View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4586-Insertion-2 (Length: 771)

Name: NF4586-Insertion-2
Description: NF4586
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4586-Insertion-2
NF4586-Insertion-2
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (275-742)||(3944519-3944986)
chr2 (8-154)||(3945107-3945254)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (395-744)||(16066372-16066719)
chr1 (415-742)||(46559523-46559851)
chr1 (412-745)||(16068677-16069007)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (401-741)||(4022351-4022689)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (401-742)||(36566057-36566384)
chr3 (401-742)||(36541940-36542267)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (415-742)||(20644995-20645324)
chr6 (417-630)||(3174977-3175189)
chr6 (651-744)||(3174877-3174970)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (415-568)||(33249173-33249325)
chr4 (672-745)||(25551987-25552060)
chr4 (651-742)||(33249007-33249095)
chr4 (401-548)||(25553427-25553573)
chr4 (686-745)||(25551785-25551844)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 275 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 3944986 - 3944519
Alignment:
Q  275 tgagagaggagagtactttggatcagaaagatcctatgtaagctgcatcctgtaaacttcagttaggttgttagttttactagtgtcccgtgcaacgcac 374  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   |||     
T  3944986 tgagagaggagagtactttg-atcagaaagatcctatgtaagctgcatcctgcaaacttcagttaggttgttagttttactagtgtcccaacccgtgcaa 3944888  T
Q  375 -ggttcgtgacattttaaacactatgatttgattaccgagacgaaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcag 473  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3944887 tggttcgtaacattttaaacactatgatttgattacagagatgaaattaatttttaatcaaagttaaaaacgacaataacaaactaattctacaatgcag 3944788  T
Q  474 cagaaattatgtcatgattataattattcacggttgtcgtcaattcaagataaatattattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatcacaacaac 573  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944787 tagaaattatgtcatgattataattattcacggttgtcgtcaattcaagataaatatcattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatcacaacaac 3944688  T
Q  574 acacatacacattaaactcaccaaaagtcataaaagatatgtcccaatatccaattagtcttccaaactnnnnnnngcaaaggacatattacaccaactt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  3944687 acacatacacattaaactcaccaaaagtcgtaaaagatatgtctcaatatccaattagtcttccaaactaaaaaaaacaaaggacatattacaccaactt 3944588  T
Q  674 ctatttatattacataatacatataattcaaaagtaagcataaaaacgatatacaaacatccactaaaa 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3944587 ctatttatattacataatacatataattcaaaagtaagcataaaaacgatagacaaacatccactaaaa 3944519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3945254 - 3945107
Alignment:
Q  8 caagcttctaatattggttcatcagttacttctttgatctagagtgaacaataaacttaatcctcagttcaagttcaaggtcatc-ttaatttggtacct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3945254 caagcttctaatattggttcatcagttacttctttgatctagagtgaacaataaactcaatcctcagttcaagttcaaggtcatctttaatttggtacct 3945155  T
Q  107 ttgtttagctttacttattaggcttctctgtcttgttactattactac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3945154 ttgtttagctttacttattaggcttctctatcttgttactattactac 3945107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 395 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 16066719 - 16066372
Alignment:
Q  395 ctatgatttgattaccgagacgaaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcagcagaaattatgtcatgattat 494  Q
    |||||||||||| ||  || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||    
T  16066719 ctatgatttgatcacaaaggcggaattaatttttaatcaaagttaaaaacgacaatgacaaactaattctgcattgcggtagaaattatgtcataattat 16066620  T
Q  495 aattattcacggttgtcgtcaattcaagataaatattattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatcacaacaacacacatacacattaaactcac 594  Q
      |||||||  |||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  16066619 gtttattcattgttgccgtcaattcaagataaataccattaattaacaatagctgcgtgaacataataaccacaacaacacacaaacacattaaactcgc 16066520  T
