View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4581-Insertion-8 (Length: 538)

Name: NF4581-Insertion-8
Description: NF4581
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4581-Insertion-8
NF4581-Insertion-8
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (11-537)||(26179472-26179998)
chr7 (17-489)||(26251285-26251757)
chr7 (14-491)||(26242835-26243312)
chr7 (11-458)||(26278167-26278611)
chr7 (12-491)||(26297883-26298362)
chr7 (64-537)||(26088171-26088644)
chr7 (64-537)||(26111959-26112432)
chr7 (92-512)||(26302223-26302643)
chr7 (62-525)||(26191666-26192129)
chr7 (54-531)||(19102822-19103299)
chr7 (54-513)||(26155601-26156060)
chr7 (11-322)||(26186853-26187163)
chr7 (11-512)||(26204299-26204800)
chr7 (11-512)||(26223937-26224437)
chr7 (62-531)||(26128962-26129431)
chr7 (92-309)||(26260489-26260706)
chr7 (92-302)||(26208035-26208245)
chr7 (90-302)||(26227596-26227808)
chr7 (358-531)||(26186637-26186810)
chr7 (358-499)||(26260299-26260440)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (14-508)||(44903671-44904165)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 26179998 - 26179472
Alignment:
Q  11 actatctcttccctcctcaccactttctctacattaatgttaatccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaa 110  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26179998 actatatcttctcttctcaccactttctctacattaatgttaatccataaattgttttcttttgctcctactgggacccctatcttcaaaacatcaacaa 26179899  T
Q  111 gcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26179898 gcaacttctcgttgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttcaagaattgagttccaaccacagtgagt 26179799  T
Q  211 cacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26179798 cacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaat 26179699  T
Q  311 tcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26179698 tcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcatatttttttataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaa 26179599  T
Q  411 gctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttcc 510  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26179598 gctgagcatgcggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatataatacagactcattttgctttgagttaagccaatttagccattcttcctcttttcc 26179499  T
Q  511 aagttcctctatgtgtccccttttggc 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26179498 aagttcctctatgtgtccccttttggc 26179472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 26251757 - 26251285
Alignment:
Q  17 tcttccctcctcaccactttctctacattaatgttaatccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaact 116  Q
    |||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26251757 tcttcccttctcaccacttcctcttcactaatattaatccataacttattttcttttgctcctactgggacccctatcttcaaaacatcaactagcaact 26251658  T
Q  117 tctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26251657 tctcattgtaaaattgctcagcaaacactggccacgtgatcattggcaaaccagcatttaagctttcaagagttgagttccaaccacaatgagtcacaat 26251558  T
Q  217 ccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgc 316  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26251557 tcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagttgtggtgcccaattccagatgatatagcccttgttgctttctttcatcctttcctcaaatttttgc 26251458  T
Q  317 aggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgag 416  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26251457 aaaaaaccttctccatcctcatctttatcatctttttttataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccatgtgcaatttctacaagctgag 26251358  T
Q  417 catgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatt 489  Q
    ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26251357 catgaggaagcctagtaaggctgccaaaacttacatacaatactgactcattttgcttcgagttaagccaatt 26251285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 26243312 - 26242835
Alignment:
Q  14 atctcttccctcctcaccactttctctacattaatgttaatccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagca 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||  ||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26243312 atctcttcccttctcaccatttcatctactgtaatgttcatccagaacttgtttacttttgctcctgctgggacccctatctttaaaacatcaacaagca 26243213  T
Q  114 acttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcac 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26243212 acttctcattgtaaaattgctcagaagacactggccacgtaatcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcac 26243113  T
Q  214 aatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattct 313  Q
    ||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26243112 aattcctcttgttgctgggtgatccaatatcagaagttgcggtgcccagtcccatatgatatagcccttgttgctttctttcatcctttcctcaaattct 26243013  T
Q  314 tgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagct 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||         ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26243012 tgcaggaaaccttctccatcctcaactttatcatctttttttataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccgtgagcaatttctacaagct 26242913  T
Q  414 gagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaattta 491  Q
    |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26242912 gagcatgaggaaacctagtctggctgccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcaggttaagccaattta 26242835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 26278611 - 26278167
Alignment:
Q  11 actatctcttccctcctcaccactttctctacattaatgttaatccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaa 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26278611 actatctcttcccttctcaccatttcctctacactaatgttagtccataacttgtttacttttgctccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaa 26278512  T
