View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4594-Insertion-2 (Length: 835)

Name: NF4594-Insertion-2
Description: NF4594
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4594-Insertion-2
NF4594-Insertion-2
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (471-835)||(15160932-15161296)
chr1 (254-664)||(8996014-8996423)
chr1 (249-666)||(40999851-41000267)
chr1 (252-666)||(38121682-38122096)
chr1 (252-666)||(39000931-39001345)
chr1 (252-667)||(11738548-11738962)
chr1 (252-666)||(12167966-12168380)
chr1 (244-479)||(15161612-15161847)
chr1 (253-666)||(16832534-16832946)
chr1 (253-666)||(432092-432504)
chr1 (8-247)||(15164196-15164428)
chr1 (252-666)||(44505018-44505434)
chr1 (252-666)||(33491948-33492362)
chr1 (253-666)||(9667447-9667859)
chr1 (252-666)||(13217799-13218209)
chr1 (252-666)||(49249070-49249476)
chr1 (244-554)||(36083869-36084178)
chr1 (244-680)||(9268620-9269056)
chr1 (276-666)||(13830286-13830673)
chr1 (244-472)||(16130706-16130925)
chr1 (396-665)||(39454102-39454375)
chr1 (276-665)||(6244200-6244583)
chr1 (475-666)||(16129657-16129848)
chr1 (475-644)||(16130234-16130402)
chr1 (603-679)||(36080205-36080281)
chr1 (598-680)||(7612384-7612469)
chr1 (357-497)||(13249115-13249254)
chr1 (357-496)||(31473658-31473796)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (249-664)||(22233597-22234012)
chr8 (252-676)||(13509954-13510375)
chr8 (252-676)||(13599484-13599905)
chr8 (249-664)||(22222422-22222828)
chr8 (244-666)||(16958548-16958972)
chr8 (252-666)||(22180599-22181013)
chr8 (249-664)||(22228764-22229170)
chr8 (253-680)||(4861702-4862128)
chr8 (256-680)||(22242997-22243420)
chr8 (252-671)||(11308737-11309156)
chr8 (252-666)||(9067917-9068331)
chr8 (252-666)||(8743033-8743447)
chr8 (252-666)||(28925893-28926307)
chr8 (252-666)||(3298800-3299213)
chr8 (253-666)||(28370091-28370504)
chr8 (252-666)||(27348024-27348438)
chr8 (252-666)||(41577081-41577495)
chr8 (253-666)||(34006524-34006924)
chr8 (244-666)||(12538155-12538583)
chr8 (247-675)||(1607272-1607703)
chr8 (345-666)||(16580083-16580404)
chr8 (249-444)||(17993087-17993281)
chr8 (244-453)||(13849071-13849278)
chr8 (474-680)||(17992878-17993085)
chr8 (244-441)||(21692669-21692866)
chr8 (442-625)||(24040756-24040937)
chr8 (244-414)||(36736948-36737117)
chr8 (598-680)||(21692149-21692234)
chr8 (249-291)||(22227255-22227297)
chr8 (630-666)||(36737112-36737149)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (252-680)||(1274574-1274999)
chr7 (253-676)||(22909108-22909528)
chr7 (244-666)||(2477656-2478080)
chr7 (252-667)||(2797313-2797728)
chr7 (244-666)||(3544620-3545044)
chr7 (252-666)||(10346055-10346469)
chr7 (252-666)||(31158026-31158440)
chr7 (254-666)||(31878599-31879009)
chr7 (252-666)||(2631394-2631808)
chr7 (252-666)||(12090210-12090624)
chr7 (252-666)||(8107638-8108052)
chr7 (255-666)||(22321554-22321964)
chr7 (276-680)||(29032568-29032961)
chr7 (275-666)||(12190841-12191230)
chr7 (252-666)||(23795092-23795506)
chr7 (252-666)||(12183864-12184276)
chr7 (244-666)||(45500453-45500874)
chr7 (244-666)||(24482742-24483165)
chr7 (252-589)||(19471940-19472275)
chr7 (286-666)||(31664279-31664658)
chr7 (252-666)||(6172525-6172927)
chr7 (354-666)||(22818410-22818721)
chr7 (341-666)||(1953955-1954270)
chr7 (253-364)||(22820404-22820515)
chr7 (531-666)||(19472291-19472427)
chr7 (527-680)||(19063500-19063651)
chr7 (264-334)||(31882440-31882510)
chr7 (244-306)||(1954285-1954347)
chr7 (598-675)||(27951479-27951557)
chr7 (357-446)||(8139140-8139229)
chr7 (604-666)||(33160180-33160243)
chr7 (598-666)||(27954733-27954802)
chr7 (244-324)||(9702027-9702108)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (244-680)||(1232233-1232673)
chr3 (253-680)||(2357145-2357571)
chr3 (249-680)||(23193907-23194334)
chr3 (252-666)||(9989394-9989807)
chr3 (252-667)||(45527644-45528059)
chr3 (244-666)||(3588398-3588820)
chr3 (252-666)||(48167944-48168357)
chr3 (253-666)||(37471438-37471850)
chr3 (244-666)||(33247986-33248409)
chr3 (252-666)||(7652972-7653386)
chr3 (252-666)||(10385820-10386234)
chr3 (252-666)||(22097665-22098078)
chr3 (252-666)||(52307835-52308249)
chr3 (244-672)||(49434089-49434517)
chr3 (253-666)||(20837092-20837504)
chr3 (253-666)||(36469187-36469598)
chr3 (252-666)||(27850301-27850713)
chr3 (244-677)||(26335102-26335528)
chr3 (252-625)||(4742753-4743122)
chr3 (351-666)||(8615501-8615816)
chr3 (252-486)||(37022867-37023102)
chr3 (252-447)||(20963006-20963200)
chr3 (439-666)||(23385394-23385622)
chr3 (252-356)||(8625931-8626035)
chr3 (491-666)||(27030672-27030847)
chr3 (252-404)||(23411748-23411889)
chr3 (561-666)||(20963711-20963817)
chr3 (598-666)||(17405155-17405224)
chr3 (277-324)||(27104326-27104373)
chr3 (276-479)||(17404894-17405097)
chr3 (598-666)||(25804980-25805049)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (244-674)||(9786846-9787282)
chr2 (244-680)||(21159945-21160385)
chr2 (244-671)||(13230084-13230510)
chr2 (252-666)||(36667619-36668033)
chr2 (244-666)||(28457619-28458041)
chr2 (244-666)||(14700639-14701063)
chr2 (252-666)||(27257383-27257796)
chr2 (252-666)||(36040012-36040426)
chr2 (252-666)||(29223713-29224126)
chr2 (252-666)||(29337012-29337425)
chr2 (253-666)||(23924783-23925195)
chr2 (244-666)||(24662871-24663295)
chr2 (244-666)||(32522927-32523348)
chr2 (252-676)||(43991517-43991937)
chr2 (254-549)||(41977710-41978004)
chr2 (252-479)||(42700723-42700949)
chr2 (447-666)||(36557465-36557686)
chr2 (244-430)||(40200173-40200359)
chr2 (255-405)||(36557315-36557466)
chr2 (244-441)||(31758500-31758697)
chr2 (471-666)||(42702175-42702370)
chr2 (491-666)||(5784513-5784688)
chr2 (603-679)||(492724-492800)
chr2 (598-671)||(8687768-8687842)
chr2 (598-666)||(11651814-11651883)
chr2 (598-680)||(31758256-31758341)
chr2 (357-406)||(24852800-24852849)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (244-673)||(726-1154)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (252-676)||(25976940-25977361)
chr6 (252-680)||(14270656-14271084)
chr6 (252-674)||(1454786-1455203)
chr6 (252-674)||(1466478-1466895)
chr6 (252-664)||(34006502-34006914)
chr6 (252-666)||(3539045-3539459)
chr6 (252-666)||(26515178-26515592)
chr6 (244-666)||(5988744-5989166)
chr6 (252-666)||(24161006-24161419)
chr6 (252-666)||(9932555-9932969)
chr6 (252-666)||(32806513-32806926)
chr6 (253-666)||(21596279-21596695)
chr6 (244-666)||(15642416-15642838)
chr6 (252-550)||(34913803-34914100)
chr6 (253-666)||(24878863-24879276)
chr6 (264-674)||(13173586-13173987)
chr6 (256-674)||(13182111-13182520)
chr6 (249-680)||(9518193-9518621)
chr6 (249-674)||(21631170-21631598)
chr6 (249-666)||(26604337-26604755)
chr6 (252-486)||(16698088-16698321)
chr6 (345-694)||(32821772-32822119)
chr6 (491-666)||(14479558-14479733)
chr6 (358-663)||(6867907-6868213)
chr6 (556-680)||(34913435-34913557)
chr6 (583-666)||(26510392-26510476)
chr6 (774-835)||(1454627-1454689)
chr6 (774-835)||(1466319-1466381)
chr6 (276-508)||(25541255-25541486)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (254-664)||(37251657-37252065)
chr5 (252-666)||(11723026-11723440)
chr5 (252-666)||(16904359-16904773)
chr5 (252-666)||(27166848-27167261)
chr5 (252-666)||(9404422-9404836)
chr5 (252-666)||(11766753-11767166)
chr5 (252-666)||(31845978-31846391)
chr5 (252-666)||(30606826-30607240)
chr5 (252-666)||(33434601-33435014)
chr5 (253-666)||(34869497-34869910)
chr5 (252-666)||(34456295-34456707)
chr5 (249-679)||(39655783-39656214)
chr5 (287-666)||(7314963-7315342)
chr5 (252-666)||(14344467-14344873)
chr5 (252-666)||(6269888-6270302)
chr5 (252-666)||(24835733-24836134)
chr5 (252-510)||(7315358-7315616)
chr5 (249-373)||(519320-519444)
chr5 (252-408)||(32226914-32227070)
chr5 (599-664)||(32226833-32226898)
chr5 (357-497)||(42747484-42747623)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (252-676)||(11954-12373)
scaffold0298 (252-676)||(15724-16143)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (252-666)||(116318-116731)
scaffold0019 (252-320)||(169158-169226)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (253-666)||(30218137-30218555)
chr4 (252-666)||(19247578-19247991)
chr4 (252-666)||(4838886-4839300)
chr4 (253-666)||(40995298-40995713)
chr4 (252-680)||(33110452-33110881)
chr4 (252-666)||(21677417-21677831)
chr4 (244-662)||(46691779-46692196)
chr4 (252-666)||(26069723-26070139)
chr4 (244-638)||(53895406-53895798)
chr4 (252-664)||(1187965-1188376)
chr4 (252-666)||(323436-323850)
chr4 (252-666)||(22047679-22048093)
chr4 (252-666)||(42532636-42533051)
chr4 (276-666)||(20948743-20949133)
chr4 (244-666)||(26373373-26373793)
chr4 (252-666)||(52618512-52618914)
chr4 (252-666)||(5273312-5273715)
chr4 (275-666)||(55326772-55327165)
chr4 (252-666)||(35416446-35416847)
chr4 (357-665)||(6639976-6640286)
chr4 (244-441)||(9417175-9417372)
chr4 (531-666)||(44432081-44432217)
chr4 (598-675)||(8894920-8894998)
chr4 (598-666)||(9417531-9417600)
chr4 (253-324)||(8895205-8895277)
chr4 (244-324)||(13568266-13568347)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (244-675)||(14176-14605)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (252-676)||(12185-12606)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (252-666)||(28649-29063)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (252-666)||(8740-9154)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (244-666)||(76194-76615)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (253-666)||(25401-25814)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (244-666)||(16215-16637)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (254-666)||(6730-7141)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (252-513)||(12238-12491)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (433-679)||(35212-35458)
scaffold0160 (249-373)||(35070-35191)
[»] scaffold0447 (4 HSPs)
scaffold0447 (385-522)||(7205-7341)
scaffold0447 (385-522)||(11819-11955)
scaffold0447 (287-356)||(7340-7409)
scaffold0447 (287-356)||(11954-12023)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (385-522)||(9814-9950)
scaffold0383 (287-356)||(9949-10018)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (396-665)||(9343-9616)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (491-666)||(1562-1737)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (538-680)||(5-150)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 471 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 15161296 - 15160932
Alignment:
Q  471 tatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagagg 570  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15161296 tatattaaaaaatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccataagagtagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcagagg 15161197  T
Q  571 atgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctttgtgtttctctctagaa 670  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15161196 atgaagaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctactcctaatatcttgctttgtgtttctctctagaa 15161097  T
Q  671 atgccatctccaaaaagtgtgctattgtacaaaactttggtgttgcttcctgccaaaaacctcttcctagttgtgcgcagcttttcaccaacgtgactcc 770  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15161096 atgccatctccaaaaagtgtgctgttgtacaaaactttggtgttgctttctgccaaaaacctcttcctagttgtgcgcagcttttcaccaacgtgaatcc 15160997  T
Q  771 ctagttctattccatgatggcttgttttatatcttccctcttttgaaaagctaacttacctttca 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15160996 ctagttctattccatgatggcttgttttatatcttccctcttttgaaaacctaacttacctttca 15160932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 254 - 664
Target Start/End: Original strand, 8996014 - 8996423
Alignment:
Q  254 ttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataact 353  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  8996014 ttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaatttttagattaaaagtgattatcaaatattagcatccatgtctagagtgataact 8996113  T
Q  354 taagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattga 453  Q
    ||||||||||| |||||||| | || ||| |||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8996114 taagatagattgttattctatttctagattcaaaaggatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacattaaatgcaataataacaacaatattga 8996212  T
Q  454 ataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtcta 553  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8996213 ataaatagctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacatcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtcta 8996312  T
Q  554 taatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctt 653  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| | ||  |||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||    
T  8996313 tgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcgcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctt 8996412  T
Q  654 tgtgtttctct 664  Q
    |||||||||||    
T  8996413 tgtgtttctct 8996423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 249 - 666
Target Start/End: Original strand, 40999851 - 41000267
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtga 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40999851 atcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtga 40999950  T
Q  349 taacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaat 448  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  40999951 taacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctc-aataaaagaataaaagcaagaataacaacaat 41000049  T
Q  449 attgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatat 548  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  41000050 attgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataactacatat 41000148  T
Q  549 gtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atc 647  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |    
T  41000149 gtctatgatagatttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacc 41000248  T
Q  648 ttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41000249 ttgctttgtgtttctctct 41000267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 38121682 - 38122096
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38121682 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 38121781  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  38121782 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 38121880  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  38121881 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 38121979  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  38121980 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 38122079  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  38122080 gctttgtgtttctctct 38122096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 39000931 - 39001345
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  39000931 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattgacatccatgtctagagtgataa 39001030  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  39001031 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 39001129  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  39001130 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 39001228  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  39001229 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 39001328  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  39001329 gctttgtgtttctctct 39001345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 667
Target Start/End: Original strand, 11738548 - 11738962
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11738548 gtttagtcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 11738647  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11738648 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctc-agtaaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 11738746  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || ||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  11738747 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtc 11738845  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||| | ||||    
T  11738846 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtgtcaacaaatcttggcttgaatttactcctaactaccttg 11738945  T
Q  651 ctttgtgtttctctcta 667  Q
    |||||||||||||||||    
T  11738946 ctttgtgtttctctcta 11738962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 12167966 - 12168380
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12167966 gtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 12168065  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  12168066 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtcaatattattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 12168164  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  12168165 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 12168263  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||| | |||    
T  12168264 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacacctaactacctt 12168363  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  12168364 gctttgtgtttctctct 12168380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 244 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15161847 - 15161612
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15161847 attgaaccgtttaatcgactatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctatattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 15161748  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161747 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgttaatatccttttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 15161648  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccatatattaaa 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15161647 acaatattgaataaatagctagaaccatatattaaa 15161612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 16832534 - 16832946
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  16832534 tttaatcgacgatttcctaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataac 16832633  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16832634 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatct-aaataacatattaaatgcaagaatagcaacaatattg 16832732  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  16832733 aataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagctacatatatct 16832831  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgc 651  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||| |    
T  16832832 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttac 16832931  T
Q  652 tttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||    
T  16832932 tttgtgtttctctct 16832946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 432092 - 432504
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  432092 tttaatcgacgatttcccaaccgattaattcacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 432191  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  432192 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattg 432290  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  |||  | ||| |||||||||||||||    
T  432291 aataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctacatatgtct 432389  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgc 651  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||| | |||||    
T  432390 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgagtctactcctaactaccttgc 432489  T
Q  652 tttgtgtttctctct 666  Q
     |||| |||||||||    
T  432490 cttgtatttctctct 432504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15164428 - 15164196
Alignment:
Q  8 ctatttcgtaagtatatgctgaatattttatttttatgtgacacactgatgcatgccgataaggcttttatgaagttgttcaagatagtaatctctgtga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15164428 ctatttcgtaagtatatgctgaatattttatttttatgtga-------atgcatgccaataaggcttttatgaagttgttcaagatagtaatctctgtga 15164336  T
Q  108 tatacaattgacggggtactcatacacatggtgttgagggtgcaatgtacaaggtagaacggaagagcagttggaccaggccatggctactcaatattag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15164335 tatacaattgacggggtactcatacacatggtgttgagggtgcaatgtacaaggtagaacagaagagcagttggaccaggccatggctactcaatattag 15164236  T
Q  208 ttagatttattttcaaatgtttcgctcactaacctcattg 247  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15164235 ttagatttatttccaaatgttacgctcactaacctcattg 15164196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 44505018 - 44505434
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44505018 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 44505117  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
     |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  44505118 tttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 44505216  T
Q  452 gaataaataggtagaa-ccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttg-tttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatg 549  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  44505217 gaataaatagctagaacccatatattaaataatcaaaagattacataatagcttgttttgaatacctcaaaaaccacaagtttagatgtagctacatatg 44505316  T
Q  550 tctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atct 648  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| | ||    
T  44505317 tctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaattttggcttgaatctactcctaactacct 44505416  T
Q  649 tgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44505417 tgctttgtgtttctctct 44505434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 33491948 - 33492362
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33491948 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 33492047  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  33492048 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatatt 33492146  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| | || |   ||| |||||| | |||||||||||    
T  33492147 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaa-ctacaagagtagatgtggctacatatgt 33492245  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  33492246 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 33492345  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  33492346 gctttgtgtttctctct 33492362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 9667447 - 9667859
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9667447 tttaatcgacgatttaccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 9667546  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  9667547 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattg 9667645  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  |||  |  || |||||||||||||||    
T  9667646 aataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatgtatgtagctacatatgtct 9667744  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgc 651  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||    
T  9667745 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 9667844  T
Q  652 tttgtgtttctctct 666  Q
     |||| |||||||||    
T  9667845 cttgtatttctctct 9667859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 13217799 - 13218209
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13217799 gtttaatcgacgatttcccagctaattaaattatccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataa 13217898  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||   |||||||||||||||    
T  13217899 cttaagataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatct-taataaaacattaaaggc---aataacaacaatatt 13217994  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  13217995 gaataaatagctagaaccgtatattaaattatcaaaagattacataatatcttgtttgaatgcctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtc 13218093  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa-catcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| || ||||    
T  13218094 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagttccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaaccaccttg 13218193  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  13218194 ctttgtgtttctctct 13218209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 49249476 - 49249070
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  49249476 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattactcaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatttctagagtgataa 49249377  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  49249376 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatataattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 49249278  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||        |||||||||  ||||||||||||||| |||| |   ||| |||||| |||||||||||||    
T  49249277 gaataaataagctagaaccatatattaaaaga--------ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgt 49249187  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  49249186 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 49249087  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
     ||||||||||||||||    
T  49249086 actttgtgtttctctct 49249070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 244 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 36084178 - 36083869
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36084178 attggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaatgcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 36084079  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||| ||  || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  36084078 aatgaaaacttaagatagattgttattatatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctc-aataaaacattaaacacaagaataac 36083980  T
Q  443 aacaatattgaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||| || |    
T  36083979 aacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagat-aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaa-ggtagatgtaac 36083882  T
Q  542 tacatatgtctat 554  Q
    |||||||||||||    
T  36083881 tacatatgtctat 36083869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 244 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 9269056 - 9268620
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaag-tgattatcaaatattaacatctatatcta 342  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||   |||||| || | |||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||    
T  9269056 attggatcgtttaatcgacgatttcccaatcaattaaacgacctaaaagcattaagctcttgatttcaaggtgattatcaaagattaaattctatgtcta 9268957  T
Q  343 gagtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    || |||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  9268956 gaatgaacactta-gatagattattattctgatcctagatccaaaagtatttgtcaataaaatttcaaatctcaaataaagctttagatgcaagaataat 9268858  T
Q  443 aacaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagct 542  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  9268857 aacaatattgaataaatagctagaaacatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttggttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagct 9268758  T
Q  543 acatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactccta 642  Q
    |||||||||| |   || || ||| ||||| |   ||| ||||||||| || |   ||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||    
T  9268757 acatatgtctttgcaagtttggcaaaggataaaagaaagatgaagatttcatgtctagactcatgatgtctcaataaatattaggaagaatctactctta 9268658  T
