View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4568_low_79 (Length: 219)

Name: NF4568_low_79
Description: NF4568
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4568_low_79
NF4568_low_79
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (1-209)||(53082003-53082212)
chr4 (1-209)||(46640309-46640516)
chr4 (5-209)||(12288066-12288270)
chr4 (1-186)||(13703-13890)
chr4 (1-187)||(39706142-39706328)
chr4 (83-209)||(52243128-52243256)
chr4 (1-156)||(8846485-8846640)
chr4 (1-195)||(43198408-43198601)
chr4 (1-106)||(12774160-12774265)
chr4 (1-162)||(15190423-15190583)
chr4 (83-186)||(15464865-15464970)
chr4 (4-162)||(15099456-15099613)
chr4 (52-183)||(15791858-15791991)
chr4 (83-148)||(16043133-16043198)
chr4 (81-209)||(18212792-18212920)
chr4 (81-208)||(26050408-26050534)
chr4 (83-186)||(44928858-44928963)
chr4 (81-209)||(17333337-17333468)
chr4 (81-183)||(24047232-24047335)
chr4 (82-186)||(12611021-12611126)
chr4 (82-186)||(18215253-18215358)
chr4 (3-132)||(16596782-16596911)
chr4 (64-148)||(32306910-32306995)
chr4 (81-145)||(15041894-15041958)
chr4 (81-145)||(15112466-15112530)
chr4 (84-182)||(13591862-13591961)
chr4 (81-148)||(14852808-14852875)
chr4 (81-183)||(17048067-17048170)
chr4 (86-148)||(26789458-26789521)
chr4 (86-186)||(15118335-15118436)
chr4 (86-186)||(44615366-44615467)
chr4 (81-182)||(51463765-51463867)
chr4 (82-186)||(51463847-51463952)
chr4 (86-186)||(52312588-52312689)
chr4 (86-139)||(1837492-1837544)
chr4 (86-139)||(7641175-7641227)
chr4 (35-87)||(14164731-14164783)
chr4 (83-139)||(44102341-44102396)
chr4 (81-148)||(10056759-10056826)
chr4 (84-139)||(21815566-21815620)
chr4 (81-148)||(23803162-23803229)
chr4 (86-137)||(44773070-44773120)
chr4 (90-186)||(12294-12391)
chr4 (86-186)||(18239402-18239503)
chr4 (82-186)||(23803244-23803349)
chr4 (86-186)||(50222322-50222423)
chr4 (86-139)||(3515134-3515186)
chr4 (86-139)||(15355307-15355359)
chr4 (3-44)||(15552038-15552079)
chr4 (87-148)||(40907192-40907253)
chr4 (81-182)||(12611106-12611205)
chr4 (35-87)||(14158026-14158078)
chr4 (83-139)||(15367821-15367876)
chr4 (83-139)||(15371333-15371388)
chr4 (83-139)||(15373614-15373669)
chr4 (83-139)||(15402834-15402889)
chr4 (86-138)||(19618155-19618206)
chr4 (83-139)||(22353964-22354019)
chr4 (88-148)||(40907034-40907094)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (1-209)||(17266845-17267054)
chr8 (1-203)||(22364728-22364930)
chr8 (2-209)||(37116408-37116616)
chr8 (1-209)||(24353081-24353292)
chr8 (1-186)||(20498644-20498831)
chr8 (81-209)||(17439438-17439567)
chr8 (1-186)||(21285679-21285865)
chr8 (4-187)||(6520449-6520632)
chr8 (1-190)||(983255-983447)
chr8 (1-187)||(38855105-38855291)
chr8 (81-209)||(40492785-40492913)
chr8 (5-187)||(21673785-21673967)
chr8 (1-148)||(2418727-2418873)
chr8 (5-183)||(26355557-26355734)
chr8 (5-187)||(23760698-23760884)
chr8 (74-187)||(13508009-13508125)
chr8 (74-187)||(13597541-13597657)
chr8 (14-148)||(22419282-22419414)
chr8 (84-209)||(37515765-37515890)
chr8 (3-132)||(5866132-5866261)
chr8 (3-132)||(17141050-17141179)
chr8 (83-148)||(35026797-35026862)
chr8 (81-148)||(18833683-18833750)
chr8 (81-148)||(23667930-23667997)
chr8 (91-148)||(14103167-14103224)
chr8 (3-132)||(21491129-21491258)
chr8 (81-140)||(17438149-17438208)
chr8 (81-183)||(25363135-25363238)
chr8 (82-186)||(25484254-25484359)
chr8 (81-209)||(19154818-19154947)
chr8 (83-186)||(41598266-41598370)
chr8 (81-208)||(17086086-17086213)
chr8 (81-140)||(5083086-5083145)
chr8 (81-148)||(20502034-20502101)
chr8 (86-186)||(1484480-1484581)
chr8 (86-186)||(4483358-4483459)
chr8 (86-186)||(5853275-5853376)
chr8 (86-186)||(14409427-14409528)
chr8 (95-156)||(17612056-17612118)
chr8 (86-186)||(20403305-20403406)
chr8 (86-186)||(22001831-22001932)
chr8 (81-163)||(23943926-23944008)
chr8 (86-139)||(15203214-15203266)
chr8 (86-139)||(19896395-19896447)
chr8 (86-139)||(20046178-20046230)
chr8 (86-139)||(24486027-24486079)
chr8 (83-148)||(28397671-28397735)
chr8 (86-139)||(32810058-32810110)
chr8 (81-148)||(14397795-14397862)
chr8 (81-148)||(17460985-17461052)
chr8 (81-148)||(19808295-19808362)
chr8 (81-148)||(23659528-23659595)
chr8 (81-148)||(25484172-25484239)
chr8 (81-148)||(27941587-27941654)
chr8 (86-186)||(4542356-4542457)
chr8 (86-186)||(14823851-14823952)
chr8 (86-186)||(16413299-16413400)
chr8 (86-186)||(26223997-26224098)
chr8 (83-186)||(19801362-19801466)
chr8 (83-183)||(22995928-22996029)
chr8 (167-207)||(22525620-22525660)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (5-209)||(65-270)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (1-209)||(25108948-25109157)
chr2 (1-209)||(23791334-23791543)
chr2 (1-209)||(23207338-23207546)
chr2 (1-186)||(7585-7772)
chr2 (83-209)||(20520127-20520253)
chr2 (81-207)||(24697538-24697665)
chr2 (1-191)||(18786755-18786945)
chr2 (83-209)||(22413070-22413198)
chr2 (1-187)||(25175931-25176118)
chr2 (2-156)||(22459415-22459570)
chr2 (1-187)||(28406058-28406245)
chr2 (82-209)||(23004809-23004937)
chr2 (83-186)||(23708553-23708658)
chr2 (81-209)||(19662353-19662481)
chr2 (81-209)||(9241986-9242114)
chr2 (1-106)||(22134070-22134175)
chr2 (81-145)||(19201907-19201971)
chr2 (88-187)||(19671911-19672010)
chr2 (86-148)||(21237874-21237936)
chr2 (82-186)||(32039477-32039582)
chr2 (82-139)||(22173808-22173864)
chr2 (101-209)||(23287423-23287531)
chr2 (82-139)||(24642835-24642891)
chr2 (83-143)||(24529508-24529567)
chr2 (92-183)||(31345201-31345293)
chr2 (81-180)||(34137028-34137128)
chr2 (86-186)||(18809021-18809122)
chr2 (86-186)||(22105491-22105592)
chr2 (81-182)||(22173726-22173828)
chr2 (86-186)||(23130940-23131041)
chr2 (86-186)||(23133407-23133508)
chr2 (86-186)||(23709515-23709616)
chr2 (86-186)||(23711996-23712097)
chr2 (86-186)||(24367852-24367953)
chr2 (86-186)||(24898178-24898279)
chr2 (86-186)||(24900661-24900762)
chr2 (86-186)||(24903138-24903239)
chr2 (86-186)||(24905615-24905716)
chr2 (86-186)||(24908090-24908191)
chr2 (86-186)||(26505457-26505558)
chr2 (86-186)||(26507935-26508036)
chr2 (86-186)||(28577177-28577278)
chr2 (86-183)||(30643984-30644082)
chr2 (86-186)||(34402505-34402606)
chr2 (86-186)||(39682391-39682492)
chr2 (86-186)||(45029837-45029938)
chr2 (86-139)||(571524-571576)
chr2 (86-139)||(6726122-6726174)
chr2 (86-139)||(21155043-21155095)
chr2 (81-183)||(6261076-6261180)
chr2 (103-187)||(7679666-7679750)
chr2 (81-183)||(21073425-21073528)
chr2 (81-148)||(21081669-21081736)
chr2 (81-183)||(23069216-23069319)
chr2 (86-186)||(23135668-23135769)
chr2 (86-186)||(32214904-32215005)
chr2 (81-139)||(43137426-43137483)
chr2 (86-186)||(38967452-38967553)
chr2 (83-139)||(43947306-43947361)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-209)||(6135-6344)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (1-209)||(22178072-22178281)
chr5 (1-186)||(26011888-26012074)
chr5 (1-209)||(20026793-20027001)
chr5 (1-148)||(21329350-21329497)
chr5 (81-209)||(29448063-29448192)
chr5 (1-186)||(21502007-21502195)
chr5 (1-187)||(21565623-21565810)
chr5 (1-209)||(15796479-15796689)
chr5 (83-186)||(22144131-22144236)
chr5 (5-184)||(19668982-19669161)
chr5 (83-156)||(40725966-40726040)
chr5 (3-132)||(19660693-19660822)
chr5 (81-209)||(37598815-37598943)
chr5 (81-183)||(42960627-42960730)
chr5 (1-148)||(25743841-25743988)
chr5 (5-187)||(22959392-22959572)
chr5 (81-148)||(23469923-23469990)
chr5 (81-148)||(25574402-25574469)
chr5 (81-148)||(25575595-25575662)
chr5 (1-196)||(27988782-27988980)
chr5 (81-209)||(28370954-28371082)
chr5 (1-76)||(21741398-21741473)
chr5 (86-186)||(264751-264852)
chr5 (86-186)||(20909090-20909191)
chr5 (81-183)||(25576788-25576890)
chr5 (86-186)||(29330012-29330113)
chr5 (86-186)||(29346058-29346159)
chr5 (86-186)||(29348531-29348632)
chr5 (86-186)||(29351004-29351105)
chr5 (86-186)||(39363462-39363563)
chr5 (167-209)||(41861473-41861515)
chr5 (86-186)||(42245348-42245449)
chr5 (86-139)||(32027520-32027572)
chr5 (83-186)||(36154763-36154867)
chr5 (83-139)||(2154593-2154648)
chr5 (83-139)||(20901988-20902043)
chr5 (81-183)||(30138861-30138964)
chr5 (81-148)||(33895588-33895655)
chr5 (86-186)||(10732923-10733024)
chr5 (86-186)||(39245214-39245315)
chr5 (83-139)||(10775656-10775710)
chr5 (83-148)||(21328150-21328215)
chr5 (83-127)||(20572028-20572072)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (1-209)||(37251020-37251228)
chr3 (1-209)||(22110204-22110412)
chr3 (1-111)||(43927291-43927401)
chr3 (1-187)||(15471005-15471191)
chr3 (106-209)||(43926019-43926123)
chr3 (1-187)||(16097409-16097596)
chr3 (88-208)||(2051138-2051260)
chr3 (1-187)||(16103861-16104047)
chr3 (88-209)||(52523666-52523789)
chr3 (1-156)||(49389483-49389638)
chr3 (5-187)||(14234568-14234753)
chr3 (123-209)||(606301-606386)
chr3 (83-187)||(24340657-24340763)
chr3 (1-106)||(1644537-1644642)
chr3 (81-183)||(9577707-9577810)
chr3 (1-104)||(12934165-12934268)
chr3 (83-156)||(37642199-37642273)
chr3 (1-162)||(1465264-1465424)
chr3 (81-209)||(12377982-12378110)
chr3 (83-188)||(23318650-23318755)
chr3 (81-209)||(23371405-23371533)
chr3 (81-209)||(51300621-51300749)
chr3 (1-97)||(49667938-49668034)
chr3 (84-180)||(15246106-15246204)
chr3 (84-180)||(15265227-15265325)
chr3 (81-194)||(16796559-16796673)
chr3 (81-209)||(14763659-14763787)
chr3 (38-187)||(12174152-12174299)
chr3 (74-187)||(23274768-23274884)
chr3 (81-183)||(5223388-5223491)
chr3 (81-183)||(12339790-12339893)
chr3 (81-183)||(14179455-14179558)
chr3 (81-183)||(43889559-43889662)
chr3 (86-186)||(7781330-7781431)
chr3 (82-186)||(8899172-8899277)
chr3 (91-156)||(22147467-22147533)
chr3 (82-186)||(50242900-50243005)
chr3 (81-209)||(14670982-14671110)
chr3 (81-209)||(14682481-14682609)
chr3 (84-148)||(15207057-15207122)
chr3 (83-140)||(28194821-28194878)
chr3 (1-106)||(32307830-32307935)
chr3 (88-148)||(37427835-37427895)
chr3 (5-112)||(9521039-9521146)
chr3 (81-148)||(9533416-9533483)
chr3 (81-183)||(10834037-10834139)
chr3 (81-183)||(12469985-12470088)
chr3 (81-186)||(29172560-29172667)
chr3 (86-186)||(10247706-10247807)
chr3 (86-186)||(13151773-13151874)
chr3 (86-186)||(13154238-13154339)
chr3 (1-187)||(13210182-13210367)
chr3 (86-186)||(16454264-16454365)
chr3 (86-186)||(17463256-17463357)
chr3 (86-186)||(27165329-27165431)
chr3 (86-186)||(34159404-34159505)
chr3 (86-186)||(38961874-38961975)
chr3 (86-186)||(41123965-41124066)
chr3 (82-186)||(43550457-43550562)
chr3 (86-186)||(45606890-45606991)
chr3 (81-182)||(50242985-50243087)
chr3 (86-186)||(55476569-55476670)
chr3 (5-106)||(9513070-9513171)
chr3 (86-139)||(9707590-9707642)
chr3 (86-139)||(16282794-16282846)
chr3 (92-183)||(15465159-15465251)
chr3 (83-139)||(17248221-17248276)
chr3 (83-139)||(53070633-53070688)
chr3 (81-148)||(324355-324422)
chr3 (81-183)||(10542365-10542468)
chr3 (86-187)||(12567637-12567739)
chr3 (86-187)||(13544102-13544204)
chr3 (81-148)||(14966289-14966356)
chr3 (81-148)||(16643292-16643359)
chr3 (81-148)||(52989655-52989722)
chr3 (86-186)||(53301487-53301590)
chr3 (86-186)||(6469117-6469218)
chr3 (86-186)||(17446638-17446739)
chr3 (86-186)||(28848594-28848695)
chr3 (81-147)||(43550375-43550441)
chr3 (86-127)||(8499658-8499699)
chr3 (83-186)||(17672704-17672808)
chr3 (87-186)||(42386492-42386593)
chr3 (83-127)||(12119704-12119747)
chr3 (88-186)||(14972936-14973036)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (1-209)||(50686672-50686881)
chr1 (1-209)||(16368139-16368346)
chr1 (1-209)||(50613969-50614177)
chr1 (1-209)||(50621797-50622005)
chr1 (4-209)||(41049891-41050096)
chr1 (1-209)||(21896111-21896316)
chr1 (1-186)||(21861422-21861609)
chr1 (1-187)||(22921722-22921909)
chr1 (1-187)||(33681088-33681275)
chr1 (1-154)||(52927835-52927988)
chr1 (85-209)||(26064999-26065123)
chr1 (1-187)||(22237708-22237896)
chr1 (101-209)||(16093836-16093945)
chr1 (83-186)||(35261015-35261117)
chr1 (81-209)||(16758710-16758839)
chr1 (4-137)||(20636980-20637113)
chr1 (81-209)||(22124345-22124473)
chr1 (1-121)||(12271702-12271815)
chr1 (1-187)||(21754126-21754303)
chr1 (1-162)||(35981541-35981701)
chr1 (1-162)||(49261447-49261607)
chr1 (52-183)||(47190685-47190818)
chr1 (83-180)||(433094-433193)
chr1 (2-65)||(16381388-16381451)
chr1 (81-148)||(52940810-52940877)
chr1 (5-187)||(20248360-20248539)
chr1 (81-209)||(20958168-20958296)
chr1 (81-209)||(21043214-21043342)
chr1 (80-148)||(48520632-48520700)
chr1 (86-186)||(13988944-13989045)
chr1 (86-186)||(21475070-21475171)
chr1 (83-133)||(21477653-21477703)
chr1 (86-186)||(21923274-21923375)
chr1 (82-132)||(22130844-22130894)
chr1 (86-186)||(23593717-23593819)
chr1 (86-186)||(29776766-29776867)
chr1 (86-186)||(31612391-31612492)
chr1 (82-139)||(45574821-45574877)
chr1 (81-148)||(13881314-13881381)
chr1 (86-137)||(16362046-16362097)
chr1 (81-148)||(20437925-20437992)
chr1 (81-179)||(48603541-48603640)
chr1 (83-137)||(13212841-13212894)
chr1 (167-209)||(20454572-20454614)
chr1 (83-137)||(21347091-21347144)
chr1 (78-183)||(21533803-21533908)
chr1 (86-136)||(22123050-22123099)
chr1 (81-147)||(22130763-22130829)
chr1 (81-147)||(45574739-45574805)
chr1 (86-139)||(29298263-29298315)
chr1 (83-139)||(21707294-21707349)
chr1 (83-139)||(21711836-21711891)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (4-209)||(78383-78587)
scaffold0022 (13-209)||(128835-129031)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-208)||(18090-18298)
scaffold0138 (1-186)||(13021-13207)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-209)||(97066-97274)
scaffold0006 (1-209)||(106344-106552)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-209)||(38377-38586)
[»] chr7 (80 HSPs)
chr7 (1-209)||(20220042-20220248)
chr7 (1-186)||(16056409-16056595)
chr7 (83-209)||(1867929-1868055)
chr7 (5-187)||(16219574-16219757)
chr7 (83-209)||(15008433-15008559)
chr7 (2-209)||(12901384-12901595)
chr7 (5-187)||(67826-68008)
chr7 (5-187)||(18005727-18005910)
chr7 (5-187)||(810988-811171)
chr7 (1-183)||(15113028-15113211)
chr7 (1-183)||(15116565-15116748)
chr7 (1-186)||(22072996-22073183)
chr7 (2-187)||(47831888-47832074)
chr7 (82-209)||(14044807-14044935)
chr7 (82-209)||(14354837-14354965)
chr7 (1-187)||(44014259-44014440)
chr7 (134-209)||(14036315-14036391)
chr7 (134-209)||(14346345-14346421)
chr7 (88-188)||(12255730-12255832)
chr7 (4-98)||(16324176-16324270)
chr7 (83-186)||(2280053-2280158)
chr7 (1-187)||(15754742-15754927)
chr7 (81-183)||(16996307-16996409)
chr7 (81-209)||(14566228-14566356)
chr7 (81-209)||(18872386-18872514)
chr7 (84-148)||(9033281-9033345)
chr7 (83-156)||(19486678-19486752)
chr7 (81-209)||(11661332-11661460)
chr7 (3-132)||(34200920-34201049)
chr7 (81-183)||(1858764-1858867)
chr7 (81-148)||(10501356-10501423)
chr7 (81-148)||(11768851-11768918)
chr7 (81-183)||(16008629-16008732)
chr7 (86-187)||(18430789-18430891)
chr7 (81-140)||(20619510-20619569)
chr7 (82-186)||(13647407-13647512)
chr7 (3-132)||(28505156-28505285)
chr7 (81-209)||(38519432-38519560)
chr7 (83-139)||(17061895-17061950)
chr7 (88-186)||(20110624-20110723)
chr7 (81-148)||(14157037-14157104)
chr7 (81-183)||(14258535-14258638)
chr7 (81-183)||(16460698-16460801)
chr7 (81-183)||(16579843-16579946)
chr7 (81-183)||(16585717-16585820)
chr7 (81-148)||(16998713-16998780)
chr7 (81-148)||(18607574-18607641)
chr7 (81-183)||(42462034-42462137)
chr7 (86-186)||(456399-456500)
chr7 (1-43)||(9389550-9389592)
chr7 (86-186)||(11393270-11393371)
chr7 (86-186)||(11972574-11972675)
chr7 (86-186)||(14949105-14949206)
chr7 (86-186)||(15376696-15376797)
chr7 (86-186)||(16232598-16232699)
chr7 (81-163)||(17017400-17017482)
chr7 (86-186)||(20385106-20385207)
chr7 (81-163)||(20487647-20487729)
chr7 (86-186)||(21189578-21189679)
chr7 (86-186)||(24702316-24702417)
chr7 (86-186)||(27216938-27217039)
chr7 (86-186)||(32125569-32125670)
chr7 (86-186)||(41522995-41523096)
chr7 (86-186)||(41525457-41525558)
chr7 (3-132)||(11995885-11996014)
chr7 (82-139)||(15081928-15081984)
chr7 (86-139)||(24704812-24704864)
chr7 (83-186)||(44116587-44116691)
chr7 (81-183)||(130749-130853)
chr7 (84-148)||(9725595-9725659)
chr7 (83-135)||(12756651-12756702)
chr7 (83-122)||(10063757-10063796)
chr7 (80-147)||(13647528-13647595)
chr7 (81-148)||(14422072-14422139)
chr7 (81-148)||(25927184-25927251)
chr7 (81-148)||(46580608-46580675)
chr7 (86-186)||(18640350-18640451)
chr7 (86-139)||(26355966-26356018)
chr7 (86-139)||(26358418-26358470)
chr7 (83-163)||(9177600-9177680)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (1-209)||(1650-1858)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-209)||(19737-19945)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-209)||(611-817)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-209)||(267721-267916)
[»] chr6 (61 HSPs)
chr6 (4-209)||(23076791-23076997)
chr6 (1-209)||(35008209-35008418)
chr6 (81-209)||(18696547-18696675)
chr6 (81-209)||(18706365-18706493)
chr6 (1-195)||(19668446-19668640)
chr6 (2-186)||(23019488-23019673)
chr6 (1-209)||(18177524-18177734)
chr6 (1-209)||(18199268-18199478)
chr6 (1-209)||(18204137-18204347)
chr6 (45-140)||(28103795-28103890)
chr6 (1-187)||(19652276-19652461)
chr6 (1-182)||(20109224-20109409)
chr6 (1-156)||(22080592-22080747)
chr6 (1-195)||(9098378-9098560)
chr6 (1-147)||(17105854-17106000)
chr6 (1-156)||(28496327-28496482)
chr6 (1-156)||(29808738-29808893)
chr6 (1-187)||(1561384-1561569)
chr6 (1-148)||(23527959-23528106)
chr6 (85-188)||(18896252-18896355)
chr6 (1-148)||(23539090-23539236)
chr6 (83-184)||(25644405-25644508)
chr6 (1-80)||(27333138-27333217)
chr6 (1-80)||(27393878-27393957)
chr6 (83-156)||(8227445-8227519)
chr6 (78-209)||(18453242-18453373)
chr6 (81-209)||(4476884-4477012)
chr6 (83-188)||(19362506-19362611)
chr6 (83-183)||(20136755-20136855)
chr6 (83-183)||(22196014-22196114)
chr6 (81-209)||(23838234-23838362)
chr6 (81-148)||(15817454-15817521)
chr6 (81-183)||(19773475-19773578)
chr6 (81-183)||(23414969-23415072)
chr6 (83-197)||(23538881-23538996)
chr6 (82-186)||(25754887-25754992)
chr6 (83-186)||(18456797-18456901)
chr6 (82-139)||(20556873-20556929)
chr6 (82-137)||(22782356-22782410)
chr6 (86-186)||(2291163-2291264)
chr6 (86-186)||(8055107-8055208)
chr6 (86-186)||(12742395-12742496)
chr6 (86-186)||(18334575-18334676)
chr6 (86-186)||(19005124-19005225)
chr6 (86-186)||(19858902-19859003)
chr6 (81-182)||(20556791-20556893)
chr6 (86-186)||(24422625-24422726)
chr6 (86-186)||(26924623-26924724)
chr6 (86-186)||(30676693-30676794)
chr6 (86-186)||(33861872-33861973)
chr6 (86-186)||(33864356-33864457)
chr6 (81-162)||(27556749-27556830)
chr6 (83-139)||(19847929-19847984)
chr6 (81-148)||(14979320-14979387)
chr6 (81-183)||(15705376-15705479)
chr6 (81-183)||(22806017-22806119)
chr6 (81-147)||(25752838-25752904)
chr6 (81-182)||(25754972-25755074)
chr6 (86-186)||(34963451-34963552)
chr6 (86-139)||(1540894-1540946)
chr6 (87-139)||(3852001-3852052)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (81-209)||(597-725)
scaffold0123 (85-209)||(25167-25290)
scaffold0123 (80-127)||(6335-6381)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (2-209)||(136221-136429)
scaffold0021 (2-209)||(144929-145137)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-209)||(7929-8134)
scaffold0218 (3-77)||(29135-29209)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-186)||(8097-8283)
scaffold0556 (5-187)||(6893-7073)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-187)||(10608-10795)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-186)||(32618-32803)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-187)||(12847-13034)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-186)||(53401-53588)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (2-147)||(103492-103637)
scaffold0040 (91-148)||(22366-22423)
scaffold0040 (91-148)||(11266-11323)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-187)||(10394-10581)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-187)||(129986-130173)
scaffold0010 (83-209)||(60649-60776)
scaffold0010 (81-148)||(768-835)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-186)||(8548-8737)
scaffold0621 (5-187)||(6616-6798)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (7-211)||(7917-8123)
scaffold0507 (81-145)||(2603-2667)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (1-187)||(40027-40214)
scaffold0023 (1-187)||(100455-100642)
scaffold0023 (81-148)||(105201-105268)
scaffold0023 (86-186)||(94489-94590)
scaffold0023 (1-44)||(101618-101661)
scaffold0023 (86-186)||(17423-17524)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-186)||(12650-12836)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-187)||(160765-160951)
scaffold0001 (83-137)||(85559-85612)
scaffold0001 (86-186)||(501162-501263)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (1-187)||(2071-2258)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (5-187)||(5980-6163)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (2-187)||(210-395)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (5-187)||(19345-19528)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-156)||(1195-1350)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-148)||(6732-6879)
scaffold0333 (1-148)||(14112-14259)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (5-187)||(5724-5906)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (5-187)||(2502-2685)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (1-148)||(144-290)
scaffold1419 (55-123)||(1-68)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-187)||(45645-45832)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-187)||(22527-22710)
scaffold0037 (82-186)||(82150-82255)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (5-187)||(14554-14737)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-187)||(2657-2846)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (5-187)||(892-1074)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (83-184)||(225491-225593)
scaffold0012 (84-140)||(221143-221199)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (83-186)||(16034-16139)
scaffold0357 (83-186)||(13210-13316)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-106)||(132814-132919)
scaffold0028 (9-156)||(62308-62455)
scaffold0028 (86-186)||(134289-134390)
scaffold0028 (86-186)||(136758-136859)
scaffold0028 (86-186)||(139227-139328)
scaffold0028 (86-186)||(141696-141797)
scaffold0028 (86-186)||(144165-144266)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-82)||(15685-15766)
scaffold0020 (81-145)||(142706-142770)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (83-186)||(27683-27788)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (1-112)||(28664-28775)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (83-187)||(17961-18067)
scaffold0247 (83-137)||(2108-2161)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (15-106)||(32254-32345)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (83-156)||(11577-11651)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (83-156)||(38190-38264)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (86-188)||(26016-26118)
scaffold0046 (91-188)||(16861-16958)
scaffold0046 (3-132)||(11426-11555)
scaffold0046 (32-132)||(2131-2231)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (64-183)||(675-796)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (81-209)||(1954-2082)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (81-209)||(36240-36368)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (83-183)||(75763-75864)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (81-209)||(110713-110841)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (91-148)||(10594-10651)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (91-148)||(604-661)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (3-132)||(15795-15924)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (81-145)||(1063-1127)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (81-145)||(3081-3145)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (81-145)||(7554-7618)
scaffold0111 (81-145)||(14673-14737)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (81-148)||(538-605)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (81-148)||(8152-8219)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (81-207)||(17564-17690)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (81-183)||(39337-39440)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (81-183)||(126040-126143)
[»] scaffold1439 (2 HSPs)
scaffold1439 (82-186)||(184-289)
scaffold1439 (81-182)||(269-371)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (94-148)||(6156-6210)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (82-186)||(12136-12241)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (86-186)||(38639-38741)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (86-188)||(57897-57999)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (81-194)||(132990-133104)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (1-106)||(2156-2261)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (81-209)||(6092-6220)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (78-139)||(19576-19637)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (81-209)||(21226-21354)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (83-140)||(30461-30518)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (81-148)||(2425-2492)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (81-148)||(9654-9721)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (81-148)||(3989-4056)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (81-148)||(18100-18167)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (81-183)||(17658-17761)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (81-148)||(55617-55684)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (81-183)||(31208-31311)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (81-183)||(20835-20938)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (83-209)||(206459-206585)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (86-186)||(20825-20926)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (86-186)||(14025-14126)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (86-186)||(37899-38000)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (167-209)||(2736-2778)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (81-194)||(24530-24644)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (86-186)||(158433-158534)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (82-139)||(1259-1315)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (5-121)||(34268-34384)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (83-139)||(16911-16966)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (83-139)||(79264-79319)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (101-145)||(85669-85713)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (81-183)||(937-1040)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (81-148)||(280-347)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (81-148)||(29356-29423)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (87-137)||(1834-1884)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (86-186)||(4772-4873)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (86-186)||(13470-13571)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (81-147)||(149-215)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (85-139)||(9877-9930)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (83-186)||(20360-20463)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (83-137)||(164570-164623)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (83-139)||(4342-4396)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (83-144)||(4419-4479)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (3-132)||(2300-2429)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (86-135)||(40531-40579)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (88-186)||(3090-3190)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (88-148)||(10284-10344)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (83-139)||(30059-30114)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (88-209)||(39537-39658)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (88-186)||(27912-28012)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (88-209)||(75154-75275)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 53082003 - 53082212
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggg-gtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082003 cacgagttgatgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgtta 53082102  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082103 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 53082202  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||| ||||    
T  53082203 actgcttatg 53082212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 46640309 - 46640516
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640309 cacgagttgatgtgagttgatcatgggg-taagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaa 46640407  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46640408 tgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg-ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatat 46640506  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    |||| |||||    
T  46640507 actgtctatg 46640516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 12288066 - 12288270
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  12288066 agttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaat 12288165  T
Q  105 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactg 203  Q
    || |||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||    
T  12288166 gttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactg 12288264  T
Q  204 cctatg 209  Q
    ||||||    
T  12288265 cctatg 12288270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 13703 - 13890
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||| |    
T  13703 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgttta 13802  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13803 taatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 39706142 - 39706328
