View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF4595_low_6 (Length: 389)

Name: NF4595_low_6
Description: NF4595
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF4595_low_6
NF4595_low_6
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (19-357)||(14182560-14182898)
chr8 (19-357)||(40717319-40717657)
chr8 (34-377)||(14191515-14191864)
chr8 (19-324)||(14200514-14200819)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (19-385)||(34645615-34645987)
chr5 (19-379)||(34665309-34665675)
chr5 (33-385)||(19649558-19649916)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (37-356)||(34302291-34302610)
chr6 (32-80)||(33890023-33890071)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (115-389)||(45644906-45645187)
chr4 (32-312)||(1389909-1390191)
chr4 (36-83)||(45644853-45644900)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (214-357)||(28402637-28402780)
chr2 (214-357)||(45396705-45396848)
chr2 (271-357)||(44491559-44491645)
chr2 (37-89)||(28402454-28402506)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 14182560 - 14182898
Alignment:
Q  19 tctcatgcgctatacaatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactataccaacctacacaaaacaaataccaacatattg 118  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14182560 tctcatgctctaaacaatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactataccaacctacacaaaacaaataccaacatattg 14182659  T
Q  119 tcaacgccgcacgccgttctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacaccttaatcaactgtaatccccgatcatggcgagta 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14182660 tcaatgccgcacgccgttctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacacctcaatcaactgtaatccccgatcatggcgagta 14182759  T
Q  219 tctcatgacctattcagttggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtaaacaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14182760 tctcatgacctattcagttggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgcaaagaa 14182859  T
Q  319 tgttacaaccaaaccactcctaagtttaatccatcaaaa 357  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14182860 tgttacaatcaaacaactcctaagtttaaaccatcaaaa 14182898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Original strand, 40717319 - 40717657
Alignment:
Q  19 tctcatgcgctatacaatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactataccaacctacacaaaacaaataccaacatattg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |  |||    
T  40717319 tctcatgcgctaaacaatggttttagcgttgaacttatccaccgcgactcttcaaaatcaccattctaccaacctacacaaaacaagtaccaaaaagttg 40717418  T
Q  119 tcaacgccgcacgccgttctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacaccttaatcaactgtaatccccgatcatggcgagta 218  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | || ||||   ||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||||    
T  40717419 tgaatgccgcacgtcgttctatcaaccgtgctaatcatttctacaaaaattcacttacaagttcacctgaatcaaatgtaatccctgataatggtgagta 40717518  T
Q  219 tctcatgacctattcagttggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtaaacaa 318  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40717519 tctgatgacctattcaattggtagcccaccatttaagttatatggcattgttgacacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtgaacaa 40717618  T
Q  319 tgttacaaccaaaccactcctaagtttaatccatcaaaa 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40717619 tgttacaaccaaaccactcctaagtttaaaccatcaaaa 40717657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Original strand, 14191515 - 14191864
Alignment:
Q  34 aatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactataccaacctacacaaaacaaataccaacatattgtcaacgccgcacgcc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||| || ||||| | |||||||| |    
T  14191515 aatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactctttaaaatcaccactctataaacctactcaaaataaataccaatattttgtcgatgccgcacgtc 14191614  T
Q  134 gttctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacaccttaatcaactgtaatccccgatcatggcgagtatctcatgacctattc 233  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  14191615 gttccatcaaccgtgccaatcatttttacaaatattcccttgcaaatatacctcaatcaactgtaatccccgatatcggcgagtatctaatgacctattc 14191714  T
Q  234 agttggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtaaacaatgttacaaccaaacc 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14191715 agttggtacaccaccatttaagttatatggtattgttgataccggtagtgatattgtttggcttcaatgtgagccttgtcaagaatgttacaaccaaacc 14191814  T
Q  334 actcctaagtttaatccatcaaa------aagttacaaaaacattccttg 377  Q
    ||||||| ||||||||| || ||      |||||||||||||||||||||    
T  14191815 actcctatgtttaatccgtcgaaatcgtcaagttacaaaaacattccttg 14191864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 324
Target Start/End: Original strand, 14200514 - 14200819
Alignment:
Q  19 tctcatgcgctatacaatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactataccaacctacacaaaacaaataccaacatattg 118  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  14200514 tctcatgctctaaacaatggtttcactcttgaactcatccatcgcgactcttcaaaatcaccattctaccaacctacacaaaacaaatacgaacgcattg 14200613  T
Q  119 tcaacgccgcacgccgttctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacaccttaatcaactgtaatccccgatcatggcgagta 218  Q
     ||| || |  || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||  | | ||||| |  |||||| |||||||||||| | | ||| | || |||||    