Q  643 acatcttgctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    ||| | |  ||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  9268657 acaaccttatttatgtttgtctctaaaaatgtcatctc 9268620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 276 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 13830673 - 13830286
Alignment:
Q  276 attaaatgatccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagattattattctaa 374  Q
    |||||||||| | | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||   | || |||||| | | |||||  ||||||||||||||||||    
T  13830673 attaaatgatacgatagccttaagttcttgattacaaagtgattatcaaaacttaaatccaatctctagaatcaaaacttt-gatagattattattctaa 13830575  T
Q  375 tcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-aggtagaaccatat 473  Q
     ||| || |||||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13830574 ccctagacccaaaagtatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagtattaaat---acaataataacaatattgaataaataagctagaaccatat 13830478  T
Q  474 attaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatg 573  Q
    |||||| |||||||    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  13830477 attaaatgatcaag-taatacataatagcttgtttgaatacctaaaaacccacaagggtaaatgtagctacatatgtctatgaaaactttgcaaaggatg 13830379  T
Q  574 aggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |   ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  13830378 aaagaaaaatgaagatttcatgctaagattcatgacgtctcaacaaatcttaggaagaatctactcctaacacccttccttgtgtttctctct 13830286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16130925 - 16130706
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16130925 attggatcgtttaatcgacgattccctaaccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 16130826  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||         |||| ||||||||||||    
T  16130825 agtgataacttaagatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaa---------taaaagcaagaataaca 16130735  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccata 472  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  16130734 acaatattgaataaatggctagaatcata 16130706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 396 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 39454375 - 39454102
Alignment:
Q  396 tcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttac 494  Q
    |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||||| || ||||    
T  39454375 tcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaa-agattac 39454277  T
Q  495 a---taatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattc 591  Q
    |   ||||  |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||    ||| ||||||||||    
T  39454276 aaattaatagcttgtttgaataccttaaaaaccacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaagatgaagattc 39454177  T
Q  592 caagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacat-cttgctttgtgtttctctc 665  Q
    ||  |||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39454176 catactaagattcatgatatctctacaaatcctaggaagaatctacttctaacatgcttgatttgtgtttctctc 39454102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 276 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 6244583 - 6244200
Alignment:
Q  276 attaaatgatccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagattattattctaa 374  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||   |||  ||||| |||||| | | ||||| | ||||||||||||| |||    
T  6244583 attaaatgacccaataacattaagttcttgattttaaagtgattaccaaaatctaaactctatgtctagaataaaaacttta-atagattattattttaa 6244485  T
Q  375 tcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-aggtagaaccatat 473  Q
     ||| ||| ||||||||  | |||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||  || | |||||||||    
T  6244484 ccctagattcaaaagtacctttcaataacatttcgaatctaaaataaa-cattaaacacaagaatgataacaatattgaataaaagagctggaaccatat 6244386  T
Q  474 attaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatg 573  Q
    |||||| |||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| || | |  ||| |||||||||| | ||||    
T  6244385 attaaatgatcaagagtttaca-------ttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctatatgttttcatagtagctttgcaaaagatg 6244293  T
Q  574 aggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctttgtgtttctctc 665  Q
        ||  |||||||||||| |  || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6244292 gaagaaggatgaagattccatgacaatattcatgatatctctacaaatctttagaagaatctactcctaacacccttgctttgtgtttctctc 6244200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 475 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 16129848 - 16129657
Alignment:
Q  475 ttaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatga 574  Q
    ||||| |||||| || |||||||||   |||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  16129848 ttaaatgatcaaaagattacataatagattgtttgaatacctcaaaaccac-aagagtagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatga 16129750  T
Q  575 ggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
     ||| | |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16129749 agaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatcttgctttgtgtttctctct 16129657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 475 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 16130402 - 16130234
Alignment:
Q  475 ttaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatga 574  Q
    ||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| |   ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||    
T  16130402 ttaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatcac-aagagtagatatagctacatatgtctatgataactttgcaaatgatga 16130304  T
Q  575 ggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac 644  Q
     ||| | |||||||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  16130303 agaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaac 16130234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 603 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 36080281 - 36080205
Alignment:
Q  603 tcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctttgtgtttctctctagaaatgccatct 679  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36080281 tcatgatgtctcaacaagtcttggatagaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctctctagaaatgccatct 36080205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 680
Target Start/End: Original strand, 7612384 - 7612469
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctt--tgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  7612384 aagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctctctagaaatgccctctc 7612469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 497
Target Start/End: Original strand, 13249115 - 13249254
Alignment:
Q  357 gatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 456  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||  | ||||| ||| || | |||||||||   ||||||  ||||    
T  13249115 gatagatgattattctaaccctagattcaaaagtatttttcaataacattttaaatcaaatataaa-catgaattacaagaataatctcaatatcaaata 13249213  T
Q  457 aataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacata 497  Q
    || || ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||    
T  13249214 aagagctagaatcatatattaaaagaacaaaagattacata 13249254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 496
Target Start/End: Original strand, 31473658 - 31473796
Alignment:
Q  357 gatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 456  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||  | ||||| ||| || |||||||||||   ||||||  ||||    
T  31473658 gatagatgattattctaaccctagattcaaaagtatttttcaataacattttaaatcaaacataaa-catgaattgcaagaataatctcaatatcaaata 31473756  T
Q  457 aataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacat 496  Q
    || || ||||| |||||||| || |||||| || ||||||    
T  31473757 aaaagctagaatcatatatttaaggatcaaaagattacat 31473796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 249 - 664
Target Start/End: Original strand, 22233597 - 22234012
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtga 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22233597 atcgtttaatcgacgatttcccaacagattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtga 22233696  T
Q  349 taacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaa 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  22233697 taacttaagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctc-aataaaacattaaacacaagaataacaacaa 22233795  T
Q  448 tattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacata 547  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  22233796 tattgaataaacagctagaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacata 22233895  T
Q  548 tgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatc 647  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  22233896 tgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacacc 22233995  T
Q  648 ttgctttgtgtttctct 664  Q
    |||||||||||||||||    
T  22233996 ttgctttgtgtttctct 22234012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 252 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 13510375 - 13509954
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13510375 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 13510276  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13510275 cttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 13510177  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  13510176 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtc 13510077  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgc 651  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||    
T  13510076 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaacatcttgc 13509977  T
Q  652 tttgtgtttctctctagaaatgcca 676  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  13509976 tttgtgttt--ctctagaaatgcca 13509954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 252 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 13599905 - 13599484
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13599905 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 13599806  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13599805 cttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 13599707  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  13599706 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtc 13599607  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgc 651  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||    
T  13599606 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttaggttgaatctacttctaacatcttgc 13599507  T
Q  652 tttgtgtttctctctagaaatgcca 676  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  13599506 tttgtgttt--ctctagaaatgcca 13599484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 249 - 664
Target Start/End: Original strand, 22222422 - 22222828
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtga 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22222422 atcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtga 22222521  T
Q  349 taacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaa 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  22222522 taacttaagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctc-aataaaacattaaacacaagaataacaacaa 22222620  T
Q  448 tattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacata 547  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  22222621 tattgaataaatagctagaatcatatat-----------aagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacata 22222709  T
Q  548 tgtctataatagctttgcagaggatgaggaaa--atatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca 645  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22222710 tgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca 22222809  T
Q  646 tcttgctttgtgtttctct 664  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22222810 ccttgctttgtgtttctct 22222828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 16958972 - 16958548
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  16958972 attggatcgtttaatcgacgatttcccaacctattaaacgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaaatctatgtctaa 16958873  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  16958872 agtgataacttaaaatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatacaagaataac 16958774  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  16958773 aacaatagtgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattaaataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagc 16958674  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |    
T  16958673 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactctt 16958574  T
Q  642 aac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  16958573 aactaccttgctttgtgtttctctct 16958548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 22181013 - 22180599
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22181013 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 22180914  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  22180913 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 22180815  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22180814 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtc 22180715  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  22180714 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 22180615  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    |||| |||||||||||    
T  22180614 ctttttgtttctctct 22180599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 249 - 664
Target Start/End: Original strand, 22228764 - 22229170
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtga 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22228764 atcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagtttaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctagagtga 22228863  T
Q  349 taacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaa 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  22228864 taacttaagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctc-aataaaacattaaacacaagaataacaacaa 22228962  T
Q  448 tattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacata 547  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||            ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  22228963 tattgaataaatagctagaatcatatat-----------aagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacata 22229051  T
Q  548 tgtctataatagctttgcagaggatgaggaaa--atatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca 645  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22229052 tgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaaca 22229151  T
Q  646 tcttgctttgtgtttctct 664  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22229152 ccttgctttgtgtttctct 22229170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 253 - 680
Target Start/End: Original strand, 4861702 - 4862128
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4861702 tttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 4861801  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  4861802 ttaagataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattg 4861900  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  4861901 aataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtct 4861999  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgc 651  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||| | ||| |    
T  4862000 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcttaactaccttac 4862099  T
Q  652 tttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4862100 cttgtgtttctctctaaaaatgccatctc 4862128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 256 - 680
Target Start/End: Original strand, 22242997 - 22243420
Alignment:
Q  256 aatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataactta 355  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22242997 aatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactta 22243096  T
Q  356 agatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaat 455  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22243097 agatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacatttaattcaagaataacaataatattgaat 22243195  T
Q  456 aaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctat 554  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  22243196 aaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctacatatgtctat 22243295  T
Q  555 aatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctt 653  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| | |||| ||    
T  22243296 gatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctacttctaactaccttgttt 22243395  T
Q  654 tgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  22243396 tgtgtt--tctctagaaatgtcatctc 22243420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 252 - 671
Target Start/End: Original strand, 11308737 - 11309156
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11308737 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 11308836  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  11308837 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacagtaaaagcaagaataacaacaatatt 11308935  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  11308936 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 11309034  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  11309035 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtggagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 11309134  T
Q  650 gctttgtgtttctctctagaaa 671  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11309135 gctttgtgtttctctctagaaa 11309156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 9067917 - 9068331
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9067917 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 9068016  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  9068017 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 9068115  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  9068116 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 9068214  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  9068215 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 9068314  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  9068315 gctttgtgtttctctct 9068331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 8743033 - 8743447
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8743033 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 8743132  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  8743133 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaaacaagaataacaacaatatt 8743231  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  8743232 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 8743330  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  8743331 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 8743430  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  8743431 gctttgtgtttctctct 8743447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 28925893 - 28926307
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28925893 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 28925992  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  28925993 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 28926091  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  28926092 gaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 28926190  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  28926191 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 28926290  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  28926291 gctttgtgtttctctct 28926307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 3299213 - 3298800
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3299213 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 3299114  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  3299113 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 3299015  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  3299014 gaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtc 3298916  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| |||||||||||  |||||| ||||   ||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  3298915 tatgatagctttgcaatggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 3298816  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  3298815 ctttgtgtttctctct 3298800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 28370504 - 28370091
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28370504 tttaatcgacgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 28370405  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| ||||| || | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  28370404 ttaagatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattg 28370306  T
Q  453 aataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| |   ||| ||| || ||||||||||||||    
T  28370305 aataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtaaatgtagctacatatgtc 28370207  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  28370206 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 28370107  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  28370106 ctttgtgtttctctct 28370091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 27348438 - 27348024
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27348438 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 27348339  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    |||||||| |||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  27348338 cttaagatggattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 27348240  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||||| || | |   ||| |||||| |||||||||||||    
T  27348239 gaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaga-ctacaagagtagatgtagctacatatgt 27348141  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  27348140 ctatgataactttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 27348041  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  27348040 gctttgtgtttctctct 27348024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 41577081 - 41577495
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||    
T  41577081 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaagatccatgtttagagtgataa 41577180  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  41577181 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtacgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaaacaagaataacaacaatatt 41577279  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| | ||| |   ||| |||||| |||||||||||||    
T  41577280 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacc-tcaaagctacaagagtagatgtagctacatatgt 41577378  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  41577379 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 41577478  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  41577479 gctttgtgtttctctct 41577495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 34006524 - 34006924
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  34006524 tttaaacgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcaatgtatagagtgataac 34006623  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  34006624 ttaagatagattgttattctatttatagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaa-caataaaagcaagaataacaacaatattg 34006721  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||||    
T  34006722 aataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtct 34006820  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgc 651  Q
    || ||||||||||| |||           |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| | |||||    
T  34006821 atgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctttaatctactcctaactaccttgc 34006909  T
Q  652 tttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||    
T  34006910 tttgtgtttctctct 34006924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 12538583 - 12538155
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | ||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12538583 attggatcgtttaatcgacgattttctaatcgattaaatgacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatatctag 12538484  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttca------atctcaaataaagcattaaatgcaaga 437  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |      |||||||  |||  || |||| |||||    
T  12538483 agtgataacttaagataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaattttaaatctcaataaaataataaaat-caaga 12538385  T
Q  438 ataacaacaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagata 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||   |||||||||||||| |||||||  ||||||||||     
T  12538384 ataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatg 12538285  T
Q  538 tagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctac 637  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |     |||||||     
T  12538284 tacctacatatgtctaagatagctttgcaaatgatgaagaagagatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcatagcttgaatctaa 12538185  T
Q  638 tcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  12538184 tcctaactaccttgatttgtgtttctctct 12538155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 247 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 1607703 - 1607272
Alignment:
Q  247 gaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatctatatctagag 345  Q
    |||||||||||||||| || || |||   |||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||     
T  1607703 gaatcgtttaatcgacgatgtctcaatctattaaacgatacaatagcattaacttcttgattacaaagtgattatcaaagattaaatcctatatctagaa 1607604  T
Q  346 tgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaac 445  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  1607603 taaaaactta-gatagattattattctaactctagatccaaaattatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaagtacaagaataataac 1607505  T
Q  446 aatattgaataaata-ggtagaaccatatattaaa-agatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagcta 543  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||   |||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||    
T  1607504 aatatttaataaataaggtagaaccatatattaaataaataaaga--ttacataatagtttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagcta 1607407  T
Q  544 catatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa 643  Q
    |||||| |||| | ||||||||| |||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  1607406 catatgcctatgaaagctttgcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttaggaagaatatactcttaa 1607307  T
Q  644 ca-tcttgctttgtgtttctc--tctagaaatgcc 675  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1607306 cacccttgctttgtgtttctctatctagaaatgcc 1607272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 345 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 16580404 - 16580083
Alignment:
Q  345 gtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaa 444  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||    
T  16580404 gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaa 16580306  T
Q  445 caatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagcta 543  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||    
T  16580305 caatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagcta 16580207  T
Q  544 catatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa 643  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  16580206 catatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaa 16580107  T
