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttt-tgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  || |||| ||||| | ||||||| || ||    
T  9174685 ttgtgagagttaacttaaaatcaggttctgcagaa-tcgtggcacgacggctaggcaacgtagcacgatg-gaggttttagtttattaggcaaggcactg 9174588  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||   ||| |||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| || ||  ||||||    
T  9174587 gaaaaatcatggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagtttttaa 9174488  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  9174487 gcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 9174388  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  9174387 tgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagaga 9174288  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||| ||    
T  9174287 ttgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttc 9174189  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9174188 tctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9174131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Original strand, 14633316 - 14633666
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  14633316 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 14633414  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14633415 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattggg 14633513  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14633514 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 14633613  T
Q  598 c-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633614 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14633666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 18846922 - 18847500
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc---gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||||||| | |||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||  |     
T  18846922 ttgtgagagttaacttaaaatcagatttttctgcagaa-tcgtggcacgattgttgggaatcgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaaggtac 18847020  T
Q  195 tggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattt- 293  Q
    ||||   ||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||| | || | ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||     
T  18847021 tggaaaaatcgtggtacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctcgcggggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacaaattta 18847120  T
Q  294 ---------------------taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcag 371  Q
                         ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  18847121 aagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttag 18847220  T
Q  372 aaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg 471  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  18847221 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattg 18847320  T
Q  472 -agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 570  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  18847321 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatc 18847419  T
Q  571 ata--gtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||  ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847420 atatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 8631760 - 8631404
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  8631760 tactttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 8631661  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  8631660 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 8631561  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||    
T  8631560 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 8631461  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631460 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 8631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 226 - 649
Target Start/End: Original strand, 7941240 - 7941671
Alignment:
Q  226 gtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 325  Q
    |||||||||||| ||| |||   |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7941240 gtggcacgatggtgcgctggtgacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacgtt 7941339  T
Q  326 gtatcaaagtaactttg---acatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaa 422  Q
    |||||| || ||    |   | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || |||    
T  7941340 gtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaa 7941439  T
Q  423 a--cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgg 520  Q
    |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7941440 atgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 7941539  T
Q  521 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttaga 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  7941540 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 7941639  T
Q  618 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941640 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7941671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096234
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  402 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |      
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag 19096079  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||| ||    
T  19096080 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctccc 19096179  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19096180 ccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 19096234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 24348209 - 24348566
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||    
T  24348209 atacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggt 24348308  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24348309 ttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 24348408  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  24348409 ctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 24348508  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348509 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24348566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395827
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12395981  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||    
T  12395980 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccc 12395881  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12395880 cagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctc 12395827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 304 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415470
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  33415721 agtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 33415623  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc-c 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33415622 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctc 33415523  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33415522 aggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctc 33415470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400789
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12400943  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||    
T  12400942 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccc 12400843  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12400842 cagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctc 12400789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 300 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14787771 - 14787423
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14787771 atacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 14787672  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14787671 gtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 14787572  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  14787571 gtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 14787472  T
Q  595 t---ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14787471 tctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 14787423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 304 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313047
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||| | |||    
T  37313200 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccc 37313101  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37313100 cagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttctctc 37313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Original strand, 6764835 - 6765192
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6764835 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6764934  T
Q  400 tagagtttgtctcttt-----ggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  6764935 tagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagagg 6765034  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |  | ||||||||||    
T  6765035 ctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctc 6765134  T
Q  593 tctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765135 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6765192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 301 - 647
Target Start/End: Original strand, 47868397 - 47868747
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  47868397 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 47868496  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |    
T  47868497 tagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 47868596  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| |    
T  47868597 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 47868696  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47868697 cccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgtt 47868747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Original strand, 36378288 - 36378644
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  36378288 tacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 36378387  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36378388 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattggg 36378487  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||     
T  36378488 actttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 36378587  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36378588 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctc 36378644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 17662576 - 17662227
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17662576 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 17662477  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    |||           |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  17662476 ttg-----------tctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaga 17662388  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  17662387 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 17662288  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662287 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17662227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 44600176 - 44599823
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||     
T  44600176 atacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 44600077  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44600076 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 44599977  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  44599976 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 44599878  T
Q  596 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  44599877 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 44599823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 2485210 - 2484858
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacataga-gggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||  |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  2485210 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 2485111  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  2485110 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 2485011  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  2485010 gactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 2484912  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2484911 ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttct 2484858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Original strand, 16453305 - 16453661
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| || || |   || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  16453305 tacttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 16453404  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16453405 caaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 16453504  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  | || ||||||||     
T  16453505 actttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctc 16453604  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  16453605 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctc 16453661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 16934506 - 16934128
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaa 373  Q
    |||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16934506 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaa 16934407  T
Q  374 aggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-a 472  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  16934406 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16934307  T
Q  473 gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  16934306 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat 16934208  T
Q  573 a--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16934207 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16934128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 307 - 637
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997828
Alignment:
Q  307 tactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagt 405  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  406 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttg 505  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttg 41997693  T
Q  506 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccaga 602  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41997694 ggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctccccaga 41997793  T
Q  603 ctaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  41997794 ctaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 104 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 52943002 - 52942537
Alignment:
Q  104 gagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| || || | |    
T  52943002 gagttaacttaaaatcaggttttgcaaaaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcagctttgaggcaagtcactgaatattt 52942903  T
Q  204 cgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatgggg---------------------cgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagattt 282  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||                     || |||||||||| |||| |||  ||||||| | |||||||||    
T  52942902 cgtggcacgatggggtcacaacgtggcacgatggggtcacaacgtggcacgatgatgcgctggcagcgaataacataaacatattttttggtgcagattt 52942803  T
Q  283 attccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtat--caaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaa 379  Q
     ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  52942802 gttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaa 52942704  T
Q  380 caacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 479  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942703 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 52942604  T
Q  480 ggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 559  Q
    |||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942603 ggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 304 - 630
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030770
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagct 56030642  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-ag 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  56030643 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcata-tgaaacggagggctgctctctcccctag 56030741  T
Q  602 actaggtcaatttagaccgaactgggtca 630  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56030742 actaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 291 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 9176821 - 9176461
Alignment:
Q  291 ttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatt 389  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |    
T  9176821 ttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact 9176722  T
Q  390 agggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacggg 488  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9176721 agggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggg 9176622  T
Q  489 aaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaaggg 586  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||    
T  9176621 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 9176523  T
Q  587 ctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  9176522 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgtt 9176461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 11008933 - 11008553
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt-----gacatagagggggctgaaacaagagttc 369  Q
    |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||      || |||||||||||||||||||| |||     
T  11008933 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggttt 11008834  T
Q  370 agaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggat 469  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11008833 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 11008734  T
Q  470 tg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactca 568  Q
    || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| | ||||||    
T  11008733 tggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct---ttgtaatggtactca 11008637  T
Q  569 tcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||  ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11008636 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 11008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 16932152 - 16931774
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaa 373  Q
    |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16932152 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaa 16932053  T
Q  374 aggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-a 472  Q
    | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  16932052 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16931953  T
Q  473 gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  16931952 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat 16931854  T
Q  573 a--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16931853 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16931774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 377 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085962
Alignment:
Q  377 caacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtct 476  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  477 cttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atag 574  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||  ||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  575 tgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || | || | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26086037 tggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 26085962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 351 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 22134901 - 22134615
Alignment:
Q  351 ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttacct 450  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22134901 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcacct 22134803  T
Q  451 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatct 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22134802 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 22134703  T
Q  551 cttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22134702 cttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18709455 - 18709149
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18709455 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgat 18709356  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18709355 tcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattg 18709256  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||    
T  18709255 atttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 18709157  T
Q  642 tgtgttct 649  Q
    ||||||||    
T  18709156 tgtgttct 18709149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 300 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 22132737 - 22132389
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagag---------ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| | ||||         |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  22132737 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 22132638  T
Q  390 agggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 489  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132637 tgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 22132539  T
Q  490 aaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggc 587  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | |||||    
T  22132538 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggc 22132440  T
Q  588 tgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22132439 tgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 309 - 652
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323046
Alignment:
Q  309 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagttt 407  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  408 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttggg 507  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T
Q  508 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagac 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  19322897 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagac 19322996  T
Q  604 taggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  19322997 taggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttctctc 19323046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22780665 - 22780358
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22780665 atagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgat 22780566  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780565 tcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 22780466  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   |    
T  22780465 gatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatct 22780367  T
Q  641 ttgtgttct 649  Q
    |||||||||    
T  22780366 ttgtgttct 22780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22783030 - 22782723
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22783030 atagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgat 22782931  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782930 tcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 22782831  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||   |    
T  22782830 gatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatct 22782732  T
Q  641 ttgtgttct 649  Q
    |||||||||    
T  22782731 ttgtgttct 22782723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 304 - 614
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544272
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |    |||||||||||||||||||  |  |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  398 catagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||    
T  13544152 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 13544251  T
Q  595 -tccccagactaggtcaattt 614  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  13544252 tttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 380 - 652
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380701
Alignment:
Q  380 caacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 479  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  480 ggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtg 576  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  577 aaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     |||  || |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 36380701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 53405122 - 53405481
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagag---ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| | |||    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  53405122 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 53405221  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||      
T  53405222 tgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggc 53405320  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggc 587  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||  || ||    
T  53405321 tgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagc 53405420  T
Q  588 tgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53405421 tgctctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttct 53405481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 209 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 8756679 - 8756233
Alignment:
Q  209 cacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatactttta 308  Q
    ||||||| ||| |||||||| || | ||| ||| |||  ||||| ||||||||  ||||| | | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  8756679 cacgatgagatcgcaacgtgccatgttggtgcgctggaggcgaataacagaaacatatttctcggtgcagatttgttccaaattataaacgatactttta 8756580  T
Q  309 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaa-caagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||| | |||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  8756579 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtt 8756481  T
Q  407 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaaaagattgggactttg 505  Q
    || ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  8756480 tg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttg 8756384  T
Q  506 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccag 601  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||| |||| | || |||||||||| ||||    
T  8756383 agtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctccag 8756284  T
Q  602 actaggtc-aatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||   ||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  8756283 actaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 8756233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 417 - 652
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455591
Alignment:
Q  417 gaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattag 516  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  517 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat 612  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  613 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 16455591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 303 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409344
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |  ||| |||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| |||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||  || | |||||||||||    
T  18409482 ttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccc 18409384  T
Q  599 -cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
     |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  18409383 tcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 300 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 47211084 - 47210756
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |      ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47211084 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 47210985  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 492  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  47210984 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaga 47210897  T
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgc 590  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||    
T  47210896 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgc 47210797  T
Q  591 tctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtca 630  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  47210796 tctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 389 - 652
Target Start/End: Original strand, 27499130 - 27499393
Alignment:
Q  389 tagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  27499130 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgat 27499229  T
Q  489 aaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagg 585  Q
    || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||    
T  27499230 aagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaagg 27499326  T
Q  586 gctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499327 gctgctctttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27499393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 303 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537470
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaa-caagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||   ||||||||| | |||||||| ||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaact-agggtttgtat 18537709  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 18537612  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| |    
T  18537611 cttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 18537512  T
Q  597 cccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||| | |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18537511 cccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 447 - 652
Target Start/End: Original strand, 2891434 - 2891643
Alignment:
Q  447 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2891434 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgat 2891533  T
Q  547 atctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 642  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2891534 atctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 2891633  T
Q  643 gtgttctctc 652  Q
    ||||||||||    
T  2891634 gtgttctctc 2891643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 452 - 652
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547505
Alignment:
Q  452 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  552 ttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 648  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttc 13547501  T
Q  649 tctc 652  Q
    ||||    
T  13547502 tctc 13547505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 303 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| | |    
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattct 532  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937344 tttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 303 - 522
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||| | |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  502 tttgggtagaattaggcggga 522  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6133070 tttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 481 - 651
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215656
Alignment:
Q  481 gttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaa 578  Q
    |||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  579 acgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 4215656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 384 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  384 aaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 483  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  484 acgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaac 580  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  581 gaagggctgctctctcccc-agactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
      ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 303 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 18535164 - 18534828
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaa-caagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||| | |||   ||||||||| | |||||||| ||    
T  18535164 cttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaact-agggtttgtat 18535067  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||    
T  18535066 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgaga 18534970  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctct-ctc 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||   || |||||| |||| |||| |||||| | |    
T  18534969 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccc 18534870  T
Q  597 cccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  18534869 cccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 15032875 - 15032584
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||| |||||||||    
T  15032875 gatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttg 15032777  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||          ||||| |||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||     
T  15032776 tatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagattt 15032689  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||    
T  15032688 ggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctc 15032589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 499 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635461
Alignment:
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 498 - 649
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437710
Alignment:
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 11437655  T
Q  596 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437656 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 392 - 652
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136901
Alignment:
Q  392 ggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaa 491  Q
    |||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||     
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggct 588  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||  | ||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggct 30136836  T
Q  589 gctctctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  30136837 gctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctc 30136901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 505 - 652
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101279
Alignment:
Q  505 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctccccaga 602  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctccccaga 5101229  T
Q  603 ctaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101230 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 5101279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 439 - 637
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  439 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 537  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  538 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaac 632  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  633 aaatt 637  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 303 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     ||||||||| |||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 24446820  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatta 465  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 303 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatta 465  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 384 - 637
Target Start/End: Original strand, 28453767 - 28454020
Alignment:
Q  384 aaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 483  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28453767 aaaactagggtttgca--gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt 28453861  T
Q  484 acgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaac 580  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  28453862 acgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 28453961  T
Q  581 gaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    | ||  || |||||| ||||||||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||    
T  28453962 ggagaactactctctcccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 439 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983524
Alignment:
Q  439 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 537  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  538 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaaca 633  Q
    ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||||| ||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaaca 31983528  T
Q  634 aatt 637  Q
    ||||    
T  31983527 aatt 31983524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 300 - 440
Target Start/End: Original strand, 5100992 - 5101133
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||| ||||||||| |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||     
T  5100992 atacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgt 5101091  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101092 atagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 440 - 652
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357994
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggta----gaattaggcggga-gacttattcttg 534  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||    |||||| |   || ||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  535 taacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtc 629  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||  |||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  630 aacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  25357972 aacaaatttttgtgtgttctctc 25357994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 455 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185831
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||||| || |    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc-t 16185920  T
Q  554 ttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||| ||||||||||   |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16185919 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 454 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 3982362 - 3982200
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctc 551  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   || |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  3982362 gaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctc 3982263  T
Q  552 ttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtca 610  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  3982262 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtca 3982200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 277 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 40999308 - 40999017
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaa-caagagttcagaaa 374  Q
    |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||  ||||| |  |||||| |||| ||| |||      
T  40999308 agatttgttccaaattttaagggttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagac- 40999211  T
Q  375 ggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagt 474  Q
    | |||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||   ||||||||||||| || |||  |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  40999210 gtcaacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagt 40999114  T
Q  475 ctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 570  Q
    |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||   |||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40999113 ctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatc 40999017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 384 - 637
Target Start/End: Original strand, 9863791 - 9864049
Alignment:
Q  384 aaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 483  Q
    |||| |||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  9863791 aaaactagggtttg--tagagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtc 9863885  T
Q  484 acgggaaaagattgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc------atagtg 576  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||      ||||||    
T  9863886 acgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtg 9863984  T
Q  577 aaacgaagggctgctctct---ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
     |||| || ||||||||||   |||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  9863985 gaacggagagctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 440 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150959
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 538  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcat 47150959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 303 - 421
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891434
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgta-tcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| | || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  401 agagtttgtctctttggaaca 421  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 552 - 652
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563112
Alignment:
Q  552 ttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccca-gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 648  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 47563108  T
Q  649 tctc 652  Q
    ||||    
T  47563109 tctc 47563112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9177035 - 9176852
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttg-aggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||  || |||| ||||||  ||||||| || ||    
T  9177035 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggttaggcaacgtggcacgatg-gaggttttagttttttaggcaaggcactg 9176938  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagattt 282  Q
    ||   |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9176937 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagattt 9176852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 524 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446636
Alignment:
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccga 621  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||            |||| ||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc------------atttggaccga 24446667  T
Q  622 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446666 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 24446636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 7941133 - 7941251
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag--ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||| || |    
T  7941133 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacga-tggaggtttcagttttttgaggcaaggcact 7941230  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgg 216  Q
    |||   || ||||||||||||    
T  7941231 ggaaaaatggtggcacgatgg 7941251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 11434769 - 11434887
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag--ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||| || |    
T  11434769 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacga-tggaggtttcagttttttgaggcaagacact 11434866  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgg 216  Q
    |||   |||||||||||||||    
T  11434867 ggaaaaatcgtggcacgatgg 11434887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 628
Target Start/End: Original strand, 10112952 - 10113198
Alignment:
Q  384 aaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 483  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10112952 aaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtc 10113046  T
Q  484 ac-gggaaaagattgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacc-cattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtga 577  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||   |||| ||||||     
T  10113047 acggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtgg 10113145  T
Q  578 aacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggt 628  Q
    || | || |||||||||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||    
T  10113146 aatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 571 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 14789494 - 14789422
Alignment:
Q  571 atagtgaaacgaagggctgctctctc---cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14789494 atagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16932361 - 16932213
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  16932361 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 16932264  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| ||||    
T  16932263 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 16932213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 440 - 599
Target Start/End: Original strand, 9022438 - 9022603
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 537  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||    
T  9022438 ttgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaa 9022537  T
Q  538 ccc--attgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    ||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9022538 cctctattgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccc 9022603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 458 - 637
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300608
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 31300521  T
Q  557 taacgttactcatc-----atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||| |  ||||||      |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  31300522 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 31300608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 52942526 - 52942470
Alignment:
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52942526 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 52942470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 566 - 652
Target Start/End: Original strand, 6133101 - 6133188
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| |||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6133101 tcattatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6133188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 526 - 641
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  526 ttattcttgtaacccattgatatc-tcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct--ccccagactaggtcaatttagaccg 620  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||  ||  || ||||||  ||||||||||||||||||| | |||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22780953 - 22780885
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22780953 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgat 22780885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16934714 - 16934647
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16934714 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacatggcacgat 16934647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22783317 - 22783250
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22783317 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgat 22783250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22801346 - 22801262
Alignment:
Q  132 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttatcgtggcacgatgg 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||   |||||||||||||||    
T  22801346 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcagttttgaggcaaggaactggaaaaatcgtggcacgatgg 22801262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336764
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | |||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  554 ttgtaacg---ttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 648  Q
    |   || |   ||  |||| |||||| |||| || |||||||||||||| | | ||||||||| || ||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgttc 5336766  T
Q  649 tc 650  Q
    ||    
T  5336765 tc 5336764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317145
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 15317055  T
Q  557 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15317056 taaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 15317145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3937309 - 3937256
Alignment:
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3937309 cagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctc 3937256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 54867241 - 54867188
Alignment:
Q  581 gaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  54867241 gaagggctgctctctccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11009028 - 11008932
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  11009028 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcactggcagcaaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagc 11008932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 637
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489533
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 16489446  T
Q  557 taacgttactcat-----catagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||| |  ||||||      |||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||    
T  16489447 taaagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctctccctagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 16489533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570155
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050378
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853610
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 337
Target Start/End: Original strand, 25357631 - 25357669
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357631 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa 25357669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529455
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctc-tttg 8529364  T
Q  557 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8529365 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 8529455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22048576 - 22048508
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  22048576 ttgtgagagttaacttaaaatcaagatccgcaagaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgat 22048508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 568
Target Start/End: Original strand, 54906737 - 54906852
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 551  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||   |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  54906737 gaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactctttgatatctc 54906836  T
Q  552 ttttgtaacgttactca 568  Q
     ||||||| ||||||||    
T  54906837 -tttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 616 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 3824628 - 3824593
Alignment:
Q  616 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824628 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 3824593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587027
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 52043791 - 52043737
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||| |||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043791 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatatagaccttgtatca 52043737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822326
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| |||||||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 418 - 482
Target Start/End: Original strand, 10114443 - 10114505
Alignment:
Q  418 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 482  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10114443 aacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Original strand, 4884986 - 4885062
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4884986 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688934
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 16689025  T
Q  557 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| |||| || ||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16689024 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16688934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22134968 - 22134936
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134968 atacttttactataaatatagaccttgtatcaa 22134936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Original strand, 31985658 - 31985726
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  | || ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  31985658 tcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831202
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattagg 15831202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 29609654 - 29609591
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||| ||||| | |||||||||||    
T  29609654 gaaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 38270155 - 38270120
Alignment:
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 527  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270155 agattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16186176 - 16186138
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16186176 gatacttttactataaatataaaccttgtatcagagtaa 16186138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 455 - 513
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638884
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaat 513  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaat 16638884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 10047452 - 10047383
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  10047452 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18709509 - 18709480
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709509 atacttttactataaatatagaccttgtat 18709480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22780744 - 22780687
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaa 332  Q
    |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22780744 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 22780687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22783109 - 22783052
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaa 332  Q
    |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22783109 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 22783052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 39246067 - 39245998
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  39246067 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 461 - 516
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760161
Alignment:
Q  461 tattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga-ttgggactttgggtagaattag 516  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||| || | |||||||||||||||||    
T  3760105 tattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattag 3760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 458 - 490
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4884909
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 4884909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Original strand, 18587098 - 18587154
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18587098 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 18587154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 28453681 - 28453713
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453681 gatatttttactataaatatagaccttgtatca 28453713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Original strand, 36769591 - 36769667
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||    