T  14200614 ccaatgcggtgcgtcgttccatcaaccgtgtcaaccatttctacaaatattctctcactagtacacctcaatcaactgtaaactctgataaaggtgagta 14200713  T
Q  219 tctcatgacctattcagttggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtaaacaa 318  Q
    ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14200714 tctcatgagttattcaattggtactccaccatttaaggtatttggctttgttgatacaggtagtgaccttgtttggcttcaatgtgagccttgtaaacaa 14200813  T
Q  319 tgttac 324  Q
    ||||||    
T  14200814 tgttac 14200819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 385
Target Start/End: Original strand, 34645615 - 34645987
Alignment:
Q  19 tctcatgcgctatacaatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactataccaacctacacaaaacaaataccaacatattg 118  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| |||||||  |||| |||||||||||  |||    
T  34645615 tctcatgctctaagcaatggttttagtgttgaactcatccaccgtgactccccaaaatcaccatactacaaacctaccgaaaataaataccaacactttg 34645714  T
Q  119 tcaacgccgcacgccgttctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacaccttaatcaactgtaatccccgatcatggcgagta 218  Q
    || | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||  | |   |||||  |||||| ||||||||||||||||||||   || |  ||    
T  34645715 tcgatgcagcacgtcgttccatcaatcgtgccaatcatttctttaaagattctgacacaagtacacctgaatcaactgtaatccccgataggggtggtta 34645814  T
Q  219 tctcatgacctattcagttggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtaaacaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34645815 tctcatgacctattcagttggtacccctccaactaagatatatggtattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtgaacaa 34645914  T
Q  319 tgttacaaccaaaccactcctaagtttaatccatcaaaa------agttacaaaaacattccttgttcttcta 385  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34645915 tgttacaaccaaaccactcccatttttaatccatcaaaatcatctagttacaaaaacattccttgttcgtcta 34645987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 379
Target Start/End: Original strand, 34665309 - 34665675
Alignment:
Q  19 tctcatgcgctatacaatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactataccaacctacacaaaacaaataccaacatattg 118  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| |||||||  |||| |||||||||||  |||    
T  34665309 tctcatgctctaagcaatggttttagtgttgaactcatccaccgtgactccccaaaatcaccatactacaaacctaccgaaaataaataccaacactttg 34665408  T
Q  119 tcaacgccgcacgccgttctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacaccttaatcaactgtaatccccgatcatggcgagta 218  Q
    || | || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||  | |   |||||  |||||| ||||||||||||||||||||   || |  ||    
T  34665409 tcgatgcagcacgtcgttccatcaatcgtgccaatcatttctttaaagattctgacacaagtacacctgaatcaactgtaatccccgataggggtggtta 34665508  T
Q  219 tctcatgacctattcagttggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtaaacaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34665509 tctcatgacctattcagttggtacccctccaactaagatatacggtattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgtgagccttgtgaacaa 34665608  T
Q  319 tgttacaaccaaaccactcctaagtttaatccatcaaaa------agttacaaaaacattccttgtt 379  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||    
T  34665609 tgttacaaccaaaccactcccatttttaatccatcaaaatcatctagttacaaaaacattccttgtt 34665675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19649916 - 19649558
Alignment:
Q  33 caatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactataccaacctacacaaaacaaataccaacatattgtcaacgccgcacgc 132  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| || |||||     
T  19649916 caatagttttagttttgaactcatccaccgcgattcttcaaaatcaccactctacaaacctgcacaaaacaaattccagcatgttgtcaatgctgcacgt 19649817  T
Q  133 cgttctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacaccttaatcaactgtaatccccgatcatggcgagtatctcatgacctatt 232  Q
    || || |||||||||||||||| ||| |  |||  | ||||| | || |||||| ||||||| |||     | ||   || |||||| | ||||| ||||    
T  19649816 cggtccatcaatcgtgccaatcgtttatttaaagattccctctccaatacacctgaatcaaccgtatatgtcaatggaggtgagtatttgatgacttatt 19649717  T
Q  233 cagttggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtaaacaatgttacaaccaaac 332  Q
    | |||||||| || || |||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  19649716 cggttggtacacctccgtttaatgtatatggtgttgttgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgtaagccttgtgaacaatgctacaagcaaac 19649617  T
Q  333 cactcctaagtttaatccatcaaa------aagttacaaaaacattccttgttcttcta 385  Q
    ||||||||  |||||||| |||||      |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19649616 cactcctatatttaatccttcaaaatcatcaagttacaaaaatattccttgctcttcta 19649558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 356
Target Start/End: Original strand, 34302291 - 34302610
Alignment:
Q  37 ggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactataccaacctacacaaaacaaataccaacatattgtcaacgccgcacgccgtt 136  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || | ||  ||||    
T  34302291 ggttttagtattgaacttatacaccgtgactcctcaaaatcacctttctacaaacctacacaaaacaaataccaacatgttgtcgatgcagtacatcgtt 34302390  T
Q  137 ctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacaccttaatcaactgtaatccccgatcatggcgagtatctcatgacctattcagt 236  Q
    | |||||||||| |||||| |   |||||| | | ||  |||  |||||| |||||||||||||| |  || | || || ||| |||||| |||||||||    
T  34302391 cgatcaatcgtgtcaatcactctaacaaaaattctcttgcaagtacacctgaatcaactgtaatctcttatgagggtgattatatcatgagctattcagt 34302490  T
