View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4586_low_2 (Length: 638)

Name: NF4586_low_2
Description: NF4586
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4586_low_2
NF4586_low_2
[»] chr6 (79 HSPs)
chr6 (11-621)||(26802201-26802814)
chr6 (11-587)||(28780902-28781477)
chr6 (11-587)||(28786041-28786616)
chr6 (11-597)||(27718218-27718803)
chr6 (33-587)||(28792184-28792737)
chr6 (22-617)||(27698313-27698906)
chr6 (31-597)||(27610841-27611406)
chr6 (11-621)||(27604520-27605135)
chr6 (12-506)||(27724775-27725267)
chr6 (85-621)||(27592835-27593371)
chr6 (85-621)||(27678782-27679318)
chr6 (85-621)||(27677429-27677965)
chr6 (85-621)||(27706217-27706753)
chr6 (111-578)||(26884025-26884494)
chr6 (11-578)||(26655752-26656318)
chr6 (11-578)||(26761723-26762289)
chr6 (131-568)||(27531065-27531502)
chr6 (87-618)||(26861454-26861979)
chr6 (11-364)||(27228997-27229347)
chr6 (104-437)||(26646334-26646667)
chr6 (104-437)||(26752302-26752635)
chr6 (85-488)||(31284124-31284527)
chr6 (71-578)||(27337923-27338430)
chr6 (71-578)||(27398663-27399170)
chr6 (16-581)||(27427461-27428020)
chr6 (143-611)||(25481636-25482104)
chr6 (79-437)||(26622806-26623164)
chr6 (79-437)||(26728784-26729142)
chr6 (11-434)||(26823609-26824025)
chr6 (143-611)||(25579613-25580081)
chr6 (143-613)||(25538434-25538904)
chr6 (143-437)||(26142759-26143053)
chr6 (143-437)||(26055820-26056114)
chr6 (143-437)||(26075790-26076084)
chr6 (143-437)||(26048739-26049033)
chr6 (143-437)||(26069908-26070202)
chr6 (126-373)||(28234441-28234688)
chr6 (114-384)||(28226815-28227085)
chr6 (111-384)||(28325343-28325616)
chr6 (253-370)||(25506975-25507092)
chr6 (105-373)||(28185222-28185490)
chr6 (147-439)||(28242702-28242994)
chr6 (105-384)||(28180970-28181249)
chr6 (81-434)||(28139373-28139726)
chr6 (223-398)||(28149912-28150086)
chr6 (144-384)||(26848555-26848795)
chr6 (103-379)||(28098426-28098702)
chr6 (113-384)||(26341986-26342257)
chr6 (126-364)||(26893543-26893781)
chr6 (111-384)||(28297765-28298038)
chr6 (111-384)||(28514035-28514308)
chr6 (109-373)||(26936954-26937218)
chr6 (180-304)||(29825958-29826082)
chr6 (144-298)||(26635585-26635739)
chr6 (144-298)||(26741551-26741705)
chr6 (144-308)||(25071554-25071718)
chr6 (533-611)||(26646763-26646838)
chr6 (533-611)||(26752731-26752806)
chr6 (168-308)||(26949580-26949720)
chr6 (144-272)||(27214312-27214440)
chr6 (144-272)||(27234788-27234916)
chr6 (189-274)||(26617266-26617351)
chr6 (189-274)||(26723194-26723279)
chr6 (153-274)||(26959069-26959190)
chr6 (144-281)||(27665272-27665409)
chr6 (533-613)||(26056210-26056290)
chr6 (533-613)||(26076180-26076260)
chr6 (543-611)||(26143159-26143227)
chr6 (193-296)||(26811453-26811556)
chr6 (249-403)||(2184288-2184442)
chr6 (11-43)||(27338450-27338482)
chr6 (11-43)||(27399190-27399222)
chr6 (212-296)||(28491660-28491744)
chr6 (212-296)||(29804070-29804154)
chr6 (231-402)||(2184880-2185051)
chr6 (219-298)||(29467797-29467876)
chr6 (168-298)||(26974971-26975101)
chr6 (481-587)||(27214652-27214758)
chr6 (481-587)||(27234470-27234576)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (11-578)||(13490-14056)
scaffold0277 (11-578)||(4529-5100)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (12-597)||(3259-3844)
scaffold0349 (22-597)||(14195-14767)
scaffold0349 (11-176)||(8061-8225)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (11-578)||(7295-7854)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (11-352)||(1-334)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (13-437)||(18699386-18699807)
chr4 (11-435)||(18731492-18731913)
chr4 (11-437)||(18655463-18655886)
chr4 (11-437)||(18679553-18679976)
chr4 (79-435)||(18724073-18724429)
chr4 (16-581)||(18073535-18074094)
chr4 (16-247)||(17989226-17989454)
chr4 (153-488)||(5090902-5091237)
chr4 (513-587)||(18655313-18655387)
chr4 (513-587)||(18723921-18723995)
chr4 (513-578)||(18731349-18731414)
chr4 (513-587)||(18679403-18679477)
chr4 (513-578)||(18699245-18699310)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (65-586)||(28164200-28164720)
chr1 (111-586)||(28127516-28127992)
chr1 (85-437)||(268343-268695)
chr1 (513-578)||(268202-268267)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (16-581)||(59343-59902)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (85-437)||(29273769-29274121)
chr8 (125-280)||(31903727-31903882)
chr8 (533-578)||(29273628-29273673)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (126-384)||(34602-34860)
scaffold0038 (114-384)||(27313-27583)
scaffold0038 (111-384)||(116658-116931)
scaffold0038 (147-439)||(42864-43156)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (111-384)||(58334-58607)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (123-384)||(3279562-3279823)
chr2 (87-308)||(17993812-17994033)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (182-298)||(16688944-16689060)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 563; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 621
Target Start/End: Original strand, 26802201 - 26802814
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnn---catccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802201 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcttttttttttcatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcc 26802300  T
Q  108 tcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802301 tcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctc 26802400  T
Q  208 ttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802401 ttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaat 26802500  T
Q  308 ttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802501 ttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtc 26802600  T
Q  408 ttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgata 507  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802601 ttgcctattttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggctgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgata 26802700  T
Q  508 aggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttact 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802701 aggataacatggagaggttggagcgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttact 26802800  T
Q  608 taaatcctattttt 621  Q
    ||||||||||||||    
T  26802801 taaatcctattttt 26802814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 587
Target Start/End: Original strand, 28780902 - 28781477
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||     
T  28780902 cacagaccacaaaaacaaactcattcatattctgaattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattatcatggctatgcaattaccttcctct 28781000  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28781001 tcctcttcattttcctctgcattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctctta 28781100  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28781101 ctgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttt 28781200  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  28781201 tattcctgtgttttctatcaactatgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttg 28781300  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataagg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28781301 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatcatacaggtccttatggtgaagcattggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataagg 28781400  T
Q  511 ataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcct 587  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28781401 ataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcct 28781477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 587
Target Start/End: Original strand, 28786041 - 28786616
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||| | |||||||| || || |||||||||    
T  28786041 cacagaccacaaaaacaaactcattcatattctgaattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattcttatggctatacaatcaccttcctca 28786139  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28786140 tcctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctctta 28786239  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28786240 ctgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttt 28786339  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  28786340 tattcctgtgttttctatcaactacgccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttg 28786439  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataagg 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28786440 cctgttttctttggtgtcgatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataagg 28786539  T
Q  511 ataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcct 587  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28786540 ataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcct 28786616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27718803 - 27718218
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  27718803 cacagaacacaaaaattcactcattcatattctgcattctcaaactctttttt-catcctatttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctca 27718705  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27718704 tcctcttcattctcccatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggcacagttttaccggaaatctctacaaggctctta 27718605  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27718604 ctgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttt 27718505  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27718504 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttg 27718405  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataagg 510  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27718404 cctgttttcttcggcgtggaacctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataaga 27718305  T
Q  511 ataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacc 597  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27718304 ataacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacc 27718218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 587
Target Start/End: Original strand, 28792184 - 28792737
Alignment:
Q  33 attcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggat 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28792184 attcatattctgaattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattcttatggctatacaatcaccttcctcatcctcttcattttcctatggat 28792282  T
Q  133 tcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  28792283 tcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaacctt 28792382  T
Q  233 cattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28792383 cattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaac 28792482  T
Q  333 tatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatc 432  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28792483 tacgccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtcgatc 28792582  T
Q  433 ctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcg 532  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  28792583 ctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatca 28792682  T
Q  533 atggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcct 587  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28792683 atggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcct 28792737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 27698906 - 27698313
Alignment:
Q  22 aaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcatt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  27698906 aaaatttactcattcatattctgcattctcaaactcttttt--catcctatttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctcatccacttcatt 27698809  T
Q  122 ttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaaggga 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27698808 ttcctatggattcacttaccaagtgttcatcagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaaggga 27698709  T
Q  222 atccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27698708 atccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgt 27698609  T
Q  322 tttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctt 421  Q
    ||||| |||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27698608 tttctctcaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacgagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctt 27698509  T
Q  422 tggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggag 521  Q
     |||||||| || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||||||    
T  27698508 cggtgtggaaccaactaatgtgagacatcataaaggtagttatggcaaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggag 27698409  T
Q  522 aggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaatcctat 617  Q
    |||||| || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27698408 aggttgcagggatggaaagaggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcccaggtacccaactttacttaaatcctat 27698313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27611406 - 27610841
Alignment:
Q  31 tcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatgg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27611406 tcattcatattctgcattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattttcatggctatgcaattagcttcctcttcttcttcattttcctatgg 27611308  T
Q  131 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27611307 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccatacc 27611208  T
Q  231 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatca 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27611207 ttcattgatgacaatgatcttccaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgttttctatca 27611108  T
Q  331 actatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtgga 430  Q
    |||||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27611107 actatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttcttcggcgtgga 27611008  T
Q  431 tcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggag 530  Q
     |||||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27611007 acctactaaagtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatggagaggttgcag 27610908  T
Q  531 cgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacc 597  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27610907 ggatggaaagtggctctgagccaggctgcaaacttttccggctaccatgatagtcctcctgggtacc 27610841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 27605135 - 27604520