T  36769591 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattctt 36769667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 652
Target Start/End: Original strand, 55822396 - 55822464
Alignment:
Q  586 gctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaat-tcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||    
T  55822396 gctgctctctccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgttttctctc 55822464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Original strand, 21947769 - 21948323
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||    
T  21947769 ttgtgagagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacgtgacacgattggaggtttcagttttgaggtaagtcactgg 21947868  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21947869 actttacgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggtg---tggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 21947965  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt-gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21947966 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggttt 21948064  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |    
T  21948065 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 21948164  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  21948165 gggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 21948264  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948265 tcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 21948323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 103 - 649
Target Start/End: Original strand, 4236374 - 4236922
Alignment:
Q  103 agagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggattt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||       
T  4236374 agagttaacttaaaatcagatttctgcagaatt-gtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttaaggcaaggcactggaaaa 4236472  T
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4236473 atcgtggcacaatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacgtattttgag-tgcagatttgttccaaattttaagcgat 4236571  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4236572 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 4236671  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  4236672 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 4236771  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||    
T  4236772 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 4236871  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4236872 ccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttct 4236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 99 - 649
Target Start/End: Original strand, 38881845 - 38882399
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt-gaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||||| |||||||| || |||    
T  38881845 tgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatg-gaggttttagtttttgaggcaaggcactgg 38881943  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38881944 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 38882043  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggg-gctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  38882044 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 38882143  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  38882144 tgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 38882243  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||    
T  38882244 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38882342  T
Q  594 ctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882343 ctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 99 - 650
Target Start/End: Original strand, 16775897 - 16776452
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||  || || |    
T  16775897 tgtgagaattaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtgacacgattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactgaa 16775996  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  16775997 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcatcgaaaaacagaaacatatttttgagtgaagatttgttccaaattttaagc 16776096  T
Q  299 gatacttttactataaa-tatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  16776097 gatacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggttt 16776196  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  16776197 gtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 16776296  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| | || ||||||||| ||    
T  16776297 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatc 16776395  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 650  Q
    | |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776396 tcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 16776452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 225 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 25921886 - 25921458
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921886 cgtggcacgatggtgcgctgacagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 25921787  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25921786 tgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 25921687  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  25921686 cactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaag 25921587  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccg 620  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25921586 acttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 25921487  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921486 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25921458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 243 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 2818731 - 2818317
Alignment:
Q  243 tggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-cttt 341  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2818731 tggcagcgaataacaaaaacgtattttcgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt 2818632  T
Q  342 gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 441  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818631 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 2818532  T
Q  442 -gatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 540  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  2818531 tgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 2818432  T
Q  541 attgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2818431 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaatt 2818332  T
Q  638 cttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||    
T  2818331 cttttgtgttctctc 2818317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 225 - 649
Target Start/End: Original strand, 2174785 - 2175212
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  2174785 cgtggcacgatggtgcactggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatacaggcct 2174884  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2174885 tgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa 2174984  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174985 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 2175084  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccg 620  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2175085 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 2175183  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175184 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 36402846 - 36402310
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  36402846 ttgtgagagttaacttaaaattaggtttctgcagaa-tctaggcacgatggctgggcaacatagcacgattggaggtttcagttttgaggcaagtcactg 36402748  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    | ||| ||||                     |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  36402747 gttttttcgt---------------------ggcacgatggtgcgttggcaacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttc-aaattttaa 36402670  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||  || ||| |||||||    
T  36402669 gcgatacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtt 36402570  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  36402569 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagat 36402470  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | | |||||||    
T  36402469 tggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctct 36402370  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36402369 ctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36402310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 225 - 652
Target Start/End: Original strand, 6756360 - 6756789
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||    
T  6756360 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttggtgcagatttattccaaattttaagttatacttttactattaatatagatct 6756459  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756460 tgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 6756559  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756560 cactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 6756659  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagacc 619  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  6756660 acttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaacg-agggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggacc 6756756  T
Q  620 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6756757 gaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctc 6756789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 305 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511194
Alignment:
Q  305 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 18511448  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18511447 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 18511348  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18511347 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 18511248  T
Q  600 -agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18511247 tagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 18511194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 301 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 10529436 - 10529091
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||  |    
T  10529436 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattttta 10529337  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10529336 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 10529237  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || | ||||||||||| |    
T  10529236 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcc 10529137  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 642  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10529136 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12556442 - 12555905
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  12556442 ttgtgagagttaatttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggcataatggctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagttttgaggcaagtcactgg 12556343  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |||| ||||                     |||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| || |||| ||||||    
T  12556342 atttttcgt---------------------ggcacgatgatgcgctggcagcgaataacagaaatgtatttttgtgtacagatttgtttcaaaatttaag 12556264  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||||||| ||| ||||    
T  12556263 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagttt 12556164  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  12556163 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagatt 12556064  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
     ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||| |    
T  12556063 -ggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctat 12555965  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12555964 ctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctc 12555905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Original strand, 39854426 - 39854780
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  39854426 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 39854524  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||     
T  39854525 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgga 39854624  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |    
T  39854625 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 39854724  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39854725 cccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39854780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Original strand, 25804012 - 25804318
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804012 atagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 25804111  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804112 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 25804211  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 642  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25804212 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattctttt 25804311  T
Q  643 gtgttct 649  Q
    |||||||    
T  25804312 gtgttct 25804318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Original strand, 40221464 - 40221820
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  40221464 tacttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 40221563  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40221564 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 40221663  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||||     
T  40221664 acttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 40221763  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40221764 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctc 40221820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 16092492 - 16092181
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16092492 atagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgat 16092393  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092392 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 16092293  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16092292 agatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattctt 16092193  T
Q  641 ttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||    
T  16092192 ttgtgttctctc 16092181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Original strand, 26097674 - 26098028
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||     
T  26097674 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgg 26097773  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||    
T  26097774 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgg 26097872  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||| ||||||||||    
T  26097873 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagg-ctgctctctc 26097971  T
Q  597 c-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097972 ctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 26098028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189589
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaa--cttt---gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||| |||| |||| ||||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctct 1189650  T
Q  594 ctc--cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189649 ctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1189589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127153
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  24127000 tttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 24127099  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127100 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 24127153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904400
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggc 25904246  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| | | ||||||||| |||    
T  25904247 tttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccc 25904346  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25904347 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctc 25904400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073181
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggc 17073026  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  17073027 tttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccc 17073126  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17073127 ccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgctttctctc 17073181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 18468948 - 18469303
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18468948 atacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 18469047  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18469048 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 18469147  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca--tagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  18469148 ctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctc 18469247  T
Q  593 tctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  18469248 tct-cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttct 18469303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Original strand, 31544996 - 31545374
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaa 373  Q
    |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  31544996 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 31545095  T
Q  374 aggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-ga 472  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31545096 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaga 31545195  T
Q  473 gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  31545196 gtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacagtactcatcat 31545294  T
Q  573 a--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31545295 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31545374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21684897 - 21684437
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| || |||||||||||| |     
T  21684897 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttacaaattttaagcaaa 21684798  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatta 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |          ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||    
T  21684797 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaacta 21684698  T
Q  391 gggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684697 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 21684598  T
Q  491 aagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggct 588  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || ||||||    
T  21684597 gaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggct 21684499  T
Q  589 gctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21684498 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 21684437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 349 - 651
Target Start/End: Original strand, 6745060 - 6745364
Alignment:
Q  349 agggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttac 448  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  6745060 agggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcac 6745158  T
Q  449 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6745159 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 6745258  T
Q  549 ctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745259 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 6745358  T
Q  646 ttctct 651  Q
    ||||||    
T  6745359 ttctct 6745364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 304 - 649
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466978
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||    
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgg 18466824  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| || |||| || ||||||||||     
T  18466825 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctc 18466924  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466925 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 18466978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 305 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509300
Alignment:
Q  305 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagag-ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | | || |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggact 18509453  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc- 599  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  18509452 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccct 18509353  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18509352 agactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 18509300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Original strand, 31542651 - 31543028
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaa 373  Q
    |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31542651 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 31542750  T
Q  374 aggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-a 472  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  31542751 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 31542850  T
Q  473 gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  31542851 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctcttt-gtaacagtactcatcat 31542948  T
Q  573 a--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31542949 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31543028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 306 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474305
Alignment:
Q  306 ttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagag 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  405 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggacttt 504  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggacttt 10474456  T
Q  505 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccag 601  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||     
T  10474455 gagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccat 10474356  T
Q  602 actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10474355 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 10474305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 227 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31466389 - 31465971
Alignment:
Q  227 tggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttg 326  Q
    ||||||||||| ||  |||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31466389 tggcacgatggtgcactggcagggaataccataaatgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagaccttg 31466290  T
Q  327 tatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaaca 425  Q
    ||||| | ||| |||||| ||| | |||||||||||||  ||| | ||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31466289 tatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaca 31466190  T
Q  426 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagac 525  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31466189 ccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac 31466090  T
Q  526 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttagaccgaact 624  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||         ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31466089 -tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcata--------tagggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccgaact 31465999  T
Q  625 gggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31465998 aggtcaacaaattcttttgtattctctc 31465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 300 - 648
Target Start/End: Original strand, 18596588 - 18596939
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| |||||||||     
T  18596588 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggt--ataaagacaacaacaaaactagggtttgt 18596685  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18596686 atagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 18596785  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||||    
T  18596786 gactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct 18596885  T
Q  596 cc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 648  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18596886 cctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 301 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 17818826 - 17818475
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||  || ||| |||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  17818826 tacttttgttataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaaga-ggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 17818728  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17818727 tagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgag 17818628  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat--agtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||  |||||| ||||| ||    
T  17818627 gctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggcttctctc-cc 17818529  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818528 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17818475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472594
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |  |||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 31472749  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    ||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  31472748 ttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctccc 31472649  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31472648 ccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 31472594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 99 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20508001 - 20507659
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20508001 tgtgagagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggcacgatagttgggcaacgtagcacgattggaggttttagttttgaggcaagtcattgga 20507902  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||  |||||||    
T  20507901 tttttcgtggcacgatgggattgcaacatggcacgaaggtgcgctagcagcgaataacagaaacatatttttgggagcagatttgttccaagatttaagc 20507802  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20507801 gatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttg 20507702  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 440  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20507701 tatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 27910386 - 27910744
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagag------ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| | ||||      |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  27910386 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaag-gtttaaaaaggcaacaacaaaactagg 27910484  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 492  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27910485 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaaga 27910584  T
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgc 590  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| || |||| || |||||    
T  27910585 ggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgc 27910684  T
Q  591 tctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910685 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 27912471 - 27912830
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |      ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27912471 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 27912570  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 492  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27912571 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaaga 27912670  T
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgc 590  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||  ||  ||||    
T  27912671 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgc 27912770  T
Q  591 tctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912771 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27912830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 380 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658338
Alignment:
Q  380 caacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 479  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  480 ggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtga 577  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  578 aacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658410 aacggatggctg--ctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 658338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 302 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 31179707 - 31179368
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31179707 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31179608  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31179607 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 31179508  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||||    
T  31179507 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 31179409  T
Q  598 cc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  31179408 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 34477346 - 34477038
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34477346 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 34477247  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccat 542  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  34477246 tcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccat 34477147  T
Q  543 tgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattct 639  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34477146 tgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 34477048  T
Q  640 tttgtgttct 649  Q
     |||||||||    
T  34477047 cttgtgttct 34477038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 301 - 651
Target Start/End: Original strand, 6747246 - 6747600
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt---gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||       || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  6747246 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttg 6747345  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6747346 tataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactg 6747444  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||| | || |||||||||||||    
T  6747445 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctct 6747543  T
Q  596 c-cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747544 ctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6747600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 34479711 - 34479403
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34479711 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 34479612  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccat 542  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  34479611 tcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccat 34479512  T
Q  543 tgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattct 639  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34479511 tgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 34479413  T
Q  640 tttgtgttct 649  Q
    ||||||||||    
T  34479412 tttgtgttct 34479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 301 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 37706117 - 37705774
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |    
T  37706117 tacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgta 37706018  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  37706017 tagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 37705918  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
      ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  37705917 gttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcc 37705818  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  37705817 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696175
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| | |||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
              |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 696020  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  696021 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 696120  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  696121 ccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctc 696175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39397975
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |   |||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  402 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||   ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  39398129 ctttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctccc 39398030  T
Q  599 -cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  39398029 acagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttctctc 39397975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 311 - 652
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954713
Alignment:
Q  311 ataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgt 409  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| ||||||| |  ||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||  || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  410 ctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggt 508  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  509 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagacta 605  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaacta 2954666  T
Q  606 ggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2954667 ggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 2954713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 436 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505825
Alignment:
Q  436 agggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 535  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  536 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaaca 633  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 20505844  T
Q  634 aattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20505843 aattcttttgtgttctctc 20505825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Original strand, 15552232 - 15552539
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15552232 atagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgat 15552331  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552332 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 15552431  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |    
T  15552432 gatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttct 15552530  T
Q  641 ttgtgttct 649  Q
    |||||||||    
T  15552531 ttgtgttct 15552539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 303 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530731
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34530801 tttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcat 34530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 310 - 652
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289058
Alignment:
Q  310 tataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttg 408  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| | |||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  409 tctctttggaacaaacactagggtt------tgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc- 599  Q
    |||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||        ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat--------cttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccc 21289005  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21289006 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctc 21289058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 425 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585726
Alignment:
Q  425 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 524  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  525 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccga 621  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  622 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 41585726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 10586780 - 10587126
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagag---ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| | |||    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||        
T  10586780 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag---- 10586875  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
           ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||    
T  10586876 -------agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagaga 10586968  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  10586969 ttgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 10587067  T
Q  593 tct--ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10587068 tctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10587126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 420 - 652
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724190
Alignment:
Q  420 caaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcg 519  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  520 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttag 616  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  617 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 2724190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 303 - 516
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || || | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 20043193  T
Q  502 tttgggtagaattag 516  Q
    ||||| |||||||||    
T  20043194 tttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 437 - 649
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798341
Alignment:
Q  437 gggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 536  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  537 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaaca 633  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  634 aattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||    
T  39798326 aattcttttgtgttct 39798341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 425 - 649
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410316
Alignment:
Q  425 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 524  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  525 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccga 621  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | || |||||||||||||| |||||||||||  || ||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  622 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 4410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 308 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661181
Alignment:
Q  308 actataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  407 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgg 506  Q
    ||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgg 6661317  T
Q  507 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctctccc-caga 602  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   || |||||| |||| | | |||||||||||| ||||    
T  6661316 gtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcaga 6661217  T
Q  603 ctaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  6661216 ctaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 303 - 520
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || || | |||| | |||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||| |||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgg 520  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20045154 tttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 454 - 641
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749986
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 10749894  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10749895 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10749986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 439 - 644
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208865
Alignment:
Q  439 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 537  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  538 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaa 36208855  T
Q  635 attcttttgt 644  Q
    ||||||||||    
T  36208856 attcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 454 - 641
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757462
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc- 10757370  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757371 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattcttt 10757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665337
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 23665237  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23665238 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23665337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793250
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 23793350  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23793349 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23793250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 300 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26098589 - 26098379
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | || |||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| || | |||||||||     
T  26098589 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgt 26098490  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26098489 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattgg 26098390  T
Q  499 gactttgggta 509  Q
    |  ||||||||    
T  26098389 ggttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354560
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 15354660  T
Q  553 tttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||   |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15354659 tttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15354560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356836
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 15356936  T
Q  553 tttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||   |||||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15356935 tttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15356836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20504453 - 20504316
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||    
T  20504453 ttgtgagagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgattggaggttttagttttgaggcaagtcaatgg 20504354  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgat 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20504353 atttttcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgat 20504316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373122
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  553 tttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3373220 tt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 3373122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054134
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||  |||| ||| ||||  ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttgg-----agattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattct 639  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   |||||  |||| | ||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20054022 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattct 20054121  T
Q  640 tttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||    
T  20054122 tttgtgttctctc 20054134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960117
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 38960217  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38960216 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 38960117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 382 - 652
Target Start/End: Original strand, 9020246 - 9020517
Alignment:
Q  382 acaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 481  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||   ||||| | ||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9020246 acaaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttgg 9020341  T
Q  482 ttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaa 578  Q
    | ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| |    
T  9020342 tcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgga 9020441  T
Q  579 acgaagggctgctctctcc-ccagactaggtc-aatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     || | ||||||||||||| ||| | ||||||   ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  9020442 tcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttctctc 9020517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 461 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741844
Alignment:
Q  461 tattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 559  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaa 23741937  T
Q  560 cgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||  |||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23741936 cgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23741844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 400 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 17413402 - 17413232
Alignment:
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  17413402 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag 17413306  T
Q  500 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    ||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17413305 actttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 17413232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 440 - 637
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143750
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 538  Q
    |||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaaca 633  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||  | |||||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaaca 15143746  T
Q  634 aatt 637  Q
    ||||    
T  15143747 aatt 15143750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Original strand, 659712 - 659829
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||    
T  659712 ttgtgagagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcag-tttgaggcaagtcactgg 659810  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgg 216  Q
    |   |||||||||||||||    
T  659811 aaaaatcgtggcacgatgg 659829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2818847 - 2818729
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaa-cttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  2818847 tgtgagagttaaacttaaaattaggttctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgaggcaagtcactgg 2818748  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgg 216  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  2818747 atttttcgtggcacgatgg 2818729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31466497 - 31466379
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  31466497 ttgtgagagttaacttaaaatcaggttttgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatgagatgtttcagttatgaggcaagtcactgg 31466398  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgg 216  Q
    |   ||| |||||||||||    
T  31466397 aaaaatcttggcacgatgg 31466379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 484 - 573
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  484 acgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 573  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 546 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098270
Alignment:
Q  546 tatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc--agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 26098281  T
Q  642 tgtgttctctc 652  Q
    | |||||||||    
T  26098280 tatgttctctc 26098270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Original strand, 39797956 - 39798058
Alignment:
Q  227 tggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttg 326  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39797956 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttg 39798055  T
Q  327 tat 329  Q
    |||    
T  39798056 tat 39798058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18186587 - 18186493
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtca 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18186587 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaa-tcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaagtca 18186493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 455 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 15445453 - 15445263
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggtt---acgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatct 550  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||     ||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||   || || | ||||||||||||| |||||||||    
T  15445453 aaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatct 15445354  T
Q  551 cttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||    
T  15445353 cttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctcttcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 458 - 572
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897943
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  557 taacgttactcatcat 572  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcat 4897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Original strand, 6756257 - 6756372
Alignment:
Q  101 tgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatt 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  6756257 tgagggttaatttaaaatcaggttctacagaaatcgtggcacgatgcctggataacatggcacgattagaggtttcaactttgaggcaagtcactggatt 6756356  T
Q  201 tatcgtggcacgatgg 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  6756357 tttcgtggcacgatgg 6756372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Original strand, 31544797 - 31544997
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  31544797 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-aaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 31544894  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttta 295  Q
    |||   |||||||||||||||| |  || || | |||||||| ||| |||| |  || ||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  31544895 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttattacagatttta 31544994  T
Q  296 agc 298  Q
    |||    
T  31544995 agc 31544997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34477633 - 34477485
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttg-aggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  ||||||| || |    
T  34477633 ttgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatg-gaggttttagttttttaggcaaggcact 34477536  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  34477535 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 34477485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 572 - 652
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043287
Alignment:
Q  572 tagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 20043287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 526
Target Start/End: Original strand, 42770714 - 42770934
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaactttgacatagagggggctgaaa-caagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |   ||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||||| |||||||||| |||     
T  42770714 gatacttttactataaatataaactttgtatcgagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaattagg-ttta 42770810  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||| ||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42770811 tatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattg 42770905  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagact 526  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770906 agactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34479973 - 34479905
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479973 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 34479905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 440 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033563
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgta 536  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||   | |||||| || | |||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaattaagtttgaagacttgttatggta 34033669  T
Q  537 acccatt-gatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaa 631  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    ||| |||  ||  ||||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||| ||    
T  34033668 accccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcattactgtggaacatagaactgctctctcccctgactaggtcagtattggatcgaactgggtaaa 34033569  T
Q  632 caaatt 637  Q
    ||||||    
T  34033568 caaatt 34033563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21684970 - 21684905
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684970 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 21684905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 454 - 638
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667601
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | || |||||||||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| ||||||||||| |||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  553 tttgtaacgttactcatca--tagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattc 638  Q
    || ||||||| ||||||||  || || | || ||||||||||||| |||||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  23667514 tt-gtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25921992 - 25921874
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag--ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | || |||||||  |||||||||||| || |    
T  25921992 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgatggttggacaacgtggcacga-tggaggtttcagttttttgaggcaaggcact 25921895  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgg 216  Q
    |||   |||||||||||||||    
T  25921894 ggaaaaatcgtggcacgatgg 25921874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 397
Target Start/End: Original strand, 4409999 - 4410100
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4409999 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4410098  T
Q  396 tg 397  Q
    ||    
T  4410099 tg 4410100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 2174680 - 2174797
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||||| || ||    
T  2174680 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagttttttaggcaaggcactg 2174777  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgg 216  Q
    ||   |||||||||||||||    
T  2174778 gaaaaatcgtggcacgatgg 2174797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Original strand, 31542442 - 31542625
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||| || ||||  |||||| || ||    
T  31542442 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-aaatcgtgacacgatagctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 31542539  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagattt 282  Q
    ||   |||||||||||||||| |  || || | |||||||| ||| |||| |  || ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  31542540 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagattt 31542625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 190
Target Start/End: Original strand, 39797849 - 39797940
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaag 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||||||||    