Q  111 gcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  26278511 gcaacttctcattgtaaaattcctcggcaaacactggccacgtgatcattggcaaaccagcatttacgctttcaagagttgagttccaaccacaatgagt 26278412  T
Q  211 cacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaat 310  Q
    ||||||||||||  |||||||||  || |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26278411 cacaatccctccgattgcagggtattccaatatcagcagttgtggtgcccaatcccatatgatgtagcccttgttgctttctttcatccttttctcaaat 26278312  T
Q  311 tcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |         ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26278311 tcttgcaggaaaccttctccatcctcatctttatta---ttttttataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccgtgtgcaatttctacaa 26278215  T
Q  411 gctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaata 458  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  26278214 gctgagcatgaggaagcctaataaggctgccaaagcttacatacaata 26278167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 26298362 - 26297883
Alignment:
Q  12 ctatctcttccctcctcaccactttctctacattaatgttaatccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaag 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26298362 ctatctcttcccttctcaccactttctctacactaatgtcaagccataacttgttttcttttgctccgactgggacccctatctttaaaacatcaacaag 26298263  T
Q  112 caacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26298262 caacttctcattgtaaaattgctcagcaaaaataggccatgtgatcattggcaaaccagcattcaagctttcgagagttgagttccaaccacaatgagtc 26298163  T
Q  212 acaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaatt 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  26298162 acaattcctcctgttgcagggtggtccaatatcagaagttgcggtgcccagtcccatatgatatagcccttgctgctttctttaatcctttcctcaaatt 26298063  T
Q  312 cttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaag 411  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||         ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26298062 cttgcagaaaaccttctccatcctcatctgtatcatccctttttataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccatgaacaatttctacaag 26297963  T
Q  412 ctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaattta 491  Q
    |||||||| ||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26297962 ctgagcataaggaagcctagtaaagctgccaaaacttacatacaatacagattcattttccttcgaattaagccaattta 26297883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 64 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 26088644 - 26088171
Alignment:
Q  64 gttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggc 163  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||    
T  26088644 gtttacttttgctccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttttcattgtaaaattgctcagcaaatattggccatgcgatcattggc 26088545  T
Q  164 aaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaat 263  Q
    ||||| |  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26088544 aaaccagcattcaagctttcaagaatcgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcaggatgatccaatatcagaagttgtggtgcccaat 26088445  T
Q  264 tccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataaccca 363  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   | | ||   |||||  | |||         | ||||||    
T  26088444 tccatatgatatagccctttttgctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaagtgttttcactctcatccctctcatatttccttacaaccca 26088345  T
Q  364 gataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagac 463  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |  || |||||  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  26088344 gataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctaattagacttccaaaacttacatacaatacggac 26088245  T
Q  464 tcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtccccttttggc 537  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26088244 tcattttcctttgagttaagccaatttagccactcttcctcttttccaagctcctctatgtgtcccctattggc 26088171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 64 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 26112432 - 26111959
Alignment:
Q  64 gttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggc 163  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||||||    
T  26112432 gtttacttttgctccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttttcattgtaaaattgctcagcaaatattggccatgcgatcattggc 26112333  T
Q  164 aaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaat 263  Q
    ||||| |  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26112332 aaaccagcattcaagctttcaagaatcgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcaggatgatccaatatcagaagttgtggtgcccaat 26112233  T
Q  264 tccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataaccca 363  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   | | ||   |||||  | |||         | ||||||    
T  26112232 tccatatgatatagccctttttgctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaagtgttttcactctcatccctctcatatttccttacaaccca 26112133  T
Q  364 gataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagac 463  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |  || |||||  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  26112132 gataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctaattagacttccaaaacttacatacaatacggac 26112033  T
Q  464 tcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtccccttttggc 537  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26112032 tcattttcctttgagttaagccaatttagccactcttcctcttttccaagctcctctatgtgtcccctattggc 26111959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 92 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26302643 - 26302223