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||    
T  27605135 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattctcatggctatgcaattaccttcctca 27605037  T
Q  111 tcctc------ttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaagg 204  Q
    |||||      ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27605036 tcctcatcctcttcattttcctatgcattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgatacggttttaccggcaatctctacaagg 27604937  T
Q  205 ctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctag 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  27604936 ctcttactgacaagggaattcataccttcattgatgaaaatgatcttcgaagaggagatgaaatcacaccagcacttctcaaggccattgatgaatccag 27604837  T
Q  305 aatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctc 404  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  27604836 gatttttattcctgtgttttctatcaaatatgcctcttcttccttttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacacgacaaagggtcgcgtc 27604737  T
Q  405 gtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatg 504  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| | |||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27604736 gttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttacggtcaagcattggctgagcataaaaaaaggtttcaaaatg 27604637  T
Q  505 ataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaacttt 604  Q
    || ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  27604636 atgaggataacataaagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttttccggctaccatgatagtcctcctgggtactcaacact 27604537  T
Q  605 acttaaatcctattttt 621  Q
    || ||||||||||||||    
T  27604536 acataaatcctattttt 27604520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 12 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 27725267 - 27724775
Alignment:
Q  12 acagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcat 111  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  27725267 acagaccacaaaaatttac-cattcatattctgcattctcaaactctttttt-catcctatttctctcaattgtcatggctatacaatcaccttcctcat 27725170  T
Q  112 cctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttat 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  27725169 cctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttac 27725070  T
Q  212 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaattttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27725069 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggattttt 27724970  T
Q  312 attcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27724969 attcctgtgttttctatcaactatgcctattcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgc 27724870  T
Q  412 ctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgat 506  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27724869 ctgttttcttcggcgtggaacctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgat 27724775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 85 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 27593371 - 27592835
Alignment:
Q  85 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 184  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||  | ||  |||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  27593371 tcatggctatgcaatcaccttcctcttccacttcaatttcctatgattacaaataccaagtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtacggttt 27593272  T
Q  185 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 284  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  27593271 caccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaacaccttcattgatgacaatggtcttcaaagaggaaatgaaatcacaccatcacttctc 27593172  T
Q  285 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27593171 aaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcgttttgtttggacgaacttgaccacatcattcattgct 27593072  T
Q  385 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagca 484  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27593071 acaagacaaagggtcgccctgttttgcctgttttctttggtgtggatccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagca 27592972  T
Q  485 tgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagt 584  Q
    |||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||| || ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27592971 tgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcagggatggaaagacgctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagt 27592872  T
Q  585 cctcctcggtacccaactttacttaaatcctattttt 621  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27592871 cctcctgggtacccaactttacttaaatcctattttt 27592835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 85 - 621
Target Start/End: Original strand, 27678782 - 27679318
Alignment:
Q  85 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 184  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||  | ||  |||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  27678782 tcatggctatgcaatcaccttcctcttccacttcaatttcctatgagtacaaataccaagtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtacggttt 27678881  T
Q  185 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 284  Q
     || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27678882 caccgggaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaacaccttcattgataagaatggtcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttctc 27678981  T
Q  285 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27678982 aaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 27679081  T
Q  385 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagca 484  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27679082 acaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttctttggtgtggaacctactgttgtgcgacatcgtaaaggtagttatggtgaagcattggctgagca 27679181  T
Q  485 tgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagt 584  Q
    |||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679182 tgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcaaggatggaaaaaggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagt 27679281  T
Q  585 cctcctcggtacccaactttacttaaatcctattttt 621  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679282 cctcctgggtacccaactttacttaaatcctattttt 27679318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 85 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 27677965 - 27677429
Alignment:
Q  85 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 184  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||  | ||  |||||||| ||||||| ||| || || | ||||||||||||||||||    
T  27677965 tcatggctatgcaatcaccttcctcttccacttcaatttcctatgagtacaaataccaagtattcctcaatttcagaggaagtgacactcggtacggttt 27677866  T
Q  185 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 284  Q
     || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  27677865 caccggcaatctctacaaggctcttgatgacaagggaatccacaccttcattgacaatcatgaacttcaaagaggggatgaaatcacaccatcacttctc 27677766  T
Q  285 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27677765 aaggccattgaagagtctaggatttttattgctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 27677666  T
Q  385 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagca 484  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27677665 acaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttctttgctgtggaacctactattgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagca 27677566  T
Q  485 tgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagt 584  Q
    |||||| |||||||||||||||  | | | ||||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677565 tgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaagcatggagaggttgcagggatggaaagaggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagt 27677466  T
Q  585 cctcctcggtacccaactttacttaaatcctattttt 621  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677465 cctcctgggtacccaactttacttaaatcctattttt 27677429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 85 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 27706753 - 27706217
Alignment:
Q  85 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 184  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||| |||| ||||  | ||  |||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||    
T  27706753 tcatggctatgcaatcacctttctcttccacttcaatttcctatgagtacaaataccaagtattcctcagtttcagaggaggtgacactcggtacggttt 27706654  T
Q  185 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 284  Q
     || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||  |  |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    
T  27706653 cacaggcaatctctacaaggcttttgatgacaagggaatccacaccttcattgacaatcatgaacttcaaagaagggatgaaatcacaccatcacttctc 27706554  T
Q  285 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  27706553 aaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcacctatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 27706454  T
Q  385 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagca 484  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27706453 acaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttatttggtgtagaacctactattgtgcgacatcgtaaaggtagttatggtgaagcattggctgagca 27706354  T
Q  485 tgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagt 584  Q
    |||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27706353 tgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggagaggttgcagggatggaaagaggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagt 27706254  T
Q  585 cctcctcggtacccaactttacttaaatcctattttt 621  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27706253 cctcctgggtacccaactttacttaaatcctattttt 27706217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 111 - 578
Target Start/End: Original strand, 26884025 - 26884494
Alignment:
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  26884025 tcctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttcctcagtttcagaggaagtgacactcggtatggtttcactggaaatctctacaaggctctta 26884124  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884125 ctaacaagggaatccacaccttcattgatgataatcatcttccaagaggaagcgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 26884224  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcaca--ttattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtct 408  Q
    ||||||  | ||||||| ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||  | ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |    
T  26884225 tattccaatattttctaccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatgtcattcactgctacgagacaaagggtcgcctcgttt 26884324  T
Q  409 tgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataa 508  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26884325 tgcctgtttttgttggtgtggatcctactgatgtgcgacatcatacaggtagttatggtgaagcattggctgaccatgaaaaaaggtttcaaaatgataa 26884424  T
Q  509 ggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccat 578  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  26884425 ggataacatggagaggttgcagcgatggaaaatggctatgaggcaagttgctaacttgtccggctaccat 26884494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 578
Target Start/End: Original strand, 26655752 - 26656318
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||| |||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  26655752 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattcccaaactctttttt-catccattttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctca 26655850  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26655851 tcctcttcattttcctatgggtttaaataccaagtgttcctcagttttaggggcattgacacccggcacggttttaccggcaatctctacaaggctctta 26655950  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||    
T  26655951 ttgataagggaatccatactttcattgatgacaatgatcttctcagaggagatgaaatcacaccatcactcgttaaggccattgaagaatccaggatttt 26656050  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
    ||||||  | ||||||  ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    || |||    
T  26656051 tattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctataagacaaagggttgttcggttttg 26656150  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcat-tggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataag 509  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  | || ||||| ||  | || || |||| ||||| |  |  |||||||||| | ||| |||||| | |||    
T  26656151 cctgttttctatggtgtggatcctactcacatacgacatcagactggaagttacggtg-agcatcttactaagcatgaaaagaagttccaaaataacaag 26656249  T
Q  510 gataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccat 578  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  26656250 gaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccat 26656318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 578
Target Start/End: Original strand, 26761723 - 26762289
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||| |||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  26761723 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattcccaaactctttttt-catccattttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctca 26761821  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26761822 tcctcttcattttcctatgggtttaaataccaagtgttcctcagttttaggggcattgacacccggcacggttttaccggcaatctctacaaggctctta 26761921  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||    
T  26761922 ttgataagggaatccatactttcattgatgacaatgatcttctcagaggagatgaaatcacaccatcactcgttaaggccattgaagaatccaggatttt 26762021  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
    ||||||  | ||||||  ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    || |||    
T  26762022 tattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctataagacaaagggttgttcggttttg 26762121  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcat-tggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataag 509  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  | || ||||| ||  | || || |||| ||||| |  |  |||||||||| | ||| |||||| | |||    
T  26762122 cctgttttctatggtgtggatcctactcacatacgacatcagactggaagttacggtg-agcatcttactaagcatgaaaagaagttccaaaataacaag 26762220  T
Q  510 gataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccat 578  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||    