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||      
T  39706142 cacgagttgatgtgagttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgc 39706241  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  39706242 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgt-tgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatga 39706328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 52243128 - 52243256
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattg-atttgctttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  52243128 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttat 52243227  T
Q  181 atcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||||    
T  52243228 atcatgaactgatttgcatactgcctatg 52243256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8846640 - 8846485
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | | ||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  8846640 cacgagttgatgtgagttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 8846541  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgtt 156  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  8846540 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgtt 8846485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 43198408 - 43198601
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |    | ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||| || |   |||||| ||||||||||| |    
T  43198408 cacgagttgatgtgagttgcta---gaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagactaatgcatatgaattgatgttgttta 43198504  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgtttt 195  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43198505 taatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgtttt 43198601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12774265 - 12774160
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  12774265 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 12774166  T
Q  101 taatgt 106  Q
    ||||||    
T  12774165 taatgt 12774160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15190583 - 15190423
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||  ||||||  || ||||||||||| ||| |||  | | |||||| | |    
T  15190583 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatga 15190484  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgat 162  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  15190483 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgat 15190423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 15464865 - 15464970
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||| ||| | ||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15464865 atgatttgatgtcgtttaaaatttgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 15464964  T
Q  181 atcatg 186  Q
    ||||||    
T  15464965 atcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15099613 - 15099456
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||  ||||||  || ||||||||||| ||| |||  | | |||||| | ||||    
T  15099613 gagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataa 15099514  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgat 162  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  15099513 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgat 15099456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15791991 - 15791858
Alignment:
Q  52 tactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgag 151  Q
    |||||||| ||||||||  || ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||    
T  15791991 tactgttgatgtttcagagagtctgatataaatgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaag 15791892  T
Q  152 atgttattga--tttgctttgatattgttatatc 183  Q
     || | ||||  | | ||||||||||||||||||    
T  15791891 ttgatgttgaattatcctttgatattgttatatc 15791858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16043198 - 16043133
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16043198 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 16043133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18212920 - 18212792
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  18212920 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 18212821  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  18212820 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 18212792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Original strand, 26050408 - 26050534
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  26050408 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattttcatttgatattgtta 26050506  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctat 208  Q
    |||| |||  |||||| ||| ||||||||    
T  26050507 tatcttgagatgtttt-tgtgctgcctat 26050534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 44928858 - 44928963
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  44928858 atgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattat 44928957  T
Q  181 atcatg 186  Q
     |||||    
T  44928958 gtcatg 44928963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17333468 - 17333337
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt----tgctttgatattg 176  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||  || ||||||||||||| || || |||| ||||||    |  ||||||||||    
T  17333468 atatgatttaatgttgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattattattatttgatattg 17333370  T
Q  177 ttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  17333369 ttatatcttgagatgttttatgtactgtctatg 17333337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 24047232 - 24047335
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  24047232 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 24047331  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  24047332 tatc 24047335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12611126 - 12611021
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  12611126 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 12611028  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  12611027 tgtcatg 12611021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Original strand, 18215253 - 18215358
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||    
T  18215253 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 18215351  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  18215352 tgtcatg 18215358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16596911 - 16596782
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||  |||||| ||||    ||| | || |||||| | |||    
T  16596911 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgcttata 16596812  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  16596811 atgttatataattgtatatacattacatga 16596782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 148
Target Start/End: Original strand, 32306910 - 32306995
Alignment:
Q  64 ttcagtaagcctga-attatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  32306910 ttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 32306995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Original strand, 15041894 - 15041958
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 145  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  15041894 atatgatttgatgttcttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 15041958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15112530 - 15112466
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 145  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  15112530 atatgatttgatgtttttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 15112466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 182
Target Start/End: Original strand, 13591862 - 13591961
Alignment:
Q  84 tgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttatat 182  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| || || | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  13591862 tgatttaatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 13591961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 14852808 - 14852875
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  14852808 atatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgttt 14852875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 17048067 - 17048170
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  17048067 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 17048166  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  17048167 tatc 17048170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26789521 - 26789458
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  26789521 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgttt 26789458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 15118335 - 15118436
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  15118335 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 15118433  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  15118434 atg 15118436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44615467 - 44615366
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  44615467 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 44615369  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  44615368 atg 44615366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 182
Target Start/End: Original strand, 51463765 - 51463867
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||||| || |||||| ||||||    
T  51463765 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgtta 51463864  T
Q  180 tat 182  Q
    |||    
T  51463865 tat 51463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Original strand, 51463847 - 51463952
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||  |||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  51463847 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 51463945  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  51463946 tgtcatg 51463952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 52312689 - 52312588
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  52312689 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 52312591  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  52312590 atg 52312588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 1837492 - 1837544
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  1837492 atttgatgttgtta-taatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatat 1837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 7641175 - 7641227
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7641175 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 7641227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14164783 - 14164731
Alignment:
Q  35 aactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgat 87  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  14164783 aactaagttgtttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaatcatatgat 14164731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 44102396 - 44102341
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44102396 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44102341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10056826 - 10056759
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  10056826 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 10056759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 139
Target Start/End: Original strand, 21815566 - 21815620
Alignment:
Q  84 tgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21815566 tgatttgatgttgtta-tattatgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21815620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 23803162 - 23803229
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  23803162 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 23803229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Original strand, 44773070 - 44773120
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44773070 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 44773120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 186
Target Start/End: Original strand, 12294 - 12391
Alignment:
Q  90 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  12294 gatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 12391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 18239402 - 18239503
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  18239402 atttgatgttgtta-tactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 18239500  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  18239501 atg 18239503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Original strand, 23803244 - 23803349
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  || ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  23803244 tatgattttatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattatta 23803342  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  23803343 tgtcatg 23803349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 50222322 - 50222423
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  50222322 atttgatattgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 50222420  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  50222421 atg 50222423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3515186 - 3515134
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  3515186 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatat 3515134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 15355307 - 15355359
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  15355307 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 15355359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15552079 - 15552038
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttg 44  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  15552079 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttg 15552038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40907253 - 40907192
Alignment:
Q  87 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  40907253 tttgatgttgttaatgatgtgaaatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgttt 40907192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12611205 - 12611106
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  ||||||||||||   ||||||||||| ||||||| || || | |||||| || |||||| ||||||    
T  12611205 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgtta 12611109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14158078 - 14158026
Alignment:
Q  35 aactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgat 87  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  14158078 aactaagttttttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaatcatatgat 14158026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15367876 - 15367821
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  15367876 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15367821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15371388 - 15371333
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  15371388 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15371333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15373669 - 15373614
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  15373669 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15373614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15402889 - 15402834
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  15402889 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatat 15402834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 138
Target Start/End: Original strand, 19618155 - 19618206
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  19618155 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattata 19618206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22354019 - 22353964
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22354019 atgatttattgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22353964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40907094 - 40907034
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  40907094 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgttt 40907034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 17266845 - 17267054
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266845 cacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 17266944  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17266945 taatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgt 17267044  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  17267045 actgcctatg 17267054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22364930 - 22364728
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22364930 cacgagttgatgtgagttgatcagggggataataaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 22364831  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgta 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22364830 taaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttctttgatattgttatatcatgaactgttttatgta 22364731  T
Q  201 ctg 203  Q
    |||    
T  22364730 ctg 22364728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37116616 - 37116408
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaat 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37116616 acgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaat 37116517  T
Q  102 aatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgta 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116516 aatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgta 37116417  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  37116416 ctgcctatg 37116408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24353292 - 24353081
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtt---tcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353292 cacgagttgatgtgagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgt 24353193  T
Q  98 taataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttat 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353192 taataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgcattgatattgttatatcatgaactgttttat 24353093  T
Q  198 gtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||    
T  24353092 gtactgcctatg 24353081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20498831 - 20498644
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |    
T  20498831 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgttta 20498732  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20498731 taatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 20498644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 17439438 - 17439567
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17439438 atatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 17439537  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17439538 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 17439567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21285865 - 21285679
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||      
T  21285865 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgt 21285766  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    |||||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21285765 taatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 21285679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6520632 - 6520449
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||    
T  6520632 gagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaa 6520533  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  6520532 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgt-tgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 6520449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 983255 - 983447
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatc---ttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgt 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||   ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  983255 cacgagttgatatgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaatgttgt 983354  T
Q  98 taataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaact 190  Q
    | ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  983355 tgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaact 983447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 38855105 - 38855291
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||      
T  38855105 cacgagttgatgtgaattgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgc 38855204  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  38855205 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 38855291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 40492785 - 40492913
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || | |||| |||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40492785 atatgatttaatgttgatagtgatgtaatatatttgtatatgcaat-catgaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 40492883  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40492884 tatcatgaactgttttatgtactgcatatg 40492913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21673967 - 21673785
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||  |||    
T  21673967 agttaatgtgagttgatattagaggttaaaaactaagttg-ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 21673869  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||  |||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21673868 tggtatataattgtatatacattaaataaattatat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 21673785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 2418727 - 2418873
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||| | |||||||||||| | ||| || ||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||    
T  2418727 cacgagtcgctgtgagttgatccttgggttaggaaatgaagttgtttatattactgttgttgtt-cagtatgcctgactaagatgatttgatgttgttaa 2418825  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
     |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2418826 caatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 2418873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Original strand, 26355557 - 26355734
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||  |||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||    
T  26355557 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 26355656  T
Q  105 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatc 183  Q
    || |||||| ||||||| ||||| ||| | ||| | |||||  ||||||||| ||||||   || ||||||||||||||    
T  26355657 gttatataattgtatatacattaaatggaatatgt-tgatggctgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatc 26355734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 23760698 - 23760884
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgctta---tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaat-tatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||   | ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||      
T  23760698 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgt 23760797  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttg-ctttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  23760798 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatga 23760884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 187
Target Start/End: Original strand, 13508009 - 13508125
Alignment:
Q  74 ctgaattat-atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttg 170  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| || | |||| || |    
T  13508009 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcg 13508108  T
Q  171 atattgttatatcatga 187  Q
    ||||| |||||||||||    
T  13508109 atattattatatcatga 13508125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 187
Target Start/End: Original strand, 13597541 - 13597657
Alignment:
Q  74 ctgaattat-atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttg 170  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || || |||| |||||| || | |||| || |    
T  13597541 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcg 13597640  T
Q  171 atattgttatatcatga 187  Q
    ||||| |||||||||||    
T  13597641 atattattatatcatga 13597657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 22419282 - 22419414
Alignment:
Q  14 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataa 113  Q
    ||||||||| | |||||| ||||  |||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  22419282 gagttgatccttggggtaggaaataaagttg-ttatattactgctgttgtt-cagtatgcctgactaagatgatttaatgttgtcaataatgtgatatga 22419379  T
Q  114 atgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
     |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  22419380 ttgtatatgcattatgtgaattatttatgatgttt 22419414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37515890 - 37515765
Alignment:
Q  84 tgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttatat 182  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  37515890 tgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 37515791  T
Q  183 catgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    | |||  || ||||||| |||||||||    
T  37515790 cttgatatg-tttatgtgctgcctatg 37515765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 5866132 - 5866261
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  5866132 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 5866231  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  5866232 atgttatataattgtatatacattacatga 5866261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17141179 - 17141050
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  17141179 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 17141080  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  17141079 atgttatataattgtatatacattacatga 17141050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Original strand, 35026797 - 35026862
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35026797 atgatttgatgttgttaataatgtgatatgattttatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 35026862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18833750 - 18833683
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18833750 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 18833683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23667997 - 23667930
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23667997 atatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgttt 23667930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Original strand, 14103167 - 14103224
Alignment:
Q  91 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14103167 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgttt 14103224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21491258 - 21491129
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  21491258 cgagttaatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttgcttata 21491159  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  21491158 atgttatataattgtatatacattacatga 21491129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 17438149 - 17438208
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  17438149 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 17438208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 25363135 - 25363238
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  25363135 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 25363234  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  25363235 tatc 25363238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Original strand, 25484254 - 25484359
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  25484254 tatgatttgatgttatta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 25484352  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  25484353 tgtcatg 25484359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 19154818 - 19154947
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||| || |||| |||||| ||  |||||||| |||    
T  19154818 atatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatattatta 19154917  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||  ||  |||||||| |||||||||||    
T  19154918 tatctggatatgttttatatactgcctatg 19154947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598266
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  41598370 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 41598272  T
Q  181 atcatg 186  Q
     |||||    
T  41598271 gtcatg 41598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Original strand, 17086086 - 17086213
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| || || | |||||| |  |||| ||||||||    
T  17086086 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatgttgattattatttggtattgtta 17086185  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctat 208  Q
    |||| |||  || ||||||| ||||||||    
T  17086186 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctat 17086213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Original strand, 5083086 - 5083145
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||    
T  5083086 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatata 5083145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 20502034 - 20502101
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  20502034 atatgatttgatgttgttagtaatatgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 20502101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1484581 - 1484480
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  1484581 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 1484483  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  1484482 atg 1484480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4483459 - 4483358