Q  644 c-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  16580106 ctaccttgctttgtgtttctctct 16580083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 249 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17993281 - 17993087
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtga 348  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17993281 atcgtttaatcgacgattttccaagcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtga 17993182  T
Q  349 taacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaa 444  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17993181 taacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaa 17993087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 244 - 453
Target Start/End: Original strand, 13849071 - 13849278
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  13849071 attggatcatttaatcgatgatttcccaatctattaattgatctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtatag 13849170  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    | ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||| |    
T  13849171 aatgaaaactt-agatagattgttattctactcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctc-aataaagctttaaatacaagaataata 13849268  T
Q  444 acaatattga 453  Q
    ||||||||||    
T  13849269 acaatattga 13849278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 474 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 17993085 - 17992878
Alignment:
Q  474 attaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatg 573  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17993085 attaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatg 17992986  T
Q  574 aggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctctagaaat 672  Q
    | ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||||    |||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17992985 aagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttggattgaatctactcttaactaccttgccttgtgtttctctctagaaat 17992886  T
Q  673 gccatctc 680  Q
    ||||||||    
T  17992885 gccatctc 17992878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21692866 - 21692669
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| ||||||||||| |  ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21692866 attggatcgtttaatcaaaaatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 21692767  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataa 441  Q
    | ||| || |||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  21692766 aatgaaaatttaaaatagattgttattctatttcttggatccaaaagcatttgtcaatatcattttgaatctc-aataaagcattaaacacaagaataa 21692669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 442 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 24040937 - 24040756
Alignment:
Q  442 caacaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||    
T  24040937 caacaatattgaataaatagctaaaaccatatattaaat-atcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacca-taagagtagatatagc 24040840  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttg 625  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24040839 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttg 24040756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 414
Target Start/End: Original strand, 36736948 - 36737117
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||||   |||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  36736948 attgcatcatttaatcgatgatttcccaatctattaaatgactcaaaagcttcaagttctagattaatagtgattatcaaagattaaaatctatgtctag 36737047  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatct 414  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36737048 agtgaaaactt-agatagattattattctattcctagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatct 36737117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21692234 - 21692149
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctt--tgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  21692234 aagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctctctagaaatgccctctc 21692149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 291
Target Start/End: Original strand, 22227255 - 22227297
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaa 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22227255 atcgtttaatcgacgatttcccaacagattaaatgacccaaaa 22227297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 630 - 666
Target Start/End: Original strand, 36737112 - 36737149
Alignment:
Q  630 gaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36737112 gaatctactcctaactatcttgctttgtgtttctctct 36737149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 252 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 1274999 - 1274574
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1274999 gtttaatcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 1274900  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1274899 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 1274801  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  1274800 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataataacttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagctacatatgtc 1274701  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgc 651  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| | || ||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||| |    
T  1274700 tatgatagctttgcataggatgaagaagagataaagattcaatgccgagatccatgatgtctcaacaaatcttgagttaaatctactcataacaccttac 1274601  T
Q  652 tttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1274600 tttgtgttt--ctctagaaatgccatctc 1274574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 253 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 22909528 - 22909108
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22909528 tttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 22909429  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22909428 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattg 22909330  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  22909329 aatatatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctacatatgtct 22909230  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgaga-agaatctactcctaacatcttgc 651  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | |   |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||    
T  22909229 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgactagatccatgatgtctcaacaaatctt-agattgaatctactcctaacaccttgc 22909131  T
Q  652 tttgtgtttctctctagaaatgcca 676  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  22909130 tttgtgtt--tctctagaaatgcca 22909108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 2478080 - 2477656
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2478080 attggatcgtttaatcgacgatttcctaacctattaaacgacccaaaagcattaagttctagatgaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctag 2477981  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  2477980 agtgataacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaa-taaagccttaaatagaagaataac 2477882  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||    
T  2477881 aacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatggagc 2477782  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  2477781 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcct 2477682  T
Q  642 aac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  2477681 aactaccttgctttgtgtttctctct 2477656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 252 - 667
Target Start/End: Original strand, 2797313 - 2797728
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2797313 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 2797412  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  2797413 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 2797511  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  2797512 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtc 2797611  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||| | ||||    
T  2797612 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttg 2797711  T
Q  651 ctttgtgtttctctcta 667  Q
     ||||||||||||||||    
T  2797712 ttttgtgtttctctcta 2797728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Original strand, 3544620 - 3545044
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3544620 attggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 3544719  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  3544720 agtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatacaagaataac 3544818  T
Q  443 aacaatattgaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  3544819 aacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagtaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagc 3544918  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||  | ||  |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  3544919 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatggagaagagatgaagatttaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcct 3545018  T
Q  642 aac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| | ||| |||| |||||||||||    
T  3545019 aactacctttctttttgtttctctct 3545044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 10346055 - 10346469
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10346055 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 10346154  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  10346155 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 10346253  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  10346254 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 10346352  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  10346353 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 10346452  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  10346453 gctttgtgtttctctct 10346469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 31158026 - 31158440
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31158026 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 31158125  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  31158126 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 31158224  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  31158225 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaggttacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 31158323  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  31158324 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 31158423  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  31158424 gctttgtgtttctctct 31158440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 254 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 31879009 - 31878599
Alignment:
Q  254 ttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataact 353  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  31879009 ttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagagtgataact 31878910  T
Q  354 taagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattga 453  Q
    ||||||||||| ||||| || | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31878909 taagatagattgttattatatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaactgcaagaataacaacaatattga 31878811  T
Q  454 ataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtcta 553  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||     
T  31878810 ataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtctt 31878712  T
Q  554 taatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgct 652  Q
    | |||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  31878711 tgatagttttgcaaaggatga-aaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttgct 31878613  T
Q  653 ttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||    
T  31878612 ttgtgtttctctct 31878599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 2631808 - 2631394
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2631808 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 2631709  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || | ||  |||||||||||| ||||||    
T  2631708 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaatgaaaacaagaataacaataatatt 2631610  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  2631609 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 2631511  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
     ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  2631510 ttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 2631411  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  2631410 gctttgtgtttctctct 2631394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 12090210 - 12090624
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12090210 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 12090309  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaa-tat 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||| |||    
T  12090310 cttaagatagattgttattctagttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaataataacaacaaatat 12090408  T
Q  451 tgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||   |||  ||||| |||||||||||||    
T  12090409 tgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacatattagcttgtttgaatacctcaaaaccac-aagattagatgtagctacatatgt 12090507  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||| | |||    
T  12090508 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatttactcctaactacctt 12090607  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  12090608 gctttgtgtttctctct 12090624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 8107638 - 8108052
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  8107638 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataa 8107737  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  8107738 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaatgaaaacaagaataacaacaatatt 8107836  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||     ||| |||||| |||||||||||||    
T  8107837 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ttacaagagtagatgtagctacatatgt 8107935  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  8107936 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 8108035  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  8108036 gctttgtgtttctctct 8108052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 666
Target Start/End: Original strand, 22321554 - 22321964
Alignment:
Q  255 taatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataactt 354  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22321554 taatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataactt 22321653  T
Q  355 aagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaa 454  Q
    |||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22321654 aagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatat-gaa 22321751  T
Q  455 taaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtcta 553  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22321752 taaataagctagaaccatatattaaaggatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtcta 22321850  T
Q  554 taatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgct 652  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||    
T  22321851 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaggatgaagattcaatgaaaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaacttgct 22321950  T
Q  653 ttgtgtttctctct 666  Q
    |||| |||||||||    
T  22321951 ttgtatttctctct 22321964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 276 - 680
Target Start/End: Original strand, 29032568 - 29032961
Alignment:
Q  276 attaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagattattattctaat 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |            |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  29032568 attaattgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaaa------------gtgataacttaagatatatttttattctatt 29032655  T
Q  376 cctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagg-tagaaccatat 473  Q
     ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29032656 tcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatttcaa-taaagcattaaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatat 29032754  T
Q  474 attaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatg 573  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||   ||||| ||| | ||||    
T  29032755 attaaaagatcaaaagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaaggttagatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaatgatg 29032854  T
Q  574 aggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctttgtgtttctctctagaaatg 673  Q
    |   ||| |||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29032855 aaagaaagatgaagattccatgtctagactcatgatgtctcaacaaatcttgaatagaatctactcctaacaccttactttgtgtttctctatagaaatg 29032954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 275 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 12191230 - 12190841
Alignment:
Q  275 gattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagattattattctaa 374  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  12191230 gattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaattttaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctat 12191131  T
Q  375 tcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataggtagaaccatata 474  Q
    | || ||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  12191130 ttctagattcaaaagtatgtgtccatatca-tttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatatccagaaccatata 12191033  T
Q  475 ttaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatga 574  Q
    ||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12191032 ttaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtaaatacatatgtctatgatagctttgcaaaggatga 12190934  T
Q  575 ggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
     ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12190933 agaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 12190841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 23795506 - 23795092
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23795506 gtttaatcgacgatttcccaatcgactaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 23795407  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||| ||    
T  23795406 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatatgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaaacaagaataacaacaatttt 23795308  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| ||||||  ||||||||||||    
T  23795307 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatggagctacatatgt 23795209  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  23795208 ctataatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 23795109  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||| ||||||||||    
T  23795108 gctttgagtttctctct 23795092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 12184276 - 12183864
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  12184276 gtttaatcgacgatttcccaactgattaaattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaattttaacatccatgtatagagtgataa 12184177  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    || |||||||||| ||||||||   || ||| ||||||||| | || |||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12184176 ctcaagatagattgttattctatctctagattcaaaagtatgtatccatatcatttg-aatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 12184079  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||   || | ||||| ||||||||||||||    
T  12184078 gaacaaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaaaag-tagatgtagctacatatgtc 12183980  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  12183979 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 12183880  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  12183879 ctttgtgtttctctct 12183864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Original strand, 45500453 - 45500874
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  45500453 attggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctag 45500552  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  45500553 agtgataacttaagatacattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataaca 45500651  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagcta 543  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||| | |||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||| |||    
T  45500652 acaatattgaataaataactataaccatatattaaatggtcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataacta 45500750  T
Q  544 catatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa 643  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||| | |  |||||  |||||||||||||||||||||    |||||||||| |||    
T  45500751 catatgtctgtgatagctttgcaaatgatgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcataa 45500850  T
Q  644 c-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  45500851 ctaccttgctttgtgtttctctct 45500874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 24483165 - 24482742
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24483165 attggatcgtttaatcgacgatt-ctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagt-ctagattaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctag 24483068  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  || | || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  24483067 agtgataacttaagataaattattattctagttcttagacccaaaagtaattgtcaatatcattttgaatctc-aataaaacattaaacacaagaataac 24482969  T
Q  443 aacaatattgaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacct-taaaacccgtaagggtagatatag 540  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||    
T  24482968 aacaatattgaataaataaactagaaccatattttaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctctaaaatccacaagggtagatgtag 24482869  T
Q  541 ctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcc 640  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| | |   |||| |||||||||||||||||||||| |    ||||||||     
T  24482868 ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggtttgatctactca 24482769  T
Q  641 taac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||    
T  24482768 taactcccttgctttgtgtttctctct 24482742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 252 - 589
Target Start/End: Original strand, 19471940 - 19472275
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19471940 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 19472039  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  19472040 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 19472138  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  19472139 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtc 19472237  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagat 589  Q
    ||| |||||||| || ||||||| ||||  ||||||||    
T  19472238 tatgatagctttacaaaggatgaagaaaggatgaagat 19472275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 286 - 666
Target Start/End: Original strand, 31664279 - 31664658
Alignment:
Q  286 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagattattattctaatcctggatcca 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||    
T  31664279 ccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagattgataacttaagatagattgttattctagttctagattca 31664378  T
Q  386 aaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatca 485  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31664379 aaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatca 31664477  T
Q  486 agagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatga 585  Q
    | || |||||||||  | |||| |||||||| |||| ||  ||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||| | ||||| ||||    
T  31664478 aaagattacataatagcctgttcgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctagatatgtttatgatagctttgtaaaggattaagaaaagatga 31664576  T
Q  586 agattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31664577 agattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 31664658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 6172927 - 6172525
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6172927 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagtcctagattaaaactgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 6172828  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || |||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||    
T  6172827 cttaagatagattgttattctatttctagattaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaacgcaagaataacagcaatatt 6172729  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||||||||||||||||||    
T  6172728 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatatagctacatatgtc 6172630  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| |||           |||||||||||| |  | |||  |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  6172629 tatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaggatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 6172541  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  6172540 ctttgtgtttctctct 6172525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 354 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 22818721 - 22818410
Alignment:
Q  354 taagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattga 453  Q
    ||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22818721 taagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatattga 22818623  T
Q  454 ataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtcta 553  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  |||  | ||| ||||||||||||||||    
T  22818622 ataaatagctagaaccatacattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctacatatgtcta 22818524  T
Q  554 taatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgct 652  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||     
T  22818523 tgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgcc 22818424  T
Q  653 ttgtgtttctctct 666  Q
    |||| |||||||||    
T  22818423 ttgtatttctctct 22818410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 341 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 1954270 - 1953955
Alignment:
Q  341 tagagtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaata 440  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1954270 tagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaa-taaagcaataaaagcaagaata 1954172  T
Q  441 acaacaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatag 540  Q
             |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||   ||  ||||||||||    
T  1954171 ---------ttgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaaccac-aatagtagatatag 1954082  T
Q  541 ctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcc 640  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||| | |  ||||| |||||||||| |||||||||||    |||||||||||    
T  1954081 ctacatatgtctatgatagcttttcaaaggatgaagaagaattgaagattcaatgacaagatccatgatgtcttaacaaatcttggcttgaatctactcc 1953982  T
Q  641 taac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||    
T  1953981 taactacattgctttgtgtttctctct 1953955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 253 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22820515 - 22820404