Q  595 caaaagtcataaaagatatgtcccaatatccaattagtcttccaaactnnnnnnngcaaaggacatattacaccaacttctatttatattacataataca 694  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||||||  ||| ||||||| |        ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16066519 caaaagtcgtaaaaggtttgtctcaatatccaacaagttttccaaaataaaaaaa-caaaggacatatt-cactaaattctatttatattacataataca 16066422  T
Q  695 tataattcaaaagtaagcataaaaacgatatacaaacatccactaaaata 744  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  16066421 tatagttcaaaagtaagcataaaaacgatagacaaacgtcaactaaaata 16066372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 415 - 742
Target Start/End: Original strand, 46559523 - 46559851
Alignment:
Q  415 cgaaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcagcagaaattatgtcatgattataattattcacggttgtcgtc 514  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  || | ||||||||||| || ||||   ||||| |  |||||||||    
T  46559523 cgaaattaatttttaattaaagttgaaaacgacaatgacaaactaattc-acaacgcggtagaaattatgtaataattagg-ttatttattgttgtcgtc 46559620  T
Q  515 aattcaagataaatattattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatcacaacaacacacatacacattaaactcaccaaaagtcataaaagatatg 614  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||     
T  46559621 aattcatgataaatatcattgattaatagtagttgtgtgaagataaaaaccataacaacacacaaacacgttaaactcgccaaaagttgtaaaagatata 46559720  T
Q  615 tcccaatatccaattagtcttcca---aactnnnnnnngcaaaggacatattacaccaacttctatttatattacataatacatataattcaaaagtaag 711  Q
    || |||||||| |  |||||||||   ||          |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |  | || |||||||||    
T  46559721 tcgcaatatccgacaagtcttccaagcaagctaaaaaaacaaaggacatgttacaccaacttctatttatattgtataatactttaagttaaaaagtaag 46559820  T
Q  712 cataaaaacgatatacaaacatccactaaaa 742  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46559821 cataaaaacgatagacaaacatccactaaaa 46559851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 16069007 - 16068677
Alignment:
Q  412 agacgaaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcagcagaaattatgtcatgattataattattcacggttgtc 511  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||| | ||||| ||| |||| ||||   ||||| |  ||||||    
T  16069007 agacgaaattaaaatttaattaaagttgaaaacgacaataaaaagttaattgtacactgcggtagaaagtat-tcataattaggtttatttattgttgtc 16068909  T
Q  512 gtcaattcaagataaatattattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatcacaacaacacacatacacattaaactcaccaaaagtcataaaagat 611  Q
    || |||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||  |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||   |||||| | ||||||||    
T  16068908 gtaaattcaagataaatatcatccactaacaatggttgtatgaagataaatattacaacaacacacaaacacattaaact-tgcaaaagacgtaaaagat 16068810  T
Q  612 atgtcccaatatccaattagtcttccaaactnnnnnnngcaaaggacatattacaccaacttctatttatattacataatacatataattc-aaaagtaa 710  Q
    || || ||| ||||||  ||||||| || ||        ||||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||     
T  16068809 atatcgcaacatccaacgagtcttcaaagctaaaaaaa-caaaggacatatt-caccagattctatttataatgcataatgcatatgattcaaaaagtag 16068712  T
Q  711 gcataaaaacgatatacaaacatccactaaaatat 745  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  16068711 acataaaaacaatagaaaaacatccactaaaatat 16068677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 401 - 741
Target Start/End: Original strand, 4022351 - 4022689
Alignment:
Q  401 tttgattaccgagacgaaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcagcagaaattatgtcatgattataattat 500  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||   | | |||||||||||||| ||||   ||||    
T  4022351 tttgattacaaaggcgaaattaatttttaactaaagttgaaagcgacaataacaaagtaattatacaccacggtagaaattatgtcataattagg-ttat 4022449  T
Q  501 tcacggttgtcgtcaattcaagataaatattattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatcacaacaacacacatacacattaaactcaccaaaag 600  Q
    | |  || ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||   ||||||    
T  4022450 ttattgtcgtcgtcgtttcaagataaatataattgattaacaatagttgcgtgaagataaaaaccataacaccacacaaacacattaaacttgtcaaaag 4022549  T
Q  601 tcataaaagatatgtcccaatatccaattagtcttccaaactnnnnnnngcaaaggacatattacaccaacttctatttatattacataatacatataat 700  Q