Alignment:
Q  92 atcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattg 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |  ||||  ||||| |||||||    
T  26302643 atcttcaaaacatcaacaagaaacttctcgttgttaaattgctcagcaaaaatgggccatgtgatcattggcaaaccagcattcaagctttcgagaattg 26302544  T
Q  192 agttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttc 291  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26302543 agttccaacaacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatattagaagctgcggtgcccaattccatatgatatagccttttttgctttc 26302444  T
Q  292 tttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagc 391  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||         |  ||||| |||||| | |||||||| |||||||||    
T  26302443 tttcatcctttcctcaaatacttgcaggaaaccttcttcatcctcatttctatcatattttcgtacgacccaaataaaactatgacctgaattttcaagc 26302344  T
Q  392 ccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaattta 491  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26302343 ccgtgtgcaatttctacaagctgagcatgaggatgccaaacaaggctgccaaaacttacatacaatacagactcattttgctttgagttaagccaattta 26302244  T
Q  492 accattcttcctcttttccaa 512  Q
     | |||||   ||||||||||    
T  26302243 ccaattctgtttcttttccaa 26302223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 62 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26192129 - 26191666
Alignment:
Q  62 ttgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattg 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  26192129 ttgttttcttttgctccaactcggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcggcaaacattggccacgcgatcattg 26192030  T
Q  162 gcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgccca 261  Q
    ||||||| |  ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||    
T  26192029 gcaaaccagcattcaagctttcaagaatcgagttccaaccacagtgagtcacaattccacctgttgcagggtgatccaatatctgaagctgtggtgccca 26191930  T
Q  262 attccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacc 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||  | | ||   |||||  |||||         | ||||    
T  26191929 attccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttccctcaaaatcttgtaggaaactgttttcactctcatccatatcatttttccttacaacc 26191830  T
Q  362 cagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacag 461  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  | ||||   |  || ||||| |||||||| | |||||    
T  26191829 cagataaaattatgacctgaattttcaagcccatgtgcaatttctacaagctgagcatgagttagcctagttaaacttccaaagcttacataaagtacag 26191730  T
Q  462 actcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtg 525  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||   |||||||||||    
T  26191729 actcattttgctttgagttaagccaatttagccactctgccacttttccattctcctctatgtg 26191666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 54 - 531
Target Start/End: Original strand, 19102822 - 19103299
Alignment:
Q  54 tccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgt 153  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||    
T  19102822 tccataacttgtttacttttgctcctactccgacccctatcttcaaaacatcgacgagcaacttttcattgtaaaactgctcagcaaaaattggccatgt 19102921  T
Q  154 gatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgt 253  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19102922 gatcattggcaaacccgaattcaagctttcgagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagttgc 19103021  T
Q  254 gatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnn 353  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||  | | ||   |||||| | |||           
T  19103022 ggtgcccaattccatatgatatatccctttttgctttctttcatccttgcctcaaaatcttgtagaaaactgttttcactctcatctctctcatttttcc 19103121  T
Q  354 nnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacata 453  Q
      | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||| |||    || ||||   || || ||||||||||||||    
T  19103122 ttacaacccagataaaattatgacctgaattttcaagaccgtgtgcgatttctacaatctgatcattttcaagcctagttagacttccaaaacttacata 19103221  T
Q  454 caatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtcccct 531  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||    
T  19103222 caatacagactcattttgctttgagttaagccaatttagccactcttcctcttttccgatctcctctacgtgccccct 19103299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 54 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26156060 - 26155601
Alignment:
Q  54 tccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgt 153  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||    
T  26156060 tccataacttattttcttttgctccaactgggaccgctatcttcaaaacatcaacaagcaacttttcattgtaaaattgatcaccaaacattggccatgt 26155961  T
Q  154 gatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgt 253  Q
     |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26155960 aatcattggcaaaccagaattcaagctttcgagagttgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgt 26155861  T
Q  254 gatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnn 353  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   | | ||   |||||  | ||            
T  26155860 ggtgcccaattccatatgatatatccctttttgctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaagtgttttcactctcatcgctctcctttttcc 26155761  T
Q  354 nnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacata 453  Q
      | ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||   || || ||||||||||||||    
T  26155760 ttacaacccagataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctagttagacttccaaaacttacata 26155661  T
Q  454 caatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaag 513  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26155660 caatacggactcattttgctttgtgttaagccaatttaaccactcggcctcttttccaag 26155601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26187163 - 26186853
Alignment:
Q  11 actatctcttccctcctcaccactttctctacattaatgttaatccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaa 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26187163 actatctcttcccttctcaccatttcatctacactaatgttaatctagaacttgttttcttttgctcctacttggacccctatcttcaaaacatcaacaa 26187064  T
Q  111 gcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26187063 gcaacttctcattgtaaaattgctcctcagacattggccatgtgatcattggcaaacccgagttcacgctttccagaattgagttccaacaacagtgagt 26186964  T
Q  211 cacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| ||||||     
T  26186963 cacaatccctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggtgcccaattccatatgatatatccctttttgctttctttcattcttt-ctcaaaa 26186865  T
Q  311 tcttgcaggaaa 322  Q
    ||||| ||||||    
T  26186864 tcttgtaggaaa 26186853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26204800 - 26204299
Alignment:
Q  11 actatctcttccctcctcaccactttctctacattaatgttaatccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaa 110  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |||| ||  |||| ||| ||| || | |||  ||||||  ||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  26204800 actatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaagccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaa 26204701  T
Q  111 gcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagt 210  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26204700 gcagcttctcattgtaaaattgttcagcaaatattggccatgttatcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagt 26204601  T
Q  211 cacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaat 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  26204600 cacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaa 26204501  T
Q  311 tcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaa 410  Q
    |||  ||| ||||||||| || | |||||||||||          | |||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||  |||    
T  26204500 tctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctctaacaacccaaatgaaattatgaccagaattttcaagaccatgagctatttcagcaa 26204401  T
Q  411 gctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttcc 510  Q
     |||  |||||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  26204400 tctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatacaacacagactcgttttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttcc 26204301  T
Q  511 aa 512  Q
    ||    
T  26204300 aa 26204299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26224437 - 26223937
Alignment:
Q  11 actatctcttccctcctcaccactttctctacattaatgttaatccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaa 110  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |||| ||  |||| ||| ||| || | |||  ||||||  ||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  26224437 actatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaagccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaa 26224338  T
Q  111 gcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagt 210  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26224337 gcagcttctcattgtaaaattgttcagcaaatattggccatgttatcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagt 26224238  T
Q  211 cacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaat 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  26224237 cacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaa- 26224139  T
Q  311 tcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaa 410  Q
    |||  ||| ||||||||| || | |||||||||||          | |||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||  |||    
T  26224138 tctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctctaacaacccaaatgaaattatgaccagaattttcaagaccatgagctatttcagcaa 26224039  T
Q  411 gctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttcc 510  Q
     |||  |||||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  26224038 tctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatacaacacagactcgttttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttcc 26223939  T
Q  511 aa 512  Q
    ||    
T  26223938 aa 26223937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 62 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 26129431 - 26128962
Alignment:
Q  62 ttgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattg 161  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||   ||||| || |||||||    
T  26129431 ttgttttcttttgctcctactgaaacccctatcttcaaaacatcaacgagcaacttttcattgtaaaattgatcgccaaaccttggccatgtaatcattg 26129332  T
Q  162 gcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgccca 261  Q
    ||||||| |  || |  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| || || |||| ||||||    
T  26129331 gcaaaccagcatttaagctttcgagagttgagttccaaccacaatgagtcacaattcctcctatggcagggtgatccaatataaggagctgtggtgccca 26129232  T
Q  262 attccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   | | ||   |||||  | ||          | ||||    
T  26129231 attccatatgatatagcccttttttctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaattgttttcactctcatcgctctcctttttccttacaacc 26129132  T
Q  362 cagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacag 461  Q
    || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||   || || |||||||||||||||| ||| |    
T  26129131 catataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctagttagacttccaaaacttacatacagtacgg 26129032  T