T  26762221 gaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccat 26762289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 131 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 27531502 - 27531065
Alignment:
Q  131 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccatacc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27531502 attcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcgcggacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatctatacc 27531403  T
Q  231 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||   |    
T  27531402 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactaaaaaatgccattgaaaaatctaggatttttattcccgtattttctgaaa 27531303  T
Q  331 actatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtgga 430  Q
    ||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||||||| | || || |||||||||||  ||||||||||    
T  27531302 actatgcatcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcactcattgctacgatacaaagggttgtcttgttttgcctgtttttattggtgtgga 27531203  T
Q  431 tcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggag 530  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  27531202 tcctactgatgtgcgacatcacacaggtagatatggtgaagcattagctgtgcataaaaaaaagtttcaaaatgataaggataacactgagaggttgcag 27531103  T
Q  531 cgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtc 568  Q
    | |||||||   ||||||| ||| || |||||||||||    
T  27531102 caatggaaagaagctctgagccaagcggctaacttgtc 27531065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 87 - 618
Target Start/End: Original strand, 26861454 - 26861979
Alignment:
Q  87 atggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggtttta 186  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||    
T  26861454 atggctatgcaatcaccttgctcttcctcttccatttcctatggattcaaataccaggtattcctcagtttcagaggaagtgacactcggtatggtttta 26861553  T
Q  187 cgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaa 286  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||   ||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||  |||    
T  26861554 ccggtaatctctacaaggctcttactgacaagggaattcacaccttcatggatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaaagatcactcgacaa 26861653  T
Q  287 ggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctat 386  Q
     ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||| || || ||| | |||       
T  26861654 tgccattgaagagtctagaattttcattcctgtgttttctgccaactatgcctcttcgtcattttgtttggatgaacttgtccaaatcattaactgc--- 26861750  T
Q  387 aagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatg 486  Q
    |||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  26861751 aaggaaaagggtcgcgtcgttttgcctgttttctatggcatggatcctactaatgtgcgacatcatagaggtatttatggtgaagcattggctaagcatg 26861850  T
Q  487 aaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcc 586  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  |||       
T  26861851 aaaaaaggtttcaaaatgatatggataacatggagaggttgcagagatggaaagttgctctgaaccaagctgctaacttgtcaggctaccattttag--- 26861947  T
Q  587 tcctcggtacccaactttacttaaatcctatt 618  Q
    |||| ||||||| |||| || |||||||||||    
T  26861948 tcctgggtaccccacttaacataaatcctatt 26861979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 27228997 - 27229347
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||| ||| | |||||||||| || || ||||||||     
T  27228997 cacataccacaaaaacatactcattcatattctgcattctaaaactctttt---catccaatttctctcaagtctcatggctatacaatcaccttcctct 27229093  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27229094 tcctcttcattttcctttggattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggcaatctctacaaggctctta 27229193  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||    
T  27229194 ctgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagacgaaatcacaccatcactcgtcaaggccattgacgaatctcggatttt 27229293  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaact 364  Q
    ||||||  | ||||||  ||||||||| |||||   |||||| ||| |||||||    
T  27229294 tattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcattttgtttgaacgaact 27229347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 104 - 437
Target Start/End: Original strand, 26646334 - 26646667
Alignment:
Q  104 ttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaag 203  Q
    |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||| || |||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||    
T  26646334 ttcctcttcctctttaatttcctacggattcacctaccaggtcttcctcaacttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggacatctctacaag 26646433  T
Q  204 gctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatcta 303  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646434 gctcttactgacaagggaattcacaccttcattgatgattgtgatcttaagagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatcta 26646533  T
Q  304 gaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcct 403  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26646534 ggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgtct 26646633  T
Q  404 cgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  26646634 cgttttgcccgttttctatggcgtggatcctact 26646667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 104 - 437
Target Start/End: Original strand, 26752302 - 26752635
Alignment:
Q  104 ttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaag 203  Q
    |||||| ||||||| | |||| || |||||||| ||||| || |||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||    
T  26752302 ttcctcttcctctttaatttcctacggattcacctaccaggtcttcctcaacttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggacatctctacaag 26752401  T
Q  204 gctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatcta 303  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752402 gctcttactgacaagggaattcacaccttcattgatgattgtgatcttaagagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatcta 26752501  T
Q  304 gaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcct 403  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26752502 ggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttctaaattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgtct 26752601  T
Q  404 cgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  26752602 cgttttgcccgttttctatggcgtggatcctact 26752635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 85 - 488
Target Start/End: Original strand, 31284124 - 31284527
Alignment:
Q  85 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 184  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  31284124 tcatggctatgcaatcatcttcctcttcctcttcaatttcctatgtattcaaataccaagtattccttagtttcaggggaagtgacactcggtatggttt 31284223  T
Q  185 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 284  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  31284224 caccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatagtgaacttcaaagaggggatgaaatcacaccatcactcgac 31284323  T
Q  285 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  |    
T  31284324 aatgccattgaagagtctaggatttttatccccgtgttttctgccaactatgcctcttcgtcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcacttgt 31284423  T
Q  385 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagca 484  Q
    |||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| | |||| ||||| |||||||||||  ||||    
T  31284424 ataagcaaaatggtcgcctcgttttgcccgttttctttggcgtggatccttctcatgtgcgacatcatagaggtagttatggagaagcattggctaagca 31284523  T
Q  485 tgaa 488  Q
    ||||    
T  31284524 tgaa 31284527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 71 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27338430 - 27337923
Alignment:
Q  71 atttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgac 170  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||| | ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  27338430 atttctctcaattctcatggctatgcaatcactttcctcttcctcttcaatttcctctgggttcaaataccatgtgttcctcagttttagggacattgac 27338331  T
Q  171 actcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatca 270  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  27338330 actctttacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaacgatcttgaaagaggagatgaaagca 27338231  T
Q  271 caccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttca 370  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  27338230 caccatcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttgattcccatattttctgcaaactatgcatcttcttcattttgcttggacgaacttgtcca 27338131  T
Q  371 cattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaa 470  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||| |||| |    || ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || || ||||| ||  | || ||||||| |    
T  27338130 catcattcactgctacaagacaaggggttgttcggttttgcctgttttctatggtgcggatcctactcacgtacgacatcagactgggagttatggtg-a 27338032  T
Q  471 gcat-tggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtcc 569  Q
    |||| |  |  |||||||| | | ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  27338031 gcatcttactaagcatgaagataagttccaaaataacaaggaaaacatggagaggttgaagaaatggaagatggctcttacccaagctgctaacttctcc 27337932  T
Q  570 ggctaccat 578  Q
    ||| |||||    
T  27337931 ggccaccat 27337923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 71 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27399170 - 27398663
Alignment:
Q  71 atttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgac 170  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||| | ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  27399170 atttctctcaattctcatggctatgcaatcactttcctcttcctcttcaatttcctctgggttcaaataccatgtgttcctcagttttagggacattgac 27399071  T
Q  171 actcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatca 270  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  27399070 actctttacggttttaccggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaacgatcttgaaagaggagatgaaagca 27398971  T
Q  271 caccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttca 370  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||   |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||    
T  27398970 caccatcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttgattcccatattttctgcaaactatgcatcttcttcattttgcttggacgaacttgtcca 27398871  T
Q  371 cattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaa 470  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||| |||| |    || ||||||||||||| ||||| |||||||||| | || || ||||| ||  | || ||||||| |    
T  27398870 catcattcactgctacaagacaaggggttgttcggttttgcctgttttctatggtgcggatcctactcacgtacgacatcagactgggagttatggtg-a 27398772  T
Q  471 gcat-tggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtcc 569  Q
    |||| |  |  |||||||| | | ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  27398771 gcatcttactaagcatgaagataagttccaaaataacaaggaaaacatggagaggttgaagaaatggaagatggctcttacccaagctgctaacttctcc 27398672  T
Q  570 ggctaccat 578  Q
    ||| |||||    
T  27398671 ggccaccat 27398663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 27428020 - 27427461
Alignment:
Q  16 accacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctc 115  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| |  |||| ||  |||||    
T  27428020 accacaaaaacatcctcattcatattctgcattctcaaactcttct---catcttatttctctcaattctcatggccatgcaattacctttctattcctc 27427924  T
Q  116 ttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgac 215  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  27427923 ttcattttcctatgcattcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgac 27427824  T
Q  216 aagggaatccataccttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaattt 309  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| || ||||    
T  27427823 aagggaattcgtaccttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattt 27427733  T
Q  310 ttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtctt 409  Q
    | |||||  | ||||||  ||||||||| |||||   || ||| ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  27427732 tgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgtttt 27427633  T
Q  410 gcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27427632 gcctgttttctttggtgtggaacctactgatgtgcgacatcatacaggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaataggtttcaaaatgatacg 27427533  T
Q  510 gataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgat 581  Q
     | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  27427532 aaaaacatggagaggttgcagcaatggaaagtggctctgagtctggctgctaacttgcccagctaccatgat 27427461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 143 - 611
Target Start/End: Original strand, 25481636 - 25482104
Alignment:
Q  143 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 242  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  25481636 agtgttcctcaatttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtactttcattgatgaa 25481735  T
Q  243 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25481736 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttgtattcccatattttctgccaactatgcatctt 25481835  T
Q  343 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgt 442  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| || || | || || || ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25481836 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattacccgttttctatggtgtggatcctactgatgt 25481935  T
Q  443 gcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattg 542  Q
     || | |||||||||||| |||||||||    || |  |||||||| |  |||| |||||| |  || | ||||||||| | |||   | ||||||  ||    
T  25481936 tcgacgtcatacatgtagttatggtgaatatctgactaagcatgaagaggggttccaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagatg 25482035  T
Q  543 gctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaa 611  Q
    ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  25482036 gctcttactcaagctgctaatttgtccggctatcattatagtcctcatgagtaccccactttacttaaa 25482104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 79 - 437
Target Start/End: Original strand, 26622806 - 26623164
Alignment:
Q  79 caattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggta 178  Q
    ||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||| |||  |||||  |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  26622806 caattatcatggctatgcaatcaccatcctcttcctcttcaatttcctatcaattcaaataccaagtgttcctaagtttcagaggcagtgacactcggta 26622905  T