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  4483459 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 4483361  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  4483360 atg 4483358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 5853275 - 5853376
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  5853275 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 5853373  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  5853374 atg 5853376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 14409427 - 14409528
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  14409427 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 14409525  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  14409526 atg 14409528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 156
Target Start/End: Original strand, 17612056 - 17612118
Alignment:
Q  95 tgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgtt 156  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  17612056 tgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgtt 17612118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20403406 - 20403305
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  20403406 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 20403308  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  20403307 atg 20403305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22001932 - 22001831
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  22001932 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 22001834  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  22001833 atg 22001831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Original strand, 23943926 - 23944008
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt 163  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||| || |||| ||||||    
T  23943926 atatgatttgatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatt 23944008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 15203214 - 15203266
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15203214 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 15203266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 19896447 - 19896395
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19896447 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 19896395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 20046178 - 20046230
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20046178 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20046230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 24486027 - 24486079
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24486027 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24486079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 28397735 - 28397671
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||  |||||||    
T  28397735 atgatttaatgttgttaataatgtgatat-attgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttt 28397671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32810110 - 32810058
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32810110 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32810058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 14397795 - 14397862
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||  ||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14397795 atatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 14397862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 17460985 - 17461052
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  17460985 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 17461052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 19808295 - 19808362
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  19808295 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 19808362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23659595 - 23659528
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  23659595 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 23659528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 25484172 - 25484239
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  25484172 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 25484239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 27941587 - 27941654
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||  |||||||    
T  27941587 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatgttt 27941654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 4542356 - 4542457
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  4542356 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 4542454  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  4542455 atg 4542457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14823952 - 14823851
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  14823952 atttaatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 14823854  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  14823853 atg 14823851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 16413299 - 16413400
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  16413299 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 16413397  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  16413398 atg 16413400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223997
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  | |||||||| || ||  |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  26224098 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 26224000  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  26223999 atg 26223997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 19801362 - 19801466
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  19801362 atgacttgatgttgtta-tattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattat 19801460  T
Q  181 atcatg 186  Q
     |||||    
T  19801461 gtcatg 19801466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22996029 - 22995928
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttata 181  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||| || ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||||    
T  22996029 atgatttgatgttaaaaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttata 22995930  T
Q  182 tc 183  Q
    ||    
T  22995929 tc 22995928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22525660 - 22525620
Alignment:
Q  167 tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgccta 207  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22525660 tttgatattgttatatcttgagatgttttatgtactgccta 22525620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 65
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  270 agttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataat 171  T
Q  105 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactg 203  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  170 gttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatgaactgttttatgtactg 71  T
Q  204 cctatg 209  Q
    ||||||    
T  70 cctatg 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25109157 - 25108948
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25109157 cacgagttgatgtaagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 25109058  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattga-tttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25109057 taatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgt 25108958  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  25108957 actgcctatg 25108948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23791543 - 23791334
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23791543 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 23791444  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23791443 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgt 23791344  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  23791343 actgcctatg 23791334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23207546 - 23207338
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207546 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 23207447  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23207446 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttataatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatat 23207348  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  23207347 actgcctatg 23207338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 7585 - 7772
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  7585 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgt 7684  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7685 taatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 7772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 20520127 - 20520253
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatat 182  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20520127 atgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcattgatattgttatat 20520226  T
Q  183 catgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20520227 catgaactgttttatgtactgcatatg 20520253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Original strand, 24697538 - 24697665
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  24697538 atatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtta 24697637  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgccta 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24697638 tatcatgaactgtttgatgtactgccta 24697665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 18786755 - 18786945
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || |    
T  18786755 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattga 18786854  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactg 191  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| || ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18786855 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatg-ttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactg 18786945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 22413070 - 22413198
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttg--atattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  22413070 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgtta 22413168  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22413169 tatcatgagctgttttatatactgcctatg 22413198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25176118 - 25175931
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 99  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  25176118 cacgaattgatgtaagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 25176019  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
     |||||| |||||| | ||||| | ||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25176018 ttaatgttatataattatatatacgttatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 25175931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 22459415 - 22459570
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaat 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||| || |||||||| || ||    
T  22459415 acgagttgatgtgagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttat 22459514  T
Q  102 aatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgtt 156  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| || || |||||||||||    
T  22459515 aatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgtt 22459570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28406245 - 28406058
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |  |||||||     
T  28406245 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 28406146  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28406145 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-agttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 28406058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23004937 - 23004809
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| | |||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  23004937 tatgatttaacgttgttaatgatgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 23004838  T
Q  181 atcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  23004837 atcctgaactattttatgtactacctatg 23004809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 23708553 - 23708658
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||    
T  23708553 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttat 23708652  T
Q  181 atcatg 186  Q
    ||||||    
T  23708653 atcatg 23708658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 19662353 - 19662481
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  19662353 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 19662452  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  19662453 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 19662481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9242114 - 9241986
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  9242114 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 9242015  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  9242014 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 9241986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 22134070 - 22134175
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || || ||||||| ||||   |||||| ||| ||||||| |    
T  22134070 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactgatgcatatgaattggtgttgttta 22134169  T
Q  101 taatgt 106  Q
    ||||||    
T  22134170 taatgt 22134175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Original strand, 19201907 - 19201971
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 145  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19201907 atatgatttgaagttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatg 19201971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671911
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||| || | |||| || |||||| ||||||||||    
T  19672010 ttgatgttgtta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21237936 - 21237874
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  21237936 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 21237874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Original strand, 32039477 - 32039582
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||    
T  32039477 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 32039575  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  32039576 tgtcatg 32039582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 22173808 - 22173864
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22173808 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 22173864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23287531 - 23287423
Alignment:
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||  || ||||||||||||| || || |||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  23287531 taatgtgatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttttatgt 23287433  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  23287432 actgcctatg 23287423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 24642835 - 24642891
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24642835 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24642891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 143
Target Start/End: Original strand, 24529508 - 24529567
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga 143  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24529508 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatga 24529567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31345293 - 31345201
Alignment:
Q  92 tgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatc 183  Q
    ||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  31345293 tgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatc 31345201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34137128 - 34137028
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  34137128 atatgatgtgatgttactagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 34137029  T
Q  180 t 180  Q
    |    
T  34137028 t 34137028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18809122 - 18809021
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  18809122 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 18809024  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  18809023 atg 18809021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22105592 - 22105491
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  22105592 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtc 22105494  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  22105493 atg 22105491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 182
Target Start/End: Original strand, 22173726 - 22173828
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||||| || |||||| ||||||    
T  22173726 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgtta 22173825  T
Q  180 tat 182  Q
    |||    
T  22173826 tat 22173828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23131041 - 23130940
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  23131041 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 23130943  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  23130942 atg 23130940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23133508 - 23133407
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  23133508 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 23133410  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  23133409 atg 23133407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 23709515 - 23709616
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  23709515 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 23709613  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  23709614 atg 23709616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 23711996 - 23712097
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  23711996 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 23712094  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  23712095 atg 23712097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24367953 - 24367852
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  24367953 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 24367855  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  24367854 atg 24367852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 24898178 - 24898279
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  24898178 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 24898276  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  24898277 atg 24898279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 24900661 - 24900762
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  24900661 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 24900759  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  24900760 atg 24900762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 24903138 - 24903239
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  24903138 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 24903236  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  24903237 atg 24903239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 24905615 - 24905716
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  24905615 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 24905713  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  24905714 atg 24905716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 24908090 - 24908191
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  24908090 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 24908188  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  24908189 atg 24908191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26505558 - 26505457
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  26505558 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 26505460  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  26505459 atg 26505457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26508036 - 26507935
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  26508036 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 26507938  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  26507937 atg 26507935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28577278 - 28577177
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||  |||| ||||||||| |||||||    
T  28577278 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatc 28577180  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  28577179 atg 28577177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 183
Target Start/End: Original strand, 30643984 - 30644082
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||  | |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  30643984 atttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagatattgattatcatttgatattgttatatc 30644082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 34402505 - 34402606
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  34402505 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 34402603  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  34402604 atg 34402606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39682492 - 39682391
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  39682492 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 39682394  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  39682393 atg 39682391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 45029837 - 45029938
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  45029837 atttcatgttgtta-tattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 45029935  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  45029936 atg 45029938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 571576 - 571524
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  571576 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 571524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 6726174 - 6726122
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6726174 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 6726122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 21155043 - 21155095
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21155043 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 21155095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 6261076 - 6261180
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtata-tgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtt 178  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  ||||||||||||    
T  6261076 atataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtt 6261175  T
Q  179 atatc 183  Q
    |||||    
T  6261176 atatc 6261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679666
Alignment:
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacattgatattgttatatcatga 7679666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 21073425 - 21073528
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||  || |||||||| ||| ||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  21073425 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 21073524  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  21073525 tatc 21073528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 21081669 - 21081736
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  21081669 atatgatttaatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 21081736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 23069216 - 23069319
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |   ||||| |||||  | |||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  23069216 atatgatttgatgttgatggcaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 23069315  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  23069316 tatc 23069319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23135769 - 23135668
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  23135769 atttgatgttgtta-tactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 23135671  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  23135670 atg 23135668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 32214904 - 32215005
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  32214904 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 32215002  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  32215003 atg 32215005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43137483 - 43137426
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43137483 atatgttttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 43137426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38967553 - 38967452
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgtt-attgatttgc-tttgatattgttatat 182  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  38967553 atttgatgttgt--atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattattt 38967456  T
Q  183 catg 186  Q
    ||||    
T  38967455 catg 38967452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 43947306 - 43947361
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||||    
T  43947306 atgatttaatgttgttaataatgtgatat-attgtatatgcactatgtgaattatat 43947361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 6135 - 6344
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6135 cacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttat 6234  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  6235 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatat 6334  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  6335 actgcctatg 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22178072 - 22178281
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22178072 cacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggatgttgttaa 22178171  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  22178172 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatat 22178271  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  22178272 actgcctatg 22178281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 26011888 - 26012074
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||      
T  26011888 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgt 26011987  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  26011988 tgatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatg 26012074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20026793 - 20027001
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  20026793 cacgagtcgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttga 20026892  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |    
T  20026893 taatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggat 20026991  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  20026992 actgcctatg 20027001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 21329350 - 21329497
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||      
T  21329350 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgc 21329449  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  21329450 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgttt 21329497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29448192 - 29448063
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29448192 atatgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 29448093  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29448092 tatcatgagctgttttatatactgcctatg 29448063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 21502007 - 21502195
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaa-ctaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtt 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  21502007 cacgagttgatgttagttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 21502106  T
Q  99 aataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
      |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |  ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  21502107 gttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 21502195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21565810 - 21565623
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  21565810 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 21565711  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| |||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  21565710 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 21565623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15796689 - 15796479
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||  |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||    
T  15796689 cacgagttgttgtgagatgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactactgctgctgtttcagtaagcctgatataaatgatttgatgttgctaa 15796590  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgaga-tgttattgatt-tgctttgatattgttatatcatgaactgttttatg 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||   ||||||| ||| || | |||||| |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15796589 taatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctgttttatg 15796490  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    | |||||||||    
T  15796489 tgctgcctatg 15796479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22144236 - 22144131
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  22144236 atgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttat 22144137  T
Q  181 atcatg 186  Q
    ||||||    
T  22144136 atcatg 22144131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19669161 - 19668982
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatga--tttgatgttgttaata 102  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||| ||||   ||||||   ||||||||||| |||    