T  39797849 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatga-tggaggtttcagtttttgaggcaag 39797940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 2144763 - 2144599
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 536  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||    
T  2144763 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgta 2144664  T
Q  537 acc-cattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||   || ||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2144663 accttttttatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 517
Target Start/End: Original strand, 4754198 - 4754312
Alignment:
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || |||| |||||| |    
T  4754198 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtg 4754294  T
Q  500 actttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  4754295 actttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 661286 - 661227
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  661286 tgtgagagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggtatgatggctaggcaacgt 661227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Original strand, 29748443 - 29748502
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaa 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29748443 gaaacactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170872
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385573
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 10749505 - 10749652
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || ||    
T  10749505 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 10749602  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  10749603 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 10749652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093413
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattag 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 331
Target Start/End: Original strand, 29748260 - 29748313
Alignment:
Q  278 gatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29748260 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatca 29748313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208597
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctg-aaacaagagttcagaaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 36208597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34477435 - 34477379
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477435 gcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatca 34477379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452556
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3373379 - 3373345
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373379 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 3373345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627425
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattagg 10627425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 10756959 - 10757107
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  10756959 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtagcacgacggctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 10757056  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  10757057 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 10757107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15355066 - 15354918
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  15355066 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 15354969  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  15354968 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 15354918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15357342 - 15357194
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  15357342 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 15357245  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  15357244 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 15357194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31179934 - 31179885
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31179934 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgatgg 31179885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 41586044 - 41585946
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||   ||| ||||||| |||||||||    
T  41586044 atacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 517
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445557
Alignment:
Q  460 ctattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2144931 - 2144899
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144931 gatacttttactataaatatagaccttgtatca 2144899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 10757207 - 10757239
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757207 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 10757239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15354818 - 15354786
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354818 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 15354786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15357094 - 15357062
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357094 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 15357062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 23665081 - 23665113
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665081 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 23665113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23793506 - 23793474
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793506 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 23793474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 517
Target Start/End: Original strand, 32520533 - 32520597
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  32520533 gaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34479796 - 34479740
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34479796 gcagatttgttacagattttaagcgagacctttactataaaaatagaccttgtatca 34479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 440 - 572
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430394
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 536  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 35430358  T
Q  537 a-cccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |  |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35430359 attcttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcat 35430394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 38960378 - 38960346
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960378 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 38960346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38960605 - 38960550
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  38960605 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacggctgggc 38960550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Original strand, 42238372 - 42238448
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42238372 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 42238448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 331
Target Start/End: Original strand, 15552176 - 15552207
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552176 atacttttactataaatatagaccttgtatca 15552207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 331
Target Start/End: Original strand, 25803957 - 25803988
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803957 atacttttactataaatatagaccttgtatca 25803988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786465
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattagg 28786465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240489
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 566 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 26406536 - 26406451
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 650  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  26406536 tcattatagtggaacgaagagctgctctctcctccagagtaggttaacattagaccgaactaggtaaacaaattc-tttgtgttctc 26406451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 659929 - 659869
Alignment:
Q  154 aacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttatcgtggcacgatg 215  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  659929 aacgtggcacgattggaggtttcagttt-gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatg 659869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10282318 - 10282269
Alignment:
Q  129 agaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag 178  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10282318 agaaatcgtggcacgtttgcagggcaacgtggcacgattggatggttcag 10282269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Original strand, 17003984 - 17004053
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  17003984 tcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 23667108 - 23667256
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||||  || ||||||||    | |||   ||||  || ||| || ||    
T  23667108 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaa-tcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactg 23667206  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  23667207 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 23667256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 10749730 - 10749762
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10749730 acttttagtataaatatagaccttgtatcaaag 10749762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 528 - 572
Target Start/End: Original strand, 20045210 - 20045254
Alignment:
Q  528 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  20045210 attcttttaacccattgatatcttttttgtaaagttacttatcat 20045254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Original strand, 22672966 - 22673022
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22672966 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22673022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 23664834 - 23664901
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||||    
T  23664834 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgat 23664901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 246
Target Start/End: Original strand, 23664937 - 23664981
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  23664937 atcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 23664981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 23667356 - 23667388
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23667356 actttaactataaatatagaccttgtatcaaag 23667388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23742101 - 23742069
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23742101 acttttactataaatatagaccttgtgtcaaag 23742069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23793650 - 23793606
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  23793650 atcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 23793606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23793753 - 23793686
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||||    
T  23793753 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgat 23793686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Original strand, 25445628 - 25445684
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25445628 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25445684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 136)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 27306767 - 27306214
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27306767 tgtgagagttaacttaaaataaggttttgca-aaatcgtggcacgatggctggacaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaagtcattgga 27306669  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27306668 aaaatcgtggcacgatggggtcgcttcgtggcacgatggtgcgctagcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 27306569  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  27306568 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttt 27306469  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  27306468 -atagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 27306370  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  27306369 ggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct 27306270  T
Q  596 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27306269 cccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 27306214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31435586 - 31435028
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31435586 tgtgagagttgacttaaaatcaggttctacagaaatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaagtcactgga 31435487  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttg-gatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    ||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||| |||  ||||||||||||||    
T  31435486 tttttcgtggcacgatggggtcacaacttggcacgatggtgcgctggcaacgaataacagaaacgtatttttttggtgcaaattg-ttccaaattttaag 31435388  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31435387 cgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31435288  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  31435287 gtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 31435188  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||    
T  31435187 ggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 31435088  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435087 ctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 31435028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 35378 - 35933
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  || |||    
T  35378 ttgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcgtggcacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactgg 35477  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||||||||||||| | ||| |||||| |||| | ||| ||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35478 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcccgatcgtgcgctggcagcaaatagcagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 35577  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35578 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggttt 35677  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  35678 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggct 35777  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||| ||    
T  35778 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttc 35877  T
Q  595 tcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35878 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttct 35933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 99 - 649
Target Start/End: Original strand, 3878322 - 3878881
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  || |||    
T  3878322 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactgg 3878420  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  3878421 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtacgctggcagcgaataacagaaacgtattttggg-tgcagatttgttccaaattttaag 3878519  T
Q  298 cgatacttttactataaat----atagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatta 390  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| || || |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  3878520 cgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 3878619  T
Q  391 gggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878620 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 3878719  T
Q  491 aagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggct 588  Q
     ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||    
T  3878720 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 3878819  T
Q  589 gctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878820 gctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 44313 - 44868
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||  ||||| ||||  || |||    
T  44313 ttgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcgtggcacgatttctgggcaatgtggcacgattggaggtttcaagtttgacgcaaagcactgg 44412  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  44413 aaaaatcatggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcagatttgtaccaaattttaag 44512  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44513 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 44612  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  44613 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggtt 44712  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |  |||||| ||    
T  44713 gggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttc 44812  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44813 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 99 - 647
Target Start/End: Original strand, 25542281 - 25542830
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| || | ||    
T  25542281 tgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaat-gtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttaaggcaaggcacttga 25542379  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttgga-tgcagatttattccaaattttaag 297  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  25542380 aaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttgagtgtagatttattccaaattttaag 25542479  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25542480 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggttt 25542578  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  25542579 gtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagact 25542677  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || || |||||||||    
T  25542678 gggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctc 25542776  T
Q  595 tcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542777 tcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25542830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 225 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 1049708 - 1049283
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1049708 cgtggcacgaaggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 1049609  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||| | || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  1049608 tgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaa 1049509  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049508 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 1049409  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccg 620  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1049408 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 1049310  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1049309 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1049283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137091
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggac 20137245  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20137244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 20137145  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137144 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20137091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 225 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 40837156 - 40836728
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttgga-tgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacc 323  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||| || |||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40837156 cgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaatagaaacatattttttgagtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagacc 40837057  T
Q  324 ttgtatcaaagtaactttg-acatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaa 422  Q
    |||||||| || || |||| | || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40837056 ttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa 40836957  T
Q  423 acactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga 522  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  40836956 acactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 40836857  T
Q  523 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagacc 619  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40836856 gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 40836758  T
Q  620 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836757 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40836728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724886
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | | || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  44724733 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 44724832  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724833 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 44724886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13099814 - 13099456
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||     
T  13099814 atacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 13099715  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13099714 atagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgg 13099615  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  13099614 ggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc 13099515  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099514 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 13099456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 38393933 - 38394290
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38393933 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 38394032  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  38394033 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 38394132  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  38394133 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 38394232  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394233 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38394290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Original strand, 443546 - 443903
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||| |||||||| ||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||     
T  443546 atacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 443645  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  443646 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgg 443745  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  443746 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctc 443845  T
Q  596 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443846 ccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 443903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748902
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 24748747  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc- 597  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||     
T  24748748 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcct 24748847  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24748848 ccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 24748902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Original strand, 48457601 - 48457957
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  48457601 tactttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 48457700  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  48457701 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 48457800  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  48457801 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 48457900  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457901 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48457957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 42331337 - 42330979
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| || ||||||     
T  42331337 atacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgt 42331238  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgggaaaagatt 496  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  42331237 atagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagatt 42331138  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||  ||||    
T  42331137 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctc 42331038  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331037 tcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 42330979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295916
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagacctt-gtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  401 agagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 4296072  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||| |    
T  4296071 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctcc 4295972  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4295971 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctc 4295916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 305 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470007
Alignment:
Q  305 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |    
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 7470160  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| || |    
T  7470159 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcc 7470060  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470059 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Original strand, 20626035 - 20626345
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20626035 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgat 20626134  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20626135 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattg 20626234  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20626235 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 20626334  T
Q  642 tgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||    
T  20626335 tgtgttctctc 20626345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Original strand, 20629926 - 20630236
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20629926 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgat 20630025  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20630026 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattg 20630125  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20630126 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 20630225  T
Q  642 tgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||    
T  20630226 tgtgttctctc 20630236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Original strand, 20642345 - 20642655
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20642345 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgat 20642444  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20642445 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattg 20642544  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20642545 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 20642644  T
Q  642 tgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||    
T  20642645 tgtgttctctc 20642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 305 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471965
Alignment:
Q  305 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||     
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga 7472118  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || | ||||||||||| |    
T  7472117 actttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcc 7472018  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472017 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7471965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 336 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 21592444 - 21592125
Alignment:
Q  336 aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592444 aactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 21592345  T
Q  436 agggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 535  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21592344 agggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgt 21592245  T
Q  536 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaac 632  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21592244 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 21592145  T
Q  633 aaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21592144 aaattcttttgtgttctctc 21592125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355565
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagac 11355411  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| |||  || ||||||||||||||    
T  11355412 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccc 11355511  T
Q  600 -agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11355512 tagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctc 11355565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 20299405 - 20299764
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagag-ttcagaaaggcaacaacaaaattaggg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||| |||||    
T  20299405 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactaggg 20299504  T
Q  394 tttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 492  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20299505 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 20299604  T
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgc 590  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||| |||    
T  20299605 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgc 20299704  T
Q  591 tctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299705 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 347 - 649
Target Start/End: Original strand, 40946327 - 40946632
Alignment:
Q  347 agagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattt 446  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40946327 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgattt 40946426  T
Q  447 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 546  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40946427 actttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 40946526  T
Q  547 atctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttg 643  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946527 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 40946626  T
Q  644 tgttct 649  Q
    ||||||    
T  40946627 tgttct 40946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 99 - 466
Target Start/End: Original strand, 18567363 - 18567731
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18567363 tgtgagagttgacttaaaatcaggttctacagaaatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaagtcactgga 18567462  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttg-gatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    ||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||| |||  ||||||||||||||    
T  18567463 tttttcgtggcacgatggggtcacaacttggcacgatggtgcgctggcaacgaataacagaaacgtatttttttggtgcaaattg-ttccaaattttaag 18567561  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18567562 cgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18567661  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattag 466  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18567662 gtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 304 - 652
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990457
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | || ||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| || | |||| ||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 21990304  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc- 599  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||     
T  21990305 ttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccca 21990404  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990405 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 21990457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 18345488 - 18345845
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgac----atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||     |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18345488 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 18345587  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  18345588 ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagg 18345687  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||| ||    
T  18345688 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttc 18345787  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18345788 tctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 18345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 279 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 31156271 - 31155896
Alignment:
Q  279 atttattccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaagg 376  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31156271 atttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 31156172  T
Q  377 caacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 475  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31156171 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 31156072  T
Q  476 tcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--ata 573  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||    
T  31156071 tcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcctata 31155973  T
Q  574 gtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| |  | ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31155972 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31155896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 300 - 648
Target Start/End: Original strand, 3035668 - 3036027
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  3035668 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 3035767  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa-aag 493  Q
    ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3035768 ttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaag 3035867  T
Q  494 at--tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctg 589  Q
    |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  3035868 aggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctg 3035967  T
Q  590 ctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 648  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035968 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 3036027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678371
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21678220 tttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccc 21678319  T
Q  600 -agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  21678320 tagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattc--ttgtgttctctc 21678371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680337
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  || |||||||||| |||    
T  21680181 tttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccc 21680280  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaa---ctgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21680281 cagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctc 21680337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 304 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412109
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | || ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  403 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggac 37412263  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||||||    
T  37412262 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 37412163  T
Q  598 cc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 650  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37412162 cctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttctc 37412109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 20297309 - 20297666
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||    
T  20297309 atacttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggt 20297408  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20297409 ttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 20297508  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||    
T  20297509 ttggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctc 20297608  T
Q  593 tctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20297609 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 20297666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 98 - 541
Target Start/End: Original strand, 26804344 - 26804765
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcg-cagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || ||    
T  26804344 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggtacgattggaggtttcagttttgaggcaaggcagtg 26804442  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||   ||||||||||||                     ||| ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26804443 gaaaaatcgtggcacga---------------------tggtgcgctggcagcaaataacagaaacgta-ttttgggtgcagatttgttccaaattttaa 26804520  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26804521 gcgatacttttactataaatatagaccttgt----gagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 26804616  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacac---tagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 492  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26804617 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaaga 26804716  T
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 541  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804717 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Original strand, 1849978 - 1850285
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1849978 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgat 1850077  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850078 tcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 1850177  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1850178 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 1850277  T
Q  642 tgtgttct 649  Q
    ||||||||    
T  1850278 tgtgttct 1850285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145968
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  |||| | |||| || ||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaac 39146123  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc-tctcc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  ||||||||| | |||    
T  39146122 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttcc 39146023  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146022 ctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39145968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 300 - 647
Target Start/End: Original strand, 28485513 - 28485867
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28485513 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 28485612  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28485613 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaga 28485712  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatag--tgaaacgaagggctgctc 592  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| |  |||| |||||    
T  28485713 ttggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctc 28485812  T
Q  593 tctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485813 tctcctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 28485867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681127
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaa--cttt---gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||    || |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 9680967  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  9680968 tgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 9681067  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9681068 ctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctc 9681127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 345 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 1047216 - 1046912
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1047216 atagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 1047117  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047116 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 1047017  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1047016 atttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 1046918  T
Q  642 tgtgtt 647  Q
    ||||||    
T  1046917 tgtgtt 1046912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 28487500 - 28487857
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| ||    
T  28487500 atacttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagt 28487599  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  28487600 ttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaga 28487699  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||| |||||    
T  28487700 ttggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctc 28487799  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28487800 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 28487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223465
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagg-gggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||| ||||| | ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  401 agagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 42223309  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
     |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||| |    
T  42223310 gctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcc 42223409  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42223410 cccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctc 42223465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 304 - 652
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679366
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |    |||||||||||||||||||  |  |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  398 catagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||    
T  9679208 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 9679307  T
Q  595 -tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9679308 tttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 9679366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 309 - 652
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258775
Alignment:
Q  309 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagttt 407  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 24258522  T
Q  408 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttggg 507  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  24258523 gtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttgga 24258622  T
Q  508 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc------atagtgaaacgaagggctgctctctc-ccca 600  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||| |||| ||||||||||||||   ||    
T  24258623 tagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttca 24258722  T
Q  601 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaac-aaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  24258723 gactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttttgtgttctctc 24258775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 418 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092198
Alignment:
Q  418 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  518 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaattta 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccagactaggtcaatttg 7092232  T
Q  616 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092231 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276437
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 25276294  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||            |||||    
T  25276295 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg-----------gctccc 25276383  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25276384 cagactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttctctc 25276437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 43253862 - 43253502
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatag--------agggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatta 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| | ||        || |||||||||||||  || |||| | ||||||||||| ||    
T  43253862 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaacta 43253763  T
Q  391 gggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43253762 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaa 43253664  T
Q  491 aagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggct 588  Q
     ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | |  ||||||    
T  43253663 gaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggct 43253564  T
Q  589 gctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43253563 gctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 43253502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 7351996 - 7351637
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||| |      ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7351996 atacttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 7351897  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaa 491  Q
     |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  7351896 ctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 7351797  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctg 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  7351796 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 7351698  T
Q  590 ctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7351697 ctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 7351637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 300 - 573
Target Start/End: Original strand, 11757175 - 11757455
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagag-ttcagaaaggcaacaacaaaattaggg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||| |||||    
T  11757175 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactaggg 11757274  T
Q  394 tttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 492  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11757275 tttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 11757374  T
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 573  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11757375 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 11757455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 7349617 - 7349262
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |      ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7349617 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 7349518  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaa 491  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  7349517 gtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 7349418  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctg 589  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  7349417 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 7349319  T
Q  590 ctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||| |||||||||||||||  || |||||||    |||||||||||  ||||||||||    
T  7349318 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttct 7349262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 287 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 22251893 - 22251611
Alignment:
Q  287 caaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaa 385  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22251893 caaattttaagcgacacttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaa 22251794  T
Q  386 aattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac 485  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  22251793 aactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttac 22251702  T
Q  486 gggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22251701 gggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcat 22251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 354 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27832916 - 27832631
Alignment:
Q  354 gctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg 453  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27832916 gctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgg 27832817  T
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27832816 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 27832717  T
Q  554 ttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
     ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||    
T  27832716 ctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcccccagactaggtcaattt-----gaactgggtaaacaaattctt 27832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 299 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 22828972 - 22828672
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  22828972 gatacttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttg 22828873  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| |||||||| |  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22828872 tatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattg 22828773  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   || ||||||||||  ||||||||||||    
T  22828772 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctc 22828673  T
Q  595 t 595  Q
    |    
T  22828672 t 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 418 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094445
Alignment:
Q  418 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  518 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaattt 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  615 agaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 7094445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 299 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 20091880 - 20091583
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaa-caagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |||  | | ||||||| ||||| ||||||||    
T  20091880 gatacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaaca-caaaactagggttt 20091783  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||| || || | |||||| | ||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  20091782 gtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagatt 20091686  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctc 596  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20091685 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatagtggaacggagggctgctctctc 20091586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 299 - 572
Target Start/End: Original strand, 7188493 - 7188763
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||| |||||||||    
T  7188493 gatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaaatagggtttg 7188591  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7188592 tatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattg 7188688  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  7188689 agactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcat 7188763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 426 - 649
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396938
Alignment:
Q  426 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagac 525  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  526 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaa 622  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  623 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 38396938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 305 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817389
Alignment:
Q  305 tttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||| | || ||||||||| ||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 24817489  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  24817488 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 24817389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 377 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813480
Alignment:
Q  377 caacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtct 476  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  477 cttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---ata 573  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||   |||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  574 gtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| | || | ||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 24813480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 454 - 637
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935560
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 2935472  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  2935473 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137381
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 22137281  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22137282 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22137381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552408
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 40552308  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40552309 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40552408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 495
Target Start/End: Original strand, 22392326 - 22392608
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||  || || |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22392326 atcgtgccacgatgggatcgcaacgtggtacgatggtgcgctggaggcaaaaaacagaaatgtatttttcagtgcagatttgttccaaattgtaagcgat 22392425  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |        ||  ||| ||||||||| ||    
T  22392426 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttata--------aatcaaactagggtttgtat 22392517  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    ||| |||| || || | ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22392518 agaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108370
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 22108270  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22108271 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22108370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550130
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 40550030  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40550031 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40550130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 454 - 637
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606671
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 1606583  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  1606584 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 454 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 9027279  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |  | ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  9027278 tttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 502 - 652
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394030
Alignment:
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  599 c-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 22394030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 304 - 637
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465829
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||   |||        ||||||||| |||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatcaaac--------tagggtttgtata 24465594  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |   |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||   ||| |||||||   | ||||||||| ||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctccc 24465789  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||| || ||||||||    
T  24465790 ccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 493 - 640
Target Start/End: Original strand, 26295592 - 26295743
Alignment:
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctg 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  | | |||    
T  26295592 gattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactg 26295691  T
Q  590 ctctctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  26295692 ctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 299 - 637
Target Start/End: Original strand, 6332176 - 6332514
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaactttgacatagagggggctg-aaacaagagttcagaaaggca-acaacaaaattagggttt 396  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||| | |||  || |||||| | | |||||||    
T  6332176 gatacttttactataaatataaaacttgtatcagagtaaccttgagagagagggggctggaaacaagggtttataaa--catacaacagact-agggttt 6332272  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
      |||||||||  ||||| | ||||||||||||| || |||  |||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  6332273 --atagagttta-ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagatt 6332367  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    | |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| | | ||| ||    
T  6332368 gagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttc 6332467  T
Q  593 tctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  6332468 tctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 478 - 572
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  478 ttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 377 - 652
Target Start/End: Original strand, 11081540 - 11081817
Alignment:
Q  377 caacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtct 476  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||   ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11081540 caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaacactattaggattgagtct 11081634  T
Q  477 cttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttttgtaacgttactcatc--- 570  Q
    |||| | ||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||       
T  11081635 cttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatcttt 11081734  T
Q  571 atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | | || |||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  11081735 aaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 11081817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 440 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaac 538  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  539 cc-attgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaac 632  Q
    ||  || |||||||||||| || ||||||||||   |||||  |||| || |||||||||||||| |||||| |||| | || |||||||||| || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  633 aaatt 637  Q
    |||||    
T  16297022 aaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1049813 - 1049722
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaag 190  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  1049813 tgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaagcaag 1049722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 583 - 649
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759431
Alignment:
Q  583 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11759431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1047504 - 1047356
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  1047504 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 1047407  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| ||||    
T  1047406 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 1047356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 488 - 610
Target Start/End: Original strand, 6046633 - 6046759
Alignment:
Q  488 gaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaa 583  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| || |||    
T  6046633 gaaaagaatgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaa 6046731  T
Q  584 gggctgctctct-ccccagactaggtca 610  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||    
T  6046732 gagctgctctctcccccagactaggtca 6046759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 597 - 652
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804817
Alignment:
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 26804817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 409 - 572
Target Start/End: Original strand, 6048932 - 6049094
Alignment:
Q  409 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttggg 507  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||     
T  6048932 tctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttgga 6049029  T
Q  508 tagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  6049030 tagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatc-cctttgtaaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 447 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40281568 - 40281468
Alignment:
Q  447 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattga 545  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||    
T  40281568 accttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttga 40281469  T
Q  546 t 546  Q
    |    
T  40281468 t 40281468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 329
Target Start/End: Original strand, 45366446 - 45366526
Alignment:
Q  249 cgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtat 329  Q
    |||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45366446 cgaaaaacagaaacgtatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtat 45366526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 640
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351539
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25351447  T
Q  554 ttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||| |  |||||||   |||||| | || || |||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25351448 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 640
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357233
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25357141  T
Q  554 ttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||| |  |||||||   |||||| | ||||| | || ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25357142 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25357233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 640
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410318
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| |    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-t 25410224  T
Q  554 ttgtaacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||| |  ||     |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25410225 ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25410318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40837261 - 40837144
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||||| || ||    
T  40837261 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgatggtcggacaacgtggcacga-tggaggtttcagttttttaggcaaggcactg 40837164  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgg 216  Q
    ||   |||||||||||||||    
T  40837163 gaaaaatcgtggcacgatgg 40837144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 409
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  348 gagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgt 409  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512520
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 44512610  T
Q  557 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  ||     |||| |||| | |||| || ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44512609 taaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctctccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 44512520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2120960
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320171
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324919
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 649
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069975
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||   |||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 7069875  T
Q  554 ttgtaacgttactcatc----atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    | |||| |  ||||||     |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  7069876 t-gtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa-tattttgtgtt 7069973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074848
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405454
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 2935070 - 2935217
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || ||    
T  2935070 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 2935167  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  2935168 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 2935217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9027687 - 9027540
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || ||    
T  9027687 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 9027590  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  9027589 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 9027540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 7094759 - 7094662
Alignment:
Q  305 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7094759 tttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 350
Target Start/End: Original strand, 1606421 - 1606472
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaag-taactttgacatagag 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  1606421 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378625
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541116
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 22136877 - 22137025
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  22136877 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 22136974  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  22136975 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 22137025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30906389 - 30906327
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaa 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  30906389 gatacttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaa 30906327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 40551904 - 40552052
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  40551904 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 40552001  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  40552002 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 40552052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 56020 - 55955
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaa 631  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  56020 tcatcatagtggattggagggctgctctctccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067183
Alignment:
Q  464 taggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgt 562  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||   || |||| |||||||||| ||  ||||||||||||   || |     
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaagg 6067275  T
Q  563 tactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
     |||| ||||   ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  6067274 aactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttct 6067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 12310198 - 12310157
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12310198 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 616 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22251603 - 22251570
Alignment:
Q  616 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251603 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22251570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 2935306 - 2935338
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935306 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 2935338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 7464589 - 7464513
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7464589 tcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 7464513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9027440 - 9027408
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027440 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 9027408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 22108114 - 22108146
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108114 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 22108146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 22137125 - 22137157
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137125 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 22137157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 34546950 - 34546874
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34546950 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 34546874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 40549874 - 40549906
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549874 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 40549906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 40552152 - 40552184
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552152 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 40552184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 458 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143997
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Original strand, 22107865 - 22108014
Alignment:
Q  97 cttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||| |  | |||| || ||||  |||||| ||     
T  22107865 cttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacga-tgcaggttttagttttttgggcaaggcac 22107962  T
Q  195 tggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  22107963 tggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 22108014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 331
Target Start/End: Original strand, 38396237 - 38396268
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396237 atacttttactataaatatagaccttgtatca 38396268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Original strand, 40549625 - 40549774
Alignment:
Q  97 cttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||| |  | |||| || ||||  |||||| ||     
T  40549625 cttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacga-tgcaggttttagttttttgggcaaggcac 40549722  T
Q  195 tggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  40549723 tggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 40549774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 329
Target Start/End: Original strand, 42006420 - 42006545
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||  |||||  ||  || |||| ||| |||||||  | || |||||| ||||| |||||||| | |    
T  42006420 atcgtggcacgatggaatcgtaacgtggcacgatggtacgttga-aggaaataacataaacgtattttcag-tgaagatttgttccatattttaagggtt 42006517  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtat 329  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  42006518 acttttactataaatataaaccgtgtat 42006545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 137
Target Start/End: Original strand, 42006316 - 42006354
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42006316 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttggagaaatcgt 42006354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1047295 - 1047238
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaa 332  Q
    |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1047295 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaa 1047238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 634
Target Start/End: Original strand, 9190052 - 9190101
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  9190052 gctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Original strand, 22392291 - 22392340
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  22392291 ttgtgagagttaatttaaaatcaggttatggagaaatcgtgccacgatgg 22392340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 638
Target Start/End: Original strand, 42006780 - 42006849
Alignment:
Q  571 atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattc 638  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||    
T  42006780 atagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaattc 42006849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Original strand, 46516334 - 46516403
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  46516334 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Original strand, 2075247 - 2075303
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2075247 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2075303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 583 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20284145 - 20284093
Alignment:
Q  583 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  20284145 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 583 - 634
Target Start/End: Original strand, 33332491 - 33332543
Alignment:
Q  583 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  33332491 agggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 182)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 18099708 - 18099151
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||    
T  18099708 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-aaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaagacactg 18099610  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18099609 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaacaatagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaa 18099510  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaactttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  18099509 gcgagacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 18099411  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18099410 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 18099311  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  18099310 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctc 18099211  T
Q  593 tctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099210 tctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 18099151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 32264580 - 32264018
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt-gaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32264580 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttgcagaaatcgtggcacgatggctggg-aacgtggcacgattggaggtttcagtttttgaggcaagtcactgg 32264482  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  32264481 atttttcgtggcacgatgggcttgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaag 32264382  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-----ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||      
T  32264381 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaa 32264282  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 492  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32264281 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaga 32264182  T
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggct 588  Q
    |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||    
T  32264181 ggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggct 32264082  T
Q  589 gctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32264081 gctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtgttctctc 32264018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 649
Target Start/End: Original strand, 5191374 - 5191925
Alignment:
Q  100 gtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||    
T  5191374 gtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaa-tcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaaggtactgga 5191472  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||     
T  5191473 aaaatcgtggcacgatgggatctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagg 5191572  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5191573 gaaacttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 5191672  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  5191673 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 5191772  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| | |  ||||||| |||||    
T  5191773 ggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctct 5191871  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191872 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5191925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 10956564 - 10956010
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||| || |||||||||||| |||||| || |||    
T  10956564 ttgtgagagttaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtggcac-atggctggacatcatggcacgattggaggtttcagttttggggcaaggcactgg 10956466  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  10956465 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaattttaag 10956366  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaactttgac-atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10956365 caatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 10956266  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  10956265 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 10956166  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  10956165 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 10956066  T
Q  595 tcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956065 tccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10956010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 202 - 652
Target Start/End: Original strand, 45882762 - 45883217
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  45882762 atcgtgccacgatgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctgacaacgaataacagaaacctatttttgggtgcagatttgttgaaaattttaagcgat 45882861  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  45882862 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 45882961  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  45882962 agattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga 45883061  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45883062 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 45883161  T
Q  599 c--agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883162 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 45883217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22114843 - 22114288
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt-gaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| || |    
T  22114843 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaa-tcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcact 22114746  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttta 295  Q
    |||   || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22114745 ggaaaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgatggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaatttta 22114646  T
Q  296 agcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  22114645 agcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggt 22114546  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22114545 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 22114446  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatag--tgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||| || ||    
T  22114445 ctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatc 22114346  T
Q  593 tctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| | || | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114345 tctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22114288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18097423 - 18096880
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |    
T  18097423 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-aaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaaggcatag 18097325  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||   |||||||||||||||| | |||  |||||                 ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  18097324 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatagtggcg----------------gcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaa 18097241  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaactttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |  ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  18097240 gcgagacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 18097141  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  18097140 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 18097041  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||    
T  18097040 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctc 18096941  T
Q  593 tctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18096940 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttctctc 18096880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 26720267 - 26720821
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||  || |||    
T  26720267 ttgtgagagttaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcaggattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactgg 26720366  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  26720367 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttagtgcagatttgttccaaattttaag 26720466  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26720467 caatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 26720566  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |    
T  26720567 gtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggct 26720665  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| | | ||||||||    
T  26720666 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctc 26720765  T
Q  595 tcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720766 tcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttct 26720821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 5523153 - 5522610
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  | || |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||  | |||    
T  5523153 ttgtgagagttaacttaaaatcaagatctggaggaatcgtggcaagattgctgggcaacatggcacgattggtggtttcagttttgaggcaaggtactgg 5523054  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  5523053 aaaaatcgtggcacaatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtttcaaattttaag 5522954  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5522953 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 5522854  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    |           |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  5522853 g-----------tctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 5522765  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||||||    
T  5522764 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 5522666  T
Q  595 tccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522665 tcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 99 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 48362186 - 48361651
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | ||    
T  48362186 tgtgagagttaacttaaaatcaggttctgtagaaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaagtttcagttttgaggcaagtaactaga 48362087  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
    ||| |||||||| ||                     ||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48362086 tttttcgtggcatga---------------------tggtgcgctggcagcgaatagcagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagc 48362008  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||||||    
T  48362007 gatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaag-gtttagaatgacaacaacaaaactagggtttg 48361909  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48361908 tatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattg 48361809  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||| || ||||||||||    
T  48361808 gggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctct 48361709  T
Q  596 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48361708 cccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 48361651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 225 - 649
Target Start/End: Original strand, 11170250 - 11170678
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    |||||| |||| | ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11170250 cgtggctcgattgtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacct 11170349  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11170350 tgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 11170449  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11170450 cactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggag 11170549  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccg 620  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  11170550 acttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccg 11170649  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11170650 aactgggtcaacaaattcttttgttttct 11170678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 4308616 - 4308261
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4308616 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4308517  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4308516 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 4308417  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  4308416 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 4308317  T
Q  598 cc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308316 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 4308261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 225 - 652
Target Start/End: Original strand, 18162510 - 18162940
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162510 cgtgccacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 18162609  T
Q  325 tgtatcaa-agtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaa 422  Q
    |||||||  ||||| ||| || ||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18162610 tgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaa 18162707  T
Q  423 acactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga 522  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18162708 acactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtggga 18162807  T
Q  523 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagac 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  18162808 gacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga- 18162906  T
Q  619 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18162907 cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctc 18162940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 202 - 649
Target Start/End: Original strand, 3859351 - 3859801
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| |||| ||||| || | ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||     
T  3859351 atcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcgaa 3859450  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3859451 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3859550  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||    
T  3859551 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 3859650  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||    
T  3859651 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctccc 3859749  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859750 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 202 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 10958757 - 10958306
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10958757 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagccaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagcaat 10958658  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10958657 ttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 10958558  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |    
T  10958557 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaca 10958458  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  10958457 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctccc 10958358  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10958357 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttct 10958306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Original strand, 38889935 - 38890314
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaactttgaca----tagagggggctgaaacaagagttca 370  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |    
T  38889935 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatagca--aactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 38890032  T
Q  371 gaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38890033 gaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 38890132  T
Q  471 gagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 570  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38890133 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 38890232  T
Q  571 --atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
      |||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890233 atatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38890314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Original strand, 1313331 - 1313686
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||     
T  1313331 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaag-gtttacaatggcaacaacaaaactagggtttgt 1313429  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1313430 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgg 1313529  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  1313530 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 1313629  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313630 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1313686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 225 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 10084804 - 10084372
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10084804 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatatagacct 10084705  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaa 419  Q
    ||||||  || || |||||| |    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10084704 tgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaa 10084605  T
Q  420 caaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcg 519  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |    
T  10084604 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggag 10084505  T
Q  520 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttag 616  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10084504 ggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttgg 10084405  T
Q  617 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10084404 accgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 10084372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 225 - 652
Target Start/End: Original strand, 24979553 - 24979985
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||| |||| |||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  24979553 cgtggcacgatggtacgctggtagcgaataacataaacatattttttggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatatacct 24979652  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24979653 tgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 24979752  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24979753 cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggag 24979852  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagacc 619  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |    
T  24979853 acttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatc 24979952  T
Q  620 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979953 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 24979985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Original strand, 32218835 - 32219362
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||  |||    
T  32218835 ttgtgagagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggcacgatgattgggcaacgtggcacgattggaggtttcaactttgaggcaagtcgctgg 32218934  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |||| ||                    ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32218935 attt-tc--------------------cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataagagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 32219013  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
      ||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||         
T  32219014 taatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag----- 32219108  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
          |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32219109 ------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagatt 32219202  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  32219203 gggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 32219302  T
Q  594 ctc-cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32219303 ctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 32219362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626663
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc-cc 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  1626816 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcc 1626717  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1626716 cagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1626663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423443
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc- 598  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||     
T  43423596 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccct 43423497  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423496 gagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 43423443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 53915832 - 53915476
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || | |||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||||| |||||||||     
T  53915832 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgt 53915733  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53915732 atagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 53915633  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca--tagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||     
T  53915632 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctc 53915533  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915532 ccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 53915476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 53918000 - 53917644
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||| || ||||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||     
T  53918000 atacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgt 53917901  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53917900 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 53917801  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  53917800 gattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 53917701  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917700 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 53917644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Original strand, 43228213 - 43228568
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  43228213 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgta 43228312  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  43228313 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43228412  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |    
T  43228413 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43228512  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43228513 cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 43228568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 304 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421395
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cccc 599  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctccccc 43421448  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421447 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 43421395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314962
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 3314807  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  3314808 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 3314907  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314908 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3314962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Original strand, 42990271 - 42990581
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42990271 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgat 42990370  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42990371 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattg 42990470  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42990471 atttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 42990570  T
Q  642 tgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||    
T  42990571 tgtgttctctc 42990581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 252 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12268350 - 12267955
Alignment:
Q  252 acaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagag 350  Q
    |||||||| | ||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  12268350 acaacagagacgtatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagag 12268251  T
Q  351 ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaat-tagggtttgcatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttac 448  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12268250 ggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcac 12268151  T
Q  449 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 548  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  12268150 cttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa----------- 12268062  T
Q  549 ctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 645  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268061 ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 12267962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 51727341 - 51726990
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || |    
T  51727341 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgta 51727242  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  || |    
T  51727241 tagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgag 51727143  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| |    
T  51727142 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 51727043  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51727042 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51726990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28101982
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 28102136  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  28102135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctcccc 28102036  T
Q  600 aga-ctaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | | |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28102035 aaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28101982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 27101520 - 27101161
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt-----gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||      || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27101520 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27101421  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  27101420 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaa 27101321  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||    
T  27101320 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 27101221  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27101220 ctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 27101161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880431
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  402 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattgggg 880586  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  880585 ctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctccc 880486  T
Q  599 c-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880485 ctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 880431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Original strand, 30005808 - 30006118
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005808 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 30005907  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30005908 tcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattg 30006007  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30006008 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 30006107  T
Q  642 tgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||    
T  30006108 tgtgttctctc 30006118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 25533355 - 25533716
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatta 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |        ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  25533355 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 25533454  T
Q  391 gggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25533455 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaa 25533554  T
Q  491 aagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggct 588  Q
     ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||    
T  25533555 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 25533654  T
Q  589 gctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533655 gctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Original strand, 43226008 - 43226360
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | |||| |    
T  43226008 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgta 43226106  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  43226107 tagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43226206  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||||    
T  43226207 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43226306  T
Q  598 cc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43226307 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 43226360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Original strand, 51943292 - 51943647
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | || |||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  51943292 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 51943391  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51943392 atagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 51943491  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||     
T  51943492 ggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 51943590  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51943591 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctc 51943647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 225 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 10191724 - 10191305
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191724 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 10191625  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacataga----gggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaa 419  Q
    ||||||  || || |||||| | |||    |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10191624 tgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaa 10191525  T
Q  420 caaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcg 519  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||| |    
T  10191524 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggag 10191426  T
Q  520 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttag 616  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  10191425 ggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttgg 10191326  T
Q  617 accgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10191325 accgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 4104235 - 4103879
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4104235 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 4104136  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  4104135 ttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 4104036  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||     
T  4104035 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgcta 4103937  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103936 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4103879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 9604896 - 9604587
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  9604896 atagagggggctgaaacaag-gtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgat 9604798  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604797 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 9604698  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9604697 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttt 9604598  T
Q  642 tgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||    
T  9604597 tgtgttctctc 9604587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 303 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926746
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 5926898  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc- 598  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| | | ||||||||||||     
T  5926897 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccg 5926798  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5926797 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttctct 5926746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 259 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 6066174 - 6065779
Alignment:
Q  259 aaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagaggggg-ct 356  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||    
T  6066174 aaatgtatttttgggagcagatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggct 6066075  T
Q  357 gaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaa 456  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6066074 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6065975  T
Q  457 acactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 555  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6065974 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt- 6065876  T
Q  556 gtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||  ||||||||||  ||| |  | | ||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6065875 gtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 6065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 266 - 652
Target Start/End: Original strand, 15780747 - 15781156
Alignment:
Q  266 tttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaag 364  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  15780747 tttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaag 15780846  T
Q  365 agttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtt-----------tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg 453  Q
     ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15780847 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 15780946  T
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tc 549  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  15780947 gaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttc 15781046  T
Q  550 tcttttgtaacgtta---ctcatcatagtgaaacgaaggg---ctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 642  Q
    |||||||||| ||||    |||| |||||| |||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15781047 tcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 15781146  T
Q  643 gtgttctctc 652  Q
    || |||||||    
T  15781147 gttttctctc 15781156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Original strand, 39715392 - 39715742
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| |    
T  39715392 tacttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgta 39715490  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39715491 tagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 39715590  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||    
T  39715591 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatagtgaaacagatggttgctctc-cccc 39715689  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39715690 atactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39715742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 6063809 - 6063429
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcag 371  Q
    |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6063809 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttag 6063710  T
Q  372 aaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg 471  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6063709 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6063610  T
Q  472 -agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 570  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  6063609 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatc 6063511  T
Q  571 ata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  6063510 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttct 6063429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468433
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | || | ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||| |||| |||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggac 53468590  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct-ctcc 597  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  53468589 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctacccc 53468490  T
Q  598 ccag--actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468489 ccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 53468433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 746672 - 747031
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |      ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  746672 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 746771  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaa 491  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  746772 gtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 746871  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctg 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||| |||    
T  746872 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactg 746970  T
Q  590 ctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  746971 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 747031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012104
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | |||| ||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||| ||| || |||||| |||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgac 36011950  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc-tccc 598  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||| ||      
T  36011951 tttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttctt 36012050  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36012051 cagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 36012104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 309 - 572
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562005
Alignment:
Q  309 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  408 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttggg 507  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6561939  T
Q  508 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  6561940 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcat 6562005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 225 - 543