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22820515 tttaatcgacgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaattgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 22820416  T
Q  353 ttaagatagatt 364  Q
    ||||||||||||    
T  22820415 ttaagatagatt 22820404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 531 - 666
Target Start/End: Original strand, 19472291 - 19472427
Alignment:
Q  531 gtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaag 630  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||  ||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    |    
T  19472291 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgcagaaaggatgaagattccaagacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttg 19472390  T
Q  631 aatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19472391 aatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 19472427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 527 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 19063651 - 19063500
Alignment:
Q  527 aagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttga 626  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||| ||| | |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||| ||      
T  19063651 aagggtagatataactacatatgtctatgatagctttacatagaatgaagaagagatgaagattcaatgcttagatccatgatgtctcaacaaattttag 19063552  T
Q  627 gaagaatctactcctaacatcttgctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    |  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  19063551 gttgaatctactcctaacaccttactttgtgtt--tctctagaaataccatctc 19063500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 264 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31882510 - 31882440
Alignment:
Q  264 atttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatc 334  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882510 atttcccaaccgattaaatcacccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatc 31882440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1954347 - 1954285
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctaga 306  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1954347 attggatcgtttaatcgacgatttcctaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctaga 1954285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 675
Target Start/End: Original strand, 27951479 - 27951557
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctttgtgtttctctctagaaatgcc 675  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27951479 aagattcatgatgtttaaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctctagaaatgcc 27951557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 357 - 446
Target Start/End: Original strand, 8139140 - 8139229
Alignment:
Q  357 gatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaaca 446  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||  ||||  | |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  8139140 gatagattattattctaatcgtggattcaaaagtacctttcaatatcatttcaaatcatatataaagcattaaacacaagaataataaca 8139229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 604 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 33160243 - 33160180
Alignment:
Q  604 catgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33160243 catgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 33160180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 666
Target Start/End: Original strand, 27954733 - 27954802
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  27954733 aagattcatgatgtctcaacaaattttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctct 27954802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Original strand, 9702027 - 9702108
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagtt-ctagattaaaagtgattatcaaa 324  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  9702027 attgagtcgtttaatcgtcgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaa 9702108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 244 - 680
Target Start/End: Original strand, 1232233 - 1232673
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  1232233 attgaatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctat 1232332  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  1232333 agtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacattaaatgaaagaataaca 1232431  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagcta 543  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  1232432 acaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagaaattacataatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagcta 1232531  T
Q  544 catatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa 643  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1232532 catatgtctataatagctttgcaaaggatgaagaagagataaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactcctaa 1232631  T
Q  644 c-----atcttgctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    |     || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1232632 caccttattttgctttgtgtttctctctagaaatgtcatctc 1232673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 253 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 2357571 - 2357145
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  2357571 tttaatcgatgatttcccaatcaattaattgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctgt--ctagagtgataac 2357474  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2357473 ttaatatagattattattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaa-taaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 2357375  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||  || | ||||| |||||||||||||    
T  2357374 gaataaataagctagaaccatatattagaagatcaagagtttacatcatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaatgttagatgtagctacatatgt 2357275  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttg 650  Q
    |||||  ||||| ||| |||||||   ||| ||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  2357274 ctatacaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacatcttg 2357175  T
Q  651 ctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2357174 ctttgtgtttctctatagaaatgtcatctc 2357145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 249 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 23194334 - 23193907
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtga 348  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23194334 atcgtttaatcgacgatttcctaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgtttatcaaatattaacatccatgtctagagtga 23194235  T
Q  349 taacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaat 448  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  23194234 taacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaat---aacaat 23194139  T
Q  449 attgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatat 548  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  23194138 attgaataaatagatagaaccatatattaaatgatcaaaagattacgtaatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatat 23194039  T
Q  549 gtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atc 647  Q
    |||| | |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||| | |    
T  23194038 gtctctgatag-tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcttaactacc 23193940  T
Q  648 ttgctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23193939 ttgccttgtgtttctctctaaaaatgccatctc 23193907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 9989807 - 9989394
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9989807 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 9989708  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  9989707 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 9989609  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  9989608 gaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtc 9989510  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||| ||||   ||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  9989509 tatgatagctttgcaaaggttgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 9989410  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  9989409 ctttgtgtttctctct 9989394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 252 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 45528059 - 45527644
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  45528059 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 45527960  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcatt-aaatgcaagaataacaacaatat 450  Q
    ||||||||||||| ||||| || | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  45527959 cttaagatagatttttattttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaaatgcaagaataacaacaatat 45527861  T
Q  451 tgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| |||||| ||||||    
T  45527860 tgaataaatagctagaaccatgtattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctagatatgt 45527762  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  45527761 ctatgatagctttgcaaaggatgatgaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 45527662  T
Q  650 gctttgtgtttctctcta 667  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45527661 gctttgtgtttctctcta 45527644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 3588820 - 3588398
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3588820 attggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgactaaatgacccaaaagcattaagtcctagattataagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 3588721  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||  | |||| ||||||||||||    
T  3588720 agtgataacttaagatagattgttattctatctctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaataataaaagcaagaataaca 3588622  T
Q  444 acaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagct 542  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||    
T  3588621 acaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagct 3588523  T
Q  543 acatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactccta 642  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  3588522 acatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactccta 3588423  T
Q  643 ac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    || | ||||||||||||||||||||    
T  3588422 actaccttgctttgtgtttctctct 3588398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 48167944 - 48168357
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48167944 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 48168043  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48168044 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatgtcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 48168142  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  48168143 gaataaatagctaaaacaatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtc 48168241  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |  || ||| |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  48168242 tatgatagctttgcataggatgaagtgaagatgcagattccatgataagatccctgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 48168341  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| ||||||||||||    
T  48168342 cttcgtgtttctctct 48168357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 37471438 - 37471850
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  37471438 tttaatcgacgatttctcaactgattaaattatccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataac 37471537  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  37471538 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattg 37471636  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||| | |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37471637 aataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaa-ccacaagagtagatatagctacatatgtct 37471735  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgc 651  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||  |||||||||||| |||    ||||||||||||||| |  ||||    
T  37471736 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgtcgtctcaacaaattttggcttgaatctactcctaactactttgc 37471835  T
Q  652 tttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||    
T  37471836 tttgtgtttctctct 37471850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 33248409 - 33247986
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33248409 attggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttcgagataaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 33248310  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  || | || |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||| |||||    
T  33248309 agtgataacttaagatagattgttattctagttcttagacccaaaaatattggtcaatatcattttgaatctc-aataaagcattaaacataag-ataac 33248212  T
Q  443 aacaatattgaataaa-taggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  |||    
T  33248211 aacaatattgaataaattagctagaatcatatattaaaatatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgcagc 33248112  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || | |||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  33248111 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaaaagagatgaagattcaatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcct 33248012  T
Q  642 aac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  33248011 aactaccttgctttgtgtttctctct 33247986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 7652972 - 7653386
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7652972 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 7653071  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || | ||  |||||||||||||||||||    
T  7653072 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaatgaaaacaagaataacaacaatatt 7653170  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  7653171 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 7653269  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||  ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  7653270 ctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 7653369  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  7653370 gctttgtgtttctctct 7653386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 10385820 - 10386234
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10385820 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 10385919  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  10385920 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaatacaagcaagaataacaacaatatt 10386018  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  10386019 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaggattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 10386117  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  10386118 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggctcgaatctactcctaactacctt 10386217  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  10386218 gctttgtgtttctctct 10386234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 22098078 - 22097665
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22098078 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 22097979  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||    
T  22097978 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagtaagaataacaacaatatt 22097880  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22097879 gaataaatggctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtc 22097781  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||     
T  22097780 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctta 22097681  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  22097680 ctttgtgtttctctct 22097665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 52307835 - 52308249
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  52307835 gtttaatcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 52307934  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    |||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  52307935 cttaagatagattattattctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaaacaagaataacaacaatatt 52308033  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  52308034 gaataaataagctagaaccatgtattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 52308132  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||  ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||| | |||    
T  52308133 ctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctaaacaaatattggctagaatctactcctaactacctt 52308232  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  52308233 gctttgtgtttctctct 52308249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 244 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 49434517 - 49434089
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49434517 attggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 49434418  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    | ||  ||||||||||||||| ||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  49434417 aatgtaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttaaatctc-aataaaacattaaacacaagaataac 49434319  T
Q  443 aacaatattgaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |  || | || || ||||    
T  49434318 aacaatattaaataaataagttagaactatatattaaaagatgaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacgcacaa-gataaatgtagc 49434220  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattcca-agctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcc 640  Q
    |||||||||||||   ||||| ||| |||||||   ||| || |||||| || | |||| | |||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  49434219 tacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaa-actcataatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcc 49434121  T
Q  641 taacatcttgctttgtgtttctctctagaaat 672  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49434120 taacaccttgctttgtgtttctctctagaaat 49434089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 20837504 - 20837092
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  20837504 tttaatcgatgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaatatccatgtctagagtgataac 20837405  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  20837404 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaataatattg 20837306  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  |||  | ||| |||||||||||||||    
T  20837305 aataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctacatatgtct 20837207  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgc 651  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||    
T  20837206 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 20837107  T
Q  652 tttgtgtttctctct 666  Q
     |||| |||||||||    
T  20837106 cttgtatttctctct 20837092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 36469187 - 36469598
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36469187 tttaaccgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 36469286  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| ||||||||   || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  36469287 ttaagatagattgttattctatgtctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaacaataaaatgcaagaataacaacaatattg 36469385  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||| | |||||||||||||||    
T  36469386 aataaattgctagaaccatgtattaaaagatctaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagttgtagctacatatgtct 36469484  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgc 651  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||    
T  36469485 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgc 36469584  T
Q  652 tttgtgtttctctct 666  Q
     ||||||||||||||    
T  36469585 -ttgtgtttctctct 36469598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 27850301 - 27850713
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27850301 gtttaatcgacgatttctcaaccgattaaattagccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 27850400  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    |||| |||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  27850401 cttacgatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 27850499  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||  |||  | ||| ||||||||||||||    
T  27850500 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttaaatacctcaaaa-ccacaagattggatgtagctacatatgtc 27850598  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  27850599 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaatgatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 27850698  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    | ||||||||||||||    
T  27850699 c-ttgtgtttctctct 27850713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 244 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26335528 - 26335102
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||| |||  |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26335528 attggatcatttaattgacgatttccaaacctattaaacgacccataagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 26335429  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  26335428 agttataacttaagatagattgttattctattttttagatccaaaagtatttgtcaatatcgttttgaatctcaa-taaagcaataaatacaagaataac 26335330  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  26335329 aacaatattgaataaataagctaaaatcatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagc 26335230  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||           ||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |    
T  26335229 tacatatgtctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagatttcatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactctt 26335141  T
Q  642 aac-atcttgctttgtg--tttctctctagaaatgccat 677  Q
    ||| | |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  26335140 aactaccttgctttgtgtttttctctctagaaaagccat 26335102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 252 - 625
Target Start/End: Original strand, 4742753 - 4743122
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4742753 gtttaatcgacaatttccaaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaacatccatgtctagagtgataa 4742852  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  4742853 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaa-caataaaagcaagaataacaacaatatt 4742950  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  4742951 gaataaatagctagaaccatatattaat-gatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtc 4743048  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttg 625  Q
    ||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| || |  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4743049 tatgatagctttgcaaacgatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatctctcaacaaatcttg 4743122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 351 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 8615816 - 8615501
Alignment:
Q  351 acttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatat 450  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  8615816 acttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatat 8615718  T
Q  451 tgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatg 549  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||    
T  8615717 tgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatg 8615619  T
Q  550 tctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atct 648  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||    
T  8615618 tctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacct 8615519  T
Q  649 tgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8615518 tgctttgtgtttctctct 8615501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 252 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 37023102 - 37022867
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagt--tctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgat 349  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  37023102 gttttatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaatcatatagattaaaagtgattatcaaatatcaacatccatgtctagagtgat 37023003  T
Q  350 aacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaata 449  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37023002 aacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaata 37022904  T
Q  450 ttgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaa 486  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37022903 ttgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaa 37022867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 447
Target Start/End: Original strand, 20963006 - 20963200
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  20963006 gtttaatcgatgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattgagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgatac 20963105  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaa 447  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||| || |||| |||| |||||||||||    
T  20963106 cttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatatgttcatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaataataacaacaa 20963200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 439 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 23385622 - 23385394
Alignment:
Q  439 taacaacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagata 537  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||| ||||| |   |||  |||||     
T  23385622 taacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacc-taaaaactacaagaatagatg 23385524  T
Q  538 tagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctac 637  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   || |||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  23385523 tagctaaatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgtagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctac 23385424  T
Q  638 tcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  23385423 tcctaactaccttgctttttgtttctctct 23385394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8626035 - 8625931
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8626035 gtttaatcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 8625936  T
Q  352 cttaa 356  Q
     ||||    
T  8625935 attaa 8625931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 491 - 666
Target Start/End: Original strand, 27030672 - 27030847
Alignment:
Q  491 ttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagatt 590  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||    
T  27030672 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 27030770  T
Q  591 ccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27030771 ccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 27030847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23411889 - 23411748
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           || |||||||||||||    
T  23411889 gtttaatcgacgatttcccaaccgaataaattacccaaaagaattaagttctagattaaaagtgattatcaaa-----------atgtctagagtgataa 23411801  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatca 404  Q
    ||||||||||||  |||||||| | || ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  23411800 cttaagatagatcgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatca 23411748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 561 - 666
Target Start/End: Original strand, 20963711 - 20963817
Alignment:
Q  561 tttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtt 659  Q
    |||||| | ||||| || || |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20963711 tttgcaaatgatgaagagaagatgaagattccacgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtt 20963810  T
Q  660 tctctct 666  Q
    |||||||    
T  20963811 tctctct 20963817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 598 - 666
Target Start/End: Original strand, 17405155 - 17405224
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17405155 aagactcatgatatctctacaaatcttgaaaagaatctactcctaacacccttgctttgtgtttctctct 17405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27104373 - 27104326
Alignment:
Q  277 ttaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaa 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27104373 ttaattgatccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaa 27104326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 479
Target Start/End: Original strand, 17404894 - 17405097
Alignment:
Q  276 attaaatgatccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagattattattctaa 374  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||   |||  |||||  ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||    
T  17404894 attaaacgattcaatagcattaagttcttgattttaaagtgattaccaaaacctaaactctattactagagtaaaaacttt-gatagattattattctaa 17404992  T
Q  375 tcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaat-aaataggtagaaccatat 473  Q
     |||  || ||||| ||  | |||||| |||||  ||| | ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  17404993 ccctatattcaaaaatacctttcaataacatttcaaatttaaaataaa-cattaaacacaagaataataacaatattgaataaaagatctagaaccatat 17405091  T
Q  474 attaaa 479  Q
    ||||||    
T  17405092 attaaa 17405097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 25805049 - 25804980
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  25805049 aagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatcaacttctaacactcttgcttcatgtttctctct 25804980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 244 - 674
Target Start/End: Original strand, 9786846 - 9787282
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9786846 attgaatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctag 9786945  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9786946 agtgataacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgttaatatcatattgaatctcaa-taaagcattaaatacaagaataac 9787044  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||      
T  9787045 aacaatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaatggtagatatact 9787144  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9787145 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatgcctagattcatgatatctcaacaaatcttgataagaatctactcct 9787244  T
Q  642 aacatcttgc-----tttgtgtttctctctagaaatgc 674  Q
    ||||||||||     ||||||| |||||||||||||||    
T  9787245 aacatcttgctttgctttgtgtctctctctagaaatgc 9787282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 244 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21160385 - 21159945
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21160385 attgaatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctag 21160286  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21160285 agtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataaca 21160187  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagcta 543  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  21160186 acaatattgaataaatagctagaatcatatattgaatgatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagcta 21160087  T
Q  544 catatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa 643  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21160086 catatgtctatgatagctttgcaaaagatgaagaagagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgataagaatctactcctaa 21159987  T
Q  644 catc-----ttgctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    || |     ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  21159986 caccttactttgctttgtgtgtctctcttgaaatgtcatctc 21159945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 244 - 671
Target Start/End: Original strand, 13230084 - 13230510
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13230084 attggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgaactaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctag 13230183  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  13230184 agtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataaca 13230282  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagcta 543  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| | || ||  ||| |||||| ||||||    
T  13230283 acaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaa-ccacaagagtagatgtagcta 13230381  T
Q  544 catatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa 643  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||| |||    
T  13230382 catatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcataa 13230481  T
Q  644 c-atcttgctttgtgtttctctctagaaa 671  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  13230482 ctaccttgctttgtgtttctctctagaaa 13230510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 36667619 - 36668033
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  36667619 gtttaatcgacgatttcccaacggattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgcctagagtgataa 36667718  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  36667719 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 36667817  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  36667818 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtc 36667917  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||     | |||||||||||| | ||||    
T  36667918 tatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttaagtctactcctaactaccttg 36668017  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  36668018 ctttgtgtttctctct 36668033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Original strand, 28457619 - 28458041
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28457619 attggatcatttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaaattctagattaaatgtaattatcaaatattaacatctatgtctag 28457718  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatcc-aaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  28457719 agtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaa-taaagcattaca--caagaataac 28457815  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  28457816 aacaatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagc 28457915  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||  |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  28457916 tacatatgtctatgatagcattgcaaaggatgaagaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtcttaacaaatcttgagttgaatctactcct 28458015  T
Q  642 aac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  28458016 aactaccttgctttgtgtttctctct 28458041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 14701063 - 14700639
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14701063 attggatcgtttaatcgacgatttcccaacctattaaacgacctaaaaatattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 14700964  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  14700963 agtgataacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttctcaatatcattttgaatctcaa-taaagcattaaatacaagaacaac 14700865  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||| |||||||  |||||||||| || |    
T  14700864 aacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatagttagtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtaac 14700765  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |    
T  14700764 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagtttccttgcctagactcaagatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactctt 14700665  T
Q  642 aac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||    
T  14700664 aactaccttgctttgtgtttttctct 14700639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 27257796 - 27257383
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27257796 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 27257697  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
     |||||||||||| |||||||| | || |||  |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27257696 tttaagatagattgttattctatttctagatttaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatttaagaataacaacaatatt 27257598  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  27257597 gaataaatagctagaactatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtc 27257499  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||| |   ||||| |||| ||| | ||||    
T  27257498 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttaaatctcctccaaactaccttg 27257399  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
     |||||||||||||||    
T  27257398 ttttgtgtttctctct 27257383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 36040012 - 36040426
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  36040012 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 36040111  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||  | |||| ||||||||||||||||||||    
T  36040112 cttaagatagattgttattctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaaaaaataaaagcaagaataacaacaatatt 36040211  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  36040212 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtc 36040310  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  36040311 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 36040410  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  36040411 ctttgtgtttctctct 36040426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 29224126 - 29223713
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  29224126 gtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataa 29224027  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  29224026 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 29223928  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||  |   ||| |||||| |||||||||||||    
T  29223927 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaa--ctacaagagtagatgtagctacatatgt 29223830  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  29223829 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 29223730  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  29223729 gctttgtgtttctctct 29223713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 29337425 - 29337012
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  29337425 gtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataa 29337326  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  29337325 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 29337227  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||  |   ||| |||||| |||||||||||||    
T  29337226 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaa--ctacaagagtagatgtagctacatatgt 29337129  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  29337128 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 29337029  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  29337028 gctttgtgtttctctct 29337012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 23924783 - 23925195
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  23924783 tttaattgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaaacctagattaaaagtgattatcaaaaattaacatccatgtctagagtgataac 23924882  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23924883 ttaagatagattattattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattg 23924981  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  ||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  23924982 aataaatagctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacaac-aagagtagatgtagatacatatgtct 23925080  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgc 651  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | |||||    
T  23925081 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacatgatccatgatgtctcaacaaatcttcgcttgaatctactcctaactaccttgc 23925180  T
Q  652 tttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||    
T  23925181 tttgtgtttctctct 23925195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Original strand, 24662871 - 24663295
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatctatatcta 342  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||   |||| ||||    
T  24662871 attggatcatttaatcgacgatttcccaacctattaaacgaccaaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaaatcctatgtcta 24662970  T
Q  343 gagtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  24662971 gaatgaaaactta-gatagattattattttaatcttagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaatgcaagaataat 24663069  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||| ||||    
T  24663070 aacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacctcaaaactcacaagcgtagatgtagc 24663169  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    |||||||||||||   ||||| ||| |||||||   ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  24663170 tacatatgtctatgcaagcttcgcaaaggatgaaagaaagatgaagattcaatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtatgaaactactcct 24663269  T
Q  642 aac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  24663270 aacaaccttgctttgtgtttctctct 24663295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 32523348 - 32522927
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  32523348 attggatcgtttaatcgacgatttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtttag 32523249  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||| || |||| | ||||||||||    
T  32523248 agtgataacttaagatggattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctc-aataaaacaataaaagtaagaataaca 32523150  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagcta 543  Q
    ||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||    
T  32523149 acactattgaataaatcgctataaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagggtagaaatagcta 32523051  T
Q  544 catatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa 643  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| || ||| | |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||    
T  32523050 catatgtccatgatagctttgcaaaggacgaagaagaaatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaataaatcttggcttgaatctactcctaa 32522951  T
Q  644 c-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  32522950 ctaccttgctttgtgtttctctct 32522927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 252 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 43991937 - 43991517
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  43991937 gttttatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattacgtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctacagtgataa 43991838  T
Q  352 cttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatat 450  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43991837 cttaagatagattgttattctattttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatat 43991739  T
Q  451 tgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  43991738 tgaataaatagctagcaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgt 43991640  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||      ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  43991639 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaa------aagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 43991546  T
Q  650 gctttgtgtttc--tctctagaaatgcca 676  Q
    || |||||||||  |||||||||| ||||    
T  43991545 gccttgtgtttctatctctagaaaagcca 43991517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 254 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 41978004 - 41977710
Alignment:
Q  254 ttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataact 353  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  41978004 ttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataact 41977905  T
Q  354 taagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattga 453  Q
    ||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41977904 taagataaattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattga 41977806  T
Q  454 ataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatg 549  Q
    |||||||| || || | |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||    
T  41977805 ataaatagctaaaatcgtatattaaaatatcaaaagtttacataatggcttgtttgaataccttaaaacccacaatggtagatgtagctatatatg 41977710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 479
Target Start/End: Original strand, 42700723 - 42700949
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  42700723 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaccaaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacttccatgtctagagtgataa 42700822  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  42700823 cttaatatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 42700921  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaa 479  Q
     || |||||| |||||||||||||||||    
T  42700922 aaacaaatagctagaaccatatattaaa 42700949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 447 - 666
Target Start/End: Original strand, 36557465 - 36557686
Alignment:
Q  447 atattgaataaataggt-agaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctaca 545  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| || |||||    
T  36557465 atattgaataaataagttagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtacctaca 36557564  T
Q  546 tatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac- 644  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||  | ||  |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||     
T  36557565 tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattaaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaact 36557664  T
Q  645 atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  36557665 accttgctatgtgtttctctct 36557686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 40200359 - 40200173
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  40200359 attggatcgtttaatcgacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctgg 40200260  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaa 430  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  40200259 aatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctc-aataaagcattaaa 40200173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 255 - 405
Target Start/End: Original strand, 36557315 - 36557466
Alignment:
Q  255 taatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataactt 354  Q
    |||||||| |||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36557315 taatcgacgatttcccagccgtttgaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataactt 36557414  T
Q  355 aagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcat 405  Q
    |||||||||| ||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36557415 aagatagattgttattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcat 36557466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 244 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31758697 - 31758500
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  31758697 attggatcgtttaatcaacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctgg 31758598  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataa 441  Q
    | ||| |||||||||||| || ||||||||  || | |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  31758597 aatgaaaacttaagatagcttgttattctatttcttagatccaaaagcattggtcaatatcattttgaatctc-aataaagcattaaacacaagaataa 31758500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 471 - 666
Target Start/End: Original strand, 42702175 - 42702370
Alignment:
Q  471 tatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagagg 570  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  42702175 tatattaaatgatcaaaagattacataatagcttatttgaatacctcaaaaccac-aagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagg 42702273  T
Q  571 atgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    | || ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42702274 aggaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 42702370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 491 - 666
Target Start/End: Original strand, 5784513 - 5784688
Alignment:
Q  491 ttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagatt 590  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||    
T  5784513 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 5784611  T
Q  591 ccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacat-cttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5784612 ccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaacttccttgctttgtgtttctctct 5784688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 603 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 492800 - 492724
Alignment:
Q  603 tcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctttgtgtttctctctagaaatgccatct 679  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  492800 tcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttgatttgtgtttctctctagaaatgccatct 492724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 598 - 671
Target Start/End: Original strand, 8687768 - 8687842
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctctagaaa 671  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  8687768 aagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctctagaaa 8687842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 598 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 11651883 - 11651814
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  11651883 aagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctactcataacacccttgctttgtgtttctctct 11651814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 31758341 - 31758256
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctt--tgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||    
T  31758341 aagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaagaatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctctctagaaatgccctctc 31758256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24852849 - 24852800
Alignment:
Q  357 gatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcatt 406  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24852849 gatagatgattattctaaccctagattcaaaagtatttttcaatatcatt 24852800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 244 - 673
Target Start/End: Original strand, 726 - 1154
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  726 attggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaatcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctag 825  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  826 agtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataaca 924  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagcta 543  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||    
T  925 acaatattgaataaataagctacaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagcta 1024  T
Q  544 catatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa 643  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  1025 catatgtctgtgataactttgcaaaggacgaagaagatatgaaaattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttggatagaatctactcctaa 1124  T
Q  644 catcttgctttgtgtttctctctagaaatg 673  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1125 caccttactttgtgtttctctctagaaatg 1154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 252 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 25977361 - 25976940
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25977361 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 25977262  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25977261 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaatcattaaatacaaaaataacaacaatatt 25977163  T
Q  452 gaataaa-taggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  25977162 gaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgt 25977063  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttg 650  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  25977062 ctatgatagctttgca-aagatgaagaaaagatgaagattccataacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaacaccttg 25976964  T
Q  651 ctttgtgtttctctctagaaatgcca 676  Q
    |||||||||  |||||||||||||||    
T  25976963 ctttgtgtt--tctctagaaatgcca 25976940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 252 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 14271084 - 14270656
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14271084 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 14270985  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    |||||||||||||  ||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  14270984 cttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaacacaagaataacaacaatatt 14270886  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  14270885 gaataaataagctagaaccatatattaaaaaatcaagaaattacataattgcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtatatatagctacatatgt 14270786  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttg 650  Q
    |||| |||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||   ||  ||||  ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  14270785 ctatgatagttttgcaaaagatgaagaaaagatgaagattcactgcctagatctatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttg 14270686  T
Q  651 ctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14270685 ctttgtgtttctctctagaaatgtcatctc 14270656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 252 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 1455203 - 1454786
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1455203 gtttaatcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 1455104  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||      ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1455103 cttaagatagattgtaattctat-----gattcaaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaa-taaaacatcaaatacaagaataacaacaatatt 1455010  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  1455009 gaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttacatatgt 1454910  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttg 650  Q
    ||||   ||||| ||| |||||||   ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  1454909 ctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttg 1454810  T
Q  651 ctttgtgtttctctctagaaatgc 674  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  1454809 ctttgtgtttctctatagaaatgc 1454786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 252 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 1466895 - 1466478
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1466895 gtttaatcaacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 1466796  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||      ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1466795 cttaagatagattgtaattctat-----gattcaaaagtatttgtcaacatcattttgaatctcaa-taaaacatcaaatacaagaataacaacaatatt 1466702  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  1466701 gaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagttacatatgt 1466602  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttg 650  Q
    ||||   ||||| ||| |||||||   ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  1466601 ctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttg 1466502  T