T  19669161 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttata 19669062  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatca 184  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| | |||| |||||   ||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  19669061 atgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcgatattgttatatca 19668982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725966
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgtt 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgtt 40725966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 19660693 - 19660822
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  19660693 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 19660792  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  19660793 atgttatataattgtatatacattacatga 19660822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 37598815 - 37598943
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  37598815 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 37598914  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  37598915 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 37598943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42960730 - 42960627
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  42960730 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 42960631  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  42960630 tatc 42960627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25743988 - 25743841
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||| | | ||| || | |||||||| ||||||||     
T  25743988 cacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaataaactaagttgcttatgctgttgttgttg-ttcagaatgtctg-ataagatgatttggtgttgttat 25743891  T
Q  101 taatgtg--atataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||  |||||  | |||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  25743890 taatgtgacatatatttatatatgcattatgtgaattatttgtgatgttt 25743841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 22959392 - 22959572
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| ||||   |||||| |  |||||| | | |||    
T  22959392 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttggttaaaat 22959491  T
Q  105 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||   ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  22959492 gttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatga 22959572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23469990 - 23469923
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  23469990 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 23469923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 25574402 - 25574469
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  25574402 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 25574469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 25575595 - 25575662
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  25575595 atatgatttgatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 25575662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27988782 - 27988980
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| | | ||| || | ||||||| ||||||||||    
T  27988782 cacgagttgatgtgagttgatcatgaggttaaggaactaagttgtttatatatctgttgttg-ttcagaatgtctg-ataagatgattt-atgttgttaa 27988878  T
Q  101 taatgtgatataaa--tgtatatgcatt-acatgaattatatatgatgtttga--gatgttattgatt-tgctttgatattgttatatcatgaactgttt 194  Q
     |||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||| | ||||||| |  | || | |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27988879 gaatgtgatataaatttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 28370954 - 28371082
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  28370954 atatgatctgatgttgttagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 28371053  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  28371054 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 28371082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 21741398 - 21741473
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||  ||||||  || |||||||||||    
T  21741398 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgttgtcattccagtaagcctg 21741473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 264751 - 264852
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  264751 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 264849  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  264850 atg 264852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20909191 - 20909090
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  20909191 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 20909093  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  20909092 atg 20909090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 25576788 - 25576890
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttat 180  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| || || | ||||||    |||||||||||||    
T  25576788 atatgattttatgttgatagtaatgtgatatagttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattattgatattgttat 25576887  T
Q  181 atc 183  Q
    |||    
T  25576888 atc 25576890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29330113 - 29330012
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  29330113 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29330015  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  29330014 atg 29330012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29346159 - 29346058
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  29346159 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29346061  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  29346060 atg 29346058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29348632 - 29348531
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  29348632 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29348534  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  29348533 atg 29348531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29351105 - 29351004
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  29351105 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29351007  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  29351006 atg 29351004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39363563 - 39363462
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  39363563 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 39363465  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  39363464 atg 39363462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 41861473 - 41861515
Alignment:
Q  167 tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41861473 tttgatattgttatatcatgagctgttttatgtgctgcctatg 41861515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 42245348 - 42245449
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  42245348 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 42245446  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  42245447 atg 42245449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32027572 - 32027520
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32027572 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 32027520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 36154763 - 36154867
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  36154763 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 36154861  T
Q  181 atcatg 186  Q
     |||||    
T  36154862 gtcatg 36154867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154648
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  2154593 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 2154648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902043
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  20901988 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 20902043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 30138861 - 30138964
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||  || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  30138861 atatgatttaatgttcgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtta 30138960  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  30138961 tatc 30138964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 33895588 - 33895655
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  33895588 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 33895655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 10732923 - 10733024
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  10732923 atttgatgttgtta-tacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 10733021  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  10733022 atg 10733024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39245315 - 39245214
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  ||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  39245315 atttgatgttgtta-tattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtc 39245217  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  39245216 atg 39245214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 10775656 - 10775710
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  10775656 atgatttgatgttgt--atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 10775710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Original strand, 21328150 - 21328215
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| |||| || |||||||    
T  21328150 atgatttgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgttt 21328215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20572072 - 20572028
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||    
T  20572072 atgatttgatgttgttagtaatgtaatatagttgtatatgcatta 20572028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 37251020 - 37251228
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37251020 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaa 37251119  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37251120 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatat 37251218  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  37251219 actgcctatg 37251228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22110204 - 22110412
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22110204 cacgaattgatgtgagttgatcatgagggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaa 22110303  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110304 taatgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatgatg-ttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 22110402  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  22110403 actgcctatg 22110412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 43927401 - 43927291
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43927401 cacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 43927302  T
Q  101 taatgtgatat 111  Q
    |||||||||||    
T  43927301 taatgtgatat 43927291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15471191 - 15471005
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||      
T  15471191 cacgagttgatgttagatgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatct-aagttgttgt 15471093  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  15471092 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 15471005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43926123 - 43926019
Alignment:
Q  106 tgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43926123 tgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgc 43926024  T
Q  205 ctatg 209  Q
    |||||    
T  43926023 ctatg 43926019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16097596 - 16097409
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  16097596 cacgagttgatgtgagttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 16097497  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||| ||||    
T  16097496 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatga 16097409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 208
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051260
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcat 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  186 gaactgttttatgtactgcctat 208  Q
    ||||||||||   ||||||||||    
T  2051238 gaactgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16104047 - 16103861
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |   |||||| ||||||||||| |    
T  16104047 cacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgttta 16103948  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||    
T  16103947 taatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatga 16103861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523789
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcat 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  186 gaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||   |||||||||||    
T  52523766 gaactgttttgcatactgcctatg 52523789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 49389483 - 49389638
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  49389483 cacgagttgatgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 49389582  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgtt 156  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||    
T  49389583 taatgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgtt 49389638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14234753 - 14234568
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtt--tcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| | | || | ||||||||  ||    
T  14234753 agttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtttaatctaatgttgttgcta 14234654  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  14234653 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 14234568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Original strand, 606301 - 606386
Alignment:
Q  123 cattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  606301 cattacatgaattctatatgatgtt-gagatgttgttgaattgcattgatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatg 606386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 187
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340763
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| || | |||| || |||||| ||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 24340756  T
Q  181 atcatga 187  Q
    |||||||    
T  24340757 atcatga 24340763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 1644537 - 1644642
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  1644537 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 1644636  T
Q  101 taatgt 106  Q
    ||||||    
T  1644637 taatgt 1644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9577810 - 9577707
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  9577810 atatgatttgatgttgttagtaatgtgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttgttgattatcatttgatattgtta 9577711  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  9577710 tatc 9577707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 12934165 - 12934268
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  12934165 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 12934264  T
Q  101 taat 104  Q
    ||||    
T  12934265 taat 12934268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 156
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642273
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgtt 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgtt 37642273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 1465264 - 1465424
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||  || |||  || ||||||||||| ||| | |  | | |||||| | |    
T  1465264 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgctgtcattccagtaagcctggattgtttattctaatgttgatga 1465363  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgat 162  Q
    |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  1465364 taatgttatacaattgtatatacattacatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgat 1465424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12378110 - 12377982
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || |||| | |||||  |||||||| ||||  |||||||| || ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12378110 atatgatttaatgttgatagtaatttaatatat-tgtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgtta 12378012  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||    
T  12378011 tatcatgagctattttatatactgcctatg 12377982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Original strand, 23318650 - 23318755
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatat 182  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| | ||||  || |||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  23318650 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagttgttcaagttgttgttgattgtcattgatattgttatat 23318749  T
Q  183 catgaa 188  Q
    | ||||    
T  23318750 cttgaa 23318755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 23371405 - 23371533
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  23371405 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 23371504  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  23371505 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 23371533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51300749 - 51300621
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  51300749 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 51300650  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  51300649 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 51300621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 49667938 - 49668034
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||    
T  49667938 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgagttgatgttgt 49668034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15246204 - 15246106
Alignment:
Q  84 tgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| || || | |||||| | |||||||||||||||    
T  15246204 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttat 15246106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15265325 - 15265227
Alignment:
Q  84 tgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| || || | |||||| | |||||||||||||||    
T  15265325 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttat 15265227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16796673 - 16796559
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  16796673 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 16796574  T
Q  180 tatcatgaactgttt 194  Q
    |||| |||| |||||    
T  16796573 tatcttgaaatgttt 16796559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 14763659 - 14763787
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  14763659 atataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 14763758  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  14763759 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 14763787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174299
Alignment:
Q  38 taagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||| |  |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttat 12174251  T
Q  138 atatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgttatatcatga 187  Q
     | |||| |||||| |||| ||   |||| || ||||||||||||||||||    
T  12174252 gtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatga 12174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23274884 - 23274768
Alignment:
Q  74 ctgaattat-atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttg 170  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | |||| |||||||||| || || ||||||||||| || | |||| || |    
T  23274884 ctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcg 23274785  T
Q  171 atattgttatatcatga 187  Q
    ||||| |||||||||||    
T  23274784 atattattatatcatga 23274768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5223491 - 5223388
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||  ||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  5223491 atatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 5223392  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  5223391 tatc 5223388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12339893 - 12339790
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  12339893 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 12339794  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  12339793 tatc 12339790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14179558 - 14179455
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  14179558 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 14179459  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  14179458 tatc 14179455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 43889559 - 43889662
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  43889559 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 43889658  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  43889659 tatc 43889662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 7781330 - 7781431
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  7781330 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtc 7781428  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  7781429 atg 7781431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8899277 - 8899172
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||    
T  8899277 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 8899179  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  8899178 tgtcatg 8899172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147533
Alignment:
Q  91 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgtt 156  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgtt 22147533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50243005 - 50242900
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  50243005 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 50242907  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  50242906 tgtcatg 50242900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14671110 - 14670982
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  14671110 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtta 14671011  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  14671010 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 14670982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14682609 - 14682481
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  14682609 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatcttgtta 14682510  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  14682509 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 14682481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15207122 - 15207057
Alignment:
Q  84 tgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  15207122 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgttt 15207057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 28194878 - 28194821
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  28194878 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 28194821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 32307935 - 32307830
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||  |||||| ||||    ||||| || |||||||| |    
T  32307935 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactgatgcttatgaattaatgttgttta 32307836  T
Q  101 taatgt 106  Q
    ||||||    
T  32307835 taatgt 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 37427895 - 37427835
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  37427895 ttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgttt 37427835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9521146 - 9521039
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||  |||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||    
T  9521146 agtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 9521047  T
Q  105 gtgatata 112  Q
    ||| ||||    
T  9521046 gtgttata 9521039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9533483 - 9533416
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  9533483 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 9533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 10834037 - 10834139
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  10834037 atatgatttgatgttgttagtaatgagatat-attgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 10834135  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  10834136 tatc 10834139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12470088 - 12469985
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  12470088 atatgatgtgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 12469989  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  12469988 tatc 12469985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 186
Target Start/End: Original strand, 29172560 - 29172667
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtt 178  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||    
T  29172560 atataatttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 29172659  T
Q  179 atatcatg 186  Q
    || |||||    
T  29172660 atgtcatg 29172667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 10247706 - 10247807
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  10247706 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 10247804  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  10247805 atg 10247807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 13151773 - 13151874
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  13151773 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 13151871  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  13151872 atg 13151874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 13154238 - 13154339
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  13154238 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 13154336  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  13154337 atg 13154339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 13210182 - 13210367
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatg-atttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||    || ||||||| ||||   ||||| |||  |||||| |     
T  13210182 cacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctgatgcatatgaattcaatgttgctt 13210281  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||   | ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  13210282 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatattt---aagttgttgatttgcattcgatattattatatcatga 13210367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 16454264 - 16454365
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  16454264 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 16454362  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  16454363 atg 16454365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17463357 - 17463256
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  17463357 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 17463259  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  17463258 atg 17463256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27165431 - 27165329
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||||||| || |||||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  27165431 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatc 27165332  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  27165331 atg 27165329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34159505 - 34159404
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  34159505 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 34159407  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  34159406 atg 34159404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 38961874 - 38961975
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  38961874 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 38961972  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  38961973 atg 38961975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41124066 - 41123965
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  41124066 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 41123968  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  41123967 atg 41123965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Original strand, 43550457 - 43550562
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||    
T  43550457 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 43550555  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  43550556 tgtcatg 43550562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 45606890 - 45606991
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  45606890 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 45606988  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  45606989 atg 45606991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 50243087 - 50242985
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||||| || |||||| ||||||    
T  50243087 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgtta 50242988  T
Q  180 tat 182  Q
    |||    
T  50242987 tat 50242985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 55476670 - 55476569
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  55476670 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 55476572  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  55476571 atg 55476569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9513171 - 9513070
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||  |||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||    