Q  462 actcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtcccct 531  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26129031 actcattttgctttgagttaagccaatttaaccagtctgcctcttttccaagctcctctatgtgtcccct 26128962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 92 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 26260706 - 26260489
Alignment:
Q  92 atcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  26260706 atcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacattggccatgcaatcattggcaaacccgagttcaagctttcaagaattg 26260607  T
Q  192 agttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttc 291  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26260606 agttccatccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatataaggagctgtggtgcccaattccatatgatatagccctttttgctttc 26260507  T
Q  292 tttcaacctttcctcaaa 309  Q
    ||||| ||||| ||||||    
T  26260506 tttcatcctttgctcaaa 26260489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 92 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26208245 - 26208035
Alignment:
Q  92 atcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||| || |||||     | |  ||||| |||||||    
T  26208245 atcttcaaaacatcaacaagcaatttctcattgtaaaattgctcagcaaacattggccatgcaatcatgggtaaaccaacactaaggctttcaagaattg 26208146  T
Q  192 agttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttc 291  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  26208145 aattccaaccacaatgagtcactatccctcctgttgcagggtggcctaatatgagaagctgtggtgcccaattccatatgatatatccctttttgttttc 26208046  T
Q  292 tttcaaccttt 302  Q
    ||||| |||||    
T  26208045 tttcatccttt 26208035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26227808 - 26227596
Alignment:
Q  90 ctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaat 189  Q
    ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || || ||||||||||      |||  ||||| |||||    
T  26227808 ctatcttcaaaacaaaaacaagaagcttctcattgtaaaactgctccgcaaacattggccatgtaataattggcaaactaacactcaagctttcaagaat 26227709  T
Q  190 tgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctt 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  26227708 tgagttccaaccacaatgagtcactacccctgctgttgcagggtgacctaatatgagaagttgtggtgcccaattccatatgatatatccctttttgttt 26227609  T
Q  290 tctttcaaccttt 302  Q
    ||||||| |||||    
T  26227608 tctttcatccttt 26227596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 26186810 - 26186637
Alignment:
Q  358 aacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaat 457  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |  || ||||   |  || |||||||||| ||||| |    
T  26186810 aacccagataaaattatgatctgaattttcaagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctagttacacttccaaaacttaaatacagt 26186711  T
Q  458 acagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctcttttccaagttcctctatgtgtcccct 531  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  26186710 acggactcaatttgctttgagttaagccaatttagccactcttcctcttctgcaagctcctccatgtgtcccct 26186637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 26260440 - 26260299
Alignment:
Q  358 aacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaat 457  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||||| || || ||||   | ||| |||||||||||||||||     
T  26260440 aacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctatttcaacaacctgagcataagaaagcctagtcaagcttccaaaacttacatacaac 26260341  T
Q  458 acagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattct 499  Q
    ||||| |||||  | || |||||||||||||||||| |||||    
T  26260340 acagaatcattagggttagagttaagccaatttaacaattct 26260299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 44904165 - 44903671
Alignment:
Q  14 atctcttccctcctcaccactttctctacattaatgttaatccataaattgttttcttttgccccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagca 113  Q
    ||||||||||| || |||| |  ||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44904165 atctcttcccttctaaccattgcctctacagtaaagctattccataacttgttttcttttgctccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagca 44904066  T
Q  114 acttctcattgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtgatcattggcaaacccgagttcacactttccagaattgagttccaaccacagtgagtcac 213  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||     | |  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44904065 acctctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtgatcattggcaaaccaacactaatgctttcaagagttgagttccaaccacagtgagtcac 44903966  T
Q  214 aatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtgatgcccaattccatatgatgtagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattct 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  44903965 aattcctcctgttgcagggtgatccaatatgagaagctgcggtgcccaattccatatgatatagcccttgttgctttctttcaccctttcctcaaaatct 44903866  T
Q  314 tgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcannnnnnnnnataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagct 413  Q
    ||||||||||||||  | |  || ||| |||||         | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44903865 tgcaggaaaccttcctcgttctcgtctctatcatttttccttacaacccagataaaattatgacctgacttttcaagcccatgtgcaatttctacaagct 44903766  T
Q  414 gagcatgaggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatacaatacagactcattttgcttcgagttaagccaatttaaccattcttcctctttt 508  Q
    ||||||||  || | ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||    
T  44903765 gagcatgaaaaagcttagtaaggcttccaaaacttacatacaacacagactcattttgctttgagttaagccaatttagcaattctctctctttt 44903671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University