Q  651 ctttgtgtttctctctagaaatgc 674  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  1466501 ctttgtgtttctctatagaaatgc 1466478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 252 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 34006914 - 34006502
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  34006914 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 34006815  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  34006814 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaaacaagaataacaacaatatt 34006716  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  34006715 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 34006617  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  34006616 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggtttgaatctactcctaactacctt 34006517  T
Q  650 gctttgtgtttctct 664  Q
    |||||||||||||||    
T  34006516 gctttgtgtttctct 34006502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 3539459 - 3539045
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3539459 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 3539360  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  3539359 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 3539261  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  3539260 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 3539162  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  3539161 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 3539062  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  3539061 gctttgtgtttctctct 3539045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 26515178 - 26515592
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26515178 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 26515277  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  26515278 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 26515376  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  26515377 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 26515475  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  26515476 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 26515575  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  26515576 gctttgtgtttctctct 26515592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Original strand, 5988744 - 5989166
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5988744 attggatcgtttaattgacgatttccctaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctaaattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 5988843  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  5988844 aatgaaaacttaagatagattgttat-ctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaa-taaagcattaaacacaagaataac 5988941  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||    
T  5988942 aacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtaaatgtagc 5989041  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||  |||| |||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  5989042 tacatatgtctatgatagctttgcaaatgatga-aaaaagatgaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcct 5989140  T
Q  642 aac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5989141 aactaccttgctttgtgtttctctct 5989166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 24161006 - 24161419
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  24161006 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtccttgattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtcgagagtgataa 24161105  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24161106 cttaagatagattattattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 24161204  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  24161205 gaataaataactagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtc 24161303  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | ||||    
T  24161304 tatgatagctttgccaagaatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatctttgcttgaatctactcctaactaccttg 24161403  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  24161404 ctttgtgtttctctct 24161419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 9932555 - 9932969
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9932555 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 9932654  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  9932655 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 9932753  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  9932754 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 9932852  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
     ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  9932853 atatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttgccttgaatctactcctaactacctt 9932952  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    | |||||||||||||||    
T  9932953 gttttgtgtttctctct 9932969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 32806513 - 32806926
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  32806513 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattattaaatattaacatccatgtctagagtgataa 32806612  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  32806613 cttaagatagatttttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaccaataaaagcaagaataacaacaatatt 32806711  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  ||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||| | ||| ||||||||||    
T  32806712 gaataaatagctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtaggtgtagatacatatgtc 32806810  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  32806811 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 32806910  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  32806911 ctttgtgtttctctct 32806926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 21596279 - 21596695
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21596279 tttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 21596378  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    ||||||||| || |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  21596379 ttaagatagtttgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatattg 21596477  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||   |||  ||||| |||||||||||||||    
T  21596478 aataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccac-aagtttagatgtagctacatatgtct 21596576  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagc----taagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atc 647  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||     |||||  |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |    
T  21596577 atgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcatgacaagatctatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacc 21596676  T
Q  648 ttgctttgtgtttctctct 666  Q
     ||||||||||||||||||    
T  21596677 atgctttgtgtttctctct 21596695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 15642838 - 15642416
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatctatatcta 342  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||   |||| ||||    
T  15642838 attggatcgtttaatcgacgatttcctaacctattaaacgatccaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatgaaagattaaatactatgtcta 15642739  T
Q  343 gagtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    || ||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||     
T  15642738 gaatgaaaacata-gatagattattattctaatcctagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaaggcaagaataat 15642640  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15642639 aacaatattcaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttatttgaatacctcaaaacccacaagggtagatttagc 15642540  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    |||||||||||||   ||||| ||| |||||||   ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15642539 tacatatgtctatgcaagcttagcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttggtaagaatctactcct 15642440  T
Q  642 aacatcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||| ||| |  |||||||||||||    
T  15642439 aacaactttc-atgtgtttctctct 15642416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 252 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 34914100 - 34913803
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  34914100 gtttaatcgacgatttcccaactgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 34914001  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  34914000 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacagcaatatt 34913902  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  34913901 gaataaatagatagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgt 34913803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 24879276 - 24878863
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  24879276 tttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataac 24879177  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24879176 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgtatctc-aataaaacattaaacacaagaataacaacaatattg 24879078  T
Q  453 aataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    ||||||| || || | ||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| |   ||| ||| || ||||||||||||||    
T  24879077 aataaataagctatagccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtatatgtagctacatatgtc 24878979  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||| | ||||    
T  24878978 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttg 24878879  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
     |||||||||||||||    
T  24878878 ttttgtgtttctctct 24878863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 264 - 674
Target Start/End: Original strand, 13173586 - 13173987
Alignment:
Q  264 atttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagat 363  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  13173586 atttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataacttaagatagat 13173685  T
Q  364 tattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataggt 463  Q
    | |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13173686 tgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagct 13173784  T
Q  464 agaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagcttt 563  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||         ||||||||| ||||||||    
T  13173785 agaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagggtagat--------gtatgtctatgatagcttt 13173876  T
Q  564 gcagaggatgaggaaa--atatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctttgtgtttc 661  Q
    ||| ||||||| ||||  | |||||||||||| ||   || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  13173877 gcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgc--cgactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttactttgtgtttt 13173974  T
Q  662 tctctagaaatgc 674  Q
    ||| |||||||||    
T  13173975 tctatagaaatgc 13173987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 256 - 674
Target Start/End: Original strand, 13182111 - 13182520
Alignment:
Q  256 aatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataactta 355  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  13182111 aatcgacgattttccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataactta 13182210  T
Q  356 agatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaat 455  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13182211 agatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaaaacaagaataacaacaatattgaat 13182309  T
Q  456 aaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctata 555  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||         |||||||||     
T  13182310 aaatagctagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaagggtagat--------gtatgtctatg 13182401  T
Q  556 atagctttgcagaggatgaggaaa--atatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctt 653  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||| ||   || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||    
T  13182402 atagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgc--cgactcatgatatctcaacaaatcttgggtagaatctactcctaacaccttactt 13182499  T
Q  654 tgtgtttctctctagaaatgc 674  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  13182500 tgtgtttttctatagaaatgc 13182520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 249 - 680
Target Start/End: Original strand, 9518193 - 9518621
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtg 347  Q
    |||||||||||||| ||||| |||   |||||| || ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||   |||| |||||| |     
T  9518193 atcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgacccaaaagtattaagttcttaattacaaagtgattatcaaagattaaatcctatgtctagaata 9518292  T
Q  348 ataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaa 447  Q
    | ||||||     |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9518293 aaaactta-----gattattattctaaccctagattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataacaa 9518387  T
Q  448 tattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacat 546  Q
    |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9518388 ttatgaataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacat 9518487  T
Q  547 atgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacat 646  Q
    ||||||||   | ||| ||| |||||||   ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  9518488 atgtctatgcaaacttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgctaaaattcatgatgtctcaacaaatcttcataagaatctacttctaacat 9518587  T
Q  647 cttgctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9518588 ctcattttgtgtttctctctagaaatgtcatctc 9518621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 249 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 21631598 - 21631170
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtga 348  Q
    |||||||||||||| ||||| |||   |||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21631598 atcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgacccaaaaacattaagttctagattataagtgattatcaaagattaacatctatgtctagagtga 21631499  T
Q  349 taacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaa 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  || | ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21631498 taacttaagatagattgttattctatttcttagattcaaaagcatttttcaatatcattttgaatctc-aataaagcattaaatacaagaataacaacaa 21631400  T
Q  448 tattgaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacat 546  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||| ||  ||| |||||| || ||||||    
T  21631399 tattgaataaataagctagaaccatgtattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaatacc-tcaaatccacaagagtagatgtaactacat 21631301  T
Q  547 atgtctataatagctttgcagaggatgaggaaa--atatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac 644  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||||  | |||||||||| | |   |||| |||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||    
T  21631300 atgtctatgatagctttacaaaggatgaagaaaagagatgaagattctatgtctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttaaatctactcttaac 21631201  T
Q  645 -atcttgctttgtgtttctctctagaaatgc 674  Q
     | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21631200 taccttgctttatgtttctctctaaaaatgc 21631170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 249 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 26604755 - 26604337
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtg 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||   |||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||| |||||| |     
T  26604755 atcgtttaatcgacgatttcccaatctattaaacgatcaaatagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaaacttaaactctatgtctagaata 26604656  T
Q  348 ataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaa 447  Q
    | |||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  26604655 aaaacttt-gatagattattattctaaccctacatccaaaagtatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaaaacaagaataataacaa 26604557  T
Q  448 tattgaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacat 546  Q
    |||||||||||| || ||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||||||||| || ||||  |||| ||||| |||||||||    
T  26604556 tattgaataaataagctagaatcttatattaaatgatcaa-agattacataatagcttttttgaatacctcaatacccacaaggatagatgtagctacat 26604458  T
Q  547 atgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca- 645  Q
    |||||||| | ||||||||| | ||||    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  26604457 atgtctatgaaagctttgcaaaagatggaagaaagatgaagattccatgctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgggaagaatctacttctaacac 26604358  T
Q  646 tcttgctttgtgtttctctct 666  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  26604357 ccttgctttgtgtttctctct 26604337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 252 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16698321 - 16698088
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16698321 gtttaatcgacgatttccaaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 16698222  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    |||||||||| || |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  16698221 cttaagataggttgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 16698123  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaa 486  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16698122 gaataaatagttagaaccatatattaaatgatcaa 16698088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 345 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 32822119 - 32821772
Alignment:
Q  345 gtgataacttaagatagattattattctaatcctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  32822119 gtgataacttatgatatattgttattctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaa-taaaacagtaaatacaagaataaca 32822021  T
Q  444 acaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagct 542  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | || |||||||||  ||| ||||||||||| |||||||  |||  ||||| |||||    
T  32822020 acaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaa-atctaaagattacataattgcttatttgaatacctcaaaacccacaag--tagatgtagct 32821924  T
Q  543 acatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactccta 642  Q
    |||| ||||||| ||||||||  | ||||||  ||| | |||||||||| | ||  |||| |||||| | ||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  32821923 acatttgtctatgatagcttttaaaaggatggagaagagatgaagattcaatgcatagatccatgatttatcaacaaatcttgggttgaatctattccta 32821824  T
Q  643 acatcttgctttgtgtttctctctagaaatgccatctccaaaaagtgtgcta 694  Q
    | | |||||||| | ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  32821823 ataccttgctttatatttctatcttgaaatgccatttctaaaaagtgtgcta 32821772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 491 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 14479733 - 14479558
Alignment:
Q  491 ttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagatt 590  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  14479733 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccac-aagagtagatatagctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt 14479635  T
Q  591 ccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14479634 ccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 14479558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 358 - 663
Target Start/End: Original strand, 6867907 - 6868213
Alignment:
Q  358 atagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa 457  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  | |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||| ||| || |||||  || ||    
T  6867907 atagattattattctaaccctagattcaaaagtacctttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaacacaagactaataaaaatatcaaaaaa 6868006  T
Q  458 at-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataa 556  Q
    || || |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || |  |||     
T  6868007 atgagctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaacccacaagggtagatgtagctacaaattttcatag 6868106  T
Q  557 tagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctttg 655  Q
    |||| ||||| | ||||    ||||||||||| |||| |  |||||||||||| | || ||| |||||| || ||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  6868107 tagccttgcaaaagatggaagaaatatgaagactccatgacaagattcatgatat-tctacatatcttgggaggaatctacttctaacacccttgttttg 6868205  T
Q  656 tgtttctc 663  Q
    ||||||||    
T  6868206 tgtttctc 6868213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 34913557 - 34913435
Alignment:
Q  556 atagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctttg 655  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| | ||  | || ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  34913557 atagctttgcataggatgatgaagagatgaagattcaatgcctaaatccataatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgctttg 34913458  T
Q  656 tgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||    
T  34913457 tgttt--ctctagaaatgtcatctc 34913435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 583 - 666
Target Start/End: Original strand, 26510392 - 26510476
Alignment:
Q  583 tgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26510392 tgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 26510476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 774 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 1454689 - 1454627
Alignment:
Q  774 gttctattccatgatggcttgttttatatc-ttccctcttttgaaaagctaacttacctttca 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  1454689 gttctattccatgatggcttgttttatatctttctcctttttgaaaacctaacttacctttca 1454627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 774 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 1466381 - 1466319
Alignment:
Q  774 gttctattccatgatggcttgttttatatc-ttccctcttttgaaaagctaacttacctttca 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  1466381 gttctattccatgatggcttgttttatatctttctcctttttgaaaacctaacttacctttca 1466319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 25541486 - 25541255
Alignment:
Q  276 attaaatgatccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagattattattctaa 374  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||  ||||  || || |||||| | | |||||  |||| |||||||||||||    
T  25541486 attaaacgatccaatagcattaagctcttgattacaaagtgattaccaaaacttaaactccatgtctagaataa-aacttt-gatatattattattctaa 25541389  T
Q  375 tcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-aggtagaaccatat 473  Q
     |||  || ||||||||| | |||||| |||||  ||| | ||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||    
T  25541388 ccctatattcaaaagtatatttcaataacatttcaaattttaaataaagcaagaaacacaagaataataacaatatttaataaataagctagaaccttat 25541289  T
Q  474 attaaaagatcaagagtttacataatgacttgttt 508  Q
    || ||| |||||| || |||||||||  |||||||    
T  25541288 atgaaatgatcaa-agattacataatagcttgttt 25541255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 254 - 664
Target Start/End: Original strand, 37251657 - 37252065
Alignment:
Q  254 ttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataact 353  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  37251657 ttaatcgacgatttcccaaacgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctagagtgataact 37251756  T
Q  354 taagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattga 453  Q
    ||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37251757 taagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattga 37251855  T
Q  454 ataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtcta 553  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37251856 ataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatatcta 37251955  T
Q  554 taatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctt 653  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||  || |||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||| |||| ||    
T  37251956 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatcct-tgactcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctacacctaacaccttgttt 37252054  T
Q  654 tgtgtttctct 664  Q
    ||||| |||||    
T  37252055 tgtgtctctct 37252065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 11723026 - 11723440
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11723026 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 11723125  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  11723126 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 11723224  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  11723225 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 11723323  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  11723324 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 11723423  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  11723424 gctttgtgtttctctct 11723440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 16904359 - 16904773
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16904359 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 16904458  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  16904459 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 16904557  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  16904558 gaataaataggctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 16904656  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||| | |||    
T  16904657 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacccctaactacctt 16904756  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  16904757 gctttgtgtttctctct 16904773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 27166848 - 27167261
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27166848 gtttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 27166947  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | || ||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27166948 cttaagataaattgttattctatttctagattcaaaaatatatgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 27167046  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  27167047 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtc 27167145  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  27167146 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtcccaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 27167245  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  27167246 ctttgtgtttctctct 27167261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 9404836 - 9404422
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9404836 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 9404737  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  9404736 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaaacaagaataacaacaatatt 9404638  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  9404637 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 9404539  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  9404538 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 9404439  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  9404438 gctttgtgtttctctct 9404422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 11767166 - 11766753
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11767166 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 11767067  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||    