T  9513171 agtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 9513072  T
Q  105 gt 106  Q
    ||    
T  9513071 gt 9513070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 9707590 - 9707642
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9707590 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 9707642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 16282794 - 16282846
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16282794 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15465251 - 15465159
Alignment:
Q  92 tgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatc 183  Q
    ||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| || || |||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  15465251 tgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatc 15465159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 17248221 - 17248276
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  17248221 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 17248276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070688
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53070633 atgatttgatgttgttag-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 53070688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 324422 - 324355
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  324422 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 324355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 10542365 - 10542468
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||| | |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  10542365 atatgatttgatgtcgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtta 10542464  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  10542465 tatc 10542468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12567739 - 12567637
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  12567739 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 12567641  T
Q  184 atga 187  Q
    ||||    
T  12567640 atga 12567637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13544204 - 13544102
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  13544204 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 13544106  T
Q  184 atga 187  Q
    ||||    
T  13544105 atga 13544102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14966356 - 14966289
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  14966356 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 14966289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16643359 - 16643292
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  16643359 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgttt 16643292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 52989655 - 52989722
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  52989655 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 52989722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 53301487 - 53301590
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgtt-attgatttgc-tttgatattgttatat 182  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| || |||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  53301487 attttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatat 53301586  T
Q  183 catg 186  Q
    ||||    
T  53301587 catg 53301590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 6469117 - 6469218
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| |  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  6469117 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 6469215  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  6469216 atg 6469218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 17446638 - 17446739
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  17446638 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 17446736  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  17446737 atg 17446739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 28848594 - 28848695
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  28848594 atttgatgttgtta-tactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 28848692  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  28848693 atg 28848695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 147
Target Start/End: Original strand, 43550375 - 43550441
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 147  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  43550375 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 43550441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8499699 - 8499658
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 127  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  8499699 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcatta 8499658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17672808 - 17672704
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||  |||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  17672808 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattat 17672710  T
Q  181 atcatg 186  Q
     |||||    
T  17672709 gtcatg 17672704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42386593 - 42386492
Alignment:
Q  87 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatca 184  Q
    |||||||||| | || |||||||||||   |||||||||| | ||||||||  ||| || ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||    
T  42386593 tttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtca 42386494  T
Q  185 tg 186  Q
    ||    
T  42386493 tg 42386492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 127
Target Start/End: Original strand, 12119704 - 12119747
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 127  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  12119704 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcatta 12119747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14973036 - 14972936
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcat 185  Q
    ||||||||| | || |||||||||||   |||||||||||| ||||||||  ||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  14973036 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 14972937  T
Q  186 g 186  Q
    |    
T  14972936 g 14972936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50686881 - 50686672
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50686881 cacgagttgacgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaa 50686782  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  50686781 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaactattttatga 50686682  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  50686681 actgcctatg 50686672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16368139 - 16368346
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368139 cacgagttgatgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 16368238  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  16368239 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatg-ttgagatgttgttgatttgcattgatattgttatatcatgaattgttttatatg 16368337  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  16368338 ctgcctatg 16368346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 50613969 - 50614177
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  50613969 cacgagttgatgtgaattgatca-gggggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatat 50614067  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614068 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 50614167  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  50614168 actgcctatg 50614177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 50621797 - 50622005
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  50621797 cacgagttgatgtgaattgatca-gggggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatat 50621895  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621896 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 50621995  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  50621996 actgcctatg 50622005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 41049891 - 41050096
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41049891 gagttgatgtgagttgatcataggggtaaggaactaggtttcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataa 41049990  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtact 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41049991 tgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatact 41050089  T
Q  203 gcctatg 209  Q
    |||||||    
T  41050090 gcctatg 41050096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21896111 - 21896316
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  21896111 cacgagttgatgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatctt---gttgttgtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgttta 21896207  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatg 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |     
T  21896208 taatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg--ctgttttgta 21896305  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    |||||||||||    
T  21896306 tactgcctatg 21896316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 21861422 - 21861609
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |    
T  21861422 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgttta 21861521  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21861522 taatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22921722 - 22921909
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  22921722 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 22921821  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
     |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22921822 ttaatgttatataattgtatatacattatatgaattttgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 22921909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33681275 - 33681088
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  33681275 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 33681176  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||   || |||| || ||||||||||||||||||    
T  33681175 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatga 33681088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 52927835 - 52927988
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  52927835 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 52927934  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatg 154  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  52927935 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg 52927988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26065123 - 26064999
Alignment:
Q  85 gatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatca 184  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26065123 gatttgatgtcattaataatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcattggtattgttatatca 26065024  T
Q  185 tgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  26065023 tgaattattttatgtactgcctatg 26064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22237896 - 22237708
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactg-ttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  || ||||   |||||| |||||||||||     
T  22237896 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgatacatatgaattgatgttgttt 22237797  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
     ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  22237796 ctaaagttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 22237708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 209
Target Start/End: Original strand, 16093836 - 16093945
Alignment:
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgtt-attgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  16093836 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcattgatattgttatatcatgagctgttttctat 16093935  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  16093936 actgcctatg 16093945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 35261015 - 35261117
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  35261015 atgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatg---ttgatttgcatttgatattgttat 35261111  T
Q  181 atcatg 186  Q
    ||||||    
T  35261112 atcatg 35261117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16758839 - 16758710
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattg-atttgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||| ||| |||   |||||||||||||    
T  16758839 atatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgtta 16758740  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||    
T  16758739 tatcatgaactggtttgcatactgcctatg 16758710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20637113 - 20636980
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||  ||||||  || ||||||||||||||| |||  ||| |||||| | ||||    
T  20637113 gagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataa 20637014  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  20637013 tgttatataattgtatatacattatatgaattat 20636980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22124473 - 22124345
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  22124473 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 22124374  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  22124373 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 22124345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12271815 - 12271702
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||       ||| |||||||| || |    
T  12271815 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactg-------tgagttgatgttattta 12271723  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatat 121  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  12271722 taatgtgatataattgtatat 12271702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21754303 - 21754126
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  21754303 cacgagttgatgtgagttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 21754204  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||||||        ||||||| ||||| ||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  21754203 taatgt--------tgtatatacattaaatggattatgt-tgataattgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatga 21754126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 35981541 - 35981701
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||  ||||||  || ||||||||||| ||| |||  | | |||||| | |    
T  35981541 cacgaattgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatga 35981640  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgat 162  Q
    |||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  35981641 taatgttatataattgcatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgat 35981701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 49261607 - 49261447
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||  ||||||  || ||||||||| ||||| |||  | | |||||| | |    
T  49261607 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaattgtatattctaatgttgatga 49261508  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgat 162  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  49261507 taatgttatataattgtatatacattatataaattatgt-tgatatttgagatgttgttgat 49261447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 47190818 - 47190685
Alignment:
Q  52 tactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgag 151  Q
    |||||||| ||||||||  || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||    
T  47190818 tactgttgatgtttcagagagtctgatataaatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaag 47190719  T
Q  152 atgttattgattt--gctttgatattgttatatc 183  Q
     || | |||||||   ||||||||||||||||||    
T  47190718 ttgatgttgatttcctctttgatattgttatatc 47190685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 433094
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 433094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16381451 - 16381388
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttt 65  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  16381451 acgagttgatgtgagttgatcatgagggtaagaaactaagttgtttatatttctattgttgttt 16381388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 52940810 - 52940877
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  52940810 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 52940877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20248539 - 20248360
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||  |||||||| | ||||||| ||||   |||||| |  |||||||| |||||    
T  20248539 agttgatgtaaattgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttg-tccagtaagactgatgcatatgaatccatgttgtttataat 20248441  T
Q  105 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |  |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||   | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20248440 gatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatattt---aagttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 20248360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20958296 - 20958168
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| |  ||||||||||| |    
T  20958296 atatgttttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtca 20958197  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  20958196 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 20958168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 21043214 - 21043342
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | || ||| |  |||||||||||||    
T  21043214 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatttttattatcatttgatattgtta 21043313  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  21043314 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 21043342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 48520700 - 48520632
Alignment:
Q  80 tatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  48520700 tatatgaattgatgttataaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 48520632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13989045 - 13988944
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  13989045 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 13988947  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  13988946 atg 13988944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 21475070 - 21475171
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  21475070 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 21475168  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  21475169 atg 21475171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21477703 - 21477653
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaa 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  21477703 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatacgcattacttgaa 21477653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 21923274 - 21923375
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  21923274 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 21923372  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  21923373 atg 21923375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 22130844 - 22130894
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22130844 tatgatttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatga 22130894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 23593717 - 23593819
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  23593717 atttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 23593816  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  23593817 atg 23593819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29776867 - 29776766
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  29776867 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29776769  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  29776768 atg 29776766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31612492 - 31612391
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  31612492 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 31612394  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  31612393 atg 31612391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 45574821 - 45574877
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45574821 tatgatttgatgttctta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 45574877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 13881314 - 13881381
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  13881314 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 13881381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16362097 - 16362046
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  16362097 atttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattat 16362046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 20437925 - 20437992
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  20437925 atatgatttgatgctgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 20437992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48603640 - 48603541
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  48603640 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 48603541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Original strand, 13212841 - 13212894
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  13212841 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 13212894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 20454572 - 20454614
Alignment:
Q  167 tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20454572 tttgatattgttataccatgagctgttttatgtgctgcctatg 20454614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 21347144 - 21347091
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  21347144 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 21347091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 183
Target Start/End: Original strand, 21533803 - 21533908
Alignment:
Q  78 attatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattg 176  Q
    |||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || |||| |||||| |  ||||||||||    
T  21533803 attacatgatttaatgttgatagaaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattg 21533901  T
Q  177 ttatatc 183  Q
    |||||||    
T  21533902 ttatatc 21533908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 136
Target Start/End: Original strand, 22123050 - 22123099
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatta 136  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22123050 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaatta 22123099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 147
Target Start/End: Original strand, 22130763 - 22130829
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 147  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  22130763 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 22130829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 147
Target Start/End: Original strand, 45574739 - 45574805
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 147  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  45574739 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 45574805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 29298315 - 29298263
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29298315 atttgatgttatta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 29298263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21707349 - 21707294
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  21707349 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtataggcattacatgatttatat 21707294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21711891 - 21711836
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  21711891 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtataggcattacatgatttatat 21711836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 78587 - 78383
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78587 gagttgatgtgagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataa 78488  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  78487 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgatg-ttgagatgttgttgatttgcattgatattgttatatcatgaactgttttatatgctg 78389  T
Q  204 cctatg 209  Q
    ||||||    
T  78388 cctatg 78383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 128835 - 129031
Alignment:
Q  13 tgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatata 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128835 tgagttgatcatgggg-taagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatata 128933  T
Q  113 aatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  128934 tttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatg 129031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 18090 - 18298
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18090 cacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttat 18189  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  18190 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatat 18289  T
Q  200 actgcctat 208  Q
    |||||||||    
T  18290 actgcctat 18298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13021
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || | ||||||||      
T  13207 cacgagttgatgtgagttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgc 13108  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  13107 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 13021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 97274 - 97066
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  97274 cacgagttgatgtgagttgatcatgggg-taagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaa 97176  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97175 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 97076  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  97075 actgcctatg 97066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 106552 - 106344
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  106552 cacgagttgatgtgagttgatcatgggg-taagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaa 106454  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106453 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 106354  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  106353 actgcctatg 106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38586 - 38377
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  38586 cacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagat 38487  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  38486 taatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatat 38387  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  38386 actgcctatg 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 80)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20220042 - 20220248
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20220042 cacgagttgatgtgaggtgatcacaggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaa 20220141  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20220142 taatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatg---ttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 20220238  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  20220239 actgcctatg 20220248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16056595 - 16056409
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||      
T  16056595 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgt 16056496  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16056495 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 16056409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1868055
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcattgatattgttatat 1868028  T
Q  183 catgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1868029 catgagctgttttatatactgcctatg 1868055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 16219574 - 16219757
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||    
T  16219574 agttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaat 16219673  T
Q  105 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  16219674 gttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 16219757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 15008433 - 15008559
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15008433 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcattgatattgttatat 15008532  T
Q  183 catgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15008533 catgaactgttttatatactacctatg 15008559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12901595 - 12901384
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttgggggtaag----aaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12901595 acgagttgatgtgagttgatcttggaggtacgtaggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgt 12901496  T
Q  98 taataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgtttta 196  Q
    |  |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||     
T  12901495 tgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtatgatg-ttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttg 12901397  T
Q  197 tgtactgcctatg 209  Q
    | |||||||||||    
T  12901396 tatactgcctatg 12901384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 68008 - 67826
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||  |||    
T  68008 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 67909  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  67908 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgat-attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 67826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18005910 - 18005727
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||  |||    