Q  237 tggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtaaacaatgttacaaccaaaccact 336  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34302491 tggcaccccaccaattaagtcatatggtattgtcgatacaggtagtgacattgtatggctacaatgcgagccttgtgaacaatgttacaatcaaaccact 34302590  T
Q  337 cctaagtttaatccatcaaa 356  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34302591 cctaagtttaatccatcaaa 34302610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 33890071 - 33890023
Alignment:
Q  32 acaatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcacc 80  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  33890071 acaatggtttcagtgttgaactcattcatcgtgactcctcaaaatcacc 33890023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 115 - 389
Target Start/End: Original strand, 45644906 - 45645187
Alignment:
Q  115 attgtcaacgccgcacgccgttctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacaccttaatcaactgtaatccccgatcatggcg 214  Q
    |||||||| || ||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| | | ||| |||  |||||| |||||||||| |||||| ||   ||      
T  45644906 attgtcaatgcagcacatcgttccatcattcgtgtcaatcatttctataaaaattctctcgcaagtacacctgaatcaactgtgatccccaatacaggtt 45645005  T
Q  215 agtatctcatgacctattcagttggtaccccaccatttaagtt-atatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgta 313  Q
      |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45645006 cttatctcatgaactattgagttggtaccccaccatttaagtttatatggtattatcgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgta 45645105  T
Q  314 aacaatgttacaaccaaaccactcctaagtttaatccatcaaa------aagttacaaaaacattccttgttcttctatcct 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45645106 aacaatgttacaaccaaaccactcctaagtttaatccatcaaaatcatcaagttacataaacattccttgttcttctatcct 45645187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Original strand, 1389909 - 1390191
Alignment:
Q  32 acaatggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactataccaacctacacaaaacaaataccaacatattgtcaacgccgcacg 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |||   |     
T  1389909 acaatggctttagtgttgaactcatccaccgtgactcttcaaaatcaccactctaccaacctacacaaaataaataccaacgt-gtgtcaatgccatgca 1390007  T
Q  132 ccgttctatcaatcgtgccaatcatttctacaaaactgccctcacaaacacaccttaatcaactgtaatccccgatcatggcgagtatctcatgacctat 231  Q
     ||||| ||  |||||| | ||||||||||| ||  | |||| || |||| |||| |||| ||||| ||||||| | | || |||| ||| |||||||||    
T  1390008 tcgttccattgatcgtgtcgatcatttctactaacattcccttactaacaaacctaaatccactgtgatccccgctaaaggtgagtttcttatgacctat 1390107  T
Q  232 tcagttggtaccccaccatttaag---ttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgt 312  Q
    ||||| |||||||||||||| |||   |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  1390108 tcagtcggtaccccaccattaaagttattatatggtattgttgatacaggtagtgacatggtttggcttcaatgtaagccttgt 1390191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 83
Target Start/End: Original strand, 45644853 - 45644900
Alignment:
Q  36 tggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccact 83  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  45644853 tggttttagtgttgaacttattcaccgcgactcctcaaaatcaccact 45644900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 357
Target Start/End: Original strand, 28402637 - 28402780
Alignment:
Q  214 gagtatctcatgacctattcagttggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgta 313  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||  | |||||  ||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  28402637 gagtatctcattagttactcagttggtaccccaccctttaaagtttatggttttatggatacaggtagtaacatagtttggcttcaatgccagccttgtc 28402736  T
Q  314 aacaatgttacaaccaaaccactcctaagtttaatccatcaaaa 357  Q
    |   ||||| ||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  28402737 atacatgtttcaatcaaacctctcctatatttaatccttcaaaa 28402780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 45396848 - 45396705
Alignment:
Q  214 gagtatctcatgacctattcagttggtaccccaccatttaagttatatggcattgctgatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgta 313  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||  | || ||  ||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45396848 gagtatctcattagttactcagttggtaccccaccctttaaagtttaaggttttatggatacaggtagtaacatagtttggcttcaatgccagccttgta 45396749  T
Q  314 aacaatgttacaaccaaaccactcctaagtttaatccatcaaaa 357  Q
    |   ||||| ||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  45396748 atacatgtttcaatcaaacctctcctatatttaatccttcaaaa 45396705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44491645 - 44491559
Alignment:
Q  271 gatacaggtagtgacattgtttggcttcaatgcgagccttgtaaacaatgttacaaccaaaccactcctaagtttaatccatcaaaa 357  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||| |||||| | ||||  |||||||| ||||||    
T  44491645 gatacaggtagtgacttagtttggcttcaatgcaagccttgcaatatatgttacaagcaaacctcgcctatatttaatccttcaaaa 44491559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 89
Target Start/End: Original strand, 28402454 - 28402506
Alignment:
Q  37 ggttttagtgttgaactcatccaccgcgactcctcaaaatcaccactatacca 89  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28402454 ggtttaagtgttgaaatgattcaccgtgactcctcaaaatcacccctatacca 28402506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University