T  11767066 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaataataaaagcaagaataacaacaatatt 11766968  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||    
T  11766967 gaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtc 11766869  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  11766868 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 11766769  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  11766768 ctttgtgtttctctct 11766753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 31846391 - 31845978
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31846391 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 31846292  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  31846291 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 31846193  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| |   |||  || || ||||||||||||||    
T  31846192 gaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagattaaatgtagctacatatgtc 31846094  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  31846093 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 31845994  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  31845993 ctttgtgtttctctct 31845978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 30606826 - 30607240
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30606826 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 30606925  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  30606926 cttaagatagattattattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaaacaagaataacaacaatatt 30607024  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  30607025 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 30607123  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| | |||    
T  30607124 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatattggcttgaatctactcctaactacctt 30607223  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  30607224 gctttgtgtttctctct 30607240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 33435014 - 33434601
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33435014 gtttaatcgtcgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 33434915  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  33434914 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 33434816  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| |||| |   ||| | |||| ||||||||||||||    
T  33434815 gaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgagtacctcaaaa-ctacaagaggagatgtagctacatatgtc 33434717  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  33434716 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 33434617  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  33434616 ctttgtgtttctctct 33434601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 34869497 - 34869910
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34869497 tttaatcgaggatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 34869596  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||| ||||| ||||| || | || ||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34869597 ttaagaaagattgttattttatttctagattcaaaagtacgtgtccatatcattttaaatctcaa-tagaacattatatgcaagaataacaacaatattg 34869695  T
Q  453 aataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtct 552  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  34869696 aataaatagctagaaccatatattaaatgatcgaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtct 34869795  T
Q  553 ataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgc 651  Q
    || ||||||||||| || ||||  || | |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||     
T  34869796 atgatagctttgcaaagaatgaataagagatgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgt 34869895  T
Q  652 tttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||    
T  34869896 tttgtgtttctctct 34869910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 34456707 - 34456295
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  34456707 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtc--gagtgataa 34456610  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  34456609 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaaacaagaataacaacaatatt 34456511  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  34456510 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 34456412  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  34456411 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 34456312  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  34456311 gctttgtgtttctctct 34456295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 249 - 679
Target Start/End: Original strand, 39655783 - 39656214
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagatta-aaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtg 347  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   |||||| || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||   |||| |||||| |     
T  39655783 atcgttcaatcgacgatttcccaatctattaaacgacccaaaaccattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaaatcctatgtctagaatt 39655882  T
Q  348 ataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaa 447  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  39655883 aaaactta-gatagattattattttaaccctagattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataataagaa 39655981  T
Q  448 tattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacat 546  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  39655982 gattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacat 39656081  T
Q  547 atgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacat 646  Q
    |||||| |   |||||  || |||||||   ||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||     
T  39656082 atgtctttgcaagcttgacaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttttgtagaatctactcctaacac 39656181  T
Q  647 cttgctttgtgtttctctctagaaatgccatct 679  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39656182 cttacgttgtgtttctctctagaaatgtcatct 39656214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 287 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 7315342 - 7314963
Alignment:
Q  287 caaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaa 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||    
T  7315342 caaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaa 7315243  T
Q  387 aagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatca 485  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7315242 aagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatca 7315144  T
Q  486 agagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatga 585  Q
    | || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||    
T  7315143 aaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtga 7315045  T
Q  586 agattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7315044 agattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 7314963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 14344873 - 14344467
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14344873 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 14344774  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  14344773 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaaacaagaataacaacaatatt 14344675  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||        |||||||||  ||||||||||||||| |||| |   ||| |||||| |||||||||||||    
T  14344674 gaataaataagttagaaccatatattaaaaga--------ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgt 14344584  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  14344583 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 14344484  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||| ||||||||||    
T  14344483 gctttgagtttctctct 14344467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 6270302 - 6269888
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttccc-aacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgata 350  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  6270302 gtttaatcgacgatttccccaaccgattaaattaccaaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgata 6270203  T
Q  351 acttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatat 450  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||  |||| |||||||||| | |||| |||||| || ||||  ||||||||||||||||||    
T  6270202 acttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtacatgtccatatcattttgagtctc-aataaaacaataaagacaagaataacaacaatat 6270104  T
Q  451 tgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  6270103 tgaataaatagctagaaatatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagctacatatgt 6270005  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |  ||||| |||| |||| ||||||||||||    |||||||||| |||| |  ||    
T  6270004 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagattccttgacaagatccatgttgtcacaacaaatcttggcttgaatctactcataactacatt 6269905  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
     ||||||||||||||||    
T  6269904 tctttgtgtttctctct 6269888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 24836134 - 24835733
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |                
T  24836134 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgt------------ 24836047  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
     |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  24836046 -ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 24835949  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  24835948 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 24835850  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | |||    
T  24835849 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcctgacttgaatctactcctaactacctt 24835750  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    | |||||||||||||||    
T  24835749 gatttgtgtttctctct 24835733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 252 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 7315616 - 7315358
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7315616 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 7315517  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||    
T  7315516 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaaacaagaataacaacaatatt 7315418  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttga 510  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  7315417 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttga 7315358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 249 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 519444 - 519320
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtga 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  519444 atcgtttaatcgacaatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatttagaatga 519345  T
Q  349 taacttaagatagattattattcta 373  Q
     ||||||||||||||| ||||||||    
T  519344 aaacttaagatagattgttattcta 519320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 32227070 - 32226914
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  32227070 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcactaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattgacattcatgtctagagtgataa 32226971  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcatttt 408  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  32226970 cttaagacagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttt 32226914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 599 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 32226898 - 32226833
Alignment:
Q  599 agattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgctttgtgtttctct 664  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32226898 agatccatgatgtctcaacaaattttaggttgaatctactcctaacaccttgctttgtgtttctct 32226833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 497
Target Start/End: Original strand, 42747484 - 42747623
Alignment:
Q  357 gatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaata 456  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||  | ||||| ||| ||  ||||||||||   ||||||  ||||    
T  42747484 gatagatgattattctaaccctagattcaaaagtatttttcaataacattttaaatcaaacataaa-catgaatcgcaagaataatctcaatatcaaata 42747582  T
Q  457 aataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacata 497  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  42747583 aagagctagaatcatatattcaaagatcaaaagattacata 42747623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 252 - 676
Target Start/End: Original strand, 11954 - 12373
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11954 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataa 12053  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12054 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 12152  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||  |||||||    
T  12153 gaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtc 12250  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgc 651  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  12251 tatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgc 12350  T
Q  652 tttgtgtttctctctagaaatgcca 676  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  12351 tttgtgtt--tctctagaaatgcca 12373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 252 - 676
Target Start/End: Original strand, 15724 - 16143
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15724 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataa 15823  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15824 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 15922  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||  |||||||    
T  15923 gaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgtc 16020  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttgc 651  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  16021 tatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttgc 16120  T
Q  652 tttgtgtttctctctagaaatgcca 676  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  16121 tttgtgtt--tctctagaaatgcca 16143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 116318 - 116731
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  116318 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 116417  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  116418 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaattcaagaataacaacaatatt 116516  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  116517 gaattaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtc 116615  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  116616 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaggattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 116715  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  116716 ctttgtgtttctctct 116731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 320
Target Start/End: Original strand, 169158 - 169226
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattat 320  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  169158 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatttaaagtgattat 169226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 30218137 - 30218555
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30218137 tttaatcgatgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgataac 30218236  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||  || | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30218237 ttaagatagattgttattctatttcttagaacaaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaa-taaagcattaaatacaagaatagcaacaatatt 30218335  T
Q  452 gaataaata----ggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacata 547  Q
    |||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  30218336 gaataaataataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtagctacata 30218435  T
Q  548 tgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-at 646  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |     
T  30218436 tgtctatgatagctttgctaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactcatgacgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactac 30218535  T
Q  647 cttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30218536 cttgctttgtgtttctctct 30218555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 19247578 - 19247991
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19247578 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 19247677  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19247678 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaagctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 19247776  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  19247777 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgtc 19247875  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||| ||| | ||||    
T  19247876 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaacaaatattggtttgaatctactcccaactaccttg 19247975  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  19247976 ctttgtgtttctctct 19247991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 4838886 - 4839300
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  4838886 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 4838985  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  4838986 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 4839084  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  4839085 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 4839183  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  4839184 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 4839283  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  4839284 gctttgtgtttctctct 4839300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 40995298 - 40995713
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40995298 tttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgactcaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 40995397  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  40995398 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctc-aataagacaataaaagcaagaataacaacaatattg 40995496  T
Q  453 aataaataggtagaaccata---tattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatg 549  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || |||||||||  ||| ||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  40995497 aataaatagctagaaccatatattattaaatgatcaaaagattacataatagcttttttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatatagctacatatg 40995595  T
Q  550 tctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atct 648  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||    
T  40995596 tctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacct 40995695  T
Q  649 tgctttgtgtttctctct 666  Q
    || |||||||||||||||    
T  40995696 tgatttgtgtttctctct 40995713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 252 - 680
Target Start/End: Original strand, 33110452 - 33110881
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33110452 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccctgaacattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgataa 33110551  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||| | ||||  |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33110552 cttaagatagactcttatgtttttcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaa-taaagctttaaatacaagaataacaacaatatt 33110650  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  33110651 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatggcttgtgtgaatacctcaaaacccacaagggtatatataactacatatgt 33110750  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||  ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||  || ||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| | |||    
T  33110751 ctacgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagatgtcatgcctaaattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctactcttaactacctt 33110850  T
Q  650 gctttgtgtttctctctagaaatgccatctc 680  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33110851 gccttgtgtttctctctagaaatgtcatctc 33110881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 21677417 - 21677831
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21677417 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 21677516  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677517 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctc-aatcaaacattaaatgcaagaataacaacaatatt 21677615  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  21677616 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgt 21677714  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||  | ||  ||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||| ||||||| |  ||    
T  21677715 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattttatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctattcctaactacttt 21677814  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  21677815 gctttgtgtttctctct 21677831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 244 - 662
Target Start/End: Original strand, 46691779 - 46692196
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  46691779 attggatcgtttaatcgatgatttcccaaccgattaattgacctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatcaatgtttag 46691878  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| | || |||  |||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  46691879 agggataacttaagatagattgttattctatttctagatttaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataaca 46691977  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagcta 543  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||| |||    
T  46691978 acaatattgaataaatagctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatataacta 46692076  T
Q  544 catatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa 643  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  46692077 catatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagattcaatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaa 46692176  T
Q  644 c-atcttgctttgtgtttct 662  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  46692177 ctaccttgctttgtgtttct 46692196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 26070139 - 26069723
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  26070139 gtttaatcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagttctagactaaaagtgattatcaaatattaacatacatgtctagagtgataa 26070040  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  26070039 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtctgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 26069941  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagata--tagctacatatg 549  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  26069940 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatatgtagctacatatg 26069841  T
Q  550 tctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atct 648  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |  ||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||| | ||    
T  26069840 tctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagttgaagattcaatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctacttctaactacct 26069741  T
Q  649 tgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26069740 tgctttgtgtttctctct 26069723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 244 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 53895798 - 53895406
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53895798 attggatcgtttaatagacgatttcccaacctattaaacgacccaaaaacattaaggtctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 53895699  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctg-gatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  53895698 aatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaa-taaagcattaaacacaagaataac 53895600  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  53895599 aacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaata---agagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagc 53895503  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctact 638  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  53895502 tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagactccatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggttgaatctact 53895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 252 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1188376 - 1187965
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1188376 gtttattcgacgatttcccaaccgattaaatcacccaaaagcatcaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 1188277  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    |||||||||||||  ||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1188276 cttaagatagattgctattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaattcaataataacaacaatatt 1188178  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
     ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| |||||||||||| |    
T  1188177 aaataaataactagaatcatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatgcc 1188079  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||    
T  1188078 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgacaagattcatgatgtctcaacaaatcttgacttgaatctactcctaactaccttg 1187979  T
Q  651 ctttgtgtttctct 664  Q
    ||||||||||||||    
T  1187978 ctttgtgtttctct 1187965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 323850 - 323436
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  323850 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagcgtgataa 323751  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  323750 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccgtatcattttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 323652  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| | |||| |   ||| |||||| |||||||||||||    
T  323651 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacatcaaaa-ctacaagagtagatgtagctacatatgt 323553  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
     ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  323552 ttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatctt 323453  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  323452 gctttgtgtttctctct 323436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 22048093 - 22047679
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22048093 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 22047994  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| |||| || ||||  ||| |||||||||||||||    
T  22047993 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattctgaatctcaa-taaaacaataaaaacaaaaataacaacaatatt 22047895  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  22047894 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 22047796  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||||||    |||||| |||||||| | |||    
T  22047795 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccataatgtctcaacaaatcttggcttgaatcttctcctaactacctt 22047696  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  22047695 gctttgtgtttctctct 22047679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 42532636 - 42533051