Q  179 cggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatca 278  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  26622906 cggtttcactggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggacgaaatcaaaccatca 26623005  T
Q  279 ctcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattc 378  Q
    ||   ||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||   |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26623006 cttgacaatgctatcgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctcccaactatgcatattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattc 26623105  T
Q  379 attgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  26623106 actgctacaaaacaaagggtcgtctcgttttgcccgtcttctatggcgtggatcctact 26623164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 79 - 437
Target Start/End: Original strand, 26728784 - 26729142
Alignment:
Q  79 caattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggta 178  Q
    ||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||| |||| |||  |||||  |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  26728784 caattatcatggctatgcaatcaccatcctcttcctcttcaatttcctatcaattcaaataccaagtgttcctaagtttcagaggcagtgacactcggta 26728883  T
Q  179 cggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatca 278  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  26728884 cggtttcactggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggacgaaatcaaaccatca 26728983  T
Q  279 ctcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattc 378  Q
    ||   ||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||   |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26728984 cttgacaatgctatcgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctcccaactatgcatattcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattc 26729083  T
Q  379 attgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  26729084 actgctacaaaacaaagggtcgtctcgttttgcccgtcttctatggcgtggatcctact 26729142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 434
Target Start/End: Original strand, 26823609 - 26824025
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||     
T  26823609 cacacaccacagtaacatactcattcatattctgcattctcaaactctttctt-cgtccaatttctctcaattctcatggctatgcagtcaacttcctc- 26823706  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
         |||| |||| ||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26823707 -----ttcagtttcatatgatttcaaataccaagtgtttctcagttttagaggcgctgacactcggtatgaatttaccggcaatctctacaaggctctta 26823801  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
      |||||||||||||| |||||  |||||||   ||| ||||||||||| ||| |||||  || ||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  26823802 cagacaagggaatccacaccttttttgatgatcgtgaacttcaaagaggggataaaatcgaacaatcactcaataatgccattgaagagtctaggatttt 26823901  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    ||| |||  |||||| |||||||| |||    
T  26823902 tattcctgtgttttctgccaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcgcgtctacaaggaaaaggggcgcctcgttttg 26824001  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcct 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  26824002 cctgttttctatggtgtggatcct 26824025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 143 - 611
Target Start/End: Original strand, 25579613 - 25580081
Alignment:
Q  143 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 242  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||     
T  25579613 agtgttcctcagtttcagaggcagtgacactcgcaacacttttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtaccttctttgatgat 25579712  T
Q  243 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25579713 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 25579812  T
Q  343 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgt 442  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||| |||||| |  |    
T  25579813 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcacat 25579912  T
Q  443 gcgccatcatacatgtagctatggtgaagcat-tggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaatt 541  Q
     || ||||| |   | || ||||||| || || |  |  |||||||| | |||||||||||| |  || | ||||||||| | |||   | ||||||  |    
T  25579913 acgacatcagagtgggagttatggtg-agtatcttactaagcatgaagagaggtttcaaaataacgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagat 25580011  T
Q  542 ggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaa 611  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  25580012 agctcttacccaagctgctaacttgtccggctatcattatagtcctcatgggtaccccactttacttaaa 25580081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 143 - 613
Target Start/End: Original strand, 25538434 - 25538904
Alignment:
Q  143 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||   ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||| ||||| |||||     
T  25538434 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaaatttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattagtactttcatagatgat 25538533  T
Q  243 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  25538534 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccatcgaagaatctagaatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 25538633  T
Q  343 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgt 442  Q
    |   |||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||| |||||| |  |    
T  25538634 cttcattttgtttggacgaacttgtccagatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctactcagtt 25538733  T
Q  443 gcgccatcatacatgtagctatggtgaagca-ttggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaatt 541  Q
     || ||||| |   | || ||||||| |||| ||  |  |||||||| | |||||||||||| || || | ||||||||| | |||   | ||||||  |    
T  25538734 acgacatcagagtgggagttatggtg-agcattttactaagcatgaagagaggtttcaaaataatgagaaaaacatggagcgattgcgtcaatggaagat 25538832  T
Q  542 ggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaatc 613  Q
     ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  25538833 agctcttatccaagctgctaacttgtccggctatcattatagtcctcatgggtaccccactttacttaaatc 25538904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 143 - 437
Target Start/End: Original strand, 26142759 - 26143053
Alignment:
Q  143 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||   ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  26142759 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaaatttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattcgtactttcattgatgat 26142858  T
Q  243 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26142859 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26142958  T
Q  343 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| || || | || || || ||||||| || |||||| ||||||    
T  26142959 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtatttcccgttttctatgatgtggaacctact 26143053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 437
Target Start/End: Original strand, 26055820 - 26056114
Alignment:
Q  143 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 242  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||     
T  26055820 agtgttcctcattttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattaatactttcattgatgaa 26055919  T
Q  243 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26055920 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26056019  T
Q  343 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  26056020 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaacacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctact 26056114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 437
Target Start/End: Original strand, 26075790 - 26076084
Alignment:
Q  143 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 242  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||     
T  26075790 agtgttcctcaatttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctcttgttgacaagggaattaatactttcattgatgaa 26075889  T
Q  243 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26075890 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26075989  T
Q  343 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| || || | || ||||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  26075990 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaacacaaagagttgcttagtattgcccgttttctatgatgtggaacctact 26076084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 437
Target Start/End: Original strand, 26048739 - 26049033
Alignment:
Q  143 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  26048739 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctctcattgacaagggaatttgtactttcattgatgat 26048838  T
Q  243 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26048839 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacacccaaacttgtcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26048938  T
Q  343 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| || || | || ||||| ||||| | || |||||| ||||||    
T  26048939 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttttatgatgtggaacctact 26049033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 437
Target Start/End: Original strand, 26069908 - 26070202
Alignment:
Q  143 agtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgac 242  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||     
T  26069908 agtgttcctcagtttcaggggcagtgacactcgcaacaattttaccggtaatctctataaggctctcattgacaagggaatttgtactttcattgatgat 26070007  T
Q  243 aatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctctt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| ||||    
T  26070008 aatgatcttgaaagaggagatgaaatcacacccaaacttgtcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt 26070107  T
Q  343 caaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    |   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| || || | || ||||| ||||| | || |||||| ||||||    
T  26070108 cttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagagttgcttagtattgcccgttttttatgatgtggaacctact 26070202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 373
Target Start/End: Original strand, 28234441 - 28234688
Alignment:
Q  126 tatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcc 225  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |  |||||||| |  ||||||  | ||||||||||||    
T  28234441 tatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtagtgacactcgctatggttttaccgaaaatctctatagagctctttgtcacaagggaatcc 28234540  T
Q  226 ataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttc 325  Q
    | ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  28234541 acaccttcattgatgacagggagcttcaaggaggagatgaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtc 28234640  T
Q  326 tatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 373  Q
    |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28234641 tatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 28234688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 384
Target Start/End: Original strand, 28226815 - 28227085
Alignment:
Q  114 tcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattg 213  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||  | ||||  |     
T  28226815 tcttccttctcttatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtattgacactcgttatggttttactggaaatctctacagtgatctttgta 28226914  T
Q  214 acaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttat 313  Q
    | |||||||| || || ||| ||||||| |  || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  28226915 agaagggaattcacacattctttgatgatagagagcttcaaggaggtgatgaaataacatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcat 28227014  T
Q  314 tcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28227015 tcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgct 28227085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Original strand, 28325343 - 28325616
Alignment:
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||     
T  28325343 tcctcttccttttcctatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatcttt 28325442  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     |   ||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28325443 gtaggaagagaattcgtaccttcattgatgacaaagaccttcaacgaggtgacgaaataacaccgtcacttttcaaggccattgaagagtctaggatttt 28325542  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
     |||||| | || |||||||| ||||| |||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  28325543 cattcctattttgtctatcaattatgcttcttcttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactgct 28325616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 253 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25507092 - 25506975
Alignment:
Q  253 aaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25507092 aaagaggagatgaaatcacaccatcagtcgtcatcgccattgaagaatctaggatttttattccggttctttctatcaactatgcctcttcaaaattttg 25506993  T
Q  353 cttggacgaacttgttca 370  Q
     ||||| |||||||||||    
T  25506992 tttggaggaacttgttca 25506975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 373
Target Start/End: Original strand, 28185222 - 28185490
Alignment:
Q  105 tcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaagg 204  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| || | ||||||||| ||  ||||||| || |||||| | |  |    
T  28185222 tcctcatcctcttccttctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtagtgacactcgttatcgttttactggaaatctcaatagag 28185321  T
Q  205 ctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctag 304  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28185322 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataacatcatcacttttcaaggccattgaagagtctag 28185421  T
Q  305 aatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 373  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28185422 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 28185490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 439
Target Start/End: Original strand, 28242702 - 28242994
Alignment:
Q  147 ttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatg 246  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||  | | |||||||| |  ||||||||||||||||  |    
T  28242702 ttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaagaagggaattcgcaccttcattgatgacagag 28242801  T
Q  247 atcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaa 346  Q