Target Start/End: Original strand, 35777268 - 35777587
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  35777268 cgtggcacgatggtgcgctggcagcaaa-aacataaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacat 35777366  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  35777367 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa 35777466  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga 522  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777467 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 35777566  T
Q  523 gacttattcttgtaacccatt 543  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  35777567 gacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Original strand, 50493895 - 50494273
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaa 373  Q
    |||||||| || || |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  50493895 gcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 50493994  T
Q  374 aggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-a 472  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  50493995 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 50494094  T
Q  473 gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  50494095 gtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat 50494193  T
Q  573 a--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  50494194 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 50494273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 47149185 - 47148875
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaa-caaacactagggtttgagggttga 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  47149185 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttga 47149086  T
Q  444 tttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149085 ttcaccttgg-aaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 47148987  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||    
T  47148986 gatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattatt 47148887  T
Q  641 ttgtgttctctc 652  Q
     |||||||||||    
T  47148886 ctgtgttctctc 47148875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 382 - 649
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321753
Alignment:
Q  382 acaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 481  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  482 ttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaa 579  Q
    |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |     
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  580 cgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1321753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 458201 - 458558
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa--cttt---gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||    || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  458201 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 458300  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  458301 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 458400  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgct 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||    
T  458401 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 458499  T
Q  592 ctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  458500 ctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 458558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 299 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 28761765 - 28761407
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28761765 gatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttg 28761666  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  28761665 tatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattg 28761567  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
     |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28761566 agactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctc 28761467  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaa-tttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28761466 tcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttctctc 28761407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 354 - 649
Target Start/End: Original strand, 25388882 - 25389179
Alignment:
Q  354 gctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg 453  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25388882 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 25388981  T
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  25388982 -aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc- 25389079  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25389080 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 25389179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 304 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674746
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||||         
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttg----- 51674993  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  51674992 ------tccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cccc 599  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctccccc 51674799  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51674798 ataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 51674746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 455824 - 456181
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa--cttt---gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||    || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  455824 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 455923  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  455924 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 456023  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgct 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||    
T  456024 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 456122  T
Q  592 ctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  456123 ctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 456181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 301 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 35918284 - 35917944
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt-gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  35918284 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 35918185  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacac------tagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  35918184 tagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagag 35918085  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgct 591  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||||||    
T  35918084 actgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgct 35917985  T
Q  592 ctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaac 632  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35917984 ctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 10621820 - 10621513
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10621820 atagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgat 10621721  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621720 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 10621621  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||  |    
T  10621620 gatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttct 10621522  T
Q  641 ttgtgttct 649  Q
    |||||||||    
T  10621521 ttgtgttct 10621513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 299 - 652
Target Start/End: Original strand, 23633380 - 23633730
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||| ||||| |||||||  || |||| | |||||| |||| |||||||||    
T  23633380 gatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttg 23633478  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23633479 tatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 23633573  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||    
T  23633574 agactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctc 23633672  T
Q  595 tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23633673 tccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 23633730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 303 - 634
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591442
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||         
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt----- 53591213  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
          |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||     
T  53591214 ------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggat 53591307  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53591308 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctctcccc 53591407  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  53591408 agactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 345 - 597
Target Start/End: Original strand, 29956653 - 29956907
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29956653 atagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgat 29956752  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29956753 tcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattg 29956852  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  29956853 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 276 - 649
Target Start/End: Original strand, 38210265 - 38210644
Alignment:
Q  276 cagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt---gacatagagggggctgaaacaagagttcaga 372  Q
    ||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||  ||    || |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  38210265 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcaggctattttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 38210364  T
Q  373 aaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg- 471  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  38210365 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 38210464  T
Q  472 agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca 571  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  38210465 agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt-gtaacgaaactcatca 38210563  T
Q  572 ta--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||  ||| |  | || |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  38210564 tatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 38210644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 391 - 652
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484637
Alignment:
Q  391 gggtttgcatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 489  Q
    |||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  490 aaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggc 587  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 6484571  T
Q  588 tgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484572 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6484637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 387 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 7606833 - 7606571
Alignment:
Q  387 attagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 486  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606833 attagggtttg--tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 7606736  T
Q  487 ggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaag 584  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||  |||||| | || ||    
T  7606735 ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggag 7606637  T
Q  585 ggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606636 ggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7606571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 370 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28413297 - 28413014
Alignment:
Q  370 agaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggat 469  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28413297 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 28413198  T
Q  470 tga-gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactca 568  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||    
T  28413197 tgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactca 28413099  T
Q  569 tcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttct 649  Q
    |||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  28413098 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttct 28413014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 303 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889779
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | |||| |||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtata 890007  T
Q  402 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttgggg 889908  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  889907 ctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctccc 889808  T
Q  599 -cagactaggtcaatttagaccgaactgg 626  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||    
T  889807 gcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691554
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | || | |||||||||| | |||||||  || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||| || |    
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggc 54691708  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54691707 tttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccc 54691608  T
Q  600 -agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     |||||| ||||||||  || ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  54691607 tagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgttttctc 54691554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 429 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688140
Alignment:
Q  429 gggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagactta 528  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  529 ttcttgtaacccattgatatctcttttgt-aacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaact 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  625 gggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgttctctc 25688140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 399 - 652
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666791
Alignment:
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ct 4666732  T
Q  594 ctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4666733 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 4666791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Original strand, 42992203 - 42992547
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-cttt----gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||    || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  42992203 atacttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 42992302  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  42992303 ttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaga 42992402  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     | |||||||||||||               ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||  |||||||||    
T  42992403 gt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctc 42992486  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42992487 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttctctc 42992547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 99 - 482
Target Start/End: Original strand, 24176999 - 24177380
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  24176999 tgtgagagttaacttaaaatcaagttctggagaaatcgtggcacgtttgcagggcaacgtggcacgattggttgtttcagttctgaagcaagtcactgga 24177098  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||     
T  24177099 aaaaatgtggcacgatgggatcgcaatgtggcacgatggtgcgttggaggcgaaaaacataaacgtatttttaagtgcagatttgttccaaattttaagg 24177198  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctg-aaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| || | | |||||| |||| ||||||||    
T  24177199 gatacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttag-atgtcaacaagaaaactagggttt 24177297  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 482  Q
    | |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177298 gtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 303 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100174 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151622
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaa-ctttgacatagagggggctgaaa-caagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | | || |||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||| |||| ||||||||| |    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggg 31151466  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactca---tcatagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||| |||| |||||||||||||     
T  31151467 actttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctc 31151564  T
Q  596 ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||  ||| | | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  31151565 ccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctc 31151622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 426 - 652
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232077
Alignment:
Q  426 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagac 525  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  526 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccga 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   |||| |||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtg-aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  622 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6232077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 226 - 445
Target Start/End: Original strand, 11162997 - 11163217
Alignment:
Q  226 gtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 325  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11162997 gtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagacctt 11163096  T
Q  326 gtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaac 424  Q
    |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11163097 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 11163196  T
Q  425 actagggtttgagggttgatt 445  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  11163197 actagggtttgtggattgatt 11163217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 378
Target Start/End: Original strand, 1321161 - 1321441
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  || || |    
T  1321161 tgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattagaggtttcaagtttgaggcaaagcactgaa 1321260  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  1321261 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagc 1321360  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaag-taactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1321361 gatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 439 - 651
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886474
Alignment:
Q  439 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 538  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 635  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T
Q  636 ttcttttgtgttctct 651  Q
    ||||||||||||||||    
T  5886459 ttcttttgtgttctct 5886474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 439 - 651
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899947
Alignment:
Q  439 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 538  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa 635  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T
Q  636 ttcttttgtgttctct 651  Q
    ||||||||||||||||    
T  5899932 ttcttttgtgttctct 5899947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 304 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635638
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||                   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||            ||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt-------------------gggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ct 27635791  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cccc 599  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27635790 ttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 27635691  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635690 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27635638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 303 - 538
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||| | |  || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaatagg--tttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 538  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181146 tttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 442 - 649
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168375
Alignment:
Q  442 gatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 541  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  542 ttgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattc 638  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  639 ttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||    
T  11168365 ttttgtgttct 11168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 418 - 652
Target Start/End: Original strand, 17795301 - 17795536
Alignment:
Q  418 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  17795301 aacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattagg 17795397  T
Q  518 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatt 613  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17795398 cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatt 17795497  T
Q  614 tagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |  |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17795498 tgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctc 17795536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 418 - 652
Target Start/End: Original strand, 19103741 - 19103976
Alignment:
Q  418 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||    
T  19103741 aacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgaggctttgggtagaattagg 19103837  T
Q  518 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatt 613  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19103838 cggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatt 19103937  T
Q  614 tagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |  |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19103938 tgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctc 19103976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 555
Target Start/End: Original strand, 23636947 - 23637200
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||| ||||| |||||||||| || |||||||| ||||| | |||| ||||||| |||| ||||||| ||| |||| | |||||| |||| |||||||||    
T  23636947 gataattttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttg 23637045  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||     
T  23637046 tatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatatta 23637142  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637143 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 13420428 - 13420208
Alignment:
Q  389 tagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 488  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13420428 tagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 13420333  T
Q  489 aaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagg 585  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   || ||| || |||| ||     
T  13420332 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggaga 13420233  T
Q  586 gctgctctctccccagactaggtca 610  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  13420232 gctgctctctcaccagactaggtca 13420208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 572
Target Start/End: Original strand, 53597161 - 53597430
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||  ||||||||| ||| | || | |||||| |||| ||||| |||    
T  53597161 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaacaagggtttataa-gtcaacaagaaaactaggggttg 53597258  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||    
T  53597259 tatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattg 53597355  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
     || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  53597356 agattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcat 53597430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 303 - 572
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884348
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||  |||| | |||| |||||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||  ||    
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttg--ta 54884178  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||  ||    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaac 54884278  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54884279 tttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 54884348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 389 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 562020 - 561769
Alignment:
Q  389 tagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 488  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  562020 tagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtg 561924  T
Q  489 aaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagg 585  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||| ||||||||    
T  561923 aagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagg 561824  T
Q  586 gctgctctctcc--ccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  561823 gctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 303 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggc 28137440  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagact 526  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  28137439 tttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 456 - 652
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307037
Alignment:
Q  456 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  556 gtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||| | | || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct-cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctctc 3307037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 389 - 637
Target Start/End: Original strand, 25635395 - 25635644
Alignment:
Q  389 tagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 488  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25635395 tagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacggg 25635491  T
Q  489 aaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagg 585  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   || |||||||  |||    
T  25635492 aagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaacagagg 25635591  T
Q  586 gctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    | ||||||||||||  | ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  25635592 gttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 505 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701652
Alignment:
Q  505 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccag 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  602 actaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctct 47701652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 378 - 637
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674227
Alignment:
Q  378 aacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctc 477  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  478 ttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtga 577  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||      |  ||     
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttac------ttttgg 1674165  T
Q  578 aacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  1674166 aacggatggctgctctctccaccagactaggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 1674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 350 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871295
Alignment:
Q  350 gggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttacc 449  Q
    ||||||||||||||| ||| | || | |||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||||| |||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcacc 36871488  T
Q  450 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatat 548  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  36871487 ttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttat 36871388  T
Q  549 ctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||| ||||||| |||| |||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||    
T  36871387 ctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 345 - 470
Target Start/End: Original strand, 41849119 - 41849244
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849119 atagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 41849218  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggatt 470  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  41849219 tcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 484 - 637
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181644
Alignment:
Q  484 acgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaac 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  581 gaagggctgctctctcc-ccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    | | | ||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 303 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggt 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 521 - 652
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634164
Alignment:
Q  521 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttag 616  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||      
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  617 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 25634164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 422 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560355
Alignment:
Q  422 aacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggg 521  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| |     
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag- 4560399  T
Q  522 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
       |||    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  4560398 ---ctt----ttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcat 4560355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 304 - 431
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactaggg 431  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 440 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634504
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 538  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 573  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 440 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620483
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 538  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | || ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtca 610  Q
    || |||||||||| |||||||  |||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1620557 cctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 1620483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 571 - 652
Target Start/End: Original strand, 41849254 - 41849336
Alignment:
Q  571 atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849254 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 41849336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 35919177 - 35919098
Alignment:
Q  571 atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919177 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 304 - 421
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | | || ||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  403 agtttgtctctttggaaca 421  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Original strand, 38210064 - 38210134
Alignment:
Q  96 acttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38210064 acttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat 38210134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 583 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 53894107 - 53894040
Alignment:
Q  583 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53894107 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 53894040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7606964 - 7606896
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7606964 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtgacacgatggctgggcaacgtggcacgat 7606896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913949
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 29914038  T
Q  557 taacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  |||||||   |||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29914037 taaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 29913949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 50493676 - 50493743
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50493676 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgat 50493743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 53896754 - 53896687
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53896754 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgat 53896687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 190
Target Start/End: Original strand, 11162891 - 11162982
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaag 190  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||    
T  11162891 tgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaag 11162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 514
Target Start/End: Original strand, 13419878 - 13420015
Alignment:
Q  372 aaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg 471  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  13419878 aaagccaacaagaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatca 13419972  T
Q  472 agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatt 514  Q
    ||||||||||| |||| || |||||   | |||||||||||||    
T  13419973 agtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878165
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   |||||||||| |    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-g 47878256  T
Q  557 taacgttactcatc-----atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  ||||||      |||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  47878255 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 333
Target Start/End: Original strand, 13893288 - 13893347
Alignment:
Q  274 tgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13893288 tgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatcaaa 13893347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 46967023 - 46966940
Alignment:
Q  248 gcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||| ||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  46967023 gcgaaaaacagaaacatatttttcaatgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaacattgtatca 46966940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 594 - 652
Target Start/End: Original strand, 42992605 - 42992663
Alignment:
Q  594 ctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  42992605 ctccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattctctc 42992663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768709
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||  || ||||| |||||| |||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattagg 7768709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10192525 - 10192401
Alignment:
Q  103 agagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggattta 202  Q
    |||||||||| |||||||| |||    | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||   |    
T  10192525 agagttaactgaaaatcagatttatgcggaatcgtggcacgatcgcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagttttgaggcaaggcactggaaaaa 10192427  T
Q  203 tcgtggcacgatgggattgcaacgtg 228  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10192426 tcgtggcacgatgggatcgcatcgtg 10192401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Original strand, 11170144 - 11170212
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11170144 ttgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcgtggcacggttgctgggcaacgtggcacgat 11170212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094195
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201075
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 482
Target Start/End: Original strand, 25633934 - 25634024
Alignment:
Q  389 tagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 482  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633934 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 53896557 - 53896475
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaag-taactttgacatagagggggct 356  Q
    |||||||| || || |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  53896557 gcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 467 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007587
Alignment:
Q  467 gattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttact 566  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||         | |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 38889757 - 38889875
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggttt--cgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||||| ||||    
T  38889757 tgtgagagttaacttaaaattaggttttctgcag-aatcgtggtacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagttttttaggcaaggcatt 38889854  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgg 216  Q
    |||   |||||||||||||||    
T  38889855 ggaaaaatcgtggcacgatgg 38889875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 331
Target Start/End: Original strand, 5886181 - 5886237
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5886181 gcagatttgttacagattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatca 5886237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 331
Target Start/End: Original strand, 5899656 - 5899712
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5899656 gcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatca 5899712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6719472 - 6719416
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6719472 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatca 6719416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6719651 - 6719532
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatt--agatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||  || ||    
T  6719651 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcttaatcgtggcacgattgaagggcatcgtggcacgattggagaggtttcagtttttaggcaatgcactg 6719552  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgg 216  Q
    ||   |||||||||||||||    
T  6719551 gaaaaatcgtggcacgatgg 6719532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10085605 - 10085490
Alignment:
Q  103 agagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggattta 202  Q
    |||||||||| |||||||| |||    | |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||   |    
T  10085605 agagttaactgaaaatcagatttatgcggaatcgtggcatgatcgcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagttttgaggcaaggcactggaaaaa 10085507  T
Q  203 tcgtggcacgatgggat 219  Q
    |||||||||||||||||    
T  10085506 tcgtggcacgatgggat 10085490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 331
Target Start/End: Original strand, 25388794 - 25388850
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388794 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatca 25388850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 35777163 - 35777230
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35777163 tgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaa-tcgtggcacgacagctgggcaacgtggcacgat 35777230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 636
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188692
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 54188606  T
Q  557 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaat 636  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  54188607 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54188692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193287
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 517
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535675
Alignment:
Q  463 ttaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4560625 - 4560513
Alignment:
Q  277 agatttattccaaatttta--agcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaa 373  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||| | ||    
T  4560625 agatttattccaa-ttttacgagggatactttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataa 4560527  T
Q  374 aggcaacaacaaaa 387  Q
    ||| ||||||||||    
T  4560526 aggtaacaacaaaa 4560513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6064007 - 6063942
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6064007 ttgtgagaattaacttaaaatcaggtttatgcagaa-tcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcac 6063942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100212
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 10100212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208121
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079578
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattagg 11079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16996936
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Original strand, 25388617 - 25388666
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25388617 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgatgg 25388666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544334
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| || |||||||||||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattagg 27544334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 46966816 - 46966633
Alignment:
Q  471 gagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactca 568  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |  |||||    
T  46966816 gagtctcttgctcacggaaaaagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctcttt-gtaaagaaactca 46966718  T
Q  569 tcat---agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||   |||| |||  || ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||| | |||||||| ||||| |||||    
T  46966717 tcattatagtggaacagagagctgccctctccccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaattattttgcgttct 46966633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Original strand, 5899456 - 5899657
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaact--taaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttg-aggcaagtca 193  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| ||| || || ||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||| ||    
T  5899456 ttgtgagagttaactcttataatcaggtttctgcataa-tcatggcacgattgaagggcaacgtggcacgatg-gatgttttagttttttaggcaaggca 5899553  T
Q  194 ttggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattt 293  Q
     ||||   ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||  || || | ||| |||||||||| | ||||||| || || ||||    
T  5899554 ctggaaaaatcatggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaata-aaacgtatttttgggtacagatttgttacagattt 5899652  T
Q  294 taagc 298  Q
    |||||    
T  5899653 taagc 5899657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  422 aacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattagg 467  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 10612848 - 10612762
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  10612848 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--ttgtgttctctc 10612762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 626
Target Start/End: Original strand, 28181185 - 28181238
Alignment:
Q  573 agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgg 626  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28181185 agtgaaacggaaggctgctctctccctagactaggtcaatttggactgaactgg 28181238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 503
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303358
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 6303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897193
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 10897102  T
Q  557 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10897103 taaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10897193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 418 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  418 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttg 480  Q
    |||||||||||||||| |  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10621878 - 10621847
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621878 atacttttactataaatatagaccttgtatca 10621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031439
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 331
Target Start/End: Original strand, 42990203 - 42990234
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990203 atacttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 618 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 8183148 - 8183114
Alignment:
Q  618 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8183148 ccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 8183114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Original strand, 26762863 - 26762917
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26762863 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatataaaccttgtatca 26762917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Original strand, 1736319 - 1736388
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1736319 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 3859317 - 3859365
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  3859317 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-taatcgtggcacgatgg 3859365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 6066291 - 6066243
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  6066291 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aattgtggcacgatgg 6066243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6719544 - 6719487
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagattt 282  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  6719544 cgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagattt 6719487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Original strand, 18552897 - 18552966
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  18552897 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 517
Target Start/End: Original strand, 23941821 - 23941902
Alignment:
Q  439 gttgatttaccttggg-aaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23941821 gttgatttaccttgaataaatactattaggcttaagtctctttggtcacgggaaaagattcgggaatttgggtagaattagg 23941902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Original strand, 30709804 - 30709873
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  30709804 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31021479 - 31021450
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31021479 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 31021450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 282
Target Start/End: Original strand, 38889863 - 38889920
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagattt 282  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  38889863 cgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagattt 38889920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 364
Target Start/End: Original strand, 6484307 - 6484371
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaag 364  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  6484307 tacttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaag 6484371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 455 - 503
Target Start/End: Original strand, 7418064 - 7418112
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 503  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7418064 aaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggactt 7418112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 10595104 - 10595028
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10595104 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10595028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 13419796 - 13419828
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13419796 gatacttttactataaatatagaccttatatca 13419828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 145
Target Start/End: Original strand, 18162399 - 18162451
Alignment:
Q  93 catacttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgat 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||||    
T  18162399 catacgtgtgagagttaacttaaaatcaggatctgcataaatcgtgccacgat 18162451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 455 - 515
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38002928
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 515  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 45882659 - 45882707
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||||||||    
T  45882659 tgtgagagttaacttaaaatcaggatctgcaaaaatcgtgccacgatgg 45882707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47149205
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatca 47149205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 48390372 - 48390296
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  48390372 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattctt 48390296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 119)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 6259351 - 6258799
Alignment:
Q  102 gagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||       
T  6259351 gagagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggcacgatggctgtgcaacgtggcactattggatgtttcagttttgaggaaagtcactggaaaa 6259252  T
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| | ||| ||||||||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6259251 atcgtggcacgatgggatcgcaacgtgacacgatggtgcgctggcggtgaataacagaaacatatttttgggtgcagacttgttccaaattttaagcgat 6259152  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  6259151 acttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtat 6259052  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  6259051 agagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg--aagattgggg 6258954  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc---atcatagtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6258953 ctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctcc 6258854  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258853 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6258799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 40032588 - 40032035
Alignment:
Q  97 cttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  40032588 cttgtgagagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagacaagtcactg 40032489  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||           ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  40032488 gatttttcgtggcacgatgggat-----------acgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaagttttaa 40032400  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40032399 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 40032300  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  40032299 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggt 40032200  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggct 588  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| || ||||||||||   ||||||||||| |||||     
T  40032199 taggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggcc 40032100  T
Q  589 gctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40032099 gctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctc 40032035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 21521235 - 21520675
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || |||    
T  21521235 ttgtgagagttaacttaaaatcaggttctacaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaagcaagccactgg 21521136  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  21521135 aaaaatcgtgccacgatgggatcgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaaatttaag 21521036  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||| |  |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||     
T  21521035 cgatacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggc 21520936  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  21520935 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagg 21520836  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  21520835 ctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctc 21520736  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21520735 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctc 21520675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 19502551 - 19501996
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttg-aggcaagtcatt 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||| || |    
T  19502551 ttgtgatagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagttttttaggcaaggcact 19502454  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttta 295  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  19502453 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcgacgaataacagaaacatatttttggttgcagatttgatccaaatttta 19502354  T
Q  296 agcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    || || | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19502353 agggaaaattttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 19502254  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19502253 ttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 19502154  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  19502153 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctc 19502054  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502053 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19501996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 27104514 - 27105067
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt-gaggcaagtcatt 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| || |    
T  27104514 ttgtaagagttaacttaaaatcagatttctgcagaa-tcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcact 27104611  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttta 295  Q
    |||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  27104612 ggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacataaacatatttttgagtgcagatttgttccaaatttta 27104711  T
Q  296 agcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27104712 agcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggt 27104811  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27104812 ttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 27104910  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  27104911 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctc 27105009  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105010 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27105067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 99 - 649
Target Start/End: Original strand, 42064231 - 42064785
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||  ||||||||||  || ||||    
T  42064231 tgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggtacgactggaggtttcaagtttgaggcaaagcactgga 42064330  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  42064331 aaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttagtgcagatttgttccaaattttaagc 42064430  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42064431 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 42064530  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  42064531 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 42064630  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || |||||||||||||    