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  42532636 gtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 42532735  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctgga-tccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatat 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || || || |||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  42532736 cttaagatagattgttattctagttctagattcaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatct-taataaaacaataaaagcaagaataacaacaatat 42532834  T
Q  451 tgaataaataggtagaa-ccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatg 549  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  42532835 tgaataaatagctagaacccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagagtagatgtagctacatatg 42532933  T
Q  550 tctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa-catct 648  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||| |    |||||||||||||| || ||    
T  42532934 tctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgacgtctcaacaaatctaggcttgaatctactcctaaccacct 42533033  T
Q  649 tgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42533034 tgctttgtgtttctctct 42533051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 276 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 20949133 - 20948743
Alignment:
Q  276 attaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagattattattctaat 375  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||| |||||||| |    
T  20949133 attaattgatccaaaaacattaaattctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtctggaatgaaaactta-gatagattgttattctatt 20949035  T
Q  376 cctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagg-tagaaccatata 474  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20949034 cctagatccaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaa-taaagctataaatacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatata 20948936  T
Q  475 ttaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatga 574  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||  || |||||||    
T  20948935 ttaaaatatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaggatagatgtagctacatatatttatgatagcttgacaaaggatga 20948836  T
Q  575 ggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
     ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  20948835 agaaaagatgaagattccatgcctagattcatgatgtctcgacaaatcttgggttgaatctacttttaactaccttgctttgtgtttctctct 20948743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Original strand, 26373373 - 26373793
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  26373373 attggatcgtttaatcgacgatttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctag 26373472  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |  | ||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  26373473 agtgataacttaaggtagattgttattctatttatagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctc-aataaaaca-taaaagcaagaataaca 26373570  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacc-cgtaagggtagatatagct 542  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||| | | |||   |||||||||    
T  26373571 acaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacatgagg--tgatatagct 26373668  T
Q  543 acatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactccta 642  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  26373669 atatatgtctatgatagctttgcaaaggataaagaagaaatgaagattcaatgataagatccatgatatctcaacaaatattggcttgaatctactccta 26373768  T
Q  643 ac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    || | ||||||||||||||||||||    
T  26373769 actaccttgctttgtgtttctctct 26373793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 52618914 - 52618512
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||| ||| ||||||| |  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  52618914 gtttaattgacgatttcccgatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 52618815  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52618814 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtttgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaatcattaaatgcaagaataacaacaatatt 52618716  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||||   ||  |||||| ||||||||||||||    
T  52618715 gaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccac-aatagtagatgtagctacatatgtc 52618617  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| |||           |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||| | ||||    
T  52618616 tatgatagctttgcaaagg-----------atgaagattccatgacaagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatctactcctaactaccttg 52618528  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  52618527 ctttgtgtttctctct 52618512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 5273312 - 5273715
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5273312 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 5273411  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||  |||||||||||||||| ||    
T  5273412 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaaacaagaataacaacaatttt 5273510  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  5273511 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 5273609  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| |||           ||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  5273610 ctatgatagctttgcaaagg-----------atgaagaatccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 5273698  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  5273699 gctttgtgtttctctct 5273715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 275 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 55327165 - 55326772
Alignment:
Q  275 gattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaagatagattattattctaa 374  Q
    |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  55327165 gattaaattacccaaaaacattaagctctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaagtgataacttaagatagattgttattctat 55327066  T
Q  375 tcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-aggtagaaccatat 473  Q
    | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  55327065 ttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaagcattaaacacaagaataacaacaattttgaataaataagctagaaccatat 55326967  T
Q  474 attaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatg 573  Q
    |||||| |||||| || || ||||||  |||| |||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  55326966 attaaatgatcaaaagattgcataatagcttgcttgaatacctcaaaa-ccacaagggtagatgtagctacatatgtctatgatagctttggaatggatg 55326868  T
Q  574 aggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaaga--atctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    | ||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||  ||||||| |  ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  55326867 aagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaatgaatcttgggttgaatatctactcctaactatcttgctatgtgtttctctct 55326772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 35416446 - 35416847
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35416446 gtttaattgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 35416545  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  35416546 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctc-aataaaacaataaaagcaagaatatcaataatatt 35416644  T
Q  452 gaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||| |||||||| | |||| ||  ||| |||||| || |||||||||||    
T  35416645 gaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttg-ttgaatacatcaaaa-ccacaagagtagatgtaactacatatgtc 35416742  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| |||| | |||           |||| ||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||     
T  35416743 tatgatagttgtgc-----------aaaagatgaagatttcatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactatcttt 35416831  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  35416832 ctttgtgtttctctct 35416847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 357 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 6640286 - 6639976
Alignment:
Q  357 gatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaa-caatattgaat 455  Q
    |||||||||||||| ||  ||| | | ||||||||||| |||||| |||||  ||||  |||||||||||||||  |||||| || || ||||| |||||    
T  6640286 gatagattattattttagccctaggttcaaaagtatttttcaataacatttcaaatcataaataaagcattaaacacaagaacaataatcaataatgaat 6640187  T
Q  456 aaataggt-agaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctat 554  Q
    |||||  | |||||| ||||||||| |||||| || || ||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6640186 aaataaattagaaccttatattaaatgatcaa-agattccataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatgtctat 6640088  T
Q  555 aatagctttgcagaggat-gaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgct 652  Q
     | ||||||| | | ||| || | ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  6640087 gaaagctttggaaaagatagaag-aaagatgaagattacatgctaagattcaagatgtctcaacaaattttgggaagaatctactcctaacacccttgct 6639989  T
Q  653 ttgtgtttctctc 665  Q
    |||||||||||||    
T  6639988 ttgtgtttctctc 6639976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 244 - 441
Target Start/End: Original strand, 9417175 - 9417372
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  9417175 attggatcatttaatcgacgatttcccaacctattaaacaaaccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattgtaaaatattaacatctatgtctag 9417274  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattcta-atcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataa 441  Q
    | ||| |||||| |||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  9417275 aatgaaaacttacgatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctc-aataaagcattaaacacaagaataa 9417372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 531 - 666
Target Start/End: Original strand, 44432081 - 44432217
Alignment:
Q  531 gtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaag 630  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||    |    
T  44432081 gtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaagggtgaagattccatggcaagatccatgatgtctcaagaaatcttggcttg 44432180  T
Q  631 aatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  44432181 aatctactcctaactaccttgctttgagtttctctct 44432217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 8894998 - 8894920
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctttgtgtttctctctagaaatgcc 675  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8894998 aagattcatgatttctctacaaatcttgggaagaatctacttctaacacccttgcattgtgtttctctctagaaatgcc 8894920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 666
Target Start/End: Original strand, 9417531 - 9417600
Alignment:
Q  598 aagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaaca-tcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  9417531 aagattcatgatgtctcaacaaatcttggaaataatccacttctaacactcttgcttcatgtttctctct 9417600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8895277 - 8895205
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctaga-ttaaaagtgattatcaaa 324  Q
    |||||||||  ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  8895277 tttaatcgatgatttctcaacctattaaacgatccaaaagcattaagttcttgatttcaaagtgattatcaaa 8895205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Original strand, 13568266 - 13568347
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagtt-ctagattaaaagtgattatcaaa 324  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  13568266 attgagtcgtttaatcgtcgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattatcaaa 13568347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 244 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 14605 - 14176
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||   |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14605 attggatcgtttaatcgacgattttccaatctattaaacgatccaaaagcattaagctcttgatttaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctag 14506  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctgg-atccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataac 442  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  14505 aatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttatatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaa-taaagcattaaacacaagaataac 14407  T
Q  443 aacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagc 541  Q
    ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  14406 aactatattgaataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttac-taatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagc 14308  T
Q  542 tacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcct 641  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||  |  | | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14307 tacatatgtatatgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagattccatccctaaactcatgatgtctcaacaaatcttgagttgaatctactcct 14208  T
Q  642 aacatcttgctttgtgtttctctctagaaatgcc 675  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14207 aacaccttgctttgtg--tctctctagaaatgcc 14176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 12606 - 12185
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12606 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctagagtgataa 12507  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaat-aacaacaatat 450  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12506 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaattaaatgcaagaataaacaacaatat 12407  T
Q  451 tgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||  ||||||    
T  12406 tgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacacacaagggtagatgcagct--atatgt 12309  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacatcttg 650  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  12308 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagattcaatgcctagattcatgatgtctcaataaatcttgggttgaatctactcctaacaccttg 12209  T
Q  651 ctttgtgtttctctctagaaatgcca 676  Q
    |||||||||  |||||||||||||||    
T  12208 ctttgtgtt--tctctagaaatgcca 12185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Original strand, 28649 - 29063
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28649 gtttaatcgacgattttccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 28748  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  28749 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 28847  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  28848 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 28946  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  28947 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 29046  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    |||||||||||||||||    
T  29047 gctttgtgtttctctct 29063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 9154 - 8740
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9154 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 9055  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  9054 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatatt 8956  T
Q  452 gaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgt 550  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| |||||||||||||    
T  8955 gaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgt 8857  T
Q  551 ctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atctt 649  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||    
T  8856 ctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactacctt 8757  T
Q  650 gctttgtgtttctctct 666  Q
    || ||||||||||||||    
T  8756 gccttgtgtttctctct 8740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Original strand, 76194 - 76615
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  76194 attgaatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctag 76293  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  76294 agtgataacttaagatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataaca 76392  T
Q  444 acaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagcta 543  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || |||    
T  76393 acaatattgaataaatagctagaaccatacattaaatgatcaaaagattacataataacttgtttgaatacctcaaaa-tcacaagagtagatgtatcta 76491  T
Q  544 catatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaa 643  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  76492 catatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaattgttgaagattctatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaa 76591  T
Q  644 c-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  76592 ctaccttgctttgtgtttctctct 76615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 253 - 666
Target Start/End: Original strand, 25401 - 25814
Alignment:
Q  253 tttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataac 352  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25401 tttaatcgacgatttccaaaccgattaatttacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataac 25500  T
Q  353 ttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattg 452  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  25501 ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacaataaaagcaagaataacaacaatattg 25599  T
Q  453 aataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtc 551  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  25600 aataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatatc 25698  T
Q  552 tataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttg 650  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||    
T  25699 tatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttg 25798  T
Q  651 ctttgtgtttctctct 666  Q
    ||||||||||||||||    
T  25799 ctttgtgtttctctct 25814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 244 - 666
Target Start/End: Original strand, 16215 - 16637
Alignment:
Q  244 attgaatcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctag 343  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16215 attggatcgtttaatcgatgatttcccaatctattaatcgatccaaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaagattaacatctatgtctag 16314  T
Q  344 agtgataacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataaca 443  Q
    | ||| |||||| |||||||| ||||   | |||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  16315 aatgaaaactta-gatagattgttatataattcctagatccaaaagtattagttaatatcatttcaaatctcaa-taaagccttaaatacaagaataaca 16412  T
Q  444 acaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagct 542  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||  ||||||| || ||| |    
T  16413 accatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagggtttacataatagcttatttaaatacctcaaaacccacaagggtatatgtagat 16512  T
Q  543 acatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactccta 642  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  16513 acatatgtctaagatagcttggcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctagattcatgatgtctcaacaaatcttgggtagaatctactctta 16612  T
Q  643 ac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    || | ||| ||||||||||||||||    
T  16613 actaccttactttgtgtttctctct 16637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 254 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 7141 - 6730
Alignment:
Q  254 ttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataact 353  Q
    ||||||||| |||| |||||  ||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7141 ttaatcgacgattttccaaccaattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataact 7042  T
Q  354 taagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattga 453  Q
    ||| ||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7041 taaaatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctc-aagaaaacaataaaagcaagaataacaacaatattga 6943  T
Q  454 ataaataggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtcta 553  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||  |||  | ||| ||||||||||||||||    
T  6942 ataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaa-ccacaagaatggatgtagctacatatgtcta 6844  T
Q  554 taatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgct 652  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | |||||     
T  6843 tgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgacaagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgcc 6744  T
Q  653 ttgtgtttctctct 666  Q
    |||| |||||||||    
T  6743 ttgtatttctctct 6730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 252 - 513
Target Start/End: Original strand, 12238 - 12491
Alignment:
Q  252 gtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataa 351  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12238 gtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataa 12337  T
Q  352 cttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatatt 451  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||         |||| ||||||||||||||||||||    
T  12338 cttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa---------taaaagcaagaataacaacaatatt 12428  T
Q  452 gaataaat-aggtagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaata 513  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  12429 gaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaata 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 433 - 679
Target Start/End: Original strand, 35212 - 35458
Alignment:
Q  433 caagaataacaacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaaggg 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || ||    
T  35212 caagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaaaaatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaactcacaatgg 35311  T
Q  532 tagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaaga 631  Q
    | ||| || ||||||||||||||   ||||| ||| |||||||   ||| ||||||||| ||  |  ||| |||| |||||||||||||||||| | |||    
T  35312 tggatgtacctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcataccgagactcataatgtctcaacaaatcttgggtaga 35411  T
Q  632 atctactcctaacatcttgctttgtgtttctctctagaaatgccatct 679  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35412 atctactcctaacaccttgctttgtgtttctc-ctagaaatgccatct 35458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 249 - 373
Target Start/End: Original strand, 35070 - 35191
Alignment:
Q  249 atcgtttaatcgactatttcccaacagattaaatgatccaaaagcattaagttctaga-ttaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtg 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  35070 atcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgaccaaaaagcattaagttctagatttaaaagtgattatcaaatattaacatcta----tagagtg 35165  T
Q  348 ataacttaagatagattattattcta 373  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||    
T  35166 ataacttaaggtagattgttattcta 35191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 385 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7205
Alignment:
Q  385 aaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatc 484  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7341 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatc 7243  T
Q  485 aagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaac 522  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7242 aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 7205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 385 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 11955 - 11819
Alignment:
Q  385 aaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatc 484  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11955 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatc 11857  T
Q  485 aagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaac 522  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11856 aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 11819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7409 - 7340
Alignment:
Q  287 caaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaa 356  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7409 caaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 7340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12023 - 11954
Alignment:
Q  287 caaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaa 356  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12023 caaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 11954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 385 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 9950 - 9814
Alignment:
Q  385 aaaagtatttgtcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaataggtagaaccatatattaaaagatc 484  Q
    |||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9950 aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatc 9852  T
Q  485 aagagtttacataatgacttgtttgaataccttaaaac 522  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9851 aagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaac 9814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10018 - 9949
Alignment:
Q  287 caaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatatctagagtgataacttaa 356  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10018 caaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa 9949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 396 - 665
Target Start/End: Original strand, 9343 - 9616
Alignment:
Q  396 tcaatatcattttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagg-tagaaccatatattaaaagatcaagagtttac 494  Q
    |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||||| || ||||    
T  9343 tcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaa-agattac 9441  T
Q  495 a---taatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattc 591  Q
    |   ||||  |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||    ||| ||||||||||    
T  9442 aaattaatagcttgtttgaataccttaaaaaccacaagcgtagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaagatgaagattc 9541  T
Q  592 caagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaacat-cttgctttgtgtttctctc 665  Q
    ||  |||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9542 catactaagattcatgatatctctacaaatcctaggaagaatctacttctaacatgcttgatttgtgtttctctc 9616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 73; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 491 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 1737 - 1562
Alignment:
Q  491 ttacataatgacttgtttgaataccttaaaacccgtaagggtagatatagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagatt 590  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||    
T  1737 ttacataatagcttgtttgaatacctcaaaactac-aagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt 1639  T
Q  591 ccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctactcctaac-atcttgctttgtgtttctctct 666  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1638 ccatgataagatccatgatgtctcaacaaatcttggcttgaatctactcctaactaccttgctttgtgtttctctct 1562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 538 - 680
Target Start/End: Original strand, 5 - 150
Alignment:
Q  538 tagctacatatgtctataatagctttgcagaggatgaggaaaatatgaagattccaagctaagattcatgatgtctcaacaaatcttgagaagaatctac 637  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | | |||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  5 tagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagaggaagattcaatgcctagatccatgatgtctcaacaaatcttgtgttgaatctac 104  T
Q  638 tcctaac-atcttgctttgtgtt--tctctctagaaatgccatctc 680  Q
    ||| ||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  105 tcccaactaccttgctttgtctttctctctctagaaatgccctctc 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University