    | |||| | |||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||       
T  28242802 aacttccaggaggtgacaaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttc 28242901  T
Q  347 attttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaa 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || ||||| || |||||  |||||| || |||||| ||| ||||    
T  28242902 attttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaagaaaaatggacgcctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctaa 28242994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Original strand, 28180970 - 28181249
Alignment:
Q  105 tcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaagg 204  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | | |||||| || ||||| ||   ||||||||| || |||||||| || |||||| | |  |    
T  28180970 tcctcatcctcttccttctcctatggattcacctatgacgcgttccttagctttagaggtggtgacactcgttatggttttactggaaatctcaatagag 28181069  T
Q  205 ctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctag 304  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28181070 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataacatcatcacttttcaaggccattgaagagtctag 28181169  T
Q  305 aatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28181170 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgct 28181249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 434
Target Start/End: Original strand, 28139373 - 28139726
Alignment:
Q  81 attttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacg 180  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| || ||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||| || || |||| ||||||||| | ||    
T  28139373 attttcatggctttgcaaccaccttcttcttctacttctttctcctatggcttcacatacgatgtctttctcagcttcagaggcagtgacactcgtttcg 28139472  T
Q  181 gttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcact 280  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||||  ||||   |||||||| || || |||||||| |  || |||||| |||| || |||||  |||| |||||    
T  28139473 gtttcactggaaatctctacaaagctcttcgtgactgtggaatccacacttttattgatgatagggagcttcaaggaggtgacgaaatatcaccgtcact 28139572  T
Q  281 catcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcat 380  Q
    | | || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |     
T  28139573 cgtaaaagccattgaagaatctaggattttcatccctgtgttttccatcaactatgcctcttcttcgttttgcttggacgaacttgtccacatcattgac 28139672  T
Q  381 tgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcct 434  Q
    ||||  || ||||||||  |  | || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28139673 tgcttcaacacaaagggatgtttggttttgcctgttttctatggtgtggatcct 28139726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 398
Target Start/End: Original strand, 28149912 - 28150086
Alignment:
Q  223 tccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgtt 322  Q
    |||| |||||||||||||| |  || ||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||  | ||    
T  28149912 tccacaccttcattgatgatacggagctttaacgaggggacgaaatcacaccatcactc-tcaaggccattgaagagtccaggattttcattccaatctt 28150010  T
Q  323 ttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggt 398  Q
     |||||||||||| | |||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  28150011 ctctatcaactatacttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacattattcactgcttcaaggcaaagggt 28150086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 384
Target Start/End: Original strand, 26848555 - 26848795
Alignment:
Q  144 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 243  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||| | | | |||| || || |||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  26848555 gtgttcattagtttcaggggcaccgacactagattcagtttcactggtaatctctataaagctctttctgacaatggaatccgaaccttcattgatgaca 26848654  T
Q  244 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttc 343  Q
    | |||||||| || || ||||| |||||||| || ||| |||||  ||||||||| || || ||||  |||| ||| || |||   ||||||||| ||||    
T  26848655 aggatcttcagagtggtgatgagatcacaccttcgctcctcaagaacattgaagactcgaggatttccattcttgtattctctgagaactatgccacttc 26848754  T
Q  344 aaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
        ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26848755 ttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgct 26848795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28098702 - 28098426
Alignment:
Q  103 cttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaa 202  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  28098702 cttcctctttctcttcattctcttatggattcacctatgacgtgtttcttaattttaggggcaccgacactcggtatggttttactggaaatctctacaa 28098603  T
Q  203 ggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatct 302  Q
     ||||||  ||||   ||| |||  |||||||||||  | || ||||||||   ||| |||  |||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| ||     
T  28098602 agctctttgtgacggaggagtccgcaccttcattgaccataaagatcttcatgaaggtgatagaatcacacaatcccttgtcaaggccatcgaagagtcc 28098503  T
Q  303 agaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattca 379  Q
    || ||||| ||||| || || ||||  |||||||| |||||    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28098502 aggattttaattccggtcttctctaagaactatgcttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacatcattca 28098426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 26342257 - 26341986
Alignment:
Q  113 ctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttatt 212  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||||||| || |||||| || |||||||| |||||| |||| |  |||||   |    
T  26342257 ctcttcattctcatatggattcacatatgatgtgttcctcaattttaggggcattggcactcgctatggttttactggcaatatctatagagctctatgt 26342158  T
Q  213 gacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaattttta 312  Q
    |||   ||| |||  |||||||||||||| |  || |||||  |||| ||  ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| || || ||||| |    
T  26342157 gacggtggagtccgcaccttcattgatgatagggagcttcatggaggtgacaaaatcacacaatcacttgtcaaagccattgaagagtccaggattttca 26342058  T
Q  313 ttcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    ||||  | || || ||||||||||| |||||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26342057 ttccaattttctcaatcaactatgcttcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgct 26341986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26893781 - 26893543
Alignment:
Q  126 tatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcc 225  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||| |||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||  |||| || || ||||||  ||| |  ||||| |    
T  26893781 tatggattcacctacgatgtcttcctcaattttagaggctctgacactcgttttggttttacgggtcatctttataaagctctttgtgatagtggaattc 26893682  T
Q  226 ataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttc 325  Q
    | |||||||||||||| |  || ||||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || |  ||||| ||  | ||    
T  26893681 acaccttcattgatgatacagagcttcatagaggtgacgaaatctcaccatcacttatcaaggcaattgaagagtctatgatatacattccagtcctctc 26893582  T
Q  326 tatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaact 364  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||    
T  26893581 tatcaactatgcttcttctatattttgtttggaagaact 26893543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28298038 - 28297765
Alignment:
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||| || || |||||||||||| |  | || ||||| |||||||| || | |||||| || ||| ||||||  || |||||| |||| | ||||     
T  28298038 tcctcttccttctcctatggattcactcatgacgttttcctaagttttagaggtagtgacacacgctacagttttattggaaatctccacaaagatcttt 28297939  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     |   |||||||| |  ||||||||||||||||  || ||| || |||| || ||||| |||||||||||  |||||  |||||||||  |||| |||||    
T  28297938 gtaggaagggaattcgcaccttcattgatgacagagagcttaaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaagcacattgaagagactaggatttt 28297839  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28297838 cattcctgtcttatctaccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgct 28297765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Original strand, 28514035 - 28514308
Alignment:
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||| || || |||||||||||| |  | || ||||| |||||||| || | |||||| || ||| ||||||  || |||||| |||| | ||||     
T  28514035 tcctcttccttctcctatggattcactcatgacgttttcctaagttttagaggtagtgacacacgctacagttttattggaaatctccacaaagatcttt 28514134  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     |   |||||||| |  ||||||||||||||||  || ||| || |||| || ||||| |||||||||||  |||||  |||||||||  |||| |||||    
T  28514135 gtaggaagggaattcgcaccttcattgatgacagagagcttaaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaagcacattgaagagactaggatttt 28514234  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  28514235 cattcctgtcttatctaccaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgct 28514308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 373
Target Start/End: Original strand, 26936954 - 26937218
Alignment:
Q  109 catcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctct 208  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| | |  |||||  ||  |||| ||||| |||||    
T  26936954 catcatcttccttctcttatggattcacctatgacgtgttcctcagtttcagaggcaccgacactcgcttccattttattggtcatctttacaaagctct 26937053  T
Q  209 tattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatt 308  Q
    |  |||    ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  | |||    
T  26937054 ttgtgattgtggaattcgcaccttcattgatgacaaggagctccatggaggagaagaaatcacaccatcacttgtcaaggcaattgaagattccgggatt 26937153  T
Q  309 tttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacat 373  Q
       || ||||| || ||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||| |||||    
T  26937154 gccatacctgtattctctatcaactatgccacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 26937218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Original strand, 29825958 - 29826082
Alignment:
Q  180 ggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcac 279  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||  ||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  29825958 ggttttaccggcaatctctacaaagctctaactgacaagaaaattcgcaccttcattgatgacaaagagcttcaaagaggggacgaaatcacaccctcac 29826057  T
Q  280 tcatcaaggccattgaagaatctag 304  Q
    |  | ||||| ||| ||||||||||    
T  29826058 ttgtgaaggcaattcaagaatctag 29826082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 298
Target Start/End: Original strand, 26635585 - 26635739
Alignment:
Q  144 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 243  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||  | |||||| || || || ||||| || ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  26635585 gtgttcattagtttcaggggcaccgacactcaattcggtttcaccggtaacctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacaccttcattgatgaca 26635684  T
Q  244 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaaga 298  Q
    | || ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||    
T  26635685 aggagcttaaaaaaggggatgaaatcacaccttcgctcctcaagagcattgaaga 26635739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 298
Target Start/End: Original strand, 26741551 - 26741705
Alignment:
Q  144 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 243  Q
    |||||| | ||||| |||||||| |||||||  | |||||| || || || ||||| || ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  26741551 gtgttcattagtttcaggggcaccgacactcaattcggtttcaccggtaacctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacaccttcattgatgaca 26741650  T
Q  244 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaaga 298  Q
    | || ||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||    
T  26741651 aggagcttaaaaaaggggatgaaatcacaccttcgctcctcaagagcattgaaga 26741705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 308
Target Start/End: Original strand, 25071554 - 25071718
Alignment:
Q  144 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 243  Q
    |||||| | ||||| ||||| || |||||||| | ||||||||| || ||||| || || ||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  25071554 gtgttcattagtttcaggggtaccgacactcgattcggttttaccggtaatctttataaagctctttctgacaaaggaatccacacctttattgatgaca 25071653  T
Q  244 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatt 308  Q
    | || ||| | ||||| || ||||||||||| || |||  ||||  ||||||||| || ||||||    
T  25071654 aagagcttaagagaggtgacgaaatcacaccttcgctccgcaagagcattgaagattcgagaatt 25071718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 533 - 611
Target Start/End: Original strand, 26646763 - 26646838
Alignment:
Q  533 atggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaa 611  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  26646763 atggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggataccattatag---tcctgggtaccccactttacttaaa 26646838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 533 - 611
Target Start/End: Original strand, 26752731 - 26752806
Alignment:
Q  533 atggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaa 611  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   |||| ||||||| ||||||||||||    
T  26752731 atggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggataccattatag---tcctgggtaccccactttacttaaa 26752806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 308
Target Start/End: Original strand, 26949580 - 26949720
Alignment:
Q  168 gacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaa 267  Q
    |||||||| | |||||| || || |||||||| || |||||   ||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| | ||| || ||||    
T  26949580 gacactcgattcggtttcaccggtaatctctataaagctctctctgacaagggaatccgaaccttcattgatgataaggagcttcagaaaggtgacgaaa 26949679  T
Q  268 tcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatt 308  Q
    ||||||| |||||| |||||   ||||||||||| ||||||    
T  26949680 tcacaccttcactcctcaagagaattgaagaatcgagaatt 26949720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Original strand, 27214312 - 27214440
Alignment:
Q  144 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 243  Q
    |||||| | ||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || |||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  27214312 gtgttcattagtttcaggggtaccgacactcgacacggtttcaccggtaatctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgaca 27214411  T