T  42064631 agactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 42064729  T
Q  596 -ccccagactaggtc-aatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064730 cccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 210 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 22287764 - 22287318
Alignment:
Q  210 acgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttac 309  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22287764 acgatgggatcgtaacgtggcaccatggtgcgctggcagcgaataacaaaaatgtatgtttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttac 22287665  T
Q  310 tataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttg 408  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  22287664 tataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctg 22287565  T
Q  409 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggt 508  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  22287564 tctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggt 22287465  T
Q  509 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agacta 605  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  22287464 agaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccctagacta 22287365  T
Q  606 ggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287364 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22287318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 104 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 6264658 - 6264130
Alignment:
Q  104 gagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  6264658 gagttaacttaaaatcaggttctgcagaaattgttgcacgatggttgggcaacgtggcatgattggatgtttcagttttgaggcaagtcactggaaaaat 6264559  T
Q  204 cgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatac 303  Q
    |||||||||||||   ||||                  || || ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6264558 cgtggcacgatgg---tgca------------------ttagcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatat 6264480  T
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||    
T  6264479 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatag 6264384  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  6264383 agtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggct 6264284  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6264283 ttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 6264184  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264183 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6264130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 99 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 19504884 - 19504331
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttg-aggcaagtcattg 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||| | ||||  ||||||| || ||    
T  19504884 tgtgaaagttaacttaaaatcaggtttcagcagaa-tcatggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggttttaattttttaggcaaggcactg 19504787  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||   |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  19504786 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcgacgaataacagaaacacatttttaggtgcagatttgttccaaattttaa 19504687  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19504686 gggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 19504587  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||      
T  19504586 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagaggc 19504488  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||| |    
T  19504487 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctat 19504388  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504387 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19504331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 24162753 - 24162208
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt--gaggcaagtcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||| ||     
T  24162753 ttgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaa-tcgtggcacaatggttgggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagttttttgaggcaaggcac 24162656  T
Q  195 tggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttt 294  Q
    ||||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  24162655 tggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgattgtgcgctggctgcgaatattagaaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaatttt 24162556  T
Q  295 aagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattaggg 393  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24162555 aagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 24162456  T
Q  394 tttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |            
T  24162455 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc-------- 24162364  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgct 591  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||  |||||| |  | | |||||||    
T  24162363 --tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgct 24162267  T
Q  592 ctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24162266 ctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 24162208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 202 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 13910480 - 13910030
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||     
T  13910480 atcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagggaa 13910381  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13910380 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 13910281  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  13910280 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaa 13910181  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||| | |  | ||||||||||||||    
T  13910180 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctccc 13910082  T
Q  599 c-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910081 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13910030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 303 - 651
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007912
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19007760 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccc 19007859  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19007860 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 19007912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 43624086 - 43623562
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||    
T  43624086 ttgtgaaagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcatggcacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgaggcaaggcactg 43623988  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
     |   ||||||||||||                     ||| ||| ||||||| || |||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43623987 aaaaaatcgtggcacga---------------------tggtgcgctggcagcaaataacataaacgta-ttttgggtgcagatttgttccaaattttaa 43623910  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43623909 gcaatacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 43623810  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || |||||||||||||            ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  43623809 tgtatagagtttgtct------------cactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 43623722  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  43623721 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 43623622  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43623621 ctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 43623562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 42923849 - 42923491
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa--cttt-gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||  || ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| |||    
T  42923849 atacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggattt 42923750  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42923749 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagatt 42923650  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  42923649 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctc 42923550  T
Q  595 tcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923549 tcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 42923491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 45280322 - 45279969
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaag-gcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||     
T  45280322 tactttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 45280223  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  45280222 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 45280123  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||||     
T  45280122 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 45280023  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280022 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45279969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 42452700 - 42453050
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||     
T  42452700 atacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgt 42452799  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  42452800 ataaagtttgtctctgt--aacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 42452897  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||    
T  42452898 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 42452997  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452998 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42453050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196908
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |    
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggc 28196756  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28196757 tttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccc 28196856  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196857 cagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28196908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 23452579 - 23452222
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacataga----gggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| | |||    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23452579 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 23452480  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  23452479 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 23452380  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||    
T  23452379 ctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctc 23452280  T
Q  593 tctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452279 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23452222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739541
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||| |||| | | ||||||||| ||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 11739596  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739595 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11739541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 99 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22407948 - 22407591
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22407948 tgtgagagttaatttaaaattaggttctgcaggaatcgtggcacgattgaagggtaacatggcacgattggatgtttcagttttgaggcaagtcagtgaa 22407849  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22407848 aaaattgtggcacgatgggatcacaacgtggcacgatggtgcgttggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttcaaaattttaagc 22407749  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22407748 aatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 22407649  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttggga 455  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22407648 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 311 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979559
Alignment:
Q  311 ataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgt 409  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  410 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggta 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  510 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct--ctccccagact 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaact 34979607  T
Q  605 aggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979606 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 34979559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849390
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| ||| ||| | |||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagac 17849236  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||    
T  17849237 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacg-ggggctgctctctccc 17849335  T
Q  599 -cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     || ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17849336 acatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17849390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848713
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||| | |||| |||||||||||| |||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatca--gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  402 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 17848562  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||| ||    
T  17848563 ctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccc 17848658  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17848659 ccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837541
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| | |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||| |||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gggaagagattgagac 14837386  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| | || |||||||| ||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctccc 14837486  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14837487 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 14837541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289049
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| || || | |||| ||||||||| || ||||||  ||| || ||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggac 44289204  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    || ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||  | || |||||| | ||    
T  44289203 ttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttccc 44289104  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289103 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 44289049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 303 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732772
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggac 31732913  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||||| ||| ||||||||| ||    
T  31732912 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctccc 31732813  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattc 638  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  31732812 ccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 304 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539553
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||| |||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  403 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggact 502  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  503 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15539609 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 306 - 652
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022445
Alignment:
Q  306 ttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagag 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  405 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggacttt 504  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggtttt 3022285  T
Q  505 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc------------atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||            ||| ||||||  | ||||||||    
T  3022286 aggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctc 3022384  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022385 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3022445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 274 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18800666 - 18800295
Alignment:
Q  274 tgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcaga 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | || ||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  18800666 tgcagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttaga 18800567  T
Q  373 aaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga 472  Q
    ||   | |        ||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18800566 aatcaagc--------tagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18800479  T
Q  473 gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac---tcat 569  Q
    |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||    
T  18800478 gtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcat 18800379  T
Q  570 catagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18800378 tatagtgaaacggagggctactctctccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 18800295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 35215878 - 35215571
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  35215878 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgat 35215779  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  35215778 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcatt 35215679  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   |    
T  35215678 gatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatct 35215580  T
Q  641 ttgtgttct 649  Q
    |||||||||    
T  35215579 ttgtgttct 35215571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 35218255 - 35217948
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  35218255 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgat 35218156  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  35218155 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgtt 35218056  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||   |    
T  35218055 gatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatct 35217957  T
Q  641 ttgtgttct 649  Q
    |||||||||    
T  35217956 ttgtgttct 35217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 432 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375328
Alignment:
Q  432 tttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 531  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattc 5375452  T
Q  532 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggt 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  629 caacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtgttctctc 5375328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 345 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 45239268 - 45239000
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttga 443  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45239268 atagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagacttt--ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttga 45239171  T
Q  444 tttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45239170 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccatt 45239071  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaa 611  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45239070 gatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 303 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578104
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    || ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||  |||| ||||||||||| | ||    
T  11578244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttccc 11578145  T
Q  598 ccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11578144 ccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 392 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459172
Alignment:
Q  392 ggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaa 491  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggct 588  Q
    || ||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  589 gctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     |||||| || ||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  28459235 tctctctacctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctc 28459172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558849
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36558949  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36558948 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36558849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561126
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36561226  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36561225 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36561126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 389 - 652
Target Start/End: Original strand, 22874141 - 22874404
Alignment:
Q  389 tagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 488  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  22874141 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacggg 22874236  T
Q  489 aaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagg 585  Q
    || |||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||     
T  22874237 aagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgaga 22874336  T
Q  586 gctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22874337 gctgctctctccctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctc 22874404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 495 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407436
Alignment:
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22407496 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22407436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 17897581 - 17897242
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaact-ttgacatagagggggctga-aacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||||  ||||| |  |||| |||||| ||| |||| | |||||| |||| |||||||    
T  17897581 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtt 17897484  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || |||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  17897483 tgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagat 17897388  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||  |||| | ||||||||    
T  17897387 tgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctc 17897288  T
Q  593 tctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||    
T  17897287 tctccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 299 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 20146946 - 20146604
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa--cttt-gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |     ||||||| ||| |||| | |||||| |||| |||||||    
T  20146946 gatatttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtt 20146848  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || |||||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20146847 tgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagat 20146751  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||    
T  20146750 tgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctc 20146651  T
Q  593 tctccc-cagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||| ||| ||||    
T  20146650 tctccctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 303 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 479  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332166
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc- 45332266  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  45332265 tttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 45332166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 345 - 539
Target Start/End: Original strand, 38020165 - 38020349
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38020165 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgat 38020264  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 539  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020265 tcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt-----------attgggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 263 - 652
Target Start/End: Original strand, 35107180 - 35107569
Alignment:
Q  263 gtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaac 361  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||  ||||| |  || ||||    
T  35107180 gtatttttcaatgcagatttgttccaaattttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaac 35107278  T
Q  362 -aagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacac 460  Q
     ||||||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || |||||| |||||| ||||||     
T  35107279 caagagtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacat 35107371  T
Q  461 tattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgta 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||     | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  35107372 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgta 35107470  T
Q  559 acgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||||||   |||||| |||| | || || |||| | |||||||||||||| | || ||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  35107471 atgttactcatcattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctc 35107569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 438 - 637
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  438 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 536  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  537 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaa 631  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||  |||| |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  632 caaatt 637  Q
    ||||||    
T  40699629 caaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 518 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707733
Alignment:
Q  518 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct---ccccagactaggtcaat 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  613 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22707733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 418 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 27136343 - 27136195
Alignment:
Q  418 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||    
T  27136343 aacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaattgggactttgagtagaattagg 27136246  T
Q  518 -cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactc 567  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27136245 tttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 455 - 572
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  554 ttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 548 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163004
Alignment:
Q  548 tctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 22163012  T
Q  645 gttctctc 652  Q
    ||||||||    
T  22163011 gttctctc 22163004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 425 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  425 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 524  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 301 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 5377770 - 5377629
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||| |    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  5377770 tactttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtt 5377671  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 437  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5377670 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 508 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  508 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagact 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||   |||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  605 aggtcaa-tttagaccgaactgggtcaa 631  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 517 - 652
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871089
Alignment:
Q  517 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatt 613  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  614 tagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | || | |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctc 23871089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 299 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 37963266 - 37962938
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||   |||        |||||||||    
T  37963266 gatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatcaaac--------tagggtttg 37963175  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
      || |||||| |||||   ||||||||| | ||||   | |||||||  |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||| ||||||    
T  37963174 tgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattg 37963079  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
     | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||| |||| |||||   ||||||||||   || ||| ||||    
T  37963078 aggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgat---ttttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctc 37962982  T
Q  595 tc-cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37962981 tctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 454 - 572
Target Start/End: Original strand, 15693974 - 15694094
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctc 551  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  15693974 gaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc 15694073  T
Q  552 ttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  15694074 ttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18800820 - 18800702
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  18800820 ttgtgagagttaacttaaaatcatgttctggagaaatcgtggcacgtttgttgggcaacgtgacacgattggatgtttcagttatgaagcaagtcactgg 18800721  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgg 216  Q
    |   || ||||||||||||    
T  18800720 aaaaattgtggcacgatgg 18800702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 572
Target Start/End: Original strand, 43139395 - 43139564
Alignment:
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |    
T  43139395 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgag 43139491  T
Q  500 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    ||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  43139492 actttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-tttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 454 - 610
Target Start/End: Original strand, 17921769 - 17921927
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||     | ||| ||||||| ||||| |||||   ||    
T  17921769 gaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgcaaccctttgat---tc 17921865  T
Q  552 ttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca 610  Q
    |||  ||| |||| |||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17921866 tttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctctacccagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 377 - 599
Target Start/End: Original strand, 35028574 - 35028795
Alignment:
Q  377 caacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtct 476  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35028574 caacaataaaatttgggtttg--tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtct 35028668  T
Q  477 cttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat--- 572  Q
    |||| | ||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |   | | ||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||  |||||||||||       
T  35028669 cttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattactcatcattgc 35028768  T
Q  573 agtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  35028769 agtggaacggagagctgctctctcccc 35028795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741002
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 515
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  439 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaatta 515  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28462650 - 28462593
Alignment:
Q  274 tgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28462650 tgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatca 28462593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 441 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  441 tgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaaa-gattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736266
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaatta 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaatta 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539511
Alignment:
Q  610 aatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 15539511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462497
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054886
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36559359 - 36559211
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  36559359 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 36559262  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  36559261 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 36559211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687044
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12342749 - 12342684
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaa 363  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12342749 gatacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa 12342684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 396
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||| | | || |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828411
Alignment:
Q  478 ttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat 569  Q
    ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |   || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcat 13828411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943723
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc-tttg 17943634  T
Q  557 taacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  |||||||   |||||| | |  || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17943635 taaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattctt 17943723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517633
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 27517724  T
Q  557 taacgttac-----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  ||     |||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27517723 taaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaattctt 27517633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 45332675 - 45332608
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  45332675 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgat 45332608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479055
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 30720796 - 30720684
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| |||| |  ||    
T  30720796 gaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgaaa--tc 30720699  T
Q  552 ttttgtaacgttact 566  Q
    |||||||| ||||||    
T  30720698 ttttgtaaagttact 30720684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 571 - 640
Target Start/End: Original strand, 38191129 - 38191200
Alignment:
Q  571 atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38191129 atagtggaacgaagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 38191200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 333
Target Start/End: Original strand, 45156946 - 45157001
Alignment:
Q  278 gatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 333  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45156946 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttatatcaaa 45157001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 515
Target Start/End: Original strand, 7502990 - 7503052
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga-ttgggactttgggtagaatta 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  7502990 gaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Original strand, 35028473 - 35028527
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35028473 agatttgttccaattttttagggatacttttactataaatatagacattgtatca 35028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 36561677 - 36561537
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || ||    
T  36561677 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacggctgggcttcacggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 36561580  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatgggg 239  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36561579 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgggg 36561537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147049
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa 20147049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 41303228 - 41303155
Alignment:
Q  444 tttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaatta 515  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41303228 tttaccttggagaaaaattattaggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaatta 41303155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36559111 - 36559079
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559111 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 36559079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 36561388 - 36561356
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561388 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 36561356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 45332428 - 45332396
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45332428 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 45332396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 549 - 634
Target Start/End: Original strand, 14699016 - 14699100
Alignment:
Q  549 ctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  14699016 ctcttttgtaacctt--tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35215934 - 35215903
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215934 atacttttactataaatatagaccttgtatca 35215903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 17057407 - 17057369
Alignment:
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17057407 ccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 17085390 - 17085352
Alignment:
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17085390 ccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 464 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27248021
Alignment:
Q  464 taggattgagtctcttggttacgggaaaagat-tgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattagg 27248021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680106
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  || ||| |||||||||||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 337
Target Start/End: Original strand, 40699226 - 40699264
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40699226 gatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaa 40699264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35218315 - 35218286
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218315 atacttttactataaatatagaccttgtat 35218286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42269979 - 42269930
Alignment:
Q  129 agaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag 178  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42269979 agaaatcgtggcacgtttgcagggcaacgtggcacgattggatggttcag 42269930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 42288154 - 42288105
Alignment:
Q  591 tctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| || |||||    
T  42288154 tctctccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatttctt 42288105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 455 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050172
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgg 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 20050172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 20054815 - 20054759
Alignment:
Q  586 gctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20054815 gctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 20054759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 331
Target Start/End: Original strand, 20589581 - 20589609
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589581 cttttactataaatatagaccttgtatca 20589609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 21630016 - 21629948
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  | || ||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  21630016 tcatcatagtggattggagagctgctctctccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 21629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Original strand, 30479126 - 30479182
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30479126 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 30479182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 329
Target Start/End: Original strand, 33603818 - 33603870
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtat 329  Q
    |||||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33603818 agatttgttccaatttgttagggatacttttactataaatataaaccttgtat 33603870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 458 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 33674584 - 33674552
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33674584 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 33674552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 183
Target Start/End: Original strand, 34681824 - 34681876
Alignment:
Q  131 aaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttg 183  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  34681824 aaatcgtggcacgtttgcagggcaacgtggcacgattggatggttcaggtttg 34681876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 37170822 - 37170778
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca 610  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37170822 tcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtca 37170778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 455 - 503
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191045
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 503  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 636
Target Start/End: Original strand, 39680156 - 39680228
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaat 636  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  39680156 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39680228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 101)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 652
Target Start/End: Original strand, 15072505 - 15073064
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| || | |    
T  15072505 ttgtgagagttaacttaaaatcagattctgcaggaatcgtgacacgatggctgggcaacgtgacacgattggaggtttcagttttgaagcaagccactag 15072604  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  15072605 aaaaatcgtgtcacgatgggatcgcaacgtggcatgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 15072704  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  15072705 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggttt 15072804  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa-aagat 495  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |    
T  15072805 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggt 15072904  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat--agtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  15072905 tgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctct 15073004  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15073005 ctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctc 15073064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 648
Target Start/End: Original strand, 15067776 - 15068330
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||| || |||    
T  15067776 ttgtgagtgttaacttaaaatcagattttgcaggaatcgtggcaagatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgaagcaagccactgg 15067875  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15067876 aaaaatcatgccacgatgggatcgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 15067975  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15067976 cgatacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggttt 15068075  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || ||    
T  15068076 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggtt 15068175  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||    
T  15068176 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctc 15068275  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 648  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15068276 tcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 103 - 652
Target Start/End: Original strand, 14807552 - 14808114
Alignment:
Q  103 agagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||  || ||||       
T  14807552 agagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcatgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactggaaaa 14807650  T
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14807651 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacggtggtgcgctggcagcgaaaaacataaacgtattttgag-tgcagatttgttccaaattttaagcgat 14807749  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14807750 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 14807849  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  14807850 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 14807949  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct--- 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||       
T  14807950 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 14808049  T
Q  596 --------ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
            ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808050 cctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 14808114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 27829092 - 27829646
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt-gaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| |||| |||||||  || ||    
T  27829092 ttgtgagagttaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatg-gaggtttcattttttgaggcaaaacactg 27829190  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  27829191 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaa 27829290  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27829291 gcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27829390  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  27829391 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 27829490  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || |||||||||||    
T  27829491 tgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27829589  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829590 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27829646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 27826781 - 27827335
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt-gaggcaagtcattg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| |||| || ||||  || ||    
T  27826781 ttgtgagagttaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatg-gaggtttcattttttgaagcaaagcactg 27826879  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  27826880 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaa 27826979  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  27826980 gcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27827079  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||      
T  27827080 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggc 27827179  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || |||||||||||    
T  27827180 tgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27827278  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827279 ctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27827335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 202 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 28252002 - 28251549
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28252002 atcgtggcacgatgggatcgcatcgtggtacgatggtgcgttggcagcgaaaaacagaaacgtattttgag-tgcagatttgttccaaattttaagcgat 28251904  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28251903 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 28251804  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  28251803 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 28251704  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| ||    
T  28251703 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 28251604  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251603 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28251549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 225 - 649
Target Start/End: Original strand, 4423940 - 4424368
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4423940 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaatagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagacct 4424039  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  4424040 tgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaa 4424139  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4424140 cactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggag 4424239  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccg 620  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4424240 acttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 4424339  T
Q  621 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424340 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 32339302 - 32339659
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32339302 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 32339401  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32339402 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 32339501  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  32339502 ttggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 32339601  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32339602 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttct 32339659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 299 - 652
Target Start/End: Original strand, 27911011 - 27911366
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27911011 gatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttg 27911109  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27911110 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 27911209  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  27911210 ggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct 27911309  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27911310 ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctc 27911366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 299 - 652
Target Start/End: Original strand, 27957430 - 27957785
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27957430 gatacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttg 27957528  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27957529 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 27957628  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  27957629 ggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct 27957728  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27957729 ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctc 27957785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 299 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14419530 - 14419172
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14419530 gatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttg 14419431  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14419430 tatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattg 14419331  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||    
T  14419330 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctc 14419231  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419230 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 14419172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106879
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 27107033  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc-c 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  27107032 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctc 27106933  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27106932 cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttttctc 27106879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480485
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||| |||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggc 30480639  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | | ||||||||||| |||    
T  30480638 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccc 30480539  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480538 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 30480485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 301 - 652
Target Start/End: Original strand, 1225164 - 1225520
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  1225164 tacttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 1225263  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1225264 aagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 1225363  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctc 596  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  1225364 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctc 1225463  T
Q  597 cc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1225464 cctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1225520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Original strand, 18810680 - 18811057
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaa 373  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18810680 gcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 18810779  T
Q  374 aggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgag 473  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18810780 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18810879  T
Q  474 tctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 573  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  18810880 tctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcata 18810978  T
Q  574 --gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
      ||| |  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810979 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18811057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 345 - 642
Target Start/End: Original strand, 608777 - 609077
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608777 atagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 608876  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608877 tcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 608976  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  608977 atttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 609076  T
Q  642 t 642  Q
    |    
T  609077 t 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 3874003 - 3874360
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacataga----gggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| | |||    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||  ||    