T  18005910 agttgatatgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaa 18005811  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18005810 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 18005727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 810988 - 811171
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  ||||    
T  810988 agttgatgtgagttgaccttggaagttagaaactaagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaat 811087  T
Q  105 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  811088 gttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatga 811171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15113211 - 15113028
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  | |    
T  15113211 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaatta 15113112  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||| |||   ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  15113111 taatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15116748 - 15116565
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| || |    
T  15116748 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaagactgatgtatatgagttgatgttattta 15116649  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||| |||   ||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  15116648 taatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22073183 - 22072996
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||      
T  22073183 cacgagttgatgtgagttgatcttacaggtaaggaactaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgt 22073084  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    |||||| |||||| || |||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  22073083 taatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 22072996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47832074 - 47831888
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||   |    
T  47832074 acgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgct 47831975  T
Q  102 aatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  47831974 aatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 47831888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044807
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgtt-attgatttgctttgatattgttat 180  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttat 14044836  T
Q  181 atcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||    
T  14044835 atcaggagctgttttatgtactgcctatg 14044807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354837
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgtt-attgatttgctttgatattgttat 180  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttat 14354866  T
Q  181 atcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||    
T  14354865 atcaggagctgttttatgtactgcctatg 14354837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44014440 - 44014259
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||   | ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  44014440 cacgaattgatgtgagttgatca--gaggttaaaaactaagttg-ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttt 44014344  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44014343 ttaatggtatataactgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatg---ttgatttgcattcgatattgttatatcatga 44014259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14036391 - 14036315
Alignment:
Q  134 ttatatatgatgtttgagatgtt-attgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14036391 ttatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatg 14036315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14346421 - 14346345
Alignment:
Q  134 ttatatatgatgtttgagatgtt-attgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14346421 ttatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatg 14346345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255832
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattg-atttgctttgatattgttatatcat 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||||||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  186 gaa 188  Q
    |||    
T  12255830 gaa 12255832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16324270 - 16324176
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||    
T  16324270 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtt 16324176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 2280053 - 2280158
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  2280053 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 2280152  T
Q  181 atcatg 186  Q
    ||||||    
T  2280153 atcatg 2280158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 15754742 - 15754927
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatg-atttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||  | || ||||||| ||||   ||||| |||| |||||| |     
T  15754742 cacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgctt 15754841  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||   ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  15754842 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcgatattattatatcatga 15754927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16996409 - 16996307
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  16996409 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt-aaatgttgttgattttcatttgatattgtta 16996311  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  16996310 tatc 16996307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14566356 - 14566228
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  14566356 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 14566257  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  14566256 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 14566228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18872514 - 18872386
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  18872514 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 18872415  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  18872414 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 18872386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Original strand, 9033281 - 9033345
Alignment:
Q  84 tgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  9033281 tgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 9033345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 156
Target Start/End: Original strand, 19486678 - 19486752
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgtt 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  19486678 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgtt 19486752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11661460 - 11661332
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  11661460 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 11661361  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  11661360 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 11661332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34201049 - 34200920
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||  ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  34201049 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 34200950  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  34200949 atgttatataattgtatatacattacatga 34200920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 1858764 - 1858867
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||  ||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  1858764 atatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 1858863  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  1858864 tatc 1858867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 10501356 - 10501423
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10501356 atatgatttgattttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 10501423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 11768851 - 11768918
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  11768851 atatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 11768918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16008732 - 16008629
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  16008732 atataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 16008633  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  16008632 tatc 16008629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18430891 - 18430789
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  18430891 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 18430793  T
Q  184 atga 187  Q
    ||||    
T  18430792 atga 18430789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20619569 - 20619510
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  20619569 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 20619510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13647512 - 13647407
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||    
T  13647512 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 13647414  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  13647413 tgtcatg 13647407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 28505156 - 28505285
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||  |||   |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  28505156 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 28505255  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  28505256 atgttatataattgtatatacattacatga 28505285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38519560 - 38519432
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||  || ||| |||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  38519560 atatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 38519461  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  38519460 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 38519432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17061950
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17061895 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 17061950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110624
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcat 185  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  20110723 ttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcat 20110625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 14157037 - 14157104
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14157037 atatgatttgatatcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 14157104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14258638 - 14258535
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||| ||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  14258638 atatgatttgatattgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 14258539  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  14258538 tatc 14258535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 16460698 - 16460801
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  16460698 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtta 16460797  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  16460798 tatc 16460801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16579946 - 16579843
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  16579946 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgtta 16579847  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  16579846 tatc 16579843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 16585717 - 16585820
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  16585717 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgtta 16585816  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  16585817 tatc 16585820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16998780 - 16998713
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  16998780 atatgatttaatgttgataataatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 16998713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18607641 - 18607574
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  18607641 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 18607574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42462137 - 42462034
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  42462137 atataatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 42462038  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  42462037 tatc 42462034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 456500 - 456399
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  456500 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 456402  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  456401 atg 456399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 9389550 - 9389592
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagtt 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9389550 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagtt 9389592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 11393270 - 11393371
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  11393270 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 11393368  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  11393369 atg 11393371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11972675 - 11972574
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  11972675 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 11972577  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  11972576 atg 11972574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 14949105 - 14949206
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  14949105 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 14949203  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  14949204 atg 14949206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 15376696 - 15376797
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  15376696 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 15376794  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  15376795 atg 15376797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16232699 - 16232598
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  16232699 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 16232601  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  16232600 atg 16232598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Original strand, 17017400 - 17017482
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt 163  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || |||| ||||||    
T  17017400 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatt 17017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 20385106 - 20385207
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  20385106 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 20385204  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  20385205 atg 20385207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20487729 - 20487647
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt 163  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||    
T  20487729 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgatt 20487647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 21189578 - 21189679
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  21189578 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 21189676  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  21189677 atg 21189679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24702417 - 24702316
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  24702417 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 24702319  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  24702318 atg 24702316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27217039 - 27216938
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  27217039 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 27216941  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  27216940 atg 27216938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32125670 - 32125569
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  32125670 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 32125572  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  32125571 atg 32125569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41523096 - 41522995
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  41523096 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 41522998  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  41522997 atg 41522995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41525558 - 41525457
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  41525558 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 41525460  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  41525459 atg 41525457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 11995885 - 11996014
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||  ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  11995885 cgagttgatgtgagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 11995984  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  11995985 atgttatataattgtatatacattacatga 11996014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 15081928 - 15081984
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  15081928 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 15081984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24704864 - 24704812
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24704864 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 24704812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44116691 - 44116587
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  44116691 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 44116593  T
Q  181 atcatg 186  Q
     |||||    
T  44116592 gtcatg 44116587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 130749 - 130853
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatg-ttattgatt-tgctttgatattgtt 178  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||| | ||||| || || | ||||||| |  ||||||||||||    
T  130749 atatgatttgatgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgtt 130848  T
Q  179 atatc 183  Q
    |||||    
T  130849 atatc 130853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Original strand, 9725595 - 9725659
Alignment:
Q  84 tgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  9725595 tgatttaatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgttt 9725659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Original strand, 12756651 - 12756702
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt 135  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12756651 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaatt 12756702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 122
Target Start/End: Original strand, 10063757 - 10063796
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatg 122  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10063757 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatg 10063796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13647595 - 13647528
Alignment:
Q  80 tatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 147  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  13647595 tatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 13647528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14422139 - 14422072
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || || ||||| |||||||    
T  14422139 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataagatgttt 14422072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 25927184 - 25927251
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||  ||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25927184 atatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 25927251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 46580608 - 46580675
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  46580608 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 46580675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18640451 - 18640350
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  18640451 attttatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 18640353  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  18640352 atg 18640350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 26355966 - 26356018
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26355966 atttaatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26356018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 26358418 - 26358470
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26358418 atttaatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 26358470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 163
Target Start/End: Original strand, 9177600 - 9177680
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt 163  Q
    ||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||| || |||| ||||||    
T  9177600 atgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatt 9177680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1650 - 1858
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1650 cacgagttgatgtgagttgatcttgagggtaagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaa 1749  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1750 taatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatat 1848  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||| ||||||    
T  1849 actacctatg 1858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 19737 - 19945
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19737 cacgggttgatatgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaa 19836  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19837 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgagttatttatgatg-ctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatat 19935  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  19936 actgcctatg 19945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 817 - 611
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  817 cacgagttgatgtgagttgatcatatgg-taagaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatcttttaaa 719  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgta 200  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  718 taatatgatattaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg-ttgggatgttgttgatttgcattgatattgttatatcatgaactgttttatatg 620  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  619 ctgcctatg 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 267916 - 267721
Alignment:
Q  14 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataa 113  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  267916 gagttgatcataagggtaagaaactaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatgatatgatttgatggtgttaataatgtgatataa 267817  T
Q  114 atgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  267816 atgtatatgcattacatgaattatatatgatg-ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatg 267721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 61)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23076997 - 23076791
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  23076997 gagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataa 23076898  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgtact 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |   |||||||| |||||||  ||  |||||||||||||    
T  23076897 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtact 23076798  T
Q  203 gcctatg 209  Q
    |||||||    
T  23076797 gcctatg 23076791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35008418 - 35008209
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  35008418 cacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaa 35008319  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |   |||||||| |||||||  ||  ||||||||||    
T  35008318 taatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgt 35008219  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  35008218 actgcctatg 35008209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18696675 - 18696547
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttat 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18696675 atatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgctttgatattgttat 18696576  T
Q  181 atcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18696575 atcatgaactgttttatgtattgcctatg 18696547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18706493 - 18706365
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18706493 atatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgctttgatattgttat 18706394  T
Q  181 atcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18706393 atcatgaactgttttatatattgcctatg 18706365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19668640 - 19668446
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |  ||||||| |    
T  19668640 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttga 19668541  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgtttt 195  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668540 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattacgtatgatg-ttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt 19668446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23019673 - 23019488
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||  |    
T  23019673 acgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgtt 23019574  T
Q  102 aatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23019573 aatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 23019488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18177524 - 18177734
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  18177524 cacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataaatgatttgatgttgttaa 18177623  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgaga-tgttattgatt-tgctttgatattgttatatcatgaactgttttatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || | |||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18177624 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatg 18177723  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    | || ||||||    
T  18177724 tgcttcctatg 18177734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 18199268 - 18199478
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  18199268 cacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataaatgatttgatgttgttaa 18199367  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgaga-tgttattgatt-tgctttgatattgttatatcatgaactgttttatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || | |||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18199368 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatg 18199467  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    | || ||||||    
T  18199468 tgcttcctatg 18199478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18204347 - 18204137
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  18204347 cacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaaatgatttgatgttgttaa 18204248  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgaga-tgttattgatt-tgctttgatattgttatatcatgaactgttttatg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || | |||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18204247 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttttatg 18204148  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    | || ||||||    
T  18204147 tgcttcctatg 18204137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 140
Target Start/End: Original strand, 28103795 - 28103890
Alignment:
Q  45 cttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28103795 cttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatata 28103890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19652461 - 19652276
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  19652461 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 19652362  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| | ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||||    
T  19652361 taatgttatataattgtatatactttaaatggattatgt-tgatgtttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatga 19652276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20109409 - 20109224
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||  |||||| ||||  ||||| | ||||||||||| |    
T  20109409 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgatgttgttta 20109310  T
Q  101 taatgtgatata--aatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatat 182  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  20109309 taatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatat 20109224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22080592 - 22080747
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| ||||     
T  22080592 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttg 22080691  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgtt 156  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||  | |||||||||||||||    
T  22080692 ttaatgttatataaatgtatatacattatattaattat-gacgatgtttgagatgtt 22080747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 9098378 - 9098560
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||         
T  9098378 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgtt----- 9098472  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgtttt 195  Q
           |||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||||| | || ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9098473 -------atataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgtttt 9098560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17106000 - 17105854