    |  ||||||||   || ||||||||||  |||||||||| ||        |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  4022550 ttgtaaaagattaatcgcaatatccaacaagtcttccaagctaaaaaaa-caaaggacatgttacaccaaattctatttgtattacataatacctatagt 4022648  T
Q  701 tcaaaagtaagcataaaaacgatatacaaacatccactaaa 741  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4022649 tcaaaagcaagcataaaaacgatagacaaacatctactaaa 4022689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 36566384 - 36566057
Alignment:
Q  401 tttgattaccgagacgaaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcagcagaaattatgtcatgattataattat 500  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||| | ||||    
T  36566384 tttgattacaaagacgaaattaatttttaattaaagttgaaaacgacaataaaaaacaaattctacatcgcggtagaaattatgtcataatta-agttat 36566286  T
Q  501 tcacggttgtcgtcaattcaagataaatattattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatcacaacaacacacatacacattaaactcaccaaaag 600  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||| ||             ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||      
T  36566285 ttattgttgtcgtcaattcaagataaatatcat-------------ttgtgtgaagataaaaaccacaacaacacacaaacacattaaactggccaaagt 36566199  T
Q  601 tcataaaagatatgtcccaatatccaattagtcttccaaactnnnnnnngcaaaggacatattacaccaacttctatttatattacataatacatataat 700  Q
    |  |||||||| ||| | ||| | |||  |||||||||| ||        |||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||| |||| |    
T  36566198 ttgtaaaagatttgttcaaatgttcaacaagtcttccaagctaaaaaaaacaaaggacgtattacacaaaattttatttatattgcataatacgtatagt 36566099  T
Q  701 tcaaaagtaagcataaaaacgatatacaaacatccactaaaa 742  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  36566098 tcaaaagcaagcataaaaacgatagacaaacgtccaccaaaa 36566057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 742
Target Start/End: Original strand, 36541940 - 36542267
Alignment:
Q  401 tttgattaccgagacgaaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcagcagaaattatgtcatgattataattat 500  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||   ||||    
T  36541940 tttgattacaaagacgaaattaatttttaattaaagttgaaaacgacagtaaaaaactaattctacatcgcggtagaaattatgtcataatta-ggttat 36542038  T
Q  501 tcacggttgtcgtcaattcaagataaatattattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatcacaacaacacacatacacattaaactcaccaaaag 600  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||| ||             ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||      
T  36542039 ttattgttgtcgtcaattcaagataaatatcat-------------ttgtgtgaagataaaaaccacaacaacacacaaacacattaaactggccaaagt 36542125  T
Q  601 tcataaaagatatgtcccaatatccaattagtcttccaaactnnnnnnngcaaaggacatattacaccaacttctatttatattacataatacatataat 700  Q
    |  |||||||| ||| | ||| | |||  |||||||||| ||        |||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||| | || |    
T  36542126 ttgtaaaagatttgttcaaatgttcaacaagtcttccaagctaaaaaaaacaaaggacgtattacacaaaattttatttatattgcataatacgtgtagt 36542225  T
Q  701 tcaaaagtaagcataaaaacgatatacaaacatccactaaaa 742  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  36542226 tcaaaagcaagcataaaaacgatagacaaacatccaccaaaa 36542267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 415 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 20645324 - 20644995
Alignment:
Q  415 cgaaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcagcagaaattatgtcatgattataattattcacggttgtcgtc 514  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | |  |  | | |||||||||||| ||||   ||||| |  |||||||||    
T  20645324 cgaaattaatttttaattaaagttgaaaacgacaatgacaaactaattc-ataacgtggtaaaaattatgtcataattagg-ttatttattgttgtcgtc 20645227  T
Q  515 aattcaagataaatattattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatc-acaacaacacacatacacattaaactcaccaaaagtcataaaagatat 613  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||  |||||||| |    
T  20645226 aattcatgataaatatcattgattaatagtagttgtgtgaagataaaaaaccataacaacacacaaacacgttaaactcgctaaaagttgtaaaagattt 20645127  T
Q  614 gtcccaatatccaattagtcttccaaactnnnnnnng---caaaggacatattacaccaacttctatttatattacataatacatataattcaaaagtaa 710  Q