Q  244 atgatcttcaaagaggagatgaaatcaca 272  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||||    
T  27214412 aggagcttcagagaggtgacgaaatcaca 27214440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27234916 - 27234788
Alignment:
Q  144 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 243  Q
    |||||| | ||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || || |||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  27234916 gtgttcattagtttcaggggtaccgacactcgacacggtttcaccggtaatctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgaca 27234817  T
Q  244 atgatcttcaaagaggagatgaaatcaca 272  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||||    
T  27234816 aggagcttcagagaggtgacgaaatcaca 27234788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 274
Target Start/End: Original strand, 26617266 - 26617351
Alignment:
Q  189 ggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacacc 274  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26617266 ggcaatctctataaagctctttgtgacaaaggagtccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgatgaaatcacacc 26617351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 274
Target Start/End: Original strand, 26723194 - 26723279
Alignment:
Q  189 ggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacacc 274  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26723194 ggcaatctctataaagctctttgtgacaaaggagtccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgatgaaatcacacc 26723279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 274
Target Start/End: Original strand, 26959069 - 26959190
Alignment:
Q  153 agttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttc 252  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | | |||| || || || ||||| || ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||     
T  26959069 agtttcaggggcaccgacactcgattcagtttcaccggtaacctctataaagctctttctgacaaaggaatcgacaccttcattgatgacaaagagctta 26959168  T
Q  253 aaagaggagatgaaatcacacc 274  Q
    ||| ||| ||||||||||||||    
T  26959169 aaaaaggggatgaaatcacacc 26959190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27665409 - 27665272
Alignment:
Q  144 gtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgaca 243  Q
    |||||| | ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27665409 gtgttcattagtttcaggggtaccgacactcgatttggtttcaccggtaacctctataaggctctttctgacaaaggaatccacaccttcattgatgaca 27665310  T
Q  244 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactc 281  Q
    | || |||| ||  || || ||||||||||| ||||||    
T  27665309 aggagcttccaactggtgacgaaatcacaccttcactc 27665272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 533 - 613
Target Start/End: Original strand, 26056210 - 26056290
Alignment:
Q  533 atggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaatc 613  Q
    ||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  26056210 atggaagatggctcttactcaagctgctaacttgtccggctatcattatagtcctcatgagtaccctactttacttaaatc 26056290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 533 - 613
Target Start/End: Original strand, 26076180 - 26076260
Alignment:
Q  533 atggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaatc 613  Q
    ||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  26076180 atggaagatggctcttactcaagctgctaacttgtccggctatcattatagtcctcatgagtaccctactttacttaaatc 26076260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 543 - 611
Target Start/End: Original strand, 26143159 - 26143227
Alignment:
Q  543 gctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacccaactttacttaaa 611  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  26143159 gctcttatccaagctgctaacttgtccggctatcattatagtcctcatgggtaccccactttacttaaa 26143227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Original strand, 26811453 - 26811556
Alignment:
Q  193 atctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccat 292  Q
    ||||||| || ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||| |||||  |||    
T  26811453 atctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaatcacaccttcgctcctcaagagcat 26811552  T
Q  293 tgaa 296  Q
    ||||    
T  26811553 tgaa 26811556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 403
Target Start/End: Original strand, 2184288 - 2184442
Alignment:
Q  249 cttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaat 348  Q
    |||||| |||| | |||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || |  |||||||| |||||   ||    
T  2184288 cttcaacgagggggtgaaataacagcatcacttatgaaagccattgaagagtccagaattttcatccctgttttctcaaagaactatgcttcttcttcat 2184387  T
Q  349 tttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcct 403  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||| ||||||| |||||    
T  2184388 tttgtttggacgaacttgtccacatcattcgttactccaagtcaaagggacgcct 2184442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 27338482 - 27338450
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattct 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338482 cacagaccacaaaaacttactcattcatattct 27338450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 27399222 - 27399190
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattct 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27399222 cacagaccacaaaaacttactcattcatattct 27399190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28491744 - 28491660
Alignment:
Q  212 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaa 296  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||| || ||| | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28491744 tgacaaaggagtccgtactttcatggacgacgaggagcttcaaaaaggtgaagaaatcacaccatcactcatcaaagccattgaa 28491660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29804154 - 29804070
Alignment:
Q  212 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaa 296  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||| || ||| | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29804154 tgacaaaggagtccgtactttcatggacgacgaggagcttcaaaaaggtgaagaaatcacaccatcactcatcaaagccattgaa 29804070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 402
Target Start/End: Original strand, 2184880 - 2185051
Alignment:
Q  231 ttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatca 330  Q
    ||||| |||||| | || |||||| |||| | |||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || |       
T  2184880 ttcatggatgacgaagagcttcaacgagggggtgaaataacaccatcgcttgtgaaagccattgaagaatccagaattttcatccctgttttctcaaagg 2184979  T
Q  331 actatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcc 402  Q
    ||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| || || |||| |||||  ||| ||||||| ||||    
T  2184980 actatgcttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccatatcattcgttgctccaagtcaaagggacgcc 2185051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 298
Target Start/End: Original strand, 29467797 - 29467876
Alignment:
Q  219 ggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaaga 298  Q
    ||||| || |||||||| |||||  | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29467797 ggaattcacaccttcatggatgatgaagaacttcaaaaaggcgaagaaatcacaccatcactcatcaaagctattgaaga 29467876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 298
Target Start/End: Original strand, 26974971 - 26975101
Alignment:
Q  168 gacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaa 267  Q
    |||||||| | |||||| || || || ||||| || ||||||  |||||| |||||| | | ||||||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||    
T  26974971 gacactcgattcggtttcaccggtaacctctataaagctctttctgacaaaggaatcaacatcttcattgatgacaaggagcttaaaaaaggggacgaaa 26975070  T
Q  268 tcacaccatcactcatcaaggccattgaaga 298  Q
    ||||||| || ||| |||||  |||||||||    
T  26975071 tcacaccttcgctcctcaagagcattgaaga 26975101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 587
Target Start/End: Original strand, 27214652 - 27214758
Alignment:
Q  481 agcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatga 580  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||  | ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||| |    
T  27214652 agcatgaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctgctaacttatctggctatcatta 27214751  T
Q  581 tagtcct 587  Q
    |||||||    
T  27214752 tagtcct 27214758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 481 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 27234576 - 27234470
Alignment:
Q  481 agcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatga 580  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||  | ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||| |    
T  27234576 agcatgaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctgctaacttatctggctatcatta 27234477  T
Q  581 tagtcct 587  Q
    |||||||    
T  27234476 tagtcct 27234470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14056 - 13490
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||     
T  14056 cacagaccacaaaaacaaactcattcatattctgaattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattatcatggctatgcaattaccttcctct 13958  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13957 tcctcttcattttcctctgcattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctctta 13858  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13857 ctgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttt 13758  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  13757 tattcctgtgttttctatcaactacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttg 13658  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataagg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||     
T  13657 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataaga 13558  T
Q  511 ataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccat 578  Q
    ||||||||||| | ||| | | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13557 ataacatggagcgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccat 13490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 5100 - 4529
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcatt-----catattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctcctt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||     ||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||| | |||||||| || || ||||    
T  5100 cacagaccacaaaaacttattcattaaattcatattctgaattctcaaactctttttt-catccaatttctctcaattcttatggctatacaatcacctt 5002  T
Q  106 cctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggc 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  5001 cctcatcctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggc 4902  T
Q  206 tcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctaga 305  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||     
T  4901 tcttactgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatccctccgcaaggccattgatgaatctagg 4802  T
Q  306 atttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4801 atttttattcctgtgttttctatcttctatgccttttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcg 4702  T
Q  406 tcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatga 505  Q
    | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4701 ttttgcctgttttcttcggcgtggaacctactaacgtgcgacatctgaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatga 4602  T
Q  506 taaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccat 578  Q
    |||| ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4601 taagaataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccat 4529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 3844 - 3259
Alignment:
Q  12 acagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcat 111  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||    
T  3844 acagaccacaaaaatttac-cattcatattctgcattctcaaactctttttt-catcctatttctctcaattgtcatggctatacaatcaccttcctcat 3747  T
Q  112 cctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttat 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  3746 cctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttac 3647  T
Q  212 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaattttt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3646 tgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggattttt 3547  T
Q  312 attcctgtgttttctatcaa-ctatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  3546 attcctgtgttttctatcaacctatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttctg 3447  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataag- 509  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |     
T  3446 cctgttttatttggtgtggaacctactattgtgcgacatcgtaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccga 3347  T
Q  510 gataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacc 597  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3346 aaaaacatggagaggttgcagcgatggaaagtggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacc 3259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 14767 - 14195
Alignment:
Q  22 aaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcatt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  14767 aaaatttactcattcatattctgcattctcaaactcttttt--catcctatttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctcatccacttcatt 14670  T
Q  122 ttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaaggga 221  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14669 ttcctatggattcacttaccaagtgttcatcagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaaggga 14570  T
Q  222 atccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14569 atccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgt 14470  T
Q  322 tttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctt 421  Q
    |||||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14469 tttctatcaactatgcct-ttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttctt 14371  T
Q  422 tggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggag 521  Q
     || ||||| |||||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||||||    
T  14370 cggcgtggaacctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaaacatggag 14271  T
Q  522 aggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctcggtacc 597  Q