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctga-attatatgatttgatgttgtta 99  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||    
T  17106000 cacgagttgttgtgagttgatccttggggtagggaatgaagttgtttatattactgttgttgtt-cagtaaccctgacataaaatgaattgatgttgtta 17105902  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 147  Q
    |||| ||||||||  |||||||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  17105901 ataacgtgatatagttgtatatgaattatgtgaattatgtatgatgtt 17105854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 28496327 - 28496482
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||   |||||| || |||||| | |    
T  28496327 cacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgctta 28496426  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgtt 156  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||| ||||    
T  28496427 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgtt 28496482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 29808738 - 29808893
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||   |||||| || |||||| | |    
T  29808738 cacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgctta 29808837  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgtt 156  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||| ||||    
T  29808838 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgtt 29808893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1561569 - 1561384
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatg-atttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||  | || ||||||| ||||   ||||| |||| |||||| |     
T  1561569 cacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgctt 1561470  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||   ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  1561469 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcgatattattatatcatga 1561384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 23527959 - 23528106
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattat-atgatttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||| | |||  |||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  23527959 cacgagttgtggtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatgttactgttgttgct-cagagagcctgaaataagatgatttgatgttgata 23528057  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
     ||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23528058 gtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 23528106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Original strand, 18896252 - 18896355
Alignment:
Q  85 gatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatca 184  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||  | ||||||||||||||||     
T  18896252 gatttaatgttgttagtaatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattgtcattgatattgttatatct 18896351  T
Q  185 tgaa 188  Q
    ||||    
T  18896352 tgaa 18896355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23539236 - 23539090
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||  || || | ||||||| |||||  |||    
T  23539236 cacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaataaagttgtttatattacagttgttgtttcagtaagtttg-ataagatgatttaatgttaataa 23539138  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||| ||||||||  |||| ||||||||  || ||||||||||||||||    
T  23539137 taaggtgatatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgttt 23539090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25644508 - 25644405
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||||    
T  25644508 atgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttat 25644409  T
Q  181 atca 184  Q
    ||||    
T  25644408 atca 25644405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 27333138 - 27333217
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27333138 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaatt 27333217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 27393878 - 27393957
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27393878 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaatt 27393957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 156
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227519
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgtt 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgtt 8227519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18453373 - 18453242
Alignment:
Q  78 attatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattg 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||| |||    
T  18453373 attatatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgattttg 18453274  T
Q  177 ttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  18453273 ttatatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 18453242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4477012 - 4476884
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  4477012 atataatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 4476913  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  4476912 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 4476884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19362611 - 19362506
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatat 182  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| || ||||||  || |||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  19362611 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaagatgttcaagttgttgttgattgtcattgatattgttatat 19362512  T
Q  183 catgaa 188  Q
    | ||||    
T  19362511 cttgaa 19362506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20136855 - 20136755
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttata 181  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  20136855 atgatttgatgttgttagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttata 20136757  T
Q  182 tc 183  Q
    ||    
T  20136756 tc 20136755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Original strand, 22196014 - 22196114
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttata 181  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  22196014 atgatttgatgttgttagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttata 22196112  T
Q  182 tc 183  Q
    ||    
T  22196113 tc 22196114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23838362 - 23838234
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  23838362 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 23838263  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  23838262 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 23838234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 15817454 - 15817521
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15817454 atatgatttgatgttgttagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 15817521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 19773475 - 19773578
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  19773475 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttcttgattatcatttgatattgtta 19773574  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  19773575 tatc 19773578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23415072 - 23414969
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||  ||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  23415072 atatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 23414973  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  23414972 tatc 23414969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23538996 - 23538881
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttata 181  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||  | || | |||||| |  |||||||||||||||    
T  23538996 atgaattgatgttgttgttaatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatgttgattgtcatttgatattgttata 23538897  T
Q  182 tcatgaactgttttat 197  Q
    |||||| |||||||||    
T  23538896 tcatgagctgttttat 23538881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25754992 - 25754887
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  25754992 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 25754894  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  25754893 tgtcatg 25754887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456797
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  18456901 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 18456803  T
Q  181 atcatg 186  Q
     |||||    
T  18456802 gtcatg 18456797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 20556873 - 20556929
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20556873 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 20556929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22782410 - 22782356
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22782410 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 22782356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 2291163 - 2291264
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  2291163 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 2291261  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  2291262 atg 2291264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8055208 - 8055107
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  8055208 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 8055110  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  8055109 atg 8055107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12742496 - 12742395
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  12742496 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 12742398  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  12742397 atg 12742395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 18334575 - 18334676
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  18334575 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 18334673  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  18334674 atg 18334676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19005225 - 19005124
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  19005225 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 19005127  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  19005126 atg 19005124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 19858902 - 19859003
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  19858902 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 19859000  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  19859001 atg 19859003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 182
Target Start/End: Original strand, 20556791 - 20556893
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||||| || |||||| ||||||    
T  20556791 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgtta 20556890  T
Q  180 tat 182  Q
    |||    
T  20556891 tat 20556893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24422726 - 24422625
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  24422726 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 24422628  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  24422627 atg 24422625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 26924623 - 26924724
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  26924623 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 26924721  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  26924722 atg 26924724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 30676693 - 30676794
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||    
T  30676693 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatc 30676791  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  30676792 atg 30676794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33861973 - 33861872
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  33861973 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 33861875  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  33861874 atg 33861872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33864457 - 33864356
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  33864457 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 33864359  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  33864358 atg 33864356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27556830 - 27556749
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgat 162  Q
    |||||||||  ||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  27556830 atatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgat 27556749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 19847929 - 19847984
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  19847929 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 19847984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 14979320 - 14979387
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  14979320 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 14979387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Original strand, 15705376 - 15705479
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||| |||||||||| |  |||||| |||||  ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  15705376 atatggtttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 15705475  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  15705476 tatc 15705479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22806119 - 22806017
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  22806119 atatgatttaatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-agttgttgttgattatcatttgatattgtta 22806021  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  22806020 tatc 22806017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25752904 - 25752838
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 147  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  25752904 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25755074 - 25754972
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || || | |||||| || |||||| ||||||    
T  25755074 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgtta 25754975  T
Q  180 tat 182  Q
    |||    
T  25754974 tat 25754972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34963552 - 34963451
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  34963552 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 34963454  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  34963453 atg 34963451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Original strand, 1540894 - 1540946
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1540894 atttgatgttgtta-tattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatat 1540946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 139
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852052
Alignment:
Q  87 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3852001 tttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 3852052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 725 - 597
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttat 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  725 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttat 626  T
Q  181 atcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||    
T  625 atcatgaactgttttatgtattgtctatg 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25290 - 25167
Alignment:
Q  85 gatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatca 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25290 gatttgatgttgt-aataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcattgatatcgttatatca 25192  T
Q  185 tgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  25191 tgagctgttttatatactgcctatg 25167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6381 - 6335
Alignment:
Q  80 tatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6381 tatatgatttggtgttgttaataatgtgatat-attgtatatgcatta 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 136221 - 136429
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatga-tttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||      
T  136221 acgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgt 136320  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  136321 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgt 136419  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  136420 actgcctatg 136429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Original strand, 144929 - 145137
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatga-tttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||      
T  144929 acgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgt 145028  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  145029 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgt 145127  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  145128 actgcctatg 145137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 7929 - 8134
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7929 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgtt---gtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttga 8025  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttg-ctttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 199  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  8026 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatg-ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtat 8124  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  8125 actgcctatg 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 77
Target Start/End: Original strand, 29135 - 29209
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctga 77  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    
T  29135 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 29209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8283 - 8097
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||      
T  8283 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgt 8184  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8183 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7073 - 6893
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||| || |||||||| |||||    
T  7073 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataat 6974  T
Q  105 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||   ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  6973 gttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatga 6893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10795 - 10608
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||      
T  10795 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgt 10696  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  10695 taatgtcatataattgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 10608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32803 - 32618
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||      
T  32803 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgt 32704  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatg 186  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  32703 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatg 32618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13034 - 12847
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  13034 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttat 12935  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  12934 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 12847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 53401 - 53588
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | ||||||||||||||||| |    
T  53401 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgttta 53500  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  53501 taatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 53588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 147
Target Start/End: Original strand, 103492 - 103637
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  103492 acgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgtt 103591  T
Q  102 aatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 147  Q
    ||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  103592 aatgttatgtagttgtatatacattacatgaattatgtatgatgtt 103637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22423 - 22366
Alignment:
Q  91 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22423 atgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgttt 22366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11323 - 11266
Alignment:
Q  91 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  11323 atgttattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgttt 11266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 10394 - 10581
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  10394 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 10493  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  10494 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 10581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 130173 - 129986
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  130173 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 130074  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
     ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  130073 caatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 129986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 60649 - 60776
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttata 181  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  60649 atgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattgatattggtata 60748  T
Q  182 tcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  60749 tcatgagctgttttgtatactgcctatg 60776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 835 - 768
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  835 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8737 - 8548
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |    
T  8737 cacgagttgatgtgaattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgttta 8638  T
Q  101 taatgtgatata--aatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8637 taatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 8548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6798 - 6616
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||    
T  6798 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttg-ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 6700  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6699 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 6616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 7917 - 8123
Alignment:
Q  7 ttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgt 106  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7917 ttgatgtgagttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgt 8016  T
Q  107 gatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattg-atttgctttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgc 204  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||   ||||||    
T  8017 gatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgc 8116  T
Q  205 ctatgct 211  Q
    |||||||    
T  8117 ctatgct 8123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Original strand, 2603 - 2667
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  2603 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 2667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 40027 - 40214
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||     
T  40027 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttg 40126  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  40127 ttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 40214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 100642 - 100455
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||     
T  100642 cacgagttgatgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttg 100543  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
     |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | | || ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  100542 ttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgt-taatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatga 100455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 105268 - 105201
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  105268 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgttt 105201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 94590 - 94489
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  94590 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 94492  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  94491 atg 94489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 101661 - 101618
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttg 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  101661 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttg 101618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 17423 - 17524
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  17423 atttgatgttgtta-tactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 17521  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  17522 atg 17524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12836 - 12650
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |  | ||| ||||||||||||| |    
T  12836 cacgagtggatgtgagttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgttta 12737  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 186  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12736 taatgtgatataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 12650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 160951 - 160765
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  160951 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 160852  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||| | |||| ||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  160851 taatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatga 160765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Original strand, 85559 - 85612
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  85559 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 85612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 501263 - 501162
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  501263 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 501165  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  501164 atg 501162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 2071 - 2258
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||     
T  2071 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttg 2170  T
Q  100 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2171 ttaatggtatataattgtatatacattatatgaattat-gctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 2258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 5980 - 6163
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  ||||    
T  5980 agttgatgttagttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaat 6079  T
Q  105 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  6080 gttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatga 6163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 395 - 210
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||| || ||||   |||||| ||||||||||| ||    
T  395 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactgagttg-ttatcttgctgttgttgttctagtgagactgatacatatgaattgatgttgtttat 297  T
Q  102 aatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  296 aatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19528 - 19345
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||  |||    
T  19528 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaa 19429  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19428 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 19345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1350 - 1195
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||      
T  1350 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgt 1251  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgtt 156  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| |||||    
T  1250 taatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgtt 1195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6879 - 6732
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||      
T  6879 cacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgt 6780  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  6779 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgttt 6732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14259 - 14112
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||      
T  14259 cacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgt 14160  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  14159 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgttt 14112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5906 - 5724
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||    
T  5906 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttt-ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 5808  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5807 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 5724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 2502 - 2685
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  |||    
T  2502 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 2601  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  2602 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatga 2685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 144