     |||||||| || |  |||||||||| |            |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | || ||||||||    
T  20645126 atcccaataaccgacaagtcttccaagcaagctaaaaaaacaaaggacatgttacaccaacttctatttatattgcataatactttaagttaaaaagtaa 20645027  T
Q  711 gcataaaaacgatatacaaacatccactaaaa 742  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20645026 gcataaaaacgatagacaaacatccactaaaa 20644995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 417 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 3175189 - 3174977
Alignment:
Q  417 aaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcagcagaaattatgtcatgattataattattcacggttgtcgtcaa 516  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||| |||| ||||   ||||| |  ||||||||| |    
T  3175189 aaattaaaatttaattaaagttgaagacgacaataacaaattaattgtacactgcagtataaattatatcataattaggtttatttatcgttgtcgtcga 3175090  T
Q  517 ttcaagataaatattattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatcacaacaacacacatacacattaaactcaccaaaagtcataaaagatatgtc 616  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3175089 ttcaagataaataacatcaattaacaatagttgcatgaaaataaataccacaacaacacacaaacacattaaactcacc-aaagtcgtaaaagatatgtc 3174991  T
Q  617 ccaatatccaatta 630  Q
     ||| |||||||||    
T  3174990 gcaacatccaatta 3174977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 651 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3174970 - 3174877
Alignment:
Q  651 caaaggacatattacaccaacttctatttatattacataatacatataattca-aaagtaagcataaaaacgatatacaaacatccactaaaata 744  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  3174970 caaaggaaatatt-cacccaattctatttgtaatgcataatacatataattcataaagtatgcataaaaacaatagacagacatccactcaaata 3174877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 415 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 33249325 - 33249173
Alignment:
Q  415 cgaaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcagcagaaattatgtcatgattataattattcacggttgtcgtc 514  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  || | |||||||||||||| ||||   ||||| |  |||||||||    
T  33249325 cgaaattaatttttaattaaagttgaaaacgacaatgacaaactaattccacaccgcggtagaaattatgtcataattagg-ttatttagtgttgtcgtc 33249227  T
Q  515 aattcaagataaatattattgattaacaatagttgcgtgaacataaaaatcaca 568  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  33249226 aattcaagataaatatcattgattaacagtagttatgtgaagataaaaatcaca 33249173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 672 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 25552060 - 25551987
Alignment:
Q  672 ttctatttatattacataatacatataattcaaaagtaagcataaaaacgatatacaaacatccactaaaatat 745  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25552060 ttctatttatggtgcataatacatatagttcaaaactaagcataaaaatgatatacaaacatccactaaaatat 25551987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 33249095 - 33249007
Alignment:
Q  651 caaaggacatattacaccaacttctatttatattacataatacatataattcaaaagtaagcataaaaacgatatacaaacatccactaaaa 742  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33249095 caaaggacatgttacaccaacttctc---atattgcataatacattaagttaaaaagtaagcataaaaacgatagataaacatccactaaaa 33249007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 25553573 - 25553427
Alignment:
Q  401 tttgattaccgagacgaaattaatttttaatcaaagttgaaaacgataataacaaactaattctacattgcagcagaaattatgtcatgattataattat 500  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| ||||||||    |  | |||| ||||||| ||||  | |||    
T  25553573 tttgattacaaagacgaaattaatttttaatcaaagctgaacacgacaataacacactgattctacacgatactataaataatgtcataattagta-tat 25553475  T
Q  501 tcacggttgtcgtcaattcaagataaatattattgattaacaatagtt 548  Q
    | |  |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  25553474 ttattgttgccgtcaattcaagataaataccattcattaacaatagtt 25553427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 25551844 - 25551785
Alignment:
Q  686 cataatacatataattcaaaagtaagcataaaaacgatatacaaacatccactaaaatat 745  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  25551844 cataatgcatatagttcaaaactaagcataaaatcgatagacaaacatttactaaaatat 25551785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University