    |||||| || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14270 aggttgcagggatggaaagaggctctgagccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcctcctgggtacc 14195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8225 - 8061
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||    
T  8225 cacagaacacaaaaattcactcattcatattctgcattctcaaactctttttt-catcctatttctctcaattctcatggctatacaatcaccttcctca 8127  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgg 176  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8126 tcctcttcattctcccatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgg 8061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 578
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7854
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||       |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| ||||     
T  7295 cacagaccacaaaaacttactcattcatattct-------caaactctttttt-catctaatttctctcaattctcatggctatgcaatcacctccctct 7386  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7387 tcctcttcattttcatatgcattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctctta 7486  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7487 ctgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttt 7586  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  7587 tattcctgtgttttctatcaactacgccacttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacagaaggtcgcctcgttttg 7686  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataagg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||     
T  7687 cctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataaga 7786  T
Q  511 ataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccat 578  Q
    ||||||||||| | ||| | | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7787 ataacatggagcgattgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccat 7854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 334 - 1
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||       |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| ||||     
T  334 cacagaccacaaaaacttactcattcatattct-------caaactctttttt-catctaatttctctcaattctcatggctatgcaatcacctccctct 243  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  242 tcctcttcattttcatatgcattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctctta 143  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  142 ctgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttt 43  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42 tattcctgtgttttctatcaactacgccacttcaaaattttg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18699807 - 18699386
Alignment:
Q  13 cagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatc 112  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||       |||| | |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  18699807 cagaccacaaaaacttaacc--tcatattctgcattctcaaactctttttt-catctagtttctctcaattctcatggctatgcaatcaccttcctcatc 18699711  T
Q  113 ctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttatt 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |    
T  18699710 ctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcactgacactcgtgacggttttactggccatctctacaaagctcttact 18699611  T
Q  213 gacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaattttta 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  18699610 gacaagggaatccacaccttcattgatgaccgtgacctgcaaagtggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatcttca 18699511  T
Q  313 ttcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18699510 ttcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgttcacatcattcactgctacaagacaaaaggtcgtctcgttttgcc 18699411  T
Q  413 tgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    |||||||| ||| || |||||||||    
T  18699410 tgttttctatggcgtagatcctact 18699386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18731913 - 18731492
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18731913 cacataccacaaaaacttaaac--tcatattctgcattctcaaactctttttt-catccagtttctctcgattttcatggctatgcaatcaccttcctca 18731817  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  |||||||    
T  18731816 tcctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggccatctctacagagctctta 18731717  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  18731716 ctgacaagggaatccacaccttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatctt 18731617  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || |||    
T  18731616 cattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcatgcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttg 18731517  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatccta 435  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||    
T  18731516 cctgttttctatggcgtggatccta 18731492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18655886 - 18655463
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  18655886 cacataccacaaaaacttaaac--tcatattctgcattctcaaactctttttt-catccagtttctctcaattttcatggctaggcaatcaccttcctca 18655790  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  18655789 tcctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactgggcatctctacaaagctctta 18655690  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| |||||| |||| ||||| || ||    
T  18655689 ctgacaagggaatccacaccttcattgatgaccgtgagctgcaaagtggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattcaagagtctaggatctt 18655590  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||     
T  18655589 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccgcatcattcactgctacaagacaaagggtcgtctcgttttt 18655490  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18655489 cctgttttctatggcgtggatcctact 18655463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18679976 - 18679553
Alignment:
Q  11 cacagaccacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctca 110  Q
    |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18679976 cacataccacaaaaacttaaac--tcatattctgcattctcaaactctttttt-catccagtttctctctattttcatggctatgcaatcaccttcctca 18679880  T
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  18679879 ttctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactggtcatctctacaaggctctta 18679780  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  18679779 ctgacaaaggaatccacaccttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatctt 18679680  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttg 410  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||    
T  18679679 cattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgtcttgttttg 18679580  T
Q  411 cctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  18679579 cctgttttctatgtcgtggatcctact 18679553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 79 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18724429 - 18724073
Alignment:
Q  79 caattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggta 178  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |    
T  18724429 caattctcatggctatgcaatcaccttcctcatcctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaa 18724330  T
Q  179 cggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatca 278  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  18724329 cggttttactggtcatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatca 18724230  T
Q  279 ctcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattc 378  Q
    |||  ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||| ||||| || |    
T  18724229 ctcgacaatgccattgaagagtctaggatcttcattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttgaacgaacttgtccacatcatgc 18724130  T
Q  379 attgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatccta 435  Q
    | ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18724129 actgctacaagacaaagggtcgtcttgttttgcctgttttctatggcgtggatccta 18724073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 581
Target Start/End: Original strand, 18073535 - 18074094
Alignment:
Q  16 accacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctc 115  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| |  |||| ||  |||||    
T  18073535 accacaaaaacatcctcattcatattctgcattctcaaactcttct---catcttatttctctcaattctcatggccatgcaattacctttctattcctc 18073631  T
Q  116 ttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgac 215  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18073632 ttcattttcctatgcattcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgac 18073731  T
Q  216 aagggaatccataccttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaattt 309  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| || ||||    
T  18073732 aagggaattcgtaccttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattt 18073822  T
Q  310 ttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtctt 409  Q
    | |||||  | ||||||  ||||||||| |||||   || ||| ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  18073823 tgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgtttt 18073922  T
Q  410 gcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18073923 gcctgttttctttggtgtggaacctactgatgtgcgacatcatacaggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaataggtttcaaaatgatacg 18074022  T
Q  510 gataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgat 581  Q
     | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  18074023 aaaaacatggagaggttgcagcaatggaaagtggctctgagtctggctgctaacttgcccagctaccatgat 18074094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17989454 - 17989226
Alignment:
Q  16 accacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctc 115  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| |  |||| ||  |||||    
T  17989454 accacaaaaacatcctcattcatattctgcattctcaaactcttct---catcttatttctctcaattctcatggccatgcaattacctttctattcctc 17989358  T
Q  116 ttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgac 215  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  17989357 ttcattttcctatgcattcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgac 17989258  T
Q  216 aagggaatccataccttcattgatgacaatga 247  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| ||||    
T  17989257 aagggaattcgtaccttccatgatgacgatga 17989226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 5091237 - 5090902
Alignment:
Q  153 agttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttc 252  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||||   || ||||||||| || ||||||||||||||||  || ||||    
T  5091237 agttttagaggcaccgacactcgttacggttttactggaaatctctatgaagctctacgtgtcaagggaattcacaccttcattgatgacagagagcttc 5091138  T
Q  253 aaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttg 352  Q
    |  |||||||  |||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||  ||| | |||   || || |||| | ||||||| |||||    |||||    
T  5091137 agcgaggagaccaaataacaccgtcacttctcaaggccattcaagaatctaagattgtcattatcgttttctctaaccactatgcttcttcttcgttttg 5091038  T
Q  353 cttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcat 452  Q
     || || |||||||| || |||||||| ||||  |||  ||| ||| |||| || |||||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||  ||||     
T  5091037 tttagatgaacttgtccatattattcactgctccaaggaaaatggttgcctggttttgcctattttctatggtgtggaaccttctcatgtgcgatatcag 5090938  T
Q  453 acatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaa 488  Q
    ||  | || |||||||||||| | || |||||||||    
T  5090937 actggaagttatggtgaagcacttgctgagcatgaa 5090902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 513 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 18655387 - 18655313
Alignment:
Q  513 aacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcct 587  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18655387 aacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcct 18655313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 513 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 18723995 - 18723921
Alignment:
Q  513 aacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcct 587  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18723995 aacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttagtcct 18723921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 513 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18731414 - 18731349
Alignment:
Q  513 aacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccat 578  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18731414 aacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccat 18731349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 18679477 - 18679403
Alignment:
Q  513 aacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcct 587  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18679477 aacatggagcggttgcatcaatggaagttagctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattttagtcct 18679403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18699310 - 18699245
Alignment:
Q  513 aacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccat 578  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18699310 aacatggagcggttgcatcaatggaagttagctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccat 18699245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 65 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28164720 - 28164200
Alignment:
Q  65 catccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggc 164  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| |  || | |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28164720 catccaatttctgtcaattctcatggctatacgatcgcattcctcttcctcttcaatttcctatggattcacataccaagtgttcctcagttttaggggc 28164621  T
Q  165 actgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatg 264  Q
    | |||||||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||| || || |||||||||||   ||||||| | |||||||| |    
T  28164620 agtgacactcgtgacggtttcactggccatctctataaggcccttgacgacaagggaattcacacattcattgatgattgtgatcttgagagaggagaag 28164521  T
Q  265 aaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaact 364  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  28164520 aaatcacaccgtcattcatcaaggccattgaaaaatcttgaatttttattcctgtgttatctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaact 28164421  T
Q  365 tgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctat 464  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||    