T  3874003 atacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagt 3874102  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  3874103 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagagg 3874202  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  3874203 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 3874302  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874303 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3874360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 15809212 - 15809568
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacataga----gggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| | |||    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15809212 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 15809311  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15809312 ttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaa 15809410  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |  ||||||||||    
T  15809411 ctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 15809510  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809511 tcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15809568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28283563 - 28283206
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |      ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  28283563 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagg 28283464  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 492  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28283463 gtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaaga 28283364  T
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgc 590  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||    
T  28283363 gattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 28283265  T
Q  591 tctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283264 tctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Original strand, 41384742 - 41385097
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||     
T  41384742 atacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgt 41384840  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41384841 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 41384940  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
      |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||     
T  41384941 agctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 41385040  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41385041 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttctctc 41385097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Original strand, 44720815 - 44721193
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaa 373  Q
    |||||||| || || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44720815 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44720914  T
Q  374 aggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaa-cactattaggattga 472  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44720915 aggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattga 44721014  T
Q  473 gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  44721015 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcat 44721113  T
Q  573 a--gtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |  ||| |  | || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44721114 atagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 44721193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 299 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 13858823 - 13858469
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13858823 gatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 13858724  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13858723 tatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattg 13858624  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||    
T  13858623 gggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctc 13858525  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 650  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13858524 tcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattc-tttgtgttctc 13858469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22684948 - 22684638
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22684948 atagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgat 22684849  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---a 541  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  22684848 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaata 22684749  T
Q  542 ttgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattc 638  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22684748 ttgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 22684649  T
Q  639 ttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||    
T  22684648 ttttgtgttct 22684638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 304 - 649
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865887
Alignment:
Q  304 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||| ||    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctccc 36865834  T
Q  599 c--agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36865835 ccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttct 36865887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 303 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372161
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct--c 596  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| | ||||||  |    
T  5372313 tttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccc 5372214  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  5372213 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgttct 5372161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Original strand, 41382670 - 41383015
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||     
T  41382670 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgt 41382769  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||           |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41382770 atagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattgg 41382858  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||     
T  41382859 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 41382958  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41382959 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 41383015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952874
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || || | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagac 25952719  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  25952720 attgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 25952819  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25952820 ccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 25952874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 350 - 649
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079952
Alignment:
Q  350 gggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttacc 449  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  450 ttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 548  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  549 ctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 645  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  43079850 ctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtg 43079948  T
Q  646 ttct 649  Q
    ||||    
T  43079949 ttct 43079952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 279 - 649
Target Start/End: Original strand, 43530099 - 43530465
Alignment:
Q  279 atttattccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcaga 372  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  43530099 atttattccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 43530198  T
Q  373 aaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga 472  Q
    || ||||||||             |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43530199 aaagcaacaac-------------gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 43530285  T
Q  473 gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc-- 570  Q
    |||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  43530286 gtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcat 43530385  T
Q  571 atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||| | || ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530386 atagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43530465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 275 - 649
Target Start/End: Original strand, 18812865 - 18813231
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaa 373  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  18812865 gcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaa 18812964  T
Q  374 aggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgag 473  Q
    |||||||||||||| |||           |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18812965 aggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18813053  T
Q  474 tctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 573  Q
    |||||||| |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  18813054 tctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcata 18813152  T
Q  574 --gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
      ||| |  | ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18813153 tagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Original strand, 43082016 - 43082323
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43082016 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 43082115  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43082116 tcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccatt 43082215  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |    
T  43082216 gatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttct 43082314  T
Q  641 ttgtgttct 649  Q
    |||||||||    
T  43082315 ttgtgttct 43082323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541392
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggac 33541524  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccc 598  Q
    ||| ||||||||||||                      |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  33541523 ttttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccc 33541446  T
Q  599 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  33541445 cagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttctctc 33541392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 300 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 24873525 - 24873178
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |      ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24873525 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 24873426  T
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaa 491  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  24873425 gtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaag 24873326  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctg 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||    
T  24873325 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 24873227  T
Q  590 ctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||||||| | |||||||||  || ||||||| || |||||||||||    
T  24873226 ctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 303 - 548
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477522
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || || | |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477476 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 299 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15186049 - 15185696
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||| ||| ||| | |||||||||| ||| ||||||  || ||||||| || |||||     
T  15186049 gatacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggttta 15185950  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctct--tggttacgggaaaagat 495  Q
     ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  15185949 tataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagagat 15185850  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    |       |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| ||| ||| ||    
T  15185849 t-------tgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttc 15185757  T
Q  593 tctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15185756 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctc 15185696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 99 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12517565 - 12517248
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   | ||||    
T  12517565 tgtgagagttaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaatgtactgga 12517466  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  12517465 aaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagc 12517366  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaag-taacttt--gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12517365 gatacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 12517266  T
Q  396 tgcatagagtttgtctct 413  Q
    || |||||||||||||||    
T  12517265 tgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 392 - 652
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956311
Alignment:
Q  392 ggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaa 491  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggct 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||| |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  589 gctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctc 15956311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 303 - 637
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482649
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||| |||||   |||        ||||||||| |||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatcaaac--------tagggtttgtata 21482413  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagt---gaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |   |||||| ||||||||||||||||    
T  21482510 tttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctccc 21482609  T
Q  599 c-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21482610 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 637
Target Start/End: Original strand, 31162209 - 31162551
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaa-caagagttcagaaaggcaa-caacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | |||||||||| ||| |||  ||| |||||  ||| ||||||| |||| |||    
T  31162209 gatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaa-ttagtgtt 31162305  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || ||| |||||| ||||| | |||||||||||  |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  31162306 tgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagat 31162402  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| |||  ||||||||||    
T  31162403 tgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctc 31162502  T
Q  593 tct---ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||   ||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  31162503 tctcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 389 - 628
Target Start/End: Original strand, 21480593 - 21480832
Alignment:
Q  389 tagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 488  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21480593 tagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacggg 21480688  T
Q  489 aaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagg 585  Q
    || | ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  |||    
T  21480689 aagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagg 21480788  T
Q  586 gctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggt 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21480789 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 393 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 3005872 - 3005624
Alignment:
Q  393 gtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaa 492  Q
    ||||| |||||||||| |||||   |||||||| ||||||| ||   |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |    
T  3005872 gtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaaga 3005777  T
Q  493 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctg 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||| |||| |||| ||    
T  3005776 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtg 3005677  T
Q  590 ctctct-ccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3005676 ctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaattctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 303 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 5623073 - 5622877
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  5623073 cttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 5622974  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5622973 gagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 301 - 479
Target Start/End: Original strand, 26775199 - 26775378
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || || | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  26775199 tacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgta 26775298  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 479  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775299 tatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 425 - 599
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181798
Alignment:
Q  425 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggg 521  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  522 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatagtgaaacagatgactgctctctcccc 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 225 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3886334 - 3886153
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtattttt---ggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatataga 321  Q
    ||||| ||||||| | | |||||||||| ||||||||  |||||||   || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886334 cgtggtacgatggtgtgctggcagcgaataacagaaacatattttttttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataga 3886235  T
Q  322 ccttgtatcaaag-taactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 402  Q
    | |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3886234 ctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 303 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     ||||||||| |||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 35872619  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatta 465  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2468513 - 2468261
Alignment:
Q  223 aacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 322  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2468513 aacgtggcacgatggtgcgctggatgcgaataacagaaacgtattttttagtgcagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagac 2468414  T
Q  323 cttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaaca 421  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||   ||| ||    |    || |  |||||||||| ||||| | ||||    
T  2468413 cttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaaatcaaactacggttt----gtatatatagagtttg-ctcttggcaaca 2468319  T
Q  422 aacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 482  Q
    || |||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468318 aatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 440 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 538  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaattta-gaccgaactgggtcaaca 633  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  634 aatt 637  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 390 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214317
Alignment:
Q  390 agggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacggga 37214348  T
Q  490 aaagattgggactttgggtagaattaggcgg 520  Q
    |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37214347 agcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 437 - 637
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  437 gggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 535  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  536 aacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagac--taggtcaat-ttagaccgaactgggt 628  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| | || |||||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  629 caacaaatt 637  Q
     ||||||||    
T  31035451 aaacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 400 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 31573961 - 31573794
Alignment:
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  31573961 tagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 31573865  T
Q  500 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat 569  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31573864 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Original strand, 44720616 - 44720816
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc--gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||  | |    
T  44720616 ttgtgagagttaacttaaaatcaggttttctgcagaa-tcgtggcatgattgctgggcattgtggcacgtttggaggtttcagttttgaggcaaggtact 44720714  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttta 295  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  44720715 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagc-aaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagatttta 44720813  T
Q  296 agc 298  Q
    |||    
T  44720814 agc 44720816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 508 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  508 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagac 603  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||   |||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  604 taggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 524 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872435
Alignment:
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccga 621  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||            |||| ||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc------------atttggaccga 35872466  T
Q  622 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872465 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 35872435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 454 - 610
Target Start/End: Original strand, 17847677 - 17847830
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  17847677 gaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa-cctttgatatctct 17847775  T
Q  553 tttgtaacgttactcatcatagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtca 610  Q
    |||||||    | |||| |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17847776 tttgtaa----aatcattatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 17847830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 18812667 - 18812815
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttg-aggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||  ||||||| || ||    
T  18812667 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgaagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatg-gaggttttagttttttaggcaaggcactg 18812765  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  18812766 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 18812815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 4423835 - 4423952
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| || ||||    
T  4423835 tgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaatcgtggcacaattgctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagttttaaggcaaggcactgga 4423934  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgg 216  Q
       |||||||||||||||    
T  4423935 aaaatcgtggcacgatgg 4423952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214246
Alignment:
Q  585 ggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttctc 37214246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 397
Target Start/End: Original strand, 181534 - 181632
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||    
T  181534 atacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 18810483 - 18810550
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18810483 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat 18810550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 455 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985163
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccctttggaatctctt 13985163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28252122 - 28252036
Alignment:
Q  103 agagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||  ||||||||||    
T  28252122 agagttaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggtacgattggaggtttcaagtttgaggcaa 28252036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 331
Target Start/End: Original strand, 17847501 - 17847556
Alignment:
Q  276 cagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847501 cagatttgttccaaattttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatca 17847556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Original strand, 43079344 - 43079414
Alignment:
Q  96 acttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  43079344 acttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgat 43079414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 474
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035238
Alignment:
Q  377 caacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagt 474  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 652
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376342
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||  |||||||||||   | ||||| |||||||| |||  |||||||||| |    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctc-t 6376239  T
Q  554 ttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 648  Q
    |||||| ||||||||||   |||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||  || |||||||| || |||||||    
T  6376240 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt-ttgtgtgttc 6376338  T
Q  649 tctc 652  Q
    ||||    
T  6376339 tctc 6376342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 572
Target Start/End: Original strand, 3895972 - 3896092
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt-attcttgtaacccat-tgatatctc 551  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||   || | || ||||||||||| | | |||||||||    
T  3895972 gaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctc 3896071  T
Q  552 ttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  3896072 ttttgtaaagttactcatcat 3896092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 571 - 649
Target Start/End: Original strand, 14477521 - 14477601
Alignment:
Q  571 atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactg-ggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14477521 atagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttct 14477601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 635
Target Start/End: Original strand, 16833769 - 16833886
Alignment:
Q  522 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttact---catcatagtgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttaga 617  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |     
T  16833769 agacttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttgg 16833868  T
Q  618 ccgaactgggtcaacaaa 635  Q
     |||||||||| ||||||    
T  16833869 acgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021228
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757388
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327969
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Original strand, 43081721 - 43081789
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  43081721 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggcaaggcaaagtggcacgat 43081789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 337
Target Start/End: Original strand, 6375962 - 6376023
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcg--atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa 337  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6375962 agatttattccaa-ttttatgcgggatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaa 6376023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 340 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 37214507 - 37214460
Alignment:
Q  340 ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaa 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37214507 ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaa 37214460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 652
Target Start/End: Original strand, 181798 - 181832
Alignment:
Q  618 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  181798 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 181832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812608
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattag 516  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332692
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554908
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 17799494 - 17799418
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17799494 tcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 331
Target Start/End: Original strand, 31035028 - 31035095
Alignment:
Q  263 gtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31035028 gtatttttgggctcagatttgttccaattttttag-gatatttttactataaatatagaccttgtatca 31035095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799571
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 17799571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684704
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggac-ttgggtagaattagg 25684704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 2267205 - 2267144
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  2267205 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggac-ttgggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Original strand, 26402717 - 26402766
Alignment:
Q  129 agaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag 178  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26402717 agaaatcgtggcacgtttgcagggcaacgtggcacgattggatggttcag 26402766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 33839105 - 33839043
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  33839105 gaaacactattaggattgagtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattagg 33839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 331
Target Start/End: Original strand, 43079585 - 43079614
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079585 acttttactataaatatagaccttgtatca 43079614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 331
Target Start/End: Original strand, 43081957 - 43081986
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081957 acttttactataaatatagaccttgtatca 43081986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 4812538 - 4812486
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccca-gactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaat 636  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  4812538 gctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaat 4812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 9021157 - 9021101
Alignment:
Q  586 gctgctctctcc-ccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9021157 gctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 9021101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 177
Target Start/End: Original strand, 9765385 - 9765433
Alignment:
Q  129 agaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttca 177  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9765385 agaaatcgtggcacgtttgcagggcaacgtggcacgattggatggttca 9765433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 596 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 10930237 - 10930193
Alignment:
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  10930237 ccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 591 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 18106124 - 18106084
Alignment:
Q  591 tctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaa 631  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  18106124 tctctccccagaataggtcaagttggaccgaactgggtcaa 18106084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 23179611 - 23179555
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23179611 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 23179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 119)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 99 - 652
Target Start/End: Original strand, 9019702 - 9020258
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| || ||||    
T  9019702 tgtgagagttaacttaaaatcaggatctgtaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttgggcaaggcactgga 9019801  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| || |||| || |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  9019802 aaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctgacagcaaataacagaaacgtattttggg-tgcagatttgttccaaattttaagc 9019900  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9019901 gatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 9020000  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  9020001 tatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattg 9020100  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  9020101 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctct 9020200  T
Q  596 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020201 cccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 9020258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 97 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 11983568 - 11983011
Alignment:
Q  97 cttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||||  || ||||||||| ||||| ||| || |    
T  11983568 cttgtaagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggtacgatggttgggcaacatggtacgatg-gaggtttcagttgtgaggtaag-cact 11983472  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttta 295  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  11983471 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtttcaaatttta 11983372  T
Q  296 agcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  11983371 aacgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggt 11983272  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11983271 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 11983172  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||    
T  11983171 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 11983072  T
Q  593 tct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983071 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11983011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 99 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 14507716 - 14507161
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt---gaggcaagtcat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||   ||  |||| ||     
T  14507716 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttttgatacaaggcac 14507619  T
Q  195 tggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaatttt 294  Q
    ||||   || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||  ||||||||  || |||||| |||||||||||    
T  14507618 tggaaaaatggtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctgccagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgtagatttgttccaaatttt 14507519  T
Q  295 aagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattaggg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14507518 aagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 14507419  T
Q  394 tttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14507418 tttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 14507319  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgct 591  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||  |||||||| || |||||||||    
T  14507318 gctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgct 14507220  T
Q  592 ctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507219 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14507161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 225 - 652
Target Start/End: Original strand, 32279898 - 32280329
Alignment:
Q  225 cgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacct 324  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32279898 cgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaatgtatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagacct 32279997  T
Q  325 tgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaa 423  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  32279998 tgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaa 32280096  T
Q  424 cactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggag 523  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32280097 cacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggag 32280196  T
Q  524 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagacc 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32280197 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 32280296  T
Q  620 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32280297 gaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctc 32280329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 209 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15541569 - 15541122
Alignment:
Q  209 cacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatactttta 308  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||  || |||||||||| | ||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  15541569 cacgatgagatcgcaacgtggcacgatggtacgctggcagcgaatagcagaaacatatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagttacactttta 15541470  T
Q  309 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagttt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15541469 ctataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 15541370  T
Q  408 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttggg 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  15541369 gtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttggg 15541270  T
Q  508 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagact 604  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||  |  |||||||||||| |||||||    
T  15541269 taggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagact 15541170  T
Q  605 aggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541169 aggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 15541122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 182 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 30729284 - 30728806
Alignment:
Q  182 tgaggcaagtcattggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatt 281  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30729284 tgaggcaagtcactggaaatttcgtgccacgatggggtcacaacgtggcacgatagtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatt 30729185  T
Q  282 tattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaac 380  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||    
T  30729184 tgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaac 30729085  T
Q  381 aacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 480  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30729084 aacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttg 30728985  T
Q  481 gttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgtaacgttactc--atcatag 574  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||||||||| |||||||  || ||||    
T  30728984 gttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatag 30728885  T
Q  575 tgaaacgaagggctgctctctccc-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30728884 tggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 30728806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 99 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 15530661 - 15530166
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||  || | ||    
T  15530661 tgtgagagttaacttaaaatcaggatctgcaggaatcgtggcacgatggctgggtaacgtggcacaattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactcga 15530562  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
        |||||| ||||||||   ||| ||||||||||||| | | |||||| |||  | |||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  15530561 aaattcgtggtacgatggggccgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagtgaattatagaaacatatttttgggtgcaggtttgttccaaattttaagc 15530462  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15530461 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttg 15530362  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15530361 tatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 15530262  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  15530261 aggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 182 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 15533137 - 15532674
Alignment:
Q  182 tgaggcaagtcattggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatt 281  Q
    |||||||||||| ||||  | | ||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||| ||| ||| || || |||||  ||||||| | ||||||||    
T  15533137 tgaggcaagtcactggaaattttgtgccacgatgagatcgcaacgtgtcacaatggtgcgctggtagcaaataagagaaacatatttttaggtgcagatt 15533038  T
Q  282 tattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaac 380  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  15533037 tgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaac 15532938  T
Q  381 aacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 480  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15532937 aacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 15532838  T
Q  481 gttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaa 578  Q
    || | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15532837 gtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaa 15532738  T
Q  579 acgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 642  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15532737 acggagggctgctctatccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057527
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 13057372  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  13057373 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctccc 13057472  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13057473 ccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctc 13057527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28241658 - 28241306
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28241658 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 28241559  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  28241558 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28241459  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |    
T  28241458 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 28241359  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241358 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28241306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 1230586 - 1230234
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1230586 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 1230487  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  ||||    
T  1230486 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctggg 1230387  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| |    
T  1230386 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 1230287  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230286 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1230234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629847
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggc 3630000  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3629999 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctctcccc 3629900  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629899 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3629847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 299 - 652
Target Start/End: Original strand, 3390354 - 3390712
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3390354 gatacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 3390453  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  3390454 tatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattg 3390553  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  3390554 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctc 3390653  T
Q  595 t-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3390654 tcccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtgatctctc 3390712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 310 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458752
Alignment:
Q  310 tataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttg 408  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  409 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggt 508  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  509 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agacta 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 14458796  T
Q  606 ggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458795 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14458752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040087
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | |||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||| |||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctccc 598  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13039933 tttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 13040032  T
Q  599 c-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13040033 ctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 13040087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 305 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631921
Alignment:
Q  305 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcataga 403  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  404 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactt 503  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactt 3632072  T
Q  504 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcccca 600  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  3632071 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt-ccca 3631973  T
Q  601 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3631972 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 3631921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 97 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 19227950 - 19227514
Alignment:
Q  97 cttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagtttt-gaggcaagtcatt 195  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  || |||||| |||| |||||||| || |    
T  19227950 cttgtgagagttaacttaaaattaagatctgcaggaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcatgatg-gaggtttcaatttttgaggcaaggcact 19227852  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtattttt-ggatgcagatttattccaaatttt 294  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  19227851 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatattttttgggtgcagatttgttccaaatttt 19227752  T
Q  295 aagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattaggg 393  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19227751 aagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 19227652  T
Q  394 tttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19227651 tttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 19227552  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 531  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227551 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477614
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |    
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggc 25477452  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttac----------tcatcatagtgaaacgaagggctgct 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||||||  |||||||||    
T  25477453 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgct 25477552  T
Q  592 ctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25477553 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattctctc 25477614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 4816523 - 4816216
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4816523 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 4816424  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816423 tcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 4816324  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4816323 atttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 4816224  T
Q  642 tgtgttct 649  Q
    ||||||||    
T  4816223 tgtgttct 4816216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Original strand, 30967174 - 30967530
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaactttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||    
T  30967174 atacttttactataaatatagaccttgtataggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtt 30967273  T
Q  396 tgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagat 495  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  30967274 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 30967373  T
Q  496 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctct 593  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | || || ||||||||    
T  30967374 tgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctct 30967473  T
Q  594 ct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967474 ctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30967530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 300 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 30034945 - 30034590
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-cttt----gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||    || |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  30034945 atacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagt 30034846  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||     
T  30034845 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagagg 30034746  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | | || ||||||||||    
T  30034745 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctc 30034646  T
Q  593 tctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034645 tctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 275 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 20915721 - 20915351
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt---gacatagagggggctgaaacaagagttcag 371  Q
    |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||    || |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20915721 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 20915622  T
Q  372 aaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg 471  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20915621 aaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 20915522  T
Q  472 -agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 570  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  20915521 gagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatc 20915423  T
Q  571 ata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattct 639  Q
    |||  ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20915422 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 2629228 - 2628871
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagag-----ggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattaggg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| | ||||     |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2629228 atacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 2629129  T
Q  394 tttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 493  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2629128 tttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 2629029  T
Q  494 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgct 591  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || |||||||||    
T  2629028 attgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgct 2628930  T
Q  592 ctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2628929 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 2628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 301 - 651
Target Start/End: Original strand, 26064958 - 26065312
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt------gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |      || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||    
T  26064958 tactttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagt 26065057  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  26065058 ttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 26065154  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |   |||||| | || ||||||||||    
T  26065155 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctc 26065253  T
Q  593 tctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26065254 tctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 26065312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 301 - 651
Target Start/End: Original strand, 26084927 - 26085281
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaacttt------gacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggt 394  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |      || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| ||    
T  26084927 tactttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagt 26085026  T
Q  395 ttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga 494  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  26085027 ttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 26085123  T
Q  495 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat--catagtgaaacgaagggctgctc 592  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |   |||||| | || ||||||||||    
T  26085124 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctc 26085222  T
Q  593 tctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 651  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26085223 tctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 26085281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233707
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | || | ||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| || |||||| |||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  402 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  3233866 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctccc 3233767  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagacc-----gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233766 ccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3233707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 300 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 12195853 - 12195500
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||     
T  12195853 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 12195754  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12195753 atagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 12195654  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||||||||||||    
T  12195653 ggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 12195555  T
Q  596 cccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  12195554 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttct 12195500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 348 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 19704858 - 19704552
Alignment:
Q  348 gagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattta 447  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  19704858 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattca 19704759  T
Q  448 ccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704758 ccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 19704659  T
Q  547 atctct-tttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 642  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19704658 ttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattatttt 19704559  T
Q  643 gtgttct 649  Q
    |||||||    
T  19704558 gtgttct 19704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338430
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
     ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||  ||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaaga 24338584  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24338583 ctttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc-cc 24338485  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  24338484 ccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctc 24338430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 99 - 422
Target Start/End: Original strand, 8995255 - 8995578
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| || ||||    
T  8995255 tgtgagagttaacttaaaatcaggatctgtaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttgggcaaggcactgga 8995354  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
       |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| || |||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  8995355 aaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctgacagcaaataacagaaacgta-ttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 8995453  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  || |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  8995454 gatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 8995553  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaa 422  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  8995554 tatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161540
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagt-aactttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||| |||| ||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagata-aaggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  12161790 gagtttgtctc--tggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagac 12161693  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc 599  Q
    ||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| | | ||||| ||||||||     
T  12161692 tttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctctccct 12161593  T
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  12161592 aaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctc 12161540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26932854 - 26932546
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||| ||||||||| | | ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  26932854 atagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgat 26932755  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932754 tcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 26932655  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaa-ttct 639  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26932654 gatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttct 26932556  T
Q  640 tttgtgttct 649  Q
    ||||||||||    
T  26932555 tttgtgttct 26932546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 99 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 1072395 - 1072069
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1072395 tgtgagagttaacttaaaatcaggttctgcagaaatcgtggtacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttaagttttgaggcaagtcattgga 1072296  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
    ||| ||||                     ||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1072295 tttttcgt---------------------ggcacgatggtacgtaggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 1072217  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1072216 aatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttg 1072117  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 445  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1072116 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgatt 1072069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 447 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 1069909 - 1069700
Alignment:
Q  447 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069909 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 1069810  T
Q  547 atctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctc-tccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctttt 642  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  1069809 atctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattctttt 1069710  T
Q  643 gtgttctctc 652  Q
     |||||||||    
T  1069709 atgttctctc 1069700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 303 - 572
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490889
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttca-gaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |  |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 22490817  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22490818 ctttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 299 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 3028189 - 3027848
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaa-caagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| | |||||||||| |||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  3028189 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaactagggttt 3028092  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  3028091 gtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagatt 3027995  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctc- 592  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||     
T  3027994 gagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 3027895  T
Q  593 -tctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
     || |||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3027894 ttccccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatt 3027848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 422 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  422 aacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgg 520  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  521 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttaga 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||  |||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  618 ccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 400 - 652
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466656
Alignment:
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||| || | | ||||| | |    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgttt 14466598  T
Q  596 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14466599 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctc 14466656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 389 - 637
Target Start/End: Original strand, 15719712 - 15719961
Alignment:
Q  389 tagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 488  Q
    ||||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||   | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15719712 tagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatggg 15719807  T
Q  489 aaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagg 585  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||     
T  15719808 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagaga 15719907  T
Q  586 gctgctc--tctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    | |||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  15719908 gttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaatt 15719961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066109
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26066209  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26066208 tttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26066109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 439 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186053
Alignment:
Q  439 gttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 537  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  538 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaaca 633  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  634 aattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  12186071 aattattttgtgttctctc 12186053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068380
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 26068480  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26068479 tttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26068380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754694
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc- 29754794  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29754793 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 29754694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309185
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33309085  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33309086 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33309185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 385 - 652
Target Start/End: Original strand, 15367097 - 15367363
Alignment:
Q  385 aaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 484  Q
    ||||||||| ||| || | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  15367097 aaattaggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcg 15367192  T
Q  485 cgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacga 582  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||     
T  15367193 cgggaagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacgg 15367292  T
Q  583 agggctg--ctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15367293 aaggctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 15367363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311454
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc- 33311354  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33311355 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33311454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 384 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16455676 - 16455421
Alignment:
Q  384 aaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 483  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |     
T  16455676 aaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctc 16455580  T
Q  484 acgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaac 580  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||   |||||| |||    
T  16455579 acggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaac 16455480  T
Q  581 gaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||| || ||||||||    
T  16455479 ggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 309 - 570
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012287
Alignment:
Q  309 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaa-acaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||| ||||| | ||| ||| |||| |  ||||||||| | |||||||| ||| ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaa-gtaaacaacaaact-agggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  407 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgg 506  Q
    || ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||   |||| |    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttg 17012223  T
Q  507 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17012224 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 438 - 637
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  438 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 536  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  537 acccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctct-ctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaa 631  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||  |||||||||| ||||| | ||||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  632 caaatt 637  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 303 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactag-ggtttgagggttgatttacct 450  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 277 - 637
Target Start/End: Original strand, 19696394 - 19696759
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaactttgacatagaggg--ggctgaaa-caagagttcaga 372  Q
    |||||| |||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||   | | ||| |||| | ||||||  |||||||| |||| ||| |||    
T  19696394 agatttgttccaatttttgaaggattcttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttaga 19696493  T
Q  373 aaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattga 472  Q
    ||   ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  |   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19696494 aaca-aacaacaaa-ttagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattga 19696588  T
Q  473 gtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc- 570  Q
    ||||||| || || | || |||||| |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||     
T  19696589 gtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatca 19696688  T
Q  571 --atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
      |||||| |||  |  ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  19696689 ttatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 498 - 637
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346664
Alignment:
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||| |  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  596 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 300 - 431
Target Start/End: Original strand, 17852518 - 17852650
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||| |||||     
T  17852518 atacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgt 17852617  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 431  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17852618 atagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 441 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037794
Alignment:
Q  441 tgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 539  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  540 cattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 573  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 28037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 440 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078540
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 538  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| || |||||| || |||  |||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  539 ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||| |||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||| |||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaa 25078557  T
Q  635 attcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| || |||||||||||    
T  25078556 att-ttgtgtgttctctc 25078540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 409 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 22858181 - 22857949
Alignment:
Q  409 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggt 508  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||| |||||| |||    
T  22858181 tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggt 22858084  T
Q  509 agaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc-attgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccaga 602  Q
    ||| |||||   | ||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||   |||||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  22858083 agatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccaga 22857985  T
Q  603 ctaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||||| | || |||||||||| || ||||||||    
T  22857984 ctaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatt 22857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 566 - 652
Target Start/End: Original strand, 10584241 - 10584328
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcc-ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10584241 tcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctc 10584328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 310 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  310 tataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttg 408  Q
    ||||||||||| | |||||||| || || | |||| ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  409 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttacctt 451  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 455 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937219
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || |||||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  554 ttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtc 609  Q
    | |||| ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12937276 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccccagactaggtc 12937219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 418 - 596
Target Start/End: Original strand, 20526902 - 20527081
Alignment:
Q  418 aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  20526902 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattagg 20526999  T
Q  518 -cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctc 596  Q
       | ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||   |||||| |||| || |||||||||||    
T  20527000 tttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 202 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24192731 - 24192630
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  24192731 atcgtgccacgatgggattgcaatgtggcatgatggggcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagcaat 24192632  T
Q  302 ac 303  Q
    ||    
T  24192631 ac 24192630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 192
Target Start/End: Original strand, 32279794 - 32279886
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtc 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  32279794 tgtgagagttaacttaaaatcagttct-gcaggaaacgtgacacgattgttgggcaacgtggcacgattggatgtttcagttctgaggcaagtc 32279886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 33308684 - 33308832
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  33308684 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 33308781  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  33308782 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 33308832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 33310953 - 33311101
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  33310953 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 33311050  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  33311051 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 33311101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24191634 - 24191533
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  24191634 atcgtgccacgatgggattgcaatgtggtatgatggggcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagcaat 24191535  T
Q  302 ac 303  Q
    ||    
T  24191534 ac 24191533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465573
Alignment:
Q  518 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctctc-cccagactaggtcaat- 612  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  613 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 25465573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 454 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 7542567 - 7542452
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaga-ttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 551  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  7542567 gaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctc 7542468  T
Q  552 ttttgtaacgttactca 568  Q
     ||||||| ||||||||    
T  7542467 -tttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 440 - 515
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  440 ttgatttaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 515  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 458 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694846
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-tttg 17694936  T
Q  557 taacgttac----tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| |  ||    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17694935 taaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17694846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 499 - 572
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445773
Alignment:
Q  499 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 30445773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911471
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctctt 553  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||  || |||||| |||||| |||||| |||||   || | || ||||||||||||  || |||||||||    
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12911530  T
Q  554 ttgtaacgttactcatcat---agtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtc 609  Q
    | |||| ||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12911529 t-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 12911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 3577559 - 3577484
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3577559 tcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 3577484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4816749 - 4816624
Alignment:
Q  156 cgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaa 255  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | | ||| ||| || ||    
T  4816749 cgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgtgctggtagc-aaaaa 4816651  T
Q  256 cagaaatgtatttttggatgcagattt 282  Q
    ||||||  ||||||| | |||||||||    
T  4816650 cagaaacatattttttggtgcagattt 4816624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  463 ttaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878788
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883536
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785980
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26066612 - 26066544
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  26066612 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtag-aatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgat 26066544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26068882 - 26068735
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| || | || |||| || ||||  |||||| || ||    
T  26068882 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcatga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 26068785  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||   |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| ||||    
T  26068784 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 26068735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29755279 - 29755132
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || ||    
T  29755279 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 29755182  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  29755181 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 29755132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4816608 - 4816552
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816608 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatca 4816552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15541679 - 15541631
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  15541679 tgtgagagttaacttaaaatcaggatttgcagaaatcgtgccacgatgg 15541631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24191668 - 24191620
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  24191668 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttacagaaatcgtgccacgatgg 24191620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24192765 - 24192717
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  24192765 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttacagaaatcgtgccacgatgg 24192717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12911812 - 12911754
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaa--tatagaccttgtatcaaa 333  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  12911812 agatttattccaaatttttagggatacttttactataaatatatagacattgtatcaaa 12911754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 13467536 - 13467461
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13467536 tcattatagtggaacggagagctgctctctccccagactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaattctt 13467461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 468
Target Start/End: Original strand, 15346366 - 15346524
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    |||        |||||||||    
T  15346366 gatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttagaattcaaac--------tagggtttg 15346457  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattagga 468  Q
     ||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15346458 tataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26068662 - 26068603
Alignment:
Q  275 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068662 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 26068603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12937559 - 12937517
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatata 319  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12937559 agatttattccaaatttttagggatacttttactataaatata 12937517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078261
Alignment:
Q  522 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 28078261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26066389 - 26066332
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066389 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 26066332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 566 - 640
Target Start/End: Original strand, 25941781 - 25941857
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25941781 tcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25941857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29755032 - 29755000
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755032 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 29755000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 33308932 - 33308964
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308932 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 33308964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 33311201 - 33311233
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311201 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 33311233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 462 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  462 attaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12186431 - 12186376
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattttaagcgat-acttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12186431 agatttgttccaattttttagcgattacttttactataaatataaaccttgtatca 12186376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16455799 - 16455732
Alignment:
Q  263 gtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 330  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16455799 gtatttttgggctcagatttgttccaatttttcagggatacctttactataaatatataccttgtatc 16455732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || || ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28038044 - 28038006
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28038044 gatacttttactataaatatagacattgtatcaacgtaa 28038006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 528 - 572
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833526
Alignment:
Q  528 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtt-actcatcat 572  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcat 3833526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 387
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466397
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaa 387  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | | ||| | |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaa 14466397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15533221 - 15533172
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatgg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||    
T  15533221 ttgtgagagttaacttaaaatcaggatctacagaaatcgtgccacgatgg 15533172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 461 - 517
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  461 tattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 538
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643259
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |   |||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26643259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 458 - 538
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749225
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |   |||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26749225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467585
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||  ||||||||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 15367011 - 15367043
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatca 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367011 gatacttttactataaatatagacattgtatca 15367043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 22342851 - 22342795
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22342851 gctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22342795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 22963772 - 22963704
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  22963772 tcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 22963704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Original strand, 23824621 - 23824689
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  23824621 tcatcatagtggattggagggctgctctctccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 23824689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 566 - 652
Target Start/End: Original strand, 30443533 - 30443621
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||    
T  30443533 tcattatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttttctc 30443621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 35201377 - 35201325
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccca-gactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaat 636  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  35201377 gctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaat 35201325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 69834 - 69277
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||  || ||    
T  69834 ttgtaagagttaacttaaaatcagatttctgcagaa-tcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgaggcaaagcactg 69736  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaa 296  Q
    ||   ||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  69735 gaaaaatcgtagcacaatgggatcgcatcgttgcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttggg-tgcagatttgttccaaattttaa 69637  T
Q  297 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattag 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  69636 gcgatacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 69537  T
Q  392 ggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaa 491  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  69536 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 69437  T
Q  492 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctg 589  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || || ||||    
T  69436 aggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctg 69338  T
Q  590 ctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69337 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 69277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 226 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 73438 - 73207
Alignment:
Q  226 gtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 325  Q
    |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  73438 gtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttggg-tgcagatttgttccaaattttaagagatacttttactataaatatagaccgt 73340  T
Q  326 gtatcaaagtaa-ctttgaca----tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaac 420  Q
    ||||||||| || |||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  73339 gtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 73240  T
Q  421 aaacactagggtttgagggttgatttaccttgg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  73239 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 73545 - 73454
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaa 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||    
T  73545 ttgtaagagttaacttaaaatcagatttatgcagaa-tcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgaggcaa 73454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73160
Alignment:
Q  414 ttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatt 464  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 100 - 652
Target Start/End: Original strand, 14768 - 15323
Alignment:
Q  100 gtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14768 gtgagagttaacttaaaatcaggattctgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggaacgatgggaagtttcagttatgaggcaagtcactgga 14867  T
Q  199 tttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagc 298  Q
      | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  14868 aatttcgtggcacgatgggatcacaacgtgacacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 14967  T
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||     
T  14968 gatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttt 15067  T
Q  398 catagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattg 497  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  15068 tataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattc 15167  T
Q  498 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct 595  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| | ||||||| |||    
T  15168 agactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtct 15267  T
Q  596 -ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
     |||||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  15268 cccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattc--ttgtgttctctc 15323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 345 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14674 - 14366
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14674 atagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgat 14575  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 544  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14574 tcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 14475  T
Q  545 atatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttt 641  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  14474 atatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--t 14377  T
Q  642 tgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||    
T  14376 tgtgttctctc 14366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 212 - 649
Target Start/End: Original strand, 3859 - 4298
Alignment:
Q  212 gatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgatacttttacta 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  3859 gatggaattgcaacgtggcacgatggtgcgatggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttacta 3958  T
Q  312 taaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtc 410  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  3959 taaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtc 4057  T
Q  411 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtag 510  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  4058 tctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtag 4157  T
Q  511 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctccccagactaggt 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4158 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccagactaggt 4257  T
Q  609 caatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4258 caatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 98 - 649
Target Start/End: Original strand, 2628 - 3182
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttcgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcagttttgaggcaagtcattgg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  | |||    
T  2628 ttgtgagagttaacttaaaatcaagatctgcaggaattgtgacacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaggcaaggtactgg 2727  T
Q  198 atttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaag 297  Q
    |   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2728 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 2827  T
Q  298 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  2828 cgaaacttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 2927  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |    
T  2928 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 3027  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||||||||| ||    
T  3028 tggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatc 3126  T
Q  595 tcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  3127 tccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttct 3182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 183976 - 183626
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  183976 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 183878  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  183877 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattggg 183779  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctctcc 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  183778 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 183679  T
Q  598 c-cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183678 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 300 - 640
Target Start/End: Original strand, 51959 - 52307
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca--tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51959 atacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggttt 52058  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52059 gtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 52158  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctc 594  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  52159 gtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 52258  T
Q  595 t---ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  52259 tctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 52307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 571 - 640
Target Start/End: Original strand, 50236 - 50308
Alignment:
Q  571 atagtgaaacgaagggctgctctctc---cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50236 atagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 301 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 41820 - 41468
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41820 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 41721  T
Q  400 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  41720 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 41621  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |    
T  41620 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 41521  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41520 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Original strand, 79135 - 79491
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaact-ttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  79135 atacctttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 79234  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  79235 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 79334  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct- 595  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||     
T  79335 gaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 79434  T
Q  596 ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  79435 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttctctc 79491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 300 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 11811 - 11455
Alignment:
Q  300 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | || |||||||||||||||||| |  || |||| | ||||||||||| |||||||||     
T  11811 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgt 11712  T
Q  399 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgg 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11711 atagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 11612  T
Q  499 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctc 596  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |  | || |||||||||||    
T  11611 gactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctc 11512  T
Q  597 ccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11511 ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 202 - 649
Target Start/End: Original strand, 29013 - 29473
Alignment:
Q  202 atcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaaatgtatttttggatgcagatttattccaaattttaagcgat 301  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| || |||||||||||| |     
T  29013 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttacaaattttaagcaaa 29112  T
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca----------tagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaatta 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |          ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||    
T  29113 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaacta 29212  T
Q  391 gggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29213 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 29312  T
Q  491 aagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggct 588  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||  |||||| | || ||||||    
T  29313 gaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggct 29411  T
Q  589 gctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29412 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 163
Target Start/End: Original strand, 28940 - 29005
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28940 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 29005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 302 - 649
Target Start/End: Original strand, 6151 - 6502
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||    
T  6151 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtat 6250  T
Q  401 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattggg 499  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6251 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattggg 6350  T
Q  500 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-c 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |    
T  6351 actttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcc 6449  T
Q  597 cccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  6450 cccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttct 6502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 5927 - 5994
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  5927 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgat 5994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80165
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||| |||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  402 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggga 500  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggg 80011  T
Q  501 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  80012 ctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 80110  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  80111 ccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctctc 80165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 345 - 649
Target Start/End: Original strand, 37 - 344
Alignment:
Q  345 atagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgat 136  T
Q  445 ttaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 543  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  137 tcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccatt 236  T
Q  544 gatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||  ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |    
T  237 gatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttct 335  T
Q  641 ttgtgttct 649  Q
    |||||||||    
T  336 ttgtgttct 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 416 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1438
Alignment:
Q  416 ggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaatta 515  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  516 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  613 ttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 284 - 600
Target Start/End: Original strand, 1969 - 2294
Alignment:
Q  284 ttccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgaca------tagagggggctgaaacaagagttcagaaag 375  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||| |      || |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1969 ttccaaatttataagttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaag 2068  T
Q  376 gcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtc 475  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2069 gcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 2167  T
Q  476 tcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--ata 573  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||    
T  2168 tcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatata 2267  T
Q  574 gtgaaacgaagggctgctctctcccca 600  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||    
T  2268 gtgaatcggagggctactctctcccca 2294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 303 - 652
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85537
Alignment:
Q  303 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcata 401  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||| ||||| | ||  ||||||||  || | |||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  402 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggac 501  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgac 85382  T
Q  502 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-cc 597  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||| |||| | | ||||||||| ||    
T  85383 tttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 85482  T
Q  598 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||||||||||||||  || ||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  85483 ccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttctctc 85537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 277 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16180 - 15817
Alignment:
Q  277 agatttattccaaattt-taagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaa 374  Q
    |||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | || | |||||||||| ||||| ||| ||| ||||     
T  16180 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa- 16082  T
Q  375 ggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagt 474  Q
    | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16081 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 15985  T
Q  475 ctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat-- 572  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  15984 ctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 15885  T
Q  573 -agtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
     |||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  15884 gagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 354 - 529
Target Start/End: Original strand, 35644 - 35819
Alignment:
Q  354 gctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgg 453  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  35644 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagg 35743  T
Q  454 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 529  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744 gaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 571 - 652
Target Start/End: Original strand, 35818 - 35900
Alignment:
Q  571 atagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 652  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35818 atagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctc 35900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 312 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1638
Alignment:
Q  312 taaatatagaccttgtatcaaa-gtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgt 409  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | | || ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttc- 1861  T
Q  410 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggta 509  Q
            ||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1860 --------aacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  510 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc---atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagacta 605  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatacta 1671  T
Q  606 ggtca-atttagaccgaactgggtcaacaaatt 637  Q
    |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1670 ggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 16986 - 16716
Alignment:
Q  299 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaa-caagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggttt 396  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||| |||| |||  ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16986 gataattttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggttt 16889  T
Q  397 gcatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt 496  Q
    | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  16888 gtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagatt 16792  T
Q  497 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16791 gagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 6)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22418
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc- 22318  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22319 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 649
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24693
Alignment:
Q  454 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc- 24593  T
Q  553 tttgtaacgttactcatc--atagtgaaacgaagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 649  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24594 tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 24693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 21914 - 22062
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  21914 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 22011  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  22012 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 22062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 24189 - 24337
Alignment:
Q  98 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||  || ||||||| | || |||| || ||||  |||||| || |    
T  24189 ttgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgca-caatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 24286  T
Q  196 ggatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    |||   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  24287 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 24337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 22162 - 22194
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22162 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 22194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 334
Target Start/End: Original strand, 24437 - 24469
Alignment:
Q  302 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24437 acttttactataaatatagaccttgtatcaaag 24469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 301 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1168 - 993
Alignment:
Q  301 tacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaa-ctttgacatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaattagggtttgca 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1168 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 1069  T
Q  400 tagagtttgtctc-----tttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt 470  Q
    |||||||||||||     |||||||||||||||| | || ||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||    
T  1068 tagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 450 - 572
Target Start/End: Original strand, 4911 - 5034
Alignment:
Q  450 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4911 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatc 5010  T
Q  550 tc-ttttgtaacgttactcatcat 572  Q
    || |||||||| | ||||||||||    
T  5011 tctttttgtaaagatactcatcat 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 4731 - 4666
Alignment:
Q  583 agggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 647  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4731 agggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 455 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57497
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 552  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||   | |||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctat 57514  T
Q  553 tttgtaacgttactcat 569  Q
    ||||||| |||||||||    
T  57513 tttgtaaagttactcat 57497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 600 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1439
Alignment:
Q  600 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 646  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12907
Alignment:
Q  99 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttc-gcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag-ttttgaggcaagtcattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | || |||| || ||||  |||||| || ||    
T  13054 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgatgtcaaggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 12957  T
Q  197 gatttatcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggggcgttggc 246  Q
    ||   |||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| ||||    
T  12956 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 12907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 455 - 517
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  455 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 5756 - 5687
Alignment:
Q  566 tcatcatagtgaaacgaagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaa 634  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5756 tcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 458 - 517
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16386
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggactttgggtagaattagg 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11337 - 11288
Alignment:
Q  129 agaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattagatgtttcag 178  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11337 agaaatcgtggcacgtttgcagggcaacgtggcacgattagatggttcag 11288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 17036 - 16980
Alignment:
Q  586 gctgctctctcccc-agactaggtcaat-ttagaccgaactgggtcaacaaattctt 640  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17036 gctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 458 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17133
Alignment:
Q  458 cactattaggattgagtctcttggttacgggaa 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 17133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University