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||  |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  290 cacgagttgttgtgagtcgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatattactattgttgtt-cagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaa 192  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  191 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgttt 144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 68 - 1
Alignment:
Q  55 tgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgc 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  68 tgttgttgttt-agtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 45645 - 45832
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| || ||||  ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  45645 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 45744  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||||||||||  ||| || | || ||||||||||||||||||    
T  45745 taatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatga 45832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22527 - 22710
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||  ||||| |||| ||||||| ||||   ||||    |||||||||| |    
T  22527 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgcatat----tgatgttgttta 22622  T
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  22623 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 22710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 82255 - 82150
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  82255 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 82157  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  82156 tgtcatg 82150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 14554 - 14737
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataa 103  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| ||  |||    
T  14554 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaa 14653  T
Q  104 tgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    ||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||||||||||    
T  14654 tggtatataatagtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatga 14737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 2657 - 2846
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||||     
T  2657 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttg 2756  T
Q  100 ataatgtgata--taaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
     |||||  |||  |  || ||||| ||||  |||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2757 ttaatggtataattgtatatatatacattttatgaatta-agctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 2846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 892 - 1074
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||||||||  ||||    
T  892 agttgatgttagttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgta-aatctaatgttgttgctaat 990  T
Q  105 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 187  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  991 gttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatga 1074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 225593 - 225491
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttata 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||    
T  225593 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgattgcatttgatattattata 225494  T
Q  182 tca 184  Q
    |||    
T  225493 tca 225491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Original strand, 221143 - 221199
Alignment:
Q  84 tgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 140  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||    
T  221143 tgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatata 221199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 16034 - 16139
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  16034 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttat 16133  T
Q  181 atcatg 186  Q
    ||||||    
T  16134 atcatg 16139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13316 - 13210
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13316 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 13217  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    |||||||    
T  13216 tatcatg 13210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 132919 - 132814
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  132919 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 132820  T
Q  101 taatgt 106  Q
    ||||||    
T  132819 taatgt 132814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 62455 - 62308
Alignment:
Q  9 gatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaataatgtg 107  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||| ||||  ||||||     
T  62455 gatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgtt 62356  T
Q  108 atataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgtt 156  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||    
T  62355 atataattgtatatacattatatgaattatgt-tgatatttgagatgtt 62308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 134390 - 134289
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  134390 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 134292  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  134291 atg 134289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 136859 - 136758
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  136859 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 136761  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  136760 atg 136758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 139328 - 139227
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  139328 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 139230  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  139229 atg 139227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 141797 - 141696
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  141797 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 141699  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  141698 atg 141696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 144266 - 144165
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  144266 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 144168  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  144167 atg 144165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 15685 - 15766
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15685 cacgagttgatgtgagttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattat 15766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 142770 - 142706
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  142770 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 142706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 27683 - 27788
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  27683 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttat 27782  T
Q  181 atcatg 186  Q
    ||||||    
T  27783 atcatg 27788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 28664 - 28775
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  28664 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 28763  T
Q  101 taatgtgatata 112  Q
    |||||| |||||    
T  28764 taatgttatata 28775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 187
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18067
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| || | |||| || |||||| ||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 18060  T
Q  181 atcatga 187  Q
    |||||||    
T  18061 atcatga 18067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Original strand, 2108 - 2161
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  2108 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 32345 - 32254
Alignment:
Q  15 agttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgt 106  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |||||||    
T  32345 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 32254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11577
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgtt 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgtt 11577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 156
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38264
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgtt 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgtt 38264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 188
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26118
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcat 185  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||  || |||| ||||||  | |||||||||||||||| |    
T  26016 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttgttgattgtccttgatattgttatatctt 26115  T
Q  186 gaa 188  Q
    |||    
T  26116 gaa 26118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 16861 - 16958
Alignment:
Q  91 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcatgaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||  || |||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttgttgttgattgtcattgatattgttatatcttgaa 16958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 11555 - 11426
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||  ||||  ||||  |||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  11555 cgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgttaatgttcaagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 11456  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  11455 atgttatataatagtatatacattacatga 11426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2231 - 2131
Alignment:
Q  32 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatg 131  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  2231 agaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatg 2132  T
Q  132 a 132  Q
    |    
T  2131 a 2131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 183
Target Start/End: Original strand, 675 - 796
Alignment:
Q  64 ttcagtaagcctga-attatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgat 162  Q
    |||||||||||||| || || |||| |||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||    
T  675 ttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttgatagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgat 774  T
Q  163 t-tgctttgatattgttatatc 183  Q
    | |  |||||||||||||||||    
T  775 tatcttttgatattgttatatc 796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2082 - 1954
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  2082 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 1983  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  1982 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 1954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36368 - 36240
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || |||  |||||| |  |||||||||||||    
T  36368 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgtcgttgattatcatttgatattgtta 36269  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  36268 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 36240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 183
Target Start/End: Original strand, 75763 - 75864
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttata 181  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||  || |||||||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  75763 atgatttgatgttgttagtaatgtgataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttata 75862  T
Q  182 tc 183  Q
    ||    
T  75863 tc 75864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 110841 - 110713
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || |||||||| |  |||||||||||||    
T  110841 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgtta 110742  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  110741 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 110713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10594
Alignment:
Q  91 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10651 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgttt 10594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Original strand, 604 - 661
Alignment:
Q  91 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  604 atgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgttt 661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 15924 - 15795
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  || | ||||||| |||| |  |||||  | |||||| | |||    
T  15924 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgcttata 15825  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  15824 atgttatataattgtatatacattacatga 15795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1127 - 1063
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  1127 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 1063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3145 - 3081
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  3145 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 3081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7618 - 7554
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  7618 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 7554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14737 - 14673
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  14737 atatgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg 14673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 538
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  605 atataatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8219 - 8152
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8219 atatgatttgatgtcattagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgttt 8152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17690 - 17564
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  17690 atatgatttgaagttgttggtaatgtgatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 17591  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgccta 207  Q
    |||| |||  || |||||||||||||||    
T  17590 tatcttgagatg-tttatgtactgccta 17564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39440 - 39337
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||  ||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  39440 atatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 39341  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  39340 tatc 39337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 126143 - 126040
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  126143 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 126044  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  126043 tatc 126040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 184
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  289 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 191  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  190 tgtcatg 184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 371 - 269
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||||| || |||||| ||||||    
T  371 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgatgttgattatgatttgatgttgtta 272  T
Q  180 tat 182  Q
    |||    
T  271 tat 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6210 - 6156
Alignment:
Q  94 ttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  6210 ttgttaataatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgttt 6156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12241 - 12136
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||    
T  12241 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 12143  T
Q  180 tatcatg 186  Q
    | |||||    
T  12142 tgtcatg 12136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 38639 - 38741
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-gatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||  || |||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  38639 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatc 38738  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  38739 atg 38741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 57999 - 57897
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgctttgatattgttatatcat 185  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||  |||||  || |||| ||||||  | |||||||||||||||| |    
T  57999 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaaatgttcaagttgttgttgattgtcattgatattgttatatctt 57900  T
Q  186 gaa 188  Q
    |||    
T  57899 gaa 57897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 133104 - 132990
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||  || |||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||||||||||    
T  133104 atatgatttgatgttgttagtaataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtta 133005  T
Q  180 tatcatgaactgttt 194  Q
    |||| |||| |||||    
T  133004 tatcttgaaatgttt 132990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 2156 - 2261
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaa 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |  ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| |    
T  2156 cacgagtggatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgatcttatcccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttta 2255  T
Q  101 taatgt 106  Q
    ||||||    
T  2256 taatgt 2261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Original strand, 6092 - 6220
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||| ||||||    
T  6092 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgtta 6191  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  6192 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 139
Target Start/End: Original strand, 19576 - 19637
Alignment:
Q  78 attatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  19576 attatgtgatttgatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 19637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21354 - 21226
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  |||||||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  21354 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 21255  T
Q  180 tatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |||| |||  || ||||||| |||||||||    
T  21254 tatcttgagatg-tttatgtgctgcctatg 21226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30461
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatata 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  30518 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 30461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 2425 - 2492
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  2425 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 9654 - 9721
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  9654 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgttt 9721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4056 - 3989
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  4056 atatgatttgatgttgttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 3989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 18100 - 18167
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  18100 atatgatttgatattgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 18167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17761 - 17658
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||  ||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  17761 atatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 17662  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  17661 tatc 17658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 55617 - 55684
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  55617 atatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgttt 55684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31311 - 31208
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||  ||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| || ||| |  |||||||||||||    
T  31311 atatgatttagtgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtttattatcatttgatattgtta 31212  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  31211 tatc 31208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20938 - 20835
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||  |  |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  20938 atatgatttgatgttaatggtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 20839  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  20838 tatc 20835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 206459 - 206585
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgttata 181  Q
    ||||||| || |||||| |||||| |||||  |||||||||||||  || |||||| | |||| || || |||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  206459 atgatttaatattgttagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttata 206557  T
Q  182 tcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||    
T  206558 tcttgagatgttttatgtactgcctatg 206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20926 - 20825
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  20926 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 20828  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  20827 atg 20825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14126 - 14025
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  14126 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 14028  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  14027 atg 14025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38000 - 37899
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  38000 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 37902  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  37901 atg 37899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2778 - 2736
Alignment:
Q  167 tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2778 tttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatg 2736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 194
Target Start/End: Original strand, 24530 - 24644
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || | |||||| |  |||||| ||||||    
T  24530 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtta 24629  T
Q  180 tatcatgaactgttt 194  Q
    |||| |||| |||||    
T  24630 tatcttgaaatgttt 24644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158534
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  158433 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 158531  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  158532 atg 158534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Original strand, 1259 - 1315
Alignment:
Q  82 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  1259 tatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 1315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 34384 - 34268
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataat 104  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||  | || ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||||    
T  34384 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 34285  T
Q  105 gtgatataaatgtatat 121  Q
    || |||||| |||||||    
T  34284 gttatataattgtatat 34268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16966 - 16911
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16966 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 16911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79319
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  79264 atgatttgatgttgtta-tattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatat 79319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 85713 - 85669
Alignment:
Q  101 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 145  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  85713 taatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatg 85669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1040 - 937
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatt-tgctttgatattgtta 179  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||  | |||||| ||||  ||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |  |||||||||||||    
T  1040 atatgatttgatgttgatggtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtta 941  T
Q  180 tatc 183  Q
    ||||    
T  940 tatc 937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 347 - 280
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  347 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgttt 280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 29356 - 29423
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  29356 atatgatttgaggttgttagtaatgtgatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgttt 29423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1884 - 1834
Alignment:
Q  87 tttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  1884 tttgatgttgttaatgatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 1834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4873 - 4772
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  4873 atttgatgttgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 4775  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  4774 atg 4772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13470
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  13571 atttgatgttgtta-tactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 13473  T
Q  184 atg 186  Q
    |||    
T  13472 atg 13470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 149
Alignment:
Q  81 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 147  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  215 atatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9877
Alignment:
Q  85 gatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  9930 gatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatat 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 186
Target Start/End: Original strand, 20360 - 20463
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttat 180  Q
    ||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  20360 atgatttgatgtttt--atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 20457  T
Q  181 atcatg 186  Q
     |||||    
T  20458 gtcatg 20463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 137
Target Start/End: Original strand, 164570 - 164623
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 137  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  164570 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 164623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4396 - 4342
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  4396 atgatttgatgttgt--atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatat 4342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4479 - 4419
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgat 144  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4479 atgatttgatgatgtta-tattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgat 4419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 132
Target Start/End: Original strand, 2300 - 2429
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaata 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||| ||| || ||  |||| ||||||| ||||    ||||| || |||||| | |||    
T  2300 cgagtttatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttata 2399  T
Q  103 atgtgatataaatgtatatgcattacatga 132  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  2400 atgttatataattgtatatacattaaatga 2429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 40579 - 40531
Alignment:
Q  86 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt 135  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40579 atttgatgttgtta-tactgtgatataattgtatatgcattacttgaatt 40531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Original strand, 3090 - 3190
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcat 185  Q
    ||||||||| | || |||||||||||   |||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  3090 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 3189  T
Q  186 g 186  Q
    |    
T  3190 g 3190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10344 - 10284
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 148  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  10344 ttgatgttgttagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 10284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 30114 - 30059
Alignment:
Q  83 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 139  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  30114 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatat 30059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39658 - 39537
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcat 185  Q
    ||||||||| | || |||||||||||   ||| |||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  39658 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 39559  T
Q  186 gaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |  ||||||| | |||||||||||    
T  39558 g--ctgttttgtatactgcctatg 39537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28012 - 27912
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcat 185  Q
    ||||||||| | || |||||||||||   |||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  28012 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 27913  T
Q  186 g 186  Q
    |    
T  27912 g 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Original strand, 75154 - 75275
Alignment:
Q  88 ttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcat 185  Q
    ||||||||| | || |||||||||||   ||| |||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  75154 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 75253  T
Q  186 gaactgttttatgtactgcctatg 209  Q
    |  ||||||| | |||||||||||    
T  75254 g--ctgttttgtatactgcctatg 75275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University