T  28164420 tgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctagttttgcctgttttc-ttggcgtggatcctactgatgtgcgacatcatacagggagttat 28164322  T
Q  465 ggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaact 564  Q
    ||  |||   |  |  ||||||   | ||||| |||||| | ||| | ||||||||| | ||| | | ||||||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  28164321 ggcaaagatcttactaagcatggtgagaggttccaaaataacaagaaaaacatggagcgattgcaccaatggaagatagctctaacccaagctgctaact 28164222  T
Q  565 tgtccggctaccatgatagtcc 586  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  28164221 tgtccggctaccattatagtcc 28164200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 111 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28127992 - 28127516
Alignment:
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||||| |||     
T  28127992 tcctcttcaatttcctatggattcacataccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtgacggtttcactggccatctctacaaggcccttt 28127893  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggag-atgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaattt 309  Q
     ||||||||||||||| || |||||||||||   | ||||| | ||||||| |  |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  28127892 atgacaagggaatccacacattcattgatgattgtaatcttgagagaggagaaaaaaatcacaccgtcacttttaaaggccattgaagaatctagaattt 28127793  T
Q  310 ttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtctt 409  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  28127792 ttattcctgtattttctaccaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtgcacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctagtttt 28127693  T
Q  410 gcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataag 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||||||   | ||  |||||| | | ||||| |||||| | |||    
T  28127692 gcctgttttctttggcgtggatcctactgatgtgcgatatcatacagggagttatggtgaagagcttgctaagcatggagagaggttccaaaataacaag 28127593  T
Q  510 gataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgatagtcc 586  Q
     | ||||||||| | ||| | | ||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28127592 aaaaacatggagcgattgcaccaatggaagatagctctaacccaagctgctaacttgtccggctaccattatagtcc 28127516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 268695 - 268343
Alignment:
Q  85 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 184  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||||  | ||||| || |||||||  || || |||  |||||||||  | |||||    
T  268695 tcatggctatgcaatcaccttcctcttcctcttcaatctcatatggatttgcctaccaggtcttcctcaacttcagaggcggtgacactcgtgagggttt 268596  T
Q  185 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 284  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |    
T  268595 tattggccatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgac 268496  T
Q  285 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  268495 aatgccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 268396  T
Q  385 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    | |||| ||||||||| ||| | ||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  268395 acaagaaaaagggtcgtctcattttgcccgtcttctatggcgtggatcctact 268343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 268267 - 268202
Alignment:
Q  513 aacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccat 578  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  268267 aacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagcttctaacttgtctggctaccat 268202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 581
Target Start/End: Original strand, 59343 - 59902
Alignment:
Q  16 accacaaaaacttactcattcatattctgcattctcaaactcnnnnnnncatccaatttctcacaattttcatggctatgcagtctccttcctcatcctc 115  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||| |  |||| ||  |||||    
T  59343 accacaaaaacatcctcattcatattctgcattctcaaactcttct---catcttatttctctcaattctcatggccatgcaattacctttctattcctc 59439  T
Q  116 ttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgac 215  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  59440 ttcattttcctatgcattcagttacgatgtgttcctcatttgtaagggcaccgacactcggtacggtttcaccggcaatctcttgaaggctcttattgac 59539  T
Q  216 aagggaatccataccttcattgatgacaatga------tcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaattt 309  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| ||||      |||||||||| ||||  || ||||||||    |||| |      |||||||||| || ||||    
T  59540 aagggaattcgtaccttccatgatgacgatgacagtgatcttcaaagaagagacaaagtcacaccaa---tcatta------ttgaagaatccaggattt 59630  T
Q  310 ttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtctt 409  Q
    | |||||  | ||||||  ||||||||| |||||   || ||| ||||||  |||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  59631 tgattcccatattttctgccaactatgcatcttcttcatcttgtttggacacacttgtccacatcattcactgctacaaaaccaagggttgcctcgtttt 59730  T
Q  410 gcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgccatcatacatgtagctatggtgaagcattggccgagcatgaaaaaaggtttcaaaatgataag 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  59731 gcctgttttctttggtgtggaacctactgatgtgcgacatcatacaggtaggtatggtaaagcattggctgagcatgaaaataggtttcaaaatgatacg 59830  T
Q  510 gataacatggagaggttggagcgatggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccatgat 581  Q
     | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  59831 aaaaacatggagaggttgcagcaatggaaagtggctctgagtctggctgctaacttgcccagctaccatgat 59902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 29274121 - 29273769
Alignment:
Q  85 tcatggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttt 184  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||  |||||||||  |||||||    
T  29274121 tcatggctatgcaatcaccttcctcttcctcttcaatctcatatggattcacttaccaggtcttcctcaactttagaggcggtgacactcgtgacggttt 29274022  T
Q  185 tacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatc 284  Q
    ||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |    
T  29274021 tattggccatctctacaagactcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaatcatcactcgac 29273922  T
Q  285 aaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  29273921 aatgtcattgaagagtctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 29273822  T
Q  385 ataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctact 437  Q
    | |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  29273821 acaagacaaagggtcgtctcattttgcctgtcttctatggcgtggatcctact 29273769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 280
Target Start/End: Original strand, 31903727 - 31903882
Alignment:
Q  125 ttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatc 224  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||   |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||    
T  31903727 ttatggattcacctacgatgtgttcctcagctttagaggcttagacactcgctatggttttactggaaatctctacaaagctctttatgataagggaatc 31903826  T
Q  225 cataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcact 280  Q
    || ||||| ||||| ||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31903827 cacacctttattgacgatgaagaacttcaaagaggacatgaaatcacaccatcact 31903882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 533 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 29273673 - 29273628
Alignment:
Q  533 atggaaattggctctgacccaggctgctaacttgtccggctaccat 578  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  29273673 atggaagttggctctgacccaagcttctaacttgtctggctaccat 29273628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 384
Target Start/End: Original strand, 34602 - 34860
Alignment:
Q  126 tatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatcc 225  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |  |||||||| |  ||||||  | ||||||||||||    
T  34602 tatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtagtgacactcgctatggttttaccgaaaatctctatagagctctttgtcacaagggaatcc 34701  T
Q  226 ataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttc 325  Q
    | ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  34702 acaccttcattgatgacagggagcttcaaggaggagatgaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtc 34801  T
Q  326 tatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  34802 tatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgct 34860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 384
Target Start/End: Original strand, 27313 - 27583
Alignment:
Q  114 tcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattg 213  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||  | ||||  |     
T  27313 tcttccttctcttatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtattgacactcgttatggttttactggaaatctctacagtgatctttgta 27412  T
Q  214 acaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttat 313  Q
    | |||||||| || || ||| ||||||| |  || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  27413 agaagggaattcacacattctttgatgatagagagcttcaaggaggtgatgaaataacatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcat 27512  T
Q  314 tcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27513 tcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgct 27583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Original strand, 116658 - 116931
Alignment:
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||     
T  116658 tcctcttccttttcctatggattcacctatgacgtgttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatcttt 116757  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     |   ||| |||| | |||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  116758 gtaggaagagaattcgtaccttcattgatgacaaagaccttcaacgaggtgacgaaataacaccgtcacttttcaaggccattgaagagtctaggatttt 116857  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
     |||||| | || |||||||| ||||| |||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  116858 cattcctattttgtctatcaattatgcttcttcttccttttgcttggatgaacttgtccacattattcactgct 116931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 439
Target Start/End: Original strand, 42864 - 43156
Alignment:
Q  147 ttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatg 246  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||  | | |||||||| |  ||||||||||||||||  |    
T  42864 ttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaagaagggaattcgcaccttcattgatgacagag 42963  T
Q  247 atcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaa 346  Q
    | |||| | |||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||       
T  42964 aacttccaggaggtgacaaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttcttcttc 43063  T
Q  347 attttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctataagacaaagggtcgcctcgtcttgcctgttttctttggtgtggatcctactaa 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || ||||| || |||||  |||||| || |||||| ||| ||||    
T  43064 attttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaagaaaaatggacgcctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctaa 43156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 58607 - 58334
Alignment:
Q  111 tcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctctta 210  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||   ||||||||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||     
T  58607 tcctcttccttctcctatggattcacctatcacgtgttccttagctttagaggttgtgacactcgctatggttttactggaaatctctacagagctcttt 58508  T
Q  211 ttgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttt 310  Q
     ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  58507 gtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaaggccattaaagagtctaggatttt 58408  T
Q  311 tattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
     ||||| || || |||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  58407 cattcccgtcttgtctatcaactatgcttcttcttcattttgcttgaacgaacttgtccacatcattcactgct 58334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 384
Target Start/End: Original strand, 3279562 - 3279823
Alignment:
Q  123 tcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaa 222  Q
    |||||||||||||| ||  | || ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |  ||| | | ||||   |||     
T  3279562 tcttatggattcacctatgacgtattcttgagttttaggggcactgacactcgctatggttttactggaaatctctatagagctttaagtgacggtggat 3279661  T
Q  223 tccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtgtt 322  Q
    ||   |||||||||||||| |  || |||||  |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| || |  ||||||||||| || ||    
T  3279662 tctgcaccttcattgatgatagggagcttcatggaggtgatgaaatcacacaatcacttgtcaaggccatcgaagagtccatgatttttattccggtctt 3279761  T
Q  323 ttctatcaactatgcctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgct 384  Q
     |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3279762 ctctatcaactatgcttcttctatattttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgct 3279823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17994033 - 17993812
Alignment:
Q  87 atggctatgcagtctccttcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggtttta 186  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || || || |||||||| ||||  | | | |||||| | ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  17994033 atggctatgcaatcaccttcctcctcttcctccttatcttatggtttcagcttcgatgtgttcattagtttcaggggtaccgatactcgatatggtttca 17993934  T
Q  187 cgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaa 286  Q
    | || |||||||| || ||||||  |||||||||||| |  |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||    
T  17993933 ccggtaatctctataaagctctttctgacaagggaattcgaaccttcatcgatgacaaagagcttcagagaggtgatgaaatcacaccgtcgctcctcaa 17993834  T
Q  287 ggccattgaagaatctagaatt 308  Q
    |  ||||||||| || ||||||    
T  17993833 gagcattgaagactcaagaatt 17993812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 298
Target Start/End: Original strand, 16688944 - 16689060
Alignment:
Q  182 ttttacgggcaatctctacaaggctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactc 281  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||   |||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||     
T  16688944 ttttactggtaatctgtacaaagctctatgtgacaagggaatccgtgtcttcattgatgacaaggaacttcagagaggtgacaaaatcacaccatcactt 16689043  T
Q  282 atcaaggccattgaaga 298  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16689044 atcaaggcaattgaaga 16689060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University